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gi|5                          :  GTAACAAAGTAAACATTTTTACACATAAAA-TGACTATACATAACCC-TTAGGCTTTCACAATACTCTTCATGTAC---AGGTA-------ATTACATGTTAT------TACATAAATGATA--GTGAACAT--TTT-----TTATATGTAG--ACTGCACAG-TA--TAATAACTGGTCAGTTGTAT--TG-----------------AGAGAGCAAGA-----TGTTTTTTGTTGCA----------------------AAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATA----GGAAAATGACTTGT-----TG-------------A----A-------------GT---------GAA--GCAAGATGGGGAGAGAATGA-----------TGA--------------T------------ATG------------------AAG---------------TTGATGATCAAGAATTCTAGTGAAGTT--CG------------------GTG------------AGTGATAC-ATTGTA-AA-TATCTAATATTG--CTGGAATAAT---GTTTTTGGCTTATATTG----AGTATCGCGTGAATTCAA--T-TGTCTTTC--GC--------GATGTA-ATA-CAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAAATTGTTATTAAATTCAT-CAATACCATTTCTATATA--GTAAAAGCA-ATTTCCTTTTACTTAA--AGAAATATCTCCTCTTTTTTGGGCATGGTGAAAA-------A---TG-----------G-------------G--------T-----------AG---AATGTTGATTCGTGGACCATAC---CAT--TATGAAGCACCAAGA---TACAAGACAAGATTCAAG------------------A---------------------G-TA---------------------CA---------------AATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAACGTCAGTTCCT------------ACTATGAGATGTGAAAAACAGTTGATGTA-------TATATAA--------TTGGA--TGCACGA-CGTAT-CAAATTCCATAGTGACGTGAAACTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---AACATAGCA-------TTTATTCTATAAAAAATGTGTAGTGCATACATTATAAGAAATAT-AAAACCATTATACGGGAGTGCAGAAGTGACATAAAGACTAACATTTTACGA------TATATACTACTAGT-ATTTGTGT--------TATTACAGTTAAGGCTGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATACTTTTC-TTGAATCCACATTTTCTCTT-CTTTAT--CTGTC--TCA--AACTTTTCTATCTAACTATTTTTCTGATTTATTTT-TTTG--AATTAAATTa
gi|6                          :  GTAACGAAGTTAACTATTTTACACATACA--TGACTACACATAACCA-TTAAACGTTCACGGTATTCTTTATGTAC---AGGTA-------ATAACATGTATT------TACAAAAATCATA--ATTAACAC--TTT-----GTATGTGTAG--ACTGCTCAG-TG--TAACAG--G-TCAGTTGT-T--TT---GTT---TTT-----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTATGTTACA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTGCATATATATA----GGAAAATGGCTTGT-----TGAAGTGAAAATACTA----A-------------GT--------TGAAT-ACAAGACAAAGCGAGAATGC-----------TAA--------------T------------ATA------------------AAG---------------T-------------------------TGATGTTCAAGAATTTTGGTGAAGTG------------AGTGATAC-ATT-CTAAA-TATTTGATTTTG--ATGGAATTTT---GTTTTTGTCTTATATTG----AGTATCGTATAAACTCAA--A-TGTCGTTC--TC--------GGTGTA-ATA-CACTATTGATATATAAATAC--AATTTACGCGAG--A------------AAATTCCT-CAATACCACTTTTACAAA--GTAAAAGTA-ATTTTCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCACGGTGATAA-------A---TG-----------GT------------A--------CTTTCTTGGGGGGG---AATGTTGAATCATGAACCATAA---GAT--TATGAAGTATTAAGA---C----------------GATGCCA------------A---------------------A-TACGGGTACAAAAGTTTGCAGTACA---------------TATTGAATCTATGGCGGACTTA--AATTTCCA
gi|15                         :  GTAACGAAGTTAACATTTTTACACATAAGA-TGACTACGCATAACCC-TTAAACGTTCACAGTACCCTTTATGTACTTTATGTAACCGGTAATTACTTGTAAT------TATACAAAT-ATA----------------------ATAT---A--ACTG-------------------GTCAGTTGTAT--TG---TTGC--TTTG----AGAGAGGAATA-----TGTATTATGTTACA----------------------TTCAAGTCTGAGACCTTGCATAGGTATA----GAAAAGGGGCTTGT-----TG-------------ACGTGAAGATACTAC----GT--------TGAAA-ACAAGATGAGGCGAGAATGG-----------TAA--------------T------------ATG------------------AAG-----------------------------------------T--TG------------------GTG-------------TTGAAGTGGTTATT-GATTATTTGGC-TTGGAATGGAATTAA---AACTTTGTCtatacagattccatggtgacgtgaaataccacaactagatgtaatattttgatatagtatttattctataaaatgtaaagtgcaaatgaaatataaaacatttagaagtaagttcagactaaagtttctcgtacatttatgtcatcaaagcttagactgtttaagaagatatttgatatataatatatccatatattgtcatgcattgtatttatctttgatccatactttctcttctttatctgtcttgaacttttctatttaactatctctctgattcatgaatttatactggtgtagtagttgtttgttataaaaatatttttattaaacaaaatgacaacataaacattgttac
gi|1                          :   TAACATAGTAAACATTTTTACGCATAAAA-TAACTACA--TAACCC-TTAGGCTTTTACAATACTCTTTTTGTAC---AGGTA-------ATTACATGTAAT------TACATAAATCATA--GTGAACAC--TAT-----TTATGTGTAC--ACTGCATA--TACTT-------GGTCAGTTGTATATTG---GTTT--TTTG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTACA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACACAGGTATA----GGAA--------AG-----TG-------------A----A-------------GT--------TGAAT-GCAAGATGAGGCGAGAATGA-----------TAA--------------TATGAAGTTG---ATGTTTAAGAATTCTAGTGTTAAG---------------T-------------------------T--CG------------------GTG------------AGTGATAC-ATTGTA-AA-TATTTGATATTG--CTGGAATTAT---GCTTTTATCTTATATTG----AGTATCGCATAAATTTAA--A-TGTCTTTC--GC--------GGCGTA-ATA-CAACATTGATATGTAAATAC--GGTTTACGCGAG--AAAT-TTCTTATTAACTTCCT-CAATACCACTTCTATATA--GTAAAAGCA-ATTTTCTTTTCCTTAT--AGAAATATCTCCTCTTTTTTGGTTACGGTGATAA-------A---TGCTATTACCTAGG-------------G--------T-----------GG---AATGTTGATTCATGAACCATAA---AAT--TATGAAGTACCAAGA---T----------------G------------------ATGTCAA---------------A-TA---------------------CAATAATCTTCAGTAAATATTCATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAACGTCAGTTTGTTAAATAATTGA-ACATTAAGGCGTGAAAAACAGTTGATATATAATAACTATATAC--------TTGGA--TACACGA-CGTATATAGATTCCATGATGACGTGAAATTCCACAACTAGAT---ATACTAT---AGTATAGTA-------TTTATTCTAT-ATAAAAGTAAAG-----AAA-TAT---AAATATGTA---TATTATACGAGAGTGCAAAAGTGGCATAAAGACTTATACTTGACGA------TATATACTACTAATATG-TGTGT--------TATTACAGTTTAGGCTGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATAGTGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCATACTTTCTCTT-CTTTGT--CTGTC--TCA--AACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATT---AT------TTCAAT----TAAGTTTATACTGGTGTCATAGTTGTTTATGATAACAACATATTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTC
gi|10                         :   TAACAA-GTTAACATGTTAACACATAAA--CGACTACATATAACGC-TTAACCTTTCACAGTACTCTTTATGTAC---AGGTA------AAT-ACACGTAGG------TACATAAATCATA--GTGAACAC--GTT-----TTATGTGTAG--ACT--ACAG-TA--T-------------TT---T--TA---GTCA--GTTG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTATGTTACA----------------------AAGAGGTATGGAACCTTGCACAGGCATA----GGAAAATGGCTTGT-----TG-------------A----A-------------GTGAAAAAGTTGAAT-GCAAGATGAGGCGAGAATAA-----------TAA--------------T------------ATG------------------AAG---------------TGATTTTCAAGATCTCTAGTGAAGT-T--CG------------------GTG------------AGTGATAC-ATTGTA-AA-TATTTGATTTTG--ATGGAATTCT---GGTTTTATCATATATTA----AGTATCGCAGTAACTCAA--A-TG--TATT--GA--------GATGTT-TTA-CTATATTGATCTGTAAATAC--GATTTACACAAC--AAAG-TTCATATTGAATTCCT-CAATTATATTTCTACGTA--GTAAAAGCA-ATTTCCTTTTACTTAT--AGAAACATATCCTCCTTTTTGGTTACGATGATAA-------A---TG-----------GTTCTACCTTGAGAG--------T-----------GG---AATGTTTATTCATAAGCCATAA---ACT--TATGAAGTATCAAGA---C----------------G------------------ATGCCA----------------A-TA---------------------CA---------------CATTGAATCTATGTTGAAC-------TTT----AACCTTAGTTCATAAAAGTATGGA-ACTAAGAGGTGTGAAA--CAG-----ATAATAT----ACATAC--------TTGGA--TCCACGACATTATATAGATTACATTGTGACGTGATAAACCACAACTAGATGCTATATTAT---GATAAAGTA-------TTTATTCTAT-AAAAATGTAAAGTG-------TATAAGACATAT-AACACATTTATACGGGACTTCAAAAGTGGCGTAAAGACTAAGATTTTATGATA----TATAT--T---------TTGTG--------ATATTAAAGTTTAAGCTGTTTAAGA-AGAT-AATTGATATATAATACATCAAT-TATcc
gi|14                         :                                                                                         aGTAATTACATGTAATTACCTGTACGTAAAGAGTACTGTGAA-AG--TTTAAGGGTTATGTGTAGTCATTTTAT-G-TG--TAAAAA--GGTTAATTTTGT--Tc
gi|8                          :                                                                                                                                                           tgtTGCACGG-TA--TAAC-T--GGTCAGTTGTAT--TG---ATTT--TTTT----TGAGAAGAAGA-----TGTGTTATGTAACA----------------------TAATGATCTGGAACCTTATATAGGTATA----GGACAACGGCTTGT-----TG-------------A----A-------------GTGAAGT---TGAATTACAAGATGACACGAAAATGA-----------TAA--------------TTCAAGAATTCTAGTG------------------AAG---------------T-------------------------T--CG------------------ATG------------AGTGATAC-ATTGTA-AA-TAGTTTATTTTG--CTGGAATTAT---GTTTTTGTCTTATATTG----AGTATCGCATCAACTCAA--A-TGTCTTTC--GC--------GGTGTA-ATA-CAATATTGATATGTAAAT----GATTAATGCGAG--AAAA-TTCTTACTAAATTTTT-CAATAACATTTCTGTATA--ATAAAAACA-ATTTCCTTTTACTTATGTAGAAATATCTCCTCGTTTTTGGTCACGGTGATAATGGTACTACCTTG-----------G-------------G--------T-----------GG---AATGTTGATTCATGAACCATAA---AAA--TATGAAGTAC-AAGA---T----------------GGTGCCAAATACAATCTACA---------------------A-TA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAA--AATTTTTAAAACGTAAGTGCGTAAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAAAAATAGTTGACATAT---------ATAC--------TTGGA--TACACGA-CGTATATAAATTCCATGCTGACGTGAAAATCTACAACTAGAT---ATGATAT---AATATAGTA-------TTTATTCTAT-AAAAAATTAAAGT-------CTATAAGAAATAT-AAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAACATTTCACGATA----TATAT--TACTAGT-ATTTGTG-TA-------ATTACAGT------TGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATAT-----------------CCATATTTTT------------------TCTT-CTTTAT--CTGTC--TCA--AACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTTT-TTTGTTTATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTAATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTACCGCataaatcataatgaacactttttatgtgtagactgcaaggtgtaactggtcagttgcattggttttatgagagaggaagatgtgttgtattgcataaaggtctggtaccttgcataggtataggaaaatggcttgttgaagtgaagttgaatgcaagatgaggcgagaatgataatataaagctgatgttcaagaattctagtgtgaagttcggtgagtgatacattgtaaatatttgatattgctgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATA----GGAAAATGACTTGT-----TG-------------A----A-------------GTGAAGT---TGAAT-GCAAGATGAGGCGAGAATGA-----------TAA--------------T------------ATG------------------AAG---------------TTGATGTTCAAGAATTCTAGTGAAGCT--CG------------------GTG------------AGTGATAC-ATTGTA-AA-TATTTGATATTG--CTGGAATTAT---GTTTTTGTCTTAAATTG----AGAATCGCATTAATTCAA--AATGTCTTTC--GC--------AGTGTA-ATA-CAATATTGATATGTAAATATATGATTTACTTGGG--AAAA-TTATTAATAA-TTCAT-CAATACCATTTCTGCATA--GTAAAAACA-ATTTCCCC----------------ATCTCCTCCTTTTTGGCCACGGTGATAA-------A---TG-----------GTACTACCTTGG--G--------T-----------GG---AATGTTGATTCATGTCCCATAG---AAT--TGTGAAGTATCAAAA---T----------------G------------------ATGCCAAATACTAAAATCTACAG-TA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGCTGACAAG--AATTTCCAAAACGTCAGTTCATTAAAGAATGGA-ACTTTGAGACATGAAAA-CAGTTGATATAT-ATA--TATATAC--------TTGGA--TACACGA-CGTATATAGATTCCATGGTGACATGAAATTCCACAACTTGAT---ATGCTAT---AATATAGTA-------TTTATTCTAT-AAAAATGTTAAGTG-------TATAAGAAATAT-AAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGATGTAAAGACTAACATTTTACAATA----TATAT--TACTAGT-ATTTGTGTTA--------TTACAGTTAAGGCTGTTTGAGAG--GAAAATTGATATATAATATATCAATATATGGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCATACTTTCTCTT-CTTTAT--CTGTC--TCA--AACGTTTCTATCCAATTATCTCTCTGATTTATT-T-TTTC--AATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAAAAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAGACAAAATGACAACATTAACATCATCGCac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATTG--CTGGAATTAT---GTTTTTGTCTTATATTG----GGTATCGCATAAATTCAA--A-TGTCTTTC--GC--------GATGTA-ATA-CAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCAT-CAATACCATTTCTATATA--GTAAAAGCA-ATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCATTTTGATCTTGGTGAAAA-------A---TG-----------G-------------G--------T-----------GG---AATGTTGATTCGTGGACCATAA---AAT--TATGAATGACCAAGA---TACAAGATTCAA-----G------------------A---------------------G-TA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACTAG--AATTTCCAAAACGTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTGATATATAAT---TATATAC--------TTGGA--TAAACGA-CGTATATAGATTCAATGGTGACGTGAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GGTATAGCA-------TTTATTCCAT-GAAGATGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATAT-AAAACAATTATACGGGAGTGCAGAAGTGACATAAATACTAATATTTTATGA------TATATGCTACTAGT-TGTTGTGTTA-CAATGTATTACAGTTTAGGCTGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGC------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTTCTCTT-CTTTAC--CTGTC--TCA--AACTTTTCTATCTAACTAAC-CTCGAATTTATTAA-ATTG--AATTAAATTACACAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACTAAATGACAACATACATTTTGTCGCa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --CTGGAATTATTATGTTTTTGTCTTATATTG----AGTATCGCATAATTTCAA--A-TGTCTTTC--GC--------GGTGTA-ATA-CAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTTTTATTAAATTCCT-CAGTATCTTTTCTATATA--GGAAAAGCA-ATTTCCCTTTACTTAT--AAAAATATCTCGTCCTTTTGGGTCACGGTAATAA-------A---TG-----------GTACTACCTTGG--G--------T-----------GG---AATGTTGATTCATGAACCATAACAAGATAATGCCAAATAC-AGGAGTCT----------------A------------------C---------------------ACTA---------------------CA---------------TCTTGATTCTGTGGTGAACAAG--AATTTCCAGAACGTCAGTTCGTTAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTTAAAAACAGTTGATATATCGG---TATATAAATACACACTTGGATCTACACGA-CGTATa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     caccgatgttatggatttctatatgtacaaggcgtttttcgtcacaGGAA--AT---TGCTTT-TACTATATAGAAATGGTATTG-ATGAATTTAATAA-TAATTTTCTCGCGTAAATCGTATTTACATATCAACGTTG-TAT-----TAC---AT---CGCGAA--AGA---TAT--TTGAATTTATGCAATACC----CAATATAAGACAAAAACATAATTCC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtaacaaagttaacatttttacacataaaatgactacacataacccttaagctttaacaatactctttatgtacaggtacggtaattacatgtaattacataaatgatagtgaacactttttatatgcagactgcacagtataaaagggtcagttgtattggttatttgagagaggaagatgtgttgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaaaggtctgggaccttacatagagataactaggaatatgatttgttgaagttgaatgcaagatgaggcgagaatgatgatatgaagtttggtgagtgaaacataattaatatttaatattgct-TA---------------------TA---------------TATTGAGTCTGTTGTGGACTTGTAAATT-TCACAACGTCAGTTCGTTA-ACAA-GGACAGTATGAGGCTTAAAGAAtttaacttatagaaatatctcctcctttttggttttggtgaaaaatggatggaatgtcgatttgtagaccataaaattacgaagtaccaagatgaatacatattgattctatggtggacaagaattcccaaaacgtcagcttgttagaaaatggaactatgagacgtgaaaaacagtttatatattattatatacttggatacacgaagcatatagattccatggtgacgtaaaattccacgactagatatgctatgatatagcatttattctatggagatgtgaagtgcataaattataagaaatttaaaacaattatacgagagtgcagaagtgacataaagtctagcattttatgatacatgtatatgctactagttgttgtgttacaatatattacagtttaggctgtttgagagaggaaaattgatatataatatatccatatattgtcatacattatatttttcttgaatccacattttctcttctttaactgtctctaacttttctatctaactatctctctgatttcttaaattgaattaaattacataaatttatactggtgtaatagttgtt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTATATAGTTTCGGTGATGATGTGAAATTCCACAACTAGAT---ATAATAT---AATATAGTAATAATTATTTATTCTAT-AAAAATGTAAAGCG-------TATAAGAAATAT-AAAACATTTAAACGGGAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAATATTTCACGATA------TATACTACTAGT-AGTTGTGTTA--------TTACAGTTTAGGCTATTT--GAGAGGAAAATTGATACATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTGTATTTTTTATTTAATCCATATTTTGTCTTCCTCTAT--CTGTC--TCA--AACTTTTCTGTCTAACTATCTCTATGGTTTATTTA-TTTG--AATTAAATTTCATAAATTAATACTGGTGTAATAATTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAAAATTGTCGCgac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATACAGATTCCATGGTGACGTGAAATACCACAACTAGAT---GTAATATTTTGATATAGTA-------TTTATTCTAT-AAA-ATGTAAAGTGCA--AAT-----GAAATAT-AAAACATTTAGAAGTAAGTTCAG-----AC-TAAAGT--------TTCTCGTACAT------------------TTATGTCATCAA--------AGCTTAGACTGTTTAAGA-AGATAT-TTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTGTATTTATC-TTTGATCCATACTTTCTCTT-CTTTAT--CTGTC--TTG--AACTTTTCTATTTAACTATCTCTCTGATT-----------------------CATGAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTTGTTATAAAAATATTTTTATTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTac
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAATTAACCTTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAACTTTCACAGTACTCTTTACGTAC---AGGTA-------ATTACATGTAATTACATAAATCATAATGAACACTTTTTATGT--GTAGACTGCAAGGT-GTAAC-T--GGTCAGTTGCAT--TG---GTTTTAT--G----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTATTGCA----------------------TAAAGGTCTGGTACCTTGCATAGGTATA----GGA-AAATGGCTTGTTGAAGTGA----A---------GT-------------TGAAT-GC-A-AG-------------------ATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------AAT------------AT------------------------AAAGCTGATG-TT------------------CAAGAATTCTAGTGTGAAGTTCG--GTG----AGT---GATACATTGTAAATATT-------TGATATTG--CTGGac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACGAAGTTAACATTTTTACACATAAGA-TGACTACGCATAACCCTTAAACGTTCACAGTACCCTTTATGTACTTTATGTAACCGGTAATTACTTGT---------AATTATA-CAAA-------TAT---------------AAT-ATAAC-T--GGTCAGTTGTAT--TG---TTGCTTT--G----AGAGAGGAATA-----TGTATTATGTTACA----------------------TTCAAGTCTGAGACCTTGCATAGGTATA----GAA-AAGGGGCTTGT-----TGACGTGAAGATACTACGT-------------TGAAA-AC-A-AG-------------------ATGAGGC--------GAGAAT--------------GGT-------AAT------------AT------------------------GAA------G-TT----------------------------------------G--GTGTTGAAGT---GGT-TATTG--ATTATT-------TGGC-TTGGAATGGAATTA---AAACT---TTGTC
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tTA---------------------TA---------------TATTGAGTCTGTTGTGGACTTGTAAATTTC-ACAAC--GTCAGTTCGTTAACAA--GGACAGTATGAGGCTTAAAGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCgac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAAG--GGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATA----GGA-ATATGATTTGT-----TGA----A---------GT-------------TGAAT-GC-A-AG-------------------ATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TT------------------T---------------------G--GTG----AGT---GAAACATTACTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCTATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-CTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T-A----T-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATATATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGTAAATTGATATACAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGCnnnnnnnnnnaacatat
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gi|7                          : gtaacgaagttaactattttacacatacatgactacacataaccattaaacgttcacggtattctttatgtacaggtaataacatgtatttacaaaaatcataattaacactttgtatgtgtagactgctcagtgtaacaggtcagttgttttgtttttagagaggaagatgtgttatgttacataaaggtctgggaccttgcatatatataggaaaatggcttgttgaagtgaaaatactaagttgaatacaagacaaagcgagaatgctaatataaagttgatgttcaagaattttggtgaagtgagtgatacattctaaatatttgattttgatggaattttgtttttgtcttatattgagtatcgtataaactcaaatgtcgttctcggtgtaatacactattgatatataaatacaatttacgcgagaaaattcctcaataccacttttacaaagtaaaagtaattttctttaacttatagaaatatctcctcctttttggtcacggtgataaatggtactttcttgggggggaatgttgaatcatgaaccataagattatgaagtattaagacgatgccaaatacgggtacaaaagtttgcagtacatattgaatctatggcggacttaaatttcTGTAACAAAGTTAGCATATTTACCCATAAAAATGACTACACACAACCCTTTAACGTCCACAGTACTCTTCATGTAC---AGATA---ATTAATT----GTAAATGCATAAATAATAGTGAACCCTTTTTTTGTATGTAGACTG----GTTATA-TCT--GGTCGATTGTAT--TAAATGTTGTTTTTGTATCATACAGGAAGA-----TGT-------TACA----------------------TCAAGGTTTGGGA-------------------AAA-AAATAGCTTGT-----TGA----A---------GTAAAGAGACTATGTTGAGT-AC-A-AG-------------------ATGAGGC--------GAGAATGATAGCATGCAGCTGATGTTCAAGAATTCCT--------GT------------------------GAA------G-GT------------------C---------------------G--ATG----AGT---GATACATTGTTAATATT-----------GTTC--CT----------T-TTT---TTGTCTGGTATTCAGCATCGCATAAACC----CAG--TGTCTTTCGCGATG--ATACAATATTGATATGAAAATAC--GATTCACGCGAGAAAAAA-AAAATATTGAATTATTTGATATAATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCT------------------TCTCCT--TTTTTGGTCATGGTGATAA-------A-----------T------------GGAACTATCATTG-------------GTGTAATGTCGAATCATTAACTAT---AAGATAATG--ATGTGTAAAGA---C----------------GATGCCT------------A---------------------ATA---------------------CAATAATCTTCAGTATGTATTCATTTTATGATGGACTTT--AATTTC--AAACTTGCCAGTTCGTT-AAGTATGAA-ACAATCAGGCGTG--AAATAGATTATATA----A-A----C-----TAGATtac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTAGATTTGATAATAT---AGTATAGCA-------TTTATTTTATAAAAA-----------A-CAAT-------AATA---AACATTTATACGGGAGTTCAGAAGTGTTACAATGTCTAACATTTCAGGATA----AAC---CT-CT------TGTGTCA-------TTGCAGTTTAGGCTGCTTAA------AAAGATGAT------TA-ATCCATATATTGTAACATGTATGCATTGTATTTTTC-TTG--------TTTTAAAGCT--------ATCGTTCTCAAACTTTTAAATCTAAATATCTCTCTGATTTGTTAGTAT----ATTACATTTCATAAATTTATACTGGTGTATTTGTTCTTTGTGACAACAATAGTTTT-----ACAAGATGACAACATAAACATTGTTGttgataatatagtatagcatttattttataaaaaacaataataaacatttatacgggagttcagaagtgttacaatgtctaacatttcaggataaacctcttgtgtcattgcagtttaggctgcttaaaaagatgattaatccatatattgtaacatgtatgcattgtatttttcttgttttaaagctatcgttctcaaacttttaaatctaaatatctctctgatttgttagtatattacatttcataaatttatactggtgtatttgttctttgtgacaacaatagttttacaagatgacaacataaacattgttg
gi|8                          :                                                                                                                      tgtaacaaagttagcatatttacccataaaaatgactacacacaaccctttaacgtccacagtactcttcatgtacagataattaattgtaaatgcataaataatagtgaaccctttttttgtatgtagactggttatatctggtcgattgtattaaatgttgtttttgtatcatacaggaagatgttacatcaaggtttgggaaaaaaatagcttgttgaagtaaagagactatgttgagtacaagatgaggcgagaatgatagcatgcagctgatgttcaagaattcctgtgaaggtcgatgagtgatacattgttaatattgttcctttttttgtctggtattcagcatcgcataaacccagtgtctttcgcgatgatacaatattgatatgaaaatacgattcacgcgagaaaaaaaaaatattgaattatttgatataatttctgcatagtaaaaacaatttccttctccttttttggtcatggtgataaatggaactatcattggtgtaatgtcgaatcattaactataagataatgatgtgtaaagacgatgcctaatacaataatcttcagtatgtattcattttatgatggactttaatttcaaacttgccagttcgttaagtatgaaacaatcaggcgtgaaatagattatataaTGCACGGT-ATAAC-T--GGTCAGTTGTAT--TG---ATTTTTT--T----TGAGAAGAAGA-----TGTGTTATGTAACA----------------------TAATGATCTGGAACCTTATATAGGTATA----GGA-CAACGGCTTGT-----TGA----A---------GTGAAGT--------TGAATTAC-A-AG-------------------ATGACAC--------GAAAAT--------------GAT-------AATTCAAGAATTCTAGT------------------------GAA------G-TT------------------C---------------------G--ATG----AGT---GATACATTGTAAATAGT-------TTATTTTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATCAACT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAAT----GATTAATGCGAG--AAAA-TTCTTACTAAATTTTTCAATAACATTTCTGTATAATAAAAACAATTTCCTTTTACTTATGTAGAAATATCTCCTCGTTTTTGGTCACGGTGATAATGGTACTACCT--------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTTGATTCATGAACCAT---AAAAATATG--AAGTAC-AAGA---T----------------GGTGCCAAATACAATCTACA---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAA--AATTTTTAAAAC--GTAAGTGCGTAAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAAAAATAGTTGACA-------------------TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAAATTCCATGCTGACGTGAAAATCTACAACTAGAT---ATGATAT---AATATAGTA-------TTTATTCTATAAAAA-ATTAAAGT-------CTATAAGAAATATAAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAACATTTCACGATA----TATAT--TACTAGTATTTGTG-TA------ATTACAGT------TGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATAT-----------------CCATATTTTT----------------------TCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTTTTTTGTTTATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTAATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTACCGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATA----GGA-AAATGACTTGT-----TGA----A---------GTGAAGT--------TGAAT-GC-A-AG-------------------ATGAGGC--------GAGAATGATAATATGAAGTTGATGTTCAAGAATTCTA--------GT------------------------GAA------G-CT------------------C---------------------G--GTG----AGT---GATACATTGTAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTAAATTGAGAATCGCATTAATT----CAAAATGTCTTTCGCAGTGTAATACAATATTGATATGTAAATATATGATTTACTTGGG--AAAA-TTATTAATAA-TTCATCAATACCATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCCC----------------ATCTCCTCCTTTTTGGCCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------GTACTACCTTGG--GTGGAATGTTGATTCATGTCCCAT---AGAATTGTG--AAGTATCAAAA---T----------------G------------------ATGCCAAATACTAAAATCTACAGTA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGCTGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCATTAAAGAATGGA-ACTTTGAGACATG-AAAACAGTTGATATA----T-A----TA----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACATGAAATTCCACAACTTGAT---ATGCTAT---AATATAGTA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTTAAGTG-------TATAAGAAATATAAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGATGTAAAGACTAACATTTTACAATA----TATAT--TACTAGTATTTGTGT-------TATTACAGTTAAGGCTGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCAATATATGGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCATACTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACGTTTCTATCCAATTATCTCTCTGATTTATT-TTTTC--AATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAAAAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAGACAAAATGACAACATTAACATCATCGCac
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Unaligned ( gi|20 ): TAATATAATGAACAGCATTGTGGACATTATATTATATGTGTTTGTA






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Reference ( family-181 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTCACAGTACTCTTTATGTAC---AGGTA---GGTAATTACATGTAATTACATAAATNATAGTGAACACTTTTTATG--TGTAGACTGCACAG-TATAACA--TGGTCAGTTGTAT--TG---GT--TNTTTG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTACA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGGNATA----GGA-AAATGGCTTGTTGAA-GTA-A-----------TGA-------AT-G-CA-AGATGAGGC--------GAGAA--------------TGAT-------AAT------------AT------------------------GAA------G-TT-------------------------C---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATAAATT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCNTCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTNACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTCGATTCGTGGACCAT---AAAATTATG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCGTTAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAAAAACAGTTGATATA----T-A----T-----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACGTGAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATAAAACANTTATACGGGAGTGCAGAAGTGACGTAAAGACTAACATTTTACGATA----TATAT-CTACTAGTNGTTGTGT-----TA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAATTTG--AATTAAATTNCATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTATA----GAACAAATGGCTTGTTGAA-GTATA-----------C--------------CATAGATGACGC--------G-GCA--------------CTATTG-----AAT------------AT------------------------AGG------GCTT-------------------------C---------------------TGT-------TCCAGATATTCTGGTAAA-GTTCAGTGAGTGATGTGA--GTGAAGTTA---T--TTGCACTGTCTTCTATTGAATATCGCATACATTCAAGCAAA-TACCTTTCTCGGTAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTA---------------------TA---------------TATTGAGTCTGTTGTGGACTTGTAAATTTC-ACAAC--GTCAGTTCGTTAACAA--GGACAGTATGAGGCTTAAAGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCgac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATA--TGCAGACTGCACAG-TATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GT--TATTTG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATA----GGA-ATATGATTTGTTGAA-GT--------------TGA-------AT-G-CA-AGATGAGGC--------GAGAA--------------TGAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TT-------------------------T---------------------GGTG----AGT---GAAACATTA-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCTATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-CTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T-A----T-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGTAAATTGATATACAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGCnnnnnnnnnnaacatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATA--TGCAGACTGCACAG-TATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GT--TATTTG----AGAGAGGAAGA-----TGT-TTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATA----GGA-ATATGATTTGTTGAA-GT--------------TGA-------AT-G-CA-AGATGAGGC--------GAGAA--------------TGAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TT-------------------------T---------------------GGTG----AGT---GAAACATTG-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCGATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T-A----T-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAACATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTT-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATA--TGCAGACTGCACAG-TATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GT--TATTTG----AGAGAGGAAGATGTGTTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATAACTAGGA-ATATGATTTGTTGAA-GT--------------TGA-------AT-G-CA-AGATGAGGC--------GAGAA--------------TGAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TT-------------------------T---------------------GGTG----AGT---GAAACATAA-TTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TATCTTTCGCGATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTTTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTTGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAC--GTCAGCTTGTTAGAAAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T-A----T-----TATATACTTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGGAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATTTAAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTCTTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAT-ATACAGATTCCATGGTGACGTGAAATACCACAACTAGAT---GTAATATTTTGATATAGTA-------TTTATTCTATAAAA--TGTAAAGTGCA--AAT-----GAAATATAAAACATTTA------------GAAGTAA-GTTCAGACTAAAGTTTCTCG-------TACAT-TTA----------TGT-----CA-----T--CAAAGCTTAGACTGTTTAAGAA--GATATTTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTGTATTTATC-TTTGATCCATACTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTTGAACTTTTCTATTTAACTATCTCTCTGATT----------------------CATGAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTTGTTATAAAAATATTTTTATTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTtatacagattccatggtgacgtgaaataccacaactagatgtaatattttgatatagtatttattctataaaatgtaaagtgcaaatgaaatataaaacatttagaagtaagttcagactaaagtttctcgtacatttatgtcatcaaagcttagactgtttaagaagatatttgatatataatatatccatatattgtcatgcattgtatttatctttgatccatactttctcttctttatctgtcttgaacttttctatttaactatctctctgattcatgaatttatactggtgtagtagttgtttgttataaaaatatttttattaaacaaaatgacaacataaacattgttac
gi|7                          : gtaacgaagttaactattttacacatacatgactacacataaccattaaacgttcacggtattctttatgtacaggtaataacatgtatttacaaaaatcataattaacactttgtatgtgtagactgctcagtgtaacaggtcagttgttttgtttttagagaggaagatgtgttatgttacataaaggtctgggaccttgcatatatataggaaaatggcttgttgaagtgaaaatactaagttgaatacaagacaaagcgagaatgctaatataaagttgatgttcaagaattttggtgaagtgagtgatacattctaaatatttgattttgatggaattttgtttttgtcttatattgagtatcgtataaactcaaatgtcgttctcggtgtaatacactattgatatataaatacaatttacgcgagaaaattcctcaataccacttttacaaagtaaaagtaattttctttaacttatagaaatatctcctcctttttggtcacggtgataaatggtactttcttgggggggaatgttgaatcatgaaccataagattatgaagtattaagacgatgccaaatacgggtacaaaagtttgcagtacatattgaatctatggcggacttaaatttcTGTAACAAAGTTAGCATATTTACCCATAAAAATGACTACACACAACCCTTTAACGTCCACAGTACTCTTCATGTAC---AGATA---ATTAAT----TGTAAATGCATAAATAATAGTGAACCCTTTTTTTGTATGTAGACTG----GTTATATC---TGGTCGATTGTAT--TAAATGTTGTTTTTGTATCATACAGGAAGA------------TGTTACA----------------------TCAAGGTTTGGG---------------A----AAA-AAATAGCTTGTTGAA-GTA-AAGAGACTATGTTGA-------GT-A-CA-AGATGAGGC--------GAGAA--------------TGAT-------AGC------------AT------------------------GCA------G-CTGATGTTCAAGAATTCCTGTGAAGGTC---------------------GATG----AGT---GATACATTG-TTAATAT-----------TGTTC--CT----T-------TTT---TTGTCTGGTATTCAGCATCGCATAAACC----C-AG-TGTCTTTCGCGATG--ATACAATATTGATATGAAAATAC--GATTCACGCGAGAAAAAA-AAAATATTGAATTATTTGATATAATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCT------------------TCTCCT--TTTTTGGTCATGGTGATAA-------A-----------T------------GGAACTATCATTG-------------GTGTAATGTCGAATCATTAACTAT---AAGATAATG--ATGTGTAAAGA---C----------------GATGCCT------------A---------------------ATA---------------------CAATAATCTTCAGTATGTATTCATTTTATGATGGACTTT--AATTTC--AAACTTGCCAGTTCGTT-AAGTATGAA-ACAATCAGGCGTG--AAATAGATTATATA----A-A----C-----TAGATtac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACTAGATTTGATAATAT---AGTATAGCA-------TTTATTTTATAAAAA---------ACA------ATAA------TAAA-CATTTATACGGGAGTTCAGAAGTGTTACAATGTCTAACATTTCAGGATA----AACCT-CT---------TGTGT-----CA-----T--TGCAGTTTAGGCTGCTTAA------AAAGATGAT------TA-ATCCATATATTGTAACATGTATGCATTGTATTTTTC-TTG--------TTTTAAAGCT--------ATCGTTCTCAAACTTTTAAATCTAAATATCTCTCTGATTTGTTAGTAT----ATTACATTTCATAAATTTATACTGGTGTATTTGTTCTTTGTGACAACAATAGTTTT-----ACAAGATGACAACATAAACATTGTTGttgataatatagtatagcatttattttataaaaaacaataataaacatttatacgggagttcagaagtgttacaatgtctaacatttcaggataaacctcttgtgtcattgcagtttaggctgcttaaaaagatgattaatccatatattgtaacatgtatgcattgtatttttcttgttttaaagctatcgttctcaaacttttaaatctaaatatctctctgatttgttagtatattacatttcataaatttatactggtgtatttgttctttgtgacaacaatagttttacaagatgacaacataaacattgttg
gi|8                          :                                                                                                                      tgtaacaaagttagcatatttacccataaaaatgactacacacaaccctttaacgtccacagtactcttcatgtacagataattaattgtaaatgcataaataatagtgaaccctttttttgtatgtagactggttatatctggtcgattgtattaaatgttgtttttgtatcatacaggaagatgttacatcaaggtttgggaaaaaaatagcttgttgaagtaaagagactatgttgagtacaagatgaggcgagaatgatagcatgcagctgatgttcaagaattcctgtgaaggtcgatgagtgatacattgttaatattgttcctttttttgtctggtattcagcatcgcataaacccagtgtctttcgcgatgatacaatattgatatgaaaatacgattcacgcgagaaaaaaaaaatattgaattatttgatataatttctgcatagtaaaaacaatttccttctccttttttggtcatggtgataaatggaactatcattggtgtaatgtcgaatcattaactataagataatgatgtgtaaagacgatgcctaatacaataatcttcagtatgtattcattttatgatggactttaatttcaaacttgccagttcgttaagtatgaaacaatcaggcgtgaaatagattatataaTGCACGG-TATAAC---TGGTCAGTTGTAT--TG---AT--TTTTTT----TGAGAAGAAGA-----TGTGTTATGTAACA----------------------TAATGATCTGGAACCTTATATAGGTATA----GGA-CAACGGCTTGTTGAA-GTG-AAGT--------TGA-------ATTA-CA-AGATGACAC--------GAAAA--------------TGAT-------AATTCAAGAATTCTAGT------------------------GAA------G-TT-------------------------C---------------------GATG----AGT---GATACATTG-TAAATAGT-------TTATTTTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATCAACT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAAT----GATTAATGCGAG--AAAA-TTCTTACTAAATTTTTCAATAACATTTCTGTATAATAAAAACAATTTCCTTTTACTTATGTAGAAATATCTCCTCGTTTTTGGTCACGGTGATAATGGTACTACCT--------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTTGATTCATGAACCAT---AAAAATATG--AAGTAC-AAGA---T----------------GGTGCCAAATACAATCTACA---------------------ATA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAA--AATTTTTAAAAC--GTAAGTGCGTAAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAAAAATAGTTGACATA----T-A--------------TACTTGGA--TACACGACGT-ATATAAATTCCATGCTGACGTGAAAATCTACAACTAGAT---ATGATAT---AATATAGTA-------TTTATTCTATAAAAA-ATTAAAGT-------CTATAAGAAATATAAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAACATTTCACGATA----TATAT--TACTAGTATTTGTG------TA------ATTACAGT------TGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATAT-----------------CCATATTTTT----------------------TCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTTTTTTGTTTATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTAATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTACCGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGATA----GGA-AAATGACTTGTTGAA-GTG-AAGT--------TGA-------AT-G-CA-AGATGAGGC--------GAGAATGATAATATGAAGTTGATGTTCAAGAATTCTA--------GT------------------------GAA------G-CT-------------------------C---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTAAATTGAGAATCGCATTAATT----CAAAATGTCTTTCGCAGTGTAATACAATATTGATATGTAAATATATGATTTACTTGGG--AAAA-TTATTAATAA-TTCATCAATACCATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCCC----------------ATCTCCTCCTTTTTGGCCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------GTACTACCTTGG--GTGGAATGTTGATTCATGTCCCAT---AGAATTGTG--AAGTATCAAAA---T----------------G------------------ATGCCAAATACTAAAATCTACAGTA---------------------CA---------------TATTGATTCTATGGCTGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCATTAAAGAATGGA-ACTTTGAGACATG-AAAACAGTTGATATA----T-A----TA----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACATGAAATTCCACAACTTGAT---ATGCTAT---AATATAGTA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTTAAGTG-------TATAAGAAATATAAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGATGTAAAGACTAACATTTTACAATA----TATAT--TACTAGTATTTGTGT------------TATTACAGTTAAGGCTGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCAATATATGGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCATACTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACGTTTCTATCCAATTATCTCTCTGATTTATT-TTTTC--AATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAAAAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAGACAAAATGACAACATTAACATCATCGCac
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Unaligned ( gi|20 ): TAATATAATGAACAGCATTGTGGACATTATATTATATGTGTTTGTA






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Reference ( family-181 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTCACAGTACTCTTTATGTAC---AGGTA---GGTAATTACATGTAATTACATAAATNATAGTGAACACTTTTTATGT--GTAGACTGCACAGT-ATAACA--TGGTCAGTTGTAT--TG---GTTNTTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTACA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGGNA----TAGGA-AAATGGCTTGTTGAA------GTGAAG---------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------AAT------------AT------------------------GAA------G-TTC---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATAAATT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCNTCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTNACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTCGATTCGTGGACCAT---AAAATTATG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCGTTAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAAAAACAGTTGATATA----T----AT-----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACGTGAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATAAAACANTTATACGGGAGTGCAGAAGTGACGTAAAGACTAACATTTTACGATA----TATAT-CTACTAGTNGTTGTGT-----TA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAATTTG--AATTAAATTNCATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caccgatgttatggatttctatatgtacaaggcgtttttcgtcacaGT-ATATAGTTTCGGTGATGATGTGAAATTCCACAACTAGAT---ATAATAT---AATATAGTAATAATTATTTATTCTATAAAAA-TGTAAAGCG-------TATAAGAAATATAAAACATTTAAACGGGAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAATATTTCACGATA----TATA--CTACTAGTAGTTGTGT-----TA-----T--TACAGTTTAGGCTATTT--GAGAGGAAAATTGATACATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTGTATTTTTTATTTAATCCATATTTT----GTCTTCCTCTATCTGTCTCAAACTTTTCTGTCTAACTATCTCTATGGTTTATTTATTTG--AATTAAATTTCATAAATTAATACTGGTGTAATAATTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAAAATTGTCGC
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTA----TAGAACAAATGGCTTGTTGAA------GT-------------------AT-A-CCATAGATGACGC--------G-GCAC--------------TATTG-----AAT------------AT------------------------AGG------GCTTC---------------------TGT-------TCCAGATATTCTGGTAAA-GTTCAGTGAGTGATGTGA--GTGAAGTTA---T--TTGCACTGTCTTCTATTGAATATCGCATACATTCAAGCAAA-TACCTTTCTCGGTAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTA---------------------T---------------A---------------TATTGAGTCTGTTGTGGACTTGTAAATTTC-ACAAC--GTCAGTTCGTTAACAA--GGACAGTATGAGGCTTAAAGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCgac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGA----TAGGA-ATATGATTTGTTGAA------GT-------------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TTT---------------------GGTG----AGT---GAAACATTA-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCTATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-CTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T----AT-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGTAAATTGATATACAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGCnnnnnnnnnnaacatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGT-TTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGA----TAGGA-ATATGATTTGTTGAA------GT-------------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TTT---------------------GGTG----AGT---GAAACATTG-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCGATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T----AT-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAACATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTT-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGATGTGTTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATAACTAGGA-ATATGATTTGTTGAA------GT-------------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TTT---------------------GGTG----AGT---GAAACATAA-TTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TATCTTTCGCGATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTTTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTTGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAC--GTCAGCTTGTTAGAAAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T----AT-----TATATACTTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGGAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATTTAAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTCTTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACAAAGTAAACATTTTTACACATAAAA-TGACTATACATAACCCTTAGGCTTTCACAATACTCTTCATGTAC---AGGTA-------ATTACATGTTATTACATAAATGATAGTGAACATTTTTTATAT--GTAGACTGCACAGT-ATAATAACTGGTCAGTTGTAT--TG-----------------AGAGAGCAAGA-----TGTTTTTTGTTGCA----------------------AAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGA----TAGGA-AAATGACTTGTTGAA------GTGAAG--------------------C-A-AGATGGGGA--------GAGAATGATGATATGAAGTTGAT-------GATCAAGAATTCTA-GT------------------------GAA------G-TTC---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATC-------TAATATTG--CTGGAATAA---TGTTT---TTGGCTTATATTGAGTATCGCGTGAATT----CAAT-TGTCTTTCGCGATGTAATACAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAAATTGTTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTTACTTAA--AGAAATATCTCCTCTTTTTTGGGCATGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------GTAGAATGTTGATTCGTGGACCAT---ACCATTATG--AAGCACCAAGA---TACAAGACAAGATTCAAG------------------A---------------------GTA---------------------C---------------A---------------AATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCCT------------ACTATGAGATGTGAAAAACAGTTGATGTA----T----AT--------ATAATTGGA--TGCACGACGT-AT-CAAATTCCATAGTGACGTGAAACTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---AACATAGCA-------TTTATTCTATAAAAAATGTGTAGTGCATACATTATAAGAAATATAAAACCATTATACGGGAGTGCAGAAGTGACATAAAGACTAACATTTTACGATA----TATA--CTACTAGTATTTGTGT-----TA-----T--TACAGTTAAGGCTGTTTGAGA--GGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATACTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATTTTTCTGATTTATTTTTTTG--AATTAAATT
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gi|7                          : gtaacgaagttaactattttacacatacatgactacacataaccattaaacgttcacggtattctttatgtacaggtaataacatgtatttacaaaaatcataattaacactttgtatgtgtagactgctcagtgtaacaggtcagttgttttgtttttagagaggaagatgtgttatgttacataaaggtctgggaccttgcatatatataggaaaatggcttgttgaagtgaaaatactaagttgaatacaagacaaagcgagaatgctaatataaagttgatgttcaagaattttggtgaagtgagtgatacattctaaatatttgattttgatggaattttgtttttgtcttatattgagtatcgtataaactcaaatgtcgttctcggtgtaatacactattgatatataaatacaatttacgcgagaaaattcctcaataccacttttacaaagtaaaagtaattttctttaacttatagaaatatctcctcctttttggtcacggtgataaatggtactttcttgggggggaatgttgaatcatgaaccataagattatgaagtattaagacgatgccaaatacgggtacaaaagtttgcagtacatattgaatctatggcggacttaaatttcTGTAACAAAGTTAGCATATTTACCCATAAAAATGACTACACACAACCCTTTAACGTCCACAGTACTCTTCATGTAC---AGATA---ATTAATT----GTAAATGCATAAATAATAGTGAACCCTTTTTTTGTATGTAGACTG----GTTATATC---TGGTCGATTGTAT--TAAATGTTGTTTTTGTATCATACAGGAAGA-----TGT-------TACA----------------------TCAAGGTTTGGGA-------------------AAA-AAATAGCTTGTTGAA------GTAAAGAGACTATGTT-GA--GT-A-C-A-AGATGAGGC--------GAGAATGATAGCATGCAGCTGATGTTCAAGAATTCCT--------GT------------------------GAA------G-GTC---------------------GATG----AGT---GATACATTG-TTAATATT-----------GTTC--CT----------T-TTT---TTGTCTGGTATTCAGCATCGCATAAACC----CAG--TGTCTTTCGCGATG--ATACAATATTGATATGAAAATAC--GATTCACGCGAGAAAAAA-AAAATATTGAATTATTTGATATAATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCT------------------TCTCCT--TTTTTGGTCATGGTGATAA-------A-----------T------------GGAACTATCATTG-------------GTGTAATGTCGAATCATTAACTAT---AAGATAATG--ATGTGTAAAGA---C----------------GATGCCT------------A---------------------ATA---------------------C---------------AATAATCTTCAGTATGTATTCATTTTATGATGGACTTT--AATTTC--AAACTTGCCAGTTCGTT-AAGTATGAA-ACAATCAGGCGTG--AAATAGATTATATA----A----AC-----TAGATtac
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Reference ( family-181 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTCACAGTACTCTTTATGTAC---AGGTA---GGTAATTACATGTAATTACATAAATNATAGTGAACACTTTTTATGT--GTAGACTGCACAGT-ATAACA--TGGTCAGTTGTAT--TG---GTTNTTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTACA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGGNA----TAGGA-AAATGGCTTGTTGAA------GTGAAG---------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------AAT------------AT------------------------GAA------G-TTC---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATAAATT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCNTCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTNACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTCGATTCGTGGACCAT---AAAATTATG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCGTTAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAAAAACAGTTGATATA----T----AT-----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACGTGAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATAAAACANTTATACGGGAGTGCAGAAGTGACGTAAAGACTAACATTTTACGATA----TATAT-CTACTAGTNGTTGTGT-----TA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAATTTG--AATTAAATTNCATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caccgatgttatggatttctatatgtacaaggcgtttttcgtcacaGT-ATATAGTTTCGGTGATGATGTGAAATTCCACAACTAGAT---ATAATAT---AATATAGTAATAATTATTTATTCTATAAAAA-TGTAAAGCG-------TATAAGAAATATAAAACATTTAAACGGGAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAATATTTCACGATA----TATA--CTACTAGTAGTTGTGT-----TA-----T--TACAGTTTAGGCTATTT--GAGAGGAAAATTGATACATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTGTATTTTTTATTTAATCCATATTTT----GTCTTCCTCTATCTGTCTCAAACTTTTCTGTCTAACTATCTCTATGGTTTATTTATTTG--AATTAAATTTCATAAATTAATACTGGTGTAATAATTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAAAATTGTCGC
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTA----TAGAACAAATGGCTTGTTGAA------GT-------------------AT-A-CCATAGATGACGC--------G-GCAC--------------TATTG-----AAT------------AT------------------------AGG------GCTTC---------------------TGT-------TCCAGATATTCTGGTAAA-GTTCAGTGAGTGATGTGA--GTGAAGTTA---T--TTGCACTGTCTTCTATTGAATATCGCATACATTCAAGCAAA-TACCTTTCTCGGTAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTA---------------------T---------------A---------------TATTGAGTCTGTTGTGGACTTGTAAATTTC-ACAAC--GTCAGTTCGTTAACAA--GGACAGTATGAGGCTTAAAGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCgac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGA----TAGGA-ATATGATTTGTTGAA------GT-------------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TTT---------------------GGTG----AGT---GAAACATTA-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCTATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-CTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T----AT-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGTAAATTGATATACAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGCnnnnnnnnnnaacatat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGA-----TGT-TTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGA----TAGGA-ATATGATTTGTTGAA------GT-------------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TTT---------------------GGTG----AGT---GAAACATTG-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCGATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T----AT-----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAACATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTT-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTAC--GGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATAT--GCAGACTGCACAGT-ATAAAA--GGGTCAGTTGTAT--TG---GTTATTT--G----AGAGAGGAAGATGTGTTGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATAACTAGGA-ATATGATTTGTTGAA------GT-------------T-GA--AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAAT--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TTT---------------------GGTG----AGT---GAAACATAA-TTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TATCTTTCGCGATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTTTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTTGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAC--GTCAGCTTGTTAGAAAATGGA-ACTATGAGACGTGAAAAACAGTTTATATAT---T----AT-----TATATACTTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGGAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATTTAAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATA-----TATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTCTTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACAAAGTAAACATTTTTACACATAAAA-TGACTATACATAACCCTTAGGCTTTCACAATACTCTTCATGTAC---AGGTA-------ATTACATGTTATTACATAAATGATAGTGAACATTTTTTATAT--GTAGACTGCACAGT-ATAATAACTGGTCAGTTGTAT--TG-----------------AGAGAGCAAGA-----TGTTTTTTGTTGCA----------------------AAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGA----TAGGA-AAATGACTTGTTGAA------GTGAAG--------------------C-A-AGATGGGGA--------GAGAATGATGATATGAAGTTGAT-------GATCAAGAATTCTA-GT------------------------GAA------G-TTC---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATC-------TAATATTG--CTGGAATAA---TGTTT---TTGGCTTATATTGAGTATCGCGTGAATT----CAAT-TGTCTTTCGCGATGTAATACAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAAATTGTTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTTACTTAA--AGAAATATCTCCTCTTTTTTGGGCATGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------GTAGAATGTTGATTCGTGGACCAT---ACCATTATG--AAGCACCAAGA---TACAAGACAAGATTCAAG------------------A---------------------GTA---------------------C---------------A---------------AATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCCT------------ACTATGAGATGTGAAAAACAGTTGATGTA----T----AT--------ATAATTGGA--TGCACGACGT-AT-CAAATTCCATAGTGACGTGAAACTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---AACATAGCA-------TTTATTCTATAAAAAATGTGTAGTGCATACATTATAAGAAATATAAAACCATTATACGGGAGTGCAGAAGTGACATAAAGACTAACATTTTACGATA----TATA--CTACTAGTATTTGTGT-----TA-----T--TACAGTTAAGGCTGTTTGAGA--GGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATACTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATTTTTCTGATTTATTTTTTTG--AATTAAATT
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gi|7                          : gtaacgaagttaactattttacacatacatgactacacataaccattaaacgttcacggtattctttatgtacaggtaataacatgtatttacaaaaatcataattaacactttgtatgtgtagactgctcagtgtaacaggtcagttgttttgtttttagagaggaagatgtgttatgttacataaaggtctgggaccttgcatatatataggaaaatggcttgttgaagtgaaaatactaagttgaatacaagacaaagcgagaatgctaatataaagttgatgttcaagaattttggtgaagtgagtgatacattctaaatatttgattttgatggaattttgtttttgtcttatattgagtatcgtataaactcaaatgtcgttctcggtgtaatacactattgatatataaatacaatttacgcgagaaaattcctcaataccacttttacaaagtaaaagtaattttctttaacttatagaaatatctcctcctttttggtcacggtgataaatggtactttcttgggggggaatgttgaatcatgaaccataagattatgaagtattaagacgatgccaaatacgggtacaaaagtttgcagtacatattgaatctatggcggacttaaatttcTGTAACAAAGTTAGCATATTTACCCATAAAAATGACTACACACAACCCTTTAACGTCCACAGTACTCTTCATGTAC---AGATA---ATTAATT----GTAAATGCATAAATAATAGTGAACCCTTTTTTTGTATGTAGACTG----GTTATATC---TGGTCGATTGTAT--TAAATGTTGTTTTTGTATCATACAGGAAGA-----TGT-------TACA----------------------TCAAGGTTTGGGA-------------------AAA-AAATAGCTTGTTGAA------GTAAAGAGACTATGTT-GA--GT-A-C-A-AGATGAGGC--------GAGAATGATAGCATGCAGCTGATGTTCAAGAATTCCT--------GT------------------------GAA------G-GTC---------------------GATG----AGT---GATACATTG-TTAATATT-----------GTTC--CT----------T-TTT---TTGTCTGGTATTCAGCATCGCATAAACC----CAG--TGTCTTTCGCGATG--ATACAATATTGATATGAAAATAC--GATTCACGCGAGAAAAAA-AAAATATTGAATTATTTGATATAATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCT------------------TCTCCT--TTTTTGGTCATGGTGATAA-------A-----------T------------GGAACTATCATTG-------------GTGTAATGTCGAATCATTAACTAT---AAGATAATG--ATGTGTAAAGA---C----------------GATGCCT------------A---------------------ATA---------------------C---------------AATAATCTTCAGTATGTATTCATTTTATGATGGACTTT--AATTTC--AAACTTGCCAGTTCGTT-AAGTATGAA-ACAATCAGGCGTG--AAATAGATTATATA----A----AC-----TAGATtac
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Reference ( family-181 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTCACAGTACTCTTTATGTAC---AGGTA--CGGTAATTACATGTAATTACATAAATNATAGTGAACACTTTTTATG--TGTAGACTGCACAG-TATAA---CNGG-TCAGTTGTAT--TG---GT--TNTTTG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTACA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGGNATA----GGA-AAATGGCTTGTTGAAGTG--------AA--------GTTGA-------AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAA--------------T--------------GAT-------AAT------------AT------------------------GAA------G-TT-------------------------C---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATAAATT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-TTATTATTAAATTCNTCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTNACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTCGATTCGTGGACCAT---AAAATTATG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCGTTAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAA-----------AAAC-AG--TTGAT-ATA-T---------A-A----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACGTGAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATAAAACANTTATACGGGAGTGCAGAAGTGACGTAAAGACTAACATTTTACGATA----TATAT-CTACTAGTNGTTGTGTTAT------TTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAANTTG--AATTAAATTNCATAAATTTATACTGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAATTAACCTTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAACTTTCACAGTACTCTTTACGTAC---AGGTA-------ATTACATGTAATTACATAAATCATAATGAACACTTTTTATG--TGTAGACTGCAAGG-TGTAA---CTGG-TCAGTTGCAT--TG---GT--TTTATG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTATTGCA----------------------TAAAGGTCTGGTACCTTGCATAGGTATA----GGA-AAATGGCTTGTTGAAGTG--------AA--------GTTGA-------AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAA--------------T--------------GAT-------AAT------------AT------------------------AAAGCTGATG-TT-------------------------CAAGAATTCTAGTGTGAAGTTCGGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAACGAAGTTAACATTTTTACACATAAGA-TGACTACGCATAACCCTTAAACGTTCACAGTACCCTTTATGTACTTTATGTAACCGGTAATTACTTGT---------AATTATA-CAAA-------TAT---------------AA-TATAA---CTGG-TCAGTTGTAT--TG---TT--GCTTTG----AGAGAGGAATA-----TGTATTATGTTACA----------------------TTCAAGTCTGAGACCTTGCATAGGTATA----GAA-AAGGGGCTTGTTGACGTG--------AAGATACTACGTTGA-------AA-A-C-A-AGATGAGGC--------GAGAA--------------T--------------GGT-------AAT------------AT------------------------GAA------G-TT-----------------------------------------------GGTGTTGAAGT---GGT-TATTG---ATTATT-------TGGC-TTGGAATGGAATTA---AAACT---TTGTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTATA----GAACAAATGGCTTGTTGAAGT-------------------------------AT-A-CCATAGATGACGC--------G-GCA--------------C--------------TATTG-----AAT------------AT------------------------AGG------GCTT-------------------------C---------------------TGT-------TCCAGATATTCTGGTAAA-GTTCAGTGAGTGATGTGA--GTGAAGTTA---T--TTGCACTGTCTTCTATTGAATATCGCATACATTCAAGCAAA-TACCTTTCTCGGTAT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tTA---------------------T---------------A---------------TATTGAGTCTGTTGTGGACTTGTAAATTTC-ACAAC--GTCAGTTCGTTAACAA--GGACAGTATGAGGCTTAAA-----------GAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCgac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAACAAAGTTAACATTTTTACACATAAAA-TGACTACACATAACCCTTAAGCTTTAACAATACTCTTTATGTAC---AGGTA--CGGTAATTACATGTAATTACATAAATGATAGTGAACACTTTTTATA--TGCAGACTGCACAG-TATAA---AAGGGTCAGTTGTAT--TG---GT--TATTTG----AGAGAGGAAGA-----TGTGTTGTGTTGCA----------------------TAAAGGTCTGGGACCTTACATAGAGATA----GGA-ATATGATTTGTTGAA---------------------GTTGA-------AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAA--------------T--------------GAT-------GAT------------AT------------------------GAA------G-TT-------------------------T---------------------GGTG----AGT---GAAACATTA-CTAATATT-------TAATATTG--CTGGAATTA---TGGTT---TTGTCTTATATTGGGTATTGCATAAATT----CAAA-TAACTTTCGCTATGTAATACAACGTTGATATGTAAATAC--GATTTACGCGAG--AAAA-CTATTATTAAATTCATCAATACCATTTCTATATAGTAAAAGCAATTTCCTTTAACTTAT--AGAAATATCTCCTCCTTTTTGGTCTTGGTGAAAA-------A-----------T------------G-----------G-------------ATGGAATGTCGATTCGTAGACCAT---AAAATTACG--AAGTACCAAGA---T----------------G------------------A---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAG--AATTCCCAAAAT--GTCAGCTTGTTAGAGAATGGA-ACTATGAGACGTGAA-----------AAAC-AG--TTTAT-ATATT---------A-T----TATGTAATTGGA--TACACGAAGC-ATATAGATTCCATGGTGACGTAAAATTCCACGACTAGAT---ATGCTAT---GATATAGCA-------TTTATTCTATGAAGA-TGTGAAGTGCATAAATTATAAGAAATATTAAACAATTATACGAGAGTGCAGAAGTGACATAAAGTCTAGCATTTTATGATACATGTATATGCTACTAGTTGTTGTGTTACAATATATTACAGTTTAGGCTGTTTGAGAGAGGTAAATTGATATACAATATATCCATATATTGT------CATACATTATATTTTTC-TTGAATCCACATTTT----CTCTT-CTTTAACTGTCTCTAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTAAATTG--AATTAAATTACATAAATTTATACCGGTGTAATAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTGAACAAAATGACAACATAAACATTGTCGCnnnnnnnnnnaacatat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAT-ATACAGATTCCATGGTGACGTGAAATACCACAACTAGAT---GTAATATTTTGATATAGTA-------TTTATTCTATAAAA--TGTAAAGTGCA--AAT-----GAAATATAAAACATTTA------------GAAGTAA-GTTCAGACTAAAGTTTCTCG-------TACAT-TTA----------TGTCAT------C-AAAGCTTAGACTGTTTAAGAA--GATATTTGATATATAATATATCCATATATTGT------CATGCATTGTATTTATC-TTTGATCCATACTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTTGAACTTTTCTATTTAACTATCTCTCTGATT----------------------CATGAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTTGTTATAAAAATATTTTTATTAAACAAAATGACAACATAAACATTGTtatacagattccatggtgacgtgaaataccacaactagatgtaatattttgatatagtatttattctataaaatgtaaagtgcaaatgaaatataaaacatttagaagtaagttcagactaaagtttctcgtacatttatgtcatcaaagcttagactgtttaagaagatatttgatatataatatatccatatattgtcatgcattgtatttatctttgatccatactttctcttctttatctgtcttgaacttttctatttaactatctctctgattcatgaatttatactggtgtagtagttgtttgttataaaaatatttttattaaacaaaatgacaacataaacattgttac
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTAGATTTGATAATAT---AGTATAGCA-------TTTATTTTATAAAAA---------ACA------ATAA------TAAA-CATTTATACGGGAGTTCAGAAGTGTTACAATGTCTAACATTTCAGGATA----AACCT-CT---------TGTGTCAT------T-GCAGTTTAGGCTGCTTAA------AAAGATGAT------TA-ATCCATATATTGTAACATGTATGCATTGTATTTTTC-TTG--------TTTTAAAGCT--------ATCGTTCTCAAACTTTTAAATCTAAATATCTCTCTGATTTGTTAGTAT----ATTACATTTCATAAATTTATACTGGTGTATTTGTTCTTTGTGACAACAATAGTTTT-----ACAAGATGACAACATAAACATTGTTGgcatttattttataaaaaacaataataaacatttatacgggagttcagaagtgttacaatgtctaacatttcaggataaacctcttgtgtcattgcagtttaggctgcttaaaaagatgattaatccatatattgtaacatgtatgcattgtatttttcttgttttaaagctatcgttctcaaacttttaaatctaaatatctctctgatttgttagtatattacatttcataaatttatactggtgtatttgttctttgtgacaacaatagttttacaagatgacaacataaacattgttg
gi|8                          :                                                                                                                      tgtaacaaagttagcatatttacccataaaaatgactacacacaaccctttaacgtccacagtactcttcatgtacagataattaattgtaaatgcataaataatagtgaaccctttttttgtatgtagactggttatatctggtcgattgtattaaatgttgtttttgtatcatacaggaagatgttacatcaaggtttgggaaaaaaatagcttgttgaagtaaagagactatgttgagtacaagatgaggcgagaatgatagcatgcagctgatgttcaagaattcctgtgaaggtcgatgagtgatacattgttaatattgttcctttttttgtctggtattcagcatcgcataaacccagtgtctttcgcgatgatacaatattgatatgaaaatacgattcacgcgagaaaaaaaaaatattgaattatttgatataatttctgcatagtaaaaacaatttccttctccttttttggtcatggtgataaatggaactatcattggtgtaatgtcgaatcattaactataagataatgatgtgtaaagacgatgcctaatacaataatcttcagtatgtattcattttatgatggactttaatttcaaacttgccagttcgttaagtatgaaacaatcaggcgtgaaatagattatataaTGCACGG-TATAA---CTGG-TCAGTTGTAT--TG---AT--TTTTTT----TGAGAAGAAGA-----TGTGTTATGTAACA----------------------TAATGATCTGGAACCTTATATAGGTATA----GGA-CAACGGCTTGTTGAAGTG--------AA--------GTTGA-------ATTA-C-A-AGATGACAC--------GAAAA--------------T--------------GAT-------AATTCAAGAATTCTAGT------------------------GAA------G-TT-------------------------C---------------------GATG----AGT---GATACATTG-TAAATAGT-------TTATTTTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTATATTGAGTATCGCATCAACT----CAAA-TGTCTTTCGCGGTGTAATACAATATTGATATGTAAAT----GATTAATGCGAG--AAAA-TTCTTACTAAATTTTTCAATAACATTTCTGTATAATAAAAACAATTTCCTTTTACTTATGTAGAAATATCTCCTCGTTTTTGGTCACGGTGATAATGGTACTACCT--------T------------G-----------G-------------GTGGAATGTTGATTCATGAACCAT---AAAAATATG--AAGTAC-AAGA---T----------------GGTGCCAAATACAATCTACA---------------------ATA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGTGGACAAA--AATTTTTAAAAC--GTAAGTGCGTAAAAGAATGGA-ACTATGAGGCGTGAA-----------AAAT-AG--TTGAC-ATA-T-------------------ATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAAATTCCATGCTGACGTGAAAATCTACAACTAGAT---ATGATAT---AATATAGTA-------TTTATTCTATAAAAA-ATTAAAGT-------CTATAAGAAATATAAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGGCGTAAAGACTAACATTTCACGATA----TATAT--TACTAGTATTTGTG-TAA------TTACAGT------TGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCCATAT-----------------CCATATTTTT----------------------TCTT-CTTTATCTGTCTCAAACTTTTCTATCTAACTATCTCTCTGATTTATTTTTTTGTTTATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAGTAGTTGTTAATGATAACAATATCTTTACTAAACAAAATGACAACATAAACATTACCGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGATA----GGA-AAATGACTTGTTGAAGTG--------AA--------GTTGA-------AT-G-C-A-AGATGAGGC--------GAGAA--------------TGATAATATGAAGTTGATGTTCAAGAATTCTA--------GT------------------------GAA------G-CT-------------------------C---------------------GGTG----AGT---GATACATTG-TAAATATT-------TGATATTG--CTGGAATTA---TGTTT---TTGTCTTAAATTGAGAATCGCATTAATT----CAAAATGTCTTTCGCAGTGTAATACAATATTGATATGTAAATATATGATTTACTTGGG--AAAA-TTATTAATAA-TTCATCAATACCATTTCTGCATAGTAAAAACAATTTCCCC----------------ATCTCCTCCTTTTTGGCCACGGTGATAA-------A-----------T------------G-----------GTACTACCTTGG--GTGGAATGTTGATTCATGTCCCAT---AGAATTGTG--AAGTATCAAAA---T----------------G------------------ATGCCAAATACTAAAATCTACAGTA---------------------C---------------A---------------TATTGATTCTATGGCTGACAAG--AATTTCCAAAAC--GTCAGTTCATTAAAGAATGGA-ACTTTGAGACATG-A-----------AAAC-AG--TTGAT-ATA-T---------ATA----TATATACTTGGA--TACACGACGT-ATATAGATTCCATGGTGACATGAAATTCCACAACTTGAT---ATGCTAT---AATATAGTA-------TTTATTCTATAAAAA-TGTTAAGTG-------TATAAGAAATATAAAACATTTATACGGAAGTGCAGAAGTGATGTAAAGACTAACATTTTACAATA----TATAT--TACTAGTATTTGTGTTA-------TTACAGTTAAGGCTGTTT--GAGAGGAAAATTGATATATAATATATCAATATATGGT------CATGCATTATATTTTTC-TTGAATCCATACTTT----CTCTT-CTTTATCTGTCTCAAACGTTTCTATCCAATTATCTCTCTGATTTATT-TTTTC--AATTAAATTTCATAAATTTATACTGGTGTAAAAGTTGTTTATGATAACAATATCTTTACTAGACAAAATGACAACATTAACATCATCGCac
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): ACACCGATGTTATAGATTTATATATGTACAAGGCGTTTTTCGTCACA
Unaligned ( gi|20 ): TAATATAATGAACAGCATTGTGGACATTATATTATATGTGTTTGTA