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Reference ( gi|2 )            :                                                TGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAAC-----TTTGA---TTTGA-------------G------------------T----AT--------------------------TTTGAATA-----AT---AAA---CCCG-----TA---ATTTTA-----------------ACATTAG--CGATAAACTTTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCA---C---TAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--AAAT-------TGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TT-GG-A-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGG-TAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------AT-T----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATG-A---ATGG-ATTTGT-----T--TCCAGTTT--GTTGA----TAAGTTGATATACACAAAGT-CAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACAAAATTATCTTATTTATAGTTGTATATTATGTACAAGTTTCTGCAGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACACTACAAAATT--A-AGAA--TTCAAAATTTATAAATTGTTTA----CAAGTCTTT---TTTA-----TT-ATA-----TTTGT---TTTATAA----TTGAGAAATGGGTTCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAATTTTATTCATATTATGTGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATAT-ATATTGA-TGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTGTTA-----TATTCTATTCTGTTCTATA------TGCTATTCATTTA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGT--ATT--A-------AATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TT------GG-A-C-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCA-TCA-TTACCGCACGA--TAC-GCACAAAA
gi|1                          :                                                TGTTATGTGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAATACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTCATAATATTTTTGAATAACTGAAAATTA--TGTCATACGGTAAACTTTGATTTGAGTTTTTGAAAAATTACAAATTG------------------TTCAAAA--------------------------TTTAAATATTTTAGT---AAA---CTCG-----TA---ATTCTA-----------------ACATTAT--TGATAAACTTTTCTAGTTCCATTTTTGCATTTTTG---AATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACTTAAATGAGGGTTCAATTTTAGCAATAGAGTCTTGATTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGGGCTTGGCCAGATATAAATAATCAGTTTAATGAAAGATAGTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTACAGATGTACACAATTGGGGTTTCCTGGGATTAATTTAAGTCTAATCGCATTATTTTTATGTAAATGCCCCTTTTTCGCAACTAACACACTATGAAACGATTGGTCAAGAAATCACCCC---TAATTAATATACAGCATTTCATTAGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATAAAAGGTACCTTACTGCAGGTCCAGTCA-CTTAACATCAGTGACA-----CGTTGTA--TT--AAAT-------TGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TT-GG-A-C-TGGAAAAGGACCTCTTTTTA-CTTTTTAGG-TAAGTGAT-----CTTTTCTTGAAGT-----TT-------AT-T----TGTAGATATATTTTATTTTATTTT-AAAATAAATCTTATATCCTACCATAATAAATATACATTGTGACAGTTGAAAGATATATC-----TTAAGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATG-A---AGGG-ATTTAT-----T--TCAAGTTG--GTTGA----TAAGTTGATATATAC-ATGT----AGTCCAAGGTGGTTTAATCAATGAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTAAATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTCAACGAAACAAAATTATCTTATTTATATATGTATATTATGTGCAATCTTCAACAGTACAAAATACCTTTCCGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTTAAAAATATATA--CTCGTAAATTAAAGTTACACAAAATAAAATT--T-ATAA--TTAGAAATTTATAAATTGTTAA----TGAGTTTTT---GTAA-----TT-ATA-----CTTGT---TTTATAA----TTGAGAAATGGATTCTATTGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTGTTATTAATTAAATTGATTCAGTTTTTATGTTAAATTTCAGTGTAATTTGGTGTATTGCTTTTAGA--AAAATAGTCAACAGACTGTGAAGAA---TATT-------TATGTGAGATTGGTTTTGTTTATTACACATTGGATAT--TGTTGA----AAAGTTCATTAATATTTAGTTAGATTGTAATTGTGTTATATTCTATTCTATTCTGTTCTATA------TGCTATTCATTTA---ATAA--GA-CTTATCATCTGTGACT-----CGTTGT--ATT--A-------AATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TT------GG-A-C-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCA-TTA-TTACCGTACTA---AC-G-GCAAAA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatgcggcaaatttcagtaaaatttgtttataatatttgttttgaatcacggaaaaagacgacagatttTCAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--AAGT-------TATGTAAT-AAA-AGT-TT---A-TTTAA-A-C-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCAGCCAT------T----------T-----TT-------AT-ataacattgatgaattgaaata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataactTCA-CTTAGCATATGTGACT-----CGTTGTA--TTC-AAAT-------TGTGAAAT-AAA-ATTATTTTAA-TT-GG-A------AAAAGGAaatgcgatcagcaccaa
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aacgaaacacaagagcatatactttatgggtactgaaagtggtatatatgtacagtctcctgcggtacagaatacctttcatatattttcggtatttgtccctttcggttcgataagtttaattatatattctcgtaaattaaagttacacgaataaattttgtatttttgaaatttataaattgacacaagtgtttgtatttaaactgtgagatttgcttgtttataacaccttgaatattgatgaaaaacacattgctgtttagtttatttttaattgtgatttactctgttctattctacatgcttttaaaataactaCA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTATA--TT--AAATCATGAATTGTATAAT-AAA-TTT-TT---A-TT-GG-A-C-TGAAAAAGGATCTCTTTTTggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacatacattgatatttagtttacttgaaattgtgttctattctgttatatcctatatgttattcatttaatcactgA-CTTAACATCTGTGACT-----GGCTATA--TT--AAAT-------TGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TT-GG-A----AAAAAAAGACCggatcacccaatttatttaccgcacaaagtggcacaaaagtttctttaaaatatccataaga
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aattgaattggttcagctttcgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttgtacaaaaacagtcaacagactgaagaattttattcatattctatgtgaaattggttttgtttataacaccttggatacatattgatgctaaacgcattgaaatttagtttatttgtaattgtgttatattgtattctgttctgtatgctattcatttaacttgTAAT-AAAAGTT-TC---A-TT-AG-AAC-TCGAAAAGGA---CTTTTTTTCTTTTAAGG-TGAGTGAT-----CT----------G-----TT-------TT-TGAAATGTAGATATATTTTAATTTGTGTTAAAATAAA-TCC-ATGTTCTGCCATACTAAGTATACAATGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATTTGTGAG-AGTCAAT-T--------TCAG--CTGTGATATACATGTAGTCATAG-A-CTGT-----TTATTCAATTA--GGTAATTTTTAGGTTTATATattagattatgt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttgttttccagatttaa-GA-A-C-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTTGGA-TCAGT--C-----CA----------T-----TT-------ATAT----CGTAgaatatatttgataatattatttcttttaacaccccagtttccaaaataaacaaaattatatgatagattgattgatttatttattgattgattctttatttactgcatagtacaaatatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctgTTAAA-ATAAATCCATGTTCTGCCATAC-TAAGTATACAATGTGAAAGTT--TAAAAT-AT-ATCTT----------TGGTATTTGTGAGAGT----CAATTTCAGCTG----------TGATATACAT---GT----AGTCATAGACTGTTTATTCAATTAGGTAATTTTTAGGTTTATATGAATATATTTGATAATATTATTTCT-TTTAACACCC-CAGTTTCCAAAATAAACAAAATTATtcaacggcacaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgttttccagatttaataataaaagtttcattagaactcgaaaaggactttttttcttttaaggtgagtgatctgtttttgaaatgtagatatattttaatttgtgAGTGGTATAT-ATGTACAGTCTCCTGCGGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACACGAATAAATT--T-TGTATTTTTGAAATTTATAAATTG-ACA----CAAGTGTTTGTATTTAAACTGTG-AGA-----TTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTG------ATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGatgatagattgattgatttatttattgattgattctttatttactgcatagtacaaatatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aacgaaacacaagagcatatactttatgggtactgaa-AAATTACGTACTCTCGTAAATTAAAGTTAC-CA-TACA-----------------CGGAATTTATAAATTGTC-A----CAAGTGTTT---GTAT-----TT-AAA-----CTTAT---TCTGGTG----GTGAGAAATGGATTCTATGGTAAGATACGATTA--GTTTAGATTAATATTAATTGAAATGATTTAGCTTTTGTGTTTAATTTGCGTTTAATTTtgatttactctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cATTACGTACTCTCGTAAATTAAAGTTACACG------------------------GAATTTATAAATTGTC-A----CAAGTGTTT---GTAT-----TT-AAA-----CTTAT---TCTATTG----GTGAGAAATGGATTCTATGGTAAGATACGATTA--GTTTAGATTAATATTAATTGAATTGATTTAGCTTTTGTGTTAAATTT
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cTTATAAATTATTGATTGTCAAAAGTTT---TGTA-----TT--TAAAAACTTTGA---TT----G----TTGAGA------TTTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAA---TATTTACAACAAATGT-ACAT--------------ACGCTTC---TATGATATTGGTTTGAA-----ATTG-TGTCTATTCTATT--CAATTCCGTTC-----CATTCTA---TGTTGTACA-------GTTA---A--TA---ACTT--CAGCTT-ACATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAA-AGT-TT---ATTT------AA-A-C-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCA-TTT-TTATAATGCGA--TCA-GCACCAA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgttatgcggcaaatttcagtaaaatttgtttataatatgtgtttgaatctcgaaaaaagacgacaaatttcgtttaaatttcgtttataatatctttaaataacagaaaattatgtcatacggtaaactttgatttgagtattttgaaaaattacaaattgtcaaaaatttaaatattttcgtaaactcgtaattttaacataagtgataaatttttctagttcgatatttgcatttttttaatattttcgcagcttgtcgaacatactaattggatcacttaatcactgaattaagggttcaattttagcgatagagtcttgacttaaagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttggccggatattaataatcagtttaatcaaaggtagtcgatacacgtaaattgatgtaacaaaatgttatagatgtacacaattagagtttcccgggattaatttaagtccaatcgcattatttttatgtaaatgtccctttttcgcagctaacacgctatgaaatgattggtcgagaaatcaaccctaattaatatacagcatttcattggcttaaactgacaggaaacttttcattataaaaaatcccttactccaggaccagtcaaaTAAT-AAAAGTT-TC---A-TT------AG-AAC-TCGAAAAGGA---CTTTTTTTCTTTTAAGGtaagtgatcttttcttgaagtttacttgtagatatatgttattttgttttaaaatacatcttatgttttaccatattaattatacagtgtgaaagtttaaaatatatcttttggatatgtgagattaaatttaaagttatcagaattgtatattcatgaattgatttgtttcaagtttgttgatcagttgataaacatgtagtccaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtgaatgttttctctttaacacttgcagtattttaacgaaacaaaatcatgttacttatagttgtatattatttacaatcttctg
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAGAAACTGCCCAAACTGAAATATTTTG----GT---AAACTTGT----AATTCAAACA--TCAGTTCGATgtttctttaaaatatccataaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAG------------------TATTTTGAATAAT---AAACT--T----AATT--------TTAG--CGATAGAGT--------------------------CTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCC---TAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATACAT----GA---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCTTATTTATAGAT----------GTATGTTATGTACAATCTTCAACAGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-------AAATTA-TGTACTC---TCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GG-----AAATTTATAAATTG-TT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAgacttaaagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
gi|6                          : cttcacaaaaattggtttataatatttgttttgaatcacagaaaaaaacgacaaatttcatttaaatttgtttataatattttgaaataactgaaaaaaaaatgtcatactgtcaactttgatttgagtattttgaaaaattacaaataattaacatcagtgataaacttttctggttcgatatttgcattttttaaaataatttcgcagcttgtcgaacatactaatcggatcacttaatctcttaagagttcaattccagcgatagggtcttgacttaaagtaataatccgcaagtgtttttgactggaagagcttggccggatataaattatcagtttaatcaaaggtagtcgatacacgtaaattgatgcaacaccatgttatatatgggtttcctggaattaatttaagcttaatcgcattatttttggtaaaatccactttttcgcagctaacacagtataaaatgattggtaaaaaaatcacccctaattaatattcagcattccattggcataaactgacaagccaattctcattacagaaggtaccttactccaggtccagTGTTTTAAATTATTGAAAATGATGTCATAT---AGTAAAATTT-AATAATAACATTTT-GAAAAATTACAAGTT---TTCCATA-----AGCTT------AAA------------------TATTTCGA----T---AAACTCGT----AAGTTGAACA--TTAG--TGAGATTTT--------------------------TTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT---ATATT--------------------ATCGAAA---ACACT--TATCGTATC-------------------------GGTTAAATTTTAGCGATTGAGTTTTGACTTAAAGCAATT-------------TT-GACTAGAAGAGTTTATCCGGATGTAACTAATCAATTAAATAATTGGTCATCGATACATGTACATTGATGTAACAACATGTTATAGACATACAAAATGAGGGTTTCCTGGGATTGAGTTAAACCAAATGGTATTATTTTAATGTAAACGCCCATTCTTCGCAGTTAACACACTATGGAAAGATTGGTCA------TATCGCCCCTAATTAGTACGTACCATTTCATTGGCTTAAACTTACAGGACACTTTTTATTATATACGGTACCTT-CTCCGGTTCCAATCAGTTAACATCTGTGAC-------ATT--AAATTGTAGAATAAAA-GTT-TT---ATTTGGA-C-TGGAAAAAGAAC--------TCTTTCTAGATATGCGGT-----AT----------T-----TTCTTGAAAATTTAA-TGTAAATATATGTTGGTGTGTTTCAAAAAAAAATC-TAGGGTCTGCCATTATGAATATATAGTGGGAAAG--TAAT-GTAAATC-----TTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTTTCGTTTC---AAGCTTGTTTACAAATTGTCGTAC-CGGGTAGTAATTTA--GTC-------------CAAA------ACT-------G-----TT-ATGTTATAAATT-ATTGATTG-TC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATATACTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTACAGTCTCCTGCGGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-------TAATTA-TATATTC---TCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G------AAATTTATAAATTG-AC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aacgaaacacaagagcatatactttatgggtactgaaagtggtatatatgtacagtctcctgcggtacagaatacctttcatatattttcggtatttgtccctttcggttcgataagtttaattatatattctcgtaaattaaagttacacgaataaattttgtatttttgaaatttataaattgacacaagTTGTTTTCCAGATTTAATAAT-AAAAGTT-TC---A-TTAGAAC-TCGAAAAGGAC---TTTTTTTCTTTTAAGGTGAGTGAT-----CT----------G-----TT-------TTTGAAATGTAGATATATTTTAATTTGTGTTAAAATAAA-TCC-ATGTTCTGCCATACTAAGTATACAATGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATTTGTGAG-AGTCAAT-T--------TCAG--CTGTGATATACATGcaaattcattgcgtgaatgaaatg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAGAAACTGCCCAAACTGAAATATTTTGGTAAACT---TGT----AATTCAAACA--TC--AGTTCGATgtttctttaaaatatccataaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttcaattttttagtaataaagttttttaaagggggtgtag-AAATTACGTACTCTCGTAAATTAAAGTT--ACCA--T-A--CA-------------------------C-G-GAATTTATAAATTGTC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CT-TA---TTCTGGTGGTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGATACGATTA--GTTTAGATTAATATTAATTGAAATGATTTAGCTTTTGTGTTTAATTTGCGTTTAATTT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTCTAT---AAGTTTTTTTTATTTA-TA--TA---ATTTT-CA-CTTAGCATATGTGACT-----CGTTGTA--TTC-A-------AATTGTGAAAT-AAAATTATTTTAATT------GG-A-----AAAAGGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCACTTAGCATATGTGACTCGTTGTATTC-AAATTGTGAAAT-AAA-ATTATTTTAA-TTGGA------AAAAGGACtgctcattggaatgtgcaaccaaagcacaaaacttgtttaatatcgagttaaga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tattctataagttttttttatttatataatttATTACGTACTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--G-A----------------------------------AATTTATAAATTGTC-A-CAAGTTTTTGTATTTAAA---CT-TA---TTCTATTGGTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGATACGATAA--GTTTAGATTGTTATTAATTGAATTtgctcattggaatgtgcaaccaaagcacaaaacttgtttaatatcgagttaaga
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGATTTGAGTATTT--------TGAATAAT------AAACC---CGT--AA--TTTTAACA--TT--AG--CGATAAACT----------------------------------TTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCAC-----TAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGG-ATTTGTT----TCCAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---ACAAAG-----TCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACAC--T-A--CAAA------ATT-------AAGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTTA-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTT--------TGAATAAT------AAACT---T------AATT--------TT--AG--CGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCC--TAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---AT---G-----A---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-AAATTATGTACTCTCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GGAAATTTATAAATTGTT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTT--------TGAAAAATT---ACAAAT-----------AATT--AACA--TC--AG--TGATAAACT----------------------------------TTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCC--TAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgTTCGTT----TCAAGCTT-GTTTACAAATTGTCGTACCGGGTA--GTAATTT---AGTCCAAAACTGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctTT-------A-----T----AAATT-ATTGATTGTC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTTatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgTGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G-AAATTTATAAATTGAC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAGAAACTGCCCAAACTGAAATATTTTGGTAAACT---TGT----AATTCAAACA--TCAGTTCGATgtttctttaaaatatccataaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttcaattttttagtaataaagttttttaaagggggtgtag-AAATTACGTACTCTCGTAAATTAAAGTT--ACCA--T-A--CA-------------------------C-G-GAATTTATAAATTGTC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CT-TA---TTCTGGTGGTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGATACGATTA--GTTTAGATTAATATTAATTGAAATGATTTAGCTTTTGTGTTTAATTTGCGTTTAATTT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATTCTAT---AAGTTTTTTTTATTTA-TA--TA---ATTTT-CA-CTTAGCATATGTGACT-----CGTTGTA--TTC-A-------AATTGTGAAAT-AAAATTATTTTAATT------GG-A-----AAAAGGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCACTTAGCATATGTGACTCGTTGTATTC-AAATTGTGAAAT-AAA-ATTATTTTAA-TTGGA------AAAAGGACtgctcattggaatgtgcaaccaaagcacaaaacttgtttaatatcgagttaaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGATTTGAGTATTT--------TGAATAAT------AAACC---CGT--AA--TTTTAACA--TTAG--CGATAAACT-------------------------------TTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCAC----TAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGG-ATTTGTT----TCCAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---ACAAAG-----TCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACAC--T-A--CAAA------ATT-------AAGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTTA-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTT--------TGAATAAT------AAACT---T------AATT--------TTAG--CGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCC-TAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---AT---G-----A---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-AAATTATGTACTCTCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GGAAATTTATAAATTGTT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTT--------TGAA------------------------AAATT---ACA---------AATAA----------T-T-AACA-TCAG--TGATAAACTTTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCC-TAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgTTCGTT----TCAAGCTT-GTTTACAAATTGTCGTACCGGGTA--GTAATTT---AGTCCAAAACTGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctTT-------A-----T----AAATT-ATTGATTGTC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTTatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgTGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G-AAATTTATAAATTGAC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAG---------AAACTGCCCAAACT----GA--AATATTT-------------TGGTAAACTTGTAA-TT-CAAACATCAGTgtttctttaaaatatccataaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGAT---------TTGA-------------------GT--AT--TTTGAATA----------ATAAACCCGTAA-TT-TTAACATTAGCGATAAACTTTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCAC----TAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGG-ATTTGTT----TCCAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---ACAAAG-----TCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACAC--T-A--CAAA------ATT-------AAGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTTA-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT-----AAACT---T------AATT--------TT--AGCGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCC-TAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---AT---G-----A---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-AAATTATGTACTCTCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GGAAATTTATAAATTGTT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTTTGAA-----------------------AAATT---ACA---------AATAA----------T-T-AACATCAGTGATAAACTTTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCC-TAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgTTCGTT----TCAAGCTT-GTTTACAAATTGTCGTACCGGGTA--GTAATTT---AGTCCAAAACTGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tctTT-------A-----T----AAATT-ATTGATTGTC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTTatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgTGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G-AAATTTATAAATTGAC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAG---------AAACTGC---CC---------AAACTGAAATATTTTGGTAAACTTGTAA-TT-CAAACATCAGTgtttctttaaaatatccataaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACCC---GT----AATTT--------------------------T-AACATTAGCGATAAACTTTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCA----CTAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGG-ATTTGTT----TCCAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---ACAAA-G-----TCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACAC--T-A--CAAA------ATT-------AAGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTT-A-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACTT---------AATTT---TA--GCGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCC-TAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---AT----G-----A---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-AAATTATGTACTCTCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GGAAATTTATAAATTG-TT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatgcggcaaatttcagtaaaatttgtttataatatttgttttgaatcacggaaaaagacgacagatttTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATGTGTTT-GAATCTCGAAAAAAGACGACAAATTTCGTTTAAATTTCGTTTATAATATCTTTAAATAACAGAAAATTA--TGTCATACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAAAAATTACAAA-TT---GTCAAAAATTTAAATATTTTCGTAAACTCGTAATTT-T-AACATAAGTGATAAATTTTTCTAGTTCGATATTTGCA-TTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATTGGATCAC----TT--AATCACTGAATTAAGGGTTCAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATTAATAATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGTAACAAAATGTTATAGATGTACACAATTAGAGTTTCCCGGGATTAATTTAAGTCCAATCGCATTATTTTTATGTAAATGTCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATGATTGGTCGAGAAATCA-ACCCTAATTAATATACAGCATTTCATTGGCTTAAACTGACAGGAAACTTTTCATTATAAAAAATCCCTTACTCCAGGACCAGTCAAATAACATCTGTGACTCATTGTATT--TAATTGTATAAT-GAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGGCCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CTTTTCTTGAAGT-----TT-------ACT----TGTAGATATATGTTATTTTGTTTT-AAAATACATCTTATGTTTTACCATATTAATTATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTTGGATATGTGAG-ATTAAAT-TTAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATTG-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATCAGTTGATAAAC---AT----G-----T---AGTCCAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTGAATG-T-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATTTTAACGAAACA--AAATCATGT--T--ACTTATAGTT----------GTATATTATTTAC--AATCTT------CTGataacattgatgaattgaaata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTTTGAAA---------------------AATT-----------ACAAA----TAA-TT---AACATCAGTGATAAACTTTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCC-TAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgTTCGTT----TCAAGCTT-GTTTACAAATTGTCGTACCGGGT--A-GTAATTT---AGTCCAAAACTGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tctTT-------A-----T----AAATT-ATTGATTG-TC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTTatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgTGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G-AAATTTATAAATTG-AC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAG---------AAACTGC---CC---------AAACTGAAATATTTTGGTAAACTTGTAA-TT-CAAACATCAGTgtttctttaaaatatccataaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACCC---GT----AATTT--------------------------T-AACATTAGCGATAAACTTTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCA---CTAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGG-ATTTGTT----TCCAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---ACAAA-G-----TCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACAC--T-A--CAAA------ATT-------AAGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTT-A-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACTT--------AATTTTAG------CGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCCTAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---AT----G-----A---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-AAATTATGTACTCTCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GGAAATTTATAAATTG-TT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTTTGA---------------------AAAATT-----------ACAAA----TAA-TT---AACATCAGTGATAAACTTTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCCTAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgTTCGTT----TCAAGCTT-GTTTACAAATTGTCGTACCGGGT--A-GTAATTT---AGTCCAAAACTGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tctTT-------A-----T----AAATT-ATTGATTG-TC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTTatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgTGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G-AAATTTATAAATTG-AC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAG---------AAACTGC---CC---------AAACTGAAATATTTTGGTAAACTTGTAA-TT-CAAACATCAGTgtttctttaaaatatccataaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACCC---GT----AATTT--------------------------T-AACATTAGCGATAAACTTTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCA---CTAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGG-ATTTGTT----TCCAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---ACAAA-G-----TCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-AAATTATTTACTCTCGTAAATTAAAGTTGCACAC--T-A--CAAA------ATT-------AAGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTT-A-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACTT--------AATTTTAG------CGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCCTAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATGAATGA-ATTTGTT----TCAAGTTT-GTTGATAAGTTGATATAC---AT----G-----A---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-AAATTATGTACTCTCGTAAATTAAAGTC--GCAC--A-AAACAAA------ATTTAATAAAA-----TT-GGAAATTTATAAATTG-TT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTTTGA---------------------AAAATT-----------ACAAA----TAA-TT---AACATCAGTGATAAACTTTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCCTAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgTTCGTT----TCAAGCTT-GTTTACAAATTGTCGTACCGGGT--A-GTAATTT---AGTCCAAAACTGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tctTT-------A-----T----AAATT-ATTGATTG-TC-A-AAAGT-TTTGTATTTAAAAACTT-TG-------ATTGTTGAGA----------T-TTTATGGTAAGATATATATA--GTGTAGATTGTTATTAATTGAATTTACTAATCTTTTTTGTTATATTTCTGTTTAATTTGGAGTATTGCTTTTTTAGTAAAACAGTTTACAAACTGTCAAGAATATTTACAACAAATGTACATACGCTTCTA-----TGATATTGGTTTatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctatgatattggtttgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgTGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-TAATTATATATTCTCGTAAATTAAAGTT--ACAC--GAA--TAAATTTTGTATT-------T-----TT-G-AAATTTATAAATTG-AC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aacgaaacacaagagcatatactttatgggtactgaaagtggtatatatgtacagtctcctgcggtacagaatacctttcatatattttcggtatttgtccctttcggttcgataagtttaattatatattctcgtaaattaaagttacacgaataaattttgtatttttgaaatttataaattgacacaagTTGTTTTCCAGATTTAATAAT-AAAAGTT-TC---A-TTAGAAC-TCGAAAAGGAC---TTTTTTTCTTTTAAGGTGAGTGAT-----CT----------G-----TT-------TTTGAAATGTAGATATATTTTAATTTGTGTTAAAATAAA-TCC-ATGTTCTGCCATACTAAGTATACAATGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATTTGTGAG-AGTCAAT-T--------TCAG--CTGTGATATACATGcaaattcattgcgtgaatgaaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAAA-ATAAATCCATGTTCTGCCATAC-TAAGTATACAATGTGAAAGTT--TAAAAT-AT-ATCTT------TGGTATTTGTGAGAGTCAATTTCAGCTG------TGATATAC---AT----G-----T---AGTCATAGACTGTTTATTCAATTAGGTAATTTTTAGGTTTATATGAATATATTTGATAATATTATTTCT-TTTAACACCC-CAGTTTCCAAAATAAACA--AAATTATATGATAGATTGATTGAT----------TTAT-TTATTGATTGATTCTTTATTTACTGCATAGTACAAAtagtcatagactgtttattcaattaggtaatttttaggtttatatgaatatatttgataatattatttcttttaacaccccagtttccaaaataaacaaaattatatgatagattgattgatttatttattgattgattctttatttactgcatagtacaaatatg


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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaatactgttctgaaaacatgcaaaactgtgaacgacataTGTTATGCGTCAAATTTCATTTATAAAATGTGTTTATAACATTTGTTTTGAATTACTGAAAAAGGCAACAAATTTCATTTTAATTT-ATTTTTGATAGTTTTGAATAACTGAAAATTA--CATCATACAGTAAACGGTGATTAGAG---------AAACTGC---CC---------AAACTGAAATATTTTGGTAAACTTGTAA-TT-CAAACATCAGTgtttctttaaaatatccataaga
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c------GA-AC-TGGAAAAGGACCTGTTCTTATCTTTTT-GGATCAGTCCATT--TATATCGTATCA-A-CGGCACAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTGAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACACATTTTATTTAAATTT-GTTTATAATGTTTTCGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACAGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACCC---GT----AATTT--------------------------T-AACATTAGCGATAAACTTTTCTAGTTCGATATTTGCATTTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCACGTAAACAAGGGTTCAATTTTAGCGATACAGTCTTGACTTAAAGTAATTATTCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATAATTAGTTTAATTACAGGTATTCGATACACGTAAATTGATGTAACAACATGTTATAGATGTACAAAATTGGGATTTCCTGGAATTAGTTTAAGCTTAATCGCATTAGTTTTATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTTATACGCTATGAAATGATTGGTCAAGAAATCA---CTAATTAATATACAGCATTCCAATGGCTTAAACTGACAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGTTGTATT--AAATTGTGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGATCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CT----------T-----TT-------ATT----TGTAGATATATGTTATTTTATTTTAAAAAAAAATCTTATGTTCTGCCATAATAAAGATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATATGTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATG-A---ATGG-ATTTGT---T----TCCAGTTT-GTTGA----TAAGTTG--ATATACACAAAGTCAAAGTCGAAGACGGTTTATTCAATTAAGTACTTGTTAGGTTCATATGAACATTATTGTTTATGTT-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAAAGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGTT----------GTATATTATGTAC--AAGTTT------CTGC--AGTACATAATACCTTTCTGGTCTTTTCGGTATTTGTCTCTTTCAGTTCGATAAGTT-------AAATTA-TTTACTC---TCGTAAATTAAAGTTGC-ACACTA---CA-AAA--T---T------A----AGAATTC-A-AAATTTATAAATTGTTT-A-CAAGTCTTTTTTATTATA---TT-TG---TTTTATAATTGAGAA-A---TGGGT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTAGATTATTATTAATTGAGTTGTTTCAGCTTTCGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTATTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGGAGAAT-TTTA---------TTCATA---TTATG---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGATATATATTGATGGAAAACGTATTGATATTTAGTTGATTTGTAATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA---ACTT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGTTGTA--TT--A-------AATTGTGTAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-AC-TGGAAAAGGACCTCTTTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATC--ATTACCGCACGATA-C-GCACAAAA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTATGCGGCAAATTTCA---TTAAAATTTGTTCATAATAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACGGAAAAAGACGACAGATTTTATTTAAATTT-GTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTG--TGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAATAAT---AAACTT--------AATTTTAG------CGATAGAGTCTTGA-CT-T-AA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taTATTTAAATTTGTTTGTAATATTTTTGAATAACTGAAAATTGTGTCGTACGGTAAACTTTGATTTGAGTAT----TTTGAATAA--TAAAC------TTAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGGCGGATATAAATACTCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATCCGCGTAAATTGATGTAACA---TGTTATAGATGTACAAAATTGGGGTTTCCTGGGATTAGTTTATGCCTAATCGCATTATTTTGATGTAGATGCCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATAATTGGTCAAGAAATCACCCCTAATTAATATACAGCATATCATTGGCTTAAACTGATAGGACACTTTTCATTATATAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTCGT---ATT--AAATTATGTAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAATGACCTCTTTTTATCTTTT-AGGTAAGTGATATTTTCT----------TGAAGTTT-------ATT----TGTAGATATGTGTTATTTTGTTTTAAAATAAA-TCTTATGTTCTGCCATAATAAATTTACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATAT------------------GTGAG-ATTCAAT-TGAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATG-A---ATGA-ATTTGT---T----TCAAGTTT-GTTGA----TAAGTTG--ATATACAT---GA---AGTACAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTATATGTT-TTTTTCTTTAACACTTGCAGTATCTTAACGAAACA--AAATTATCT--T--ATTTATAGAT----------GTATGTTATGTAC--AATCTT------CAAC--AGTACAAAATGCCTTTCCGGTCTTTTCGTTATTTGTCTCTTTCGGTTCGATAAGTT-------AAATTA-TGTACTC---TCGTAAATTAAAGTCGC-AC---AAAACA-AAA--T---TTAATAAA----A----TT-GGAAATTTATAAATTG-TT-AACAAGTTTTTGTAATTATA---AT-TG---TTTTAAAATTGAGAA-A---TGGAT-TCTATGGTAAGACGCGAATA--GTTTCAATTAATATTAATTGAATTGATTCAGCTTTTGTGTTAAATTTCAGTTTAATTTGGCGTGTTGCTTTTACA--AAAACAGTCAACAGACTGTGAAGATT-TTTA---------TTCATA---TTCTA---TGTGAGATTGGTTTTGTTTATAACACCTTGGGTATATATTGATGGAAAACATATTGATATTTAGTTTATTTGTTATTGTG-----T----TATATTCTATTCTGTTCTAT---A------TGCTATTCA-TT--TA-----TTAACA-CTTAACATATGTGACT-----CGTTGTA--AT--A-------AATTGTATAAT-AAAGTC-TT---ATTGGCCCGGG-AC-TGGAAAAGGACCTC-TTTTATCTTTTTAGGATCACCCCATT--GTTACCGTGCTA-A-CGGCACAAAAagcaattatccgcaagtgttttgactggaagagcttgggcggatataaatactcagtttaatcaaaggtagtcgatccgcgtaaattgatgtaacatgttatagatgtacaaaattggggtttcctgggattagtttatgcctaatcgcattattttgatgtagatgcccctttttcgcagctaacacgctatgaaataattggtcaagaaatcacccctaattaatatacagcatatcattggcttaaactgataggacacttttcattatataaggtaccttactccaggtccagtcacttaacatctgtgactcgtattaaattatgtaataaagttttattggactggaaaatgacctctttttatcttttaggtaagtgatattttcttgaagtttatttgtagatatgtgttattttgttttaaaataaatcttatgttctgccataataaatttacagtgtgaaagtttaaaatatgtgagattcaattgaaagttatcagaattgtatattcatgaatgaatttgtttcaagtttgttgataagttgatatacatgaagtacaagatggtttattcaattaagtactttttaggttcatatgaacattattgtatatgtttttttctttaacacttgcagtatcttaacgaaacaaaattatcttatttatagatgtatgttatgtacaatcttcaacagtacaaaatgcctttccggtcttttcgttatttgtctctttcggttcgataagttaaattatgtactctcgtaaattaaagtcgcacaaaacaaaatttaataaaattggaaatttataaattgttaacaagtttttgtaattataattgttttaaaattgagaaatggattctatggtaagacgcgaatagtttcaattaatattaattgaattgattcagcttttgtgttaaatttcagtttaatttggcgtgttgcttttacaaaaacagtcaacagactgtgaagatttttattcatattctatgtgagattggttttgtttataacaccttgggtatatattgatggaaaacatattgatatttagtttatttgttattgtgttatattctattctgttctatatgctattcatttattaacacttaacatatgtgactcgttgtaataaattgtataataaagtcttattggcccgggactggaaaaggacctcttttatctttttaggatcaccccattgttaccgtgctaacggcacaaaaataacattgatgaattgaaata
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatgcggcaaatttcagtaaaatttgtttataatatttgttttgaatcacggaaaaagacgacagatttTGTTATGCGGCAAATTTCA---GTAAAATTTGTTTATAATATGTGTTT-GAATCTCGAAAAAAGACGACAAATTTCGTTTAAATTTCGTTTATAATATCTTTAAATAACAGAAAATTA--TGTCATACGGTAAACTTTGATTTGAGTATTTTGAAAAATTACAAA-TT---GTCAAAAATTTAAATATTTTCGTAAACTCGTAATTT-T-AACATAAGTGATAAATTTTTCTAGTTCGATATTTGCA-TTTTTT-TAATATTTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATTGGATCAC----TT--AATCACTGAATTAAGGGTTCAATTTTAGCGATAGAGTCTTGACTTAAAGCAATTATCCGCAAGTGTTTT-GACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATTAATAATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGTAACAAAATGTTATAGATGTACACAATTAGAGTTTCCCGGGATTAATTTAAGTCCAATCGCATTATTTTTATGTAAATGTCCCTTTTTCGCAGCTAACACGCTATGAAATGATTGGTCGAGAAATCAACCCTAATTAATATACAGCATTTCATTGGCTTAAACTGACAGGAAACTTTTCATTATAAAAAATCCCTTACTCCAGGACCAGTCAAATAACATCTGTGACTCATTGTATT--TAATTGTATAAT-GAA-GTT-TT---A-TTGGA-C-TGGAAAAGGGCCTCTTTTTATCTTTTTAGGTAAGTGAT-----CTTTTCTTGAAGT-----TT-------ACT----TGTAGATATATGTTATTTTGTTTT-AAAATACATCTTATGTTTTACCATATTAATTATACAGTGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTTGGATATGTGAG-ATTAAAT-TTAAAGTTATCAGAATTGT-ATATTCATG-A---ATTG-ATTTGT---T----TCAAGTTT-GTTGA----TCAGTTG--ATAAACAT---GT---AGTCCAAGATGGTTTATTCAATTAAGTACTTTTTAGGTTCATATGAACATTATTGTGAATG-T-TTTCTCTTTAACACTTGCAGTATTTTAACGAAACA--AAATCATGT--T--ACTTATAGTT----------GTATATTATTTAC--AATCTT------CTGataacattgatgaattgaaata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTCA---CAAAAATTGGTTTATAATATTTGTTTTGAATCACAGAAAAAAACGACAAATTTCATTTAAATTT-GTTTATAATATTTTGAAATAACTGAAAAAAAAATGTCATACTGTCAACTTTGATTTGAGTATTTTGA---------------------AAAATT-----------ACAAA----TAA-TT---AACATCAGTGATAAACTTTTCTGGTTCGATATTTGCATTTTTTA-AAATAATTTCG--CAGCT--------TGTCGAAC---ATACT--AATCGGATCAC----TT--AATCTCTTAA----GAGTTCAATTCCAGCGATAGGGTCTTGACTTAAAGTAATAATCCGCAAGTGTTTTTGACTGGAAGAGCTTGGCCGGATATAAATTATCAGTTTAATCAAAGGTAGTCGATACACGTAAATTGATGCAACACCATGTTATATATG-----------GGTTTCCTGGAATTAATTTAAGCTTAATCGCATTATTTTTG-GTAAAATCCACTTTTTCGCAGCTAACACAGTATAAAATGATTGGTAAAAAAATCACCCCTAATTAATATTCAGCATTCCATTGGCATAAACTGACAAGCCAATTCTCATTACAGAAGGTACCTTACTCCAGGTCCAGTCACTTAACATCTGTGACTC---GTATT--AAATTGTAAAAT-AAA-GTT-TT---A-TTGGA-CTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATCTTTTAGGATAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cT--CA-CTTAACATCTGTGACT-----CGT---A--TT--A-------AATTGTAAAAT-AAAGTT-TT---ATT------GG-ACTTGGAAAAAGAC--CTTTTTATC-TTTTAGGATAACCCCATT--AT--CC---CAC-A-CAGCACAAAccccattatcccacacagcacaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGATATT--G---GTTTGAAATTGTG-----TCTATTCTATTCAATTCCGTTCCATTCTA------TGTTGTACAGTTAATA---ACTT--CAGCTTA-CATCTGTGACTTTTTGCATTATACATT--A-------AGTTATGTAAT-AAAAGT-TT---ATTT-----AA-AC-TGGGAAAGGACCTCTGTTTAACTTTTTAGGATCA-GCCATT--TTTATAATGCGA-T-CAGCACCAAgaaattgtgtctattctattcaattccgttccattctatgttgtacagttaataacttcagcttacatctgtgactttttgcattatacattaagttatgtaataaaagtttatttaaactgggaaaggacctctgtttaactttttaggatcagccatttttataatgcgatcagcaccaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tctttcgtttcaagcttgtttacaaattgtcgtaccgggtagtaatttagtccaaaactgttatgttataaattattgattgtcaaaagttttgtatttaaaaactttgattgttgagattttatggtaagatatatatagtgtagattgttattaattgaatttactaatcttttttgttatatttctgtttaatttggagtattgcttttttagtaaaacagtttacaaactgtcaagaatatttacaacaaatgtacatacgcttctaAACGAAACACAAGAGCATAT--A--CTTTATGGGTACTGAAAGTGGTATAT-ATGTAC--AGTCTC------CTGC--GGTACAGAATACCTTTCATATATTTTCGGTATTTGTCCCTTTCGGTTCGATAAGTT-------TAATTA-TATATTC---TCGTAAATTAAAGTTAC-AC---G---AATAAATTT---T------GT---ATTT-TT-G-AAATTTATAAATTG-AC-A-CAAGTGTTTGTATTTAAA---CTGTGAGATTTGCTTGTTTATAACACCTTGAATATTGATGA-AAAACAC-ATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTG---TGATTTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TG---------TTTGTA---TT-TAAACTGTGAGATTTGCTT-GTTTATAACACCTTGAATAT----TGATGAAAAACACATTGCTGTTTAGTTTATTTTTAATTGTG-----A----TTTACTCTGTTCTATTCTAC---A------TGCTTTTAA-AA--TA---ACTA--CA-CTTAACATCTGTGATT-----CGTTAAA--TTGGA-------AATTGTATAACAAAAGTT-TC---ATT------GGAAC-TAGAAAAGGA---CTTT-----TTTTTAGGATCAGCCCATT--TATATCGTACCA-A-CGGCATAActctgttctattctacatgcttttaaaataactacacttaacatctgtgattcgttaaattggaaattgtataacaaaagtttcattggaactagaaaaggacttttttttaggatcagcccatttatatcgtaccaacggcataacaaattcattgcgtgaatgaaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aacgaaacacaagagcatatactttatgggtactgaaagtggtatatatgtacagtctcctgcggtacagaatacctttcatatattttcggtatttgtccctttcggttcgataagtttaattatatattctcgtaaattaaagttacacgaataaattttgtatttttgaaatttataaattgacacaagTTGTTTTCCAGATTTAATAAT-AAAAGTT-TC---A-TTAGAAC-TCGAAAAGGAC---TTTTTTTCTTTTAAGGTGAGTGAT-----CT----------G-----TT-------TTTGAAATGTAGATATATTTTAATTTGTGTTAAAATAAA-TCC-ATGTTCTGCCATACTAAGTATACAATGTGAAAGTTTAAA-ATATATC-----TTTGGTATTTGTGAG-AGTCAAT-T--------TCAG--CTGTGATATACATGTAGTCATAG-A-CTGTTTAT----TCAA-TTA-GGTAATTTTTAGGTTT--ATATGAAT---AT---Acaaattcattgcgtgaatgaaatg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAAA-ATAAATCCATGTTCTGCCATAC-TAAGTATACAATGTGAAAGTT--TAAAAT-AT-ATCTT----------TGGTATTTGT---GAGAGTCAATTTCAGCTG----------TG--ATATACAT---GT---AGTCATAGACTGTTTATTCAATTAGGTAATTTTTAGGTTTATATGAATATATTTGATAATATTATTTCT-TTTAACACCC-CAGTTTCCAAAATAAACA--AAATTATATGATAGATTGATTGAT----------TTAT-TTATTGATTGATTCTTTATTTACTGCATAGTACAAAtttgataatattatttcttttaacaccccagtttccaaaataaacaaaattatatgatagattgattgatttatttattgattgattctttatttactgcatagtacaaatatg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CTCAGAAAACTATGCTTGATTTTAAAAGCATTTAGCCTACATGTATCTGTGTAATCAAAAGCTTAATTTTGATTGGCTATTTAAATTAT