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Reference ( gi|1 ) : TGTGGACATGTTTGAGTTAATGTCAAAGAATAAGTATAAAATTTGAAAAAATAATTTTA-----GTGAAAATTTGATAAA-TAATTCTAT-TGAAAATGGCTTTTCCATGTGGTGATTGTGGTAAGCATTGTGTCAGATCATGC-ATTGCATGTGAAGGTTGTGATCAGTGGTTTCATATTAGATGTCAAAAAATAAT-AAAGTCACAACTGGCTACTTTGACTTCTACATTGTGTGACTTCTTTTGTTTTAGCTGTACTTATAAAAATGGGGAGTTTGATTACAAATTATCGCATGAACGTCTTGAAAAATTTTG--CTGAGACGGGGAATCTAAATGAGGGTGTAGTAATTGAAAAGCTTTTGATGCGAAAAGAAAATATAAAACCG-----------AACTGATGTTACATTTAGCTCAGGGAAACTCACCGAAGATAGTGCGTCTCAAAATATGTTACAGTCTCTCGGCATGTCGGTCCCAGGAAAATCACCGATTTTTGTTAGCGGTGACGGGAATTGTCTTTT-AA-TGCAATTTCTATGGCATTGTTTGGGCATGAAGAAATGTCTA-TGAAATTA--G--TCAAAACGTGTATTGAACTGATGGAAAATAAGTCAGAGTACGAAAATCATAACACCCATT-GCTTTTGGTATCACCATCAGTAGATGAAGCGTGCCGAGAGACTGCTAAAAACCATAGCTTCTCCTCCGCCTGGGCTATGGTCACTGCAGCATCAGTCATTGGATGTCTTATCCAGTCAGTGTATCCACCTAATAA-TGGTATTTTGGACAAAGCAATTGGTATATTAAACCAAACTTTCC----AACCACT---TGGAAAAATCTCTAAATGTGATCCAATTTTGGTTTTATGGATACACACAAATTCCGGTTTACAGAAAACGTAGACACCCAACCACTTTGTACC-ATGATATGAAGCGCCTCCCCGTGGTGTGGCCTGGATACACTTTTACCTTCTTAAGGTAAATTTGTAACGAAACGCTTCTATTCAGCTAAAAATAATACAATAAGATAATAAAGAAAAAAT-----ATTAAA--TT-AAAATTAATACGATAAAATAATAAAGA------AGATTAATAA-----------------TGTG---TATGTAGTCCA-CG-ACAC-C----ATCGCTTC-T-GA----------C----------ACTAAATAGTGATATTACCTGTAA--CGAAACATTTCTTGACGCT----T-CTTGACTCTTCTTGTCGCTAAATAGTGATTTTTACCTGAAAGGTTT-TTGATGCCAAGTTAATTTTGGCTTGTTGTCAAA---------AAA-TA--AAATTAAA-----TTTGAAAA---TGTC-C-T-TA-TGTATTCAATAGTAATTTATT-AA-T-TA--AGTGTGGAATAGGTGTATAGTTAAATG--AAATGT-AGAT-CG-AGATA----T-AGT-T--TGACG-CTTCTTGACGCTAACGGGTTACTATCCTTTGCATAAACAAAATGGCCGATCTTCTTGTCGGTATCGCAACGGAGAAACAAATTTCAATTATGACTTTATTAATGAATGGAATTTAAAAAAAATCAACTGATATATGTTTAT-ATAGGTATAATATACA-C-ATG-----T-TT-TTTCCTGACGGTAACTTTTATTAATAATAAGGCTCTTGACG--CTTCTTGTCGCTTCTTG
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gi|23 : gccag-TTTTCTGTTGGTAACTTTTATGAACAATAAAGCTCTTGAGGGCCTTCaatgggctccactgtcaactggagacacttcttgacgctaaatagtgtaa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): ATGGTGTGATACACAAAATGCAAAGATCTGTAATATTAAACTTTCACTTAATGTATTTAATAACGACAATTAGTATCATTATAAACATGTCAA
Unaligned ( gi|22 ): TTATTCATTTCATACTAAAAAATACATGTTTACATATGTAAATTGTTTCAGTATTTTCC
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Reference ( family-1878 ) : NGTGGACATGTTTGAATTAATGTCAAAAAAT-----GTGTAAAATTTGANA-AAATATTTTTA-----GTGAAA-ATTTGATGAA-TA-TTC-GA--GTGAAAATGGCTTTTCCATGTGGCGATTGTGGTAAGAATTGTGTCAGATCATG-CGTTGCATGTAAAGGCTGTGATCAGTGGTTCCATATTAGATGCCAAAAAATAAT-AAAGTCACAATTGGCTACTTTGACTT-CTCCGTTGTGTGACTTCTTTTGTTTTGGCTGTACTTATTAAAATGGGGAGTTTGATTACAAATTATCGCTTGAACGTCTTGAAAAATTTTA--CTGAGACGGGGAATCTAAATGAGGGTGTAGTAATTGAAAAGCTTTTGATGCGAAAAGAAAATATGGAACCGTTGAGTGAGCGAACTGATGTTACATTTAGCTCAGGGAAACTCACCGGAGATAGTGTGTCTCAAAATATGTTGCAGTCTCTNGGCATGTCGGTCCCGGGAAAATCACCGATTTTTGTTAGCGGTGACGGGAATTGCCTTTTTAAATGCAATTTCTATGGCATNGTTTGGGCATGAAGAAATGTCTAATGAAATTAAAGAGTCAAAACGTGTATTGANCTGACGGAAAATAAGTCAGAGNACGAAAATCGTAGCGCCCGTTTGCTCTTGGTATCACCATCAGTAGATGAAGCGTGCCNAGAGACTGCTAAAAACCACAGCTTCTCCTCCGCCTGNGCTATGGTCGCTGCAGCATCAGTCACTGGATGTCCTATCCAGTCAGTNTATCCACCT-AAAAATGGTATTTTGGACGAAGCAATTGGTATATTAAACCAAACTTTCC----AACCACT---TGGAAAAATCTCTAAATGTGATCCAATTTTGGTTTTATGGNCACACACAAATTCCGGTTTCCAGAAAACGTGGACACCCAACCACTTTGTACCTATGATATGAAGCGCCTCCCCGTGGTGTGACCTGGATACACTTTTACCTTCTTATGGTAAATTTGTAACGAAACGCTTCTATTAAGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAGAAATTTGTTATTAAA--TTAAAA-TAATAC-ATAAAATAATAAAGA------AGANTAATAA-----------------TGCG---TATGTAGTCCAT-G-ACA-C-C----GTCGCT-------TCT--T---------TGAC----------GCTAAATAGTGATATTACCTGTAGCGAAACATTTCTTGACGCT-------T-CTTGACGCTTCTTGNCGCTAA-----ATAGTGATTTNTACCTGAANGGTTTCTTGACGCTAAGTTNATTTTGGCTTGTTGTCAAA-AAA-TA--AAATTAAA-----TTTGAA---AA---TGTC-C-T-T-A-TNTATTTAATANTAATNTATTAA-TTA-T-A-GTGTGGAATATGTATATAGTTANATG--AAATGT-AGAT---CGATATA----T-AGTT--TG--ACG-CTTCTTGACGCTAACGGGTTACTATCCTTTGCATAAACAAAATGGCGGATCTTCTTGTCGGTATCGCAACGGAGAAACAAAGTTCAATTATGACTTTATTAATGAATGGAATTTAAAAAAAATCAACTGATATATGTTTAT-ATAGGTATA--ATATACACATGG--TTATTTCCTGTCGGTAACTTTTATTAATAATAAAGCTCTTGACG--CTTCTTGTCGCTTCTTG
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gi|11 : cttgacgctatttaaaagattgcttgatactgatattgtgagaaaaaatAA-TA--GA-TTAAAATAT-TTT------AA---TGTC-C-T-TTA-TTTATTTAATATTGATGTATTAAATTA-TTA-GTGGAGGATATGTACATAATTAGAT---CTATGA-AGAC---CAATACAG---T-A-TG--TG--ACA-CTTCGTAATGCTTATAGGTtgataatcctatacaacaaccatattaatagattaaaatattttaatgtcctttatttatttaatattgatgtattaaattattagtggaggatatgtacataattagatctatgaagaccaatacagtatgtgacacttcgtaatgcttataggt
gi|12 : cttgacgctatttaaaagattgcttgatactgatattgtgagaaaaaattatgtagtttgtggcccttcttggcactaataggtcacatgtaatgaaacgcttctttgataatcctatacaacaaccatattTGTATAGTTATATG--AAATGT-AGAT---CGATATA----T-AGTT--TG--ACG-CTTCTTGATGCTAACGGGTTACTATCCTTTGCATAAACAAAATGGTAGATCTTCTTGTCAGTGTC-------------AAAGTTCAATTATGACTTTATTAATGAATGGAACATAAAA-AAATCAACTGATATATGTTTAT-ATATGTATA--ATGTATACATGG--TTATATCCTGTCGGTAACTTTTATTAATAATAAAGCTCTTGATG--CT
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Reference ( family-1878 ) : NGTGGACATGTTTGAATTAATGTCAAAAAATA-----AGTGTAAAATTTGAAA-AAATATTTTTA-----GTGAAA-ATTTGATGAA-TA-TTC-GA--GTGAAAATGGCTTTTCCATGTGGTGATTGTGGTAAGAATTGTGTCAGATCATGC-GTTGCATGTGAAGGCTGTGATCAGTGGTTCCATATTAGATGTCAAAAAATAAT-AAAGTCACAACTGGCTACTTTGACTTCTACATTTTGTGACTTCTTTTGTTTTGGCTGTACTTATNAAAATGGGGAGTTTGATTACAAATTATCGCTTGAACGTCTTGAAAAATTTTA--CTGAGACGGGGAATCTAAATGAGGGTGTAGTAATTGAAAAGCTTTTGATGCGAAAAGAAAATATGGAACCGTTGAGTGAGCGAACTGATGTTACATTTAGCTCAGGGAAACTCACCGAAGATAGTGCGTCTCAAAATATGTTGCAGTCTCTCGGCATGTCGGTCCCGGGAAAATCACCGATTTTTGTTAGCGGTGACGGGAATTGTCTTTT-AA-TGCAATTTCTATGGCATTGTTTGGGCATGAAGAAATGTCTAATGAAATTA-A-GTCAAAACGTGTATTGAACTGACGGAAAATAAGTCAGAGTACGAAAATCGTAACGCCCGTTTGCTTTTGGTATCACCATCAGTAGATGAAGCGTGCCGAGAGACTGCTAAAAACCATAGCTTCTCCTCCGCCTGGGCTATGGTCGCTGCAGCATCAGTCATTGGATGTCCTATCCAGTCAGTGTATCCACCTAAAA-ATGGTATTTTGGACAAAGCAATTGGTATATTAAACCAAACTTTCC----AACCACT---TGGAAAAATCTCTAAATGTGATCCAATTTTGGTTTTATGGACACACACAAATTCCGGTTTCCAGAAAACGTGGACACCCAACCACTTTGTACC-ATGATATGAAGCGCCTCCCCGTGGTGTGGCCTGGATACACTTTTACCTTCTTANGGTAAATTTGTAACGAAACGCTTCTATTNAGCTAAAAATAATACAATAAGATAATAAAGAAGAAATTTGTTATTAAA--TTAAAA-TAATACGATAA--AATAATAAAGA------AGATTAATAA-----------------TGCGTATGTAGTCCA-TG-ACA-C-C----GTCGCT-------TCT--T---------TGAC----------GCTAAATAGTGATATTACCTGTGACGAAACAT--TTCTTGACGC--T-------T-CTTGACGCTTCTTGNCGCTAA-----ATAG-TGATTTNTACCTGAAAGGTTTCTTGACGCTAAGTTAATTTTGGCTCGTTGTC--AAA-AA--A-TA-----AAATTAAA-----TTTGAA---AA---TGTC-C-T-T-A-TNTATTTAATAGTAATNTATT-AATTA-T-A-GTGCGGAATATGTNTATAGTTANATG--AAATGT-AGAT---CGATATA----T-AGTT--TGACG-CTTCTTGACGCTAACGGGTTACTATCCTTTGCATAAACAAAATGGCGGATCTTCTTGTCGGTATCGCAACGGAGAAACAAAGTTCAATTATGACTTTATTAATGAATGGAATTTAAAAAAAATCAACTGATATATGTTTAT-ATAGGTATA--ATATACACATGG--TTATTTCCTGTCGGTAACTTTTATTAATAATAAAGCTCTTGACG--CTTCTTGTCGCTTCTTG
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Reference ( family-1878 ) : NGTGGACATGTTTGAATTAATGTCAAAAAATA-----AGTGTAAAATTTGAAA-AAATATTTTTA-----GTGAAA-ATTTGATGAA-TA-TTC-GA--GTGAAAATGGCTTTTCCATGTGGTGATTGTGGTAAGAATTGTGTCAGATCATGC-GTTGCATGTGAAGGCTGTGATCAGTGGTTCCATATTAGATGTCAAAAAATAAT-AAAGTCACAACTGGCTACTTTGACTTCTACATTTTGTGACTTCTTTTGTTTTGGCTGTACTTATNAAAATGGGGAGTTTGATTACAAATTATCGCTTGAACGTCTTGAAAAATTTTA--CTGAGACGGGGAATCTAAATGAGGGTGTAGTAATTGAAAAGCTTTTGATGCGAAAAGAAAATATGGAACCGTTGAGTGAGCGAACTGATGTTACATTTAGCTCAGGGAAACTCACCGAAGATAGTGCGTCTCAAAATATGTTGCAGTCTCTCGGCATGTCGGTCCCGGGAAAATCACCGATTTTTGTTAGCGGTGACGGGAATTGTCTTTT-AA-TGCAATTTCTATGGCATTGTTTGGGCATGAAGAAATGTCTAATGAAATTA-A-GTCAAAACGTGTATTGAACTGACGGAAAATAAGTCAGAGTACGAAAATCGTAACGCCCGTTTGCTTTTGGTATCACCATCAGTAGATGAAGCGTGCCGAGAGACTGCTAAAAACCATAGCTTCTCCTCCGCCTGGGCTATGGTCGCTGCAGCATCAGTCATTGGATGTCCTATCCAGTCAGTGTATCCACCTAAAA-ATGGTATTTTGGACAAAGCAATTGGTATATTAAACCAAACTTTCC----AACCACT---TGGAAAAATCTCTAAATGTGATCCAATTTTGGTTTTATGGACACACACAAATTCCGGTTTCCAGAAAACGTGGACACCCAACCACTTTGTACC-ATGATATGAAGCGCCTCCCCGTGGTGTGGCCTGGATACACTTTTACCTTCTTANGGTAAATTTGTAACGAAACGCTTCTATTNAGCTAAAAATAATACAATAAGATAATAAAGAAGAAATTTGTTATTAAA--TTAAAA-TAATACGATAAA--ATAATAAAGA------AGATTAATAA-----------------TGC-T-ATGTAGTCCAT-G-ACA-C-C----GTCGCT-------TCT--T---------TGAC----------GCTAAATAGTGATATTACCTGTGACGAAACAT--TTCTTGACGC--T-------T-CTTGACGCTTCTTGACGCTAA-----ATAG-TGATTTNTACCTGAAAGGTTTCTTGACGCTAAGTTAATTTTGGCTCGTTGTC--AAA-AA--A-TA-----AAATTAAA-----TTTGAA---AA---TGTC-C-T-T-A-TNTATTTAATAGTAATNTATTAA-TTA-T-A-GTGCGGAATATGTNTATAGTTANATG--AAATGT-AGAT---CGATATA----T-AGTT--TGACG-CTTCTTGACGCTAACGGGTTACTATCCTTTGCATAAACAAAATGGCGGATCTTCTTGTCGGTATCGCAACGGAGAAACAAAGTTCAATTATGACTTTATTAATGAATGGAATTTAAAAAAAATCAACTGATATATGTTTAT-ATAGGTATA--ATATACACATGG--TTATTTCCTGTCGGTAACTTTTATTAATAATAAAGCTCTTGACG--CTTCTTGTCGCTTCTTG
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Reference ( family-1878 ) : NGTGGACATGTTTGAATTAATGTCAAAAAATA-----AGTGTAAAATTTGAAA-AAATATTTTTA-----GTGAAA-ATTTGATGAA-TA-TTC-GA--GTGAAAATGGCTTTTCCATGTGGTGATTGTGGTAAGAATTGTGTCAGATCATGC-GTTGCATGTGAAGGCTGTGATCAGTGGTTCCATATTAGATGTCAAAAAATAAT-AAAGTCACAACTGGCTACTTTGACTTCTACATTTTGTGACTTCTTTTGTTTTGGCTGTACTTATNAAAATGGGGAGTTTGATTACAAATTATCGCTTGAACGTCTTGAAAAATTTTA--CTGAGACGGGGAATCTAAATGAGGGTGTAGTAATTGAAAAGCTTTTGATGCGAAAAGAAAATATGGAACCGTTGAGTGAGCGAACTGATGTTACATTTAGCTCAGGGAAACTCACCGAAGATAGTGCGTCTCAAAATATGTTGCAGTCTCTCGGCATGTCGGTCCCGGGAAAATCACCGATTTTTGTTAGCGGTGACGGGAATTGTCTTTT-AA-TGCAATTTCTATGGCATTGTTTGGGCATGAAGAAATGTCTAATGAAATTA-A-GTCAAAACGTGTATTGAACTGACGGAAAATAAGTCAGAGTACGAAAATCGTAACGCCCGTTTGCTTTTGGTATCACCATCAGTAGATGAAGCGTGCCGAGAGACTGCTAAAAACCATAGCTTCTCCTCCGCCTGGGCTATGGTCGCTGCAGCATCAGTCATTGGATGTCCTATCCAGTCAGTGTATCCACCTAAAA-ATGGTATTTTGGACAAAGCAATTGGTATATTAAACCAAACTTTCC----AACCACT---TGGAAAAATCTCTAAATGTGATCCAATTTTGGTTTTATGGACACACACAAATTCCGGTTTCCAGAAAACGTGGACACCCAACCACTTTGTACC-ATGATATGAAGCGCCTCCCCGTGGTGTGGCCTGGATACACTTTTACCTTCTTANGGTAAATTTGTAACGAAACGCTTCTATTNAGCTAAAAATAATACAATAAGATAATAAAGAAGAAATTTGTTATTAAA--TTAAAA-TAATACGATAAA--ATAATAAAGA------AGATTAATAA-----------------TGC-T-ATGTAGTCCAT-G-ACA-C-C----GTCGCT-------TCT--T---------TGAC----------GCTAAATAGTGATATTACCTGTGACGAAACAT--TTCTTGACGC--T-------T-CTTGACGCTTCTTGACGCTAA-----ATAG-TGATTTNTACCTGAAAGGTTTCTTGACGCTAAGTTAATTTTGGCTCGTTGTC--AAA-AA--A-TA-----AAATTAAA-----TTTGAA---AA---TGTC-C-T-T-A-TNTATTTAATAGTAATNTATTAA-TTA-T-A-GTGCGGAATATGTNTATAGTTANATG--AAATGT-AGAT---CGATATA----T-AGTT--TGACG-CTTCTTGACGCTAACGGGTTACTATCCTTTGCATAAACAAAATGGCGGATCTTCTTGTCGGTATCGCAACGGAGAAACAAAGTTCAATTATGACTTTATTAATGAATGGAATTTAAAAAAAATCAACTGATATATGTTTAT-ATAGGTATA--ATATACACATGG--TTATTTCCTGTCGGTAACTTTTATTAATAATAAAGCTCTTGACG--CTTCTTGTCGCTTCTTG
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