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Reference ( gi|2 ) : TCAGGGCTCACGCTGTTGG-TCGCCAAT--GGCGACA----AATGTGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAG-TTTGGCGAA-AGTAATTGGCGCTAACAAAATATGCCAA-------TAT-TT-T-AGCTTT--ACGGCCATGATTTGTTCATAAAGTAACTCTTCACTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCT-TC-ATTGATACCACCTGTCCGATAGCTAGCGG-ACATGAA---CACACTGAACCGCGAATCACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTATGTTGTTCGTATCTCGA-GGTGTTATG-GT----TTTATGATTAG---TGGTAACAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATCAGTCTGTATTCTGTTTCT-TGAGGTCTCAAAAAATTTAAACTTTACAATATTCGCTCCAAGAT----AAACATAT--A---T--TTT--TTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTG-TTTCATTATGTACATTTTCCCTAATTTC----AA----TCAATTTAA--TA-CGACAAATAAA--ATGATCCAACTGTTTTGAA-----AAG--------ATAGCCAC-CAGAGAAAAATAACAGAATTTT---CACTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACAC-----TCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTG-TT-ATGACAA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAATT--TGTTCAATAT-------AATATCAC--GG--ACA--TT----T--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAAT-----AAG-T--------TTG---------TCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCGAAGTATCAATGAATG--AAAACAAAG----TTAA--AA-------------T---------------AT--------A--CAAAA--CCATTTCCTCCTTTGTTTTGTTTCATC--AAA-----------TTGCCAGGATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGTTCCGTTAATGATTATTGCAATAA----CGGGACGTTTTAGGGTTTACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGATACAAAAGA-TAAA-AGA-TGT----ATTATTCAGTAAAATTTTAGAAATA--TA-GTTA-A----TTTT-T--T-CAA-AA-ACA-T-CGTTAAGAATACAATCAAA--TATATA-------TTTAT-ATTTACTTTAAGGT-AATATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGAT--ATT------------AT-------AC-------------TACTGAGTG-------------GAC--AAA---AAAA-TCCACC---TAAATCTAAAAAGAG-AAATACAGATTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|18 : AGTAGCATTTCATTTTCCTTAACACTCGATCAAACAGT-GT--CT-CC-ATGGATACAACCTGTCGGTTAGCTGGTGA-ACATGGA---TGCACTGAACCGTGAATTACTCAAGTTGTGTGTCGTACATGaatatagttgtgtttttttttcaataacatcgtttacattcttttttagaaatctacatttttaaatgtaagatattatataaagatgggaagtactgagcagacaaaaaaatccgcctaaatctaaaaagaatatagactgaaacttagattcaatgatgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
gi|22 : T-GCGGCT-CC-ACGGATACCA--TGTCAGATAGCTGATCG-ACATtgtgcgtttatattgcaacaaatatatgttaggaaatttgttatataatggaatatctaatatttgtacacagcatagagttatgttgaacacagataatgggtatacattctgttatgt
gi|15 : taattagctagaatccagggtctacgctgtccgtaggcaaaaacgccaactgcaataaaaaattaaaatggctatgtttctttcagttttggcaaatgtaattttctccatcaaaatatactaagtggttgtgttttcagttcagtgtcatggtttattaGACACCTTATTGGGGTTT-CCTAATCTGTTAAT--TGTT--TATC---ATGGTGTTATG-TC----TTTATAATTAG---GAGGAACAATT-ATATATTAAGTTATAA----------------ATAAAT--GAGTGACAAATATATTTGTTTTCTGCTGCG-TCA-GTTTCAAAAAATTTAATTTTGGC--TA---GCTTCAAGAT----AAATATAG--A---T--TAT--TTC--AT-GGAT--G-----TTTGCT-GAGTGTA-TTT--TTATGTGCAAGTTTACTATTTTT----AAAAGGGTAATCTAT--TG-TTACCAGTGAAATATGATATAATTTTTTTCAAATAGGAAG--------ATA
gi|29 : tacagGTTCGTAT---AA-ACCGTTATT-ATCTTTTTTATAATTAGGAATTATTACAACA-ATGTATTAAGTAA-AA----------------ATAGAT--AATCTACAGATAAATTTGTATTCTGTTGTG-TCA-GTCCTGAAACGTTT-AATTCTACAAaatccattc
gi|25 : ATTTCGA-GATGTTATG-GT----TTTATAATAAG---TGaacgcgtttagat
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gi|7 : aatttcgagatgttatggttAAGTCCCGAAAAATATAAGTTCTATAAGACTCGCGTCGATAT----AAACACAG--A---T--TTTTTTTT--ATAAAATTAAAAAAA-TTGATCAACTGTGTTTTCA-AATGGCTATT-----TAACTACGAAAAA----CTACATTAA--AATTGGAAAATACA--ATGATGCAGCTGTTTTGAA-----AAA--------CTAG
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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2293 ) : TCAGGGCTCACGCTGTCGG-TCGCCAA-AGGCGCCA------ANTGCGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAGCTCTTCATTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATGGATACCACCTGTCCGATAGCTGGTGGACACGAA---TGCACTGAACCGCGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTNATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-TTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAC---------GA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATTACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TNTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCAAAGAANTAATGAATG--AAAACACAGTTAA--AATG-GTTTATTT-G-----A-T--ACAAAA--CCATTTCCTNCTNTGTTTTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACNGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAANGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAATA--TA-GTT--AN----TTTT-T--T-CAATAACATACGTT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAG--A-----G-----G----G---TACTGAGCGGACAA-AAAAA-TCCACCT-----AAATCTAAAAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|10 : TGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCTTGATTT--GTTCATAAAGTAACTCTTCTTTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GCATCTCCATAGATACCACCTGGCCGATAGCTGGTGGACACGAA---TGCACTGAACCACGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACGTAATTGCATTTT-CCAAATCTGTTTA--TTGTTTGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAAGCACAGATAAGTTTGTATTCTATT-TGA-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTCGCTGCAAGAT----AACC--ATATATATT--TTTTTT--AT-GAATTTGGAAACTTTGGTAAAGTGTacccaagttggctccaaaatcttaaattttctcaattggcgaatgtgttggcgacaagattttttcagccagagtagg
gi|11 : TTTAAATCTGTAATAATTTTAAAAGACACAACAGACAAAAAAAA-------T-ATTGTG-TAA-AAAATTTGAGAACTA--AA-GTT--AA----TTTTCT--T-CAATAACATACATT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATATAAATGTAGTTTAT-ATTTATTTT-----GG----AGT-AACATTCTTCTTAAGAATTCTACA---TTTTC------AAGCTATTAAATAAAG--A-----G-----GGGGAG---TTCCAAACAGACAA-AAAAAGCCCACCC-----AAATTTAAAAAGAGAAAGGCATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|13 : AAAATTAACATTGAAAGTATATT-TTC---AATTGATACTAATGTTGAAGGACACAAAAAAATAAACATACTGTTTTT-ATTATT-TAACACCATTTGTGAAAAA--AA-GTC--AT----TTTT-T--TTCAATAATATATATTTAAGAATATATGAAAAAGATAGA---------TT------------------AA----GGT-AACATTATTCTATGGAATTCTATA---TTTC-------AAGCTATTATATAAAG--A-----G-----A----G-------GAA-GGACCG-AAAG----CACATCAAGAAAATTTAAAAAGAGAAA---ATAACTTTGAAACTT-AGAGCCAATGAAGtcaagttggctccaatgtcataaatttggctccgattttctcaatgggcgaatgtgttggagacaagattttttttcagccaatggt
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gi|15 : tacagACTATTTTTAAAAGGGTAATCTATTGTTA--------CCAGTGAAATATGATATAATTTTTTTCAAATAGGAAGATA-AATCCATTCtaggaagataaatccattc
gi|16 : tacaggacaccttattggggtttcctaatctgttaattgtttatcatggtgttatgtctttataattaggaggaacaattatatattaagttataaataaatgagtgacaaatatatttgttttctgctgcgtcagtttcaaaaaatttaattttggctagcttcaagataaatatagattatttcatggatgtttgctgagtgtatttttatgtgcaagtttTATTTTGTATTGACAGTACATGCATAATTTAAAACCGAATATGC--ACA-----ATTCAACTTTTACAGC---TG-TTGGTTGCTTTATTTATGAAGATCTATAAT---TTCATTCATTAA-----CACAAACTATGCACACTTGTCCTGTGAAAAAGTGAAAA--TTTGATCAAGACAATGCAAAATATCAA--AGACAATT--TGTAAGTAAAT--------AA-AACAAG-----AT-TTTAGAAA-------AAG-G---TT--------------GTCTCAATAACTCATAAACAAA-CTACAAAGGACAAATGATTG--AAAAAGCAGTCCA--AATG-GTTTATTT-
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gi|2 : atcagagctcagtcagaaagcaaagttttactgggatcaacTCAGGGCTCACGCTGTTGG-TCGCCAA-TGGCGACA------AATGTGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCTAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTTTACGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAACTCTTCACTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTTCATTGATACCACCTGTCCGATAGCTAGCGGACATGAA---CACACTGAACCGCGAATCACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTATGTTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATGATTAG----TGGTAACAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATCAGTCTGTATTCTGTT-TCT-TGAGGTCTCAAAAAATTTAAACTTTACAATATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTCATTATGTAC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--A-TAC---------GA--CAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------ATA--GCCA--------CCAGAGAAAAATAACAGAA-TTTTCACTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----CTCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTG-TTATGACAA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TTTGTTCAATAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----TAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCGAAGTATCAATGAATG--AAAACAAAGTTAA--AAT-----------------A-T--ACAAAA--CCATTTCCTCCTTTGTTTTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGTTCCGTTAATGATTATTGCAATAA----CGGGACGTTTTAGGGTTTACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGATACAAAAGATAAAAGATG-------T-ATTATT-CAGTAAAATTTTAGAAATA--TA-GTT--AA----TTTT-T--T-CAAAAACAT-CGTT-AAGAATACAATCAAAT-ATATA---------TTTAT-ATTTACTTT-----AA----GGT-AATATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATAC---------------------------TACTGAGTGGACAA-AAAAA-TCCACCT-----AAATCTAAAAAGAGAAATACAGA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|25 : ATT-TCGAGATGTTATGGT----TTTATAATAAG----TGtctatctgtctagtgatactat
gi|25 : aTTATA-----------------ATAAGTGTTAAGCACATATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCTGAAAAATTTAAACTTTATAAGATTTGCTCCAAGAT----ATACATATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGATAAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTCAGA----TCAATTTA--ttaagcacatataagtttgtattctgtttgttaaggtcctgaaaaatttaaactttataagatttgctccaagatatacatatatatttttttatgaattaggaaactttgataaagtgtgttttgttatgtgcattttccctaattcagatcaattta
gi|26 : aatttcgagatgttatggtt-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAA---AC-------TTAAATGTAAGATGT---ATAATG--A-----C-----GT---GAATTACTGAGCAGACAA-AAAAAGTCCACCT-----AAATCTAATAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-GGAACCAAGGAAG
gi|27 : TTTTAGGGTTCATTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTTTTATTTTTAAATCAATAATAATTTTAAAAGACACAAAAGATAAAAAA-A-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAATAATTATATT--AA----ATTT-TCAT-CAATAACATACACT-AAGAATAAAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-Atcaagttgactccaaaatcttaaatttcttttctcagttg
gi|28 : tgTCTGGGCCTACACTGTCGG-TCACCAA-AGGCACCA------AATGCAATA-AAAAAATAAATGTGGCGCAAGTTTATT-TT--T---AATTTT-GGCAAA-AGTAATTGGCACCAAAAAGATATGCCAATGGTCA--TATT-TAGTCATATG
gi|29 : atttaaaacataactgGTTCGTAT----AAACCGTTATTATCTTTTTTATAATTAGGAATTATTA-CAACA-ATGTATTAAGTAA-AA----------------ATAGAT--AATCTACAGATAAATTTGTATTCTGTTGTGT-CA--GTCCTGAAACGTTT-AATTCTACAAAACGCGTTT--AGAT----tca
gi|3 : GCCAAT----G---------GCTATATGGCC-TGATTT--GTTCATAAAGTAACTATTCATAGTCCTTAACTGTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATAGATACCACATGTCTGATAGCTAGAGGG-ACAAA---TGCACTGAACCGTGAATTACCCA---TGCG-GTCATTTATGACATGTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-T-GTTTGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATTC----------------ATAGCT--TAATCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTGACATGATTCGCTCCAAGAT----AAAC---------------TTTT--GA-GAATTAGGCAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTACGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAT---------GA--AAAATAAAATGATCCAATTGTTATGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAACTATTACAGAA-GTTTCGCTAACAGGAAGATGCAATTTATTAAAAA-ATCAACCATTTATTTGGTATTGATGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCGAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGATGA--TGTTAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TGTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTTAACAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATATTATGAGAAAA-CATTAAAGAAATAATGAATG--AAAACACACTTAA--AATG-GTTTATTTGG-----A-TAAACAAAT--CCATTTCCTACTATG-TTTGTTTCATC--AAATTGCCAGGATGTTGCCAGGATGTTG---------------GGTTGCACTAAACGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTTATGATTGTTGCAATAA----CGAGAAAT
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gi|30 : gccaatggctatatggcctgatttgttcataaagtaactattcatagtccttaactgtcgatcataaagtgtgtctccatagataccacatgtctgatagctagagggacaaatgcactgaaccgtgaattacccatgcggtcatttatgacatgtaattgcgttttcctaatctgtttattgtttgtatctcgaggtgttatggttttataattagtggtagcaacagtgtattaacttattcatagcttaatcacagataagtttgtattctgtttgttaaggtcccgaaaaatttaaacttgacatgattcgctccaagataaacttttgagaattaggcaactttggtcaagtgtgttttgttacgtgcattttccctaatttcaatcaatttaactatgaaaaataaaatgatccaattgttatgaaaagctagccaccagtgaactattacagaagtttcgctaacaggaagatgcaatttattaaaaaatcaaccatttatttggtattgatggcgcatgcgcaatttgaaaatgaatatgcacaatctaaattttacagcgagcgattggttgctttgtttatgatgatgttacttgtctgaccaaacactgaaaatgtgttcaagataatatcacggacatttaacaaaagtaaataaaacaaatatttaggaaacaagtttgtctcaatatattatgagaaaacattaaagaaataatgaatgaaaacacacttaaaatggtttatttggataaacaaatccatttcctactatgtttgtttcatcaaattgccaggatgttgccaggatgttgggttgcactaaacgtcggcacctttcttttcggagtgcggctccgtttatgattgttgcaataacgT-----AA----GGTTAACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCGTATGTAAGTTATTAGATAAAG--AATGGGG-----A----G---TACTAAAAGGACAAGAAAAG-CCCACCT-----AAATTTAAAAAGAGAAAGACATG---CTGAAACTT-AGAGCCAAtgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
gi|31 : AATA-------T-ATTATT-CCACAAAATTTGCGAAATA--TA-ATT--AT----TTTT-T--T-CAATAACGTACATC-AAGAATACAAGCAAAA-ATGTA---------TTTATAATTAATTTT-----AA----CGT-ATTATTCTTC-----AAA--TGCATTCTTTTCAA
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : TCAGGGCTCACGCTGTCGG-TCGCCAA-AGGCGCCA------ANTGCGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAGCTCTTCATTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATGGATACCACCTGTCCGATAGCTGGTGGACACGAA---CGCACTGAACCGCGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-TTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAC---------GA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATNACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TNTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCAAAGAANTAATGAATG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGCGTATA--CA--AAACCATTTCCT-C-T-TG-T--TTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAANGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAATA--TA-GTTA-A----TTTTTTT-CAATAACATACGTT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGA----GGG--G---TA---CCGAGCGGACAA-AAAAA-TCCACCTAAATCTAAAAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
Reference ( family-2293 ) : TCAGGGCTCACGCTGTCGG-TCGCCAA-AGGCGCCA------ANTGCGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAGCTCTTCATTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATGGATACCACCTGTCCGATAGCTGGTGGACACGAA---CGCACTGAACCGCGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-TTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAC---------GA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATNACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TNTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCAAAGAANTAATGAATG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGCGTATA--CA--AAACCATTTCCTNC-T-TG-T--TTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAANGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAATA--TA-GTT--A----TTTTTTT-CAATAACATACGTT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGA----GGG--G---TA---CCGAGCGGACAA-AAAAA-TCCACCTAAATCTAAAAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|15 : tacagACTATTTTTAAAAGGGTAATCTATTGTTA--------CCAGTGAAATATGATATAATTTTTTTCAAATAGGAAGATA-AATCCATTCtaggaagataaatccattc
gi|16 : tacaggacaccttattggggtttcctaatctgttaattgtttatcatggtgttatgtctttataattaggaggaacaattatatattaagttataaataaatgagtgacaaatatatttgttttctgctgcgtcagtttcaaaaaatttaattttggctagcttcaagataaatatagattatttcatggatgtttgctgagtgtatttttatgtgcaagtttTATTTTGTATTGACAGTACATGCATAATTTAAAACCGAATATGC--ACA-----ATTCAACTTTTACAGC---TG-TTGGTTGCTTTATTTATGAAGATCTATAAT---TTCATTCATTAA-----CACAAACTATGCACACTTGTCCTGTGAAAAAGTGAAAA--TTTGATCAAGACAATGCAAAATATCAA--AGACAATT--TGTAAGTAAAT--------AA-AACAAG-----AT-TTTAGAAA-------AAG-G---TT--------------GTCTCAATAACTCATAAACAAA-CTACAAAGGACAAATGATTG--AAAAAGCAGTCCAAATGGTTTATT--TACAT
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gi|25 : aTTATA-----------------ATAAGTGTTAAGCACATATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCTGAAAAATTTAAACTTTATAAGATTTGCTCCAAGAT----ATACATATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGATAAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTCAGA----TCAATTTA--ttaagcacatataagtttgtattctgtttgttaaggtcctgaaaaatttaaactttataagatttgctccaagatatacatatatatttttttatgaattaggaaactttgataaagtgtgttttgttatgtgcattttccctaattcagatcaattta
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Reference ( family-2293 ) : TCAGGGCTCACGCTGTCGG-TCGCCAA-AGGCGCCA------ANTGCGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAGCTCTTCATTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATGGATACCACCTGTCCGATAGCTGGTGGACACGAA---CGCACTGAACCGCGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-TTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAC---------GA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATNACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TNTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCAAAGAANTAATGAATG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGC--GTATA--CAAAACCATTTCCT--C--T-TG-T--TTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAANGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAA----TATAGTT-AA---TTTTTTTCAATAACATACGTT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGA----GGG--G---TA---CCGAGCGGACAA-AAAAA-TCCACCTAAATCTAAAAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
gi|1 : CAGGGCTCACTCTGTCAG-TCGCCAA-A--------------ATGCGATA-AAAAAAT------GGTGTATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCAAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGTCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGGTTT--TTTCATAAAGTAGCTCTACATTGTCCTTAATTTTCGATCATAAAGT-GT--CTCCATGGATTCCACCTGTCTGATAACTGGTGGACAATAA---CGCACTGAACCATGAATTACCCA---TGCG-CTCATATATGACACCTAATTGCTTTTT-CCTAATCCGTTTAT-T-GTTCGTATC-T---------------------ATAACTAG----TGGTAACAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGAT--TAGGCAAAGAT------GTATTCTGTT-TGT-TACGGTCCCGAAAATTTTAAACTC-----GATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATAGA---T--TTTTTTTTAT-AAATTTGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----GCAAATTA--ACTAC---------AA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATGACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAAACATTTATTTGGAATTGATGACGCATGTGCAATTTGAAAATGAATTTGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAATGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-AAAA-----CAT------------------TG------TCTGACCAA---------------------GACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------AAATTTCGGAAA-----AAAACT---TT--------------GTCTCAATATATTATGTGAAAA-CATCAAAGAATTATTGAAAG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGT--GCATA--CAAAACCATTTCCT--C--T----T--TTGTTT-ATC--AAATTACCAG-----------GATGTTG---------------GATTGCACTAAAAGTCAGCACCTTTTT--TTTTATTGGAGTGTGGCTCTGTTAATGATTCTTGCAATAA----TGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTATGGAAGTG-GGC-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTTAGAAA----AATAGTC-AA---CTTTTTTCAATAACATACATT-AAGAATACAAGCAAAA-CTGTA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGATTG-GAA--G---TA---CCGAGTGGACAA-AAAAG-TCCACCTTAATCTAAAAAGAGAAATACATA---CTGAAACTT-GAAGCCAATGAA
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gi|11 : TTTAAATCTGTAATAATTTTAAAAGACACAACAGACAAAAAAAA-------T-ATTGTG-TAA-AAAATTTGAGAAC----TAAAGTT-AA---TTTTCTTCAATAACATACATT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATATAAATGTAGTTTAT-ATTTATTTT-----GG----AGT-AACATTCTTCTTAAGAATTCTACA---TTTTC------AAGCTATTAAATAAAGA----GGG--G---GAGTTCCAAACAGACAA-AAAAAGCCCACCCAAATTTAAAAAGAGAAAGGCATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|13 : AAAATTAACATTGAAAGTATATT-TTC---AATTGATACTAATGTTGAAGGACACAAAAAAATAAACATACTGTTTTT-ATTATT-TAACACCATTTGTGAAA----AAAAGTC-AT---TTTTTTTCAATAATATATATTTAAGAATATATGAAAAAGATAGA---------TT------------------AA----GGT-AACATTATTCTATGGAATTCTATA---TTTC-------AAGCTATTATATAAAGA----GAG--GAAGGA---CCGAAAGCACAT-CAAGA--------AAATTTAAAAAGAGAAA---ATAACTTTGAAACTT-AGAGCCAATGAAGtcaagttggctccaatgtcataaatttggctccgattttctcaatgggcgaatgtgttggagacaagattttttttcagccaatggt
gi|15 : GACACCTTATTGGGGTTT-CCTAATCTGTTAAT-T-GTT--TATCAT---GGTGTTATGTC----TTTATAATTAG----GAGGAACAATT-ATATATTAAGTTATAA----------------ATAAAT--GAGTGACAAATATATTTGTTTTCTGCTGCGT-CA--GTTTCAAAAAATTT-AATTTT----GGCTAGCTTCAAGAT----AAAT--ATAGA---T--TATTTC--AT-GGAT--G-----TTTGCT-GAGTGTATTT--TTATGTGC-AAGTTTACTATTTTTAAAAGGGTAATCTATTGTTAC---------CAGTGAAAT---ATGATATAATTTTTTTCAAAtcaagttggctccaatgtcataaatttggctccgattttctcaatgggcgaatgtgttggagacaagatttttttcagccaatggt
gi|15 : tacagACTATTTTTAAAAGGGTAATCTATTGTTA--------CCAGTGAAATATGATATAATTTTTTTCAAATAGGAAGATA-AATCCATTCtaggaagataaatccattc
gi|16 : tacaggacaccttattggggtttcctaatctgttaattgtttatcatggtgttatgtctttataattaggaggaacaattatatattaagttataaataaatgagtgacaaatatatttgttttctgctgcgtcagtttcaaaaaatttaattttggctagcttcaagataaatatagattatttcatggatgtttgctgagtgtatttttatgtgcaagtttTATTTTGTATTGACAGTACATGCATAATTTAAAACCGAATATGC--ACA-----ATTCAACTTTTACAGC---TG-TTGGTTGCTTTATTTATGAAGATCTATAAT---TTCATTCATTAA-----CACAAACTATGCACACTTGTCCTGTGAAAAAGTGAAAA--TTTGATCAAGACAATGCAAAATATCAA--AGACAATT--TGTAAGTAAAT--------AA-AACAAG-----AT-TTTAGAAA-------AAG-G---TT--------------GTCTCAATAACTCATAAACAAA-CTACAAAGGACAAATGATTG--AAAAAGCAGTCCAAATGGTTTATT--TAC--AT
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gi|25 : aTTATA-----------------ATAAGTGTTAAGCACATATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCTGAAAAATTTAAACTTTATAAGATTTGCTCCAAGAT----ATACATATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGATAAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTCAGA----TCAATTTA--ttaagcacatataagtttgtattctgtttgttaaggtcctgaaaaatttaaactttataagatttgctccaagatatacatatatatttttttatgaattaggaaactttgataaagtgtgttttgttatgtgcattttccctaattcagatcaattta
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gi|3 : gccaatggctatatggcctgatttgttcataaagtaactattcatagtccttaactgtcgatcataaagtgtgtctccatagataccacatgtctgatagctagagggacaaatgcactgaaccgtgaattacccatgcggtcatttatgacatgtaattgcgttttcctaatctgtttattgtttgtatctcgaggtgttatggttttataattagtggtagcaacagtgtattaacttattcatagcttaatcacagataagtttgtattctgtttgttaaggtcccgaaaaatttaaacttgacatgattcgctccaagataaacttttgagaattaggcaactttggtcaagtgtgttttgttacgtgcattttccctaatttcaatcaatttaactatgaaaaataaaatgatccaattgttatgaaaagctagccaccagtgaactattacagaagtttcgctaacaggaagatgcaatttattaaaaaatcaaccatttatttggtattgatggcgcatgcgcaatttgaaaatgaatatgcacaatctaaattttacagcgagcgattggttgctttgtttatgatgatgttacttgtctgaccaaacactgaaaatgtgttcaagataatatcacggacatttaacaaaagtaaataaaacaaatatttaggaaacaagtttgtctcaatatattatgagaaaacattaaagaaataatgaatgaaaacacacttaaaatggtttatttggataaacaaatccatttcctactatgtttgtttcatcaaattgccaggatgttgccaggatgttgggttgcactaaacgtcggcacctttcttttcggagtgcggctccgttAGAA-ATATA---------GTTGT-GTTTTTTTTTCAATAACATCGTT-TACATTCTTTTTTAGAAATCTACA---TTTTTAAATGTAAGATATTATATAAAGAT---GGGAAG---TA---CTGAGCAGACAA-AAAAA-TCCGCCTAAATCTAAAAAG---AATATAGA---CTGAAACTT-AGATTCAATGAtacattcttttttagaaatctacatttttaaatgtaagatattatataaagatgggaagtactgagcagacaaaaaaatccgcctaaatctaaaaagaatatagactgaaacttagattcaatgatgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
gi|30 : gccaatggctatatggcctgatttgttcataaagtaactattcatagtccttaactgtcgatcataaagtgtgtctccatagataccacatgtctgatagctagagggacaaatgcactgaaccgtgaattacccatgcggtcatttatgacatgtaattgcgttttcctaatctgtttattgtttgtatctcgaggtgttatggttttataattagtggtagcaacagtgtattaacttattcatagcttaatcacagataagtttgtattctgtttgttaaggtcccgaaaaatttaaacttgacatgattcgctccaagataaacttttgagaattaggcaactttggtcaagtgtgttttgttacgtgcattttccctaatttcaatcaatttaactatgaaaaataaaatgatccaattgttatgaaaagctagccaccagtgaactattacagaagtttcgctaacaggaagatgcaatttattaaaaaatcaaccatttatttggtattgatggcgcatgcgcaatttgaaaatgaatatgcacaatctaaattttacagcgagcgattggttgctttgtttatgatgatgttacttgtctgaccaaacactgaaaatgtgttcaagataatatcacggacatttaacaaaagtaaataaaacaaatatttaggaaacaagtttgtctcaatatattatgagaaaacattaaagaaataatgaatgaaaacacacttaaaatggtttatttggataaacaaatccatttcctactatgtttgtttcatcaaattgccaggatgttgccaggatgttgggttgcactaaacgtcggcacctttcttttcggagtgcggctccgtttatgattgttgcaataacgT-----AA----GGTTAACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCGTATGTAAGTTATTAGATAAAGAATGGGGA--G---TA---CTAAAAGGACAAGAAAAG-CCCACCTAAATTTAAAAAGAGAAAGACATG---CTGAAACTT-AGAGCCAAtgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
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gi|17 : GAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTAT-AAACCAATAATAACTTTAAAAGACACAAA-GATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATATGAGAAA----TGTAGTT-AA---TTTTTTTCAATAACATTCATT-TAGAATACAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTATCTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGtaataaa
gi|18 : ttcttgttggatgtctgacatatggAGTAGCATTTCATTTTCCTTAACACTCGATCAAACAGT-GT--CTCCATGGATACAACCTGTCGGTTAGCTGGTGAACATGGA---TGCACTGAACCGTGAATTACTCAAGTTGTGTGTCGTACATGgagtctgttaaattttgaaagaa
gi|19 : TTACAATAATAATCAGTAATGTTTTAGTT---GTGGAGTGCGGCTCTGTTAATGATTCTTGCAATAA----TGGGAT-TTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TT--TAAATCAATAATAGCTTTAAATGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTTAGAAA----TATAGTT-AA---TTTTTTTCATTAACtgtgcgtttatattgcaacaaatatatgttaggaaatttgttatataatggaatatctaatatttgtacacagcatagagttatgttgaacacagataatgggtatacattctgttatgt
gi|2 : atcagagctcagtcagaaagcaaagttttactgggatcaacTCAGGGCTCACGCTGTTGG-TCGCCAA-TGGCGACA------AATGTGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCTAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTTTACGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAACTCTTCACTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTTCATTGATACCACCTGTCCGATAGCTAGCGGACATGAA---CACACTGAACCGCGAATCACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTATGTTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATGATTAG----TGGTAACAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATCAGTCTGTATTCTGTT-TCT-TGAGGTCTCAAAAAATTTAAACTTTACAATATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTCATTATGTAC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--A-TAC---------GA--CAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------ATA--GCCA--------CCAGAGAAAAATAACAGAA-TTTTCACTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----CTCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTG-TTATGACAA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TTTGTTCAATAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----TAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCGAAGTATCAATGAATG--AAAACAAAGTTAAAA-----------------TATA--CAAAACCATTTCCT--CCTT-TGTT--TTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGTTCCGTTAATGATTATTGCAATAA----CGGGACGTTTTAGGGTTTACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGATACAAAAGATAAAAGATG-------T-ATTATT-CAGTAAAATTTTAGAAA----TATAGTT-AA----TTTTTTCAAAAACAT-CGTT-AAGAATACAATCAAAT-ATATA---------TTTAT-ATTTACTTT-----AA----GGT-AATATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATAC------------------TA---CTGAGTGGACAA-AAAAA-TCCACCTAAATCTAAAAAGAGAAATACAGA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
gi|20 : TTAGGGCTCACACTGTCGG-TCGTTAA-AGG----ATATTTTATTGCGGTT-AAACAATAAAAATGGCGCGTTT---TT-TT--TTT-CAGGTT-TGCAAA-AGTAATTGGCGCTAACAAAATATGCCAAT----A--TATT-TAGTTATATGTTCAAG------GTTTATAAAGTAGCACTTCATTGTCCATAACTTTTGGTCATATAATGGTATTTCCATGGATACCGCCTGTC
gi|21 : CAGAGCTCATGCTGTCGA-TTACCAA-TGATGCCA------TATGTGATA-AAAAA-TCAAAGTGGCGCATGT---TTCTT--T---CAATTA-GGTGAA-AGTAATTGGTGACATCAAAATATGCCAAT----A--T-TTCTAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAACTCTTCATTGTCCTTAACTTTTGATCATAAAGT-G----TCCATGGATACAACCTGTCC
gi|22 : agCAGGGTCTACGCTGTCCG-TAGGCAA-AAACGCCA------ACTGCAATA-AAAAATTAAAA-TGGC-TATGT---TTCTT--T---CAGTTTTGGCAAA-TGTAATTTTCTCCATCAAAATA-------------------TA-CTAAGTGGTTGTGTTTTCAGTTCA----GTG-----TCATGGT--------TT--ATTAT------GCGGCTCCACGGATACCA--TGTCAGATAGCTGATCGACA
gi|23 : taattagctagaatcAATGAATG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGCATATATA--TAAAAACATTTC----C--T-TC-T--TTGTTTCACC--AAATTGCCAG-----------AATGTTA---------------AGTTGTACTTAAAGATGGCACCTTT-T--TA---TTGGAGTACGGCTCCTTTTATGATTCTTGCAATAA----TGGGACATTTAAGGGTTCACTTTAAATTTACAGTGGTAGTGTTTT-TTt
gi|24 : atgCAGGACCTACACTAGTGC-TCATCAATATG-GCCA------ACTGCAAAA-ATGAAATGAAAGTGGTTCATGT---TT-TT--TTTTCTGTTT-AGCAAA-AGAAATTTGTGCAAACAAAATAAGCCTGT----GGTT-TT-CA-----ATGTC--TGAGGT--GTT--TAAAATACATATTCCTTTTCCTTAACATTTGATCATA
gi|25 : ATT-TCGAGATGTTATGGT----TTTATAATAAG----TGtctatctgtctagtgatactat
gi|25 : aTTATA-----------------ATAAGTGTTAAGCACATATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCTGAAAAATTTAAACTTTATAAGATTTGCTCCAAGAT----ATACATATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGATAAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTCAGA----TCAATTTA--ttaagcacatataagtttgtattctgtttgttaaggtcctgaaaaatttaaactttataagatttgctccaagatatacatatatatttttttatgaattaggaaactttgataaagtgtgttttgttatgtgcattttccctaattcagatcaattta
gi|26 : aatttcgagatgttatggtt-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAA---AC-------TTAAATGTAAGATGT---ATAATGA----CGT--GAATTA---CTGAGCAGACAA-AAAAAGTCCACCTAAATCTAATAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-GGAACCAAGGAAG
gi|27 : TTTTAGGGTTCATTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTTTTATTTTTAAATCAATAATAATTTTAAAAGACACAAAAGATAAAAAA-A-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAATAATTATATTA-AA---TTTTCATCAATAACATACACT-AAGAATAAAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-Atcaagttgactccaaaatcttaaatttcttttctcagttg
gi|28 : tgTCTGGGCCTACACTGTCGG-TCACCAA-AGGCACCA------AATGCAATA-AAAAAATAAATGTGGCGCAAGTTTATT-TT--T---AATTTT-GGCAAA-AGTAATTGGCACCAAAAAGATATGCCAATGGTCA--TATT-TAGTCATATG
gi|29 : atttaaaacataactgGTTCGTAT----AAACCGTTATTATCTTTTTTATAATTAGGAATTATTA-CAACA-ATGTATTAAGTAA-AA----------------ATAGAT--AATCTACAGATAAATTTGTATTCTGTTGTGT-CA--GTCCTGAAACGTTT-AATTCTACAAAACGCGTTT--AGAT----tca
gi|3 : GCCAAT----G---------GCTATATGGCC-TGATTT--GTTCATAAAGTAACTATTCATAGTCCTTAACTGTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATAGATACCACATGTCTGATAGCTAGAGGG-ACAAA---TGCACTGAACCGTGAATTACCCA---TGCG-GTCATTTATGACATGTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-T-GTTTGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATTC----------------ATAGCT--TAATCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTGACATGATTCGCTCCAAGAT----AAAC---------------TTTT--GA-GAATTAGGCAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTACGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAT---------GA--AAAATAAAATGATCCAATTGTTATGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAACTATTACAGAA-GTTTCGCTAACAGGAAGATGCAATTTATTAAAAA-ATCAACCATTTATTTGGTATTGATGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCGAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGATGA--TGTTAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TGTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTTAACAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATATTATGAGAAAA-CATTAAAGAAATAATGAATG--AAAACACACTTAAAATGGTTTATT--TGG--ATAAA--CAAATCCATTTCCTA-C--TATG-T--TTGTTTCATC--AAATTGCCAGGATGTTGCCAGGATGTTG---------------GGTTGCACTAAACGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTTATGATTGTTGCAATAA----CGAGAAAT
gi|3 : TA-------TGATTGTTGCAATAA----CGAGAAA----TATAGTT-GTGTTTTTTTTTCAATAACAT-CGTT-atagttgtgtttttttttcaataacatcgtttacattcttttttagaaatctacatttttaaatgtaagatattatataaagatgggaagtactgagcagacaaaaaaatccgcctaaatctaaaaagaatatagactgaaacttagattcaatgatgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
gi|3 : gccaatggctatatggcctgatttgttcataaagtaactattcatagtccttaactgtcgatcataaagtgtgtctccatagataccacatgtctgatagctagagggacaaatgcactgaaccgtgaattacccatgcggtcatttatgacatgtaattgcgttttcctaatctgtttattgtttgtatctcgaggtgttatggttttataattagtggtagcaacagtgtattaacttattcatagcttaatcacagataagtttgtattctgtttgttaaggtcccgaaaaatttaaacttgacatgattcgctccaagataaacttttgagaattaggcaactttggtcaagtgtgttttgttacgtgcattttccctaatttcaatcaatttaactatgaaaaataaaatgatccaattgttatgaaaagctagccaccagtgaactattacagaagtttcgctaacaggaagatgcaatttattaaaaaatcaaccatttatttggtattgatggcgcatgcgcaatttgaaaatgaatatgcacaatctaaattttacagcgagcgattggttgctttgtttatgatgatgttacttgtctgaccaaacactgaaaatgtgttcaagataatatcacggacatttaacaaaagtaaataaaacaaatatttaggaaacaagtttgtctcaatatattatgagaaaacattaaagaaataatgaatgaaaacacacttaaaatggtttatttggataaacaaatccatttcctactatgtttgtttcatcaaattgccaggatgttgccaggatgttgggttgcactaaacgtcggcacctttcttttcggagtgcggctccgttAGAA-ATATA---------GTTGT-GTTTTTTTTTCAATAACATCGTT-TACATTCTTTTTTAGAAATCTACA---TTTTTAAATGTAAGATATTATATAAAGAT---GGGAAG---TA---CTGAGCAGACAA-AAAAA-TCCGCCTAAATCTAAAAAG---AATATAGA---CTGAAACTT-AGATTCAATGAtacattcttttttagaaatctacatttttaaatgtaagatattatataaagatgggaagtactgagcagacaaaaaaatccgcctaaatctaaaaagaatatagactgaaacttagattcaatgatgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
gi|30 : gccaatggctatatggcctgatttgttcataaagtaactattcatagtccttaactgtcgatcataaagtgtgtctccatagataccacatgtctgatagctagagggacaaatgcactgaaccgtgaattacccatgcggtcatttatgacatgtaattgcgttttcctaatctgtttattgtttgtatctcgaggtgttatggttttataattagtggtagcaacagtgtattaacttattcatagcttaatcacagataagtttgtattctgtttgttaaggtcccgaaaaatttaaacttgacatgattcgctccaagataaacttttgagaattaggcaactttggtcaagtgtgttttgttacgtgcattttccctaatttcaatcaatttaactatgaaaaataaaatgatccaattgttatgaaaagctagccaccagtgaactattacagaagtttcgctaacaggaagatgcaatttattaaaaaatcaaccatttatttggtattgatggcgcatgcgcaatttgaaaatgaatatgcacaatctaaattttacagcgagcgattggttgctttgtttatgatgatgttacttgtctgaccaaacactgaaaatgtgttcaagataatatcacggacatttaacaaaagtaaataaaacaaatatttaggaaacaagtttgtctcaatatattatgagaaaacattaaagaaataatgaatgaaaacacacttaaaatggtttatttggataaacaaatccatttcctactatgtttgtttcatcaaattgccaggatgttgccaggatgttgggttgcactaaacgtcggcacctttcttttcggagtgcggctccgtttatgattgttgcaataacgT-----AA----GGTTAACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCGTATGTAAGTTATTAGATAAAGAATGGGGA--G---TA---CTAAAAGGACAAGAAAAG-CCCACCTAAATTTAAAAAGAGAAAGACATG---CTGAAACTT-AGAGCCAAtgcaaagttggctccaaaatcttaaatttggctccaacttttctcagttggtgaatgtgtaggccctgttaaacattacagaaaacaacgagcgtttatttt
gi|31 : AATA-------T-ATTATT-CCACAAAATTTGCGAAA----TATAATT-A----TTTTTTTCAATAACGTACATC-AAGAATACAAGCAAAA-ATGTA---------TTTATAATTAATTTT-----AA----CGT-ATTATTCTTC-----AAA--TGCATTCTTTTCAA
gi|32 : tAAGTCAGCAC-----T--TT---TCAGAGCA----------AGTGATTCTTGCAATAA----CGGGACGTTTTAGGGTTCACTAAGAATTTGCAGTGAAAGTGT-TT-TTTTTAAATTAATAATAACTTTAAAAGACACAAAAGA
gi|33 : ACG-TGTTCG-TCGCCAA-AG---------------ACGAT--AAAAAGT--AAGTGGCTTGTGG---CT-TT--T---CAGTTT-TGCGGA-AGTAATTGACG-TGACAACATA
gi|36 : gggccaaTGTGATA-AAAAAATAAAAGTGGTGCACGT---TT-CT--TAA-CAGTTT-GGCAAACAGTAAa
gi|4 : aatgtcgctttaGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCTTGATTT--CTTCATAAAGTACCTCTTCATTTTCCTTCACTTACGATCATAAAGT-ATGTCTCCATAGATACCACCTGTCCAATAGCTGGTGGACACAAA---TGCACTGAATCGCGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTACGATACTTTATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTA--TTGTTTGTATC-TTGAGGTGTTATTGT----TTTATAATTAG----TAGTAGCAATA-TTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAAGCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTTGCTCC-----------AT--ATTTA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGT--------------TTTTCTCTAATTTCAA----TTTATTTA--ACTAC---------GA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGACAAG------CTA--GCCA--------GCAGTGAAATATTGCAGAA---TTCGCTAATAAG----------------AAGA-TTCAACCATTTCTTTGGTATTGACGGCACATGCGCGATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTAACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGATGA--TGTAAC---TT--GTC--TGAC----C-CGAA-----GAC------------------TGAAAA--TGTGTTCAAGAT-------AATATCAC--AGAAATTTCACAAAAGTAAAT--------AATAACAA------ATATTTAGGAAA-----CAA-------------------------------------GAGAAAA-CATTAAAGAAATAATGAATGAAAAAACACACTTTAAATGGTTTATT--TGA--GTACA--AAAATCCATTTCCTTCT--T-TG-T--TTGTTTCATC--AAATTGCAAG-----------GATGTTG---------------GATTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TTGTAGTACGGCTCCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CGGGACATTTAAGGGTTTACTTAAAATTTAATGTGAAAGTG---T-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGACACAAAAG----AAAATA-------T-ATTAAT-CAATAAAATTTTAGAAA----TATAGTTGGG---TTTTTTTCAATAACAT-TGTT-AAGAATACAATCAAAG-ATATA---------TTTAT-ATATATTTT-----AT----AGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAATATATTTTATAAAGAT---GGGTAG---TA---CTGAGCAGAC-A-AAAAA-TCCACCTTAATCT-AAAAGAGAAATACAGA---TTAAAACTTAAGAGTCAATGAAG
gi|40 : cACACTGTTGGGTCACAAA-AAGCACTA------ACTGTAATA-AAAAAATGAAc
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gi|6 : ATTAA--ACTAC---------AA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGACAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATTACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCGAGA-TTCAACTATTTATTTGGAATTTACGGCACATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATTACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAA------------------TGAAAA--TGTGTT
gi|6 : ------ATATTAAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GCCTCAATATCTTATGAAAAAT-TATTAAAGAAATAATGAATG--GAAACAC--TTAAAATGGTTTATT--TGC--ATATA--CAAAATCATTTCCTA-C--TCTA-T--TTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGATGCACTAAAAGTCGGCACCTTTTT--TT---TCGGAGAGCGGCACCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CTGGACATTTTAGAGTTTACT------------TAAAAGTGTG-T-TTTTAAAATCAATAATAACTTTAAACGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTTAGAAA----TATAGTT-AA---TTTTTTTCAATACCAT-CGTT-AGTAATACAATCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTAT--------------AGT-AACATTCTTCTTAAGAAATCTACA---TGTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGACAG-GAA--G---TA---CTGAGCGGACAA-AAAAA-TCCTCCTAAATCTAAAAAGAGAAATACAGA---TTGAAACTA-AACGCCAATGAAGatattaaggaaacaagtttgcctcaatatcttatgaaaaattattaaagaaataatgaatggaaacacttaaaatggtttatttgcatatacaaaatcatttcctactctatttgtttcatcaaattgccaggatgttgggatgcactaaaagtcggcaccttttttttcggagagcggcaccgttaatgattcttgcaataactggacattttagagtttacttaaaagtgtgtttttaaaatcaataataactttaaacgacacaaaagataaaaaatatattattcaacaaaattttagaaatatagttaatttttttcaataccatcgttagtaatacaatcaaaaatatatttatatttatagtaacattcttcttaagaaatctacatgttcaaatgtaagatattatataaagacaggaagtactgagcggacaaaaaaatcctcctaaatctaaaaagagaaatacagattgaaactaaacgccaatgaagccaagttggctccaaaatcttaaaattggctccaacttttctccgttggtgacaagattttttcagccagagcag
gi|7 : attaaactacaaaaaataaaatgatccaactgttttgacaagctagccaccagtgaaatattacagaattttcgctgataggaagatgtaatttattcgagattcaactatttatttggaatttacggcacatgcgcaatttgaaaatgaatatgcacaatctaaattttacagcaagcgattggttgctttgtttattacgatgtaacttgtctgaccaaacaatgaaaatgtgttTCAAGACTCACGCTGTTGG-TCGGTAA-AGGCGCCA------ATTGGGATATAAAAAATAAAAGTGGAGCATGT---TA-TT--T---CAATTT-GGCAAA-AATAGT--G-GCCAACAAAGTGTGCCAAT-------T-TT-TAGTTAAATGGCCAAG------GTTTATAAACTAGCTCTTTATTTTCCTTGACTTTTGACCATATAGT-GTGTCTCCTTGGATACCACCTGTCCGATAGCTGGTGGACACAAAGATCGCACTGAACTGTGAATTATCCT---TGCG-ATTGTT--TGACACCTAATTGTGTTTT-CTTAATCCCTTT-C-TTGTTTGCATC-TTGAGGTGTGACGAA----TTT-TAAATAG----TAGTAACAACACTTGTATTAACTTATACTTTGTAGTATATATATATAGAT--TAGACACAGATAAATTTGAATTCTGTT-TGTGTCA-GTCCCGAAAAATATAAATTCTATAAGACTCGCGTCAAG-TCCCGAAAA--ATATA---ccaagttggctccaaaatcttaaaattggctccaacttttctccgttggtgacaagattttttcagccagagcag
gi|7 : actaaaatatttgatatGT-CAAG-TCCCGAAAAATATAAGTTCTATAAGACTCGCGTCGATAT----AAAC--ACAGATT-T--TTTTTT--ATAAAATTAAAAAAA-TTGATCAACTGTGTTTTCAAATG-GCTATT-----TAACTACGA------AA---A--ACTACATTAAAATTGG--AAAATACAATGATGCAGCTGTTTTGAAAAA------CTA--Gagttctataagactcgcgtcgatataaacacagatttttttttataaaattaaaaaaattgatcaactgtgttttcaaatggctatttaactacgaaaaactacattaaaattggaaaatacaatgatgcagctgttttgaaaaactag
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-2293 ) : TCAGGGCTCACGCTGTCGG-TCGCCAA-AGGCGCCAAAT------GCGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAGCTCTTCATTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTCCATGGATACCACCTGTCCGATAGCTGGTGGACACGAA---CGCACTGAACCGCGAATTACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTAT-TTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATAATTAG----TGGTAGCAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATAAGTTTGTATTCTGTT-TGT-TAAGGTCCCGAAAAATTTAAACTTTACAAGATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--ACTAC---------GA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATNACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TNTGTTCAAGAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----CAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCAAAGAANTAATGAATG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGCGTATA--CA--AAACCATTTCCTNCTNTG-TTTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGCTCCGTTAATGATTCTTGCAATAA----CGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAANGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTGAGAAA----TATAGTT-AA---TTTTTTTCAATAACATACGTT-AAGAATACAAGCAAAA-ATATA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGA----GGG--G---TA---CCGAGCGGACAA-AAAAA-TCCACCTAAATCTAAAAAGAGAAATACATA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
gi|1 : CAGGGCTCACTCTGTCAG-TCGCCAA-A--------AT------GCGATA-AAAAAAT------GGTGTATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCAAA-AGTAATTGGCGCCAACAAAATATGTCAAT----A--T-TT-TAGCTATATGGCCATGGTTT--TTTCATAAAGTAGCTCTACATTGTCCTTAATTTTCGATCATAAAGT-GT--CTCCATGGATTCCACCTGTCTGATAACTGGTGGACAATAA---CGCACTGAACCATGAATTACCCA---TGCG-CTCATATATGACACCTAATTGCTTTTT-CCTAATCCGTTTAT-T-GTTCGTATC-T---------------------ATAACTAG----TGGTAACAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGAT--TAGGCAAAGAT------GTATTCTGTT-TGT-TACGGTCCCGAAAATTTTAAACTC-----GATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATAGA---T--TTTTTTTTAT-AAATTTGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTTGTTATGTGC-ATTTTCCCTAATTTCAA----GCAAATTA--ACTAC---------AA--AAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------CTA--GCCA--------CCAGTGAAATATGACAGAA-TTTTCGCTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAAACATTTATTTGGAATTGATGACGCATGTGCAATTTGAAAATGAATTTGC--ACA-----ATCTAAATTTTACAGCAAATGATTGGTTGCTTTGTTTATGACGA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-AAAA-----CAT------------------TG------TCTGACCAA---------------------GACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------AAATTTCGGAAA-----AAAACT---TT--------------GTCTCAATATATTATGTGAAAA-CATCAAAGAATTATTGAAAG--AAAACACAGTTAAAATGGTTTATT--TGTGCATA--CA--AAACCATTTCCTCTTTTG-TTT-----ATC--AAATTACCAG-----------GATGTTG---------------GATTGCACTAAAAGTCAGCACCTTTTT--TTTTATTGGAGTGTGGCTCTGTTAATGATTCTTGCAATAA----TGGGACATTTTAGGGTTCACTAAGAATTTACTATGGAAGTG-GGC-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGACACAAAAGATAAAAAATA-------T-ATTATT-CAACAAAATTTTAGAAA----AATAGTC-AA---CTTTTTTCAATAACATACATT-AAGAATACAAGCAAAA-CTGTA---------TTTAT-ATTTATTTT-----AA----GGT-AACATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATATAAAGATTG-GAA--G---TA---CCGAGTGGACAA-AAAAG-TCCACCTTAATCTAAAAAGAGAAATACATA---CTGAAACTT-GAAGCCAATGAA
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gi|13 : AAAATTAACATTGAAAGTATATT-TTC---AATTGATACTAATGTTGAAGGACACAAAAAAATAAACATACTGTTTTT-ATTATT-TAACACCATTTGTGAAA----AAAAGTC-AT---TTTTTTTCAATAATATATATTTAAGAATATATGAAAAAGATAGA---------TT------------------AA----GGT-AACATTATTCTATGGAATTCTATA---TTTC-------AAGCTATTATATAAAGA----GAG--GAAGGA---CCGAAAGCACAT-CAAGA--------AAATTTAAAAAGAGAAA---ATAACTTTGAAACTT-AGAGCCAATGAAGtcaagttggctccaatgtcataaatttggctccgattttctcaatgggcgaatgtgttggagacaagattttttttcagccaatggt
gi|15 : GACACCTTATTGGGGTTT-CCTAATCTGTTAAT-T-GTT--TATCAT---GGTGTTATGTC----TTTATAATTAG----GAGGAACAATT-ATATATTAAGTTATAA----------------ATAAAT--GAGTGACAAATATATTTGTTTTCTGCTGCGT-CA--GTTTCAAAAAATTT-AATTTT----GGCTAGCTTCAAGAT----AAAT--ATAGA---T--TATTTC--AT-GGAT--G-----TTTGCT-GAGTGTATTT--TTATGTGC-AAGTTTACTATTTTTAAAAGGGTAATCTATTGTTAC---------CAGTGAAAT---ATGATATAATTTTTTTCAAAtcaagttggctccaatgtcataaatttggctccgattttctcaatgggcgaatgtgttggagacaagatttttttcagccaatggt
gi|15 : tacagACTATTTTTAAAAGGGTAATCTATTGTTA--------CCAGTGAAATATGATATAATTTTTTTCAAATAGGAAGATA-AATCCATTCtaggaagataaatccattc
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gi|18 : ttcttgttggatgtctgacatatggAGTAGCATTTCATTTTCCTTAACACTCGATCAAACAGT-GT--CTCCATGGATACAACCTGTCGGTTAGCTGGTGAACATGGA---TGCACTGAACCGTGAATTACTCAAGTTGTGTGTCGTACATGgagtctgttaaattttgaaagaa
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gi|2 : atcagagctcagtcagaaagcaaagttttactgggatcaacTCAGGGCTCACGCTGTTGG-TCGCCAA-TGGCGACAAAT------GTGATA-AAAAAATAAAAGTGGCGCATGT---TT-TT--T---CAGTTT-GGCGAA-AGTAATTGGCGCTAACAAAATATGCCAAT----A--T-TT-TAGCTTTACGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAACTCTTCACTGTCCTTAACTTTCGATCATAAAGT-GTGTCTTCATTGATACCACCTGTCCGATAGCTAGCGGACATGAA---CACACTGAACCGCGAATCACCCA---TGCG-GTCGTTTATGACACCTAATTGCGTTTT-CCTAATCTGTTTATGTTGTTCGTATC-TCGAGGTGTTATGGT----TTTATGATTAG----TGGTAACAACA-GTGTATTAACTTATAC----------------ATAGGT--TAGGCACAGATCAGTCTGTATTCTGTT-TCT-TGAGGTCTCAAAAAATTTAAACTTTACAATATTCGCTCCAAGAT----AAAC--ATATA---T--TTTTTT--AT-GAATTAGGAAACTTTGGTCAAGTGTGTTTCATTATGTAC-ATTTTCCCTAATTTCAA----TCAATTTA--A-TAC---------GA--CAAATAAAATGATCCAACTGTTTTGAAAAG------ATA--GCCA--------CCAGAGAAAAATAACAGAA-TTTTCACTGATAGGAAGATGTAATTTATTCAAGA-TTCAACCATTTATTTGGTATTGACGGCGCATGCGCAATTTGAAAATGAATATGC--ACA-----CTCTAAATTTTACAGCAAGCGATTGGTTGCTTTG-TTATGACAA--TGTAAC---TT--GTC--TGA-----C-CAAA-----CAC------------------TGAAAA--TTTGTTCAATAT-------AATATCAC--GGACATTT--CAAAAGTAAAT--------AA-AACAA------ATATTTAGGAAA-----TAAG-T---TT--------------GTCTCAATATCTTATGAGAAAA-CATCGAAGTATCAATGAATG--AAAACAAAGTTAAAA---------------TATA--CA--AAACCATTTCCTCCTTTGTTTTGTTTCATC--AAATTGCCAG-----------GATGTTG---------------GGTTGCACTAAAAGTCGGCACCTTTCT--TT---TCGGAGTGCGGTTCCGTTAATGATTATTGCAATAA----CGGGACGTTTTAGGGTTTACTAAGAATTTACTGTGAAAGTGTGTT-TTTTTAAATCAATAATAACTTTAAATGATACAAAAGATAAAAGATG-------T-ATTATT-CAGTAAAATTTTAGAAA----TATAGTT-AA----TTTTTTCAAAAACAT-CGTT-AAGAATACAATCAAAT-ATATA---------TTTAT-ATTTACTTT-----AA----GGT-AATATTCTTCTTTAGAAATCTACA---TTTTCAAATGTAAGATATTATAC------------------TA---CTGAGTGGACAA-AAAAA-TCCACCTAAATCTAAAAAGAGAAATACAGA---TTGAAACTT-AGAGCCAATGAAG
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gi|21 : CAGAGCTCATGCTGTCGA-TTACCAA-TGATGCCATAT------GTGATA-AAAAA-TCAAAGTGGCGCATGT---TTCTT--T---CAATTA-GGTGAA-AGTAATTGGTGACATCAAAATATGCCAAT----A--T-TTCTAGCTATATGGCCATGATTT--GTTCATAAAGTAACTCTTCATTGTCCTTAACTTTTGATCATAAAGT-G----TCCATGGATACAACCTGTCC
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