lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                
lowQualScore                  :                                                           222222222222222      1111                                     222222                   11              1                     111                             222          1111111                    11         777777777777777777                        1                                     22222       77777777          111         2222222222     2222222            3333333333333                                         111               2222        3333    7777777777                         1111111             22222222222222                                 111111   111111                    111         11                                       111111  11111                      22222       2222         3333333333333333333333           7777777777777777777777      1111111      1                                              5555555555555555555555555                 11111                                     2       111  1          2222222222         1                                 3333333           66666666666666             888888888                   555555555555555555555555555555555    1          4444444444             3333333333333                       1                                                                  1  
lowQualScore                  :                 33        777777                 5555   1 777777777777777   33 2222    66      1     4 333   2 2  333   333333   1   4    2   2  88   2  333     6      55555          333 4444    55555  6            888          6666666    7777     7 2 7  77    2 33 555555555555555555    44   99999    2 33  6  7       888  666666     666  444 2 11111 2 2   44444444     5    111  777 2  6666666666     0000000  3 555     1111111111111         2       7       7           77  444     666       0000 55     2222    0000000000 0         3        8    6666666    44       00000000000000    66666   3  0       2       3 444444   111111    11   44         222     5   55   4 2         8888888   777777        111111  22222 2 5555     8888888 2 88888 8 6   2222   8888  7777777777777777777777           2222222222222222222222   9  5555555  55  3   3 666    99999   7777            5     55  9999999999999999999999999    5        55  88888 0 1    55 4                 5 5 5   0     6 111  5  6       4444444444         7         7                       4444444           11111111111111             333333333               1   333333333333333333333333333333333  0 7          0000000000             6666666666666          3   6        5     3     88              88        6     3        55            7  
lowQualScore                  :                 ..        ......                 ....   . ...............   .. ....    ..      .     . ...   . .  ...   ......   .   .    .   .  ..   .  ...     .      .....          ... ....    .....  .            ...          .......    ....     . . .  ..    . .. ..................    ..   .....    . ..  .  .       ...  ......     ...  ... . ..... . .   ........     .    ...  ... .  ..........     .......  . ...     .............         .       .       .           ..  ...     ...       .... ..     ....    .......... .         .        .    .......    ..       ..............    .....   .  .       .       . ......   ......    ..   ..         ...     .   ..   . .         .......   ......        ......  ..... . ....     ....... . ..... . .   ....   ....  ......................           ......................   .  .......  ..  .   . ...    .....   ....            .     ..  .........................    .        ..  ..... . .    .. .                 . . .   .     . ...  .  .       ..........         .         .                       .......           ..............             .........               .   .................................  . .          ..........             .............          .   .        .     .     ..              ..        .     .        ..            .  
lowQualScore                  :                 77        222222                 7777   9 444444444444444   22 9999    11      2     4 999   4 2  999   444444   3   7    2   2  33   1  777     6      00000          999 2222    00000  0            000          1111111    7777     2 4 6  55    5 44 999999999999999999    55   11111    4 22  5  2       222  888888     555  111 4 00000 5 5   88888888     6    777  777 7  6666666666     7777777  7 000     7777777777777         7       3       7           22  777     444       5555 00     5555    8888888888 3         3        6    0000000    22       88888888888888    44444   1  6       5       1 000000   111111    77   00         333     1   77   7 7         7777777   777777        333333  33333 7 3333     1111111 5 22222 0 0   2222   2222  3333333333333333333333           3333333333333333333333   1  8888888  00  6   6 444    11111   7777            4     55  4444444444444444444444444    0        00  44444 9 9    55 0                 0 0 7   0     7 777  0  7       1111111111         3         8                       3333333           88888888888888             000000000               2   000000000000000000000000000000000  7 3          7777777777             7777777777777          7   0        0     0     00              55        0     0        00            0  
consensus                     :       NGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----C------G--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AA---AAA----CAGCTAATTACATT-AAA-ATGATCA-TT---TATCTAAAATAA-----TTATTGATCT--AT----TATT-----TT-CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGTATCA---CAAAATTT-CAGT-ACCTT-A--T---AA-N----AT-T--TAATC-CTTA-----CAAA-T--TGAGTACCTTATT---TT------ACTTG---AA---A-ACTTATT-A-TTA-TA---A-TAGTTCATAA--GTTG-AA-AA--AAA---T-AAGCT-AAA-A-TGAA---ATAAA-A-----------GTGAATCTT-AAAGTGACATGAAATGCTTGGAAAGCCCAGTA--AAGTC---CGAGGAC-TTNT--TTCCAC-T-GGGGTCC---TA-CATATAACGCGA-TTAAAAAANTACCCTTAG-ACACT--AGCAATA-----A--A--AATATAT-T---ATT-CTTTAAAAATGTATTAAA-T-A-A-TAAA-A----TAATCAAAAT-AACATATTTCACAAGTATTATG-AATNA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-A----TATTA-------T-AC----A-GCACAGA--TGCG---AA----------------------AATATTGCTTA-GGTTACATGAAT-TAAATA--TTAAAC------TAA--TGTGTA-T---TGCA-----CTA----TATAGTAAGTCACATATT--TACA---------------------A-GTTGCACAGATCC--TACCAAAACCGTAAA--G-GTTATTTATACAAGTTT-A-G-AAAATGTTT-C---TTAAC-TTCTTTCNTG-AACCTATCATGATTTTTAATTGTTTGAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCC------ATGTGACTATACTA-A-----TTG--AGTAAAAAGTTGTCGAA---TGACACATTGTTGACTTCGGG-------------A----AT-------------TTACTTTTCCGTGTC--CTAAAAGAGTGAACATCTGACC-GCTTCG-----TGAAGTTTTCCGTCATATATGATGGGCACNTGTCGNNATATATTTCATGCANATGATTCATTTCTAANTGTTTGACNNTGTCCTCCAATTTTA
Reference ( gi|1 )            :       TGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----C------G--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AA---AAA----CTGCTAATTGCATT-AAA-ATTGTCA-TT---TATCTTAAATAA-----TTATTGATCT--TT----TATT-----TT-CTATGAACATCATTAAATGTCATTATAAATGTATCA---TAAAATGT-CGGT-TCCTT-A--T---AA-A----AT-TTGTAATC-CTTA-----CAAA-T--TGTGTGTCTTATT---TT------ACTTG---AA---A-ATTTAGT-A-TTACTACATG-TAGTTTATAA--TTTG-AA-AA--AAA---G-AAGCT-AAT-A-TGGA---ATAAA-G-----------GTGAATCTT-AAAGTGATATGAAATACTTGGAAAGCCCGGTT--AAGTC---CGAGGAC-ATTT--TTCCAA-A-GGGGCCTATATA-TATATAACGCGA-TTAAAAAACTACCATTTG-GCACT--AGCAATA-----A--G--AAAATAT-T---ATT-CTTTAAAAATATATTAAA-T-A-A-TAAA-A----TAATCAAAAT-AACATATTTAATAAGTACTATT-AATTA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-A----TATTA-------T-AT----A-GTACAGT--TGCA---AA----------------------AATATTGCTTACGGATACATGCAT-TAGATA--TTAGAC------CAA--TGAATA-T---TGCA-----CTA----TATAGTAAGTCATATATT--TAC----------------------A-GTTGTACAGATCC--TAATAAGATCATAAA--G-GTTATTTATACAAGTTT-A-G-AAA-TGTTT-C---TTCAC-TTCTTTTGTG-TACCTGTCATGATTTCTAATTGTTTAAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCC------TTGTGACTATACTA-A-----TTA--AGTAAAAAGTTGTCGAAGACTGACACATTGTTGACTTTAGG-------------A----AT-------------TTGCCTTTCCGTGTC--ATGAAAGTGTGAACATCTGACT-TCGTCG-----TGAAGTTTTCCATCGTATATGATCGACACTTGTCATAATATATTTTATGCACGTGATTCATCTCTAATTGTTTGACCCTGTCCTCCAATTATA
gi|7                          :        GTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----T------G--CATGAA----CAGG--AATTTACAAGAT-T---TGT-A-AA---AAA----CAGCTGATTACATT-AAA-ATGATCA-TT---TATCCAAAATAA-----TTATTGACCT--AT----TATT-----TT-CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGGATCA---CAAAATTT-CAGT-ACCTC-A--TCACAG-A----AT----AAATC-CTAA-----CAAA-T--TGAGTATCTTATT---GT------ACTTG---GA---A-ACT---T-A-TCA-TAAA---TAGTTCATAA--GTTG--A-AA--AAA---T-AAGCT-AAGAA-TGAA---ATAAA-A-----------GTGAGTCTT-AAAGTGACATGTAATGCTTGGAAAGCTGAGTA--AAATC---CGAGGATAATAT--TTCCACTT-GGGTCCT--------TATGACACGA-TTAAAAAACTACCTTTAG-ACACT--AGCAATA-----A--A--AATATAT-T---ATT-CTTTAAAAATGTA-TGAA-TAA-A-GAAA-G----TGATCAAAAT-AACAAATTTCGCAAGTATTATG-GATTA-CACTGATGT-------ATC------TAATTGAT------TA-----T-A----TATTA---------------A-GCACATA--TGCA---A
gi|11                         :        GTTTTATTC--AGCAAGCG------TGCTATACAGTATATAT----ACATA-----------------T--A----TATG--TATTTACAAAAT-A---AAC-G-AA---AAA----CAGATA-TTACATT-AAA-ATTGTCA-TT---TATCTAATATAA-----TTATTGATAT--AT----TATT-----TT-CTATAAACATCACTGAATGACATTATGAATGCATCA---CAATAGTT-CAGT-ACCTA-A--TCACAG-A----AT-T---AATC-CTT-------------------GTTTCATC-----------ACTTG---AA---A-ATATATT-A-TTA------A-TAGTTCATAA--GTTG-AACAA--AAA---T-AAGTTTAAA-A-TGAA---ATAAA-C-----------GTGAATCTT-AAAGTGACATGTAATGATTGGAAATCCCAGTA--AAGTT---TAAGG---ATTTACTTCCAC-T-GGGG------TA-AATATAACGTGA---AAAAAATTCCC--TTA-G-ACTTAAGC-ATA-----A--G--AATATA--T---ATT-C-ATAAAAAT
gi|29                         :       aGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAA----A---A-----C------A--TAT--A----TTTG--TATTTACATAGT-T---TAT-G-GA---AAT----CAACTTATTACATT-AAA-ATGATCA-TT---TATCTAAAATAA-----TTATTGATCT--AT----TATT-----TT-CTATGAACATCACAGAATGTCAATATAAATGTATCA---CACAATGT-CAGT-g
gi|26                         :      taGTTTTATTC--AGCATATA------TGTCATACAATATATAT----ATATA-----C------A--TAT--AA---TTTT--TTTTTACCAAAT-T---TAT-G-AG---AAA----TAGCTTATTACGTT-AAA-ATGATCA-TT---TATCTGAAATAA-----TTATTGATCT--AT----TATT-----TT-CTATGAACATTACAGAATGCAATTACAAATac
gi|16                         :       gGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACACTATATAC----ACACA-----CAT----G--TAT--A----TATAGATATTTACAAAAT-A---TATAA-AA---AAA----CAGCTTATTACATT-AAATAT--TTA-TA---TATCTAAAATAA-----TTATTGATCT--AT----ACTT-----TG-GTATGAACATCACAGAATGTCATTA------TATCA---CAGACTTT-CTGT-ACCGT-A--TCCCAG-T----AT----TAATC-ATAA-----C-AA-T--TGAATACCTTATT---TTAAGACGACTTGTTTAA---A-GTTTAaaaggacttatttatatagtttgt
gi|33                         :       aGTTTTATTTTTAGCATATA------TGTCATACAGTATATAT----GCATA-----T------A---AT--A----TATG--TATTAACAAAAT-T---AAT-C-AA---AAG----CAGCTAATTGCA-----------TCA-TT---TATCTAAATTAA-----CTATTGATC---TA----TACT-----TTACTATGAACATCAta
gi|31                         :      taGTTTTATTT--AGCAAATA------TGTTTTACAGTATTTAT----ACATA-----T------AATTAT--AAAATTATA--TAATTACAAAAT-T---TAT-T-TT---AAA----CAACTAATTACATG-CAA-ATGATCA-TT---TATCTAAAATAT-----TTGTTGATCT--TT----TAAT-----TG-CTATTAACGTCATca
gi|39                         :        GTTTTCTTC--AGCATATA------TGTCATACAGTATATATCCGCACATA-----T------G--TAT--A----AATA--TATGGAGATAAT-TATGTGT-G-AA---CAA----C
gi|41                         :     ataGTTTTATTC--AGCATACT------TGTCATACAGTATATAC----ACACA-----C------A--TGT-------------TATT---AAAAT-T---a
gi|42                         :    tagaGTTGTATTC--AGTATACA------TGTCAAACCGTATGTAT----ACA-----------------TAT--A----TCTG--TATTTata
gi|8                          :  tcagttaTTTTATTC--AGCATGCA------TGTCATACAGTAT-TAA----ACA
gi|6                          :         TTGTATTC--AGAATGGA------TGTCATACAGTATATAA----ACATA-----TACAAATG--TAT--A----TATA--T-TTTAAAAAAA-A---TAT-G-AA---AAAAATCCAGCTAATAACATT-AAA-ATGATCA-TTAATTATCTGAAGTAA-----TTATTGATCT--AT----ACTT-----GG-CCATGACTATCACAGAATGTCATTATA------TCA---CACA-TGTTCAGT-ACCTT-A--C---CA---------TTG-AA-------------AAT-T--TGAGTAACTTATT---TT------ACTTG---AA---A-ACTTATT-A-TT------TA-TAGTTCATGA--GTT--AA-AA--AAA---T-CAGATAAAT-A-TTAA---ATAAA-ACTTTTATAAACGTGAATTTT-AAAATGACATGAAAT---------------------GTC---CGAGGAC-TTAT--TTTCAC-T-GGGGTCCATATACTA-GTAACATGA-TTTGGAAGTTATTCTTAG-ACACT--AGCAATA-----A--C--AAAAGTT-T---ATT-TTTTAAAAATGAATTAAATT-T-A-TCAA-A----TAATCAAAGT-AACTGATTTCACAGATACTATC-AGTAA-CTTCGATAT-------AAT------TAATCGGTTATTAGTA-----T-A----TGTTA-------T-ACA---A-GCACAAA--CACG---AA----------------------AA-AATGCTTA-AGAT---TACAT-TAACCAAGTTAAACAAAGTTTAA--TGTATA-T---TGAA-----CTA----aataacattaaaatgatcatttatctaaaataaaatatttattgatctatttttttttctatgaacatcacaggatgccattacaaatgtatcacaacatgtcagcaccttaacacagtattattcctcacaaattgagtttcttatctgacttgaaaaaaatcattattactagttcgtatgttgaaaagtaaaataaaaaagaaataaaaggcaacctgaaagtgaaattaaatgcttggaaagcccagtaaagtcctaggacttatttccgcagtgggttcatataacgggattaaaaaaatctttacacactagcaatatacctaaaatatattatttttaaaaatgtattaaataaataaaataatatatctgacggcattatgtattatttttaatgtattaagctgattatatattatataagcacagatgcga
gi|44                         :         TTTTATTC--AGCATACATGTACATGTCATACAGTACATAT----ACAgagtgaacctatcaagatattta
gi|22                         :         taaTGTTC--AGCATACA------TGCCTTACAGTATAT
gi|5                          :             ATTC--AGCATATA------TCTCATACAGCACAAAT----ACATAATTATT------A--TAT--AAT--TATG--TATTTTTAAAAT-T---TAT-G-AA---AAAAACCCAGCTAATTACATT-AAA-ATAATCA-TT---TATCTAAAATAA-----CTATTGACCT--AT----CTTT-----TG-CCATGAACATCAC-------------------ATCA---CAAAATTT-CAGT-ACCTT-A--T---CA-C----AG-TATTAATC-ATTG-----CAAAAT--TA-GAATTTAACT---TT------ACTTA---AA---A-ACTT--T-A-TTG-TAAAT---AGTTCATAA--GTTA-AA-AA----------------------TGAA---ATAAA-T-----------GTGAATCTT-TAATTGACATGAATTGTTTGGAAAGCCCAGTT--AAGTC---CGAGGAC-TTAT--TTCCGC-T-GGGGTC-------CATATAACGCGA-TTAAAAAAAT-CCG-TAG-ATACT--AGCAATA-----A--A--TTTATAT-C---ATT-TTGTAAAAATGTATTATA-T-A-A-AAAACA----TAATCA-------------TGAAAAGT--TATA-AATAA-CTTTGATGT-------ATTGACATGTAAATGAT------TATAATTT-A----TATTA-------T-GCA---A-GCACAGA--TGCATATAACTGGAAATGTGTAAACCCACACAATATTGTTTACGGTTACATTAATCTAG-----TTAAAC------TAA--TGTACA-T---TGTG-----C------TATAGTAAGTCACA---C--TACA---------------------A-GTTGCACAGACTC--TACCACAACCATAAAAGG-GTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatatacatatatttacaaaatttatgaaaaacaacttattacataaaaattatcatttatctaaaataattatttatctatactttgctgtcaacatattgcttaagattatatctatcaagttaaagtacttacgtacat
gi|27                         :                          A------TATCATACATTATATAT----ACA-------C------A--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-GAAA---AAA----CAACTTATAACATT-TAA-ATTATCA-TT---TATCTAAAATAG------TATTGATC---TT----GATT-----TT-C
gi|4                          : tgtttaaattagtcatcaaggactgtatatctctatataattccctgtagtcattgTA-----C------A--AAT--G----TATG--TATTTA-AAAATAT---TAT-G-AA---AAA----CAGCTGATTACATT-AGA-ATGAGCA-TG---TATCTGAAATAA-----TTATTGATCT--GA----TATT-----TA-CTATTAACATCACAGAATGTCAACATAACT---------TAA--------GT-ACCTT-A--T---CA-C----AG-TATTAATC-CTTA-----CAAA-T--TTAGTTCCTTATT---TT------ACTTG---AA---A-ACTCATT-A-TTA------A-TAGTTCATAA--TCTG-AA-AA--AAA---ATAAGCTTAGA-A-TTAA---ATAAA-A-----------GTCCATCTT-AAAGTGTCATAAAATGTTTAGAAAGCCCGGTT--AAGTC---CGAGGAC-CTTT--TTCCGC-T-GGGG------TT-CACATAACGCGA-TTAAAAACATATTATTTG-ACACT--AGCAATA-----A-----CATACAT-T---ATT-CTTTAAAAATGTATTAAT-TAA-A-TAAA-A----TAATTAAAAT-AACATATTTCACAAGTATTGTA-AATAA-CTTTGATTT-------ATT------TAATTGGT------TA-----T-G----TATTA-------T-ACA---A-GCACAGA--TGCG---AA----------------------AATTGTGCTTAATGTTACATGAAT-CAA--G--TTAAAC------TAA--TGTGTA-T---TGCA-----CTT----TATAGTTAGTTACATATT--TACA---------------------A-GTTGCACAGATCC--TACCAAAATCGTAAA--G-GTTATTTATACAAGTTTAA-A-AAA-TGTAT-C---TT-ACTTTCTTTCTTG-AACCTATCATGATTTTTAATTGTTTGATTTTTTTCAGGAAGAGTATTCC------ATATGACTATAC---------TTA--TGTAAACAGTTGT-G------GACACATTGTGGACatcttgtttctcataaca
gi|15                         :                                                                        --TAT--AA---CACA--TATTTACACAAT-T---TAC-G-AATTCAGA--------TAATTTCATT-AAA-ATT----------TATCTAAAATAA-----CTATTGATCT--ATACAATATTGCAATTTACTATGAACATCAC---AGGTCATCATA------TCA---CTTATTTT-CAGT-ACCTT-A--T---CACA----GTATTG--ATC-ATTATCTATCAA-----TGAGTACCTTATTCTTTT------ACTTG---AA---T-ACCTATT-A-TTA------A-TAGTTTGCAG--GATG-AA-AACTAAAACTA-AAACTAAAC-A-TGAA---ATAAT-G-----------GTGAACTTG-AAAGTGACACAAATTGCTTGGAAAACCa
gi|22                         :                                                                 tataaaa--TAT--A----CATA--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AA---AAA----CAACTTATTACATA-AAA-ATTATCA-TT---TATCTAAAATAA-----TTATTTATCT--AT----ACTT-----TG-CTGTCAACAT-ATTGCTTAAGATTAT--ATCTATCAAGTTAAAGT
gi|23                         :       tgttcagcatacatgccttacagtatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta--TAT--G----TCTGGTTGTTCACAAA-T-T---AAT-G-AA---AAA----CGGCTAATGGCGTTGAAA-ATGATCA-TT---AATTTAAAATAA-----TTATTGATCT--AT----ACTC-----TC-CTATGAACATCACAGAATGTCATTA------TATCA---CAAAAGTT-TAGT-GATTT-A--TC--AG-A----AT-AT-TAATCAAATA-----AAAA-T--TGAGTTCCTTATTAAGCT------ATT-----AA---A-ATGTAAT-A-acttacgtacat
gi|2                          :                                                                                 acattTG--TATTTG-AAAATAT---TAT-G-AA---AAA----TACCTAATTACGTT-GAA-AT-GACAGTT---TATCTAAAATGT-----TTACAGAACT--AT----TATT-----CT-CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAACGTATCA---TTAAAGGT-CAGT-ACCTC-A--T---CA-C----AG-TACTAAAC-CTTA-----CAAA-T--TGGGTATCTTAGT---TT------ACTTG---AA---A---CCA-T-A-TCATTA---A-TAGTTCATAA--GTTG-CA-AA--AC----T-AAGCT-AAA-ACTGAA---AAAAACA-----------GTGAATCTT-AAATTTGCATGAAATGCTTGGAAAGCTCAGTA--AAGTT---CGAAGAC-TTAT--TTCCAC-T-GGTGTCCATATA-------ATGC------------TACCCTTAG-GCACT--AGCAATA-----A--G--AATATTT-T---ATT-CTT-AAAAATGTATTAAA-T-A-AACAAA-A----TCATCAAATTTAATATATTTCACAAGTATTATG-AATAA-CTTTGATGC-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-AATTTTACCA-------T-AAGGCAA-GCACAGA--TGCG---AA----------------------AATATTGTTTA-------ATG----TAAA-A--TTA-AT------CAAACTAAACA-TACGTGCAGTGTTCTA----TAAAGTAAGTCACATATT--TAC----------------------AAGTTGTACAGATCC--TACCAAAACCGTAAA--G-GTTATTCATACAAGTTT-A-G-AAAATGTTA-T---TTAAC-TTTCTTTA----ACCCATCATGATTTTTAATTGTTTTAATTTTCTCGTGAAGAACATTCC------ATGTGACTACAT---A-----TTGC-AATAAAAGGCTGTCGAAA--T--CACATTGTTGACTTAAAA-------------ATTAAAT-------------TTACTTTTCCGTGTC--CCAAAAGAGTGAATATCTGACC-ACTTCG-----AGAAGTTTTACATCATATATGATGGGCACGTGTCGTTATATATTTTATGCACATGATTCATTTTTAAGTGTTTGACCCTGTCCTCCAATTaaagtg
gi|18                         :                                                                                                 AAAAT-T---TAT-G-AA---AAA----CATCTAATTA-AT----A-ATTA----------AT---AAATAA-----TTATTGATCT--AT----CATT-----TT-CTTTGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGTATCA---CAAAATCT-CAGT-ACCTT-A--T---CA-C----AG-TATTAATC-TTGG-----CAAA-T--TTGGTATCCTATT---TT------ACTTG---AA---T-ACTTACT-A-TTA------A-TAGCTCATAA--TTT--CA-AA--ATA---T-AAGTT-AAA-C-TGAT---ATAAA-A-----------GTGAATCTT-AAAATtcaatatgcgaagattgttaaagtcacttcagttcagtaatg
gi|9                          :                                                                                                                -AA---AAA------GTTTATTACCTT-AAA-ACGATCA-TA---TGTCTAAAATAG-----TTATTGATCTA-TA----CATT-----GC-CT-TGAATATCACAGAATGGCATT-T-----TATCA----AAAAGGT-CA---------A--T---AA-----------CTAATC-ATTA-----TGAT-T--TGAGTACCTTATT---TT------ACTTG---AATTTA-CTTGAAC-ACTTA-TAAGTGATATTTCATCA--GCTG--A-AT--GAA---T-AAGCT-AAA-A-TTGAAATATAAA-ATTAT-------GTGAATCTTAAAAGTAAAATGAAATACTTGGAAAGCC--ATTTAAAGTC---CGAGGAC---TT--TTCCAC-T-GGGGTC-------CATATGACGCGA-TTAAAACACTATCATTAG-AGACT--AGCAATA-----AC-T--ACAGT-T-A---ATT-ATTTAAAAAAAAAC--AA-C-A-A-CAAA-A----TAATT----C-AACATATTTCACA--TATTTTTAAATTA-CTTTGATAT-------TTT------TAATTGAT------TA-----T-A----TA-TA-------T-AT----t
gi|8                          :                                                                                                                       tatatatacaaAATAACATT-AAA-ATGATCA-TT---TATCTAAAATAAAATATTTATTGATCTATTT----TTTT-----TT-CTATGAACATCACAGGATGCCATTACAAATGTATCA---CAACATGT-CAGC-ACCTTAA--C---AC-A----GT-AT-TATTC-CTCA-----CAAA-T--TGAGTTTCTTATC---TG------ACTTG---AA---A-A--AAATCA-TTATTAC----TAGTTCGTAT--GTTG-AA-AA--GTA---A-AA--TAAAA-A-AGAA---ATAAA-A-----------GGCAACCTG-AAAGTGAAATTAAATGCTTGGAAAGCCCAGTA--AAGTC---CTAGGAC-TTAT--TTCCGC-A-GTGGGTT------CATATAACGGGA-TTAAAAAA--ATC-TTTACACACT--AGCAATATACCTA--A--AATATAT-T---ATT--TTTAAAAATGTATTAAA-T-------AA-A----T----AAAAT-AATATATCTGAC-GGCATTATG-TATTATTTTTAATGT-------ATT------AAGCTGAT------TA-----T-A----TATTA-------T-ATA---A-GCACAGA--TGCG---A
gi|19                         :                                                                                                                   ttttattcagcatgcatgtcatacagtattaaacaA-TT---TGTCTAAAATTA-----TTATTGATCT--AT----TTTT-----TT-CCATGAACATCACAGAATGCCATTACAAATGTATCA---TAGAATTT-GAGT-ACCTT-A--TCACAG-C----AT----TAAAC-CTTA-----CGAA-T--TGAGTATCTTATT---TT------ACTTG---AA---A-ACT---T-A-TTA-TAAATA-T--TTCATAA--GTT------A--AAA---GTAAGCT-AAA-A-AGAA---ATAAA-------------ATGAATCTA-AAAGTGATATGAAATGCTT
gi|17                         :                                                                                                                                                           atatgataAAATGC-----TTATTGAT-T--TC----TACT-----TTGCTATGAACATCACAGAACGTCATTACA------TCA---TAAAATTT-ACGT-ACCTT-A--T---A-------------------TTTA-----AGAA-T--TGAGTACCTTATT---TT------ACTTG---AA---T-ACTTATA-A-TTATTA---A-TAATTCATAA--GTTG-AT-AA--GA----T-AAGCT-AAA-AATAAA---ATAAA-T-----------GTGAATCTT-AAAGTGCCATGAAATGCTTGGAAAGTCTACTA--AAGTC---CAGGGAC--TTA--TTTCAA-CTGGGGTCCATtaa
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                               taATTATAAATGTATCA---CAAAATTT-CAGTATCGGT-ACCT---AA-ATATCAC-TATTAAAA-CTGA-----CAAA-T--TAAGTATTTTATT---TT------ACTTGC--AA---ACACTTATT-A-TTA------A-TAGTTCATAA--TTTG-AA-Ag
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                         tT-CAGT-ACCTT-A--T---AA-C----AG-TATCAATC-ATTAGT---TAAA-TATTGAGTACCTTATT---TC------ACTTG---AA---T-ACTAATT-A-TTATTAGACA--AAT---TAG--CTTGAAA-AA--AAA---G-AAGCTAAAA-A-TAAA---ATAAA-A-----------TTGAATA---AAAATGACTTGAAATGCTCGAAAAGTC
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctcTATTC-CTTA-----CAAA-C--TGTGTTTCTTATT---TT------ACTTG---AA---A-ACT-----A-TT--TATGAA-TAGTTCAGAAGTTCTC-AA-AA--------T-AAGCT-AAA-A-ATGA---ATTAA-A-----------GTGAATCTT-AAAATGAAATGAAATATTTGGAAAGCCCgtc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atttaggtaccctatTGAATCTT-AAAGTAACATAAGATTCTCGGCAAGCCTAGTA--AAGTCGACCGAGGAC-TTGT--TTCTAT-T-GGGGTC-----A--ATGTGACACAA-TTAAAAAACTACTCTAAA-ACACT--AGCAATA-----C--A--AACATAT-TATAATT-CGTTAAAAATATACTAAA-T-A-A-TAAATAGT--TAATCCAAAA-AACATACGTGA-----ATTATG-AATTA-CTTTGACGC-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-G-----ATTA-------T-AT----A-CCATAA---TGCA---AGCT--------------------AAT-----CTATGTATA-GTTTAA-TA-ATA--CAAAA--------AA--TGTATACT---TACA-----GTA----T-TTGCAAG-----TATT------------------------------TTGT-CAGATATGATAATAAAATAATACA--GTGTTGTATAa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAGTTCTTGGAAATCCCATTA--AAGAG---TGAGGAC-TTAT--TTTCAA-T-GGGGTCCATATA-------GCGCAACTTAAAA--TTGCCTTGAG-ACACT--TGCAATA-----A--A--AATATAT-T---ATT-CA--AAAAATGCATTAAA-TCA-A-TTTG-T----TAATCAAAAT-AACATATTTCACAAGTATTATG-AATAA-TTTTGATGT-------ATT------TAAATGATTA----TA-----T-A----TATTA-------TAAC----A-GCACA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         at-TATATAAAGTGA-TTTAAAAAATATCCTTTG-ACACT--TGCAATA-----AATG--ATAATATAT---AATACTATACAAATGTATTAGA-T-AGA-TAAA-AAAACTAATTAAAAC-AACATATTTCACAA----------ATTT-CTTTGATGTACAATGCATT------TAAGTGAT------TA-----T-A----TGTTA-------T-AC----A-aa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttccactcactttATATAATGAGA-TTAAAAAAATACACTTAG-ACACT--AGCAATA-----A--ATCAAAGTGT---------CTTTAAAAATGTATTAAA-T-A-G-ACAA-A----TAAT--AGA-----------AATAAGTATTATG-AAT----------GT-------ATT------TATTTAAT------TA-----TGA----TATTA-------T-AC----AAGCACATA--TGCA---AA----------------------CATATTGCTTATGGTTACATGAAT-CAAGT----TAAAC------TAA--TATGTA-T---TGCA-----CTA----TATAGTAAGTAACATAT----AC----------------------AAGTTGCATATATCC--TACCTAAATCGTAAA--G-GTTATTTATACAAGTTT-A-G-AAaacacataagc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tggaatgcttggaaagcttagttttcactggactccCATT--AGGGATA-----A--A--ACTATAT-T---ATT-CTTTAAAAATGTATTAAA-T-A-A--AAA-A----TAA---AAAT-AACATATTTCACAAGTATTATG-AATAA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-A----TATTA-------T-ACG---A-GCACAAG--TG-A---AG----------------------ATTATTACTTAAAGTTACATGAAT-CAAGT----TAAAC------TTA--TGTGTA-T---TTCG-----CGA----TATAGTAAGTCGCACATT--TATTATATCAGTATCTATTATTATAA-GTTGCACAGGTCC--TACTAGAACCGTAAA--G-GTTATCTATTTAATTTT-A-G-AAAACGTTTTC---TTGAC-TTCTTTCGTG-AACCCATCATGATTTTTAATTGTTTGAAATTTCTCAGGAAGAGCATTCC------ATGCGATTATACTAGA-----GT---AGTAAAAAGTTGTGGAA----GACAAATTGTTGATTTT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttagtAAAAATATATTAAA-T-A-AATAAA-A----TAATCAAAAT-AGAATATTCCACAAGTACAATG-CATTA-CTCTGACGT-------ATT------CAATTGAT------TA-----G-A----TA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTCACAAGTATGATG-AATTA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-A----TATTA-------T-ACA---A-GCACAGA--TGC----AA----------------------AATATTGCTTAAGGTTACATGAATCTAG-T---TTAAAC------TAA--TGTGTA-T---TGCA-----CTA----TATAGTAAGTCACATATT--TACA---------------------A-GTTGCACAGATC-----ATA----C-------------------CAAATTT-A-GAAAA-TGTTT-C---TTAAT-TTCTTTTTTG-TA----TCATGATTT----TTGTTAGAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCCATGTGACTGTGACTATACTA-T-----TGC--AGTAAGAAaacatacattgaaaa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaATTTCAAAGGTATTATG-AATTA-CTTCAATGT-------ATT------TAATCTAT------TAGGCC-T-A----TAATAATACCTTC-ATGCA-A-GCGCAGA--TGTG---TA----------------------AATATTGCTTATGTTAACATTAAT-CA-AT---TCAAAC------TGA--TATGTA-T---TGCA-----CCA----GACAGTAAGCCACATATT--TACA---------------------A-GTTGCACAGATCC--TAtaggattaaaaaaaattgtctttcatttaaat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----TATTA-------T-AC----AAGCACA-TAATGTG---GA----------------------AGTATTACTTA----TA-----AT-TA--CA--TTAAAC------TAA--TGGACA-T---TGTA-----CTAGTTCTATAGTTAGTTTCATATT--TA---------------------------TGTGC---TTC--ACATAC--TCA---G--G-ATTATTTGTGAGAGTTT-G-G-AAAATGTTT-C---TAAAC-CTTTTCT-TG-AGCGTATTATGTCTTTTAATTGATTGAGCAATCTCAGGATGAGCAT-CC------ATGTCACTTTGCTA--------TAGTAGTAAAATATTGTCAAA---T-ATACATTGCTGACTTCAGG-------------A----ACATAGAAACGGAACTTGC-TTACCGTCTCCCAT--AAGATTGAACATTAAATTATGGTCGCTTGTTAAAGTGTTCAAAAATATATGATGGACACTTGTCAAAATATATTTCATGCAGATAATTCATTTCTAATTGTTTGACAATGTCCTCCAATTTTAccaaaact
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TA-------T-AC----ATGCACAGA--TTCG---AA----------------------AATAGTGCTTA-AGAT---TACAT-TAAACAAGTTAAAC------TAC--TGTGCA-T---TGAA-----CTA-----A-AGTTATTCATATATAAATA-----------------------A-GTTG--------C--TGA--AAACCATAAA--G-GTTATTTACACAAGTGT-A-aaatgccaattttatgaaaattactacatttatgtaatgttattggtgaaacactcaaattggaccttatttactttgtttaggtcactttaagtttagatttgattgtttcctccctatgaaggttggaccaatccgaacaagcacattgaactagagaattacaaaacgttttcctagtattaagtcaagaacattattatatctgtagaagaacttcaatcaagagttaacttattattttattatatctgcttcacaggaattagccgatagggtagtctgtaggaaataacctaaatatttaaatgaactttgtgactttataatgtggccattacaacccacaaagaaacgaacagtttacttgttttcattt
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCACAAAACC--TACTTAAACCATTAA--G-GTGATTTATAAAAGTTC-ACA-AAA-TGTTT-CTTGTTCTC-CTCTTTTG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCTTTCTTGATAC-TATCATGATTT-TGATTGTTTGAATCTTCTCAGGAAGAGCATTCC------ATGTAACTATACTATACTGTTTTG--ATAAAAAAATTGTTAAA----AATACATTGCTGACTTTGGGAACATAAAAATTAA----AT-------------TTACTTTTCCGTGTC--CTAAATAAGTAAACATCTGACC-GCTTCA-----TGAAGTTTTCTGTCaacatatcaccccatggattgatttgtgttaattatctgtt

Unaligned ( gi|20 ): GAAAATGATATTTATTCTAATGTGATTATTAATCTATACTTGGCCATGACTATCACAGAATGTCTTTGTATTATACATGTTCAGTACCTTATCATTGAAAACTTCAGTAACTAATTTTACTTGAAAACTTATTAATTGTTCATGAAGTGAAAAATTAAGCTTAAAATAAAACGTATTATAAAAGTGAACCCAGATTGTATCATGATATGGG
Unaligned ( gi|38 ): AATGTTAAAAAATTATATGTTTATAGCAAGGACTTGTATCTCTATATAATTCCTTGGTTTATAGTCATTTCCGATATCATTCGTCTATA
Unaligned ( gi|40 ): ACATATAGGGAACACTTGTTGGTTTTAGTGACAAATAACCAAAGCGACACTTTGCATTAATTAAGGGATAAATACA
Unaligned ( gi|43 ): AAACGTCGAGATATTACTGTTACCAAGGACGTGTACCTCTATATAATTCCTT
Unaligned ( gi|45 ): TCAAATTGTATTTTCCAAAATAATTTACGCA

lowQualScore                  :                                                           222222222222222      1111                                                                                                                                             111111                            5555555555555555555555     1111111111                                                           2222222                11111111                    1                        1111111111111                                                                               4444444                                                     1111                                  111111     1111                                                                         111111  11111             33333333333           111111111   2222222222222222            11111         1   333333333                                                    333333333333333333333                                                                                           2222222222                                                          55555555555555                 33333                   77777777777777777777777777777777   11  1                        222222                                                                                                        
lowQualScore                  :                 33        666666                 5555   1 444444444444444   33 2222    55      0     4 333   2 2     8888     0        2   1  2      333   1         44444            55555   44444 888                         555555                    55555   2222222222222222222222   2 1111111111  2   22      0      333   333    2  4444  33   55555   0  7777777 2        2     55555555 2  888  33 33    2 2  2 5 5    8888888   2  8888888888888         2   33                            2    555         44 3         2     9999999   6666        3        2 3                   77777  0000      2  777                      333333   5 0000          2                 2        4 2         8888888   777777        000000  11111 2      2 2  66666666666     33    111111111   6666666666666666  3   3     99999 3   3   0   222222222      999999         3        7777                  444444444444444444444             0       1      1    55           0              5       5    2    1  0        1111111111      888 0                                          5    22222222222222             5   99999               66  66666666666666666666666666666666   33  0                        888888     0    0          22             0   1    222        0     1               1        22               
lowQualScore                  :                 ..        ......                 ....   . ...............   .. ....    ..      .     . ...   . .     ....     .        .   .  .      ...   .         .....            .....   ..... ...                         ......                    .....   ......................   . ..........  .   ..      .      ...   ...    .  ....  ..   .....   .  ....... .        .     ........ .  ...  .. ..    . .  . . .    .......   .  .............         .   ..                            .    ...         .. .         .     .......   ....        .        . .                   .....  ....      .  ...                      ......   . ....          .                 .        . .         .......   ......        ......  ..... .      . .  ...........     ..    .........   ................  .   .     ..... .   .   .   .........      ......         .        ....                  .....................             .       .      .    ..           .              .       .    .    .  .        ..........      ... .                                          .    ..............             .   .....               ..  ................................   ..  .                        ......     .    .          ..             .   .    ...        .     .               .        ..               
lowQualScore                  :                 44        888888                 3333   1 333333333333333   11 2222    88      6     2 777   2 1     5555     8        0   9  7      333   9         55555            77777   55555 000                         555555                    33333   4444444444444444444444   8 5555555555  1   99      2      777   999    2  3333  11   66666   4  6666666 2        2     22222222 4  888  77 44    5 5  5 0 0    1111111   5  2222222222222         4   22                            6    444         22 2         9     4444444   5555        1        1 5                   11111  0000      9  999                      999999   7 0000          9                 5        3 5         1111111   222222        666666  66666 5      4 4  00000000000     44    444444444   7777777777777777  3   3     22222 3   3   8   222222222      666666         3        1111                  000000000000000000000             5       2      4    55           1              7       7    5    0  4        9999999999      888 1                                          7    00000000000000             2   00000               22  22222222222222222222222222222222   88  0                        888888     2    2          22             7   0    777        7     0               0        00               
consensus                     :       NGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----C------G--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AAAAA----CAGCTAATTACATT-AAA-ATGATCATT---TAT-CTAAAATAA-----TTATTGATCTAT----TATT-----TT--CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGTATCACAAAATTTCAGTACC-----TTA---T---A-ACA-T-----T--TAATC-CTTA-----CA-AAT--TGAGTACCTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--TTA-----TTATTA-T-A---A-TAGTTCAT-AAGTT------GAA-AA---AAA-T--AAGC-T-AA-A-A-TGAA-------ATA-AA-A-----------GTGAATCTT-AAA--GTGACATGAAATGCTTGGAAAGCCCAGTAAAGT---CCGAGGACT--TATTTCCACTG-GGGTCC------ATA----TAACGCGA-TTAAAAAANTACCCTTAGACACTAGCAATA-----AA----AATATA-TT---ATTCTTTAAAAATGTATTAAAT-A-A-TAAA-A----TAATCAAAAT-AACATATTTCACAAGTA-TTATGAATNA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-ATATTA-T-AC---------A-GCACA-GATGC---------GAA----------------AA-TAT-TGCTT-A-G-G-TTA-CATGAAT-CAAGTG--TTAAAC------TAATGTGTA-TTGCACTA----TATAGTAAGTCACATATT---------------------TACAAGTTGCACAGATCCTACCAAAACCGTAAA--GGTTATTTATACAAGTTTAGAAAATG-TTTCTTA-ACTTCTTTCTTGAACCTATCA----------TGATTT---TTAATTGTTTGAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCCATGTGACTAT-ACTAT---A-----TTG-AGTAAAAAGTTGTCGAA---TGACACATTGTTGACTTTAGG-------------A----ATTTA---------CTT--TT-CCGTGTCCCAAAAGAGTGAACATC------TGACCGCTTCGTGAAGTTTTCCGTCGTATATGATGGACACTTGTCGTAATATATTTTATGCACGTGATTCATTTCTAATTGTTTGACCCTGTCCTCCAATTTTA
Reference ( family-1653 )     :       NGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----C------G--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AAAAA----CAGCTAATTACATT-AAA-ATGATCATT---TAT-CTAAAATAA-----TTATTGATCTAT----TATT-----TT--CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGTATCACAAAATTTCAGTACC-----TTA---T---A-ANA-T-----T--TAATC-CTTA-----CA-AAT--TGAGTACCTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--TTA-----TTATTA-T-A---A-TAGTTCAT-AAGTT------GAA-AA---AAA-T--AAGC-T-AA-A-A-TGAA-------ATA-AA-A-----------GTGAATCTT-AAA--GTGACATGAAATGCTTGGAAAGCCCAGTAAAGT---CCGAGGACT--TNTTTCCACTG-GGGTCC---TACATA----TAACGCGA-TTAAAAAANTACCCTTAGACACTAGCAATA-----AA----AATATA-TT---ATTCTTTAAAAATGTATTAAAT-A-A-TAAA-A----TAATCAAAAT-AACATATTTCACAAGTA-TTATGAATNA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-ATATTA-T-AC---------A-GCACA-GATGC---------GAA----------------AA-TAT-TGCTT-A-G-G-TTA-CATGAAT-TAAATA--TTAAAC------TAATGTGTA-TTGCACTA----TATAGTAAGTCACATATT---------------------TACAAGTTGCACAGATCCTACCAAAACCGTAAA--GGTTATTTATACAAGTTTAGAAAATG-TTTCTTA-ACTTCTTTCNTGAACCTATCA----------TGATTT---TTAATTGTTTGAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCCATGTGACTAT-ACTA----A-----TTG-AGTAAAAAGTTGTCGAA---TGACACATTGTTGACTTCGGG-------------A----ATTTA---------CTT--TT-CCGTGTCCTAAAAGAGTGAACATC------TGACCGCTTCGTGAAGTTTTCCGTCATATATGATGGGCACNTGTCGNNATATATTTCATGCANATGATTCATTTCTAANTGTTTGACNNTGTCCTCCAATTTTA
gi|1                          :        GTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----C------G--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AAAAA----CTGCTAATTGCATT-AAA-ATTGTCATT---TAT-CTTAAATAA-----TTATTGATCTTT----TATT-----TT--CTATGAACATCATTAAATGTCATTATAAATGTATCATAAAATGTCGGTTCC-----TTA---T---A-AAA-T-----TTGTAATC-CTTA-----CA-AAT--TGTGTGTCTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AT--TTA-----GTATTACT-ACATG-TAGTTTAT-AATTT------GAA-AA---AAA-G--AAGC-T-AA-T-A-TGGA-------ATA-AA-G-----------GTGAATCTT-AAA--GTGATATGAAATACTTGGAAAGCCCGGTTAAGT---CCGAGGACA--TTTTTCCAAAG-GGGCCTATATATATA----TAACGCGA-TTAAAAAACTACCATTTGGCACTAGCAATA-----AG----AAAATA-TT---ATTCTTTAAAAATATATTAAAT-A-A-TAAA-A----TAATCAAAAT-AACATATTTAATAAGTA-CTATTAATTA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-ATATTA-T-AT---------A-GTACA-GTTGC---------AAA----------------AA-TAT-TGCTT-ACG-G-ATA-CATGCAT-TAGATA--TTAGAC------CAATGAATA-TTGCACTA----TATAGTAAGTCATATATT---------------------TAC-AGTTGTACAGATCCTAATAAGATCATAAA--GGTTATTTATACAAGTTTAG-AAATG-TTTCTTC-ACTTCTTTTGTGTACCTGTCA----------TGATTT---CTAATTGTTTAAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCCTTGTGACTAT-ACTA----A-----TTA-AGTAAAAAGTTGTCGAAGACTGACACATTGTTGACTTTAGG-------------A----ATTTG---------CCT--TT-CCGTGTCATGAAAGTGTGAACATC------TGACTTCGTCGTGAAGTTTTCCATCGTATATGATCGACACTTGTCATAATATATTTTATGCACGTGATTCATCTCTAATTGTTTGACCCTGTCCTCCAATTATA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tCTTAGTCATTAGGGATA-----AA----ACTATA-TT---ATTCTTTAAAAATGTATTAAAT-A-A--AAA-A----TAA---AAAT-AACATATTTCACAAGTA-TTATGAATAA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-ATATTA-T-ACG--------A-GCACA-A--GT---------GAA----------------GATTAT-TACTTAA-A-G-TTA-CATGAAT-CAA--G--TTAAAC------TTATGTGTA-TTTCGCGA----TATAGTAAGTCGCACATTTATTATATCAGTATCTATTATTATAAGTTGCACAGGTCCTACTAGAACCGTAAA--GGTTATCTATTTAATTTTAGAAAACGTTTTCTTG-ACTTCTTTCGTGAACCCATCA----------TGATTT---TTAATTGTTTGAAATTTCTCAGGAAGAGCATTCCATGCGATTAT-ACTAG---A-----GT--AGTAAAAAGTTGTGGAA----GACAAATTGTTGATTT
gi|11                         :        GTTTTATTC--AGCAAGCG------TGCTATACAGTATATAT----ACATA-----------------T--A----TATG--TATTTACAAAAT-A---AAC-G-AAAAA----CAGATA-TTACATT-AAA-ATTGTCATT---TAT-CTAATATAA-----TTATTGATATAT----TATT-----TT--CTATAAACATCACTGAATGACATTATGAATGCATCACAATAGTTCAGTACC-----T-------------------------AATC----A-----CAGAAT--TAA-T-CCTTGTT---TCATCACTTG-AA--A-AT--ATA-----TTATTA-------A-TAGTTCAT-AAGTT------GAACAA---AAA-T--AAGT-TTAA-A-A-TGAA-------ATA-AA-C-----------GTGAATCTT-AAA--GTGACATGTAATGATTGGAAATCCCAGTAAAGT---TTAAGGATT--TACTTCCACTG-GGG------TAAATA----TAACGTGA---AAAAAATT-CCCTTAGACTTAAGC-ATA-----AG----AATATA--T---ATTC-ATAAAAATGt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aTGAATCTT-AAA--GTAACATAAGATTCTCGGCAAGCCTAGTAAAGTCGACCGAGGACT--TGTTTCTATTG-GGGTC-----A-ATG----TGACACAA-TTAAAAAACTACTCTAAAACACTAGCAATA-----CA----AACATA-TTATAATTCGTTAAAAATATACTAAAT-A-A-TAAATAGT--TAATCCAAAA-AACATACGTGA-----A-TTATGAATTA-CTTTGACGC-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-G-ATTA-T-AT---------A-CCATA--ATGC---------AAGCT--------------AA-TCTATGTAT-A-G-T-TTA--AT-------AATA--CAAAA--------AATGTATACTTACAGTA----T-TTGCAAGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGGAATGCTTGGAAAGCTTAGT----------------------TTTCACTG-GACTCC------ATA----TAATGAGA-TTAAAAAAATACACTTAGACACTAGCAATA-----AATC--AAAGTG-T-------CTTTAAAAATGTATTAAAT-A-G-ACAA-A----TAATAGAAAT-AA------------GTA-TTATGAAT----------GT-------ATT------TATTTAAT------TA-----TGATATTA-T-AC---------AAGCACA-TATGC---------AAA----------------CA-TAT-TGCTT-ATG-G-TTA-CATGAAT-CAAGT----TAAAC------TAATATGTA-TTGCACTA----TATAGTAAGTAACATAT-----------------------ACAAGTTGCATATATCCTACCTAAATCGTAAA--GGTTATTTATACAAGTTTAGAAattttgtcagatatgataataaaataatacagtgttgtata
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTCACAAGTA-TGATGAATTA-CTTTGATGT-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-ATATTA-T-ACA--------A-GCACA-GATGC----------AA----------------AA-TAT-TGCTTAA-G-G-TTA-CATGAAT-CTAGT---TTAAAC------TAATGTGTA-TTGCACTA----TATAGTAAGTCACATATT---------------------TACAAGTTGCACAGATCATACCAAA-------------------------TTTAGAAAATG-TTTCTTA-ATTTCTTTTTTG----TATCA----------TGATTT-------TTGTTAGAATTTTCTCAGGAAGAGCATTCCATGTGACTGTGACTATACTA-----TTGCAGTAAGAA
gi|15                         :                                                                      aa--TAT--AA---CACA--TATTTACACAAT-T---TAC-G-AATT-----CAGATAATTTCATT-AAA-AT------T---TAT-CTAAAATAA-----CTATTGATCTATACAATATTGCAATTTA-CTATGAACATCACAG---GTCATCATA------TCACTTATTTTCAGTACC-----TTA---T---C-ACAGTA----T--TGATC-ATTATCTATCA-A----TGAGTACCTTATTCTTTTA---CTTG-AA--T-AC--CTA-----TTATTA-------A-TAGTTTGC-AGGAT------GAA-AACTAAAA-CTAAAAC-T-AA-ACA-TGAA-------ATA-AT-G-----------GTGAACTTG-AAA--GTGACACAAATTGCTTGGAAAACCtaggattaaaaaaaattgtctttcatttaaat
gi|16                         : tataaaaGTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACACTATATAC----ACACA-----CAT----G--TAT--A----TATAGATATTTACAAAAT-A---TATAA-AAAAA----CAGCTTATTACATT-AAATAT--TTATA---TAT-CTAAAATAA-----TTATTGATCTAT----ACTT-----TG--GTATGAACATCACAGAATGTCATTA------TATCACAGACTTTCTGTACC-----GTA---TCCCA-GTA-------T--TAATC-ATAA-----C--AAT--TGAATACCTTATT---TTA---A--G-AC--G-AC--TTG-----TT-----T-A---A--AGTTTAT-A
gi|17                         :                                                                                                                                                             aTAAAATGC-----TTATTGATTT-C----TACT-----TTG-CTATGAACATCACAGAACGTCATTACA------TCATAAAATTTACGTACC-----TTA---T---A-----T-----T--TAA-------------G-AAT--TGAGTACCTTATT---TTA---CTTG-AA--T-AC--TTA-----TAATTA-TTA---A-TAATTCAT-AAGTT------G-A-TA---AGA-T--AAGC-TAAA-A-A-TAAA-------ATA-AA-T-----------GTGAATCTT-AAA--GTGCCATGAAATGCTTGGAAAGTCTACTAAAGT---CCAGGGACT--TATTTCAACTG-GGGTCC---
gi|18                         :                                                                                                 AAAAT-T---TAT-G-AAAAA----CATCTAATTA------------ATAATT---AAT----AAATAA-----TTATTGATCTAT----CATT-----TT--CTTTGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGTATCACAAAATCTCAGTACC-----TTA---T---C-ACAGTA----T--TAATC-TTGG-----CA-AAT--TTGGTATCCTATT---TTA---CTTG-AA--T-AC--TTA-----CTAT---T-A---A-TAGCTCAT-AA-TT------TCA-AA---ATA-T--AAGT-T-AA-A-C-TGAT-------ATA-AA-A-----------GTGAATCTT-AAA--ATatg
gi|19                         :                                                                                                                                            -ATGATAATT---TGT-CTAAAATTA-----TTATTGATCTAT----TTTT-----TT--CCATGAACATCACAGAATGCCATTACAAATGTATCATAGAATTTGAGTACC-----TTA---T---C-ACA-GCA---T--TAAAC-CTTA-----CG-AAT--TGAGTATCTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--TTA-----TTA-TA---A---A-TATTTCAT-AAGTT----------AA---AAG-T--AAGC-T-AA-A-A-AGAA-------ATA-AA-A------------TGAATCTA-AAA--GTGATATGAAATGCTTt
gi|2                          :                                                                                    atTG--TATTTG-AAAATAT---TAT-G-AAAAA----TACCTAATTACGTT-GAA-ATGACAGTT---TAT-CTAAAATGT-----TTACAGAACTAT----TATT-----CT--CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAACGTATCATTAAAGGTCAGTACC-----TCA---T---C-ACA-G-----TACTAAAC-CTTA-----CA-AAT--TGGGTATCTTAGT---TTA---CTTG-AA--A-CC--ATA-----TCATTA-------A-TAGTTCAT-AAGTT------GCA-AA---AC--T--AAGC-T-AA-A-ACTGAA-------AAA-AACA-----------GTGAATCTT-AAA--TTTGCATGAAATGCTTGGAAAGCTCAGTAAAGT---TCGAAGACT--TATTTCCACTG-GTGTCC------ATA----TAATGC------------TACCCTTAGGCACTAGCAATA-----AG----AATATT-TT---ATTCTT-AAAAATGTATTAAAT-A-AACAAA-A----TCATCAAATTTAATATATTTCACAAGTA-TTATGAATAA-CTTTGATGC-------ATT------TAATTGAT------TA-----T-A-ATTT-T-ACCATAAGGCAA-GCACA-GATGC---------GAA----------------AA-TAT-TGTTT-A-ATG-TAA-AATTAAT-CAAAC----TAAAC------ATACGTGCA-GTGTTCTA----TAAAGTAAGTCACATATT---------------------TACAAGTTGTACAGATCCTACCAAAACCGTAAA--GGTTATTCATACAAGTTTAGAAAATG-TTATTTA-ACTT---TCTTTAACCCATCA----------TGATTT---TTAATTGTTTTAATTTTCTCGTGAAGAACATTCCATGTGACTAC-AT------A-----TTGCAATAAAAGGCTGTCGAAA--T--CACATTGTTGACTTAAAA-------------ATTAAATTTA---------CTT--TT-CCGTGTCCCAAAAGAGTGAATATC------TGACCACTTCGAGAAGTTTTACATCATATATGATGGGCACGTGTCGTTATATATTTTATGCACATGATTCATTTTTAAGTGTTTGACCCTGTCCTCCAATTTCAtaa
gi|20                         :                                                                                                                                        -AAA-ATGAT-ATT---TATTCTAATGTGA-----TTATTAATCTAT----ACTT-----GG--CCATGACTATCACAGAATGTC-TT-----TGTATTATACATGTTCAGTACC-----TTA---T------CA-T-----T--GAA-------------A-ACT--TCAGTAACTAATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--TTA-----T------T-A---A-TTGTTCATGAAGT--------GA-AA---AAT-T--AAGCTT-AA-A-A-TAAAACGTATTATA-AA-A-----------GTGAA-CCC-AGATTGTATCATGATATGatatgcgaagattgttaaagtcacttcagttcagtaatg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gAAGTTCTTGGAAATCCCATTAAAGA---GTGAGGACT--TATTTTCAATG-GGGTCC------ATA----TAGCGCAACTTAAAA--TTGCCTTGAGACACTTGCAATA-----AA----AATATA-TT---ATTCA--AAAAATGCATTAAATCA-A-TTTG-T----TAATCAAAAT-AACATATTTCACAAGTA-TTATGAATAA-TTTTGATGT-------ATT------TAAATGATTA----TA-----T-ATATTA-TAAC---------A-GCACA-AAgg
gi|22                         :          atTGTTC--AGCATACA------TGCCTTACAGTATAT
gi|22                         :                                                                        --TAT--A----CATA--TATTTACAAAAT-T---TAT-G-AAAAA----CAACTTATTACATA-AAA-ATTATCATT---TAT-CTAAAATAA-----TTATTTATCTAT----ACTT-----TG--CTGTCAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatatacatatatttacaaaatttatgaaaaacaacttattacataaaaattatcatttatctaaaataattatttatctatactttgctgtcaacatattgcttaagattatatctatcaagttaaagtacttacgtacat
gi|23                         :       tgttcagcatacatgccttacagtatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta--TAT--G----TCTGGTTGTTCACAAA-T-T---AAT-G-AAAAA----CGGCTAATGGCGTTGAAA-ATGATCATT---AAT-TTAAAATAA-----TTATTGATCTAT----ACTC-----TC--CTATGAACATCACAGAATGTCATTA------TATCACAAAAGTTTAGTGAT-----TTA---TC--A-GAA-TA----T--TAATCAAATA-----AA-AAT--TGAGTTCCTTATT---attgcttaagattatatctatcaagttaaagtacttacgtacat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acattTCTTTCTTGATACTATCA----------TGATTT---T-GATTGTTTGAATCTTCTCAGGAAGAGCATTCCATGTAACTAT-ACTAT---ACTGTTTTG-ATAAAAAAATTGTTAAA----AATACATTGCTGACTTTGGGAACATAAAAATTAA----ATTTA---------CTT--TT-CCGTGTCCTAAATAAGTAAACATC------TGACCGCTTCATGAAGTTTTCTGTCaagctattaaaatgtaataaaagtg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTCCACTC-A---CT---TTTATA----TAAAGTGA-TTTAAAAAATATCCTTTGACACTTGCAATA-----AATGATAATATA-TA---ATACTATACAAATGTATTAGAT-AGA-TAAA-AAAACTAATTAAAAC-AACATATTTCACAAAT--TT---------CTTTGATGTACAATGCATT------TAAGTGAT------TA-----T-ATGTTA-T-ACA--------A-ACACA-t
gi|26                         :       aGTTTTATTC--AGCATATA------TGTCATACAATATATAT----ATATA-----C------A--TAT--AA---TTTT--TTTTTACCAAAT-T---TAT-G-AGAAA----TAGCTTATTACGTT-AAA-ATGATCATT---TAT-CTGAAATAA-----TTATTGATCTAT----TATT-----TT--CTATGAACATTACAGAATGCAATTACAAATtaagc
gi|27                         :                         gA------TATCATACATTATATAT----ACA-------C------A--TAT--A----TATG--TATTTACAAAAT-T---TAT-GAAAAAA----CAACTTATAACATT-TAA-ATTATCATT---TAT-CTAAAATAG------TATTGATCT-T----GATT-----TT--Caaaggacttatttatatagtttgt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgtttaaattagtcatcaaggactgtatatctctatataattccctgtagtcattgATTTCAAAGGTA-TTATGAATTA-CTTCAATGT-------ATT------TAATCTAT------TAGGCC-T-ATAATAAT-ACCTTCATGCAA-GCGCA-GATGT---------GTA----------------AA-TAT-TGCTT-A-T-G-TTAACATTAAT-CAA-T---TCAAAC------TGATATGTA-TTGCACCA----GACAGTAAGCCACATATT---------------------TACAAGTTGCACAGATCCTACCAAAACatcttgtttctcataaca
gi|29                         :        GTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAA----A---A-----C------A--TAT--A----TTTG--TATTTACATAGT-T---TAT-G-GAAAT----CAACTTATTACATT-AAA-ATGATCATT---TAT-CTAAAATAA-----TTATTGATCTAT----TATT-----TT--CTATGAACATCACAGAATGTCAATATAAATGTATCACACAATGTCAGTACt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taTATTA-T-AC---------AAGCACATAATGT---------GGA----------------AG-TAT-TACTT-A-----------T-AAT-TA--CA--TTAAAC------TAATGGACA-TTGTACTAGTTCTATAGTTAGTTTCATATT---------------------TATGTGCTTCACA-----TAC--------TCAG--GATTATTTGTGAGAGTTTGGAAAATG-TTTCTAA-ACCT-TTTCTTGAGCGTATTA----------TGTCTT---TTAATTGATTGAGCAATCTCAGGATGAGCAT-CCATGTCACTTT-GCTAT---A-----GT--AGTAAAATATTGTCAAA---T-ATACATTGCTGACTTCAGG-------------A----ACATAGAAACGGAACTTGCTTACCGTCTCCCATAAGATTGAACATTAAATTATGGTCGCTTGTTAAAGTGTTCAAAAATATATGATGGACACTTGTCAAAATATATTTCATGCAGATAATTCATTTCTAATTGTTTGACAATGTCCTCCAATTTTA
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                 TCTCAGTACC-----TTA---T---A-ACAGTA----T--CAATC-ATTAGT---TA-AATATTGAGTACCTTATT---TCA---CTTG-AA--T-AC--TAA-----TTATTA-T-------TAG---AC-AAATTAGCTTGAAA-AA---AAA-G--AAGC-TAAA-A-A-TAAA-------ATA-AA-A-----------TTGAATA---AAA--ATGACTTGAAATGCTCGAAAAGTCaaatgccaattttatgaaaattactacatttatgtaatgttattggtgaaacactcaaattggaccttatttactttgtttaggtcactttaagtttagatttgattgtttcctccctatgaaggttggaccaatccgaacaagcacattgaactagagaattacaaaacgttttcctagtattaagtcaagaacattattatatctgtagaagaacttcaatcaagagttaacttattattttattatatctgcttcacaggaattagccgatagggtagtctgtaggaaataacctaaatatttaaatgaactttgtgactttataatgtggccattacaacccacaaagaaacgaacagtttacttgttttcattt
gi|31                         :       cGTTTTATTT--AGCAAATA------TGTTTTACAGTATTTAT----ACATA-----T------AATTAT--AAAATTATA--TAATTACAAAAT-T---TAT-T-TTAAA----CAACTAATTACATG-CAA-ATGATCATT---TAT-CTAAAATAT-----TTGTTGATCTTT----TAAT-----TG--CTATTAACGTCAgtc
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                ATTTAGGTACC-----CTA---T------------------TATTC-CTTA-----CA-AAC--TGTGTTTCTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--T-A-----TT--TA-TGA---A-TAGTTCAG-AAGTT------CTC-AA---AA--T--AAGC-TAAA-A-A-TG-A-------ATT-AA-A-----------GTGAATCTT-AAA--ATGAAATGAAATATTTGGAAAGCCCAt
gi|33                         :        GTTTTATTTTTAGCATATA------TGTCATACAGTATATAT----GCATA-----T------A---AT--A----TATG--TATTAACAAAAT-T---AAT-C-AAAAG----CAGCTAATTGCAT-----------CATT---TAT-CTAAATTAA-----CTATTGATCTA-----TACT-----TTA-CTATGAACATCACA
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taTA-T-AC---------ATGCACA-GATTC---------GAA----------------AA-TAG-TGCTT-A-A-GATTA-CAT-----TAAACAAGTTAAAC------TACTGTGCA-TTGAACTA-----A-AGTTATTCATATATA---------------------AATAAGTTGC--------TG--AAAACCATAAA--GGTTATTTACACAAGTGTA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                             ATTATAAATGTATCACAAAATTTCAGTATCGGTACCTA-------A-ATA-TCACTAT--TAAAA-CTGA-----CA-AAT--TAAGTATTTTATT---TTA---CTTGCAA--ACAC--TTA-----TTATTA-------A-TAGTTCAT-AATTT------GAA-A
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tGCACAAAACCTACTTAAACCATTAA--GGTGATTTATAAAAGTTCACAAAATG-TTTCTTGTTCTCCTCTTTTGAACATATCACCCCATGGATTGATTTGTGTTAATTATCTG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAATATATTAAAT-A-AATAAA-A----TAATCAAAAT-AGAATATTCCACAAGTA-CAATGCATTA-CTCTGACGT-------ATT------CAATTGAT------TA-----G-ATAtt
gi|39                         :        GTTTTCTTC--AGCATATA------TGTCATACAGTATATATCCGCACATA-----T------G--TAT--A----AATA--TATGGAGATAAT-TATGTGT-G-AACAA----CAaacatacattgaaaa
gi|4                          :                                                      ataTA-----C------A--AAT--G----TATG--TATTTA-AAAATAT---TAT-G-AAAAA----CAGCTGATTACATT-AGA-ATGAGCATG---TAT-CTGAAATAA-----TTATTGATCTGA----TATT-----TA--CTATTAACATCACAGAATGTCA-------------ACATAACTTAAGTACC-----TTA---T---C-ACAGTA----T--TAATC-CTTA-----CA-AAT--TTAGTTCCTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--TCA-----TTATTA-------A-TAGTTCAT-AATCT------GAA-AA---AAAAT--AAGC-TTAG-A-A-TTAA-------ATA-AA-A-----------GTCCATCTT-AAA--GTGTCATAAAATGTTTAGAAAGCCCGGTTAAGT---CCGAGGACC--TTTTTCCGCTG-GGGTTC------ACA----TAACGCGA-TTAAAAACATATTATTTGACACTAGCAATA-----AC----A-TACA-TT---ATTCTTTAAAAATGTATTAATT-A-AATAAA-A----TAATTAAAAT-AACATATTTCACAAGTA-TTGTAAATAA-CTTTGATTT-------ATT------TAATTGGT------TA-----T-GTATTA-T-AC---------AAGCACA-GATGC---------GAA----------------AA-TTG-TGCTT-A-ATG-TTA-CATGAAT-CAAGT----TAAAC------TAATGTGTA-TTGCACTT----TATAGTTAGTTACATATT---------------------TACAAGTTGCACAGATCCTACCAAAATCGTAAA--GGTTATTTATACAAGTTTAAAAAATG-TATCTTA-CTTTCTTTCTTGAACCTATCA----------TGATTT---TTAATTGTTTGATTTTTTTCAGGAAGAGTATTCCATATGACTAT-ACTT----A-----T----GTAAACAGTTGT-G------GACACATTGTGGAC
gi|41                         :        GTTTTATTC--AGCATACT------TGTCATACAGTATATAC----ACACA-----C------A--TGT-------------TATT---AAAAT-T---a
gi|42                         :    tagaGTTGTATTC--AGTATACA------TGTCAAACCGTATGTAT----ACA-----------------TAT--A----TCTG--TATTTata
gi|44                         :  tcagttaTTTTATTC--AGCATACATGTACATGTCATACAGTACATAT----ACA
gi|5                          :          taaATTC--AGCATATA------TCTCATACAGCACAAAT----ACATAATTATT------A--TAT--AAT--TATG--TATTTTTAAAAT-T---TAT-G-AAAAAAACCCAGCTAATTACATT-AAA-ATAATCATT---TAT-CTAAAATAA-----CTATTGACCTAT----CTTT-----TG--CCATGAACATCACA-------------------TCACAAAATTTCAGTACC-----TTA---T---C-ACAGTA----T--TAATC-ATTG-----CA-AAA--TTAGAATTTAACT---TTA---CTTA-AA--A-AC--TT-------TATTG-T-A---AATAGTTCAT-AAGTT------AAA-AA------------------------TGAA-------ATA-AA-T-----------GTGAATCTT-TAA--TTGACATGAATTGTTTGGAAAGCCCAGTTAAGT---CCGAGGACT--TATTTCCGCTG-GGGTC------CATA----TAACGCGA-TTAAAAAAAT--CCGTAGATACTAGCAATA-----AA----TTTATA-TC---ATTTTGTAAAAATGTATTATAT-A-A-AAAACA----TAATCA-------------TGAAAAG---TTATAAATAA-CTTTGATGT-------ATTGACATGTAAATGAT------TATAATTT-ATATTA-T-GCA--------A-GCACA-GATGCATATAACTGGAAATGTGTAAACCCACACAA-TAT-TGTTT-ACG-G-TTA-CATTAATCTA---G--TTAAAC------TAATGTACA-TTGTGC------TATAGTAAGTCACA---C---------------------TACAAGTTGCACAGACTCTACCACAACCATAAAAGGGTT
gi|6                          :         TTGTATTC--AGAATGGA------TGTCATACAGTATATAA----ACATA-----TACAAATG--TAT--A----TATA--T-TTTAAAAAAA-A---TAT-G-AAAAAAATCCAGCTAATAACATT-AAA-ATGATCATTAATTAT-CTGAAGTAA-----TTATTGATCTAT----ACTT-----GG--CCATGACTATCACAGAATGTCATTATA------TCACACATGTTCAGTACC-----TTA---C------CA-T-----T--GAA-------------A-ATT--TGAGTAACTTATT---TTA---CTTG-AA--A-AC--TTA-----TTATT--T-A-----TAGTTCAT-GAGTT-------AA-AA---AAA-T--CAGA-T-AA-ATA-TTAA-------ATA-AA-ACTTTTATAAACGTGAATTTT-AAA--ATGACATGAAATG-------------------T---CCGAGGACT--TATTTTCACTG-GGGTCC----ATATACTAGTAACATGA-TTTGGAAGTTATTCTTAGACACTAGCAATA-----AC----AAAAGT-TT---ATTTTTTAAAAATGAATTAAAT-TTA-TCAA-A----TAATCAAAGT-AACTGATTTCACAGATA-CTATCAGTAA-CTTCGATAT-------AAT------TAATCGGTTATTAGTA-----T-ATGTTA-T-ACA--------A-GCACA-AACAC---------GAA----------------AA--AA-TGCTTAA-G-A-TTA-CATTAAC-CAA--G--TTAAACAAAGTTTAATGTATA-TTGAACTA----
gi|7                          :        GTTTTATTC--AGCATACA------TGTCATACAGTATATAT----ACATA-----T------G--CATGAA----CAGG--AATTTACAAGAT-T---TGT-A-AAAAA----CAGCTGATTACATT-AAA-ATGATCATT---TAT-CCAAAATAA-----TTATTGACCTAT----TATT-----TT--CTATGAACATCACAGAATGTCATTATAAATGGATCACAAAATTTCAGTACC-----TCA---TC--ACAGA-A-----T--AAATC-CTAA-----CA-AAT--TGAGTATCTTATT---GTA---CTTG-GA--A-AC--TTA-----TCA-TA---A---A-TAGTTCAT-AAGTT------G-A-AA---AAA-T--AAGC-T-AAGA-A-TGAA-------ATA-AA-A-----------GTGAGTCTT-AAA--GTGACATGTAATGCTTGGAAAGCTGAGTAAAAT---CCGAGGA-TAATATTTCCACTT-GGGTCC---T---TA----TGACACGA-TTAAAAAACTACCTTTAGACACTAGCAATA-----AA----AATATA-TT---ATTCTTTAAAAATGTA-TGAATAA-A-GAAA-G----TGATCAAAAT-AACAAATTTCGCAAGTA-TTATGGATTA-CACTGATGT-------ATC------TAATTGAT------TA-----T-ATATTA--------------A-GCACA-TATGC---------AAgagtgaacctatcaagatattta
gi|8                          :         TTTTATTC--AGCATGCA------TGTCATACAGTAT-TAA----ACA
gi|8                          :                                                                                                                   AAA----CA---AATAACATT-AAA-ATGATCATT---TAT-CTAAAATAAAATATTTATTGATCTAT----TTTT-----TTTTCTATGAACATCACAGGATGCCATTACAAATGTATCACAACATGTCAGCACC-----TTAACAC---A-GTA-T-----T---ATTC-CTCA-----CA-AAT--TGAGTTTCTTATC---TGA---CTTG-AA--A-AAAATCA-----TTATTA-C-------TAGTTCGT-ATGTT------GAA-AAGTAAAA-T--AA-----AA-A-A--GAA-------ATA-AA-A-----------GGCAACCTG-AAA--GTGAAATTAAATGCTTGGAAAGCCCAGTAAAGT---CCTAGGACT--TATTTCCGCAGTGGGTT------CATA----TAACGGGA-TTAAAAAAAT--CTTTACACACTAGCAATATACCTAA----AATATA-TT---ATT-TTTAAAAATGTATTAAAT-------AA-A----T----AAAAT-AATATATCTGAC-GGCA-TTATGTATTATTTTTAATGT-------ATT------AAGCTGAT------TA-----T-ATATTA-T-ATA--------A-GCACA-GATGC---------GAaataacattaaaatgatcatttatctaaaataaaatatttattgatctatttttttttctatgaacatcacaggatgccattacaaatgtatcacaacatgtcagcaccttaacacagtattattcctcacaaattgagtttcttatctgacttgaaaaaaatcattattactagttcgtatgttgaaaagtaaaataaaaaagaaataaaaggcaacctgaaagtgaaattaaatgcttggaaagcccagtaaagtcctaggacttatttccgcagtgggttcatataacgggattaaaaaaatctttacacactagcaatatacctaaaatatattatttttaaaaatgtattaaataaataaaataatatatctgacggcattatgtattatttttaatgtattaagctgattatatattatataagcacagatgcga
gi|9                          :                                                                                  ttttattcagcatgcatgtcatacagtatt-AAAAA----AAGTTTATTACCTT-AAA-ACGATCATA---TGT-CTAAAATAG-----TTATTGATCTATA---CATT-----GC--CT-TGAATATCACAGAATGGCATT-T-----TATCA-AAAAGGTCA------------A---T---A-AC-----------TAATC-ATTA-----TG-ATT--TGAGTACCTTATT---TTA---CTTG-AATTT-AC--TTGAACACTTATAAGT-G---A-TATTTCAT-CAGCT------G-A-AT---GAA-T--AAGC-T-AA-A-ATTGAA-------ATATAA-AATTAT------GTGAATCTTAAAA--GTAAAATGAAATACTTGGAAAGCCATTTAAAGT---CCGAGGACT----TTTCCACTG-GGGTC------CATA----TGACGCGA-TTAAAACACTATCATTAGAGACTAGCAAT-------A----ACTACAGTTA--ATTATTTAAAAAAAAAC--AAC-A-A-CAAA-A----TAATT----C-AACATATTTCACA--TATTTTTAAATTA-CTTTGATAT-------TTT------TAATTGAT------TA-----T-ATA-TA-T-A