lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 1 11 1 88888888888888888888888 1111111111111 1 11111111111111 111 222222 11 11111111111111 1 11 2222 11
lowQualScore : 3 6 3 3 4 0 99 99 222 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222 4 444 33 2 3 1 33 33 33 2 4 777 2 6 66666 77 2 9 1 5 6 3 2 77777 2 44444444444444444444444 2 444 33 2 444 2 2 3333333333333 33 444 3 33333333333333 2 444 2 0 2 0 33 2 33 55555555 333 888888 4 2 4 44 22 2 333 6666666 99 00000000000000 11 3333 1 1 2 66 8888 33333 3333 1111 88888 1 1 00 7 1 1 3 1 11
lowQualScore : . . . . . . .. .. ... . ..................................................................................................................... . ...... . ... .. . . . .. .. .. . . ... . . ..... .. . . . . . . . ..... . ....................... . ... .. . ... . . ............. .. ... . .............. . ... . . . . .. . .. ........ ... ...... . . . .. .. . ... ....... .. .............. .. .... . . . .. .... ..... .... .... ..... . . .. . . . . . ..
lowQualScore : 2 0 5 2 8 6 22 22 333 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 666666 0 444 44 5 2 3 44 44 44 7 5 333 7 4 77777 55 7 4 4 7 1 4 9 11111 9 77777777777777777777777 7 777 77 7 777 7 5 8888888888888 22 111 6 88888888888888 4 111 4 3 2 5 11 2 11 33333333 111 555555 4 2 0 88 88 0 555 5555555 66 66666666666666 99 0000 4 4 9 33 0000 66666 0000 9999 99999 5 5 66 0 5 3 9 4 88
consensus : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCCGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CA--GAGG-T-TAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAGCANAGTNNNACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGTAAATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAATCATTTACTCAGGTGATCGACTTACA----TGGG-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AAGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TTTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GA-TTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAANTGGTACCAATTT--TCTGTTTAGCTCACGGCCTA
Reference ( gi|3 ) : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTCGTATGTCAATTGGTTTATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGCTTC--CA--GAGA-T-TAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACACAATGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAGGTGATTGACTTACA----TTGG-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCGCAA---AA-AAGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGA-------------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCTTTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATG--A---T-T-TTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCAAAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|1 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTTATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATTATCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGATTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CACTGAGG-T-TAA-CTTTTACAAAGTGTTAATAAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNN-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---CATA--TTTCATGTTTGTATTTGC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACCAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTGCCGTAATTCACAA---AA-AAGA-----GAGAGTTTTACTCCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-T-TGTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AAAATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTCTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGCGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACAATTATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATAGGCGGCCATTTTGTAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCTGAGATATGCCCCCCCCCCCCC-C--CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|2 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaataTAGCTTTTTTAAATCTTCTGAAAGTGAT--GTTGTATGTCAATTCGTTGATAATCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGTTTC--CA--CAGA-GGTAAACTTTTACAAAGTGTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNN-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AAAAATTTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATAAATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AAAA------AGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-CCTTTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----TAA-TATTATGA-------------CATATACCATCTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTTATGTTTTTAGTTTT--TAA---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACATAGTATGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTATCACACATTAATGTGATAAGAAACT--TATAACACATACATTTATGCAG-T--CAAAACTTG----A---AGATCGGGTGTATATTANN-NNNNNNNNN--N---N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG-AA--TTG--C-TCATTTTTAGAC---AT-------TAAGCTGTGTCCGAGATATG------------GCC--CC----CC-C-A-GATTTTTTTTAGTGTAGAGATA-----TATATCTT----C----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|4 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaataTAGCCTTTTTAAATATTCTGCAAGTGGTATGTTGTATGTAAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACTGGGTTCCC-------------GGGTTTC--CA--CAGAGG-TAAACTTTTACAAAGTGTTAAAAAGCAC
gi|20 : AGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAACTGGTTGATAGTTCTTTATCtaagtacatgattgtatggagtttaaatattttacatctagtattgtctggtagctctgtataaactttgataaatctggaccccatttgtccacagttggacgacttggcccacttgggcttcttgtttaaacatttttatagatatttcaagtttgtattttcatcaattttaagtgttcatgagatcattttgctagaaataaatgttaaacatgataaaccaatatatgcatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgccatataccccacccacttcgattttactgtaattcacaaaataagagttcaacatctaatttgtataaaatctatagttcctttttaacctgaagtcatatcttaattaaaaatttaggacattaaccatctaacataaaacataaaatttacacaattattatgcaaaaatgtgttcttgatgttgacttttttagtttgtattaacataaatctatttttccccaatacaaagtgtttcaataaagaaaattacaatagtcatacctaaatgtgataagtaactaataaaacacatacatgtttacagttaaaatatgttaatcatgtgtatattatagataatgacatttttttaaataactggctgccattttggaagccattttggaaatttctcattttcagacataattaagctgtgcctgagatatggccccccagattgtttttggtgaagagatgtttatctttcaaaaaatcatagggggaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttcactcatggcttat
gi|24 : ATTTGCTGATTATCCTCTAGCAAGATTGCACAAGCCGGAATGTAAGTGTAAAATTCAGTACTGTAGCA--GAAG-T-CACAGTTTTACAAAGTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcctttgatcaggtga
gi|5 : GTTCATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAGCTGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CA--GAGA-T-TAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAGGTGAATGACTTACA----TGGG-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAAAA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAAAATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCGCAA---AA-AAGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGA-------------CATATACCATCTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTGGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCTGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTAG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCTT
gi|6 : --CA--GAGG-T-CAAGCTTTTACAAAGCGTTAATAAGCAAAGT---ACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGTAAATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAATCATTTACTCAGGTAAGCAACTTAAACGACTTGGGCTTCGTGTTTAAAACATATGTATA---AATA--TTTCAGGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGTTAGAAATAAATGCTAAACA--TGATAAACCAGTAAATGTATATAAATTATGAATAA--TTTTAAAAT--TGTGTATATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACATTGATTTTGCTGTTATTCACAA---AA-ATAA-----GAG--TTCATTATGTACTTTC-GATAAAATCTATAGTTAC-TTTTTGATCTGAAGACATATC-TAATTA-----AAA-TAAAAAGACATACATATATACCAT-------CTAA-C---AGGTAT-TA---AA----ACAAAATTTACACAATC-TTC-------------ACGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATA-TTTTAGTTCG--TAT---TAACAAAAATCCATT----------------T-TTTT---CAA---ATTG------AATAAAA-AAAATTACCCTTTTTCATACCTTGATGTGATCACTATCT--T-AAACACATATATTTATTCAGAC--AAAAATATG----C---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTTGCGGCCACATTGGAAAC------G--------G--C-TCATTTTTATAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T--CC----CT-T-A-GATTTATTTCGGTGTAGAG-TA-----GATATCTT----T----C-----AA-AA-AG--GTATA-CGGGGAATTTGCCAA-ATAATTGGTACTGATTT--GTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|13 : caCAGGTGATCGACGTACA----TGGA-CTTCTCATTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATATTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGAAATTCCCAAAACAA-AAAA-----GAGAGTTCAACACCTAATTTT-CATAAAA--------T-C-TGATTAAAGT--------------ATTA-----GGA-CAT--GTAC------------CAT-------CTAA-T---A--TATAAA---AA-AACATAAAATTTACACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTAATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAATAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGTGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCAATTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CA-C-A-GAATAATTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGC
gi|7 : CAGGTGATCAACTTCCA----TGGG-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTGTGTTAGAAATAAATGTTTAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAAAATTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCCCACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AAAA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TTTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGA-------------CATATACTGTCTAA-C---A--TAT-AA---AAAAACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAGTCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAAAGAGG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCTG-T--TAAAATTTG----A---AAATCATGTGTATATTANN-NNNNNNNNN--N---N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------GCC--CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGGTGTAAAGAGA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|8 : AGGTGATCGACTTACA----TGGG-CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTTTATCAATTTTTAGTGTTCATAAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATTTATGTATATTAATTATGACTAA--TTGTAAAAT--TGTGTAAATAGTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTCGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AAGA-----GAG--TTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCT-TAGTTCC-TGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGGGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAATTCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTCATG-AG-AACATTACAT-TTTTTATACTTTAAGGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTA----A---AAATCGGGTGTATTTTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATCGGCGGTCATTTTGGAAGCCATTTTGC-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG-----------------CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGATGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--ACATA-GTGGAAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACG
gi|4 : TTGGCCCACT----TGGG-CTTCTTGTTTAAA-CATTTTTATA---GATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAGATCATTTTGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAACCAATATATGCATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCCATATACCCC-ACCCACTTCGATTTTACTGTAATTCACAA---AATAAGA-----G----TTCAACATCTAATTTG-TATAAAATCTATAGTTCC-TTTTTAACCTGAAGTCATATCTTAATTA-----AAA-ATTTAGGA-------------CAT--------TAACC---A--TCT-AACATAA-AACATAAAATTTACACAATT-ATT-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGACTTTTTTAGTTTG--TAT---TAACATAAATC----TA--------------T-TTTTCCCCAATACAAAGTGTTTCAATAAAG-AAAATTACAA-TAGTCATACCTAAATGTGATAAGTAACTAATAAAACACATACATGTTTACAG-T--TAAAATATG----T---TAATCATGTGTATATTA---TAGATAATG--ACATT-T-TTTTAAATAACTGGCTGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGAAA--TTT--C-TCATTTTCAGACATAAT-------TAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GATTGTTTTTGGTGAAGAGATG-----TTTATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTCACTCATGGCTTAtc
gi|10 : tagcctttttaaatattctgcaagtggtatgttgtatgtaaattggttgatagtcctttatcaagattgttcaaactgggttcccgggtttccacagaggtaaacttttacaaagtgttaaaaagcactaagtacatgattgtatggagtttaaatattttacatctagtattgtctggtagctctgtataaactttgataaatctggaccccatttgtccacagttggacgacGG-CTTCTTGTTTAAAACAAATGAATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-GTCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATACATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTACGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AAAA-----GAGTGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAATT-C-TTTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAATACATTCATTTATGCAG-T--TAACATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CC-CTG-GAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTt
gi|9 : -CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTAAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTTTCAAAC--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AA-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TTTTTAACCATATATCATATC-TGATTACCGGTAAATTATTACGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATGTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA----------------TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAGGTTACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAAGCGGGTGTATATTANNNNNNNNNNNN--N---N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C--CC----CCAC-A-T-TTTTTTTTGGTGTTGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGACCTA
gi|11 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAAAA--TTATTGAACAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AA-A-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TTTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGA-------------CATATACCATCTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCTG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCA-TTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GAATTTTCTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|12 : TTCTTGTTTAAAATAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGAATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCACAA---AA-AA-A-----GAG--TTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-CCTTTTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTATGA-------------CATATACCATCTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAATTTT--TAA---TAAAAGAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTATCATACATTAATGTTATAAGAAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAAACGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGCCGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCGGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AG-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|14 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTAATTCGCAA---AA-AAGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TAT-AA---AA-AACATAAAATTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAATTGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAACAAAAATCCATTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTANN-NNNNNNNNN--N---N-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCAAAGATATG------------GCC--CC----CC-C-A-GAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----
gi|15 : TTCTTGTTTAAAACAGATGTATA---AATA--TTTTAAGTTTGTATTTTC-ATCAGTTTTTAGTGTTAATGAATTAATTACGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTGTGATTCACAA---AA-AAAAAAAAGAAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAG---C-TTTTTAACCTATTATCACATC-TGATTG-----AAA-TATTAGGACATATAC------CAT-------CTAA-C---A--TTT-AA---AA-AAC------TTTATACAATT-TTA-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATATTTTTAGTTTT--TAT---AAACAAAAATCCTTTTA--------------T-TTTT---CAACAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AA-----------------CATTAATGTGACAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATAGGGTGTATATTA---TAGATAATGACA---T-T-TTTTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCAATTTTG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCTGAGACATG------------G-C--CC----CC-A-A-GAA-CTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-
gi|22 : TGTATATTAAATA--TTTCAAGTTTGTATTGCC-AATAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAGCTAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTG
gi|16 : cagtGTTTA---AATA--TTTTGAATA-GTGCTGTC-AGCAAGTTTGGGTATTAATGAAAGCATTTGGTTGCAAATTAATGTTAAAAAAAT-ATAAACCATTATATGTACATAAATTAC------------CAAATACTTTGTAAATAATGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTT---TGTGATTCATAAT--TT-ACGA-----G----TTCAACATCTAATTCGAGATAAAA
gi|16 : A-------------CAT-------CTAA-TTCGA--GAT-AA---AA-GG--TCAAGTTGATACAATTGTTATGATACAACTGTTATACAAAAATGTGTTGTTGACGTTGCTGATTTTAATTTG--TATATATAA-AAAAATCC----A--------------TATTTT---CAACACA-------TTA--GAAATAAAATTAAAA-TTTTCATACCTAAAAGTGAAAAGTAACT--TAAAATACATACATTTAGAGGG-TAACAAAATTTGTGTAATGTAAATCGGGCGTATATTA---TAGATAATG--A---TATGTTTTAAGAAATTGGCGAA-ATTTTCGGAGAAATTTTGG-AAA-TCG--CACCATTCT-AGAC---ATAAAGCATTCAGCTGTGCCCGAGATACG------------C-C--TCTTCTCT-C-G-GA--TTGTTTGGTG--AAGATA-----TAT------------------------A-AA--TTATG-G--------TACCA---------------ATTT--TTTGTTTAGCTCTCGGCCTggtcaagttgatacaattgttatgatacaactgttatacaaaaatgtgttgttgacgttgctgattttaatttgtatatataaaaaaatccatattttcaacacattagaaataaaattaaaattttcatacctaaaagtgaaaagtaacttaaaatacatacatttagagggtaacaaaatttgtgtaatgtaaatcgggcgtatattatagataatgatatgttttaagaaattggcgaaattttcggagaaattttggaaatcgcaccattctagacataaagcattcagctgtgcccgagatacgcctcttctctcggattgtttggtgaagatatataaattatggtaccaattttttgtttagctctcggcct
gi|17 : gtttaaatattttgaatagtgctgtcagcaagtttgggtattaatgaaagcatttggttgcaaattaatgttaaaaaaatataaaccattatatgtacataaattaccaaatactttgtaaataatgtgcgatttaccccatccactttgattttgtgattcataatttacgagttcaATACAATT-TTT-------------ATGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATGTTTTTAGTTATACTAT----AATAAAAATTGTTATACCAAAAATAGATTTT-TTTT---CAATAGAATGTGTTTTAAT-AAG-AAAAT-ACAA-TTTGTGTAC-TTAATGTAGTAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAG-T--TAAAATATG----T---AAATCAGGTGTATATTT---TAGAAAATT--A---CAT-TTTTAAGAAATTCGCAGTCATTTTGGAAGCCATGTTGG-AAAATT---C-TTATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T--CC----CC-C-A-GATTGTTTTTGGTGTAAATATG-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-AGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTAAGCTCACGGCCT
gi|18 : TATTTTTAGTTTT--AAT---TAACGAAAGTCCTATCA------------------------AATAGAACGTGTTTTAATAAAG-AAAATTACAA-TTTTCATACCTTAATGTGAAAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAG-C--AAAAATATG----T---AAATCGGGTATATATTA---TAGATGAC---A---T-T-TTTCAAGAAACTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGAAA--TTG--C-TCATCTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C--CA----CC-C-A-GATTTTTGTTGGTGTAGACATA-----TTTATCAT----T----CA----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAGTTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGACTATCTTAC
gi|19 : ACAA-TTTTCATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCAG-T--TAAAATTTG----A---AAATCGGGTGTATATTA---TAGATAATG--ACATT-T-TTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG-AA--TTG--C-TCATTTTCAGAC---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C--CC----CC-C-A-GATTTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT----T----C-----AA-AA-AA--TCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTC--TTAGTTTAGCTCACGGCCTa
gi|21 : GTCATTTTGCAAGCCATGTCAG-AA--CCG--C-ATTTTTTCGAAC---CA-------TAAGCTGTGACCGAGAAACG------------T-CTTCG----CC-C-A-TGATTGTATTGA---AGAGATGGTGATTGTGTCTT----T----C-----AA-AATTA--TC-TACGGGGGAAATTGGCAGTAGAAGTAGTACCAATCTCACTTTTTAAGGTCACGG
gi|25 : aacgacacgttttcaaaacTTGG-AA--GTGAAC-TGATTTTCAGAT---AT-------TAAGCTGTGCCCGAGATATT------------G-C--
gi|5 : -C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATATCTC----TACACC-----AA-AA-AAATTC-TG-GGGGGannnnnnnnnnccggtccagcaatatata
gi|1 : gttcatagtcctttatcaaaattgttcaagctgggttgctggggtgaaattaagggcttccagagattaaacttttacaaagtgttaataaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggtgaatgacttacatgggcttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcattagaaataaatgttcaaaatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaaaattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcgcaaaaaagagagattttaacacctaattttgataaaatctattgttctgtttaactttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttggtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaatctggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggcggccattttggaagccattttagaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatgg-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATATCTC----TACACC-----AA-AA-AAATTC-TG-GGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacggctt
gi|10 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaatatagcttttttaaatcttctgcaagttatatgttgtatgtcaattggttgattatcctttatcaaaattgttcaaactggattgctggggtgaaattaagggcttccactgaggttaacttttacaaagtgttaataaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcttgtttaaaacaaatgtatacatatttcatgtttgtatttgcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcattagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgaccaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccatccactttgattttgccgtaattcacaaaaaagagagagttttactcctaattttgataaaatctattgttttgtttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaaaataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtctttagtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgcgttttaatgaagaacattacaattttcatacaattatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaataggcggccattttgtaagccattttggaattgctcattttcagacattaagctgtgcctgagatatgccccccccccccc-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATATCTC----TACACC-----AA-AA-AAATTC-CA-GGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacggccta
gi|11 : ggcttcttgtttaaaacaaatgaataaatatttcaagtttgtattttcgtcaatttttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaacatgattaaccaatacatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtacgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaagagtgtttaacacctaattttgataaaatctataattctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaatacattcatttatgcagttaacatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggtggccattttggaagccattttggaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggc-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATATCTC----TACACC-----AAGAA-AA--TTCTG-GGGGGaatttgccagaaaattggtaccaattttttgtttagctcacggcct
gi|2 : ttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaaaattattgaacaatatatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaagagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgctgttaaaatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggcggccattttggaagccattttggaattgctcatttcagacattaagctgtgcccgagatatgg-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTGG----AAGATA-----TATATCTC----TA---CACTAAAA-AA-AA--TC-TG-GGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacggccta
gi|12 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaatatagcttttttaaatcttctgaaagtgatgttgtatgtcaattcgttgataatcctttatcaagattgttcaaaccgggttgctgggatgaaattaagggtttccacagaggtaaacttttacaaagtgttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcttgtttaaaacaaatgtataaaaaattttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaataaatttcgctagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatatgaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcaatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaaagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttcctttttaaccttatatcatatctgattataatattatgacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgtttatgtttttagtttttaataacaaaaatccatttatttttcaacatagtatgttttaatgaagaacattacaattatcacacattaatgtgataagaaacttataacacatacatttatgcagtcaaaacttgaagatcgggtgtatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaattgctcatttttagacattaagctgtgtccgagatatggc-C--CC----CC-T-ATGA--TTCTTTG----AAAGATA-----TATATCTC----TACACC-----AA-AA-AAATTC-TG-GGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacggcct
gi|7 : ttcttgtttaaaataaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgaatatgaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaagagtttaacacctaattttgataaaatctattgttcctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattatgacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttaatttttaataaaagaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattatcatacattaatgttataagaaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaaacgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggccgccattttggaagccattttggaattgctcattttcggacattaagctgtgcccgagatatgg-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATCTCTT----TACACC-----AA-AA-AAATTC-TG-GGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacggcct
gi|9 : caggtgatcaacttccatgggcttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaattgtgttagaaataaatgtttaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaaaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttacccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaagagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatatactgtctaacatataaaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaagtccatttatttttcaacagagtgtgttttaaagaggaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatatatgctgttaaaatttgaaaatcatgtgtatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggc-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATATCTCAACAC----C-----AA-AA-AA--AAATG-TGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacggccta
gi|19 : cttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcgtaagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaattttcaaactgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaaagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttcctttttaaccatatatcatatctgattaccggtaaattattacgacatataccatctaacatataaaaaacataaaatgtatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttgatgttgatgtttttagtttttattaacaaaaatccatttattttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataggttacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaagcgggtgtatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaattgctcattttcagacattaagctgtgcctgagatatggc-C--CC----CC-T-ATGA--TTTTTTG----AAAGATA-----TATATCTC----TA---CACCAAAA-AA-AA--TC-TG-GGGGGaatttgccagaaaaatggtaccaattttttgtttagctcacgaccta
gi|17 : acaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatatatgcagttaaaatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacatttttttaagaaattggcggccattttggaagccattttggaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggGAGCTTAACAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGaatttgccagaaaaatggtaccaattcttagtttagctcacggcct
gi|18 : atacaatttttatgcaaaaatgtgttcttaatgttgatgtttttagttatactataataaaaattgttataccaaaaatagattttttttcaatagaatgtgttttaataagaaaatacaatttgtgtacttaatgtagtaagtaacttaaaacacatacatttatacagttaaaatatgtaaatcaggtgtatattttagaaaattacatttttaagaaattcgcagtcattttggaagccatgttggaaaattcttattttcagacattaagctgtgcccgagatatggtcccccagattgtttttggtgtaaatatgtatatctttcaaaaaatcataaggggaatttgcGTCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGacggcct
gi|5 : tatttttagttttaattaacgaaagtcctatcaaatagaacgtgttttaataaagaaaattacaattttcataccttaatgtgaaaagtaacttaaaacacatacatttatacagcaaaaatatgtaaatcgggtatatattatagatgacatttttcaagaaactggtggccattttggaagccattttggaaattgctcatcttcagacattaagctgtgcctgagatatggccacccagatttttgttggtgtagacatatttatcattcaaaaaaatcatagggggagtttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtatcttaca
gi|1 : gttcatagtcctttatcaaaattgttcaagctgggttgctggggtgaaattaagggcttccagagattaaacttttacaaagtgttaataaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggtgaatgacttacatgggcttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcattagaaataaatgttcaaaatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaaaattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcgcaaaaaagagagattttaacacctaattttgataaaatctattgttctgtttaactttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttggtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaatctggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggcggccattttggaagccattttagaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggccccccagaatttttttggtgtagagatatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggctt
gi|10 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaatatagcttttttaaatcttctgcaagttatatgttgtatgtcaattggttgattatcctttatcaaaattgttcaaactggattgctggggtgaaattaagggcttccactgaggttaacttttacaaagtgttaataaacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcttgtttaaaacaaatgtatacatatttcatgtttgtatttgcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcattagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgaccaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccatccactttgattttgccgtaattcacaaaaaagagagagttttactcctaattttgataaaatctattgttttgtttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaaaataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtctttagtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgcgttttaatgaagaacattacaattttcatacaattatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaataggcggccattttgtaagccattttggaattgctcattttcagacattaagctgtgcctgagatatgcccccccccccccccccccagaatttttttggtgtagagatatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCAATTT--TCTGtttagctcacggccta
gi|11 : ggcttcttgtttaaaacaaatgaataaatatttcaagtttgtattttcgtcaatttttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaacatgattaaccaatacatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtacgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaagagtgtttaacacctaattttgataaaatctataattctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaatacattcatttatgcagttaacatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggtggccattttggaagccattttggaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggcccccctggaatttttttggtgtagagatatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggcct
gi|2 : ttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaaaattattgaacaatatatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaagagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgctgttaaaatttgaaaatcgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggcggccattttggaagccattttggaattgctcatttcagacattaagctgtgcccgagatatggccccccagaattttcttggtgtagagatatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggccta
gi|12 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaatatagcttttttaaatcttctgaaagtgatgttgtatgtcaattcgttgataatcctttatcaagattgttcaaaccgggttgctgggatgaaattaagggtttccacagaggtaaacttttacaaagtgttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcttgtttaaaacaaatgtataaaaaattttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaataaatttcgctagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatatgaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcaatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaaagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttcctttttaaccttatatcatatctgattataatattatgacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgtttatgtttttagtttttaataacaaaaatccatttatttttcaacatagtatgttttaatgaagaacattacaattatcacacattaatgtgataagaaacttataacacatacatttatgcagtcaaaacttgaagatcgggtgtatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaattgctcatttttagacattaagctgtgtccgagatatggcccccccagattttttttagtgtagagatatatatcttccaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggcct
gi|8 : ttcttgtttaaaataaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgaatatgaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaagagtttaacacctaattttgataaaatctattgttcctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattatgacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttaatttttaataaaagaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattatcatacattaatgttataagaaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaaacgggtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggccgccattttggaagccattttggaattgctcattttcggacattaagctgtgcccgagatatggccccccagaatttttttggtgtagagatatatatctttcaaagaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggcct
gi|13 : aggtgatcgacttacatgggcttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttttatcaatttttagtgttcataaattaatttcgttagaaataaatgttaaacatgattaaccaatttatgtatattaattatgactaattgtaaaattgtgtaaatagtgtgcaatttaccccacccacttcgattttgctgtaattcacaaaaaagagagtttaacacctaattttgataaaatcttagttcctgtttaactttatatcatatctgattaaaatattaggacatataccatctaacatataaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgggttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaattccatttatttttcaacagagtgtgttttcatgagaacattacattttttatactttaaggtgataagtaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttaaaaatcgggtgtattttatagataatgacattttttaagaaatcggcggtcattttggaagccattttgcaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatgcccccagaatttttttgatgtagagatatatatctttcaaaaaaacatagtggaaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacgtc
gi|7 : caggtgatcgacgtacatggacttctcatttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatatttagtgttcatgaattaatttcgttagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgaaattcccaaaacaaaaaagagagttcaacacctaattttcataaaatctgattaaagtattaggacatgtaccatctaatatataaaaaaacataaaatttacacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttaatgtttttagtttttattaataaaaatccatttatttttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaatcgtgtgtatattatagataatgacattttttaagaaattggcggccattttggaagccaatttggaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggccccacagaataattttggtgtagagatatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggc
gi|9 : caggtgatcaacttccatgggcttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaattgtgttagaaataaatgtttaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaaaattgtcaaattgtgtaaatattgtgcgatttacccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaagagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttctttttaaccttatatcatatctgattaaaatattaggacatatactgtctaacatataaaaaaacataaaatttatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttggtgttgatgtttttagtttttattaacaaaagtccatttatttttcaacagagtgtgttttaaagaggaacattacaattttcatacattaatgtgataagtaacttaaaacacatacatatatgctgttaaaatttgaaaatcatgtgtatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaattgctcattttcagacattaagctgtgcccgagatatggcccccccagaatttttttggtgtaaagagatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacggccta
gi|4 : cttcttgtttaaaacaaatgtataaatatttcaagtttgtattttcatcaatttttagtgttcatgaattaatttcgtaagaaataaatgttaaacatgattaaccaatatatgtatataaattatgactaattttcaaactgtgtaaatattgtgcgatttaccccacccactttgattttgctgtaattcacaaaaaaaaagagtttaacacctaattttgataaaatctatagttcctttttaaccatatatcatatctgattaccggtaaattattacgacatataccatctaacatataaaaaacataaaatgtatacaattttaatgcaaaaatgtgttcttgatgttgatgtttttagtttttattaacaaaaatccatttattttcaacagagtgtgttttaatgaagaacattacaattttcatacattaatgtgataggttacttaaaacacatacatttatgcagttaaaatttgaaaagcgggtgtatattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaattgctcattttcagacattaagctgtgcctgagatatggcccccacatttttttttggtgttgagatatatatctttcaaaaaatcatagggggaatttgcCAA-AAAATTGGTACCATTTT--TCTGtttagctcacgaccta
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): TTATACATATTTTGATAAATCCGGATTCCTCTGGTAAAATTTGGGGCTTCCACAAAGGCGGATCCTTTTACACAGGGAAGCATATCTTATGTCTCTT
Unaligned ( gi|26 ): TTACTTCTCAAAAGGAACCTCATCAAAGTTGAAAATGAGATTTTTTTGTTTTCCCTATTTA
Alignments
lowQualScore : 22 3333333333333333 111111111 11111 11111 11111111 1 111111111111 1111111111111111111 11
lowQualScore : 0 0 4 3 77 33 9 0 6666666666666666 2 33 3 222222222 666666 77 11 0 22222 0 1 11111 444 33 2 33 33 33 2 66666 2 2 77777777 2 0 2 2 2 66666 2 777777 33 5 33 666 111111111111 2 2 2 22 22 2 44444444 2 2 2 88 22 1 6666666 333 3333333333333333333 1 1 77 5 3 1 1 44444 2 2 2 2 1 77 2
lowQualScore : . . . . .. .. . . ................ . .. . ......... ...... .. .. . ..... . . ..... ... .. . .. .. .. . ..... . . ........ . . . . . ..... . ...... .. . .. ... ............ . . . .. .. . ........ . . . .. .. . ....... ... ................... . . .. . . . . ..... . . . . . .. .
lowQualScore : 8 7 8 7 99 66 3 1 2222222222222222 0 22 4 000000000 111111 66 11 4 00000 4 3 11111 111 22 4 22 22 22 5 22222 5 5 88888888 5 7 7 7 7 77777 7 777777 77 3 11 999 444444444444 2 2 1 99 99 1 55555555 1 0 0 33 66 9 2222222 333 2222222222222222222 9 9 99 7 8 9 9 88888 1 1 2 2 8 33 2
consensus : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CAC-GAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAANNTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGTA-AATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGATCN-TTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCTA
Reference ( family-2255 ) : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCCGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CA--GAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAGCAN--AGTNNN-------ACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGTA-AATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAATCA-TTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-G--A-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAANTGGTACCAATTTT-CTGTTT-AGCTCACGGCCTA
gi|1 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTTATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATTATCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGATTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CACTGAGGTTAA-CTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---CATA--TTTCATGTTTGTATTTGC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACCAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTGCCG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTTACTCCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-T-TG-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AAAATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTCTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGCGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACAATTATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATAGGCGGCCATTTTGTAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATGCCCCCCCCCCCCC-C----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCTA
gi|10 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaataGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGAATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-GTCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATACATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTACGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGTGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAATT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAATACATTCATTTATGCAGT--TAACATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CT-GGAA-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCT
gi|11 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAAAA--TTATTGAACAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCA-TTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TC-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCTA
gi|12 : TTCTTGTTTAAAATAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGAATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A--------AGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-CCTT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAATTTT--TAA---TAA------------AAGAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CATACATTAATGTTATAAGAAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAACGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCCGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCGGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAG-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCT
gi|13 : CAGGTGATCGACGTACA-----TGGACTTCTCATTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATATTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----AAATTCCCAAAACA-AAA-----AAGAG----------AGTTC-----AACACCTA-A---------TTT----TCATA--AAATC-TGATTA-----AAG-TATTAGGACATG------TACCATCTAATA--TATAAAAAAACATAAAATTTACACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTAATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------TAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGTGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCAATTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCA-CA-GA-A-TA-A-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGC
gi|14 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAATTGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------GCC----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT
gi|15 : TTCTTGTTTAAAACAGATGTATA---AATA--TTTTAAGTTTGTATTTTC-ATCAGTTTTTAGTGTTAATGAATTAATTACGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TGATTCACAAAA-A-AAAAAAAGAAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAG---C-TT-TTTAACCTATTATCACATC-TGATTG-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TTTAAAA-AAC------TTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATATTTTTAGTTTT--TAT---AAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-A-----------------ACATTAATGTGACAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATAGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCAATTTTG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGACATG------------G-C----CCCC-AA-G--A-AC-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-
gi|16 : GTTTA---AATA--TTTTGAATA-GTGCTGTC-AGCAAGTTTGGGTATTAATGAAAGCATTTGGTTGCAAATTAATGTTAAAAAAAT-ATAAACCATTATATGTACATAAATTAC------------CAAATACTTTGTAAATAATGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTG-TGATTCATAATTTAC-----------------GAGTTCAACATCTAATTCGAGATAAAA
gi|16 : ATACAACTGTTATACAAAAATGTGTTGTTGACGTTGCTGATTTTAATTTG--TATATATAA-------------AAAAATCCAT--ATTTT-CAA-CACA-------TTA--GAAATAAAATTAAAATTTT-CATACCTAAAAGTGAAAAGTAACT--TAAAATACATACATTTAGAGGGTAACAAAATT-TGTGTAATGTAAATCGGGCGTATATTA-TAGATAATGATA-TGTT-TTAAGAAATTGGCGA-AATTTTCGGAGAAATTTTGGA-AATCG--CACCATTCT-AGACATAAAGC---ATTCAGCTGTGCCCGAGATACG------------C-CTCTTCTCT-CG-G--A--T-T-GT-TTGGTG--AAGATA-----TAT-----------A-AATTATG-G--------TACCA---------------ATTTT-TTGTTT-AGCTCTCGGCCTggtcaagttgatacaattgttatgatacaactgttatacaaaaatgtgttgttgacgttgctgattttaatttgtatatataaaaaaatccatattttcaacacattagaaataaaattaaaattttcatacctaaaagtgaaaagtaacttaaaatacatacatttagagggtaacaaaatttgtgtaatgtaaatcgggcgtatattatagataatgatatgttttaagaaattggcgaaattttcggagaaattttggaaatcgcaccattctagacataaagcattcagctgtgcccgagatacgcctcttctctcggattgtttggtgaagatatataaattatggtaccaattttttgtttagctctcggcct
gi|17 : gtttaaatattttgaatagtgctgtcagcaagtttgggtattaatgaaagcatttggttgcaaattaatgttaaaaaaatataaaccattatatgtacataaattaccaaatactttgtaaataatgtgcgatttaccccatccactttgattttgtgattcataatttacgagttcaacatctaattcgagataaaaggtcaagttgatacaattgttatgATACAATTTTTATGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATGTTTTTAGTTATACTATAA-TAAAAATTGTTATACCAAAAATAGATTT-TTTTTCAA-TAGAATGTGTTTTAAT-AAG-AAAAT-ACAATTTG-TGTAC-TTAATGTAGTAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGT--TAAAATA-TG----T---AAATCAGGTGTATATTT-TAGAAAATTACA--TTT-TTAAGAAATTCGCAGTCATTTTGGAAGCCATGTTGGAAAATT---C-TTATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCC-CA-G--A-TTGT-TT-TTGGTGTAAATATG-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-AGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTA-AGCTCACGGCCT
gi|18 : TATTTTTAGTTTT--AAT---TAA------------CGAAAGTCC---TAT----CAAATAGAACGTGTTTTAATAAAG-AAAATTACAATTTT-CATACCTTAATGTGAAAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGC--AAAAATA-TG----T---AAATCGGGTATATATTA-TAG---ATGACA-TTTT-TCAAGAAACTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTG--C-TCATCTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CACC-CA-G--A-TT-T-TTGTTGGTGTAGACATA-----TTTATCATTCAAAAA-AATCATA-GGGGGAGTTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGACT-ATCTTAC
gi|19 : ACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTTTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-G--ATTT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTCT-TAGTTT-AGCTCACGGCCTa
gi|2 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGAAAGTGAT--GTTGTATGTCAATTCGTTGATAATCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGTTTC--CACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAATNNNNNN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AAAAATTTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATAAATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----TAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTTATGTTTTTAGTTTT--TAA---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CATAGTATGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CACACATTAATGTGATAAGAAACT--TATAACACATACATTTATGCAGT--CAAAACT-TG----A---AGATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTTAGA-------C---ATTAAGCTGTGTCCGAGATATG------------GCC----CCCC-CA-G--ATTT-T-TT-TTAGTGTAGAGATA-----TATATCTTCC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCT
gi|20 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaataAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAACTGGTTGATAGTTCTTTATC
gi|21 : AACGACA-CGTT-TTCAAAA-----CG-TCATTTTGCAAGCCATGTCAG--AACCG--C-ATTTTTTCGAA-------C---CATAAGCTGTGACCGAGAAACG------------T-CTT--CGCC-CATG--A-TT-G-TA-TTGA---AGAGATGGTGATTGTGTCTTTC-AAAATTATC-TACGGGGGAAATTGGCAGTAGAAGTAGTACCAATCTCACTTTTTAAGGTCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcctttgatcaggtga
gi|22 : TGTATATTAAATA--TTTCAAGTTTGTATTGCC-AATAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAGCTAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTG
gi|23 : cagtTTTGATAAATCCGGATTCCTCTGGTAAAATTTGGGGCTTCCACAAAGGCGGATCCTTTTACACAGG
gi|24 : ttatacatatATTTGCTGATTATCCTCTAGCAAGATTGCACAAGCCGGAATGTAAGTGTAAAATTCAGTACTGTAGCA--GAAGTCACAGTTTTACAAAGTGgaagcatatcttatgtctctt
gi|25 : TTGG--AAGTGAAC-TGATTTTCAGA-------T---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATT------------G-------CAN-NN-N--N-NN-N-NN-CCGGTCCAGCAATA-----TATA
gi|3 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTCGTATGTCAATTGGTTTATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGCTTC--CA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AATGAA-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNTCAGGTGATTGACTTACA-----TTGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACAT-------------CTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATG--A-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------G-C----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCTA
gi|4 : TAGCCTTTTTAAATATTCTGCAAGTGGTATGTTGTATGTAAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACTGGGTTCCCGGG-------------TTTC--CACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAAAAAGCACTAAGTACATGATTGTATGGAGTTTAAATATTTTACATCTAGTATTGTCTGGTAGCTCTGTATAAACTTTGATAAATCTGGACCCC---------ATTTG-----TCCACA---GTTGGACG----ACT----TGGCCCACTT---------GGGCTTCTTGTTTAAA-CATTTTTATA---GATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAGATCATTTTGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAACCAATATATGCATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCCATATACCCC-ACCCACTTCGATTTTACTG-----TAATTCACAAAA-T-A--------AGAGTTCAACATCTAATTTG-TATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTGAAGTCATATCTTAATTA-----AAA-ATTTAGGACATT------AACCATCTAACA--T----AA-AACATAAAATTTACACAATTATTATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGACTTTTTTAGTTTG--TAT---TAA------------CATAAATCTATTT-TTCCCCAA-TACAAAGTGTTTCAATAAAG-AAAATTACAATAGT-CATACCTAAATGTGATAAGTAACTAATAAAACACATACATGTTTACAGT--TAAAATA-TG----T---TAATCATGTGTATATTA-TAGATAATGACATTTTT-TTAAATAACTGGCTGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTT--C-TCATTTTCAGA-------CATAATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-G--A-TTGT-TT-TTGGTGAAGAGATG-----TTTATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-CACTCATGGCTTA
gi|5 : GTTCATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAGCTGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTC--CA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNTCAGGTGAATGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAAAA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAAAATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTGGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCTGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTAG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CA-G--AATT-T-TT-TTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCTTt
gi|6 : --CA--GAGGTCAAGCTTTTACAAAGCGTTAATAAGCAA--AGT----------ACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGTA-AATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAATCA-TTTACTCAGGTAAGCAACTTAAACGACTTGGGCTTCGTGTTTAAAACATATGTATA---AATA--TTTCAGGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGTTAGAAATAAATGCTAAACA--TGATAAACCAGTAAATGTATATAAATTATGAATAA--TTTTAAAAT--TGTGTATATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACATTGATTTTGCTG-----TTATTCACAAAA-ATA--------AGAGTTCATTATGTACTTTC-GATAAAATCTATAGTTAC-TT-TTTGATCTGAAGACATATC-TAATTA-----AAA-TAAAAAGACATACATATATACCATCTAACAGGTATTAAA-A---CAAAATTTACACAATCTTCACGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATATTTT-AGTTCG--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTT--TTTTCAA----ATTG------AATAAAA-AAAATTACCCTTTTTCATACCTTGATGTGATCACTATCT--TAAA-CACATATATTTATTCAGA--CAAAAATATG----C---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTTGCGGCCACATTGGAAAC-------G------G--C-TCATTTTTATA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCT-TA-G--A-TT-TATT-TCGGTGTAGAG-TA-----GATATCTTTC-AAAA-AGGTATA-CGGGGAATTTGCCAA-ATAATTGGTACTGATTTG-TTGTTT-AGCTCACGGCCTA
gi|7 : caCAGGTGATCAACTTCCA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTGTGTTAGAAATAAATGTTTAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAAAATTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCCCACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACTGTCTAACA--TATAAAAAAACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAGTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAAAGAGG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCATGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------GCC----CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGGTGTAAAGAGA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGGCCTA
gi|8 : AGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTTTATCAATTTTTAGTGTTCATAAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATTTATGTATATTAATTATGACTAA--TTGTAAAAT--TGTGTAAATAGTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTCGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----G--AGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCT-TAGTT-C-CTGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGGGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAATTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTCATG-AG-AACATTACATTTTT-TATACTTTAAGGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TA----A---AAATCGGGTGTATTTTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATCGGCGGTCATTTTGGAAGCCATTTTGC--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG-------------------CCCC-CA-GA-A-TT-T-TT-TTGATGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AAACATA-GTGGAAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACG
gi|9 : CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTAAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTTTCAAAC--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCATATATCATATC-TGATTACCGGTAAATTATTACGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATGTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTA-TTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAGGTTACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAGCGGGTGTATATTANNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCCACA-T--T-TT-T-TT-TTGGTGTTGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTTT-TTGTTT-AGCTCACGACCTAtc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTACTTCTCAAAAGGAACCTCATCAAAGTTGAAAATGAGATTTTTTTGTTTTCCCTATTTA
Alignments
lowQualScore : 33 3333333333 111111111 11111 11111111 1 111111111111 11111111111111
lowQualScore : 0 0 3 22 9 99 1111111111 1 222 0 0 111111111 55555 66 0 7777777 0 11111 444 33 2 33 33 33 2 66666 2 2 77777777 2 0 2 2 2 66666 2 777777 33 5 33 666 111111111111 2 2 2 22 22 2 44444444 2 2 2 88 22 1 6666666 333 11111111111111 6666 2 2 2 55555 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . .. . .. .......... . ... . . ......... ..... .. . ....... . ..... ... .. . .. .. .. . ..... . . ........ . . . . . ..... . ...... .. . .. ... ............ . . . .. .. . ........ . . . .. .. . ....... ... .............. .... . . . ..... . . . . ..
lowQualScore : 8 7 7 99 3 22 5555555555 0 444 1 9 999999999 11111 77 1 4444444 4 11111 111 22 4 22 22 22 5 22222 5 5 88888888 5 7 7 7 7 77777 7 777777 77 3 11 999 444444444444 2 2 1 99 99 1 55555555 1 0 0 33 66 9 2222222 333 44444444444444 7777 0 0 6 00000 1 1 2 2 11
consensus : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
Reference ( family-2255 ) : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCAC-GAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAANNTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|1 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTTATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATTATCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGATTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACTGAGGTT-AACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---CATA--TTTCATGTTTGTATTTGC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACCAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTGCCG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTTACTCCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-T-TG-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AAAATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTCTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGCGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACAATTATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATAGGCGGCCATTTTGTAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATGCCCCCCCCCCCCC-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|10 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaataGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGAATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-GTCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATACATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTACGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGTGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAATT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAATACATTCATTTATGCAGT--TAACATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CTGGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|11 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAAAA--TTATTGAACAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCA-TTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTCTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|12 : TTCTTGTTTAAAATAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGAATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A--------AGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-CCTT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAATTTT--TAA---TAA------------AAGAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CATACATTAATGTTATAAGAAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAACGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCCGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCGGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAG-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|13 : CAGGTGATCGACGTACA-----TGGACTTCTCATTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATATTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----AAATTCCCAAAACA-AAA-----AAGAG----------AGTTC-----AACACCTA-A---------TTT----TCATA--AAATC-TGATTA-----AAG-TATTAGGACATG------TACCATCTAATA--TATAAAAAAACATAAAATTTACACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTAATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------TAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGTGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCAATTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCA-C-AGAATAATTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGC
gi|14 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAATTGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT
gi|15 : TTCTTGTTTAAAACAGATGTATA---AATA--TTTTAAGTTTGTATTTTC-ATCAGTTTTTAGTGTTAATGAATTAATTACGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TGATTCACAAAA-A-AAAAAAAGAAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAG---C-TT-TTTAACCTATTATCACATC-TGATTG-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TTTAAAA-AAC------TTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATATTTTTAGTTTT--TAT---AAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-A-----------------ACATTAATGTGACAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATAGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCAATTTTG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGACATG------------G-C----CCCC-A-AGAA-CTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-
gi|16 : GTTTA---AATA--TTTTGAATA-GTGCTGTC-AGCAAGTTTGGGTATTAATGAAAGCATTTGGTTGCAAATTAATGTTAAAAAAAT-ATAAACCATTATATGTACATAAATTAC------------CAAATACTTTGTAAATAATGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTG-TGATTCATAATTTAC-----------------GAGTTCAACATCTAATTCGAGATAAAA
gi|16 : ATACAACTGTTATACAAAAATGTGTTGTTGACGTTGCTGATTTTAATTTG--TATATATAA-------------AAAAATCCAT--ATTTT-CAA-CACA-------TTA--GAAATAAAATTAAAATTTT-CATACCTAAAAGTGAAAAGTAACT--TAAAATACATACATTTAGAGGGTAACAAAATT-TGTGTAATGTAAATCGGGCGTATATTA-TAGATAATGATA-TGTT-TTAAGAAATTGGCGA-AATTTTCGGAGAAATTTTGGA-AATCG--CACCATTCT-AGACATAAAGC---ATTCAGCTGTGCCCGAGATACG------------C-CTCTTCTCT-C-GGA--TTGTTTGGTG--AAGATA-----TAT-----------A-AATTATG-G--------TACCA---------------ATTT--TTTGTTTAGCTCTCGGCCTggtcaagttgatacaattgttatgatacaactgttatacaaaaatgtgttgttgacgttgctgattttaatttgtatatataaaaaaatccatattttcaacacattagaaataaaattaaaattttcatacctaaaagtgaaaagtaacttaaaatacatacatttagagggtaacaaaatttgtgtaatgtaaatcgggcgtatattatagataatgatatgttttaagaaattggcgaaattttcggagaaattttggaaatcgcaccattctagacataaagcattcagctgtgcccgagatacgcctcttctctcggattgtttggtgaagatatataaattatggtaccaattttttgtttagctctcggcct
gi|17 : gtttaaatattttgaatagtgctgtcagcaagtttgggtattaatgaaagcatttggttgcaaattaatgttaaaaaaatataaaccattatatgtacataaattaccaaatactttgtaaataatgtgcgatttaccccatccactttgattttgtgattcataatttacgagttcaacatctaattcgagataaaaggtcaagttgatacaattgttatgATACAATTTTTATGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATGTTTTTAGTTATACTATAA-TAAAAATTGTTATACCAAAAATAGATTT-TTTTTCAA-TAGAATGTGTTTTAAT-AAG-AAAAT-ACAATTTG-TGTAC-TTAATGTAGTAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGT--TAAAATA-TG----T---AAATCAGGTGTATATTT-TAGAAAATTACA--TTT-TTAAGAAATTCGCAGTCATTTTGGAAGCCATGTTGGAAAATT---C-TTATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCC-C-AGATTGTTTTTGGTGTAAATATG-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-AGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTAAGCTCACGGCCT
gi|18 : TATTTTTAGTTTT--AAT---TAA------------CGAAAGTCC---TAT----CAAATAGAACGTGTTTTAATAAAG-AAAATTACAATTTT-CATACCTTAATGTGAAAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGC--AAAAATA-TG----T---AAATCGGGTATATATTA-TAG---ATGACA-TTTT-TCAAGAAACTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTG--C-TCATCTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CACC-C-AGATTTTTGTTGGTGTAGACATA-----TTTATCATTCAAAAA-AATCATA-GGGGGAGTTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGACTATCTTAC
gi|19 : ACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTTTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGATTTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTC--TTAGTTTAGCTCACGGCCTa
gi|2 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGAAAGTGAT--GTTGTATGTCAATTCGTTGATAATCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGTTTCCACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAATNNNNNN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AAAAATTTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATAAATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----TAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTTATGTTTTTAGTTTT--TAA---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CATAGTATGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CACACATTAATGTGATAAGAAACT--TATAACACATACATTTATGCAGT--CAAAACT-TG----A---AGATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTTAGA-------C---ATTAAGCTGTGTCCGAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGATTTTTTTTAGTGTAGAGATA-----TATATCTTCC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|20 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaataAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAACTGGTTGATAGTTCTTTATC
gi|21 : AACGACA-CGTT-TTCAAAA-----CG-TCATTTTGCAAGCCATGTCAG--AACCG--C-ATTTTTTCGAA-------C---CATAAGCTGTGACCGAGAAACG------------T-CTT--CGCC-C-ATGATTGTATTGA---AGAGATGGTGATTGTGTCTTTC-AAAATTATC-TACGGGGGAAATTGGCAGTAGAAGTAGTACCAATCTCACTTTTTAAGGTCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcctttgatcaggtga
gi|22 : TGTATATTAAATA--TTTCAAGTTTGTATTGCC-AATAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAGCTAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTG
gi|23 : cagtTATACATATTTTGATAAATCCGGATTCCTCTGGTAAAATTTGGGGCTTCCACAAAGGCGGATCCTTTTACACAGG
gi|24 : tATTTGCTGATTATCCTCTAGCAAGATTGCACAAGCCGGAATGTAAGTGTAAAATTCAGTACTGTAGCAGAAGTCACAGTTTTACAAAGTGgaagcatatcttatgtctctt
gi|25 : TTGG--AAGTGAAC-TGATTTTCAGA-------T---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATT------------G-C----
gi|3 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTCGTATGTCAATTGGTTTATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGCTTCCA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AATGAA-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNTCAGGTGATTGACTTACA-----TTGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACAT-------------CTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATG--A-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTAannnnnnnnnnccggtccagcaatatata
gi|4 : TAGCCTTTTTAAATATTCTGCAAGTGGTATGTTGTATGTAAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACTGGGTTCCCGGG-------------TTTCCACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAAAAAGCACTAAGTACATGATTGTATGGAGTTTAAATATTTTACATCTAGTATTGTCTGGTAGCTCTGTATAAACTTTGATAAATCTGGACCCC---------ATTTG-----TCCACA---GTTGGA-CG---ACT----TGGCCCACT---------TGGGCTTCTTGTTT-AAACATTTTTATA---GATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAGATCATTTTGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAACCAATATATGCATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCCATATACCCC-ACCCACTTCGATTTTACTG-----TAATTCACAAAA-T-A--------AGAGTTCAACATCTAATTTG-TATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTGAAGTCATATCTTAATTA-----AAA-ATTTAGGACATT------AACCATCTAACA--T----AA-AACATAAAATTTACACAATTATTATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGACTTTTTTAGTTTG--TAT---TAA------------CATAAATCTATTT-TTCCCCAA-TACAAAGTGTTTCAATAAAG-AAAATTACAATAGT-CATACCTAAATGTGATAAGTAACTAATAAAACACATACATGTTTACAGT--TAAAATA-TG----T---TAATCATGTGTATATTA-TAGATAATGACATTTTT-TTAAATAACTGGCTGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTT--C-TCATTTTCAGA-------CATAATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGATTGTTTTTGGTGAAGAGATG-----TTTATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTCACTCATGGCTTA
gi|5 : GTTCATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAGCTGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNTCAGGTGAATGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAAAA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAAAATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTGGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCTGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTAG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCTTt
gi|6 : CACAGAGGTCAAGCTTTTACAAAGCGTTAATAAGCAA--AGT----------ACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGT-AAATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAAT-CATTTACTCAGGTAAGCAACTTAAACGACTTGGGCTTCGTGTTTAAAACATATGTATA---AATA--TTTCAGGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGTTAGAAATAAATGCTAAACA--TGATAAACCAGTAAATGTATATAAATTATGAATAA--TTTTAAAAT--TGTGTATATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACATTGATTTTGCTG-----TTATTCACAAAA-ATA--------AGAGTTCATTATGTACTTTC-GATAAAATCTATAGTTAC-TT-TTTGATCTGAAGACATATC-TAATTA-----AAA-TAAAAAGACATACATATATACCATCTAACAGGTATTAAA-A---CAAAATTTACACAATCTTCACGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATATTTT-AGTTCG--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTT--TTTTCAA----ATTG------AATAAAA-AAAATTACCCTTTTTCATACCTTGATGTGATCACTATCT--TAAA-CACATATATTTATTCAGA--CAAAAATATG----C---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTTGCGGCCACATTGGAAAC-------G------G--C-TCATTTTTATA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCT-T-AGATTTATTTCGGTGTAGAG-TA-----GATATCTTTC-AAAA-AGGTATA-CGGGGAATTTGCCAA-ATAATTGGTACTGATTT--GTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|7 : CAGGTGATCAACTTCCA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTGTGTTAGAAATAAATGTTTAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAAAATTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCCCACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACTGTCTAACA--TATAAAAAAACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAGTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAAAGAGG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCATGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAAAGAGA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|8 : AGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTTTATCAATTTTTAGTGTTCATAAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATTTATGTATATTAATTATGACTAA--TTGTAAAAT--TGTGTAAATAGTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTCGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----G--AGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCT-TAGTT-C-CTGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGGGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAATTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTCATG-AG-AACATTACATTTTT-TATACTTTAAGGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TA----A---AAATCGGGTGTATTTTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATCGGCGGTCATTTTGGAAGCCATTTTGC--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG-------------------CCCC-C-AGAATTTTTTTGATGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AAACATA-GTGGAAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACG
gi|9 : CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTAAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTTTCAAAC--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCATATATCATATC-TGATTACCGGTAAATTATTACGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATGTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTA-TTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAGGTTACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAGCGGGTGTATATTANNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCCAC-AT-TTTTTTTTGGTGTTGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGACCTAtc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTACTTCTCAAAAGGAACCTCATCAAAGTTGAAAATGAGATTTTTTTGTTTTCCCTATTTA
Alignments
lowQualScore : 3333333333 111111111 11111 11111111 1 111111111111 11111111111111
lowQualScore : 0 0 3 55 9 0 99 1111111111 1 111 0 0 111111111 55555 66 0 7777777 0 11111 444 33 2 33 33 33 2 66666 2 2 77777777 2 0 2 2 2 66666 2 777777 33 5 33 666 111111111111 2 2 2 22 22 2 44444444 2 2 2 88 22 1 6666666 333 11111111111111 6666 2 2 2 55555 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . .. . . .. .......... . ... . . ......... ..... .. . ....... . ..... ... .. . .. .. .. . ..... . . ........ . . . . . ..... . ...... .. . .. ... ............ . . . .. .. . ........ . . . .. .. . ....... ... .............. .... . . . ..... . . . . ..
lowQualScore : 8 7 7 99 3 1 22 5555555555 0 666 1 9 999999999 11111 77 1 4444444 4 11111 111 22 4 22 22 22 5 22222 5 5 88888888 5 7 7 7 7 77777 7 777777 77 3 11 999 444444444444 2 2 1 99 99 1 55555555 1 0 0 33 66 9 2222222 333 44444444444444 7777 0 0 6 00000 1 1 2 2 11
consensus : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
Reference ( family-2255 ) : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|1 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTTATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATTATCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGATTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACTGAGGTTAA-CTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---CATA--TTTCATGTTTGTATTTGC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACCAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTGCCG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTTACTCCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-T-TG-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AAAATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTCTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGCGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACAATTATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATAGGCGGCCATTTTGTAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATGCCCCCCCCCCCCC-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|10 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaataGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGAATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-GTCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATACATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTACGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGTGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAATT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAATACATTCATTTATGCAGT--TAACATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CTGGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|11 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAAAA--TTATTGAACAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCA-TTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTCTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|12 : TTCTTGTTTAAAATAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGAATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A--------AGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-CCTT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAATTTT--TAA---TAA------------AAGAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CATACATTAATGTTATAAGAAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAACGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCCGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCGGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAG-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|13 : CAGGTGATCGACGTACA-----TGGACTTCTCATTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATATTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----AAATTCCCAAAACA-AAA-----AAGAG----------AGTTC-----AACACCTA-A---------TTT----TCATA--AAATC-TGATTA-----AAG-TATTAGGACATG------TACCATCTAATA--TATAAAAAAACATAAAATTTACACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTAATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------TAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGTGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCAATTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCA-C-AGAATAATTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGC
gi|14 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAATTGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT
gi|15 : TTCTTGTTTAAAACAGATGTATA---AATA--TTTTAAGTTTGTATTTTC-ATCAGTTTTTAGTGTTAATGAATTAATTACGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TGATTCACAAAA-A-AAAAAAAGAAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAG---C-TT-TTTAACCTATTATCACATC-TGATTG-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TTTAAAA-AAC------TTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATATTTTTAGTTTT--TAT---AAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-A-----------------ACATTAATGTGACAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATAGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCAATTTTG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGACATG------------G-C----CCCC-A-AGAA-CTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-
gi|16 : GTTTA---AATA--TTTTGAATA-GTGCTGTC-AGCAAGTTTGGGTATTAATGAAAGCATTTGGTTGCAAATTAATGTTAAAAAAAT-ATAAACCATTATATGTACATAAATTAC------------CAAATACTTTGTAAATAATGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTG-TGATTCATAATTTAC-----------------GAGTTCAACATCTAATTCGAGATAAAA
gi|16 : ATACAACTGTTATACAAAAATGTGTTGTTGACGTTGCTGATTTTAATTTG--TATATATAA-------------AAAAATCCAT--ATTTT-CAA-CACA-------TTA--GAAATAAAATTAAAATTTT-CATACCTAAAAGTGAAAAGTAACT--TAAAATACATACATTTAGAGGGTAACAAAATT-TGTGTAATGTAAATCGGGCGTATATTA-TAGATAATGATA-TGTT-TTAAGAAATTGGCGA-AATTTTCGGAGAAATTTTGGA-AATCG--CACCATTCT-AGACATAAAGC---ATTCAGCTGTGCCCGAGATACG------------C-CTCTTCTCT-C-GGA--TTGTTTGGTG--AAGATA-----TAT-----------A-AATTATG-G--------TACCA---------------ATTT--TTTGTTTAGCTCTCGGCCTggtcaagttgatacaattgttatgatacaactgttatacaaaaatgtgttgttgacgttgctgattttaatttgtatatataaaaaaatccatattttcaacacattagaaataaaattaaaattttcatacctaaaagtgaaaagtaacttaaaatacatacatttagagggtaacaaaatttgtgtaatgtaaatcgggcgtatattatagataatgatatgttttaagaaattggcgaaattttcggagaaattttggaaatcgcaccattctagacataaagcattcagctgtgcccgagatacgcctcttctctcggattgtttggtgaagatatataaattatggtaccaattttttgtttagctctcggcct
gi|17 : gtttaaatattttgaatagtgctgtcagcaagtttgggtattaatgaaagcatttggttgcaaattaatgttaaaaaaatataaaccattatatgtacataaattaccaaatactttgtaaataatgtgcgatttaccccatccactttgattttgtgattcataatttacgagttcaacatctaattcgagataaaaggtcaagttgatacaattgttatgATACAATTTTTATGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATGTTTTTAGTTATACTATAA-TAAAAATTGTTATACCAAAAATAGATTT-TTTTTCAA-TAGAATGTGTTTTAAT-AAG-AAAAT-ACAATTTG-TGTAC-TTAATGTAGTAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGT--TAAAATA-TG----T---AAATCAGGTGTATATTT-TAGAAAATTACA--TTT-TTAAGAAATTCGCAGTCATTTTGGAAGCCATGTTGGAAAATT---C-TTATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCC-C-AGATTGTTTTTGGTGTAAATATG-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-AGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTAAGCTCACGGCCT
gi|18 : TATTTTTAGTTTT--AAT---TAA------------CGAAAGTCC---TAT----CAAATAGAACGTGTTTTAATAAAG-AAAATTACAATTTT-CATACCTTAATGTGAAAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGC--AAAAATA-TG----T---AAATCGGGTATATATTA-TAG---ATGACA-TTTT-TCAAGAAACTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTG--C-TCATCTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CACC-C-AGATTTTTGTTGGTGTAGACATA-----TTTATCATTCAAAAA-AATCATA-GGGGGAGTTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGACTATCTTAC
gi|19 : ACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTTTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGATTTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTC--TTAGTTTAGCTCACGGCCTa
gi|2 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGAAAGTGAT--GTTGTATGTCAATTCGTTGATAATCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGTTTCCACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAATNNNNNN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AAAAATTTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATAAATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----TAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTTATGTTTTTAGTTTT--TAA---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CATAGTATGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CACACATTAATGTGATAAGAAACT--TATAACACATACATTTATGCAGT--CAAAACT-TG----A---AGATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTTAGA-------C---ATTAAGCTGTGTCCGAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGATTTTTTTTAGTGTAGAGATA-----TATATCTTCC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|20 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaataAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAACTGGTTGATAGTTCTTTATC
gi|21 : AACGACA-CGTT-TTCAAAA-----CG-TCATTTTGCAAGCCATGTCAG--AACCG--C-ATTTTTTCGAA-------C---CATAAGCTGTGACCGAGAAACG------------T-CTT--CGCC-C-ATGATTGTATTGA---AGAGATGGTGATTGTGTCTTTC-AAAATTATC-TACGGGGGAAATTGGCAGTAGAAGTAGTACCAATCTCACTTTTTAAGGTCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcctttgatcaggtga
gi|22 : TGTATATTAAATA--TTTCAAGTTTGTATTGCC-AATAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAGCTAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTG
gi|23 : cagtTATACATATTTTGATAAATCCGGATTCCTCTGGTAAAATTTGGGGCTTCCACAAAGGCGGATCCTTTTACACAGG
gi|24 : tATTTGCTGATTATCCTCTAGCAAGATTGCACAAGCCGGAATGTAAGTGTAAAATTCAGTACTGTAGCAGAAGTCACAGTTTTACAAAGTGgaagcatatcttatgtctctt
gi|25 : TTGG--AAGTGAAC-TGATTTTCAGA-------T---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATT------------G-C----
gi|3 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTCGTATGTCAATTGGTTTATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGCTTCCA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AATGAA-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNTCAGGTGATTGACTTACA-----TTGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACAT-------------CTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATG--A-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTAannnnnnnnnnccggtccagcaatatata
gi|4 : TAGCCTTTTTAAATATTCTGCAAGTGGTATGTTGTATGTAAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACTGGGTTCCCGGG-------------TTTCCACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAAAAAGCACTAAGTACATGATTGTATGGAGTTTAAATATTTTACATCTAGTATTGTCTGGTAGCTCTGTATAAACTTTGATAAATCTGGACCCC---------ATTTG-----TCCACA---GTTGGA-CG---ACT----TGGCCCACT---------TGGGCTTCTTGTTT-AAACATTTTTATA---GATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAGATCATTTTGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAACCAATATATGCATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCCATATACCCC-ACCCACTTCGATTTTACTG-----TAATTCACAAAA-T-A--------AGAGTTCAACATCTAATTTG-TATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTGAAGTCATATCTTAATTA-----AAA-ATTTAGGACATT------AACCATCTAACA--T----AA-AACATAAAATTTACACAATTATTATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGACTTTTTTAGTTTG--TAT---TAA------------CATAAATCTATTT-TTCCCCAA-TACAAAGTGTTTCAATAAAG-AAAATTACAATAGT-CATACCTAAATGTGATAAGTAACTAATAAAACACATACATGTTTACAGT--TAAAATA-TG----T---TAATCATGTGTATATTA-TAGATAATGACATTTTT-TTAAATAACTGGCTGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTT--C-TCATTTTCAGA-------CATAATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGATTGTTTTTGGTGAAGAGATG-----TTTATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTCACTCATGGCTTA
gi|5 : GTTCATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAGCTGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNTCAGGTGAATGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAAAA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAAAATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTGGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCTGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTAG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCTTt
gi|6 : CACAGAGGTCAAGCTTTTACAAAGCGTTAATAAGCAA--AGT----------ACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGT-AAATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAAT-CATTTACTCAGGTAAGCAACTTAAACGACTTGGGCTTCGTGTTTAAAACATATGTATA---AATA--TTTCAGGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGTTAGAAATAAATGCTAAACA--TGATAAACCAGTAAATGTATATAAATTATGAATAA--TTTTAAAAT--TGTGTATATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACATTGATTTTGCTG-----TTATTCACAAAA-ATA--------AGAGTTCATTATGTACTTTC-GATAAAATCTATAGTTAC-TT-TTTGATCTGAAGACATATC-TAATTA-----AAA-TAAAAAGACATACATATATACCATCTAACAGGTATTAAA-A---CAAAATTTACACAATCTTCACGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATATTTT-AGTTCG--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTT--TTTTCAA----ATTG------AATAAAA-AAAATTACCCTTTTTCATACCTTGATGTGATCACTATCT--TAAA-CACATATATTTATTCAGA--CAAAAATATG----C---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTTGCGGCCACATTGGAAAC-------G------G--C-TCATTTTTATA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCT-T-AGATTTATTTCGGTGTAGAG-TA-----GATATCTTTC-AAAA-AGGTATA-CGGGGAATTTGCCAA-ATAATTGGTACTGATTT--GTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|7 : CAGGTGATCAACTTCCA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTGTGTTAGAAATAAATGTTTAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAAAATTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCCCACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACTGTCTAACA--TATAAAAAAACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAGTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAAAGAGG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCATGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAAAGAGA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|8 : AGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTTTATCAATTTTTAGTGTTCATAAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATTTATGTATATTAATTATGACTAA--TTGTAAAAT--TGTGTAAATAGTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTCGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----G--AGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCT-TAGTT-C-CTGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGGGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAATTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTCATG-AG-AACATTACATTTTT-TATACTTTAAGGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TA----A---AAATCGGGTGTATTTTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATCGGCGGTCATTTTGGAAGCCATTTTGC--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG-------------------CCCC-C-AGAATTTTTTTGATGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AAACATA-GTGGAAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACG
gi|9 : CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTAAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTTTCAAAC--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCATATATCATATC-TGATTACCGGTAAATTATTACGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATGTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTA-TTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAGGTTACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAGCGGGTGTATATTANNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCCAC-AT-TTTTTTTTGGTGTTGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGACCTAtc
blockSeqs : A CA C TA ACATGATTGT N NNN TCTGGTAAA NNNNN NN TCCTTTT CGACT TTA AT T AA AA AC C ATTCA C T AAAAAAGA A C C G T CCGGT T CATATA GG A AC ATA AAATTGTTATAC A T T AA AA A TGTAATGT N T T AA AA A CATAAAG ATA GC TCTT A T A GTGAT A T C T CA
blockSeqs : G CA T . NNN N TAT NNNNNNNN GGGCT AA NNNNNN . . . . . . . . . . . AAG . C . . . . . . . A . AA . . . . . . . A . . . A . . . . GC TT . . A . . . . . .
blockSeqs : A CA T . GAA T NNN NNNNNNNN NNNNN NN NNNNNN . . . . . . . . . . . AAA . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . GC . . . A . . . . . .
blockSeqs : G CA C . NNN N AAC NNNNNNNN NNNNN NN NNNNNN . . . . . . . . . . . GAG . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A NNN TTTGGTAA GGGCC TA TCATTT . . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . ACA . . . ACG . . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . G . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : G*************
originalCons : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
finalCons : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATGG-------------C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTACTTCTCAAAAGGAACCTCATCAAAGTTGAAAATGAGATTTTTTTGTTTTCCCTATTTA
Alignments
lowQualScore : 3333333333 111111111 11111 11111111 1 111111111111 11111111111111
lowQualScore : 0 0 3 55 9 0 99 1111111111 1 111 0 0 111111111 55555 66 0 7777777 0 11111 444 33 2 33 33 33 2 66666 2 2 77777777 2 0 2 2 2 66666 2 777777 33 5 33 666 111111111111 2 2 2 22 22 2 44444444 2 2 2 88 22 1 6666666 333 11111111111111 6666 2 2 2 55555 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . .. . . .. .......... . ... . . ......... ..... .. . ....... . ..... ... .. . .. .. .. . ..... . . ........ . . . . . ..... . ...... .. . .. ... ............ . . . .. .. . ........ . . . .. .. . ....... ... .............. .... . . . ..... . . . . ..
lowQualScore : 8 7 7 99 3 1 22 5555555555 0 666 1 9 999999999 11111 77 1 4444444 4 11111 111 22 4 22 22 22 5 22222 5 5 88888888 5 7 7 7 7 77777 7 777777 77 3 11 999 444444444444 2 2 1 99 99 1 55555555 1 0 0 33 66 9 2222222 333 44444444444444 7777 0 0 6 00000 1 1 2 2 11
consensus : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
Reference ( family-2255 ) : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACAGAGGTTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AGTGNA-------ACGGAGTTTAAATATTTNACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAAANTTTGATAAATCCGGACCCCTCTGGT-AAATTTGGGGCCTCCACANAGGTTGAT-CNTTTACTCAGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|1 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTTATATGTTGTATGTCAATTGGTTGATTATCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGATTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCACTGAGGTTAA-CTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---CATA--TTTCATGTTTGTATTTGC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACCAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTGCCG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----GAGAGTTTTACTCCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-T-TG-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AAAATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTCTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGCGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACAATTATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATAGGCGGCCATTTTGTAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATGCCCCCCCCCCCCC-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|10 : taaaaacacttctatagtatatgaaaatgctaaataGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGAATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-GTCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATACATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTACGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGTGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAATT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAATACATTCATTTATGCAGT--TAACATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-CTGGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|11 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAAAA--TTATTGAACAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCA-TTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTCTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|12 : TTCTTGTTTAAAATAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGAATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A--------AGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-CCTT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAATTTT--TAA---TAA------------AAGAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CATACATTAATGTTATAAGAAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAACGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCCGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCGGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAG-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|13 : CAGGTGATCGACGTACA-----TGGACTTCTCATTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATATTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----AAATTCCCAAAACA-AAA-----AAGAG----------AGTTC-----AACACCTA-A---------TTT----TCATA--AAATC-TGATTA-----AAG-TATTAGGACATG------TACCATCTAATA--TATAAAAAAACATAAAATTTACACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTAATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------TAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGTGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCAATTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCA-C-AGAATAATTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGC
gi|14 : TTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAATTGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTT
gi|15 : TTCTTGTTTAAAACAGATGTATA---AATA--TTTTAAGTTTGTATTTTC-ATCAGTTTTTAGTGTTAATGAATTAATTACGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TGATTCACAAAA-A-AAAAAAAGAAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAG---C-TT-TTTAACCTATTATCACATC-TGATTG-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TTTAAAA-AAC------TTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATATTTTTAGTTTT--TAT---AAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-A-----------------ACATTAATGTGACAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATAGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGTGGCCATTTTGGAAGCCAATTTTG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGACATG------------G-C----CCCC-A-AGAA-CTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-
gi|16 : GTTTA---AATA--TTTTGAATA-GTGCTGTC-AGCAAGTTTGGGTATTAATGAAAGCATTTGGTTGCAAATTAATGTTAAAAAAAT-ATAAACCATTATATGTACATAAATTAC------------CAAATACTTTGTAAATAATGTGCGATTTACCCC-ATCCACTTTGATTTTG-TGATTCATAATTTAC-----------------GAGTTCAACATCTAATTCGAGATAAAA
gi|16 : ATACAACTGTTATACAAAAATGTGTTGTTGACGTTGCTGATTTTAATTTG--TATATATAA-------------AAAAATCCAT--ATTTT-CAA-CACA-------TTA--GAAATAAAATTAAAATTTT-CATACCTAAAAGTGAAAAGTAACT--TAAAATACATACATTTAGAGGGTAACAAAATT-TGTGTAATGTAAATCGGGCGTATATTA-TAGATAATGATA-TGTT-TTAAGAAATTGGCGA-AATTTTCGGAGAAATTTTGGA-AATCG--CACCATTCT-AGACATAAAGC---ATTCAGCTGTGCCCGAGATACG------------C-CTCTTCTCT-C-GGA--TTGTTTGGTG--AAGATA-----TAT-----------A-AATTATG-G--------TACCA---------------ATTT--TTTGTTTAGCTCTCGGCCTggtcaagttgatacaattgttatgatacaactgttatacaaaaatgtgttgttgacgttgctgattttaatttgtatatataaaaaaatccatattttcaacacattagaaataaaattaaaattttcatacctaaaagtgaaaagtaacttaaaatacatacatttagagggtaacaaaatttgtgtaatgtaaatcgggcgtatattatagataatgatatgttttaagaaattggcgaaattttcggagaaattttggaaatcgcaccattctagacataaagcattcagctgtgcccgagatacgcctcttctctcggattgtttggtgaagatatataaattatggtaccaattttttgtttagctctcggcct
gi|17 : gtttaaatattttgaatagtgctgtcagcaagtttgggtattaatgaaagcatttggttgcaaattaatgttaaaaaaatataaaccattatatgtacataaattaccaaatactttgtaaataatgtgcgatttaccccatccactttgattttgtgattcataatttacgagttcaacatctaattcgagataaaaggtcaagttgatacaattgttatgATACAATTTTTATGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATGTTTTTAGTTATACTATAA-TAAAAATTGTTATACCAAAAATAGATTT-TTTTTCAA-TAGAATGTGTTTTAAT-AAG-AAAAT-ACAATTTG-TGTAC-TTAATGTAGTAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGT--TAAAATA-TG----T---AAATCAGGTGTATATTT-TAGAAAATTACA--TTT-TTAAGAAATTCGCAGTCATTTTGGAAGCCATGTTGGAAAATT---C-TTATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCC-C-AGATTGTTTTTGGTGTAAATATG-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-AGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTAAGCTCACGGCCT
gi|18 : TATTTTTAGTTTT--AAT---TAA------------CGAAAGTCC---TAT----CAAATAGAACGTGTTTTAATAAAG-AAAATTACAATTTT-CATACCTTAATGTGAAAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATACAGC--AAAAATA-TG----T---AAATCGGGTATATATTA-TAG---ATGACA-TTTT-TCAAGAAACTGGTGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTG--C-TCATCTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CACC-C-AGATTTTTGTTGGTGTAGACATA-----TTTATCATTCAAAAA-AATCATA-GGGGGAGTTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGACTATCTTAC
gi|19 : ACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTTTTTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGATTTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTC--TTAGTTTAGCTCACGGCCTa
gi|2 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGAAAGTGAT--GTTGTATGTCAATTCGTTGATAATCCTTTATCAAGATTGTTCAAACCGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGTTTCCACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAATNNNNNN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AAAAATTTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATAAATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATGAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----TAA-TATTATGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTTATGTTTTTAGTTTT--TAA---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CATAGTATGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTAT-CACACATTAATGTGATAAGAAACT--TATAACACATACATTTATGCAGT--CAAAACT-TG----A---AGATCGGGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTTAGA-------C---ATTAAGCTGTGTCCGAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGATTTTTTTTAGTGTAGAGATA-----TATATCTTCC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCT
gi|20 : taaaaacacttctatagtaaatatgagaatgccataggtaaataAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTTGTATGTCAACTGGTTGATAGTTCTTTATC
gi|21 : AACGACA-CGTT-TTCAAAA-----CG-TCATTTTGCAAGCCATGTCAG--AACCG--C-ATTTTTTCGAA-------C---CATAAGCTGTGACCGAGAAACG------------T-CTT--CGCC-C-ATGATTGTATTGA---AGAGATGGTGATTGTGTCTTTC-AAAATTATC-TACGGGGGAAATTGGCAGTAGAAGTAGTACCAATCTCACTTTTTAAGGTCACGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcctttgatcaggtga
gi|22 : TGTATATTAAATA--TTTCAAGTTTGTATTGCC-AATAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAGCTAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTG
gi|23 : cagtTATACATATTTTGATAAATCCGGATTCCTCTGGTAAAATTTGGGGCTTCCACAAAGGCGGATCCTTTTACACAGG
gi|24 : tATTTGCTGATTATCCTCTAGCAAGATTGCACAAGCCGGAATGTAAGTGTAAAATTCAGTACTGTAGCAGAAGTCACAGTTTTACAAAGTGgaagcatatcttatgtctctt
gi|25 : TTGG--AAGTGAAC-TGATTTTCAGA-------T---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATT------------G-C----
gi|3 : TAGCTTTTTTAAATCTTCTGCAAGTGATATGTCGTATGTCAATTGGTTTATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAACTGGGTTGCTGGGATGAAATTAAGGGCTTCCA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAC--AATGAA-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNTCAGGTGATTGACTTACA-----TTGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACAT-------------CTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCTTTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATG--A-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTGG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCAAAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAATTGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTAannnnnnnnnnccggtccagcaatatata
gi|4 : TAGCCTTTTTAAATATTCTGCAAGTGGTATGTTGTATGTAAATTGGTTGATAGTCCTTTATCAAGATTGTTCAAACTGGGTTCCCGGG-------------TTTCCACAGAGGT-AAACTTTTACAAAGTGTTAAAAAGCACTAAGTACATGATTGTATGGAGTTTAAATATTTTACATCTAGTATTGTCTGGTAGCTCTGTATAAACTTTGATAAATCTGGACCCC---------ATTTG-----TCCACA---GTTGGA-CG---ACT----TGGCCCACT---------TGGGCTTCTTGTTT-AAACATTTTTATA---GATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAGATCATTTTGCTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATAAACCAATATATGCATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCCATATACCCC-ACCCACTTCGATTTTACTG-----TAATTCACAAAA-T-A--------AGAGTTCAACATCTAATTTG-TATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCTGAAGTCATATCTTAATTA-----AAA-ATTTAGGACATT------AACCATCTAACA--T----AA-AACATAAAATTTACACAATTATTATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGACTTTTTTAGTTTG--TAT---TAA------------CATAAATCTATTT-TTCCCCAA-TACAAAGTGTTTCAATAAAG-AAAATTACAATAGT-CATACCTAAATGTGATAAGTAACTAATAAAACACATACATGTTTACAGT--TAAAATA-TG----T---TAATCATGTGTATATTA-TAGATAATGACATTTTT-TTAAATAACTGGCTGCCATTTTGGAAGCCATTTTGGA-AATTT--C-TCATTTTCAGA-------CATAATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGATTGTTTTTGGTGAAGAGATG-----TTTATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTCACTCATGGCTTA
gi|5 : GTTCATAGTCCTTTATCAAAATTGTTCAAGCTGGGTTGCTGGGGTGAAATTAAGGGCTTCCA--GAGATTAAACTTTTACAAAGTGTTAATAAACAN--NNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNTCAGGTGAATGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCATTAGAAATAAATGTTCAAAA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTGTCAAAT--TGTGTAAAAATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCGCAAAA-A-AGA-----GAGATTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATTGTT-C-TG-TTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTGGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAATCTGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTGGCGGCCATTTTGGAAGCCATTTTAG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-C----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCTTt
gi|6 : CACAGAGGTCAAGCTTTTACAAAGCGTTAATAAGCAA--AGT----------ACGGAGTTTAAATATTTAACATCTAGTATTGTCTGGTAGCCCTGTATAACATTTGATCAATCTGGACCCCTTTGGT-AAATTTAGGGCCTCCACATAGGTTAAT-CATTTACTCAGGTAAGCAACTTAAACGACTTGGGCTTCGTGTTTAAAACATATGTATA---AATA--TTTCAGGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTAAGTGTTCATGAAATCATTTCGTTAGAAATAAATGCTAAACA--TGATAAACCAGTAAATGTATATAAATTATGAATAA--TTTTAAAAT--TGTGTATATATTGTGCAATTTACCCC-ACCCACATTGATTTTGCTG-----TTATTCACAAAA-ATA--------AGAGTTCATTATGTACTTTC-GATAAAATCTATAGTTAC-TT-TTTGATCTGAAGACATATC-TAATTA-----AAA-TAAAAAGACATACATATATACCATCTAACAGGTATTAAA-A---CAAAATTTACACAATCTTCACGCAAAAATGTGTTCTTAATGTTGATATTTT-AGTTCG--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTT--TTTTCAA----ATTG------AATAAAA-AAAATTACCCTTTTTCATACCTTGATGTGATCACTATCT--TAAA-CACATATATTTATTCAGA--CAAAAATATG----C---AAATCGGGTGTATATTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATTTGCGGCCACATTGGAAAC-------G------G--C-TCATTTTTATA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------G-T----CCCT-T-AGATTTATTTCGGTGTAGAG-TA-----GATATCTTTC-AAAA-AGGTATA-CGGGGAATTTGCCAA-ATAATTGGTACTGATTT--GTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|7 : CAGGTGATCAACTTCCA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTGTGTTAGAAATAAATGTTTAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAAAATTGTCAAAT--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCCCACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AAA-----GAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTT-C-TT-TTTAACCTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACTGTCTAACA--TATAAAAAAACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAGTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAAAGAGG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATATATGCTGT--TAAAATT-TG----A---AAATCATGTGTATATTA-NNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG------------GCC----CCCC-C-AGAATTTTTTTGGTGTAAAGAGA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGGCCTA
gi|8 : AGGTGATCGACTTACA-----TGGGCTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTTTATCAATTTTTAGTGTTCATAAATTAATTTCGTTAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATTTATGTATATTAATTATGACTAA--TTGTAAAAT--TGTGTAAATAGTGTGCAATTTACCCC-ACCCACTTCGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-AGA-----G--AGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCT-TAGTT-C-CTGTTTAACTTTATATCATATC-TGATTA-----AAA-TATTAGGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATTTATACAATTTTAATGCAAAAATGGGTTCTTGGTGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAATTCCATTTATTTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTCATG-AG-AACATTACATTTTT-TATACTTTAAGGTGATAAGTAACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TA----A---AAATCGGGTGTATTTTA-TAGATAATGACA-TTTT-TTAAGAAATCGGCGGTCATTTTGGAAGCCATTTTGC--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCCGAGATATG-------------------CCCC-C-AGAATTTTTTTGATGTAGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AAACATA-GTGGAAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACG
gi|9 : CTTCTTGTTTAAAACAAATGTATA---AATA--TTTCAAGTTTGTATTTTC-ATCAATTTTTAGTGTTCATGAATTAATTTCGTAAGAAATAAATGTTAAACA--TGATTAACCAATATATGTATATAAATTATGACTAA--TTTTCAAAC--TGTGTAAATATTGTGCGATTTACCCC-ACCCACTTTGATTTTGCTG-----TAATTCACAAAA-A-A-A-----AAGAGTTTAACACCTAATTTT-GATAAAATCTATAGTTCC-TT-TTTAACCATATATCATATC-TGATTACCGGTAAATTATTACGACATA------TACCATCTAACA--TATAAAA-AACATAAAATGTATACAATTTTAATGCAAAAATGTGTTCTTGATGTTGATGTTTTTAGTTTT--TAT---TAA------------CAAAAATCCATTTA-TTTTCAA-CAGAGTGTGTTTTAATGAAG-AACATTACAATTTT-CATACATTAATGTGATAGGTTACT--TAAAACACATACATTTATGCAGT--TAAAATT-TG----A---AAAGCGGGTGTATATTANNNNNNNNNNNNN-NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AATTG--C-TCATTTTCAGA-------C---ATTAAGCTGTGCCTGAGATATG------------G-C----CCCCAC-AT-TTTTTTTTGGTGTTGAGATA-----TATATCTTTC-AAAA-AATCATA-GGGGGAATTTGCCAG-AAAAATGGTACCAATTT--TTTGTTTAGCTCACGACCTAtc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTACTTCTCAAAAGGAACCTCATCAAAGTTGAAAATGAGATTTTTTTGTTTTCCCTATTTA