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Reference ( gi|4 )            :                                 TTGCTAAGCACCAAATAATTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTATACAGATAAGTCCAGGTATTGC-----CT-------------------------A-----TAC--AGATAGTCGTGCTAGG-GTACGGAGAAGGCTAGGGGAGAGATTCCTCGCAACCA-ACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-GGCGGCACCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACGTCATCGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGTAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCTGTCCTCATGCTCCC-CA--TGC-TGTCCGAGTGCACCTTCAGAGGGAGAGGATT-GCACGTATGGACTGGCAAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAG-C--CAAAACGTATCCATGAACTTGGTGC-A-ATG--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATTAGGAACCTTATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAAAAGCAACGGGTCACATACTCGATAGT--AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-CTTTTTGA-CAAATTTAG-AAAATT-CCCTATTTTATCAAAAA-TCTCTTTTTTCAATGGTTATCTTATTCAAAGGCTTAAAACAAACATAAAACACAAAACAAATTCTAAAATG-CTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAAAGAAAAGTACAAAC----AATTTTCATAACAATACTGCAACTA-----TAACGTAAAATATGTAC--TTGGATATTGTTGGTGCTTAGCAAACTTTAAG
gi|1                          :                                 TTGCTA-GCACCAAATG-TTTACATGGCGTTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGATGAGTCCATGTATTGC-----CTGATGAGTCCATGTATTGCCTAGACAA-----TAC--AGATAGGCGTGCTAGT-GTATGGAGAAGGCTAGGGGAAAGATTCCACGCAGCCA-ACATTGCTGAGTATGACCACTATTGAGGGCGGT-TCATGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACCTCATTGTCCTT-GATTGAGGTACATTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGTAAAAATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTAATGGGTTCATTTTAATGGACTGTAATGCCCGTTCTCATGCTGCC-CA--TGC-TGTACGGGAGTACCTTCAAAGGGAGGGGATT-GCATGTCTGAACTGGCCAGCCCGACCCCCCGACTTCAGTCC---C---------ATCGAGCATGTGCGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGTATTTCAACCCGTCAAGTCCAG-C--CAAGAAGTATCCAGGAGCTTGGTGC-C-ATG--CTGATCCAGGAATAGAACAACATCCTGCAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCATTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACTGGTCACATACTCGATATT--AATCCCATTTATCCCATACTGAGTTAGCTCCGTTAG-CTTTTTGG-CAAATTTAA-ATAATT-CCCAATATTATCAAAAA-TCTCAATTTTCAATGGTTATCTCACTCAAGAGTGTAAAACAAACATAAAACAC-AAACAAATTCTAAAAAA-TTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAACGAAAAGTACAAACAAAAAA---TCATAACAATATTGCAACTACATTGTAACGTAAAACGTGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGGAAACTATGAG
gi|2                          :  ttggtggaatacctgatatacttctcaaagtTTGCTAAGAACCAAATATTTCACACGGCATTTAACAGAGAGGACTGGTGACCTGTCCTTTTTACAGATGAGTCTAGA-----------CT-------------------------A-----TAT--AGATAAGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTGCATGCAGCCA-ACATTGCTGAGCATAACCGCTTTGGA-GGCGGCTCCATGATGGTCTG-GGGCAGAATCAGCTTGGATGGACGTACAGACCGCATTGTCCTT-GACAGAGGTACACTGAACGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATATTGGTGCAAAGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGTCCGTCGTCATGCTGCC-CA--TGC-TTCTCGGGAGTACGTTCAGAGGGAGGGGATT-GCACCTCTGGACTGGCCAGACCTATCATCCGACCTCAATCT---C---------ATTTAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGAAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAG-C--CAAAAAGTATCCAGGAGAGTGGTGC-C-ATG--CTGGTCCAAGAATTGAACAACATCCCACAAAGGACCATAGGGAATCTGTTAGGGAGTATGAGGAGGTGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACATGTAACATACTAGATAGT--AATCAAA--TACC--------AATTAGATCCGTCAG-CTTTTTTAGCAAATTTAG-AAAATT-CCCTATTTTATCAAAAAATCTCTATTTTCAATGTTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACACAAA-CAAATTCTAAAAGT-TTTGCCT------TAAA-GAGAATATTAAA------GTGCAAAC----AATTGTCATAACAATATTGCAACTA-----TTATGAAAAACATATAC--TTG-------------CTTAGCAATTTTTAAGcagt
gi|7                          : attttatattcaatttatatactactcaaagtTTGCTAAACGGCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAAGACTGGCGAGCTGTCTTTT-TACAGATGAGTCCATGTTTTGCCTAGACT-------------------------A-----TAC--AGATAGACGTGCAAGG-GTATGGAGAAGACCAGGAGAGAGATTCCca
gi|6                          :   tataatatttcgatatattctactcaaagtTTGTTAAGCACCAAATATTTCACACGGCGTTGATCAGAAAGAAATGGCGACCTGTTCTTTTTACAGACGAGTCCAGGTATTGCTTAGACT-------------------------A-----TAC--AGATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGGCAGGGGAGAGATTCCACG-AAGCATACATTGCTGAGTATGACCGCTATGGA-GGTGGCTCTGTGATGGGCTGTGGGTGAGATCAGATGGGTTAGACGTACAGACCTCATTATCCTT-GACTGAGGTACACTGAATGCCCAGCCGTATAGTGATGAGATTATGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTCATTgtgattgtctggggcgggatcagctgggatggacgtacaaacctcattgtccttgactggggtacactgaatgcccagcggtatagagaggagattctggatacccatgtaagattgtatgctggtgcagtgggtgatgtgttcattctaatgggcgataatgtccgttctaatactgcccatgctgtccggggatacctacagagggagtggattgcacgtctggacttgccagtctgatcccccgactttattcacatggagcatgtgttgaatgagttgcagcttggaattccagtccgtcaagtccagccaagaagtatccagtagcttggtgcaatgctggtccaagaatggaacaacatcccacaaaggaccaccaggaacctgatagggagcatcaggaggcgttgccaagttgtaatcaacagcaacgggtcacatactcgatattaatcccataccagtcagctacatcagcgctttggcaaatttagaaaattcccctattttatcatcaatctcttttttaaatggttatgttacttaaaagcttgaaacaaacgtaaaacacaaaaacattctaaaatatttgccaacatcttaaaag
gi|3                          :   aatacagttcatatatatactactccaggtTCGCTAAGCACAAAATATTTCACACGGCACTGAGCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTATTGATGAGACCAGGTATTGC-----CT-------------------------AGACTATAC--AGATAGACGTGCTAGG-GTGTGGAGTAGGCCAGGGGAGATATTCCACGCAGCCA-ACATTGCTGAGCATAACCGCTATGGA-GGCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGGCGTACATACCTCATTGTCTTT-GACCGGGGTACATTGAACTCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGCAGTTGGTAATGGGTTCATTCTACTGGA-GATAATGCCTGTCTTCATGCTGTC-CA--TGC-TGTCCGGGAGTACCTTCAgcacgtctgcacttgccaacccgatcccaagaccgcaatcctatcgagcatgtgtgaaatgagttgcagcttagaacttcagcccgtcaagtccagccaagaagtatccaagagcgtggtccaagaatgcaacaaaatcccacaaaggaccgccaggaacctgatagggagcataaggaggcgtttccaagctttaattaacagcaacgggtcacatactcgatattaatcctataccagttagctctgtcagcgttttggcaaatttagaaaatttatcaaaaatctctttttttcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattataatttcttaaaagagaatattaaatgttaagtacaaacaatgtttataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttagatattcttggtgcttagcaaactttgagca
gi|10                         :                     actactcaaagtTTGCTAAACACCAA-TATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTAATGACCTGTCCTTTTTACAGAAGAGTCAAAGTATTTC-----CT-------------------------AGACAATAC--AGATAGGTGTGCTAGGAGCGTGGAGAAGGCCACGGG-GAAATTCCACGCAGTCA-ACATTGCTGAGCATGACCGCTATAGA-GGCGGCTCCGTGATGGTCTG-AGGCGGGATCAGCTGGGAAGGACGTACAGACCTCATTGTatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|14                         :   ttcatatatcgaatatatactactcaaagtTTGCTAAGCGCCAAATATTTCACATGACATTGACCAGAAAGGACTGGCAACCTGTCCTTATTACAGATGAGTCCAGATATTGCCTAGACT-------------------------A-----TAC--AGATAGGTATGCTATG-GTATGGAG
gi|5                          :                          actcaaagtGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCACTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTATTTTTTAAAGACAAG-----GTATTGC-----CT-------------------------AGACTATAT--AGA-AGGCATGCTAAG-GTATGGAGAAGGCCAGGG-AGAGATTCCAAG-AGGCA-ACATTGCTGAGCATAACCGCCATTGA-GGTGGCTTAGTGATGATCTG-GAACGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTTTGGCCGGGGTACACCGAATGCCCAGCTGTATAGAGATGAGATTCTAAATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTTATTCTAATGGACGATAATGCTCGTCCTCATGCTGCC-CA--TGC-TATCCGAGAGTACCTcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|15                         :                              actcaaagttgCAGCAAATATTTCACATGGCATTGTCCAGAGAGGACTTGCGATCTGTCCTTTTTACTAATGAGTCCAGGTATTGC-----CT-------------------------AGAC--TACCAAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGAATAAGGCCAGGGAAGAGATTcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                           tatataggcatatttatatactactaaaagtttttGAGCATGACTGCTATGGA-GGCGGCTCCGTGATGGTCTG-GAGCAAGATCAGCTGGGATGGAg
gi|7                          :                                                                                                                            actcaaagtttgctaagcgccaaatatttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatgCCGTGATTGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAAACCTCATTGTCCTT-GACTGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGAGGAGATTCTGGATACCCATGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGTGTTCATTCTAATGGGCGATAATGTCCGTTCTAATACTGCC-CA--TGC-TGTCCGGGGATACCTACAGAGGGAGTGGATT-GCACGTCTGGACTTGCCAGTCTGATCCCCCGACTTTATTCA---C---------ATGGAGCATGTGTTGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTCCAGTCCGTCAAGTCCAG-C--CAAGAAGTATCCAGTAGCTTGGTGC-A-ATG--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCACCAGGAACCTGATAGGGAGCATCAGGAGGCGTTGCCAAGTTGTAATCAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT--AATCCCA--TACC--------AGTCAGCTACATCAG-CGCTTTGG-CAAATTTAG-AAAATTCCCCTATTTTATCATCAA-TCTCTTTTTTAAATGGTTATGTTACTTAAAAGCTTGAAACAAACGTAAAACACAAAA-ACATTCTAAAATA-TTTGCCAACATCTTAAAAGtcta
gi|9                          :                                                                                                                                   tataatatttcgatatattctactcaaagtttgctaaacggcaaatatttcacacggcattgaccagagaagactggcgagctgtctttttacagatgagtccatgttttgcctagactatacagatagacgtgcaagggtatggagaagaccaggagagagattATTGTCCTT-GAACGGGGTACCCTGAATG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgaataaggccagggaagagGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAATGGATGATGGGTTCATTCTAATCGACGATAATGCCCAGCTTCATGCTGGC-CA--TGC-TGTCCGGGAGTACCTTCAGAGGCAGTGGATT-GCACATCTGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCAACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTT-CAGCTTGGAAT-------------ATCCAG-C--AAAGAAGCATCCAGGAGCTTGGTGC-C-ATG--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCAACTAAGGACAATCAGGAACCTGATAGGAAGCATGAGGAAGCGTTGCGAAGCTATAATTAACAGCAACGGTTCACATACTTGATATA--AATCCCA--TACC--------TGTTAGTTCTGTCAG-ATTTTTGG-CAAATTAAGAAAAATT-CCCTATTATATGAAAAA-TCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTTAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAGCAAATTCTAATTTT-TTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATTTTAAATAACAAGTGCAAAC----AATTTTCATAACAATATTGCAACTA-----CAACGTAAAACATGTAA--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTTAGggttcattctaatgggcaataatgcctgtccttgtgctgcccagcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGGGTTCATTCTAATGGGCAATAATGCCTGTCCTTGTGCTGCC-CA--cag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgaataaggccagggaagagattgtccttgaacggggtaccctgaTTTTCATGCAAAATAATGCCCCGCCTCATACTGCCACAACCGCACGTCAGA-TGT---TGCAGGCCAACAACATTCGAACGT-TAGACTGGCCAGCTTGCAGTTCCGACCTCAATCCGATCGAAAATCCGATCGAACACGTGTGGTGCGAGATTGACCG-TTGGA---TCAGGAGGTT--GCCTAGACAACAAAATGTA--CATGAACTTGGgcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa
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gi|16                         :                                                                                                                              aatacagttcatatatatactactccaggtttgttaagcaccaaatatttcacacggcgttgatcagaaagaaatggcgacctgttctttttacagacgagtccaggtattgcttagactatacagataggcgtgctagggtatggagaagggcaggggagagattccacgaagcatacattgctgagtatgaccgctatggaggtggctctgtgatgggctgtgggtgagatcagatgggttagacgtacagacctcattatccttgactgaggtacactgaatgcccagccgtatagtgatgagattatggatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggttcACTGGCCAGCTTGCAGTCTAGATCTCAATCC---G---------ATCGAACATGTGCAAGACGAG-ca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cgttacCTGCCCAGCCCAATCCCCCAACCTCAATCC---C---------ATTGAGCATGTGTGTAATGGG-TCG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAG------C--CAAGAAGTATCCAGGAGCTTGGTGC-C-ATG--CTGGTCCAAGAATGGAACAGCATCCCACAAAGGATGATTAGGAACCTGATAGG-AGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAATA-TAACGGTTCACATACTCGATATT--AATCCCA--TACCA-------AGTTAGCTTTGTCAG-CTTTTTGG-CAAATTTAG-AAAATT-CCCCATTTTATCAAAAC-TCACTATTTTCAACTGTTATCTTACTCAAAAGTTTAAAACAAACGTAAAGCAC-TAAC-AATTTT----TT-TTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATAAAAAGTGCAGAC----AATTTTCATAACAATATTGCAACTA-----TAACGTAAAACATGTGCTTTTGGATATTCTTGTTGCTTAGCAAACTTTGAGcagaaagttattcagacaacaagatgtacctgaacttcagagtggacctcaccaacacatgg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgaataaggccagggaagagattgtccttgaacggggtaccctgaatgggttcattctaatgggcaataatgcctgtccttgtgACCTCAATCC---A---------ATCGAGAATGTGTGGAATGAG-ATG-AAGCTTGGAATT-CAGCCCGTCATGTCCAG-C--CAAGAAGTATTCAGGAGCTTGGTGCCATATG--CTGGTCAAAGAATAGAATAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAATTTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGGCATTAACAGCAATGGGTCACATACTCGATA-TCAAATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAGTTTTTTTGG-CAAATTTTG-AAAACT-CCCTATTTTAACAAAAA-TCTCTACTTTCAA---TTATCTTACTCAAAAGATTAAAACAATCGTAAAACAC-ACACAAATTCTAAAATT-TTTGCCTACATCTTAAGAGAGAATATTAAATAAAAcaa
gi|3                          :                                                                                                                             actcaaagttggctaagcaccaaatatttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtCTTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-AAGCTTGGAATT-CAGCCTGTCAAGTCCAG-C--CAAGAAGTATCCAGGAGCTTGGTGC-C-ATATTCTGGTCCAAGAATAGAACAACATCCAACAAAGGACCATCTGGAATCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTCATTAACAGCAATGGGTCACATACTAGATATT--AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-CTTTTTGG-CAAATTATG-AAAACT-CCCTATTTTATCAAAAA-TCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACACA----AAGTTCT-AAATGTTTTGCCTACATCATAAAAGAGAATATTAAATGAAAAcaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtacGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAATGGGTCACATACTCAATATT--AATCAAA--TACA--------AGTTAGCTCCGTCAG-CTTTTTGG-CAAATTTAG-AAAATA-CCCTATTTTATCAAAAA-TATCTATTTTCAATGGTTATCGTACTCAAAAGCTTAAAAGAAACATAAAGTGC-AAACAAATTCTGATGTT-TTTGCCTACATCTTAAAAGAGAACAcaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTATTAAAAA-TCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACACAAAATAAATTCTAAAATC-TTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAAGATCAAAC----AATTTTCATATCAATATTGCAACTG-----AAACGTTAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTTCTTAGCAAACTTTGAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcagtaacattcattgGAAAAGTACAAAC----AGTTTTCATAACAATATTGCAACTA-----TAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTTGTGCTTGGCAAACATTca
gi|5                          :                                                                                                                    actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatGAAAAGTACAAAC----ACTTTTCATAACAATACTGCAACTT-----TAACGTAAACCCGGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTGGCAAACATTg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                             actcaaagttggctaagcaccaaatatttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatATATT--TGGTTCTTAGCAAACTTTGAGgcg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attttatattcaatttatatactaATATT--TGGTGCTTAGCCAACTTTGAGttcacacggcatttaacagagaggactggtgacctgtcctttttacagatgagtctagactatatagataagcgtgctagggtatggagaaggccaggggagagattgcatgcagccaacattgctgagcataaccgctttggaggcggctccatgatggtctggggcagaatcagcttggatggacgtacagaccgcattgtccttgacagaggtacactgaacgcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatattggtgcaaagggtgatgggttcattctaatggacgataatgtccgtcgtcatgctgcccatgcttctcgggagtacgttcagagggaggggattgcacctctggactggccagacctatcatccgacctcaatctcatttagcatgtgtggaatgagttgcagcttgaaatttcagcccgtcaagtccagccaaaaagtatccaggagagtggtgccatgctggtccaagaattgaacaacatcccacaaaggaccatagggaatctgttagggagtatgaggaggtgttgccaagctgtaattaacagcaacatgtaacatactagatagtaatcaaataccaattagatccgtcagcttttttagcaaatttagaaaattccctattttatcaaaaaatctctattttcaatgtttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattctaaaagttttgccttaaagagaatattaaagtgcaaacaattgtcataacaatattgcaactattatgaaaaacatatacttgcttagcaatttttaagca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aATATT--TGGCGCTTAGCAAACTTTGAGttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTATTGGTGTTTAGCAAACTTTGAGttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatggagcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttcatatatcgaatatatactaTTGGTGCT-AGCAAACTTTGAGtttcacacggcattgaccagagaggactaatgacctgtcctttttacagaagagtcaaagtatttcctagacaatacagataggtgtgctaggagcgtggagaaggccacggggaaattccacgcagtcaacattgctgagcatgaccgctatagaggcggctccgtgatggtctgaggcgggatcagctgggaaggacgtacagacctcattgt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CAAGGACTTGTATAGACTCTTTCTAATTCCTTGACAGTTTGAAAAGGAAAAAAAGTTT






Alignments
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Reference ( family-2100 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGACG--------------------AGTCCAGGTATTGCCTAGAC--TA--C--A--GATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGGAGNGGATT-GCACGTC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAG-AAAATT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACACAAAACAAATTCTAAAATTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAAGTGCAAACAATTT----TCATAACAATATTGCAACTA-----TAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTGAG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcagtaacattcattgGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAATGGGTCACATACTCAATATT-AATCAAA--TACA--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAG-AAAATA-CCCTATTTTATC-AAAAATATCTATTTTCAATGGTTATCGTACTCAAAAGCTTAAAAGAAACATAAAGTGC-AAACAAATTCTGATGTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAACAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATATT--TGGCGCTTAGCAAACTTTGAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTTGCTAAGCGCCAAATATTTCACATGACATTGACCAGAAAGGACTGGCAACCTGTCCTTATTACAGATG--------------------AGTCCAGATATTGCCTAGACTATA--C--A--GATAGGTATGCTATG-GTATGGAGttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatggagcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actcaaagtGAGCATGACTGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GAGCAAGATCAGCTGGGATGGAcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actcaaagtttgctaagcgccaaatatttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatgCAGCAAATATTTCACATGGCATTGTCCAGAGAGGACTTGCGATCTGTCCTTTTTACTAATG--------------------AGTCCAGGTATTGCCTAGAC--TA--CCAA--GATAGGCGTGCTAGG-GTATGAATAAGGCCAGGGAAGAGATTtcta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatataggcatatttatatactactaaaagtttttACTGGCCAGCTTGCAGTCTAGATCTCAATCC---G---------ATCGAACATGTGCAAGACGAG-g
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgttacATATT--TGGTTCTTAGCAAACTTTGAGcagaaagttattcagacaacaagatgtacctgaacttcagagtggacctcaccaacacatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttatattcaatttatatactaTTGCTAAGAACCAAATATTTCACACGGCATTTAACAGAGAGGACTGGTGACCTGTCCTTTTTACAGATG--------------------AGTCTAGA------CTA-----TA--T--A--GATAAGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTGCATGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTTTGGA-G-GCGGCTCCATGATGGTCTG-GGGCAGAATCAGCTTGGATGGACGTACAGACCGCATTGTCCTT-GACAGAGGTACACTGAACGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATATTGGTGCAAAGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGTCCGTCGTCATGCTGCC-CATGCTTCTCGGGAGTACGTT-CAGAGGGAGGGGATT-GCACCTC--TGGACTGGCCAGACCTATCATCCGACCTCAATCT---C---------ATTTAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGAAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AAAGTATCCAGGAGAGTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATTGAACAACATCCCACAAAGGACCATAGGGAATCTGTTAGGGAGTATGAGGAGGTGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACATGTAACATACTAGATAGT-AATCAAA--TACC--------AATTAGATCCGTCAG-CTTTTTTAGCAAATTTAG-AAAATT-CCCTATTTTATCAAAAAATCTCTATTTTCAATGTTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAACAAATTCTAAAAGTTTTGCCT---T----AAAGAGAATATT------AAAGTGCAAACAATTG----TCATAACAATATTGCAACTA-----TTATGAAAAACATATAC--T-------------TGCTTAGCAATTTTTAAGttcacacggcatttaacagagaggactggtgacctgtcctttttacagatgagtctagactatatagataagcgtgctagggtatggagaaggccaggggagagattgcatgcagccaacattgctgagcataaccgctttggaggcggctccatgatggtctggggcagaatcagcttggatggacgtacagaccgcattgtccttgacagaggtacactgaacgcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatattggtgcaaagggtgatgggttcattctaatggacgataatgtccgtcgtcatgctgcccatgcttctcgggagtacgttcagagggaggggattgcacctctggactggccagacctatcatccgacctcaatctcatttagcatgtgtggaatgagttgcagcttgaaatttcagcccgtcaagtccagccaaaaagtatccaggagagtggtgccatgctggtccaagaattgaacaacatcccacaaaggaccatagggaatctgttagggagtatgaggaggtgttgccaagctgtaattaacagcaacatgtaacatactagatagtaatcaaataccaattagatccgtcagcttttttagcaaatttagaaaattccctattttatcaaaaaatctctattttcaatgtttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattctaaaagttttgccttaaagagaatattaaagtgcaaacaattgtcataacaatattgcaactattatgaaaaacatatacttgcttagcaatttttaagca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attttatattcaatttatatactactcaaagtATATTTT--GTGCTTAGCGAACTTTGAGca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actaTCGCTAAGCACAAAATATTTCACACGGCACTGAGCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTATTGATG--------------------AGACCAGGTATTGCCTAGAC--TATAC--A--GATAGACGTGCTAGG-GTGTGGAGTAGGCCAGGGGAGATATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGGCGTACATACCTCATTGTCTTT-GACCGGGGTACATTGAACTCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGCAGTTGGTAATGGGTTCATTCTACTGGA-GATAATGCCTGTCTTCATGCTGTC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtacATGAAAAGTACAAACAGTTT----TCATAACAATATTGCAACTA-----TAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTTGTGCTTGGCAAACATTGcaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|4                          : actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgTTGCTAAGCACCAAATAATTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTATACAGATA--------------------AGTCCAGGTATTGCCTA-----TA--C--A--GATAGTCGTGCTAGG-GTACGGAGAAGGCTAGGGGAGAGATTCCTCGCAACCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCACCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACGTCATCGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGTAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCTGTCCTCATGCTCCC-CATGCTGTCCGAGTGCACCTT-CAGAGGGAGAGGATT-GCACGTA--TGGACTGGCAAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AACGTATCCATGAACTTGGTGCAAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATTAGGAACCTTATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAAAAGCAACGGGTCACATACTCGATAGT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGACAAATTTAG-AAAATT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTTTTTTCAATGGTTATCTTATTCAAAGGCTTAAAACAAACATAAAACACAAAACAAATTCTAAAATGCTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAAAGAAAAGTACAAACAATTT----TCATAACAATACTGCAACTA-----TAACGTAAAATATGTAC--TTGGATATTGTTGGTGCTTAGCAAACTTTAAG
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCACTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTATTTTTTAAAGACA--------------------AG-----GTATTGCCTAGAC--TA--T--ATAGA-AGGCATGCTAAG-GTATGGAGAAGGCCAGGG-AGAGATTCCAAG-AGGCAACATTGCTGAGCATAACCGCCATTGA-G-GTGGCTTAGTGATGATCTG-GAACGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTTTGGCCGGGGTACACCGAATGCCCAGCTGTATAGAGATGAGATTCTAAATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTTATTCTAATGGACGATAATGCTCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTATCCGAGAGTACCTttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tataatatttcgatatattctactcaaagtGGA-GAGAGATTCCGTGATTGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAAACCTCATTGTCCTT-GACTGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGAGGAGATTCTGGATACCCATGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGTGTTCATTCTAATGGGCGATAATGTCCGTTCTAATACTGCC-CATGCTGTCCGGGGATACCTA-CAGAGGGAGTGGATT-GCACGTC--TGGACTTGCCAGTCTGATCCCCCGACTTTATTCA---C---------ATGGAGCATGTGTTGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTCCAGTCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGTAGCTTGGTGCAAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCACCAGGAACCTGATAGGGAGCATCAGGAGGCGTTGCCAAGTTGTAATCAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTCAGCTACATCAG-C-GCTTTGGCAAATTTAG-AAAATTCCCCTATTTTATC-ATCAATCTCTTTTTTAAATGGTTATGTTACTTAAAAGCTTGAAACAAACGTAAAACACAAAA-ACATTCTAAAATATTTGCCAACATCTTAAAAGgtgattgtctggggcgggatcagctgggatggacgtacaaacctcattgtccttgactggggtacactgaatgcccagcggtatagagaggagattctggatacccatgtaagattgtatgctggtgcagtgggtgatgtgttcattctaatgggcgataatgtccgttctaatactgcccatgctgtccggggatacctacagagggagtggattgcacgtctggacttgccagtctgatcccccgactttattcacatggagcatgtgttgaatgagttgcagcttggaattccagtccgtcaagtccagccaagaagtatccagtagcttggtgcaatgctggtccaagaatggaacaacatcccacaaaggaccaccaggaacctgatagggagcatcaggaggcgttgccaagttgtaatcaacagcaacgggtcacatactcgatattaatcccataccagtcagctacatcagcgctttggcaaatttagaaaattcccctattttatcatcaatctcttttttaaatggttatgttacttaaaagcttgaaacaaacgtaaaacacaaaaacattctaaaatatttgccaacatcttaaaag
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTGTCCTT-GAACGGGGTACCCTGAATGcag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgaataaggccagggaagagATGGGTTCATTCTAATGGGCAATAATGCCTGTCCTTGTGCTGCC-CAggttcattctaatgggcaataatgcctgtccttgtgctgcccagcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTA-TAC--AGATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGGAGNGGATT-GCACGTC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAATTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTGAG
Reference ( family-2100 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGAC-A-TAC--AGATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGGAGNGGATT-GCACGTC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAATTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTGAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATGTA------AACATT--TGGTGCT-AGCAAACTTTGAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttggtggaatacctgatatacttTTGCTA-GCACCAAATGTTT-ACATGGCGTTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGATGAGTCCATGTATTGCCTGATGAGTCCATGTATTGCCTAGAC-AATAC--AGATAGGCGTGCTAGT-GTATGGAGAAGGCTAGGGGAAAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGTATGACCACTATTGAGG-GCGG-TTCATGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACCTCATTGTCCTT-GATTGAGGTACATTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGTAAAAATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTAATGGGTTCATTTTAATGGACTGTAATGCCCGTTCTCATGCTGCC-CATGCTGTACGGGAGTACCTT-CAAAGGGAGGGGATT-GCATGTC--TGAACTGGCCAGCCCGACCCCCCGACTTCAGTCC---C---------ATCGAGCATGTGCGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGTATTTCAACCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGATCCAGGAATAGAACAACATCCTGCAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCATTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACTGGTCACATACTCGATATT-AATCCCATTTATCCCATACTGAGTTAGCTCCGTTAG-C-TTTTTGGCAAATTTAAATAA-TT-CCCAATATTATC-AAAAATCTCAATTTTCAATGGTTATCTCACTCAAGAGTGTAAAACAAACATAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAAATTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAACGAAAA---------GTACAAAC-------AA-----AAAATCAT----------AACAATATT-GCAAC--TACATTGT---AAC------GTAAAACGTGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGGAAACTATGAGgcgttgaccagagaggactggcgacctgtcctttttacagatgagtccatgtattgcctgatgagtccatgtattgcctagacaatacagataggcgtgctagtgtatggagaaggctaggggaaagattccacgcagccaacattgctgagtatgaccactattgagggcggttcatgatggtctggggcgggatcagctgggatggacgtacatacctcattgtccttgattgaggtacattgaatgcccagcggtatagagatgagattctggatacccagtaaaaattgtatgctggtgcagtgggtaatgggttcattttaatggactgtaatgcccgttctcatgctgcccatgctgtacgggagtaccttcaaagggaggggattgcatgtctgaactggccagcccgaccccccgacttcagtcccatcgagcatgtgcgaaatgagttgcagcttggtatttcaacccgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctgatccaggaatagaacaacatcctgcaaaggaccatcaggaacctgatagggagcatgaggaggcattgccaagctgtaattaacagcaactggtcacatactcgatattaatcccatttatcccatactgagttagctccgttagctttttggcaaatttaaataattcccaatattatcaaaaatctcaattttcaatggttatctcactcaagagtgtaaaacaaacataaaacacaaacaaattctaaaaaatttgcctacatcttaaaagagaatattaaacgaaaagtacaaacaaaaaatcataacaatattgcaactacattgtaacgtaaaacgtgtacttggatattcttggtgcttaggaaactatgagcagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttggtggaatacctgatatacttctcaaagtTTGGTGTTTAGCAAACTTTGAGcagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttcatatatcgaatatatactaTTGCTAAACACCAA-TATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTAATGACCTGTCCTTTTTACAGAA--------------------GAGTCAAAGTATTTCCTAGAC-AATAC--AGATAGGTGTGCTAGGAGCGTGGAGAAGGCCACGGG-GAAATTCCACGCAGTCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATAGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-AGGCGGGATCAGCTGGGAAGGACGTACAGACCTCATTGTtatttcacacggcattgaccagagaggactaatgacctgtcctttttacagaagagtcaaagtatttcctagacaatacagataggtgtgctaggagcgtggagaaggccacggggaaattccacgcagtcaacattgctgagcatgaccgctatagaggcggctccgtgatggtctgaggcgggatcagctgggaaggacgtacagacctcattgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttcatatatcgaatatatactactcaaagtTTTTCATGCAAAATAATGCCCCGCCTCATACTGCCACA-ACCGCACGTCAG-ATGTTGCAGGCCAACAACATTCGAACGT---TAGACTGGCCAGCTTGCAGTTCCGACCTCAATCCGATCGAAAATCCGATCGAACACGTGTGGTGCGAGATTGACCG-TTGGA---TCAGGAGGTT--GCCTAGACAACAAAATGTACATGAACTTGG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTATT-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAAATAAATTCTAAAATCTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GATCAAAC-------AATT--T----TCAT----------ATCAATATT-GCAAC--TG-----A---AAC------GTTAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTTCTTAGCAAACTTTGAGgagtgacctcatcagcacacgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcagtaacattcattgGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAATGGGTCACATACTCAATATT-AATCAAA--TACA--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TA-CCCTATTTTATC-AAAAATATCTATTTTCAATGGTTATCGTACTCAAAAGCTTAAAAGAAACATAAAGTGC-AAA-CAAATTCTGATGTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAACAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATATT--TGGCGCTTAGCAAACTTTGAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTGCTAAGCGCCAAATATTTCACATGACATTGACCAGAAAGGACTGGCAACCTGTCCTTATTACAGAT--------------------GAGTCCAGATATTGCCTAGACTA-TAC--AGATAGGTATGCTATG-GTATGGAGttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatggagcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actcaaagtGAGCATGACTGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GAGCAAGATCAGCTGGGATGGAcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    actcaaagtttgctaagcgccaaatatttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatgCAGCAAATATTTCACATGGCATTGTCCAGAGAGGACTTGCGATCTGTCCTTTTTACTAAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGAC---TACCAAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGAATAAGGCCAGGGAAGAGATTtcta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatataggcatatttatatactactaaaagtttttACTGGCCAGCTTGCAGTCTAGATCTCAATCC---G---------ATCGAACATGTGCAAGACGAG-g
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgttacATATT--TGGTTCTTAGCAAACTTTGAGcagaaagttattcagacaacaagatgtacctgaacttcagagtggacctcaccaacacatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attttatattcaatttatatactaTTGCTAAGAACCAAATATTTCACACGGCATTTAACAGAGAGGACTGGTGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTC-----------TAGACTA-TAT--AGATAAGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTGCATGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTTTGGA-G-GCGGCTCCATGATGGTCTG-GGGCAGAATCAGCTTGGATGGACGTACAGACCGCATTGTCCTT-GACAGAGGTACACTGAACGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATATTGGTGCAAAGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGTCCGTCGTCATGCTGCC-CATGCTTCTCGGGAGTACGTT-CAGAGGGAGGGGATT-GCACCTC--TGGACTGGCCAGACCTATCATCCGACCTCAATCT---C---------ATTTAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGAAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AAAGTATCCAGGAGAGTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATTGAACAACATCCCACAAAGGACCATAGGGAATCTGTTAGGGAGTATGAGGAGGTGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACATGTAACATACTAGATAGT-AATCAAA--TACC--------AATTAGATCCGTCAG-CTTTTTTAGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATCAAAAAATCTCTATTTTCAATGTTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAGTTTTGCCT---T----AAAGAGAATATT------AAA---------GTGCAAAC-------AATT--G----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---TAT------GAAAAACATATAC--T-------------TGCTTAGCAATTTTTAAGttcacacggcatttaacagagaggactggtgacctgtcctttttacagatgagtctagactatatagataagcgtgctagggtatggagaaggccaggggagagattgcatgcagccaacattgctgagcataaccgctttggaggcggctccatgatggtctggggcagaatcagcttggatggacgtacagaccgcattgtccttgacagaggtacactgaacgcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatattggtgcaaagggtgatgggttcattctaatggacgataatgtccgtcgtcatgctgcccatgcttctcgggagtacgttcagagggaggggattgcacctctggactggccagacctatcatccgacctcaatctcatttagcatgtgtggaatgagttgcagcttgaaatttcagcccgtcaagtccagccaaaaagtatccaggagagtggtgccatgctggtccaagaattgaacaacatcccacaaaggaccatagggaatctgttagggagtatgaggaggtgttgccaagctgtaattaacagcaacatgtaacatactagatagtaatcaaataccaattagatccgtcagcttttttagcaaatttagaaaattccctattttatcaaaaaatctctattttcaatgtttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattctaaaagttttgccttaaagagaatattaaagtgcaaacaattgtcataacaatattgcaactattatgaaaaacatatacttgcttagcaatttttaagca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               attttatattcaatttatatactactcaaagtATATTTT--GTGCTTAGCGAACTTTGAGca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actaTCGCTAAGCACAAAATATTTCACACGGCACTGAGCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTATTGAT--------------------GAGACCAGGTATTGCCTAGACTA-TAC--AGATAGACGTGCTAGG-GTGTGGAGTAGGCCAGGGGAGATATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGGCGTACATACCTCATTGTCTTT-GACCGGGGTACATTGAACTCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGCAGTTGGTAATGGGTTCATTCTACTGGA-GATAATGCCTGTCTTCATGCTGTC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actactcaaagtCTTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-AAGCTTGGAATT-CAGCCTGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--ATTCTGGTCCAAGAATAGAACAACATCCAACAAAGGACCATCTGGAATCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTCATTAACAGCAATGGGTCACATACTAGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTATGAAAA-CT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-A----AAGTTCTAAATGTTTTGCCTACATCATAAAAGAGAATATTAAATGAAAACAAGGACTTGTATAGACTCTATATAATTCCT----TGATGAAAAGTACAAACAGTTTTCATAACAATA-----TTGCAACTATAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTTGTGCTTGGCAAACATTGatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|4                          : actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtacTTGCTAAGCACCAAATAATTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTATACAGAT--------------------AAGTCCAGGTATTGCCTA------TAC--AGATAGTCGTGCTAGG-GTACGGAGAAGGCTAGGGGAGAGATTCCTCGCAACCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCACCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACGTCATCGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGTAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCTGTCCTCATGCTCCC-CATGCTGTCCGAGTGCACCTT-CAGAGGGAGAGGATT-GCACGTA--TGGACTGGCAAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AACGTATCCATGAACTTGGTGCAAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATTAGGAACCTTATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAAAAGCAACGGGTCACATACTCGATAGT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGACAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTTTTTTCAATGGTTATCTTATTCAAAGGCTTAAAACAAACATAAAACACAAAA-CAAATTCTAAAATGCTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAAAGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATACT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAATATGTAC--TTGGATATTGTTGGTGCTTAGCAAACTTTAAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATATT--TGGTGCTTAGCCAACTTTGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCACTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTATTTTTTAAAGA-------------------------CAAGGTATTGCCTAGACTA-TAT--AGA-AGGCATGCTAAG-GTATGGAGAAGGCCAGGG-AGAGATTCCAAG-AGGCAACATTGCTGAGCATAACCGCCATTGA-G-GTGGCTTAGTGATGATCTG-GAACGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTTTGGCCGGGGTACACCGAATGCCCAGCTGTATAGAGATGAGATTCTAAATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTTATTCTAATGGACGATAATGCTCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTATCCGAGAGTACCTttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
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Reference ( family-2100 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTATACAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGGAGNGGATT-GCACGTC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAATTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTGAG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttggtggaatacctgatatacttTTGCTA-GCACCAAATGTTT-ACATGGCGTTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGATGAGTCCATGTATTGCCTGATGAGTCCATGTATTGCCTAGACAATACAGATAGGCGTGCTAGT-GTATGGAGAAGGCTAGGGGAAAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGTATGACCACTATTGAGG-GCGG-TTCATGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACCTCATTGTCCTT-GATTGAGGTACATTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGTAAAAATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTAATGGGTTCATTTTAATGGACTGTAATGCCCGTTCTCATGCTGCC-CATGCTGTACGGGAGTACCTT-CAAAGGGAGGGGATT-GCATGTC--TGAACTGGCCAGCCCGACCCCCCGACTTCAGTCC---C---------ATCGAGCATGTGCGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGTATTTCAACCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGATCCAGGAATAGAACAACATCCTGCAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCATTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACTGGTCACATACTCGATATT-AATCCCATTTATCCCATACTGAGTTAGCTCCGTTAG-C-TTTTTGGCAAATTTAAATAA-TT-CCCAATATTATC-AAAAATCTCAATTTTCAATGGTTATCTCACTCAAGAGTGTAAAACAAACATAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAAATTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAACGAAAA---------GTACAAAC-------AA-----AAAATCAT----------AACAATATT-GCAAC--TACATTGT---AAC------GTAAAACGTGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGGAAACTATGAGgcgttgaccagagaggactggcgacctgtcctttttacagatgagtccatgtattgcctgatgagtccatgtattgcctagacaatacagataggcgtgctagtgtatggagaaggctaggggaaagattccacgcagccaacattgctgagtatgaccactattgagggcggttcatgatggtctggggcgggatcagctgggatggacgtacatacctcattgtccttgattgaggtacattgaatgcccagcggtatagagatgagattctggatacccagtaaaaattgtatgctggtgcagtgggtaatgggttcattttaatggactgtaatgcccgttctcatgctgcccatgctgtacgggagtaccttcaaagggaggggattgcatgtctgaactggccagcccgaccccccgacttcagtcccatcgagcatgtgcgaaatgagttgcagcttggtatttcaacccgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctgatccaggaatagaacaacatcctgcaaaggaccatcaggaacctgatagggagcatgaggaggcattgccaagctgtaattaacagcaactggtcacatactcgatattaatcccatttatcccatactgagttagctccgttagctttttggcaaatttaaataattcccaatattatcaaaaatctcaattttcaatggttatctcactcaagagtgtaaaacaaacataaaacacaaacaaattctaaaaaatttgcctacatcttaaaagagaatattaaacgaaaagtacaaacaaaaaatcataacaatattgcaactacattgtaacgtaaaacgtgtacttggatattcttggtgcttaggaaactatgagcagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggtggaatacctgatatacttctcaaagtTTGGTGTTTAGCAAACTTTGAGcagt
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttcatatatcgaatatatactactcaaagtTTTTCATGCAAAATAATGCCCCGCCTCATACTGCCACA-ACCGCACGTCAG-ATGTTGCAGGCCAACAACATTCGAACGT---TAGACTGGCCAGCTTGCAGTTCCGACCTCAATCCGATCGAAAATCCGATCGAACACGTGTGGTGCGAGATTGACCG-TTGGA---TCAGGAGGTT--GCCTAGACAACAAAATGTACATGAACTTGG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTATT-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAAATAAATTCTAAAATCTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GATCAAAC-------AATT--T----TCAT----------ATCAATATT-GCAAC--TG-----A---AAC------GTTAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTTCTTAGCAAACTTTGAGgagtgacctcatcagcacacgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcagtaacattcattgGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAATGGGTCACATACTCAATATT-AATCAAA--TACA--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TA-CCCTATTTTATC-AAAAATATCTATTTTCAATGGTTATCGTACTCAAAAGCTTAAAAGAAACATAAAGTGC-AAA-CAAATTCTGATGTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAACAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT--TGGCGCTTAGCAAACTTTGAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTGCTAAGCGCCAAATATTTCACATGACATTGACCAGAAAGGACTGGCAACCTGTCCTTATTACAGAT--------------------GAGTCCAGATATTGCCTAGACTATACAGATAGGTATGCTATG-GTATGGAGttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatggagcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actcaaagtGAGCATGACTGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GAGCAAGATCAGCTGGGATGGAcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    actcaaagtttgctaagcgccaaatatttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatgCAGCAAATATTTCACATGGCATTGTCCAGAGAGGACTTGCGATCTGTCCTTTTTACTAAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTACCAAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGAATAAGGCCAGGGAAGAGATTtcta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatataggcatatttatatactactaaaagtttttACTGGCCAGCTTGCAGTCTAGATCTCAATCC---G---------ATCGAACATGTGCAAGACGAG-g
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cgttacATATT--TGGTTCTTAGCAAACTTTGAGcagaaagttattcagacaacaagatgtacctgaacttcagagtggacctcaccaacacatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attttatattcaatttatatactaTTGCTAAGAACCAAATATTTCACACGGCATTTAACAGAGAGGACTGGTGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTC-----------TAGACTATATAGATAAGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTGCATGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTTTGGA-G-GCGGCTCCATGATGGTCTG-GGGCAGAATCAGCTTGGATGGACGTACAGACCGCATTGTCCTT-GACAGAGGTACACTGAACGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATATTGGTGCAAAGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGTCCGTCGTCATGCTGCC-CATGCTTCTCGGGAGTACGTT-CAGAGGGAGGGGATT-GCACCTC--TGGACTGGCCAGACCTATCATCCGACCTCAATCT---C---------ATTTAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGAAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AAAGTATCCAGGAGAGTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATTGAACAACATCCCACAAAGGACCATAGGGAATCTGTTAGGGAGTATGAGGAGGTGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACATGTAACATACTAGATAGT-AATCAAA--TACC--------AATTAGATCCGTCAG-CTTTTTTAGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATCAAAAAATCTCTATTTTCAATGTTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAGTTTTGCCT---T----AAAGAGAATATT------AAA---------GTGCAAAC-------AATT--G----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---TAT------GAAAAACATATAC--T-------------TGCTTAGCAATTTTTAAGttcacacggcatttaacagagaggactggtgacctgtcctttttacagatgagtctagactatatagataagcgtgctagggtatggagaaggccaggggagagattgcatgcagccaacattgctgagcataaccgctttggaggcggctccatgatggtctggggcagaatcagcttggatggacgtacagaccgcattgtccttgacagaggtacactgaacgcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatattggtgcaaagggtgatgggttcattctaatggacgataatgtccgtcgtcatgctgcccatgcttctcgggagtacgttcagagggaggggattgcacctctggactggccagacctatcatccgacctcaatctcatttagcatgtgtggaatgagttgcagcttgaaatttcagcccgtcaagtccagccaaaaagtatccaggagagtggtgccatgctggtccaagaattgaacaacatcccacaaaggaccatagggaatctgttagggagtatgaggaggtgttgccaagctgtaattaacagcaacatgtaacatactagatagtaatcaaataccaattagatccgtcagcttttttagcaaatttagaaaattccctattttatcaaaaaatctctattttcaatgtttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattctaaaagttttgccttaaagagaatattaaagtgcaaacaattgtcataacaatattgcaactattatgaaaaacatatacttgcttagcaatttttaagca
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actaTCGCTAAGCACAAAATATTTCACACGGCACTGAGCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTATTGAT--------------------GAGACCAGGTATTGCCTAGACTATACAGATAGACGTGCTAGG-GTGTGGAGTAGGCCAGGGGAGATATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGGCGTACATACCTCATTGTCTTT-GACCGGGGTACATTGAACTCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGCAGTTGGTAATGGGTTCATTCTACTGGA-GATAATGCCTGTCTTCATGCTGTC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actactcaaagtCTTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-AAGCTTGGAATT-CAGCCTGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--ATTCTGGTCCAAGAATAGAACAACATCCAACAAAGGACCATCTGGAATCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTCATTAACAGCAATGGGTCACATACTAGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTATGAAAA-CT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-A----AAGTTCTAAATGTTTTGCCTACATCATAAAAGAGAATATTAAATGAAAACAAGGACTTGTATAGACTCTATATAATTCCT----TGATGAAAAGTACAAACAGTTTTCATAACAATA-----TTGCAACTATAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTTGTGCTTGGCAAACATTGatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|4                          : actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtacTTGCTAAGCACCAAATAATTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTATACAGAT--------------------AAGTCCAGGTATTGCCTA-----TACAGATAGTCGTGCTAGG-GTACGGAGAAGGCTAGGGGAGAGATTCCTCGCAACCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCACCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACGTCATCGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGTAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCTGTCCTCATGCTCCC-CATGCTGTCCGAGTGCACCTT-CAGAGGGAGAGGATT-GCACGTA--TGGACTGGCAAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AACGTATCCATGAACTTGGTGCAAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATTAGGAACCTTATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAAAAGCAACGGGTCACATACTCGATAGT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGACAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTTTTTTCAATGGTTATCTTATTCAAAGGCTTAAAACAAACATAAAACACAAAA-CAAATTCTAAAATGCTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAAAGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATACT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAATATGTAC--TTGGATATTGTTGGTGCTTAGCAAACTTTAAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT--TGGTGCTTAGCCAACTTTGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCACTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTATTTTTTAAAGA-------------------------CAAGGTATTGCCTAGACTATATAGA-AGGCATGCTAAG-GTATGGAGAAGGCCAGGG-AGAGATTCCAAG-AGGCAACATTGCTGAGCATAACCGCCATTGA-G-GTGGCTTAGTGATGATCTG-GAACGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTTTGGCCGGGGTACACCGAATGCCCAGCTGTATAGAGATGAGATTCTAAATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTTATTCTAATGGACGATAATGCTCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTATCCGAGAGTACCTttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
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Reference ( family-2100 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTATACAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGGAGNGGATT-GCACGTC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAATTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTGAG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttggtggaatacctgatatacttTTGCTA-GCACCAAATGTTT-ACATGGCGTTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGATGAGTCCATGTATTGCCTGATGAGTCCATGTATTGCCTAGACAATACAGATAGGCGTGCTAGT-GTATGGAGAAGGCTAGGGGAAAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGTATGACCACTATTGAGG-GCGG-TTCATGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACCTCATTGTCCTT-GATTGAGGTACATTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGTAAAAATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTAATGGGTTCATTTTAATGGACTGTAATGCCCGTTCTCATGCTGCC-CATGCTGTACGGGAGTACCTT-CAAAGGGAGGGGATT-GCATGTC--TGAACTGGCCAGCCCGACCCCCCGACTTCAGTCC---C---------ATCGAGCATGTGCGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGTATTTCAACCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGATCCAGGAATAGAACAACATCCTGCAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCATTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACTGGTCACATACTCGATATT-AATCCCATTTATCCCATACTGAGTTAGCTCCGTTAG-C-TTTTTGGCAAATTTAAATAA-TT-CCCAATATTATC-AAAAATCTCAATTTTCAATGGTTATCTCACTCAAGAGTGTAAAACAAACATAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAAATTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAACGAAAA---------GTACAAAC-------AA-----AAAATCAT----------AACAATATT-GCAAC--TACATTGT---AAC------GTAAAACGTGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGGAAACTATGAGgcgttgaccagagaggactggcgacctgtcctttttacagatgagtccatgtattgcctgatgagtccatgtattgcctagacaatacagataggcgtgctagtgtatggagaaggctaggggaaagattccacgcagccaacattgctgagtatgaccactattgagggcggttcatgatggtctggggcgggatcagctgggatggacgtacatacctcattgtccttgattgaggtacattgaatgcccagcggtatagagatgagattctggatacccagtaaaaattgtatgctggtgcagtgggtaatgggttcattttaatggactgtaatgcccgttctcatgctgcccatgctgtacgggagtaccttcaaagggaggggattgcatgtctgaactggccagcccgaccccccgacttcagtcccatcgagcatgtgcgaaatgagttgcagcttggtatttcaacccgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctgatccaggaatagaacaacatcctgcaaaggaccatcaggaacctgatagggagcatgaggaggcattgccaagctgtaattaacagcaactggtcacatactcgatattaatcccatttatcccatactgagttagctccgttagctttttggcaaatttaaataattcccaatattatcaaaaatctcaattttcaatggttatctcactcaagagtgtaaaacaaacataaaacacaaacaaattctaaaaaatttgcctacatcttaaaagagaatattaaacgaaaagtacaaacaaaaaatcataacaatattgcaactacattgtaacgtaaaacgtgtacttggatattcttggtgcttaggaaactatgagcagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggtggaatacctgatatacttctcaaagtTTGGTGTTTAGCAAACTTTGAGcagt
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttcatatatcgaatatatactactcaaagtTTTTCATGCAAAATAATGCCCCGCCTCATACTGCCACA-ACCGCACGTCAG-ATGTTGCAGGCCAACAACATTCGAACGT---TAGACTGGCCAGCTTGCAGTTCCGACCTCAATCCGATCGAAAATCCGATCGAACACGTGTGGTGCGAGATTGACCG-TTGGA---TCAGGAGGTT--GCCTAGACAACAAAATGTACATGAACTTGG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTATT-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAAATAAATTCTAAAATCTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GATCAAAC-------AATT--T----TCAT----------ATCAATATT-GCAAC--TG-----A---AAC------GTTAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTTCTTAGCAAACTTTGAGgagtgacctcatcagcacacgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcagtaacattcattgGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAATGGGTCACATACTCAATATT-AATCAAA--TACA--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TA-CCCTATTTTATC-AAAAATATCTATTTTCAATGGTTATCGTACTCAAAAGCTTAAAAGAAACATAAAGTGC-AAA-CAAATTCTGATGTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAACAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT--TGGCGCTTAGCAAACTTTGAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTGCTAAGCGCCAAATATTTCACATGACATTGACCAGAAAGGACTGGCAACCTGTCCTTATTACAGAT--------------------GAGTCCAGATATTGCCTAGACTATACAGATAGGTATGCTATG-GTATGGAGttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatggagcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actcaaagtGAGCATGACTGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GAGCAAGATCAGCTGGGATGGAcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    actcaaagtttgctaagcgccaaatatttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatgCAGCAAATATTTCACATGGCATTGTCCAGAGAGGACTTGCGATCTGTCCTTTTTACTAAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTACCAAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGAATAAGGCCAGGGAAGAGATTtcta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatataggcatatttatatactactaaaagtttttACTGGCCAGCTTGCAGTCTAGATCTCAATCC---G---------ATCGAACATGTGCAAGACGAG-g
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cgttacATATT--TGGTTCTTAGCAAACTTTGAGcagaaagttattcagacaacaagatgtacctgaacttcagagtggacctcaccaacacatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attttatattcaatttatatactaTTGCTAAGAACCAAATATTTCACACGGCATTTAACAGAGAGGACTGGTGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTC-----------TAGACTATATAGATAAGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTGCATGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTTTGGA-G-GCGGCTCCATGATGGTCTG-GGGCAGAATCAGCTTGGATGGACGTACAGACCGCATTGTCCTT-GACAGAGGTACACTGAACGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATATTGGTGCAAAGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGTCCGTCGTCATGCTGCC-CATGCTTCTCGGGAGTACGTT-CAGAGGGAGGGGATT-GCACCTC--TGGACTGGCCAGACCTATCATCCGACCTCAATCT---C---------ATTTAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGAAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AAAGTATCCAGGAGAGTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATTGAACAACATCCCACAAAGGACCATAGGGAATCTGTTAGGGAGTATGAGGAGGTGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACATGTAACATACTAGATAGT-AATCAAA--TACC--------AATTAGATCCGTCAG-CTTTTTTAGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATCAAAAAATCTCTATTTTCAATGTTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAGTTTTGCCT---T----AAAGAGAATATT------AAA---------GTGCAAAC-------AATT--G----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---TAT------GAAAAACATATAC--T-------------TGCTTAGCAATTTTTAAGttcacacggcatttaacagagaggactggtgacctgtcctttttacagatgagtctagactatatagataagcgtgctagggtatggagaaggccaggggagagattgcatgcagccaacattgctgagcataaccgctttggaggcggctccatgatggtctggggcagaatcagcttggatggacgtacagaccgcattgtccttgacagaggtacactgaacgcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatattggtgcaaagggtgatgggttcattctaatggacgataatgtccgtcgtcatgctgcccatgcttctcgggagtacgttcagagggaggggattgcacctctggactggccagacctatcatccgacctcaatctcatttagcatgtgtggaatgagttgcagcttgaaatttcagcccgtcaagtccagccaaaaagtatccaggagagtggtgccatgctggtccaagaattgaacaacatcccacaaaggaccatagggaatctgttagggagtatgaggaggtgttgccaagctgtaattaacagcaacatgtaacatactagatagtaatcaaataccaattagatccgtcagcttttttagcaaatttagaaaattccctattttatcaaaaaatctctattttcaatgtttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattctaaaagttttgccttaaagagaatattaaagtgcaaacaattgtcataacaatattgcaactattatgaaaaacatatacttgcttagcaatttttaagca
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actaTCGCTAAGCACAAAATATTTCACACGGCACTGAGCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTATTGAT--------------------GAGACCAGGTATTGCCTAGACTATACAGATAGACGTGCTAGG-GTGTGGAGTAGGCCAGGGGAGATATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGGCGTACATACCTCATTGTCTTT-GACCGGGGTACATTGAACTCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGCAGTTGGTAATGGGTTCATTCTACTGGA-GATAATGCCTGTCTTCATGCTGTC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actactcaaagtCTTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-AAGCTTGGAATT-CAGCCTGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--ATTCTGGTCCAAGAATAGAACAACATCCAACAAAGGACCATCTGGAATCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTCATTAACAGCAATGGGTCACATACTAGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTATGAAAA-CT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-A----AAGTTCTAAATGTTTTGCCTACATCATAAAAGAGAATATTAAATGAAAACAAGGACTTGTATAGACTCTATATAATTCCT----TGATGAAAAGTACAAACAGTTTTCATAACAATA-----TTGCAACTATAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTTGTGCTTGGCAAACATTGatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|4                          : actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtacTTGCTAAGCACCAAATAATTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTATACAGAT--------------------AAGTCCAGGTATTGCCTA-----TACAGATAGTCGTGCTAGG-GTACGGAGAAGGCTAGGGGAGAGATTCCTCGCAACCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCACCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACGTCATCGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGTAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCTGTCCTCATGCTCCC-CATGCTGTCCGAGTGCACCTT-CAGAGGGAGAGGATT-GCACGTA--TGGACTGGCAAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AACGTATCCATGAACTTGGTGCAAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATTAGGAACCTTATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAAAAGCAACGGGTCACATACTCGATAGT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGACAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTTTTTTCAATGGTTATCTTATTCAAAGGCTTAAAACAAACATAAAACACAAAA-CAAATTCTAAAATGCTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAAAGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATACT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAATATGTAC--TTGGATATTGTTGGTGCTTAGCAAACTTTAAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT--TGGTGCTTAGCCAACTTTGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCACTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTATTTTTTAAAGA-------------------------CAAGGTATTGCCTAGACTATATAGA-AGGCATGCTAAG-GTATGGAGAAGGCCAGGG-AGAGATTCCAAG-AGGCAACATTGCTGAGCATAACCGCCATTGA-G-GTGGCTTAGTGATGATCTG-GAACGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTTTGGCCGGGGTACACCGAATGCCCAGCTGTATAGAGATGAGATTCTAAATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTTATTCTAATGGACGATAATGCTCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTATCCGAGAGTACCTttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tataatatttcgatatattctactcaaagtttgctaaacggcaaatatttcacacggcattgaccagagaagactggcgagctgtctttttacagatgagtccatgttttgcctagactatacagatagacgtgcaagggtatggagaagaccaGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAATGGATGATGGGTTCATTCTAATCGACGATAATGCCCAGCTTCATGCTGGC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGCAGTGGATT-GCACATC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCAACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTT-CAGCTTGGAAT-------------ATCCAGCAAA-GAAGCATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCAACTAAGGACAATCAGGAACCTGATAGGAAGCATGAGGAAGCGTTGCGAAGCTATAATTAACAGCAACGGTTCACATACTTGATATA-AATCCCA--TACC--------TGTTAGTTCTGTCAG-A-TTTTTGGCAAATTAAGAAAAATT-CCCTATTATATG-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTTAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAG-CAAATTCTAATTTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATTTTAAATAACAA---------GTGCAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----C---AAC------GTAAAACATGTAA--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTTAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTGTCCTT-GAACGGGGTACCCTGAATGcag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgaataaggccagggaagagATGGGTTCATTCTAATGGGCAATAATGCCTGTCCTTGTGCTGCC-CAggttcattctaatgggcaataatgcctgtccttgtgctgcccagcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgaataaggccagggaagagattgtccttgaacggggtaccctgaT-GCCTGTCCTTGTGCTGCCCAGCCCAATCCCCCAACCTCAATCC---C---------ATTGAGCATGTGTGTAATGGG-TCG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAG-----CCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAGCATCCCACAAAGGATGATTAGGAACCTGATAGG-AGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAATA-TAACGGTTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACCA-------AGTTAGCTTTGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCCATTTTATC-AAAACTCACTATTTTCAACTGTTATCTTACTCAAAAGTTTAAAACAAACGTAAAGCAC-TAA-C-AATTTT----TTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATAAAAA---------GTGCAGAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTGCTTTTGGATATTCTTGTTGCTTAGCAAACTTTGAGgcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa


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Reference ( family-2100 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTATACAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGGAGNGGATT-GCACGTC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACGGGTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAATTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTGAG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttggtggaatacctgatatacttTTGCTA-GCACCAAATGTTT-ACATGGCGTTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTACAGATGAGTCCATGTATTGCCTGATGAGTCCATGTATTGCCTAGACAATACAGATAGGCGTGCTAGT-GTATGGAGAAGGCTAGGGGAAAGATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGTATGACCACTATTGAGG-GCGG-TTCATGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACCTCATTGTCCTT-GATTGAGGTACATTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGTAAAAATTGTATGCTGGTGCAGTGGGTAATGGGTTCATTTTAATGGACTGTAATGCCCGTTCTCATGCTGCC-CATGCTGTACGGGAGTACCTT-CAAAGGGAGGGGATT-GCATGTC--TGAACTGGCCAGCCCGACCCCCCGACTTCAGTCC---C---------ATCGAGCATGTGCGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGTATTTCAACCCGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGATCCAGGAATAGAACAACATCCTGCAAAGGACCATCAGGAACCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCATTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACTGGTCACATACTCGATATT-AATCCCATTTATCCCATACTGAGTTAGCTCCGTTAG-C-TTTTTGGCAAATTTAAATAA-TT-CCCAATATTATC-AAAAATCTCAATTTTCAATGGTTATCTCACTCAAGAGTGTAAAACAAACATAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAAATTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAACGAAAA---------GTACAAAC-------AA-----AAAATCAT----------AACAATATT-GCAAC--TACATTGT---AAC------GTAAAACGTGTAC--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGGAAACTATGAGgcgttgaccagagaggactggcgacctgtcctttttacagatgagtccatgtattgcctgatgagtccatgtattgcctagacaatacagataggcgtgctagtgtatggagaaggctaggggaaagattccacgcagccaacattgctgagtatgaccactattgagggcggttcatgatggtctggggcgggatcagctgggatggacgtacatacctcattgtccttgattgaggtacattgaatgcccagcggtatagagatgagattctggatacccagtaaaaattgtatgctggtgcagtgggtaatgggttcattttaatggactgtaatgcccgttctcatgctgcccatgctgtacgggagtaccttcaaagggaggggattgcatgtctgaactggccagcccgaccccccgacttcagtcccatcgagcatgtgcgaaatgagttgcagcttggtatttcaacccgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctgatccaggaatagaacaacatcctgcaaaggaccatcaggaacctgatagggagcatgaggaggcattgccaagctgtaattaacagcaactggtcacatactcgatattaatcccatttatcccatactgagttagctccgttagctttttggcaaatttaaataattcccaatattatcaaaaatctcaattttcaatggttatctcactcaagagtgtaaaacaaacataaaacacaaacaaattctaaaaaatttgcctacatcttaaaagagaatattaaacgaaaagtacaaacaaaaaatcataacaatattgcaactacattgtaacgtaaaacgtgtacttggatattcttggtgcttaggaaactatgagcagt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggtggaatacctgatatacttctcaaagtTTGGTGTTTAGCAAACTTTGAGcagt
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttcatatatcgaatatatactactcaaagtTTTTCATGCAAAATAATGCCCCGCCTCATACTGCCACA-ACCGCACGTCAG-ATGTTGCAGGCCAACAACATTCGAACGT---TAGACTGGCCAGCTTGCAGTTCCGACCTCAATCCGATCGAAAATCCGATCGAACACGTGTGGTGCGAGATTGACCG-TTGGA---TCAGGAGGTT--GCCTAGACAACAAAATGTACATGAACTTGG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTATT-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAAATAAATTCTAAAATCTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATGAAAA---------GATCAAAC-------AATT--T----TCAT----------ATCAATATT-GCAAC--TG-----A---AAC------GTTAAACATGTAC--TTGGATATTCTTGGTTCTTAGCAAACTTTGAGgagtgacctcatcagcacacgg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcagtaacattcattgGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAATGGGTCACATACTCAATATT-AATCAAA--TACA--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TA-CCCTATTTTATC-AAAAATATCTATTTTCAATGGTTATCGTACTCAAAAGCTTAAAAGAAACATAAAGTGC-AAA-CAAATTCTGATGTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAACAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT--TGGCGCTTAGCAAACTTTGAG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aTTGCTAAGCGCCAAATATTTCACATGACATTGACCAGAAAGGACTGGCAACCTGTCCTTATTACAGAT--------------------GAGTCCAGATATTGCCTAGACTATACAGATAGGTATGCTATG-GTATGGAGttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatggagcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actcaaagtGAGCATGACTGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GAGCAAGATCAGCTGGGATGGAcatgactgctatggaggcggctccgtgatggtctggagcaagatcagctgggatggatcta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    actcaaagtttgctaagcgccaaatatttcacatgacattgaccagaaaggactggcaacctgtccttattacagatgagtccagatattgcctagactatacagataggtatgctatggtatgCAGCAAATATTTCACATGGCATTGTCCAGAGAGGACTTGCGATCTGTCCTTTTTACTAAT--------------------GAGTCCAGGTATTGCCTAGACTACCAAGATAGGCGTGCTAGG-GTATGAATAAGGCCAGGGAAGAGATTtcta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatataggcatatttatatactactaaaagtttttACTGGCCAGCTTGCAGTCTAGATCTCAATCC---G---------ATCGAACATGTGCAAGACGAG-g
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cgttacATATT--TGGTTCTTAGCAAACTTTGAGcagaaagttattcagacaacaagatgtacctgaacttcagagtggacctcaccaacacatgg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attttatattcaatttatatactaTTGCTAAGAACCAAATATTTCACACGGCATTTAACAGAGAGGACTGGTGACCTGTCCTTTTTACAGAT--------------------GAGTC-----------TAGACTATATAGATAAGCGTGCTAGG-GTATGGAGAAGGCCAGGGGAGAGATTGCATGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTTTGGA-G-GCGGCTCCATGATGGTCTG-GGGCAGAATCAGCTTGGATGGACGTACAGACCGCATTGTCCTT-GACAGAGGTACACTGAACGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATATTGGTGCAAAGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGTCCGTCGTCATGCTGCC-CATGCTTCTCGGGAGTACGTT-CAGAGGGAGGGGATT-GCACCTC--TGGACTGGCCAGACCTATCATCCGACCTCAATCT---C---------ATTTAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-CAGCTTGAAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AAAGTATCCAGGAGAGTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATTGAACAACATCCCACAAAGGACCATAGGGAATCTGTTAGGGAGTATGAGGAGGTGTTGCCAAGCTGTAATTAACAGCAACATGTAACATACTAGATAGT-AATCAAA--TACC--------AATTAGATCCGTCAG-CTTTTTTAGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATCAAAAAATCTCTATTTTCAATGTTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAA-CAAATTCTAAAAGTTTTGCCT---T----AAAGAGAATATT------AAA---------GTGCAAAC-------AATT--G----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---TAT------GAAAAACATATAC--T-------------TGCTTAGCAATTTTTAAGttcacacggcatttaacagagaggactggtgacctgtcctttttacagatgagtctagactatatagataagcgtgctagggtatggagaaggccaggggagagattgcatgcagccaacattgctgagcataaccgctttggaggcggctccatgatggtctggggcagaatcagcttggatggacgtacagaccgcattgtccttgacagaggtacactgaacgcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatattggtgcaaagggtgatgggttcattctaatggacgataatgtccgtcgtcatgctgcccatgcttctcgggagtacgttcagagggaggggattgcacctctggactggccagacctatcatccgacctcaatctcatttagcatgtgtggaatgagttgcagcttgaaatttcagcccgtcaagtccagccaaaaagtatccaggagagtggtgccatgctggtccaagaattgaacaacatcccacaaaggaccatagggaatctgttagggagtatgaggaggtgttgccaagctgtaattaacagcaacatgtaacatactagatagtaatcaaataccaattagatccgtcagcttttttagcaaatttagaaaattccctattttatcaaaaaatctctattttcaatgtttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaacaaattctaaaagttttgccttaaagagaatattaaagtgcaaacaattgtcataacaatattgcaactattatgaaaaacatatacttgcttagcaatttttaagca
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actaTCGCTAAGCACAAAATATTTCACACGGCACTGAGCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTTTATTGAT--------------------GAGACCAGGTATTGCCTAGACTATACAGATAGACGTGCTAGG-GTGTGGAGTAGGCCAGGGGAGATATTCCACGCAGCCAACATTGCTGAGCATAACCGCTATGGA-G-GCGGCTCCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGGCGTACATACCTCATTGTCTTT-GACCGGGGTACATTGAACTCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGCAGTTGGTAATGGGTTCATTCTACTGGA-GATAATGCCTGTCTTCATGCTGTC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtaccttcaatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actactcaaagtCTTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTG-AAGCTTGGAATT-CAGCCTGTCAAGTCCAGCCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--ATTCTGGTCCAAGAATAGAACAACATCCAACAAAGGACCATCTGGAATCTGATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTCATTAACAGCAATGGGTCACATACTAGATATT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTATGAAAA-CT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTCAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-A----AAGTTCTAAATGTTTTGCCTACATCATAAAAGAGAATATTAAATGAAAACAAGGACTTGTATAGACTCTATATAATTCCT----TGATGAAAAGTACAAACAGTTTTCATAACAATA-----TTGCAACTATAACGTAAAACATGTAC--TTGGATATTCTTTGTGCTTGGCAAACATTGatcccatcgagcatgtgtggaatgagttgaagcttggaattcagcctgtcaagtccagccaagaagtatccaggagcttggtgccatattctggtccaagaatagaacaacatccaacaaaggaccatctggaatctgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctgtcattaacagcaatgggtcacatactagatattaatcccataccagttagctccgtcagctttttggcaaattatgaaaactccctattttatcaaaaatctctattttcaatggttatcttactcaaaagcttaaaacaaacgtaaaacacaaagttctaaatgttttgcctacatcataaaagagaatattaaatgaaaacaaggacttgtatagactctatataattccttgatgaaaagtacaaacagttttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtacttggatattctttgtgcttggcaaacattg
gi|4                          : actactcaaagttcgctaagcacaaaatatttcacacggcactgagcagagaggactggcgacctgtcctttttattgatgagaccaggtattgcctagactatacagatagacgtgctagggtgtggagtaggccaggggagatattccacgcagccaacattgctgagcataaccgctatggaggcggctccgtgatggtctggggcgggatcagctgggatgggcgtacatacctcattgtctttgaccggggtacattgaactcccagcggtatagagatgagattctggatacccaggtaagattgtatgctgatgcagttggtaatgggttcattctactggagataatgcctgtcttcatgctgtccatgctgtccgggagtacTTGCTAAGCACCAAATAATTCACACGGCATTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTCCTTTATACAGAT--------------------AAGTCCAGGTATTGCCTA-----TACAGATAGTCGTGCTAGG-GTACGGAGAAGGCTAGGGGAGAGATTCCTCGCAACCAACATTGCTGAGCATGACCGCTATGGA-G-GCGGCACCGTGATGGTCTG-GGGCGGGATCAGCTGGGATGGACGTACATACGTCATCGTCCTT-GACCGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGATGTAGTGGGTGATGGGTTCATTCTAATGGACGATAATGCCTGTCCTCATGCTCCC-CATGCTGTCCGAGTGCACCTT-CAGAGGGAGAGGATT-GCACGTA--TGGACTGGCAAGCCCGATCCCCCGACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGAAATGAG-TTG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAGTCCAGCCAA-AACGTATCCATGAACTTGGTGCAAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCCACAAAGGACCATTAGGAACCTTATAGGGAGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAAAAGCAACGGGTCACATACTCGATAGT-AATCCCA--TACC--------AGTTAGCTCCGTCAG-C-TTTTTGACAAATTTAGAAAA-TT-CCCTATTTTATC-AAAAATCTCTTTTTTCAATGGTTATCTTATTCAAAGGCTTAAAACAAACATAAAACACAAAA-CAAATTCTAAAATGCTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAAAGAAAA---------GTACAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATACT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAATATGTAC--TTGGATATTGTTGGTGCTTAGCAAACTTTAAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATT--TGGTGCTTAGCCAACTTTGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aGCTAAGCACCAAATATTTCACACGGCACTGACCAGAGAGGACTGGCGACCTGTATTTTTTAAAGA-------------------------CAAGGTATTGCCTAGACTATATAGA-AGGCATGCTAAG-GTATGGAGAAGGCCAGGG-AGAGATTCCAAG-AGGCAACATTGCTGAGCATAACCGCCATTGA-G-GTGGCTTAGTGATGATCTG-GAACGGGATCAGCTGGGATGGACGTACAGACCTCATTGTCCTTTGGCCGGGGTACACCGAATGCCCAGCTGTATAGAGATGAGATTCTAAATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGAAGTGGGTGATGGGTTTATTCTAATGGACGATAATGCTCGTCCTCATGCTGCC-CATGCTATCCGAGAGTACCTttcacacggcactgaccagagaggactggcgacctgtattttttaaagacaaggtattgcctagactatatagaaggcatgctaaggtatggagaaggccagggagagattccaagaggcaacattgctgagcataaccgccattgaggtggcttagtgatgatctggaacgggatcagctgggatggacgtacagacctcattgtcctttggccggggtacaccgaatgcccagctgtatagagatgagattctaaatacccaggtaagattgtatgctggtgaagtgggtgatgggtttattctaatggacgataatgctcgtcctcatgctgcccatgctatccgagagtacctcaatccaatcgagaatgtgtggaatgagatgaagcttggaattcagcccgtcatgtccagccaagaagtattcaggagcttggtgccatatgctggtcaaagaatagaataacatcccacaaaggaccatcaggaatttgatagggagcatgaggaggcgttgccaagctggcattaacagcaatgggtcacatactcgatatcaaatcccataccagttagctccgtcagtttttttggcaaattttgaaaactccctattttaacaaaaatctctactttcaattatcttactcaaaagattaaaacaatcgtaaaacacacacaaattctaaaatttttgcctacatcttaagagagaatattaaataaaacaaggactatataaggtatagtctctatataattccatgatgaaaagtacaaacacttttcataacaatactgcaactttaacgtaaacccggtacttggatattcttggtgcttggcaaacattgcg
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tataatatttcgatatattctactcaaagtttgctaaacggcaaatatttcacacggcattgaccagagaagactggcgagctgtctttttacagatgagtccatgttttgcctagactatacagatagacgtgcaagggtatggagaagaccaGGGGTACACTGAATGCCCAGCGGTATAGAGATGAGATTCTGGATACCCAGGTAAGATTGTATGCTGGTGCAATGGATGATGGGTTCATTCTAATCGACGATAATGCCCAGCTTCATGCTGGC-CATGCTGTCCGGGAGTACCTT-CAGAGGCAGTGGATT-GCACATC--TGGACTGGCCAGCCCGATCCCCCAACCTCAATCC---C---------ATCGAGCATGTGTGGAATGAG-TTT-CAGCTTGGAAT-------------ATCCAGCAAA-GAAGCATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAACATCCAACTAAGGACAATCAGGAACCTGATAGGAAGCATGAGGAAGCGTTGCGAAGCTATAATTAACAGCAACGGTTCACATACTTGATATA-AATCCCA--TACC--------TGTTAGTTCTGTCAG-A-TTTTTGGCAAATTAAGAAAAATT-CCCTATTATATG-AAAAATCTCTATTTTCAATGGTTATCTTACTTAAAAGCTTAAAACAAACGTAAAACAC-AAG-CAAATTCTAATTTTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATTTTAAATAACAA---------GTGCAAAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----C---AAC------GTAAAACATGTAA--TTGGATATTCTTGGTGCTTAGCAAACTTTTAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTGTCCTT-GAACGGGGTACCCTGAATGcag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgaataaggccagggaagagATGGGTTCATTCTAATGGGCAATAATGCCTGTCCTTGTGCTGCC-CAggttcattctaatgggcaataatgcctgtccttgtgctgcccagcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgaataaggccagggaagagattgtccttgaacggggtaccctgaT-GCCTGTCCTTGTGCTGCCCAGCCCAATCCCCCAACCTCAATCC---C---------ATTGAGCATGTGTGTAATGGG-TCG-CAGCTTGGAATTTCAGCCCGTCAAG-----CCAA-GAAGTATCCAGGAGCTTGGTGCCAT--G--CTGGTCCAAGAATGGAACAGCATCCCACAAAGGATGATTAGGAACCTGATAGG-AGCATGAGGAGGCGTTGCCAAGCTGTAATTAATA-TAACGGTTCACATACTCGATATT-AATCCCA--TACCA-------AGTTAGCTTTGTCAG-C-TTTTTGGCAAATTTAGAAAA-TT-CCCCATTTTATC-AAAACTCACTATTTTCAACTGTTATCTTACTCAAAAGTTTAAAACAAACGTAAAGCAC-TAA-C-AATTTT----TTTTTGCCTACATCTTAAAAGAGAATATTAAATAAAAA---------GTGCAGAC-------AATT--T----TCAT----------AACAATATT-GCAAC--TA-----T---AAC------GTAAAACATGTGCTTTTGGATATTCTTGTTGCTTAGCAAACTTTGAGgcccaatcccccaacctcaatcccattgagcatgtgtgtaatgggtcgcagcttggaatttcagcccgtcaagccaagaagtatccaggagcttggtgccatgctggtccaagaatggaacagcatcccacaaaggatgattaggaacctgataggagcatgaggaggcgttgccaagctgtaattaatataacggttcacatactcgatattaatcccataccaagttagctttgtcagctttttggcaaatttagaaaattccccattttatcaaaactcactattttcaactgttatcttactcaaaagtttaaaacaaacgtaaagcactaacaatttttttttgcctacatcttaaaagagaatattaaataaaaagtgcagacaattttcataacaatattgcaactataacgtaaaacatgtgcttttggatattcttgttgcttagcaaactttgagcaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CAAGGACTTGTATAGACTCTTTCTAATTCCTTGACAGTTTGAAAAGGAAAAAAAGTTT