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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTT--TGTACAAT-G-TGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAATATGTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCTA-----------TACAAAA-------------T-------GTGGGGGCAGAT-GGG----CCATGCTAAATGGGGCCAGATT----------------ATTCATGGCC------ATTTTGAAATGGGCCCAGGTTTTCCAGGTTtgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataattttggggccggattctccatggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCTA--------------AAAATATTTTT------T-------A--------AAT-GGA----CCATGCTAAATGGGGCCTGATT----------------CTCCAGGGGCAAGATAATTTTGG-----GGCCGGATTCTCCAc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctATAATAAATAA---TATTATT--TT-----------T--AAAA-------------TTAATGTAG--------GACCGGATTTTCCATGCTAAATGGGGCCGGATA----------------TTCCAAGAAC------GTTTtggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgTGATAAATAACCCTTACATTGCTA-----------A--AAAAAATATTTAAGAAGT-------GAGACCA--GAT-TGA----CCATGCTAAATGGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCT------GTTTTGGAATGGGGCTGGATTTTCCAGGttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtatgcaattaattttagtgaatgcaacgtcaacatcttaacgggatcaaatattcctgatataaaggattttgcggtcattcaatataattgtattgtaattggaaataatgtcaccactgtatcctgttgatatctattgcgtgtgtcatcttgagttaggttggtttg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacgaaatgactggatcccTAAGTAACCCTAATATTGCTAAAAAAAAATTTT--AAAAAGTGGGGC-----C-------G--------GAT-GGA----CCATGCTAAATGGGGCTAGATT----------------CTCCATGGCT------GTTTTGGAATGGGGCCGGATTTTCCAGGTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----CTATGTTAAATGGGGCCGGATA----------------TTCCAAGGAC------GTTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atggagtatccggccccatggaaatccagcccctggatg----CCATGCTAAATGGGACCGGATA----------------TTTCAAGGAT------GTTTaaaatccggccccacactaattttaaaaataatatcaattattatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactaatccggcctttggatg----CCATGCTAAATGGGGCCAGGTA----------------TTCCAAGGAC------GGTTTaaaatccggccccttattgattttaaaaataatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatggaatatccggccccatgtaaatctggcccctggatgGGGCCGGTTT----------------CTCCATGGCC------ATTTTGGAATGGGGCCGGATTTTCCAGGTTaaaatctggccctacattaattttcaaaataatataatttattatttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GGAATATCCGGCCCCACATTAATTTTAAAAATAATATCATTTATTATTTGGTATTTCTAATGAAATATTGAAATATTGGAATGTTGTTAGATCATTTGAAACGCACATATTAATTACTGCGGGATTGTTATTGAAAAAATTCTCGTAACGGGAATTATATAGTGCATATAATAATCAATGATTGTTAATGAAAAATAACTTTTTGGTGGGATTAAACACTTATGATTTATAATTCAATTTAATATTCAATTACTTAATATAATCATAAACAATGAATATAAGTATATACATCTCTCTCCCTCGTTCTATCTCTCAAAACGA
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|11 ): ATGTAATATCCGGCCCCATGTAAATCCGGCTCCGTCACTAGTCCGGCCCCTGGATGAAACGTCCTTAAAATATCCGGCCCCATCTAGTTAGATTTCCAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCGCATATAATATGTATGCAAAGTTTTAAATGCTTCTGTATATTGAAATAT
Unaligned ( gi|14 ): AATATCCGGTCCCATGTAGTCCGGCCCAGTTCTTAAACCGGCCCCTGGATGAAACGTCCTTGGAATATCTGGGCCCATTTAGAATGGACAATCCTGCCCTACATTAATTTTAAAAATAATATCAATT
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






Alignments
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Reference ( family-2146 )     :                                          ATGCAGTTAATTTTAGTGAATGGCAACGTCAACATCTTAACGGGATCAAATATTCCTGATATAAAGGNTTTTGCGNTCATTCAATACAATTGTATNGTAATTGNANATAANGCCNCCACTGTATCCTGNTGATATCTATTNNGTGTGTCATCTTGAGTTGGGTTGGTTTGTAAAATGGCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAGTTGTCTTCTAAAATATCGCATNATCACTAGCGTNAACANTTATAATATATNTAGTNTCGGGTATNTTTCCNTATCGCCCANATCNTGTAGTANNGTAGCATAATAGCTCTNTTCAAAATACAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTCAGCAGACAGTCAGTTCAAAGTTCAGCAGACAGTCACGTNATTTGNGTAATGTAAATGNNTACGATTCAAATAGCTATGGGACACAACTTAAACTTAATGCACAAAGGTTTGCCGGNTGTGTAATATGATGCGTACGTTAATGAATAAGTGTTGTACGTTGAAAAACTAATTNAAAATTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTACATGTATTTGATACGAATTGAGATGATNATGGACACAATGGACAGAATAGATTATATTTGGTACGAGTATTTCAAAGGTGTNCAATTCAGAGANTGTATCTATACTTCGTATNTGAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAGAATGATGCGTGTTTTTCTCAAAGGCAAATAGANTACTGTATTCATTATAAGTGTAGATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTAACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTNTGCCACCGTC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTGTTGATTTGTT-----GATGTGCGCGACAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATNTTGATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACCCTNATATTGCT--ATA-AA-AA-T-T--TT------------T-----------------G------GA--T-GGA----CCATGCTAAATGGGGC----------------CGGATTCTCCANGGNC------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGAT-TTTCCAGGTT
gi|1                          :                                          ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAGCAACGTCAACATTTTAAC---------------TGATATAAAGGTTTTTGCATTCATTCAATACAATTGTATAGTAATTGTATATAAAACCCTTACTGTATCCTGATAATATCTATTTAGTGTGTCATCTTGAG--GGATTGGTTTGTAAAATGGCATGTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT-TAAGTTGTCTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATT---ATATATTTAGTTTCGGGTATATTTCCTTATCGCCCATATCGTGTAGTAAA-----ATAATAACTCTCT---------------------GTTCAAAATTCAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTCAGCAGACAGTCACGTTATTTGTGTAATGTAAATGATTATGATTCAAATAGCTATGGGACACAACTTAAACTTAATGCACAAAGGTTTGCAAGTTGT-TAATATGAT-CATACGTTAATGAAT---T----TACGTTGAAAAACTAATTAAAAATTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTACATGTATTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGGACAGAATAGATTATATTTGGTATGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTGTATCTATACTTCATATTTGAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAGAATGATGCATGTTTTTCTCAAAGGCAAATAGATTACTGTATTCATTATAAGTGTAGATTAATACAACTATTCTTTATTTATGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTCTGCCATCATCATTTTATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTGCAACACAAATTATCAA------------GTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATATAAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT--A-A-AA-A------------------------------------------------------------------AAGTGGGGC----------------CGGATTCTCCATGGCC------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttcttcagaaaactgtaacatgatagtCTAGATGGGGC----------------CGGATATTTTAAGGAC------GTTT-----------C--------A---TCCAGGGGCCGGAC-
gi|11                         :                                                                                                                                                              atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCT--AAA-AA-AAATAT--TTAAGAAG------T-----------------GAGACCAGA--T-TGA----CCATGCTAAATGGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCT------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCTGGAT-TTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacgaaatgactggatccc----CCATGCTAAATGGGAC----------------CGGATATTTCAAGGAT------GTTTCA---------TCCA-----A--------AGGCCGGAT-
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactGGGGC----------------CGGATTTTCCATGCT------------------------AA-----A---T---GGGACCGGATATTTCAAGGaaaatccggccccttattgattttaaaaataatg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactaatccggcctttggatgaaacatTGATATTATT--TTT-AA-AA-T-TAATG------------TAGGGCA-----------G------GA--T-TGT----CCATTCTAAATGGGCC----------------CAGATATTCCAAGGAC------GTTT-----------C--------A---TCCAGGGGCCGG-T-TTttattgattttaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCTAAAAA-AA-AA-T-T--TTAAAAAGTGGGGCC-----------------G------GA--T-GGA----CCATGCTAAATGGGGC----------------TAGATTCTCCATGGCT------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGAT-TTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                          ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCT---------------------GTTCAAAATTCAGTAGACAG-----------------------TCACGTGATTTGTGT-ATGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT----TATGAT-CATACGTTAATGAATGA--GTTGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGC------TATTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAGTTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTTTGTG-CAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATGTGTA-TTCATAAAT-----ATTTAAATATAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT--ATA-AA-A---------------------T-----------------G------GA--T-GGA----CTATGCTAAATTGGGC----------------CGGATTCTCCATGGCC------GTTT-----------TGGA-----A---T---GCGCCCAGAG-TTTCCAGGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                          GATTGGTTTGTAAAATGGCAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTAAGTTATCTTCTAAAATATCGCATAATCACTAGCGTAAACACTTATAATATATGTAGTATCGGGTATTTTTCCATATTGCCCAAATCTTGTAGTACTGTAGCATAATAGCTCTGTTCAAAATACAGT-----------------------AGACAGTCAGTTCAAAGTTTAGCAGACAGTCACGTGATTTGGGT-ATGTAAATGCGTACGgcaaacctttaaatgagactgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttatcttctaaaatatcgcataatcactagcgtaaacacttataatatatgtagtatcgggtatttttccatattgcccaaatcttgtagtactgtagcataatagctctgttcaaaatacagtagacagtcagttcaaagtttagcagacagtcacgtgatttgggtatgtaaatgcgtacgttaatgaataagtgttgtacgttgaaaaactaattcaaaattgtaatattgtgatgtaaataactagttatttgatacgaagagatgatgatggacacaatgaacagaattatatttgatacgagtatttcaaaggtgttcaattcagagagtgtatctatacttcgtatataaattttgtatacaatatctcatgttgaaaatgtagatttgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaatagaatacgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagtttattaacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccaccgtctttagtatgttgaatatcgtgcatatgtataataccttacaaaatcaaaagcaaattgatttccagtgttacatatccacagtttcaataattgtgacgtatgaaaaaactgttgatttgttgattggcgacacaaatgatcaagtttaccgtgtttatgtgtatttcagatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgaaatgtgtatgataaataaccctaatattgctaaacgtttttttaaaaaaagtgggaccggatggaccatgttaaatggggccggattctcaaggggccagataatcttggggccggtttctccatggccattttggaatggggccggattttccaggtt
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gi|4                          : ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattATGCAATTAATTTTAGTGAATG-CAACGTCAACATCTTAACGGGATCAAATATTCCTGATATAAAGGATTTTGCGGTCATTCAATATAATTGTATTGTAATTGGAAATAATGTCACCACTGTATCCTGTTGATATCTATTGCGTGTGTCATCTTGAGTTAGGTTGGTTTGttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtatgcaattaattttagtgaatgcaacgtcaacatcttaacgggatcaaatattcctgatataaaggattttgcggtcattcaatataattgtattgtaattggaaataatgtcaccactgtatcctgttgatatctattgcgtgtgtcatcttgagttaggttggtttg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgaaacgttcttggaatatccggccccatttagcatggaaaatccggtcctacattaattttaaaaataatattatttattatttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATACTTATAATATATTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAAGAAAACTATTGACTTGTT-----GATGTGCGACACAAGTTATCAAGTT---TATCATGTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATTTTGATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCT--AAA-AATAT-T-T--TT------------T-----------------A------AA--T-GGA----CCATGCT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTTTTTAAATGGACCATGCT--TGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCT--AAA-AATAT-T-T--TT------------T-----------------A------AA--T-GGA----CCATGCTAAATGGGGC----------------CTGATTCTCCAGGGGCAAGATAATTT------------------------T---GGGGCCGGAT-TCTCCAtgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataattttggggccggattctccatggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaaTGGGGC----------------CGGATTCTCCATGGCC------ATTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGAT-TTTCAAGGTTtggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgcttgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataatttATAATAAAT------TATATTATT--TTG-AA-AA-T-TAATG------------TAG---------------G------GC--C-AGATTTTCCATGCTAAATGGGGC----------------CAGGTATTCCAAGGAC------GGTT-----------T--C-----A---TCCAGGGGCCAGAT-TT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatggaatatccggccccatgtAATAAT--TGATATTATT--TTT-AA-AA-T-TAGTG------------T-----------------G------GGGCC-GGATTTTCTATGTTAAATGGGGC----------------CGGATATTCCAAGGAC------GTTTCATCCAGGGGCTGGATTTCCA---T---GGGGCCGGAT-ACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGTGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAAT-----ATGTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCT--ATACAA-AA-T-G--TG------------G-----------------GGGCA--GA--T-GGG----CCATGCTAAATGGGGC----------------CAGATTATTCATGGCC------ATTT-----------TGAA-----A---T---GGGCCCAGGT-TTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GGAATATCCGGCCCCACATTAATTTTAAAAATAATATCATTTATTATTTGGTATTTCTAATGAAATATTGAAATATTGGAATGTTGTTAGATCATTTGAAACGCACATATTAATTACTGCGGGATTGTTATTGAAAAAATTCTCGTAACGGGAATTATATAGTGCATATAATAATCAATGATTGTTAATGAAAAATAACTTTTTGGTGGGATTAAACACTTATGATTTATAATTCAATTTAATATTCAATTACTTAATATAATCATAAACAATGAATATAAGTATATACATCTCTCTCCCTCGTTCTATCTCTCAAAACGA
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






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Reference ( family-2146 )     :                                          ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAGCAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCGTTCATTCAATACAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCATGTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAGTTGTCTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATAATATATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCCATATCGTGTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTCAGCAGACAGTCACGTGATTTGTGT-ATGTAAATGCTTACGATTCAAATNGCTATGGGACACNACTTAANCTTANTGCGCAAANGTTTGCNGGGTGT-TAATATGATCGTACGTTAATGAATGA-TGTTGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAATTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA----TATTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAATAG-TT-ATATTTGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTGTATCTATACTTCGTATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAGAATGATGCGTGTTTTTCTCAAAGGCAAATAGATTACTGTATTCATTATAAGTGTAGATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTNACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCACCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTGCGACACAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATNTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACCCTNATATTGCT--ATA-AA-AA---TT--T------------N-----T-----------------G-GA--C----G---GA----CCATGCTAAATGGGGC----------------CGGATTCTCCANGGNC------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGATTTTCCAGGTT
gi|1                          :                                          ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAGCAACGTCAACATTTTAAC---------------TGATATAAAGGTTTTTGCATTCATTCAATACAATTGTATAGTAATTGTATATAAAACCCTTACTGTATCCTGATAATATCTATTTAGTGTGTCATCTTGAG--GGATTGGTTTGTAAAATGGCATGTT-TTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAGTTGTCTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATATTTCCTTATCGCCCATATCGTGTAGTAAA-----ATAATAACTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTCAGCAGACAGTCACGTTATTTGTGTAATGTAAATGATTATGATTCAAATAGCTATGGGACACAACTTAAACTTAATGCACAAAGGTTTGCAAGTTGT-TAATATGATCATACGTTAATGAAT---T----TACGTTGAAAAACTAATTAAAAATTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTACATGTATTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGGACAGAATAGATT-ATATTTGGTATGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTGTATCTATACTTCATATTTGAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAGAATGATGCATGTTTTTCTCAAAGGCAAATAGATTACTGTATTCATTATAAGTGTAGATTAATACAACTATTCTTTATTTATGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTCTGCCATCATCATTTTATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTGCAACACAAATTATCAA------------GTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATATAAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT--A-A-AA-A-------------------------------------------------------------------------AAGTGGGGC----------------CGGATTCTCCATGGCC------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttcttcagaaaactgtaacatgatagtCTAGATGGGGC----------------CGGATATTTTAAGGAC------GTTT-----------C--------A---TCCAGGGGCCGGACT
gi|11                         :                                                                                                                                                              atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCT--AAA-AA-AAATATT--T------------AAGAAGT-----------------GAGA--CCA--GATTGA----CCATGCTAAATGGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCT------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacgaaatgactggatccc-----------------G-GC--C----G---GATTTTCCATGCTAAATGGGAC----------------CGGATATTTCAAGGAT------GTTTCA---------TCCA-----A--------AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATT--TTT-AA-AA---TTAAT------------G-----TA----------------G-GG--CA---G---GATTGTCCATTCTAAATGGGCC----------------CAGATATTCCAAGGAC------GTTT-----------C--------A---TCCAGGGGCCGG-TTTccttattgattttaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCTAAAAA-AA-AA---TT--TTAAAAAGTGGGGC-----C-----------------G-GA--T----G---GA----CCATGCTAAATGGGGC----------------TAGATTCTCCATGGCT------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                          ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCA-----------------------CGTGATTTGTGT-ATGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT-TA---TGATCATACGTTAATGAATGA--GTTGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA----T--TTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAG-TTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTTTG-TGCAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATGTGTA-TTCATAAAT-----ATTTAAATATAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT--ATA-AA-A---------------------------T-----------------G-GA--T----G---GA----CTATGCTAAATTGGGC----------------CGGATTCTCCATGGCC------GTTT-----------TGGA-----A---T---GCGCCCAGAGTTTCCAGGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                          GATTGGTTTGTAAAATGGCATG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTAAGTTATCTTCTAAAATATCGCATAATCACTAGCGTAAACACTTATAATATATGTAGTATCGGGTATTTTTCCATATTGCCCAAATCTTGTAGTACTGTAGCATAATAG--CTCTGTTCAAAATACAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTTAGCAGACAGTCACGTGATTTGGGT-ATGTAAATGCGTACGcaaacctttaaatgagactgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttatcttctaaaatatcgcataatcactagcgtaaacacttataatatatgtagtatcgggtatttttccatattgcccaaatcttgtagtactgtagcataatagctctgttcaaaatacagtagacagtcagttcaaagtttagcagacagtcacgtgatttgggtatgtaaatgcgtacgttaatgaataagtgttgtacgttgaaaaactaattcaaaattgtaatattgtgatgtaaataactagttatttgatacgaagagatgatgatggacacaatgaacagaattatatttgatacgagtatttcaaaggtgttcaattcagagagtgtatctatacttcgtatataaattttgtatacaatatctcatgttgaaaatgtagatttgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaatagaatacgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagtttattaacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccaccgtctttagtatgttgaatatcgtgcatatgtataataccttacaaaatcaaaagcaaattgatttccagtgttacatatccacagtttcaataattgtgacgtatgaaaaaactgttgatttgttgattggcgacacaaatgatcaagtttaccgtgtttatgtgtatttcagatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgaaatgtgtatgataaataaccctaatattgctaaacgtttttttaaaaaaagtgggaccggatggaccatgttaaatggggccggattctcaaggggccagataatcttggggccggtttctccatggccattttggaatggggccggattttccaggtt
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTTTTTAAATGGACCATGCT--TGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCT--AAA-AATAT---TT--T------------T-----T-----------------A-AA--T----G---GA----CCATGCTAAATGGGGC----------------CTGATTCTCCAGGGGCAAGATAATTT------------------------T---GGGGCCGGATTCTCCAtgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataattttggggccggattctccatggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaaTGGGGC----------------CGGATTCTCCATGGCC------ATTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGATTTTCAAGGTTtggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgcttgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataatttATAATAAAT------TATATTATT--TTG-AA-AA---TTAAT------------G-----TAG---------------G-GC--C----A---GATTTTCCATGCTAAATGGGGC----------------CAGGTATTCCAAGGAC------GGTT-----------T--C-----A---TCCAGGGGCCAGATTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatggaatatccggccccatgtAATAAT--TGATATTATT--TTT-AA-AA---TTAGT------------G-----T-----------------G-GGGCC----G---GATTTTCTATGTTAAATGGGGC----------------CGGATATTCCAAGGAC------GTTTCATCCAGGGGCTGGATTTCCA---T---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGTGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAAT-----ATGTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCT--ATACAA-AA---TG--T------------G-----G-----------------G-GG--CAGATG---GG----CCATGCTAAATGGGGC----------------CAGATTATTCATGGCC------ATTT-----------TGAA-----A---T---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GGAATATCCGGCCCCACATTAATTTTAAAAATAATATCATTTATTATTTGGTATTTCTAATGAAATATTGAAATATTGGAATGTTGTTAGATCATTTGAAACGCACATATTAATTACTGCGGGATTGTTATTGAAAAAATTCTCGTAACGGGAATTATATAGTGCATATAATAATCAATGATTGTTAATGAAAAATAACTTTTTGGTGGGATTAAACACTTATGATTTATAATTCAATTTAATATTCAATTACTTAATATAATCATAAACAATGAATATAAGTATATACATCTCTCTCCCTCGTTCTATCTCTCAAAACGA
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCTA----------AA-AA-AAATATT--TAAGAAGT--GAGA--CC------------A---GAT-T-GACC-ATG--CTAAAT------GGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCTGTTT-----------T-------GGA----------A---T---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tacgaaatgactggatccc--G-GC--C-------------G---GAT-T-TTCC-ATG--CTAAAT------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------T-------CCA----------A--------AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATTT----------TT-AA-AA---TTAAT-----GTA-G-GG--CA------------G---GAT-TGT-CC-ATT--CTAAAT------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------------------A---TCCAGGGGCCGG-TTTccttattgattttaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCTA----------AA-AA-AAAATTT--TAAAAAGT--G-GGGCC-------------G---GAT-G-GACC-ATG--CTAAAT------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------T-------GGA----------A---T---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                                                                                                                        ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACAT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gattggtttgtaaaatggcatgcaaacctttaaatgagactgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttatcttctaaaatatcgcataatcactagcgtaaacacttataatatatgtagtatcgggtatttttccatattgcccaaatcttgtagtactgtagcataatagctctgttcaaaatacagtagacagtcagttcaaagtttagcagacagtcacgtgatttgggtatgtaaatgcgtacgttaatgaataagtgttgtacgttgaaaaactaattcaaaattgtaatattgtgatgtaaataactagttatttgatacgaagagatgatgatggacacaatgaacagaattatatttgatacgagtatttcaaaggtgttcaattcagagagtgtatctatacttcgtatataaattttgtatacaatatctcatgttgaaaatgtagatttgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaatagaatacgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagtttattaacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccaccgtctttagtatgttgaatatcgtgcatatgtataataccttacaaaatcaaaagcaaattgatttccagtgttacatatccacagtttcaataattgtgacgtatgaaaaaactgttgatttgttgattggcgacacaaatgatcaagtttaccgtgtttatgtgtatttcagatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgaaatgtgtatgataaataaccctaatattgctaaacgtttttttaaaaaaagtgggaccggatggaccatgttaaatggggccggattctcaaggggccagataatctATAATAAATAA------TATTATTT----------TT-AA-AA---TTAAT-----GTA-G-GA--CC------------G---GAT-T-TTCC-ATG--CTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGAAC----------------GTTT-----------C--------------------A---TCCAGGGGCTGGATT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgaaacgttcttggaatatccggccccatttagcatggaaaatccggtcctacattaattttaaaaataatattatttattatttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATACTTATAATATATTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAAGAAAACTATTGACTTGTT-----GATGTGCGACACAAGTTATCAAGTT---TATCATGTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATTTTGATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCTA----------AA-AATAT---TT--T-----TT--A-AA--T-------------G---GA------CC-ATG--CT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTTTTTAAATGGACCATGCT--TGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCTA----------AA-AA-TA---TT--TTTTAAAT--G-GA--CCATGCTAAATGGGGCCTGAT-TCT-CC-AGGGGCAAGATAATTTTGGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------ATTT-----------T-------GGA----------A---T---GGGGCCGGATTTTCAAGGTTtgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataattttggggccggattctccatggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaaATAATAAAT------TATATTATTT----------TG-AA-AA---TTAAT-----GTAGG-GC--C-------------A---GAT-T-TTCC-ATG--CTAAAT------GGGGCCAGGTATTCCAAGGAC----------------GGTT-----------TCATCCAGGGGCCAGATTTACA---T---GGGGCCGGATATTCCA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taAATAAT--TGATATTATTT----------TT-AA-AA---TTAGT-----GT--G-GGGCC-------------G---GAT-T-T-TCTATG--TTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGGAC----------------GTTTCATCCAGGGGCT-------GGATTTCC-----A---T---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGTGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAAT-----ATGTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCTA----------TACAA-AA---TG--T-----GG--G-GG--C-------------A---GATGG-G-CC-ATG--CTAAAT------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------T-------GAA----------A---T---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GGAATATCCGGCCCCACATTAATTTTAAAAATAATATCATTTATTATTTGGTATTTCTAATGAAATATTGAAATATTGGAATGTTGTTAGATCATTTGAAACGCACATATTAATTACTGCGGGATTGTTATTGAAAAAATTCTCGTAACGGGAATTATATAGTGCATATAATAATCAATGATTGTTAATGAAAAATAACTTTTTGGTGGGATTAAACACTTATGATTTATAATTCAATTTAATATTCAATTACTTAATATAATCATAAACAATGAATATAAGTATATACATCTCTCTCCCTCGTTCTATCTCTCAAAACGA
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacgaaatgactggatccc-GGC--C-GGAT-T-TTCC-ATG--CTAAAT------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------T-------CCA----------A--------AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATTT----------TT-AA-AA---TTAAT-------------------GTAGGG--CAGGAT-TGT-CC-ATT--CTAAAT------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------------------A---TCCAGGGGCCGG-TTTccttattgattttaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCTA----------AA-AA-AAAATTT--TAAAAA--------------GT-GGGGCC-GGAT-G-GACC-ATG--CTAAAT------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------T-------GGA----------A---T---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                                                                                                                        ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACAT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gattggtttgtaaaatggcatgcaaacctttaaatgagactgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttatcttctaaaatatcgcataatcactagcgtaaacacttataatatatgtagtatcgggtatttttccatattgcccaaatcttgtagtactgtagcataatagctctgttcaaaatacagtagacagtcagttcaaagtttagcagacagtcacgtgatttgggtatgtaaatgcgtacgttaatgaataagtgttgtacgttgaaaaactaattcaaaattgtaatattgtgatgtaaataactagttatttgatacgaagagatgatgatggacacaatgaacagaattatatttgatacgagtatttcaaaggtgttcaattcagagagtgtatctatacttcgtatataaattttgtatacaatatctcatgttgaaaatgtagatttgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaatagaatacgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagtttattaacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccaccgtctttagtatgttgaatatcgtgcatatgtataataccttacaaaatcaaaagcaaattgatttccagtgttacatatccacagtttcaataattgtgacgtatgaaaaaactgttgatttgttgattggcgacacaaatgatcaagtttaccgtgtttatgtgtatttcagatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgaaatgtgtatgataaataaccctaatattgctaaacgtttttttaaaaaaagtgggaccggatggaccatgttaaatggggccggattctcaaggggccagataatctATAATAAATAA------TATTATTT----------TT-AA-AA---TTAAT-------------------GT-AGGACC-GGAT-T-TTCC-ATG--CTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGAAC----------------GTTT-----------C--------------------A---TCCAGGGGCTGGATT
gi|4                          :                                                                                               ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattATGCAATTAATTTTAGTGAAT-GCAACGTCAACATCTTAACGGGATCAAATATTCCTGATATAAAGGATTTTGCGGTCATTCAATATAATTGTATTGTAATTGGAAATAATGTCACCACTGTATCCTGTTGATATCTATTGCGTGTGTCATCTTGAGTTAGGTTGGTTTGttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtatgcaattaattttagtgaatgcaacgtcaacatcttaacgggatcaaatattcctgatataaaggattttgcggtcattcaatataattgtattgtaattggaaataatgtcaccactgtatcctgttgatatctattgcgtgtgtcatcttgagttaggttggtttg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgaaacgttcttggaatatccggccccatttagcatggaaaatccggtcctacattaattttaaaaataatattatttattatttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATACTTATAATATATTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAAGAAAACTATTGACTTGTT-----GATGTGCGACACAAGTTATCAAGTT---TATCATGTT-TATGTGTATTTCATAAAT-----ATTTTGATGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCTA----------AA-AATAT---TT--T-------------------TT-AAA--T-GGA------CC-ATG--CT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTTTTTAAATGGACCATGCT--TGTAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCTA----------AA-AA-TA---TT--TTTTAAATGGACCATGCTAAAT-GGGGCC-TGAT-TCT-CC-AGGGGCAAGATAATTTTGGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------ATTT-----------T-------GGA----------A---T---GGGGCCGGATTTTCAAGGTTtgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaatattttttaaatggaccatgctaaatggggcctgattctccaggggcaagataattttggggccggattctccatggccattttggaatggggccggattttcaaggtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaaATAATAAAT------TATATTATTT----------TG-AA-AA---TTAAT-------------------GT-AGGGCC-AGAT-T-TTCC-ATG--CTAAAT------GGGGCCAGGTATTCCAAGGAC----------------GGTT-----------TCATCCAGGGGCCAGATTTACA---T---GGGGCCGGATATTCCA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taAATAAT--TGATATTATTT----------TT-AA-AA---TTAGT-------------------GT-GGGGCC-GGAT-T-T-TCTATG--TTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGGAC----------------GTTTCATCCAGGGGCT-------GGATTTCC-----A---T---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGTGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAAT-----ATGTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCTA----------TACAA-AA---TG--T-------------------GG-GGG--C-AGATGG-G-CC-ATG--CTAAAT------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------T-------GAA----------A---T---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GGAATATCCGGCCCCACATTAATTTTAAAAATAATATCATTTATTATTTGGTATTTCTAATGAAATATTGAAATATTGGAATGTTGTTAGATCATTTGAAACGCACATATTAATTACTGCGGGATTGTTATTGAAAAAATTCTCGTAACGGGAATTATATAGTGCATATAATAATCAATGATTGTTAATGAAAAATAACTTTTTGGTGGGATTAAACACTTATGATTTATAATTCAATTTAATATTCAATTACTTAATATAATCATAAACAATGAATATAAGTATATACATCTCTCTCCCTCGTTCTATCTCTCAAAACGA
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                            atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCTA----------AA-AAAAATATT--TAAGAA--------------GTGAGACCAGAT-T-GACC-A---TG--CTAAAT------GGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCTGTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacgaaatgactggatcccGGGGCCGGAT-T-TTCC-A---TG--CTAAAT------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------TCCA-----A--------AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATTT----------TT-AAAA---TTAAT-------------------GTAGGGCAGGAT-TGT-CC-A---TT--CTAAAT------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------A---TCCAGGGGCCGG-TTTttattgattttaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCTA----------AA-AAAAAATTT--TAAAAA--------------GTGGGGCCGGAT-G-GACC-A---TG--CTAAAT------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------TGGA-----A---T---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                                                                                                                        ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCA-----------------------CGTGATTTGTGTA-TGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT-TA---TGATCATACGTTAATGAATGAGT--TGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA------TTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAG-TTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTTTG-TGCAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATGTGTA-TTCATAAAT-----ATTTAAATATAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCTA----------TA-AAA-----------------------------TGGA--TGGA------CT-A---TG--CTAAAT------TGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------GTTT-----------TGGA-----A---T---GCGCCCAGAGTTTCCAGGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaagttgttttctaaaatatcgcattatcactagcgttaacaattatatatttagtttcgggtatttttccatatcgccaatatcgtttagtaatataatagctctctgttcaaaattcagtagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaatgcttacgattcaaattgctatgggacactacttaactttactgcgcaaatgtttgctgggtgttatgatcatacgttaatgaatgagttgtacgttgaaaaactaattcaaaagtgtagtattgtgatgtaaataactagctatttgataaattgagatgatcatagacacaatgaacagaaaagtttatattagatacgagtatttcaaaggtgtacaatttagagattatatctatacttcatatttaaattttgtatgcaatatctcatgttgaaaatgtagatttatgttaaaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaagtagatgactgttttcattataagtgtaaattaatacaactattctttatttacggtttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaattaaaagcaaattgatttccaatgttacattttcacagtttcaataattgtgatgtatgaaaaaactattgatttgttgatgtttgtgcaaattatcaagtttaccgtgtttatgtgtattcataaatatttaaatataagcatatacatattatgtatgtattgcttatgataagtaaccctaatattgctataaaatggatggactatgctaaattgggccggattctccatggccgttttggaatgcgcccagagtttccaggtt
gi|3                          : atgcagttaattttagtgaataacaacgtcaacatcttaactgatataaaggattttgcattcattcaatgcaattgtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcctgttaatatctattgagtgtgtcatcttgagagattggtttgtacaatgacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATTGGTTTGTAAAATGGCATG
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaaGGGGCCAGAT-T-T-AC-A---TG---------------GGGCCGGATATTCCA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatggaatatccggccccatgtAATAAT--TGATATTATTT----------TT-AAAA---TTAGT-------------------GTGGGGCCGGAT-T-T-TCTA---TG--TTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGGAC----------------GTTTCATCCAGGGGCTGGATTTCCA---T---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGTGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAAT-----ATGTTAATGTAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCTA----------TACAAAA-------T-------------------GTGGGGGCAGATGG-G-CC-A---TG--CTAAAT------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------TGAA-----A---T---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAT-----ATTTCAATATACAGAAGCATTTAAAACTTTGCATACATATTAT--ATGCG-CCATTT----TACA-AACC--AATCTAACTG----------GAAATCTAA----------------------CT-------------A-G-------A-----TGGGGCCGGAT--------A---TT--TTAA----------GGACGTTTCATCCAGGGGCCG--------------GACT-----------AGTG-----AC---GGAGCCGGATTTgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atgtaatatccggccccatgt--CTAGAT------GGGGCCGGATATTTTAAGGAC----------------GTTT-----------C--------ATCCAGGGGCCGGACT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                            atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCTA----------AAAA---AA----------------------AT-------------A-TTTAAGAAG-----TGAGACCAGAT-T-GACC-A---TG--CTAAAT------GGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCTGTTT-----------TGGA-----AT---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacgaaatgactggatcccAA---AA----------------------TC-------------AAT-------A-----AGGGGCCGGAT-T-TTCC-A---TG--CTAAAT------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------TCCA-----A-----AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATTT----------TTAA---AA----------------------TT-------------AAT-------G-----TAGGGCAGGAT-TGT-CC-A---TT--CTAAAT------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------ATCCAGGGGCCGG-TTTaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCTA----------AAAA---AAAATT------------------TT-------------A-AAAA----G-----TGGGGCCGGAT-G-GACC-A---TG--CTAAAT------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------TGGA-----AT---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                                                                                                                        ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCA-----------------------CGTGATTTGTGTA-TGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT-TA---TGATCATACGTTAATGAATGAGT--TGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA------TTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAG-TTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGTTTG-TGCAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATGTGTATT-CATAAAT-----ATTTAAATATA----AGCAT------------ATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCTA----------TAAA---A------------------------------------------------------TGGA--TGGA------CT-A---TG--CTAAAT------TGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------GTTT-----------TGGA-----AT---GCGCCCAGAGTTTCCAGGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaagttgttttctaaaatatcgcattatcactagcgttaacaattatatatttagtttcgggtatttttccatatcgccaatatcgtttagtaatataatagctctctgttcaaaattcagtagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaatgcttacgattcaaattgctatgggacactacttaactttactgcgcaaatgtttgctgggtgttatgatcatacgttaatgaatgagttgtacgttgaaaaactaattcaaaagtgtagtattgtgatgtaaataactagctatttgataaattgagatgatcatagacacaatgaacagaaaagtttatattagatacgagtatttcaaaggtgtacaatttagagattatatctatacttcatatttaaattttgtatgcaatatctcatgttgaaaatgtagatttatgttaaaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaagtagatgactgttttcattataagtgtaaattaatacaactattctttatttacggtttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaattaaaagcaaattgatttccaatgttacattttcacagtttcaataattgtgatgtatgaaaaaactattgatttgttgatgtttgtgcaaattatcaagtttaccgtgtttatgtgtattcataaatatttaaatataagcatatacatattatgtatgtattgcttatgataagtaaccctaatattgctataaaatggatggactatgctaaattgggccggattctccatggccgttttggaatgcgcccagagtttccaggtt
gi|3                          : atgcagttaattttagtgaataacaacgtcaacatcttaactgatataaaggattttgcattcattcaatgcaattgtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcctgttaatatctattgagtgtgtcatcttgagagattggtttgtacaatgacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATTGGTTTGTAAAATGGCATG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAAGTTATCTTCTAAAATATCGCATAATCACTAGCGTAAACACTTATAATATATGTAGTATCGGGTATTTTTCCATATTGCCCAAATCTTGTAGTACTGTAGCATAATAGCTCT--GTTCAAAATACAGTAGACAGTCAGTTCAAAGTTTAGCAGACAGTCACGTGATTTGGGTA-TGTAAATGCGTACGcaaacctttaaatgagactgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttaagttatcttctaaaatatcgcataatcactagcgtaaacacttataatatatgtagtatcgggtatttttccatattgcccaaatcttgtagtactgtagcataatagctctgttcaaaatacagtagacagtcagttcaaagtttagcagacagtcacgtgatttgggtatgtaaatgcgtacgttaatgaataagtgttgtacgttgaaaaactaattcaaaattgtaatattgtgatgtaaataactagttatttgatacgaagagatgatgatggacacaatgaacagaattatatttgatacgagtatttcaaaggtgttcaattcagagagtgtatctatacttcgtatataaattttgtatacaatatctcatgttgaaaatgtagatttgttagaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaaatagaatacgtattcattataagtgtagattaatacaactattctttatttacagtttattaacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccaccgtctttagtatgttgaatatcgtgcatatgtataataccttacaaaatcaaaagcaaattgatttccagtgttacatatccacagtttcaataattgtgacgtatgaaaaaactgttgatttgttgattggcgacacaaatgatcaagtttaccgtgtttatgtgtatttcagatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgaaatgtgtatgataaataaccctaatattgctaaacgtttttttaaaaaaagtgggaccggatggaccatgttaaatggggccggattctcaaggggccagataatcttggggccggtttctccatggccattttggaatggggccggattttccaggtt
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattttgatgtaagcatatacatattatgtatgtattgtttatgataaataacagttatattgctaaaaaATAATAAAT------TATATTATTT----------TGAA---AA----------------------TT-------------AAT-------G-----TAGGGCCAGAT-T-TTCC-A---TG--CTAAAT------GGGGCCAGGTATTCCAAGGAC----------------GGTT-----------T--C-----ATCCAGGGGCCAGATTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatggaatatccggccccatgtAATAAT--TGATATTATTT----------TTAA---AA----------------------TT-------------AGT-------G-----TGGGGCCGGAT-T-T-TCTA---TG--TTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGGAC----------------GTTTCATCCAGGGGCTGGATTTCCAT---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGTGCGACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTGTGTATTTCATAAAT-----ATGTTAATGTA----AGCAT------------ATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCTA----------TACA---AA-------------------------------------A-T-------G-----TGGGGGCAGATGG-G-CC-A---TG--CTAAAT------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------TGAA-----AT---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATAATAAAT------GATATTATTT----------TTAA---AA----------------------TT-------------AAT-------G-----TGGGGCCGGATAT-T-CC-c
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aCTAGA------T------GGGGCCGGATATTTTAAGGAC----------------GTTT-----------C--------------------ATCCAGGGGCCGGACTccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                            atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCT------------AAAAAAAATAT----------------TT-----AAGAAG------------TGAGACCAGAT-T-GACC-A---TGCTAAA------T------GGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCTGTTT-----------T-------GGA----------AT---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacgaaatgactggatcccAAAA--------------------TC-----AAT--A------------AGGGGCCGGAT-T-TTCC-A---TGCTAAA------T------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------T-------CCA----------A-----AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TAGGGCAGGAT-TGT-CC-A---TTCTAAA------T------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------------------ATCCAGGGGCCGG-TTTaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCT------------AAAAAAAAATT----------------TT-----AAAAAG------------TGGGGCCGGAT-G-GACC-A---TGCTAAA------T------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------T-------GGA----------AT---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                                                                                                                        ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCA-----------------------CGTGATTTGTGTA-TGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT-TA---TGATCATACGTTAATGAATGAGT--TGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA------TTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAG-TTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGT--TTG--TGCAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATG------------TGTA-TTC-ATAAATATTTA---AATA-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT------------ATAAAA----------------------------------------------TGGA--TGGA------CT-A---TGCTAAA------T------TGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------GTTT-----------T-------GGA----------AT---GCGCCCAGAGTTTCCAGGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaagttgttttctaaaatatcgcattatcactagcgttaacaattatatatttagtttcgggtatttttccatatcgccaatatcgtttagtaatataatagctctctgttcaaaattcagtagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaatgcttacgattcaaattgctatgggacactacttaactttactgcgcaaatgtttgctgggtgttatgatcatacgttaatgaatgagttgtacgttgaaaaactaattcaaaagtgtagtattgtgatgtaaataactagctatttgataaattgagatgatcatagacacaatgaacagaaaagtttatattagatacgagtatttcaaaggtgtacaatttagagattatatctatacttcatatttaaattttgtatgcaatatctcatgttgaaaatgtagatttatgttaaaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaagtagatgactgttttcattataagtgtaaattaatacaactattctttatttacggtttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaattaaaagcaaattgatttccaatgttacattttcacagtttcaataattgtgatgtatgaaaaaactattgatttgttgatgtttgtgcaaattatcaagtttaccgtgtttatgtgtattcataaatatttaaatataagcatatacatattatgtatgtattgcttatgataagtaaccctaatattgctataaaatggatggactatgctaaattgggccggattctccatggccgttttggaatgcgcccagagtttccaggtt
gi|3                          : atgcagttaattttagtgaataacaacgtcaacatcttaactgatataaaggattttgcattcattcaatgcaattgtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcctgttaatatctattgagtgtgtcatcttgagagattggtttgtacaatgacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATTGGTTTGTAAAATGGCATG
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gi|4                          :                                                                                               ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattATGCAATTAATTTTAGTGAAT-GCAACGTCAACATCTTAACGGGATCAAATATTCCTGATATAAAGGATTTTGCGGTCATTCAATATAATTGTATTGTAATTGGAAATAATGTCACCACTGTATCCTGTTGATATCTATTGCGTGTGTCATCTTGAGTTAGGTTGGTTTGttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtatgcaattaattttagtgaatgcaacgtcaacatcttaacgggatcaaatattcctgatataaaggattttgcggtcattcaatataattgtattgtaattggaaataatgtcaccactgtatcctgttgatatctattgcgtgtgtcatcttgagttaggttggtttg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgaaacgttcttggaatatccggccccatttagcatggaaaatccggtcctacattaattttaaaaataatattatttattatttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATACTTATAATATATTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAAGAAAACTATTGACTTGTT-----GATGT--GCG-ACACAAGTTATCAAGTT---TATCATGTT-TATG------------TGTATTTC-ATAAATATTTT---GATG-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCT------------AAAAATA--------------------TT-----
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctatagtatgttgaatatggtgcatacttataatatattacaaaatcaaaagcaaattgatttccaatgttacatttccacagtttcaataattgtgatgtatgaagaaaactattgacttgttgatgtgcgacacaagttatcaagtttatcatgtttatgtgtatttcataaatattATAATAAAT------TATATTATT------------TTGAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TAGGGCCAGAT-T-TTCC-A---TGCTAAA------T------GGGGCCAGGTATTCCAAGGAC----------------GGTT-----------TCATCCAGGGGCCAGATTTACAT---GGGGCCGGATATTCCA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taAATAAT--TGATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AGT--G------------TGGGGCCGGAT-T-T-TCTA---TGTTAAA------T------GGGGCCGGATATTCCAAGGAC----------------GTTTCATCCAGGGGCT-------GGATTTCC-----AT---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGT--GCG-ACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTG------------TGTATTTC-ATAAATATGTT---AATG-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCT------------ATACAA----------------------------AAT--G------------TGGGGGCAGATGG-G-CC-A---TGCTAAA------T------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------T-------GAA----------AT---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAATAAAT------GATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TGGGGCCGGATAT-T-CC-c
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aCTAGA------T------GGGGCCGGATATTTTAAGGAC----------------GTTT-----------C--------------------ATCCAGGGGCCGGACTccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                            atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactAGTTAGATTGGTTTGTAAAATGGCttagatttccagttagattggtttgtaaaatggcgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCT------------AAAAAAAATAT----------------TT-----AAGAAG------------TGAGACCAGAT-T-GACC-A---TGCTAAA------T------GGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCTGTTT-----------T-------GGA----------AT---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacgaaatgactggatcccAAAA--------------------TC-----AAT--A------------AGGGGCCGGAT-T-TTCC-A---TGCTAAA------T------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------T-------CCA----------A-----AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TAGGGCAGGAT-TGT-CC-A---TTCTAAA------T------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------------------ATCCAGGGGCCGG-TTTaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCT------------AAAAAAAAATT----------------TT-----AAAAAG------------TGGGGCCGGAT-G-GACC-A---TGCTAAA------T------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------T-------GGA----------AT---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
gi|2                          :                                                                                                                                        ATGCAGTTAATTTTAGTGAATAACAACGTCAACATCTTAAC---------------TGATATAAAGGATTTTGCATTCATTCAATGCAATTGTATTGTAATTGTATATAATGCCCCTACTGTATCCTGTTAATATCTATTGAGTGTGTCATCTTGAG--AGATTGGTTTGTACAATGACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCA-----------------------CGTGATTTGTGTA-TGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT-TA---TGATCATACGTTAATGAATGAGT--TGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA------TTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAG-TTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGT--TTG--TGCAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATG------------TGTA-TTC-ATAAATATTTA---AATA-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT------------ATAAAA----------------------------------------------TGGA--TGGA------CT-A---TGCTAAA------T------TGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------GTTT-----------T-------GGA----------AT---GCGCCCAGAGTTTCCAGGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaagttgttttctaaaatatcgcattatcactagcgttaacaattatatatttagtttcgggtatttttccatatcgccaatatcgtttagtaatataatagctctctgttcaaaattcagtagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaatgcttacgattcaaattgctatgggacactacttaactttactgcgcaaatgtttgctgggtgttatgatcatacgttaatgaatgagttgtacgttgaaaaactaattcaaaagtgtagtattgtgatgtaaataactagctatttgataaattgagatgatcatagacacaatgaacagaaaagtttatattagatacgagtatttcaaaggtgtacaatttagagattatatctatacttcatatttaaattttgtatgcaatatctcatgttgaaaatgtagatttatgttaaaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaagtagatgactgttttcattataagtgtaaattaatacaactattctttatttacggtttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaattaaaagcaaattgatttccaatgttacattttcacagtttcaataattgtgatgtatgaaaaaactattgatttgttgatgtttgtgcaaattatcaagtttaccgtgtttatgtgtattcataaatatttaaatataagcatatacatattatgtatgtattgcttatgataagtaaccctaatattgctataaaatggatggactatgctaaattgggccggattctccatggccgttttggaatgcgcccagagtttccaggtt
gi|3                          : atgcagttaattttagtgaataacaacgtcaacatcttaactgatataaaggattttgcattcattcaatgcaattgtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcctgttaatatctattgagtgtgtcatcttgagagattggtttgtacaatgacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATTGGTTTGTAAAATGGCATG
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gi|4                          :                                                                                               ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattATGCAATTAATTTTAGTGAAT-GCAACGTCAACATCTTAACGGGATCAAATATTCCTGATATAAAGGATTTTGCGGTCATTCAATATAATTGTATTGTAATTGGAAATAATGTCACCACTGTATCCTGTTGATATCTATTGCGTGTGTCATCTTGAGTTAGGTTGGTTTGttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtatgcaattaattttagtgaatgcaacgtcaacatcttaacgggatcaaatattcctgatataaaggattttgcggtcattcaatataattgtattgtaattggaaataatgtcaccactgtatcctgttgatatctattgcgtgtgtcatcttgagttaggttggtttg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgaaacgttcttggaatatccggccccatttagcatggaaaatccggtcctacattaattttaaaaataatattatttattatttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATACTTATAATATATTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAAGAAAACTATTGACTTGTT-----GATGT--GCG-ACACAAGTTATCAAGTT---TATCATGTT-TATG------------TGTATTTC-ATAAATATTTT---GATG-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCT------------AAAAATA--------------------TT-----
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGT--GCG-ACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTG------------TGTATTTC-ATAAATATGTT---AATG-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCT------------ATACAA----------------------------AAT--G------------TGGGGGCAGATGG-G-CC-A---TGCTAAA------T------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------T-------GAA----------AT---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAATAAAT------GATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TGGGGCCGGATAT-T-CC-c


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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgtaatatccggccccatgtaaatccggctccgtcactagtccggcccctggatgaaacgtccttaaaatatccggccccatctagttagatttccTGATAAATAACCCTTACATTGCT------------AAAAAAAATAT----------------TT-----AAGAAG------------TGAGACCAGATTGACCATG--CTAAAT------GGGGCCGGATTCTCCAGGGGCCAGATTCTCCATGGCTGTTT-----------TGGA-----AT---GGGGCTGGATTTTCCAGGgcatataatatgtatgcaaagttttaaatgcttctgtatattgaaatat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacgaaatgactggatcccAAAA--------------------TC-----AAT--A------------AGGGGCCGGATTTTCCATG--CTAAAT------GGGACCGGATATTTCAAGGAT----------------GTTTCA---------TCCA-----A-----AGGCCGGATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttatggaatatctggcaccatgtaaatctggacccgttactTGATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TAGGGCAGGATTGTCCATT--CTAAAT------GGGCCCAGATATTCCAAGGAC----------------GTTT-----------C--------ATCCAGGGGCCGG-TTTaaaaataatg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aatatccggtcccatgtagtccggcccagttcttTATGTGTGTAGA-------AATTATTTATTATATCCAGTTAATTAACACATGTAAATATATTAAAAAAAGCATT-GTGTGTCACTATC----Tatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggaaataaatacatacaagttgactaTAAGTAACCCTAATATTGCT------------AAAAAAAAATT----------------TT-----AAAAAG------------TGGGGCCGGATGGACCATG--CTAAAT------GGGGCTAGATTCTCCATGGCT----------------GTTT-----------TGGA-----AT---GGGGCCGGATTTTCCAGGTTttcatttgtt
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTAAGTTGTTTTCTAAAATATCGCATTATCACTAGCGTTAACAATTATA---TATTTAGTTTCGGGTATTTTTCCATATCGCCAATATCGTTTAGTAAT-----ATAATAGCTCTCTGTTCAAAATTCAGTAGACAGTCA-----------------------CGTGATTTGTGTA-TGTAAATGCTTACGATTCAAATTGCTATGGGACACTACTTAACTTTACTGCGCAAATGTTTGCTGGGTGT-TA---TGATCATACGTTAATGAATGAGT--TGTACGTTGAAAAACTAATTCAAAAGTGTAGTATTGTGATGTAAATAACTAGCTA------TTTGATA--AATTGAGATGATCATAGACACAATGAACAGAAAAG-TTTATATTAGATACGAGTATTTCAAAGGTGTACAATTTAGAGATTATATCTATACTTCATATTTAAATTTTGTATGCAATATCTCATGTTGAAAATGTAGATTTATGTTAAAATGATGTGTGTTTTTCTCAAAGGCAAGTAGATGACTGTTTTCATTATAAGTGTAAATTAATACAACTATTCTTTATTTACGGTTTATTTACACATGC--ATA-ATT-AAAAAAGTATTGGTTTGCCATCATC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAATTAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTTCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAA-AAAACTATTGATTTGTT-----GATGT--TTG--TGCAAATTATCAAGTT---TACCGTGTT-TATG------------TGTATT-C-ATAAATATTTA---AATA-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGCTTATGATAAGTAACCCTAATATTGCT------------ATAAAA----------------------------------------------TGGA--TGGA----CTATG--CTAAAT------TGGGCCGGATTCTCCATGGCC----------------GTTT-----------TGGA-----AT---GCGCCCAGAGTTTCCAGGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttaagttgttttctaaaatatcgcattatcactagcgttaacaattatatatttagtttcgggtatttttccatatcgccaatatcgtttagtaatataatagctctctgttcaaaattcagtagacagtcacgtgatttgtgtatgtaaatgcttacgattcaaattgctatgggacactacttaactttactgcgcaaatgtttgctgggtgttatgatcatacgttaatgaatgagttgtacgttgaaaaactaattcaaaagtgtagtattgtgatgtaaataactagctatttgataaattgagatgatcatagacacaatgaacagaaaagtttatattagatacgagtatttcaaaggtgtacaatttagagattatatctatacttcatatttaaattttgtatgcaatatctcatgttgaaaatgtagatttatgttaaaatgatgtgtgtttttctcaaaggcaagtagatgactgttttcattataagtgtaaattaatacaactattctttatttacggtttatttacacatgcataattaaaaaagtattggtttgccatcatctatagtatgttgaatatggtgcatatttataatatcttacaaaattaaaagcaaattgatttccaatgttacattttcacagtttcaataattgtgatgtatgaaaaaactattgatttgttgatgtttgtgcaaattatcaagtttaccgtgtttatgtgtattcataaatatttaaatataagcatatacatattatgtatgtattgcttatgataagtaaccctaatattgctataaaatggatggactatgctaaattgggccggattctccatggccgttttggaatgcgcccagagtttccaggtt
gi|3                          : atgcagttaattttagtgaataacaacgtcaacatcttaactgatataaaggattttgcattcattcaatgcaattgtattgtaattgtatataatgcccctactgtatcctgttaatatctattgagtgtgtcatcttgagagattggtttgtacaatgacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGATTGGTTTGTAAAATGGCATG
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttatggaatatccggccccatgtaaatcctgccccgttattaatccagcccctggatgaaacgttcttggaatatccggccccatttagcatggaaaatccggtcctacattaattttaaaaataatattatttattatttagtatttctaatgaaatattggaaagttattagatagtttgaaacgcacatattaattactgcgggattgttattgaaatattactcataacgggaattatatagtgcatacaataaccaatgactgttaatgaaaagtaactatatttgggaattaaacatgtatgatttatatttcaatttaataatgttttaatttatataatcataaacaatgaatatcattatatacatctctctcccttgttctatctctcaagacgatacttttaaaaagataaatacaggaaaaaatcaacacaaaaagacaagaaaaaaatggatcgcctattatcaggaaacagtaacatggtagtC----TATAGTATGTTGAATATGGTGCATACTTATAATATATTACAAAATCAAAAGCAAATTGATTTCCAATGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAAGAAAACTATTGACTTGTT-----GATGT--GCG-ACACAAGTTATCAAGTT---TATCATGTT-TATG------------TGTATTTC-ATAAATATTTT---GATG-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTA-TTGTTTATGATAAATAACAGTTATATTGCT------------AAAAATA--------------------TT-----
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taATAATAAAT------TATATTATT------------TTGAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TAGGGCCAGATTTTCCATG--CTAAAT------GGGGCCAGGTATTCCAAGGAC----------------GGTT-----------T--C-----ATCCAGGGGCCAGATTTtggatgaaaccgtccttggaatacctggccccatttagcatggaaaatctggccctacattaattttcaaaataatataatttattatttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tatggaatatccggccccatgtAATAAT--TGATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AGT--G------------TGGGGCCGGATTTTCTATG--TTAAAT------GGGGCCGGATATTCCAAGGAC----------------GTTTCATCCAGGGGCTGGATTTCCAT---GGGGCCGGATACTCCAttggtatttctaatgaaatattggaaagttattagataatttgaaacgcacatatttattactgcgggattgttattgaaatatttctcataacgggctttagatcgtgcttacaataatcaataactgttattgaaaagtagctatttttgggaattaaacacgtatgatttataattgtttatgggatcggttataagtttgtcattaatcattacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATAGTATGTTGAAAATGGTGCATATTTATAATATCTTACAAAACCAAAAACAAATTGATTTCCAAAGTTACATTTCCACAGTTTCAATAATTGTGATGTATGAG-CAAACTGTTGATTTGTTTGTACAATGT--GCG-ACACAAATTATCAA-TTATATACAATCTCATGTG------------TGTATTTC-ATAAATATGTT---AATG-----------TAAGCATATACATATTATGTATGTATTTGTTTATGATAAATAACCCTTATATTGCT------------ATACAA----------------------------AAT--G------------TGGGGGCAGATGGGCCATG--CTAAAT------GGGGCCAGATTATTCATGGCC----------------ATTT-----------TGAA-----AT---GGGCCCAGGTTTTCCAGGTTatttggtatttcttatgaaatattggaaagttattagataatttgaaactcacatattaattacagtgggattgttattgaaaacttactcttaacgggaattataaagtggatagttattataatcagttattgttaatgaaaagtaactttttgggggaatgaaatacttatgatttataattcaatttaataattaattaattgatataatcataaaca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAATAAAT------GATATTATT------------TTTAAAA--------------------TT-----AAT--G------------TGGGGCCGGATATTCCc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTGAAACGCACATATTAATTACTGCAGTATTGTTATTGATATTAATTACTGCAGGATTGTTATTGAAAAACGGGAATTATATAATGCATATAATAATCAATGACTGTTAATGAAAAGTAACTATTTTTTAGGAATCAAACACGTATGATTCATTATTCAATTTAATAATTAGTTTATTAATATAACCGTAAACAATGAAAATAATTATATACATCGCTCTCACTCGTTCTATGATATATCTCAAGACGATACTTTTAAAAAGATATATATA
Unaligned ( gi|17 ): GTTGTGGAATATCCAGCCCCATGTAAATCC