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Reference ( gi|1 ) : TAAATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGAATTTAT--GTCCGATTCTAACTTTGAC--TTTT-CTGATCTGATCTGATGACAGAAGCAATTTAT-TTACATACATGTAGATCTACATGT----AA-ACAT-A-TAGCA------CAGAG----ATTCT-TTTTAATAATGCGCAAGAAGGGAAAGTTATAAAACGAGTTTGTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTA----ATGGAAGAACACAT-A-A--T--AGAATAATAAT-AA------------GTCATTTCTATTTTTACTGTTAT-ATTAACGGATAA---ATTGTTACTAGACCTACA------ATTAGTATAATTAA---AACTAC--CAC-TATCTATT---------AT---------T---------GTT--ATTA---ATTATTCATAACAA---AAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTT------GTAA------TAATTAT-ATTTAT-GG------TAGAAA-T-T--AT---TTATT-----A-T-----TA--GT-AGTA-A---AGGTAG----T-CCT--TAATTATTATTGTAAATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCTAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTATGGTTTTCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCAGATAAGTCCAATAAAATGTCACTAACGTCGATATCCCCATTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGCCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTTACTTTGTTAATTCTTTCGTGTATTACCGTGAGAGGTGTAATGCGCGTTATTGTTTCCGTGATTTACTGATAAACAAGAGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACC-GC-CAAT-CG-ATTTTATTGAAATAATAT-T-AA-AAAAA--AA-TAGCATTTTGTTTACCCTTTAAA
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Reference ( family-1857 ) : TAAATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGAATTTAT--GTCCGATTCTAACTTTGAC--TTTT-CTGATCTGATCTGATGACAGAAGCAATTTATTTACATACATGTAGATCTACATGT----AA-ACAT-A-TAGCATAGGGATTCT-TTTTAAAAATGCGCAAGAAGGGAAAGTAATAAAACGAGTTTGTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAGGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACTATTAT-ATTAACGGATAAA----TTGTTACTAGACCTACA------ATTATTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATNA--ATTATTCATAACAATAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTTGTATTAATTATAATTATGGTAGAA-----ATTATTTATTATTAGT-AGTA-A-AGGTAGTNCTTAATTAT-----TA---TTG----TAAATAATCT----GTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTAGGGTTTCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGATAAGTCCGATAAAATGTCACTAACGTCGGAATCCCCATTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTAACTCCGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGNGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TAATC--GATTTTATTCAAATA--ATAT-NAA-AAAA-AAA-TAGCATTTTGGTTACCCTTTAAA
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Reference ( family-1857 ) : TAAATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGAATTTAT--GTCCGATTCTAACTTTGAC--TTTT-CTGATCTGATCTGATGACAGAAGCAATTTATTTACATACATGTAGATCTACATGTAAACA-TAA---TAGCATAGGGATTCT-TTTTAAAAATGCGCAAGAAGGGAAAGTAATAAAACGAGTTTGTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAGGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACTATTAT-ATTAACGGATAAA----TTGTTACTAGACCTACA------ATTATTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATTA--ATTATTCATAACAATAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTTGTATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATTATTTATTATTAGT-AGTA-A-AGGTAGTCCTTAATTATTATTGTAAATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTAGGGTTTCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGATAAGTCCGATAAAATGTCACTAACGTCGGAATCCCCATTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTAACTCCGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGNGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TAATC--GATTTTATTCAAATA--ATATA-AA-AAAA-AAA-TAGCATTTTGGTTACCCTTTAAA
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gi|11 : tttttttttttttcataagtaaaataatagaataataataagtcatttccatttttactattatattaactgataaattgttacttgacctaccattattataattaaaactaccactttctattattgttattaattattcataataatagatctgataataaatatgtaatagttgtattaattataattgtaataatATAAA----TTGTTACTAGACCTACATGTACCATTATTATCATTAAAACTACCACTATCTATAATTGTTAAATGAATATTAATTATAATAATAGATTTGATAATAAATATGTAGTAGTTc
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gi|12 : ataaattgttactagacctacatgtaccattattatcattaaaactaccactatcATAATAGATATCTAGTAGTTGTATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATGATTTATTATTAGT-AGTA-TTAGGTAGTATTTAATTATTATTTTATATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATATAGGGCGCCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGAGAAGTCCGATAAAATGTCACTAACATCGGAATCCCCATTAAATTAA--CTCACT--CGTGAAATGTTTACGTCCACTGACGCCATCTTGAGTTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCTGTAACCTCGTTCACGTAACTCTGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGCGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATCAACCTC-TAATC--GATTTTAgt
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gi|6 : ATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGA-------------ATT-TA----TG-------T-CCGATCCGATTT---------------TTATTTACATACATGTAGATCTACATGTAAACA-TA----TAGCACAGAGATTCT-TTTTAATAATGCGCAAGAAGGGAAAGTTATAAAACGAGTTTCTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAAGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACTGTTAT-ATTAACGGATACA----TTGTTACTAGACCTACA------ATTAGTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATTA--ATTATTCATAACAATAGATCTAATAATAAATATGAAGTAGTTGTATTAATTATATTTATGGTAGA--AATTATTTATTATTAGT-AGTA-A-AGGTAGTCCTTAATTATTATTGTAAATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCTAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTATGGTTTCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCAGATAAGTCCAATAAAATGTCACTAACGTCGATATCCCCATTAAAATAA--CAC--T--CGTGAAATGTTTTCGCCCATTGAAGCCATCTTGAATAAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTAACTCCGTTAATTCTTTCGTGTATTACCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACTGATGAACAAGAGCGAATTTCATGAAAATAAAACCATTTTTATAAATCAC-CAATC--GATTTTATTCAAATA--ATga
gi|7 : TCTGATGACAGAAGCAATTTATTTACATACATGTAGATCTACATGTAAACA-TAA---TAGCATAGGGATTCT-TTTTAAAAATGCGCAAGAAGGGAAAGTAATAAAACGAGTTT------TTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAGGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACCATTAT-ATTAACGGTTGAA----TTATTACTAAACATACA------ATTATTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATTA--ATTATTCATAACAACAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTTATATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATTATTTTTTATATGT-AGTT-A-AGGAAGTTCTTAATTATTATTGTAAATAAT--GTTTCTCCATCAAGTACTACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTAGGGTTTCCTGTTCTTTATCACTGCTTGAGCCTGATAAGTCCGATAAAATGTCACTAACGTCGGAATCCCCGTTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTAACTCCGTTAATTATATCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGTGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGAGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TTATC--GATATTATTAAAATA--ATATA-AACAAAA-AAA-TAGCATTTTGGTTACCCTTAAAA
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Alignments
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Reference ( family-1857 ) : TAAATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGAATTTAT--GTCCGATTCTAACTTTGAC--TTTT-CTGATCTGATCTGATGACAGAAGCAATTTATTTACATACATGTAGATCTACATGTAAACA-TAA---TAGCATAGGGATTCT-TTTTAAAAATGCGCAAGAAGGGAAAGTAATAAAACGAGTTTGTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAGGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACTATTAT-ATTAACGGATAAA----TTGTTACTAGACCTACA------ATTATTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATTA--ATTATTCATAACAATAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTTGTATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATTATTTATTATTAGT-AGTA-A-AGGTAGTCCTTAATTATTATTGTANATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTAGGGTTTCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGATAAGTCCGATAAAATGTCACTAACGTCGGAATCCCCATTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTAACTCCGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGNGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TAATC--GATTTTATTCAAATA--ATATA-AA-AAAA-AAA-TAGCATTTTGGTTACCCTTTAAA
gi|1 : TAAATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGAATTTAT--GTCCGATTCTAACTTTGAC--TTTT-CTGATCTGATCTGATGACAGAAGCAATTTATTTACATACATGTAGATCTACATGTAAACA-TA----TAGCACAGAGATTCT-TTTTAATAATGCGCAAGAAGGGAAAGTTATAAAACGAGTTTGTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAAGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACTGTTAT-ATTAACGGATAAA----TTGTTACTAGACCTACA------ATTAGTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATTA--ATTATTCATAACAAAAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTTGTAATAATTATATTTATGGTAGA--AATTATTTATTATTAGT-AGTA-A-AGGTAGTCCTTAATTATTATTGTAAATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCTAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTATGGTTTTCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCAGATAAGTCCAATAAAATGTCACTAACGTCGATATCCCCATTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGCCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTTACTTTGTTAATTCTTTCGTGTATTACCGTGAGAGGTGTAATGCGCGTTATTGTTTCCGTGATTTACTGATAAACAAGAGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCGC-CAATC--GATTTTATTGAAATA--ATATT-AA-AAAA-AAA-TAGCATTTTGTTTACCCTTTAAA
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gi|11 : tttttttttttttcataagtaaaataatagaataataataagtcatttccatttttactattatattaactgataaattgttacttgacctaccattattataattaaaactaccactttctattattgttattaattattcataataatagatctgataataaatatgtaatagttgtattaattataattgtaataatATAAA----TTGTTACTAGACCTACATGTACCATTATTATCATTAAAACTACCACTATCTATAATTGTTAAATGAATATTAATTATAATAATAGATTTGATAATAAATATGTAGTAGTTc
gi|11 : TATAATT--GTTAAATGAAT-ATTAATTAT-AAT-AATA-G-ATTTGAT----AATAAATAT-GTAG-TA----GTTTTTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGGATGCCATAATCTAGGGTTTCGTGTTCTTAATCACTGCTTGAGCCTGAGAAGTCCGATAAAATGTCATTTACGTCAGAATCCCCATTAAAATAACTCTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGCAGCCATCTTGAATTAGATCACGTTATGGGTATGACGTCATCTGTAACCTCGTTCGGGTAACTCTGTTGATTCCT--GTGTATTTCTGTGAGAGGTGTAACGTGCGTTACTGTTTCCCTGATTTAGCGATGAACAAGCGCGAATTTCTTGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TAATC--GATTCTATTCAAATA--ATATA-AA-AAAT-AAT-TAGCATTTTGGTTACCCTTTAAtttccatcgagtaccaccggttcaaactggtatggttggatgccataatctagggtttcgtgttcttaatcactgcttgagcctgagaagtccgataaaatgtcatttacgtcagaatccccattaaaataactctctcgtgaaatgttttcgtccattgcagccatcttgaattagatcacgttatgggtatgacgtcatctgtaacctcgttcgggtaactctgttgattcctgtgtatttctgtgagaggtgtaacgtgcgttactgtttccctgatttagcgatgaacaagcgcgaatttcttgaaaacaaaaccatttttataaacctctaatcgattctattcaaataatataaaaaataattagcattttggttaccctttaagt
gi|12 : ataaattgttactagacctacatgtaccattattatcattaaaactaccactatcATAATAGATATCTAGTAGTTGTATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATGATTTATTATTAGT-AGTA-TTAGGTAGTATTTAATTATTATTTTATATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATATAGGGCGCCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGAGAAGTCCGATAAAATGTCACTAACATCGGAATCCCCATTAAATTAA--CTCACT--CGTGAAATGTTTACGTCCACTGACGCCATCTTGAGTTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCTGTAACCTCGTTCACGTAACTCTGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGCGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATCAACCTC-TAATC--GATTTTAgt
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Reference ( family-1857 ) : TAAATATTATACGCATTACCGATTTAGATAAATTTTGAATTTAT--GTCCGATTCTAACTTTGAC--TTTT-CTGATCTGATCTGATGACAGAAGCAATTTATTTACATACATGTAGATCTACATGTAAACA-TAA---TAGCATAGGGATTCT-TTTTAAAAATGCGCAAGAAGGGAAAGTAATAAAACGAGTTTGTTTTCTTTTTTCATAGGTAAAATTTTAGCATGGTAATGGAGGAACACATAATAGAATAATAATAA------------GTCATTTCTATTTTTACTATTAT-ATTAACGGATAAA----TTGTTACTAGACCTACA------ATTATTATAATTAAAACTACCACTATCTATTATTGTT--ATTA--ATTATTCATAACAATAGATCTAATAATAAATATGTAGTAGTTGTATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATTATTTATTATTAGT-AGTA-A-AGGTAGTCCTTAATTATTATTGTANATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATCTAGGGTTTCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGATAAGTCCGATAAAATGTCACTAACGTCGGAATCCCCATTAAAATAA--CTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGAAGCCATCTTGAATTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCGGGGACCTCGTTCGGGTAACTCCGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGNGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TAATC--GATTTTATTCAAATA--ATATA-AA-AAAA-AAA-TAGCATTTTGGTTACCCTTTAAA
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gi|11 : tttttttttttttcataagtaaaataatagaataataataagtcatttccatttttactattatattaactgataaattgttacttgacctaccattattataattaaaactaccactttctattattgttattaattattcataataatagatctgataataaatatgtaatagttgtattaattataattgtaataatATAAA----TTGTTACTAGACCTACATGTACCATTATTATCATTAAAACTACCACTATCTATAATTGTTAAATGAATATTAATTATAATAATAGATTTGATAATAAATATGTAGTAGTTc
gi|11 : TATAATT--GTTAAATGAAT-ATTAATTAT-AAT-AATA-G-ATTTGAT----AATAAATAT-GTAG-TA----GTTTTTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGGATGCCATAATCTAGGGTTTCGTGTTCTTAATCACTGCTTGAGCCTGAGAAGTCCGATAAAATGTCATTTACGTCAGAATCCCCATTAAAATAACTCTC--T--CGTGAAATGTTTTCGTCCATTGCAGCCATCTTGAATTAGATCACGTTATGGGTATGACGTCATCTGTAACCTCGTTCGGGTAACTCTGTTGATTCCT--GTGTATTTCTGTGAGAGGTGTAACGTGCGTTACTGTTTCCCTGATTTAGCGATGAACAAGCGCGAATTTCTTGAAAACAAAACCATTTTTATAAACCTC-TAATC--GATTCTATTCAAATA--ATATA-AA-AAAT-AAT-TAGCATTTTGGTTACCCTTTAAtttccatcgagtaccaccggttcaaactggtatggttggatgccataatctagggtttcgtgttcttaatcactgcttgagcctgagaagtccgataaaatgtcatttacgtcagaatccccattaaaataactctctcgtgaaatgttttcgtccattgcagccatcttgaattagatcacgttatgggtatgacgtcatctgtaacctcgttcgggtaactctgttgattcctgtgtatttctgtgagaggtgtaacgtgcgttactgtttccctgatttagcgatgaacaagcgcgaatttcttgaaaacaaaaccatttttataaacctctaatcgattctattcaaataatataaaaaataattagcattttggttaccctttaagt
gi|12 : ataaattgttactagacctacatgtaccattattatcattaaaactaccactatcATAATAGATATCTAGTAGTTGTATTAATTATAATTAAGGTAGA--AATGATTTATTATTAGT-AGTA-TTAGGTAGTATTTAATTATTATTTTATATAATCTGTTTCTCCATCGAGTACCACCGGTTCAAACTGGTATGGTTGAATGCCATAATATAGGGCGCCCTGTTCTTCATCACTGCTTGAGCCTGAGAAGTCCGATAAAATGTCACTAACATCGGAATCCCCATTAAATTAA--CTCACT--CGTGAAATGTTTACGTCCACTGACGCCATCTTGAGTTAGATCGCGTTATGGGTATGACGTCATCTGTAACCTCGTTCACGTAACTCTGTTAATTCTTTCGTGTATTTCCGTGAGAGGTGTAATGTGCGTTACTGTTTCCGTGATTTACCGATGAACAAGCGCGAATTTCATGAAAACAAAACCATTTTTATCAACCTC-TAATC--GATTTTAgt
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