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Reference ( gi|1 )            :       ACCGACGGTATATGCTACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGC--GATGCCACAATAGTACGATGACACGATGG---T--GATG-G--CACGATAGTA----CG-ATAGCACGATG--G--TGATGGTATGATGAC-ACAATG---GT----GAT--------GACA----C-GATA--GCACGATGACGATGACG--CAAT----ATTG-C---ATCG-CGCCAT----CGT--C--A--TCG---TG----------------C-----------CA-------T--C--AC---CATTG-TGTC---ATCTTACTAT--CACG--ATCGTGCTAT-CG-TACCAT----CGTG----C-CATC--AC-CAT--CGT-G----TCATCGTACCATCA--C--CATCGTGCTAT-CG-TTCTACTGTGCCATCAC-CAT-CGTGTCATCGTGCTATC------G-T-G-CATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTGTGTCTTTATATTAAAGAATGTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTCAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTTTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTGTTTTACTT--CTTCTTCTTCTATATCTAGAAATGG-AA---AAGAAAGGGGAACGCT--TACTCGTGTACTATATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAAC--A-ATTAATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTCGCAGTGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAAGGTATTGGGTTCAGCATGATATACATGTGTTACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTTAGCGTAATTGTTATGCTATCGAGAGCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTAGGTTTGATCCTCCGCCACAGTTATGTGTGAGGCGAACACTATATTCGTATATGCTTAGTACTGTTTCTACCAAGGAATACACCGAACGTGATTTATAATAGTAACGTGTGTTACAATCAAAGTGACATAAATAAATTTTAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCTATTTACTGAAATCATTCCCGTTTGAAATACTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATTGGACGAGATGTCTTTAAATAGGGGACACGTTGTCTCGAAACTTGGGACAAATTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTC------TTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGA-GACTGATAGACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGAATACTGGCGGGTATTCTAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGCTACCAACTGATCGAACAGGGCCAATCTTTACCATGTATGACCAATCCACTTTGAACAGTGATCACTAATTCCTAA---------TAACTACCAAAAATATTTTCTTACTC--GACAC-CGACTTTCTTGCTCAATACACAATTTTTTAACTAGACACTCGTCTT-TCTCACTC--GACACT-GAACTTTCTCACTCGACACTCGACATTCTTACTCGACATTCTTT--CTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTTAA-------AACTCTACCAAAGGTGACATA
gi|13                         :           ACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACACGCATACGC--GATGCCACGATAGCACGATGACACGATGG---T--GATT-G--CA--A----------G-ATAGCACGATG--G--TGATAGTA
gi|2                          :              tattcaaaTACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCACACG------------------CGATGCCACGATAG---CACGATG-A--CACGATGGT------G-ATGACGCGATG--A--C------ACGATGAC-ACAATG---GT----GAT--------GGTA----C-GGTG--ACACGATGGTGATGGAG--CGAT----TCTA-CG--ATGG-CACGATGA--CG------A--TGA---CG----------------C-----------GA-------T--T--AT---TATCG-TGTC---ATC--------------------GTCAT-CG-TGCCAT----TGTG----C-CATC--AC-CAT--TGT-G----TCATCGT-----CA--C--CATCGTGCTAG-CG-AACTATCGTGCCATCTG-CAT-CGTGTCATCGTGCTATC------A-TAG-CATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATGAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTAATGATAAACTATGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTTCTTTTTCT-----------------TCTTCTTCTATAACAAAAAATGG-AA---AATCAAGAGGAACGCT--TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACATTGAATATATAATGACAT--A-ATTAATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTTGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTG-TACC--AGCACTGAACAGTTGTTc
gi|17                         : gcactcaatgaatcgccattgTGCGGTGTTCCATTAGGGCTACCGTGATATCG--------AC-----TGCAC--GATG--GCGATGGAGCGAAGTTACGATGG---T--GTTGTG--CAgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|2                          :                                      tGTCATCGTGCTATCG---TGGCATC--GCGTGTGCTTGTTG--ACAA-AG--CGATAGCACGATGGCCCT--AACG-G--AAC-ACCGTA----CA-ATGGCgaaggaacg
gi|13                         :                         gcactcaatgaatcGTCATCGTGCTATCG---TGGCATCGCGTATGCGT--GTTG--ACAA-AG--CGATAGCACGATGGCCCT--AACG-GAACACCGTAATA----TG-acgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|9                          :                                                       tattcaaaactgCATA-GT--GATGGAGCAGTGG-ACAATGAT--GA-AG---T--GAAG-G--CATGA-AG-A----CA-A-AG-ACG--------CAATGCTATGACAGC-ACCACT---GA----GAT--------GGAG----C-GATG--G-ACGATGATGAAGAAG--CGAT----ATAA-A---ATGG-CATTTT----TGT--C--A--TTG---TG----------------CCTTTTCTGCTTCA-------T--C--ACTTTCATTG-TGacgatggtgattgcaagatagcacgatggtgatagtac
gi|2                          :                                                                        GC--GATGCTATGATAGCACGATGACACGATGC---A--GATG-G--CACGATAGTT----CG-CTAGCACGATG--G--TG-----ACGATGAC-ACAATG---GT----GAT--------GGCA----C-AATG--GCACGATGACGATGACA--CGAT----AATA-----ATCG-CGTCAT----CGT--C--A--TCG---TGCCATCGTAGAATCGCTC-----------CA-------T--C--AC---CATCG-TGTC---ACCGTACCAT--CACC--ATTGTGTCAT-CG-TGTCAT----CGCG----T-CATC--AC-CAT--CGT-G----TCATCGTGCTATCG--TGGCATCGCGgtgctgtcat
gi|23                         :  gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacaGC--GATGC--------TACGATGACACGATGA---C--GATG-A--CGCGATActtcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|19                         :                                                                                    gatggaATGACAGCACGATGG---T--AATG-----------GTA----TG-CTACAACAATG--G--TGATG----GATGGA-GCAATG---Gtt
gi|3                          :                                                                                             ggtgacCGATGG---T--GAT------ACAACAGCAGAATCT-ATGTTATGATG--G--CGACA--AAGA-GAT-GCGATG---GT----GGT--------GGCAGTGGC-TATA--TCACGAT-AC--TGAC-----AG----ACTGAC---ACCG-CG--ATGAAATGT--CAGA--CCGA--TG----------------C-----------C---------------------TGG-CGTCTGAAGTTTG--AA--CATG--ATAGTATTA--CGTTACTATATCCCAAGACAAC-CAACA-AC-TAT--CAT-G----GCCTCTTACCACCA--CAGTATCGTTCTAT-Ccacgca
gi|16                         :                                                                                                    tATGG---T--GACG-G--C--------A----TG-ATAGCACTGTG--G--TGA-GGAGCGGTGGC-ATGATA---AC----GAA--------GATA----C-GATA--
gi|23                         :                                                                             cacggcagtacgatgaggaagacacgacattt--GATG-G--AGCGATGCTA----CG-ATGACACGATG--A--CGATGACGCGAT
gi|13                         :                                                                                                                                A----CGCATA-CGCGATGCCA--CGATAGCACGATGAC-ACGATG---GT----GAT--------TGCA----A-GATA--GCACGATGGTGATatt
gi|19                         :                                                                     tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacA----TG-ACAGCACGATG--G--TAATGGTATGCT-ACAACAATG---GT----GAT--------G---------GATG--GAGCAATGGC----ACG--CAagtac
gi|3                          :                                                                                                                                ggtgacG-ATAGAACGATACTG--TGGTGGTAAGAGGCC-ATGATA---GTTGTTGGTTGTCTTGGGATA----T-AGTA--ACGTAAT-ACTATCATGTTCAA-----ACTT-C---A--GACGCCA------GG--C--A--TCGGTCTG----------------A-----------CA-------TTTC--AT---CGCGG-TGTC---AGT---CTGT--CAGT--ATCGTGATAT-AG---CCAC------TG----C-CACC--AC-CAT--CGC-A----TC-TCTT--TGTCG--C--CATCATAACAT-AGATTCTGCTGTTGTATCAC-CAT-CG
gi|23                         :                                                                                                                                              tGATG--GAGCGATGCTACGATGAC-ACGATG---AC----GAT--------GACG----C-GATA--
gi|16                         :                                                                                                                                                ATG--G--TGACGGCATGATAGC-ACTGTG---GT----GAG--------GA-G----C-GGTG--GCATGATAACGAAGATA--CGAT----AAAA-T---GTCG-TGTCTT----CCT--C--A--TCG---TA----------------C-----------tt
gi|9                          :                                                                                                                                                               cacggcaC-ACAATGAAAGT----GAT--------GAAG----CAGAAAAGGCACAATGACAAAAATG--CCAT----TTTA-T---ATCG-CTTCTT----CAT--C--A--TCG---T-----------------C-----------CA-------T--C--GC---T-------CC---ATCT----------CA--GTGGTGCTGT-CA-TAGCAT----TGCG----T-CTT-------------T-G----TCTTCATGCCTTCA--CTTCATC-----AT-TG-TCC-ACTGCTCCATCAC-TAT-GGTGCTGTCAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                           ATGC--GT----GTT--------GACAAAG-C-GATA--GCACGATGGCCCTAACG--GAAC----ACCG-T---A
gi|2                          :                                                                                                                                                            tattcaaaactgcatatG---GC----GAT--------GCTA----T-GATA--GCACGATGAC-ACGATG--CAG--------------ATGG-CACGAT----AGT--------TCG---------------------C-----------TA-------G--C--AC---GATGG-TG----------ACGATGACACA--ATGGTG--AT-GG-CACAAT----GGCA----C-GATG--AC-GATGACAC-GATAATAATCGCGTCATCG--T--CATCGTGCCAT-CG-TAGAATCGCTCCATCAC-CAT-CGTGTCACCGTACCATCACCATTG-T-GTCATCGacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgattgcaagatagcacgatggtgatagtac
gi|13                         :                                                        gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgaca---GC----GAT--------GCCA----C-GATA--GCACGAT------GACA--CGATGGTGATTG-CAAGATAG-CACGAT----GGT--G--A--TAG---TA----------------C-----------ttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|23                         :                                                                                                           tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacacgcatac---GC----GAT--------GCTA----C-GATG--ACACGATGACGATGACG--CGAT----ATT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                              gatggaCA----C-GGCA--GTACGATGAGGAAGACA--CGAC----ATTT-T---ATCG-TATCTT----CGT--T--A--TCA---TG----------------C-----------CACCGCTCCT--C--AC---CACAG-TGCT---ATCATGCCGT--CACC--AT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                               TG-C---ACAA-CACCAT----CGT--A--ACTTCG---CT----------------C-----------CA-------T--C--GC---CATCG-TGCA---GTC--GATAT--CACG--GTAGCCCTA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                     ttgcggtgttccat---ATCG-CGTCAT----CGT--C--A--TCG---TG----------------T-----------CA-------T--CGTAG---CATCG-CTCC---ATCgaaggaacg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                        CG-TGCCAT----TGCTCC--A--TC----------------------------------CA-------T--C--AC---CATTGTTGT----AGCATACCAT--TACC--ATCGTGCTGT-CA-TGTCAC----Catt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                          -CACCAT----CGTGCT--A--TCT---TG----------------C-----------AA-------T--C--AC---CATCG-TGTC---ATCGTGCTAT--CGTGGCATCGCG-TATGCG-Tca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaac--A--TCG---CG----------------T-----------CA-------T--C--GT---CATCG-TGTC---ATCGTAGCAT--CGCatagtac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            gatggaG---TA----------------C-----------TA-------T--C--AC---CATCG-TGCT---ATCTTGCAAT--CACC--ATCGTGTCAT-CG-TGCTAT----CGTG----G-CATC--GCGTATG-CGT-G----Tatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaTACTAT--CACC--ATCGTGCTAT-C-------T------TG----C-AATC--AC-CAT--CGT-G----TCATCGTGCTATCG--TGGCATCGCG-TATGCG-T
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaac--CACG--A-CATTTTAT-CG-TATCTT----CGT----------------TAT--CAT-G----CCACCGCTCC-TCA--C--CACAGTGCTAT-C---------ATGCCGTCAC-CAT-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cacggcagtacgatgaggaaga--ATCGCGTCAT-CG-T--CAT----CGTG----T-CATCGTAG-CAT--CGC-T----CCATC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGTGCCAT-TG-CTCCAT----C---------CATC--AC-CAT--TGTTG----T-AGCATACCATTA--C--CATCGTGCTGT-CA-Tatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggtgac-CG-TTCCTT----C-TG----CACAAC--AC-CAT--CGT-A----ACTTCGCTCCATCG--C--CATCGTGCAGT-CG-ca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttgcggtgttccattagggctaccgtgatatAT----CGCG----T-CATC--GT-CAT--CGT-G----TCATCGTAGCATCGCTC--CATC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTA----C-TATC--AC-CAT--CGT-G----CTATCTTGCAATCA--C--CATCGTGTCAT-CG-TGCTATCGTGGCATCGCGTATGCGTGTatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtca--CGT-G----CCATTGCTCCATC------CATCA--CCAT-TG-TTGTAGCATACCATTAC-CAT-CGTGCTGTCATGTCACC------
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTACTATCA--C--CATCGTGCTAT-C--------T-TGCAATCAC-CAT-CGTGTCATCGTGCTATC------G-TGG-CATCGCca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattcaaaactgcatattacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacacgcatacTATCGCGTCATCGT-CAT-CGTGTCATCGTAGCATC------GCT-C-CATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -G-CATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGTATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTTTAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gta-G-CATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTATGTGTTTATATTTAA----GTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTAT-TGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTATTCTCCTCCTCCTcct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -G-CATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTATTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTAGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTATTCTCCTCTTCCcct
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTAAGTGGGATTCTTATAAAAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAA----GTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCAGTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCATACATGTATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTATTTTTCTCCTCCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGGGAAACTGTGTATAATCTTATTCTCCTCCTCCT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATGGGATTCTTATAATAGTAT-GGAAGGTATAGTTATGTCTTCATATTACAG----TATGTACATGTTACTCATTCAATTCATTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTTATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCATCTTTGTACTTTGA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTTCTTCTTCATCTTCGTTTTCTTCTTCTTTTTCTCGGCTTCTTTTCCTACTTGCAGTTATGACAATCTAATACAAGGGGACG-TGATACTCGTATAATTTATTTAAACAAAACAGTGTACATACAATAAAACTTATTTTAATGTATCTTACTAA--AATTTGAATGTTTTCAAAAAGAATTACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGAGAACG----TGATAGTATACTTCAGTTTAACAAAACAATGAATATATAATAAGAT--A-CTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taagaagtccagtgcCATATTTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTTGTCTCGAAACTTGGGACGAGTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTC------TTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGA-GACTGGTATACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTTGATTGACAGTCAGACACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTC--GACACTCGACTTTCTTGCTCAATATTCAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTT-TCTCACTC--GACA--------TTTTTACTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTCtaaatttcccttattaagat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtGGACAAGTCGTCCCAAA------GACAACTCGTCCCACATTTTGAGACAACTCGTCCCAAGTTTCGAGACAACTTGTCCaaaactctaccaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                      gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggGGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTCTataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTC------TTTGGTAAGGCTTttggtaaggctt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGATGACTGATAAACGTATACCAGTC-TCA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                  gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaaGCAGGTCTTCAACCTCATGACCACTGGACTGACAGTCAGGCACcggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTTCTTACTCTGAACACTCTACTTTCCTACTTGGCACACAACTTT---ATTA----TTCAACTTATTTTACTT--GACACT-CAACTTTTTAACTCGACACTCAACATTTT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gacactccTTACTC--GACACTCGAATTTCTTATTCGACACgaactct
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taCTCAACACGCGACTTTTTAACTCAACACTCGtcgacactctaccaaaagtgatac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttaaATTTTCTTACTCGACACTCGACTT-TCTTGCTC--AATATT-CAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTTTCTCACTCGACATTTTTA--CTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTCAA-------AACTCTACCAAAacagttagaactcctc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                          gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatTTTTAACTCAACACGCGACTT-TTTAACTC--AACACT-
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-TTTAACTC--AACACG-CGACTTTTTAACTCAACACTCGACA
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taTTACTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACA--------CTCGACACTCTACaccaaaagtgatac
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taTTA--CTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACACTCGA-------CACTCTACCAAAAGTGATcaaaagtgatac
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTAAAATGGAAAA






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Reference ( family-1966 )     : NNNNACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGNCAACGCGCATGCGCGATG-C-ACGATAG-A-CGATGGCACGATGGTGATG-GCACGATAGTACGATAGCACGATGGCGATGGTACGATGACACGATG---G--CGATG--G--------CACGATA--GCACGATGACGATGACGCGATACTGCATCGCGCCATCGTCATCG---TGCCA-------TCACCATCG---TGTCA-TC-T-GCCATCACNATCGTGCTATCGTGCCATCGCGCCATCACCATCG-TGTCATCGTGCCATCGC--CATCGTGCTATCG----TNCTATCGCGCCATCACCATCGTGTCGTCGTGCCATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTNAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACNTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTTTTTCTCGGCTTCTTCTCCTACNNNNAGNNATGGCAATCTAATNNAGGGGAACG-T--TACTCGTATACTTTATTTTAACAAAACANTGAATATATAATAANA--TA-NTT--AATGTATCTTACTAATGAATTCGAANGTTTTCGNAANGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTNTCACCTGAGCANTGAACAGTTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTCGTCNCGAAAC-TGGGACAANTTGTCTCAAAATGTGGGACGANTCGTCTTCGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGATGACTGGTANACGTNTACCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTNTTCAANCTCATGACCNCTNGACTGACAGTCAGGCACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTACTCGACACGCGACTTTCTNACTCGACACTCGACTTTCTTACTC--GACACTCGACTTTCTTACTCGACACTCGACNTTCTTATTCGACAT-TNTTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGACACTCGA-------AACTCTACCAAAAGTGATA
gi|1                          :     ACGGTATATGCTACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATG-CCACAATAGTA-CGATGACACGATGGTGATG-GCACGATAGTACGATAGCACGATGGTGATGGTATGATGACACAATG---G--TGATG--A--------CACGATA--GCACGATGACGATGACGCAATATTGCATCGCGCCATCGTCATCG---TGCCA-------TCACCATTG---TGTCA-TC-TTACTATCACGATCGTGCTATCGTACCATCGTGCCATCACCATCG-TGTCATCGTACCATCAC--CATCGTGCTATCG----TTCTACTGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTGTGTCTTTATATTAAAGAATGTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTCAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTTTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTGTTTTACTT--CTTCTTCTTCTATATCTAGAAATGG-AA---AAGAAAGGGGAACGCT--TACTCGTGTACTATATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--CA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTCGCAGTGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAAGGTATTGGGTTCAGCATGATATACATGTGTTACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTTAGCGTAATTGTTATGCTATCGAGAGCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTAGGTTTGATCCTCCGCCACAGTTATGTGTGAGGCGAACACTATATTCGTATATGCTTAGTACTGTTTCTACCAAGGAATACACCGAACGTGATTTATAATAGTAACGTGTGTTACAATCAAAGTGACATAAATAAATTTTAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCTATTTACTGAAATCATTCCCGTTTGAAATACTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATTGGACGAGATGTCTTTAAATAGGGGACACGTTGTCTCGAAACTTGGGACAAATTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGA-GACTGATAGACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGAATACTGGCGGGTATTCTAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGCTACCAACTGATCGAACAGGGCCAATCTTTACCATGTATGACCAATCCACTTTGAACAGTGATCACTAATTCCTAA---------TAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACAC-CGACTTTCTTGCTCAATACACAATTTTTTAACTAGACACTCGTCTTTCTCACTC--GACACTGAACTTTCTCACTCGACACTCGACATTCTTACTCGACAT-TCTTTCTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTTAA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             accgTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGGGAAACTGTGTATAATCTTATTCTCCTCCTCCTta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATGGGATTCTTATAATAGTAT-GGAAGGTATAGTTATGTCTTCATATTACAG----TATGTACATGTTACTCATTCAATTCATTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTTATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCATCTTTGTACTTTGA
gi|13                         :     ACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACACGCATACGCGATGCC-ACGATAGCA-CGATGACACGATGGTGATT-GCA--A------GATAGCACGATGGTGATAGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tattcaaaGACACTCCATTTTCTTACTCTGAACACTCTACTTTCCTACTTGGCACACAACTTTATTATTCAACTTATTTTACTTGACACTCAACTTTTTAACTCGACACTCAACATTTTGAACTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGTCCAGTGCAGGAGAACG-T--GA-TAGTATACTTCAGTTTAACAAAACAATGAATATATAATAAGA--TA-CTTTAAATTTCCCTTATTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                taaga--------CACGGCA--GTACGATGAGGAAGACACGACATTTTATCGTATCTTCGTTATCA---TGCCACCGCTCCTCACCACAG---TGCTA-TCAT-GCCGTCACCATgat
gi|17                         :             T--TGCGGTGTTCCATTAGGGCTACCGTGATATCG--------AC-----TGCACGATG---GCGATGG-AGCGAAGTTACGATGGTGTTGTGCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTGCCATTGCTCCATC----CATCACCATTGTTGT-AGCATACCATTAC--CATCGTGCTGTCA----Tgaaggaacg
gi|2                          :        ggtgac--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCACACGCGATG-CCACGATAGCA-CGATGACACGATGGTGATG-ACGCGATGACACGATGACACAATGGTGATGGTACGGTGACACGATG---G--TGATG--GAGCGATTCTACGATG--GCACGATGACGATGA-------------CGCG-------------------A-------TTATTATCG---TGTCA-TC-----------------GTCATCGTGCCATTGTGCCATCACCATTG-TGTCATCGT-----CAC--CATCGTGCTAGCG----AACTATCGTGCCATCTGCATCGTGTCATCGTGCTATCATAGCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATGAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTAATGATAAACTATGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTTCTTTTTCTTCTTCTT-----------------CTATAACAAAAAATGG-AA---AATCAAGAGGAACGCT--TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACATTGAATATATAATGACA--TA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTTGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTGT-ACC--AGCACTGAACAGTTGTTca
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcactcaatgaatcgccattgTCATATTTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTTGTCTCGAAACTTGGGACGAGTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGA-GACTGGTATACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTTGATTGACAGTCAGACACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATATTCAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTTTCTCACTC--GACA-------TTTTTACTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGAC-------ACTCAAAACTCTACgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcag-TATTACTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACACTCGA-------CACTCTACCAAAAGTGATAcaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTAACTCAACACGCGACTTTTTAACTCAACACTCGACc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aGGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTCTTTGGTAAGGCTTagttagaactcctc
gi|23                         :                                                                                                                                                   GATG---GAGCGATG--C--------TACGATG--ACACGATGACGATGACGCGATATT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCAGGTCTTCAACCTCATGACCACTGGACTGACAGTCAGGCAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                    CGCCA--GGCATCGGTCTGACA-------TT-TCATCGCGGTGTCAGTC-T-G---TCAGTATCGTGATATAG--CCACTGC--CACCACCATCG-CATC-TCTT--TGTCGC--CATCATAACATAGATTCTGCTGTTG---TATCACCATCG
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Reference ( family-1966 )     : NNNNACNGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATG-GCACGATGGCACGATAGCACGATG--GTGATGGTACGGTGAC-ACGATG---G--T----GATG--G--------CACGAC--GGCACGATGACGATGACGCGATATTNTATCGCGC-----CNTC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATCG---TGTCA-TC-T-GCCGTCACNATCGTGCTATCGTACCATCGCGCCATCACCATCGTGTCATCGTACCGTCA---C--CATCGTGCTATCG-TNCTACTGCGCCATCACCATCGTGTCGTCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTNAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACNTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTTTT-CTC--CTTCTTCTCCTATATCNAGAAATGG-AATCCAATANAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--TA-NTT--AATGTATCTTACTAATGAATTCCAAAGTTTTCGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAANGTATNGGGTTCGGCATGNTACTCATGTGTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTNAGCGTAATTNTTATGCCATNGAGANCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGGCGGACACTATATTCGTATATNCTTAGTACTGTTTCTACCNAGGAATACACCGAACNTGATTTANAATAGTAACNTGTGTCACAATCAAAGTGANATAAATANATTTNAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCNACTNACTGANATCNTTCCCGTTTGAAATGNTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATNGGACGAGNTGTCTTTAAATAGGGGACANGTTGTCTCGAAACTTGGGACGANTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTANACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGANTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGNTACCAACTGATCGAACAGGGCCCGTCTTNACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGNTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATACGCGATTTTTTAACTAGACACTCGNCTTTCTCACTC--GACACT--ACTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGAC-TTNTT--ACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGACACTCGA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|1                          :     ACGGTATATGCTACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACAATAGTACGATGACACGATGGTGATG-GCACGATAGTACGATAGCACGATG--GTGATGGTATGATGAC-ACAATG---G--T----GATG--A--------CACGAT--AGCACGATGACGATGACGCAATATTGCATCGCGC-----CATC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATTG---TGTCA-TC-TTACTATCACGATCGTGCTATCGTACCATCGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTACCATCA---C--CATCGTGCTATCG-TTCTACTGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTGTGTCTTTATATTAAAGAATGTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTCAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTTTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTGTTTTACTT--CTTCTTCTTCTATATCTAGAAATGG-AA---AAGAAAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTATATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--CA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTCGCAGTGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAAGGTATTGGGTTCAGCATGATATACATGTGTTACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTTAGCGTAATTGTTATGCTATCGAGAGCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTAGGTTTGATCCTCCGCCACAGTTATGTGTGAGGCGAACACTATATTCGTATATGCTTAGTACTGTTTCTACCAAGGAATACACCGAACGTGATTTATAATAGTAACGTGTGTTACAATCAAAGTGACATAAATAAATTTTAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCTATTTACTGAAATCATTCCCGTTTGAAATACTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATTGGACGAGATGTCTTTAAATAGGGGACACGTTGTCTCGAAACTTGGGACAAATTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGATAGACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGAATACTGGCGGGTATTCTAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGCTACCAACTGATCGAACAGGGCCAATCTTTACCATGTATGACCAATCCACTTTGAACAGTGATCACTAATTCCTAA---------TAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACAC-CGACTTTCTTGCTCAATACACAATTTTTTAACTAGACACTCGTCTTTCTCACTC--GACACTGAACTTTCTCACTCGACACTCGACATTCTTACTCGACATTCTT--TCTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTTAA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              accgTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGGGAAACTGTGTATAATCTTATTCTCCTCCTCCTta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAATGGGATTCTTATAATAGTAT-GGAAGGTATAGTTATGTCTTCATATTACAG----TATGTACATGTTACTCATTCAATTCATTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTTATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCATCTTTGTACTTTGA
gi|13                         :     ACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACACGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGAT--------T-GCAAGATAGCACGATG--GTGATAGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tattcaaaGACACTCCATTTTCTTACTCTGAACACTCTACTTTCCTACTTGGCACACAACTTTATTATTCAAC-TTATTTTACTTGACACTCAACTTTTTAACTCGACACTCAACATTTTGAACTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GA-AGTCCAGTGCAGGAGAACG---TGATAGTATACTTCAGTTTAACAAAACAATGAATATATAATAAGA--TA-CTTTAAATTTCCCTTATTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                       taa--------CACGGC--AGTACGATGAGGAAGACACGACATTTTATCGTAT-----CTTC--------GTTATCA---TGCCACCGCTCCTCACCACAG---TGCTA-TCAT-GCCGTCACCATgat
gi|17                         :             T--TGCGGTGTTCCATTAGGGCTACCGTGATATCG--------AC-----TGCACGATG--GCGATGGAGCGAAGTTACGATGGTGTTGTGCA-GAAGGAACG
gi|19                         :                                                                                                           GGTGACATGACAGCACGATG--GTAATGGTATGCT-ACAACAATG---G--TGATGGATG--G--------AGCAAT--GGCACG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATCGCCATTGTA-CGGTGTTCCGTTAGGGC--CATCGTGCTATCG-ca
gi|2                          :   gcactcaatga--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCACACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATG-ACGCGATGACACGATGACACAATG--GTGATGGTACGGTGAC-ACGATG---G--T----GATG--GAGCGATTCTACGAT--GGCACGATGACGATGA-------------CGCG--------------------------------A-------TTATTATCG---TGTCA-TC------GTCA-----------TCGTGCCATTGTGCCATCACCATTGTGTCATCGT-----CA---C--CATCGTGCTAGCG-AACTATCGTGCCATCTGCATCGTGTCATCGTGCTATCATAGCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATGAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTAATGATAAACTATGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTTCTTTTTCTTCTTCTT-----------------CTATAACAAAAAATGG-AA---AATCAAGAGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACATTGAATATATAATGACA--TA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTTGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTGT-ACC--AGCACTGAACAGTTGTTctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcactcaatgaatcgccattgTCATATTTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTTGTCTCGAAACTTGGGACGAGTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTATACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTTGATTGACAGTCAGACACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATATTCAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTTTCTCACTC--GACA-------TTTTTACTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGAC--------ACTCAAAACTCTACgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagTATT--ACTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACACTCGA-------CACTCTACCAAAAGTGATAcaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTCAACACGCGACTTTTTAACTCAACACTCGACc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attttaaGGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTCTTTGGTAAGGCTTagttagaactcctc
gi|23                         :                                                                                                                                                    GATG---GAGC----GATG--C--------TACGAT--GACACGATGACGATGACGCGATATT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCAGGTCTTCAACCTCATGACCACTGGACTGACAGTCAGGCAC
gi|3                          :                                                                                                                   GATAGAACGATACTGTGGTGGTAAGAGGCC-ATGATA---G--TT---GTTG--G--------T-TGTCTTGG---GAT-ATAGTAACGTAATA--CTATCATGTTCAAACTTCAGACGCCAGGCATCGGTCTGACA-------TT-TCATCGCGGTGTCAGTC-T-G---TCAGTATCGTGATATAG--CCACTGC--CACCACCATCGCATC-TCTT--TGTCG---C--CATCATAACATAGATTCTGCTGTTGTATCACCATCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               t-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGTATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTTTAGTCTTCTTCTCCTCCTCCT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore                  :       0      88                                5         22            5        2                 2 888888   2                00         4 8 5  0      22222222222    3333333333333333333                0  7   000       8888888888888888888888888888888888888888888      000     0  22222222   88  5   5 8   00       88               4  666666666666      8    6  00        0                7            0                                                                     0   4444                                                     888888            0                                1                          33333333      333       0        0  555   88         555                       5    2              8 88  00  88       0   00  3                                              0    0            0           0   3           33                                           0         0         0    0                                                                            0                  0               0       0         0           0000    0       0    0                                        0   0     0   0               0                                      0       0                   0                    7 0                                                                                             0                                   0                                                 0                      5     0                               0              555555555                               5                   7 7                    0           33    3333                                   444444             2                   7 3333333                   
consensus                     : NNNNACNGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGGCGC-GATGGCACGATAGCACGATG--GTGATGGTACGATGAC-ACGATG---G--T----GATG--G--------CACGAC--GGCACGATGACGATGACGCGATATTNTATCGCGT-----CTTC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATCG---TGTCA-TC-T-G-C-GTCACNATCGTGCTATCGTACCATTGCGCCATCGCCATCGTGTCGTCGT-CCGTCA---CCATCGTGCTATCG-TTCTACTGTNCCATCACCATCGTGTCGTCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTNAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACNTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTTTT-CTC--CTTCTTCTCCTATATCNAGAAATGG-AATCCAATANAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--TA-NTT--AATGTATCTTACTAATGAATTCCAAAGTTTTCGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAANGTATNGGGTTCGGCATGNTACTCATGTGTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTNAGCGTAATTNTTATGCCATNGAGANCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGGCGGACACTATATTCGTATATNCTTAGTACTGTTTCTACCNAGGAATACACCGAACNTGATTTANAATAGTAACNTGTGTCACAATCAAAGTGANATAAATANATTTNAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCNACTNACTGANATCNTTCCCGTTTGAAATGNTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATNGGACGAGNTGTCTTTAAATAGGGGACANGTTGTCTCGAAACTTGGGACGANTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTANACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGANTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGNTACCAACTGATCGAACAGGGCCCGTCTTNACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGNTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATACGCGATTTTTTAACTAGACACTCGNCTTTCTCACTC--GACACT--ACTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGAC-TTA--TTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGACACTCGA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
Reference ( family-1966 )     : NNNNACNGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGGCGC-GATGGCACGATAGCACGATG--GTGATGGTACGATGAC-ACGATG---G--T----GATG--G--------CACGAC--GGCACGATGACGATGACGCGATATTNTATCGCGT-----CTTC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATCG---TGTCA-TC-T-G-C-GTCACNATCGTGCTATCGTACCATTGCGCCATCACCATCGTGTCGTCGT-CCGTCA---CCATCGTGCTATCG-TTCTACTGTNCCATCACCATCGTGTCGTCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTNAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACNTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTTTT-CTC--CTTCTTCTCCTATATCNAGAAATGG-AATCCAATANAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--TA-NTT--AATGTATCTTACTAATGAATTCCAAAGTTTTCGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAANGTATNGGGTTCGGCATGNTACTCATGTGTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTNAGCGTAATTNTTATGCCATNGAGANCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGGCGGACACTATATTCGTATATNCTTAGTACTGTTTCTACCNAGGAATACACCGAACNTGATTTANAATAGTAACNTGTGTCACAATCAAAGTGANATAAATANATTTNAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCNACTNACTGANATCNTTCCCGTTTGAAATGNTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATNGGACGAGNTGTCTTTAAATAGGGGACANGTTGTCTCGAAACTTGGGACGANTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTANACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGANTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGNTACCAACTGATCGAACAGGGCCCGTCTTNACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGNTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATACGCGATTTTTTAACTAGACACTCGNCTTTCTCACTC--GACACT--ACTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGAC-TTA--TTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGACACTCGA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|1                          :     ACGGTATATGCTACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACAATAGTACGATGACACGATGGTGATGGCAC-GATAGTACGATAGCACGATG--GTGATGGTATGATGAC-ACAATG---G--T----GATG--A--------CACGAT--AGCACGATGACGATGACGCAATATTGCATCGCGC-----CATC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATTG---TGTCA-TC-TTA-CTATCACGATCGTGCTATCGTACCATCGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTACCATCA---CCATCGTGCTATCG-TTCTACTGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTGTGTCTTTATATTAAAGAATGTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTCAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTTTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTGTTTTACTT--CTTCTTCTTCTATATCTAGAAATGG-AA---AAGAAAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTATATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--CA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTCGCAGTGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAAGGTATTGGGTTCAGCATGATATACATGTGTTACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTTAGCGTAATTGTTATGCTATCGAGAGCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTAGGTTTGATCCTCCGCCACAGTTATGTGTGAGGCGAACACTATATTCGTATATGCTTAGTACTGTTTCTACCAAGGAATACACCGAACGTGATTTATAATAGTAACGTGTGTTACAATCAAAGTGACATAAATAAATTTTAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCTATTTACTGAAATCATTCCCGTTTGAAATACTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATTGGACGAGATGTCTTTAAATAGGGGACACGTTGTCTCGAAACTTGGGACAAATTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGATAGACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGAATACTGGCGGGTATTCTAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGCTACCAACTGATCGAACAGGGCCAATCTTTACCATGTATGACCAATCCACTTTGAACAGTGATCACTAATTCCTAA---------TAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACAC-CGACTTTCTTGCTCAATACACAATTTTTTAACTAGACACTCGTCTTTCTCACTC--GACACTGAACTTTCTCACTCGACACTCGACATTCTTACTCGACATTC--TTTCTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTTAA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             accgTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGGGAAACTGTGTATAATCTTATTCTCCTCCTCCTta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATGGGATTCTTATAATAGTAT-GGAAGGTATAGTTATGTCTTCATATTACAG----TATGTACATGTTACTCATTCAATTCATTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTTATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCATCTTTGTACTTTGA
gi|13                         :     ACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACACGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGAT--------T-GCAAGATAGCACGATG--GTGATAGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tattcaaaGACACTCCATTTTCTTACTCTGAACACTCTACTTTCCTACTTGGCACACAACTTTATTATTCAAC-TTATTTTACTTGACACTCAACTTTTTAACTCGACACTCAACATTTTGAACTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GA-AGTCCAGTGCAGGAGAACG---TGATAGTATACTTCAGTTTAACAAAACAATGAATATATAATAAGA--TA-CTTTAAATTTCCCTTATTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                       taa--------CACGGC--AGTACGATGAGGAAGACACGACATTTTATCGTAT-----CTTC--------GTTATCA---TGCCACCGCTCCTCACCACAG---TGCTA-TCAT-GCC-GTCACCATgat
gi|17                         :             T--TGCGGTGTTCCATTAGGGCTACCGTGATATCG--------AC-----TGCACGATG--GCGATGGAGCGAAGTTACGATGGTG-TTGTGCAGAAGGAACG
gi|19                         :                                                                                                          -GGTGACATGACAGCACGATG--GTAATGGTATGCT-ACAACAATG---G--TGATGGATG--G--------AGCAAT--GGCACG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCGCCATTGTACGGTGTT-CCGTTAGGGCCATCGTGCTATCG-CTTTca
gi|2                          :   gcactcaatga--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCACACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGACGC-GATGACACGATGACACAATG--GTGATGGTACGGTGAC-ACGATG---G--T----GATG--GAGCGATTCTACGAT--GGCACGATGACGATGA-------------CGCG--------------------------------A-------TTATTATCG---TGTCA-TC-------GTCA-----------TCGTGCCATTGTGCCATCACCATTGTGTCATCGT-C----A---CCATCGTGCTAGCG-AACTATCGTGCCATCTGCATCGTGTCATCGTGCTATCATAGCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATGAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTAATGATAAACTATGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTTCTTTTTCTTCTTCTT-----------------CTATAACAAAAAATGG-AA---AATCAAGAGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACATTGAATATATAATGACA--TA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTTGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTGT-ACC--AGCACTGAACAGTTGTTgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcactcaatgaatcgccattgTCATATTTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTTGTCTCGAAACTTGGGACGAGTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTATACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTTGATTGACAGTCAGACACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATATTCAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTTTCTCACTC--GACA-------TTTTTACTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGAC--------ACTCAAAACTCTACgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagTA--TTACTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACACTCGA-------CACTCTACCAAAAGTGATAcaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTCAACACGCGACTTTTTAACTCAACACTCGACc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attttaaGGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTCTTTGGTAAGGCTTagttagaactcctc
gi|23                         :                                                                                                                                                    GATG---GAGC----GATG--C--------TACGAT--GACACGATGACGATGACGCGATATT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCAGGTCTTCAACCTCATGACCACTGGACTGACAGTCAGGCAC
gi|3                          :                                                                                                                   GATAGAACGATACTGTGGTGGTAAGAGGCC-ATGATA---G--TT---GTTG--G--------T-TGTCTTGG---GAT-ATAGTAACGTAATA--CTATCATGTTCAAACTTCAGACGCCAGGCATCGGTCTGACA-------TT-TCATCGCGGTGTCAGTC-T-G----TCAGTATCGTGATATAG--CCACTGC--CACCACCATCGCATC-TC-T-TTGTCG---CCATCATAACATAGATTCTGCTGTTGTATCACCATCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGTATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTTTAGTCTTCTTCTCCTCCTCCT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     : NNNNACNGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGGCGC-GATGGCACGATAGCACGATG--GTGATGGTACGATGAC-ACGATG---G--T----GATG--G--------CACGAC--GGCACGATGACGATGACGCGATATTNTATCGCGT-----CTTC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATCG---TGTCA-TC-T-G-C-GTCACNATCGTGCTATCGTACCATTGCGCCATCGCCATCGTGTCGTCGT-CCGTCA---CCATCGTGCTATCG-TTCTACTGTNCCATCACCATCGTGTCGTCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTNAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACNTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTTTT-CTC--CTTCTTCTCCTATATCNAGAAATGG-AATCCAATANAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--TA-NTT--AATGTATCTTACTAATGAATTCCAAAGTTTTCGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAANGTATNGGGTTCGGCATGNTACTCATGTGTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTNAGCGTAATTNTTATGCCATNGAGANCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGGCGGACACTATATTCGTATATNCTTAGTACTGTTTCTACCNAGGAATACACCGAACNTGATTTANAATAGTAACNTGTGTCACAATCAAAGTGANATAAATANATTTNAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCNACTNACTGANATCNTTCCCGTTTGAAATGNTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATNGGACGAGNTGTCTTTAAATAGGGGACANGTTGTCTCGAAACTTGGGACGANTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTANACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGANTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGNTACCAACTGATCGAACAGGGCCCGTCTTNACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGNTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATACGCGATTTTTTAACTAGACACTCGNCTTTCTCACTC--GACACT--ACTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGAC-TTA--TTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGACACTCGA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
Reference ( family-1966 )     : NNNNACNGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGGCGC-GATGGCACGATAGCACGATG--GTGATGGTACGATGAC-ACGATG---G--T----GATG--G--------CACGAC--GGCACGATGACGATGACGCGATATTNTATCGCGT-----CTTC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATCG---TGTCA-TC-T-G-C-GTCACNATCGTGCTATCGTACCATTGCGCCATCGCCATCGTGTCGTCGT-CCGTCA---CCATCGTGCTATCG-TTCTACTGTNCCATCACCATCGTGTCGTCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTNAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACNTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTCTTTT-CTC--CTTCTTCTCCTATATCNAGAAATGG-AATCCAATANAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--TA-NTT--AATGTATCTTACTAATGAATTCCAAAGTTTTCGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAANGTATNGGGTTCGGCATGNTACTCATGTGTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTNAGCGTAATTNTTATGCCATNGAGANCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGGCGGACACTATATTCGTATATNCTTAGTACTGTTTCTACCNAGGAATACACCGAACNTGATTTANAATAGTAACNTGTGTCACAATCAAAGTGANATAAATANATTTNAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCNACTNACTGANATCNTTCCCGTTTGAAATGNTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATNGGACGAGNTGTCTTTAAATAGGGGACANGTTGTCTCGAAACTTGGGACGANTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTANACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGANTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGNTACCAACTGATCGAACAGGGCCCGTCTTNACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGNTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATACGCGATTTTTTAACTAGACACTCGNCTTTCTCACTC--GACACT--ACTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGAC-TTA--TTACTCGACACTCGACTTTCTTATTCGACACTCGA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|1                          :     ACGGTATATGCTACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCATACGCGATGCCACAATAGTACGATGACACGATGGTGATGGCAC-GATAGTACGATAGCACGATG--GTGATGGTATGATGAC-ACAATG---G--T----GATG--A--------CACGAT--AGCACGATGACGATGACGCAATATTGCATCGCGC-----CATC--------GTCATCG---TGCCA-------TCACCATTG---TGTCA-TC-TTA-CTATCACGATCGTGCTATCGTACCATCGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTACCATCA---CCATCGTGCTATCG-TTCTACTGTGCCATCACCATCGTGTCATCGTGCTATCGT-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTGTGTCTTTATATTAAAGAATGTATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTCAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTTTCCTCCTCCTTTTTCTTCTTGTTTTACTT--CTTCTTCTTCTATATCTAGAAATGG-AA---AAGAAAGGGGAACGCT-TACTCGTGTACTATATTTTAACACGACAATGAATATATAATAAAA--CA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTCGCAGTGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAAGGTATTGGGTTCAGCATGATATACATGTGTTACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTCTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTTAGCGTAATTGTTATGCTATCGAGAGCTAACAGACGATCAGAGGGTCGTAGGTTTGATCCTCCGCCACAGTTATGTGTGAGGCGAACACTATATTCGTATATGCTTAGTACTGTTTCTACCAAGGAATACACCGAACGTGATTTATAATAGTAACGTGTGTTACAATCAAAGTGACATAAATAAATTTTAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCTATTTACTGAAATCATTCCCGTTTGAAATACTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATTGGACGAGATGTCTTTAAATAGGGGACACGTTGTCTCGAAACTTGGGACAAATTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGATAGACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTGTAGAATACTGGCGGGTATTCTAACTCATGACCCCTGGATTGACAGTCAGACACGCTACCAACTGATCGAACAGGGCCAATCTTTACCATGTATGACCAATCCACTTTGAACAGTGATCACTAATTCCTAA---------TAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACAC-CGACTTTCTTGCTCAATACACAATTTTTTAACTAGACACTCGTCTTTCTCACTC--GACACTGAACTTTCTCACTCGACACTCGACATTCTTACTCGACATTC--TTTCTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGACACTTAA-------AACTCTACCAAAGGTGACA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             accgTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGGGAAACTGTGTATAATCTTATTCTCCTCCTCCTta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATGGGATTCTTATAATAGTAT-GGAAGGTATAGTTATGTCTTCATATTACAG----TATGTACATGTTACTCATTCAATTCATTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTTATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCATCTTTGTACTTTGA
gi|13                         :     ACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACACGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGAT--------T-GCAAGATAGCACGATG--GTGATAGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tattcaaaGACACTCCATTTTCTTACTCTGAACACTCTACTTTCCTACTTGGCACACAACTTTATTATTCAAC-TTATTTTACTTGACACTCAACTTTTTAACTCGACACTCAACATTTTGAACTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GA-AGTCCAGTGCAGGAGAACG---TGATAGTATACTTCAGTTTAACAAAACAATGAATATATAATAAGA--TA-CTTTAAATTTCCCTTATTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                       taa--------CACGGC--AGTACGATGAGGAAGACACGACATTTTATCGTAT-----CTTC--------GTTATCA---TGCCACCGCTCCTCACCACAG---TGCTA-TCAT-GCC-GTCACCATgat
gi|17                         :             T--TGCGGTGTTCCATTAGGGCTACCGTGATATCG--------AC-----TGCACGATG--GCGATGGAGCGAAGTTACGATGGTG-TTGTGCAGAAGGAACG
gi|19                         :                                                                                                          -GGTGACATGACAGCACGATG--GTAATGGTATGCT-ACAACAATG---G--TGATGGATG--G--------AGCAAT--GGCACG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCGCCATTGTACGGTGTT-CCGTTAGGGCCATCGTGCTATCG-CTTTca
gi|2                          :   gcactcaatga--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCACACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGACGC-GATGACACGATGACACAATG--GTGATGGTACGGTGAC-ACGATG---G--T----GATG--GAGCGATTCTACGAT--GGCACGATGACGATGA-------------CGCG--------------------------------A-------TTATTATCG---TGTCA-TC-------GTCA-----------TCGTGCCATTGTGCCATCACCATTGTGTCATCGT-C----A---CCATCGTGCTAGCG-AACTATCGTGCCATCTGCATCGTGTCATCGTGCTATCATAGCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATGAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTAATGATAAACTATGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTTCTTTTTCTTCTTCTT-----------------CTATAACAAAAAATGG-AA---AATCAAGAGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACATTGAATATATAATGACA--TA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTTGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTGT-ACC--AGCACTGAACAGTTGTTgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcactcaatgaatcgccattgTCATATTTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTTGTCTCGAAACTTGGGACGAGTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTATACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTTGATTGACAGTCAGACACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATATTCAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTTTCTCACTC--GACA-------TTTTTACTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGAC--------ACTCAAAACTCTACgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagTA--TTACTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACACTCGA-------CACTCTACCAAAAGTGATAcaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTCAACACGCGACTTTTTAACTCAACACTCGACc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attttaaGGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTCTTTGGTAAGGCTTagttagaactcctc
gi|23                         :                                                                                                                                                    GATG---GAGC----GATG--C--------TACGAT--GACACGATGACGATGACGCGATATT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCAGGTCTTCAACCTCATGACCACTGGACTGACAGTCAGGCAC
gi|3                          :                                                                                                                   GATAGAACGATACTGTGGTGGTAAGAGGCC-ATGATA---G--TT---GTTG--G--------T-TGTCTTGG---GAT-ATAGTAACGTAATA--CTATCATGTTCAAACTTCAGACGCCAGGCATCGGTCTGACA-------TT-TCATCGCGGTGTCAGTC-T-G----TCAGTATCGTGATATAG--CCACTGC--CACCACCATCGCATC-TC-T-TTGTCG---CCATCATAACATAGATTCTGCTGTTGTATCACCATCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGTATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTTTAGTCTTCTTCTCCTCCTCCT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gta-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTAT-TGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTATTCTCCTCCTCCTcct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTATTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTAGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTATTCTCCTCTTCCcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTCTTCTTCATCTTCGTTTTCTTCTTCTTTTTCTCGGCTTCTTTTCCTACTTGCAGTTATGACAATCTAATACAAGGGGACGTGATACTCGTATAATTTATTTAAACAAAACAGTGTACATACAATAAAACTTATTTT--AATGTATCTTACTAA--AATTTGAATGTTTTCAAAAAGAATTACT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAAGTGGGATTCTTATAAAAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCAGTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCATACATGTATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTATTTTTCTCCTCCT
gi|9                          :                                                                                                                                                C-ACAATGAAAG--T----GATGAAG--------CA-GAAAAGGCACAATGACAAAAATGCCATTTTATATCGCTT-----CTTC--------ATCATCG---T--------------CCATCG---CTCCA-TC-T---------CAGTGGTGCTGTCATAGCATTGCGTCTTTGTCTTCATGCCTTCA---CTTCA---TCATTG----------TCCACTGCTCCATCACTATGGTGCTGTCAT


blockSeqs                     :       T      .                                 C         AC            C                          A TGTGCA   G                CT         C   G  A      GTGATG         GAGCGATTCTACGAT                    C  G   TTT       TTCAAACTTCAGACGCCAGGCATCGGTCTGACATT              CGG     G  ATGCCG     CC  C   A     TG       GC               G  TTCCGTTAGGG               AT        G                             A                                                                     T   .                                                        TACATG            T                                                           TTTCTCGG      TTC       A        C  TCC   GC         TGA                       A    A                CT  TT  TA       C   TT  T                                              T    A            T           C   T           AG                                           A         T         A    T                                                                            T                  C               T       A         T           .       A       C    A                                        A   A     T   T               G                                      G       T                   A                      G                                                                                             T                                   T                                                 A                      C     A                               C              TTGGGTGTT                               T                   T                      A           TG    CTCT                                   TTATT                                    CATTTTG
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATGGGATTCTTATAATAGTAT-GGAAGGTATAGTTATGTCTTCATATTACAG----TATGTACATGTTACTCATTCAATTCATTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTTATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCATCTTTGTACTTTGA
gi|13                         :     ACTGCATAT--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACACGCATACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGAT--------T-GCAAGATAGCACGATG--GTGATAGTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tattcaaaGACACTCCATTTTCTTACTCTGAACACTCTACTTTCCTACTTGGCACACAACTTTATTATTCAAC-TTATTTTACTTGACACTCAACTTTTTAACTCGACACTCAACATTTTGAACTCT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GA-AGTCCAGTGCAGGAGAACG---TGATAGTATACTTCAGTTTAACAAAACAATGAATATATAATAAGA--TA-CTTTAAATTTCCCTTATTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                       taa--------CACGGC--AGTACGATGAGGAAGACACGACATTTTATCGTAT-----CTTCGT--------TATCA---------TG------CCACCG---C-----TC-----CTCACCACAGTGCTATCATGCCGT--CACCATgat
gi|17                         :             T--TGCGGTGTTCCATTAGGGCTACCGTGATATCG--------AC-----TGCACGATG--GCGATGGAGCGAAGTTACGATGGTG-TTGTGCAGAAGGAACG
gi|19                         :                                                                                                          -GGTGACATGACAGCACGATG--GTAATGGTATGCT-ACAACAATG---G--TGATGGATG--G--------AGCAAT--GGCACG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATCGCCATTGTACGGT-GTT---CCGTTAGGGCCATCGTGCTATCG-CTTTca
gi|2                          :   gcactcaatga--TACGGTGTTCCGTTAGGGCCATCGTGCTATCGCTTTGTCAACAAGCACACGCGATGCCACGATAGCACGATGACACGATGGTGATGACGC-GATGACACGATGACACAATG--GTGATGGTACGGTGAC-ACGATG---G--T----GATG--GAGCGATTCTACGAT--GGCACGATGACGATGACGCGAT-------------------------------TATT--------------------ATCG---TGTCA-TC-----GTCA-----------TCGTGCCATTGTGCCATCACCATTGT---GTCATC-----GTC---ACCATCGTGCTAGCG-AACTATCGTGCCATCTGCATCGTGTCATCGTGCTATCATAGCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATGAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAGCATTGTACTTTAATGATAAACTATGTATAGTCTTCTTCTCCTCCTTCTTTTTCTTCTTCTT-----------------CTATAACAAAAAATGG-AA---AATCAAGAGGAACGCT-TACTCGTGTACTTTATTTTAACACGACATTGAATATATAATGACA--TA-ATT--AATGTAT-TTA--AATGAATTCCAAAGTTTTTGCAATGAATTACTAGTCTAGTTGTCTAGAATGTATAAGGTTCGGCATGTTACTCATGTGT-ACC--AGCACTGAACAGTTGTTgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcactcaatgaatcgccattgTCATATTTCACTTGAACAATGAAC--TTGTTCACTTTTCTCTTACCATTTGATTGTTGAGTTGAGTGTTAAGCGTAATTTTTATGCCATAGAGATTTAACAGACGATCAGAGGGTCGTGGGTTTGATCCTCCGCCACGGTTATGTGTGAGACGGACACTATATTCGTATATTCTTAGTACTGTTTCTACCCAGGAATATACCGAACTTGATTTAAAATAATAACTTGTGTCACAAT----GTGAAATAAATACATTTAAAGTAAGTGTTAACAGACGATCAGTTAAACTCATTTGCGCAACTAACTGATATCTTTCCCGTTTGAAATGGTACAGGAAATAATTAATTGGGACGACTTGTCTTTTGATGGGACGAGTTGTCTTTAAATAGGGGACAAGTTGTCTCGAAACTTGGGACGAGTTGTCTCAAAATGTGGGACGAGTTGTCTTTGGGACGACTTGTCCATAACTCTTTTGAAACAGTGGTTAGAGACGAATGACAATGAGACTGGTATACGTTTATCAGTCATCACGGAGAATGTGTTATAGATTACTGGCGGGTATTCAAACTCATGACCCCTTGATTGACAGTCAGACACGATACCAACTGATCGAATAGGGCCCGTCTTAACCATGTATGGCCAATCCACTTTGAACAGTGCTCACTAATTCCTAATTGGGTGTTTAACTACCAAAAATATTTTCTTACTCGACACTCGACTTTCTTGCTCAATATTCAGTTTTCTTACTAGACACTTGTCTTTCTCACTC--GACA-------TTTTTACTCGACACTCGACTTTCTTTTTCGAC--------ACTCAAAACTCTACgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagtcatatttcacttgaacaatgaacttgttcacttttctcttaccatttgattgttgagttgagtgttaagcgtaatttttatgccatagagatttaacagacgatcagagggtcgtgggtttgatcctccgccacggttatgtgtgagacggacactatattcgtatattcttagtactgtttctacccaggaatataccgaacttgatttaaaataataacttgtgtcacaatgtgaaataaatacatttaaagtaagtgttaacagacgatcagttaaactcatttgcgcaactaactgatatctttcccgtttgaaatggtacaggaaataattaattgggacgacttgtcttttgatgggacgagttgtctttaaataggggacaagttgtctcgaaacttgggacgagttgtctcaaaatgtgggacgagttgtctttgggacgacttgtccataactcttttgaaacagtggttagagacgaatgacaatgagactggtatacgtttatcagtcatcacggagaatgtgttatagattactggcgggtattcaaactcatgaccccttgattgacagtcagacacgataccaactgatcgaatagggcccgtcttaaccatgtatggccaatccactttgaacagtgctcactaattcctaattgggtgtttaactaccaaaaatattttcttactcgacactcgactttcttgctcaatattcagttttcttactagacacttgtctttctcactcgacatttttactcgacactcgactttctttttcgacactcaaaactctaccaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcactcaatgaatcgccattgtacggtgttccgttagggccatcgtgctatcgctttgtcaacaagcacacgcgatgccacgatagcacgatgacacgatggtgatgacgcgatgacacgatgacacaatggtgatggtacggtgacacgatggtgatggagcgattctacgatggcacgatgacgatgacgcgattattatcgtgtcatcgtcatcgtgccattgtgccatcaccattgtgtcatcgtcaccatcgtgctagcgaactatcgtgccatctgcatcgtgtcatcgtgctatcatagcatcgccttcctgtatttaagtgggattcttataatagtatcggaaggtatagttatgtctttatatgaaagtatgtacatgttagtcattcaactcgttttgtgtttatgtgtttaaatatgcatattactgcagcattgtactttaatgataaactatgtatagtcttcttctcctccttctttttcttcttcttctataacaaaaaatggaaaatcaagaggaacgcttactcgtgtactttattttaacacgacattgaatatataatgacataattaatgtatttaaatgaattccaaagtttttgcaatgaattactagtctagttgtctagaatgtataaggttcggcatgttactcatgtgtaccagcactgaacagttgttgaaaacgacaataaacacccaacaatacaatacaatatacgttcagTA--TTACTCGACACTCGAATTTCTTATTCGACACTCGA-------CACTCTACCAAAAGTGATAcaaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTCAACACGCGACTTTTTAACTCAACACTCGACc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        attttaaGGACAATTTGTCACAAAATGTGGAACACATTGTCTTTGGTAAGGCTTagttagaactcctc
gi|23                         :                                                                                                                                                    GATG---GAGC----GATG--C--------TACGAT--GACACGATGACGATGACGCGATATT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCAGGTCTTCAACCTCATGACCACTGGACTGACAGTCAGGCAC
gi|3                          :                                                                                                                   GATAGAACGATACTGTGGTGGTAAGAGGCC-ATGATA---G--TT---GTTG--G--------T-TGTCTTGG---GAT-ATAGTAACGTAATA--CTATCATGTTCAAACTTCAGACGCCAGGCATCGGTCTGACATT-------TCATCGCGGTGTCAGTCT----GTCAGTATCGTGATATAG--CCACTGC--CACCACCATCGC---ATCTCT---TTGTC---GCCATCATAACATAGATTCTGCTGTTGTATCACCATCG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGTATTCTTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTTTAGTCTTCTTCTCCTCCTCCT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gta-GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTCTTATAATAGTATCGGAAGATATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCGTTTTGTGTTTAT-TGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTATTCTCCTCCTCCTcct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GCATCGCCTTCCTGTATTTAAGTGGGATTATTATAATAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTGTTTATATTTAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTAGTTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCA------TATTACTGCAACTTTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTCTTATTCTCCTCTTCCcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTCTTCTTCATCTTCGTTTTCTTCTTCTTTTTCTCGGCTTCTTTTCCTACTTGCAGTTATGACAATCTAATACAAGGGGACGTGATACTCGTATAATTTATTTAAACAAAACAGTGTACATACAATAAAACTTATTTT--AATGTATCTTACTAA--AATTTGAATGTTTTCAAAAAGAATTACT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAAGTGGGATTCTTATAAAAGTATCGGAAGGTATAGTTATGTCTTTATATTAAAG----TATGTACATGTTAGTCATTCAACTCAGTTTGTGTTTATGTGTTTAAATATGCATACATGTATTACTGCAACATTGTACTTTGATGAGAAACTGTGTATAGTATTTTTCTCCTCCT
gi|9                          :                                                                                                                                                C-ACAATGAAAG--T----GATGAAG--------CA-GAAAAGGCACAATGACAAAAATGCCATTTTATATCGCTT-----CTTCAT--------CATCG---------T-------CCATCG---CTCCA-TC------TCA--GTGGTGCTGTCATAGCATTGCGTCTTTGTCTTCAT---GCCTTC---ACTTC---ATCATTG----------TCCACTGCTCCATCACTATGGTGCTGTCAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TGTATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTAAAATGGAAAA