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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|16 : GGATGCTGTCTCATCAAA----AT-GA--AAGT------C-----A------TT---A---G--------A----T----T-T----T--T--T------C---C------CA-----GTT--A----A----A-AAT-------G-AT--AAT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CG-AAA-AAA-ATA----TGTTGCCGTGCTC
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gi|18 : GGGTCGTCGAA----AT-GA--AAGTTCATGTA-----A------TT---A---TT-------A----A----T-T----T--A--A------T---T------CA-----GCT--A----A----A-AAG-------C-GA--GTT-----TA---TC-----A--------T-------T--AT----CT--T------AAATG-----AAATTGATC----------G-C--AAA-ATA-GTA----TGATGTCGTGCTCttatagtctaag
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gi|3 : GATGTTGTATGAT--AA----ATCAA--AAGT------A-----A------TT---A---G--------A----T----T-T----TGTT--T------TAAAT------CA-----GTT--A----A----A-AGTTTAAATTC-AT--ATT-----TA---TT-----T--------T-------A--AT----CT--A------AAATG-----AAATTAATCTGATTTTTTTA-CG-AAA-AAG-GTA----TGTTGCAGTGC
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Reference ( family-2447 ) : TTAAGGATGTTGGCTCGTCAAA----AT-GA--AAGT------A----A------T--T---A-G--------AT----T-T----T--T--T------T---T------CA-----GTT--A----A----A-AAC-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CG-AAA-AAG-GTA----TGTTGCCGTGCTCA
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gi|27 : taAGGATGTTGGCTCGTCATA----AT-TA--A-GT------A----A------T--A---A-G--------AT----C-T----T--T--T------T---TTAATT-CA-----ATT--A----A----A-TAT-------C-AT--TTT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTTAGA----------A-CG-AAA-AAT-GTA----TATTttgtcgta
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gi|31 : GATATTGGCTCGT---------T-GA--AAGT------A----A------T--A---A-G--------AT----T-T----T--T--T------T---T------TAATTCCGTT--A----A----A-A-T-------G-AT--GTT-----TA---TT-----A--------T-------T--AA----CT--A------ACATG-----AAATTGATT----------A-CG-AAA-AAT-GCA----TGTTGCCagtt
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Reference ( family-2447 ) : TTAAGGATGTTGGCTCGTCAAA----AT-GA--AAGT------A----A------T--T---A-G--------AT----T-T----T--T--T------T---T------CA-----GTT--A----A----A-AAC-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CG-AAA-AAG-GTA----TGTTGCCGTGCTCA
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gi|36 : CTCGT-AAA----GT-AA--AAAT------A----A------T--T---A-T--------AC----T-T----T--T--TAAA---T---T------CT-----GTT--T----A----A-AAC-------C-AC--AAT-----TA---TT-----A--------T-------A--AT----GT--A------AGATA-----AAATTGATC----------A-C---AA-CAG-ATG----TATTGCCATG
gi|37 : CGTCAAA-----T-GG--AAGT------A----G------T--T---A-GTCTATGACAT----T-T----T--T--C------T---T------CAATTCTGTT--A----A----A-AAG-------C-AT--GCG-----TA---TT-----A--------T-------T--GT----CC--A------AAATA-----AAA-TGATC----------A-C
gi|38 : gttagccagagTTAAAGAT--TACATTGTTAAA----AT-GG--AAGA------A----A------T--T---A-G--------AT----A-T----T--T--TAA----T---T------CG-----GTT--A----A----A-ATA-------T-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------CGA
gi|39 : aGGATGTTGGCCCGTCAAA----AT-GA--AAGT------A----A------T--T---A-T--------ATA---T-T----T--T--TTAA---T---T------CA-----GTT--A----A----A-AAT-------C-ATACATTGTATATA---TT-----A--------T-------T--TT----CT--A------AGATG-----AAAATGATcaagagcatattgccgcg
gi|4 : GATATTGGCTCGACAAA----AC-GA--AAGT------A----AATGTAAT--T---A-G--------AT----T-T----T--T--T------T---TAATT--CG-----GTT--A----A----A-AAT-------T-AT--ATT-----TA---TT-----G--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CGAAAA-AAA-GTA----TGTTGCCGTGCaa
gi|40 : aTGTTGGCTCGTCAAA----AT-GA--AAGT------A----T------T--T---------------T----T-T----T--TA-T------T---T------CC-----GTTTAA----A----A-AAT-------G-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------G--AT----CT--A------AGATG-----AACTTAATC----------A-CC-AAA-TAA-GTA----CGT
gi|41 : ATGTTGACTCGT-AGA----AT-GA--ATGG------A----A------T--T---A-A--------AA----TATA---T--T--T------TAAAT------CA-----AGT--A----A----A-AAC-------C-AT--ATT-----CA---------------------------------------------------------AAA-TGATC----------A-CG-TAA-AA---TA----TGTCACCGCGCTC
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gi|46 : tGGTTCGT-AAA----AT-GA--AAGT------A----C------TAAC---A-G--------GT----T-T----T--T--T------TATTT------CA-----GTA--A----A----A-AAA-------C-AT--GTT-----TG---TT-----T--------T-------T--AT----CT--C------AGATA-----CAAATCATC----------A-CA-AA
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gi|49 : GT------A----A------T--T---A-G--------AT----T-T----T--T--T------TAATT------CA-----GTT--A----A----A-ACT-------G-AT--ATC-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----TT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CC-TAA-AAC-GTA----TGTCGCCGTGt
gi|5 : GTTGGCTCG-CAAT----AT-GA--AAAT------A----G------T--A---T-G--------AT----T-TATT-T--T--TAA----T---T------CA-----GTT--A----A----A-AAC-------CCAT--ATT-----TG---TT-----T--------T-------T--AT----CT--ATGAGTAAGATG-----AAATTGACC----------A-CG-AAA-ATG-GTA----TGTTATCGTGCTC
gi|50 : aTGTTGGCTCGT-AAT----AT-GA--AAGT------A----A------T--T---------------------------------------------------CA-----ATT--A----A----A-A-C-------T-GT--ATT-----TC---GT-----A--------T-------T--TT----CT--G------AGATG-----AAATTGCTC----------A-CG-AGACAAT-GTA----TGT
gi|51 : TGTTG-CTCGTCAAA----AT-GA--AAGT------------------C--T-----G--------TT----T-T----T--TA-T------T---T------CA-----ACT--A----A----T-AAT-------G-AT--ATT-----TA---CT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGACG-----AAATTGATC----------A-CG-A
gi|52 : ----A------T--T---A-G--------AT----T-T----C--T--T------T---TTTAATTCA-----ATT--A----A----A-AAT-------C-AT--ATT-----TA---TT-----T--------T-------T--AT----C---A------AAATG-----GTATTGATC----------A-TG-AAA-AAG-GTA----TGCTGTCt
gi|53 : AAGGATGTTGGCTCGAGAAA----AT-GA--AATT------A----A------T--T---C-G--------GT----T-C----T--T--TTAAA--T---T------TA-----GTT--A----A----A-TGC-------C-AT--ATT-----TT---TG-----A--------T-------C--AT----AT--A------AGATtg
gi|54 : taAA----AT-GA--AAGT------T----A------T--T---A-G--------AT----T-TAGATT--T--TAA----T---T------CA-----GTT--A----A----A-AAA-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AC----TT--A------AGATG-----AAATTGATC----------G-TG-AAA-A
gi|55 : -T----T--T--C------T---T------GA-----ATT--A----ATTTAA-AAG-------C-AT--AGA-----TA---AC-----A--------T-------C--ACTAGGCT--A------ATATG-----AAATTTATC----------A-C--AAA-AAG-GTA----TGTTGCCGTg
gi|56 : T-GA--AAGT------A----C------T--T---A-G--------AT----T-T----T--T--T------TAATT------CA-----GTT--G----A----A-ATT-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AG---------------------------A-CG-AAA-AAA-GTA----TGTAGCCGTGCTaatc
gi|57 : A-----GTA--A----A----A-GAC-------C-TT--ATA-----TA---TT-----A--------CAAAGTTAT--AT----CT--A------AGATG-----AAATTCATC----------A-CA-TAA-AGT-ACA----TGTTGTCGTGCTCA
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gi|6 : ttccGGATGTTGACTAGTTAAATTTAAT-AATAAAGT------A----A------T--T---A-G--------AT----T-T----T--T--TTAA---T---T------CA-----GTT--A----A----A-ATA-------T-AC--ATT-----CA---GC-----A--------T-------G--AT----TT--AC-----ATGTA-----GAATC-ATC----------A-CG-AAA-AAC-TTA----CGGTGTTGTGtgt
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gi|25 : aTTTAGGATGTTGACC--TTAAA----AT-GA--AAGA------A----A------T--T----A-G--------AT--T-T---T--TTA---AA-TTAAGTT--A--T-T-A----------C-AA--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T---T----TT--A------AGATG-----AAATT-ATT----------ATCG-AAA-AAG-GTA----TGT
gi|26 : atatTAATGATGTTGGCTCGT-AAA----AT-GA--AAGT------T----A------T--T----A-G--------ATAAT-A---T--TTT----A-TTCAGTT--A--A-A-AC-C-------C-AT--ATT-----TA---AT-----ACAAGTGACT-------T--AA----TT--AC-----AGATG-----AAATTGg
gi|27 : taAGGATGTTGGCTCGTCATA----AT-TA--A-GT------A----A------T--A----A-G--------ATCTT-T---T--TTT---AA-TTCAATT--A--A-A-TA-T-------C-AT--TTT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTTAGA----------A-CG-AAA-AAT-GTA----TATTttgtcgta
gi|28 : GGCTGGT-AAA----AT-GA--AAGC------A----A------T--A----A-T--------AT--T-T---T--TTT---TA-TTAAGT---G--A-A-AA-C-------C-AT--ATT-----TA---AT-----A--------T-------T--AT----CT--G------AGATG-----AAATTGATC----------A-CA-AAT-AAG-ATA----TGTTGTCGTAC
gi|29 : tgaaTGATGGCTCGTCAAA----AC-GA--AAAT------A----A------T--TTCAAA-A--------A------------TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AA-T-------G-AT--ATT-----TA---TG-----A--------T-------T--AT----CT--A------ACATG-----ACATTGATC----------A-CG--AA-AAG-ATA-----ATTGCCGTG
gi|3 : GATGTTGTATGAT--AA----ATCAA--AAGT------A----A------T--T----A-G--------AT--T-T---TGTTTT---AA-ATCAGTT--A--A-A-AG-TTTAAATTC-AT--ATT-----TA---TT-----T--------T-------A--AT----CT--A------AAATG-----AAATTAATCTGATTTTTTTA-CG-AAA-AAG-GTA----TGTTGCAGTGC
gi|30 : AGGATGTTGGCTCGTC-AA----AT-GA--AAGC------A----A------T--A----A-GA-------AT--A-T---G--TTT---AA-TTCA-TT--AAGA-A-AA-C-------A-A----------------------------------------T--AT----CT--A------AAATG-----AAAATGATC----------A-TG-GGA-CAG-GTA----AGTGACCG
gi|31 : GATATTGGCTCGT---------T-GA--AAGT------A----A------T--A----A-G--------AT--T-T---T--TTTTT-AA-TTCCGTT--A--A-A-A--T-------G-AT--GTT-----TA---TT-----A--------T-------T--AA----CT--A------ACATG-----AAATTGATT----------A-CG-AAA-AAT-GCA----TGTTGCCagtt
gi|32 : GGCTGGT-AAA----AT-GA--AAGC------A----A------T--A----A-T--------AT--T-T---T--TTT---AA-TTAAGTT--A--A-A-CA-C---------AT--ATT-----TA---AT-----A--------T-------T--AT----CT--G------AGTTG-----AAAATGATC----------A-CG-AAT-AAG-ATA----TGTTGTCGTa
gi|33 : aGGCTCGT-AAA----GT-AA--AAAC------A----A------T--T----A-T--------AC--T-T---T--TTA---AA-TTCTGTT--T--A-A-AA-C-------C-AC--AAT-----TA---TT-----A--------T-------A--AT----GT--A------AGATA-----AAATTTATC----------A-C---AA-CAG-ATG----TATTGCCATGa
gi|34 : gAAG----GT-GA--AAGT------A---------------------G--------AT--T-A---T--TTT---AAATTCGGTT--A--A-A-G----------C-AT--ATT-----AA---TTTGGTTA--------T-------T--AT----CT--G------ACATA-----AAA-TGATA----------A-CA-AAACAAA-ACA----TGTCGCTG
gi|35 : agcttctCAAA----TT-GA--AAGT------A----T------T--T----A-T--------AT--T-T---T--TTA---AA-TTTAGTT--A--A-A-AA-G-------C-AT--ATT-----CA---TT-----A--------T-------T--AT----TT--A------AGATG-----AAATTGATA----------A-TG-AAA-CAG-GTG----TGTTGTCATTCT
gi|36 : CTCGT-AAA----GT-AA--AAAT------A----A------T--T----A-T--------AC--T-T---T--TTA---AA-TTCTGTT--T--A-A-AA-C-------C-AC--AAT-----TA---TT-----A--------T-------A--AT----GT--A------AGATA-----AAATTGATC----------A-C---AA-CAG-ATG----TATTGCCATG
gi|37 : CGTCAAA-----T-GG--AAGT------A----G------T--T----A-GTCTATGACAT--T-T---T--TCTTC-AA-TTCTGTT--A--A-A-AA-G-------C-AT--GCG-----TA---TT-----A--------T-------T--GT----CC--A------AAATA-----AAA-TGATC----------A-C
gi|38 : gttagccagagTTAAAGAT--TACATTGTTAAA----AT-GG--AAGA------A----A------T--T----A-G--------AT--A-T---T--TT----AA-TTCGGTT--A--A-A-AT-A-------T-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------CGA
gi|39 : aGGATGTTGGCCCGTCAAA----AT-GA--AAGT------A----A------T--T----A-T--------ATA-T-T---T--TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AA-T-------C-ATACATTGTATATA---TT-----A--------T-------T--TT----CT--A------AGATG-----AAAATGATcaagagcatattgccgcg
gi|4 : GATATTGGCTCGACAAA----AC-GA--AAGT------A----AATGTAAT--T----A-G--------AT--T-T---TT-TTT---AA-TTCGGTT--A--A-A-AA-T-------T-AT--ATT-----TA---TT-----G--------T-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CGAAAA-AAA-GTA----TGTTGCCGTGCaa
gi|40 : aTGTTGGCTCGTCAAA----AT-GA--AAGT------A--------------T----------------T--T-T---T--TTT---AT-TTCCGTTTAA--A-A-AA-T-------G-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------G--AT----CT--A------AGATG-----AACTTAATC----------A-CC-AAA-TAA-GTA----CGT
gi|41 : ATGTTGACTCGT-AGA----AT-GA--ATGG------A----A------T--T----A-A--------AA--TATA--T--TTT---AA-ATCAAGT--A--A-A-AA-C-------C-AT--ATT-----CA---------------------------------------------------------AAA-TGATC----------A-CG-TAA-AA---TA----TGTCACCGCGCTC
gi|42 : aA----AT-GA--AAGA------A----A------T--T----A-G--------ATATT-T---T--TTT---AA-TTTAGTT--A--A-A-AA-T-------A-AC--ATT-----AA---TT-----A--------T-------C--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CG-AAA-AAA-GAG----TGTTGCCGTg
gi|43 : TTAATGATATTGGCTCGT-AAA----AT-GA--AAGT------ACAAAA------T--T----A-T--------AT--C-T---T--T-----------A--T--A--A-A-AA----------------------------------------------------T--GC---------------AGATG-----AGATTGATA----------A-CG-AAA-AAG-GTA----TGTCGCCGTTCTCc
gi|44 : TCTTCAAA----AT-GA--AAGA------A----A------T--T----A-G--------AT--T-T---T--TTT---AA-TTCGGTT--A--A-A-AA-C-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGATG------AATTGATT----------G-CG-AAA-AAG-TTA----TGTTG
gi|45 : A----AT-GA--AAGA------A----A------T--T----A-G--------ATATT-T---T--TTT---AA-TTTAGTT--A--A-A-AA-T-------A-AC--ATT-----AA---TT-----A--------T-------C--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CG-AAA-AAA-GAA----TGTTGCCG
gi|46 : tGGTTCGT-AAA----AT-GA--AAGT------A----C------TAAC----A-G--------GT--T-T---T--TTT---AT-TTCAGTA--A--A-A-AA-A-------C-AT--GTT-----TG---TT-----T--------T-------T--AT----CT--C------AGATA-----CAAATCATC----------A-CA-AA
gi|47 : ATATTAGTGCGCCAAA----AT-GA--AAGT------A----A------T--T----A-G--------AT--A-T---T--CTT---TA-CTCAATT--A--A-A-AA-C-------C-AT--AGT-----TG---TT-----A--------T-------T--AT----TT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CG-AAA-tgtgtcc
gi|48 : TTAAGGATGTTGGCAC-TTAAA----AT-TA--AAGT------A----A---------------------------------------------A-TT----------------------------T--ATT-----TA---TA-----A--------C-------T--AT----CT--A------AGATG-----TAACTGATC----------A-CA-AAG-AAA-GTA----TGTTGCTGTGCT
gi|49 : GT------A----A------T--T----A-G--------AT--T-T---T--TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AC-T-------G-AT--ATC-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----TT--A------AGATG-----AAATTGATC----------A-CC-TAA-AAC-GTA----TGTCGCCGTGt
gi|5 : GTTGGCTCG-CAAT----AT-GA--AAAT------A----G------T--A----T-G--------AT--T-TAT-T--TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AA-C-------CCAT--ATT-----TG---TT-----T--------T-------T--AT----CT--ATGAGTAAGATG-----AAATTGACC----------A-CG-AAA-ATG-GTA----TGTTATCGTGCTC
gi|50 : aTGTTGGCTCGT-AAT----AT-GA--AAGT------A----A------T--T---------------------------------------CAATT--A--A-A-A--C-------T-GT--ATT-----TC---GT-----A--------T-------T--TT----CT--G------AGATG-----AAATTGCTC----------A-CG-AGACAAT-GTA----TGT
gi|51 : TGTTG-CTCGTCAAA----AT-GA--AAGT------------------C--T----G--------------T-T---T--TTT---AT-TTCAACT--A--A-T-AA-T-------G-AT--ATT-----TA---CT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AGACG-----AAATTGATC----------A-CG-A
gi|52 : ----A------T--T----A-G--------AT--T-TCTTT--TTT---AA-TTCAATT--A--A-A-AA-T-------C-AT--ATT-----TA---TT-----T--------T-------T--AT----C---A------AAATG-----GTATTGATC----------A-TG-AAA-AAG-GTA----TGCTGTCt
gi|53 : AAGGATGTTGGCTCGAGAAA----AT-GA--AATT------A----A------T--T----C-G--------GT--T-C---T--TTTA--AA-TTTAGTT--A--A-A-TG-C-------C-AT--ATT-----TT---TG-----A--------T-------C--AT----AT--A------AGATtg
gi|54 : taAA----AT-GA--AAGT------T----A------T--T----A-G--------AT--T-TAGAT--TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AA-A-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AC----TT--A------AGATG-----AAATTGATC----------G-TG-AAA-A
gi|55 : T--T-T---C--TTG---AA-TTAATTT--A--A-A-AG-C---------AT--AGA-----TA---AC-----A--------T-------C--ACTAGGCT--A------ATATG-----AAATTTATC----------A-C--AAA-AAG-GTA----TGTTGCCGTg
gi|56 : T-GA--AAGT------A----C------T--T----A-G--------AT--T-T---T--TTT---AA-TTCAGTT--G--A-A-AT-T-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----CT--A------AG---------------------------A-CG-AAA-AAA-GTA----TGTAGCCGTGCTaatc
gi|57 : AGTA--A--A-A-GA-C-------C-TT--ATA-----TA---TT-----A--------CAAAGTTAT--AT----CT--A------AGATG-----AAATTCATC----------A-CA-TAA-AGT-ACA----TGTTGTCGTGCTCA
gi|58 : ---AA-TTCAATT--T--A-A-AA-C---------AT--ATT-----TA---TA-----A--------G-------T--AT----CT--A------AGATG-----AAATTGATC----------G-CG-AAA-AAG-TTT----TTTTTCCG
gi|59 : TT-----CA---TC-----A--------C-------A--AT----CT--A------AAATGCCGGGAAAT-GACC----------A-CG-AGA-AAG-GTA----TGTCGCTTTGCTatctc
gi|6 : ttccGGATGTTGACTAGTTAAATTTAAT-AATAAAGT------A----A------T--T----A-G--------AT--T-T---T--TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AT-A-------T-AC--ATT-----CA---GC-----A--------T-------G--AT----TT--AC-----ATGTA-----GAATC-ATC----------A-CG-AAA-AAC-TTA----CGGTGTTGTGtgt
gi|60 : AAGGATGCTGGCTTGT-AAA----AT-GA--AAGT------A----A------T--T----A-G--------A
gi|61 : tgcatcc-------C-AT--ATT-----TA---TT-----A--------T-------T--AT----AT--A------AGATG-----AAATTGATT----------A-CG-AAA-A
gi|7 : TTACGGATGTTGGCTAG-AAAA----AT-GA--AAGA------A----A------T--T----A-G--------AT--T-T---T--TTTTTAAA-TTTAGTG--A--A-A-AA-A-------C-AT--ATT-----T----TT-----T--------T-------TAAAT----TT--A------AGATA-----AATCT--TT----------A-TG-AAA-AAA-GTA----TGTTGACGTGc
gi|8 : TTAAGGATGTTCGC-CTTTAAA----AC-GA--AAAT------A----A------A-------A-A--------AT--T-T---A--TTT-------CCA-TT--A--A-G-AA-C-------C-AC--ATT-----CG---TC-----A--------T-------G--CT----CT--A------AAATG-----AAAATGATC----------A-CG-CAA-ATG-TTA----TGATACCGAGCT
gi|9 : AAAAATGTTGGTTTGT-AAA----AG-GA--AAGA------A----A------T--T----ATG--------AT--C-T---T--TTT---AA-TTCAGTT--A--A-A-AAGC-------G-AT--AAT-----AG---TT-----A--------T-------C--AA----TT--T------AGATG-----AAATGGATC----------G-CT-TAA-AAT-GTA----AATTGCCGGGCtgctt