lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 1 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 1 11 33333333 2222222 1 22 2222222 1 111 1 33333333333333333 44444444444 1 11 1 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 1 7777777777777777777777777777777777777777777 3 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 1
lowQualScore : 3 1 3 5 4 3 3333 0 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333 1 33333 999 22 4 2 1 55 11 22222222 1 222 4 4 1 2 2 1 444444 1 3333333 3333333333 1 1 2 555 4 1 2 1 222 00 1 1 6666666 2 88 22 5555 0 0 333 3 7777 1 5 55 3 22222222222222222 4 0 0 88888888888 1 4 0 9 6 0 4 66 22 2 8 2 7 0 7 3 666 1 8 3 3 9999 2 2 777777 4 1 2 777777 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333 222 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222 1 555 8 1 7 222 1 77 1 3333 3 0 1 1 1111111111111111111111111111111111111111111 222 1 6 3 22 4 1 6666 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 22 5
lowQualScore : . . . . . . .... . . .............................................................. .... . ..... ... .. . . . .. .. ........ . ... . . . . . . ...... . ....... .......... . . . ... . . . . ... .. . . ....... . .. .. .... . . ... . .... . . .. . ................. . . . ........... . . . . . . . .. .. . . . . . . . ... . . . . .... . . ...... . . . ...... . ...................................................................................................... ... ... .. ......................................................... ... . ... . . . ... . .. . .... . . . . ........................................... ... . . . .. . . .... .................................................................................................. . .. .
lowQualScore : 3 9 3 1 5 3 3333 5 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0000 2 66666 111 00 0 9 4 99 99 66666666 3 222 8 3 2 5 5 2 888888 2 9999999 8888888888 2 2 9 000 0 4 9 5 888 33 7 7 4444444 2 77 44 0000 5 6 000 3 1111 6 8 00 3 66666666666666666 0 7 6 33333333333 1 0 9 9 8 3 4 11 44 2 1 0 8 7 6 1 444 2 0 3 3 6666 9 9 777777 4 6 5 777777 0 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555 333 88 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 3 666 8 4 9 555 4 99 4 0000 8 3 5 5 5555555555555555555555555555555555555555555 888 1 8 8 66 3 9 9999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 00 0
consensus : AATA-CT-T-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTT-ATC--G--TTT--TG---TT-T---TTAA--------A---A---T---T----T-----TT---ATTTGAT----AATATAACA-----TCTTTCT--ACCTTTC-C-TGG-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-TCTA---TTGCGATTATCA-CTT-C-T-T------T-TAN-----T------T---G-ATTTGAAACATACA-A-C---C-C-C-GT-TACCTAA---ATTCAC-AA-AA-A--A--G-CAN-CACTTT----TATTGTTTGTATAATTTCGTTTA--GA-AT----TGGTTTATC--TGTATTTTGATAT-TCA-TATT-CAGATTT-TGTTTCTATG-G-T-TTN---TCTTTCAATTTCG-CAATANAATTATTGAAATCAACGTTCAAG-TACTTCGT-CAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACANCAT---ACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTATCCATT-CA----ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-T-CA------ATGCGCAAG-GAG------GCTATACA----TGA----GAT------T---T---TTGTG-------------A---A-------------G---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----A----AA-----G-T--------G---------TAN--------T---AATC---GC-AATA-AGATTTTGATGAAACTTTCCAG-GAAA---GGT-AGAAAG-A-TGTTAT----ATTATCAAATAAAA-T-A--A-TT-----T--T----AA--A-AA--A-A--TCGATAA--AAAG--AACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTT--GCGTT-TCTAAA----GT-C-----T----ATGT---AATA-A-TNTACAGAGA--ATT-AAACGTATAG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTG
Reference ( gi|3 ) : AATA-CT-T-AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTT-ATC--A--TTT--TG---TT-T---TTAA--------A---A---T---C----T-----CC---ATTTGAT----AATATAATA-----TCTATGT--ACCGTTC-C-TGA-AAA-ATTA-A-----ATCAAAA-TCTA---TTGTGATTATTA-CTT-C-T-T------T-TAT-----T------T---G-ATTTGAAACATACA-A-C---C-C-C-GT-TACCTAA---AACCAC-AA-AA-A--A--G-CAT-CATTTT----TATTGTTTCTATAATTTCGTTTA--TA-AT----TGGTTTAAC--TATATTTTTATAT-TTA-TATT-TAGATTT-TGTTTCTATG-T-TTTTA---TCTTTCAATTTCG-CAATAAAATTATTGTAATCAACGTTCAAA-TACTCTGC-CAAACACTTGTTAAAGAATGGAACATCAT---ACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTATCTATT-CA----ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-T-CA------ATACACAAA-GAG------GCTTTACA----TGA----GAT------T---T---TTGTG-------------A---A-------------G---------G---T-T---GTA-AT------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----C----AA-----G-T--------G---------TAT--------T---AATC---GC-AATACAGATTTTGATGAAAATTTCCAG-GAGA---GGT-AGAAAT-A-TGTTAT----ATTCTCAAATAAAA-T-A--A-TT-----T--T----GA--A-AAC-A-G--TCAATAA--AAAA--AACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTT--GC-TT-TCTAAA----GT-T-----T----ATAT---AACACA-TCTACAGAGA--ATT-AAACATATAGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTGTATAAAATA
gi|1 : AATATCA-T-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATT-ATC--A--ATT--T----TT-T---TTAA--------TTT-A---T---T----T-----TC----TTTGAT----AATATAATA-----TCTTTCT--ACCATTT-C-TGG-AAA-GTTT-C-----GTCAAAA-TCTA---TTGCAATGATCA-CTA-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTGAAACATACA-A-C---C-CTC-GT-AATATAA---ATTCACCAA-AA-A--AT-G-CAA-CACTGT----TATTGTTTGTATAACTTTGTTTA--GA-AT----TGGTTTATC--TGTATTTTGATAT-TCA-GATT-TTGATTC-AGTTG-TATG-T-T---A---T--TTCAAGTTCG-CAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGT-CAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAACAACTT---ACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACGTTCATT-CA----ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-T-CG------ATGCACAAG-GAG------GCT----A----TAA----GATA-----C---TGA-TTGTG-----------------------------------------------T---GTG---------------T---TTCAA---ATC--AAT----AAAAAT----AA-----G-T--------AATAAAGAAATAA--------T---AATC---GC-AA--CCGATTTTGATGAAACTTTCCCG-GAAA---CGT-AGGAAG-A-TGCTAT----ATTCTCAAATAAAG-T-AG-A-TT-----T--C----AA--A-
gi|2 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagAATA-CT-TTAGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTA-ATCG-A--TTTAATGGAATT-T---GT---------------------------T-----TT---ATTTGAT----AATATAAAA-----CATTTCC--ACCTATA-C-TGG-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-TATA---TTGCGAGTATCA-CTT-C-T-T------T-TGT-----T------TTTCG-ATTTGAAACATACA-A-C---TTC-C-AA-GATCTAA---ATTCAC-AA-AC-A--C--GACA--CACTTT----TATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTT-AT----TGGTTTATC--TGTATTTTGATGT-TCA--------GGTTT-TGTTTCTATGGTGTTTTC---TCTTTCATTTTCG-CAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAA-G--TCTGCTCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAACAACAT---ACTGCAAGCC-GGTTTTCAAATAATACCCACT-CA----ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-T-AA------ATGAATAAA-GAG------GGTGTACA----CAATACTGAT------T---T---TTGTG-------------A---ATTTAGGTTACGGGG---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCTA---ATG--AAT----A----T----TA-----G-T--------G----------ATAAAAATGAT---AATT---GC-A--ACAGATTTTGATGAAACTTTTCAG-GAAA---AGT-AAAAAG-A-CGTTA-----ATTATCAAAT---A-T-T--C-TTTTTTCT--T----GA--A-A---A-A--TCGAT----AAAG--AATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAAT
gi|11 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccgaAATA-CT-TTAGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----A-------------A--TTT--T--------------A--------A---A---T-------------------AT----------ATATA----------TATAT--ACATTTC-C-TGGTAAA-ATT--C-----ATCAAAA-TCTA---TTGTGATTATCA-CTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTTAAACAAACA-ACC---C-C-C-GT-GACCTAA---ATTCAC-AA-AA-T--C--G-CAA-CACTTT----TATTGTTGGTATAATTTCGTTTG--GA-AT----TGGTTTATC--TGTATT------T-TGA-TATT-CAGATTT-TGTTTCTGTG-----CTA---TTTTTCAATTTCG-CAATACAATTATTGAAATCAGCTTTCAAA-TACTTCGT-TAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAACAACAT---ACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCACATATT-CA----ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACT-CGTATATCATAC-CAAAGGAG------TCTCTACA------A----AATACTGA-T---T---TTGTG-------------A---A---------------------------T-TTAGGTA-AC------------T---T
gi|14 : tatacaccgtAATA-CT-TTAGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTT-ATC--A--TTT--C----TT-T---TTAATT------T---A---T--------T-----AT---ATTTCAT----TATAAAATC-----TCTTTCT--ACCATTC-C-TGG-AAA-GTTT-C-----ATCAATA-TCTA---TTGGGATGATCA-CTT-C-T-T------T-TAA-----T------T---G-ATTTGAAAGTTACT-C-C---C-C-T-GT-TACCTAA---ATTTAC-AC-AA-A--A--A-TAA-CACTTT----TACTGTTTGTATATTTTCGTTTA--GA-AT----TAGTTTACC--TGT-TTT-----T-TTA-TATA-TAGATTC-TGTTGCTATG-G-TATTT---TCTTTCAATTTCG-CAATACAATTATTGAAATTAGTGTTCAAA-TACTTCGT-CAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAACAACAT-----------CCCGAATTTCAAATAGTATCCATT-TA----ATGAAAAGCCGCTggggttgta
gi|7 : acacaaaAATA-CT-TTAGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTT-ATC--A--TTT--T----CT-T---TTAA--------ATTTA---T---T----T-----G----ATTTGAT----TAT-TAATA-----TCTTTTT--ACCATTC-C-GGG-AAATGTTC-A------TCAAAA-AA-A---TTGCGTGTATCA-CTT-T-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTGAA----------C---C-C-C-GT-TACCGTA---ATTCAC-AA-AATA--C--G-CAG-CATATC----TATTGTTTGCATAATTTCGTTTA--GA-AT----TGATTTATC--TATATTTT---A----A-TGTT-CAGATTG-TGTTTCTATG-G-T---AAGTTCTTTCAATTTCG-CAATACAATTATTAAAATCAACGCTTGAA-TATGCCGT-TAAACACTTGTTCAAGAGTAAAACATCAT---AACACTAGCCCGGATTTAAAATATTATCCATT-TA----ATG
gi|17 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccgaAATA-CT-TTAGAAACGAAACAATGAGATAAACAGCAAT------TTA-------TTTTT-ATC--G--ATT--TA---TT-T---TTAA--------A---AAAATA--T----T-----TT---ATTTGAT----AAT-TAATACAACGTCTTTCT--AACTTTA-C-TTC-AAT-TTTT-C-----ATCAAAA-TCTA---TTGCGACTATTA-CTTAT-T-T------T-TAC-----TTTTTACT---G-ATCTAAAACATAAA-ATC---C-C-C-AT-TACATAA---ATTCAC-AA-AA-tcgtgtgtagcgt
gi|19 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacatgtaaattcgctgtcgtgatagcataactccgcaaggaggctatagatatactaaAATA-CAAT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGCA-TGAAACATCG----A----TTT-TTC--G--GTT--GG---AT-T---TTA---------------------T----T-----TT---ATTTTAT----AATA-AACG-----TCTTTCT--ACCTCTC-C-T------------------ATCAAAA-TATA---TTGCGAGTATCA-CTG-C-T-T------T-TTA-----T------C---A-ATTTGAAACATAAA-A-C---C-tcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|16 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaAATA-CT-TTATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACA------------TTT-ATCTGA--AAT--TG---AT-T---TT--------------------------------------ATTT-AT----AATATAATA-----TC-ATTTTAACC-TTC-T-TGA-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-TCTA---TTTCGATTATCA-TTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTGTAACATACA-A-C---C-C-C-aggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|10 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaATA-CT-TTATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTA-ATC--G--GTT--CT---TT-T---TTAA--------ATTTA---T---T----T-----T----ATTTGAT----AGAACAATA-----TCTTTTT--ACCTTTT-C-TGG-AAA-CTTT-T-----ATCAAAA-TGTA---TTGTGAATACCA-CTT-C-T-T------T-AAA-----C------T---G-ATTTGAAACTTACA-ATC---C-C-C-GT-TACCTAA---ATCCAT-Acatgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|21 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacTA-TT-G-AGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTT-ATtgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|8 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgaaacA-TT-T-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCT-ATC--G--ATT--TA---TT-T---TTAA--------A---T---T---TAG--T-----TG---ATTTGAT----AATATAGCA-----TCTTTCT--ACTTTTTTC-TGA-AAA-GTGT-C-----ATCAAAA-TCTA---ATGCGGTTATCA-CTT-C-T-T------T-TAT-----T----------G-ATTTGAAACATACA-A-C---AAC-C-GT-TACCTAA---ATTCAT-AA-AA-A--C--G-CAA-CACTTC----TATTGTTTGCATAATTTCGTTTA--GA-AT----T-ACTTGTC--TGTATTTTGATATGGTA-TTTTCTAAACAT-T-----CATG----TTTA---CC---CA----CGTCAA-------ATTGGAAT----GTTCAAG-TACTTCGT-CAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAACACCAT---ACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTATCCATT-CA----ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-T-CA------CCGCGCAAA-gtacagtgt
gi|15 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacataA-TT-T-AGAAACGCAACATTAAGACAAACAACAATAAAACGATG----ATTTTTTTCATT--A--TTT--TT---TT-T---TTTA--------A---A---TTA-T----T-----TT---ATTTGAT----AATATAATA-----TCTTTCC--ACCTTTC-T-TGT-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA--CTG---TTGC-----TCA-CTT-C---T------C-TA------T------C---A-ATTTTAAACACAAA-A-C---C-C-C-TTGTACCTAT---ATTCAC-AA-AATG--A--G-TAT-C--TTA----TATAGCCTCCAT
gi|5 : ggaacatcataccacaagcccagatttcaaatagtatccattcaatgagaagtcgctgtcgtgcatcaatgcaaT-T-AGAAACGCAACACTCGGATTAACAGCAATAAAGCATTG----AGTTCTTT-ATCG-A--TTT--T-----------TTGA--------------------T----T-----TG---ATTTAAT----AACATAACA-----TCTTTCG--ACATTTT-C-TGG-AAA-GTTT-C-----ATCACAA-TCTA---TTGCGATTATCA-CTT-C-T-T------TATA------T------T---G-AATTGAAATATACA-A-CG--C-C-C-GT-TATCTAA---ATACAC-AA-AA-tctttttggtatagatagaattgctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|4 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagtactatatgtaagtcttaatacaccgaatgattT-T-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTT-ATCG-A--TTT--TA---TT-------GA--------A---A---T---C----T----------ATTTTACCCACAATGTTACA-----TCTTTCT--ACCGTTT-C-TGA-AAA-GTTG-A-----ATAAAAAATATT---TTGCGATTATCA-CTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTAAAACATACA-ATC---C-C-C-GT-AACCTAA---ATTCAC-AA-AA-A--ACGA-CA--CACTCT----T-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----A-A-------GTTTATC--TGTACTTTGATAT--------T-TAGATTTCTG-TTCTATG-G-TGTTT---TCTTTCATTTTTG-CTAAATAATTATTAAAATCAACGTTCAAG-TGCTTTG----AAC------------------CA-CAT---ACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATACCCATT-CA----ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-T-CA------ATGCATAAA-AAG------GATATACA----AGACACTGA-------T---T---TTGTG-------------A---ATTTAGGTAACGGGG---------G---T-T---GTATGT------------T---TTAAATGTATA--AAA----A----G----AA-----G-T--------G----------A---------T---AATC---GC-AAT--AGATATTAATGAAACTTTCACG-GAAA---AGG-AGAAAG-A-TATTAT----ATTATCAAACGCAATT-T--G-TT-----T--T----CA--A-A---A-A--TCAATAG--AAAA--A--TTGGTGTTTTATGGCTGtcaataatatcttgtatagcctccttgtgcattgatgcactcatgaccgcaacttatcattgaatggataatatttggaatcaaggtttgtggtatgtttttccaatattgaacaagcgcttgacgaagtacttgaacgttgatctcaataattatattgcaaaattgaaagaaattacatgaatatcaaaatacagataaattagttctaaacgaaattatacaaacaataaaaatgttgctttttttgtgaatttaggtaactggggttttatatttcaaatcaataaaacgaagtgataattgcaatattt
gi|6 : ttatcgcatctgaagactT-T-AGAAATGCAACACTCATACACGCAACAATGAAACAT-------GTTTTTT-------------------TT-T---TAAA--------A---A---T--------------------TTTGGT----GATAAAATA-----TCTTTCT--ACCAGTC-T-TGG-AGA-GTTT-T-----ATCAAAA-TATATTTTTGCGATTACCAGCTA-T-T-T------T-TA-------------T---G-AATTCGAATGAACA-ATC---T-C-T-GT-TAGTTAA---ATCCAC-AA-AATC--A--G-TAT-CGTGTT----aagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|13 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaaagactT-T-AGAA-CGCAATACTCAGATAAACATCAATAAGGCATTG----AGTTCTTT-ATC--GATTTT--TA---TT-TATTTTA---------------------T----T-----TT---ATTTAAT----AATATAACA-----CCTTTCT--ACC-TTCAC-TGA-AGT-TTTT-C-----ATCAAAA-TCTA---TTGCAATTAATA-CTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTAGAAACATACA-A-C---G-C-C-GC-TACCTTA---ATTCAC-AA-AA-aagaattcttgcactttgatacccgcagcaacttcattgaatggataatatttcaaatctgggcttgtgatatgtttaccaatcttgaacaaacgcttgacgtagtacttgaacgttcatttcaagacttatagttcagaattgaaagaaaataccatagaaacgagttctgaatatcaaaatacagataaacccattttaaacgaactcatacaaacaataaaagtgttgcgttttattgtgaatttcggtaactctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|12 : attcagatgtaaattggctgtcgagcgggcatcaatgcgcatggaggctatacaatattgaT-T-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTT-ATC-----TTT--T----TT-C---TAAA--------A---A---A---A----TAAAGATT---ATTTGAT----ATTATAACA-----CCATTCC--ACCTTTC-C-TGG-AAG-TTTT-C-----ATTAAAA-TCTC---TTGAGATTATCA-CCT-T-T-T------T-TA------T------T---G-ATTTGAAACATACA-ACC---C-C-C-GC-TACCTAA---ATTCGC-AA-AA-aggttttcagtgtaaaaacagtaaacatttagatattttgttttaatttcttgcagatatacactaccgtgatagcgctttttgacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|12 : T-T-AGAAACGCAATACTTAGATAAACAGCAATAAAACATTA----AGTTCTTC-ATC--G--ATA--TA----T-T---TTAA--------A---A---TTA-T----T-----TT---ATTTGAT----AATATAAAA-----TATTTTT--ATCTTTT-A-TGG-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-TCTA---CTGCTATGATCA-CTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---A-ATTTAAA--ATACA-A-A---C-C-ggctatacaagattctggtttgtattttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|9 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaaattcgcaaaaggctatacaagattctT-T-AAAAACGCAACACTCAAACAAACTGCAATTAAATATTG----AGTT--------------TT--TG--------------------------------------------------ATTTGAT----GATATAACA--------ATAT--ACATTCC-C-TGG-ACA---TA-ATC---ATCAAAA-TCTA---TTGCCATTATCA-CTT-A-T-T------T--ATA----T------T---G-ATTTGAAATGTACAGA-C---C-C-T-GT-TACCTCA---ATTCAT-AA-AATC--A--G-TAT-Cagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|21 : attagtttatctgtaatttggtattcagattctgtttctatggtattttctttgaatttcgcaattaaattattgaaatcaccgaaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaaT-T-AGAAACACAACACTCAAATAAACAGCATTAGCACATTG----CGTTCTTT-ATCG-A-------TA---AT-T---TTGA--------A---A---T---G----T----------ATT--AT----AATAT-ATT-----TC---G---ACCATTC-C-TGG-AAA-GTTT-C-----ACCAAAA-TCTA---TTGCGATCATAC-CTC-C-T-TC-----T-TA------T------T---G-ACTTGAAACATAAA-G-C---T-C-agtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
gi|18 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactT-T-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTT-ATCG-A--TTC-------TT-T---TTAA--------ATTTA---T--------T-----TT---ATTTTAT----TGTATAACA-------TAT-T------TTC-C-TTG-AAA-GTTT-C-----ATCAAAC-TCTA---AACCGACTTTCG-CTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTGAAACATAT--A-CTCTC-C-C-GT-TACCTAAATTAATC-C-------------G-CATGCATTCTGAAATA-TGT-----TAATTTCATATA--TACATATAGTAGTATAGTGGTATAGTTTTATAT-ttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|2 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaaagacaATTCAGATAAACAACCATCTTACATTT----AATTCTTT-ATCG-A--T---------TT-T---TCAAGAAAAAAGA---A---T-------------------ATTTGAT----AAT-TAACG-----TCTTTTT--ACTTTTC-C-TGA-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-TCTG---TTGCAATTATCA-TTT-T-T-A------T-CACTAATAT------T---C-ATTAGAAACATACA-ACC---C-C-C-GT-AACCTAA---ATTCAC-AA-AA-ATCA--G-TAT-TGTGTA----CACCCTCTTTA----TTCATTTA--T
gi|22 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccgaaatactttagaaacgcaagtctcatataaacaacaataaaacattaaattcttaatcgatttaatggaatttgttttatttgataatataaaacatttccacctatactggaaagtttcatcaaaatatattgcgagtatcacttcttttgtttttcgatttgaaacatacaacttccaagatctaaattcacaaacacgacacacttttatggtctgtatagattcgttaagtttattggtttatctgtattttgatgttcaggttttgtttctatggtgttttctctttcattttcgcaatcgaattattgaaatctgcgttcgaagtctgctcaagtgcttgttcaaaagtggaacaacatactgcaagccggttttcaaataatacccactcaatgagaagtcgctgtcgtacgcgcCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTT-ATCG-A--------G---TTAT---TCGA--------A---A---TATAC----T-----TT---ATTTGAT----A-TAAAACA-----TCTTTCT--ACCTTTC-C-TGA-AAA-GTTT-C-----ATCTAA--TCTA---GTGCGATTATCA-ATT-A-TCT------T-TAT-----T------T-----ATTTGAAACATACA-A-CT--C-C-C-GT-
gi|20 : cacgACAAACAGCAATACAATATTT----AATTCTTT-ATC--A--ATT--T-----T-C---ATAA--------A---A---C---T----TAAG--TT---ATTTGAA----TATATAACA-----TATTTCT--ACCTTTC-C-TGG-AAA--TTGTC-----ATCAAAA-TCTG---TTACGATTATTA-CTT-T-T-T------T-CG------T------T---G-ATTTGAAGCATAGA-A-C---CAC-C-TT-TACGTAA---ATTCAC-AA-A-----------AT-CAGTTT----C-TTGTgcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|4 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaataccccgtgcatcaacgcgcaaggaggctatCAGCCATAAAACACCA----ATTTTTCT-AT-----------TGA--TT-T---TTGA--------A---A---A---CAAATT-----GC---GTTTGAT----AATATAATA-----TCTTTCT--CCTTTTC-CGTGA-AAG-TTTC-A------TTAATA-TCTA---TTGCGATTATCA-CTT-C-T-T------T-T-T-----A------T---ACATTTAAAACATACA-ACC---C-C-C-GT-TACCTAA---ATTCAC-AA-AATC--A--G-TGT-CTTGTA----TATCCTTTTTAT
gi|23 : ttatcgcatctgaagactttagatacgcaacacgcatataaacagaataaaacataaagttctttatcgattttattgaaatctattttacccacaatgttacatctttctaccgtttctgaaaagttgaataaaaaatattttgcgattatcacttctttttattgatttaaaacatacaatccccgtaacctaaattcacaaaaaacgacacactcttttgtctgtataaattcgttaagtttatctgtactttgatatttagatttctgttctatggtgttttctttcatttttgctaaataattattaaaatcaacgttcaagtgctttgaaccacataccacaagctgaatttcaaataatacccattcaatgagaagtcgctggcatacgtgcttcaatgcAAAACATTG----AGTTCTTT---------TTT--TA---TT-T---AAAA--------A---AA--TAA-T----T-----CT---ATTTAAT----AATATAACA-----TCTTTCT--ATCATTT-C-TC-------TTA-ATTGTCATCACCA-CCGA---TTGCGATGATCA-CTT-CCT-T------T-TAT-----T----------G-ATTTGAAACACACA-A-aagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|1 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaa-T---TTGA--------A---A---T---C----T-----ACTTTATTTGAG----AATATAGCA-----TCTTCCT--ACGTTTC-C-GGG-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-TCGG---TTGCGATTATTA-TTT-C-T-TTATTACT-TATTTTTAT------T---G-ATTTGAAACACACA-
gi|20 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagaatatcatagaaacgcaacactcggataaactgcattaaaacattgagttcattatcaattttttttaatttattttctttgataatataatatctttctaccatttctggaaagtttcgtcaaaatctattgcaatgatcactactttttattgatttgaaacatacaaccctcgtaatataaattcaccaaaaaatgcaacactgttattgtttgtataactttgtttagaattggtttatctgtattttgatattcagattttgattcagttgtatgttatttcaagttcgcaggaaaattattgaaatcaacgttcaaaatatttcgtcaaacgcttgttaaagagcggaacaacttaccacaagcccggatttcaaataacgttcattcaatgagaagtcgctaccgtgcgtgcatcgatgcacaaggaggctataagatactgattg---ATCTGAT----ATTATAACA-----TAGTTTT--ACCTTTC-C-TGG-ACA-GTTT-C-----ATCAACA-TCTA---TTGCGATTATGA-CTT-C-T-T------T-TTA-----A------T---G-ATTCGAAACCCAAT-A-C---C-C-C-GT-
gi|24 : ttaTTGAT----AATATTATA-----TCTTTG---ACTTTTC-C-TGG-AAA-GTTT-C-----ATCAAAA-CTTA---TTGTTATTATCA-CTTGT-T-T------T-TAT-----T----------G-ATTTGAAACATACA-A-C---C-C-CTGT-TACCTAA---GTTCAC-AA-AA-T--C--G-CAT-CACTTT----TATTGTTTGTATAATTTCGTCTA--CT-AT----TGGTgcatcaacgcgcaaggaggctatacaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|10 : gatatttaaa-----ATCAAAA-TATA---TTTCGATTATCA-CTC-C-T-T------T-TAA-----T------T---G-ATTTGAAACATACA-ATC---C-C-T-GT-TACCTAA---
gi|19 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaataAAA-TATA---TTGCAATTATCA-CTT-C-T-T------T-TTA-----T------T---G-ATTTGAAACATACA-A-C---C-C-C-GT-TACCTAA---ATCCAC-AA-AATT--A--G-TAT-C--TTG----TATTGTCTCgaaatgtgttatacttgtt
gi|22 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggatcaacgcgcaag-TCTA---TTATAAATATTA--------------------------T------T---G-CTTAGAAACAAACA-ATC---C-C-C-GT-TACCTAA---ATTCAC-AA-AA-
gi|5 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactcccgtgcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaataTA---TTGCAATTATCA-CTT-CGT-T------T-TAT-----T----------G-ATTTGAAATATAAA-A-C---C-C-CAGT-TACCTAA---ATTCAC-AA-AA-A--AA-G-CAA-CATTTT----TATTGTTTGTATAATTTCGTTTA--GA-AC----TAATTTATC--TGTATTTTGATAT-TCA-TGT----AATTT-----------------------CTTTCAATTTTG-CAATATAATTATTGAGATCAACGTTCAAG-TACTTCGT-CAAGCGCTTGTTCAATATTGGAAAAACAT---ACCACAAACCTTGATTCCAAATATTATCCATT-CA----ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-T-CA------ATGCACAAG-GAG------GCTATACA----AGA----TATTATTGAT---T---TTGTGT------------ATTTA-------------GATAACGGGCG---T-T---GTA-TA------------T---TTCAA---TTC--AAT----A----TAAAGAA-----G-T--------G----------A---------T---AATC---GC-AAT--AGATTGTGATGAAACTTTCCAG-AAAA---TGT-CGAAAG-A-TGTTAT----GTTATTAAATCAAA-T-C--A-----------------A--A-A---A-A--TCGAT----AAAG--AACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTT--GCGTT-TCTAAA----AT-aaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagtactatatgtaagtcttaatacaccgaatg-GT-TACCGAA---ATTCAC-AATAA-A--AC-G-CAA-CACTTT----TATTGTTTGTATGAGTTCGTTTA--AA-AT----GGGTTTATC--TGTATTTTGATAT-TCA--------GAACT-CGTTTCTATG-G-TATTT---TCTTTCAATTCTG-AACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTCAAG-TACTACGT-CAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTAAA-CAT---ATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTATCCATT-CA----AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-T-CA------AAGTGCAAG-AAT------TCTTAACA----CGATACTGA-------T---T---TTGTGGATTTAACTAACAG---A-------------G---------A---T-T---GT---T------------CA--TTCGA---ATT--CAT----A----A----AA-----A-T--------AGC-------TGG--------T---AATC---GCAAAAATATATTTTGATAAAACTCTCCAA-GACT---GGT-AGAAAG-A-TATTTT----ATCACCAA---------A--A-TT-----T--T----TA--A---------------AA--AAAA--AAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTT--GCATT-TCTAAA----GT-C-----T----ttt
gi|9 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaa-AT----TAGTTTATC--TGTA-------AT-TTGGTATT-CAGATTC-TGTTTCTATG-G-TATTT---TCTTTGAATTTCG-CAATTAAATTATTGAAATCACCGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|9 : TTAAATTATTGAA-ATCACCGAACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTGCTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-T-CA------ATGAGCAAG-GAG------GCTATACA------A----GATACTGA-T---T---TTATG-------------A---ATTGAGGTAACAG-G---------G---TCT---GTA-CA------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----T----AA-----A-TAA------G---------TGA--------T---AATG---GC-AAT--AGATTTTGATGATTATGTCCAG-GGAA---TGT-----AT-ATTGTTAT----ATCATCAAATCAAA-----------------------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTT--GCGTT-TTTAAA----GT-C-----T----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
gi|15 : attagtttatctgtaatttggtattcagattctgtttctatggtattttctttgaatttcgcaaGGAACATCAT---ACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTATCCATT-CA----ATGAGAAGTCGCTGT----CGTGCA-T-CA------ATGCAAATG-GAG------GC--TATA----TAA----GATACTCA-T---T---TTGTG-------------A---ATATAGGTACAAGGG---------G---T-T---TTG-TG------------T---TTAAA---ATT--GATAG--A----G----AA-----G-T--------G----------A--------------------GC-A--ACAG-TTTTGATGAAACTTTACAA-GAAA---GGT-GGAAAG-A-TATTAT----ATTATCAAATAAAA-T-A--A-TT-----T--A----AA--A-AAA-A-A----AATAATGAAAA--AAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTT--GCGTT-TCTAAA----ttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
gi|13 : ATT-CAG---ATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-T-CA------ATGCGCATG-GAG------GCTATACAATATTGA-------------T---T---TTGTG-------------A---ATTAAGGTAGCG--GC--------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCTA---ATC--AAT----A----A----AA-----A-GAA------G---------TAT--------T---AATT---GC-AATA--GATTTTGATGAAAAACTTCAG-TGAA---GGT-AGAAAG-G-TGTTAT----ATTATTAAATAAAA-T-A--A-AA-----T--A----AA--T-AAA-A-A--TCGATAA--AGAA----CTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATT--GC-GT-TCTAAAG---GT-T-----TTCA-GTGT---AAAA------ACAG-------T-AAACATTTAG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGttctttttggtatagatagaattgctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|17 : ----ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-T-AA------CTCCGCAAG-GAG------GCTATA-------GA----TATACTAA-T---T---TTGTG-------------A---A-------------T---------T---TAT---GTA-ATGGGGATTTTATGT---TTTAG---ATC--AGT----A----A----AAA----G-TAAAAATAAG---------TAA--------T---AGTC---GC-AATA--GATTTTGATGAAAAATTGAAG-TAAA---GTT-AGAAAG-A-CGTTGTATTAATTATCAAATAAAA-T-ATTT-TT-----T--T----AA--A-AATAA-A--TCGATAA--AAAT--AA-----------ATTGCTGTTTATCTCATTGTT--TCGTT-TCTAAA----GT-acagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|10 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacCGCTGTCGTCCGTGCA-GGCA------ATACA-AAA-TA----------TTAGG----TAA----CA-----------------GGG-------------A-------------------------------T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATC--AATTA--A----A----AG-----G-A--------G---------TGA--------T---AATC---GA-AATAT--ATTTTGATGAAAatttcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|20 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgCGTGCA-T-CA------ACGCGCAAG-GAG------GCTATACA----AGA----AAC------TGATT---TTGTG-------------A---ATTTACGTAAAGGTG---------G---T-T---CTA-TG------------C---TTCAA---ATC--AACG---A----A----AA-----A-A--------G---------TAA--------T---AATC---GT-AA--CAGATTTTGATGACAATTTCCAG-GAAA---GGT-AGAAAT-A-TGTTAT----ATATTCAAATAACT-T-A--AGTT-----TTAT----GA--A-AA-------TTGAT----AAAG--AATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTtgtgttatacttgtt
gi|19 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaatacccA-T-CA------ACGCGCAAG-GAG------ACAATACA------A----GATACTAA-T---T---TTGTG-------------G---ATTTAGGTAACGG-G---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATC--AATAAAAA----G----AA-----G-T--------G----------A---------T---AATT---GC-AATATA
gi|12 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggA------ATTCGCAAA--AG------GCTATACA------A----GAT------T---C---TGGT----------------------------------------------T-T---GTA---------------T---TTTAA---ATT--AAT----A----A----AAAGAA-G-T--------G----------AT--------C---A-TA---GC-AGTA--GATTTTGATGAAACTTTCCAT-AAAA---GAT-AAAAAT-A-TTTTAT----ATTATCAAATAAAA-T-A--A-TT-----T--T-----A--A-AAT-ATA--TCGAT----GAAG--AACTTAATGTTTTATTGCTGTTTATCTAAGTATT--GCGTT-TCTAAA----GC-T-----T----ttt
gi|4 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaACA-AAA-GAGTGTGTCGTTTTTTG----TGA-----AT------T---TAGGTTACG-------------G---G-------------G---------A---T-T---GTA-TG------------T---TTTAA---ATC--AAT----A----A----AAAGAA-G-T--------G----------AT------------AATC---GC-AAAATAT-TTTTTATTCAACTTTTCAG-AAAC---GGT-AGAAAG-A-TGTAAC----ATTGT-GGGTAAAA-T-A--G-AT-----T--T----CA--A-TAA-A-A--TCGAT----AAAG--AACTTTATGTTTTATT-CTGTTTATATGCGTGTT--GC-GTATCTAAA----GT-C-----T----ttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|8 : ttatcgcatctgaTTTTTA----TGA-----AT------T---T---AGGTA-------------A---C-------------G---------G---T-T---GTT-GTATG---------T---TTCAA---ATC--AAT----A----A----AA-----GAA--------G---------TGA--------T---AACC---GC-ATT--AGATTTTGATGACACTTTTCAGAAAAA---AGT-AGAAAG-A-TGCTAT----ATTATCAAATCAAC-T-A--A-AT-----T--T----AA--A-AATAA-A--TCGAT----AGAG--AACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTT--GCGTT-TCTAAATTATGT-TGGTG-T----ATATGCAAATG-A-TATAC-GAGATCATT-AGACACATActgtataaattcgttaagtttatctgtactttgatatttagatttctgttctatggtgttttctttcatttttgctaaataattattaaaatcaacgttcaagtgctttgaaccacataccacaagctgaatttcaaataatacccattcaatgagaagtcgctggcatacgtgcttcaatgcataaaaaggatatacaagacactgattttgtgaatttaggtaacgggggttgtatgttttaaatgtataaaaagaagtgataatcgcaatagatattaatgaaactttcacggaaaaggagaaagatattatattatcaaacgcaatttgttttcaaaaatcaatagaaaaattggtgttttatggctgaagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|10 : ttttatgaaacatctcaATA----TG-----GAT------T---T---AGGTA-------------A---C-------------G---------GGGAT-T---GTA-AG------------T---TTCAA---ATC--AGTTTAAA----G----AA-----G-T--------GG--------TAT--------T------C---AC-AATACA--TTTTGATAAAAGTTTCCAG-AAAA---GGT-AAAAAG-A-TATTGT----TCTATCAAATAAAA-T-A--A-AT-----T--T----AA--A-AA--A-GAACCGATTA--AGAA--A--TCAATGTTTTATTGCTGTAAATCTGAGTATT--GCGTT-TATAAA----GT-cgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|24 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatA----TGC----GAT------T---T---T-GTG-------------A---ACTTAGGTAACAGGG---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATC--AATAAAAA----C----AA-----G-T--------G----------A---------T---AATA---AC-AATA-AG-TTTTGATGAAACTTTCCAG-GAAA---AGTCAAAGAT-A-TA--AT----ATTATCAATTTAAA-T-A--gttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|1 : ga----TGA-----AT------T---TATATTACG-------------A---G-------------G---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----A----AA-----A----------G---------TAG--------T---GATCATTGC-AAT--AGATTTTGACGAAACTTTCCAG-AAAT---GGT-AGAAAG-A-TATTAT----ATTATCAAAGAAAA-T-A--A--A-----T--T----AA--A-AAA-A-A--TTGAT----AATG--AACTCAATGTTTTAATGCAGTTTATCCGAGTGTT--GCGTT-TCTAcacttttattgtttgtataatttcgtctactattggt
gi|2 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagaatatcaA----GAT------C---T---T---G-------------G---A-------------A---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATCGAAAA----A----C----AAAAGAAG-T--------G----------AT------------ACTC---GC-AATATA--TTTTGATGAAACTTTCCAG-TATA---GGT-GGAAAT-G-TTTTAT----ATTATCAAATAAAA-C-A--A-AT-----T--C----CATTA-AA-------TCGAT----TAAG--AATTTAATGTTTTATTGTTGTTTATATGAGACTT--GCGTT-TCTAAA----G--------T----ATTTC--GGTATA-CGTATAAAGA--ATTCAAACccaaaaaatgcaacactgttattgtttgtataactttgtttagaattggtttatctgtattttgatattcagattttgattcagttgtatgttatttcaagttcgcaggaaaattattgaaatcaacgttcaaaatatttcgtcaaacgcttgttaaagagcggaacaacttaccacaagcccggatttcaaataacgttcattcaatgagaagtcgctaccgtgcgtgcatcgatgcacaaggaggctataagatactgattgtgtgtgtttcaaatcaataaaaataagtaataaagaaataataatcgcaaccgattttgatgaaactttcccggaaacgtaggaagatgctatattctcaaataaagtagatttcaaa
gi|7 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacg------T---T---TTGTG-------------A---A---------------------------T-TACGGTA-AC------------GGGGTTCAA---ATC--AAT----A----A----AAAAAA-G-T--------G----------AT--------A---CA-C---GC-AATTT---TTTTGATGAACATTTCCCG-GAAT---GGT-AAAAAG-A-TATTA-----ATAATCAAATCAAA-T-A--A-AT-----T--T----AA--A-AGA-A------AATGAT-AAAG--AACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATGTGAGTGTT--GCGTT-TCTAAA----GT-aaattcacaaacacgacacacttttatggtctgtatagattcgttaagtttattggtttatctgtattttgatgttcaggttttgtttctatggtgttttctctttcattttcgcaatcgaattattgaaatctgcgttcgaagtctgctcaagtgcttgttcaaaagtggaacaacatactgcaagccggttttcaaataatacccactcaatgagaagtcgctgtcgtacgcgcataaatgaataaagagggtgtacacaatactgatttttgtgaatttaggttacgggggttgtatgtttctaatgaatattagtgataaaaatgataattgcaacagattttgatgaaacttttcaggaaaagtaaaaagacgttaattatcaaatattcttttttcttgaaaaatcgataaagaattaaatgtaagatggttgtttatctgaat
gi|12 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccgaaatGCG-------------G---G-------------G---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----A----AAAAG--G-T--------G----------AT------------AATC---TC-AAGA--GATTTTAATGAAAACTTCCAG-GAAA---GGT-GGAATG-G-TGTTAT----AATATCAAATAATC-T-TT-A-TT-----T--TTTTAGA--A-AAA-A-G-----ATAA--AGAA----CTCAATGTATTATTGCTGTGTATTTGAGTGTT--GTGTT-TCTAAtacgcagcatatctattgtttgcataatttcgtttagaattgatttatctatattttaatgttcagattgtgtttctatggtaagttctttcaatttcgcaatacaattattaaaatcaacgcttgaatatgccgttaaacacttgttcaagagtaaaacatcataacactagcccggatttaaaatattatccatttaatgtcgtgtgtagcgt
gi|16 : TG-------------G---G-------------G---------G---T-T---GTA-TG------------T---TACAA---ATC--AAT----A----A----AA-----A-G--------A---------AATGA------T---AATC---GA-AATA--GATTTTGATGAAACTTTTCAA-GA-A---GGT-TAAAATGA-TATTAT----ATTAT-AAATAAAA-TCA--A-TT-----T---------------C-A-G-----ATA--------------AATGTTTAATTGCTGTTTA-CTAAGTACT--ACGTT-TATAAA----GTATTTCGGT----ATAT---AAtacctaaattcgcaaaaggctatacaagattctggtttgtattttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|11 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctccca-------------G---------G---T-T---GTT-TG------------T---TTAAA---ATC--AAT----A----A----AAAGAA-G-T--------G----------AT------------AATC---AC-AATA--GATTTTGATGAATTTTACCAG-GAAA---TGT-----AT-A-T---AT----AT-----------A-T-AT-A-TT-----T---------------------------------AA--AATTCGATGTTTTATTGCTGTGTATCCGAATGTTGAGC--T-TCTAAA----GTAT-----T----Atgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|19 : tatacaccg-------------G---------G---T-T---TTA-TG------------T---TTCAA---ATT--GAT----A----A----AAA----G-CA-------G---------TGA--------T---ACTC---GC-AATATA--TTTTGAT----------AG-GAGA---GGT-AGAAAG-A-CGTT-T----ATTATAAAATAAAA-T-A--------------------A--A-ATC-------CAACCG--AAAA--A--TCGATGTTTCA-TGCTGTTTATCTCAGTGTT--ACATT-GCTAcccgtgacctaaattcacaaaatcgcaacacttttattgttggtataatttcgtttggaattggtttatctgtattttgatattcagattttgtttctgtgctatttttcaatttcgcaatacaattattgaaatcagctttcaaatacttcgttaagcgcagttcaagagtgaaacaacataccaaaatcccagatttcaggtatcacatattcaatgagaagtcgctgtcgtgcgtgtactcgtatatcataccaaaggagtctctacaaaatactgattttgtgaatttaggtaacttggggttgta
gi|22 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaa---------G---T-T---GTA-TG------------T---TTCAA---ATA--AAT----A----A----AG-----A-T--------A----------AT--------TGATAATC---GC-ACTA--GATTA-GATGAAACTTTTCAG-GAAA---GGT-AGAAAG-A-TGTTTT----A-TATCAAATAAAG-T-AT-A-TT-----T--C----GA--ATAAC------TCGATAA--AGAA--aggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|14 : cacgcagataaacagcg---GTA-AC------------T---TTCAA---ATC--AATTAAAA----G----AA-----G-T--------G----------AT--------C----ATC---CC-AAT--AGATATTGATGAAACTTTCCAG-GAAT---GGT-AGAAAG-A-GATTTT----ATAATGAAATATAA-T-A--A--A-----T--T----AA--A-AAG-A------AATGAT-AACG--AACTCAATGTTTTATTGTTGTTTATCTCAGCGTT--GCGTT-TCTAAA----GT-tcccgtgcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|20 : acacaaaaat------------T---TTCGA---ATC--ATT----A----A----AA-----A-GAA------G---------TCA--------T---AATC---GC-AATA--GATGTTGATGAAACTGTCCAG-GAAA---GGT-AAAACT-A-TGTTAT----AATATCAGATTAAtcccctgttacctaaatttacacaaaaataacacttttactgtttgtatattttcgtttagaattagtttacctgtttttttatatatagattctgttgctatggtattttctttcaatttcgcaatacaattattgaaattagtgttcaaatacttcgtcaatcgctttttaaaaagtggaacaacatcccgaatttcaaatagtatccatttaatgaaaagccgct
gi|21 : ------------T---TTCAA---GTC--AAT----A----AG---AA-----G-GAG------G---------TAT------------GATC---GC-AATA--GATTTTGGTGAAACTTTCCAG-GAAT---GGT-CGAAAT-A-TATTAT-----------AATACA----------T-----T--T----CA--A-AAT-T-A--TCGAT----AAAG--AACGCAATGTGCTAATGCTGTTTATTTGAGTGTT--GTGTT-TCTAAA----GT-C-----TTTCAATGT---AGCAAACTTTATAGTAA------AAATGTATAGcccaataccccgtgcatcaacgcgcaaggaggctatacaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|18 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaa------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----A----AAAGAA-G-C--------G---------AA-------------AGTC---G---GTTTAGAGTTTGATGAAACTTTCAAG-GA-----------AAAT-A-TGTTAT----ACAATAAAATAAAA-T-A--A-AT-----T--T----AA--A-AAG-A-A--TCGATAA--AGAA----CTCAATGTTTAATTGCTGTTCATCTGAGTGTT--TCGTT-TTTAAT----GT-C-----T----cataaagctcttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|23 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaa------------T---TTCAA---ATC--AAT----A----A----AA-----G-GAA------G---------TGA--------T---CATC---GC-AAT-C-GGTGGTGATGACAATT---AA-GAGAAATGAT-AGAAAG-A-TGTTAT----ATTATTAAATAGAA-T-T--A-TT-----T--T----T-----------T--TAAATAA--AAAAAGAACTCAATGTTTT-TTAcatatactctcccgttacctaaattaatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|21 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatacttCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGGGTGTT--GCGTT-TCTCAA----cacacaa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 2222222 333333333 11 11111 444444 11 222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5555555555555555555555555 3333 11111111 11 1111 444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 1 111 11 2222 2
lowQualScore : 3 2 7 5555 3333333 2 888888888 55555 5555 2 2 2 0 2 2 0 2 2 33 333 9 999 2 88 2 2 2 77777 4 6666 55 0 222222 00 55 8888 555555555 5 3 0 3 2 8 0 3 1 1 88888 2 2 777777 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 2 66 2 2 8888888888888888888888888 3 444 0000 33 555 2 0 6666 2 77777777 6666 0 2 11 3 9999 1 0 2 111111111111111111111111111111111111111111111111 4 88888888 0 000 33 8888 4 0 3
lowQualScore : . . . .... ....... . ......... ..... .... . . . . . . . . . .. ... . ... . .. . . . ..... . .... .. . ...... .. .. .... ......... . . . . . . . . . . ..... . . ...... .......................................................................... .. . .. . . ......................... . ... .... .. ... . . .... . ........ .... . . .. . .... . . . ................................................ . ........ . ... .. .... . . .
lowQualScore : 6 9 1 3333 1111111 7 000000000 99999 0000 4 7 4 8 4 1 1 0 0 88 333 1 000 0 33 2 5 7 22222 0 5555 00 2 111111 88 44 7777 444444444 8 6 2 6 3 0 9 3 0 0 33333 9 7 222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 77 7 33 7 7 2222222222222222222222222 6 777 1111 77 000 9 7 1111 4 44444444 1111 9 9 55 1 2222 5 2 1 666666666666666666666666666666666666666666666666 6 88888888 0 777 33 3333 0 0 0
consensus : AATA-CT-TTAGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGNTTT-TT-TTTAAAA-T---T--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTC-T-TTTNATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C--GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AA--GCAACAC----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATT-ATATTCAGATTT-TG---TTTCTATG-G---TA--TTNTC-TTTCAATTTCG-CAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAA-CAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATGCGCAAGGAGGCTATACA-----G--A----GAT--T---T---TT-TGTG-------------A---AT--A-GT---GG-G---------G--T-TGTATGTTTCAAATCAAT--A-A-AA-G-NA------------G-------TGATAATC---GCAATA--AGATTTTGATGAAA--CTT---TCCAGGAAAG-GTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGATAA--AAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TCT----ATGT-AACA-A--T-TACAGAGA--ATTAAACGTAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
Reference ( family-2082 ) : AATA-CT-T-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGTTTTGTT-TTTAAAA-T---T--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTC-T-TTTANTT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C--GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AA--GCANCAC----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTCATATTCAGATTT-TG---TTTCTATG-G---T---TTNTC-TTTCAATTTCG-CAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAA-CANCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATGCGCAAGGAGGCTATACA----TG--A----GAT------T---TT-TGTG-------------A---A-------------G---------G--T-TGTATGTTTCAAATCAAT--A-A-AA-G-T-------------G-------TANTAATC---GCAATA--AGATTTTGATGAAA--CTT---TCCAGGAAAG-GTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGATAA--AAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TCT----ATGT-AATA-A--TNTACAGAGA--ATTAAACGTAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTG
gi|1 : AATATCA-T-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATTATCAATTT-TT-TTTAATT-TA--T--T-----T----T-CTTTGATA-ATATAATATCTTTCTACCATTT-CTGGAAAGTTTCGTCAAAA-TCTATTGCAATGATCACTAC-T-TTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CCTC--GTAATATAA-ATTCACCAA-AA-AAT-GCAACAC----TGTTATTGTTTGTATAACTTTGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTG------ATATTCAGATTT-TG---ATTCAGTT-G---T---ATGTTATTTCAAGTTCG-CAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGTCAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAA-CAACTTACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACG-----TTCATTCA-ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-TCG------ATGCACAAGGAGGCTATA----------A----GAT------A---C----TG-------------A---T-------------T---------G----TGTGTGTTTCAAATCAAT--A-A-AA-A-TAAGTAATAAAGAAA-------TAATAATC---GCAAC---CGATTTTGATGAAA--CTT---TCCCGGAAAC-GTAGGAAGATGCTAT----ATTCTCAAATAAAG-TAG-A-TTT----CAA-A
gi|10 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagATA-CT-TTATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTAATCGGTTCTTT-TTTAAAT-T---TATT-----T----T-ATTTGATA-GAACAATATCTTTTTACCTTTT-CTGGAAACTTTTATCAAAA-TGTATTGTGAATACCACTTC-T-TTAAACT---GATTTGAAACTTACAATC---CC-C--GTTACCTAA-ATCCA-TA
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacCGCTGTCGTCCGTGCA---------------------GGCAATACA--------A----AAT------A---TTAGGTA-------------AC--A-------------G---------GGAT-TGTATGTTTCAAATCAATTAA-A-AG-G-A-------------G-------TGATAATC---GAAAT---ATATTTTGATGAAA--tgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgTTTCATCAAAA-TATATTTCGATTATCACTCC-T-TTTAATT---GATTTGAAACATACAATC---CC-T--GTTACCTAATATTtgtgttatacttgtt
gi|11 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaAATA-CT-TTAGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----AATT-----------------TTAAA--------------------T-AT---ATATATATA---------TACATTTC-CTGGTAAAATTCATCAAAA-TCTATTGTGATTATCACTTC-T-TTTTATT---GATTTTAAACAAACAA-C---CC-CC-GTGACCTAA-ATTCA-CAA-AA-TC--GCAACAC----TTTTATTGTTGGTATAATTTCGTTTGG--AATTGGTTTATCTGTATTTTG------ATATTCAGATTT-TG---TTTCTGTG---------CTATT-TTTCAATTTCG-CAATACAATTATTGAAATCAGCTTTC-AAATACTTCGTTAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAA-CAACATACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCA-----CATATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACTCGTATATCATACCAAAGGAGTCTCTACA--------A----AATACTGA-T---TT-TGTG-------------A---A-------------tgtgttatacttgtt
gi|11 : tatacaccgtTACAA-C---CC-CAAGTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-tttaggtaacttggggttgta
gi|12 : tatacaccgtaatactttagaagctcaacattcggatacacagcaataaaacatcgaattttaaatatatatatatatacatttcctggtaaaattcatcaaaatctattgtgattatcacttctttttattgattttaaacaaacaacccccgtgacctaaattcacaaaatcgcaacacttttattgttggtataatttcgtttggaattggtttatctgtattttgatattcagattttgtttctgtgctatttttcaatttcgcaatacaattattgaaatcagctttcaaatacttcgttaagcgcagttcaagagtgaaacaacataccaaaatcccagatttcaggtatcacatattcaatgagaagtcgctgtcgtgcgtgtactcgtatatcataccaaaggagtctctacaaaatactgaT-T-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTTATC-TTTT-TT-CTAAAAA-A---A--TAAAGAT----T-ATTTGATA-TTATAACACCATTCCACCTTTC-CTGGAAGTTTTCATTAAAA-TCTCTTGAGATTATCACCTT-T-TTTA-TT---GATTTGAAACATACAACC---CC-C--GCTACCTAA-ATTCG-C-A-AA-AG--GCTATACAAGATTCTG--GTTTGTAT
gi|12 : A------ATTCGCAAA-AGGCTATACA--------A----GAT------T---CT-GGT---------------------------------------------T-TGTAT--TTTAAATTAAT--A-A-AA-A---------------G-------AAGTGATCATAGCAGTA---GATTTTGATGAAA--CTT---TCCATAAAAG-ATAAAAATATTTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AAT-A-TATCGAT----GAAGAACTTAATGTTTTATTGCTGTTTATCTAAGTATTGCGTTTCTAAA----------G----tttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|13 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaATTCAGATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-TCA------ATGCGCATGGAGGCTATACAATATTG--A-------------T---TT-TGTG-------------A---ATTAAGGTAGCG--GC--------G--T-TGTATGTTTCTAATCAAT--A-A-AA-A-GAA-----------G-------TATTAATT---GCAATA---GATTTTGATGAAAAACTT-----CAGTGAAG-GTAGAAAGGTGTTAT----ATTATTAAATAAAA-TA--A-AAT----AAATAA--A-AATCGATAA--A--GAACTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATTGCGTT-CTAAA----------GGTTTTCA----GTGT-AA-A-A-----ACAG-------TAAACATTT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|14 : AATA-CT-TTAGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTTATCATTTC-TT-TTTAA-------T--T-----TATTAT-ATTTCATT-ATAAAATCTCTTTCTACCATTC-CTGGAAAGTTTCATCAATA-TCTATTGGGATGATCACTTC-T-TTTAATT---GATTTGAAAGTTACTC-C---CC-T--GTTACCTAA-ATTTA-CAC-AA-AA--ATAACAC----TTTTACTGTTTGTATATTTTCGTTTAG--AATTAGTTTACCTGTTTTTT--TAT--ATAT--AGATTC-TG---TTGCTATG-G---TA--TTTTC-TTTCAATTTCG-CAATACAATTATTGAAATTAGTGTTC-AAATACTTCGTCAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAA-CAACAT--------CCCGAATTTCAAATAGTA-----TCCATTTA-ATGAAAAGCCGCTacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|15 : acacaaaGGAA-CATCATACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGC----A-TCA------ATGCAAATGGAGGCTATATA--------A----GATACTCA-T---TT-TGTG-------------A---ATATAGGTACAAGGG---------G--T-TTTGTGTTTAAAATTGAT--A-G-A------------------G-------AAGTGA-----GCAACA--G--TTTTGATGAAA--CTT---TACAAGAAAG-GTGGAAAGATATTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A--TT----TAA-AA--A-AAAAAATAATGAAAAAAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTTGCGTTTCTAAA----------T----TCT----TTTT-GGTA------TAGATAGA--ATT
gi|16 : AATA-CT-TTATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACA------------TTTATC-----------TGAAA-TTGAT--T-----T----T-ATTT-ATA-ATATAATATCATTTTAACCTTC-TTGAAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTTCGATTATCATTTC-T-TTTTATT---GATTTGTAACATACAA-C---CC-C--gctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|16 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaCATGCG-TCA------ACGGGCAAGGAGGTTATACG----TGTAA----GACGCTGA-T---AT-TGTG-------------A---A-------------catgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|17 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaaatactttataaacgtagtacttagtaaacagcaattaaacatttatctgaaattgattttatttataatataatatcattttaaccttcttgaaaagtttcatcaaaatctatttcgattatcatttctttttattgatttgtaacatacaacccc-ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-TAA------CTCCGCAAGGAGGCTATA-------G--A----TATACTAA-T---TT-TGTG-------------A---ATTTATGTAATGGGG---------A--T-TTTATGTTTTAGATCAGT--A-A-AAAG-TAAAAATAA-----G-------TAATAGTC---GCAATA---GATTTTGATGAAA--AAT---TGAAGTAAAG-TTAGAAAGACGTTGTATTAATTATCAAATAAAA-TATTT-TTT----TAA-AAATA-AATCGATAA--AAATAA-----------ATTGCTGTTTATCTCATTGTTTCGTTTCTAAA----------G----Ttataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|18 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacT-T-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTC-TT-TTTAAAT-TTA-T--T-----T----T-ATTTTATT-GTATAACATAT-------TTTC-CTTGAAAGTTTCATCAAAC-TCTAAACCGACTTTCGCTTC-T-TTTTATT---GATTTGAAACATAT-A-CTCTCC-C--GTTACCTAA-ATTatttcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|19 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaaagacaAATA-CAAT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGCA-TGAAACATCG----A----TTTTTCGGTTGGAT-TTTA--------T--T-----T----T-ATTTTATA-ATA-AACGTCTTTCTACCTCTC-CT----------ATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTGC-T-TTTTATC---AATTTGAAACATAAAA-C---Caatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|19 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaAAA-TATATTGCAATTATCACTTC-T-TTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C--GTTACCTAA-ATCCA-CAA-AATTA--GTAT--C----TTGTATTGTCTaggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|2 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggatcaacgcgcaaggAATA-CT-TTAGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTAATCGATTTA----ATGGAA-TTTGT--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAAAACATTTCCACCTATA-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTTC-T-TTTGTTTTTCGATTTGAAACATACAA-CT--TC-C--AAGATCTAA-ATTCA-CAA-AC-AC--GACACAC----TTTTATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTTATTGGTTTATCTGTATTTTG------ATGTTCAGGTTT-TG---TTTCTATG-GTGTT---TTCTC-TTTCATTTTCG-CAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAAGT-CTGC-TCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAA-CAACATACTGCAAG-CCGGTTTTCAAATAATA-----CCCACTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-TAA------ATGAATAAAGAGGGTGTACA----CA--ATACTGAT------T---TT-TGTG-------------A---ATTTAGGTTACGGGG---------G--T-TGTATGTTTCTAATGAAT--A-T-TA-G-T-------------GATAAAAATGATAATT---GCAAC---AGATTTTGATGAAA--CTT---TTCAGGAAAA-GTAAAAAGACGTTA-----ATTATCAAAT---A-TT--C-TTTTTTCTTG-AA--A-AATCGAT----AAAGAATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAAT
gi|20 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccga--T-----T----A-ATCTGATA-TTATAACATAGTTTTACCTTTC-CTGGACAGTTTCATCAACA-TCTATTGCGATTATGACTTC-T-TTTTAAT---GATTCGAAACCCAATA-C---CC-C--GT
gi|20 : CGTGCA-TCA------ACGCGCAAGGAGGCTATACA----AG--A----AAC------TGATTT-TGTG-------------A---ATTTACGTAAAGGTG---------G--T-TCTATGCTTCAAATCAACG-A-A-AA-A-A-------------G-------TAATAATC---GTAACA---GATTTTGATGACA--ATT---TCCAGGAAAG-GTAGAAATATGTTAT----ATATTCAAATAACT-TA--AGTTT----TAT-GA--A-AATTGAT----AAAGAATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTgcatcaacgcgcaaggaggctatacaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|21 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaataccc-------------A---A-------------GA--------G--C-TTTATGTTTCAAGTCAAT--A-AGAA-G-GAG-----------G-------TA-TGATC---GCAATA---GATTTTGGTGAAA--CTT---TCCAGGAATG-GTCGAAA-----TAT----ATTAT-------AA-TAC-A-TTT----CAA-AA--T-TATCGATAA--A--GAACGCAATGTGCTAATGCTGTTTATTTGAGTGTTGTGTTTCTAAA----------G----TCTTTCAATGT-AGCA-AACTTTATAGTAA-----AAATGTAT---AG---TTA
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgTA-TT-G-AGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTTAT-GTTTttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|22 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgCACGCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTTATCG---AGTTATTCGAAA-TATAC--T-----T----T-ATTTGAT--ATAAAACATCTTTCTACCTTTC-CTGAAAAGTTTCATC-TAA-TCTAGTGCGATTATCAATTA-TCTTTATTT----ATTTGAAACATACAA-CT--CC-C--GTgtacagtgt
gi|22 : TTA-TT---GCTTAGAAACAAACAATC---CC-C--GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-gcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|23 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactcccgtgcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaataAAAACATTG----AGTTCTTT----TTTTATT-TAAAAAAATAA-T--T-----C----T-ATTTAATA-ATATAACATCTTTCTATCATTT-CTCTTAATTGTCATCACCA-CCGATTGCGATGATCACTTC-C-TTTTATT---GATTTGAAACACACAA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|24 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaa---T--T-----T----A-AATTGATA-ATATTATATCTTTG-ACTTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-CTTATTGTTATTATCACTTG-T-TTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-CT-GTTACCTAA-GTTCA-CAA-AA-TC--GCATCAC----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTCTAC--TATTGGT
gi|3 : gataAATA-CT-T-AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTTATCATTTTGTT-TTTAAAA-T---C--T-----C----C-ATTTGATA-ATATAATATCTATGTACCGTTC-CTGAAAAATTAAATCAAAA-TCTATTGTGATTATTACTTC-T-TTTATTT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C--GTTACCTAA-AACCA-CAA-AA-AA--GCATCAT----TTTTATTGTTTCTATAATTTCGTTTAT--AATTGGTTTAACTATATTTTTATATTTATATTTAGATTT-TG---TTTCTATGTT---T---TTATC-TTTCAATTTCG-CAATAAAATTATTGTAATCAACGTTC-AAATACTCTGCCAAACACTTGTTAAAGAATGGAA-CATCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTA-----TCTATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATACACAAAGAGGCTTTACA----TG--A----GAT------T---TT-TGTG-------------A---A-------------G---------G--T-TGTAATTTTCAAATCAAT--A-C-AA-G-T-------------G-------TATTAATC---GCAATAC-AGATTTTGATGAAA--ATT---TCCAGGAGAG-GTAGAAATATGTTAT----ATTCTCAAATAAAA-TA--A-TTT----TGA-AA--ACAGTCAATAA--AAAAAACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTTGC-TTTCTAAA----------G----TTT----ATAT-AACACA--TCTACAGAGA--ATTAAACATAT---AGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTG
gi|4 : T-T-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTTATCGATTT--T-ATTGAAA-TCTAT--T-----T----T-ACCC-ACA-ATGTTACATCTTTCTACCGTTT-CTGAAAAGTTGAATAAAAAATATTTTGCGATTATCACTTC-T-TTTTATT---GATTTAAAACATACAATC---CC-C--GTAACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AACGACA-CAC----TCTT-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----AA---GTTTATCTGTACTTTG------ATATTTAGATTTCTG----TTCTATG-G---TG--TTTTC-TTTCATTTTTG-CTAAATAATTATTAAAATCAACGTTC-AAGTGCTTT----------------------GAA-CCACATACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATA-----CCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-TCA------ATGCATAAAAAGGATATACA----AG--ACACTGA-------T---TT-TGTG-------------A---ATTTAGGTAACGGGG---------G--T-TGTATGTTTTAAATGTAT--A-A-AA-A-GAA-----------G-------TGATAATC---GCAAT---AGATATTAATGAAA--CTT---TCACGGAAAA-GGAGAAAGATATTAT----ATTATCAAACGCAATTT--G-TTT----T-C-AA--A-AATCAATAG--AAAAA--TTGGTGTTTTATGGCTGtataaaata
gi|5 : ttatcgcatctgaagactTATTGCAATTATCACTTCGT-TTTA-TT---GATTTGAAATATAAAA-C---CC-CA-GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AAA-GCAACAT----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AACTAATTTATCTGTATTTTGATATTCATGT---AATT---------------------------TC-TTTCAATTTTG-CAATATAATTATTGAGATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAATATTGGAA-AAACATACCACAAACCTTGATTCCAAATATTA-----TCCATTCA-ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-TCA------ATGCACAAGGAGGCTATACA----AG--A----TATTATTGAT---TT-TGTGT------------ATTTA-------------GATAACGGGCG--T-TGTATATTTCAATTCAAT--ATA-AA-GAA-------------G-------TGATAATC---GCAAT---AGATTGTGATGAAA--CTT---TCCAGAAAAT-GTCGAAAGATGTTAT----GTTATTAAATCAAA--------------TCA-AA--A-AATCGAT----AAAGAACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------A----TCaagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagtactatatgtaagtcttaatacaccgaat--GTTACCGAA-ATTCA-CAATAA-AAC-GCAACAC----TTTTATTGTTTGTATGAGTTCGTTTAA--AATGGGTTTATCTGTATTTTG------ATATTCAGAACT-CG---TTTCTATG-G---TA--TTTTC-TTTCAATTCTG-AACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTC-AAGTACTACGTCAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTA--AACATATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTA-----TCCATTCA-AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-TCA------AAGTGCAAGAATTCTTAACA----CG--ATACTGA-------T---TT-TGTGGATTTAACTAACAG---A-------------G---------A--T-TGT-TCATTCGAATTCAT--A-A-AA-A-T-------------AGC-----TGGTAATC---GCAAAAATATATTTTGATAAAA--CTC---TCCAAGACTG-GTAGAAAGATATTTT----ATCACC----AAAA-T-----TTT----TAA--------------AA--AAAAAAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTTGCATTTCTAAA----------G----TCT----ttt
gi|7 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaaAATA-CT-TTAGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCATTTT-CT-TTTAAAT-T---TA-T-----T----TGATTTGATT-AT-TAATATCTTTTTACCATTC-CGGGAAATGTTCATCAAAA-AA-ATTGCGTGTATCACTTT-T-TTTTATT---GATTTGAA---------C---CC-C--GTTACCGTA-ATTCA-CAA-AATAC--GCAGCAT----ATCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATTGATTTATCTATATTTTAATGTTCA------GATTG-TG---TTTCTATG-G---TAAGTT--C-TTTCAATTTCG-CAATACAATTATTAAAATCAACGCTT-GAATATGCCGTTAAACACTTGTTCAAGAGTAAAA-CATCATAACACTAGCCCGGATTTAAAATATTA-----TCCATTTA-ATGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|8 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccga---------G--T-TGTATGTTTCAAATCAAT--A-A-AA-G-AA------------G-------TGATAACC---GCATTA---GATTTTGATGACA--CTT---TTCAGAAAAAAGTAGAAAGATGCTAT----ATTATCAAATCAAC-TA--A-ATT----TAA-AAATA-AATCGAT----AGAGAACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTTGCGTTTCTAAATTATGTTGGTG----TAT----ATGCAAATG-A--TATAC-GAGATCATTAGACACATATGAG---ATGT-TTtcgtgtgtagcgt
gi|8 : ttttatgA-TT-T-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCTATCGATTTATT-TTTAAAT-T---TAGT-----T----G-ATTTGATA-ATATAGCATCTTTCTACTTTTTTCTGAAAAGTGTCATCAAAA-TCTAATGCGGTTATCACTTC-T-TTTA-TT---GATTTGAAACATACAA-CA--AC-C--GTTACCTAA-ATTCA-TAA-AA-AC--GCAACAC----TTCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATT-ACTTGTCTGTATTTTGATA-TGGTATT----TTC-TAAACATTC-AT--G---T---TTACC----CA----CGTCAA-------ATTGGAAT----GTTC-AAGTACTTCGTCAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAA-CACCATACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTA-----TCCATTCA-ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-TCA------CCGCGCAAaaccgttacctaaattcataaaaacgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|9 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacataATTAGTTTATCTGTAATTTGGTATTCA------GATTC-TG---TTTCTATG-G---TA--TTTTC-TTTGAATTTCG-CAATTAAATTATTGAAATCACCGa
gi|9 : TGAAATCACCGAACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTG-CTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-TCA------ATGAGCAAGGAGGCTATACA--------A----GATACTGA-T---TT-TATG-------------A---ATTGAGGTAACAG-G---------G--TCTGTACATTTCAAATCAAT--A-T-AA-A-TAA-----------G-------TGATAATG---GCAAT---AGATTTTGATGA-----TTATGTCCAGGGAAT-GTATA---TTGTTAT----ATCATCAAATCAAA---------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTTGCGTTTTTAAA----------G----TCTTTCGATGT--ACA-A--CTCAT-GAGACCATTTTCCTAAT---CC---ATAA-TTTGTTTT-GTTTATTGAAGAT----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333333333333333 1111 44444444444 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222 111111111 3333 2222222222222222222222 2222 222222222222222 1111 55555555555555555555 22222222 1 111 33 2222 1
lowQualScore : 2 2 5555 66 888 4444 666666666666666666666666 2 3 2 0 1 2 2 2 333 9 999 2 6 2 2 2 5555 6666 55 0 00000000000 33 0 55 88 666 0 3 2 8 0 0 1 88888 2 2 666666 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 55 2 2 2 5 555555555555 2 000000000 2 0000 33 555 3 6666 1 0000000000000000000000 3 8888 1 3 333333333333333 4444 11111111111111111111 1 99 88888888 0 000 33 8888 1 5 1
lowQualScore : . . .... .. ... .... ........................ . . . . . . . . ... . ... . . . . . .... .... .. . ........... .. . .. .. ... . . . . . . . ..... . . ...... ........................................................................ . .. . . . . ............ . ......... . .... .. ... . .... . ...................... . .... . . ............... .... .................... . .. ........ . ... .. .... . . .
lowQualScore : 7 7 0000 11 666 6666 888888888888888888888888 2 4 2 4 7 2 0 8 222 1 000 0 0 2 5 7 0000 1111 00 2 11111111111 99 5 00 22 444 2 6 3 0 9 3 0 33333 9 5 888888 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 66 4 4 5 0 000000000000 7 777777777 7 9999 99 444 1 5555 5 2222222222222222222222 3 3333 0 1 444444444444444 2222 00000000000000000000 2 55 22222222 0 777 33 3333 0 5 0
consensus : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGNTTT-T-TTTT---AA---A-AT---T--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTTTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AN-GCAACAC----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATT-ATAT-CAGATTT-TGTTTCTATGGTA--TT-TTCTTT---CAATTTCG-CAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATGCGCAAGGAGGCTATAC------A-GA-----N-ACTGA---TTTTGTG------AA------TTTA---A---G------T----G--G-G--G-T-TGTATGTTTCAAATCAA-T-A------------AAA-GA--------AG-TGATAATCGCAATA--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGATA---AAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TCT----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
Reference ( family-2082 ) : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGNTTT-T-TTTT---AA---A-AT---T--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTTTTNATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AA-GCAACAC----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATT-ATATTCAGATTT-TGTTTCTATGGTA--TT-NTCTTT---CAATTTCG-CAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATGCGCAAGGAGGCTATAC------A-GA-----G-ATT-----TTTTGTG------AA------T------A---G------T----G--G-G--G-T-TGTATGTTTCAAATCAA-T-A------------AAA-GN--------AG-TGATAATCGCAATA--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGATAA--AAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TCT----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGA--ATTAAACGTAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
gi|1 : AATATC-AT-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATTATCAATTT-T-TTTT---AA---T-TTA--T--T-----T----T-CTTTGATA-ATATAATATCTTTCTACCATTT-CTGGAAAGTTTCGTCAAAA-TCTATTGCAATGATCACTACTTTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CCTC-GTAATATAA-ATTCACCAA-AA-AATGCAACAC----TGTTATTGTTTGTATAACTTTGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTG------ATATTCAGATTT-TGATTCAGTTGTA--TG-TTATTT---CAAGTTCG-CAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGTCAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAACAACTTACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACG-----TTCATTCA-ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-TCG------ATGCACAAGGAGGCTATA-------A-GA-----T-ACT-----GATTG---------------------------------------------------TGTGTGTTTCAAATCAA-T-AAAAATAAGTAATAAA-GA--------AA-TAATAATCGCAAC---CGATTTTGATG--AAACTT---TCCCG-GAAACGTAGGAAGATGCTAT----ATTCTCAAATAAAG-TAG-A-TTT----CAA-A
gi|10 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagATACT-TT-ATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTAATCGGTTC-T-TTTT---TA---A-AT---T--TATT--T----T-ATTTGATA-GAACAATATCTTTTTACCTTTT-CTGGAAACTTTTATCAAAA-TGTATTGTGAATACCACTTCTTTAAACT---GATTTGAAACTTACAATC---CC-C-GTTACCTAA-ATCCA-TA
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacCGCTGTCGTCCGTGCA---------------------GGCAATAC------A-AA-------ATA-----TTAGGT-------AA------C------A---G--------------G-G--A-T-TGTATGTTTCAAATCAATT-A------------AAA-GG--------AG-TGATAATCGAAAT---ATATTTTGATG--AAAtgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgTTTCATCAAAA-TATATTTCGATTATCACTCCTTTTAATT---GATTTGAAACATACAATC---CC-T-GTTACCTAATATTtgtgttatacttgtt
gi|11 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaAATACT-TT-AGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----AATT-----------------TT---AA---A--------------------T-AT---ATATATATA---------TACATTTC-CTGGTAAAATTCATCAAAA-TCTATTGTGATTATCACTTCTTTTTATT---GATTTTAAACAAACAA-C---CC-CCGTGACCTAA-ATTCA-CAA-AA-TC-GCAACAC----TTTTATTGTTGGTATAATTTCGTTTGG--AATTGGTTTATCTGTATTTTG------ATATTCAGATTT-TGTTTCTGTGCTA--TT----TTT---CAATTTCG-CAATACAATTATTGAAATCAGCTTTC-AAATACTTCGTTAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAACAACATACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCA-----CATATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACTCGTATATCATACCAAAGGAGTCTCTAC------A-AA-----ATACTGA---TTTTGTG------AATT----T------A---GGTAACTT----G--G-G--G-T-TGTAtgtgttatacttgtt
gi|12 : tatacaccgt-TT-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTTATC-TTTT-T-TCTA---AA---A-AA---A--TAAAGAT----T-ATTTGATA-TTATAACACCATTCCACCTTTC-CTGGAAGTTTTCATTAAAA-TCTCTTGAGATTATCACCT-TTTTTATT---GATTTGAAACATACAACC---CC-C-GCTACCTAA-ATTCG-C-A-AA-AG-GCTATACAAGATTCTG--GTTTGTAT
gi|12 : A------ATTCGCAAA-AGGCTATAC------A--A-----G-ATT-----CT---------------------------------------------G-G--T-T-TGTAT--TTTAAATTAA-T-A------------AAAAGA--------AG-TGATCATAGCAGTA---GATTTTGATG--AAACTT---TCCAT-AAAAGATAAAAATATTTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AAT-A-TATCGAT----GAAGAACTTAATGTTTTATTGCTGTTTATCTAAGTATTGCGTTTCTAAA----------G----tttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|13 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaATTCAGATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-TCA------ATGCGCATGGAGGCTATAC------A--A-----T-ATTGA---TTTTGTG------AA------TTAAGGTA---G------C----G--G-C--G-T-TGTATGTTTCTAATCAA-TAA------------AAA-GA--------AG-TATTAATTGCAAT---AGATTTTGATGAAAAACTT-----CAG-TGAAGGTAGAAAGGTGTTAT----ATTATTAAATAAAA-TA--A-AAT----AAATAA--A-AATCGAT----AAAGAACTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATTGCG-TTCTAAA----------GGTTTTCA----GTGT-AA-A-A---ACA-G-------TAAACATTT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|14 : AATACT-TT-AGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTTATCATTTC-T-TTTT---AA----------T--T-----TATTAT-ATTTCATT-ATAAAATCTCTTTCTACCATTC-CTGGAAAGTTTCATCAATA-TCTATTGGGATGATCACTTCTTTTAATT---GATTTGAAAGTTACTC-C---CC-T-GTTACCTAA-ATTTA-CAC-AA-AA-ATAACAC----TTTTACTGTTTGTATATTTTCGTTTAG--AATTAGTTTACCTGT-TTTT----TT-ATATATAGATTC-TGTTGCTATGGTA--TT-TTCTTT---CAATTTCG-CAATACAATTATTGAAATTAGTGTTC-AAATACTTCGTCAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAACAACAT--------CCCGAATTTCAAATAGTA-----TCCATTTA-ATGAAAAGCCGCTacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|15 : acacaaaGGAACATCATACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGT----CGTGCA-TCA------ATGCAAATGGAGGCTATATA-----A-GA-----T-ACTCA---TTTTGTG------AA------T------ATAGG------TACAAG--G-G--G-T-TTTGTGTTTAAAATTGA-T--------------AGA-GA--------AG-TGA-----GCAACA----GTTTTGATG--AAACTT---TACAA-GAAAGGTGGAAAGATATTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A--TT----TAA-AA--A-AAAAAATAATGAAAAAAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTTGCGTTTCTAAA----------T----TCT----
gi|16 : AATACT-TT-ATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACA------------TTTATC-----------T---GA---A-ATTGAT--T-----T----T-ATTT-ATA-ATATAATATCATTTTAACCTTC-TTGAAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTTCGATTATCATTTCTTTTTATT---GATTTGTAACATACAA-C---CC-C-ttttggtatagatagaattgctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|16 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaCATGCG-TCA------ACGGGCAAGGAGGTTATACGTGTA-A-GA-----C-GCTGA---TATTGTG------AA------T------ATAGG------TAAC-G--GCG--G-T-TAGA---TTC--ATTAA-T-A------------AAG-AC--------AG-catgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|17 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaaatactttataaacgtagtacttagtaaacagcaattaaacatttatctgaaattgattttatttataatataatatcattttaaccttcttgaaaagtttcatcaaaatctatttcgattatcatttctttttattgatttgtaacatacaacccc-ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-TAA------CTCCGCAAGGAGGCTATAG------A-TA-----T-ACTAA---TTTTGTG------AA------TTTATGTA---A------T----G--G-G--GAT-TTTATGTTTTAGATCAG-T-A------------AAA-AGTAAAAATAAG-TAATAGTCGCAATA---GATTTTGATG--AAAAAT---TGAAG-TAAAGTTAGAAAGACGTTGTATTAATTATCAAATAAAA-TATTT-TTT----TAA-AAATA-AATCGATAA--AAATAA-----------ATTGCTGTTTATCTCATTGTTTCGTTTCTAAA----------G----Taaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|18 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacAAGACA-TT-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTC-T-TTTT---AA---A-TTTA-T--T-----T----T-ATTTTATT-GTATAACATAT-------TTTC-CTTGAAAGTTTCATCAAAC-TCTAAACCGACTTTCGCTTCTTTTTATT---GATTTGAAACATAT-A-CTCTCC-C-GTTACCTAA-ATTatttcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|19 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaAATACA-AT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGCA-TGAAACATCG----A----TTTTTCGGTTG-GATTTT---A-----------T--T-----T----T-ATTTTATA-ATA-AACGTCTTTCTACCTCTC-CT----------ATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTGCTTTTTATC---AATTTGAAACATAAAA-C---Caatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|19 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaAAA-TATATTGCAATTATCACTTCTTTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-ATCCA-CAA-AATTA-GTA--TC----TTGTATTGTCTaggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|2 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggatcaacgcgcaaggAATACT-TT-AGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTAATCGATTT----------AATGGA-AT---T--TGTT--T----T-ATTTGATA-ATATAAAACATTTCCACCTATA-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTTCTTTTGTTTTTCGATTTGAAACATACAA-CT--TC-C-AAGATCTAA-ATTCA-CAA-AC-AC-GACACAC----TTTTATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTTATTGGTTTATCTGTATTTTG------ATGTTCAGGTTT-TGTTTCTATGGTGTTTT-CTCTTT---CATTTTCG-CAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAAGT-CTGC-TCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAACAACATACTGCAAG-CCGGTTTTCAAATAATA-----CCCACTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-TAA------ATGAATAAAGAGGGTGTAC------A-CAATACTG-A-T-----TTTTGTG------AA------TTTA---G---G------TTACGG--G-G--G-T-TGTATGTTTCTAATGAA-T-ATTAGTG------ATA-AA--------AA-TGATAATTGCAAC---AGATTTTGATG--AAACTT---TTCAG-GAAAAGTAAAAAGACGTTA-----ATTATCAAAT---A-TT--C-TTTTTTCTTG-AA--A-AATCGAT----AAAGAATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAAT
gi|20 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccga--T-----T----A-ATCTGATA-TTATAACATAGTTTTACCTTTC-CTGGACAGTTTCATCAACA-TCTATTGCGATTATGACTTCTTTTTAAT---GATTCGAAACCCAATA-C---CC-C-G-TGCATCA-ACGCG-CAA-GG-AG-GCTATAC----
gi|20 : CGTGCA-TCA------ACGCGCAAGGAGGCTATAC------AAGA-----A-ACTGA---TTTTGTG------AA------TTT----AC--G------TAAA-G--GTG--G-T-TCTATGCTTCAAATCAA-C-G------------AAA-AA--------AG-TAATAATCGTAACA---GATTTTGATG--ACAATT---TCCAG-GAAAGGTAGAAATATGTTAT----ATATTCAAATAACT-TA--AGTTT----TAT-GA--A-AATTGAT----AAAGAATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|21 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaatacccAAGACT-TT-AGAAACACAACACTCAAATAAACAGCATTAGCACATTG----CGTTCTTTATCGATAA-T-TTTG---AA---A---------T-----G----T-ATT--ATA-ATATA-----TTTCGACCATTC-CTGGAAAGTTTCACCAAAA-TCTATTGCGATCATACCTCCTTCTTATT---GACTTGAAACATAAAG-C---TC-
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaTACTATTGAGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTTAT-GTTTttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|22 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgCACGCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTTATCGAGTT-A-TTCG---AA---ATATA--C--T-----T----T-ATTTGATA--TAAAACATCTTTCTACCTTTC-CTGAAAAGTTTCATC-TAA-TCTAGTGCGATTATCAATTATCTTTATT---TATTTGAAACATACAA-CT--CC-C-GTcagtgt
gi|22 : CGTGCA-TCA------ACGCGCAAATA---TATTCTGTTTTG-GT-----A-ATA-----TTTTGTG------AA------TTTA---G---G------TAACGG--G-G--A-T-TGTTTGTTTCTAAGCAA-T-A------------Agcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|22 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactccTTATT---GCTTAGAAACAAACAATC---CC-C-GTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|23 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactcccgtgcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaataAAAACATTG----AGTTCTTT-----TTT-T-ATTTAAAAA---A-ATAA-T--T-----C----T-ATTTAATA-ATATAACATCTTTCTATCATTT-CTCTTAATTGTCATCACCA-CCGATTGCGATGATCACTTCCTTTTATT---GATTTGAAACACACAA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|24 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaa---T--T-----T----A-AATTGATA-ATATTATATCTTTG-ACTTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-CTTATTGTTATTATCACTTGTTTTTATT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-CTGTTACCTAA-GTTCA-CAA-AA-TC-GCATCAC----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTCTAC--TATTGGT
gi|3 : gataAATACT-T--AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTTATCATTTTGT-TTTT---AA---A-AT---C--T-----C----C-ATTTGATA-ATATAATATCTATGTACCGTTC-CTGAAAAATTAAATCAAAA-TCTATTGTGATTATTACTTCTTTTATTT---GATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-AACCA-CAA-AA-AA-GCATCAT----TTTTATTGTTTCTATAATTTCGTTTAT--AATTGGTTTAACTATATTTTTATATTTATATTTAGATTT-TGTTTCTATGTTT--TT-ATCTTT---CAATTTCG-CAATAAAATTATTGTAATCAACGTTC-AAATACTCTGCCAAACACTTGTTAAAGAATGGAACATCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTA-----TCTATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATACACAAAGAGGCTTTAC------ATGA-----G-A-T-----TTTTGTG------AA----------------------------------G--G-T-TGTAATTTTCAAATCAA-T-A------------CAA-GT---------G-TATTAATCGCAATAC-AGATTTTGATG--AAAATT---TCCAG-GAGAGGTAGAAATATGTTAT----ATTCTCAAATAAAA-TA--A-TTT----TGA-AA--ACAGTCAATAA--AAAAAACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTTGC-TTTCTAAA----------G----TTT----ATAT-AACACATCTACA-GAGA--ATTAAACATAT---AGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTG
gi|4 : AAGACT-TT-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTTATCGATTT-T-ATT----GA---A-ATCTAT--T-----T----T-ACCC-ACA-ATGTTACATCTTTCTACCGTTT-CTGAAAAGTTGAATAAAAAATATTTTGCGATTATCACTTCTTTTTATT---GATTTAAAACATACAATC---CC-C-GTAACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AACGACACAC----TCTT-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----AA---GTTTATCTGTACTTTGATATT------TAGATTTCTGTT-CTATGGTG--TT-TTCTTT---CATTTTTG-CTAAATAATTATTAAAATCAACGTTC-AAGTGCTTT----------------------GAACCACATACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATA-----CCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-TCA------ATGCATAAAAAGGATATACA-----A-GA-----C-ACTGA---TTTTGTG------AA------TTTA---G---G------TAACGG--G-G--G-T-TGTATGTTTTAAATGTA-TAA------------AAA-GA--------AG-TGATAATCGCAAT---AGATATTAATG--AAACTT---TCACG-GAAAAGGAGAAAGATATTAT----ATTATCAAACGCAATTT--G-TTT----T-C-AA--A-AATCAATAG--AAAAA--TTGGTGTTTTATGGCTGtataaaata
gi|5 : ttatcgcatctgTATTGCAATTATCACTTCGTTTTATT---GATTTGAAATATAAAA-C---CC-CAGTTACCTAA-ATTCA-CAA-AA-AAAGCAACAT----TTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AACTAATTTATCTGTATTTTGATATT--------------------CATG-TA--AT-TTCTTT---CAATTTTG-CAATATAATTATTGAGATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAATATTGGAAAAACATACCACAAACCTTGATTCCAAATATTA-----TCCATTCA-ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-TCA------ATGCACAAGGAGGCTATACA-----A-GA-----T-ATTATTGATTTTGTGTATTTAGA------T------A---A------C----G--G-GC-G-T-TGTATATTTCAATTCAA-T-AT-----------AAA-GA--------AG-TGATAATCGCAAT---AGATTGTGATG--AAACTT---TCCAG-AAAATGTCGAAAGATGTTAT----GTTATTAAATCAAA--------------TCA-AA--A-AATCGAT----AAAGAACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------A----TCaagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagtactatatgtaagtcttaatacaccgaat-GTTACCGAA-ATTCA-CAATAA-AACGCAACAC----TTTTATTGTTTGTATGAGTTCGTTTAA--AATGGGTTTATCTGTATTTTGATATT------CAGAACT-CGTTTCTATGGTA--TT-TTCTTT---CAATTCTG-AACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTC-AAGTACTACGTCAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTA-AACATATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTA-----TCCATTCA-AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-TCA------AAGTGCAAGAATTCTTAAC------ACGA-----T-ACTGA---TTTTGTG------GA------TTTA---A---C------TAACAG--A-G--A-T-TGT-TCATTCGAATTCA-T-A------------AAA-AT--------AGCTGGTAATCGCAAAAATATATTTTGATA--AAACTC---TCCAA-GACTGGTAGAAAGATATTTT----ATCACC----AAAA-T-----TTT----TAA--------------AA--AAAAAAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTTGCATTTCTAAA----------G----TCT----ttt
gi|7 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaaAATACT-TT-AGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCATTTT-C-TTTT---AA---A-TT---TA-T-----T----TGATTTGATT-AT-TAATATCTTTTTACCATTC-CGGGAAATGTTCATCAAAA-AA-ATTGCGTGTATCACTTTTTTTTATT---GATTTGAA---------C---CC-C-GTTACCGTA-ATTCA-CAA-AATAC-GCAGCAT----ATCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATTGATTTATCTATATTTTAATGTT------CAGATTG-TGTTTCTATGGTA--AG-TTCTTT---CAATTTCG-CAATACAATTATTAAAATCAACGCTT-GAATATGCCGTTAAACACTTGTTCAAGAGTAAAACATCATAACACTAGCCCGGATTTAAAATATTA-----TCCATTTA-ATGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|8 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccgaT-----TTTTATG------AA------TTTA---G---G------T----AACG-GTTG-T-TGTATGTTTCAAATCAA-T-A------------AAA-GA--------AG-TGATAACCGC-ATT--AGATTTTGATG--ACACTT---TTCAGAAAAAAGTAGAAAGATGCTAT----ATTATCAAATCAAC-TA--A-ATT----TAA-AAATA-AATCGAT----AGAGAACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTTGCGTTTCTAAATTATGTTGGTG----TAT----ATGCAAATG-ATATAC--GAGATCATTAGACACATATGAG---ATGT-TTtcgtgtgtagcgt
gi|8 : ttttatgATAAT-TT-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCTATCGATTTAT-TTTT---AA---A-TT---TAGT-----T----G-ATTTGATA-ATATAGCATCTTTCTACTTTTTTCTGAAAAGTGTCATCAAAA-TCTAATGCGGTTATCACTTCTTTT-ATT---GATTTGAAACATACAA-CA--AC-C-GTTACCTAA-ATTCA-TAA-AA-AC-GCAACAC----TTCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATT-ACTTGTCTGTATTTTGATATG-GTAT-----------TTTCTA-AACA--TTCATGTTTACCCA----CGTCAA-------ATTGGAAT----GTTC-AAGTACTTCGTCAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAACACCATACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTA-----TCCATTCA-ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-TCA------CCGCGCAAcgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|9 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacATTAGTTTATCTGTAATTTGGTATT------CAGATTC-TGTTTCTATGGTA--TT-TTCTTT---GAATTTCG-CAATTAAATTATTGAAATCACCGa
gi|9 : ACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTG-CTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-TCA------ATGAGCAAGGAGGCTATACA-----A-GA-----T-ACTGA---TTTTATG------AATTGAGGT------A---A------C----A--G-G--G-TCTGTACATTTCAAATCAA-T-AT-----------AAA-TA--------AG-TGATAATGGCAAT---AGATTTTGATG--A---TTATGTCCAG-GGAATGTATA---TTGTTAT----ATCATCAAATCAAA---------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTTGCGTTTTTAAA----------G----TCTTTCGATGT--ACA-AC-T-CATGAGACCATTTTCCTAAT---CC---ATAA-TTTGTTTT-GTTTATTGAAGAT----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333333 1111111 66666666 2222222 555555555555555 22222222222222 2222 2222222222222222222222 22 666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11111111 1 111 33 2222 1
lowQualScore : 2 2 4444 55 999 444 5555555555555555555 4444 2 2 2 1 1 2 2 333 99999 2 6 2 33 33 1111111 55 0 33333333 33 2 55 99999 3 3 1 8 0 0 1 88888 2 2 666666 33 3333333 7777 2 0 777777777777777 33 4 55 2 2 2 77777777777777 444 99999999 2 8888 44 555 3 0 7777 2 8888888888888888888888 3 0 00 2 2 888888888888888888888888888888888888888888888888 00 88888888 0 000 33 8888 1 5 1
lowQualScore : . . .... .. ... ... ................... .... . . . . . . . ... ..... . . . .. .. ....... .. . ........ .. . .. ..... . . . . . . . ..... . . ...... .. ....... .... . . ............... .. . .. . . . .............. ... ........ . .... .. ... . . .... . ...................... . . .. . . ................................................ .. ........ . ... .. .... . . .
lowQualScore : 5 5 7777 22 111 111 1111111111111111111 5555 1 7 1 2 2 1 0 333 33333 0 3 4 77 99 1111111 00 2 22222222 99 0 00 11111 6 6 0 0 9 3 0 33333 9 4 888888 44 9999999 8888 4 1 888888888888888 22 7 66 4 4 5 55555555555555 777 77777777 9 0000 22 888 3 2 1111 3 7777777777777777777777 6 5 55 0 0 111111111111111111111111111111111111111111111111 00 88888888 0 777 33 3333 0 5 0
consensus : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T-TTTT---AA---A-AT---T--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-ATTCAC--AA--AA----AC-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATT----TC-AGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ACGCGCAAGGAGG--CTATAC-----A-GA---TACTGA-TTTTGTGAATTTA---GG-----TAAC-G--G-G--G-T-TGTATGTTTCAAATCAA-T-A------------AA---AG--------AAG-TGATAATCGCAAT---AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
Reference ( family-2082 ) : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGNTTT-T-TTTT---AA---A-AT---T--T-----T----T-ATTTGATA-ATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-ATTCAC--AA--AA----AN-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATT-ATATC-AGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATGCGCAAGGAGG--CTATAC-----A-GA---NACTGA-TTTTGTGAATTTA---AG-----T----G--G-G--G-T-TGTATGTTTCAAATCAA-T-A------------AA---AG--------AAG-TGATAATCGCAATA--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
gi|1 : AATATC-AT-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATTATCAATTT-T-TTTT---AA---T-TTA--T--T-----T----T-CTTTGATA-ATATAATATCTTTCTACCATTT-CTGGAAAGTTTCGTCAAAA-TCTATTGCAATGATCACTACTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CCTC-GTAATATAA-ATTCACCAAA--AA----AT-GCAACACTGTTATTGTTTGTATAACTTTGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATAT-----TC-AGATTT-TGATTCAGTTGTATGT--TAT-----TTCA-AGTT-CGCAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGTCAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAACAACTTACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACG-----TTCATTCA-ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-TCG------ATGCACAAGGAGG--CTATA------A-GA---TACTGA-TTGTGTG-------------------------------------TGTTTCAAATCAA-T-AAAAATAAGTAATAA---AG--------AAA-TAATAATCGCAAC---CGATTTTGATG--AAACTT---TCCCG-GAAACGTAGGAAGATGCTAT----ATTCTCAAATAAAG-TAG-A-TTT----CAA-A
gi|10 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagATACT-TT-ATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTAATCGGTTC-T-TTTT---TA---A-AT---T--TATT--T----T-ATTTGATA-GAACAATATCTTTTTACCTTTT-CTGGAAACTTTTATCAAAA-TGTATTGTGAATACCACTTCTT---TAAACTGATTTGAAACTTACAATC---CC-C-GTTACCTAA-ATCCAT--A
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacCGCTGTCGTCCGTGCA---------------------GG--CAATAC-----A-AA--------A-TATTAGG----TA---AC-----A----G--G-G--A-T-TGTATGTTTCAAATCAATT-A------------AA---AG--------GAG-TGATAATCGAAAT---ATATTTTGATG--AAAtgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgTTTCATCAAAA-TATATTTCGATTATCACTCCTT---TTAATTGATTTGAAACATACAATC---CC-T-GTTACCTAATATTtgtgttatacttgtt
gi|11 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaAATACT-TT-AGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----AATT-----------------TT---AA---A--------------------T-AT---ATATATATA---------TACATTTC-CTGGTAAAATTCATCAAAA-TCTATTGTGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTTAAACAAACAA-C---CC-CCGTGACCTAA-ATTCAC--AA--AA----TC-GCAACACTTTTATTGTTGGTATAATTTCGTTTGG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATAT-----TC-AGATTT-TGTTTCTGTGCTATT-----T-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATCAGCTTTC-AAATACTTCGTTAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAACAACATACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCA-----CATATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACTCGTATATCATACCAAAGGAGT--CTCTACA----A-AA---TACTGA-TTTTGTGAATTTA---GGTAACTT----G--G-G--G-T-TGTAtgtgttatacttgtt
gi|12 : tatacaccgt-TT-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTTATC-TTTT-T-TCTA---AA---A-AA---A--TAAAGAT----T-ATTTGATA-TTATAACACCATTCCACCTTTC-CTGGAAGTTTTCATTAAAA-TCTCTTGAGATTATCACCT-TT---TTTATTGATTTGAAACATACAACC---CC-C-GCTACCTAA-ATTCGC--AA--AAGGCTAT-ACAAGA---TTCTGGTTTGTAT
gi|12 : CT-TT-AGAAACGCAATACTTAGATAAACAGCAATAAAACATTA----AGTTCTTCATCGATAT-A-TTTT---AA---A-AT---TATT-----T----T-ATTTGATA-ATATAAAATATTTTTATCTTTT-ATGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTACTGCTATGATCACTTCTT---TTTATTAATTTAAA--ATACAA-A---CC-tttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|13 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaaattcgcaaaaggctatacaagattctATTCAGATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-TCA------ATGCGCATGGAGG--CTATAC-----A--A---TATTGA-TTTTGTGAATTAA---GG-----TAGC-G--G-C--G-T-TGTATGTTTCTAATCAA-TAA------------AA---AG--------AAG-TATTAATTGCAAT---AGATTTTGATGAAAAACTT-----CAG-TGAAGGTAGAAAGGTGTTAT----ATTATTAAATAAAA-TA--A-AAT----AAATAA--A-AATCGAT--AAAGAACTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATTGCG-TTCTAAA----------GGTTTTC-A----GTGT-AA-A-A---ACA-G-------TAAACATTT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|14 : AATACT-TT-AGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTTATCATTTC-T-TTTT---AA----------T--T-----TATTAT-ATTTCATT-ATAAAATCTCTTTCTACCATTC-CTGGAAAGTTTCATCAATA-TCTATTGGGATGATCACTTCTT---TTAATTGATTTGAAAGTTACTC-C---CC-T-GTTACCTAA-ATTTAC--AC--AA----AA-ATAACACTTTTACTGTTTGTATATTTTCGTTTAG--AATTAGTTTACCTGTTTTTT--TA-T-ATAT--AGATTC-TGTTGCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATTAGTGTTC-AAATACTTCGTCAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAACAACAT--------CCCGAATTTCAAATAGTA-----TCCATTTA-ATGAAAAGCCGCTacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|15 : acacaaaGGAACATCATACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGT----CGTGCA-TCA------ATGCAAATGGAGG--CTATATA----A-GA---TACTCA-TTTTGTGAATATA---GG-----TACAAG--G-G--G-T-TTTGTGTTTAAAATTGA-T--------------AG---AG--------AAG-TGA-----GCAACA----GTTTTGATG--AAACTT---TACAA-GAAAGGTGGAAAGATATTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTTAAA-AAA-AA--A-AAT-AAT-GAAAAAAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTTGCGTTTCTAAA----------T----TC-T----
gi|16 : AATACT-TT-ATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACA------------TTTATC-----------T---GA---A-ATTGAT--T-----T----T-ATTT-ATA-ATATAATATCATTTTAACCTTC-TTGAAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTTCGATTATCATTTCTT---TTTATTGATTTGTAACATACAA-C---CC-C-ttttggtatagatagaattgctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|16 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaCATGCG-TCA------ACGGGCAAGGAGG--TTATACGTGTAA-GA---CGCTGA-TATTGTGAATATA---GG-----TAAC-G--GCG--G-T-TAGA---TTC--ATTAA-T-A------------AAGACAG--------AAcatgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|17 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaaatactttataaacgtagtacttagtaaacagcaattaaacatttatctgaaattgattttatttataatataatatcattttaaccttcttgaaaagtttcatcaaaatctatttcgattatcatttctttttattgatttgtaacatacaacccc-ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-TAA------CTCCGCAAGGAGG--CTATAG-----A-TA---TACTAA-TTTTGTGAATTTATGTAA-----T----G--G-G--GAT-TTTATGTTTTAGATCAG-T-A------------AA---AAGTAAAAATAAG-TAATAGTCGCAAT---AGATTTTGATG--AAAAAT---TGAAG-TAAAGTTAGAAAGACGTTGTATTAATTATCAAATAAAA-TATTT-TTT----TAA-AAATA-AATCGAT-AAAAA----TAA------ATTGCTGTTTATCTCATTGTTTCGTTTCTAAA----------G----Taaagagttgacataaaataaatatt
gi|18 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacAAGACA-TT-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTC-T-TTTT---AA---A-TTTA-T--T-----T----T-ATTTTATT-GTATAACATAT-------TTTC-CTTGAAAGTTTCATCAAAC-TCTAAACCGACTTTCGCTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATAT-A-CTCTCC-C-GTTACCTAA-ATTatttcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|19 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaAATACA-AT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGCA-TGAAACATCG----A----TTTTTCGGTTG-GATTTT---A-----------T--T-----T----T-ATTTTATA-ATA-AACGTCTTTCTACCTCTC-CT----------ATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTGCTT---TTTATCAATTTGAAACATAAAA-C---Caatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|19 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaA-TCA------ACGCGCAAGGAGA--CAATAC-----AAGA---TACTAA-TTTTGTGGATTTA---GG-----TAAC-G--G-G--G-T-TGTATGTTTCAAATCAA-TAA------------AA---AG--------AAG-TGATAATTGCAATA--aggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|2 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggAATACT-TT-AGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTAATCGATTT----------AATGGA-AT---T--TGTT--T----T-ATTTGATA-ATATAAAACATTTCCACCTATA-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTTCTTTTGTTTTTCGATTTGAAACATACAA-CT--TC-C-AAGATCTAA-ATTCAC--AA--AC----AC-GACACACTTTTATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTTATTGGTTTATCTGTATTTTGATGT-----TC-AGGTTT-TGTTTCTATGGTGTTTTCTCT-----TTCA-TTTT-CGCAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAAGT-CTGC-TCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAACAACATACTGCAAG-CCGGTTTTCAAATAATA-----CCCACTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-TAA------ATGAATAAAGAGG--GTGTAC-----ACAA---TACTGATTTTTGTGAATTTA---GG-----TTACGG--G-G--G-T-TGTATGTTTCTAATGAA-T-ATTAGTG------AT---AA--------AAA-TGATAATTGCAAC---AGATTTTGATG--AAACTT---TTCAG-GAAAAGTAAAAAGACGTTA-----ATTATCAAAT---A-TT--C-TTTTTTCTTG-AA--A-AATCGAT--AAAGAATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAATtattt
gi|20 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccga--T-----T----A-ATCTGATA-TTATAACATAGTTTTACCTTTC-CTGGACAGTTTCATCAACA-TCTATTGCGATTATGACTTCTT---TTTAATGATTCGAAACCCAATA-C---CC-C-G-TGCATCA-ACGCGC--AA--GG----AG-GCTATAC
gi|20 : CGTGCA-TCA------ACGCGCAAGGAGG--CTATAC-----AAGA---AACTGA-TTTTGTGAATTTA---CG-----TAAA-G--GTG--G-T-TCTATGCTTCAAATCAA-C-G------------AA---AA--------AAG-TAATAATCGTAACA---GATTTTGATG--ACAATT---TCCAG-GAAAGGTAGAAATATGTTAT----ATATTCAAATAACT-TA--AGTTT----TAT-GA--A-AATTGAT--AAAGAATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|21 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaatacccAAGACT-TT-AGAAACACAACACTCAAATAAACAGCATTAGCACATTG----CGTTCTTTATCGATAA-T-TTTG---AA---A---------T-----G----T-ATT--ATA-ATATA-----TTTCGACCATTC-CTGGAAAGTTTCACCAAAA-TCTATTGCGATCATACCTCCTT---CTTATTGACTTGAAACATAAAG-C---TC-
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaTACTATTGAGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTTAT-GTTTttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|22 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgCACGCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTTATCGAGTT-A-TTCG---AA---ATATA--C--T-----T----T-ATTTGATA--TAAAACATCTTTCTACCTTTC-CTGAAAAGTTTCATC-TAA-TCTAGTGCGATTATCAATTATC---TTTATTTATTTGAAACATACAA-CT--CC-C-GTcagtgt
gi|22 : CGTGCA-TCA------ACGCGCAAATATATTCTGTTT-----T-GG---TAAT-A-TTTTGTGAATTTA---GG-----TAACGG--G-G--A-T-TGTTTGTTTCTAAGCAA-T-A------------Agcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|22 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactccTTATTGCTTAGAAACAAACAATC---CC-C-GTTACCTAA-ATTCAC--AA--AA----tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|23 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactcccgtgcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaataAAAACATTG----AGTTCTTT-----TTT-T-ATTTAAAAA---A-ATAA-T--T-----C----T-ATTTAATA-ATATAACATCTTTCTATCATTT-CTCTTAATTGTCATCACCA-CCGATTGCGATGATCACTTCCT---TTTATTGATTTGAAACACACAA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|24 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaa---T--T-----T----A-AATTGATA-ATATTATATCTTTG-ACTTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-CTTATTGTTATTATCACTTGTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-CTGTTACCTAA-GTTCAC--AA--AA----TC-GCATCACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTCTAC--TATTGGT
gi|3 : gataAATACT-T--AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTTATCATTTTGT-TTTT---AA---A-AT---C--T-----C----C-ATTTGATA-ATATAATATCTATGTACCGTTC-CTGAAAAATTAAATCAAAA-TCTATTGTGATTATTACTTCTT---TTATTTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAA-AACCAC--AA--AA----AA-GCATCATTTTTATTGTTTCTATAATTTCGTTTAT--AATTGGTTTAACTATATTTTTATATTTATATTTAGATTT-TGTTTCTATGTTTTTA--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATAAAATTATTGTAATCAACGTTC-AAATACTCTGCCAAACACTTGTTAAAGAATGGAACATCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTA-----TCTATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TCA------ATACACAAAGAGG--CTTTAC-----ATGA---GAT----TTTTGTGAA------------------------G--G-T-TGTAATTTTCAAATCAA-T-A------------CA---AG---------TG-TATTAATCGCAATAC-AGATTTTGATG--AAAATT---TCCAG-GAGAGGTAGAAATATGTTAT----ATTCTCAAATAAAA-TA--A-TTT----TGA-AA--ACAGTCAATAAAAAAAACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTTGC-TTTCTAAA----------G----TT-T----ATAT-AACACATCTACA-GAGA--ATTAAACATAT---AGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTG
gi|4 : AAGACT-TT-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTTATCGATTT-T-ATT----GA---A-ATCTAT--T-----T----T-ACCC-ACA-ATGTTACATCTTTCTACCGTTT-CTGAAAAGTTGAATAAAAAATATTTTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTAAAACATACAATC---CC-C-GTAACCTAA-ATTCAC--AA--AA----AACGACACACTCTT-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----AA---GTTTATCTGTACTTTGATATT-----T-AGATTTCTGTT-CTATGGTGTTT--TCT-----TTCA-TTTT-TGCTAAATAATTATTAAAATCAACGTTC-AAGTGCTTT----------------------GAACCACATACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATA-----CCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-TCA------ATGCATAAAAAGG--ATATACA----A-GA---CACTGA-TTTTGTGAATTTA---GG-----TAACGG--G-G--G-T-TGTATGTTTTAAATGTA-TAA------------AA---AG--------AAG-TGATAATCGCAAT---AGATATTAATG--AAACTT---TCACG-GAAAAGGAGAAAGATATTAT----ATTATCAAACGCAATTT--G-TTT----T-C-AA--A-AATCAAT-AGAAAAA-TTGGTGTTTTATGGCTGtataaaata
gi|5 : ttatcgcatctgTATTGCAATTATCACTTCGT---TTTATTGATTTGAAATATAAAA-C---CC-CAGTTACCTAA-ATTCAC--AA--AA----AAAGCAACATTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AACTAATTTATCTGTATTTTGATATT--------------------CATG-TAATT--TCT-----TTCA-ATTT-TGCAATATAATTATTGAGATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAATATTGGAAAAACATACCACAAACCTTGATTCCAAATATTA-----TCCATTCA-ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-TCA------ATGCACAAGGAGG--CTATACA----A-GATATTATTGA-TTTTGTGTATTTAGATAA-----C----G--G-GC-G-T-TGTATATTTCAATTCAA-T-AT-----------AA---AG--------AAG-TGATAATCGCAAT---AGATTGTGATG--AAACTT---TCCAG-AAAATGTCGAAAGATGTTAT----GTTATTAAATCAAA--------------TCA-AA--A-AATCGAT--AAAGAACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------A----TCATTCG-GTGT------AT-TA----AGAC--TT--ACATAT---AG---aagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagta-GTTACCGAA-ATTCAC--AATAAA----AC-GCAACACTTTTATTGTTTGTATGAGTTCGTTTAA--AATGGGTTTATCTGTATTTTGATATT-----C-AGAACT-CGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTC-TGAACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTC-AAGTACTACGTCAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTA-AACATATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTA-----TCCATTCA-AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-TCA------AAGTGCAAGAATT--CTTAAC-----ACGA---TACTGA-TTTTGTGGATTTA---AC-----TAACAG--A-G--A-T-TGT-TCATTCGAATTCA-T-A------------AA---AA--------TAGCTGGTAATCGCAAAAATATATTTTGATA--AAACTC---TCCAA-GACTGGTAGAAAGATATTTT----ATCACC----AAAA-T-----TTT----TAA-A-------------AAAAAAAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTTGCATTTCTAAA----------G----TC-T----ttt
gi|7 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaaAATACT-TT-AGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCATTTT-C-TTTT---AA---A-TT---TA-T-----T----TGATTTGATT-AT-TAATATCTTTTTACCATTC-CGGGAAATGTTCATCAAAA-AA-ATTGCGTGTATCACTTTTT---TTTATTGATTTGAA---------C---CC-C-GTTACCGTA-ATTCAC--AA--AAT---AC-GCAGCATATCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATTGATTTATCTATATTTTAATGTT-----C-AGATTG-TGTTTCTATGGTAAGT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTAAAATCAACGCTT-GAATATGCCGTTAAACACTTGTTCAAGAGTAAAACATCATAACACTAGCCCGGATTTAAAATATTA-----TCCATTTA-ATGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|8 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccga-TTTTATGAATTTA---GG-----T----AACG-GTTG-T-TGTATGTTTCAAATCAA-T-A------------AA---AG--------AAG-TGATAACCGC-ATT--AGATTTTGATG--ACACTT---TTCAGAAAAAAGTAGAAAGATGCTAT----ATTATCAAATCAAC-TA--A-ATT----TAA-AAATA-AATCGAT--AGAGAACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTTGCGTTTCTAAATTATGTTGGTG----TA-T----ATGCAAATG-ATATAC--GAGATCATTAGACACATATGAG---ATGT-TTtcgtgtgtagcgt
gi|8 : ttttatgATAAT-TT-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCTATCGATTTAT-TTTT---AA---A-TT---TAGT-----T----G-ATTTGATA-ATATAGCATCTTTCTACTTTTTTCTGAAAAGTGTCATCAAAA-TCTAATGCGGTTATCACTTC-T---TTTATTGATTTGAAACATACAA-CA--AC-C-GTTACCTAA-ATTCAT--AA--AA----AC-GCAACACTTCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATT-ACTTGTCTGTATTTTGA------------------------TATGGTATTT--TCTAAACATTCATGTTTACCCACGTCAA--ATTGGAAT----GTTC-AAGTACTTCGTCAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAACACCATACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTA-----TCCATTCA-ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-TCA------CCGCGCAAacgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|9 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacATTAGTTTATCTGTAATTTGGTATT-----C-AGATTC-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTGA-ATTT-CGCAATTAAATTATTGAAATCACCGa
gi|9 : ACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTG-CTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-TCA------ATGAGCAAGGAGG--CTATACA----A-GA---TACTGA-TTTTATGAATTGA---GG-----TAAC-A--G-G--G-TCTGTACATTTCAAATCAA-T-AT-----------AA---AT--------AAG-TGATAATGGCAAT---AGATTTTGATG--A---TTATGTCCAG-GGAATGTATA---TTGTTAT----ATCATCAAATCAAA-------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTTGCGTTTTTAAA----------G----TC-TTTCGATGT--ACA-AC-T-CATGAGACCATTTTCCTAAT---CC---ATAA-TTTGTTTT-GTTTATTGAAGAT----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333 111 11111111 222222222 222222222222 11 22222222222222 2222222222222222222222 22 666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11111111 1 111 33 2222 1
lowQualScore : 2 2 4444 8 99999 444 444 1111111111111111 2 2 2 1 1 2 2 333 6 000 2 7 33 44 44 33333333 55 0 666666666 33 2 55 99999 3 3 1 8 0 0 1 88888 2 2 5555 22 33 33 222222222222 666 2 00 4 4 7 2 77777777777777 444 2 99999999 2 555 33 44 555 3 0 7777 2 8888888888888888888888 3 0 00 2 2 888888888888888888888888888888888888888888888888 00 88888888 0 000 33 8888 1 5 1
lowQualScore : . . .... . ..... ... ... ................ . . . . . . . ... . ... . . .. .. .. ........ .. . ......... .. . .. ..... . . . . . . . ..... . . .... .. .. .. ............ ... . .. . . . . .............. ... . ........ . ... .. .. ... . . .... . ...................... . . .. . . ................................................ .. ........ . ... .. .... . . .
lowQualScore : 5 5 7777 6 22222 111 111 2222222222222222 1 1 7 2 2 1 1 555 0 000 2 1 99 22 66 44444444 00 2 555555555 99 0 00 11111 6 6 0 0 9 3 0 33333 9 4 0000 88 22 44 555555555555 555 4 33 7 7 1 4 55555555555555 777 7 77777777 9 000 99 22 888 3 2 1111 3 7777777777777777777777 6 5 55 0 0 111111111111111111111111111111111111111111111111 00 88888888 0 777 33 3333 0 5 0
consensus : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T--TTTT---AA---A-A---T---T--T---T-T-ATTTGATAATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----A-GA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
Reference ( family-2082 ) : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T--TTTT---AA---A-A---T---T--T---T-T-ATTTGATAATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----A-GA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
gi|1 : AATATC-AT-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATTATCAATTT-T--TTTT---AA---T-T---TA--T--T---T-T-CTTTGATAATATAATATCTTTCTACCATTT-CTGGAAAGTTTCGTCAAAA-TCTATTGCAATGATCACTACTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CCTC-GTAATATAAATT--CACCAAA--AA----A-T-GCAACACTGTTATTGTTTGTATAACTTTGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATA-TT-----CAGATTT-TGATTCAGTTGTATGT--TAT-----TTCA-AGTT-CGCAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGTCAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAACAACTTACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACG-----TTCATTCA-ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-TC----GAT-GCAC--AAGGAGG--CTATA------A-GA---TACTGA---TTGTGTG----------------------------TGTTTCAAATCAAT-AAAAATAAGTAATAA---A-G--------AAA-TAATAATCGC---AAC--CGATTTTGATG--AAACTT---TCCCG-GAAACGTAGGAAGATGCTAT----ATTCTCAAATAAAG-TAG-A-TTT----CAA-A
gi|10 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagATACT-TT-ATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTAATCGGTTC-T--TTTT---TA---A-A---T---T--TATTT-T-ATTTGATAGAACAATATCTTTTTACCTTTT-CTGGAAACTTTTATCAAAA-TGTATTGTGAATACCACTTCTT---TAAACTGATTTGAAACTTACAATC---CC-C-GTTACCTAAATC--CAT--A
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacCGCTGTCGTCCGTGCA----------------------GG--CAATAC-----A-AAA--TA-----------------TTAGGTA-AC--AG-G-GAT-TGTATGTTTCAAATCAATTA------------AA---A-G--------GAG-TGATAATCGA---AAT--ATATTTTGATG--AAAtgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|11 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgAATACT-TT-AGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----A-----------ATTT-T----------A---A-A---T---A--T---A-T-AT------ATATA---------TACATTTC-CTGGTAAAATTCATCAAAA-TCTATTGTGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTTAAACAAACAA-C---CC-CCGTGACCTAAATT--CAC--AA--AA----T-C-GCAACACTTTTATTGTTGGTATAATTTCGTTTGG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATA-TT-----CAGATTT-TGTTTCTGTGCTATT-----T-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATCAGCTTTC-AAATACTTCGTTAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAACAACATACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCA-----CATATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACTCGTATATC-ATACCAAAGGAGT--CTCTACA----A-AA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-ACTTGG-G-G-T-TGTAtgtgttatacttgtt
gi|12 : tatacaccgt-TT-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTTATC--TTT-T--TTCT---AA---A-AAAATAAAG--A---T-T-ATTTGATATTATAACACCATTCCACCTTTC-CTGGAAGTTTTCATTAAAA-TCTCTTGAGATTATCACCT-TT---TTTATTGATTTGAAACATACAACC---CC-C-GCTACCTAAATT--CGC--AA--AAGGCTA-T-ACAAGA---TTCTGGTTTGTAT
gi|12 : CT-TT-AGAAACGCAATACTTAGATAAACAGCAATAAAACATTA----AGTTCTTCATCGATAT-A--TTTT---AA---A-A---T---TATT---T-T-ATTTGATAATATAAAATATTTTTATCTTTT-ATGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTACTGCTATGATCACTTCTT---TTTATTAATTTAAA--ATACAA-A---CC-tttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|13 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaaattcgcaaaaggctatacaagattctATTCAGATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-TC----AAT-GCGC--ATGGAGG--CTATAC-----A--A---TATTGA---TTTTGTGAATTAAGGTA-GC--GG-C-G-T-TGTATGTTTCTAATCAAT-A------------AA---AAG--------AAG-TATTAATTGC---AAT--AGATTTTGATGAAAAACTT-----CAG-TGAAGGTAGAAAGGTGTTAT----ATTATTAAATAAAA-TA--A-AAT----AAATAA--A-AATCGAT--AAAGAACTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATTGCG-TTCTAAA----------GGTTTTC-A----GTGT-AA-A-A---ACA-G-------TAAACATTT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|14 : AATACT-TT-AGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTTATC-ATTT-C--TTTT---TA---A-T---T---TA-T---TAT-ATTTCATTATAAAATCTCTTTCTACCATTC-CTGGAAAGTTTCATCAATA-TCTATTGGGATGATCACTTCTT---TTAATTGATTTGAAAGTTACTC-C---CC-T-GTTACCTAAATTTACAC--AA--AA----A----TAACACTTTTACTGTTTGTATATTTTCGTTTAG--AATTAGTTTACCTGTTTTTTTATATAT------AGATTC-TGTTGCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATTAGTGTTC-AAATACTTCGTCAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAACAACAT--------CCCGAATTTCAAATAGTA-----TCCATTTA-ATGAAAAGCCGCTacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|15 : acacaaaGGAACATCATACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGT----CGTGCA-TC----AAT-GCAA--ATGGAGG--CTATATA----A-GA---TACTCA---TTTTGTGAATATAGGTACAA--GG-G-G-T-TTTGTGTTTAAAATTGAT--------------AG---A-G--------AAG-TGA-----GC---AAC--AG-TTTTGATG--AAACTT---TACAA-GAAAGGTGGAAAGATATTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTTAAA-AAA-AA--A-AAT-AAT-GAAAAAAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTTGCGTTTCTAAA----------T----TC-T----
gi|16 : AATACT-TT-ATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACA------------TTTATC------------T---GA---A-A---TTGAT--T---T-T-ATTT-ATAATATAATATCATTTTAACCTTC-TTGAAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTTCGATTATCATTTCTT---TTTATTGATTTGTAACATACAA-C---CC-C-ttttggtatagatagaattgctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|16 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaCATGCG-TC----AAC-GGGC--AAGGAGG--TTATACGTGTAA-GA---CGCTGA---TATTGTGAATATAGGTA-AC--GGCG-G-T-TAGA---TTC--ATTAAT-A------------AAGACA-G--------AAcatgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|17 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaaatactttataaacgtagtacttagtaaacagcaattaaacatttatctgaaattgattttatttataatataatatcattttaaccttcttgaaaagtttcatcaaaatctatttcgattatcatttctttttattgatttgtaacatacaacccc-ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-T-----AACTCCGC--AAGGAGG--CTATAG-----A-TA---TACTAA---TTTTGTGAATTTATGTA-AT--GG-G-GAT-TTTATGTTTTAGATCAGT-A------------AA---A-AGTAAAAATAAG-TAATAGTCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAAAAT---TGAAG-TAAAGTTAGAAAGACGTTGTATTAATTATCAAATAAAA-TATTT-TTT----TAA-AAATA-AATCGAT-AAAAA----TAA------ATTGCTGTTTATCTCATTGTTTCGTTTCTAAA----------G----Taaagagttgacataaaataaatatt
gi|18 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacAAGACA-TT-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTC-T--TTTT---AA---A-T---TTA-T--T---T-T-ATTTTATTGTATAACATAT-------TTTC-CTTGAAAGTTTCATCAAAC-TCTAAACCGACTTTCGCTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATAT-A-CTCTCC-C-GTTACCTAAATT--atttcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|19 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaAATACA-AT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGCA-TGAAACATCG----A----TTTTTCGGTTG-GA-TTTT---A--------------T--T---T-T-ATTTTATAATA-AACGTCTTTCTACCTCTC-CT----------ATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTGCTT---TTTATCAATTTGAAACATAAAA-C---Caatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|19 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGA--CAATAC-----AAGA---TACTAA---TTTTGTGGATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAATAA------------AA---A-G--------AAG-TGATAATTGC---AAT--ATATTTaggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|2 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggAATACT-TT-AGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTAATCGATTT-----------AATGGA-A---T---T--TGTTT-T-ATTTGATAATATAAAACATTTCCACCTATA-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTTCTTTTGTTTTTCGATTTGAAACATACAA-CT--TC-C-AAGATCTAAATT--CAC--AA--AC----A-C-GACACACTTTTATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTTATTGGTTTATCTGTATTTTGATG-TT-----CAGGTTT-TGTTTCTATGGTGTTTTCTCT-----TTCA-TTTT-CGCAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAAGT-CTGC-TCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAACAACATACTGCAAG-CCGGTTTTCAAATAATA-----CCCACTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-TA----AAT-GAAT--AAAGAGG--GTGTAC-----ACAA---TACTGAT--TTTTGTGAATTTAGGTT-ACG-GG-G-G-T-TGTATGTTTCTAATGAAT-ATTAGTG------AT---A-A--------AAA-TGATAATTGC---AAC--AGATTTTGATG--AAACTT---TTCAG-GAAAAGTAAAAAGACGTTA-----ATTATCAAAT---A-TT--C-TTTTTTCTTG-AA--A-AATCGAT--AAAGAATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAAT
gi|20 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccga--T---T-A-ATCTGATATTATAACATAGTTTTACCTTTC-CTGGACAGTTTCATCAACA-TCTATTGCGATTATGACTTCTT---TTTAATGATTCGAAACCCAATA-C---CC-C-GT
gi|20 : CGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----AAGA---AACTGA---TTTTGTGAATTTACGTA-AA--GGTG-G-T-TCTATGCTTCAAATCAAC-G------------AA---A-A--------AAG-TAATAATCGT---AAC--AGATTTTGATG--ACAATT---TCCAG-GAAAGGTAGAAATATGTTAT----ATATTCAAATAACT-TA--AGTTT----TAT-GA--A-AATTGAT--AAAGAATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTgcatcaacgcgcaaggaggctatacaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|21 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaatacccAAGACT-TT-AGAAACACAACACTCAAATAAACAGCATTAGCACATTG----CGTTCTTTATCGATAA-T--TTTG---AA---A------------T---G-T-ATT--ATAATATA-----TTTCGACCATTC-CTGGAAAGTTTCACCAAAA-TCTATTGCGATCATACCTCCTT---CTTATTGACTTGAAACATAAAG-C---TC-
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaTACTATTGAGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTTATttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|22 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgaaacCACGCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTTATCGAGTT-A--TTCG---AA---ATA---TA--C--T---T-T-ATTTGATA-TAAAACATCTTTCTACCTTTC-CTGAAAAGTTTCATC-TAA-TCTAGTGCGATTATCAATTATC---TTTATTTATTTGAAACATACAA-CT--CC-C-GTcagtgt
gi|22 : CGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAATATATTCTGTTT-----T-GG---TAAT-A---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-GAT-TGTTTGTTTCTAAGCAAT-A------------Agcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|23 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactccAAAACATTG----AGTTCTTT-----TTT-T--ATTTAAAAA---A-A---TAA-T--T---C-T-ATTTAATAATATAACATCTTTCTATCATTT-CTCTTAATTGTCATCACCA-CCGATTGCGATGATCACTTCCT---TTTATTGATTTGAAACACACAA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|24 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaa---T--T---T-A-AATTGATAATATTATATCTTTG-ACTTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-CTTATTGTTATTATCACTTGTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-CTGTTACCTAAGTT--CAC--AA--AA----T-C-GCATCACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTCTAC--TATTGGT
gi|3 : gataAATACT-T--AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTTATC-ATTT-TGTTTTT---AA---A-A---T---C--T---C-C-ATTTGATAATATAATATCTATGTACCGTTC-CTGAAAAATTAAATCAAAA-TCTATTGTGATTATTACTTCTT---TTATTTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAAAC--CAC--AA--AA----A-A-GCATCATTTTTATTGTTTCTATAATTTCGTTTAT--AATTGGTTTAACTATATTTTTATATTTATATTTAGATTT-TGTTTCTATGTTTTTA--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATAAAATTATTGTAATCAACGTTC-AAATACTCTGCCAAACACTTGTTAAAGAATGGAACATCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTA-----TCTATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAT-ACAC--AAAGAGG--CTTTAC-----A---------TGAGATTTTTGTGAA----------------G-G-T-TGTAATTTTCAAATCAAT-A------------CA---A-G---------TG-TATTAATCGC---AATACAGATTTTGATG--AAAATT---TCCAG-GAGAGGTAGAAATATGTTAT----ATTCTCAAATAAAA-TA--A-TTT----TGA-AA--ACAGTCAATAAAAAAAACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTTGC-TTTCTAAA----------G----TT-T----ATAT-AACACATCTACA-GAGA--ATTAAACATAT---AGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTG
gi|4 : AAGACT-TT-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTTATCGATTT-T--ATT----GA---A-A---TCTAT--T---T-T-ACCC-ACAATGTTACATCTTTCTACCGTTT-CTGAAAAGTTGAATAAAAAATATTTTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTAAAACATACAATC---CC-C-GTAACCTAAATT--CAC--AA--AA----AAC-GACACACTCTT-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----AA---GTTTATCTGTACTTTGATATTT------AGATTTCTGTT-CTATGGTGTTT--TCT-----TTCA-TTTT-TGCTAAATAATTATTAAAATCAACGTTC-AAGTGCTTT----------------------GAACCACATACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATA-----CCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-TC----AAT-GCAT--AAAAAGG--ATATACA----A-GA---CACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-ACG-GG-G-G-T-TGTATGTTTTAAATGTATAA------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATATTAATG--AAACTT---TCACG-GAAAAGGAGAAAGATATTAT----ATTATCAAACGCAATTT--G-TTT----T-C-AA--A-AATCAAT-AGAAAAA-TTGGTGTTTTATGGCTGtataaaata
gi|5 : ttatcgcatctgTATTGCAATTATCACTTCGT---TTTATTGATTTGAAATATAAAA-C---CC-CAGTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-AAGCAACATTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AACTAATTTATCTGTATTTTGATATTC--------------------ATG-TAATT--TCT-----TTCA-ATTT-TGCAATATAATTATTGAGATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAATATTGGAAAAACATACCACAAACCTTGATTCCAAATATTA-----TCCATTCA-ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-TC----AAT-GCAC--AAGGAGG--CTATACA----A-GATATTATTGA---TTTTGTGTATTTAGATA-AC--GG-GCG-T-TGTATATTTCAATTCAAT-AT-----------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTGTGATG--AAACTT---TCCAG-AAAATGTCGAAAGATGTTAT----GTTATTAAATCAAA--------------TCA-AA--A-AATCGAT--AAAGAACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------A----TCATTCG-GTGT------AT-TA----AGAC--TT--ACATAT---AG---aagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagta-GTTACCGAAATT--CAC--AATAAA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATGAGTTCGTTTAA--AATGGGTTTATCTGTATTTTGATATT------CAGAACT-CGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTC-TGAACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTC-AAGTACTACGTCAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTA-AACATATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTA-----TCCATTCA-AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-TC----AAA-GTGC--AAGAATT--CTTAAC-----ACGA---TACTGA---TTTTGTGGATTTAACTA-ACA-GA-G-A-T-TGT-TCATTCGAATTCAT-A------------AA---A-A--------TAGCTGGTAATCGCAAAAAT--ATATTTTGATA--AAACTC---TCCAA-GACTGGTAGAAAGATATTTT----ATCACC----AAAA-T-----TTT----TAA-A-------------AAAAAAAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTTGCATTTCTAAA----------G----TC-T----ttt
gi|7 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaaAATACT-TT-AGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATC-ATTT-T--CTTT---TA---A-A---T---T--TAT-T-TGATTTGATTAT-TAATATCTTTTTACCATTC-CGGGAAATGTTCATCAAAA-AA-ATTGCGTGTATCACTTTTT---TTTATTGATTTGAA---------C---CC-C-GTTACCGTAATT--CAC--AA--AAT---A-C-GCAGCATATCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATTGATTTATCTATATTTTAATGTT------CAGATTG-TGTTTCTATGGTAAGT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTAAAATCAACGCTT-GAATATGCCGTTAAACACTTGTTCAAGAGTAAAACATCATAACACTAGCCCGGATTTAAAATATTA-----TCCATTTA-ATGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|8 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccga---TTTTATGAATTTAGGTA-AC--GG-TTG-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAACCGC---ATT--AGATTTTGATG--ACACTT---TTCAGAAAAAAGTAGAAAGATGCTAT----ATTATCAAATCAAC-TA--A-ATT----TAA-AAATA-AATCGAT--AGAGAACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTTGCGTTTCTAAATTATGTTGGTG----TA-T----ATGCAAATG-ATATAC--GAGATCATTAGACACATATGAG---ATGT-TTtcgtgtgtagcgt
gi|8 : ttttatgATAAT-TT-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCTATCGATTTAT--TTTT---AA---A-T---T---TAGT---T-G-ATTTGATAATATAGCATCTTTCTACTTTTTTCTGAAAAGTGTCATCAAAA-TCTAATGCGGTTATCACTTC-T---TTTATTGATTTGAAACATACAA-CA--AC-C-GTTACCTAAATT--CAT--AA--AA----A-C-GCAACACTTCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATT-ACTTGTCTGTATTTTGA------------------------TATGGTATTT--TCTAAACATTCATGTTTACCCACGTCAA--ATTGGAAT----GTTC-AAGTACTTCGTCAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAACACCATACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTA-----TCCATTCA-ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-TC----ACC-GCGC--AAacgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|9 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacATTAGTTTATCTGTAATTTGGTATT------CAGATTC-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTGA-ATTT-CGCAATTAAATTATTGAAATCACCGa
gi|9 : ACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTG-CTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-TC----AAT-GAGC--AAGGAGG--CTATACA----A-GA---TACTGA---TTTTATGAATTGAGGTA-AC--AG-G-G-TCTGTACATTTCAAATCAAT-AT-----------AA---A-T--------AAG-TGATAATGGC---AAT--AGATTTTGATG--A---TTATGTCCAG-GGAATGTATA---TTGTTAT----ATCATCAAATCAAA-------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTTGCGTTTTTAAA----------G----TC-TTTCGATGT--ACA-AC-T-CATGAGACCATTTTCCTAAT---CC---ATAA-TTTGTTTT-GTTTATTGAAGAT----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA
Alignments
lowQualScore : 3333333333333333 111 11111111 222222222 222222222222 11 22222222222222 2222222222222222222222 22 666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11111111 1 111 33 2222 1
lowQualScore : 2 2 4444 8 99999 444 444 1111111111111111 2 2 2 1 1 2 2 333 6 000 2 7 33 44 44 33333333 55 0 666666666 33 2 55 99999 3 3 1 8 0 0 1 88888 2 2 5555 22 33 33 222222222222 666 2 00 4 4 7 2 77777777777777 444 2 99999999 2 555 33 44 555 3 0 7777 2 8888888888888888888888 3 0 00 2 2 888888888888888888888888888888888888888888888888 00 88888888 0 000 33 8888 1 5 1
lowQualScore : . . .... . ..... ... ... ................ . . . . . . . ... . ... . . .. .. .. ........ .. . ......... .. . .. ..... . . . . . . . ..... . . .... .. .. .. ............ ... . .. . . . . .............. ... . ........ . ... .. .. ... . . .... . ...................... . . .. . . ................................................ .. ........ . ... .. .... . . .
lowQualScore : 5 5 7777 6 22222 111 111 2222222222222222 1 1 7 2 2 1 1 555 0 000 2 1 99 22 66 44444444 00 2 555555555 99 0 00 11111 6 6 0 0 9 3 0 33333 9 4 0000 88 22 44 555555555555 555 4 33 7 7 1 4 55555555555555 777 7 77777777 9 000 99 22 888 3 2 1111 3 7777777777777777777777 6 5 55 0 0 111111111111111111111111111111111111111111111111 00 88888888 0 777 33 3333 0 5 0
consensus : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T--TTTT---AA---A-A---T---T--T---T-T-ATTTGATAATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----A-GA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
Reference ( family-2082 ) : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T--TTTT---AA---A-A---T---T--T---T-T-ATTTGATAATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----A-GA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
gi|1 : AATATC-AT-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATTATCAATTT-T--TTTT---AA---T-T---TA--T--T---T-T-CTTTGATAATATAATATCTTTCTACCATTT-CTGGAAAGTTTCGTCAAAA-TCTATTGCAATGATCACTACTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CCTC-GTAATATAAATT--CACCAAA--AA----A-T-GCAACACTGTTATTGTTTGTATAACTTTGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATA-TT-----CAGATTT-TGATTCAGTTGTATGT--TAT-----TTCA-AGTT-CGCAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGTCAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAACAACTTACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACG-----TTCATTCA-ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-TC----GAT-GCAC--AAGGAGG--CTATA------A-GA---TACTGA---TTGTGTG----------------------------TGTTTCAAATCAAT-AAAAATAAGTAATAA---A-G--------AAA-TAATAATCGC---AAC--CGATTTTGATG--AAACTT---TCCCG-GAAACGTAGGAAGATGCTAT----ATTCTCAAATAAAG-TAG-A-TTT----CAA-A
gi|10 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagATACT-TT-ATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTAATCGGTTC-T--TTTT---TA---A-A---T---T--TATTT-T-ATTTGATAGAACAATATCTTTTTACCTTTT-CTGGAAACTTTTATCAAAA-TGTATTGTGAATACCACTTCTT---TAAACTGATTTGAAACTTACAATC---CC-C-GTTACCTAAATC--CAT--A
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacCGCTGTCGTCCGTGCA----------------------GG--CAATAC-----A-AAA--TA-----------------TTAGGTA-AC--AG-G-GAT-TGTATGTTTCAAATCAATTA------------AA---A-G--------GAG-TGATAATCGA---AAT--ATATTTTGATG--AAAtgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|11 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgAATACT-TT-AGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----A-----------ATTT-T----------A---A-A---T---A--T---A-T-AT------ATATA---------TACATTTC-CTGGTAAAATTCATCAAAA-TCTATTGTGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTTAAACAAACAA-C---CC-CCGTGACCTAAATT--CAC--AA--AA----T-C-GCAACACTTTTATTGTTGGTATAATTTCGTTTGG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATA-TT-----CAGATTT-TGTTTCTGTGCTATT-----T-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATCAGCTTTC-AAATACTTCGTTAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAACAACATACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCA-----CATATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACTCGTATATC-ATACCAAAGGAGT--CTCTACA----A-AA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-ACTTGG-G-G-T-TGTAtgtgttatacttgtt
gi|12 : tatacaccgt-TT-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTTATC--TTT-T--TTCT---AA---A-AAAATAAAG--A---T-T-ATTTGATATTATAACACCATTCCACCTTTC-CTGGAAGTTTTCATTAAAA-TCTCTTGAGATTATCACCT-TT---TTTATTGATTTGAAACATACAACC---CC-C-GCTACCTAAATT--CGC--AA--AAGGCTA-T-ACAAGA---TTCTGGTTTGTAT
gi|12 : CT-TT-AGAAACGCAATACTTAGATAAACAGCAATAAAACATTA----AGTTCTTCATCGATAT-A--TTTT---AA---A-A---T---TATT---T-T-ATTTGATAATATAAAATATTTTTATCTTTT-ATGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTACTGCTATGATCACTTCTT---TTTATTAATTTAAA--ATACAA-A---CC-tttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|13 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaaattcgcaaaaggctatacaagattctATTCAGATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-TC----AAT-GCGC--ATGGAGG--CTATAC-----A--A---TATTGA---TTTTGTGAATTAAGGTA-GC--GG-C-G-T-TGTATGTTTCTAATCAAT-A------------AA---AAG--------AAG-TATTAATTGC---AAT--AGATTTTGATGAAAAACTT-----CAG-TGAAGGTAGAAAGGTGTTAT----ATTATTAAATAAAA-TA--A-AAT----AAATAA--A-AATCGAT--AAAGAACTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATTGCG-TTCTAAA----------GGTTTTC-A----GTGT-AA-A-A---ACA-G-------TAAACATTT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|14 : AATACT-TT-AGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTTATC-ATTT-C--TTTT---TA---A-T---T---TA-T---TAT-ATTTCATTATAAAATCTCTTTCTACCATTC-CTGGAAAGTTTCATCAATA-TCTATTGGGATGATCACTTCTT---TTAATTGATTTGAAAGTTACTC-C---CC-T-GTTACCTAAATTTACAC--AA--AA----A----TAACACTTTTACTGTTTGTATATTTTCGTTTAG--AATTAGTTTACCTGTTTTTTTATATAT------AGATTC-TGTTGCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATTAGTGTTC-AAATACTTCGTCAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAACAACAT--------CCCGAATTTCAAATAGTA-----TCCATTTA-ATGAAAAGCCGCTacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|15 : acacaaaGGAACATCATACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGT----CGTGCA-TC----AAT-GCAA--ATGGAGG--CTATATA----A-GA---TACTCA---TTTTGTGAATATAGGTACAA--GG-G-G-T-TTTGTGTTTAAAATTGAT--------------AG---A-G--------AAG-TGA-----GC---AAC--AG-TTTTGATG--AAACTT---TACAA-GAAAGGTGGAAAGATATTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTTAAA-AAA-AA--A-AAT-AAT-GAAAAAAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTTGCGTTTCTAAA----------T----TC-T----
gi|16 : AATACT-TT-ATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACA------------TTTATC------------T---GA---A-A---TTGAT--T---T-T-ATTT-ATAATATAATATCATTTTAACCTTC-TTGAAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTTCGATTATCATTTCTT---TTTATTGATTTGTAACATACAA-C---CC-C-ttttggtatagatagaattgctaagttatttattatacatgctcaaaatcttgtgtttttcacagaatagttttttatgt
gi|16 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaCATGCG-TC----AAC-GGGC--AAGGAGG--TTATACGTGTAA-GA---CGCTGA---TATTGTGAATATAGGTA-AC--GGCG-G-T-TAGA---TTC--ATTAAT-A------------AAGACA-G--------AAcatgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|17 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaaatactttataaacgtagtacttagtaaacagcaattaaacatttatctgaaattgattttatttataatataatatcattttaaccttcttgaaaagtttcatcaaaatctatttcgattatcatttctttttattgatttgtaacatacaacccc-ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-T-----AACTCCGC--AAGGAGG--CTATAG-----A-TA---TACTAA---TTTTGTGAATTTATGTA-AT--GG-G-GAT-TTTATGTTTTAGATCAGT-A------------AA---A-AGTAAAAATAAG-TAATAGTCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAAAAT---TGAAG-TAAAGTTAGAAAGACGTTGTATTAATTATCAAATAAAA-TATTT-TTT----TAA-AAATA-AATCGAT-AAAAA----TAA------ATTGCTGTTTATCTCATTGTTTCGTTTCTAAA----------G----Taaagagttgacataaaataaatatt
gi|18 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacAAGACA-TT-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTC-T--TTTT---AA---A-T---TTA-T--T---T-T-ATTTTATTGTATAACATAT-------TTTC-CTTGAAAGTTTCATCAAAC-TCTAAACCGACTTTCGCTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATAT-A-CTCTCC-C-GTTACCTAAATT--atttcggtgtatgttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|19 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaAATACA-AT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGCA-TGAAACATCG----A----TTTTTCGGTTG-GA-TTTT---A--------------T--T---T-T-ATTTTATAATA-AACGTCTTTCTACCTCTC-CT----------ATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTGCTT---TTTATCAATTTGAAACATAAAA-C---Caatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|19 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGA--CAATAC-----AAGA---TACTAA---TTTTGTGGATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAATAA------------AA---A-G--------AAG-TGATAATTGC---AAT--ATATTTaggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|2 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggAATACT-TT-AGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTAATCGATTT-----------AATGGA-A---T---T--TGTTT-T-ATTTGATAATATAAAACATTTCCACCTATA-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTTCTTTTGTTTTTCGATTTGAAACATACAA-CT--TC-C-AAGATCTAAATT--CAC--AA--AC----A-C-GACACACTTTTATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTTATTGGTTTATCTGTATTTTGATG-TT-----CAGGTTT-TGTTTCTATGGTGTTTTCTCT-----TTCA-TTTT-CGCAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAAGT-CTGC-TCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAACAACATACTGCAAG-CCGGTTTTCAAATAATA-----CCCACTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-TA----AAT-GAAT--AAAGAGG--GTGTAC-----ACAA---TACTGAT--TTTTGTGAATTTAGGTT-ACG-GG-G-G-T-TGTATGTTTCTAATGAAT-ATTAGTG------AT---A-A--------AAA-TGATAATTGC---AAC--AGATTTTGATG--AAACTT---TTCAG-GAAAAGTAAAAAGACGTTA-----ATTATCAAAT---A-TT--C-TTTTTTCTTG-AA--A-AATCGAT--AAAGAATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAAT
gi|20 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccga--T---T-A-ATCTGATATTATAACATAGTTTTACCTTTC-CTGGACAGTTTCATCAACA-TCTATTGCGATTATGACTTCTT---TTTAATGATTCGAAACCCAATA-C---CC-C-GT
gi|20 : CGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----AAGA---AACTGA---TTTTGTGAATTTACGTA-AA--GGTG-G-T-TCTATGCTTCAAATCAAC-G------------AA---A-A--------AAG-TAATAATCGT---AAC--AGATTTTGATG--ACAATT---TCCAG-GAAAGGTAGAAATATGTTAT----ATATTCAAATAACT-TA--AGTTT----TAT-GA--A-AATTGAT--AAAGAATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTgcatcaacgcgcaaggaggctatacaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|21 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaatacccAAGACT-TT-AGAAACACAACACTCAAATAAACAGCATTAGCACATTG----CGTTCTTTATCGATAA-T--TTTG---AA---A------------T---G-T-ATT--ATAATATA-----TTTCGACCATTC-CTGGAAAGTTTCACCAAAA-TCTATTGCGATCATACCTCCTT---CTTATTGACTTGAAACATAAAG-C---TC-
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaTACTATTGAGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTTATttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|22 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgaaacCACGCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTTATCGAGTT-A--TTCG---AA---ATA---TA--C--T---T-T-ATTTGATA-TAAAACATCTTTCTACCTTTC-CTGAAAAGTTTCATC-TAA-TCTAGTGCGATTATCAATTATC---TTTATTTATTTGAAACATACAA-CT--CC-C-GTcagtgt
gi|22 : CGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAATATATTCTGTTT-----T-GG---TAAT-A---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-GAT-TGTTTGTTTCTAAGCAAT-A------------Agcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|23 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactccAAAACATTG----AGTTCTTT-----TTT-T--ATTTAAAAA---A-A---TAA-T--T---C-T-ATTTAATAATATAACATCTTTCTATCATTT-CTCTTAATTGTCATCACCA-CCGATTGCGATGATCACTTCCT---TTTATTGATTTGAAACACACAA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|24 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaa---T--T---T-A-AATTGATAATATTATATCTTTG-ACTTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-CTTATTGTTATTATCACTTGTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-CTGTTACCTAAGTT--CAC--AA--AA----T-C-GCATCACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTCTAC--TATTGGT
gi|3 : gataAATACT-T--AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTTATC-ATTT-TGTTTTT---AA---A-A---T---C--T---C-C-ATTTGATAATATAATATCTATGTACCGTTC-CTGAAAAATTAAATCAAAA-TCTATTGTGATTATTACTTCTT---TTATTTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAAAC--CAC--AA--AA----A-A-GCATCATTTTTATTGTTTCTATAATTTCGTTTAT--AATTGGTTTAACTATATTTTTATATTTATATTTAGATTT-TGTTTCTATGTTTTTA--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATAAAATTATTGTAATCAACGTTC-AAATACTCTGCCAAACACTTGTTAAAGAATGGAACATCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTA-----TCTATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAT-ACAC--AAAGAGG--CTTTAC-----A---------TGAGATTTTTGTGAA----------------G-G-T-TGTAATTTTCAAATCAAT-A------------CA---A-G---------TG-TATTAATCGC---AATACAGATTTTGATG--AAAATT---TCCAG-GAGAGGTAGAAATATGTTAT----ATTCTCAAATAAAA-TA--A-TTT----TGA-AA--ACAGTCAATAAAAAAAACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTTGC-TTTCTAAA----------G----TT-T----ATAT-AACACATCTACA-GAGA--ATTAAACATAT---AGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTG
gi|4 : AAGACT-TT-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTTATCGATTT-T--ATT----GA---A-A---TCTAT--T---T-T-ACCC-ACAATGTTACATCTTTCTACCGTTT-CTGAAAAGTTGAATAAAAAATATTTTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTAAAACATACAATC---CC-C-GTAACCTAAATT--CAC--AA--AA----AAC-GACACACTCTT-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----AA---GTTTATCTGTACTTTGATATTT------AGATTTCTGTT-CTATGGTGTTT--TCT-----TTCA-TTTT-TGCTAAATAATTATTAAAATCAACGTTC-AAGTGCTTT----------------------GAACCACATACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATA-----CCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-TC----AAT-GCAT--AAAAAGG--ATATACA----A-GA---CACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-ACG-GG-G-G-T-TGTATGTTTTAAATGTATAA------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATATTAATG--AAACTT---TCACG-GAAAAGGAGAAAGATATTAT----ATTATCAAACGCAATTT--G-TTT----T-C-AA--A-AATCAAT-AGAAAAA-TTGGTGTTTTATGGCTGtataaaata
gi|5 : ttatcgcatctgTATTGCAATTATCACTTCGT---TTTATTGATTTGAAATATAAAA-C---CC-CAGTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-AAGCAACATTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AACTAATTTATCTGTATTTTGATATTC--------------------ATG-TAATT--TCT-----TTCA-ATTT-TGCAATATAATTATTGAGATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAATATTGGAAAAACATACCACAAACCTTGATTCCAAATATTA-----TCCATTCA-ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-TC----AAT-GCAC--AAGGAGG--CTATACA----A-GATATTATTGA---TTTTGTGTATTTAGATA-AC--GG-GCG-T-TGTATATTTCAATTCAAT-AT-----------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTGTGATG--AAACTT---TCCAG-AAAATGTCGAAAGATGTTAT----GTTATTAAATCAAA--------------TCA-AA--A-AATCGAT--AAAGAACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------A----TCATTCG-GTGT------AT-TA----AGAC--TT--ACATAT---AG---aagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagta-GTTACCGAAATT--CAC--AATAAA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATGAGTTCGTTTAA--AATGGGTTTATCTGTATTTTGATATT------CAGAACT-CGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTC-TGAACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTC-AAGTACTACGTCAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTA-AACATATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTA-----TCCATTCA-AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-TC----AAA-GTGC--AAGAATT--CTTAAC-----ACGA---TACTGA---TTTTGTGGATTTAACTA-ACA-GA-G-A-T-TGT-TCATTCGAATTCAT-A------------AA---A-A--------TAGCTGGTAATCGCAAAAAT--ATATTTTGATA--AAACTC---TCCAA-GACTGGTAGAAAGATATTTT----ATCACC----AAAA-T-----TTT----TAA-A-------------AAAAAAAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTTGCATTTCTAAA----------G----TC-T----ttt
gi|7 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaaAATACT-TT-AGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATC-ATTT-T--CTTT---TA---A-A---T---T--TAT-T-TGATTTGATTAT-TAATATCTTTTTACCATTC-CGGGAAATGTTCATCAAAA-AA-ATTGCGTGTATCACTTTTT---TTTATTGATTTGAA---------C---CC-C-GTTACCGTAATT--CAC--AA--AAT---A-C-GCAGCATATCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATTGATTTATCTATATTTTAATGTT------CAGATTG-TGTTTCTATGGTAAGT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTAAAATCAACGCTT-GAATATGCCGTTAAACACTTGTTCAAGAGTAAAACATCATAACACTAGCCCGGATTTAAAATATTA-----TCCATTTA-ATGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|8 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccga---TTTTATGAATTTAGGTA-AC--GG-TTG-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAACCGC---ATT--AGATTTTGATG--ACACTT---TTCAGAAAAAAGTAGAAAGATGCTAT----ATTATCAAATCAAC-TA--A-ATT----TAA-AAATA-AATCGAT--AGAGAACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTTGCGTTTCTAAATTATGTTGGTG----TA-T----ATGCAAATG-ATATAC--GAGATCATTAGACACATATGAG---ATGT-TTtcgtgtgtagcgt
gi|8 : ttttatgATAAT-TT-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCTATCGATTTAT--TTTT---AA---A-T---T---TAGT---T-G-ATTTGATAATATAGCATCTTTCTACTTTTTTCTGAAAAGTGTCATCAAAA-TCTAATGCGGTTATCACTTC-T---TTTATTGATTTGAAACATACAA-CA--AC-C-GTTACCTAAATT--CAT--AA--AA----A-C-GCAACACTTCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATT-ACTTGTCTGTATTTTGA------------------------TATGGTATTT--TCTAAACATTCATGTTTACCCACGTCAA--ATTGGAAT----GTTC-AAGTACTTCGTCAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAACACCATACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTA-----TCCATTCA-ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-TC----ACC-GCGC--AAacgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|9 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacATTAGTTTATCTGTAATTTGGTATT------CAGATTC-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTGA-ATTT-CGCAATTAAATTATTGAAATCACCGa
gi|9 : ACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTG-CTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-TC----AAT-GAGC--AAGGAGG--CTATACA----A-GA---TACTGA---TTTTATGAATTGAGGTA-AC--AG-G-G-TCTGTACATTTCAAATCAAT-AT-----------AA---A-T--------AAG-TGATAATGGC---AAT--AGATTTTGATG--A---TTATGTCCAG-GGAATGTATA---TTGTTAT----ATCATCAAATCAAA-------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTTGCGTTTTTAAA----------G----TC-TTTCGATGT--ACA-AC-T-CATGAGACCATTTTCCTAAT---CC---ATAA-TTTGTTTT-GTTTATTGAAGAT----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
blockSeqs : A G GAAA G TGTT AAA TGG AAAATAAAGA A G G T T T A TTG T TCT . C TA . TA GGCTAT TT TTTATATTT TC T TC AAACA T A C G T CGTTT G C GTAT CT CA TT GTGTAAGA GAT C TT C C A C ATTAGTG GAC A GTAAAAAT C AAA AC AA ATG A ATTA A TATTTTTTTAAAAAT C AA A C TTATGTTGGTGTATATGCAAATGATATACGAGATCA AA AGGGC A AA GA GTTA T A G
blockSeqs : . . . G GAT . . ATTTATT . . G C T . . . C T . T . . . AAC . TTC T G . . . . C . G . . . . C . . AAGATAT T . G T T A . TA . . . . . . . . . . A TTCTTTTTTCTTGAA . G T T GTCTTTCGATGTACAACTCATGAGACCA AG ATGAG . GT . .
blockSeqs : . . . G ATT . . ATTGATT . . G A T . . . T T . A . . . AAA . TAT C T . . . . G . G . . . . T . . AAAA . . G . . A . AA . . . . . . . . . . A TAATTTAAAAAAAA . A T A GTTTATATAACACATCTACAGAGAA TT AG .
blockSeqs : . . . G TT . . ATTTGTT . . C T T . . . . A . . . . . TAC . TTC T T . . . . A . A . . . . T . . AAAA . . A . . . . AA . . . . . . . . . . A TAAATTTAAAAAT . A C A ATCATTCGGTGTATTAAGAC . CC
blockSeqs : . . . G TT . . ATCTATT . . T T A . . . . . . . . . . TC . TTT T T . . . . T . G . . . . C . . AAGA . . . . . . . AT . . . . . . . . . . A TAAGTTTTATGA . A C C
blockSeqs : . . . G AT . . ATTATT . . T C C . . . . . . . . . . AC . TTC T T . . . . T . A . . . . C . . AAGA . . . . . . . AT . . . . . . . . . . G TAATTTTGAAA . . C T
blockSeqs : . . . G CT . . TTTATT . . G C T . . . . . . . . . . TC . TTC G T . . . . T . T . . . . T . . ACAA . . . . . . . A . . . . . . . . . . C TTTGTTTTCAA . . C C
blockSeqs : . . . G TT . . TATACT . . G A T . . . . . . . . . . AA . TTC C . . . . . C . T . . . . C . . AAGA . . . . . . . A . . . . . . . . . . A TTTTTAAA . . C G
blockSeqs : . . . G TT . . ATAATT . . G C T . . . . . . . . . . AC . TTC . . . . . . C . T . . . . C . . AAGA . . . . . . . A . . . . . . . . . . C TCAAA . . . C
blockSeqs : . . . . AT . . ATTTAT . . A C T . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . A T . . . . T . . ACGA . . . . . . . G . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . TA . . TTTAGT . . G C A . . . . . . . . . . A T . . . . T . . AAGA . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TA . . TTTAT . . G T T . . . . . . . . . . . . T . . ATA . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . . ATAT . . G T A . . . . . . . . . . . A . . TGG . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . ATCT . . G C T . . . . . . . . . C . . AA . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . T G . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ATTTATT********* ** AAGA******** A************* TATTTTAAAA************ NTNTTCGGTGTATAAATTACGAGACA********************** AG******
originalCons : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T--TTTT---AA---A-A---T---T--T---T-T-ATTTGATAATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATAC-----A-GA---TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAA-TA--A-TTT----TAA-AA--A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA----------G----TC-T----ATGT-AACA-AT-TACA-GAGACCATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
finalCons : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTT-T--TTTT---AA---AATTTATT---------T-T-ATTTGATAATATAACATCTTTCTACCTTTC-CTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AAC-GCGC--AAGGAGG--CTATACAAGA--------TACTGA---TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAATA-------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAATATTTTAAAA------------A-AATCGAT-AAAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAANTNTTCGGTGTATAAATTACGAGACA----------------------TTAAACATATAG------ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA
Alignments
lowQualScore : 111111111 111 11111111 222222222 22222222222222 22222222 11 22222 222222 6666666666666666666666666666666666 22222222 111 33 2222 1
lowQualScore : 2 2 5555 7 000000000 444 444 33 0 3 1 0 2 1 2 333 6 000 2 7 33 44 44 33333333 55 0 666666666 33 2 55 99999 3 3 1 8 0 0 1 88888 2 2 5555 0 2 33 5555 33 5555 444 2 2 99 4 4 6 2 55555555555555 444 9999999999 2 444 33 33 555 3 6666 99999999 66666 22 3 66666 1 1 111111 4 8888888888888888888888888888888888 99 66666666 8 1 000 33 8888 1 5 1
lowQualScore : . . .... . ......... ... ... .. . . . . . . . ... . ... . . .. .. .. ........ .. . ......... .. . .. ..... . . . . . . . ..... . . .... . . .. .... .. .... ... . . .. . . . . .............. ... .......... . ... .. .. ... . .... ........ ..... .. . ..... . . ...... . .................................. .. ........ . . ... .. .... . . .
lowQualScore : 7 7 0000 6 222222222 444 444 44 1 4 0 4 2 7 2 777 3 666 4 1 99 22 66 44444444 00 2 555555555 99 0 00 11111 6 6 0 0 9 3 0 33333 9 4 0000 5 2 11 0000 22 0000 111 2 2 77 4 4 7 2 44444444444444 444 6666666666 7 777 77 99 444 1 5555 33333333 33333 55 3 77777 0 4 111111 0 0000000000000000000000000000000000 77 88888888 0 0 777 33 3333 0 5 0
consensus : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTTT--TT--TTGA---AA---T--TTATTTTATTTGATAATATAACATCTTTCTAC-CTTTCCTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AACGC-GC--AAGGAGGCTATAC----A--A----GA---TACTGA-TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAAT--A---T-TTTA--A--AA--A-AATCGAT-A---AAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA--GT-TT-TCGGTGT--AT----A-A---AT----TAC-GAGAT----CATTANACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
Reference ( family-2082 ) : AATACT-TT-AGAAACGCAACACTCAGATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTTT--TT--TTAA---AA---T--TTATTTTATTTGATAATATAACATCTTTCTAC-CTTTCCTGGAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATATTT-----CAGATTT-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATANAATTATTGAAATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAAGAGTGGAACAACATACCACAAGCCCGGATTTCAAATANTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AACGC-GC--AAGGAGGCTATAC----A--A----GA---TACTGA-TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAG-GAAAGGTAGAAAGATGTTAT----ATTATCAAATAAAAT--A---T-TTTA--A--AA--A-AATCGAT-A---AAAGAACTCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGAGTGTTGCGTTTCTAAA--NT-NT-TCGGTGT--AT----A-A---AT----TAC-GAGA-----CATTAAACATAT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTG-AGAT----ATACNCTACCAGTGATAGCGCTTNTTG
gi|1 : AATATC-AT-AGAAACGCAACACTCGGATAAACTGCATTAAAACATTG----AGTTCATTATCAATTTT--TT--TTAA--------T--TTATTTTCTTTGATAATATAATATCTTTCTAC-CATTTCTGGAAAGTTTCGTCAAAA-TCTATTGCAATGATCACTACTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CCTC-GTAATATAAATT--CACCAAA--AA----A-T-GCAACACTGTTATTGTTTGTATAACTTTGTTTAG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATA-TT-----CAGATTT-TGATTCAGTTGTATGT--TAT-----TTCA-AGTT-CGCAGGAAAATTATTGAAATCAACGTTCAAAATATTTCGTCAAACGCTTGTTAAAGAGCGGAACAACTTACCACAAGCCCGGATTTCAAATAACG-----TTCATTCA-ATGAGAAGTCGCTACCGTGCGTGCA-TC----GATGC-AC--AAGGAGGCTAT------A--A----GA---TACTGA-TTGTGTG----------------------------TGTTTCAAATCAAT-AAAAATAAGTAATAA---A-G--------AAA-TAATAATCGC---AAC--CGATTTTGATG--AAACTT---TCCCG-GAAACGTAGGAAGATGCTAT----ATTCTCAAATAAAGTAGA---T-TTCA--A--A
gi|10 : tgcagaacagaatagaacattttcttcattgaggaaaaacatgtttatattttgcaataacaagtaaacaggttataagaagaatgatatgggtgtattttcacagacgttatttttaagacatttgttataaatataaactttttcgtgttttattaggtgtttatatagaacatttgccaaattaaactaaaagatagccattcttaaaagATACT-TT-ATAAACGCAATACTCAGATTTACAGCAATAAAACATTG----ATTTCTTAATCGGTTCT--TT--TTTA---AA---T--TTATTTTATTTGATAGAACAATATCTTTTTAC-CTTTTCTGGAAACTTTTATCAAAA-TGTATTGTGAATACCACTTCTT---TAAACTGATTTGAAACTTACAATC---CC-C-GTTACCTAAATC--CAT--A
gi|10 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacCGCTGTCGTCCGTGCA----------------------GGCAATAC----A--A----AA---TA---------------TTAGGTA-AC--AG-G-GAT-TGTATGTTTCAAATCAATTA------------AA---A-G--------GAG-TGATAATCGA---AAT--ATATTTTGATG--AAAtgttattgcgctgtcgtccgtgcaggcaatacaaaatattaggtaacagggattgtatgtttcaaatcaattaaaaggagtgataatcgaaatatattttgatgaaatgtgttatacttgtt
gi|11 : aaaaacaagggatcgtaagctaattttaattttatcgacattgcctcattttgtcgactaatgcaaatattttgcttatggcatcttattagcggtgacgcttgtttatatcaccgtagtgacctcatttgtcatatatacaccaacatactttataaacgcaatactcagatttacagcaataaaacattgatttcttaatcggttcttttttaaatttattttatttgatagaacaatatctttttaccttttctggaaacttttatcaaaatgtattgtgaataccacttctttaaactgatttgaaacttacaatccccgttacctaaatccatatgttattgAATACT-TT-AGAAGCTCAACATTCGGATACACAGCAATAAAACATCG----A-----------ATTTT---------A---AA---T--ATAT--------ATA-TATA---------TAC-ATTTCCTGGTAAAATTCATCAAAA-TCTATTGTGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTTAAACAAACAA-C---CC-CCGTGACCTAAATT--CAC--AA--AA----T-C-GCAACACTTTTATTGTTGGTATAATTTCGTTTGG--AATTGGTTTATCTGTATTTTGATA-TT-----CAGATTT-TGTTTCTGTGCTATT-----T-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATCAGCTTTC-AAATACTTCGTTAAGCGC-AGTTCAAGAGTGAAACAACATACCAAAATCCCAGATTTCAGGTATCA-----CATATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGTACTCGTATATCAT-ACCAAAGGAGTCTCTAC----A--A----AA---TACTGA-TTTTGTGAATTTAGGTA-ACTTGG-G-G-T-TGTAtgtgttatacttgtt
gi|12 : tatacaccgt-TT-AGAAACACAACACTCAAATACACAGCAATAATACATTG----AGTTCTTTATC--TTTT--TT--CTAA---AAAAAT--AAAGATTATTTGATATTATAACACCATTCCAC-CTTTCCTGGAAGTTTTCATTAAAA-TCTCTTGAGATTATCACCT-TT---TTTATTGATTTGAAACATACAACC---CC-C-GCTACCTAAATT--CGC--AA--AAGGCTA-T-ACAAGA---TTCTGGTTTGTAT
gi|12 : C-GC--AAA-AGGCTATAC----A--A----GA---TTCTGG-TTT-----------------------------GTAT--TTTAAATTAAT-A------------AA---AAG--------AAG-TGATCATAGC---AGT--AGATTTTGATG--AAACTT---TCCAT-AAAAGATAAAAATATTTTAT----ATTATCAAATAAAATA-A---T-TTTA--A--AAT-A-TATCGAT-----GAAGAACTTAATGTTTTATTGCTGTTTATCTAAGTATTGCGTTTCTAAAG-CT-TT-TCGGTGC--Atttaaattaataaaaagaagtgatcatagcagtagattttgatgaaactttccataaaagataaaaatattttatattatcaaataaaataattttaaaatatatcgatgaagaacttaatgttttattgctgtttatctaagtattgcgtttctaaagcttttcggtgcaaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|13 : ttagaaacacaacactcaaatacacagcaataatacattgagttctttatcttttttctaaaaaaataaagattatttgatattataacaccattccacctttcctggaagttttcattaaaatctcttgagattatcaccttttttattgatttgaaacatacaacccccgctacctaaattATTCAGATGTAAATTGGCTGTCGAGCGGGCA-TC----AATGC-GC--ATGGAGGCTATAC----A--A---------TATTGA-TTTTGTGAATTAAGGTA-GC--GG-C-G-T-TGTATGTTTCTAATCAAT-A------------AA---AAG--------AAG-TATTAATTGC---AAT--AGATTTTGATGAAAAACTT-----CAG-TGAAGGTAGAAAGGTGTTAT----ATTATTAAATAAAAT--A---A-AATA--AATAA--A-AATCGAT-----AAAGAACTCAATGCCTTATTGATGTTTATCTGAGTATTGCG-TTCTAAAG-GT-TT-TCAGTGT--A-----A-A---A------------A-----CAGTAAACATTT---AG---ATAT-TTTGTTTTAATTTCTTGCAGAT----ATACACTACC-GTGATAGCGCTTTTTGaactgacacagatatgcattatgattcatatcaaaatacatgaatgagttttgtaaaaataaaga
gi|14 : AATACT-TT-AGAAACGCAACGCTGAGATAAACAACAATAAAACATTG----AGTTCGTTATCATTTCT--TT--TTAA--------T--TTATTATATTTCATTATAAAATCTCTTTCTAC-CATTCCTGGAAAGTTTCATCAATA-TCTATTGGGATGATCACTTCTT---TTAATTGATTTGAAAGTTACTC-C---CC-T-GTTACCTAAATTTACAC--AA--AA----A----TAACACTTTTACTGTTTGTATATTTTCGTTTAG--AATTAGTTTACCTGTTTTTTTATATAT------AGATTC-TGTTGCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTGAAATTAGTGTTC-AAATACTTCGTCAATCGCTTTTTAAAAAGTGGAACAACAT--------CCCGAATTTCAAATAGTA-----TCCATTTA-ATGAAAAGCCGCTacagttctcattagaggcgtttgacatatattagatatcattatgaaataaatttccgaaataccaattggttaaactcacgcaaaata
gi|15 : acacaaaGGAACATCATACCACAAGCCCAGATTTCAAATAGTA-----TCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGT----CGTGCA-TC----AATGC-AA--ATGGAGGCTATAT----A--A----GA---TACTCA-TTTTGTGAATATAGGTACAA--GG-G-G-T-TTTGTGTTTAAAATTGAT--------------AG---A-G--------AAG-TGA-----GC---AAC--AG-TTTTGATG--AAACTT---TACAA-GAAAGGTGGAAAGATATTAT----ATTATCAAATAAAAT--A---A-TTTA--A--AA--A-AAAAAAT-AATGAAAAAAATCATCGTTTTATTGTTGTTTGTCTTAATGTTGCGTTTCTAAATTCT-TT-TTGGTATAGAT----AGA---AT----TGC-TAAGTTATTTATTATACATGCTCAAA---ATCT-TGTGTTTT
gi|16 : AATACT-TT-ATAAACGTAGTACTTAG-TAAACAGCAATTAAACATT------------TATC-------------TGA---AA---T--TGATTTTATTT-ATAATATAATATCATTTTAA-CCTTCTTGAAAAGTTTCATCAAAA-TCTATTTCGATTATCATTTCTT---TTTATTGATTTGTAACATACAA-C---CC-C-tcacagaatagttttttatgt
gi|16 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaCATGCG-TC----AACGG-GC--AAGGAGGTTATACGTGTA--A----GA---CGCTGA-TATTGTGAATATAGGTA-AC--GGCG-G-T-TAGA---TTC--ATTAAT-A------------AAGACA-G--------AAcatgcgtcaacgggcaaggaggttatacgtgtaagacgctgatattgtgaatataggtaacggcggttagattcattaataaagacagaaaaagagttgacataaaataaatatt
gi|17 : cataaaaacaattgctgacaaatagacatcattttattgtaagagtatggatttttataataagattaaagtctcccattatataccgaaatactttataaacgtagtacttagtaaacagcaattaaacatttatctgaaattgattttatttataatataatatcattttaaccttcttgaaaagtttcatcaaaatctatttcgattatcatttctttttattgatttgtaacatacaacccc-ATGTAAATTCGCTGTCGTGATAGCA-T-----AACTCCGC--AAGGAGGCTATA-----G--A----TA---TACTAA-TTTTGTGAATTTATGTA-AT--GG-G-GAT-TTTATGTTTTAGATCAGT-A------------AA---A-AGTAAAAATAAG-TAATAGTCGC---AAT--AGATTTTGATG--AAAAAT---TGAAG-TAAAGTTAGAAAGACGTTGTATTAATTATCAAATAAAAT--ATTTT-TTTA--A--AAATA-AATCGAT-A---AAAA----TAA------ATTGCTGTTTATCTCATTGTTTCGTTTCTAAA--GTATT-TCGGTGT--AT----aaagagttgacataaaataaatatt
gi|18 : cagaaagataatatcttaacacccgtttactaaacacacAAGACA-TT-AAAAACGAAACACTCAGATGAACAGCAATTAAACATTG----AGTTCTTTATCGATTCT--TT--TT-A---AA---T--TTATTTTATTTTATTGTATAACATAT--------TTTCCTTGAAAGTTTCATCAAAC-TCTAAACCGACTTTCGCTTCTT---TTTATTGATTTGAAACATAT-A-CTCTCC-C-GTTACCTAAATT--gttatatctgttctgtccattgttgcttcctattctgcaactgct
gi|19 : ttgaataattctgatatcagttccttaccatgttatatagtcacgcatcgttaagattatcatgtcatgtgtatacgtactacatgtacacggaAATACA-AT-AGCAATGTAACACTGAGATAAACAGC-ATGAAAC----------------ATCGATTTT--TCGGTTGG---AT---T--TTATTTTATTTTATAATA-AACGTCTTTCTAC-CTCTCCT----------ATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTGCTT---TTTATCAATTTGAAACATAAAA-C---Caatccgcatgcattctgaaatatgttaatttcatatatacatatagtagtatagtggtatagttttatat
gi|19 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaA-TC----AACGC-GC--AAGGAGACAATAC----A--A----GA---TACTAA-TTTTGTGGATTTAGGTA-AC--GG-G-G-T-TGTATGTTTCAAATCAATAA------------AA---A-G--------AAG-TGATAATTGC---AAT--ATATTTaggatcaacgcgcaaggagacaatacaagatactaattttgtggatttaggtaacggggttgtatgtttcaaatcaataaaaagaagtgataattgcaatatattt
gi|2 : agatatcaataaatatccacttaacagtgaaaacaatggcggatagaaatagtaataagttcaccgaaatacaatagcaatgtaacactgagataaacagcatgaaacatcgatttttcggttggattttattttattttataataaacgtctttctacctctcctatcaaaatatattgcgagtatcactgctttttatcaatttgaaacataaaaccaggAATACT-TT-AGAAACGCAAGTCTCATATAAACAACAATAAAACATTA----AATTCTTAATCGATTT---------AATGGAA---T--TTGTTTTATTTGATAATATAAAACATTTCCAC-CTATACTGGAAAGTTTCATCAAAA-TATATTGCGAGTATCACTTCTTTTGTTTTTCGATTTGAAACATACAA-CT--TC-C-AAGATCTAAATT--CAC--AA--AC----A-C-GACACACTTTTATGGTCTGTATAGATTCGTTAAGTTTATTGGTTTATCTGTATTTTGATG-TT-----CAGGTTT-TGTTTCTATGGTGTTTTCTCT-----TTCA-TTTT-CGCAATCGAATTATTGAAATCTGCGTTCGAAGT-CTGC-TCAAGTGCTTGTTCAAAAGTGGAACAACATACTGCAAG-CCGGTTTTCAAATAATA-----CCCACTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTACGCGCA-TA----AATGA-AT--AAAGAGGGTGTAC----A--C----AA---TACTGATTTTTGTGAATTTAGGTT-ACG-GG-G-G-T-TGTATGTTTCTAATGAAT-ATTAGTG------AT---A-A--------AAA-TGATAATTGC---AAC--AGATTTTGATG--AAACTT---TTCAG-GAAAAGTAAAAAGACGTTA-----ATTATCAAATATTCT--T---T-TTTCTTG--AA--A-AATCGAT-----AAAGAATTAAATGTAAGATGGTTGTTTATCTGAAT
gi|20 : tgttttaaaggaattatattggttattattaactccctcaacaacatatattaaagaataccactctttataaaacggtttgaattctttatacgtataccgaTTAATCTGATATTATAACATAGTTTTAC-CTTTCCTGGACAGTTTCATCAACA-TCTATTGCGATTATGACTTCTT---TTTAATGATTCGAAACCCAATA-C---CC-C-GT
gi|20 : CGTGCA-TC----AACGC-GC--AAGGAGGCTATAC----A--A----GA---AACTGA-TTTTGTGAATTTACGTA-AA--GGTG-G-T-TCTATGCTTCAAATCAAC-G------------AA---A-A--------AAG-TAATAATCGT---AAC--AGATTTTGATG--ACAATT---TCCAG-GAAAGGTAGAAATATGTTAT----ATATTCAAATAACTT--AAG-T-TTTA--T--GA--A-AATTGAT-----AAAGAATTAAATATTGTATTGCTGTTTGTgcatcaacgcgcaaggaggctatacaagaaactgattttgtgaatttacgtaaaggtggttctatgcttcaaatcaacgaaaaaagtaataatcgtaacagattttgatgacaatttccaggaaaggtagaaatatgttatatattcaaataacttaagttttatgaaaattgataaagaattaaatattgtattgctgtttgt
gi|21 : ttaatctgatattataacatagttttacctttcctggacagtttcatcaacatctattgcgattatgacttctttttaatgattcgaaacccaatacccAAGACT-TT-AGAAACACAACACTCAAATAAACAGCATTAGCACATTG----CGTTCTTTATCGATAAT--TT--T-GA---AA---T--GTATT-------ATAATATA-----TTTCGAC-CATTCCTGGAAAGTTTCACCAAAA-TCTATTGCGATCATACCTCCTT---CTTATTGACTTGAAACATAAAG-C---TC-
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaTACTATTGAGAAACGCAACACCCAGATAAACAGCAATAAAACATTGGAAAAGAGCTTTATttttccaatgttttattgctgtttatctgggtgttgcgtttctcaatagtacagtgt
gi|21 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgaaacCAATGTTTTATTGCTGTTTATCTGGGTGTTGCGTTTCTCAA--TA-GT-ACAGTGT--cagtgt
gi|22 : gaaattgaaaattacttcaaagtcatataaattgtaactatacatttttactataaagtttgctacattgaaagactttagaaacacaacactcaaataaacagcattagcacattgcgttctttatcgataattttgaaatgtattataatatatttcgaccattcctggaaagtttcaccaaaatctattgcgatcatacctccttcttattgacttgaaacataaagctcttttcCACGCAGATAAACAGC-----------------GTTCTTTATCGAGTTA--TT--C-GA---AA---T--ATACTTTATTTGATA-TAAAACATCTTTCTAC-CTTTCCTGAAAAGTTTCATCTAA--TCTAGTGCGATTATCAATTATC---TTTATTTATTTGAAACATACAA-CT--CC-C-GT
gi|22 : CGTGCA-TC----AACGC-GC--AAATA---TATTC----T--GTTTTGG---TAAT-A-TTTTGTGAATTTAGGTA-AC--GG-G-GAT-TGTTTGTTTCTAAGCAAT-A------------Agcatcaacgcgcaaatatattctgttttggtaatattttgtgaatttaggtaacggggattgtttgtttctaagcaataatatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|23 : cacgcagataaacagcgttctttatcgagttattcgaaatatactttatttgatataaaacatctttctacctttcctgaaaagtttcatctaatctagtgcgattatcaattatctttatttatttgaaacatacaactccAAAACATTG----AGTTCTTT-----TTTT--AT--TTAA---AA---AAATAATTCTATTTAATAATATAACATCTTTCTAT-CATTTCTCTTAATTGTCATCACCA-CCGATTGCGATGATCACTTCCT---TTTATTGATTTGAAACACACAA-tatttataatagaaaatctatgccatttcttcaagttatatttttt
gi|24 : aacggagatcaatttaccattagtatttacaaagttgatatatgtacaccgaaatactttaaTATTTAAATTGATAATATTATATCTTTG-AC-TTTTCCTGGAAAGTTTCATCAAAA-CTTATTGTTATTATCACTTGTT---TTTATTGATTTGAAACATACAA-C---CC-CTGTTACCTAAGTT--CAC--AA--AA----T-C-GCATCACTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTCTAC--TATTGGT
gi|3 : gaAATACT-T--AGAAACACAACATTCAGATAAACAGCAATAACACATTG----AGTTCTTTATC-ATTTTGTTT--TTAA---AA---T--CT---CCATTTGATAATATAATATCTATGTAC-CGTTCCTGAAAAATTAAATCAAAA-TCTATTGTGATTATTACTTCTT---TTATTTGATTTGAAACATACAA-C---CC-C-GTTACCTAAAAC--CAC--AA--AA----A-A-GCATCATTTTTATTGTTTCTATAATTTCGTTTAT--AATTGGTTTAACTATATTTTTATATTTATATTTAGATTT-TGTTTCTATGTTTTTA--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATAAAATTATTGTAATCAACGTTC-AAATACTCTGCCAAACACTTGTTAAAGAATGGAACATCATACCACAAGCCCGGATTTCAAATAGTA-----TCTATTCA-ATGAGAAGTCGCTGTCGTGCGTGCA-TC----AATAC-AC--AAAGAGGCTTTAC----ATGA----GA---T------TTTTGTGAA----------------G-G-T-TGTAATTTTCAAATCAAT-A------------CA---A-G---------TG-TATTAATCGC---AATACAGATTTTGATG--AAAATT---TCCAG-GAGAGGTAGAAATATGTTAT----ATTCTCAAATAAAATA-A---T-TTTG--A--AA--ACAGTCAATAA---AAAAAACTCAATGTTTTATTACTGTTTATCCGAGTGTTGC-TTTCTAAA--GT-T------TAT--AT----A-ACACATC---TACAGAGA------ATTAAACATAT---AGGGCATATATATATATTAA-CACTT--AGGTGTTAATACTTTATCAATAATAGCATTTGTTG
gi|4 : AAGACT-TT-AGATACGCAACACGCATATAAACAG-AATAAAACATAA----AGTTCTTTATCGATTTT--AT--T-GA---AA---T--CTATTTTACCC-ACAATGTTACATCTTTCTAC-CGTTTCTGAAAAGTTGAATAAAAAATATTTTGCGATTATCACTTCTT---TTTATTGATTTAAAACATACAATC---CC-C-GTAACCTAAATT--CAC--AA--AA----AAC-GACACACTCTT-TTGTCTGTATAAATTCGTT-----AA---GTTTATCTGTACTTTGATATTT------AGATTTCTGTT-CTATGGTGTTT--TCT-----TTCA-TTTT-TGCTAAATAATTATTAAAATCAACGTTC-AAGTGCTTT----------------------GAACCACATACCACAAG-CTGAATTTCAAATAATA-----CCCATTCA-ATGAGAAGTCGCTGGCATACGTGCT-TC----AATGC-AT--AAAAAGGATATAC----A--A----GA---CACTGA-TTTTGTGAATTTAGGTA-ACG-GG-G-G-T-TGTATGTTTTAAATGTATAA------------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATATTAATG--AAACTT---TCACG-GAAAAGGAGAAAGATATTAT----ATTATCAAACGCAAT--T---TGTTTT--C--AA--A-AATCAAT-A---GAAAAA-TTGGTGTTTTATGGCTGtataaaata
gi|5 : ttatcgcatctgTATTGCAATTATCACTTCGT---TTTATTGATTTGAAATATAAAA-C---CC-CAGTTACCTAAATT--CAC--AA--AA----A-AAGCAACATTTTTATTGTTTGTATAATTTCGTTTAG--AACTAATTTATCTGTATTTTGATATTC--------------------ATG-TAATT--TCT-----TTCA-ATTT-TGCAATATAATTATTGAGATCAACGTTC-AAGTACTTCGTCAAGCGCTTGTTCAATATTGGAAAAACATACCACAAACCTTGATTCCAAATATTA-----TCCATTCA-ATGATAAGTTGCGGTCATGAGTGCA-TC----AATGC-AC--AAGGAGGCTATAC----A--A----GATATTATTGA-TTTTGTGTATTTAGATA-AC--GG-GCG-T-TGTATATTTCAATTCAAT-AT-----------AA---A-G--------AAG-TGATAATCGC---AAT--AGATTGTGATG--AAACTT---TCCAG-AAAATGTCGAAAGATGTTAT----GTTATTAAATCAAA-----------TC--A--AA--A-AATCGAT-----AAAGAACTCAATGCTTTATTGCTGTTAATCCGAGTGTTGCGTTTCTAAA--ATCAT-TCGGTGT--------------AT----TA---AGA-----C-TT--ACATAT---AG---aagtctttcgtggatggtaatgcgaaccgtagttatcaccgttgatcagtgtttgtata
gi|6 : taataacatttatatcatgacttaaaatggatgtaacatgataatacacgtactagtagta-GTTACCGAAATT--CAC--AATAAA----A-C-GCAACACTTTTATTGTTTGTATGAGTTCGTTTAA--AATGGGTTTATCTGTATTTTGATATT------CAGAACT-CGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTCA-ATTC-TGAACTATAAGTCTTGAAATGAACGTTC-AAGTACTACGTCAAGCGTTTGTTCAAGATTGGTA-AACATATCACAAGCCCAGATTTGAAATATTA-----TCCATTCA-AT--GAAGTTGC-----TGCGGGTA-TC----AAAGT-GC--AAGAATTCTTAAC----A--C----GA---TACTGA-TTTTGTGGATTTAACTA-ACA-GA-G-A-T-TGT-TCATTCGAATTCAT-A------------AA---A-A--------TAGCTGGTAATCGCAAAAAT--ATATTTTGATA--AAACTC---TCCAA-GACTGGTAGAAAGATATTTT----ATCACC----AAAAT------T-TTTA--A--A-------------A---AAAAAAC---ATGTTTCATTGTTGCGTGTATGAGTGTTGCATTTCTAAA--GT-CT-Tttt
gi|7 : taaaatggatagtaatttcaaaattgagcaatataatgactgacagagtatttataaaagatcgaatagtcttcgaAATACT-TT-AGAAACGCAACACTCACATAAACAGCAATAAAACATTG----AGTTCTTTATC-ATTTT--CT--TTTA---AA---T--TTATTTGATTTGATTAT-TAATATCTTTTTAC-CATTCCGGGAAATGTTCATCAAAA-AA-ATTGCGTGTATCACTTTTT---TTTATTGATTTGAA---------C---CC-C-GTTACCGTAATT--CAC--AA--AAT---A-C-GCAGCATATCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATTGATTTATCTATATTTTAATGTT------CAGATTG-TGTTTCTATGGTAAGT--TCT-----TTCA-ATTT-CGCAATACAATTATTAAAATCAACGCTT-GAATATGCCGTTAAACACTTGTTCAAGAGTAAAACATCATAACACTAGCCCGGATTTAAAATATTA-----TCCATTTA-ATGtctcaatgaatgttcaattatgaaa
gi|8 : gtttaaaaaatctatattatttttcttgattgttattgcatttttcctgatcatattcgtggactatttagtataccga-TTTTATGAATTTAGGTA-AC--GG-TTG-T-TGTATGTTTCAAATCAAT-A------------AA---A-G--------AAG-TGATAACCGC---ATT--AGATTTTGATG--ACACTT---TTCAGAAAAAAGTAGAAAGATGCTAT----ATTATCAAATCAACTA-A---A-TTTA--A--AAATA-AATCGAT-----AGAGAACTGAATGTTTTATTGGTGTTTATCTCAGAGTTGCGTTTCTAAA--TT-ATGTTGGTGT--ATATGCA-A---ATGATATAC-GAGAT----CATTAGACACATATGAG---ATGT-TTtcgtgtgtagcgt
gi|8 : ttttatgATAAT-TT-AGAAACGCAACTCTGAGATAAACACCAATAAAACATTC----AGTTCTCTATCGATTTA--TT--TTTA---AA---T--TTAGTTGATTTGATAATATAGCATCTTTCTACTTTTTTCTGAAAAGTGTCATCAAAA-TCTAATGCGGTTATCACTTC-T---TTTATTGATTTGAAACATACAA-CA--AC-C-GTTACCTAAATT--CAT--AA--AA----A-C-GCAACACTTCTATTGTTTGCATAATTTCGTTTAG--AATT-ACTTGTCTGTATTTTGA------------------------TATGGTATTT--TCTAAACATTCATGTTTACCCACGTCAA--ATTGGAAT----GTTC-AAGTACTTCGTCAGGCGCATGTTCAAGAGTGAAACACCATACCACAAGTTTGGATTTCAAATATTA-----TCCATTCA-ATAAGAAGTCACTGTCGTGCGCGCA-TC----ACCGC-GC--AAacgcaacacttctattgtttgcataatttcgtttagaattacttgtctgtattttgatatggtattttctaaacattcatgtttacccacgtcaaattggaatgttcaagtacttcgtcaggcgcatgttcaagagtgaaacaccataccacaagtttggatttcaaatattatccattcaataagaagtcactgtcgtgcgcgcatcaccgcgcaaa
gi|9 : ttttatgaaacatctcatatgtgtctaatgatctcgtatatcatttgcatatacaccaacATTAGTTTATCTGTAATTTGGTATT------CAGATTC-TGTTTCTATGGTATTT--TCT-----TTGA-ATTT-CGCAATTAAATTATTGAAATCACCGa
gi|9 : ACCAAAAGCCGAGATTTTAAA-ATTACGTTTTGCATGTG-CTGAGAATTCGCTGTCGTGCGTGTC-TC----AATGA-GC--AAGGAGGCTATAC----A--A----GA---TACTGA-TTTTATGAATTGAGGTA-AC--AG-G-G-TCTGTACATTTCAAATCAAT-AT-----------AA---A-T--------AAG-TGATAATGGC---AAT--AGATTTTGATG--A---TTATGTCCAG-GGAATGTATA---TTGTTAT----ATCATCAAATCAAA----------------------------------------AACTCAATATTTAATTGCAGTTTGTTTGAGTGTTGCGTTTTTAAA--GTCTT-TCGATGT--AC----A-A---CT----CAT-GAGAC----CATTTTCCTAAT---CC---ATAA-TTTGTTTT-GTTTATTGAAGAT----aaccaaaagccgagattttaaaattacgttttgcatgtgctgagaattcgctgtcgtgcgtgtctcaatgagcaaggaggctatacaagatactgattttatgaattgaggtaacagggtctgtacatttcaaatcaatataaataagtgataatggcaatagattttgatgattatgtccagggaatgtatattgttatatcatcaaatcaaaaactcaatatttaattgcagtttgtttgagtgttgcgtttttaaagtctttcgatgtacaactcatgagaccattttcctaatccataatttgttttgtttattgaagatgcattggcatttcctgaccaataagtagattatgtatcaagcacattgataggttcttcc
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): TAATTCCTTGCATATATATTGCAATGTTTTAGCATCACTGACTCGACACACGGTTCTAAAAATAGAGTTTACTAAGC
Unaligned ( gi|26 ): TCCTTGCATGTAAACGTTTTAAAACGGACACGA