lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 333333333333333 1 1111 2222222222222222 11 333 11111 2 111111111111 2222 111 111111 11111 11 111111111111 1111 111111 33333333333 1 4444444444444444444444444 1 44444444444444 11 111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333 11111
lowQualScore : 5 8 7 0 000000000000000 2 5 4444 99 4444444444444444 00 77 888 0 7 11111 5 0 0 5 999999999999 3 6 6666 111 6 2 88 666666 3 1 11111 4 77 1 5 777 00 444 0 66 111111111111 777 77 1 0000 444444 66 1 5 66666666666 0 33 66 1 8888 0000000000000000000000000 666 99999 0 55 3 5 2 2 2 33 55555 1 33 66666666666666 55 444 33 666 2 00 33 8 0 2 333 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 9999 333333333 2 00000 3 8 66 777777 555 7777 2
lowQualScore : . . . . ............... . . .... .. ................ .. .. ... . . ..... . . . . ............ . . .... ... . . .. ...... . . ..... . .. . . ... .. ... . .. ............ ... .. . .... ...... .. . . ........... . .. .. . .... ......................... ... ..... . .. . . . . . .. ..... . .. .............. .. ... .. ... . .. .. . . . ... . ............................................................................................................. .... ......... . ..... . . .. ...... ... .... .
lowQualScore : 0 0 0 2 555555555555555 5 0 2222 22 3333333333333333 33 99 444 1 3 11111 1 3 3 7 000000000000 3 0 0000 888 7 5 55 000000 7 4 11111 0 99 7 9 000 77 999 8 11 333333333333 888 11 9 6666 444444 99 2 0 11111111111 1 55 66 6 5555 6666666666666666666666666 444 11111 5 00 3 6 5 5 4 22 99999 3 22 55555555555555 66 111 22 222 4 88 22 9 4 4 666 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6666 888888888 5 66666 0 2 44 888888 555 8888 7
consensus : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAA-A-ATAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAAC-AAAAAA-A-AT---TTC-ATATGATTATTTAAGA--T-GTAAAATAATTGGTCTT---CAGATGTTAAATCTATATTTAAA-GAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCNAT-AAGAAGTTTTCATAACACCACATT-TATCCAAGATGTNCGTAATCTTTTA-CTACANAA--TTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---A--TATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT---TAC-A---CAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCATTGCAATCG----A----G----G----T----CGG---TATATTGG---TTT-----ACCNAGA--GACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAAT-TTAA-AT--ATTG-----TCGAAGATGA--AATA-----------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGTC-C-TAAATTTGATAATTT--ACGTGAACATTTGAACGC-AAAAATTGATGAATTA-TG-----C-NTNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACANGGCAAATTT---AAACACT--TTTT-TTTTT-T-----CATTGCATTGATNGATCAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A----TAT-ATATA
Reference ( gi|4 ) : AAACCCCACATATAAGA-CGAAAAATAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-ATAGCTATGGATGCTA----GAC-GGTTAA--AAAAAA-A-AT---TTC-ATATGATTATTTAAGA--TCAAAAAATGATTGGTCTT---CCGATGTTAAAACTATATTTAAA-GAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCTTTGTCAATTAAGAAGTTTTCGTAACACCACATT-TATCCAAGATGTGCGTACTCTTTTA-CTGCATAA--TTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---A--TATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT---AAC-T---CAACTACGTTCCAGTCCCCTTCCCATTGCAATCG----A----G----G----T----CGT---TATATTGG---TTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTCTGTAAGC-AGTGTAAT-TTAA-AT--ATTG-----TCGAAGATGA--A--A-----------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGCT-C-TAAATTTGACCATTT--ACGTGAAAATTTGAATGC-AAAAATAGTTGAATTA-TG-----C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCC---AAACACT--TTTTATTTTT-T-----CATTGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A----TAT-ATATA
gi|6 : AACCCCA-ATATAAAAGTGTAAACTAAATGCTTTA-------GG-----------------TATGGATGATA----GAC-GGTTAA--CAGAAATA-AC---TT------GATTACTTAAAA--T-GTAAAATAATTTGTTTC---CAGATGGTGAATCTATATTTGAA-GAAA----------GTATGACTTTAATGCCTTGTCT-TTAAGAACTTTTGAAAACACCACAAT-TTTCCACGATGTA---AATTTATTAACTACAAAT--TTGTAAGACGAAATGGACTACTGATATACATTCA--CAAA-ATAAGTTAATTATATGTTAAAA-----A---A--TATTGA---AT-CATAATAAGTTTGATTTCGAGTAATGTTTATATG--TTAGAATGAACCTAACCAACAATTTAAGATCGTGT-AT---TAC-A---CAATTACGCCCCGGTACCCTTCCCATTGCATCCG----A----ATTATG----C----CGG---TATATTAG---TTT-----ATCAAGA--GATTCAAGATTTTGTTTGC-AGTGTCAT-TTGA-AT--ATTG-----TTGAATATGA--AATA-----------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGTC-C-TAAATTTTATTATCA--ACGAGAGCATTTGAGCGC-AAGAATTATTGAATT-----------TTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGGCAAATTT---ATACA-----TTTA-TTTT-T-----CATTGCATGAATGGATTAA---TGTTAT
gi|28 : tacgctataatctgacattcattttttagttgcgatataaattgtttatgtatttacggtcgttacatttgatgaacattgacaacggtccttacattaattcacagtgatattggttgggAAACCCGGATATAAGA-TGTAAACCAAATGTTTTACGGTTTT---CAAAAAAAAA-ATAGCTATGGATGATA----GAA-TGTTAGCCAAAAAT-G-TT---TTC-ATATGATTATTTAACATGTCAAAAA--CATTGGTCCT---CAGGTG--AAA--------TAAA-GAATGTGATa
gi|10 : ttattttaggtgtacattattctacatccttaccagtaacacaaggcgatatgagtttggACACCGCAAAGAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACAGTTT-GGA---AAACGGA-ATTGCTATGGCTGATATGTGGACAGGTTAC--ATACAT-A-TT---TTC-CTATAGTTTATTAAGG--T-GTAAAATAATTGGTCTT---CAAATGTTTAATCTACTTTTAAA-ATGATTGTCAAAGAACGTGACTTTAACTGCCTGTCAA-TAAGAGGTTTTCACAACACAATAGT-TATCCAAATTGTTCATAATCTTTTA-CAATACAA--TTATAAGACGCACTGGACATATGATATCA----T--CAAA-ATAATCTAATTGCTTAT--AAG-----A---A--TAt
gi|3 : aggtgacttaatgttttctatatgcagtgaaatttattttcgggaatggcactggcctataatggactatgcatcttcggtatgacggggatgcaaaagttgttctaaaattgacgcattacctaatggcatcttggcgtacatgcataaatgaatgtctttagcctatcagtaatttcaatggtgggacCCCACACATAAGA-CGTAAAATAAAT-CTTTACGGTTTTG--AAAAAAAATA-ATAGCAATGGATAATA----GAC-GGTTAA--CAAAAA-ATAT---TTTTATATGATTATTTAAGA--T-GTTAAATAATTGGTCTT---CCGGTGTTAAATCTATATTCAAA-GAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCCTTGTCAAT-AAGAAGTTTTCATAACACCACATT-TATCCGAGATGTCCGTACTCTTT-A-CTGCATAA--TTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---A--TATCAA---AC-TTGAATA----CGATTGCGGGT------AATATGTTTTTTAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT---AAT-A---CAACTACGTTCCGGTACCATTCCCATTGCAATCG----A----G----ACGGCT----CAT---TATATTGG---TTC-----ACCTAGA--GGCCAGAGATTCTGTAAGC-AATGCAAT-TTAA-AT--ATTG-----TCGAAGATAA--AATA-----------TAT--TTCA---TATTTT--GTTGCT-C-CAAATTTGATCATTT--ACGTGAAAATTTGAATGC-AAAAATAGTTGAATTA-TG-----C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAATCT---AAACACT--TT---TTTAT-T-----CATTGCATTGATTGATCAATTTTGTTGTTCAaattaataacatatcataggcggatctaggattttcaatg
gi|2 : agACATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTAACGAATTTGGAAAAACATATATATA--TATGGACGATA----GA------AAC-AGGAAA-A-ATATGTTC-ATACAATTATTTAAGA--T-ATAAAATAATTGGTCTT---TAGATTATAAATCTATATTTAAA-AAAAT-GATAAA-AAGGTGACATTAATGCCTTGTCTAT-ACAAAGTTTACATAACGCCACATT-TAT-------ATGCGTCATCTACTA-TT--ATAACATTATAAGACAAAATAGACAAATTATATACATTTT--CAAA---------ATTATATAT--AAA-----A---AAATATTCT---AT-TTGAATA----TGAGTGCTAGT------TATATA--TTAAAACGAACCTTAACAAAAAATGAAGATCGTGT-AT---TAC-A---CAACTAGGCTCCGGTTTTCTTCCCATTGCAATCG----A----G----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttgataaataatatatata
gi|5 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttGTTTTACGGTTTTGGAAAAAATAA----TAGCAATGGATGATA----GAC-GATTAAC-AAAAAA-A-ATATTTTT-ATATGATTATTTAAGA--TGAAAATATACTTGGACTT---CCGATATTAAATCAAAATTTAAA-GAAATT-----------------TAATACCGGGTCAAT-AAGAAGTTTTCATAACACCACATT-TATCCAAGATGTGCATACTCTTTTA-CTGTATAA--TTATAAAACTAAATAAACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---A--TATCAA---AC-ATAAAAA----CGAATGCAAGT------TATATG--TTTAAATGAACCGTAACAAAAATATAAGATCGTGT-AT---TAC-A---CAACTACGTTCCGGTACTCTTCCCATTGCAATCG----AGTTCG----G----T----CGT---TATATTCG---TTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTGTGTAAGC-AGTGTAAT-TTAA-AT--AAAG-----TCGAAGATAA--AATA-----------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGCC-A-TAAATTTGATCATTT--ACGTGAAGATATGAATGC-AAAAATAATTGAATTA-TG-----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCT---AAACA-----TTTG---TT-T-----CATTGCATTGATTGATCAATTTTGTAATTCAttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|9 : ATTATTTAAGA--T-GTAAAGTAATTGTTCTTAAATTGATGTTAAATCTATATTTAAAAGAAATTGATAA-GAAGGTGAATATTATTCCTTGTCTAT-AAGAAG-TTT---------ACATTATATACAA-------------------------AA--GTATAAGACAAAGTGGACAAATGATATAAATTCG--CAAA-ATATGATAGTTATATGT--AAG-----A---A--TATTAA---AC-TTGAATA----TGAGTGCGAGT------TATATG--TTATATTGAACCTTAACAAAAGTTCACAATCGTGT-AT-----T-T---CA---------CAA--CCCTTCCCATTGTAATCGAGTTA----G----G----T----TGG---TATATTGA---TTT-----ACTAAAA--GACCAAATATTTTTTAAGC-GGTGTAAT-TCAA-AA--TTTG-----TTGAAGACGA--AATA-----------CAT--TCAA---TATTTT--ATTGTT-C-GAACTTATATAATTT--ACGTGAATATTTGAACGC-AAAAATTGATGAATTA-TG-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtattgtaccagtcactttaataaataaaatatatata
gi|32 : TTA-CCACAAAA--TTATAAGACAAAAGTGAAAAATGATATAAATTCT--CAAA-ATAAGCTAAATATATAT--AAA-----A---C--TATTAA---AT-TTGAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaaattaaaacacgatgtttcttttttccttccattgat
gi|13 : ATATATATTCCAACAACCATACGTTGATTTAATAT--AAT-----ATCCA--CGTCAAGATATATCAAATA----TGAGTGCGAGT------TATATA--TTAAAAT-AACCTTATCACAACTTAAAGATCGTGT-AT---TAC-A---CAACTACGCTC-GGTTCCCTTCCCATTGCTATCA----A----GTTAGG----T----CGG---TATATTGG---TTT-----GTCTAGA--GACCAAATATTTTGCAAGC-AGTGTAGT-TTGA-AT--ATTG-----TTGAAAAGGA--AATA-----------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGTC-C-TAAATATGATAATTT--ACGTGAACTTTTAAACGCAAAAAATGATT-AATTC-TG-----tgctatgttctaccattaatataatatgtgtgatccttcggtatgcatgtacagtgtactatgatttggtacttcc
gi|7 : ataaAAATTTC--CAAA-ATA---T--TTATAAAT--TAGTTATCA---G--TATCAC---A-----AAAA----CAAGTGCAAGT------TATATG--TTAGAATGAACCAAAACAAAATTTTAAGATTATGT-ATTATAAG-A---CAGCT-CAT----GTTCCCTTCCCATTGCAATCG----A----GTTTGG----T----CGA---TATGTTGG---TTTGGTTTACCGAGA--AACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAAT-TTAA-AT--ATTG-----TTGAAGATAA--AATA-----------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGTC-C-CATATGTAATGATTT--ACATGAACATTTGAATGC-AAAAATTGATGAATTA-TG-----N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAATTT---AAACACTTCTTTTCTTTTTGT-----CATTGCATTGATGGAT--ATGTTATAATTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaatttaaacacttatttttcttttataattgcattgatggacaaatgttataatt
gi|26 : gaaaattaaaaacaAA---AC-TTCAGTT----TTAGTGCGAGT------CTTATT--TTAAAATGAACCTCAACAAAAACTTAAGATCGTGTCAC---GACGTACACAACTATGCTCTGGTACCCTTCCTATTGAAATCG----A----A----G----C----CGCGCATGTGTTAGTATTTT-----ACC------GGCCA------CTATTAGC-GG-GCAGTATTAAGATTGATTGACTGACCGGGTATGATTA--A-----------CATA-CTC----TACTTC--GTTACTAA-TACTTTTAACCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaacatgtattgtacctgtcactttaataaagaaaaaaaatatatatc
gi|29 : CCATTGCGATCG----A----G----T----TAGGATGG---TATATTGG---TTT-----ACCCAGACTGACCAGCGAGTATGTAAGC-AGTGTAAT-CTAA-AT--AGTA-----TTGAAGATGA--A--ATACATTATTTTCAT--TTTA---TATTTT--GTGGTC-G-TTAATTTGACAATTG--ACATGAAAACGTAAACGC-AAAAATTAATGAATTG-Tcactaacatactg
gi|16 : gatagcaattgtgagatgat----A----G----G----C----TGA---TATATTGG---TTT-----ACC-AAA--GACCTAATATTTTGTAAGC-AGTGCAAT-TTGA-AT--AATG-----TTGAAGATGA--AATA-----------CAT--TTCATATTATTTT--GCTGTC-C-TAAATTTGATAATTT--ACGTGACCATTTGAACGT-CAAAAT-GATAAATTA-TGTTNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTT---AAACAC--------TTTTT-T-----CATTGCATTGATGGATAAATtatgtaatgtaa
gi|8 : ggtatgccaactgaaacggttttgacaatcatatattcattatggcagtatacattTGTTGA---TAT-----ACCTAAG--GACCAGAGATTATGTAAGC-AGTGTAAT-TTAA-AT--ATTC-----TCGAAGACGA--A--ATA---------CAT--TTCA---TATTTTTGGTTGCT-C-TAAATTTGATCATTT--ACGTGAAAATTTGAATGC-AAATATAGTTGAATTA-TG-----C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCT---AAACACT--T----TTTTT-T-----CATTGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAg
gi|17 : gatatgtaactgaaatctgaaagattcacacttgcaaggtttgagtttaagttggtgtttatc---TTT-----ACCAAGA--GATCAAAGATTTTTTTTGC-AGTGTAAT-TTGA-AT--ATTG-----TTGAAAATGA--A--A-----------TATATTTCA---TGTTTT--GTT-TT-CACAAATTTTATAATTT--ACGTGAACATTTGAATGC---AAA------AATTAGTA-----A-GTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCAAATTT---AAACACT--TTTTTTCTTT-TTGT--CATTGCATTGATGGATAGA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttagtaaataatatata
gi|24 : GGTTTTGTAAGC-GGTGTAAT-TTGA-AT--ATT------CCG---------------------------------------------TTGTC-C-TAAATTTAATAATTC--ACGTGAACATTTGA-----AACAATTGATGAGTTA-TG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTT---AAACACT-------TTTCC-T-----CATTACATTCGTTTAT-AATTaat
gi|2 : TGCAATCGAGT-TAAC-TTAA-AT--ATTG-----TTGAAGACGA--A--ATA---------CAT--TTCA---TATTTT--GTTGTC-T-TATATTTGATCATTA--ACGCGAACATTTTCACGC-AAAAAATGATGAATTA-TGNN---N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTT---AAACAC----TTTGTTTCT-TGATGCCATTGCAGTGATGGATAGATTTTATAATTCAggtataattctt
gi|12 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccatGC-AGTTCAAT-TTAA--T--ATTT-----TTGAAGATGA--A--AATG--------TAT--TTTA---TATTTT--GTTGTC-C-CAAATTTGAC-ATTTTTACATGAACATTTGAACGC-AAAAATTGATGAATTA-TGNN---N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGTT---AAACAC--------TCTTT-T-----TATTGCATTGATTGAT-AA--TTGTTATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|14 : C-AGTGTTAT-TTGA-AT--ATTG-----TTGAAGATGA--A--ATT---------CAT--TTCA---GAT-----GTTGTC-C-TAAATTTGATAATTT--ACATGAACATTTGAATGT-AAAAATTGATGAATTA-TG-----ttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgctttgaaccagtcactttaataaagaaataataataa
gi|23 : -AGTGTTAT-TTAA-AT--GTTT-----TTGAATATGA--ATTA-----------TAT--TTTA---TATTGG--TTTGTC-C-TAAATTTGACAGTTG--ACGTGAAAATTTCAATTC-AAGAATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|25 : A-AT--ATTG-----TTGAAAATAA--A--ATA---------CAT--TTCA---T-TTTT---TTGTC-C-CAAATTTTATAATTA--ACATGAACATTTGAACGC-AAAATTTGCTGAATTA-TG-----annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaaattaaacacttggttttcattacattgataaataaatgatt
gi|48 : ATTT--ATGTGAACATTTGAACGC-AAAAATAGATGAATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaattaagattatttttttgtaattgctttgattgataaataatgataatt
gi|18 : ttaataCAAATTT---AAACACT--TTTT----TG-T-----CATTGCATTAATGGATAGATGTTATCATTtt
gi|20 : cggcttaaaacaaggAAATCT---AAACACT--TTTT----TT-T-----CATTGCATTGATTGATCAACTTTGTTATTCAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatgtattgtacctgtcacttaaataaataaaagatatatctatgaacagtc
gi|21 : AAATCCTGTATACACT--TTCT----TT-T-----CATTGCATTGATTGGTCAATTTTGTTATTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctatcactttaataaataaaatttatat
gi|19 : AAATCT---AAACACT--GGTT-TTTAT-T-----CATTGCATTGATTGAACAATTGTGTTGTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatatat
gi|14 : AATTT---AAACATT--TTTTTCTTTT-T-----CATTGCCTTGATGGGTAAA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtatctatcattttaataaataaattatatatat
gi|43 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctCT--TTTT--TTCT-T-----CATTGCATTGATGAATCAATGTTATAATTCAaatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|20 : TTTTAAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A----AAT-TTATAttttatgttgttcttgtt
gi|21 : aaatctaaacacttttttttcattgcattgattgatcaactttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A----TAT-ATATAt
gi|45 : aaatcctgtatacactttcttttcattgcattgattggtcaattttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTTAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A----TAT-ATATAt
gi|47 : TTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTTATAAAT------A---A----AAT-ATATAta
gi|19 : TTTTAAAATGTATTGTATCTATCATTTTAATAAAT------A---AATTATAT-ATATt
gi|27 : aaatctaaacactggtttttattcattgcattgattgaacaattgtgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A----TAT-ATATA
gi|50 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---T----TAT-ATATAtatgtgccattagacataaccaggcgatcattatgcagtatttgaaagacacacatatgccatggcatgtgccataatatcaatagcaaatattgcaaatattggaaaaataaatgaaaaactaaatgaaatgtgaagggttattaaagaacagtacaaacatatagcatttattaa
gi|54 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A----
gi|53 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A----
gi|49 : TTTAAAATGTATTGTACCCGTTACTTTAATAAAT------A---AAT--TAT-ATA
gi|46 : TTTAACATGTAATGTACCCGTCACTTTAATAAAT------A---A----TATGATATA
gi|7 : aTTAACATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAGAAAAAAA---A----TAT-ATATc
gi|2 : gaaaattaaaaacaaaatttccaaaatatttataaattagttatcagtatcacaaaaacaagtgcaagttatatgttagaatgaaccaaaacaaaattttaagattatgtattataagacagctcatgttcccttcccattgcaatcgagtttggtcgatatgttggtttggtttaccgagaaaccaaagattttgtaagcagtgtaatttaaatattgttgaagataaaatacatttcatattttgttgtcccatatgtaatgatttacatgaacatttgaatgcaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaatttaaacacttcttttctttttgtcattgcattgatggatatgttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTAACATGTATTGCACCTGTCACTGTAATAAAT------A---c
gi|39 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccattgcaatcgagttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTAACATGTGTTGTACCTGTCTCTTTGATATAT------ATTTA----TAC-ATATA
gi|5 : tgctgatgttgtaaaacAAAATGTATTGTACCAGTCACTTTAATAAAT------A---A----AAT-ATATAtat
gi|14 : gttttacggttttggaaaaaataatagcaatggatgatagacgattaacaaaaaaaatatttttatatgattatttaagatgaaaatatacttggacttccgatattaaatcaaaatttaaagaaatttaataccgggtcaataagaagttttcataacaccacatttatccaagatgtgcatactcttttactgtataattataaaactaaataaactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacataaaaacgaatgcaagttatatgtttaaatgaaccgtaacaaaaatataagatcgtgtattacacaactacgttccggtactcttcccattgcaatcgagttcggtcgttatattcgtttacctagagaccagagattgtgtaagcagtgtaatttaaataaagtcgaagataaaatacatttcatattttgttgccataaatttgatcatttacgtgaagatatgaatgcaaaaataattgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatctaaacatttgtttcattgcattgattgatcaattttgtaattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAAT------A---ta
gi|51 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAGT------A---A----TAT-ATATA
gi|18 : ATGTATTGTACCTGTCACTTAAATAAAT------A---A----AAG-ATATAtat
gi|37 : cggcttaaaacaaggcaaatttaaacacttttttgtcattgcattaatggatagatgttatcattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacATGTATTGTACCTGCCCCTTAAATAAAT------AG--A----TAtctatgaacagtc
gi|22 : taatacattcaacatttattaacgttcttgctaatgttgtaaatctgacGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAATA-----A---A----TAT-ATATA
17 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): TACTGATAATTATGTATTTGAAAGTGTGGTAAAACTCTATACCAATAAAAGAATGTATAAAAGTGATTTTTCAAGCTAAATAACAAAAAGCGGTTGGAATAGATTGTCTTCCAAACGACGCTTTTAAAAATGTGCATCAATTCAATTGTTAACATCAATATTTAATGAATGCTTTAAGTCGCATATTAAAACCAATATCGAAAAACTTAAAAATGATGGAAGAGTTCCAACAAATTATCATGGGATTAGTTTTATATCTATGGTATGTACATGTTATACAATACACATGTAGTAAGTTATTTAGAAACATATTATTTAATAGAAGATGAACAAAGTGGATTTTGACAACAAAAAAAGTTTTGGTTTTCATTAACAAAGATAATTGGAAATAAGTAAACACAGAATTTAAATACGTTTGCGCGCTTTGTTGATATGGCGAACGCTTTCGTGGTGTTAATAGAGATATTTTATATAGAAAGGCATATCGGGCAATATTTTTGAATCTCTTAAAAGATTGTATGATGAATGTAAAACCGCCATTGATGTAAATGGTAAATAACACAGATTTATTTAATATATGTAGAGGTGTAATGTAAAGGGGGTTATTTCCCCAACATTGTTTTCACTTTTATCAATGAATAGAAAATCTTGAAAAAGGAGTCACTTTAAACCCTGAATTTTCTGTCAGTTTATTGCTATTTGCGGATGATAGCGTTTAATAGCCTCATATTAAAAGCATTTACAGTGTATAAAATTAGCATATAAAATTAAAATAATAATAGCAAGACAAAAATGGTTAACTCCCAAAAGAAGAAAAACAATGTTACTGGATATACTTTCAGAAATGATGATTATTGTTGAAATCTGCCATAACTATAACTATCTCATGTATGGTTTTAAAATAATATCTAGATTTTTTTGAAACTGTTAGTGTTGTAACAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTCCTAGTTTTGTATAAAATGTGTTCAATAAAAGTTACTTAATGTTTTCTACGTAAAGTAAGTTTTATGATTCGAGAACATATAATGGACTATGCATCTTCCGTACGGGAATGCAAAAGTTATTCTAAACTGACACACTACATAGTTGTATTATCAAATTCTTTAAGATGTACAAATGTGCAACTACACCAGTAACTTAAGGTGATATTGAAGATTATTTAAGATGTAAAGTAATTGTTCT
Unaligned ( gi|11 ): TTAATGTATTAACAGTGTATGTTAGCAAACAAATGACAGTTAATACCAGAAAAACAAAAATTGTTCACTTTGGAAAAAATAAAAAAATGTTGCTGCATTTATTTTCAGAATTGGTGATACTATTATTGATATGTGCCATGACTATAGATATCTTGGTGTGGTTTTAAATGAATATCTAGATTTTACTGAAACTGTTAATGTTTTTAACAGAATCAGCCTGAAGAGTTTTTTTTATAGTCTTGTATCAAACGTGTTCAATAAAAATGACTTATTAAATGGATTCTACAAACAGTAAAATTTATGATGCGAGAATAGTACCTATAATGGACTATGCATCTGCGGTATGGGGATGCAAAAGCTATTCTAAAGCTGAGACACTACAGTCATAACTGACTGTTATCAAATTTACATCTACACCAGTTATTCAAGGTGATATGGGTTAAAAAAAACACAAATAAGACGTAAACTAAATGT
Unaligned ( gi|15 ): GAAAATGTACGAGTCAATTTAAAGCATGAACTTTCTGTCAGTGTGTTACTATTCGCTGATGATATAGTTTTAATAGCCCCAAAATGAAGAGCATTTACAGTGTATGATAGCAGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGAAAGACAAAATTTGTTCTGATCCGAAAGAAAAAAAATGTTACTACATTTATTTTCAGAATTTGTAATATTATCATTGAAATATGTCATTACTTAAAAGTCTTGTTGTGGTTTTAAATAGATATCAAGATTTTACTGAAACTGCTAATGTAATGTTTTATCAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTACTTATCTTGTATCAAGCTTGTTAAATAAA
Unaligned ( gi|30 ): ATAAAACATCTTCAAAAAGGAGTCAATTTAAACCGTGAGCTTTCTGAAGAGCATCTACAGGGTATGTTAGCATATCTAAATATGTGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGCAAGACAAAAATGTTCACTTCCAACGGAAGAAAAAAAAGGAACTGCATTTACAAACTTCAGTTTTAGTGCGAGTCTTATT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTATATCTTCGGTATGTAAACTTTATACAAAAGTTTAGTAAAATATGTTATAGAAGATAAACAAATTGGTTTTCGACAACAAAGGTCTTGTGAAGAAACATAGTCTCATAAACAACGATTATTAGAATTAGGAAAACACAGAAGTTAGATACATTTGCTTGCATTGTTTATATGGCGAGAGCTTTTG
Unaligned ( gi|33 ): TTTTGTTAAACAGAAAATATAATAAATGTTGGAAAATAGAAAATGAACATTAACAACGATAATAAGAACATGGAAAACACAAAATTATACATTTACGTGTTATGTTGATATTGCGAAAGCTTTTGATGATGTAAATTGAGA
Unaligned ( gi|34 ): TACCAATAATTATATATTTGAAAATATAGGTTATCCCAACTAATCTACATTCATAGAGGAATGTAGTTGGAATTGATTCTCTTCCAAATGAGTTTTTTAAAAATTGTTCATCAATCCAATTGTTAAAATCATTAT
Unaligned ( gi|35 ): AGTAACTTAATGTTTTCTACATACAGTAAAACTTATAATGCAAGAACATTGTCTATAATGGACTATGCATTTTCGGTATGGCGAGGCAAAATTTATTCTAAAACTGATGCACAACATAATCCTGT
Unaligned ( gi|36 ): ACCATTGAAACGGGATAAACAAGTAATTTTTCAAGCTAAATTACGAAAGGCAGTTAGAATCGATTGCCTACCAAACGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTCA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTTTTTGCTTTTGTCATTGCATTGATGGAAAGATGTTATATTTCATTTTATTTTGTTCTTGTTGTT
Unaligned ( gi|40 ): TTTGTGGTTTTCAAAAACCAATTGAGAGTTAATATCAGAAATACAAATATGGTTCAAATTCCAA
Unaligned ( gi|41 ): AAACACTTTTTTCTATTAGTCATTGCATTGATGAATAGATGTTATATTTCATTTTATTTTGTTT
Unaligned ( gi|42 ): GCAGTTGGAAGCGATTGCCTGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTC
Unaligned ( gi|44 ): AAATTTAAACATATTTTTATTCCTTTGGTCATTTCATTGATGGGTAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|52 ): ATACAACCTAGTCTATAATTTCCTATTTTATTACAAATAAAG
Unaligned ( gi|55 ): TGTCATTGTACTGATGGATAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|56 ): TATATATGTACATGAGATGACTACACATAAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111 1 222 2222222222222 111 11111 111111 3333333333333333333333 111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 1111
lowQualScore : 2 6 55 1 0 999 2222 66 0 1 2 000 1 4 4 4 888 3 0000000000000 1 3 3 5 000 1 4 3 0 8 5 1 3 1 55 4 3 0 55 00000 777 777 55 0 9999 222222 66 0 4 9999 1 2 2 2 3 666 7777 7777777777777777777777 000000 555 88888 1 55 2 2 2 999999999 444 33 2 2 0 0 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222 1 1 1 3333 333 1 8 66 777777 555 55 2
lowQualScore : . . .. . . ... .... .. . . . ... . . . . ... . ............. . . . . ... . . . . . . . . . .. . . . .. ..... ... ... .. . .... ...... .. . . .... . . . . . ... .... ...................... ...... ... ..... . .. . . . ......... ... .. . . . . ............................................................................................................. ...... . . . .... ... . . .. ...... ... .. .
lowQualScore : 5 7 77 4 3 111 1111 44 1 4 1 000 7 4 4 4 888 4 7777777777777 6 0 0 7 000 7 3 0 4 3 0 0 1 0 55 0 3 7 55 00000 000 000 44 7 4444 888888 11 1 4 4444 9 9 9 6 6 444 1111 8888888888888888888888 555555 888 33333 0 00 5 8 4 444444444 111 22 2 2 1 9 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888888 7 7 7 5555 000 0 9 44 888888 555 88 5
consensus : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAAA-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGA----GTT---GT----CG---G-----TAT------ATTGG---TTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG-----C-TTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT-T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATNGATNAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
Reference ( family-242 ) : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAAA-AAT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCNAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTAATCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGA----G-----GT----CG---G-----TAT------ATTGG---TTT-----ACCNAGA--GACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTCGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG-----C-NTNATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT-T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATNGATCAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
gi|1 : GATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCT
gi|10 : tactgataattatgtatttgaaagtgtggtaaaactctataccaataaaagaatgtataaaagtgatttttcaagctaaataacaaaaagcggttggaatagattgtcttccaaacgacgcttttaaaaatgtgcatcaattcaattgttaacatcaatatttaatgaatgctttaagtcgcatattaaaaccaatatcgaaaaacttaaaaatgatggaagagttccaacaaattatcatgggattagttttatatctatggtatgtacatgttatacaatacacatgtagtaagttatttagaaacatattatttaatagaagatgaacaaagtggattttgacaacaaaaaaagttttggttttcattaacaaagataattggaaataagtaaacacagaatttaaatacgtttgcgcgctttgttgatatggcgaacgctttcgtggtgttaatagagatattttatatagaaaggcatatcgggcaatatttttgaatctcttaaaagattgtatgatgaatgtaaaaccgccattgatgtaaatggtaaataacacagatttatttaatatatgtagaggtgtaatgtaaagggggttatttccccaacattgttttcacttttatcaatgaatagaaaatcttgaaaaaggagtcactttaaaccctgaattttctgtcagtttattgctatttgcggatgatagcgtttaatagcctcatattaaaagcatttacagtgtataaaattagcatataaaattaaaataataatagcaagacaaaaatggttaactcccaaaagaagaaaaacaatgttactggatatactttcagaaatgatgattattgttgaaatctgccataactataactatctcatgtatggttttaaaataatatctagatttttttgaaactgttagtgttgtaacagaatcagccagtagagcttttcctagttttgtataaaatgtgttcaataaaagttacttaatgttttctacgtaaagtaagttttatgattcgagaacatataatggactatgcatcttccgtacgggaatgcaaaagttattctaaactgacacactacatagttgtattatcaaattctttaagatgtacaaatgtgcaactacaccagtaacttaaggtgatattgaaACACCGCAAAGAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACAGTTT-GGAAAACGGAA---TTGCTATGGCTGATATGTGGACAGGTTA-CATACAT-ATT---TTCCTATAGTTTATTAAGGT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---AATGTTTAATCTACTTTTAAAATGATTGTCAAAGAACGTGACTTTAACTGCCTGTCAAT-AAGAGGTT---TTCACAACACAATAGTTATCCAAATTGTTCATAATCTTTTA-CAATACAATTATAAGACGCACTGGACATATGATATCA----T--CAAA-ATAATCTAATTGCTTAT--AAG-----A---ATA
gi|12 : aggtgacttaatgttttctatatgcagtgaaatttattttcgggaatggcactggcctataatggactatgcatcttcggtatgacggggatgcaaaagttgttctaaaattgacgcattacctaatggcatcttggcgtacatgcataaatgaatgtctttagcctatcagtaatttcaatggtgggacGC-AGTTCAATTTAA-TATTTTTGAAGATGAAAATGTATT---------TTA---TATTTT--GTTGTCCCAAATTTGACATTTTTACATGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATGNN---N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGTTAAACAC--T-C-TTT-T-T----------AT---TGCATTGATTGAT-AA--TTGTTATTaattaataacatatcataggcggatctaggattttcaatg
gi|13 : ATATATATTCCAACAACCATACGTTGATTTAATAT--AAT-----ATCCACGTCAAGATATATCAAATA----TGAGTGCGAGT------TATATA--TTAAAAT-AACCTTATCACAACTTAAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTC-GGTTCCCTTCCCA-TTGCTA---TCAA----GTTAG-GT----CG---G-----TAT------ATTGG---TTT-----GTCTAGA--GACCAAATATTTTGCAAGC-AGTGTAGTTTGAATATTGTTGAAAAGGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATATGATAATTT-ACGTGAACTTTTAAACG-CAAAAA---ATGA-------------TTAATTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAATTTAAACAC--T-TATTT-T-TC-TT----TTATAATTGCATTGATGGACAAATGTTATAATTttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgctttgaaccagtcactttaataaagaaataataataa
gi|14 : ataaC-AGTGTTATTTGAATATTGTTGAAGATGAAA-TTCATT---------TCA---GAT-----GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACATGAACATTTGAATG-TAAAAATTGATGAATTATG-----
gi|14 : AATTTAAACAT--T-T-TTT-TCTT-TT----TCAT---TGCCTTGATGGGTAAA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|14 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctAACATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAAT------A---aatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|16 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA----G-----GC----TG---A-----TAT------ATTGG---TTT-----ACCAA-A--GACCTAATATTTTGTAAGC-AGTGCAATTTGAATAATGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCATATTATTTT--GCTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGACCATTTGAACGTCAAAA--TGATAAATTATGTTNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC----------T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATGGATAAAT
gi|17 : ggtatgccaactgaaacggttttgacaatcatatattcattatggcagtatacatt---TTT-----ACCAAGA--GATCAAAGATTTTTTTTGC-AGTGTAATTTGAATATTGTTGAAAATGAAA-TATATT---------TCA---TGTTTT--GTTTTCACAAATTTTATAATTT-ACGTGAACATTTGAATG-CAAAAATTAGTAAGTT-------------ATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT-T-TC-TTTTTGTCAT---TGCATTGATGGATAGA---TGTTATg
gi|18 : ACAAGGCAAATTTAAACAC-------TT-T-TT-TG----TCAT---TGCATTAATGGATAGATGTTATCATTaat
gi|18 : cggcttaaaATGTATTGTACCTGTCACTTAAATAAAT------A---A--AAG-ATATAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatgtattgtacctgtcacttaaataaataaaagatatatctatgaacagtc
gi|19 : cggcttaaaacaaggcaaatttaaacacttttttgtcattgcattaatggatagatgttatcattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacAAATCTAAACAC--T-G-GTT-T-TT-AT----TCAT---TGCATTGATTGAACAATTGTGTTGTTCAtctatgaacagtc
gi|19 : TTTTAAAATGTATTGTATCTATCATTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtatctatcattttaataaataaattatatatat
gi|2 : aaatctaaacactggtttttattcattgcattgattgaacaattgtgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTAACGAATTTGGAAAAACATATA-TATATATGGACGATA----GA------AACAGGAAA-AATATGTTCATACAATTATTTAAGAT-AT-AAA-ATAATTGGTCTTTA---GATTATAAATCTATATTTAAAAAAAT-GATAAA-AAGGTGACATTAATGCCTTGTCTAT-ACAAAGTT---TACATAACGCCACATTTAT-----ATG--CGTCATCTACTA-TTATAACATTATAAGACAAAATAGACAAATTATATACATTTT--CAAA-AT----TA--TATATAA--AAA-----A---ATATTCT---AT-TTGAATA----TGAGTGCTAGT------TATATA--TTAAAACGAACCTTAACAAAAAATGAAGATCGTGT-AT----TACACAACTAGGCTCCGGTTTTCTTCCCA-TTGCAA---TCGA----G-----t
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttaTTGCAATCGAGT-TAACTTAAATATTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCTTATATTTGATCATTA-ACGCGAACATTTTCACG-CAAAAAATGATGAATTATGNN---N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--T-T-TGT-T-TC-TTGATGCCAT---TGCAGTGATGGATAGATTTTATAATTCAttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|20 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccaAAATCTAAACAC--T-T-TT-----T-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAACTTTGTTATTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|20 : TTTTAAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-TTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctatcactttaataaataaaatttatat
gi|21 : aaatctaaacacttttttttcattgcattgattgatcaactttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATACAC--T-T-TCT-T-TT--------CAT---TGCATTGATTGGTCAATTTTGTTATTCAt
gi|21 : aaatcctgTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatatat
gi|22 : aaatcctgtatacactttcttttcattgcattgattggtcaattttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T-TT-TG----TCAT---TGCATTGATGGATAGATGTTATTATTCAt
gi|22 : cGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAATA-----A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcaggtattgtacctgtcactttaataaataaatatatatatatgcccatttt
gi|23 : ctttttgtcattgcattgatggatagatgttattattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcag-AGTGTTATTTAAATGTTTTTGAATATGAAT-TATATT---------TTA---TATTGG--TTTGTCCTAAATTTGACAGTTG-ACGTGAAAATTTCAATT-CAAGAATtatgcccatttt
gi|23 : GCAAAATTAAACAC--T-T-GGT-T-TT--------CAT---TACATTGATAAATAAATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaaattaaacacttggttttcattacattgataaataaatgatt
gi|24 : agtgttatttaaatgtttttgaatatgaattatattttatattggtttgtcctaaatttgacagttgacgtgaaaatttcaattcaagaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGGTTTTGTAAGC-GGTGTAATTTGAATA---------------------------------------TTCC--GTTGTCCTAAATTTAATAATTC-ACGTGAACATTTGA-----AACAATTGATGAGTTATG-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--------T-T-TT-CC----TCAT---TACATTCGTTTAT-AATTgatt
gi|25 : AATATTGTTGAAAATAAAA-TACATT---------TCA---T-TTTT---TTGTCCCAAATTTTATAATTA-ACATGAACATTTGAACG-CAAAATTTGCTGAATTATG-----N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCA-----------AATT--AAGAT--T-A-TTT-T-TT-TG----TAAT---TGCTTTGATTGATAAATggtataattctt
gi|26 : AA---AC-TTCAGTT----TTAGTGCGAGT------CTTATT--TTAAAATGAACCTCAACAAAAACTTAAGATCGTGTCACGACGTACACAACTATGCTCTGGTACCCTTCCTA-TTGAAA---TCGA----A-----GC----CGCGCA-----TGT------GTTAGTATTTT-----ACCaatgataatt
gi|27 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAggccactattagcgggcagtattaagattgattgactgaccgggtatgattaacatactctacttcgttactaatacttttaaccacactaacatactg
gi|28 : AAACCCGGATATAAGA-TGTAAACCAAATGTTTTACGGTTTT--CAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAA-TGTTAGCCAAAAATGTT---TTCATATGATTATTTAACAT-GTCAAA-AACATTGGTCCTCA---GGTG--AAATtatgtgccattagacataaccaggcgatcattatgcagtatttgaaagacacacatatgccatggcatgtgccataatatcaatagcaaatattgcaaatattggaaaaataaatgaaaaactaaatgaaatgtgaagggttattaaagaacagtacaaacatatagcatttattaa
gi|29 : ttattttaggtgtacattattctacatccttaccagtaacacaaggcgatatgagtttggCCA-TTGCGA---TCGA----G-----TTAGGATG---G-----TAT------ATTGG---TTT-----ACCCAGACTGACCAGCGAGTATGTAAGC-AGTGTAATCTAAATAGTATTGAAGATGAAA-TACATTATTTTCATTTTA---TATTTT--GTGGTCGTTAATTTGACAATTG-ACATGAAAACGTAAACG-CAAAAATTAATGAATTGTaaagaatgtgatt
gi|3 : gatagcaattgtgagatgatCCCACACATAAGA-CGTAAAATAAAT-CTTTACGGTTTT-GAAAAAAAATAA-TAGCAATGGATAATA----GAC-GGTTAACAAAAAATATT---TTTATATGATTATTTAAGAT-GT-TAA-ATAATTGGTCTTCC---GGTGTTAAATCTATATTCAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCGAGATGTCCGTACTC-TTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGATTGCGGGT------AATATGTTTTTTAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AATACAACTACGTTCCGGTACCATTCCCA-TTGCAA---TCGA----G-----A-----CG---GCTCATTAT------ATTGG---TTC-----ACCTAGA--GGCCAGAGATTCTGTAAGC-AATGCAATTTAAATATTGTCGAAGATAAAA-TATATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCCAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG-----C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAATCTAAACAC------TTT-T-TT-AT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTGTTCAtatgtaatgtaa
gi|3 : agTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTGATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttgataaataatatatata
gi|32 : agcccacacataagacgtaaaataaatctttacggttttgaaaaaaaataatagcaatggataatagacggttaacaaaaaatatttttatatgattatttaagatgttaaataattggtcttccggtgttaaatctatattcaaagaaattgataaagaatgtgactttaattccttgtcaataagaagttttcataacaccacatttatccgagatgtccgtactctttactgcataattataaaacaaaatggactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacttgaatacgattgcgggtaatatgttttttaatgaaccttaacaaaaatttaagatcgtgtataatacaactacgttccggtaccattcccattgcaatcgagacggctcattatattggttcacctagaggccagagattctgtaagcaatgcaatttaaatattgtcgaagataaaatatatttcatattttgttgctccaaatttgatcatttacgtgaaaatttgaatgcaaaaatagttgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaaatctaaacacttttttattcattgcattgattgatcaattttgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA-CCACAAAATTATAAGACAAAAGTGAAAAATGATATAAATTCT--CAAA-ATAAGCTAAATATATAT--AAA-----A---CTATTAA---AT-TTGAAT
gi|37 : ATGTATTGTACCTGCCCCTTAAATAAAT------AG--A--TAtgctatgttctaccattaatataatatgtgtgatccttcggtatgcatgtacagtgtactatgatttggtacttcc
gi|39 : taatacattcaacatttattaacgttcttgctaatgttgtaaatctgacTAACATGTGTTGTACCTGTCTCTTTGATATAT------ATTTA--TAC-ATATA
gi|4 : tgctgatgttgtaaaacAACCCCACATATAAGA-CGAAAAATAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAAATAGCTATGGATGCTA----GAC-GGTTAA-AAAAAA-AAT---TTCATATGATTATTTAAGATCAA-AAA-ATGATTGGTCTTCC---GATGTTAAAACTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCTTTGTCAATTAAGAAGTT---TTCGTAACACCACATTTATCCAAGATGTGCGTACTCTTTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AACTCAACTACGTTCCAGTCCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGA----G-----GT----CG---T-----TAT------ATTGG---TTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTCTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTCGAAGATGAA---ACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCTAAATTTGACCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG-----C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCCAAACAC--T-T-TTTAT-TT-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAtat
gi|41 : aAAACAC--T-T-TTT-T-CTATTAG--TCAT---TGCATTGATGAATAGA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatata
gi|43 : -T-TTT-T-TT-CT----TCAT---TGCATTGATGAATCAATGTTATAATTCAatttcattttattttgttt
gi|45 : cTTTTTAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAttttatgttgttcttgtt
gi|46 : TTTAACATGTAATGTACCCGTCACTTTAATAAAT------A---A--TATGATATAta
gi|47 : aTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTTATAAAT------A---A--AAT-ATATAc
gi|48 : TTAATAATTT-ATGTGAACATTTGAACG-CAAAAATAGATGAATTt
gi|49 : TTTAAAATGTATTGTACCCGTTACTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATAtt
gi|5 : GTTTTACGGTTTTGGAAAAAATAA---TAGCAATGGATGATA----GAC-GATTAACAAAAAA-AATATTTTTATATGATTATTTAAGAT-GA-AAATATACTTGGACTTCC---GATATTAAATCAAAATTTAAAGAAATT-----------------TAATACCGGGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTGCATACTCTTTTA-CTGTATAATTATAAAACTAAATAAACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-ATAAAAA----CGAATGCAAGT------TATATG--TTTAAATGAACCGTAACAAAAATATAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGTTCCGGTACTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTTCG-----GT----CG---T-----TAT------ATTCG---TTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTGTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATAAAGTCGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCCATAAATTTGATCATTT-ACGTGAAGATATGAATG-CAAAAATAATTGAATTATG-----CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACA---------T-T-TG-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTAATTCA
gi|5 : AAAATGTATTGTACCAGTCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtattgtaccagtcactttaataaataaaatatatata
gi|50 : gttttacggttttggaaaaaataatagcaatggatgatagacgattaacaaaaaaaatatttttatatgattatttaagatgaaaatatacttggacttccgatattaaatcaaaatttaaagaaatttaataccgggtcaataagaagttttcataacaccacatttatccaagatgtgcatactcttttactgtataattataaaactaaataaactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacataaaaacgaatgcaagttatatgtttaaatgaaccgtaacaaaaatataagatcgtgtattacacaactacgttccggtactcttcccattgcaatcgagttcggtcgttatattcgtttacctagagaccagagattgtgtaagcagtgtaatttaaataaagtcgaagataaaatacatttcatattttgttgccataaatttgatcatttacgtgaagatatgaatgcaaaaataattgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatctaaacatttgtttcattgcattgattgatcaattttgtaattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---T--TAT-ATATAta
gi|51 : AAATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAGT------A---A--TAT-ATATA
gi|53 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--tat
gi|54 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--
gi|6 : AACCCCA-ATATAAAAGTGTAAACTAAATGCTTTA-------GG----------------TATGGATGATA----GAC-GGTTAACAGAAAT-AAC---TT-----GATTACTTAAAAT-GT-AAA-ATAATTTGTTTCCA---GATGGTGAATCTATATTTGAAGAAA---GTA-------TGACTTTAATGCCTTGTCTTT-AAGAACTT---TTGAAAACACCACAATTTTCCACGATGTA---AATTTATTAACTACAAATTTGTAAGACGAAATGGACTACTGATATACATTCA--CAAA-ATAAGTTAATTATATGTTAAAA-----A---ATATTGA---AT-CATAATAAGTTTGATTTCGAGTAATGTTTATATG--TTAGAATGAACCTAACCAACAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAATTACGCCCCGGTACCCTTCCCA-TTGCAT---CCGA----ATTAT-GC----CG---G-----TAT------ATTAG---TTT-----ATCAAGA--GATTCAAGATTTTGTTTGC-AGTGTCATTTGAATATTGTTGAATATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTTATTATCA-ACGAGAGCATTTGAGCG-CAAGAATTATTGAATT----------TTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGGCAAATTTATACA-------TTT-A-TT-TT----TCAT---TGCATGAATGGATTAA---TGTTAT
gi|7 : tacgctataatctgacattcattttttagttgcgatataaattgtttatgtatttacggtcgttacatttgatgaacattgacaacggtccttacattaattcacagtgatattggttgggAAATTTC--CAAA-ATA---T--TTATAAAT--TAGTTATCA---GTATCAC---A-----AAAA----CAAGTGCAAGT------TATATG--TTAGAATGAACCAAAACAAAATTTTAAGATTATGT-AT----TATAAGAC-A-GCTCATGTTCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGA----GTTTG-GT----CG---A-----TAT------GTTGG---TTTGGTTTACCGAGA--AACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCCATATGTAATGATTT-ACATGAACATTTGAATG-CAAAAATTGATGAATTATG-----N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAATTTAAACAC--T-T-CTT-T-TC-TTTTTGTCAT---TGCATTGATGGAT--ATGTTATAATTCAa
gi|7 : gaaaattaaaaacaTTAACATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAGAAAAAAA---A--TAT-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaacatgtattgtacctgtcactttaataaagaaaaaaaatatatatc
gi|8 : gaaaattaaaaacaaaatttccaaaatatttataaattagttatcagtatcacaaaaacaagtgcaagttatatgttagaatgaaccaaaacaaaattttaagattatgtattataagacagctcatgttcccttcccattgcaatcgagtttggtcgatatgttggtttggtttaccgagaaaccaaagattttgtaagcagtgtaatttaaatattgttgaagataaaatacatttcatattttgttgtcccatatgtaatgatttacatgaacatttgaatgcaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaatttaaacacttcttttctttttgtcattgcattgatggatatgttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTCACACTTGCAAGGTTTGA----GTTTAAGT----TG---G-----TGTTTATCTGTTGA---TAT-----ACCTAAG--GACCAGAGATTATGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTCTCGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTTTGGTTGCTCTAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAATATAGTTGAATTATG-----C-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACAC-------TT-T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAc
gi|9 : gatatgtaactgaaatctgaaagaATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCTTAAATTGATGTTAAATCTATATTTAA-----------AAGAAA--------------TTG---AT-AAGAAGGTGAAT--ATTATTCCTTGTCTAT--AAGAAGTTTACA---TTATA--TACAAAAGTATAAGACAAAGTGGACAAATGATATAAATTCG--CAAA-ATATGATAGTTATATGT--AAG-----A---ATATTAA---AC-TTGAATA----TGAGTGCGAGT------TATATG--TTATATTGAACCTTAACAAAAGTTCACAATCGTGT-AT----TTCACAAC-------------CCTTCCCA-TTGTAA---TCGA----GTTAG-GT----TG---G-----TAT------ATTGA---TTT-----ACTAAAA--GACCAAATATTTTTTAAGC-GGTGTAATTCAAAATTTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------CAA---TATTTT--ATTGTTCGAACTTATATAATTT-ACGTGAATATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG-----N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACA-----------AATTAAAACACGATGT-TTC-T-TT-TT----TCCT---TCCATTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttagtaaataatatata
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTAATGTATTAACAGTGTATGTTAGCAAACAAATGACAGTTAATACCAGAAAAACAAAAATTGTTCACTTTGGAAAAAATAAAAAAATGTTGCTGCATTTATTTTCAGAATTGGTGATACTATTATTGATATGTGCCATGACTATAGATATCTTGGTGTGGTTTTAAATGAATATCTAGATTTTACTGAAACTGTTAATGTTTTTAACAGAATCAGCCTGAAGAGTTTTTTTTATAGTCTTGTATCAAACGTGTTCAATAAAAATGACTTATTAAATGGATTCTACAAACAGTAAAATTTATGATGCGAGAATAGTACCTATAATGGACTATGCATCTGCGGTATGGGGATGCAAAAGCTATTCTAAAGCTGAGACACTACAGTCATAACTGACTGTTATCAAATTTACATCTACACCAGTTATTCAAGGTGATATGGGTTAAAAAAAACACAAATAAGACGTAAACTAAATGT
Unaligned ( gi|15 ): GAAAATGTACGAGTCAATTTAAAGCATGAACTTTCTGTCAGTGTGTTACTATTCGCTGATGATATAGTTTTAATAGCCCCAAAATGAAGAGCATTTACAGTGTATGATAGCAGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGAAAGACAAAATTTGTTCTGATCCGAAAGAAAAAAAATGTTACTACATTTATTTTCAGAATTTGTAATATTATCATTGAAATATGTCATTACTTAAAAGTCTTGTTGTGGTTTTAAATAGATATCAAGATTTTACTGAAACTGCTAATGTAATGTTTTATCAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTACTTATCTTGTATCAAGCTTGTTAAATAAA
Unaligned ( gi|30 ): ATAAAACATCTTCAAAAAGGAGTCAATTTAAACCGTGAGCTTTCTGAAGAGCATCTACAGGGTATGTTAGCATATCTAAATATGTGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGCAAGACAAAAATGTTCACTTCCAACGGAAGAAAAAAAAGGAACTGCATTTACAAACTTCAGTTTTAGTGCGAGTCTTATT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTATATCTTCGGTATGTAAACTTTATACAAAAGTTTAGTAAAATATGTTATAGAAGATAAACAAATTGGTTTTCGACAACAAAGGTCTTGTGAAGAAACATAGTCTCATAAACAACGATTATTAGAATTAGGAAAACACAGAAGTTAGATACATTTGCTTGCATTGTTTATATGGCGAGAGCTTTTG
Unaligned ( gi|33 ): TTTTGTTAAACAGAAAATATAATAAATGTTGGAAAATAGAAAATGAACATTAACAACGATAATAAGAACATGGAAAACACAAAATTATACATTTACGTGTTATGTTGATATTGCGAAAGCTTTTGATGATGTAAATTGAGA
Unaligned ( gi|34 ): TACCAATAATTATATATTTGAAAATATAGGTTATCCCAACTAATCTACATTCATAGAGGAATGTAGTTGGAATTGATTCTCTTCCAAATGAGTTTTTTAAAAATTGTTCATCAATCCAATTGTTAAAATCATTAT
Unaligned ( gi|35 ): AGTAACTTAATGTTTTCTACATACAGTAAAACTTATAATGCAAGAACATTGTCTATAATGGACTATGCATTTTCGGTATGGCGAGGCAAAATTTATTCTAAAACTGATGCACAACATAATCCTGT
Unaligned ( gi|36 ): ACCATTGAAACGGGATAAACAAGTAATTTTTCAAGCTAAATTACGAAAGGCAGTTAGAATCGATTGCCTACCAAACGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTCA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTTTTTGCTTTTGTCATTGCATTGATGGAAAGATGTTATATTTCATTTTATTTTGTTCTTGTTGTT
Unaligned ( gi|40 ): TTTGTGGTTTTCAAAAACCAATTGAGAGTTAATATCAGAAATACAAATATGGTTCAAATTCCAA
Unaligned ( gi|42 ): GCAGTTGGAAGCGATTGCCTGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTC
Unaligned ( gi|44 ): AAATTTAAACATATTTTTATTCCTTTGGTCATTTCATTGATGGGTAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|52 ): ATACAACCTAGTCTATAATTTCCTATTTTATTACAAATAAAG
Unaligned ( gi|55 ): TGTCATTGTACTGATGGATAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|56 ): TATATATGTACATGAGATGACTACACATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111 111 222 2222222222222 111 11111 111111 444 111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 1111
lowQualScore : 2 6 55 1 0 999 2222 66 0 111 1 000 4 4 4 888 3 0000000000000 1 3 1 5 000 1 4 3 0 6 5 1 3 1 55 4 3 0 55 00000 777 777 55 0 9999 222222 66 0 4 9999 1 2 2 2 3 666 000 66 0 111111 99999 1 55 2 2 999999999 444 33 2 2 0 0 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222 1 1 1 3333 333 1 2 77 777777 555 55 2
lowQualScore : . . .. . . ... .... .. . ... . ... . . . ... . ............. . . . . ... . . . . . . . . . .. . . . .. ..... ... ... .. . .... ...... .. . . .... . . . . . ... ... .. . ...... ..... . .. . . ......... ... .. . . . . ............................................................................................................... ...... . . . .... ... . . .. ...... ... .. .
lowQualScore : 5 7 77 4 3 111 1111 44 1 999 0 000 4 4 4 888 4 7777777777777 6 0 9 7 000 7 3 0 4 6 0 0 1 0 55 0 3 7 55 00000 000 000 44 7 4444 888888 11 1 4 4444 9 9 9 6 6 444 000 11 7 555555 11111 0 00 5 4 444444444 111 22 2 2 1 9 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888888 7 7 7 5555 000 0 8 77 444444 222 88 5
consensus : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTTAG-G--TCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT-T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATNGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
Reference ( family-242 ) : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT---G--TCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT-T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATNGATNAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
gi|1 : GATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCT
gi|10 : tactgataattatgtatttgaaagtgtggtaaaactctataccaataaaagaatgtataaaagtgatttttcaagctaaataacaaaaagcggttggaatagattgtcttccaaacgacgcttttaaaaatgtgcatcaattcaattgttaacatcaatatttaatgaatgctttaagtcgcatattaaaaccaatatcgaaaaacttaaaaatgatggaagagttccaacaaattatcatgggattagttttatatctatggtatgtacatgttatacaatacacatgtagtaagttatttagaaacatattatttaatagaagatgaacaaagtggattttgacaacaaaaaaagttttggttttcattaacaaagataattggaaataagtaaacacagaatttaaatacgtttgcgcgctttgttgatatggcgaacgctttcgtggtgttaatagagatattttatatagaaaggcatatcgggcaatatttttgaatctcttaaaagattgtatgatgaatgtaaaaccgccattgatgtaaatggtaaataacacagatttatttaatatatgtagaggtgtaatgtaaagggggttatttccccaacattgttttcacttttatcaatgaatagaaaatcttgaaaaaggagtcactttaaaccctgaattttctgtcagtttattgctatttgcggatgatagcgtttaatagcctcatattaaaagcatttacagtgtataaaattagcatataaaattaaaataataatagcaagacaaaaatggttaactcccaaaagaagaaaaacaatgttactggatatactttcagaaatgatgattattgttgaaatctgccataactataactatctcatgtatggttttaaaataatatctagatttttttgaaactgttagtgttgtaacagaatcagccagtagagcttttcctagttttgtataaaatgtgttcaataaaagttacttaatgttttctacgtaaagtaagttttatgattcgagaacatataatggactatgcatcttccgtacgggaatgcaaaagttattctaaactgacacactacatagttgtattatcaaattctttaagatgtacaaatgtgcaactacaccagtaacttaaggtgatattgaaACACCGCAAAGAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACAGTTT-GGAAAACGGAA---TTGCTATGGCTGATATGTGGACAGGTTA-CATACA-T-ATT---TTCCTATAGTTTATTAAGGT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---AATGTTTAATCTACTTTTAAAATGATTGTCAAAGAACGTGACTTTAACTGCCTGTCAAT-AAGAGGTT---TTCACAACACAATAGTTATCCAAATTGTTCATAATCTTTTA-CAATACAATTATAAGACGCACTGGACATATGATATCA----T--CAAA-ATAATCTAATTGCTTAT--AAG-----A---ATA
gi|12 : aggtgacttaatgttttctatatgcagtgaaatttattttcgggaatggcactggcctataatggactatgcatcttcggtatgacggggatgcaaaagttgttctaaaattgacgcattacctaatggcatcttggcgtacatgcataaatgaatgtctttagcctatcagtaatttcaatggtgggacGC-AGTTCAATTTAA-TATTTTTGAAGATGAAAATGTATT---------TTA---TATTTT--GTTGTCCCAAATTTGACATTTTTACATGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGTTAAACAC--T-C-TTT-T-T----------AT---TGCATTGATTGATAA---TTGTTATTaattaataacatatcataggcggatctaggattttcaatg
gi|13 : ATATATATTCCAACAACCATACGTTGATTTAATAT--AAT-----ATCCACGTCAAGATATATCAAATA----TGAGTGCGAGT------TATATA--TTAAAAT-AACCTTATCACAACTTAAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTC-GGTTCCCTTCCCA-TTGCTA---TCAAGTTAG-G--TCGGTAT------ATTGGTTT-----GTCTAGA--GACCAAATATTTTGCAAGC-AGTGTAGTTTGAATATTGTTGAAAAGGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATATGATAATTT-ACGTGAACTTTTAAACG-CAAAAA---ATGA----------T-----TAATTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAATTTAAACAC--T-TATTT-T-TC-TT----TTATAATTGCATTGATGGACAAATGTTATAATTttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgctttgaaccagtcactttaataaagaaataataataa
gi|14 : ataaC-AGTGTTATTTGAATATTGTTGAAGATGAAA-TTCATT---------TCA---GAT-----GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACATGAACATTTGAATG-TAAAAATTGATGAATTATG--
gi|14 : AATTTAAACAT--T-T-TTT-TCTT-TT----TCAT---TGCCTTGATGGGTAAA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|14 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctAACATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAAT------A---aatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|16 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATAT------ATTGGTTT-----ACCAA-A--GACCTAATATTTTGTAAGC-AGTGCAATTTGAATAATGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCATATTATTTT--GCTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGACCATTTGAACGTCAAAA--TGATAAATTATG--T-TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC----------T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATGGATAAAT
gi|17 : ggtatgccaactgaaacggttttgacaatcatatattcattatggcagtatacattaggctTTT-----ACCAAGA--GATCAAAGATTTTTTTTGC-AGTGTAATTTGAATATTGTTGAAAATGAAA-TATATT---------TCA---TGTTTT--GTTTTCACAAATTTTATAATTT-ACGTGAACATTTGAATG-CAAAAATTAGTAAGTTA---------------TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT-T-TC-TTTTTGTCAT---TGCATTGATGGATAGA---TGTTATg
gi|18 : ACAAGGCAAATTTAAACAC-------TT-T-TT-TG----TCAT---TGCATTAATGGATAGATGTTATCATTaat
gi|18 : cggcttaaaATGTATTGTACCTGTCACTTAAATAAAT------A---A--AAG-ATATAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatgtattgtacctgtcacttaaataaataaaagatatatctatgaacagtc
gi|19 : cggcttaaaacaaggcaaatttaaacacttttttgtcattgcattaatggatagatgttatcattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacAAATCTAAACAC--T-G-GTT-T-TT-AT----TCAT---TGCATTGATTGAACAATTGTGTTGTTCAtctatgaacagtc
gi|19 : TTTTAAAATGTATTGTATCTATCATTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtatctatcattttaataaataaattatatatat
gi|2 : aaatctaaacactggtttttattcattgcattgattgaacaattgtgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTAACGAATTTGGAAAAACATATA-TATATATGGACGATA----GA------AACAGGAA-A-AATATGTTCATACAATTATTTAAGAT-AT-AAA-ATAATTGGTCTTTA---GATTATAAATCTATATTTAAAAAAAT-GATAAA-AAGGTGACATTAATGCCTTGTCTAT-ACAAAGTT---TACATAACGCCACATTTAT-----ATG--CGTCATCTACTA-TTATAACATTATAAGACAAAATAGACAAATTATATACATTTT--CAAA-AT----TA--TATATAA--AAA-----A---ATATTCT---AT-TTGAATA----TGAGTGCTAGT------TATATA--TTAAAACGAACCTTAACAAAAAATGAAGATCGTGT-AT----TACACAACTAGGCTCCGGTTTTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT---t
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttaTTGCAATCGAGT-TAACTTAAATATTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCTTATATTTGATCATTA-ACGCGAACATTTTCACG-CAAAAAATGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--T-T-TGT-T-TC-TTGATGCCAT---TGCAGTGATGGATAGATTTTATAATTCAaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccaTAACATGTATTGCACCTGTCACTGTAATAAAT------A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|20 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccattgcaatcgagttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAAATCTAAACAC--T-T-TT-----T-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAACTTTGTTATTCA
gi|20 : TTTTAAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-TTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctatcactttaataaataaaatttatat
gi|21 : aaatctaaacacttttttttcattgcattgattgatcaactttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATACAC--T-T-TCT-T-TT--------CAT---TGCATTGATTGGTCAATTTTGTTATTCAt
gi|21 : aaatcctgTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatatat
gi|22 : aaatcctgtatacactttcttttcattgcattgattggtcaattttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T-TT-TG----TCAT---TGCATTGATGGATAGATGTTATTATTCAt
gi|22 : cGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAATA-----A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcaggtattgtacctgtcactttaataaataaatatatatatatgcccatttt
gi|23 : ctttttgtcattgcattgatggatagatgttattattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcag-AGTGTTATTTAAATGTTTTTGAATATGAAT-TATATT---------TTA---TATTGG--TTTGTCCTAAATTTGACAGTTG-ACGTGAAAATTTCAATT-CAAGAATtatgcccatttt
gi|23 : GCAAAATTAAACAC--T-T-GGT-T-TT--------CAT---TACATTGATAAATAAATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaaattaaacacttggttttcattacattgataaataaatgatt
gi|24 : agtgttatttaaatgtttttgaatatgaattatattttatattggtttgtcctaaatttgacagttgacgtgaaaatttcaattcaagaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGGTTTTGTAAGC-GGTGTAATTTGAATA---------------------------------------TTCC--GTTGTCCTAAATTTAATAATTC-ACGTGAACATTTGA-----AACAATTGATGAGTTATG-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--------T-T-TT-CC----TCAT---TACATTCGTTTATAA---TTGGTATgatt
gi|25 : AATATTGTTGAAAATAAAA-TACATT---------TCA---T-TTTT---TTGTCCCAAATTTTATAATTA-ACATGAACATTTGAACG-CAAAATTTGCTGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCA-----------AATT--AAGAT--T-A-TTT-T-TT-TG----TAAT---TGCTTTGATTGATAAATaattctt
gi|26 : AA---AC-TTCAGTT----TTAGTGCGAGT------CTTATT--TTAAAATGAACCTCAACAAAAACTTAAGATCGTGTCACGACGTACACAACTATGCTCTGGTACCCTTCCTA-TTGAAA---TCGAaatgataatt
gi|27 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAagccgcgcatgtgttagtattttaccggccactattagcgggcagtattaagattgattgactgaccgggtatgattaacatactctacttcgttactaatacttttaaccacactaacatactg
gi|28 : AAACCCGGATATAAGA-TGTAAACCAAATGTTTTACGGTTTT--CAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAA-TGTTAGCCAAAA-ATGTT---TTCATATGATTATTTAACAT-GTCAAA-AACATTGGTCCTCA---GGTG--AAATtatgtgccattagacataaccaggcgatcattatgcagtatttgaaagacacacatatgccatggcatgtgccataatatcaatagcaaatattgcaaatattggaaaaataaatgaaaaactaaatgaaatgtgaagggttattaaagaacagtacaaacatatagcatttattaa
gi|29 : ttattttaggtgtacattattctacatccttaccagtaacacaaggcgatatgagtttggCCA-TTGCGA---TCGAGTTAG-G--ATGGTAT------ATTGGTTT-----ACCCAGACTGACCAGCGAGTATGTAAGC-AGTGTAATCTAAATAGTATTGAAGATGAAA-TACATTATTTTCATTTTA---TATTTT--GTGGTCGTTAATTTGACAATTG-ACATGAAAACGTAAACG-CAAAAATTAATGAATTGTaaagaatgtgatt
gi|3 : gatagcaattgtgagatgatCCCACACATAAGA-CGTAAAATAAAT-CTTTACGGTTTT-GAAAAAAAATAA-TAGCAATGGATAATA----GAC-GGTTAACAAAAA-ATATT---TTTATATGATTATTTAAGAT-GT-TAA-ATAATTGGTCTTCC---GGTGTTAAATCTATATTCAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCGAGATGTCCGTACTC-TTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGATTGCGGGT------AATATGTTTTTTAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AATACAACTACGTTCCGGTACCATTCCCA-TTGCAA---TCGAGAC---GGCTCATTAT------ATTGGTTC-----ACCTAGA--GGCCAGAGATTCTGTAAGC-AATGCAATTTAAATATTGTCGAAGATAAAA-TATATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCCAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAATCTAAACAC------TTT-T-TT-AT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTGTTCAtatgtaatgtaa
gi|3 : agTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTGATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttgataaataatatatata
gi|32 : agcccacacataagacgtaaaataaatctttacggttttgaaaaaaaataatagcaatggataatagacggttaacaaaaaatatttttatatgattatttaagatgttaaataattggtcttccggtgttaaatctatattcaaagaaattgataaagaatgtgactttaattccttgtcaataagaagttttcataacaccacatttatccgagatgtccgtactctttactgcataattataaaacaaaatggactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacttgaatacgattgcgggtaatatgttttttaatgaaccttaacaaaaatttaagatcgtgtataatacaactacgttccggtaccattcccattgcaatcgagacggctcattatattggttcacctagaggccagagattctgtaagcaatgcaatttaaatattgtcgaagataaaatatatttcatattttgttgctccaaatttgatcatttacgtgaaaatttgaatgcaaaaatagttgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaaatctaaacacttttttattcattgcattgattgatcaattttgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA-CCACAAAATTATAAGACAAAAGTGAAAAATGATATAAATTCT--CAAA-ATAAGCTAAATATATAT--AAA-----A---CTATTAA---AT-TTGAAT
gi|37 : ATGTATTGTACCTGCCCCTTAAATAAAT------AG--A--TAtgctatgttctaccattaatataatatgtgtgatccttcggtatgcatgtacagtgtactatgatttggtacttcc
gi|39 : taatacattcaacatttattaacgttcttgctaatgttgtaaatctgacTAACATGTGTTGTACCTGTCTCTTTGATATAT------ATTTA--TAC-ATATA
gi|4 : tgctgatgttgtaaaacAACCCCACATATAAGA-CGAAAAATAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAAATAGCTATGGATGCTA----GAC-GGTTAA-AAAAA-A-AAT---TTCATATGATTATTTAAGATCAA-AAA-ATGATTGGTCTTCC---GATGTTAAAACTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCTTTGTCAATTAAGAAGTT---TTCGTAACACCACATTTATCCAAGATGTGCGTACTCTTTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATG--TTAAAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AACTCAACTACGTTCCAGTCCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAG-----G--TCGTTAT------ATTGGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTCTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTCGAAGATGAA---ACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCTAAATTTGACCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCCAAACAC--T-T-TTTAT-TT-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAtat
gi|41 : aAAACAC--T-T-TTT-T-CTATTAG--TCAT---TGCATTGATGAATAGA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatata
gi|43 : -T-TTT-T-TT-CT----TCAT---TGCATTGATGAATCAATGTTATAATTCAatttcattttattttgttt
gi|45 : cTTTTTAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAttttatgttgttcttgtt
gi|46 : TTTAACATGTAATGTACCCGTCACTTTAATAAAT------A---A--TATGATATAta
gi|47 : aTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTTATAAAT------A---A--AAT-ATATAc
gi|48 : TTAATAATTT-ATGTGAACATTTGAACG-CAAAAATAGATGAATTt
gi|49 : TTTAAAATGTATTGTACCCGTTACTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATAtt
gi|5 : GTTTTACGGTTTTGGAAAAAATAA---TAGCAATGGATGATA----GAC-GATTAACAAAAA-A-AATATTTTTATATGATTATTTAAGAT-GA-AAATATACTTGGACTTCC---GATATTAAATCAAAATTTAAAGAAATT-----------------TAATACCGGGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTGCATACTCTTTTA-CTGTATAATTATAAAACTAAATAAACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-ATAAAAA----CGAATGCAAGT------TATATG--TTTAAATGAACCGTAACAAAAATATAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGTTCCGGTACTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTTCG-G--TCGTTAT------ATTCGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTGTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATAAAGTCGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCCATAAATTTGATCATTT-ACGTGAAGATATGAATG-CAAAAATAATTGAATTATG--CNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACA---------T-T-TG-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTAATTCA
gi|5 : AAAATGTATTGTACCAGTCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtattgtaccagtcactttaataaataaaatatatata
gi|50 : gttttacggttttggaaaaaataatagcaatggatgatagacgattaacaaaaaaaatatttttatatgattatttaagatgaaaatatacttggacttccgatattaaatcaaaatttaaagaaatttaataccgggtcaataagaagttttcataacaccacatttatccaagatgtgcatactcttttactgtataattataaaactaaataaactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacataaaaacgaatgcaagttatatgtttaaatgaaccgtaacaaaaatataagatcgtgtattacacaactacgttccggtactcttcccattgcaatcgagttcggtcgttatattcgtttacctagagaccagagattgtgtaagcagtgtaatttaaataaagtcgaagataaaatacatttcatattttgttgccataaatttgatcatttacgtgaagatatgaatgcaaaaataattgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatctaaacatttgtttcattgcattgattgatcaattttgtaattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---T--TAT-ATATAta
gi|51 : AAATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAGT------A---A--TAT-ATATA
gi|53 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--tat
gi|54 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--
gi|6 : AACCCCA-ATATAAAAGTGTAAACTAAATGCTTTA-------GG----------------TATGGATGATA----GAC-GGTTAACAGAAATA-ACT---T------GATTACTTAAAAT-GT-AAA-ATAATTTGTTTCCA---GATGGTGAATCTATATTTGAAGAAA---GTA-------TGACTTTAATGCCTTGTCTTT-AAGAACTT---TTGAAAACACCACAATTTTCCACGATGTA---AATTTATTAACTACAAATTTGTAAGACGAAATGGACTACTGATATACATTCA--CAAA-ATAAGTTAATTATATGTTAAAA-----A---ATATTGA---AT-CATAATAAGTTTGATTTCGAGTAATGTTTATATG--TTAGAATGAACCTAACCAACAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAATTACGCCCCGGTACCCTTCCCA-TTGCAT---CCGAATTAT-G--CCGGTAT------ATTAGTTT-----ATCAAGA--GATTCAAGATTTTGTTTGC-AGTGTCATTTGAATATTGTTGAATATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTTATTATCA-ACGAGAGCATTTGAGCG-CAAGAATTATTGAATT-------T-----TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGGCAAATTTATACA-------TTT-A-TT-TT----TCAT---TGCATGAATGGATTAA---TGTTAT
gi|7 : tacgctataatctgacattcattttttagttgcgatataaattgtttatgtatttacggtcgttacatttgatgaacattgacaacggtccttacattaattcacagtgatattggttgggAAATTTC--CAAA-ATA---T--TTATAAAT--TAGTTATCA---GTATCAC---A-----AAAA----CAAGTGCAAGT------TATATG--TTAGAATGAACCAAAACAAAATTTTAAGATTATGT-AT----TATAAGAC-A-GCTCATGTTCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTTTG-G--TCGATAT------GTTGGTTTGGTTTACCGAGA--AACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCCATATGTAATGATTT-ACATGAACATTTGAATG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAATTTAAACAC--T-T-CTT-T-TC-TTTTTGTCAT---TGCATTGATGGAT--ATGTTATAATTCAa
gi|7 : gaaaattaaaaacaTTAACATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAGAAAAAAA---A--TAT-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaacatgtattgtacctgtcactttaataaagaaaaaaaatatatatc
gi|8 : gaaaattaaaaacaaaatttccaaaatatttataaattagttatcagtatcacaaaaacaagtgcaagttatatgttagaatgaaccaaaacaaaattttaagattatgtattataagacagctcatgttcccttcccattgcaatcgagtttggtcgatatgttggtttggtttaccgagaaaccaaagattttgtaagcagtgtaatttaaatattgttgaagataaaatacatttcatattttgttgtcccatatgtaatgatttacatgaacatttgaatgcaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaatttaaacacttcttttctttttgtcattgcattgatggatatgttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTCACACTTGCAAGGTTTGAGTTTAAG--TTGGTGTTTATCTGTTGATAT-----ACCTAAG--GACCAGAGATTATGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTCTCGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTTTGGTTGCTCTAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAATATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACAC-------TT-T-TT-TT----TCAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAc
gi|9 : gatatgtaactgaaatctgaaagaATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCTTAAATTGATGTTAAATCTATATTTAA-----------AAGAAA--------------TTG---AT-AAGAAGGTGAAT--ATTATTCCTTGTCTAT--AAGAAGTTTACA---TTATA--TACAAAAGTATAAGACAAAGTGGACAAATGATATAAATTCG--CAAA-ATATGATAGTTATATGT--AAG-----A---ATATTAA---AC-TTGAATA----TGAGTGCGAGT------TATATG--TTATATTGAACCTTAACAAAAGTTCACAATCGTGT-AT----TTCACAAC-------------CCTTCCCA-TTGTAA---TCGAGTTAG-G--TTGGTAT------ATTGATTT-----ACTAAAA--GACCAAATATTTTTTAAGC-GGTGTAATTCAAAATTTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------CAA---TATTTT--ATTGTTCGAACTTATATAATTT-ACGTGAATATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACA-----------AATTAAAACACGATGT-TTC-T-TT-TT----TCCT---TCCATTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttagtaaataatatata
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTAATGTATTAACAGTGTATGTTAGCAAACAAATGACAGTTAATACCAGAAAAACAAAAATTGTTCACTTTGGAAAAAATAAAAAAATGTTGCTGCATTTATTTTCAGAATTGGTGATACTATTATTGATATGTGCCATGACTATAGATATCTTGGTGTGGTTTTAAATGAATATCTAGATTTTACTGAAACTGTTAATGTTTTTAACAGAATCAGCCTGAAGAGTTTTTTTTATAGTCTTGTATCAAACGTGTTCAATAAAAATGACTTATTAAATGGATTCTACAAACAGTAAAATTTATGATGCGAGAATAGTACCTATAATGGACTATGCATCTGCGGTATGGGGATGCAAAAGCTATTCTAAAGCTGAGACACTACAGTCATAACTGACTGTTATCAAATTTACATCTACACCAGTTATTCAAGGTGATATGGGTTAAAAAAAACACAAATAAGACGTAAACTAAATGT
Unaligned ( gi|15 ): GAAAATGTACGAGTCAATTTAAAGCATGAACTTTCTGTCAGTGTGTTACTATTCGCTGATGATATAGTTTTAATAGCCCCAAAATGAAGAGCATTTACAGTGTATGATAGCAGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGAAAGACAAAATTTGTTCTGATCCGAAAGAAAAAAAATGTTACTACATTTATTTTCAGAATTTGTAATATTATCATTGAAATATGTCATTACTTAAAAGTCTTGTTGTGGTTTTAAATAGATATCAAGATTTTACTGAAACTGCTAATGTAATGTTTTATCAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTACTTATCTTGTATCAAGCTTGTTAAATAAA
Unaligned ( gi|30 ): ATAAAACATCTTCAAAAAGGAGTCAATTTAAACCGTGAGCTTTCTGAAGAGCATCTACAGGGTATGTTAGCATATCTAAATATGTGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGCAAGACAAAAATGTTCACTTCCAACGGAAGAAAAAAAAGGAACTGCATTTACAAACTTCAGTTTTAGTGCGAGTCTTATT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTATATCTTCGGTATGTAAACTTTATACAAAAGTTTAGTAAAATATGTTATAGAAGATAAACAAATTGGTTTTCGACAACAAAGGTCTTGTGAAGAAACATAGTCTCATAAACAACGATTATTAGAATTAGGAAAACACAGAAGTTAGATACATTTGCTTGCATTGTTTATATGGCGAGAGCTTTTG
Unaligned ( gi|33 ): TTTTGTTAAACAGAAAATATAATAAATGTTGGAAAATAGAAAATGAACATTAACAACGATAATAAGAACATGGAAAACACAAAATTATACATTTACGTGTTATGTTGATATTGCGAAAGCTTTTGATGATGTAAATTGAGA
Unaligned ( gi|34 ): TACCAATAATTATATATTTGAAAATATAGGTTATCCCAACTAATCTACATTCATAGAGGAATGTAGTTGGAATTGATTCTCTTCCAAATGAGTTTTTTAAAAATTGTTCATCAATCCAATTGTTAAAATCATTAT
Unaligned ( gi|35 ): AGTAACTTAATGTTTTCTACATACAGTAAAACTTATAATGCAAGAACATTGTCTATAATGGACTATGCATTTTCGGTATGGCGAGGCAAAATTTATTCTAAAACTGATGCACAACATAATCCTGT
Unaligned ( gi|36 ): ACCATTGAAACGGGATAAACAAGTAATTTTTCAAGCTAAATTACGAAAGGCAGTTAGAATCGATTGCCTACCAAACGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTCA
Unaligned ( gi|38 ): ACCTTTTTGCTTTTGTCATTGCATTGATGGAAAGATGTTATATTTCATTTTATTTTGTTCTTGTTGTT
Unaligned ( gi|40 ): TTTGTGGTTTTCAAAAACCAATTGAGAGTTAATATCAGAAATACAAATATGGTTCAAATTCCAA
Unaligned ( gi|42 ): GCAGTTGGAAGCGATTGCCTGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTC
Unaligned ( gi|44 ): AAATTTAAACATATTTTTATTCCTTTGGTCATTTCATTGATGGGTAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|52 ): ATACAACCTAGTCTATAATTTCCTATTTTATTACAAATAAAG
Unaligned ( gi|55 ): TGTCATTGTACTGATGGATAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|56 ): TATATATGTACATGAGATGACTACACATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111 111 222 2222222222222 111 11111 111111 111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 2 6 1 22 0 999 2222 66 0 111 1 000 4 4 4 888 3 0000000000000 1 3 1 5 000 1 4 3 0 6 5 1 3 1 55 4 3 0 55 00000 777 777 55 0 9999 222222 666 4 9999 2 2 2 3 666 3 0 111111 99999 1 55 2 2 999999999 444 33 2 2 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 44 1 1111111 3333 222 1 2 99 777777 555 55 2
lowQualScore : . . . .. . ... .... .. . ... . ... . . . ... . ............. . . . . ... . . . . . . . . . .. . . . .. ..... ... ... .. . .... ...... ... . .... . . . . ... . . ...... ..... . .. . . ......... ... .. . . . . ............................................................................................................... ...... .. . ....... .... ... . . .. ...... ... .. .
lowQualScore : 5 7 4 11 3 111 1111 44 1 999 0 000 4 4 4 888 4 7777777777777 6 0 9 7 000 7 3 0 4 6 0 0 1 0 55 0 3 7 55 00000 000 000 44 7 4444 888888 222 4 4444 9 9 6 6 444 6 7 555555 11111 0 00 5 4 444444444 111 22 2 2 1 9 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222 00 7 2222222 5555 999 0 6 88 444444 222 88 5
consensus : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
Reference ( family-242 ) : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATNGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
gi|1 : GATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCT
gi|10 : tactgataattatgtatttgaaagtgtggtaaaactctataccaataaaagaatgtataaaagtgatttttcaagctaaataacaaaaagcggttggaatagattgtcttccaaacgacgcttttaaaaatgtgcatcaattcaattgttaacatcaatatttaatgaatgctttaagtcgcatattaaaaccaatatcgaaaaacttaaaaatgatggaagagttccaacaaattatcatgggattagttttatatctatggtatgtacatgttatacaatacacatgtagtaagttatttagaaacatattatttaatagaagatgaacaaagtggattttgacaacaaaaaaagttttggttttcattaacaaagataattggaaataagtaaacacagaatttaaatacgtttgcgcgctttgttgatatggcgaacgctttcgtggtgttaatagagatattttatatagaaaggcatatcgggcaatatttttgaatctcttaaaagattgtatgatgaatgtaaaaccgccattgatgtaaatggtaaataacacagatttatttaatatatgtagaggtgtaatgtaaagggggttatttccccaacattgttttcacttttatcaatgaatagaaaatcttgaaaaaggagtcactttaaaccctgaattttctgtcagtttattgctatttgcggatgatagcgtttaatagcctcatattaaaagcatttacagtgtataaaattagcatataaaattaaaataataatagcaagacaaaaatggttaactcccaaaagaagaaaaacaatgttactggatatactttcagaaatgatgattattgttgaaatctgccataactataactatctcatgtatggttttaaaataatatctagatttttttgaaactgttagtgttgtaacagaatcagccagtagagcttttcctagttttgtataaaatgtgttcaataaaagttacttaatgttttctacgtaaagtaagttttatgattcgagaacatataatggactatgcatcttccgtacgggaatgcaaaagttattctaaactgacacactacatagttgtattatcaaattctttaagatgtacaaatgtgcaactacaccagtaacttaaggtgatattgaaACACCGCAAAGAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACAGTTT-GGAAAACGGAA---TTGCTATGGCTGATATGTGGACAGGTTA-CATACA-T-ATT---TTCCTATAGTTTATTAAGGT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---AATGTTTAATCTACTTTTAAAATGATTGTCAAAGAACGTGACTTTAACTGCCTGTCAAT-AAGAGGTT---TTCACAACACAATAGTTATCCAAATTGTTCATAATCTTTTA-CAATACAATTATAAGACGCACTGGACATATGATATCA----T--CAAA-ATAATCTAATTGCTTAT--AAG-----A---ATA
gi|12 : aggtgacttaatgttttctatatgcagtgaaatttattttcgggaatggcactggcctataatggactatgcatcttcggtatgacggggatgcaaaagttgttctaaaattgacgcattacctaatggcatcttggcgtacatgcataaatgaatgtctttagcctatcagtaatttcaatggtgggacGC-AGTTCAATTTAA-TATTTTTGAAGATGAAAATGTATT---------TTA---TATTTT--GTTGTCCCAAATTTGACATTTTTACATGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGTTAAACAC--T-C-TTT--T-T--------------AT---TGCATTGATTGATAA---TTGTTATTaattaataacatatcataggcggatctaggattttcaatg
gi|13 : ATATATATTCCAACAACCATACGTTGATTTAATAT--AAT-----ATCCACGTCAAGATATATCAAATA----TGAGTGCGAGT------TATATATTAA--AAT-AACCTTATCACAACTTAAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTC-GGTTCCCTTCCCA-TTGCTA---TCAAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----GTCTAGA--GACCAAATATTTTGCAAGC-AGTGTAGTTTGAATATTGTTGAAAAGGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATATGATAATTT-ACGTGAACTTTTAAACG-CAAAAA---ATGA----------T-----TAATTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAATTTAAACAC--T-TATTT--T-TC-TT----T----TATAATTGCATTGATGGACAAATGTTATAATTttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgctttgaaccagtcactttaataaagaaataataataa
gi|14 : ataaC-AGTGTTATTTGAATATTGTTGAAGATGAAA-TTCATT---------TCA---GAT-----GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACATGAACATTTGAATG-TAAAAATTGATGAATTATG--
gi|14 : AATTTAAACAT--T-T-TTT--TCTT-TT----T----CAT---TGCCTTGATGGGTAAA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|14 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctAACATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAAT------A---aatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|16 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-AGGCTGATAT------ATTGGTTT-----ACCAA-A--GACCTAATATTTTGTAAGC-AGTGCAATTTGAATAATGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCATATTATTTT--GCTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGACCATTTGAACGTCAAAA--TGATAAATTATG--T-TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC-----------T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAAT
gi|17 : ggtatgccaactgaaacggttttgacaatcatatattcattatggcagtatacaTTT-----ACCAAGA--GATCAAAGATTTTTTTTGC-AGTGTAATTTGAATATTGTTGAAAATGAAA-TATATT---------TCA---TGTTTT--GTTTTCACAAATTTTATAATTT-ACGTGAACATTTGAATG-CAAAAATTAGTAAGTTA---------------TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TC-TT----TTTGTCAT---TGCATTGATGGATAGA---TGTTATg
gi|18 : ACAAGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-GT------------CAT---TGCATTAATGGATAGATGTTATCATTaat
gi|18 : cggcttaaaATGTATTGTACCTGTCACTTAAATAAAT------A---A--AAG-ATATAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatgtattgtacctgtcacttaaataaataaaagatatatctatgaacagtc
gi|19 : cggcttaaaacaaggcaaatttaaacacttttttgtcattgcattaatggatagatgttatcattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacAAATCTAAACAC--T-G-GTT--T-TT-AT----T----CAT---TGCATTGATTGAACAATTGTGTTGTTCAtctatgaacagtc
gi|19 : TTTTAAAATGTATTGTATCTATCATTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtatctatcattttaataaataaattatatatat
gi|2 : aaatctaaacactggtttttattcattgcattgattgaacaattgtgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTAACGAATTTGGAAAAACATATA-TATATATGGACGATA----GA------AACAGGAA-A-AATATGTTCATACAATTATTTAAGAT-AT-AAA-ATAATTGGTCTTTA---GATTATAAATCTATATTTAAAAAAAT-GATAAA-AAGGTGACATTAATGCCTTGTCTAT-ACAAAGTT---TACATAACGCCACATTTAT-----ATG--CGTCATCTACTA-TTATAACATTATAAGACAAAATAGACAAATTATATACATTTT--CAAA-AT----TA--TATATAA--AAA-----A---ATATTCT---AT-TTGAATA----TGAGTGCTAGT------TATATATTAA--AACGAACCTTAACAAAAAATGAAGATCGTGT-AT----TACACAACTAGGCTCCGGTTTTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-At
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttaTTGCAATCGAGT-TAACTTAAATATTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCTTATATTTGATCATTA-ACGCGAACATTTTCACG-CAAAAAATGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--T-T-TGT--T-TC-TTGATGC----CAT---TGCAGTGATGGATAGATTTTATAATTCAacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccaTAACATGTATTGCACCTGTCACTGTAATAAAT------A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|20 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccattgcaatcgagttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAAATCTAAACAC--T-T-TT------T-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAACTTTGTTATTCA
gi|20 : TTTTAAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-TTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctatcactttaataaataaaatttatat
gi|21 : aaatctaaacacttttttttcattgcattgattgatcaactttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATACAC--T-T-TCT--T-TT------------CAT---TGCATTGATTGGTCAATTTTGTTATTCAt
gi|21 : aaatcctgTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatatat
gi|22 : aaatcctgtatacactttcttttcattgcattgattggtcaattttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT--T-TT-TG----T----CAT---TGCATTGATGGATAGATGTTATTATTCAt
gi|22 : cGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAATA-----A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcaggtattgtacctgtcactttaataaataaatatatatatatgcccatttt
gi|23 : ctttttgtcattgcattgatggatagatgttattattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcag-AGTGTTATTTAAATGTTTTTGAATATGAAT-TATATT---------TTA---TATTGG--TTTGTCCTAAATTTGACAGTTG-ACGTGAAAATTTCAATT-CAAGAATtatgcccatttt
gi|23 : GCAAAATTAAACAC--T-T-GGT--T-TT------------CAT---TACATTGATAAATAAATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaaattaaacacttggttttcattacattgataaataaatgatt
gi|24 : agtgttatttaaatgtttttgaatatgaattatattttatattggtttgtcctaaatttgacagttgacgtgaaaatttcaattcaagaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGGTTTTGTAAGC-GGTGTAATTTGAATA---------------------------------------TTCC--GTTGTCCTAAATTTAATAATTC-ACGTGAACATTTGA-----AACAATTGATGAGTTATG-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--------T--T-TT-CC----T----CAT---TACATTCGTTTATAA---TTGGTATgatt
gi|25 : AATATTGTTGAAAATAAAA-TACATT---------TCA---T-TTTT---TTGTCCCAAATTTTATAATTA-ACATGAACATTTGAACG-CAAAATTTGCTGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCA-----------AATT--AAGAT--T-A-TTT--T-TT-TG----T----AAT---TGCTTTGATTGATAAATaattctt
gi|26 : AA---AC-TTCAGTT----TTAGTGCGAGT------CTTATTTTAA--AATGAACCTCAACAAAAACTTAAGATCGTGTCACGACGTACACAACTATGCTCTGGTACCCTTCCTA-TTGAAA---TCGAaatgataatt
gi|27 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAagccgcgcatgtgttagtattttaccggccactattagcgggcagtattaagattgattgactgaccgggtatgattaacatactctacttcgttactaatacttttaaccacactaacatactg
gi|28 : AAACCCGGATATAAGA-TGTAAACCAAATGTTTTACGGTTTT--CAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAA-TGTTAGCCAAAA-ATGTT---TTCATATGATTATTTAACAT-GTCAAA-AACATTGGTCCTCA---GGTG--AAATtatgtgccattagacataaccaggcgatcattatgcagtatttgaaagacacacatatgccatggcatgtgccataatatcaatagcaaatattgcaaatattggaaaaataaatgaaaaactaaatgaaatgtgaagggttattaaagaacagtacaaacatatagcatttattaa
gi|29 : ttattttaggtgtacattattctacatccttaccagtaacacaaggcgatatgagtttggCCA-TTGCGA---TCGAGTT-AGGATGGTAT------ATTGGTTT-----ACCCAGACTGACCAGCGAGTATGTAAGC-AGTGTAATCTAAATAGTATTGAAGATGAAA-TACATTATTTTCATTTTA---TATTTT--GTGGTCGTTAATTTGACAATTG-ACATGAAAACGTAAACG-CAAAAATTAATGAATTGTaaagaatgtgatt
gi|3 : gatagcaattgtgagatgatCCCACACATAAGA-CGTAAAATAAAT-CTTTACGGTTTTG-AAAAAAAATAA-TAGCAATGGATAATA----GAC-GGTTAACAAAAA-ATATT---TTTATATGATTATTTAAGAT-GT-TAA-ATAATTGGTCTTCC---GGTGTTAAATCTATATTCAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCGAGATGTCCGTACTCTTT-A-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGATTGCGGGT------AATATGTTTTTTAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AATACAACTACGTTCCGGTACCATTCCCA-TTGCAA---TCGAGAC-GGCTCATTAT------ATTGGTTC-----ACCTAGA--GGCCAGAGATTCTGTAAGC-AATGCAATTTAAATATTGTCGAAGATAAAA-TATATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCCAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAATCTAAACAC------TTT--T-TT-AT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTGTTCAtatgtaatgtaa
gi|3 : agTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTGATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttgataaataatatatata
gi|32 : agcccacacataagacgtaaaataaatctttacggttttgaaaaaaaataatagcaatggataatagacggttaacaaaaaatatttttatatgattatttaagatgttaaataattggtcttccggtgttaaatctatattcaaagaaattgataaagaatgtgactttaattccttgtcaataagaagttttcataacaccacatttatccgagatgtccgtactctttactgcataattataaaacaaaatggactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacttgaatacgattgcgggtaatatgttttttaatgaaccttaacaaaaatttaagatcgtgtataatacaactacgttccggtaccattcccattgcaatcgagacggctcattatattggttcacctagaggccagagattctgtaagcaatgcaatttaaatattgtcgaagataaaatatatttcatattttgttgctccaaatttgatcatttacgtgaaaatttgaatgcaaaaatagttgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaaatctaaacacttttttattcattgcattgattgatcaattttgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA-CCACAAAATTATAAGACAAAAGTGAAAAATGATATAAATTCT--CAAA-ATAAGCTAAATATATAT--AAA-----A---CTATTAA---AT-TTGAAT
gi|37 : ATGTATTGTACCTGCCCCTTAAATAAAT------AG--A--TAtgctatgttctaccattaatataatatgtgtgatccttcggtatgcatgtacagtgtactatgatttggtacttcc
gi|38 : taatacattcaacatttattaacgttcttgctaatgttgtaaatctgacC--T-T-TTTGCT-TT-TG----T----CAT---TGCATTGATGGAAAGA---TGTTAT
gi|39 : acTAACATGTGTTGTACCTGTCTCTTTGATATAT------ATTTA--TAC-ATATAatttcattttattttgttcttgttgtt
gi|4 : tgctgatgttgtaaaacAACCCCACATATAAGA-CGAAAAATAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAAATAGCTATGGATGCTA----GAC-GGTTAA-AAAAA-A-AAT---TTCATATGATTATTTAAGATCAA-AAA-ATGATTGGTCTTCC---GATGTTAAAACTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCTTTGTCAATTAAGAAGTT---TTCGTAACACCACATTTATCCAAGATGTGCGTACTCTTTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AACTCAACTACGTTCCAGTCCCCTTCCCA-TTGCAA---TCG-----AGGTCGTTAT------ATTGGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTCTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTCGAAGATGAA---ACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCTAAATTTGACCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCCAAACAC--T-T-TTTA-T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAtat
gi|41 : aAAACAC--T-T-TTT--T-CTATTAG--T----CAT---TGCATTGATGAATAGA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatata
gi|43 : -T-TTT--T-TT-CT----T----CAT---TGCATTGATGAATCAATGTTATAATTCAatttcattttattttgttt
gi|45 : cTTTTTAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAttttatgttgttcttgtt
gi|46 : TTTAACATGTAATGTACCCGTCACTTTAATAAAT------A---A--TATGATATAta
gi|47 : aTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTTATAAAT------A---A--AAT-ATATAc
gi|48 : TTAATAATTT-ATGTGAACATTTGAACG-CAAAAATAGATGAATTt
gi|49 : TTTAAAATGTATTGTACCCGTTACTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATAtt
gi|5 : GTTTTACGGTTTTGGAAAAAATAA---TAGCAATGGATGATA----GAC-GATTAACAAAAA-A-AATATTTTTATATGATTATTTAAGAT-GA-AAATATACTTGGACTTCC---GATATTAAATCAAAATTTAAAGAAATT-----------------TAATACCGGGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTGCATACTCTTTTA-CTGTATAATTATAAAACTAAATAAACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-ATAAAAA----CGAATGCAAGT------TATATGTTTA--AATGAACCGTAACAAAAATATAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGTTCCGGTACTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-CGGTCGTTAT------ATTCGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTGTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATAAAGTCGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCCATAAATTTGATCATTT-ACGTGAAGATATGAATG-CAAAAATAATTGAATTATG--CNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACA---------T--T-TG-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTAATTCA
gi|5 : AAAATGTATTGTACCAGTCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtattgtaccagtcactttaataaataaaatatatata
gi|50 : gttttacggttttggaaaaaataatagcaatggatgatagacgattaacaaaaaaaatatttttatatgattatttaagatgaaaatatacttggacttccgatattaaatcaaaatttaaagaaatttaataccgggtcaataagaagttttcataacaccacatttatccaagatgtgcatactcttttactgtataattataaaactaaataaactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacataaaaacgaatgcaagttatatgtttaaatgaaccgtaacaaaaatataagatcgtgtattacacaactacgttccggtactcttcccattgcaatcgagttcggtcgttatattcgtttacctagagaccagagattgtgtaagcagtgtaatttaaataaagtcgaagataaaatacatttcatattttgttgccataaatttgatcatttacgtgaagatatgaatgcaaaaataattgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatctaaacatttgtttcattgcattgattgatcaattttgtaattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---T--TAT-ATATAta
gi|51 : AAATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAGT------A---A--TAT-ATATA
gi|53 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--tat
gi|54 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--
gi|6 : AACCCCA-ATATAAAAGTGTAAACTAAATGCTTTA-------GG----------------TATGGATGATA----GAC-GGTTAACAGAAATA-ACT---T------GATTACTTAAAAT-GT-AAA-ATAATTTGTTTCCA---GATGGTGAATCTATATTTGAAGAAA---GTA-------TGACTTTAATGCCTTGTCTTT-AAGAACTT---TTGAAAACACCACAATTTTCCACGATGTA---AATTTATTAACTACAAATTTGTAAGACGAAATGGACTACTGATATACATTCA--CAAA-ATAAGTTAATTATATGTTAAAA-----A---ATATTGA---AT-CATAATAAGTTTGATTTCGAGTAATGTTTATATGTTAG--AATGAACCTAACCAACAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAATTACGCCCCGGTACCCTTCCCA-TTGCAT---CCGAATT-ATGCCGGTAT------ATTAGTTT-----ATCAAGA--GATTCAAGATTTTGTTTGC-AGTGTCATTTGAATATTGTTGAATATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTTATTATCA-ACGAGAGCATTTGAGCG-CAAGAATTATTGAATT-------T-----TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGGCAAATTTATACA-------TTT--A-TT-TT----T----CAT---TGCATGAATGGATTAA---TGTTAT
gi|7 : tacgctataatctgacattcattttttagttgcgatataaattgtttatgtatttacggtcgttacatttgatgaacattgacaacggtccttacattaattcacagtgatattggttgggAAATTTC--CAAA-ATA---T--TTATAAAT--TAGTTATCA---GTATCAC---A-----AAAA----CAAGTGCAAGT------TATATGTTAG--AATGAACCAAAACAAAATTTTAAGATTATGT-AT----TATAAGAC-A-GCTCATGTTCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-TGGTCGATAT------GTTGGTTTGGTTTACCGAGA--AACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCCATATGTAATGATTT-ACATGAACATTTGAATG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAATTTAAACAC--T-T-CTT--T-TC-TTTTTGT----CAT---TGCATTGATGGAT--ATGTTATAATTCAa
gi|7 : gaaaattaaaaacaTTAACATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAGAAAAAAA---A--TAT-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaacatgtattgtacctgtcactttaataaagaaaaaaaatatatatc
gi|8 : gaaaattaaaaacaaaatttccaaaatatttataaattagttatcagtatcacaaaaacaagtgcaagttatatgttagaatgaaccaaaacaaaattttaagattatgtattataagacagctcatgttcccttcccattgcaatcgagtttggtcgatatgttggtttggtttaccgagaaaccaaagattttgtaagcagtgtaatttaaatattgttgaagataaaatacatttcatattttgttgtcccatatgtaatgatttacatgaacatttgaatgcaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaatttaaacacttcttttctttttgtcattgcattgatggatatgttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTCACACTTGCAAGGTTTGAGTTTAAGTTGGTGTTTATCTGTTGATAT-----ACCTAAG--GACCAGAGATTATGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTCTCGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTTTGGTTGCTCTAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAATATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACAC-------TT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAc
gi|9 : gatatgtaactgaaatctgaaagaATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCTTAAATTGATGTTAAATCTATATTTAA-----------AAGAAA--------------TTG---AT-AAGAAGGTGAAT--ATTATTCCTTGTCTAT--AAGAAGTTTACA---TTATA--TACAAAAGTATAAGACAAAGTGGACAAATGATATAAATTCG--CAAA-ATATGATAGTTATATGT--AAG-----A---ATATTAA---AC-TTGAATA----TGAGTGCGAGT------TATATGTTAT--ATTGAACCTTAACAAAAGTTCACAATCGTGT-AT----TTCACAA-------------CCCTTCCCA-TTGTAA---TCGAGTT-AGGTTGGTAT------ATTGATTT-----ACTAAAA--GACCAAATATTTTTTAAGC-GGTGTAATTCAAAATTTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------CAA---TATTTT--ATTGTTCGAACTTATATAATTT-ACGTGAATATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACA-----------AATTAAAACACGATGT-TTC--T-TT-TT----T----CCT---TCCATTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttagtaaataatatata
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTAATGTATTAACAGTGTATGTTAGCAAACAAATGACAGTTAATACCAGAAAAACAAAAATTGTTCACTTTGGAAAAAATAAAAAAATGTTGCTGCATTTATTTTCAGAATTGGTGATACTATTATTGATATGTGCCATGACTATAGATATCTTGGTGTGGTTTTAAATGAATATCTAGATTTTACTGAAACTGTTAATGTTTTTAACAGAATCAGCCTGAAGAGTTTTTTTTATAGTCTTGTATCAAACGTGTTCAATAAAAATGACTTATTAAATGGATTCTACAAACAGTAAAATTTATGATGCGAGAATAGTACCTATAATGGACTATGCATCTGCGGTATGGGGATGCAAAAGCTATTCTAAAGCTGAGACACTACAGTCATAACTGACTGTTATCAAATTTACATCTACACCAGTTATTCAAGGTGATATGGGTTAAAAAAAACACAAATAAGACGTAAACTAAATGT
Unaligned ( gi|15 ): GAAAATGTACGAGTCAATTTAAAGCATGAACTTTCTGTCAGTGTGTTACTATTCGCTGATGATATAGTTTTAATAGCCCCAAAATGAAGAGCATTTACAGTGTATGATAGCAGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGAAAGACAAAATTTGTTCTGATCCGAAAGAAAAAAAATGTTACTACATTTATTTTCAGAATTTGTAATATTATCATTGAAATATGTCATTACTTAAAAGTCTTGTTGTGGTTTTAAATAGATATCAAGATTTTACTGAAACTGCTAATGTAATGTTTTATCAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTACTTATCTTGTATCAAGCTTGTTAAATAAA
Unaligned ( gi|30 ): ATAAAACATCTTCAAAAAGGAGTCAATTTAAACCGTGAGCTTTCTGAAGAGCATCTACAGGGTATGTTAGCATATCTAAATATGTGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGCAAGACAAAAATGTTCACTTCCAACGGAAGAAAAAAAAGGAACTGCATTTACAAACTTCAGTTTTAGTGCGAGTCTTATT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTATATCTTCGGTATGTAAACTTTATACAAAAGTTTAGTAAAATATGTTATAGAAGATAAACAAATTGGTTTTCGACAACAAAGGTCTTGTGAAGAAACATAGTCTCATAAACAACGATTATTAGAATTAGGAAAACACAGAAGTTAGATACATTTGCTTGCATTGTTTATATGGCGAGAGCTTTTG
Unaligned ( gi|33 ): TTTTGTTAAACAGAAAATATAATAAATGTTGGAAAATAGAAAATGAACATTAACAACGATAATAAGAACATGGAAAACACAAAATTATACATTTACGTGTTATGTTGATATTGCGAAAGCTTTTGATGATGTAAATTGAGA
Unaligned ( gi|34 ): TACCAATAATTATATATTTGAAAATATAGGTTATCCCAACTAATCTACATTCATAGAGGAATGTAGTTGGAATTGATTCTCTTCCAAATGAGTTTTTTAAAAATTGTTCATCAATCCAATTGTTAAAATCATTAT
Unaligned ( gi|35 ): AGTAACTTAATGTTTTCTACATACAGTAAAACTTATAATGCAAGAACATTGTCTATAATGGACTATGCATTTTCGGTATGGCGAGGCAAAATTTATTCTAAAACTGATGCACAACATAATCCTGT
Unaligned ( gi|36 ): ACCATTGAAACGGGATAAACAAGTAATTTTTCAAGCTAAATTACGAAAGGCAGTTAGAATCGATTGCCTACCAAACGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTCA
Unaligned ( gi|40 ): TTTGTGGTTTTCAAAAACCAATTGAGAGTTAATATCAGAAATACAAATATGGTTCAAATTCCAA
Unaligned ( gi|42 ): GCAGTTGGAAGCGATTGCCTGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTC
Unaligned ( gi|44 ): AAATTTAAACATATTTTTATTCCTTTGGTCATTTCATTGATGGGTAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|52 ): ATACAACCTAGTCTATAATTTCCTATTTTATTACAAATAAAG
Unaligned ( gi|55 ): TGTCATTGTACTGATGGATAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|56 ): TATATATGTACATGAGATGACTACACATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111 111 222 2222222222222 111 11111 111111 111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 2 6 1 22 0 999 2222 66 0 111 1 000 4 4 4 888 3 0000000000000 1 3 1 5 000 1 4 3 0 6 5 1 3 1 55 4 3 0 55 00000 777 777 55 0 9999 222222 666 4 9999 2 2 2 3 666 3 0 111111 99999 1 55 2 2 999999999 444 33 2 2 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 44 1 0000000 3333 222 0 2 88 777777 555 55 2
lowQualScore : . . . .. . ... .... .. . ... . ... . . . ... . ............. . . . . ... . . . . . . . . . .. . . . .. ..... ... ... .. . .... ...... ... . .... . . . . ... . . ...... ..... . .. . . ......... ... .. . . . . ............................................................................................................... ...... .. . ....... .... ... . . .. ...... ... .. .
lowQualScore : 5 7 4 11 3 111 1111 44 1 999 0 000 4 4 4 888 4 7777777777777 6 0 9 7 000 7 3 0 4 6 0 0 1 0 55 0 3 7 55 00000 000 000 44 7 4444 888888 222 4 4444 9 9 6 6 444 6 7 555555 11111 0 00 5 4 444444444 111 22 2 2 1 9 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222 00 7 8888888 4444 888 5 6 77 444444 222 88 5
consensus : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
Reference ( family-242 ) : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
gi|1 : GATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCT
gi|10 : tactgataattatgtatttgaaagtgtggtaaaactctataccaataaaagaatgtataaaagtgatttttcaagctaaataacaaaaagcggttggaatagattgtcttccaaacgacgcttttaaaaatgtgcatcaattcaattgttaacatcaatatttaatgaatgctttaagtcgcatattaaaaccaatatcgaaaaacttaaaaatgatggaagagttccaacaaattatcatgggattagttttatatctatggtatgtacatgttatacaatacacatgtagtaagttatttagaaacatattatttaatagaagatgaacaaagtggattttgacaacaaaaaaagttttggttttcattaacaaagataattggaaataagtaaacacagaatttaaatacgtttgcgcgctttgttgatatggcgaacgctttcgtggtgttaatagagatattttatatagaaaggcatatcgggcaatatttttgaatctcttaaaagattgtatgatgaatgtaaaaccgccattgatgtaaatggtaaataacacagatttatttaatatatgtagaggtgtaatgtaaagggggttatttccccaacattgttttcacttttatcaatgaatagaaaatcttgaaaaaggagtcactttaaaccctgaattttctgtcagtttattgctatttgcggatgatagcgtttaatagcctcatattaaaagcatttacagtgtataaaattagcatataaaattaaaataataatagcaagacaaaaatggttaactcccaaaagaagaaaaacaatgttactggatatactttcagaaatgatgattattgttgaaatctgccataactataactatctcatgtatggttttaaaataatatctagatttttttgaaactgttagtgttgtaacagaatcagccagtagagcttttcctagttttgtataaaatgtgttcaataaaagttacttaatgttttctacgtaaagtaagttttatgattcgagaacatataatggactatgcatcttccgtacgggaatgcaaaagttattctaaactgacacactacatagttgtattatcaaattctttaagatgtacaaatgtgcaactacaccagtaacttaaggtgatattgaaACACCGCAAAGAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACAGTTT-GGAAAACGGAA---TTGCTATGGCTGATATGTGGACAGGTTA-CATACA-T-ATT---TTCCTATAGTTTATTAAGGT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---AATGTTTAATCTACTTTTAAAATGATTGTCAAAGAACGTGACTTTAACTGCCTGTCAAT-AAGAGGTT---TTCACAACACAATAGTTATCCAAATTGTTCATAATCTTTTA-CAATACAATTATAAGACGCACTGGACATATGATATCA----T--CAAA-ATAATCTAATTGCTTAT--AAG-----A---ATA
gi|12 : aggtgacttaatgttttctatatgcagtgaaatttattttcgggaatggcactggcctataatggactatgcatcttcggtatgacggggatgcaaaagttgttctaaaattgacgcattacctaatggcatcttggcgtacatgcataaatgaatgtctttagcctatcagtaatttcaatggtgggacGC-AGTTCAATTTAA-TATTTTTGAAGATGAAAATGTATT---------TTA---TATTTT--GTTGTCCCAAATTTGACATTTTTACATGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGTTAAACAC--T-C-TTT--T-T--------------AT---TGCATTGATTGATAA---TTGTTATTaattaataacatatcataggcggatctaggattttcaatg
gi|13 : ATATATATTCCAACAACCATACGTTGATTTAATAT--AAT-----ATCCACGTCAAGATATATCAAATA----TGAGTGCGAGT------TATATATTAA--AAT-AACCTTATCACAACTTAAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTC-GGTTCCCTTCCCA-TTGCTA---TCAAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----GTCTAGA--GACCAAATATTTTGCAAGC-AGTGTAGTTTGAATATTGTTGAAAAGGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATATGATAATTT-ACGTGAACTTTTAAACG-CAAAAA---ATGA----------T-----TAATTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAATTTAAACAC--T-TATTT--T-TC-TT----T----TATAATTGCATTGATGGACAAATGTTATAATTttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgctttgaaccagtcactttaataaagaaataataataa
gi|14 : ataaC-AGTGTTATTTGAATATTGTTGAAGATGAAA-TTCATT---------TCA---GAT-----GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACATGAACATTTGAATG-TAAAAATTGATGAATTATG--
gi|14 : AATTTAAACAT--T-T-TTT--TCTT-TT----T----CAT---TGCCTTGATGGGTAAA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|14 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctAACATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAAT------A---aatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|16 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-AGGCTGATAT------ATTGGTTT-----ACCAA-A--GACCTAATATTTTGTAAGC-AGTGCAATTTGAATAATGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCATATTATTTT--GCTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGACCATTTGAACGTCAAAA--TGATAAATTATG--T-TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC-----------T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAAT
gi|17 : ggtatgccaactgaaacggttttgacaatcatatattcattatggcagtatacaTTT-----ACCAAGA--GATCAAAGATTTTTTTTGC-AGTGTAATTTGAATATTGTTGAAAATGAAA-TATATT---------TCA---TGTTTT--GTTTTCACAAATTTTATAATTT-ACGTGAACATTTGAATG-CAAAAATTAGTAAGTTA---------------TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TC-TT----TTTGTCAT---TGCATTGATGGATAGA---TGTTATg
gi|18 : ACAAGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-GT------------CAT---TGCATTAATGGATAGATGTTATCATTaat
gi|18 : cggcttaaaATGTATTGTACCTGTCACTTAAATAAAT------A---A--AAG-ATATAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatgtattgtacctgtcacttaaataaataaaagatatatctatgaacagtc
gi|19 : cggcttaaaacaaggcaaatttaaacacttttttgtcattgcattaatggatagatgttatcattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacAAATCTAAACAC--T-G-GTT--T-TT-AT----T----CAT---TGCATTGATTGAACAATTGTGTTGTTCAtctatgaacagtc
gi|19 : TTTTAAAATGTATTGTATCTATCATTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtatctatcattttaataaataaattatatatat
gi|2 : aaatctaaacactggtttttattcattgcattgattgaacaattgtgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTAACGAATTTGGAAAAACATATA-TATATATGGACGATA----GA------AACAGGAA-A-AATATGTTCATACAATTATTTAAGAT-AT-AAA-ATAATTGGTCTTTA---GATTATAAATCTATATTTAAAAAAAT-GATAAA-AAGGTGACATTAATGCCTTGTCTAT-ACAAAGTT---TACATAACGCCACATTTAT-----ATG--CGTCATCTACTA-TTATAACATTATAAGACAAAATAGACAAATTATATACATTTT--CAAA-AT----TA--TATATAA--AAA-----A---ATATTCT---AT-TTGAATA----TGAGTGCTAGT------TATATATTAA--AACGAACCTTAACAAAAAATGAAGATCGTGT-AT----TACACAACTAGGCTCCGGTTTTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-At
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttaTTGCAATCGAGT-TAACTTAAATATTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCTTATATTTGATCATTA-ACGCGAACATTTTCACG-CAAAAAATGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--T-T-TGT--T-TC-TTGATGC----CAT---TGCAGTGATGGATAGATTTTATAATTCAacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccaTAACATGTATTGCACCTGTCACTGTAATAAAT------A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|20 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccattgcaatcgagttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAAATCTAAACAC--T-T-TT------T-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAACTTTGTTATTCA
gi|20 : TTTTAAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-TTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctatcactttaataaataaaatttatat
gi|21 : aaatctaaacacttttttttcattgcattgattgatcaactttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATACAC--T-T-TCT--T-TT------------CAT---TGCATTGATTGGTCAATTTTGTTATTCAt
gi|21 : aaatcctgTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatatat
gi|22 : aaatcctgtatacactttcttttcattgcattgattggtcaattttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT--T-TT-TG----T----CAT---TGCATTGATGGATAGATGTTATTATTCAt
gi|22 : cGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAATA-----A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcaggtattgtacctgtcactttaataaataaatatatatatatgcccatttt
gi|23 : ctttttgtcattgcattgatggatagatgttattattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcag-AGTGTTATTTAAATGTTTTTGAATATGAAT-TATATT---------TTA---TATTGG--TTTGTCCTAAATTTGACAGTTG-ACGTGAAAATTTCAATT-CAAGAATtatgcccatttt
gi|23 : GCAAAATTAAACAC--T-T-GGT--T-TT------------CAT---TACATTGATAAATAAATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaaattaaacacttggttttcattacattgataaataaatgatt
gi|24 : agtgttatttaaatgtttttgaatatgaattatattttatattggtttgtcctaaatttgacagttgacgtgaaaatttcaattcaagaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGGTTTTGTAAGC-GGTGTAATTTGAATA---------------------------------------TTCC--GTTGTCCTAAATTTAATAATTC-ACGTGAACATTTGA-----AACAATTGATGAGTTATG-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--------T--T-TT-CC----T----CAT---TACATTgatt
gi|25 : AATATTGTTGAAAATAAAA-TACATT---------TCA---T-TTTT---TTGTCCCAAATTTTATAATTA-ACATGAACATTTGAACG-CAAAATTTGCTGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCA-----------AATT--AAGAT--T-A-TTT--T-TT-TG----T----AAT---TGCTTTGATTGATAAATcgtttataattggtataattctt
gi|26 : AA---AC-TTCAGTT----TTAGTGCGAGT------CTTATTTTAA--AATGAACCTCAACAAAAACTTAAGATCGTGTCACGACGTACACAACTATGCTCTGGTACCCTTCCTA-TTGAAA---TCGAaatgataatt
gi|27 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAagccgcgcatgtgttagtattttaccggccactattagcgggcagtattaagattgattgactgaccgggtatgattaacatactctacttcgttactaatacttttaaccacactaacatactg
gi|28 : AAACCCGGATATAAGA-TGTAAACCAAATGTTTTACGGTTTT--CAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAA-TGTTAGCCAAAA-ATGTT---TTCATATGATTATTTAACAT-GTCAAA-AACATTGGTCCTCA---GGTG--AAATtatgtgccattagacataaccaggcgatcattatgcagtatttgaaagacacacatatgccatggcatgtgccataatatcaatagcaaatattgcaaatattggaaaaataaatgaaaaactaaatgaaatgtgaagggttattaaagaacagtacaaacatatagcatttattaa
gi|29 : ttattttaggtgtacattattctacatccttaccagtaacacaaggcgatatgagtttggCCA-TTGCGA---TCGAGTT-AGGATGGTAT------ATTGGTTT-----ACCCAGACTGACCAGCGAGTATGTAAGC-AGTGTAATCTAAATAGTATTGAAGATGAAA-TACATTATTTTCATTTTA---TATTTT--GTGGTCGTTAATTTGACAATTG-ACATGAAAACGTAAACG-CAAAAATTAATGAATTGTaaagaatgtgatt
gi|3 : gatagcaattgtgagatgatCCCACACATAAGA-CGTAAAATAAAT-CTTTACGGTTTTG-AAAAAAAATAA-TAGCAATGGATAATA----GAC-GGTTAACAAAAA-ATATT---TTTATATGATTATTTAAGAT-GT-TAA-ATAATTGGTCTTCC---GGTGTTAAATCTATATTCAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCGAGATGTCCGTACTCTTT-A-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGATTGCGGGT------AATATGTTTTTTAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AATACAACTACGTTCCGGTACCATTCCCA-TTGCAA---TCGAGAC-GGCTCATTAT------ATTGGTTC-----ACCTAGA--GGCCAGAGATTCTGTAAGC-AATGCAATTTAAATATTGTCGAAGATAAAA-TATATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCCAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAATCTAAACAC------TTT--T-TT-AT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTGTTCAtatgtaatgtaa
gi|3 : agTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTGATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttgataaataatatatata
gi|32 : agcccacacataagacgtaaaataaatctttacggttttgaaaaaaaataatagcaatggataatagacggttaacaaaaaatatttttatatgattatttaagatgttaaataattggtcttccggtgttaaatctatattcaaagaaattgataaagaatgtgactttaattccttgtcaataagaagttttcataacaccacatttatccgagatgtccgtactctttactgcataattataaaacaaaatggactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacttgaatacgattgcgggtaatatgttttttaatgaaccttaacaaaaatttaagatcgtgtataatacaactacgttccggtaccattcccattgcaatcgagacggctcattatattggttcacctagaggccagagattctgtaagcaatgcaatttaaatattgtcgaagataaaatatatttcatattttgttgctccaaatttgatcatttacgtgaaaatttgaatgcaaaaatagttgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaaatctaaacacttttttattcattgcattgattgatcaattttgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA-CCACAAAATTATAAGACAAAAGTGAAAAATGATATAAATTCT--CAAA-ATAAGCTAAATATATAT--AAA-----A---CTATTAA---AT-TTGAAT
gi|37 : ATGTATTGTACCTGCCCCTTAAATAAAT------AG--A--TAtgctatgttctaccattaatataatatgtgtgatccttcggtatgcatgtacagtgtactatgatttggtacttcc
gi|38 : taatacattcaacatttattaacgttcttgctaatgttgtaaatctgacC--T-T-TTTGCT-TT-TG----T----CAT---TGCATTGATGGAAAGA---TGTTAT
gi|39 : acTAACATGTGTTGTACCTGTCTCTTTGATATAT------ATTTA--TAC-ATATAatttcattttattttgttcttgttgtt
gi|4 : tgctgatgttgtaaaacAACCCCACATATAAGA-CGAAAAATAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAAATAGCTATGGATGCTA----GAC-GGTTAA-AAAAA-A-AAT---TTCATATGATTATTTAAGATCAA-AAA-ATGATTGGTCTTCC---GATGTTAAAACTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCTTTGTCAATTAAGAAGTT---TTCGTAACACCACATTTATCCAAGATGTGCGTACTCTTTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AACTCAACTACGTTCCAGTCCCCTTCCCA-TTGCAA---TCG-----AGGTCGTTAT------ATTGGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTCTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTCGAAGATGAA---ACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCTAAATTTGACCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCCAAACAC--T-T-TTTA-T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAtat
gi|41 : aAAACAC--T-T-TTT--T-CTATTAG--T----CAT---TGCATTGATGAATAGA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatata
gi|43 : -T-TTT--T-TT-CT----T----CAT---TGCATTGATGAATCAATGTTATAATTCAatttcattttattttgttt
gi|45 : cTTTTTAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAttttatgttgttcttgtt
gi|46 : TTTAACATGTAATGTACCCGTCACTTTAATAAAT------A---A--TATGATATAta
gi|47 : aTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTTATAAAT------A---A--AAT-ATATAc
gi|48 : TTAATAATTT-ATGTGAACATTTGAACG-CAAAAATAGATGAATTt
gi|49 : TTTAAAATGTATTGTACCCGTTACTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATAtt
gi|5 : GTTTTACGGTTTTGGAAAAAATAA---TAGCAATGGATGATA----GAC-GATTAACAAAAA-A-AATATTTTTATATGATTATTTAAGAT-GA-AAATATACTTGGACTTCC---GATATTAAATCAAAATTTAAAGAAATT-----------------TAATACCGGGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTGCATACTCTTTTA-CTGTATAATTATAAAACTAAATAAACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-ATAAAAA----CGAATGCAAGT------TATATGTTTA--AATGAACCGTAACAAAAATATAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGTTCCGGTACTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-CGGTCGTTAT------ATTCGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTGTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATAAAGTCGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCCATAAATTTGATCATTT-ACGTGAAGATATGAATG-CAAAAATAATTGAATTATG--CNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACA---------T--T-TG-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTAATTCA
gi|5 : AAAATGTATTGTACCAGTCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtattgtaccagtcactttaataaataaaatatatata
gi|50 : gttttacggttttggaaaaaataatagcaatggatgatagacgattaacaaaaaaaatatttttatatgattatttaagatgaaaatatacttggacttccgatattaaatcaaaatttaaagaaatttaataccgggtcaataagaagttttcataacaccacatttatccaagatgtgcatactcttttactgtataattataaaactaaataaactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacataaaaacgaatgcaagttatatgtttaaatgaaccgtaacaaaaatataagatcgtgtattacacaactacgttccggtactcttcccattgcaatcgagttcggtcgttatattcgtttacctagagaccagagattgtgtaagcagtgtaatttaaataaagtcgaagataaaatacatttcatattttgttgccataaatttgatcatttacgtgaagatatgaatgcaaaaataattgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatctaaacatttgtttcattgcattgattgatcaattttgtaattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---T--TAT-ATATAta
gi|51 : AAATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAGT------A---A--TAT-ATATA
gi|53 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--tat
gi|54 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--
gi|55 : ----T----CAT---TGTACTGATGGATAGATGTTATAATTC
gi|6 : tgAACCCCA-ATATAAAAGTGTAAACTAAATGCTTTA-------GG----------------TATGGATGATA----GAC-GGTTAACAGAAATA-ACT---T------GATTACTTAAAAT-GT-AAA-ATAATTTGTTTCCA---GATGGTGAATCTATATTTGAAGAAA---GTA-------TGACTTTAATGCCTTGTCTTT-AAGAACTT---TTGAAAACACCACAATTTTCCACGATGTA---AATTTATTAACTACAAATTTGTAAGACGAAATGGACTACTGATATACATTCA--CAAA-ATAAGTTAATTATATGTTAAAA-----A---ATATTGA---AT-CATAATAAGTTTGATTTCGAGTAATGTTTATATGTTAG--AATGAACCTAACCAACAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAATTACGCCCCGGTACCCTTCCCA-TTGCAT---CCGAATT-ATGCCGGTAT------ATTAGTTT-----ATCAAGA--GATTCAAGATTTTGTTTGC-AGTGTCATTTGAATATTGTTGAATATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTTATTATCA-ACGAGAGCATTTGAGCG-CAAGAATTATTGAATT-------T-----TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGGCAAATTTATACA-------TTT--A-TT-TT----T----CAT---TGCATGAATGGATTAA---TGTTAT
gi|7 : tacgctataatctgacattcattttttagttgcgatataaattgtttatgtatttacggtcgttacatttgatgaacattgacaacggtccttacattaattcacagtgatattggttgggAAATTTC--CAAA-ATA---T--TTATAAAT--TAGTTATCA---GTATCAC---A-----AAAA----CAAGTGCAAGT------TATATGTTAG--AATGAACCAAAACAAAATTTTAAGATTATGT-AT----TATAAGAC-A-GCTCATGTTCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-TGGTCGATAT------GTTGGTTTGGTTTACCGAGA--AACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCCATATGTAATGATTT-ACATGAACATTTGAATG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAATTTAAACAC--T-T-CTT--T-TC-TTTTTGT----CAT---TGCATTGATGGAT--ATGTTATAATTCAa
gi|7 : gaaaattaaaaacaTTAACATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAGAAAAAAA---A--TAT-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaacatgtattgtacctgtcactttaataaagaaaaaaaatatatatc
gi|8 : gaaaattaaaaacaaaatttccaaaatatttataaattagttatcagtatcacaaaaacaagtgcaagttatatgttagaatgaaccaaaacaaaattttaagattatgtattataagacagctcatgttcccttcccattgcaatcgagtttggtcgatatgttggtttggtttaccgagaaaccaaagattttgtaagcagtgtaatttaaatattgttgaagataaaatacatttcatattttgttgtcccatatgtaatgatttacatgaacatttgaatgcaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaatttaaacacttcttttctttttgtcattgcattgatggatatgttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTCACACTTGCAAGGTTTGAGTTTAAGTTGGTGTTTATCTGTTGATAT-----ACCTAAG--GACCAGAGATTATGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTCTCGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTTTGGTTGCTCTAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAATATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACAC-------TT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAc
gi|9 : gatatgtaactgaaatctgaaagaATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCTTAAATTGATGTTAAATCTATATTTAA-----------AAGAAA--------------TTG---AT-AAGAAGGTGAAT--ATTATTCCTTGTCTAT--AAGAAGTTTACA---TTATA--TACAAAAGTATAAGACAAAGTGGACAAATGATATAAATTCG--CAAA-ATATGATAGTTATATGT--AAG-----A---ATATTAA---AC-TTGAATA----TGAGTGCGAGT------TATATGTTAT--ATTGAACCTTAACAAAAGTTCACAATCGTGT-AT----TTCACAA-------------CCCTTCCCA-TTGTAA---TCGAGTT-AGGTTGGTAT------ATTGATTT-----ACTAAAA--GACCAAATATTTTTTAAGC-GGTGTAATTCAAAATTTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------CAA---TATTTT--ATTGTTCGAACTTATATAATTT-ACGTGAATATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACA-----------AATTAAAACACGATGT-TTC--T-TT-TT----T----CCT---TCCATTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttagtaaataatatata
blockSeqs : C G T GA AAA . A AT A ATG C C T ATT A TTGATAAAGAATG A G T T GAA A C C A A A A A AA C C TA TTATC TCC . T AGTT AATGTT TTT C GACG G C T C GGT T TTATCT GGTTT A CT G . ATTTTCATT TAT TG . T TTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN GATGT GC C TTGATG TTGT AAT A TG AAAAAA TTT AT G
blockSeqs : G . T GA TA . C AT T ATT . . . . T TTGATAAAGAATG T T A . . T C G C . T A T . . A . . . . C . . A . . T T A . . . . . A . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TTA A . TTTTTG . . A TG A G AT .
blockSeqs : C . T GA AA . C TA T . . . . . T TGATAAAAAGG T T A . . T C G C . A A A . . A . . . . C . . A . . C C A . . . . . C . . . . . . . . CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TT . . ATTAG . . A TT . . . .
blockSeqs : C . T C AA . C A A . . . . . T AAGAAA T A A . . T C A C . T A T . . A . . . . T . . A . . C C C . . . . . T . . . . . . . . CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA TT . . TT . . A TT . . . .
blockSeqs : . . T A . . C A A . . . . . G GTA . G T . . T . T A . T T T . . A . . . . C . . A . . C C A . . . . . T . . . . . . . . CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TT . . TT . . A CT . . . .
blockSeqs : . G . . . A C . . . . . T TT . . . . . . . . . . A G T . . A . . . . C . . G . . C C A . . . . . T . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TG . . TT . . C TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . A A A . . T . . . . T . . G . . . A T . . . . . A . . . . . . . . CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TT . . TT . . A TG . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . TTAATTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TT . . AT . . C TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . TTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGG TT . . TT . . C TT . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAG TT . . TG . . A TG . . . .
blockSeqs : . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TA . . CC . . A TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCA TT . . TG . . A TG . . . .
blockSeqs : . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACA TT . . AT . . C TG . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . TG . . A TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . TT . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CT . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TT . . C . . . .
blockSeqs : . . . TT . . C . . . .
blockSeqs : . . . TT . . A . . .
blockSeqs : . . . TT . . T . .
blockSeqs : . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : AA* **** C* *** C* TT***** TT
originalCons : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
finalCons : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TTTT-----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTAATGTATTAACAGTGTATGTTAGCAAACAAATGACAGTTAATACCAGAAAAACAAAAATTGTTCACTTTGGAAAAAATAAAAAAATGTTGCTGCATTTATTTTCAGAATTGGTGATACTATTATTGATATGTGCCATGACTATAGATATCTTGGTGTGGTTTTAAATGAATATCTAGATTTTACTGAAACTGTTAATGTTTTTAACAGAATCAGCCTGAAGAGTTTTTTTTATAGTCTTGTATCAAACGTGTTCAATAAAAATGACTTATTAAATGGATTCTACAAACAGTAAAATTTATGATGCGAGAATAGTACCTATAATGGACTATGCATCTGCGGTATGGGGATGCAAAAGCTATTCTAAAGCTGAGACACTACAGTCATAACTGACTGTTATCAAATTTACATCTACACCAGTTATTCAAGGTGATATGGGTTAAAAAAAACACAAATAAGACGTAAACTAAATGT
Unaligned ( gi|15 ): GAAAATGTACGAGTCAATTTAAAGCATGAACTTTCTGTCAGTGTGTTACTATTCGCTGATGATATAGTTTTAATAGCCCCAAAATGAAGAGCATTTACAGTGTATGATAGCAGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGAAAGACAAAATTTGTTCTGATCCGAAAGAAAAAAAATGTTACTACATTTATTTTCAGAATTTGTAATATTATCATTGAAATATGTCATTACTTAAAAGTCTTGTTGTGGTTTTAAATAGATATCAAGATTTTACTGAAACTGCTAATGTAATGTTTTATCAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTACTTATCTTGTATCAAGCTTGTTAAATAAA
Unaligned ( gi|30 ): ATAAAACATCTTCAAAAAGGAGTCAATTTAAACCGTGAGCTTTCTGAAGAGCATCTACAGGGTATGTTAGCATATCTAAATATGTGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGCAAGACAAAAATGTTCACTTCCAACGGAAGAAAAAAAAGGAACTGCATTTACAAACTTCAGTTTTAGTGCGAGTCTTATT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTATATCTTCGGTATGTAAACTTTATACAAAAGTTTAGTAAAATATGTTATAGAAGATAAACAAATTGGTTTTCGACAACAAAGGTCTTGTGAAGAAACATAGTCTCATAAACAACGATTATTAGAATTAGGAAAACACAGAAGTTAGATACATTTGCTTGCATTGTTTATATGGCGAGAGCTTTTG
Unaligned ( gi|33 ): TTTTGTTAAACAGAAAATATAATAAATGTTGGAAAATAGAAAATGAACATTAACAACGATAATAAGAACATGGAAAACACAAAATTATACATTTACGTGTTATGTTGATATTGCGAAAGCTTTTGATGATGTAAATTGAGA
Unaligned ( gi|34 ): TACCAATAATTATATATTTGAAAATATAGGTTATCCCAACTAATCTACATTCATAGAGGAATGTAGTTGGAATTGATTCTCTTCCAAATGAGTTTTTTAAAAATTGTTCATCAATCCAATTGTTAAAATCATTAT
Unaligned ( gi|35 ): AGTAACTTAATGTTTTCTACATACAGTAAAACTTATAATGCAAGAACATTGTCTATAATGGACTATGCATTTTCGGTATGGCGAGGCAAAATTTATTCTAAAACTGATGCACAACATAATCCTGT
Unaligned ( gi|36 ): ACCATTGAAACGGGATAAACAAGTAATTTTTCAAGCTAAATTACGAAAGGCAGTTAGAATCGATTGCCTACCAAACGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTCA
Unaligned ( gi|40 ): TTTGTGGTTTTCAAAAACCAATTGAGAGTTAATATCAGAAATACAAATATGGTTCAAATTCCAA
Unaligned ( gi|42 ): GCAGTTGGAAGCGATTGCCTGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTC
Unaligned ( gi|44 ): AAATTTAAACATATTTTTATTCCTTTGGTCATTTCATTGATGGGTAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|52 ): ATACAACCTAGTCTATAATTTCCTATTTTATTACAAATAAAG
Unaligned ( gi|56 ): TATATATGTACATGAGATGACTACACATAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111 111 222 2222222222222 111 11111 111111 111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 2 6 1 22 0 999 2222 66 0 111 1 000 4 4 4 888 3 0000000000000 1 3 1 5 000 1 4 3 0 6 5 1 3 1 55 4 3 0 55 00000 777 777 55 0 9999 222222 666 4 9999 2 2 2 3 666 3 0 111111 99999 1 55 2 2 999999999 444 33 2 2 0 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888888 44 1 0000000 3333 222 0 2 88 777777 555 55 2
lowQualScore : . . . .. . ... .... .. . ... . ... . . . ... . ............. . . . . ... . . . . . . . . . .. . . . .. ..... ... ... .. . .... ...... ... . .... . . . . ... . . ...... ..... . .. . . ......... ... .. . . . . ............................................................................................................... ...... .. . ....... .... ... . . .. ...... ... .. .
lowQualScore : 5 7 4 11 3 111 1111 44 1 999 0 000 4 4 4 888 4 7777777777777 6 0 9 7 000 7 3 0 4 6 0 0 1 0 55 0 3 7 55 00000 000 000 44 7 4444 888888 222 4 4444 9 9 6 6 444 6 7 555555 11111 0 00 5 4 444444444 111 22 2 2 1 9 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222 00 7 8888888 4444 888 5 6 77 444444 222 88 5
consensus : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
Reference ( family-242 ) : NAACCCCGCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAC-GGTTAACAAAAA-A-ANT---TTCATATGATTATTTAAGAT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---GATGTTAAATCTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAANGTGACTTTAATNCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTNCGTANTCTTTTA-CTACANAATTATAAGACGAAATGGACNAATGATATAAATTCC--CAAA-ATAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTCCGGTNCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----ACCNAGA--GACCAGAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--C-T-----TANTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCANGNACANGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAATTTTGTTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATA
gi|1 : GATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCT
gi|10 : tactgataattatgtatttgaaagtgtggtaaaactctataccaataaaagaatgtataaaagtgatttttcaagctaaataacaaaaagcggttggaatagattgtcttccaaacgacgcttttaaaaatgtgcatcaattcaattgttaacatcaatatttaatgaatgctttaagtcgcatattaaaaccaatatcgaaaaacttaaaaatgatggaagagttccaacaaattatcatgggattagttttatatctatggtatgtacatgttatacaatacacatgtagtaagttatttagaaacatattatttaatagaagatgaacaaagtggattttgacaacaaaaaaagttttggttttcattaacaaagataattggaaataagtaaacacagaatttaaatacgtttgcgcgctttgttgatatggcgaacgctttcgtggtgttaatagagatattttatatagaaaggcatatcgggcaatatttttgaatctcttaaaagattgtatgatgaatgtaaaaccgccattgatgtaaatggtaaataacacagatttatttaatatatgtagaggtgtaatgtaaagggggttatttccccaacattgttttcacttttatcaatgaatagaaaatcttgaaaaaggagtcactttaaaccctgaattttctgtcagtttattgctatttgcggatgatagcgtttaatagcctcatattaaaagcatttacagtgtataaaattagcatataaaattaaaataataatagcaagacaaaaatggttaactcccaaaagaagaaaaacaatgttactggatatactttcagaaatgatgattattgttgaaatctgccataactataactatctcatgtatggttttaaaataatatctagatttttttgaaactgttagtgttgtaacagaatcagccagtagagcttttcctagttttgtataaaatgtgttcaataaaagttacttaatgttttctacgtaaagtaagttttatgattcgagaacatataatggactatgcatcttccgtacgggaatgcaaaagttattctaaactgacacactacatagttgtattatcaaattctttaagatgtacaaatgtgcaactacaccagtaacttaaggtgatattgaaACACCGCAAAGAAGA-CGTAAACTAAATGCTTTACAGTTT-GGAAAACGGAA---TTGCTATGGCTGATATGTGGACAGGTTA-CATACA-T-ATT---TTCCTATAGTTTATTAAGGT-GT-AAA-ATAATTGGTCTTCA---AATGTTTAATCTACTTTTAAAATGATTGTCAAAGAACGTGACTTTAACTGCCTGTCAAT-AAGAGGTT---TTCACAACACAATAGTTATCCAAATTGTTCATAATCTTTTA-CAATACAATTATAAGACGCACTGGACATATGATATCA----T--CAAA-ATAATCTAATTGCTTAT--AAG-----A---ATA
gi|12 : aggtgacttaatgttttctatatgcagtgaaatttattttcgggaatggcactggcctataatggactatgcatcttcggtatgacggggatgcaaaagttgttctaaaattgacgcattacctaatggcatcttggcgtacatgcataaatgaatgtctttagcctatcagtaatttcaatggtgggacGC-AGTTCAATTTAA-TATTTTTGAAGATGAAAATGTATT---------TTA---TATTTT--GTTGTCCCAAATTTGACATTTTTACATGAACATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAAGTTAAACAC--T-C-TTT--T-T--------------AT---TGCATTGATTGATAA---TTGTTATTaattaataacatatcataggcggatctaggattttcaatg
gi|13 : ATATATATTCCAACAACCATACGTTGATTTAATAT--AAT-----ATCCACGTCAAGATATATCAAATA----TGAGTGCGAGT------TATATATTAA--AAT-AACCTTATCACAACTTAAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGCTC-GGTTCCCTTCCCA-TTGCTA---TCAAGTT-AGGTCGGTAT------ATTGGTTT-----GTCTAGA--GACCAAATATTTTGCAAGC-AGTGTAGTTTGAATATTGTTGAAAAGGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATATGATAATTT-ACGTGAACTTTTAAACG-CAAAAA---ATGA----------T-----TAATTCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAATTTAAACAC--T-TATTT--T-TC-TT----T----TATAATTGCATTGATGGACAAATGTTATAATTttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaacatgctttgaaccagtcactttaataaagaaataataataa
gi|14 : ataaC-AGTGTTATTTGAATATTGTTGAAGATGAAA-TTCATT---------TCA---GAT-----GTTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACATGAACATTTGAATG-TAAAAATTGATGAATTATG--
gi|14 : AATTTAAACAT--T-T-TTT--TCTT-TT----T----CAT---TGCCTTGATGGGTAAA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|14 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctAACATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAAT------A---aatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacatgtattgtacctttcactttaataaata
gi|16 : cagtgttatttgaatattgttgaagatgaaattcatttcagatgttgtcctaaatttgataatttacatgaacatttgaatgtaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaatttaaacatttttttctttttcattgccttgatgggtaaatgttataatacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-AGGCTGATAT------ATTGGTTT-----ACCAA-A--GACCTAATATTTTGTAAGC-AGTGCAATTTGAATAATGTTGAAGATGAAA-TACATT---------TCATATTATTTT--GCTGTCCTAAATTTGATAATTT-ACGTGACCATTTGAACGTCAAAA--TGATAAATTATG--T-TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC-----------T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATGGATAAAT
gi|17 : ggtatgccaactgaaacggttttgacaatcatatattcattatggcagtatacaTTT-----ACCAAGA--GATCAAAGATTTTTTTTGC-AGTGTAATTTGAATATTGTTGAAAATGAAA-TATATT---------TCA---TGTTTT--GTTTTCACAAATTTTATAATTT-ACGTGAACATTTGAATG-CAAAAATTAGTAAGTTA---------------TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-TC-TT----TTTGTCAT---TGCATTGATGGATAGA---TGTTATg
gi|18 : ACAAGGCAAATTTAAACAC--T-T-TTT--T-GT------------CAT---TGCATTAATGGATAGATGTTATCATTaat
gi|18 : cggcttaaaATGTATTGTACCTGTCACTTAAATAAAT------A---A--AAG-ATATAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacatgtattgtacctgtcacttaaataaataaaagatatatctatgaacagtc
gi|19 : cggcttaaaacaaggcaaatttaaacacttttttgtcattgcattaatggatagatgttatcattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttacAAATCTAAACAC--T-G-GTT--T-TT-AT----T----CAT---TGCATTGATTGAACAATTGTGTTGTTCAtctatgaacagtc
gi|19 : TTTTAAAATGTATTGTATCTATCATTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtatctatcattttaataaataaattatatatat
gi|2 : aaatctaaacactggtttttattcattgcattgattgaacaattgtgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATATAAGA-CGTAAACTAAATGCTTAACGAATTTGGAAAAACATATA-TATATATGGACGATA----GA------AACAGGAA-A-AATATGTTCATACAATTATTTAAGAT-AT-AAA-ATAATTGGTCTTTA---GATTATAAATCTATATTTAAAAAAAT-GATAAA-AAGGTGACATTAATGCCTTGTCTAT-ACAAAGTT---TACATAACGCCACATTTAT-----ATG--CGTCATCTACTA-TTATAACATTATAAGACAAAATAGACAAATTATATACATTTT--CAAA-AT----TA--TATATAA--AAA-----A---ATATTCT---AT-TTGAATA----TGAGTGCTAGT------TATATATTAA--AACGAACCTTAACAAAAAATGAAGATCGTGT-AT----TACACAACTAGGCTCCGGTTTTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-At
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttaTTGCAATCGAGT-TAACTTAAATATTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCTTATATTTGATCATTA-ACGCGAACATTTTCACG-CAAAAAATGATGAATTATGNNN-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--T-T-TGT--T-TC-TTGATGC----CAT---TGCAGTGATGGATAGATTTTATAATTCAacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|2 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccaTAACATGTATTGCACCTGTCACTGTAATAAAT------A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctaacatgtattgcacctgtcactgtaataaata
gi|20 : tgactttatgtttctttacaaacaataaatgtttgatgagagaattgtacctacaaaaggctgtgcgccttatgtatataaaaaattatattatatatggagatgcaaaagttattctaaagctgacacacttcataataatgttattagatcatttgtagatgtacgtaaatgtacatttactccaatagttcaaggtaatatggtttgggagtacatagttacatataagacgtaaactaaatgcttaacgaatttggaaaaacatatatatatatggacgatagaaacaggaaaaatatgttcatacaattatttaagatataaaataattggtctttagattataaatctatatttaaaaaaatgataaaaaggtgacattaatgccttgtctatacaaagtttacataacgccacatttatatgcgtcatctactattataacattataagacaaaatagacaaattatatacattttcaaaattatatataaaaaaatattctatttgaatatgagtgctagttatatattaaaacgaaccttaacaaaaaatgaagatcgtgtattacacaactaggctccggttttcttcccattgcaatcgagttaacttaaatattgttgaagacgaaatacatttcatattttgttgtcttatatttgatcattaacgcgaacattttcacgcaaaaaatgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatttaaacactttgtttcttgatgccattgcagtgatggatagattttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAAATCTAAACAC--T-T-TT------T-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAACTTTGTTATTCA
gi|20 : TTTTAAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-TTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctatcactttaataaataaaatttatat
gi|21 : aaatctaaacacttttttttcattgcattgattgatcaactttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTATACAC--T-T-TCT--T-TT------------CAT---TGCATTGATTGGTCAATTTTGTTATTCAt
gi|21 : aaatcctgTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatatat
gi|22 : aaatcctgtatacactttcttttcattgcattgattggtcaattttgttattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT--T-TT-TG----T----CAT---TGCATTGATGGATAGATGTTATTATTCAt
gi|22 : cGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAATA-----A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcaggtattgtacctgtcactttaataaataaatatatatatatgcccatttt
gi|23 : ctttttgtcattgcattgatggatagatgttattattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatagcag-AGTGTTATTTAAATGTTTTTGAATATGAAT-TATATT---------TTA---TATTGG--TTTGTCCTAAATTTGACAGTTG-ACGTGAAAATTTCAATT-CAAGAATtatgcccatttt
gi|23 : GCAAAATTAAACAC--T-T-GGT--T-TT------------CAT---TACATTGATAAATAAATaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgcaaaattaaacacttggttttcattacattgataaataaatgatt
gi|24 : agtgttatttaaatgtttttgaatatgaattatattttatattggtttgtcctaaatttgacagttgacgtgaaaatttcaattcaagaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGGTTTTGTAAGC-GGTGTAATTTGAATA---------------------------------------TTCC--GTTGTCCTAAATTTAATAATTC-ACGTGAACATTTGA-----AACAATTGATGAGTTATG-------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATTTAAACAC--------T--T-TT-CC----T----CAT---TACATTgatt
gi|25 : AATATTGTTGAAAATAAAA-TACATT---------TCA---T-TTTT---TTGTCCCAAATTTTATAATTA-ACATGAACATTTGAACG-CAAAATTTGCTGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCA-----------AATT--AAGAT--T-A-TTT--T-TT-TG----T----AAT---TGCTTTGATTGATAAATcgtttataattggtataattctt
gi|26 : AA---AC-TTCAGTT----TTAGTGCGAGT------CTTATTTTAA--AATGAACCTCAACAAAAACTTAAGATCGTGTCACGACGTACACAACTATGCTCTGGTACCCTTCCTA-TTGAAA---TCGAaatgataatt
gi|27 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAagccgcgcatgtgttagtattttaccggccactattagcgggcagtattaagattgattgactgaccgggtatgattaacatactctacttcgttactaatacttttaaccacactaacatactg
gi|28 : AAACCCGGATATAAGA-TGTAAACCAAATGTTTTACGGTTTT--CAAAAAAAAAA-TAGCTATGGATGATA----GAA-TGTTAGCCAAAA-ATGTT---TTCATATGATTATTTAACAT-GTCAAA-AACATTGGTCCTCA---GGTG--AAATtatgtgccattagacataaccaggcgatcattatgcagtatttgaaagacacacatatgccatggcatgtgccataatatcaatagcaaatattgcaaatattggaaaaataaatgaaaaactaaatgaaatgtgaagggttattaaagaacagtacaaacatatagcatttattaa
gi|29 : ttattttaggtgtacattattctacatccttaccagtaacacaaggcgatatgagtttggCCA-TTGCGA---TCGAGTT-AGGATGGTAT------ATTGGTTT-----ACCCAGACTGACCAGCGAGTATGTAAGC-AGTGTAATCTAAATAGTATTGAAGATGAAA-TACATTATTTTCATTTTA---TATTTT--GTGGTCGTTAATTTGACAATTG-ACATGAAAACGTAAACG-CAAAAATTAATGAATTGTaaagaatgtgatt
gi|3 : gatagcaattgtgagatgatCCCACACATAAGA-CGTAAAATAAAT-CTTTACGGTTTTG-AAAAAAAATAA-TAGCAATGGATAATA----GAC-GGTTAACAAAAA-ATATT---TTTATATGATTATTTAAGAT-GT-TAA-ATAATTGGTCTTCC---GGTGTTAAATCTATATTCAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCCTTGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCGAGATGTCCGTACTCTTT-A-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGATTGCGGGT------AATATGTTTTTTAATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AATACAACTACGTTCCGGTACCATTCCCA-TTGCAA---TCGAGAC-GGCTCATTAT------ATTGGTTC-----ACCTAGA--GGCCAGAGATTCTGTAAGC-AATGCAATTTAAATATTGTCGAAGATAAAA-TATATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCCAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACAAATCTAAACAC------TTT--T-TT-AT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTGTTCAtatgtaatgtaa
gi|3 : agTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTGATAAAT------A---A--TAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttgataaataatatatata
gi|32 : agcccacacataagacgtaaaataaatctttacggttttgaaaaaaaataatagcaatggataatagacggttaacaaaaaatatttttatatgattatttaagatgttaaataattggtcttccggtgttaaatctatattcaaagaaattgataaagaatgtgactttaattccttgtcaataagaagttttcataacaccacatttatccgagatgtccgtactctttactgcataattataaaacaaaatggactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacttgaatacgattgcgggtaatatgttttttaatgaaccttaacaaaaatttaagatcgtgtataatacaactacgttccggtaccattcccattgcaatcgagacggctcattatattggttcacctagaggccagagattctgtaagcaatgcaatttaaatattgtcgaagataaaatatatttcatattttgttgctccaaatttgatcatttacgtgaaaatttgaatgcaaaaatagttgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaaatctaaacacttttttattcattgcattgattgatcaattttgttgttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA-CCACAAAATTATAAGACAAAAGTGAAAAATGATATAAATTCT--CAAA-ATAAGCTAAATATATAT--AAA-----A---CTATTAA---AT-TTGAAT
gi|37 : ATGTATTGTACCTGCCCCTTAAATAAAT------AG--A--TAtgctatgttctaccattaatataatatgtgtgatccttcggtatgcatgtacagtgtactatgatttggtacttcc
gi|38 : taatacattcaacatttattaacgttcttgctaatgttgtaaatctgacC--T-T-TTTGCT-TT-TG----T----CAT---TGCATTGATGGAAAGA---TGTTAT
gi|39 : acTAACATGTGTTGTACCTGTCTCTTTGATATAT------ATTTA--TAC-ATATAatttcattttattttgttcttgttgtt
gi|4 : tgctgatgttgtaaaacAACCCCACATATAAGA-CGAAAAATAAATGCTTTACGGTTTTGGAAAAAAAAAAAATAGCTATGGATGCTA----GAC-GGTTAA-AAAAA-A-AAT---TTCATATGATTATTTAAGATCAA-AAA-ATGATTGGTCTTCC---GATGTTAAAACTATATTTAAAGAAATTGATAAAGAATGTGACTTTAATTCTTTGTCAATTAAGAAGTT---TTCGTAACACCACATTTATCCAAGATGTGCGTACTCTTTTA-CTGCATAATTATAAAACAAAATGGACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-TTGAATA----CGAGTGCGAGT------TATATGTTAA--AATGAACCTTAACAAAAATTTAAGATCGTGT-AT----AACTCAACTACGTTCCAGTCCCCTTCCCA-TTGCAA---TCG-----AGGTCGTTAT------ATTGGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTCTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTCGAAGATGAA---ACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCTCTAAATTTGACCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAAAATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCCAAACAC--T-T-TTTA-T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAtat
gi|41 : aAAACAC--T-T-TTT--T-CTATTAG--T----CAT---TGCATTGATGAATAGA---TGTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttaataaataatatatata
gi|43 : -T-TTT--T-TT-CT----T----CAT---TGCATTGATGAATCAATGTTATAATTCAatttcattttattttgttt
gi|45 : cTTTTTAAATGTATTGTACCTATCACTTTAATAAAT------A---A--TAT-ATATAttttatgttgttcttgtt
gi|46 : TTTAACATGTAATGTACCCGTCACTTTAATAAAT------A---A--TATGATATAta
gi|47 : aTTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTTATAAAT------A---A--AAT-ATATAc
gi|48 : TTAATAATTT-ATGTGAACATTTGAACG-CAAAAATAGATGAATTt
gi|49 : TTTAAAATGTATTGTACCCGTTACTTTAATAAAT------A---AATTAT-ATAtt
gi|5 : GTTTTACGGTTTTGGAAAAAATAA---TAGCAATGGATGATA----GAC-GATTAACAAAAA-A-AATATTTTTATATGATTATTTAAGAT-GA-AAATATACTTGGACTTCC---GATATTAAATCAAAATTTAAAGAAATT-----------------TAATACCGGGTCAAT-AAGAAGTT---TTCATAACACCACATTTATCCAAGATGTGCATACTCTTTTA-CTGTATAATTATAAAACTAAATAAACTAATGATATAAATTCC--CAAA-GTAAGCTAATTATATAT--AAA-----A---ATATCAA---AC-ATAAAAA----CGAATGCAAGT------TATATGTTTA--AATGAACCGTAACAAAAATATAAGATCGTGT-AT----TACACAACTACGTTCCGGTACTCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-CGGTCGTTAT------ATTCGTTT-----ACCTAGA--GACCAGAGATTGTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATAAAGTCGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGCCATAAATTTGATCATTT-ACGTGAAGATATGAATG-CAAAAATAATTGAATTATG--CNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACA---------T--T-TG-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTAATTCA
gi|5 : AAAATGTATTGTACCAGTCACTTTAATAAAT------A---A--AAT-ATATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtattgtaccagtcactttaataaataaaatatatata
gi|50 : gttttacggttttggaaaaaataatagcaatggatgatagacgattaacaaaaaaaatatttttatatgattatttaagatgaaaatatacttggacttccgatattaaatcaaaatttaaagaaatttaataccgggtcaataagaagttttcataacaccacatttatccaagatgtgcatactcttttactgtataattataaaactaaataaactaatgatataaattcccaaagtaagctaattatatataaaaatatcaaacataaaaacgaatgcaagttatatgtttaaatgaaccgtaacaaaaatataagatcgtgtattacacaactacgttccggtactcttcccattgcaatcgagttcggtcgttatattcgtttacctagagaccagagattgtgtaagcagtgtaatttaaataaagtcgaagataaaatacatttcatattttgttgccataaatttgatcatttacgtgaagatatgaatgcaaaaataattgaattatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatctaaacatttgtttcattgcattgattgatcaattttgtaattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---T--TAT-ATATAta
gi|51 : AAATGTATTGTACCTTTCACTTTAATAAGT------A---A--TAT-ATATA
gi|53 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--tat
gi|54 : TTTAAAATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAT------A---A--
gi|55 : ----T----CAT---TGTACTGATGGATAGATGTTATAATTC
gi|6 : tgAACCCCA-ATATAAAAGTGTAAACTAAATGCTTTA-------GG----------------TATGGATGATA----GAC-GGTTAACAGAAATA-ACT---T------GATTACTTAAAAT-GT-AAA-ATAATTTGTTTCCA---GATGGTGAATCTATATTTGAAGAAA---GTA-------TGACTTTAATGCCTTGTCTTT-AAGAACTT---TTGAAAACACCACAATTTTCCACGATGTA---AATTTATTAACTACAAATTTGTAAGACGAAATGGACTACTGATATACATTCA--CAAA-ATAAGTTAATTATATGTTAAAA-----A---ATATTGA---AT-CATAATAAGTTTGATTTCGAGTAATGTTTATATGTTAG--AATGAACCTAACCAACAATTTAAGATCGTGT-AT----TACACAATTACGCCCCGGTACCCTTCCCA-TTGCAT---CCGAATT-ATGCCGGTAT------ATTAGTTT-----ATCAAGA--GATTCAAGATTTTGTTTGC-AGTGTCATTTGAATATTGTTGAATATGAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCTAAATTTTATTATCA-ACGAGAGCATTTGAGCG-CAAGAATTATTGAATT-------T-----TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGTACAAGGCAAATTTATACA-------TTT--A-TT-TT----T----CAT---TGCATGAATGGATTAA---TGTTAT
gi|7 : tacgctataatctgacattcattttttagttgcgatataaattgtttatgtatttacggtcgttacatttgatgaacattgacaacggtccttacattaattcacagtgatattggttgggAAATTTC--CAAA-ATA---T--TTATAAAT--TAGTTATCA---GTATCAC---A-----AAAA----CAAGTGCAAGT------TATATGTTAG--AATGAACCAAAACAAAATTTTAAGATTATGT-AT----TATAAGAC-A-GCTCATGTTCCCTTCCCA-TTGCAA---TCGAGTT-TGGTCGATAT------GTTGGTTTGGTTTACCGAGA--AACCAAAGATTTTGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTGTTGAAGATAAAA-TACATT---------TCA---TATTTT--GTTGTCCCATATGTAATGATTT-ACATGAACATTTGAATG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAATTTAAACAC--T-T-CTT--T-TC-TTTTTGT----CAT---TGCATTGATGGAT--ATGTTATAATTCAa
gi|7 : gaaaattaaaaacaTTAACATGTATTGTACCTGTCACTTTAATAAAGAAAAAAA---A--TAT-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaacatgtattgtacctgtcactttaataaagaaaaaaaatatatatc
gi|8 : gaaaattaaaaacaaaatttccaaaatatttataaattagttatcagtatcacaaaaacaagtgcaagttatatgttagaatgaaccaaaacaaaattttaagattatgtattataagacagctcatgttcccttcccattgcaatcgagtttggtcgatatgttggtttggtttaccgagaaaccaaagattttgtaagcagtgtaatttaaatattgttgaagataaaatacatttcatattttgttgtcccatatgtaatgatttacatgaacatttgaatgcaaaaattgatgaattatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaatttaaacacttcttttctttttgtcattgcattgatggatatgttataattcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTTCACACTTGCAAGGTTTGAGTTTAAGTTGGTGTTTATCTGTTGATAT-----ACCTAAG--GACCAGAGATTATGTAAGC-AGTGTAATTTAAATATTCTCGAAGACGAAA-TACATT---------TCA---TATTTTTGGTTGCTCTAAATTTGATCATTT-ACGTGAAAATTTGAATG-CAAATATAGTTGAATTATG--C-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAATCTAAACAC-------TT--T-TT-TT----T----CAT---TGCATTGATTGATCAATTTTGTTATTCAc
gi|9 : gatatgtaactgaaatctgaaagaATTATTTAAGAT-GT-AAA-GTAATTGTTCTTAAATTGATGTTAAATCTATATTTAA-----------AAGAAA--------------TTG---AT-AAGAAGGTGAAT--ATTATTCCTTGTCTAT--AAGAAGTTTACA---TTATA--TACAAAAGTATAAGACAAAGTGGACAAATGATATAAATTCG--CAAA-ATATGATAGTTATATGT--AAG-----A---ATATTAA---AC-TTGAATA----TGAGTGCGAGT------TATATGTTAT--ATTGAACCTTAACAAAAGTTCACAATCGTGT-AT----TTCACAA-------------CCCTTCCCA-TTGTAA---TCGAGTT-AGGTTGGTAT------ATTGATTT-----ACTAAAA--GACCAAATATTTTTTAAGC-GGTGTAATTCAAAATTTGTTGAAGACGAAA-TACATT---------CAA---TATTTT--ATTGTTCGAACTTATATAATTT-ACGTGAATATTTGAACG-CAAAAATTGATGAATTATG--N-N-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACA-----------AATTAAAACACGATGT-TTC--T-TT-TT----T----CCT---TCCATTGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttaaaatgtattgtacctgtcactttagtaaataatatata
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTAATGTATTAACAGTGTATGTTAGCAAACAAATGACAGTTAATACCAGAAAAACAAAAATTGTTCACTTTGGAAAAAATAAAAAAATGTTGCTGCATTTATTTTCAGAATTGGTGATACTATTATTGATATGTGCCATGACTATAGATATCTTGGTGTGGTTTTAAATGAATATCTAGATTTTACTGAAACTGTTAATGTTTTTAACAGAATCAGCCTGAAGAGTTTTTTTTATAGTCTTGTATCAAACGTGTTCAATAAAAATGACTTATTAAATGGATTCTACAAACAGTAAAATTTATGATGCGAGAATAGTACCTATAATGGACTATGCATCTGCGGTATGGGGATGCAAAAGCTATTCTAAAGCTGAGACACTACAGTCATAACTGACTGTTATCAAATTTACATCTACACCAGTTATTCAAGGTGATATGGGTTAAAAAAAACACAAATAAGACGTAAACTAAATGT
Unaligned ( gi|15 ): GAAAATGTACGAGTCAATTTAAAGCATGAACTTTCTGTCAGTGTGTTACTATTCGCTGATGATATAGTTTTAATAGCCCCAAAATGAAGAGCATTTACAGTGTATGATAGCAGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGAAAGACAAAATTTGTTCTGATCCGAAAGAAAAAAAATGTTACTACATTTATTTTCAGAATTTGTAATATTATCATTGAAATATGTCATTACTTAAAAGTCTTGTTGTGGTTTTAAATAGATATCAAGATTTTACTGAAACTGCTAATGTAATGTTTTATCAGAATCAGCCAGTAGAGCTTTTACTTATCTTGTATCAAGCTTGTTAAATAAA
Unaligned ( gi|30 ): ATAAAACATCTTCAAAAAGGAGTCAATTTAAACCGTGAGCTTTCTGAAGAGCATCTACAGGGTATGTTAGCATATCTAAATATGTGGTGTTCAGTAAACAAAATGAGAGTTAATATCAGCAAGACAAAAATGTTCACTTCCAACGGAAGAAAAAAAAGGAACTGCATTTACAAACTTCAGTTTTAGTGCGAGTCTTATT
Unaligned ( gi|31 ): TCTTATATCTTCGGTATGTAAACTTTATACAAAAGTTTAGTAAAATATGTTATAGAAGATAAACAAATTGGTTTTCGACAACAAAGGTCTTGTGAAGAAACATAGTCTCATAAACAACGATTATTAGAATTAGGAAAACACAGAAGTTAGATACATTTGCTTGCATTGTTTATATGGCGAGAGCTTTTG
Unaligned ( gi|33 ): TTTTGTTAAACAGAAAATATAATAAATGTTGGAAAATAGAAAATGAACATTAACAACGATAATAAGAACATGGAAAACACAAAATTATACATTTACGTGTTATGTTGATATTGCGAAAGCTTTTGATGATGTAAATTGAGA
Unaligned ( gi|34 ): TACCAATAATTATATATTTGAAAATATAGGTTATCCCAACTAATCTACATTCATAGAGGAATGTAGTTGGAATTGATTCTCTTCCAAATGAGTTTTTTAAAAATTGTTCATCAATCCAATTGTTAAAATCATTAT
Unaligned ( gi|35 ): AGTAACTTAATGTTTTCTACATACAGTAAAACTTATAATGCAAGAACATTGTCTATAATGGACTATGCATTTTCGGTATGGCGAGGCAAAATTTATTCTAAAACTGATGCACAACATAATCCTGT
Unaligned ( gi|36 ): ACCATTGAAACGGGATAAACAAGTAATTTTTCAAGCTAAATTACGAAAGGCAGTTAGAATCGATTGCCTACCAAACGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTCA
Unaligned ( gi|40 ): TTTGTGGTTTTCAAAAACCAATTGAGAGTTAATATCAGAAATACAAATATGGTTCAAATTCCAA
Unaligned ( gi|42 ): GCAGTTGGAAGCGATTGCCTGAAGTTTTTAAAAATTATCCATCAATCAAATTGTTAAACTC
Unaligned ( gi|44 ): AAATTTAAACATATTTTTATTCCTTTGGTCATTTCATTGATGGGTAGATGTTATAATTC
Unaligned ( gi|52 ): ATACAACCTAGTCTATAATTTCCTATTTTATTACAAATAAAG
Unaligned ( gi|56 ): TATATATGTACATGAGATGACTACACATAAT