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lowQualScore : 7 7 9 0 555555 00 00000000000000000000000000000000000 0 5 5 5 0 0 00 7 7 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000 888 66 5 44 2 44 6 5555555 88888888888888 4 111 4 1 99999 4 4 3 2222222 4 4 44 444 7 7777777 555555555555555555555555555555 5555 1 1 2 8 1111 77777777 7777 7 9 9999999999999999 1 1 0 3 1 6 11111 222222222222222222222222 66 1 1 5 1 1 8 1 99 5555555555555 6 444 444 2222222222222222222222222222222 00 66 3 3 22222 0 4 8888888 2 11111111 8 2 66 3 22222222 6 6 33 666 000 6 3 0 1111 888 3 77 3 3 1 4 44444444444444 8 66 6 3 6 9999999999 6 555555 9 8888888 3 3 3 1 2 0 22 22 22 7 22 7 666 4 44 00000000000000000 3 0 0 3 0 0 4 0 00 8 00 88 55 88888 2 88 0 22 77 00 0 0 0 888888 88 5555555 0 2 0 0 0 88888888888888888888888 88 0 555555555 0 0 2 0 88 0 2 8 88 5 0 2 2
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Reference ( family-1712 ) : TATATGATATGATAG-TTTTTATTTCCAATATCC-AATAGGCACGCAGGCACGCAGGACCATCTGGTACATG------GTGTATGCACATATTAATAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTATGTTCATGGTATAAATCATATCGAATGA-TTTAAATTGAAGCAAAGGTGAACGTGGAGAAGGTGGTATACANANCCTTAGTGATA---TTCAAAAGTCANGCCCGAANGTCAAATNTNATGCGTACATGATCTTACCA-A--ATAAATACTAT---TGTAATTGAA--AATACAT-G--TGAAT--CATACAT--A----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTGA-----A-AAG-CTTTNA------GTATAAA-AGTACTAA-GTT--TTTTTT-A-TTGTACTG-------TTGTTTT----------C-----------AA--T-G-ATAAACTT----AGGCATGTTGGGTCTT-TCCCAATA-ATATTTATT-TATATATACNTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCT-AATTTATTA----------------CATACT-CTGCACTTTCGTTCGT-CAAATGGTGTTCTNATTGGACGTATCCAACGGCCTGCCTCTACTT-CTAA-----TCGATGC-----G-----AC-----T-----CG--TAACTTAGC-A-AA-GCT-T-TAATGAACTTA-TCAAGTTTGATACAATT--TAAATA-------A-----GGCTGAAATCTAAAATTAATAATACT-AT---TGTA---A--------A--------CA------------TG--T--TG-ACTCA-G-T-A-AACGACTATGCCAGTT-------TTNAATA--------AATTGATCACTAATNC--GTT-GTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-ACACATCATTAAAGCCTAAATTTGAT--AAAAGA-T-TTT---C-AATAAA-GAAACCCAAGNAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTAATGTAT-T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGCA--------------CAAAATCATTCTGCGTTGA--TT-TT-T-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCATCATTAAATCCCCAGACTTCAC-------TCCCGTAA-TTCAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTGCTTCGGCGATATGANTGTAAATTTGT--ATAAATATCTATTCATT--TTAAAA--ATAACC-TTTTGTGCTTGACCCG-ATAG-GTGTTAACGGCTTCAG-GAAAGAAA-CT----ACTGTAAAAACNGTACCNAAGTAGA-TNAAG-TATTA-A--CAATATCGA--TGACAACATTA--TTACACGT--AAGATGTAT--TNCGCGGTAAATTG-GCNNCNTTTTCCG-AAA--AA--AAAGATTTTTG-TTT-C-GCTGTATTAATTTTAAGCTTCCATTCATAACGATATNAATTCAATAAGTTTAGACC--------TT----TAGT----CTGC--TG-ATTC-T-------GAAAATAAAAC-GATATCGTCAGCGTATAATAGCAATG-ATATTTTA--AACATATTAATGTCAAGACCATTTAAANCACTACGTGTAAATTCCTGTTCAAT
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gi|11 : ATGTATATATCGTTGACAAATAAGGGATAGTCTGCCAAATTCACCATACATAGTTCATTATACGCAAACTCATGCTGCGTTGT--TT-TTAT-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAAACGGTCA---TACTATTTCAACAGGTACATGTTAGCAGTAATTCAATCCCCAGACTTCAA-------TCATGTAA-TGCAGAAT-TG-TTGTA-TTTCACTTGTCGAAATAGTCTACCTTGTTCTTCGGTGATTTAATTGTAAATTTATAAATAAATA--AATGCATTAATCAAAAATATAGCC-TTTAGTGCTTGGCCCGAATGA-GTGTTAGTGGCATCA--------------------GTAAAAACTGTACCCAAGTAGATTCAAG-TAACA-AGGTAATACTGAACTGACCACAaagcagtagtgaaacgtgtaccatctaaatgtgtcattcactgtaatattgtttaaataaagcacgcagtagtgaaacgtgtacc
gi|12 : ttacaataaattttgtaatacatgtgtacc--ATAAATA---T---TGTAATTGAA--AATGCAT-G--TGAAT--CATACAT--A----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTGA-----A-AAG-ATCTCACTGACAGTATACA-AGTACTAA-GTT--TTTTTA-A-TTGTACTG-------TTGCTTT----------CTGAATTTAACAAA--TTG-ATAAAATT----AGGCATATTGGGTCTT-TCTCAATG-ATATTTATT-AACATTTAC-----T----CAGATCG--------GAATAT----AGTGACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCATC--ACTTTATTA----------------CATGCT-CTGCACTTTCGTTCAC-CAAATGGTGTTCTTATTTGCCTTATCCAACGGCCTACCTCTACTT-CTAA-----TCGATGC-----GACGTAAC-----T-----CG--TAATTTAAC-A-AATGTT-T-GAATGAACTTA-TCGAGTTTGATACAGTT--TATATA-------attg
gi|13 : ATTAATAATACT-AT---TGTA---A--------AAGACTACGCG------------TG--T--TG-ACTCA-G-TTA-AAAGACTATGCCAGTT-------TTTAATA--------AATT-ATCACTAATAC--GTT-GTTTTACTTTTAAAACAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-AAAAATCATTAAAGCCTAAATTTGATG-AAAAGA-A-TTC---C-ACTAAA-GAAACCCATGTAGTCTTATATTGATATATTTCTA----AATCAGTTA---AACGC-ATATTATACA-AATTCTAATGTAT-T-TT-GAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATCATATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCAT
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gi|15 : TATATGATATAATAG-TTTTTATTTCCATTATCCAAAAAGGCACGCAGGC
gi|16 : tgtaccacatgtggccaatatagtttaatgttcaggttagatgggacagcatatactttctcatacactctctcctcaggtattaccataattgaaaagctcctacatccatgaatatatatgatcacaagaaatacaaaaaacaattaatgttgtattaaacaagcactgtcgctagggtagatcactctgtggtaacgttaaatgtcgcaccgatgctaaatgtcgaaaccgtcatTACTATAAATATAATTTAA--AA-ATGT-G--TGTAT--CAGATAT--A----TA--------------GAGCTA-TATTT---C-TGACTTAA-----A-AAG-ATTTGA------ATATAA----TA-TAA---T--ATTTTT-A-TTGTATTA-------TTATTcc
gi|17 : ctataagttgtatcagacattaataagacaaaacaaaaataaagtggagagggtcctacgcttcatttgcgcaaaatgtttatttgagacagtgttaacggcatgacagcaacaaaaatataaattatgatataacatat--ATAAATA---T---TGTAAATGAA--AATACAT-G--TGAAT--CATACAC--A----TG--------------TGGCTG-TATTTGTTT-TTATCTGA-----A-AAG-CTTTAA------GTATAAA-AGTACTAA-ACT--ATTTTT-A-TTGTAATG-------TTGTTTC----------CTGAATTTAACAAA--TTG-ATAAGCTT----AAGCATGTTGGGTTTT-TCCCAATA-ATATTTATT-TATATATACTTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAACGATATCCATCCTCT-AGTGTATTA----------------CATAAT-CTGCACTTTCGTTCGC-CAAATattatctgactttgacaaatcaataaacttacacacgtgg
gi|18 : TCTG-AAA--GT--AATGATTATTG-TTT-TTGTTGTATTTATGTTAAGCTTCCATTCATTACAATATGAATCCAATGAATTTAAACC--------TTGCCGTAATTCATCTGC--TG-ATTC-T-------GAAAATAAAAC-GATATCATCAGCGTATAAGAGCAAGA-ATATTTTA--AACATATTAATGTCGAGACCATTTAAGTCACTACGTGTAAATTTCTGTTCAAT
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gi|19 : taATAAATAGTTCCCGTGATCCGGCATCTT--------G-ATGTAGCCCACACACCATTAAAGCCTAAATTTGATA-AAAAAA-A-ATT---C-AAT-AA-GAAACCCAAGTAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTAATGTA--T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGT-TTTTTAtcccgtgatccggcatcttgatgtagcccacacaccattaaagcctaaatttgataaaaaaaaattcaataagaaacccaagtagtcttatttggatatacctctaaatcagttaaaagcatattataaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtttttta
gi|2 : tataccataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcatggctatatttcttatttgaaaagcttttatAA-GTT--CTTTAT-AATTGTACTGCCATTTTTTGGTTT----------T-----------AA--C-----AAA-TT----GGGCATTTTGGGTCCT-TTCAAATA-ATATCTATTATATCTATATTTTTTTTACACAGATCATCGGATTAGAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCTTAATTTATTG----------------CATACC-CTGCATTTCAGTTCGT-CAAATGGTGTTCTTATTGGACGTGTCCAACGGCCTACCTCAACTT-ATAA-----GCAATGT-----A-----AC-----TAGTCACG--TAGCTGAGC-A-AAAGCT-T-TTAT-----TA-TT---TTTG-TA-------TAAAAA-------A-----GGACGATATCTAAAATTAACAATATG-GT---TATA---A--------AAGACAG--CA------------TG--TGTTG-ACTCA-G-T-CTAACGACT-TTCAAGTT-------TTGAATA--------A-TTGAT----AATTC--GTT-GTTTTACTGTTAAAATGAA--GTT------ACTCGGCACCTT--------GGATGTAGCT-ACAAATCATTAAAACCTTAATTTGAT--AAAAGA-TGTTT---C-AACAAA-GAAACCCATGAAGTTTTATTTGGATAAACCTCTA----AATCAAATA---AAAAC-ATTTTATAATTCGTTC--ATGCAT-T-TT-GAATTGTTTGCATTCAGTTTTTGTAACCGAAATTTGATAATATTTGCTTACCGTTGACAAATAAGAAACAATCTGCAAAATTCATCATACA--------------CACACTCATTCTTCTTTGAGGTTGTT-T-GGCATCTATTATT----------CGTTTTAAAGA-CTGTACATGTATTCGTTCAACAGCTA------AACCGTTACCAAATCCCCAGACTTCAC-------TGCCAAAA-ATCAACAT-TG-GCGTA-ACTAACCTGTCGAAAAGATATATCCTGTGCTTTCCCGATATGAATGTAAATTTGT--GTAAATGTCTATTCATT--TTAAAA--CTAGGC-TTTTGTGCTT-ATT---AAAG-GCGTCAACGGATT
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gi|20 : tcctcgtaatcaagttctttataattgtactgccattttttggttttaacaaattgggcattttgggtcctttcaaataatatctattatatctatattttttttacacagatcatcggattagaatatagcacacattcaataataaaatgatattcatcctcttaatttattgcataccctgcatttcagttcgtcaaatggtgttcttattggacgtgtccaacggcctacctcaacttataagcaatgtaactagtcacgtagctgagcaaaagcttttattatttttgtataaaaaaggacgatatctaaaattaacaatatggttataaaagacagcatgtgttgactcagtctaacgactttcaagttttgaataattgataattcgttgttttactgttaaaatgaagttactcggcaccttggatgtagctacaaatcattaaaaccttaatttgataaaagatgtttcaacaaagaaacccatgaagttttatttggataaacctctaaatcaaataaaaacattttataattcgttcatgcattttgaattgtttgcattcagtttttgtaaccgaaatttgataatatttgcttaccgttgacaaataagaaacaatctgcaaaattcatcatacacacactcattcttctttgaggttgtttggcatctattattcgttttaaagactgtacatgtattcgttcaacagctaaaccgttaccaaatccccagacttcactgccaaaaatcaacattggcgtaactaacctgtcgaaaagatatatcctgtgctttcccgatatgaatgtaaatttgtgtaaatgtctattcattttaaaactaggcttttgtgcttattaaaggcgtcaacggattTGACA-GATAA-TTTTTATTTCCAATATCC-AAAAGACACACAGGCgtcattagtgagtaaagcaataaatattcgcattgcctcacgacaagcgcgcagtaaaacgt
gi|21 : tacATTTTTAACCAATATTTCATAATATTTGTATATCGTTGACAAATTAGATATAGTCTGCAAAATTCACCATGTA--------------CAAAATCATTCTGCATTGA--TT-TTTT-AACACCTATTACT----------ATTTTTTAAAA-CTGTAAATGTACTTTTTCAACGGGTA------AACCATCATTTAATCCCCAGATTTCAC-------TCCCGTAA-TTCAAAAA-TA-GTGTA-ATTATTTTGTCGAAATGATCTACCCTGTGCTTCGccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : TTTTTAACCAACATTTAATAGTATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCCGCCAAATTCACCATGTA--------------CAAAATCATTTTGCGTTGA--TT-TT-TTAACACCTATTGCT----------CTT-----------GTAAATGTACTCTTTCAACAGGTA------AACCATCATTAAATCCTAAGATTTAAGGAGTGAATCCCGTAA-TTCAAAAT-TG-TTGTA-ATTAACTTGTCGAAAATATCTACCCTGCGCTTC
gi|23 : tc---TATAAATAAATCAATACAT-A--CGTAT--TATAAAA--C----TT--------------TAGCTA-TATTT---C-G-GTTTGA-----ACAAA-ATTTAA-------TATA------------------TCTGT-C-TTGTGTCG-------TTATTTT----------CTGAATTTAACAAA--T-CTATAAACTT----AAGCAATTTTTGTTTTATTCCATAA-ATATCTATT-AATATACAAATGTCT----CAGATCA--------GAATAT----AAT-ATTCATCCAATAAT-AAATAATATTCATCCTTT-AATTCGTTA----------------CATA
gi|24 : aa--ATAAAT--TAT----GTGATTGAA--CATAAAT-G--AGTAT--CAGACGT--A----TA--------------TGGCTA-TACTT---C-TAATTTGATAAAAA-AAGACATTTA------CTGTAAA-TGTACTAAAGTT--TCTT---A-TTGTAGTG-------T-ATTTT----------CGGAATTTAACCAA--TTA-ATAAACTTTGGCATGCATGTTGGGTCTT-TTCCAATA------------ATATACACTTATCT----CAGATC---------GAATAT----TGC-ACGCATACAAAAACAAAATGATa
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Reference ( family-1712 ) : TATATGATATGATAG-TTTTTATTTCCAATATCC-AATAGGCACGCAGGCACGCAGGNCCATCTGGTACATGTACATGGTGTATGCACACATNNATGACAGACAGTGGTTTATTAATGATAAAAAACAGTTACAATGTTATGTTCATGGTATAAATCATATCGAATGAATTTAAATTNAAGCAAGGGCGAGNGTGGAGAAGNTGGTATACA--TAAC--TAATAATATTCAAA-GTCAT-TCCGAAAGTCAAATATAAC----CATAA-CTTACCA-A--ATAAATACTATTGTAATTGAA--AATACAT-G--TGAAT--CATACAT--A----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTG-----AAAAG-CTTTTA------GTATAAA-AGTACT-AAGTT--TTTTTT-A-TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAACAAATTGATAAACTT----AGGC-ATGTTGGGTC---TTTCCCAATA-AT--ATTTATT-TATATATACTTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCT-AATTTATTA----------------CATACT-CTGCACTTTCGTTCGT-CAAATGGTGTTCTAATTGGNCGTATCCAACGGCCTGCCTCTAC-TTCTAA-----TCGATGC-----G-----AC-----T-----CG--TAACTTAGCAAAAGCT-TTAATGAACTTA-TCAAGTTTGATACAATT--TAAAT-----A-------AGGCTGAAATCTAAAATTAATAATACT-AT---TGTA--AA---------GC--GTG--TTG-ACTCA-G-T-A-AACG-ACTATGCCAGTT-------TTTAATA--------AATTGATCACTAATNCGTT-GTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-ACACATCATTAAAGCCTAAATTTGAT--AAAAGA---T-TTT-C-AATAAA-GAAACCCAAGNAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTAATGTAT-T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGCA--------------CAAAATCATTCTGCGTTGA--TT-TT-T-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCGTCATTAAATCCCCAGACTTCAC-------TCCCGTAA-TTCAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTGCTTCGGCGATATGANTGTAAATTTGT--ATAAATATCTATTCATT--TTAAAA--ATAGCCTTTTGTGCTTGACCTG-ATAG-GTGTTAACGGCTTCAG-NAAAAAAACC----ACTGTAAAAACTGTACCNAAGTAGA-TAAAG-TATTA-A--CAATA-TCAA-TGACAACATTA--TTACACGT-AAAG-ATATATTGCGCGGTAAATTG-GCCGCNTTTTCTG-AAA--AA--AAAGATTTTTG-TTT-C-GCTGTATTNATTTTAAGCTTCCATTCATNACAATATGAATCCAATAAGTTTAGACC--------TT----TAGT----CTGC--TG-ATTC-T-------GAAAATAAAAC-GATATCATCAGCGTATAANAGCAATG-ATATTTTA--AACATATTAATGTCAAGACCATNTAAGCCACTACGTGTAAATTCCTGTTCAAT
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gi|11 : ATGTATATATCGTTGACAAATAAGGGATAGTCTGCCAAATTCACCATACATAGTTCATTATACGCAAACTCATGCTGCGTTGT--TT-TTAT-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAAACGGTCA---TACTATTTCAACAGGTACATGTTAGCAGTAATTCAATCCCCAGACTTCAA-------TCATGTAA-TGCAGAAT-TG-TTGTA-TTTCACTTGTCGAAATAGTCTACCTTGTTCTTCGGTGATTTAATTGTAAATTTATAAATAAATA--AATGCATTAATCAAAAATATAGCCTTTAGTGCTTGGCCCGAATGA-GTGTTAGTGGCATCA---------------------GTAAAAACTGTACCCAAGTAGATTCAAG-TAACA-AGGTAATACTGAACTGACCACAaagcagtagtgaaacgtgtaccatctaaatgtgtcattcactgtaatattgtttaaataaagcacgcagtagtgaaacgtgtacc
gi|12 : ttacaataaattttgtaatacatgtgtacc--ATAAATATTGTAATTGAAAATGCATG--TGAAT--CATACATA----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTG-----AAAAG-ATCTCACTGACAGTATACA-AGTACT-AAGTT--TTTTTA-A-TTGTACTGTTGCT-T--TCTGAATTTAACAAATTGATAAAATT----AGGC-ATATTGGGTC---TTTCTCAATG-AT--ATTTATT-AACA-----TTTACT----CAGATCG--------GAATAT----AGTGACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCATC--ACTTTATTA----------------CATGCT-CTGCACTTTCGTTCAC-CAAATGGTGTTCTTATTTGCCTTATCCAACGGCCTACCTCTAC-TTCTAA-----TCGATGC-----GACGTAAC-----T-----CG--TAATTTAACAAATGTT-TGAATGAACTTA-TCGAGTTTGATACAGTT--TATAT-----A-------attg
gi|13 : ATTAATAATACT-AT---TGTAAA----AGACTACGCGTGTTG-ACTCA-GTT-A-AAAG-ACTATGCCAGTT-------TTTAATA--------AATT-ATCACTAATACGTT-GTTTTACTTTTAAAACAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-AAAAATCATTAAAGCCTAAATTTGATG-AAAAGA---A-TTC-C-ACTAAA-GAAACCCATGTAGTCTTATATTGATATATTTCTA----AATCAGTTA---AACGC-ATATTATACA-AATTCTAATGTA--T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATCATATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCAT
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gi|17 : ctataagttgtatcagacattaataagacaaaacaaaaataaagtggagagggtcctacgcttcatttgcgcaaaatgtttatttgagacagtgttaacggcatgacagcaacaaaaatataaattatg--ATAAATATTGTAAATGAAAATACATG--TGAAT--CATACACA----TG--------------TGGCTG-TATTTGTTT-TTATCTG-----AAAAG-CTTTAA------GTATAAA-AGTACT-AAACT--ATTTTT-A-TTGTAATGTTGTT-T--CCTGAATTTAACAAATTGATAAGCTT----AAGC-ATGTTGGGTT---TTTCCCAATA-AT--ATTTATT-TATATATACTTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAACGATATCCATCCTCT-AGTGTATTA----------------CATAAT-CTGCACTTTCGTTCGC-CAAATgg
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gi|19 : taATAAATAGTTCCCGTGATCCGGCATCTT--------G-ATGTAGCCCACACACCATTAAAGCCTAAATTTGATA-AAAAAA---A-ATT-C-AAT-AA-GAAACCCAAGTAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTAATGTA--T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGT-TTTTTAtcccgtgatccggcatcttgatgtagcccacacaccattaaagcctaaatttgataaaaaaaaattcaataagaaacccaagtagtcttatttggatatacctctaaatcagttaaaagcatattataaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtttttta
gi|2 : tataccataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcatggctatatttcttatttgaaaagcttttat-AAGTT--CTTTAT-AATTGTACTGCCATT-T--TTTGGTTTTAACAAATTG-------------GGC-ATTTTGGGTC---CTTTCAAATA-AT--ATCTATTATATCTATATTTTTTTTACACAGATCATCGGATTAGAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCTTAATTTATTG----------------CATACC-CTGCATTTCAGTTCGT-CAAATGGTGTTCTTATTGGACGTGTCCAACGGCCTACCTCAAC-TTATAA-----GCAATGT-----A-----AC-----TAGTCACG--TAGCTGAGCAAAAGCT-TTTAT-----TA-TT---TTTG-TA-------TAAAA-----A-------AGGACGATATCTAAAATTAACAATATG-GT---TATAAA----AGACAGCATGTGTTG-ACTCA-G-T-CTAACG-ACT-TTCAAGTT-------TTGAATA--------A-TTGAT----AATTCGTT-GTTTTACTGTTAAAATGAA--GTT------ACTCGGCACCTT--------GGATGTAGCT-ACAAATCATTAAAACCTTAATTTGAT--AAAAGA---TGTTT-C-AACAAA-GAAACCCATGAAGTTTTATTTGGATAAACCTCTA----AATCAAATA---AAAAC-ATTTTATAATTCGTTC--ATGCAT-T-TT-GAATTGTTTGCATTCAGTTTTTGTAACCGAAATTTGATAATATTTGCTTACCGTTGACAAATAAGAAACAATCTGCAAAATTCATCATACA--------------CACACTCATTCTTCTTTGAGGTTGTT-T-GGCATCTATTATT----------CGTTTTAAAGA-CTGTACATGTATTCGTTCAACAGCTA------AACCGTTACCAAATCCCCAGACTTCAC-------TGCCAAAA-ATCAACAT-TG-GCGTA-ACTAACCTGTCGAAAAGATATATCCTGTGCTTTCCCGATATGAATGTAAATTTGT--GTAAATGTCTATTCATT--TTAAAA--CTAGGCTTTTGTGCTTA---TT-AAAG-GCGTCAACGGATT
gi|2 : tcctcgtaatcG-TATTA-A--CAATA-TCAA-TGACAACATTA--TTAC-CGT-AAAATATATATTCCGAGGTTAATTG--CCGCCTTTTCCG-AAA--AA--AAA-ATTTTTG-------GCTGTATTAATTTTAAGCTTCCATTCATAGCGAAAACAAGTCAATATGTTTAGACCGTGTTGCATT----CA-T----CTGC--TG-ATTC-G-------GTAAATAAAAC-GATACCGCCAGCATATAATAGC-ATG-A-ATCTTATGAACATATTAATGTCAAGACCATTTAAAACACTATCTGTTAATTCCTGTTCTATgtattaacaatatcaatgacaacattattaccgtaaaatatatattccgaggttaattgccgccttttccgaaaaaaaaatttttggctgtattaattttaagcttccattcatagcgaaaacaagtcaatatgtttagaccgtgttgcattcatctgctgattcggtaaataaaacgataccgccagcatataatagcatgaatcttatgaacatattaatgtcaagaccatttaaaacactatctgttaattcctgttctatgtcattagtgagtaaagcaataaatattcgcattgcctcacgacaagcgcgcagtaaaacgt
gi|20 : tcctcgtaatcaagttctttataattgtactgccattttttggttttaacaaattgggcattttgggtcctttcaaataatatctattatatctatattttttttacacagatcatcggattagaatatagcacacattcaataataaaatgatattcatcctcttaatttattgcataccctgcatttcagttcgtcaaatggtgttcttattggacgtgtccaacggcctacctcaacttataagcaatgtaactagtcacgtagctgagcaaaagcttttattatttttgtataaaaaaggacgatatctaaaattaacaatatggttataaaagacagcatgtgttgactcagtctaacgactttcaagttttgaataattgataattcgttgttttactgttaaaatgaagttactcggcaccttggatgtagctacaaatcattaaaaccttaatttgataaaagatgtttcaacaaagaaacccatgaagttttatttggataaacctctaaatcaaataaaaacattttataattcgttcatgcattttgaattgtttgcattcagtttttgtaaccgaaatttgataatatttgcttaccgttgacaaataagaaacaatctgcaaaattcatcatacacacactcattcttctttgaggttgtttggcatctattattcgttttaaagactgtacatgtattcgttcaacagctaaaccgttaccaaatccccagacttcactgccaaaaatcaacattggcgtaactaacctgtcgaaaagatatatcctgtgctttcccgatatgaatgtaaatttgtgtaaatgtctattcattttaaaactaggcttttgtgcttattaaaggcgtcaacggattTGACA-GATAA-TTTTTATTTCCAATATCC-AAAAGACACACAGGCgtcattagtgagtaaagcaataaatattcgcattgcctcacgacaagcgcgcagtaaaacgt
gi|21 : tacATTTTTAACCAATATTTCATAATATTTGTATATCGTTGACAAATTAGATATAGTCTGCAAAATTCACCATGTA--------------CAAAATCATTCTGCATTGA--TT-TTTT-AACACCTATTACT----------ATTTTTTAAAA-CTGTAAATGTACTTTTTCAACGGGTA------AACCATCATTTAATCCCCAGATTTCAC-------TCCCGTAA-TTCAAAAA-TA-GTGTA-ATTATTTTGTCGAAATGATCTACCCTGTGCTTCGccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
gi|22 : TTTTTAACCAACATTTAATAGTATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCCGCCAAATTCACCATGTA--------------CAAAATCATTTTGCGTTGA--TT-TT-TTAACACCTATTGCT----------CTT-----------GTAAATGTACTCTTTCAACAGGTA------AACCATCATTAAATCCTAAGATTTAAGGAGTGAATCCCGTAA-TTCAAAAT-TG-TTGTA-ATTAACTTGTCGAAAATATCTACCCTGCGCTTC
gi|23 : tc--ATAAATA----AATC---AATACATA--CGTAT--TATAAAAC----TT--------------TAGCTA-TATTT---C-G-GTTTG-----AACAA-AATTTA------ATATA------------------TCTGT-C-TTGTGTCGTTATT-T--TCTGAATTTAACAAATCTATAAACTT----AAGCAATTTTTGTTT---TATTCCATAA-AT--ATCTATT-AATATACAAATGTCT----CAGATCA--------GAATAT----AAT-ATTCATCCAATAAT-AAATAATATTCATCCTTT-AATTCGTTA----------------CATA
gi|24 : aat--ATAAATTATGTGATTGAACATAAATG--AGTAT--CAGACGTA----TA--------------TGGCTA-TACTT---C-TAATTTGATAAAAAAAGACATTTA------CTGTAAA-TGTACTAAAG----TTTCTT-A-TTGTAGTG-TATT-T--TCGGAATTTAACCAATTAATAAACTTTGGCATGC-ATGTTGGGTC---TTTTCCAATA--------------ATATACACTTATCT----CAGATC---------GAATAT----TGC-ACGCATACAAAAACAAAATGATa
gi|25 : ccTCA--------AAACAT----AGC-ACACATTCGATAGCAAAATGGCATTCATCTTCT-AATTTATTA----------------CATACT-CT--ACT---GT--ATACATACTGCATTCTTATTGGACGTGTCCAATGGTCTGACCCAAC-TTCTAAACGATTTGATAA-----G-----AG-----T-----CG--TAGCTGAG--AAAGTTGTCAATGAAC-CA-T-AAG--TAATATCGTTGATAAAT-----A-------
gi|26 : gcataaacttagccaaattgagATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGCA--------------CAAAATCATTATGCATTAATTTT-TT-T-AACACCTAATATT----------C-TTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCATCATTAAATTCCCAGA-GGAAG-------TCGCGTAA-TTAAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCGACACTGTGCTTC
gi|27 : ATGA-----G-----AC-----A-----CG--TTATTTAGCAAAAGCT-TTAATGAACTTA-TCAAGTTTGATAAAATT--CAGAT-----A-------AGGCTGAAACCTAGAATTAACA--ACTAAT---TGTAAA----AGACAGCACGTGTTG-ACTT-----------------TGCCAGTT-------TTGGAAA--------AACTGATCACTAATTCGTT-GCTTTACTGTTAAAA-AA--AGTTCCGGTGATCCGACACC
gi|28 : TGTAAATGTAAGAACATGACTGTAT--CAGACATAATTATA--------------TGGCTT-CATTT---C-C-GTTTG-----AAATG-TTTTTG------ATATAAA-AGTGCT-TTGCC--TTTATT-A-TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAACAATTTTTTTAACT------GAC--TGGTGAGTCCCATTACACATTA-ACTAATTTAT
gi|29 : aaagCCATAATTAATTCCCCAGACTTCAC-------TCCC-TAATTTCAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTACTTTGGTGATATGAAAGTTAATTTAT--ATAAA----TATTCATT--TTAAAA--A-AACCTTTTGTGCTTGACCTG-ATA--GTGTAAATGGCTTCAACG---AAAGAg
gi|3 : TGTTATGTTCATGGTATAAATCATATCGAATGA-TTTAAATTGAAGCAAAGGTGAACGTGGAGAAGGTGGTATACA--TAATCTTAATAATATTCAAAAGTCATGTCCGAAAGC-AAATATAATGCAACATGATCTTACCA-ACCATAAATACTGTAATTGAAAATGCATG--TGAAT--CATATATA----TA--------------TGGCTA-TATTT---T-TTATTTG-----AAAAG-CTTTAA------GTATAAA-AGTACT-AAGTTGTTTTTTT-A-TTGCACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAATAAATTGATTAACTT----AGAT-ATGTTTGGTC---TTTCCCAATA-AT--ATTTATT-TACATAAACCGTTTT----CAAATCG--------GAATAT----AAC-ACATATTCAATAATGAAATGATATTCATTCTTT-TATTTATTAATCCTTTTATGTTTTACATACT-CTGCACTTTCGTTCGT-CAAATGGTGTTCTAGTTGATCGTATCCAACGGCCTACCTCTAC-TTCTAA-----TCGATGC-----G-----ACGAGAGT-----CG--TAACTAAGCAAAAGCT-TTAATGAACCTA-TCAAGTTTGATACAATT--TAAAT-----A-------TGGTTGAAATCTACAATTAATAATGCT-ATAATTGTAAA----AGACTGCGCGAATTG-ATTCA-G-TTA-AACA-ACTATGTCAGTT-------TTTAATA--------AATTGATCACTAATACGTT-GTTTAACTGTTAAAATAAATAGTTCCCGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-ACACATCATTAAAGCCTAAATTTGAT--AAAAGA---T-TTTTC-AATAAA-GAAACCAAAGGAGTCTTGTTTTGATATACCTCTATTTAAATCAGTTA---AAGGC-ATATTAAAAACAATTCTAATGTAT-T-TT-GAATCGTTTGTATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATAGTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGTA--------------CAAAATCATTCTGCGTTGA--TT-TT-T-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCATCATTAAATCCCCA
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gi|34 : TTGA--TT-TT-T-AACACCTATTATTATATAAACATCTTTTTAAAAA-CTGTAAACGTACTCTTTCAATGAGTA------AACCATCATTAAATCCCCAGACTTCAC-------TCCCGTAA-TTTACAAT-TG-GTGTA-AT
gi|35 : ATG--TGTAT--CAGACATA----TG--------------TGGTTA-TTTTT---C-TGATTTT-----AAAAG-CTTTTC------ATATAAG-AGTAC--AAGT
gi|36 : gtactttaaatagaatttaaacaaacaaaacaaag--ATAAATATTGTAATTAAAAATACATG--TGAAT--CATACATA----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTG-----AAAAT-CTTTT-------------------------TT--TGT------TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAAAAAAcatgtactaagtttt
gi|37 : ccTATATGATATGATAG-TTTTTATTTCAAAT----------------AGGCACGCAGGACCATCTG------GTACATGGTGTATGCACATATTAATAACA
gi|38 : atgtcgaaaccgatatTATAT-TTTTTCT----CAGATCA--------GAATTT----TAC-ATGCATTCAATAATAAAATGTTGTTCATCCTCT-TATTTAATA----------------TATACTAGTGCACTTCC
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gi|41 : AGTGGT-TAATC-CATTA-A--AAATA-TGAA-GGACAACGTTAAATTACATGCCAAGG-ATGTATTGTGCTGTAAATTG-
gi|42 : taagtc--ATATATATTGTAACT----ATACATG---------------TA----TA--------------TGACTC-CATTT---C-TTATTTG-----AAAAG-CCATTA------ATATAAA-AGTACT-AAATC--TATTTtg
gi|43 : CCATTATTAAATCCCCAGACTGTAC-------TCCCGTAA-TTCAAC-T-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTGCTT
gi|44 : TATATATCGTTGACAAATAAGAGAAAGTCTGCCA
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gi|46 : tTGATATGATGG-TTTTTATTTCCAATATCC-AATAGGCACACAGatgata
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gi|5 : ATA----TA--------------TGGCTG-T-TTT---C-TTATTTG-----TAAAG-CTTTTA------GTATAAA-GGTATT-AAGTT--TTTTTTTA-TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAACAAATTGATAAACTT----GGGC-ATGTTGGGTC---TTTCACAATA-AT--ATTTATT-TGTATATACTTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-GCACATTCAATAATAAAATGATAT------TCT-AATTTATAA----------------CATACT-CTGAACTTTCATTCGT-CAAATGGTGTTTTAATTGAACGTACTTAATGGCCTGCCTCTAC-TTC-AA-----TCGATGTGACGAG-----AC-----T-----CA--TAACTTAGCAAAACCT-CTAATGAACCTA-TAAAGTTTGAAACAATT--TAAATAACTAA-------AGGACGAAATCTAAAATTAATAATACT-AT---TGT-AT----TGACTGCGCGTGTTG-ACTCAGG-C-A-AATG-AATATTCCAGTT-------TTTAATA--------AATTGATCTCTAATACGTT-GTTTAACTGTTAAGATAAATAGTTTCGGTGATCTAGCACCTT--------G-ATGTAGCC-ACCTATCATTAAAGTTTTAATTTGAT--AAAATATTTT-TTT-C-AATAAA-GTAACCCTAAAAGTCTTATTTGGATATACTTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATTGACAATTCTTTTGTTT-TGTTTTAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATTATATTTGTATATCCTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATACA--------------CAAAATCATTCTGCGTTTAT-TT-TT-T-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAACT-CTGAAAATGTACTCTTTCAGTGGGTA------AACCATGATTAAA---------------------TCCCATAA-TTCAAAAT-CG-GTGTA-ATACACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTGTTTCGGCGA
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gi|6 : -C-AAAAAATGAAACACAAGCAGTATCATTTGGATATATCTCTA----AATCAGTTAGTTAATACAATATTGT-ATCAAATTTGCTGTAT-T-ATGAAAT-GTTTGCATTCAG-AATTTCAACC---ATTTTATTATATTCGCATCTTATTGATAATTTAGAGCTACTCTACTAGG-TCATCGTT---------------------TCATT-TG---------T-TT-T-GACATCTGTCA-T----------ATTTTTAAACA----------------TTCATCG------------CTGTTATAAGATCCCAATGCTTTTT-------TGCCGTAT-TTCAAAATGTGTGTGTAGATT
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gi|7 : gcaaaaaatgaaacacaagcagtatcatttggatatatctctaaatcagttagttaatacaatattgtatcaaatttgctgtattatgaaatgtttgcattcagaatttcaaccattttattatattcgcatcttattgataatttagagctactctactaggtcatcgtttcatttgttttgacatctgtcatatttttaaacattcatcgctgttataagatcccaatgcttttttgccgtatttcaaa--ATAAATATTGTAATTAAAAATGCATG--TGAATAATATATATA----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTG-----AAAAG--TTTTA------GCATAAA-AGTACT-AAGTT--TTTT---A-TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAACAAACTGATAAACTT----AGGC-ATGTTGGGT--------CCAATATAT--ATTTATT-TATATATACTTTTCT----CAGATCA--------GAATATTATAAGC-ACATATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCT-AATTTATTA----------------CATACT-CTGCACTTTCATTTGT-CAAATTTTGTTCTAATTGGCCGTATCCAACGTTCTGCCTCTAC-TTCTAA-----TTGATGCAACGAG-----AC-----A-----CG--TAACTTAGCAAAAGCT-TTAATGAATTTA-TCAAGTTTAATACAAAT--TAAAT-----A-------AAGCTGAAATTTAAAATTAATAATACT-AT---TGTAAA----AGATTGTGTGTGTTG-ACTTA-ATT-A-AACG-ACTATGCCAGTT-------TTGAATA--------AATTGATCACTAATACTTT-GTTTAACTGTTAAAATAAATAGTTCTGGTGATCCAGCAATTT--------G-ATGTAGCC-ACACATCATTAAAGCCTGAATTTGAT-----------T-TTT-C-AAGAAA-GAAACCCAAGTAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTGATGTA--T-TTTGAATCATTTGCATTCAGTATTtgaatttataataaatacagaaaacaataatggcgatacacatttaatatactaaacgaaagcgacagcataacgt
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Reference ( family-1712 ) : TATATGATATGATAG-TTTTTATTTCCAATATCC-AATAGGCACGCAGGCACGCAGGNCCATCTGGTACATGTACATGGTGTATGCACACATNNATGACAGACAGTGGTTTATTAATGATAAAAAACAGTTACAATGTTATGTTCATGGTATAAATCATATCGAATGAATTTAAATTNAAGCAAGGGCGAGNGTGGAGAAGNTGGTATACA--TAAN--TAATAATATTCAAAAGTCATTTC----AGCAAA-TATAAC----CATAA-CTTACCA-A--ATAAATATTGTAATTGAAAATACATG--TGAAT--CATACATA----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTG-----AAAAG-CTTTTA------GTATAAA-AGTACT-AAGTT--TTTTTT-A-TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAACAAATTGATAAACTT----AGGC-ATGTTGGGTC---TTTCCCAATA-AT--ATTTATT-TATATATACTTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCT-AATTTATTA----------------CATACT-CTGCACTTTCGTTCGT-CAAATGGTGTTCTAATTGGNCGTATCCAACGGCCTGCCTCTAC-TTCTAA-----TCGATGC-----G-----AC-----T-----CG--TAACTTAGCAAAAGCT-TTAATGAACTTA-TCAAGTTTGATACAATT--TAAAT-----A-------AGGCTGAAATCTAAAATTAATAATACT-AT---TGTAAA----AGACTGCGCGTGTTGACTCA-G-T-A-AACG-ACTATGCCAGTT-------TTTAATA--------AATTGATCACTAATNCGTT-GTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-ACACATCATTAAAGCCTAAATTTGAT--AAAAGA---T-TTT-C-AATAAA-GAAACCCAAGNAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTAATGTAT-T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGCA--------------CAAAATCATTCTGCGTTGA--TT-TT-T-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCGTCATTAAATCCCCAGACTTCAC-------TCCCGTAA-TTCAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTGCTTCGGCGATATGANTGTAAATTTGT--ATAAATATCTATTCATT--TTAAAA--ATAGCCTTTTGTGCTTGACCTG-ATAG-GTGTTAACGGCTTCAGCG---AAAGAACC----ACTGTAAAAACTGTACCNAAGTAGA-TAAAG-TATTA-A--CAATA-TCAA-TGACAACATTA--TTACACGT-AAAG-ATATATTGCGCGGTAAATTG-GCCGCNTTTTCTG-AAA--AA--AAAGATTTTTG-TTT-C-GCTGTATTNATTTTAAGCTTCCATTCATNACAATATGAATCCAATAAGTTTAGACC--------TT----TAGT----CTGC--TG-ATTC-T-------GAAAATAAAAC-GATATCATCAGCGTATAANAGCAATG-ATATTTTA--AACATATTAATGTCAAGACCATNTAAGCCACTACGTGTAAATTCCTGTTCAAT
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gi|26 : gcataaacttagccaaattgagATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGCA--------------CAAAATCATTATGCATTAATTTT-TT-T-AACACCTAATATT----------C-TTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCATCATTAAATTCCCAGA-GGAAG-------TCGCGTAA-TTAAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCGACACTGTGCTTC
gi|27 : ATGA-----G-----AC-----A-----CG--TTATTTAGCAAAAGCT-TTAATGAACTTA-TCAAGTTTGATAAAATT--CAGAT-----A-------AGGCTGAAACCTAGAATTAACA--ACTAAT---TGTAAA----AGACAGCACGTGTTGACTT-----------------TGCCAGTT-------TTGGAAA--------AACTGATCACTAATTCGTT-GCTTTACTGTTAAAA-AA--AGTTCCGGTGATCCGACACC
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lowQualScore : . . . . ...... .. . . . . .. ... ....................................... . .. . .. . .... .............. . ... . . ..... . ....... . . .. ... . . .. .... . ... . .. . .... ........ .... . . ................ . . . . . . . . . . . . .. ............. . ... .... . . . . . ....... . ........ . . . . . ........ . . .. ..... . . . . .... ... . .. . . . . .............. . .. . . . .......... . ...... . . ....... . . . . . . .. .. .. . .. . . . .. ................... . . .. . . . .. . . .. .. ...... . ... .. . . . ...... .. ....... . . . . ....................... .. . ......... . . . .. . . . .. . . . .
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Reference ( family-1712 ) : TATATGATATGATAG-TTTTTATTTCCAATATCC-AATAGGCACGCAGGCACGCAGGNCCATCTGGTACATGTACATGGTGTATGCACACATNNATGACAGACAGTGGTTTATTAATGATAAAAAACAGTTACAATGTTATGTTCATGGTATAAATCATATCGAATGAATTTAAATTNAAGCAAGGGCGAGNGTGGAGAAGNTGGTATACA--TAAN--TAATAATATTCAAAAGTCATTTC----AGCAAA-TATAAC----CATAA-CTTACCA-A--ATAAATATTGTAATTGAAAATACATG--TGAAT--CATACATA----TA--------------TGGCTA-TATTT---C-TTATTTG-----AAAAG-CTTTTA------GTATAAA-AGTACT-AAGTT--TTTTTT-A-TTGTACTGTTGTT-T--TCTGAATTTAACAAATTGATAAACTT----AGGC-ATGTTGGGTC---TTTCCCAATA-AT--ATTTATT-TATATATACTTTTCT----CAGATCG--------GAATAT----AGC-ACACATTCAATAATAAAATGATATTCATCCTCT-AATTTATTA----------------CATACT-CTGCACTTTCGTTCGT-CAAATGGTGTTCTAATTGGNCGTATCCAACGGCCTGCCTCTAC-TTCTAATCGATGCGACGAGACNCGTAACTTAGCAAAAGCT-TTAATGAACTTA-TCAAGTTTGATACAATT--TAAAT-----A-------AGGCTGAAATCTAAAATTAATAATACT-AT---TGTAAA----AGACTGCGCGTGTTGACTCAGTCAAACGACTATGCCAGTT-------TTTAATA--------AATTGATCACTAATNCGTT-GTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTT--------G-ATGTAGCC-ACACATCATTAAAGCCTAAATTTGAT--AAAAGA---T-TTT-C-AATAAA-GAAACCCAAGNAGTCTTATTTGGATATACCTCTA----AATCAGTTA---AAAGC-ATATTATAAACAATTCTAATGTAT-T-TTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTATATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGCA--------------CAAAATCATTCTGCGTTGA--TT-TT-T-AACACCTATTATT----------CTTTTTAAAAA-CTGTAAATGTACTCTTTCAACGGGTA------AACCGTCATTAAATCCCCAGACTTCAC-------TCCCGTAA-TTCAAAAT-TG-GTGTA-ATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTGTGCTTCGGCGATATGANTGTAAATTTGT--ATAAATATCTATTCATT--TTAAAA--ATAGCCTTTTGTGCTTGACCTG-ATAG-GTGTTAACGGCTTCAGCG---AAAGAACC----ACTGTAAAAACTGTACCNAAGTAGA-TAAAG-TATTA-A--CAATA-TCAA-TGACAACATTA--TTACACGT-AAAG-ATATATTGCGCGGTAAATTG-GCCGCNTTTTCTG-AAA--AA--AAAGATTTTTG-TTT-C-GCTGTATTNATTTTAAGCTTCCATTCATNACAATATGAATCCAATAAGTTTAGACC--------TT----TAGT----CTGC--TG-ATTC-T-------GAAAATAAAAC-GATATCATCAGCGTATAANAGCAATG-ATATTTTA--AACATATTAATGTCAAGACCATNTAAGCCACTACGTGTAAATTCCTGTTCAAT
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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