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Reference ( family-1822 ) : AGGCCCTCCCGGGGGTTTTGGAG-ATCTGGGGAAC--A-TGGCCANTTACTTTTAGAGATCT-GGGG-AACATTG-G----CCATT-ACTTTCGGAGATCCGGGGANC-AAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTNCTTAATGAAAA-AA-GTACCTAATTTGATCAATTTTATCAGAGACATAT--AAACAGAGAT----AGGCAACTGGANGCACTT-GTCTAAATTTCAGGTGGCACAT--TTTGGC-TTTTTCTAGTTTAGTTCGAACTTATTTATTTTACTTCGATTGTGAAACAAGTTCTTACAACTTAGACAAATCACGCTCGAAGTCT--TCCTGGGT---AT---AACCAGTACTA-AGCATATGTGGAAAAA-----NTGT-----CTTNCTCAAGGA-CACCACACATAGTCGTGGCGAAGG--ATTGGAATACCCACGACCCTNC----GATCAC-GGGT---CCGGTGCTTTA---CCACTAGACCACGTGGCGTTTTCTAAATCATGGAAACACANATCCTCCGGAATCAAACAACATATTTTTGTGATTATGGTATCAAAAGAAAGGGCTTG--ATTT-GGN-----AGATT-N------T-----TTTNTCTTT-TT-TAAA-TTTAAANAAATGAAGA---A-T-TT----TA--CGC-TTACA-GTTATT--TTNTGTGATCATTT-TC-TC-TTTTT----AGCCCATTTT-T-------GAA-------ATAA-GAA--A------AACGA---CTTCAATAAATATCGATATGAAA--CTTTCGCC-A--CC-A-TGGANA----ACTTACTNCTTCATCTTT-CTACATAAAATTTNTATTTCT---------ATGGTGTTT----------TG----TTTAAA--CGTACAT-GATA--------TT----T---GT--T----AAATCAAG---ACTACC-----GGTGAAG-----A------A---AAA-TATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-GG-AATTGG------T-CANCATTT-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------AA------TTGTTAAATTCCGACAAAGATTCGAAGAGTTA-----CTAAAGAAAT------------ACTAAAAGT--T--AGCCGTG----NACGTTATATTG-CTATTAGCC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATAATTTTTATACTTGATCATAATTTACTTTTAAAATGAGACGTCGACTGCTTGAAACAGCTTTTGACAGCTTTGGAGGTTTCTT---ACGTGTTAGTCTTGGNCCCTGCGCAACTTCATCCCATAATCGTATGTACCCGAAATAAATTTTGGATGGTAANTCCGAACAAAGATATATTTACAGTACTGATG-TT-AAAGGCAGAATAGTGCAGTGGTTAATATCGTCGATTTCGGATCGTAAGGACTGGTGTTC------GATTTCACCCGGCNTCTANTTTTTTTT-TTTATTAGATCGTGTTTACACAATAAAGTCAATTATTTATGTGTATTTATAATTATTTATGTGTATTTATTTCCTTTTGTAAATTAACCGTTCANCTGTTCAATTT-TTTTTGTCTCTTCTGTCCTTCCA-------------TGGCTCTNCTTGCCAAAGGCCAGCAGGGCTTATGTCGTGGTA---AATCGTCC----GTCGTCCATCCGTTAACCTTTTTCTTGTAGAAGCTATA--GCATCCCCCACATTTTTCAAAGAATCTTATCCAAACTCGCACAGCATTTGTATAACCACAAACTCTTGAAGTTCTTGAACNAGCGTGATTGAACC-A-AAA-TGCTCCCTGCCACAGGGCTTACAAGCACATTTTTAAGGAAACTT---AAAAA--ACACNTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAGATATTTTAAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTGCTTATTATGATGATGTGTAAATAATAATAATAGAGAAGATTATAGTAGACGTTTTACTTAAGGGAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--T-TAA--AA-T---TT-TGGAGATCTAGGGAACAGT---GGAAA---T-ACTTTTAGAGATCTGGGGA-----------AC---------ATGGACAAAATACTTTTGGGG-AACNTTGGCAAATACTTTCGGAGATC-TGGGG-----------AACAANAGGCATTACTTTAAGAGATCCAG
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Reference ( family-1822 ) : AGGCCCTCCCGGGGGTTTTGGAGATCTGGGGAAC--ATGGCCAATTATTTTCAGAGATCT-GGGG-AACATTG-GCCATT-ACTTTCAGAGATCCAGGGATC-AAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTTAATGAAAAAA-GTACCTAATTTGATCAATTTTATCAGAGACATAT--AAACAGAGAT----AGGCAACTGGANGCACTT-GTCTAAATTTCAGGTGGCACAT--TTTGGC-TTTTTCTAGTTTAGTTTGAACTTATTTATTTTACTTCGATTGTGAAACAAGTTCTTACGACTTAGACAAATCACGCTCGAAGTCT--TCCTGGGT---AT---AACCAGTACTA-AGCATATGTGGAAAAA-----GTGT-----CTTGCTCAAGGA-CACCACACATAGTCGTGGCGAAGG--ATTGAAATACCCACGACCCTNC----GATCAC-GGGT---CCGGTGCTTTA---CCACTAGACCACGTGGCGTTTTCTAAATCATGGAAACACACATCCTCCGGAATCAAACAACATATTTTTGTGATTNTGGTATCAAAAGAAAGGGCTTG-------ATTTGGG-----AGAT---T-NTTTTATCTTT-TT-TAAA-TTTAAAGAAATGAAGA---A-T-TT----TA--CGC-TTACA-GTTATT--TTGTGTGATCATTT-TC-TC-TTTTT----AGCCCATTTT-T-------GAA-------ATAA-GAA--A------AACGA---CTTCAATAAATATCGATATGAAA--CTTTCGCC-A--CC-A-TGGANA----ACTTACTGCTTCATCTTT-CTACNTAANATTTCTATTTCT---------ATGGTGTTT----------TG----TTTAAA--CGTACAT-GATA--------TT----T---GT--T----AAATCAAG---ACTACC-----GGTGAAG-----A------A---AAA-TATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-GG-AATTGG------T-CANCATTT-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------AA------TTGTTAAATTCGGACAAAGATTCGAAGAGTTA-----CTANAGAAAT------------ACTAAAAGTT---GCCGTG----NACGTTATATTG-CTATTAGCC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATAATTTTTATACTTGATCATAATTTACTTTTAAAATGAGATGTCGACTGCTTGAAACAGCTTTTGACAGCTTTGGAGGTTTCTT---ACGTGTTAGTCTNGGNCCCTGCACAACTTCATCCCATAATCGTATGTACCCGAAATAAATTTTGGATGGTAATTCCGAACAAAGATATATTTACAGTACTGATG-TT-AAAGGCAGAATAGTGCAGTGGTTAATATCGTCGATTTCGGATCGTAAGGACTGGTGTTC------AATCCCACCCGGCATCTANTTTTTTTT----ATTAGATCGTGTTTACACAATAAAGTCAATTATTTAT-TGC-----------TTTATGTGTATTTATT-CCTTTCGTAAATTAACCGTTCAGCTGTTCAATTT-TTTTTGTCTCTTCTGTCCTTCCATCGACATCTTCTTTGGCTCTACTTGCCAAAGGCCAGCAGGGCTTATGTCGTGGTA---AATTGTCC----GTCGTCCATCCGTTAACCTTTTTCTTGTAGAAGCTATA--GCATCCCCCACATTTTTCAAAGAATCTTATCCAAACTCGCACAGCATTTGTATAACCACAAACTCTCGAAGTTCTTGAACCAGCGTGATTGAACCACAAATGCTCCCTGCCACAGGGCTTACAAGCACATTTTTAAGGAAACTT---AAAAA--ACACCTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAGATATTTTAAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTGCTTATTATGATGATGTGTAAATAATAATAATAGAGAAGATTATAGTAGACGTTTTACTTAAGGGAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--TTAAA-ACTTT-TGGAGATCTAGGGAACAGT---GGAAA---T-ACTTTTAGAGATCTGGGGA-----------AC---------ATGGACAAAATACTTTTGGGG-AACTTTGGCAAATACTTTTGGAGATC-TGGGGA-----------ACAATAGGCATTACTTTAAGAGATCCAG
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gi|26 : GCCATGAGAGCTGATATTATGGTATTGATTTGTTTATTTGTCGTCCATCCG-TAAACTTTTTCTTGTACACATTGTA--TCAT
gi|27 : AGAAATAT--ATTCAAAG-T-------CAACTGAATGCACTTTGTCTAAATTTCAGGTGGTAAATAATTTAG
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Reference ( family-1822 ) : AGGCCCTCCCGGGGGTTTTGGAGATCTGGGGAAC--ATGGCCANTTATTTTCAGAGATCT-GGGG-AACATTG-GCCATT-ACTTTCAGAGATCCAGGGATC-AAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTTAATGAAAAAAAGTACCTAATTTGATCAATTTTATCAGAGACATAT--AAACAGAGAT----AGGCAACTGGANGCACTT-GTCTAAATTTCAGGTGGCACAT--TTTGGC-TTTTTCTAGTTTAGTTTGAACTTATTTATTTTACTTCGATTGTGAAACAAGTTCTTACGACTTAGACAAATCACGCTCGAAGTCT--TCCTGGGT---AT---AACCAGTACTA-AGCATATGTGGAAAAA-----GTGT-----CTTGCTCAAGGA-CACCACACATAGTCGTGGCGAAGG--ATTGAAATACCCACGACCCTNC----GATCAC-GGGT---CCGGTGCTTTA---CCACTAGACCACGTGGCGTTTTCTAAATCATGGAAACACACATCCTCCGGAATCAAACAACATATTTTTGTGATTNTGGTATCAAAAGAAAGGGCTTG-------ATTTGGG-----AGAT---T-NTTTTATCTTT-TT-TAAA-TTTAAAGAAATGAAGA---A-T-TT----TA--CGC-TTACA-GTTATT--TTGTGTGATCATTT-TC-TC-TTTTT----AGCCCATTTT-T-------GAA-------ATAA-GA------A--A--AACGA---CTTCAATAAATATCGATATGAAA--CTTTCG-CCA--CC-A-TGGANA----ACTTACTGCTTCATCTTT-CTACNTAANATTTCTATTTCT---------ATGGTGTTT----------TG----TTTAAA--CGTACAT-GATA--------TT----T---GT--T----AAATCAAG---ACTACC-----GGTGAAG-----A------A---AAA-TATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-GG-AATTGG------T-CANCATTT-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------AA------TTGTTAAATTCGGACAAAGATTCGAAGAGTTA-----CTANAGAAAT------------ACTAAAAGTT---GCCGTG----NACGTTATATTG-CTATTAGCC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATAATTTTTATACTTGATCATAATTTACTTTTAAAATGAGATGTCGACTGCTTGAAACAGCTTTTGACAGCTTTGGAGGTTTCTT---ACGTGTTAGTCTNGGNCCCTGCACAACTTCATCCCATAATCGTATGTACCCGAAATAAATTTTGGATGGTAATTCCGAACAAAGATATATTTACAGTACTGATG-TT-AAAGGCAGAATAGTGCAGTGGTTAATATCGTCGATTTCGGATCGTAAGGACTGGTGTTC------AATCCCACCCGGCATCTANTTTTTTTT----ATTAGATCGTGTTTACACAATAAAGTCAAT----------TATTTAT-------TG-GTGTATTTATT-CCTTTTGTAAATTAACCGTTCAGCTGTTCAATTT-TTTTTGTCTCTTCTGTCCTTCCATCGACATCTTCTTTGGCTCTACTTGCCAAAGGCCAGCAGGGCTTATGTCGTGGTA---AATTGTCC----GTCGTCCATCCGTTAACCTTTTTCTTGTAGAAGCTATA--GCATCCCCCACATTTTTCAAAGAATCTTATCCAAACTCGCACAGCATTTGTATAACCACAAACTCTCGAAGTTCTTGAACCAGCGTGATTGAACCACAAATGCTCCCTGCCACAGGGCTTACAAGCACATTTTTAAGGAAACTT---AAAAA--ACACCTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAGATATTTTAAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTGCTTATTATGATGATGTGTAAATAATAATAATAGAGAAGATTATAGTAGACGTTTTACTTAAGGGAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--TTAAA-ACTTT-TGGAGATCTAGGGAACAGT---GGAAA---T-ACTTTTAGAGATCTGGGGA-----------AC---------ATGGACAAAATACTTTTGGGG-AACTTTGGCAAATACTTTTGGAGATC-TGGGGA-----------ACAATAGGCATTACTTTAAGAGATCCAG
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gi|25 : TTACTCCAGGAACACAACACATCCCCATGG--AAGGGTATTGGA---CTCTTGACCGTTCCACTGAT-ACTGGAT---CGAATGCTCTG---CCACTAGATCgggagatatatagattaactgtatttc
gi|26 : GCCATGAGAGCTGATATTATGGTATTGATTTGTTTATTTGTCGTCCATCCG-TAAACTTTTTCTTGTACACATTGTA--TCAT
gi|27 : AGAAATAT--ATTCAAAG-T-------CAACTGAATGCACTTTGTCTAAATTTCAGGTGGTAAATAATTTAG
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Reference ( family-1822 ) : AGGCCCTCCCGGGGGTTTTGGAGATCTGGGGAAC--ATGGCCANTTATTTTCAGAGATCT-GGGG-AACATTG-GCCATT-ACTTTCAGAGATCCAGGGATC-AAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTTAATGAAAAAAAGTACCTAATTTGATCAATTTTATCAGAGACATAT--AAACAGAGAT----AGGCAACTGGANGCACTT-GTCTAAATTTCAGGTGGCACAT--TTTGGC-TTTTTCTAGTTTAGTTTGAACTTATTTATTTTACTTCGATTGTGAAACAAGTTCTTACGACTTAGACAAATCACGCTCGAAGTCT--TCCTGGGT---AT---AACCAGTACTA-AGCATATGTGGAAAAA-----GTGT-----CTTGCTCAAGGA-CACCACACATAGTCGTGGCGAAGG--ATTGAAATACCCACGACCCTNC----GATCAC-GGGT---CCGGTGCTTTA---CCACTAGACCACGTGGCGTTTTCTAAATCATGGAAACACACATCCTCCGGAATCAAACAACATATTTTTGTGATTNTGGTATCAAAAGAAAGGGCTTG-------ATTTGGG-----AGAT---T-NTTTTATCTTT-TT-TAAA-TTTAAAGAAATGAAGA---A-T-TT----TA--CGC-TTACA-GTTATT--TTGTGTGATCATTT-TC-TC-TTTTT----AGCCCATTTT-T-------GAA-------ATAA-GA------A--A--AACGA---CTTCAATAAATATCGATATGAAA--CTTTCG-CCA--CC-A-TGGANA----ACTTACTGCTTCATCTTT-CTACNTAANATTTCTATTTCT---------ATGGTGTTT----------TG----TTTAAA--CGTACAT-GATA--------TT----T---GT--T----AAATCAAG---ACTACC-----GGTGAAG-----A------A---AAA-TATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-GG-AATTGG------T-CANCATTT-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------AA------TTGTTAAATTCGGACAAAGATTCGAAGAGTTA-----CTANAGAAAT------------ACTAAAAGTT---GCCGTG----NACGTTATATTG-CTATTAGCC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATAATTTTTATACTTGATCATAATTTACTTTTAAAATGAGATGTCGACTGCTTGAAACAGCTTTTGACAGCTTTGGAGGTTTCTT---ACGTGTTAGTCTNGGNCCCTGCACAACTTCATCCCATAATCGTATGTACCCGAAATAAATTTTGGATGGTAATTCCGAACAAAGATATATTTACAGTACTGATG-TT-AAAGGCAGAATAGTGCAGTGGTTAATATCGTCGATTTCGGATCGTAAGGACTGGTGTTC------AATCCCACCCGGCATCTANTTTTTTTT----ATTAGATCGTGTTTACACAATAAAGTCAAT----------TATTTAT-------TG-GTGTATTTATT-CCTTTTGTAAATTAACCGTTCAGCTGTTCAATTT-TTTTTGTCTCTTCTGTCCTTCCATCGACATCTTCTTTGGCTCTACTTGCCAAAGGCCAGCAGGGCTTATGTCGTGGTA---AATTGTCC----GTCGTCCATCCGTTAACCTTTTTCTTGTAGAAGCTATA--GCATCCCCCACATTTTTCAAAGAATCTTATCCAAACTCGCACAGCATTTGTATAACCACAAACTCTCGAAGTTCTTGAACCAGCGTGATTGAACCACAAATGCTCCCTGCCACAGGGCTTACAAGCACATTTTTAAGGAAACTT---AAAAA--ACACCTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAGATATTTTAAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTGCTTATTATGATGATGTGTAAATAATAATAATAGAGAAGATTATAGTAGACGTTTTACTTAAGGGAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--TTAAA-ACTTT-TGGAGATCTAGGGAACAGT---GGAAA---T-ACTTTTAGAGATCTGGGGA-----------AC---------ATGGACAAAATACTTTTGGGG-AACTTTGGCAAATACTTTTGGAGATC-TGGGGA-----------ACAATAGGCATTACTTTAAGAGATCCAG
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gi|25 : TTACTCCAGGAACACAACACATCCCCATGG--AAGGGTATTGGA---CTCTTGACCGTTCCACTGAT-ACTGGAT---CGAATGCTCTG---CCACTAGATCgggagatatatagattaactgtatttc
gi|26 : GCCATGAGAGCTGATATTATGGTATTGATTTGTTTATTTGTCGTCCATCCG-TAAACTTTTTCTTGTACACATTGTA--TCAT
gi|27 : AGAAATAT--ATTCAAAG-T-------CAACTGAATGCACTTTGTCTAAATTTCAGGTGGTAAATAATTTAG
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gi|3 : gtataaatttcgggtggtatattcAGGCCCTCCCGGAGTTTTTGGAGATCTGGAGAAC--ACGGCCATTTATTTTCAGAGATCT-GGGG-AACATTG-GCCATT-ACTTTCAGAGATCCAGGGATC-AAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTTAATTAAAAAA-GTACCTAATTTGATCAATTTTATCAGAGACATAT--AAACGGAGAT----AGGCAACTGGAGGCACTT-GTCTAAATTTCAGGTGGCACAT--TTTGGC-TTTTGCTAGTTTAGTTTGAACTTATTTATTTTACTTCGATTGTGAAACAAGTTCTTACGACTTAGACAAATCACGCTCGAAGTCT--TCCTGGGT---AT---AACCAGTACTA-AGCATATGTGGAAAAA-----GTGT-----ATTTCTCAAGGA-CACCACACATAGTCGTGGCGAAGG--ATTGAAATACCCACGACTCTCC----GATCAT-GGGT---TCGATGCTTTA---CCACTAGACCACGTGGCGTTTTCTAAACCACGGAAACACACATCCTCCAGAATCAAACAACTTATTTTTGTGATTATGGTATCAAAAGAACAGGCTGG-------ATTAGGG-----AGAT---T-TTTTTTTCTTT-TT-TAAA-TTTAAGGAAATGAAGA---A-T-TT----TA--CGC-TTAAA-GTT-TT--TTGTGTGATCATTT-TC-TC-TTTTT----AGCCCTTTTT-T-------GAA-------ATAA-GA------A--A--AACGA---CTTCAATAAATATCAATATGAAA--CTTTTG-CCA--CCGA-TGGAAA----ATTTACTGCTTCATTTTT-CTACCTAATATTTCTATTTTT---------ATTGTGTTT----------TG----TTTAAA--CGTACAT-GGTA--------TT----T---GT--T----AAATCAAG---ACTACC-----GGTGAAG-----A------A---AAA-TATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-GA-AATTGG------T-CATCATTT-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------AC------TTGTAAAATTCAGACAAAGATTCGAAGAGTTA-----TTATAGAAAT------------ACTAAAAGT----GTCGTG----GATATTATATTG-CTATTAGCC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATAATTTTTATACTTGATCATAAATTACTTTTAAAATGAGATGTTGACTGCTTGAAACAGCTTTTGACAGCTTTGGAGATGTCTT---ACGTGTTAGTCTGAGCCCCTGCACAACTTCGTCTCATAATCGTATGTACCCGAAATAAATTTTGGATGGTATATCCGAGCAAAGATATATTTACACTACTGATG-CTGAAAGGCAGAATAGTGCAATGGTTAATATCGTCGATTTCGGGTCGTAAGGACTGGTGTTC------AATCCCACCAGAAATCTATTTTTTTTTCTTTATTAGATCATGTTTACACAATCAAGTCAAT----------TATTTAT----------GTGTATTTATTGCCTTTTGTAAATTAACCGTTCAGTTGTTCAATTTGTTTTTGTCTCTTCTGTCCTTCCAT-------------GGCTCTACTTGCCAAAGGCCAGCAGGGATTATGTCGTGGTA---AATTGTTC----GTC-----------AACCTTTTTCTTGTAGTAG--AT---GTATCCCCCACATTTTTCAAAGAATCTTATCCAAAC------AGCATTTGTATAACCACAAACTCTTGAAGTTCTTGAACAAGCGT-----------------TCCCTGCCAAAGGGCTTACAAGCACATTTT-AAGGAAACTT---AAAAA--TCACCTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAAATATTTTTAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTACTTATTATGATGATGTGTAAATAATAATAATAGAGAAGATTATAGTAGACATTTTACTCAAGGAAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--TTAAA-A-TTT-TGAAGATCTAGGGAACAGT---GAAAA---T-ACTTTAAGAGAAAGGGGGA-----------AC---------ATGAACAAAATATTTTTGGGG-AACTTTGGCAAATACTTTTGAAGATC-TGGGGA-----------ACAAAAGGCATGACTTTAAGATATCCAG
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gi|4 : catatttttgtgattatggtatcaaGAAG-----A------A---AAAATATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-AG-ATTTGG------T-CATCATAC-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------A-------TTTTTAAATTCGGACCAAGATTCGAAGAGTTAAATAATTATAGAAAT------------ACTAAAAGT----GCCGTG----GACATTATATTG-CTATTAGTC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATACTTTTTATACTTGATCATAATTTACTTTTAAAATAAGATGTCGACTGATTGAAACAGCTTGTGACAGCTTTGGACGTTTCTA---ACGTGTTAGTCTTGACCCCTGCGCAACTTCATCCCATAATCGTATGTATCCGAAATAAATTTTGGATGGTAATTGCGAACAAAGATATATTTACAGTACTGATGATT-AAAGGCAGAATAGTGCAGTGGTTCATATCGTAGATTTTGGATCGTAAGGACTGGTGTTC------AATCCCACCCGGCAttttttgtttaaaaatctttttctttttcgtgaaatttcaacatatttcgatttcaatccgtaacaattaaaattcagaagaaaaaatattaaataattgataattagatttggtcatcatacttatcagctttactttggcaccaaatttttaaattcggaccaagattcgaagagttaaataattatagaaatactaaaagtgccgtggacattatattgctattagtctgccagtctctgtaattaagtcactgattttatgtatactttttatacttgatcataatttacttttaaaataagatgtcgactgattgaaacagcttgtgacagctttggacgtttctaacgtgttagtcttgacccctgcgcaacttcatcccataatcgtatgtatccgaaataaattttggatggtaattgcgaacaaagatatatttacagtactgatgattaaaggcagaatagtgcagtggttcatatcgtagattttggatcgtaaggactggtgttcaatcccacccggca
gi|5 : catatttttgtgattatggtatcaattctattgttttgtttaaacgaacatggtatttgttaaatcaagactatcgttttttgtttaaaaatctttttctttttcgtgaaatttcaacatatttcgatttcaatccgtaacaattaaaattcaAGGGCCAGCAGGGCTTATGTTGTGGTA---AATTGTCC----GTCGTCCATCCGTTAACCTTTTTCTTGTAGAAGCTATA--GCATCCCCCACATTTTTCGAAGAATCTTATCCAAACTCGCACAGCATTTGTATAATCATAAACTCTCGAAGTTCTTGAAATAACGTGATTGAACCACAAATGTTCCCTGCCACAGGGCTTACAAGCACATTTTAAAGGTAACTT---AAAAAACACACCTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAGATATTTTAAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTGCTTATTATGATGATGTGTA---AATAATAATAGAAAATATTATAGTAGACGTTTTACTTAAGGAAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--TTAAA-ACTTT-TGGAGATCTAGGGAACAGT---GGAAA---T-ACTTTTAGAGATCTGGGGA-----------AC---------ATGGACAAAATACTTTTTGGG-AACTTTGGTAAATACTTTTTGAGATC-TGGGGA-----------ACAAAAGGCATTACTTTAAGAGATCCAG
gi|5 : tcaatcccacccggcTTTTTGAGATCTGGGGAACAAAAGGC--ATTACTTTAAGAGATCC-AGAG-AACATGG-ACCagaacatggacccctctgggagggcc
gi|6 : tcaatcccacccggcagggccagcagggcttatgttgtggtaaattgtccgtcgtccatccgttaacctttttcttgtagaagctatagcatcccccacatttttcgaagaatcttatccaaactcgcacagcatttgtataatcataaactctcgaagttcttgaaataacgtgattgaaccacaaatgttccctgccacagggcttacaagcacattttaaaggtaacttaaaaaacacaccttttctctgaaagttcaagccatagaccatagatattttaaacaaggaaaagaagacagtacatggattttgcttattatgatgatgtgtaaataataatagaaaatattatagtagacgttttacttaaggaaacactatttggtactttcagggaactatgtttaaaacttttggagatctagggaacagtggaaatacttttagagatctggggaacatggacaaaatactttttgggaactttggtaaatacCAGAGATATATTTAAACTGAGATTTATACGTGACTGCATGTGCTT-GTCTAAATTTTTGGTGGC-TGT--TTTGGCGTTTTTCcctctgggagggcc
gi|6 : aaACATATAATTGTGGTTTGGGTTTAAAAAGGA--GGTTTG--------TTTGTACCTTTAGAT---A-GTA--AACTTT-CT-TAAAATGGAAAGAAATGAAAAC--A-T-AT----TA--CGC-TTACA-GTTATT--T---GTTATCAATA-TC-TC-ATTTT----AGCC-ATGTT-T-------TAA-------GTAA-GA------A--ATAAACAAAGCTTTTTTTGAATGTCGATATGAAA--ATTTCG-CCA--T----------------TTATTTCTTCATCTTTTCTA--TAAAATATATATTTCT---------ATGAAG-------------TG----TTAAAA--AACACAC-AATA--------TT----TTTCGT--T------TTCA--------ACC-----AGT-AAT-----A------ATTTAAA-TTCCGAAAACAT-------AAT-AGATATAAGATA----TT-GG-GAACAA------TACAACATTT-----------TTATCAGGTTCACTTTGATAACAA------AA------TTATAAAACTTGAACAAAGTTTCGAAGAGTTA-----CTAAAGAAATGTTTATGGTGCCACCAAAAGTTCTAGCCGTGTAAACATGTTGAATTGATTA-TAACTATAGTAGCCTCTGTAA-TAAGTCACTGATaggaacccacatataattgtggtttgggtttaaaaaggaggtttgtttgtacctttagatagtaaactttcttaaaatggaaagaaatgaaaacatattacgcttacagttatttgttatcaatatctcattttagccatgttttaagtaagaaataaacaaagctttttttgaatgtcgatatgaaaatttcgccatttatttcttcatcttttctataaaatatatatttctatgaagtgttaaaaaacacacaatatttttcgttttcaaccagtaataatttaaattccgaaaacataatagatataagatattgggaacaatacaacatttttatcaggttcactttgataacaaaattataaaacttgaacaaagtttcgaagagttactaaagaaatgtttatggtgccaccaaaagttctagccgtgtaaacatgttgaattgattataactatagtagcctctgtaataagtcactgataa
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1822 ) : AGGCCCTCCCGGGGGTTTTGGAGATCTGGGGAAC--ATGGCCANTTATTTTCAGAGATCT-GGGG-AACATTG-GCCATT-ACTTTCAGAGATCCAGGGATC-AAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTTAATGAAAAAAAGTACCTAATTTGATCAATTTTATCAGAGACATAT--AAACAGAGAT----AGGCAACTGGANGCACTT-GTCTAAATTTCAGGTGGCACAT--TTTGGC-TTTTTCTAGTTTAGTTTGAACTTATTTATTTTACTTCGATTGTGAAACAAGTTCTTACGACTTAGACAAATCACGCTCGAAGTCT--TCCTGGGT---AT---AACCAGTACTA-AGCATATGTGGAAAAA-----GTGT-----CTTGCTCAAGGA-CACCACACATAGTCGTGGCGAAGG--ATTGAAATACCCACGACCCTNC----GATCAC-GGGT---CCGGTGCTTTA---CCACTAGACCACGTGGCGTTTTCTAAATCATGGAAACACACATCCTCCGGAATCAAACAACATATTTTTGTGATTNTGGTATCAAAAGAAAGGGCTTG--A-------TTTGGG-----AGAT---T-NTTTTATCTTT-TT-TAAA-TTTAAAGAAATGAAGACAT-TT----TA--CGC-TTACA-GTTATT--TTGTGTGATCATTT-TC-TC-TTTTT----AGCCCATTTTT-------AAA-------ATAA-GA------A--A--AACGA---CTTCAATAAATATCGATATGAAA--CTTTCG-CCA--CC-A-TGGANA----ACTTACTGCTTCATCTTT-CTACNTAANATTTCTATTTCT---------ATGGTGTTT----------TG----TT--TAAA--CGTA-CAT-GATA--------TT----T---GT--T----AAATCAAG-ACTACCA--------GTGAAG-----A------A---AAA-TATTAA----AT-------AAT-TGATA------A----TT-GG-AATTGG------T-CANCATTT-----------TTATCAGCTTTACTTTGGCACCAA------AA------TTGTTAAATTCGGACAAAGATTCGAAGAGTTA-----CTANAGAAAT------------ACTAAAAGTT---GCCGTG----NACGTTATATTG-CTATTAGCC-TGCCAGTCTCTGTAATTAAGTCACTGATTTTATGTATAATTTTTATACTTGATCATAATTTACTTTTAAAATGAGATGTCGACTGCTTGAAACAGCTTTTGACAGCTTTGGAGGTTTCTT---ACGTGTTAGTCTNGGNCCCTGCACAACTTCATCCCATAATCGTATGTACCCGAAATAAATTTTGGATGGTAATTCCGAACAAAGATATATTTACAGTACTGATG-TT-AAAGGCAGAATAGTGCAGTGGTTAATATCGTCGATTTCGGATCGTAAGGACTGGTGTTC------AATCCCACCCGGCATCTANTTTTTTTT----ATTAGATCGTGTTTACACAATAAAGTCAAT----------TATTTAT-------TG-GTGTATTTATT-CCTTTTGTAAATTAACCGTTCAGCTGTTCAATTT-TTTTTGTCTCTTCTGTCCTTCCATCGACATCTTCTTTGGCTCTACTTGCCAAAGGCCAGCAGGGCTTATGTCGTGGTA---AATTGTCC----GTCGTCCATCCGTTAACCTTTTTCTTGTAGAAGCTATA--GCATCCCCCACATTTTTCAAAGAATCTTATCCAAACTCGCACAGCATTTGTATAACCACAAACTCTCGAAGTTCTTGAACCAGCGTGATTGAACCACAAATGCTCCCTGCCACAGGGCTTACAAGCACATTTTTAAGGAAACTT---AAAAA--ACACCTTTTCTCTGAAAGTTCAAGCCATAGACCATAGATATTTTAAACAAGGAAAAGAAGACAGTACATGGATTTTGCTTATTATGATGATGTGTAAATAATAATAATAGAGAAGATTATAGTAGACGTTTTACTTAAGGGAACA----CTATTTGG----TACTTTCAGGGA--------ACTA-TGT--TTAAA-ACTTT-TGGAGATCTAGGGAACAGT---GGAAA---T-ACTTTTAGAGATCTGGGGA-----------AC---------ATGGACAAAATACTTTTGGGG-AACTTTGGCAAATACTTTTGGAGATC-TGGGGA-----------ACAATAGGCATTACTTTAAGAGATCCAG
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