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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  g-AAGATTAAGACAATATTAACACGACGTTATA-------------AAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAGAATACAACGTTTTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAacatacgtat
gi|13                         :                                                           gtactactaaaacccagtcaaattccggccgatccggtcacttttccggccgtggggaaaaggcaaatgtggggcgtatactagtgattatgatgttaaacagcactaatcccattaataatgtactgcccttgacatatatatcaagaaaatatatgaaaaaaaaaaaaataatgccttaaatttggtcttgaagtttacctttttatgacgttgacgatttttcgccgtttttgactaattccggctgcgtttgaatgactatttacagtatattcattgtaaataaccatggttttaatagattcttacaaagattaagatatcctgaatatataacaatgaaaataacaacaaaatcaataacatataattgtttatttcgctcgatacagaggacatatattttctataaaaacctggcaatctcaccagtgtggcgtatttaccgcacgttatACAAGACGTAACA-------------AAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTTAAACGAATAAAGAATACAACGTTTTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA--------------TAGTAACAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACAAAACTTTATAACAAAGTTAAACGAATAAAGAATTCAACGTTGTGTGCATGCAGCTACTTTGCTGTGTATAGAAGGTTAACCTTTACGAATCATAGTTATATATTTTAACGAAATAATACAACATGTAACAACAAAAGGTAAAACCATTCAGATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATACTACACGATAGTTCATTAATATAAGAGTTAC-GATAATCTGATGCCATAGTTTAACTATGAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACAAGACGAACAACTCCAGAATGTCAAGTGATTTCGATTTACACATTGATAATGGTACCATATGCTTACATTTAAAATTTTGACATGAAATGAGATTGTCACCAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCACAATTGGATGGATATAACTTTAGGGTTGAAGCACAAAATACTTAAATTTCTTCCGTGCTTGGGTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACTACTTTCAATGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATATAATTTTATGTTTCAAAAATAAAATGAAAGGGGTAAATGACGCAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAATTCGGCTGTTGGTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACATTATA------TATATTTCGAAAATTAAATGAATGGGGTGAATGACAAAACTCTACTACATTCGCAATCTCAAATAATCCACAATCAAAGGAGTTGGGCTGTTGTTGAACTT--TGGGAATTTTAACGTT-----AACAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCGTATA------TTTGTAACAGTTGATTTTTTA----CGTTTA--ACTTTATGTCTTTCATATTTTC--T-----CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGTTTTAAAACTCATCGCCCAATGA--TTAGAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTTTCTGAATATTCCATTTGTTT--TTCTCATCTATAAAAAACGGG-GTATTTGTAGTTTCTTGTAAACTATT----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTTACCGACGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCAGATAATTTAAGATCATAAAATTTTAACCACCAGTCATCGAATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGACTATCAATTGTAGCGATGTCATCATCTAAAACTTTTGGTGACAGGGTTGGTAAAATTAATTTGACACGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTGACGGTGATTGCTTACGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATACAGTTGGTTTATAAATGCTGTCATCCTCTTCTTTAATGTCATG---TAGTAAACGGTTTGTACAATATCATTTATT-TTAATTAG-TTTGT-----GAGGAAATTTCAATT-GAGTTAATTCTATTCCGGTAAATTTGTAT-TCCGTTTTTAATATATAATTA
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTACAAACGCGATTGCAAATAATCAACAATCAATACTGTTATTTTGTT-TT-ATCTCATTTGGTATTCTGATGTA-----AATGGCATCT-TC-----GCCTGTTCCATATA------TTTGCGACAGTTG-TATTTTAAGTCCATTTGGTATTAT---TCTATCATCTGGTCGATCGGTACCTAAACTATCTA-ATAA-AAAT--ATTTTCTCGTCATGAAGA---ATTGAAGCT----ACCCAGTGATCTTTATG--ATT-ATGATGAATTTGGCACGACGGTGAGTGGG------TTGG-GTCCATGGGAATTTT--TG-ATA-TCCAACGATTT--TCATTGTC-AT-TGAACACGG-GCACTT----TCTC-CGTTAACTGTA----AATCACTAATAGAGTTACCGACCAGATTTCGT-AAAAGTATATTCACTGCTTCCATATGATTAGAATTTAACTTTTGACCATTcataagccagccctaccccttagaacctcagcatatgtagaattctg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acaatatgaTTAACGTCCACACAATAA-AG--AACATTACAC--GTTGCGTATACATGTATTTGTGACAGCTGAATTTTTA----CGTTTA--CTTTTATGTCTTTCATACTTTA--T-----CCTAAACCGTTTATATAAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taTCATGTTTTC--T-----CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATATTTTAAAACTCATCGCCCAATGA--TTAGAGCCATTTAAAGTGAATTTGTCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TTAAAGTTTT-CT--ATATTCCTTTTGTTT--TTCTCATCTATAAAAAACGGG-GTATTTGTAATTTCTTGTAAACTATC----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTAACCGCCGACATATA-------TTTATCGTTTAACCATTTTCAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTAAAGATCATGCAATTTTAACCACCAG--------TTCTGTAAAGCTGCTGTTCCGACTATCAATTGTAACGATGTGATCATCTAAAACTTTTGGTAAAAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACATGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTTACGGTGATTGCTTACATTTACTATAGATTTTTGTAGGTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTAT------CGT-----TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGAAAGACGTCTTTTAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAATTTTTTTCCCGGAGTTAAT---AGGTCTGGATAAT---------GT-AGTTGATATATCTTTGTTTGATATTTAATTAATTGTTTTAATTGGCGAACCTACA
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTACTACTAAAACCCCGTCAAATTCCGGCCGATCCGGTCACTTTTTCGGCCATGGGGAAAAGGCAAATGTGGCGCGTATACTAGTGATTATGATGTTAAACTGCCCTAATCCCATTAATTATGTAATGCCCTTGACATATATATCAAGAAAATATATGAAAAAAATAAATTAATGCCTTAAATCTGGTCTTGAAGTTTACATTTTTATGACGTTTTTTTGACGATTTTTCGCAGTTTATACTAATTCCGGCTGCGTTTGAATGGCAATTTAAAGTATATTTATTGTAAATAACCATGGTTTTAATCAATTCTTACAAAGATTAAGATACCAGTATGCTGAATCTATAACAATAAAAATGAAAACAAAATCAATAACATTTTATTGTTTATTTCGCTCGATACAGAGGACATATATTTTCTATAAAAACCTGGCGATTTCACCGGTGTGGCGTATTTACCACACGT
Unaligned ( gi|10 ): GCTATTAAAACCCGGTCATGTTCCGTCTGTTCCGACCACTTTCCGGCTAAAAGTGAAATTCAATTGCGGTGTGTGTAATAGTTGTTTGTGACGTTTTAATGCACTAATTGAGATCACTATGAACTGTTGTTTGCATATTTAAATGCCTTAAACCATGGAATTTTATAATATTCCTTGTTTAAATGGGGTCTTGAAACTTATCTTTTTTGACAATTTATCGCCGTTTCTGTCAGATTCTTACCGAGTTAATGTAAAAAAAATTCAAAAAACGATGTATTTACTCAGTTATTATAATATGCTGAACCCATAACAACAGAAATTATAACAAAATTAAACAGCTACAGTTGTTTATTTTACTCGATACAACAGAATGTAAAGACAGTTTACCGGTGTGACATATATTCAGCACGTCGTCAGAATCAGATATAT
Unaligned ( gi|14 ): GTCTTAGAAATTACTTTTTTATGAATTTTGACAAGTTTTTCCTGCAAGACAAATTCTGGCCATGTTAAACTGGCACTTTTCAAATTAAAACGATGGTTTTAATAAAAACTTACACAGATTACTGTATGCTGGACTCCTTAACCATGAA
Unaligned ( gi|15 ): ATAATCATTAACAACAATGGTTTAAACCAATTGTTACAAAGATTATGGTATGCTTTAACTATGTACATGTATAACAATGAATACAATAAAAACAATCTATAAATATAACGTTTATTTTGCTCGATACAAAGGACAATATTTCC
Unaligned ( gi|16 ): ATAAACAGTAAGATATAATTTGCTGTTTAACAACACAAACACAATTATTTACAATAAGTATCGTTTATTTTGCTCGAAACAAAGGATATTTTCTTCTTCGCAGTGGTTTTATCGGTGTGGTGTGTTTTCGGCACG
Unaligned ( gi|17 ): TAACAATGAAAATAACAACAAAATCAATAACATAAAATTGTTTATTTCGGTCGATACAGAGGACATATACTTTCTATAAAAACCTGGCGATTTCAACGGTGTGGTGTATTTACTGCACGT
Unaligned ( gi|19 ): TATTAATAGCTTTACTGTAAAGTTTAAGTACAGGTATTAAGACAAAGTATTTTGAAACAAGCATAAATAAATTTTATGAG
Unaligned ( gi|20 ): GGGTACTACTAAAACCCGGCCAGGTTGATCCGGCCGCTTTTCCAGCTACAAGGAAAAGGCAA
Unaligned ( gi|21 ): TTCTTTAAAGGCGAGTTCACCGGTGTGGCGTATTTACCGCACGT






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Reference ( family-1842 )     :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTNAAACGAATAAAGAATACAACGTTGTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACACGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGATCTGATGCAATAGTTTAACTATCAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCAGAATTTCAAGTTATTTCGATTTACACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCATAATTGGATG--T--ATAACTTTGGGGTTGAAGCACGAAATACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGNTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAATTAAATGAAAGGGGTGAATGACANAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAGTTNGGCTGTTGTTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCTTTCATATTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGTTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTCCATTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAGTTTCT-TGTAAACTATC----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTAACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTTAAGATCATANAATTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGACTATCAATTGTAACGATGTNATCATCTAAAACTTTTGGTGACAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACACGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTGACGGTGATTGCTTACGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTATAAATGCCGTCATCCTNTTCTTTAATGTCNTGAAATAGNAAGNNGTCTNTNCGGTGTCATTTATTGNTAGTTAGTTTTNTTCCCGGAGNNAATTTCAGNTCNGGNTAATTCTATTCCGGTAAGTTNGTATATCCGTNTTTGATATNTAATTAATTGTTTTAATTGGCGAACCTACA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                     taGTTGTAAGATTTAGACAAAATTTACAAGACGTAAAAAAACGTTGTGAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAGAATACAACGTTGTATGATTGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGCAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACACGATATATTATTGATATAGGATTGACGGATGATCTGATACAATAGTTTAACCATCAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCAGAATTTCAAGTTATTTTGATTTACTCATTGATAATGGTACTAT-TGTTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTTGCATTTTGCATTGGCACCATAATTGGATGTTT--ATAACTTTGGGGTTGAAGCATGAAATACTTAAATTTCTTCCGCGCTTTGTTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACCACTTTCAAGGAAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTTGTACAG--TA------TGTGTTTCGAAAATTAAATGAAAGGGGTGAACGACATAACTCTACTACATTCGTATTCGCAGATAATCCACAATCAAAGGAATTGGGCTTTTGTTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCTTATA------T-TTTT-GACAGTTGAATTTTTA----CGTTTAATTGTATGTCTTTCATATTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGATTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTCCATTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGTTATTTGTAGTTTCT-TGTAAACTATT----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-TAAAAAATATATTAACAGCCGGCATATG-------TTTATCGTTTAACCAATTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGACAATTTAAGATCATACAATTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGAATATCAATTGTAACTATGTGATCATCTAAAGGTTTTGGTGACAGGGTTGGAAAAAATATTTTTACACGCTTACTATCTGATGAATTATAATTTGACGGTGATCGCTTATGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTGGTATGATCGTTGATAACATATAAAGCTGGTACATA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCTTACATTTAAAATTTTGACATGAAATGAGGTTGTCAACAATATTTGGCATTCTGTAGTGACACCTTAATTGTAT-------TAA-TTTGGGACTGAAGCACGAAAGACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGATTCCTTTTGAAAATATGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCAGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAAATAAATGAAAGGGGTGAATGACAAAATTCTACTACATTCGCAATCGCAAATGATCCACAATCAAAT-ATTTCGGCTGCTGTTGAACTC--TGGGCATTTTGACGTT-----AATAA-ATGTATCATTAAGC---TTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCT---A-AGTTTC------T-CCTGAACTGTCCATATAATAGATAAATTCTCT-GTCG-AAA-ACATTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GATCCATT-AAA-TGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCATC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTGCATTTGTTTGATT----A-CTATAAAAGAACGGAGTATATGTAGTTTCT-TGTAAACTATTCAGTGA-CATTAAGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAGATTATATTAACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCTGATAATTTAAGATCAAAATGTTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTTAATCTGCTGCTCGGACTATCAATTGTAACGATGTCATCATCTAAATCTTTTAGTGGCAGCGTTGGTAAAACTAATTTTACATGCTTATTTTCTGTTATATTATAACTTGATGGTGATTGCTAACATTTcataagccagccctaccccttagaacctcagcatatgtagaattctg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtactactaaaacccagtcaaattccggccgatccggtcacttttccggccgtggggaaaaggcaaatgtggggcgtatactagtgattatgatgttaaacagcactaatcccattaataatgtactgcccttgacatatatatcaagaaaatatatgaaaaaaaaaaaaataatgccttaaatttggtcttgaagtttacctttttatgacgttgacgatttttcgccgtttttgactaattccggctgcgtttgaatgactatttacagtatattcattgtaaataaccatggttttaatagattcttacaaagattaagatatcctgaatatataacaatgaaaataacaacaaaatcaataacatataattgtttatttcgctcgatacagaggacatatattttctataaaaacctggcaatctcaccagtgtggcgtatttaccgcTCATGTTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATATTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCATTTAAAGTGAATTTGTCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TTAAAGTTTT-CT--ATATTCCTTTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAATTTCT-TGTAAACTATC----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTAACCGCCGACATATA-------TTTATCGTTTAACCATTTTCAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTAAAGATCATGCAATTTTAACCACCAG--------TTCTGTAAAGCTGCTGTTCCGACTATCAATTGTAACGATGTGATCATCTAAAACTTTTGGTAAAAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACATGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTTACGGTGATTGCTTACATTTACTATAGATTTTTGTAGGTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTAT------CGT-----TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGAAAGACGTCTTTTAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAATTTTTTTCCCGGAGTTAAT---AGGTCTGGATAAT---------GT-AGTTGATATATCTTTGTTTGATATTTAATTAATTGTTTTAATTGGCGAACCTACA
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gi|8                          :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACATTGTAAGATTTAGACAATATTTATAAGATGTAAAAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAATACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAAAATACAACATTATGTGCATGCAGATTTTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACATGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGACCTGATGCAATAGTTTAACTATCAACATATTTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCATAATTTCAAGTTATTTTGATTTATACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCgatttagacaatatttacaatacgtaacaaaactttataacaaagtaaaacgaataaaaaatacaacattatgtgcatgcagattttatgctgtgtatagaacgtttacctttacgaatcatatttatacattttaacgatacaacatgtagtaacaaaaggtacaagcattcatatacaaagaaatgatacaaaagaaaggggaatataatatatagtacatgatagattattaatataggatttacggatgacctgatgcaatagtttaactatcaacatatttatatttcattttcatttaaacacgacggacaattccataatttcaagttattttgatttatacattgataatggtaccattgcttacatttaaaattctgacatgaaatgagattgtcaacaaaatctggcattctgcagtggc
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): TTCTTTAAAGGCGAGTTCACCGGTGTGGCGTATTTACCGCACGT






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Reference ( family-1842 )     :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACANTATTTACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTNAAACGAATAAAGAATACAACGTTGTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACACGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGATCTGATGCAATAGTTTAACTATCAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCAGAATTTCAAGTTATTTTGATTTACACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCATAATTGGATG--T--ATAACTTTGGGGTTGAAGCACGAAANACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGGTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAATTAAATGAAAGGGGTGAATGACAAAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAGTTGGGCTGTTGTTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCTTTCATATTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGTTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTCCATTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAGTTTCT-TGTAAACTATT----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTNACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTTAAGATCATANAATTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGACTATCAATTGTAACGATGTCATCATCTAAAACTTTTGGTGACAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACACGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTGACGGTGATTGCTTACGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTATA-----CGTCA---TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGNAAGAC-GTCTTTNAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAA-TTTGTTCCCGGAGTTAA--TAGATCGGGATAAT---------GT-AGTTGGTATATCTTTGTTTGATATATAATTANTTGTTTTNATTGGCGNACCTACA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                     taGTTGTAAGATTTAGACAAAATTTACAAGACGTAAAAAAACGTTGTGAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAGAATACAACGTTGTATGATTGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGCAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACACGATATATTATTGATATAGGATTGACGGATGATCTGATACAATAGTTTAACCATCAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCAGAATTTCAAGTTATTTTGATTTACTCATTGATAATGGTACTAT-TGTTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTTGCATTTTGCATTGGCACCATAATTGGATGTTT--ATAACTTTGGGGTTGAAGCATGAAATACTTAAATTTCTTCCGCGCTTTGTTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACCACTTTCAAGGAAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTTGTACAG--TA------TGTGTTTCGAAAATTAAATGAAAGGGGTGAACGACATAACTCTACTACATTCGTATTCGCAGATAATCCACAATCAAAGGAATTGGGCTTTTGTTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCTTATA------T-TTTT-GACAGTTGAATTTTTA----CGTTTAATTGTATGTCTTTCATATTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGATTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTCCATTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGTTATTTGTAGTTTCT-TGTAAACTATT----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-TAAAAAATATATTAACAGCCGGCATATG-------TTTATCGTTTAACCAATTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGACAATTTAAGATCATACAATTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGAATATCAATTGTAACTATGTGATCATCTAAAGGTTTTGGTGACAGGGTTGGAAAAAATATTTTTACACGCTTACTATCTGATGAATTATAATTTGACGGTGATCGCTTATGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTGGTATGATCGTTGATAACATATAAAGCTGGTACATA-----CGT
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCTTACATTTAAAATTTTGACATGAAATGAGGTTGTCAACAATATTTGGCATTCTGTAGTGACACCTTAATTGTAT-------TAA-TTTGGGACTGAAGCACGAAAGACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGATTCCTTTTGAAAATATGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCAGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAAATAAATGAAAGGGGTGAATGACAAAATTCTACTACATTCGCAATCGCAAATGATCCACAATCAAAT-ATTTCGGCTGCTGTTGAACTC--TGGGCATTTTGACGTT-----AATAA-ATGTATCATTAAGC---TTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCT---A-AGTTTC------T-CCTGAACTGTCCATATAATAGATAAATTCTCT-GTCG-AAA-ACATTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GATCCATT-AAA-TGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCATC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTGCATTTGTTTGATT----A-CTATAAAAGAACGGAGTATATGTAGTTTCT-TGTAAACTATTCAGTGA-CATTAAGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAGATTATATTAACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCTGATAATTTAAGATCAAAATGTTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTTAATCTGCTGCTCGGACTATCAATTGTAACGATGTCATCATCTAAATCTTTTAGTGGCAGCGTTGGTAAAACTAATTTTACATGCTTATTTTCTGTTATATTATAACTTGATGGTGATTGCTAACATTTcataagccagccctaccccttagaacctcagcatatgtagaattctg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                ACAAAACTTTATAACAAAGTTAAACGAATAAAGAATTCAACGTTGTGTGCATGCAGCTACTTTGCTGTGTATAGAAGGTTAACCTTTACGAATCATAGTTATATATTTTAACGAAATAATACAACATGTAACAACAAAAGGTAAAACCATTCAGATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATACTACACGATAGTTCATTAATATAAGAGTTACG-ATAATCTGATGCCATAGTTTAACTATGAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACAAGACGAACAACTCCAGAATGTCAAGTGATTTCGATTTACACATTGATAATGGTACCATATGCTTACATTTAAAATTTTGACATGAAATGAGATTGTCACCAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCACAATTGGATGGAT--ATAACTTTAGGGTTGAAGCACAAAATACTTAAATTTCTTCCGTGCTTGGGTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACTACTTTCAATGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATATAATTTTATGTTTCAAAAATAAAATGAAAGGGGTAAATGACGCAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAATTCGGCTGTTGGTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTATAT--GGGGCATGTA------TGTTGCAGACA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtactactaaaacccagtcaaattccggccgatccggtcacttttccggccgtggggaaaaggcaaatgtggggcgtatactagtgattatgatgttaaacagcactaatcccattaataatgtactgcccttgacatatatatcaagaaaatatatgaaaaaaaaaaaaataatgccttaaatttggtcttgaagtttacctttttatgacgttgacgatttttcgccgtttttgactaattccggctgcgtttgaatgactatttacagtatattcattgtaaataaccatggttttaatagattcttacaaagattaagatatcctgaatatataacaatgaaaataacaacaaaatcaataacatataattgtttatttcgctcgatacagaggacatatattttctataaaaacctggcaatctcaccagtgtggcgtatttaccgcTCATGTTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATATTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCATTTAAAGTGAATTTGTCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TTAAAGTTTT-CT--ATATTCCTTTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAATTTCT-TGTAAACTATC----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTAACCGCCGACATATA-------TTTATCGTTTAACCATTTTCAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTAAAGATCATGCAATTTTAACCACCAG--------TTCTGTAAAGCTGCTGTTCCGACTATCAATTGTAACGATGTGATCATCTAAAACTTTTGGTAAAAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACATGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTTACGGTGATTGCTTACATTTACTATAGATTTTTGTAGGTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTAT------CGT-----TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGAAAGAC-GTCTTTTAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAATTTTTTTCCCGGAGTTAA--TAGGTCTGGATAAT---------GT-AGTTGATATATCTTTGTTTGATATTTAATTAATTGTTTTAATTGGCGAACCTACA
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gi|8                          :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACATTGTAAGATTTAGACAATATTTATAAGATGTAAAAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAATACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAAAATACAACATTATGTGCATGCAGATTTTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACATGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGACCTGATGCAATAGTTTAACTATCAACATATTTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCATAATTTCAAGTTATTTTGATTTATACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCgatttagacaatatttacaatacgtaacaaaactttataacaaagtaaaacgaataaaaaatacaacattatgtgcatgcagattttatgctgtgtatagaacgtttacctttacgaatcatatttatacattttaacgatacaacatgtagtaacaaaaggtacaagcattcatatacaaagaaatgatacaaaagaaaggggaatataatatatagtacatgatagattattaatataggatttacggatgacctgatgcaatagtttaactatcaacatatttatatttcattttcatttaaacacgacggacaattccataatttcaagttattttgatttatacattgataatggtaccattgcttacatttaaaattctgacatgaaatgagattgtcaacaaaatctggcattctgcagtggc
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|21 ): TTCTTTAAAGGCGAGTTCACCGGTGTGGCGTATTTACCGCACGT






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Reference ( family-1842 )     :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACANTATTTACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTNAAACGAATAAAGAATACAACGTTGTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACACGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGATCTGATGCAATAGTTTAACTATCAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCAGAATTTCAAGTTATTTTGATTTACACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCATAATTGGATG--T--ATAACTTTGGGGTTGAAGCACGAAANACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGGTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAATTAAATGAAAGGGGTGAATGACAAAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAGTTGGGCTGTTGTTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCTTTCATATTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGTTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTCCATTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAGTTTCT-TGTAAACTATT----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTNACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTTAAGATCATANAATTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGACTATCAATTGTAACGATGTCATCATCTAAAACTTTTGGTGACAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACACGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTGACGGTGATTGCTTACGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTATA-----CGTCA---TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGNAAGAC-GTCTTTNAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAA-TTTGTTCCCGGAGTTAA--TAGATCGGGATAAT---------GT-AGTTGGTATATCTTTGTTTGATATATAATTANTTGTTTTNATTGGCGNACCTACA
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gi|8                          :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACATTGTAAGATTTAGACAATATTTATAAGATGTAAAAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAATACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAAAATACAACATTATGTGCATGCAGATTTTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACATGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGACCTGATGCAATAGTTTAACTATCAACATATTTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCATAATTTCAAGTTATTTTGATTTATACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCgatttagacaatatttacaatacgtaacaaaactttataacaaagtaaaacgaataaaaaatacaacattatgtgcatgcagattttatgctgtgtatagaacgtttacctttacgaatcatatttatacattttaacgatacaacatgtagtaacaaaaggtacaagcattcatatacaaagaaatgatacaaaagaaaggggaatataatatatagtacatgatagattattaatataggatttacggatgacctgatgcaatagtttaactatcaacatatttatatttcattttcatttaaacacgacggacaattccataatttcaagttattttgatttatacattgataatggtaccattgcttacatttaaaattctgacatgaaatgagattgtcaacaaaatctggcattctgcagtggc


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Reference ( family-1842 )     :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACANTATTTACAAGACGTAACAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTNAAACGAATAAAGAATACAACGTTGTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACACGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGATCTGATGCAATAGTTTAACTATCAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCAGAATTTCAAGTTATTTTGATTTACACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCATAATTGGATG--T--ATAACTTTGGGGTTGAAGCACGAAANACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGGTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAATTAAATGAAAGGGGTGAATGACAAAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAGTTGGGCTGTTGTTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTAAGC--GTTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCTTTCATATTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATGTTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCGTT-AAAGTGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTCCATTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAGTTTCT-TGTAAACTATT----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTNACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTTAAGATCATANAATTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTAAAGCTGCTGTTCGGACTATCAATTGTAACGATGTCATCATCTAAAACTTTTGGTGACAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACACGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTGACGGTGATTGCTTACGTTTACTATAGCTTTTT----GTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTATA-----CGTCA---TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGNAAGAC-GTCTTTNAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAA-TTTGTTCCCGGAGTTAA--TAGATCGGGATAAT---------GT-AGTTGGTATATCTTTGTTTGATATATAATTANTTGTTTTNATTGGCGNACCTACA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCTTACATTTAAAATTTTGACATGAAATGAGGTTGTCAACAATATTTGGCATTCTGTAGTGACACCTTAATTGTAT-------TAA-TTTGGGACTGAAGCACGAAAGACTTAAATTTCTTCCGCGCTTGGATTCCTTTTGAAAATATGTCATTTTACCACTTTCAAGGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCAGGTACAGTATA------TATGTTTCGAAAAATAAATGAAAGGGGTGAATGACAAAATTCTACTACATTCGCAATCGCAAATGATCCACAATCAAAT-ATTTCGGCTGCTGTTGAACTC--TGGGCATTTTGACGTT-----AATAA-ATGTATCATTAAGC---TTGCGTATA------T-TTGT-GACAGTTGATTTTTTA----CGTTTAATTTTATGTCT---A-AGTTTC------T-CCTGAACTGTCCATATAATAGATAAATTCTCT-GTCG-AAA-ACATTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GATCCATT-AAA-TGAATTTGGCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCATC--TAAAAGTTTT-CTGAATATTGCATTTGTTTGATT----A-CTATAAAAGAACGGAGTATATGTAGTTTCT-TGTAAACTATTCAGTGA-CATTAAGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAGATTATATTAACCGCCGACATATG-------TTTATCGTTTAACCATTTACAGTTTGATATGTCATGTTTATCTGATAATTTAAGATCAAAATGTTTTAACCACCAGTCATCGGATTCTGTTAATCTGCTGCTCGGACTATCAATTGTAACGATGTCATCATCTAAATCTTTTAGTGGCAGCGTTGGTAAAACTAATTTTACATGCTTATTTTCTGTTATATTATAACTTGATGGTGATTGCTAACATTTcataagccagccctaccccttagaacctcagcatatgtagaattctg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                ACAAAACTTTATAACAAAGTTAAACGAATAAAGAATTCAACGTTGTGTGCATGCAGCTACTTTGCTGTGTATAGAAGGTTAACCTTTACGAATCATAGTTATATATTTTAACGAAATAATACAACATGTAACAACAAAAGGTAAAACCATTCAGATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATACTACACGATAGTTCATTAATATAAGAGTTACG-ATAATCTGATGCCATAGTTTAACTATGAAAATATCTATATTTCATTTTCATTTAAACAAGACGAACAACTCCAGAATGTCAAGTGATTTCGATTTACACATTGATAATGGTACCATATGCTTACATTTAAAATTTTGACATGAAATGAGATTGTCACCAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCACCACAATTGGATGGAT--ATAACTTTAGGGTTGAAGCACAAAATACTTAAATTTCTTCCGTGCTTGGGTTCCTTTGGAAAAGGTGTCATTTTACTACTTTCAATGCAATTAATAAAATGCTGGCGCATTGCTGGTACAGTATATAATTTTATGTTTCAAAAATAAAATGAAAGGGGTAAATGACGCAACTCTACTACATTCGCAATCGCAAATAATCCACAATCAAAGGAATTCGGCTGTTGGTGAACTC--TGGGAATTTTAACGTT-----AATAA-ATTTATCATTATAT--GGGGCATGTA------TGTTGCAGACA
gi|6                          :                                                                                                                                                                   ttACGTTATAAGATTAAGACAATATTAACACGACGTTATAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAAGACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAGAATACAACGTTTTGTGCATGCAGCTTCTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtactactaaaacccagtcaaattccggccgatccggtcacttttccggccgtggggaaaaggcaaatgtggggcgtatactagtgattatgatgttaaacagcactaatcccattaataatgtactgcccttgacatatatatcaagaaaatatatgaaaaaaaaaaaaataatgccttaaatttggtcttgaagtttacctttttatgacgttgacgatttttcgccgtttttgactaattccggctgcgtttgaatgactatttacagtatattcattgtaaataaccatggttttaatagattcttacaaagattaagatatcctgaatatataacaatgaaaataacaacaaaatcaataacatataattgtttatttcgctcgatacagaggacatatattttctataaaaacctggcaatctcaccagtgtggcgtatttaccgcTCATGTTTTC------T-CCTAAACTGTCTATATAGTAAATGAAGTCGCT-GTCG-GAAGATATTTTAAAACTCATCGCCCAATGAT---TA-GAGCCATTTAAAGTGAATTTGTCA--------AGCAGGTTCTATTTGGCGTC--TTAAAGTTTT-CT--ATATTCCTTTTGTTT--TTC-TCATCTATAAAA-AACGGGGTATTTGTAATTTCT-TGTAAACTATC----GA-CATTAGGA-AATTGC-------ATTTT-T-AAAATTATATTAACCGCCGACATATA-------TTTATCGTTTAACCATTTTCAGTTTGATATGTCATGTTTATCCGATAATTAAAGATCATGCAATTTTAACCACCAG--------TTCTGTAAAGCTGCTGTTCCGACTATCAATTGTAACGATGTGATCATCTAAAACTTTTGGTAAAAGGGTTGGTAAAATTAATTTTACATGCTTACTATCTGTTGAATTATAATTTTACGGTGATTGCTTACATTTACTATAGATTTTTGTAGGTAGGTGTAGTATGATCGTTGATAACAGATAAAGCTGGTTTAT------CGT-----TATTTTTTAATA-CTTGAAATAGAAAGAC-GTCTTTTAGGTGT--TTTATTGGTAGTTAATTTTTTTCCCGGAGTTAA--TAGGTCTGGATAAT---------GT-AGTTGATATATCTTTGTTTGATATTTAATTAATTGTTTTAATTGGCGAACCTACA
gi|8                          :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACATTG-AAGATTTAGACATTATTTACAAGACGTAACAAAACATTGTAAGATTTAGACAATATTTATAAGATGTAAAAAAACGTTGTAA
gi|8                          :                                                                                                                                                     TACAAGACGTAACAAAACATTGTAAGATTTAGACAATATTTATAAGATGTAAAAAAACGTTGTAAGATTTAGACAATATTTACAATACGTAACAAAACTTTATAACAAAGTAAAACGAATAAAAAATACAACATTATGTGCATGCAGATTTTATGCTGTGTATAGAACGTTTACCTTTACGAATCATATTTATACATTTTAACGA-----TACAACATGTAGTAACAAAAGGTACAAGCATTCATATACAAAGAAATGATACAAAAGAAAGGGGAATATAATATATAGTACATGATAGATTATTAATATAGGATTTACGGATGACCTGATGCAATAGTTTAACTATCAACATATTTATATTTCATTTTCATTTAAACACGACGGACAATTCCATAATTTCAAGTTATTTTGATTTATACATTGATAATGGTACCAT-TGCTTACATTTAAAATTCTGACATGAAATGAGATTGTCAACAAAATCTGGCATTCTGCAGTGGCgatttagacaatatttacaatacgtaacaaaactttataacaaagtaaaacgaataaaaaatacaacattatgtgcatgcagattttatgctgtgtatagaacgtttacctttacgaatcatatttatacattttaacgatacaacatgtagtaacaaaaggtacaagcattcatatacaaagaaatgatacaaaagaaaggggaatataatatatagtacatgatagattattaatataggatttacggatgacctgatgcaatagtttaactatcaacatatttatatttcattttcatttaaacacgacggacaattccataatttcaagttattttgatttatacattgataatggtaccattgcttacatttaaaattctgacatgaaatgagattgtcaacaaaatctggcattctgcagtggc
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GTACTACTAAAACCCCGTCAAATTCCGGCCGATCCGGTCACTTTTTCGGCCATGGGGAAAAGGCAAATGTGGCGCGTATACTAGTGATTATGATGTTAAACTGCCCTAATCCCATTAATTATGTAATGCCCTTGACATATATATCAAGAAAATATATGAAAAAAATAAATTAATGCCTTAAATCTGGTCTTGAAGTTTACATTTTTATGACGTTTTTTTGACGATTTTTCGCAGTTTATACTAATTCCGGCTGCGTTTGAATGGCAATTTAAAGTATATTTATTGTAAATAACCATGGTTTTAATCAATTCTTACAAAGATTAAGATACCAGTATGCTGAATCTATAACAATAAAAATGAAAACAAAATCAATAACATTTTATTGTTTATTTCGCTCGATACAGAGGACATATATTTTCTATAAAAACCTGGCGATTTCACCGGTGTGGCGTATTTACCACACGT
Unaligned ( gi|10 ): GCTATTAAAACCCGGTCATGTTCCGTCTGTTCCGACCACTTTCCGGCTAAAAGTGAAATTCAATTGCGGTGTGTGTAATAGTTGTTTGTGACGTTTTAATGCACTAATTGAGATCACTATGAACTGTTGTTTGCATATTTAAATGCCTTAAACCATGGAATTTTATAATATTCCTTGTTTAAATGGGGTCTTGAAACTTATCTTTTTTGACAATTTATCGCCGTTTCTGTCAGATTCTTACCGAGTTAATGTAAAAAAAATTCAAAAAACGATGTATTTACTCAGTTATTATAATATGCTGAACCCATAACAACAGAAATTATAACAAAATTAAACAGCTACAGTTGTTTATTTTACTCGATACAACAGAATGTAAAGACAGTTTACCGGTGTGACATATATTCAGCACGTCGTCAGAATCAGATATAT
Unaligned ( gi|14 ): GTCTTAGAAATTACTTTTTTATGAATTTTGACAAGTTTTTCCTGCAAGACAAATTCTGGCCATGTTAAACTGGCACTTTTCAAATTAAAACGATGGTTTTAATAAAAACTTACACAGATTACTGTATGCTGGACTCCTTAACCATGAA
Unaligned ( gi|15 ): ATAATCATTAACAACAATGGTTTAAACCAATTGTTACAAAGATTATGGTATGCTTTAACTATGTACATGTATAACAATGAATACAATAAAAACAATCTATAAATATAACGTTTATTTTGCTCGATACAAAGGACAATATTTCC
Unaligned ( gi|16 ): ATAAACAGTAAGATATAATTTGCTGTTTAACAACACAAACACAATTATTTACAATAAGTATCGTTTATTTTGCTCGAAACAAAGGATATTTTCTTCTTCGCAGTGGTTTTATCGGTGTGGTGTGTTTTCGGCACG
Unaligned ( gi|17 ): TAACAATGAAAATAACAACAAAATCAATAACATAAAATTGTTTATTTCGGTCGATACAGAGGACATATACTTTCTATAAAAACCTGGCGATTTCAACGGTGTGGTGTATTTACTGCACGT
Unaligned ( gi|19 ): TATTAATAGCTTTACTGTAAAGTTTAAGTACAGGTATTAAGACAAAGTATTTTGAAACAAGCATAAATAAATTTTATGAG
Unaligned ( gi|20 ): GGGTACTACTAAAACCCGGCCAGGTTGATCCGGCCGCTTTTCCAGCTACAAGGAAAAGGCAA
Unaligned ( gi|21 ): TTCTTTAAAGGCGAGTTCACCGGTGTGGCGTATTTACCGCACGT