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gi|8 : ttgaactcgtaagtactctacttcaaatgtcatatcataaacattacagcttttaatgaaaaaatgattcaatttattgacgacagctacacgttaatagttgggattatctcattATCACCGGGATGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTACTTT-A-TGTATTTCTGGTTTATGCACTGGTGAGTCAAGGACTGTAACCTGTACAACTTAAATGGTTGGTT--CCCA--C----GGTTA-GTAAAAAATGGTGCAGGACTGCAAC-C---AAAAAATGAACTGGAGGA-GTTAGCTCCCTT-GAC--GAAAAAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAAACAAATAACTTACTC-TTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATGAA-GAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGT---------GTTTAACAATATATA-TGTTTATACAAGTCATGTATACTTATTGAATGAAA---TTCATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACAACATG--ACTCCAGCTGAGGGACGCCAGCCAACATAG--TGTTGTCTAGGACCTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTGCC-C-ACTACGATAGGTGTACTAT-TTAATCAATTATTGTAGATGCATGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------C----------CTCGTGGACAA--G------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCGTGACACCATGACAGTTGTGTC--GACATATC-TG--------TA--------TAA---GACATAATCAACACCGAC-AAACATGATGTCTTCAGTCAGTCAGTC----TATGTTTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCAAAGCATTTTGTCGTCTACATATACGG---TGTT-----AATTTTTGAAAGTATTAGAA-C--CAACACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAA-TTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGGAAAGTT---------------------G---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTTGCTGTTGTTAGAATACATTATTGCTTCAGGATCCAAGGGTTTCCAGTTTCATTCCCAGTTGGGTTTCATCACAGTGTCCTATTCAGGTAGGTAAATGA
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gi|14 : caaaaatatataaacagcgatcggaatacttttcattatacacgcaattactttgaccgaaactttgcgaaacatatttactgcagagcaatgactttgtcgtctggttttggtattttaattatcaactaaagctaagaattttatttgtcaaaatagtttaattaTTATTAT-TATGTATTTCCGGTTTATGCATTGGTGAGTCAAGGACTGTTACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTT--CTCA--C----GGTTA-GTAAAAAATGGTGCAGGACGGCAAC-C---AAAAAATGAACTAGAGAA-GTTAGCTCCCTT-GAC--AAAAAA--GTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGCCC-GATAAGTATATGAA-GAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACAAACACTATGTTTTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAATTCATGTGTACTTATTGAAAGTAA---TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACAACATG--ACTCCAGCTGAAG-------------ATAT--TGTTGTCTAGGATCTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTG-CC-C-GCTACGATAGGTGTACTAT-TTAATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-AAATG--------------C----------TTCGTGGACAA--G------TAGTTT----------TCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTT--GACATATC-TG--------gggtga
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20 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-215 ) : NNNNNNNTAACGATATCAA---ACA---CATTTNNATTTAATAGGGGATTTATCACCGGCGC---A---G---G-CCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTGAGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTNGTGAAAAATGGTGCAGGACGGCAAC-C---AAAAAATGAACNGGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GAC-GAA-AAAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCGAATAACTTACTCTTTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGTTTTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAATTCATGTATACTTATTGAATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAGGGACGCCAGCCGACATAT--TGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TAACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TGA---GACGTAATTAACACCGACAAAAAATGAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAATTT----------TTGAAAGTATTAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATCCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGCAAGTAAATGA
gi|1 : AATGATTTCAA----TA---CA----AAATTATTAGGGGATTTATCACTGGCGC----------------------------TTTGCGGAACGGCATTGTACAG--GCGTCCGTTAAATTACAGGTGATACTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTGTGCACTGGTGATTCAAGGACTGTTACTCTTACAACTTAAATGGTTGGTTTACTT----GTCCCGTTAAAAA-GATGCCGGACGGAAAT-A---AAAAAAAGAACAGGAGGAGTA-AACTCCCTT-GAC---A-AAGAAGTGCGCGTTTTT---GGTTGAACCGAATAACTTACTC-TTTCCATACTTTAGAA-A--GTAGTCC-GATAAGTACATG-AAGAAA-TGTTACGTTAAAACGCATAAT-TACGTTTCATACACGATA-TGTTGTATGCTTTAACAATATATA-TTTATAT----TTCATTTATACTTATTGAATAAAATTTGAT-AATAACAGTTTCGAATCTTCCATTCGAACA--CCACGACTCCAGCTGAGGGACG
gi|10 : tgtttaatatatatttggctgccatgtgaccaaaacaatattgaaaagaagacttctgattagtaagttttatgatttattatgatcacagttgtagtagagcgtccactttcgcatgctgaaggtcgttggttcgattcccagtcgggtcatataaaatactttaaaactggtatatgaagcttccttgcttggggctcagcctttaggacatatttatatgtctggttgtcccgatgttcatataatgaaactgtgtggggtatcatatcatatgcctgctgcgtgatacatctgtatgatacctcaaaatactgtttcaagtaggatagtgtgtgagcgtacagtactaaaaagcggaagttgctaatctgcacggcgatgaattgtcagttgctgcatgaaaacaacaaatgtgtattttgtttatcgctcaatttcattatacatttcaagatagacgatattaaggatttatagtaagtaatcttatatcgtattcttacgctgatttgtctcagaaccgaaacattttcacaatatcgatcaatatacgttatggcgatccctgatttttacacgtgtttcgaggattttgttgcaatcaaatgagaatgaattgggttttccacgaatatatgcagtttttacttagatgctggtgcagaaaaatcatttccctatcaaagacttgtattggtttctgcttatttttattaaaaacggatagcgtttgtcaatgtactgttcacttcaatactgtacgcctagttgcttcttccactttatcgactgcacggctaggtgacagttaaaaaatcagtgataccaacggatttaatgaaattctgtacctgttatacgttatatcacaagcgcaaagtatatctcctaacctattgtatgacatgcgaaatttaggctgactatttaaAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TTCGTTACATACACGATGTGTTTT-ATGATTAAACAATATATA-TGTATATACAATTCATGTATTCTTATTGAACGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATATGCCATCCGAACA--ACATGACAGTAGCTAAGGGACGCCAGCCAACATAT--TGATGTCCTGGAT-----CTTAGTACAATTATACGTATAGATAAA-GG-CTGGTACACTTGT-TATTTTGCCCGCTACGACAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGAGGCATGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACACAA-TAATG--------------CTTCGTGGACAAGTATCGATAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCA--------TAACAGTTGTGTTGACATATCTGTGCTATATTA--------TGT---GACGTAATTAACACTGACAAAAAATGAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTAGC-------CTCGCAACTTTGCTCTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAA-TT----------TTGAAAATATTAGAATCA--A--AACTG---TATTTATAACATGAC--TTAC---ATTGTTTCAAGTAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTG---------------------TTAGCAGGTGTATTTTTTTATTTGTAAGTATGGGGTAAATCGTGTTGCCCTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTACAGTGCCTTATTCGGgattggacgtagcaaataaacaatttttaaaggatggccttagttatcacatattcagataaaataatgtacacttg
gi|11 : ATCACCAGGACGGTTTTGTACATAAGAGTCCGTTAAATTACAAGCGATGCCTA--CATTGTAT-TGCACTACCAGTTTA------GATAAGTC----------ACTCTTACAACTTAAATTGCTGGGTCCCAC-----GTCTACGTAAAATGATAAAGGACGGCAAC-C---AAAA---GAAAATAAGATGTTAAG----CTT-AACTGAACAAAAACTGCGTG--TTT---AGCAAAAGCGAATAACTAAAACTCTGCCATACTGCAAAATA--ATAGTC----------TATGAAAGAAA-TGTTATGTTAAGATGCA-TATATACGTTAGATTCACGATATGTTGTCA------AA------ATA-TTCACATTTAATTCATG----CCTATTGAATAAAA-TTGGCAAATAACAGTTCCGAACCGGTCATCCGAACAACACACAACTCCAGCTGAGGGCAGCCAGCCATCATAT--TGTTGACTAGGAT-----CTTAGTGC-ATT--------------------TGATG---TTG-------TGCATGCTACATTAGGTGTACTATTT-AATGATTTATTGTAGATGCACGAACTTGGAAGTTTTGCCACTTACACAA-TAACGCACGGCAACTTATTCTTCTTGGACAGG------GAGATCTTTTTACAGATCGTAACACCG--------TAACATTTATGTTGACATGT---------------------------GACGTAATCACCGCTGCCAAAATATG
gi|11 : gagttTGTCGGGATCTACA---GTGGTGCTTATTTAAAACTAACGTTAAAGGTATTAGAACCC--GTTTA-TGAGTTATTTTAAACATG-C--CTGC--TGT--TTTTACTTAATTGTCTCTGTTAGAATTAAttaacaaaattgatgtcgggatctacagtggtgcttatttaaaactaacgttaaaggtattagaacccgtttatgagttattttaaacatgcctgctgtttttacttaattgtctctgttagaattaaaactcaaaggaaggttgtatgaagggaatttaaagtagtgtatc
gi|12 : gagttatcaccaggacggttttgtacataagagtccgttaaattacaagcgatgcctacattgtattgcactaccagtttagataagtcactcttacaacttaaattgctgggtcccacgtctacgtaaaatgataaaggacggcaaccaaaagaaaataagatgttaagcttaactgaacaaaaactgcgtgtttagcaaaagcgaataactaaaactctgccatactgcaaaataatagtctatgaaagaaatgttatgttaagatgcatatatacgttagattcacgatatgttgtcaaaatattcacatttaattcatgcctattgaataaaattggcaaataacagttccgaaccggtcatccgaacaacacacaactccagctgagggcagccagccatcatattgttgactaggatcttagtgcatttgatgttgtgcatgctacattaggtgtactatttaatgatttattgtagatgcacgaacttggaagttttgccacttacacaataacgcacggcaacttattcttcttggacagggagatctttttacagatcgtaacaccgtaacatttatgttgacatgtgacgtaatcaccgctgccaaaatatgttaacaaaattga-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTTAGTCAAGGACTGTAACCCGTACAGCTTAAATGGTTAGTTCCCAC----GGTTAGTGAAAAACGGTGCAGGATGGCAAC-TAAAAAAAAATTAACTGGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GAC-G-A-ATAAAGTGCACA--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTC-TATCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATG-TGTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAATTCTTGTATACTTATTAAATGAAG-TTGATAAAAAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAGGACGCAAGCCGACATAT--TGTTGTCGAGGGC-----CTTCGTACAATTATACG--TATATAAA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTGCCCGCTACGATATGTGTACTGTTT-AATTATTTATTGTAAATGCACGGTCTTA----------CAC------AA-TAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTaactcaaaggaaggttgtatgaagggaatttaaagtagtgtatc
gi|13 : ttgaactcgtaagtactctacttcaaatgtcatatcataaacattacagcttttaatgaaaaaatgattcaatttattgacgacagctacacgttaatagttgggattatctcattATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGACGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGTTGAGTCAAAGACTGTAACCCGTACAACTAAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTTGTGAAAAACGGT--------GCAAC-C---AAAAAATGAACTGGAGGAGTT-AGCTCCTTT--AC-G-A-ATAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAAACAAGTAACTTACTC-TTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTTC-GATAAGTATACG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATG-TGTTTTATGATATAACACTATATT-TGTATATACAATTCATGTATACTTATTGGATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATTTGCCATCCAAACA--ATATGACTCCCGCTGAGGGACGCCAGCCGAC--AT--TGTTGTCCAGGGT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGATAAA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCAC
gi|14 : aaaagcatttgaaatatatttatattcatggcaatattgaaatcgaaatttagccatacttacgtgtcagatcaattattttacattaaacatcgtaataacatataaatgctttaatcgccaacattataggggatttTTATTAT-TATGTATTTCCGGTTTATGCATTGGTGAGTCAAGGACTGTTACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCTCAC----GGTTAGTAAAAAATGGTGCAGGACGGCAAC-C---AAAAAATGAACTAGAGAAGTT-AGCTCCCTT-GAC---A-AAAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGCCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACAAACACTATGTTTTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAATTCATGTGTACTTATTGAAAGTAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAG-------------ATAT--TGTTGTCTAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TA-TTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-AAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTT----------TCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTTGACATATCTG--------
gi|15 : T----------TTACAGGTATTAGATCCAGAA--TATTAGATTATTTA-AACATGTC--T------ATTGTTTTAAATAGTTTTCTC-GGTGAAATTAATA
gi|17 : gtacacatcatgaccccaaacgtttgtattttgacctgtgacgtaatcaccacttcccgtcgtctgccaaaaattgaaaacaataacaagttccatttgaagtctgtcatatcttcactacagtgtttgtttaaaggtttataaacacaTAACGATATCA--------------TGTTTTTAAGATGGTATTTATCCCCGGCGC---C---ATGTG-CCG---ATGT-A-AATCATCGGAACGGCATTGTACAA--GAGTCCGTTAAATTTCAAATGATGCATATTTATTTT-T-TAAACTTCCGATTTATGGACTGGTGTGTCAAGAATAGTCACTCTTACAACCTAAATGGCTGGGTCCCACCTCTGGTT-----AAAATGGTACAGGGTGGCAAC-C---AAAAAA-GAACAGGAGGAGTA-AGCTGCCTT-GAC-GAA-AAAACATGCGTG--TTC---GGTTAAACCGAATAACTTACTC-TTTCCATATTGCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAATACATG-GAGAAA-TGTAACGTAAATGCTCATAAT-TTCGTTAGATACGCGATGTttcagaatgaattatacggggtttataatgtacctgtggatggcaactgtagtagatctattttgttcaatggcgacttcagtaactctgtcatatacagaaatttgatatgtcagcagcgtatcgatcgaaactgggacaattgacaccaaaaggttagtatgtgcaatggtgcctttatgctgtgatttgtatcgtgatggcatgttgaatggtacattggtgggcatttgcttgtgaaattgaagcagcctcagaactactggactgt
gi|19 : tacagaaCTG--------TA--------TGA---GACGTAATTAACACCGA-AAAAAATGAT--GTC-TTTAGTC--------T-TGTTTTTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCATAAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAATGTTAATTT----------TTGAAAGTATAAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTATAGTTG---------------------TTAGCACGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGT---CATTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGCGTCTCCAGTTTCATTCCCGGTTGTGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGTAGGTAAATGA
gi|2 : ATCACCAGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCTGGTTTATGCACTGGTGAGTCAAGGACTGTAACCCGTAAAACTTAAATAGTTGGTTCCCAT----GGTTGGTGAAAAATGGTGCAGGACGGCAAC-C---AAAAAATGAACTGGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GAC--AA-AAAAAGTGCACA--TTT---GGCTAGACCAAATAACTTACT-TTTTCCATACTTAAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTAGATACACGATGTGTTTT-ATGATTTAAGTATATATA-TGTATATACAATTCATGTATACTTGGTGAATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA-----TGACTCCAGCTGAGGGACGACAGCCAACATAT--TGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACA--TATAT-AA-AGACTGATACACTTGT-TATTTTGCCAGCTACGATAGATGTACTATT--AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACACAA-TAATG--------------CTTTGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TAACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TACTGTATTATGT---GACGTAATTACCACTGACAAAAA-TGAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAATTT----------T-GAAAGTATTAGAACTA--A--TACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCACTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGGCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTTTTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCTAGTTTCATGCCTGGTTGGGTTTCATCACAGTACCTTATTCGGGCAAGTAAATGA
gi|20 : cgtattgcctgccaagcagctgaaagtataaaataaatatttaataatcactgtgggtgaagataataggggattt---ATA---CATTTAACTTTAATAGGGGATT-ATTCCCAGCTC---A---A---A-ACATCTGTGATATAATAGCCAGAACAGTATTGTACAC--AAGTCCGATAAATGGCAGTTGATAGCTATTTG-CTA-T-TGGAACTCCTGTTTCGGAATTGGTGAATCAAGAATAGTCACTCTAACAACTTTAGTTTTTGAGTCCAGA----AACTCTTAAAAAATGa
gi|21 : tttttttttgaaatgtctgaccatatgataatattgttttcaaccctagattaaagtgtatagcaatactgaaatgttcattttgaacttgtcagtaccaaaatgaagctttaaattaaagttctCAGCCGACATAT--AGTTGGCCAGGAT-----CTTAGTGCAATTATACG--TAGAT-AAAGG-CTGATACACTTGT-TAATTTGTGTGCTACAGTAGATGTACTATTT-ATTCAGTTATTGTAGATGCACAATCTTGGAAGTTTTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CTTCGTGCACAAG------TAGTTTACATTACAGATCGGGACACCA--------TAACAGTTATGTTGACATATCTG--------TA--------TGT---GATGTAATTAATAGTGAC-AAAAATGAT--GTC-TCCAGTCAGTCCGTCTATGTTTGTTTACC-------GTCGCAGCTTTGGTCTAGGTATTTTtaaaacacaggag
gi|24 : GAACAGGAGGAGTA-AGCTCCCTT-GAC---A-AAAAAGTGCGCG--TTTTTCGGTTACACCGAATAAATTACTATTC-CCATACTTAAAAA-AAAGTAGTCC-GATATGTACATA-AAAAAAACGTTACGTTAAAACGCATAAT-TACGTTTCATACACGTTGTGTTT--ATACTTTAACAATATATA-TTTACAT----TTCATTTATACTTATTGAATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATTTGAACA--ACATGACTCCAGCTAAGGGACGCCAG-CGACATAT--CGTTGGCCAGGActatacaagtctgttaaataaatttttggt
gi|27 : GATGAGTT-TGCTCCCTTTGAC-GAA-AAAA-GTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATATTTTACTCTT--CCATACTTCAAAA-A--GTAATCC-AATAAGTATACG-AAGAAA-TGTTACGGAAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGACG-TGTTTTATGCTTTAACAATATATATTGTATATACA-------------TATTGAATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGTAACTGCCATCGGAACA--A
gi|29 : TTTATAACATGAC--TTGCACTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATTAGGTAGGCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCTAGTTTCATGCCTGGTTGGGTTTCATCACAGTACCTTATTCGGGCAAGTAAATGA
gi|3 : TAACAATATCAAGGAACA---CATTTTTATTTAATAGGGGATTTATCACCGGCAC---A---G---GGCCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTACATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATTCACTGGTGTGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCTCAC----GGTTAGTAAAAAATGGTGCAAGACGGCAAC-C---AAAATATGAACTAAAGGAGTT-AACTCCCTT-GAC-AAA-AAAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGTTTTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAAGTCATGTATACTTATTGAAAGTAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAGGACGCCAGCCAACATAT--TGTTGTCTAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTT-CTCGCTACGATAGGTGTAGTTTTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CCTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TGA---GACGTAATCAACACCGACAAAAAAAGAT--GTC-TTTAGTCAGTCAGTCTATGATTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCAAGGTATTTTGTCG---TCTACATATACAATGTTAATTT----------TTGGAAGTATAAGAACAA--A--TACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTATATTTGTTAGTATGGGGTAAATCATGTCGCCGTTGTAAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATTCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGTAAGTAAATGA
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gi|33 : GTGCAATTGTACG--TAGGT-AA-AG--------GCTTGTGTATTT-GCGTGCTACGGTAGGTGTACTATTT-ATTCAGTTATTCTACATGCACGATCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAATTTTCGTTACAGAACGTGACACCG--------TTACAGTTGTGTTGACATATCacttattcttctcgggacaaaggtggtctctct
gi|35 : ATGTAATAGGGGATTTATCACCGGCGC---A---AAGCG-CCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GGGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGT
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gi|4 : agATTTTCATT--ATAGGGGATTTATGACCGGCGC---AAAGG---G-CCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTGGGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCCCAG----GGTTGATGAAAAATGGTATAGGCGGGCAAC-C---AAAAATTTAACAAGAGGAGTT-AACTCCCTT-GAC--AA-ATAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGTCCCGATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGATAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGTGTTTT-ATGATTTAACAAT---------ATATA-------TGTATA--TAC-------AA-TTCATG---------------TCTGCCATCCGAACA--ACATGACACCAGCTGAGGGACGCCAGCCGACATATATTGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TATAT-AAAGG-CTGTTA---TTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCTACTTACACAC-TAATA--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------AAACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TTATGTGACGTAATTAACACTGACAAAAAAATAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCTA----TGTTTACC-------ATCGCAGCTTTGCTTTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAA-TT----------TTGAAAGTATTAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGACTGTTGCC---CTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTGTTTCCGGTATTCAGTAATACGTTAGCAGGGGTA-TTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATCCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGCAAGTAAATGA
gi|43 : aaataatatatgaCAGTCAGTTTATGTTT----ACC-------TTCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTTG---TGTACa
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gi|13 : ttgaactcgtaagtactctacttcaaatgtcatatcataaacattacagcttttaatgaaaaaatgattcaatttattgacgacagctacacgttaatagttgggattatctcattATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGACGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGTTGAGTCAAAGACTGTAACCCGTACAACTAAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTTGTGAAAAACGGT--------GCAAC-C---AAAAAATGAACTGGAGGAGTT-AGCTCCTTT--AC-G-A-ATAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAAACAAGTAACTTACTC-TTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTTC-GATAAGTATACG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATG-TGTTTTATGATATAACACTATATT-TGTATATACAATTCATGTATACTTATTGGATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATTTGCCATCCAAACA--ATATGACTCCCGCTGAGGGACGCCAGCCGAC--AT--TGTTGTCCAGGGT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGATAAA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCAC
gi|14 : aaaagcatttgaaatatatttatattcatggcaatattgaaatcgaaatttagccatacttacgtgtcagatcaattattttacattaaacatcgtaataacatataaatgctttaatcgccaacattataggggatttTTATTAT-TATGTATTTCCGGTTTATGCATTGGTGAGTCAAGGACTGTTACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCTCAC----GGTTAGTAAAAAATGGTGCAGGACGGCAAC-C---AAAAAATGAACTAGAGAAGTT-AGCTCCCTT-GAC---A-AAAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGCCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACAAACACTATGTTTTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAATTCATGTGTACTTATTGAAAGTAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAG-------------ATAT--TGTTGTCTAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TA-TTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-AAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTT----------TCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTTGACATATCTG--------
gi|15 : T----------TTACAGGTATTAGATCCAGAA--TATTAGATTATTTA-AACATGTC--T------ATTGTTTTAAATAGTTTTCTC-GGTGAAATTAATA
gi|17 : gtacacatcatgaccccaaacgtttgtattttgacctgtgacgtaatcaccacttcccgtcgtctgccaaaaattgaaaacaataacaagttccatttgaagtctgtcatatcttcactacagtgtttgtttaaaggtttataaacacaTAACGATATCA----------TGTTT----TTAAGATGGTATTTATCCCCGGCGC---CATGTG-CCG---ATGT-A-AATCATCGGAACGGCATTGTACAA--GAGTCCGTTAAATTTCAAATGATGCATATTTATTTT-T-TAAACTTCCGATTTATGGACTGGTGTGTCAAGAATAGTCACTCTTACAACCTAAATGGCTGGGTCCCACCTCTGGTT-----AAAATGGTACAGGGTGGCAAC-C---AAAAAA-GAACAGGAGGAGTA-AGCTGCCTT-GAC-GAA-AAAACATGCGTG--TTC---GGTTAAACCGAATAACTTACTC-TTTCCATATTGCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAATACATG-GAGAAA-TGTAACGTAAATGCTCATAAT-TTCGTTAGATACGCGATGTttcagaatgaattatacggggtttataatgtacctgtggatggcaactgtagtagatctattttgttcaatggcgacttcagtaactctgtcatatacagaaatttgatatgtcagcagcgtatcgatcgaaactgggacaattgacaccaaaaggttagtatgtgcaatggtgcctttatgctgtgatttgtatcgtgatggcatgttgaatggtacattggtgggcatttgcttgtgaaattgaagcagcctcagaactactggactgt
gi|19 : tacagaaCTG--------TA--------TGA---GACGTAATTAACACCGA-AAAAAATGAT--GTC-TTTAGTC--------T-TGTTTTTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCATAAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAATGTTAATTT----------TTGAAAGTATAAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTATAGTTG---------------------TTAGCACGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGT---CATTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGCGTCTCCAGTTTCATTCCCGGTTGTGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGTAGGTAAATGA
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gi|20 : cgtattgcctgccaagcagctgaaagtataaaataaatatttaataatcactgtgggtgaagataataggggattt---ATA---CATTTAACTTTAATAGGGGATT-ATTCCCAGCTC---AA---A-ACATCTGTGATATAATAGCCAGAACAGTATTGTACAC--AAGTCCGATAAATGGCAGTTGATAGCTATTTG-CTA-T-TGGAACTCCTGTTTCGGAATTGGTGAATCAAGAATAGTCACTCTAACAACTTTAGTTTTTGAGTCCAGA----AACTCTTAAAAAATGa
gi|21 : tttttttttgaaatgtctgaccatatgataatattgttttcaaccctagattaaagtgtatagcaatactgaaatgttcattttgaacttgtcagtaccaaaatgaagctttaaattaaagttctCAGCCGACATAT--AGTTGGCCAGGAT-----CTTAGTGCAATTATACG--TAGAT-AAAGG-CTGATACACTTGT-TAATTTGTGTGCTACAGTAGATGTACTATTT-ATTCAGTTATTGTAGATGCACAATCTTGGAAGTTTTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CTTCGTGCACAAG------TAGTTTACATTACAGATCGGGACACCA--------TAACAGTTATGTTGACATATCTG--------TA--------TGT---GATGTAATTAATAGTGAC-AAAAATGAT--GTC-TCCAGTCAGTCCGTCTATGTTTGTTTACC-------GTCGCAGCTTTGGTCTAGGTATTTTtaaaacacaggag
gi|24 : GAACAGGAGGAGTA-AGCTCCCTT-GAC---A-AAAAAGTGCGCG--TTTTTCGGTTACACCGAATAAATTACTATTC-CCATACTTAAAAA-AAAGTAGTCC-GATATGTACATA-AAAAAAACGTTACGTTAAAACGCATAAT-TACGTTTCATACACGTTGTGTTT--ATACTTTAACAATATATA-TTTACAT----TTCATTTATACTTATTGAATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATTTGAACA--ACATGACTCCAGCTAAGGGACGCCAG-CGACATAT--CGTTGGCCAGGActatacaagtctgttaaataaatttttggt
gi|27 : GATGAGTT-TGCTCCCTTTGAC-GAA-AAAA-GTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATATTTTACTCTT--CCATACTTCAAAA-A--GTAATCC-AATAAGTATACG-AAGAAA-TGTTACGGAAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGACG-TGTTTTATGCTTTAACAATATATATTGTATATACA-------------TATTGAATGAAA-TTGATAAATAACAGTTTCGTAACTGCCATCGGAACA--A
gi|29 : TTTATAACATGAC--TTGCACTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATTAGGTAGGCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCTAGTTTCATGCCTGGTTGGGTTTCATCACAGTACCTTATTCGGGCAAGTAAATGA
gi|3 : TAACAATATCAAGGAACA---CATTTTTATTTAATAGGGGATTTATCACCGGCAC---AG---GGCCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTACATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATTCACTGGTGTGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCTCAC----GGTTAGTAAAAAATGGTGCAAGACGGCAAC-C---AAAATATGAACTAAAGGAGTT-AACTCCCTT-GAC-AAA-AAAAAGTGCACG--TTT---GGCTAAACCAAATAACTTACTCTTTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGTTTTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAAGTCATGTATACTTATTGAAAGTAA-TTGATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAGGACGCCAGCCAACATAT--TGTTGTCTAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTT-CTCGCTACGATAGGTGTAGTTTTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CCTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TGA---GACGTAATCAACACCGACAAAAAAAGAT--GTC-TTTAGTCAGTCAGTCTATGATTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCAAGGTATTTTGTCG---TCTACATATACAATGTTAATTT----------TTGGAAGTATAAGAACAA--A--TACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTATATTTGTTAGTATGGGGTAAATCATGTCGCCGTTGTAAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATTCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGTAAGTAAATGA
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gi|33 : GTGCAATTGTACG--TAGGT-AA-AG--------GCTTGTGTATTT-GCGTGCTACGGTAGGTGTACTATTT-ATTCAGTTATTCTACATGCACGATCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAATTTTCGTTACAGAACGTGACACCG--------TTACAGTTGTGTTGACATATCacttattcttctcgggacaaaggtggtctctct
gi|35 : AATGTAATAGGGGATTTATCACCGGCGC---AAAGCG-CCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTACAC--GGGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGT
gi|37 : gtcaagagaatatcatttttccttcacaatgcagaaaTTTTTTT-TTTGTTAGTATGGGGTAAATTGTGTTGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATTCA-GGGTCTTCAGTTTCATCCCTGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGCAAGTAAATGA
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gi|43 : aaataatatatgaCAGTCAGTTTATGTTT----ACC-------TTCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTTG---TGTACa
gi|47 : gtttgtattgAGTTTCATCCCCAGCTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGAGCAAGTAAATGA
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gi|49 : CAATAAAAATTGGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCTAT
gi|5 : acactgagAA---ACAGTCCATTTGAATTTATTAGGGGATTTATCACCGGCGC----------TC-------------TCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTAAGCACTGGTGAGTCAAGGACTGTAACCCGTACAATTTAAATGGTTGGTTCTCAC----GGTTATTAAAAAATGGTGCAGAACGGCAAC-C---AAAATATGAACTAGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GAC--AA-AAAAAGTGCACG--TTT---GGCCAAACCAAATAACTTACTCTTTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACACACACGATGTTTT-TTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAAGTCATGTATACTTATTGAAAGTAA-TTGATAAATAACTGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAGGACGCCAGCCAACATAT--TGTTGTCTAGGAT-----TTTAGTACAATTATACG--AAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTTCCCACTACGATAGGTGTAGTTTTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACTGTCTTGGAAGGATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CCTCGTGGACAAG------AAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TGA---GACGTAATTAACACCGACAAAAAATGAT--GTC-TTTAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCAAGGTATTTTGTCG---TCTACATATACAATGTTAATTT----------TTGGCAGTATAAGAACCA--A--TACTG---TA----------------TGCCTTGTTGTTTCAAATAATGTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGAATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTACATCGTGTCGCCGTTGTAAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATTCCCGGTTGGGTTTCATCACAATGCCTTATTCGGGTAAGTAAATGA
gi|6 : taatTAGTAGGGGATTTATGACCGGCGCTTTGC---G-CCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTTCAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTGGGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTCGTGAAAAATGGTATAGGACGGCAAC-C---AAAAAATTAACAAGAGGAGTT-AACTCC-TT-GAC--AA-ATAAAGTGCACG--TTTTT-GGCTAAACCAAATAGCTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGTCCCGATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGATAATACGCATTGT-TACGTTACATACACGATGTGTTTT-ATGATTTAACAAT---------ATATA-------TGTATA--TAC-------AA-TTCATG---------------TCTGCCATCCGAACA--ACATGACACCAGCTGAGGGAAGCCAGCCGACATATATTGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TATAT-AAAGG-CTGTTA---TTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCTACTTACA-CACTAATA--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TAACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TTATGTGACGTAATTAACACTGACAAAAAATTAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTACC-------ATCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAA-TT----------TTGAAAGTATTAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGACTGTTGCC---CTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTGTTTCCGGTATTCAGTAATACATTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATCCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGCAAGTAAATGAa
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19 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|6 : taatTAGTAGGGGATTTATGACCGGCGCTTTGC---G-CCG---GTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTTCAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTGGGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTCGTGAAAAATGGTATAGGACGGCAAC-C---AAAAAATTAACAAGAGGAGTT-AACTCC-TT-GAC--AA-ATAAAGTGCACG--TTTTT-GGCTAAACCAAATAGCTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGTCCCGATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGATAATACGCATTGT-TACGTTACATACACGATGTGTTTT-ATGATTTAACAAT---------ATATA-------TGTATA--TAC-------AA-TTCATG---------------TCTGCCATCCGAACA--ACATGACACCAGCTGAGGGAAGCCAGCCGACATATATTGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TATAT-AAAGG-CTGTTA---TTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCTACTTACA-CACTAATA--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TAACAGTTGTGTTGACATATCTG--------TA--------TTATGTGACGTAATTAACACTGACAAAAAATTAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTACC-------ATCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAA-TT----------TTGAAAGTATTAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGACTGTTGCC---CTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTGTTTCCGGTATTCAGTAATACATTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATCCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGCAAGTAAATGAa
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19 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|5 : acactgag------CATTTGAATTTATTAGGGGATTTATCACCGGCGC-------TC----------TCACCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTAAGCACTGGTGAGTCAAGGACTGTAACCCGTACAATTTAAATGGTTGGTTCTCAC----GGTTATTAAAAAATGGTGCAGAACGGCAAC-C---AAAATATGAACTAGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GAC-AAAAAAA-GTGCACG--TTT---GGCCAAACCAAATAACTTACTCTTTTCCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACACACACGATGT-TTTTTATGATTTAACAATATATA-TGTATATACAAGTCATGTATACTTATTGAAAGTAA-TTGATAAATAACTGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAAGGACGCCAGCCAACATAT--TGTTGTCTAGGAT-----TTTAGTACAATTATACG--AAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTTCCCACTACGATAGGTGTAGTTTTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACTGTCTTGGAAGGATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CCTCGTGGACAAG------AAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TGACAGTTGTGTTGACATAT-----CTG-----TA-----TGA---GACGTAATTAACACCGACAAAAAATGAT--GTC-TTTAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCAAGGTATTTTGTCG---TCTACATATACAATGTTAATTT----------TTGGCAGTATAAGAACCA--A--TACTG---TA----------------TGCCTTGTTGTTTCAAATAATGTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTG---------------------TTAGCAGGGGAATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTACATCGTGTCGCCGTTGTAAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATTCCCGGTTGGGTTTCATCACAATGCCTTATTCGGGTAAGTAAATGA
gi|6 : taataaacagtcTAGTAGGGGATTTATGACCGGCGCTTTG-CGCCGGTGA-A-AATCACCGGAACGGCATTGTTCAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTGGGTCAAGGACTGTAACCCGTACAACTTAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTCGTGAAAAATGGTATAGGACGGCAAC-C---AAAAAATTAACAAGAGGAGTT-AACTCC-TT-GAC-AAATAAA-GTGCACG--TTTTT-GGCTAAACCAAATAGCTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGTCCCGATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGATAATACGCATTGT-TACGTTACATACACGATGTGTTTT-ATGATTTAACAAT---------ATATA-------TGTATA--TAC-------AA-TTCATG---------------TCTGCCATCCGAACA--ACATGACACCAGCTGAGGGAAGCCAGCCGACATATATTGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACG--TATAT-AAAGG-CTGTTA---TTGT-TATTTTGCCCGCTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAGTTATTGTAGATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCTACTTACA-CACTAATA--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TAACAGTTGTGTTGACATAT-----CTG-----TA-----TTATGTGACGTAATTAACACTGACAAAAAATTAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTACC-------ATCGCAGCTTTGCTCTAGGCATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAA-TT----------TTGAAAGTATTAGAACCA--A--TACTG---TATTTATAACATGACTGTTGCC---CTGTTTCAAATAATTTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGTCTAGTTGTTTCCGGTATTCAGTAATACATTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTCGCCGTTGTTAGGATACATTATTGCTTCAGGATCCAGGGGTCTCCAGTTTCATCCCCGGTTGGGTTTCATCACAGTGCCTTATTCGGGCAAGTAAATGAa
gi|7 : AATGATTTCAA------TAT--AAAATTATTAGGGGATTTATCACTGGCGC-------------------TTTGCGGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGT-------------ATATTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTGTGCACTGGTGATTCAAGGACTGTTACTCTTACAACTTAAATGGTTGGTTTACTT----GTCCCGTT-AAAATGGTGCCGGACGGAAATAA---AAAAAAAGAACAGGAGGAGTA-AACTCCCTT-GAC--AAAGAA-GTGCACGTTTTT---GGTTGAACCGAATAACTTACTC-TTTCCATACTTTAGAA-A--GTAGTCC-GATAAGTACATG-AAGAAA-TGTTACGTTAAAACGCATACT-TACGTTTCATACACGATATG-TTGTATGCTTTAACAATATATA-TTTATGT----TTCATTTATACTTATTGAATAAAATTTGAT-AATAACAGTTTCGAATCTTCCATTCGAACA--CCACGACTCCA
gi|8 : gaagttgctaatctgcacggcgatgaattgtcagttgctgcatgaaaacaacaaatgtgtattttgtttatcgctcaatttcattatacatttcaagatagacgatattaaggatttatagtaagtaatcttataccgtattcttacgctgatttgtctcagaaccgaaacattttcacaatatcgatcaatatacgttatggcgatccctgatttttacacgtgtttcgaggattttgttgcaatcaaatgagagtaaattgggttttccacgaatatatgtagtttttacttagatgttggtgcagaaaaatcatttccctatcaaagacttgtattggtttctgcttatttttattaaaaacggatagcatttgtcaatgtactcttcacttcaatactgtacgcctagttgcttattccactttatcgactgcacagctaggtgacagttaaaaaatcagtgataccaacggatttaatgaaattctgtacctgttatacgttatatcacaggcgcaaagtatatctcctaacctattgtatgtcatacgaaatttaggctgactatttaaAATAGGGGATTTATCACCGG
gi|8 : ATCACCGGGATGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTACTTT-A-TGTATTTCTGGTTTATGCACTGGTGAGTCAAGGACTGTAACCTGTACAACTTAAATGGTTGGTTCCCAC----GGTTAGTAAAAAATGGTGCAGGACTGCAAC-C---AAAAAATGAACTGGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GACGAAAAAAA-GTGCACG--TTT---GGCTAAAACAAATAACTTACTCTTT-CCATACTTCAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGTGTTT---------AACAATATATA-TGTTTATACAAGTCATGTATACTTATTGAATGAAA-TTCATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCGAACA--ACATGACTCCAGCTGAGGGACGCCAGCCAACATAG--TGTTGTCTAGGAC-----CTTAGTACAATTATACG--TAGAT-AA-GG-CTGATACACTTGT-TATTTTGCCCACTACGATAGGTGTACTATTT-AATCAATTATTGTAGATGCATGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACA-AA-TAATG--------------CCTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCGTGACACCATGACAGTTGTGTCGACATAT-----CTG-----TA-----TAA---GACATAATCAACACCGAC-AAACATGAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTACC-------CTCGCAGCTTTGCTCAAAGCATTTTGTCG---TCTACATATACGGTGTTAATTT----------TTGAAAGTATTAGAACCA--A--CACTG---TATTTATAACATGAC--TTGCCTTGTTGTTTCAAATAA-TTTCTCTGCTAAAATTGATAAGGTAGGAAAGTTG---------------------TTAGCAGGGGTATTTTTTTATTTGTTAGTATGGGGTAAATCGTGTTGCTGTTGTTAGAATACATTATTGCTTCAGGATCCAAGGGTTTCCAGTTTCATTCCCAGTTGGGTTTCATCACAGTGTCCTATTCAGGTAGGTAAATGAgatggcattgtacacgcgtccgttaaattacaagtgatgcttatttactttatgtatttctggtttatgcactggtgagtcaaggactgtaacctgtacaacttaaatggttggttcccacggttagtaaaaaatggtgcaggactgcaaccaaaaaatgaactggaggagttagctcccttgacgaaaaaaagtgcacgtttggctaaaacaaataacttactctttccatacttcaaaaagtagtccgataagtatatgaagaaatgttacggtaatacgcattattacgttacatacacgatgtgtttaacaatatatatgtttatacaagtcatgtatacttattgaatgaaattcataaataacagtttcgaatctgccatccgaacaacatgactccagctgagggacgccagccaacatagtgttgtctaggaccttagtacaattatacgtagataaggctgatacacttgttattttgcccactacgataggtgtactatttaatcaattattgtagatgcatggtcttggaagtattgccacttacaaataatgcctcgtggacaagtagttttcgttacagatcgtgacaccgtgacaccatgacagttgtgtcgacatatctgtataagacataatcaacaccgacaaacatgatgtcttcagtcagtcagtctatgtttgtttaccctcgcagctttgctcaaagcattttgtcgtctacatatacggtgttaatttttgaaagtattagaaccaacactgtatttataacatgacttgccttgttgtttcaaataatttctctgctaaaattgataaggtaggaaagttgttagcaggggtatttttttatttgttagtatggggtaaatcgtgttgctgttgttagaatacattattgcttcaggatccaagggtttccagtttcattcccagttgggtttcatcacagtgtcctattcaggtaggtaaatgaa
gi|9 : aataggggatttGAACGGCATTGTACAC--GCGTCCGTTAAATTACAAGTGATGCTTATTTATTTT-T-TGTATTTCCGGTTTATGCACTGGTGAGTTAAGGACTGTAACCCGTAAAACTTAAATAGTTGGTTCCCAC----GGTTGGTGAAAAATGGTGCAGGACGGCAAC-C---AAAAAATAAACTGGAGGAGTT-AGCTCCCTT-GAC--AAAAAA-GTGCACG--TTT---GGCTAGACCAAATAACTTACT-TTTTCCATACTTAAAAA-A--GTAGTCC-GATAAGTATATG-AAGAAA-TGTTACGGTAATACGCATTAT-TACGTTACATACACGATGTG-TTTTATGATTTAAGTATATATA-TGTATATACAATTCATGTATACTTGGTGAATGAAA-TTAATAAATAACAGTTTCGAATCTGCCATCCG---A--ACATGACTCAAGCTGAGGGACGACAGCCAACATAT--TGTTGTCCAGGAT-----CTTAGTACAATTATACA--TATATAAA-GA-CTGATACACTTGT-TATTTTGCCAGCTACGATAGGTGTTCTA-TT-AATCAGTTATTGTACATGCACGGTCTTGGAAGTATTGCCACTTACACAA-TAATG--------------CTTCGTGGACAAG------TAGTTTTCGTTACAGATCGTGACACCG--------TAACAATTGTGTTGACATATCTGAACTG-----TA-----TTATGTGACGTGATTACCACTGAC-AAAAATGAT--GTC-TTCAGTCAGTCAGTCTATGTTTGTTTACCATCGCAGCTCGCAGCTTTGCTCTAGGTATTTTGTCG---TCTACATATACAGTGCTAA-TT----------TTGAAAGTATTAGAACTA--A--TACTG---TATTTATAACa
19 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TCACAATGTGGAAGCGTGCAGCATTGAAAATCGAAAGTTGCTAATCTTTACAGCGATAATTCGTCATTTGACTTGCTATGGAAAAACAGGAAGTGGATTTGTTGTAATCGCAAAATTTTATCATAAGTTTCTAGAAGAAAGAAGAAAATTCATATTTGTAGTACTTTGCATTTTTATACCACAGTAGACCTACTTACTGTTTACCCATGTTGGTTTGTCCAAGACACAATCTATCAAAACAGATTATTATGATCATGGCGATCCCGGGCGTTTACAAGTGTTTCTCGGGTTCTTTTGCTGTCAAATGAGCATAACTAGGGTCTTATTGCGAACATATCAAGTTACCACTTAAACGTTGTAAATAATTGTTTCACCAATATATCATTCTGTCCATTTCTTCTTTTTTC
Unaligned ( gi|18 ): AGTGTAAGAGCGTACAGTATTGAAAAGCGGAAGATGCCGGTTTGTACGGCGATGAATTGTCAGTTGCTGTTTGAAAAAAAAAAAAAACGTAGGTTTTGTTTATCGCTCAATTTCATTATACATTTCAAAAAGAAAGACGATATTTAGGATTTGTAGTAAGTAATCTTATATCGCAGTATTGTTTTCTTACGCTGCTTTGTCTCAGAACCTGAACTATTTCACAATATCGATCAAAATACGTCGTGGTGATCCCTGGTTTTTACACTTGTTTCGAAGATTTTGTTGCAATCAAATGAGGATATATTGGGTTTTCCACGATTAAGTTTTAACATAAAAATAATCATTCATCAAAATGTAACTTTGG
Unaligned ( gi|22 ): AAGTGACCGATATGTACGGCGATGATTTGTCAGTAGCGGTATGAAAACAACAAACGTGGAGTGCGTTTATCGCGCCTTTCAAGAAACATGACGATATTTAGGATTTGTAGTAAGTGTTCTTATATCGCAGTATTGTTTTCTTACGCTGATTTGTCCCAGAACCGAAACATGTTTACAATATCGATCAAGATCCCGAGTCGAGGATTTTTTTTAAAATCAAATGAGGACAAACGAGGATTTCCACGAATACATTCAGTTGTTACTTAGAGGTTGCTGCAGAAAAATCATTTCCCTATCGAGGATGGTTCCGTTCTGTATATCATAT
Unaligned ( gi|23 ): CAGTCAACAAAAGAGCAGAAACTGAGGATCTGTACGGCGACGATTTGTTAGTAGCTATAGAAAACGTGTACAAGTTTATTTTATAAATTCTCTATTTAAATCAAGTCACGCTTGAACTGAAATTTAGTATATTTATATTGTGGTATGGTTTACAAACCAAAAAACGAGACTATTTTCACGATAAATATCCAAATATGTTAAGACGACCCTGTACACCGATTTCATGGATTTGATTTCATTCAAATTAGAAGAAATATATTTTGCACGATTATCTTAAGTTTTTCTTTCAATACTTTCGTAGAAAACAATTATTTT
Unaligned ( gi|25 ): GCGTACAGTATTGAAAAGCGGAAGTTGCTATCTGTACGGCGATGAATTGTCAGATAACAAACGTGGATTTTTTTTATCGCTCAGTTTCATTATACATCTGAAGAAAGACGAGATTTTTGATTCGTAGTAAGTAACCATATATCGCAGTATTGTTTTCATACGCTGATTTGTCTCAAAACCGAAACATTTTCTCAATAGCGATCAAAATACAATCATGTTTTCCCTCATTTTTATACATATTCGTTAAAGTTTAGAAAGTTTTTTGCTAATAATGTATGGATTTTC
Unaligned ( gi|26 ): AAACGAAAAGTCGTTTGCTGCTTCCGCTCAATTTTATCATAAATAGTAGTAAACATTCATATATTGCAGTATTGTTTACTAGAACTGTTGGTTTGTCCTGGAACCCACACATTTTCCCAATATCTGAAAATGATGTGACGATACCATGAATTTTAACGTGTTTCATGGATTTTGTTTCTATTAAATGAGTTTTAGCATGGGTTTCCGAATATGTATGCAAAATATTGTTAGGTAGATGTCGTTGAAGAAA
Unaligned ( gi|28 ): GTCCCGGAATCAAAACAATTTCACAATATCGATCAATATATAATATGGCAATCCCGGGAATTATAGCGTGTTTCGTTGATTTTTGTGCTATCAAATGACAATTAATGGAAGATTCCACGAGTATATGCATTTCTTATGTTTGCCTATCGTCGATTTGTTTTTGTTTCTGTCAAGTTTTGTGTTTATATTAAAAACATGTGTTGTTAATGTGCTCCTC
Unaligned ( gi|30 ): AAATTAAGGCATGTCTGATACTTGTGGAGATGTTTACAAATACTTGTTTGACCTATAAATGGGACAATCGAAATATAGCTGGTAATCTTGGCCCTTTACACCGATTTCACGGATTTGTATTTCGTTCAAGTTAATATAAAAGTGGTTTTCGCTATTGTCTAATGTTATTCGATCAATACTTTATATAAACATATTTC
Unaligned ( gi|31 ): GTTCCATACCTTGATGTCTGCGTAAACAGTGTTTGTATTAAGCGTTTAAATACATTTTAAAAGTATTGGTAACAGTTTATTTCAAACATGCCCTTCATTTCAAATAATTGACTGGATAAAATTAATATTCAAAATAAATTACATGGGATTTACAATATGCCTGGAGATGGTAACTGATTTGTTTTCTC
Unaligned ( gi|34 ): CAAAAAAATGCAAACAACGATCGGAATACTTTTGATTTTACCCGCAGTTATTTTGACCGAAAATTTGCGAAACATATTTACTGCATATTATGCATTTTGTCGTCTGGTTTTGGCATATTCCAATCGTCAACTAAAACTAAGAATTTCATTTGTCAAAAAAGTTTAATT
Unaligned ( gi|36 ): AATGTGGGAGCATACAGTCTTGAAGGAACGGATCTGTACGTCGACGCTTGTCAGTTGCTACAAGAAAACAAGAAAAGTAATTGTTGTTATCACTTAATTTTATCATATATTTTAAGTAGAAAAAAGAAATTTCGAAT
Unaligned ( gi|38 ): TCAAACACGTAAATAAAGGAAATGTTAAGTTGTACCGCACAATTACATCAAATACACACTCACTATGGTGTATGCCGCAACAAAATATGTTTGCATTTAATTCATAC
Unaligned ( gi|39 ): TTTTTTTTATATTTGACTCACTATGGTTTGAATACATTGTTTTACACGTATTTTGGGTTGTTTTGTTCGGTTGATGCACTGATATGTTTTAAACTCGTATTAAAGTA
Unaligned ( gi|40 ): TGAAAAGAAAAAGAAAGTATTCGTTTACAGGCATACCACAGCAATAGAGCGTCCATTTTGCATGGTGGAAAGGTCGTCGGTTCAATCCCCGCCCGG
Unaligned ( gi|41 ): AGCATACAGAAAACAAAACCCGAAGTTGCGGATATGCACGGTGACAATTTATTATTTGCTTCAAGAAAAAAAAACTAAAATGTTTATCTT
Unaligned ( gi|42 ): TTTTATTTCGTTCCAGTTAGAAGAGCTATGGTTTTCACAATTATCACAAGTTGTCAATACTTTTAACAAATCTTTTTA
Unaligned ( gi|44 ): AGAATTATAAGGGTTTACAATGCGCCTGGAGATGGCAACTGTTTTTTTTCCTACTGCCT
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