lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 66666666666666666666666666666666666666 222222222 11 1111 22222 333333 2222222 11111 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 44444444444444444444444444444444 111111111 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 22222222222222222222222222222222222222222222222222 11111 1111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111111111111111 111 1111 22222222222222222222 33333333333333333333333333333333333 1111111111111111 1111111 11111111111 111111111 111 111 333 33333 8888 22
lowQualScore : 5 66666666666666666666666666666666666666 66 222222222 2 7777 4 22 77 2 1111 44444 3 0 3 000000 33 9999999 2 2 33 44444 2 2 2 3333 33 0 2 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33333 2 2 3 77777777777777777777777777777777 1 55 1 444444444 4 3 4 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 8888 1 888888888888888 1 333 66666666 1 666 333 11 1 9999 333 22 333 22222222222222222222222222222222222222222222222222 4 2 22 00000 2 6666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 1 3333 3 1 1 1 88888888888888888888 1 1 222 333 22 0 222 2 3333 66666666666666666666 3 5 44 3 99999999999999999999999999999999999 55 1 3 3 3 2 8888888888888888 2 77777 1111111 888888 3 2 33333333333 7777777 2 3 3 222222222 3 5 5 111 888 4 3 555 99999 5555 11
lowQualScore : . ...................................... .. ......... . .... . .. .. . .... ..... . . . ...... .. ....... . . .. ..... . . . .... .. . . . ........................................................................................................................................ ..... . . . ................................ . .. . ......... . . . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ .... ...................................................................................................................................... .. .... . ............... . ... ........ . ... ... .. . .... ... .. ... .................................................. . . .. ..... . ....... ......................................................................................................................................................................................................... .. . .... . . . . .................... . . ... ... .. . ... . .... .................... . . .. . ................................... .. . . . . . ................ . ..... ....... ...... . . ........... ....... . . . ......... . . . ... ... . . ... ..... .... ..
lowQualScore : 4 22222222222222222222222222222222222222 99 555555555 0 7777 3 55 22 7 8888 66666 1 8 7 222222 77 0000000 4 4 22 22222 2 2 2 8888 11 1 7 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44444 0 0 2 99999999999999999999999999999999 9 88 9 555555555 1 2 0 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 9999 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 0000 6 111111111111111 7 777 33333333 7 888 000 22 7 4444 000 44 222 11111111111111111111111111111111111111111111111111 2 0 88 88888 1 4444444 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 77 5 8888 1 5 5 5 00000000000000000000 7 7 999 333 66 7 222 2 9999 33333333333333333333 6 9 66 3 88888888888888888888888888888888888 00 2 6 1 1 9 9999999999999999 9 11111 9999999 222222 2 9 66666666666 0000000 9 1 1 888888888 2 7 7 777 555 0 0 000 55555 0000 00
consensus : AGTGATGGTGACCAACGATCC-------------CCGA-------------TTTACCT-NA----CAGCCAATCAC----AAGCTTTCATTTTCACGTTAGAA-ATCTATACACANNA--TTTCATCAAAATA-TCTTATANACA--GAAA--A-CTGAA-GTTA-TTG-A--G-C---GA-A-AT-C--G-TTT--TTCTGT-TTTNAGTAACA--GNG----ATCT----TGACT----TT------ATC---------------C----G----TT--ANTC----TCAA------T---A----T--T-T--A-TT-------TT-C-N-T------G-N---A---GGAAGCCA-ATACA-CA-AAATGTC-ATCCAA----AT-NN--A-----T---T---A-A-GGAAA-AC---G-A--AGTTATTGA-GCGGAAACC-G-T-ATTT--TATT-T--AT---------C------AATTTTAT-GTAACAG---TGACC------TT---T--------G-C---CCGAT------T-A--ACC-----T--CA----N-AA----T----C----T-----CAA-----GCTTCCA--T--TT---CGTG--A--------T---A-GGAA--A---C---T------AT-ACA---------C-------------AA---A-------------GTT-----------T--C--------A------------AA-------------G-A------AA--C---T------A---N---AN----TTATTGAGC--G-GAAAC----C--NTT--T-TT--TCTAT----TTT-G--G-T---AACA--N-TGANCTT--GACCTTG----AC-C---NTATT-A-ACC-TT---G-A--A-A----T----C-------C--CAA--GA-------TT--CT-A--T-TT-T-ACAT--T-----A-GG--A--------A-C--ATA---TAC-NC-AAA-A--T---T--TC---ATNAAA-------A---AA----AT-NT-T--AAN-G-GAAAC---N--A--AAGTTATT-GA--G--N--GGA-AA-C--G--TTTT----T----TTCT-AT----T---AGTA-A--CAGN------G---------ACCATG-ACCCGATTT-A-C--CTTAAA----T--C-------AAA-TC--A--CT----A---G----AAGC-T-TCC-----TTTTCAT-G-T----A------T-AG-N-----A----NC-T-N-T---------A-----C---ACA--AA-ATT---TC-A-T-CAAAATA-T-CT----TA-A----A-AGAAA-C-T---AAAG---TT--ATCGAGC--GG-AAACT-N-TTTGCGG--CCTGCANCC-----GGGCA-TATNA--AAAAGGGG----------CAT--AA--------A-AAT---NNAGT--GCGGTGT-TGAAAT-T-CA-AT----------------C-CAATG-----CAAGGTCT------AG------TGATAAGC-AA-----------CCTTGTGTACAA----AT-TTAAAA-AG------AAAATAAT-TA-TGCAATAA---TTGCAAANGCTANTNTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAAT
Reference ( gi|1 ) : AGTGATGTTGACCAATTATCC-------------CCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCAC----AAGCTTTTATTTTCACGCTAAAA-ATATATATACATTA--TTTCATCAAAATA-TCTTATAGACA--GAAA--A-AGGAA-GTTA-TTG-A--G-C---GA-A-AT-T--G-TTT--TTCTGT-TTTGAGTAACA--GAA----ATCT----TAACT----TT------ATC---------------C----G----TT--ATTC----TCAA------T---A----T--T-T--A-TT-------TT-C-C-T------G-A---A---GGAAGCCA-ATACA-CA-AAATGTC-GTCCAA----AT-CA--A-----T---T---A-A-GGAAA-AC---G-A--GGTTACTCA-GCGGAAACT-G-TAATTT--TATT-T--AT---------C------AATTTTAT-GTAATAG---TGACC------TT---T--------G-C---CCGAT------T-A--TCC-----T--CA----T-AA----T----C----T-----CAA-----GCTTCCA--T--TT---CGTG--A--------T---A-GGAA--A---T---T------AT-ACA---------C-------------AA---A-------------GTT-----------T--C--------A------------AA-------------G-A------AA--C---T------A---C---AT----TTATTGAGC--A-GAAAC----C--CTT--T-TTA-TCTATG---TTT-G--A-T---AACA--T-TGAACTT--GATCTTG----AC-C---ATATT-A-ACC-TT---G-A--A-A----T----C-------C--CAA--GA-------TT--CT-A--T-TT-T-ACAT--T-----A-GG--A--------A-C--ATA---TAC-CC-AAA-G--T---T--TC---ATAAAA-------A---AA----AT-AT-T--AAC-G-AAAAC---A--A--AAGTTACT-GA--G--A--GGA-AA-T--G--TTTT----T----TTCT-ATA---T-A-AGTT-A--CAGA------A---------ACCATG-ACCCGATTT-A-C--CTTAAA----T--C-------AAA-TC--A--CT----A---GT---AAAC-T-TCC-----TTTTCAT-G-T----A------T-AG-C-----A----TC-T-C-T---------T-----C---ACA--AA-ATG---TC-A-T-CAAAATA-T-TT----TA-A----A-AGCAA-C-T---AAAG---TT--ATCGAGA--AG-AAACT-T-TTTGTGG--CCTGCAGCC-----GGGTA-TATCA--AAAAGAGG----------CAT--AA--------A-AAT---GGAGT--GCGGTGT-TGAAAT-T-CA-AT----------------C-CAATG-----CAAGGTCC------AG------TGATAGGC-AA-----------CCTTGTGTATAA----AT-TTAAAA-AG------AAAATAAT-TA-TGCAATAA---TTGCAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAATA
gi|5 : AGTAACAGTGACCA-TGA--C-------------CCAA-------------TTTAGCT-TA----AATCCAATCACTAGTAAGCTTCC-TTTTCAT-TTAAAGTATCTATACACAAAA--TTTCATCAAATTA-TCTT-TAA--A--GAAACTA-AAG-----TA-TCG-A--GAA---GA-A-AC-C--A-TTT--
gi|19 : atattgagcgaaatcgtttttctgttttgggtaacagtaatctgaactttatccgttattctcaaactttttattgatacaagaagcgaacatacaaaatgtcgtacaaatacattaaaggaaaacgaggctattaagcggaaactgttattgtatttatcaaatttatgtaatagggacctttgcccgattgacctaaaaatcccaagcttccatcccgtgataggaaattatacacaaagaaactacatttattgagcagaaacattttatctatatttggttacaatgaacttgatcttgaccttattaaccttgaaatccaaactttctatattacactaggaacatatacccaaagtttcataagaaaatattaacaaaaacaaaagttactgattttAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCAC----AAGCTTTCATTTTCACGCTAAAA--TCTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAGA--AAAA--A-ATGAC-GTTA-TTG-A--G-C---GA-A-AT-T--G-TTT--TTCTGT-TTTGAGTAACA--GTT----ATCT----GAACT----TT------ATC---------------C----G----TT--ATTC----TCAA------T---A----T--T-T--T-TA-------TT-T-A-T------G-C---A---AGAAGCCA-ACATA-CA-AAATGTC-GTTCAA----AT-AC--A-----T---TA--A-A-GGAAA-AC---G-A--AGTTACTAA-GCGGAAACT-G-CTATTT--TATT-G--AT---------C------AATATTAT-GTAgcggcctacatccgggcgtatcaaaaagaggcataaaaatgcagtgcggtgttgaaattcaatccaatgcaaggtctagtgataagcaaccttgtgtataaatttaaaaagaagataattatgcaata
gi|26 : tAGTAATGGGGACC---TGACC-------------TGGT-------------TTTACTG-AAATT-TAACCAATC-C----AACACTTGCTTTTCATATAAGGA-ACCTATACACACGA--TTTCATCAAAATA-TCTTAAAGA
gi|6 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggaaagttttaaagaaaacaagattaattaagcagaaaatatttcattctatttttAGTGATAGTGACCGAG-A--C-------------ACAT-------------TTTACCT-AAATTCCAG--AAC--C----AAACTTTCTTTTTCACGTTAGAA-ACCTACACACAAGC--CTTCATTAAAACT-TCTTA-A---A--GGAA--A-CTTAA-GTTA-CTG-ATTG-----GA-A-AC-T--A-TTT--TTTAAT-ATTTAGTAACA--GTG----ACAC----TGACC----TTA-----AAC---------------T----GC---TC--AACC----TCAA----------A----A--T-C--A-CT------------C-C------A-A---A---GAAAACT--ATAT--TG-AAATTTA-ATCAAAACATAT-TA--A-----TATAT---A-A-AGAGA-AC---A-T--GGTTATTCA-ACGGACACC-G-T--TTT--TA-A-T--AT---------CAAGTAAAATTTCAT-----------TGAAC------TT---G--------A-C---CTGAA------T-A--ATC-----T--CA----A-AA----CCAA-C----T-----GAA-----TGTTCCT--T--CT---C------------------A-GG--------T---T------AT-ACA---------A-------------AC---A-------------ATT-----------T--C--------AT-----------AA-------------A-A------AT--C---T------A---A---A----------------A-GAAAA----C--TAT--G-GT--TCTATGGTTTTT-G--AGTGAAAACAGTT-T---CTT--G-TAGTG----A------A-AGT-A-ACC-TT---G-ATCA-A----T----A-------A--CAATTTA-------CC--CT----T-TT-T-ATAT--T-----A-GA--T--------A-C--ATA---TAA-AC-AAA-ACCT---TTATCAAAATAAAA-------AACTAA----AT--T-T--ATC----AAGC---A--A--AA-----T-GA--A--AAGGGA-CA-T--AACTCAT----A----TTAT-ATA---T-C-AGTTAA--CAGT------T---------ATCATG-aaactaag
gi|15 : taaatatttccacttgatttGTGATGTTGACCAACTATCC-------------TCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCAC----AAGCTTTCATTTTCACGTTTAAA-ATCTTTATACAG-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATA-A--TAAA--TTATGAT-GTTA-TTT-A--G-C---AA-A-AT-T--G-TTT--TTCTGT-TTTGAGTATCA---AT----ACCT----GAAAT----TT------TTC---------------C----G----TT--ATTC----TCAA------T---C----T--T-TTTA-TT-------TA-C----------G-C---A---AGAAGCCA-ACATA-CA-AAATATC-GTTCAA----AT-AC--A-----T---T---A-AAGGAAA-AC---G-A--CGTTACTTAAGCGGAAACT-G-TTATTT--TATT-T--AT---------C------AATTTTAT-GTAAAAG---TGACC------AT---T--------G-C---CCGAC------T-G--ATC-----T--CA----A-AA----T----C----
gi|3 : TTC-------------CCAA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCAC----AA-CTTTCATTTTCACGCTAAAA-ATTTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAAA--GAAA--A-ATGAA-GTTA-TTG-A--G-C---GA-A-AT-T--G-TTT--TTTTGT-TTTGAGTAACA--GTA----ATCT----GAACT----TT------ATC---------------C----G----TT--ATTC----TCAA------T---C----T--T-T--C-TA-------TT-T-A-T------G-C---A---TGAAGACA-ACATA-CA-AAATGTC-GTCCAA----AT-AC--A-----T---TA--A-A-GGAAA-AC---G-A--GGTTACTAA-GCGGAAACT-GTTAATTT--T-TT-A--AT---------C------AATTGTAT-GTAATAG---GGACC------TT---T--------G-CCCGCCGAT------T-G--ACC-----T--CA----A-AA----T----C----G-----CAA-----GCTTCCA--T--TC---CGTG--A--------T---A-GGAA--A---T---T------AT-ACA---------A-------------AA---A-------------GTT-----------T--C--------A------------AA-------------G-A------AA--C---T------G---C---AT----TTATTGAGC--A-A-----------CTG--T-TTA-TCAATG---TTT-G--G-T---TACA--A-TGAACTT--GATTTTG----AT-C---TTATT-T-ACC-TT---G-A--A-A----T----C-------C--CAT--GA-------TT--TT-A--T-AT-T-ACAT--T-----A-GA--A--------A-C--ATA---TAC-CC-AAA-G--T---T--TC---ATAAAA-------A---AA----AT-AT-C--AAT-G-AA---------------------GA--G--A--GGA-AACT--A--TTAT----T----TT-T-ATT---T-T-AGTA-A--CAGT------G---------ACCATG-ACACGATTT-A-C--CTTAAA----T--C-------TAA-TC--A--CT----A---GT---AAGC-T-TCC-----TGTTCAT-G-T----T------A-AG-T-----A----TC-T-A-A---------A-----C---ACA--AA-ATT---CC-A-T-CAAAATA-T-CT----TG-A----A-AGAAA-C-T---AAAG---TT--ATCGAGA--AA-AAAAT-A-TTTGTGG--CCTGCATCC-----GGGCA-TATAA--AAAAGAGG----------CAT--AA--------A-AAT---GCAGT--GCGGTTG-TGAAAT-T-CA-AT----------------C-CAATG-----CAAGGTCT------AG------TGATAACC-AA-----------TCTTGTGTATAG----AT-TTTAAA-AG------AAAATAAT-TA-TGCAATAA---TTGCAAA
gi|13 : tatcctcaaagccatC-------------CCGA-------------TTAACCT-CA----AAACGAAT-AC----TA------ATTTTCATATTAGAA-ATCTATACACAAAG--TTTCATCGAACTA--CTTATGAACG--GAAA--A---TAATGTTA-TTG-A--G-CA--GA-A-AT-T--G-TTT--TCCTAT-TTC---TAACA--TAA----ATCttaagtaagtgctg
gi|7 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggGA-------------CTTATTT-CA----AAACCAATCCC----AAGC-TTCA-TTTCACACTGGGA-ACCTATACACAacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|2 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagagaccatgcctaACCT-AA-----AATAAATCA------AGCTTT-ATTTTCAGGATAGAA---ACATATACATTA--AAACATAAAAATG-TATTA-A---A--GGAA--A-CTGAA-ATTG-TTGCA--A-T---GA-T-ATCT--A-TTT--TT-GGT-TTT-ATTTACA--ATG----ACCT----TGACCG---TC------ATCAAAACTATGAGTAATC----T----TC--CTTT----TC-A------T---G----TTAT-T--A-AT-------TT-C-T-A------G-A---A---AAATGTCA-TGACA-C--AAATTTC-ATAAAA----ATACT--T-----T---T---A-A-GAAAA-AT---A-A--AGTTATCTA-GTGGAAACC-A-TAGTacggaaactgaagtaattgaacaaaaacaattcttctgtttatagtgactttgactagttaactataaatcaatgtcaaacttctttttcatgtaaacaacctttacacaaaatgacatcctgttatattaaaggaagttaccgagtggaaaccattttttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|13 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgACCTCAA----CA-CCACTCAT----AGACTTTCTTTTTTAT--TACAA-A-ACCTATACAATA--TGTTATCAAAATAATCTTACA--------AA--A-CTTAA-GTTA-T-G-A--A-C---GATA-AT-A--G-TGT--TTTTAT-TTGAAGCAACA--ATA----GTCG----TGGC---------------C---------------C----GA---TT--AACC----TCAAAACGAAT---A----C--T-A--A-TT-------TT-C-A-T------A-T---T---AGAAATCT-ATACA-CA-AAGTTTC-ATCGAACT--AC-TT--A-----T---G---A-ACGGAAA-AT---A-A--TGTTATTGA-GCAGAAATT-G-T--TTTCCTATT-T--CT----------------AA---CAT-A-AATCA---CGACC------T---------------------GGTG-----T-A---CT-----T--CAAAACT-AG----T----C----C-----CAC-----GCTTCCC--T--TT---CATA--A--------T---A-aacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|10 : aAATCCC----AAGATTCTATAAT-ACATTAGGA-ACATATACCCAACG--TTTCAT---AAT--TAGTATTAAC---GAAA--A-CAGAA-GTTA-CTG-A--G-A---GG-A-AA-C--G-TTT--TTTTTA-TTTTAGTAACA--Gtatataagttaggaaggggctataactcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|8 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaTTTCCTTTACATGTTTTGA-ATATATACAAATC---TTTCATCAAAATA-TGT----GTCA--GGAA--A-CTATA-GTTA-TCG-A--G-A---GA-A-AT-T--C-ATT--TCCCGtgacacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|12 : aaaccgttcttttcattttagtagtaaggatgctgaattaatgtcctcaacacttatcactggacttcctttttatgtaagcaacctaaccataatatccatcaatagggaaactcaagctattgagcggaaactttttgtagtgatagtgaccatgacccattatctcaattggtttttacatatttctttataataatttctttaaggaaactaactgtattgatcggaaactgactttctaaaaatgacattgaccttgactcgattattttcagtatatgaagtttccaattcgtactaggaacatgtgcatatatttctttcacaatatcttaaaggaaaataaaaaaaaatcaagtggaaacagttttaagcaacactgaccttgaaccagtatatttcttacgcaattccaggttagATATACATCAAACTTCATCAAAATA-TC-CATA---A--GAAA--A-CCAAA-GTTA-TCA-A--G-CA--GA-A-AT-C--A-TTT--cgcccgtttgggcatacaa
gi|14 : tactgtagccctagtatccTTTATCAAAATA-TC--ACAAAT---GAAA--A-CT----GTTA-TTA-A--G-CTTAGA-T-CT-TTCA-TTT--TTCTAT-TT--AATAACA--GTG----ATCT----TAAAT----GTGATGCAGTCTA-------------C----A----TC--ATGA----TCAA------TTGCAAGCTT--T-C--A-TT-------TC--------------A---ATTTGGAAGCCT-ATGCA-CA-AAATAAC-ATTAAG----AT-----A-----TC--T---G-A-ACAGATACT--T-A--AGTTATAGA-GTGGA--------AATTT--T-TT-T--A----------A------AATTTTAT--TAACAC---TGATT------TT---TTACTCTTGA-C---CCGAC------TAA--ACA-----T--CA------AA----T----CAATGC-----CAGATTTTGTTTTCA--T--TT---TCAA--A--------T---G-AACA--A---C---T------TC-ACATATGTTAATC-------------AAATTA-------------TTT-----------T--A--------A------------AA-------------G-A------AA--C---TTAAAAAG---A---AT----TTATTGAGA--A-GAAAC----T--Ccccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|7 : gaCCTATACACAACGGAA--A-CTGAA-GTAA-TTG-A--A-C---AA-A-AA-C--AATTC--TTCTGT-TTATAGTGAC------------TT----TGACTAG--TT------AAC---------------T----A----TA--AATCAATGTCAA----------A----C--T-T--C-TT-------TT-T-CAT------G-T---A---AACAACCT-TTACA-CA-AAATGAC-ATCCTG-----T-TAT-A-----T---T---A-A-AG---------G-A--AGTTACCGA-GTGGAAACC-----ATTT--TTTT-T--A------------------ATTCCA--ATAACAA---TGACCATGAC-TT---T--------G-A---CACATC-----T-A--ACC-----T--CA----A-AA----T----C----CA----CAA------CTTTAG--T--TT---TGTG--C--------T---T-AGAA--T---T---T----------CA---------T-------------AA---AAT-----------GTT-----------T--T--------A------------AG---------------------------------------------------TTACTGAGCTCA-GAAAC----T--TTT--T-TT--TCTATAA--TTT-GTAG-T---GACA--G--GAACC------CCTA----CT-C---A-ATT-A-ACC-TA---A-A--T-A----T----A-------C--TAA--GT-------TT--AC-A--T-TT-A-GCGT--G-----A-GG--A--------A-C--TTC---TAC-CT-AAA-A--C---T--TC------AGC-------A---AA----AT-AT-
gi|10 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagagaccatgcctagacttatttcaaaaccaatcccaagcttcatttcacactgggaaCA--GGAA--A-CTAAA-ACTA-TTG-A--G-CA--GA-A-AC-T--G-TTT--ATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATAT----TGACC----TT------ATTAA-------------C----T----TTGAAATC----CCAA------G---A----T--TCT--A-TA-------AT-A-C-A------T-T---A---GGAA--CATATACC-CA-ACGTTTC-AT---A----AT-TAGTA-----T---T---A-A-CGAAA-ACA--G-A--AGTTACTGA-GAGGAAACG-T-TTTTTT--TA--------------------------TTTTA--GTAACAG---TGACgagcatataaaaaa
gi|26 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttcA--GAAA--ACAAGA---TTAATTA-A--G-CA--GA-A-AA-T--A-TTTCATTCTAT-TTTTAGTAATG--GGG----ACCTGACCTGGTT----TT------A-C---------------T----GAAATTT--AACCAAT-CCAA------C---A----C--T-T--GCTT-------TT-C-A-T------ATA---A---GGAA-CCT-ATACA-CA-CGATTTC-ATCAAA----AT-AT--C-----T---T---A-A-AGAAA-AC---acaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|7 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggaaagttttaaA-ATTA-TTG-A--G-C---GG-ATAT-T--A-TCT--TTCTAT-TTT-AGTAACA--GAG----ACCA----TGCCTAGACTT------ATT---------------TCAAAA----CC--AATC----CCAA------G---C----T--T-C--A-TT-------TCACAC-T------G---------GGAA-CCT-ATACA-CA-A-----C------------------------------------GGAAA-CT---G-A--AGTAATTGA-ACAAAAAC-----AATTC--T--------T---------C------TGTTT-------ATAG---TGA-C------TT---T--------G-A---CTAGT------T-A--AC---------TA----TAAA----T----CAATGT-----CAA-----ACTTCTT--T--TT---CATG-----------T---A-AACA--ACC-T---T-------T-ACA---------C-------------AA---AATGACATCCT---GTTATA--------T--T--------A------------AA-------------G-G------A----------------------AG----TTACCGAGT--G-GAAAC----C--ATT--T-TT--TTTAAT---TCC-A--A-T---AACA--A-TGACCAT--GACTTTG----ACAC---AT-CT-A-ACC-TC---A-A--A-A----T----C-------CA-CA----A-------CT--TT-A--G-TT-T----------------------------------TG---TGC-TT-AGA-A--T---T--TC---AT-----------A---AA----AT-GT-T----------------T--T--AAGTTACT-GA--GCTC--AGA-AA-C--T--TTTT----T----TTCT-ATAATTT-GTAGTG-A--CAGG------A---------ACCCCT-ACTCAATTA-A-C--C-TAAA----T------------A-T---A--C----------T---AAGT-T-TAC-----ATTTAGC-G-T----G------A-GG-A-----A----CT-T-C-T---------A-----C---CTA--AA-ACT---TC-A-G-CAAAATA-T-taag
gi|5 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagTA-TTG-A--G-C---GA-A-AT-C--G-TTT--TTCTGT-TTTGGGTAACA--GTA----ATCT----GAACT----TT------ATC---------------C----G----TT--ATTC----TCAA----------A----C--T-T-----T-------TT-A-T-T------G-ATACA---AGAAGCGA-ACATA-CA-AAATGTC-GTACAA----AT-AC--A-----T---T---A-AAGGAAA-AC---G-A--GGCTATTAA-GCGGAAACT-G-TTATTG--TATT-T--AT---------C------AAATTTAT-GTAATAG---GGACC------TT---T--------G-C---CCGAT------T-G--ACC-----T--AA----A-AA----T----C----C-----CAA-----GCTTCCA--T--CC---CGTG--A--------T---A-GGAA--A---T---T------AT-ACA-----------------------------------------------------------C--------A------------AA-------------G-A------AA--C---T------A---C---AT----TTATTGAGC--A-GAAAC----A----T--T-TTA-TCTATA---TTT-G--G-T---TACA--A-TGAACTT--GATCTTG----AC-C---TTATT-A-ACC-TT---G-A--A-A----T----C-------C--AAA--CT-------TT--CT-A--T-AT-T-ACAC--T-----A-GG--A--------A-C--ATA---TAC-CC-AAA-G--T---T--TC---AT-AAG-------A---AA----AT-AT-T--AAC-A-AAAAC---A--A--AAGTTACT-GA---------------------TTTT------------------------AGTA-A--CAGT------G---------ACCATG-ACCCAATTT-A-G--CTTAAA----T--C-------CAA-TC--A--CT----A---GT---AAGC-T-TCC-----TTTTCAT-T-T----A------A-AG-T-----A----TC-T-A-T---------A-----C---ACA--AA-ATT---TC-A-T-CAAATTA-T-CT----TT-A----A-AGAAA-C-T---AAAG----T--ATCGAGA--AG-AAACC-A-TTTGCGG--CCTACATCC-----GGGCG-TATCA--AAAAGAGG----------CAT--AA--------A-AAT---GCAGT--GCGGTGT-TGAAAT-T-CA-AT----------------C-CAATG-----CAAGGTCT------AG------TGATAAGC-AA-----------CCTTGTGTATAA----AT-TTAAAA-AG------AAGATAAT-TA-TGCAATAgagcatataaaaaa
gi|8 : aA-A-AC-C--G-TTC--TTTTCA-TTTTAGTAGTA--AGG----ATGC----TGAAT----TA------AT------------------------------GTCC----TCAA------C---A----C--T-T--A-TCACTGGACTT-C-C-TTTTTATGTA---A---GCAACCTA-AC----CA-TAATATC----CA------T-CA--A-----T---------A-GGGAA-AC---TCA--AGCTATTGA-GCGGAAACT---------------------------------------TTTTGTAGTGATAG---TGACC------AT---G--------A-C---CC-AT------T-A--TC------T--CAAT--T-GG----T----T----T---------------TTACA--TATTT---CTTT--A--------T---A-ATAA--T---T---T-------------------------------------------------------CT-----------T--T--------A------------AG-------------G-A------AA--C---T------A---A---CT----GTATTGATC--G-GAAAC----TGACTT--T-CTA-AAAATG-----------------ACA--T-TGACCTT--GA-CTCG----AT------TATT-------TT---C-A--GTA----T----A-------T--GAA--GT-------TT--CC-A--A-TT-C-GTAC--T-----A-GG--A--------A-C--ATG---TGC-AT-ATA----T---T--TC---TTTCAC-------A---AT----AT-CT-T--AAA-GGAAAAT---A--A--AAAAAAATCAA--G--T--GGA-AA-CA-G--TTTT----------------------A-AGCA-A--CACT------G---------ACCTTG-AACCAGTAT-A-TTTCTTACG-------C-------AAT-TC-----CA----G---GT---TAGT-T-TCC-----TTTACAT-G-T----T------T-TG-A-----A----TA-T-A-T-------------------ACA--AATCTT---TC-A-T-CAAAATA-T-GT----GT-C----A-GGAAA-C-T---ATAG---TT--ATCGAG---AG-AAATT-CATTT------CCCGC-GCCCGTTTGGGCA-TA-CA--A
gi|2 : ----TCAA------G---C----T--T-T--A-TT-------TT-C-A-G------G-A---T---AGAAACAT-ATACATTA-AAA---C-ATAAAA----AT-GT--A-----T---T---A-A-AGGAA-ACT--G-A--AATTGTT---GC---AATG-A-TA--TC--TATT-T---T---------T------GGTTTTAT-TT-ACAA---TGACC-------T---T--------G-A---CCG-------------TCA-----T--CA------AA----A----C----TATGAGTAA-----TCTTCCT--T--TT---CATGTTATTAATTTCT---A-GAAA--AATGT---C------ATGACA---------C-------------AA---A--------------TT-----------T--C--------A------------TA-------------A-A------AA------T------A---C---TT----TTA
gi|16 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaa---A----T--T-T--C-GT-------TT-C------------A---A---GAAA---A-ATATA-CATAAA---C-TTTCAA-----T-TA--ACTGTTT---T---A-A-AGAAA-ACTTAG-ACCGGTTATTGA-GCAGAA----------TT--TATT-T--TT---------C------TATTTT-T-CTTACAG---TGACCATGGCATT---G--------G-G---CTGTT------A-A--ACC-----T--CG----C-AG----T----T----T-----CGA-----ACTTCTA--T--TT---CAGG--T--------TG--A-AAAA--A---C---T------AT-ACA---------C-------------Aagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|25 : tcc----T--T-T--G-TT-------TT-C-A-T------G-T---T---GGAAACAT-ATACA-CA-AA-TGTCTATTCAA----AA-TG--G-----T---T---ACA-GGAAT-CT---A-A--AGTTATGAA-GAAGAAA-T-G-TA---------T-T--AT-------------------TTTA--GTAACAA---TGACC------TT---G--------A-C---CCAAA------T-A--ACC-----T--AA----A-AAACATT----C----T-----GAA-----TCTTCC---T--TTGAATGTG--A---------------GAA--A---C---TTTGGACAT-ACAACATTTCATC-------------AA---C-------------GTA-----------TAAC--------A------------AA-------------GAA------AA--C---T------A---C----C----TTACTGAGT--T-GATAC----CG-CTT--T-Tctattttacaaatatatcgtacaggaaactgtcattgttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|10 : c-------TT-C-CGT------G-AT--A---GGAA---A-GTATA-CA-AAAAGTT--TCCA------------------------------GGAAA-CT---A-A--AACTATTGA-GCAGAAACT-G-T----T--TATC-T--ATGCTTGGTTAC------AATGA-AT-TTGATAT---TGACC------TT---------------------AT------T-A--ACT-----T--TG----A-AA----T----C----C-----CAA-----GATTCTA--TAATA---CAT------------T---A-GGAA--C---A---T------AT-ACC---------C-------------AA---C-------------GTT-----------T--C--------AT-----------AATTAGTATTAAC--G-A------AA-------------A---CAGAAG----TTACTGAGA--G-GAAAC----G--TTT--T-T---TTTAT----TTT-A--G-T---AACA--G-TGAg
gi|13 : cttccaAAACC---TATA-CA-ATATGTT-ATCAAA----AT--A--A-----TCT-T---A-C---AAA-AC---TTA--AGTTA-TGA-ACGATAATA-G-TGTTTT--TATT-TGAAG---------C------AAC--------AATAG---T---C------GT---G--------G-C---CCGAT------T-A--ACC-----T--CA----A-AA--------------------CGA-----A-TACTAATT--TT---CATA--T--------T---A-GAAA--T---C---T------AT-ACA---------C-------------AA---A-------------GTT-----------T--C--------ATCG---------AACTACTTATGAACGG-A------AA--A---T------A-------ATG---TTATTGAGC--A-GAAAT----T--GTT--T-T---CCTAT----TTC------T---AACA--T---AA------ATCACG----AC-CTG-GTGT----ACT-TC---A-A--A-ACTAGT----C-------C--CAC--GC-------TT--CC-C--T-TT----CAT--------------A--------A-T--ATA---TAT-----AA-G--T---T--cacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|31 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaAACCA-CTATA-CA-CAATGTT-ATCAAA----AT-----A-----T---CTCAA-A-GGAAC-TT---A-A--AGCTATTTA-CCATAAACCAG-TTATTC---ATT-T--AT---------C------AA--------CAATGGCATTGACC-------T---T--------G-A---CCGAT------T----TCC-----T--TA----A-AA----C----C----aggaaggggctataactcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : taaagctccgtgtcatgttagc-CA-AAATATC-A--CAA----AT------------------------GAAA-AC---T-----GTTATTAA-GCTTAGATC------TTT--CATT-T--TT---------C------TATTTAAT---AACAG---TGATC------TTAAAT--------G-T-----GATGCAGTCT-A---CA-----T--CA----T-GA----T----CAAT-TG----CAA-----GCTTTCA--T--TT---CA----A--------T---TTGGAA--G---CC--T------AT-GCA---------C-------------AA---A-------------ATA-----------A--C--------ATT----------AA-------------G-ATATCTGAA--CAGAT------A---CTTAAG----TTATAGAGT--G-GAAAT----T---TT--T-TTA----AAA---TTT-T--A-TT--AACA--C-TGATTTTTTACTCTTG----AC-C---CGACT-A-AAC-AT---C-A--A-A----T----CAATG---C--C-A--GA-------TT--TT-G--T-TT-T--CAT--TTTCAAA-TG--AACAACTTCA-C--ATATGTTAA-TC-AAA-T--T---A--TT---TTAAAA-------G---AA----AC--T-T--AA----AA------A--G--AATTTATT-GA--G--A--AGA-AA-aactgcaagaatgttttgttttatattaata
gi|26 : gatttat-----T---T---A-A-AGAAA-AC---A-A--GATTAATTAAGCAGAAAAT-----ATTT--CATTCT--AT------------------TTTTA--GTAATGG---GGACC------T-------------GAC---CTGGT------T-T--TAC-----T--GAAATTT-AA----C----CAAT-C-----CAAC----ACTTGCT--T--TT---CAT---A--------T---AAGGAA--C---C---T------AT-ACA---------C-------------AC---G-------------ATT-----------T--C--------A------------ctc
gi|36 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggaaagttATTTTA--GTAGCAT---TTTCT------TT---A--------A-C---CAGAT------T-A--ACC-----C--TA----A-AA----CA---C----T-----TA------GTTTCCC--T--TT---CGTG--T--------T---A-TCAA--C---C---T------TT-ACA---------C-------------AA---A-------------GTT-----------T--C--------ATCAAACATCATGAA-------------G-A------AA--T---T------A---A---AG----TTATAGAGtcaaaatatcttaaagaaaactaag
gi|37 : ct-GTAACAT---TGACT------GT---G--------A-C---CTGAT------T-AGGTACACATAT--CA----T-AA----TTATAC----T-----CAA-----AACTCCA--T--------GT------------T---A-GGAA--C---T---T------GA-ACA---------CCACATTTCCTCCAAA---A-------------GTT-----------T--T--------A------------AAA------------G-A------AA--C---T------G---C---AG----TTATa
gi|19 : taacaCC------AT---T--------A-C---CCGAT------T-T--ACC-----TGACAGC--C-AA----T----C----A-----CAA-----GCTTTCA--T--TTT--CACG--C--------T---A---AA--A---TCTAT------AT-ACATATTTCAT-C-------------AA---A-------------ATA-----------T--CTTATATAGA------------AA-------------A-A------AA--T---G------A---C---GT----T-ATTGAGC----GAAAT----T--GTT--T-TT---CTGT----TTT-G--AGT---AACAG-T-T--ATCT--GAACTT-------------TAT-----CCGTT--------A-T----T----C-------T--CAA--TA-------TT--TTTA--T-TTAT-GCAA--G-----A-AGCCA--------A-C--ATA--------C-AAA-A--T---G--TC---GTTCAA-------A---TA-----C-AT-T--AAA-GGAAAAC---G--A--A-GTTACT-AA--G--C--GGA-AACT--G--CTAT----T----TT
gi|31 : tagtgatgttgaccaatgatcctcaaagAA-----GCT-CCG--T--GT---CATG--T--------T---A-GCAACCA---C---T------AT-ACA---------C-------------AA---T-------------GTTATCAAAATATCT--C--------A------------AA-------------G-G------AA--C---TT-----A---A---AG----CTATTTACC--A-TAAAC----CAGTTA--T-TCA-TTTAT-------------C---AACA--A-TGGCATT--GACCTTG----AC-CG--AT-TT----CC-TT---A-A--A-A----C----CAA-----CTGCAA--GAATG----TT--TT-G--T-TT-T-ATAT--T-----A-attgatcaatattatgta
gi|10 : taCTTCCA--T--TC---CGTG--A--------T---A-GGAA--A---G---T------AT-ACA---------A-------------AA---A-------------GTT-----------T--C--------C------------AG-------------G-A------AA--C---T------A---A---AA----CTATTGAGC--A-GAAAC--------TG--T-TTA-TCTATG---CTT-G--G-T---TACA--A-TGAATTT--GATATTG----AC-C---TTATT-A-ACT-TT---G-A--A-A----T----C-------C--CAA--GA-------TT--CT-A--T-AA-T-ACAT--T-----A-GG--A--------A-C--ATA---TAC-CC-AAC-G--T---T--TC---AT--AA-------T---TA----GT-AT-T--AAC-G-AAAAC---A--G--AAGTTACT-GA--G--A--GGA-AA-C--G--TTTT----T----TT-T-ATT---T-T-AGTA-A--CAGata
gi|16 : TCCA--T--TT---CGT------------TTCAA-GAAA--A---A---T------AT-ACA---------T-------------AA---ACTTTCAATTAACTGTT-----------T--T--------A------------AA-------------G-A------AAACT---T------AGACC---GG----TTATTGAGC--A-GAA---------TTTA-T-TTT-TCTAT----TTT-T--C-T---TACA--G-TGACCAT--GGCATTG----GG-C----TGTTAA-ACC-TC---G-C--A-G----T----T-------T--CGA--AC-------TT--CT-A--T-TT-C-AGGT--TGA---A-AA--A--------A-C---TA---TAC-AC-ACT-A--T---T--TT---ACAAAtgacacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|14 : ---T---T------AT-------------C-------------AA---A-------------ATA-----------T--C--------ACA----------AATG-----------A-A------AA--C---T------G-------------TTATTAAGC--T-TAGAT----C--TTTCAT-TTT-TCTAT-----TT-A--A-T---AACA--G-TGATCTT--AAATGTG----ATGC---AGTCT-ACATC-AT---G-ATCA-A----T----T-------G--CAA--GC-------TT--TC-A--T-TT-C-A-AT--T-----T-GG--A--------AGC--CTA---TGC-AC-AAA----------------ATAACATT-----A---AG----AT-AT-CTGAAC-A-GATAC---T--T--AAGTTATA-GA--G--T--GGA-AA-T--T--TTTT----TAAAATTTT-AT----T-A-A--C-A--CTGATTTTTTA---------CTCTTG-ACCCGACTA-A-A--C----A----T--C-------AAA-TC--A--AT----G---CC---AGAT-T-TTG-----TTTTCAT-T-TTCAAA------TGAA-C-----A-------A-C-T---------T-----C---AC---AT-ATG---TTAA-T-CAAATTA-T-TT----TA-A----A-AGAAA-C-TTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AG-AAACT-tatatcgtacaggaaactgtcattgttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|26 : gat-------------AA---A-------------GTT-----------T--T--------A------------AA-------------G-A------AAA-C---A------A---G---AT----TAATTAAGC--A-GAAAA----T--ATT--T-CAT-TCTATT---TTT-A--G-T---AATG----GGGACCT--GACCTGGTTTTAC-TGAAAT-TT-A-ACC-----------A-A----T------------C--CAA--CA-------CTTGCT----T-TT-C-ATAT--A-----A-GG--A--------A-C--CTA---TAC-AC-ACG-A--T---T--TC---AT-CAA-------A---AT----AT-CT-T--AAA-G-AAAAC---T--A--Ac
gi|17 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtgg-------------AA---AT------------GTC-----------T--T--------AC-----------AG-------------G-A------AA--C---T------A---A---ATAAAGTGACTGAGC--A-GAAACGTATT--CTT--T-TT-----------TTT-A--A-TT--AATA--A-TGCCCTTT-GACAATG----AC-T---CCATT-T-ACC------GCA--A-A----T----CAAACCCAC--CAA--CA-------TT--TC-T--T-TC-A-ATGT--T-----A-GG--A--------A-CTTATA---TAC-C---AA-A--T---T--TC---ATAAGA-------A---g
gi|33 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaattacgcagaatttcttggT-----------T--A--------A------------AG-------------G-A------GA--C---T------T---G---AT----TTATTGAGA--G-GAAAC----A--TTT--T-TT--TCTA-A---TTTAA--A-T---AACA-----GACCTT--GAATGTG----AC-C---CGATT-T-ACC-T------A--A-A----TTCAAT-------C--CAA--AA-----------CT-G--TCTT-T-ATAT--T-----tatctcgaaaggaaccatccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : aaatg--------A------------AA-------------G-A------GA--T---TC-----A---G---AG----TT-TTAGGG--A-GAA-C----C--GTT--T-TTT-TCTATT---TTT-A--G-T---AA---------------GGC--TG----AC-C-------T-A-AAA-T------A--A-A----T----C-----------AA--GC-------TT---T-A--T-TT-T--CAGGAT-----A-GA--A--------A-C--ATA---TACATT-AAA-A----------C---ATAAAA-------A---TG-----T-AT-T--AAA-G-GAAAC---T--G--AAATTGTT-GC--A--A--TGA-TA-TCTA--TTTT----TGG--TTTT-AT----------TT-A--CA---------------------ATG-ACC---TTG-A-C--CGTCA-----T--C-------AAA-----A--CT----ATGAGT---AATC-T-TCC-----TTTTCAT-GTT----AT-----T-A--------A----TT-T-C-TAGAAAAATGT-----CATGACAC-AA-ATT---TC-A-T-AAAAATACT-TT----TA-A----G-AA-AA-A-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GG-AAAC-----------------CA-----------TAGTAACA--AATAAAGG----------AGT--AT--------A-ACT---TGCGT--AACATATATGATAT-A-CA-AT----------------C-CCTTG-----CAAGATCT------AG------TAATGAAC-AT-----------TATTGTGTACAA----AT-TTGCAA-AA------AAAATttcatgtattatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|17 : ataattcat---C---AT----ACATTGTGC--AAGAAAC----A--GTT--TGTCAGTGCAGG---TTT-GG-A-T---AAAA--TCTGAA-----GGTCTT--------T---GTATG-A-TCT-TTTCTG-A---------T----C-------T--T----GA-------TT--TA-A--T-TT-A-ACA---------A-AT--A--------A-A--ATA----AT-CC-AAA-A--T---T--AC---GCAGAATTTCTTGG---AA----AT-GTCT--TACAG-GAAACTAAAT-A--AAGTGACT-GA--G--C--AGA-AA-C--G--TATT----C----TTTT-TTT---T-A-A-TT-A---ATA------ATGCCCTTTGACAATG-ACTCCATTT-A-C--CGCAAA----T--C-------AAACCC--A--CC----A---AC---A----T-TTC-----TTTCAAT-G-T-----------T-AG-G-----A----AC-T-TAT---------A-----T---ACC--AA-ATT---TC-A-T-AAGAATA-T-CT----CG-A----A-AGGAA-C-C---Acgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|36 : CTAT----TTT-A--G-T---AGCA--T-T----TT----CTTTA----AC-C---AGATT-A-ACC-CT---A-A--A-A----C----A-------C--TTA--GT-------TT--CC-C--T-TT-C-GTGT--T-----A-TC--A--------A-C--CTT---TAC-AC-AAA-G--T---T--TC---ATCAAA-------C---A-----------T--CAT-G-AAGAA---ATTA--AAGTTATA-GA--G--A--tccactgttgaatatcaaagatc
gi|4 : --GATCTAA----AC-C---AGATT-A-ACG-TT---A-A--A-A-----------------C--CAA--TC-------TT--CC----T-TT-T-CTAT--C-----A-GA--A--------A-T--TTA---TAA-ACGAAA-A--T---C--TC---ATGAGA-------TT--AC----CT-TT-T--AA--G-GAAAC---T--T--AAGTCATT-GT--G--C--TAA-AA-C-----TATT----T----TTCT-AT-----------------------------------------G-ACCTGATTT-A------TA----------------------C-----CT----A---G-------C-T-TCC-----CTTTCAT-G-T-----------T-AGGT-----A----TC-T-A-TA--------T-----A---ATC--AA-GTG---TC-A-C----AACA-T-CT-----------------AA-C-T---CAAG---TT--ATCAAGT--GG-AAATT-A-TTTCCTG--CCATCAGCT-----GGGTG-TATAAGAAAAAGGGG----------AAT--AACCTATGTCA-AATTTCATAG---GCAGTTT-TGAAAT-T-CA-AT----------------CACAATGTCATGCAAGATGT------AG------TGACAGGC-AA-----------CCTTATGCA-AT----ATCTTAAAA-AG------AA
gi|13 : TCGTG----GC-C---CGATT-A-ACC-TC---A-A--A-A--------------------CGA---A-------TA--CT-AATT-TT-C-ATAT--T-----A-GA--A--------A-T--CTA---TAC-AC-AAA-G--T---T--TC---ATCGAA-------CT--AC----TT-AT-G--AAC-G-GAAAA---T--A--ATGTTATT-GA--G--C--AGA-AATT--G--TTTTCCTAT----TTCT-A--------------A--CATA------A---------ATCACG-ACCTGGTGT-A-C--TTCAAA-----------------------A--CT----A---GTCCCACGC-T-TCC-----CTTTCATAA-T----A------T-Atcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|6 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagG----ACAC---ATTTT-A--CC-T------A--A-A----T----T-------C--CAG--AACCAAACTTT--CT-T--T-TT-C-ACGT--T-----A-GA--A--------A-C--CTA---CAC-AC-AAG-C--C---T--TC---ATTAAA-------A---CT-----T-CT-T--AAA-G-GAAAC---T--T--AAGTTACT-GA--T--T--GGA-AACT--A--TTTT----T----TAAT-AT----T-T-AGTA-A--CAG---------------------TG-AC---ACTG-A-C--CTTAAACTGCT--CAACCTCAAAA-TC--A--CTCCAAA---GA---AAAC-T-tataagttaggaaggggctataactcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|19 : taaatatttccacttgatttagtgatagtgaccga--A-A----T----C-------A--CAA--GC-------TT--TC-A--T-TT-TCACGC--T-----A-AA--A--------T-CT-ATA---TAC-AT-A------T---T--TC---ATCAAA-------A---TATCTTAT-AT-----A--G-AAAAA---A--ATGACGTTATT-GA--G--C--GAA-AT-T--G--TTTT----T----CTGT--TT---T-G-AGTA-A--CAGT------T---------ATC-TG-AAC---TTT-ATC--CGTTAT----T--C-----------TC--A--AT----A-------------T-TTT-----TATTTAT-G-C----AAGAAGCC-AA-C-----A----T--------------------------ACA--AA-ATG---TC-G-T-TCAAATA-C-AT----TA-A----A-GGAAA-A-C---GAAG---TT--ACTAAGC--GG-AAACT-atattgaaatttaatcaaaacatattaatatataaagagaacatggttattcaacggacaccgtttttaatatcaagtaaaatttcattgaacttgacctgaataatctcaaaaccaactgaatgttccttctcaggttatacaaacaatttcataaaaatctaaaagaaaactatggttctatggtttttgagtgaaaacagtttcttgtagtgaaagtaaccttgatcaataacaatttaccctttttatattagatacatataaacaaaacctttatcaaaataaaaaactaaatttatcaagcaaaatgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|13 : tagtgatgttgaccaatgatcctcaaagccattacccgatttacctgacagccA--GA-------CT--TT-C--T-TT-T-TTAT--T-----ACAA--A--------A-C--CTA---TAC----AAT-A--T---G--TT---ATCAAA-------A---TA----AT-CT-T--A-C---AAAAC---T--T--AAGTTA-T-GAACG--A--TAATAG-T--G--TTTT----T----ATTT-G-------A-AGCA-A--CAAT------A---------GTCGTG-GCCCGATTA-A-C--CTCAAA----A--C-------GAA-T---A--CT----A---A-------------------TTTTCAT-A-T-----------T-AGAA-----A----TC-T-A-T---------A-----C---ACA--AA-GTT---TC-A-T-CGAACTA-C-TTA---TG-A----ACGGAAA-A-T---AATG---TT--ATTGAGC--AG-AAATT-G-TTTgctattttattgatcaatattatgta
gi|25 : aacctcaacaccactcat--T-TT-C-ATGT--T-----G-GA--A--------A-C--ATA---TAC-AC-AAATG--TCTAT--TC----------------A---AA----ATGGT-T--ACA-G-GAATC---T--A--AAGTTATG-AA--G--A--AGA-AA-T--G--TATT----A----TTTT-----------AGTA-A--CAAT------G---------ACCTTG-ACCCAAATA-A-C--C-TAAA---------------AAA--C--A--TT----C---TG---AATC-T-TCC-----TTTGAAT-G-T----G--------AG-A-----A----AC-T---T---------TGGACAT---ACA--AC-ATT---TC-A-T-CAACGTA-T-AA----CA-A----A-GAAAA-C-T---Atcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|26 : ctttgt-------A---AA----GT-TT-T--AAA-G-AAAAC---A--A--GATTAATT-AA--GC-A--GAA-AA-T--A--TTTC----A----TTCT-ATT---T-TTAGTA-A--TGGG------G---------ACC-TG-ACCTGGTTT-T-A--CTGAAA----T--T-------TAA-CC--AATCC----A--------ACAC-T-TGC-----TTTTCAT-A-T----A------A-GG-A-----A----CC-T-A-T---------A-----C---ACA--CG-ATT---TC-A-T-CAAAATA-T-CT----TA-A----A-GAAAA-C-T---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|33 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtgg---AA----AT-GT-T--AAA-G-GAGAC---T--T--GATTTATT-GA--G--A--GGA-AA-C--A--TTTT----T----TTCTAATT---T-A-AATA-A--CAGACCTT--G---------AATGTG-ACCCGATTT-A-C--CTAAAT----T--C-------AAT-CC--A-----------------AAAC-TGTCTTTATATTTTCAT-G-T----A------T-g
gi|11 : T----T----TTCT-GT----T----GTT-AACCAGT------G---------ACCATG-ACC-GGTTT-C-T--CTCAAA----T---------------------------A---G----AAGT-T-TCG-----TTTTTAT-T-T-----------T-AGAC-----A----TA-TAC-C---------TGTATAC---ACA--AA-ATT---TT-A-T-CAAATTA-T-CT----TA-A----C-GGCAA-C-T---AAAA---AT--ATTGAGT--AG-AAACT-A-TTTCTCGTTCCTGC--CT-----GGATA-ACTC-----ATGTAG----------CAT----------------T---ATAGT--GCAGTAT-TGAAAT-T-CA-ATCTTGTAACATACGAGCC-TAAAG-----TAAAATCCCATACAAGGCTTTATGATGAAC-GA-----------CCATGTGTAC-------T-TTGAAA-AG-----------AAT-TG-TGCACTAT---TTGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|16 : g----TTCT-ATT---TCA-GGTT-G--AAAA------A---------ACTATACACACTATTTTA-C-----AAA----T----------ATA-TCGTA--C-----A---GG---AAAC-TGTCA-----TTGTTGG-G-T----A------T-AG-TTATGTG----TA-T-T-T---------G-----C---ACG--TG-ATT---CC-A-T-CAAAATG-TCTT----TACG----A-A--AA-C-T---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAACA-T-TCCGC-G--CCTACACAA-----GGGCT-TATGA--AAAAGGGGA---------CAT--Attggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|6 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaac-AGTG-A--TAGT------G---------ACCGAG-ACACATTTT-A-C--C-TAAA----TTCC-------AGA-----A--C----------C---AAACTT-TCT-----TTTTCAC-G-T-----------T-AG-A-----A----AC---C-T---------A-----C---ACA--CA-A-GCCTTC-A-T-TAAAACT-T-CT----TA-A----A-GGAAA-C-T---TAAG---TT--ACTGATT--GG-AAACTAT-TTT
gi|19 : taaatatttccacttgatttA------A---------GCCATT-ACCCGATTT-A-C--CTGACA----G--C-------CAA-TC--A--C--------------AAGC-T-TTCA----TTTTCAC-G-C-----------T-AA-A-----A----TC-T-A-T---------A-----T---AC---AT-ATT---TC-A-T-CAAAATA-T-CTTATATA-G----A-AAAAA-A-T---GACG---TT--ATTGAG---CG-AAATT-G-TTTttaatatttagtaacagtgacactgaccttaaactgctcaacctcaaaatcactccaaagaaaactatattgaaatttaatcaaaacatattaatatataaagagaacatggttattcaacggacaccgtttttaatatcaagtaaaatttcattgaacttgacctgaataatctcaaaaccaactgaatgttccttctcaggttatacaaacaatttcataaaaatctaaaagaaaactatggttctatggtttttgagtgaaaacagtttcttgtagtgaaagtaaccttgatcaataacaatttaccctttttatattagatacatataaacaaaacctttatcaaaataaaaaactaaatttatcaagcaaaatgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|15 : tagtgatgttgaccaatgatcctcaA------A---------GCAATG-TCACAATTT-A-C--CTGACA----G--A-------CAA-TC--A--C--------------AAGC-T-TTCA----TTTTCAC-G-T----T------T-AA-A-----A----TC-T-T-T---------A-----T---ACA--GA--TT---TC-A-T-CAAAATA-T-CT----TA-ttctgttttgagtaacagttatctgaactttatccgttattctcaatatttttatttatgcaagaagccaacatacaaaatgtcgttcaaatacattaaaggaaaacgaagttactaagcggaaactgctattttattgatcaatattatgta
gi|36 : gtgatgttgaccaactatcctcaTA-ACCAGATTA-A-C--CCTAAA-----------------A--C--A--CTT---A---GT--------T-TCC-----CTTTCGT-G-T-----------T-AT-C-----A----AC-C-T-T---------TA----C---ACA--AA-GTT---TC-A-T-C-AAACA-T-CA----T--G----A-AGAAA-T-T---AAAG---TT--ATAGAGA--tataataaattatgatgttatttagcaaaattgtttttctgttttgagtatcaatacctgaaatttttccgttattctcaatctttttatttacgcaagaagccaacatacaaaatatcgttcaaatacattaaaggaaaacgacgttacttaagcggaaactgttattttatttatcaattttatgtaaaagtgaccattgcccgactgatctcaaaatc
gi|10 : ctattttagtagcattttctt-------AAG-TT--A--CTGAG-A---GG---AAAC-G-TTT-----TTTTTAT-T-T-----------T-AG-T-----A----AC-A-G-T---------GA----C---ACA--AA-ATT---TC-G-T-AAAATTA-A-CT----TA-A----A-AGAAA-C-T---AAAG---TT--ATCGAGATAAG-AAACT-A-TTTGTGT--CCTGCATCC-----AGGTA-TAT-A--AAAAAAGG----------CAT--AA--------A-AAT---GAAGT--GCGGTGT-AGAAAT-T-TA-AT----------------C-CAATG-----CAATGTCT------AA------TGATAAGC-AA-----------TATTGTGTATAA----AT-TTAAAA-AG------AAAAT-AT-TA-TGCAATAA---CTGCAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAAT
gi|8 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagA-TC--A--CT----G---G------AC-T-TCC-----TTTTTAT-G-T----A--------AG-C-----A----AC---C-TAA-------C-----C---ATA--AT-AT----CC-A-T-CAA-------------TA-G----G--GAAA-C-T---CAAG---CT--ATTGAGC--GG-AAACT-T-TTTGTAG--
gi|31 : aaaccgttcttttcattttagtagtaaggatgctgaattaatgtcctcaacacttT---AAAG-C-TCC-----GTGTCAT-G-T-----------T-AG-C-----A----AC-CAC-T---------A-----T---ACA--CA-ATG---TT-A-T-CAAAATA-T-CT----CA-A----A-GG-AA-CTT---AAAG---CT--ATtgatagtgaccatgacccattatctcaattggtttttacatatttctttataataatttctttaaggaaactaactgtattgatcggaaactgactttctaaaaatgacattgaccttgactcgattattttcagtatatgaagtttccaattcgtactaggaacatgtgcatatatttctttcacaatatcttaaaggaaaataaaaaaaaatcaagtggaaacagttttaagcaacactgaccttgaaccagtatatttcttacgcaattccaggttagtttcctttacatgttttgaatatatacaaatctttcatcaaaatatgtgtcaggaaactatagttatcgagagaaattcatttcccgcgcccgtttgggcatacaa
gi|25 : C-T-TTG-----TTTTCAT-G-T-----------T-GG-A-----A----ACAT-A-T---------A-----C---ACA--AA--TG---TCTA-TTCAAAATG-G-TT-------A----C-AGGAATC-T---AAAG---TT--ATGAAGA--AG-AAAttaccataaaccagttattcatttatcaacaatggcattgaccttgaccgatttccttaaaaccaactgcaagaatgttttgttttatattaata
gi|30 : -----TTTTCAG-G-T----A------T-GT-T-----AGGTTTC-T-A-T---------G-----G---ACA--AA-ATT---TC-A-T-CA------T-GG----TA-A----C-AGAAA-C-T---TAA----TT--A-----A--TG-AAGC---------GG--TCTGAAGT------GGGCA-TATAA--AAAAGAGG------------T--TG--------A-ATT---CAAGT--A-AATTT-T-AAGTGT-CT-AT----------------T--AATG-----TAAGGATT------AG------TGATAATT-AA-----------CCTTGTGTACAA----AT-TTTAAA-tgtattattttagtaacaatgaccttgacccaaataacctaaaaaacattctgaatcttcctttgaatgtgagaaactttggacatacaacatttcatcaacgtataacaaagaaaactaccttactgagttgataccgcttttg
gi|42 : aaTCAT-G-T-----------T-AG-G-----A----AC-C-C-A---------A-----C---ACA--AC-ATT---TC-A-T-CAAAATA-G-TT----AA-A----A-AGAAA-C-T----TAG---TT--AT
gi|12 : ------T-AG-T-----A----TC-C-A-T---------A-----T---ACATCAA-ACT---TC-A-T-CAAAATA-T-CCA---TA-A----G-AA-AA-C-C---AAAG---TT--ATCAAGC--AG-AAATC-A-TTT------CC--CACCC-----AAGCA-TATGA--AAAAAGGGGGAAATATCTCATGCAG--------A-AAT---TTAGT--GCGGTGT-TAAAAT-T-CA-AT----------------C-GCATG-----CTAGGTCT------AG------TGATGAGCAAA-----------CCTTGTGTATCATTTTTT-TTAAAG-AATTAGGTAACATAATATATTGAAATAA---CT
gi|38 : tactgtagccc-T---------C-----C---ACA--AA-AT----TC-AAT-CAAAATA-T-CT----TT-ATTTTA-GGCAA-C-T---GAAG---TTTAATTGAGT--GG-AAACT-T-ttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|29 : tata-TATCA--AAAGG-GG----------CAT--AA--------CTCAT---GCAGT--TTAGTGT-CA-------CG-AC----------------T-CCGTG-----CAAGATCT------AG------TAATAAGT-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGTCT-A----AT-TTAGAACAG------AAccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|9 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttatA--AAAAGGGT----------CAC--AACTCATTT-A-AATT--AAAATACGCGGTGC-TAAACA-T-CA-AG----------------C-CAATT-----CAAGGTAT------AA------AGATAACC-AA-----------CCTTATGAATAA----AT-TC-AAA-TG------A----AAC-TA-GGAAACGA---TTGTTGAAGCTATTGTACAGATGTT-----GATAAAAAgcggacattatttgcttaag
gi|20 : aatcaggcaacgagtgttcgagttattgagcgaatgtttaaataaaatgcaattttagttaa-AAT---TGAAT--GCGGAAT-TGAAAT-TTCATGT----------------T-CA-TG-----CAAGATCC------CA------TGATAGGC-AA-----------CCTTGTGAACAA----AT-TTTCAA-AG----------T-AT-CA-GGCAACAAGTGTTACAAAttgcagctttgtattttaaaaagggccataattcatgtaaaattgtgtatttcaatcatatgcaaactaatgcggcaaggggtaatgtgtaccgatctaaaatagatagaacaacataaattatgtttaagttgcatgtacatgttgaacatccttattgacacccgacgccaatgctgaaaaatggggcattacaaaatatcgcctatccatagacttgtcgaggtaaatgaacacgtggtatgtttttttaaacaattagtttatttttttaaaatatttatagcacaaaa
gi|13 : aacgtatttttaaaaacacaagctattGAATT-T-CA-AT----------------C-CTATA-----CAAGGTCT------AG------TAATATGC-AA-----------TTATGGGTAAAA----AT-Tgcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|41 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgGAAGT-G-CA-AT----------------C-CCATG-----CAAGGTCT------AG------T-AC-GTC-AA-----------CAGTGTGTACGC----TT-TTAAAA-GG------AAGATAataga
gi|44 : A-AT----------------C-TAATG-----CAAGGTTT------GG------TAATAAGT-AA------------CTTGTGCACAA----TC-CTAAAA-CG------AA
14 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|22 ): ATTATTTTTTAAGAAACAGAGGCCATGACCCCAAAACCTATCACGTGAATCATTTTCACGTTAGGAAACTATACAATTTTTACAATTTTATTGAGAAGCAACTGTTTTCGGTTATTTGTAATAGCGAACCTGAATCGTTAACTTCAAAAAAACACTTTCAATCTTCTATATCCACGTAGAATCGTATGCACACACTGTCTTTCATTTTTTTGAAGGAATCCAAGCGGAAACTGTTTTTT
Unaligned ( gi|23 ): TGGGGCTCCTTATTAGCCAGCTATTTGCAGATCCAAGGTATTGTGACAAGTGTGAATAAATTAAAAAAATTATCCAGTAATATTTGTGGAGTTGTGTAGATGTTGAATAAAATGTAATTTTACATTTAAGGGACATTACTCATGTAAATTCATATCCACAGAGCTGGACATCAATCCAATGATAAGCAACATTCTGTACAATTCTGAAGAGAATTGGGCAATTACTGTTTCAAGCTATT
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|28 ): AGTGATGTATGTGAAAACCATTAAGTTAAAAAAAGGGTTGTACCTCATGTAAAATGTGTCGTGTGCAACTTATATGCAATCCCATACAAGGCCAAGTGTGATAAGCCACATTTGCAAAGAAATGAATGTAGTTGTTTAAGTTATTGAGAGGACATTGAATAAAACACGATTTTAAG
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 6666666666666666666666666666666666666 1111 11 22 222 1111 3333333333333333333333333333 11111111 222222222 3333333 111111 11111 11111 11111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222 111111 11111111111111 1111 111111 11 111111111 22222222222222222222222222222222 444444444444444444444444444444444444444444444444 3333333333333333333333333 111111111 1111 2222222 33333333333333333333333333333 11111 1111111111111 11111111111 1111 222 4444
lowQualScore : 5 1111111111111111111111111111111111111 1 7777 0 1 22 66 5 3 333 3333 66 4 1 4 2 66 1 66 4 8 2 9999 1111111111111111111111111111 33 1 3 5 1 0 6 11111111 22 4 333333333 8 4 2 55 4 1 0000000 55 0 0 222222 3 4 11111 1 22222 888 5 0 2 22222222 5 5 888 7777 55 55 666 33 7777 555 8 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555 3333 555 888 9999999999 4 1 1 3 2 666666 33 1 0 44 55555555555555 1111 2 1 33 33 3 1 1 5 000000 66 66 44 1 000000000 0 33 2 1 00000000000000000000000000000000 5555 2 777777 88888888 6 3 0 111111111111111111111111111111111111111111111111 4 555555 2 2 2 0000000000000000000000000 77777 22 222222222 22 22 2 2 2 2 2 33 4444 333 444 33 7777 55 2222222 1 3 99999 33 444 33 5 2 99999999999999999999999999999 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 5555555555555 22 1 1 33333333333 1 1 1 1 4 1 1111 0 7777 3 77777 777 0 9 1 1 000 3 2222 2
lowQualScore : . ..................................... . .... . . .. .. . . ... .... .. . . . . .. . .. . . . .... ............................ .. . . . . . . ........ .. . ......... . . . .. . . ....... .. . . ...... . . ..... . ..... ... . . . ........ . . ... .... .. .. ... .. .... ... . .......................................................... .... .... ... ... .......... . . . . . ...... .. . . .. .............. .... . . .. .. . . . . ...... .. .. .. . ......... . .. . . ................................ .... . ...... ........ . . . ................................................ . ...... . . . ......................... ..... .. ......... .. .. . . . . . .. .... ... ... .. .... .. ....... . . ..... .. ... .. . . ............................. . ..... ... .. . ....... . . ............. .. . . ........... . . . . . . .... . .... . ..... ... . . . . ... . .... .
lowQualScore : 0 5555555555555555555555555555555555555 0 9999 7 7 00 33 7 6 444 7777 99 4 7 4 6 44 7 11 4 9 6 4444 8888888888888888888888888888 77 0 4 1 9 8 6 55555555 00 0 333333333 0 0 0 55 0 4 6666666 55 9 7 444444 2 0 11111 4 55555 888 0 4 8 22222222 7 0 888 7777 00 11 444 44 5555 888 6 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7777 7777 888 333 2222222222 2 0 0 2 5 777777 55 4 2 22 55555555555555 6666 9 1 99 99 1 8 0 3 999999 33 11 44 9 777777777 6 44 5 9 33333333333333333333333333333333 0000 4 555555 55555555 1 1 1 444444444444444444444444444444444444444444444444 2 444444 0 0 0 3333333333333333333333333 22222 99 777777777 66 66 0 0 0 0 0 33 2222 555 111 22 5555 33 2222222 4 5 77777 77 777 22 0 5 66666666666666666666666666666 4 44444 111 11 1 9999999 2 2 9999999999999 22 6 6 44444444444 7 7 7 7 3 9 1111 2 1111 3 33333 000 8 8 0 0 555 2 5555 5
consensus : AGTGATGTTGACCAATGATCC-------------CCGA-------------TTTACCTGA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAN-ATTTCATCAAAATA-TCTTATATA-AGAAA--ANTGAAGTTATTGA--GCGA-AATCG-TTTTTCTGTTTTGAGTAACAGTGATCTTGACT--TT-ATCCG-TTATTC----TCAA------TATTTNT-------------T-TTCATGCAAGAAGCCAACACACAAAATGTCGTCCAA--A-----TACA-T-------T-AA-GGAAAACG-AGGTT--A-TTGAGCGGAAACTG-T--ATTT--TATTTATCAATTT---TATG-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----T---CTCA-A---GCTTCCA----TTTC--GTGAT---AGGAA--ANTAT---ACACAAA-------------GTT-----------TC---AAAGAAA---------CT-ANAN---TTATTGAG--CGGAAACCGT-T---TTT-T-CTAT--TT-TG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGA--CCNTATT-AACCTCGA--AA------TC--C--CAAGN---TTCTAT-TTTACAT--T--AGGAA-CATATACAC-AAA----G-TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACTAAA----GTTA--TTG-AGCGGAAA-C-GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---AGTAA----C-AG----TGA--------CCGTGACCCGATT---TA--C--CT-AA-ATCA-AAT--C--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTT-CA-TG-T----A--------T-A-G-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TC-T-T-AA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGGCATA--T--AA--A-AAAGG-GG----------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA-AT-TTNAAA-AGAA--ATAATTATG----CAA-TAA---TTG---CAAAAGCTATTNTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGGTGACCAACGATCC-------------CCGA-------------TTTACCTNA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTA-GAAATCTATACACANNATTTCATCAAAATA-TCTTATANACAGAAA--ACTGAAGTTATTGA--GCGA-AATCG-TTTTTCTGTTTTNAGTAACAGNGATCTTGACT--TT-ATCCG-TTANTC----TCAA------TATTTAT-------------T-TTCNTGNAGGAAGCCAATACACAAAATGTCATCCAA--A-----TNNA-T-------T-AA-GGAAAACG-AAGTT--A-TTGAGCGGAAACCG-T--ATTT--TATTTATCAATTT---TATG-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TAACCTCANAA----T---CTCA-A---GCTTCCA----TTTC--GTGAT---AGGAA--ACTAT---ACACAAA-------------GTT-----------TC---AAAGAAA---------CT-ANAN---TTATTGAG--CGGAAACCNT-T---TTT-T-CTAT--TT-TG--GTAACANTGANCTTGACCTTGA--CCNTATT-AACCTTGA--AA------TC--C--CAAGA---TTCTAT-TTTACAT--T--AGGAA-CATATACNC-AAA----A-TTTCATNAAAAAAATN-TTAANGGAAACNAAA----GTTA--TTG-AGNGGAAA-C-GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---AGTAA----C-AG----NGA--------CCATGACCCGATT---TA--C--CTTAA-ATCA-AAT--C--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTT-CA-TG-T----A--------T-A-G-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TC-T-T-AA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGC--GGAAACT-NTTTGCG-G--CCTGCANCC----GGGCATA--T--NA--A-AAAGG-GG----------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA-AT-TTAAAA-AGAA-AATAATTATG----CAA-TAA---TTG---CAAANGCTANTNTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATCC-------------CCGA-------------TTTACCTAA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTATTTCATCAAAATA-TCTTATAGACAGAAA--AAGGAAGTTATTGA--GCGA-AATTG-TTTTTCTGTTTTGAGTAACAGAAATCTTAACT--TT-ATCCG-TTATTC----TCAA------TATTTAT-------------T-TTCCTGAAGGAAGCCAATACACAAAATGTCGTCCAA--A-----TCAA-T-------T-AA-GGAAAACG-AGGTT--A-CTCAGCGGAAACTG-TA-ATTT--TATTTATCAATTT---TATG-TAA-----TAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCATAA----T---CTCA-A---GCTTCCA----TTTC--GTGAT---AGGAA--ATTAT---ACACAAA-------------GTT-----------TC---AAAGAAA---------CT-ACAT---TTATTGAG--CAGAAACCCT-T---TTTAT-CTATG-TT-TG--ATAACATTGAACTTGATCTTGA--CCATATT-AACCTTGA--AA------TC--C--CAAGA---TTCTAT-TTTACAT--T--AGGAA-CATATACCC-AAA----G-TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACAAAA----GTTA--CTG-AGAGGAAA-T-GT----T-TTT----TTCT-A--TATA--AGTTA----C-AG----AAA--------CCATGACCCGATT---TA--C--CTTAA-ATCA-AAT--C--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTT-CA-TG-T----A--------T-A-G-C-----AT----CTC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TT-T-T-AA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGGTATA--T--CA--A-AAAGA-GG----------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA-AT-TTAAAA-AGAA-AATAATTATG----CAA-TAA---TTG---CAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : CTTCCA----TTCC--GTGAT---AGGAA--AGTAT---ACAAAAA-------------GTT-----------TC---CAGGAAA---------CT-AAAA---CTATTGAG--CAGAAACTGT-T---TAT---CTATG-CT-TG--GTTACAATGAATTTGATATTGA--CCTTATT-AACTTTGA--AA------TC--C--CAAGA---TTCTAT-AATACAT--T--AGGAA-CATATACCC-AAC----G-TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACAGAA----GTTA--CTG-AGAGGAAA-C-GT----T-TTT----TT-T-ATTT-T---AGTAA----C-AG----TGA--------C----ACAAAATT---T---C--GTAAA-ATTA-ACT--T--A---AAAG-A--A-A----CT-a
gi|10 : G-A--A-A----CG-TTT-----TTTT-TA-TT-T-------------T-A-G-T-----AA----CAG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-AC-T-T-AA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGGTATA--T--AA--A-AAAAG-G-----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-C-AA-----------TATTGTGT-AT-AA-AT-TTAAAA-AGAA-AAT-ATTATG----CAA-TAA---CTG---CAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT----TTCT-G--T-T---GTTAA----CCAG----TGA--------CCATGACC-GGTT---TC--T--CTCAA-AT-----------------AG-A--A-G----TT-TCG-----TTTT-TA-TT-T-------------T-A-G-ACATATAC----CTG-T----ATA--CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TC-T-T-AA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GG--ATAACT--C------ATGT-AG----------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : g-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-C-GA-----------CCATGTGT-AC-----T-TTGAAA-AG------AATTGTG----CAC-TAT---TTG---TTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatccc-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-T-AA-----------CCTTGTGT-AT-AG-AT-ATAAAA-A-------AATCAGG----CAA-TAT---TTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-A-G-T-----AT----CCA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TC-CAT-AA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAGCATA--T--GA--A-AAAAG-GGGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-CAAA-----------CCTTGTGT-Atgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccA--T--AA--A-AATGGAGG----------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-C-AATCCAGTTA---CCCTGTGT-AC-AA-AT-TTAAAA-ATA-----AATTACA----CAA-TAT---CTG---Ctcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA---CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTA--TTACAAAACCTATACA--ATATGTTATCAAAATAATCTTACA------AA--ACTTAAGTTAT-GA--ACGATAATAG-TGTTTTTATTTGAAGCAACAATAGTCGTGGC--------CCGATTAACC----TCAAAACGAATACTAAT-------------T-TTCATATTAGAAATCTATACACAAAGTTTCATCGAACTA-----CTTA-T-------G-AACGGAAAATA-ATGTT--A-TTGAGCAGAAATTG-T---TTTCCTATTTCT-AA------CATA-AAT-----CA-CGACC-----T---------GGT-GTACTTCAAAACTAGT---CCCA-C---GCTTCCC----TTTC--ATAAT---A--------TAT---AT---AA-------------GTT-----------AG---GAAGGGG---------CT-ATAA---CTtcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-C-AA-----------TTATGGGT-AA-AA-AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgAA--AATAT----CACAAA---------------------------TG---AAA---A---------CT----G---TTATTAAG--CTTAGATCTT-TCATTTT-T-CTAT--TT--A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTCTA-CATCATGATCAA------TT--G--CAAGC---TTTCAT-TTCA-AT--T--TGGAAGCCTATGCAC-AAA----A-TAACATT-AAGATATC-TGAACAGATACTTAA----GTTA--TAG-AGTGGAAA-T-TT----T-TTTAAAATTTT-A--T-------TAA----C-AC----TGATTTTTTACTCTTGACCCGA------------CTAAACATCA-AAT--C--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTT-CA-TT-TTCAAA--------TGA-A-C-----AA----CTT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TT-T-T-AA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatttatcGTGATGTTGACCAACTATCC-------------TCAAAGCAATGTCACAATTTACCTGA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-ATTTCATCAAAATA-TCTTATATA-ATAAATTA-TGATGTTATTTA--GCAA-AATTG-TTTTTCTGTTTTGAGTATCAAT-ACCTGAAAT--TT-TTCCG-TTATTC----TCAA------TCTTTTT-------------A-TTTACGCAAGAAGCCAACATACAAAATATCGTTCAA--A-----TACA-T-------TAAA-GGAAAACG-ACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--ATTT--TATTTATCAATTT---TATG-TAA-----AAGTGACC-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAAAA----T---Cc
gi|16 : TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAAA--AATAT---ACATAAACTTTCAATTAACTGTT-----------TT---AAAGAAAAC-------TT-AGACCGGTTATTGAG--CAGAA--TTTAT---TTT-T-CTAT--TT-TT--CTTACAGTGACCATGGCATTGG--GC-TGTTAAACCTCGC--AG------TT--T--CGAAC---TTCTAT-TTCAGGT--TGAAAAAA-C-TATACAC-ACT----A-TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT-------GTCA--TTG-
gi|16 : TT---TA--C-----AA-AT-A-TAT--CGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGT-TG-GG-T----A--------T-A-G-TT----AT----GTG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TC-T-T-TA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGGCTTA--T--GA--A-AAAGG-GGA---------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA----A-TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACTAAATAAAGTGA--CTG-AGCAGAAA-C-GTATTCT-TTT----TTTT-AA-T-T---AATAATGCCC-TT----TGA--------CAATGACTCCATT---TA--C--CGCAA-ATCA-AAC--CC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTC-AA-TG-T-------------T-A-G-G-----AA----CTTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TC-T-C-GA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCTGA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA--AAATCTATATACAT-ATTTCATCAAAATA-TCTTATATAGAAAAA--AATGACGTTATTGA--GCGA-AATTG-TTTTTCTGTTTTGAGTAACAGTTATCTGAACT--TT-ATCCG-TTATTC----TCAA------TATTTTT-------------A-TTTATGCAAGAAGCCAACATACAAAATGTCGTTCAA--A-----TACA-T-------TAAA-GGAAAACG-AAGTT--A-CTAAGCGGAAACTGCT--ATTT--TATTGATCAATAT---TATG-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : t---AAAGAGA---------TTCAGAG---TT-TT-AG--GGAGAACCGT-T---TTT-TTCTAT--TT-T-------TAGTAAGGCTGACCTAAA------AT---------A--AA------TC------AAGC---TT-TAT-TTT-CAGGAT--AGAAA-CATATACATTAAA----A----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACTGAA----ATTG--TTGCAATGATAT-CTAT----T-TTTGG--TTTT-A--T-T-----TA-----C-AA----TGA--------CCTTGACC---------G--T--C-----ATCA-AA------A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTT-CA-TGTT----ATTAATTTCT-A-GAA-----AA----ATG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTT-T-T-AA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AGTA-A--C--AA--ATAAAGG-AG----------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-C-AT-----------TATTGTGT-AC-AA-AT-TTGCAA-AAAA-AAT
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-A-AA-----------CTTTATAT-AC-AC-AT-TTGAcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-C-AT-----------CATTGTGT-AA-AA-AA-TCTAAA-AGAA-tcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGA-AC-AA-AT-TTTCAA-AG-----T-ATCAGG----CAA-CAAGTGTTA---CAAAgcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctattA--A-AAGGG-GG----------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-T-AA-----------CCTTGT-T-ATGAA-AT-TTGAAA-AAAA-gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgT----T-ATT----TTTT-A--------AGAAA----C-AG----AGG--------CCATGACCCCA---------------AA-ACC--TAT--C--A---CGTG-A--A---------TCA-----TTTT-CA-CG-T-------------T-AGG-A-----AA----CTA-T----A----C--------A-AT-TT--TTACAATT-TTAT-TGAG----AAGCAACT------G---TT--TTCGtcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : a----TTTC--ACGTT---AGGAA--ACTAT---ACA---A-------------TTT-----------TT---ACA---A---------TT--------TTATTGAG--AAGCAACTGT-T---TTCGG-TTAT--TT-----GTAATAGCGAACCTGA-----A--TCG--TT-AACTTCAA--AAAAACACTT--T--CAATC---TTCTATATCCACG---T--AGAAT-CGTATGCAC-ACACTGTC-TTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCCA----------------AGCGGAAA-CTGT----T-TTT----Tgttatttgtaatagcgaacctgaatcgttaacttcaaaaaaacactttcaatcttctatatccacgtagaatcgtatgcacacactgtctttcatttttttgaaggaatccaagcggaaactgtttttt
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccatgaccccaaaacctatcacgtgaatcatAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-C-AA-----------CATTCTGT-AC-AA-TT-CTGAAG-AG------AATTGGG----CAA-TTA---CTGTTTCAA--GCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TTCATGT--T--GGAAA-CATATACAC-AAA----T-GTCTATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCTAAA----GTTA--TGA-AGAAGAAA-T-GT----A-TTA----TT------T-T---AGTAA----C-AA----TGA--------CCTTGACCCAAAT---AA--C--CT-AA-A--A-AA---C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTG-AA-TG-T----G----------A-G-A-----AA----CTT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TA-A-C-AA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAACAAGA----TTAA--TTA-AGCAGAAAAT-AT----T-TCA----TTCT-A--T-TTTTAGTAA----T-GG----GGA--------CC-TGACCTGGTT---TT--A--CTGAA-ATTT-AAC--C--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTT-CA-TA-T----A--------A-G-G-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TC-T-T-AA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtgg--T--AA--A-AAAAG-GGTTGTACCT--CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-C-CA-----------CATT---T-GC-AA-A----GAAA-TGAA-TGTAGTTGTT----TAAGTTA---TTG---g
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtTA--T--TATCA-AAAGG-GG----------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAG-T-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGT--C-TA-AT-TTAGAACAGAA-agaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataattTTC-------------CCAA-------------TTTACCTGA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-ATTTCATCAAAATA-TCTTATATAAAGAAA--AATGAAGTTATTGA--GCGA-AATTG-TTTTTTTGTTTTGAGTAACAGTAATCTGAACT--TT-ATCCG-TTATTC----TCAA------TCTTTCT-------------A-TTTATGCATGAAGACAACATACAAAATGTCGTCCAA--A-----TACA-T-------TAAA-GGAAAACG-AGGTT--A-CTAAGCGGAAACTG-TTAATTT--T-TTAATCAATTG---TATG-TAA-----TAGGGACC-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAAAA----T---CGCA-A---GCTTCCA----TTCC--GTGAT---AGGAA--ATTAT---ACAAAAA-------------GTT-----------TC---AAAGAAA---------CT-GCAT---TTATTGAG--C---AACTG--T---TTA-T-CAATG-TT-TG--GTTACAATGAACTTGATTTTGA--TCTTATT-TACCTTGA--AA------TC--C--CATGA---TTTTAT-ATTACAT--T--AGAAA-CATATACCC-AAA----G-TTTCATAAAAAAAATA-TCAATGAA-------------------G-AGAGGAAA-CTAT----TATTT----TTAT-T--T-T---AGTAA----C-AG----TGA--------CCATGACACGATT---TA--C--CTTAA-ATCT-AAT--C--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTT-CA-TG-T----T--------A-A-G-T-----AT----CTA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TC-T-T-GA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGGCATA--T--AA--A-AAAGA-GG----------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-C-AA-----------TCTTGTGT-AT-AG-AT-TTTAAA-AGAA-AATAATTATG----CAA-TAA---TTG---CAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccat-----TTTT-CA-GG-T----A--------T-G-T-T-----AGGTTTCTA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TG-G-T-AA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGGCATA--T--AA--A-AAAGA-GG------------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-T-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA-AT-TTTAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaA-A---GCT-CCG----TGTC--ATGTT---AGCAACCACTAT---ACACAAT-------------GTTATCAAAATATCTC---AAAGGAA---------CTTAAAG---CTATTTAC--CATAAACCAG-T---TAT-T-C-AT--TTAT----CAACAATGGCATTGACCTTGA--CCG-ATT--TCCTTAA--AA------CCAACTGCAAGAATGTTTTGT-TTTATAT--T--A
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACTTGA----TTTA--TTG-AGAGGAAA-C-AT----T-TTT----TTCTAA--T-TTA-AATAA----C-AGACCTTGA--------ATGTGACCCGATT---TA--C--CTAAA-TTCA-ATC--C--A--------A--A-A----CTGTCTTTATATTTT-CA-TG-T----A--------T-ata
gi|36 : --T-T---AGTAG----C-AT----TTT--------CTTTAACCAGATT---AA--C--CCTAA-A-----A---C--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTT-CG-TG-TT---A--------T-C---A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TC-A-T--G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : ctatt---AGTAA----C-AT----TGA--------CTGTGACCTGATTAGGTA--CA-C--AT-ATCATAATTAT--A---CTCA-A--A-A----C------------TC-CA-TG-T-------------T-A-G-G-----AA----CTT-GA---A----CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TT-T-T-AA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taacTA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TC-T-T-TATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taATCCACAAAAT-TCAATCAA--AATATCTTTATT-------T-TA-GGCAACTG-AAGTTTAA-TTGAGTGGAAACTT-C--CCTT--TACTTCCCAGTTCACACATGATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatGATCTAAA--CCAGATT-AACGTTAA--AA----------C--CAATC---TTCC-T-TTTCTAT--C--AGAAA-TTTATAAACGAAA----A-TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACTTAA----GTCA--TTG-TGCTAAAA-C--T----A-TTT----TTCT-A--T-------------------------------------GACCTGATT---TATAC--CT-----------------------------A-G----CT-TCC-----CTTT-CA-TG-T-------------T-A-G-GT----AT----CTA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TC-T-------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGGTGTA--TAAGA--A-AAAGG-GG----------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-C-AA-----------CCTTATG---C-AATATCTTAAAA-AGAA-cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-C-AT-----------TCCTGTATCAC-----T-CTTAAA-AGAGTTATAATCATGATATCAA-T-----TTG---TTGA-GTTATTGGTCAGATGTtcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CATTGTTT-GC-AA-AT------A-AGAA-AAtgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTG--T--AA--ACAAAGG-GG----------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-C-AA-----------TCTTgcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGTC-AA-----------CAGTGTGT-AC-GC-TT-TTAAAA-GGAA-GATAacgaa
gi|42 : T-CA-TG-T-------------T-A-G-G-----AA----CCC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GT-T-A-AA----AAGAAACT----TAG---TT--AT
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-T-AA------------CTTGTGC-AC-AA-TC-CTAAAA-CGAA-
gi|5 : tgTATTGA--GCGA-AATCG-TTTTTCTGTTTTGGGTAACAGTAATCTGAACT--TT-ATCCG-TTATTC----TCAA-------ACTTTT-------------TATTGATACAAGAAGCGAACATACAAAATGTCGTACAA--A-----TACA-T-------T-AAAGGAAAACG-AGGCT--A-TTAAGCGGAAACTG-TT-ATTG--TATTTATCAAATT---TATG-TAA-----TAGGGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAAAA----T---CCCA-A---GCTTCCA----TCCC--GTGAT---AGGAA--ATTAT---ACACAAA-----------------------------------GAAA---------CT-ACAT---TTATTGAG--CAGAAA-CAT-T---TTA-T-CTATA-TT-TG--GTTACAATGAACTTGATCTTGA--CCTTATT-AACCTTGA--AA------TC--C--AAACT---TTCTAT-ATTACAC--T--AGGAA-CATATACCC-AAA----G-TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACAAAA----GTTA--CTG-A-----------T----T----------------T-T---AGTAA----C-AG----TGA--------CCATGACCCAATT---TA--G--CTTAA-ATCC-AAT--C--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTT-CA-TT-T----A--------A-A-G-T-----AT----CTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TC-T-T-TA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGGCGTA--T--CA--A-AAAGA-GG----------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA-AT-TTAAAA-AGAA-GATAATTATG----CAA-TA
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA--C-------------ACAT-------------TTTACCTAAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACAAGCCTTCATTAAAACT-TCTTA-A---AGGAA--ACTTAAGTTACTGATTG-GA-AACTA-TTTTTTAATATTTAGTAACAGTGACACTGACC--TTAAACTGCTCAACC----TCAA-------AATCAC-------------T----CCAAAGAAAACT-ATAT-TGAAATTTAATCAAA--A-----CATA-TTAATATAT-AA-AGAGAACA-TGGTT--A-TTCAACGGACACCG-T---TTT--TA-ATATCAA---------G-TAAAATTTCATTGAAC-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAAAA----CCAACTGA-A---TGTTCCT----TCTCAGGTTAT---A-CAA--ACAATTTCATA-AAA-------------ATC-----------TA---AAAGAAAACTATGGTTCT-ATGG---TTTTTGAG--TGAAAACAGT-T---TCT-T-GTA----------GTGAAAGTAACCTTGATC----------AAT-AAC-------AA------TT--T------A---CCCT-T-TTTATAT--T--AGATA-CATATAAAC-AAA----ACCTTTATCAAAA-------TAAA--AAACTAAA----TTTA--TCA-AGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttC-AGA----G-TTCAAT--AAAAAACT-TTA---GAA-----------TTA--TTG-AGCGGATA----T----TATCT----TTCT-A--T-TTT-AGTAA----C-AG----AGA--------CCATGCCTAGACT---TA--T--TTCAA-AACC-AAT--C--C---C----A--A-G----CT-TCA-----TTTCACACTG-----------------G-G-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--Atgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttAGTAACAGAGACCA-TG--CC-------------TAGA-------------CTTATTTCA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA-------------------------ACGGAAA---CTGAAGTAATTGA--ACAA-AAACAATTCTTCTGTTT------ATAGTGACTTTGACTAGTT-AACTA-TAAATCAATGTCAA------ACTTCTT-------------T-TTCATGTAAACAACCTTTACACAAAATGACATCCTG--T-----TATA-T-------T-AA-AG-----G-AAGTT--A-CCGAGTGGAAACC-----ATTT--TTTTTA---ATTC---CA-A-TAA-----CAATGACCATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAAAA----T---C-CACA---ACTTTAG----TTTT--GTGCT---TAGAA--TTT------CATAAAAT-----------GTT-----------TT---A--------------------AG---TTACTGAGCTCAGAAACTTT-T---TTT-T-CTATAATT-TGTAGTGACAG-GAACC---CCT--A--CTCAATT-AACCTAAA--TA------TA--C--TAAGT---TTACAT-TTAGCGT--G--AGGAA-CTTCTACCT-AAA----A-CTTCAGCAAAAcggaaactgaagtaattgaacaaaaacaattcttctgtttatagtgactttgactagttaactataaatcaatgtcaaacttctttttcatgtaaacaacctttacacaaaatgacatcctgttatattaaaggaagttaccgagtggaaaccattttttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttA-AACCG-TTCTTTTCATTTTAGTAGTAAGGATGCTGAAT--TA-AT--G-TC---C----TCAA------CACTTATCACTGGACTTCCTT-TTTATGTAAGCAACCTA-AC-CATAAT---ATCCA---------TCAA-T----------A-GGGAAACTCAAGCT--A-TTGAGCGGAAAC--------------TTT-----TTG---TA-G-TGA-----TAGTGACC-----ATGAC---CC-AT-TA-------------T---CTCA-ATTGGTTTTTACATATTTC--TT---------------TAT---A-ATAA---------------TT-----------TCTTTAAGGAAA---------CT-AACT---GTATTGAT--CGGAAACTGA-C---TTT-C---------------TAAAAATGACATTGACCTTGA--CTCGATT-ATTTTCAG--TA------TA--T--GAAGT---TTCCAA-TTCGTAC--T--AGGAA-CATGTGCAT-ATA------TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAA----AAAAAATCA-AGTGGAAA-CAGT----T-TT----------A--------AGCAA----C-AC----TGA--------CCTTGAACCAGTA---TA--TTTCTTAC-G-CA-ATT--C-------CAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTA-CA-TG-T----T--------T-T-G-A-----A------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TG-T-G-TC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGGCATA--C--AA--tatgagcatataaaaaa
gi|9 : A--A-AAAGG-GT----------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-C-AA-----------CCTTATGA-AT-AA-AT-TC-AAA-TGA-----AACTAGG----AAA-CGA---TTG---TTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 1111 1111 222222 111111 111111 11111 1111 111111111 2222222 11111 111111111111 11111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 2222222222 1111 111111111 11111111111111 11111 11111111111 11111111111111111111111111111111 11111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222222 111111111 2222222 3333333333333333333333333333 11111 1111111111111 1111111 111111 222 2222
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 66 2222 0 1 99 4444 5 333333 5 1 66 4 4 2 4 4 3 111111 0 55 55 4 55 8 55 99999 8888 111111 00000 5555 1 55 1 4 4 3 4 3 1 2 1111 999999999 7777 3 3 1 55 3 0 6666666 55 4 3 888888 55 3 00000 0 555555555555 0 777 00 4 3 55 22222222 888 4 777 44 7777 44 555 0 44 44 2 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44 4 11 555 333 4444444444 3 1 2 3 6666 8888 000000000 11111111111111 6666 2 0 33 33 2 2 5 55555 66666666666 1 666 66666 0 2 2 3 2 77777777777777777777777777777777 0 5555 2 66666 11111111111 3 444444444444444444444444444444444444444444444444 4 555555 2 888888888888888888888888 77777 33 333333333 22 22 2 2 2 2 1 4444 333 444 33 888 2 2222222 1 3 99999 99999 2 33 5 2 8888888888888888888888888888 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 6666666666666 22 6666666 1 55555555 3333 1 1 44 1 22 1 4444444 3 0 6666 99999 444444 1 000 3 3333 1
lowQualScore : ..................................... .. .... . . .. .... . ...... . . .. . . . . . . ...... . .. .. . .. . .. ..... .... ...... ..... .... . .. . . . . . . . . .... ......... .... . . . .. . . ....... .. . . ...... .. . ..... . ............ . ... .. . . .. ........ ... . ... .. .... .. ... . .. .. . . .............................................................. .. . .. ... ... .......... . . . . .... .... ......... .............. .... . . .. .. . . . ..... ........... . ... ..... . . . . . ................................ . .... . ..... ........... . ................................................ . ...... . ........................ ..... .. ......... .. .. . . . . . .... ... ... .. ... . ....... . . ..... ..... . .. . . ............................ . ..... ... .. . ....... . . ............. .. ....... . ........ .... . . .. . .. . ....... . . .... ..... ...... . ... . .... .
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777 11 1111 7 7 66 6666 7 333333 0 0 11 4 0 1 0 0 9 555555 6 55 55 0 55 0 55 99999 5555 555555 22222 2222 4 55 4 0 0 6 3 6 2 4 2222 555555555 7777 6 6 8 00 6 4 4444444 00 5 6 888888 77 6 00000 1 777777777777 7 888 22 0 9 55 11111111 666 0 000 66 1111 66 888 2 22 22 1 5 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 4 22 444 444 6666666666 2 0 2 5 1111 9999 444444444 66666666666666 0000 7 3 77 77 9 7 3 11111 99999999999 6 111 11111 6 5 5 2 9 77777777777777777777777777777777 2 3333 5 77777 11111111111 2 111111111111111111111111111111111111111111111111 7 777777 1 444444444444444444444444 55555 00 888888888 88 88 0 0 0 0 3 2222 555 111 22 777 9 2222222 4 5 77777 11111 7 44 0 5 7777777777777777777777777777 4 44444 111 11 1 9999999 1 1 4444444444444 22 8888888 6 88888888 4444 7 7 00 7 77 8 6666666 1 7 5555 77777 777777 0 555 2 5555 0
consensus : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A-TTTCATCAAAAT-ATCTTATAT-A-AGAAA-ANTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TC------AATA---TTTCTT-TTCATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--A-CTGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAA--AA----T---CT--CA-A---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--A--ATTATACACAAA-------------GTT-----------TCAA--AGAAA---------CT--ANAN---TTATTGAG--CGGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TT-TG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TC--C--CAAG---CTTCTAT-TTCACAT--T--AGGAA-CATATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C-GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-------C-AA--------CCT----TGTGT-AC-AA--AT-TT-NAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAATA-A---TTG---CAAAAGCTATTGTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAN-A-TTTCATCAAAAT-ATCTTATAT-A-AGAAA-ANTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TC------AATA---TTTNTT-TTCATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--A-TTGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAA--AA----T---CT--CA-A---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--A--ANTATACACAAA-------------GTT-----------TCAA--AGAAA---------CT--ANAN---TTATTGAG--CGGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TT-TG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TC--C--CAAG---NTTCTAT-TTTACAT--T--AGGAA-CATATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C-GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCGTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-------C-AA--------CCT----TGTGT-AC-AA--AT-TT-NAAA-AG-AA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAAGCTATTNTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTA-TTTCATCAAAAT-ATCTTATAG-ACAGAAA-AAGGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGAAA------TCTTAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TC------AATA---TTTATT-TTCCTGAA--GGAAGCC-AAT-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATC-A--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--A-CTCAGCGGAAACTG-T--AATTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----TAGTGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCAT--AA----T---CT--CA-A---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--A--ATTATACACAAA-------------GTT-----------TCAA--AGAAA---------CT--ACAT---TTATTGAG--CAGAAACCCTT---TTTAT-CTATG-TT-TG--ATAACATTGAACTTGATCTTGACCATATT----AACCTT--GA--AA------TC--C--CAAG---ATTCTAT-TTTACAT--T--AGGAA-CATATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACA--AAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-T-GT----T-TTT----TTCT-A--TAT---AAGTTA----C-AG----AAA--------CCATGACCCGATT---T-A--CC-TTAA--ATCA-A-ATC--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-C-----AT----CTC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TTT-TAA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGG-----TATAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-------C-AA--------CCT----TGTGT-AT-AA--AT-TT-AAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : CT--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--A--AGTATACAAAAA-------------GTT-----------TCCA--GGAAA---------CT--AAAA---CTATTGAG--CAGAAACTGTT---TAT---CTATG-CT-TG--GTTACAATGAATTTGATATTGACCTTATT----AACTTT--GA--AA------TC--C--CAAG---ATTCTAT-AATACAT--T--AGGAA-CATATACCC-AAC--G--TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACA--GAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-C-GT----T-TTT----TT-T-ATTT-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------Ca
gi|10 : -AGGAA-ACTAAAACTATTGA--GCAGA-AACTG-TTTATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATATTGACC--T--T-ATTAACT-TTGAA----ATC----CC------AAGA---TTC--T-ATAATACATTAGGAACA-TAT-ACC-CAACGTTTCA-T--AATTAGT--AT-------T-A----A-CGAAAACAGAAGTT--A-CTGAGAGGAAAC-G-T----TTT--T-TTTAT----TT---TA--G-TAA-----CAGTGACACAAAAT-----TTCGT---AAAAT-TAACTTAAAAGAA----A---CT--AA-A---GTT-----A------TC--GAGAT---AAGA--A--ACTATacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|10 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccG-A--A-A----CG-TTT-----TTTTTATT-T-------------T-AG-T-----AA----CAG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-ACT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGG-----TATAT-A--AA-AAAAG-G----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-------C-AA--------TAT----TGTGT-AT-AA--AT-TT-AAAA-AG-AA--AATATT-ATG----CAATA-A---CTG---CAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT----TTCT-G--T-T---G-TTAA----CCAG----TGA--------CCATGACC-GGTT---T-C--TC-T-------CA-A-AT---------AG-A--A-G----TT-TCG-----TTTTTATT-T-------------T-AG-ACATATAC----CTG-T----ATA--CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TCT-TAA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GGATAACTCATGT-A------------G---------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : gA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-------C-GA--------CCA----TGTGT-AC------T-TT-GAAA-AG-------AATT-GTG----CACTA-T---TTG---TTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaa-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-------T-AA--------CCT----TGTGT-AT-AG--AT-AT-AAAA-A--------AATC-AGG----CAATA-T---TTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-AG-T-----AT----CCA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TCCATAA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAG-----CATATGA--AA-AAAGG-GGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-------CAAA--------CCT----TGTGT-AT-CATTTT-TT-TTAA-AG-AA--TTAGGTAACA----TAATATA---TTG---AAATAACT-TTGTtgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccAT-A--AA-AATGGAGG---------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-------C-AATCCAGTTACCC----TGTGT-AC-AA--AT-TT-AAAA-AT-A-----AATT-ACA----CAATA-T---CTG---Cttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA----CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTAT--TACAAAACCTATACA-AT-A-TGTTATCAAAATAATCTTAC-------AAA-ACTTAAGTTA-TGA--AC-GATAATAG-TGTTTTTAT-TTGAAGCAACAATAG------TCGTGGC----------C--CGATT--A----ACC----TCAAAACGAATA---CTAATT-TTCATATT--AGAAATC-TAT-ACA-CAAAGTTTCA-TCGAACTA-CTTAT-------G-A----ACGGAAAAT-AATGTT--A-TTGAGCAGAAATTG-T----TTTCCTATTTCT-AA------CAT-A-AAT-----CA-CGAC------C-----T---------GGT-GTACTTCAA--AACTAGT---CC--CA-C---GCT--TCCC----TTTC--ATAAT---A----------TATAT---AA-------------GTT-----------AGGA--AGGGG---------CT--ATAA---CTtcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-------C-AA--------TTA----TGGGT-AA-AA--AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgA--A--AATAT-CACAAA---------------------------TGAA--A---A---------CT-----G---TTATTAAG--CTTAGATCTTTCATTTT-T-CTAT--TT--A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTC----TACATCATGATCAA------TT--G--CAAG---CTTTCAT-TTCA-AT--T--TGGAAGCCTATGCAC-AAA--A--TAACATTAAGATA-TC-TGAACAGATACT--TAA----GTTA-TAG-AGTGGAAA-T-TT----T-TTTAAAATTTT-A--T--------TAA----C-AC----TGATTTTTTACTCTTGACCCGA-----------C-T-AAACATCA-A-ATC--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTTCATT-TTCAAA--------TGAA-C-----AA----CTT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TTT-TAA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatttatcGTGATGTTGACCAACTATC-------------CTCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-A-TTTCATCAAAAT-ATCTTATAT-A-ATAAATTATGATGTTATTTA--GC-AA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTATCAAT-A------CCTGAAAT--T--T-TTC--CG-TT--A----TTC----TC------AATC---TTTTTA-TTTACGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATATCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----AAGTGAC------C-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAA--AA----T---Cc
gi|16 : --TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAA--A--AATATACATAAACTTTCAATTAACTGTT-----------TTAA--AGAAAAC-------TT--AGACCGGTTATTGAG--CAGAATTTATT---TT--T-CTAT--TT-TT--CTTACAGTGACCATGGCATTGGGC-TGTTA---AACCTC--GC--AG------TT--T--CGAA---CTTCTAT-TTCAGGT--TGAAAAAA-C-TATACAC-ACT--A--TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT---------GTCA-TTG-
gi|16 : TT---T-A--C----AA--AT-A-T-ATCGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGTTGGG-T----A--------T-AG-TT----AT----GTG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TCT-TTA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGG-----CTTAT-G--AA-AAAGG-GGA--------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA--A--TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACT--AAATAAAGTGA-CTG-AGCAGAAA-C-GTATTCT-TTT----TTTT-AA-T-T---A-ATAATGCCC-TT----TGA--------CAATGACTCCATT---T-A--CCGC-AA--ATCA-A-ACCC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTCAATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TCT-CGA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCT--AAAATCTATATACAT-A-TTTCATCAAAAT-ATCTTATAT-AGAAAAA-AATGACGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTTA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TC------AATA---TTTTTA-TTTATGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAAGTT--A-CTAAGCGGAAACTGCT--A-TTT--TATTGATCAATAT---TAT-G-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : tAA--AGAGA---------TTC-AGAG---TT-TT-AG--GGAGAACCGTT---TTT-TTCTAT--TT-T-------TAGTAAGGCTGACCTAAA----AT--------------A--AA------TC------AAG---CTT-TAT-TTT-CAGGAT--AGAAA-CATATACATTAAA--A-----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACT--GAA----ATTG-TTGCAATGATAT-CTAT----T-TTTGG--TTTT-A--T-T------T-A----C-AA----TGA--------CCTTGACC----------G--TC-------ATCA-A-A----A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTTCATGTT----ATTAATTTCT-AGAA-----AA----ATG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTTT-TAA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AG-----TA-AC-A--AATAAAGG-AG---------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-------C-AT--------TAT----TGTGT-AC-AA--AT-TTGCAAA-AA-AA--AT
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-------A-AA--------CTT----TATAT-AC-AC--AT-TT-GAcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-------C-AT--------CAT----TGTGT-AA-AA--AA-TC-TAAA-AG-AA--tcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-------C-AA--------CCT----TGTGA-AC-AA--AT-TT-TCAA-AG------T-ATC-AGG----CAACA-AGTGTTA---CAAAgcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctatt--AA-AAGGG-GG---------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-------T-AA--------CCT----TGT-T-ATGAA--AT-TT-GAAA-AA-AA--gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcg-TGACCCCAA--AA----C---CTATCA-C---GTGAATCAT----TTTC--ACGTT---AGGA--A--ACTATACA---A-------------TTT-----------TTAC--A---A---------TT---------TTATTGAG--AAGCAACTGTT---TTCGG-TTAT--TT-----GTAATAGCGAACCTGA-----ATCG--TT----AACTTC--AA--AAAAACACTT--T--CAAT---CTTCTATATCCACG---T--AGAAT-CGTATGCAC-ACACTGTCTTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCC--A---------------AGCGGAAA-CTGT----T-TTT----Ttcggacaacttttaattgagttct
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccaAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-------C-AA--------CAT----TCTGT-AC-AA--TT-CT-GAAG-AG-------AATT-GGG----CAATT-A---CTGTTTC--AAGCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TTCATGT--T--GGAAA-CATATACAC-AAAT-G--TCT-ATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCT--AAA----GTTA-TGA-AGAAGAAA-T-GT----A-TTA----TT------T-T---A-GTAA----C-AA----TGA--------CCTTGACCCAAAT---A-A--CC-T-AA--A--A-A-A-C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTGAATG-T----G----------AG-A-----AA----CTT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TAA-CAA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAAC---AAG----ATTAATTA-AGCAGAAAAT-AT----T-TCA----TTCT-A--T-TTTTA-GTAA----T-GG----GGA--------CC-TGACCTGGTT---TTA--CT-G-AA--ATTT-A-ACC--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTTCATA-T----A--------A-GG-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggT-A--AA-AAAAG-GGTTGTACCT-CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-------C-------------------------C-AC--AT-TT-GCAA-AG-AA--ATGA---ATG-------TA-G---TTG---TTTAAGTTATTg
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAGTAATAAGC-AG--------CCTTCCCTGTGT--C-TA--AT-TT-AGAACAG-AA--gagaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttattatcTT-------------CCCAA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-A-TTTCATCAAAAT-ATCTTATATAA-AGAAA-AATGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTTTGT-TTTGAGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TC------AATC---TTTCTA-TTTATGCA--TGAAGAC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGTT--A-CTAAGCGGAAACTG-TTAA-TTT--T-TTAATCAATTG---TAT-G-TAA-----TAGGGAC------C-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAA--AA----T---CG--CA-A---GCT--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--A--ATTATACAAAAA-------------GTT-----------TCAA--AGAAA---------CT--GCAT---TTATTGAG--C---AACTG-T---TTA-T-CAATG-TT-TG--GTTACAATGAACTTGATTTTGATCTTATT----TACCTT--GA--AA------TC--C--CATG---ATTTTAT-ATTACAT--T--AGAAA-CATATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TCAA-------T--GAA-----------G-AGAGGAAA-CTAT----TATTT----TTAT-T--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACACGATT---T-A--CCTT-AA--ATCT-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTTCATG-T----T--------A-AG-T-----AT----CTA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TCT-TGA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-------C-AA--------TCT----TGTGT-AT-AG--AT-TT-TAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccat-----TTTTCAGG-T----A--------T-GT-T-----AGGTTTCTA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TGG-TAA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG-----------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-------T-AA--------CCT----TGTGT-AC-AA--AT-TT-TAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaA-A---GCT---CCG----TGTC--ATGTT---AGCA--ACCACTATACACAAT-------------GTTATCAAAATATCTCAA--AGGAA---------CTT-AAAG---CTATTTAC--CATAAACCAGT---TAT-T-C-AT--TTAT----CAACAATGGCATTGACCTTGACCG-ATT-----TCCTT--AA--AA------CCAACTGCAAGAATGTTTTGT-TTTATAT--T--A
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACT--TGA----TTTA-TTG-AGAGGAAA-C-AT----T-TTT----TTCTAA--T-TTA-A-ATAA----C-AGACCTTGA--------ATGTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATTC-A-ATC------C--A-A--A-A----CTGTCTTTATATTTTCATG-T----A--------T-ata
gi|36 : --T-T---A-GTAG----C-AT----TTT--------CTTTAACCAGATT---A-A--CC-C-------TA-A-AAC--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTTCGTG-TT---A--------T-C--A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TCA-T-G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : ctatt---A-GTAA----C-AT----TGA--------CTGTGACCTGATTAGGT-A--CA-C-AT--ATCATA-ATT--ATA-CTCA-A--A-A----CT-CC-----------ATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTT-G----AA---CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TTT-TAA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taacTA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TCT-TTATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taCA-CAAAAT-TCAATCAAAATATC--TT-------T-ATTTTA-GGCAACT-GAAGTTTAA-TTGAGTGGAAACTT-C--C-CTT--TACTTCCCAGTTCACACAT-GATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatatcGATCTAAACCAGATT----AACGTT--AA--AA----------C--CAAT---CTTCC-T-TTTCTAT--C--AGAAA-TTTATAAACGAAA--A--TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACT--TAA----GTCA-TTG-TGCTAAAA-C--T----A-TTT----TTCT-A--T--------------------------------------GACCTGATT---T-ATACC-T-A-----------------------------G----CT-TCC-----CTTTCATG-T-------------T-AG-GT----AT----CTA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TCT------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGG-----TGTAT-AAGAA-AAAGG-GG---------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-------C-AA--------CCT----TATG---C-AAT-ATCTT-AAAA-AG-AA--cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-------C-AT--------TCC----TGTATCAC------T-CT-TAAA-AG-AGTTATAATC-ATGATATCAAT------TTG---T-TGAGTTATTGGTCAGATGTtcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-------C-AA--------CAT----TGTTT-GC-AA--AT-AA-GAAA-AG-tgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTGT-A--AACAAAGG-GG---------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-------C-AA--------TCT----Tcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGT------C-AA--------CAG----TGTGT-AC-GC--TT-TT-AAAA-GG-AAG-ATAacgaa
gi|42 : TCATG-T-------------T-AG-G-----AA----CCC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GTT-AAA----AAGAAACT----TAG---TT--AT
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-------T-AA---------CT----TGTGC-AC-AA--TC-CT-AAAA-CG-AA--
gi|5 : tgTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGGGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TC------AA-A---CTTTTTATTGATACA--AGAAGCG-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TACAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGCT--A-TTAAGCGGAAACTGTT--A-TTG--TATTTATCAAATT---TAT-G-TAA-----TAGGGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAA--AA----T---CC--CA-A---GCT--TCCA----TCCC--GTGAT---AGGA--A--ATTATACA--------------------------------CAA--AGAAA---------CT--ACAT---TTATTGAG--CAGAAA-CATT---TTA-T-CTATA-TT-TG--GTTACAATGAACTTGATCTTGACCTTATT----AACCTT--GA--AA------TC--C--AAAC---TTTCTAT-ATTACAC--T--AGGAA-CATATACCC-AAA--G--TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACA--AAA----GTTA-CTG-A-----------T----T----------------T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACCCAATT---T-AG-CT-T-AA--ATCC-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTTCATT-T----A--------A-AG-T-----AT----CTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TCT-TTA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGG-----CGTAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-------C-AA--------CCT----TGTGT-AT-AA--AT-TT-AAAA-AG-AAG-ATAATT-ATG----CAATA-
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA---------------CACAT-------------TTTACCT-AAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACAA-GCCTTCATTAAAAC-TTCTTA----A-AGGAA-ACTTAAGTTACTGATTG--GA-AACTA-TTTTTTAAT-ATTTAGTAACAGTGA------CACTGACC--T--TAAAC--TGCTC--A----ACC----TC------AAAA-----TCAC-TCCA---A--AGAA----AACTATATTGAAATTTAA-TCAAAACA-T--ATTAATATAT-A----A-AGAGAAC-ATGGTT--A-TTCAACGGACACCG-T----TTT--TA-ATATCAA----------G-TAAAATTTCATTGAA------C-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAA--AA----CCAACT--GA-A---TGT--TCCT----TCTCAGGTTAT---ACAAACA--ATTTCATA-AAA-------------ATC-----------TAAA--AGAAAACTATGGTTCT--ATGG---TTTTTGAG--TGAAAACAGTT---TCT-T-GTA----------GTGAAAGTAACCTTGATC--------AAT----AAC---------AA------TT--T---------ACCCT-T-TTTATAT--T--AGATA-CATATAAAC-AAA--AC-CTTTATCAAAA-------TAAA--AAACT--AAA----TTTA-TCA-AGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttCAGA-------------GTT------------CAATAAAAAA---------CTTTAGAA---TTATTGAG--CGGATATTATC---TTT---CTAT--TT-TA--GTAACAGAGACCATG-CCTAGAC-TTATTTCAAAACC--------AA------TC--C--CAAG---CTTC-AT-TTCACAC--T--GGGAA-CCTATACAC-AA---------C------------------GGAAACT--GAA----GTAA-TTG-AACAAAAA-C-A-----A-TTC----TTCT-G--T-T------T-A----T-AG----TGA--------CTTTGACTAG-TT---A-A--CTAT-AA--ATCA-ATGTC-----------A--A-A----CT-TCT-----TTTTCATG-T----A--------A-AC-A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-AT-GACATCCTGTTA-TAT-TAA----AGG---------AAG---TT--ACCGAGT--GGAAACC-ATTTtgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttGACCA-TG--C-------------CTAGA-------------CTTATTT-CA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA---------------------------A-CGGAA-ACTGAAGTAATTGA--AC-AA-AAACAATTCTTCTGT-TT------ATAGTGA------CTTTGACTAGT--T-AAC--TA-TA--A----ATCAATGTC------AAAC---TTCTTT-TTCATGTA--AACAACC-TTT-ACA-CAAAATGACA-TCCTGTTA-T--AT-------T-A----A-AG------GAAGTT--A-CCGAGTGGAAACC-----A-TTT--TTTTTA---ATTC---CA--A-TAA-----CAATGAC------CATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAA--AA----T---C---CACA---ACT--TTAG----TTTT--GTGCT---TAGA--A--TTT---CATAAAAT-----------GTT-----------TTA-----------------------AG---TTACTGAGCTCAGAAACTTTT---TTT-T-CTATAATT-TGTAGTGACAG-GAACC---CCT--ACTCAATT----AACCTA--AA--TA------TA--C--TAAG---TTTACAT-TTAGCGT--G--AGGAA-CTTCTACCT-AAA--A--CTTCAGCAAAAtttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagaA-AACCG-TTCTTTTCA-TTTTAGTAGTAAGGA------TGCTGAAT--TAAT-GTC--C--TC--AACACTTA----TC------ACTGGACTTCCTT-TTTATGTA--AGCAACCTAAC-----CATAATATCC-ATCAA----------------T-A----G-GGAAACT-CAAGCT--A-TTGAGCGGAAACT----------------------TTT---TGTAG-TGA-----TAGTGAC------C-----ATGAC---CC-AT-T-----------A----T---CT--CA-ATTGGTT--TTTACATATTTC--TTTAT---AATA--A--TTT-----------------------CT-----------TTAA--GGAAA---------CT--AACT---GTATTGAT--CGGAAACTGAC---TTT---CTA-------------AAAATGACATTGACCTTGACTCGATT----ATTTTC--AG--TA------TA--T--GAAG---TTTCCAA-TTCGTAC--T--AGGAA-CATGTGCAT-ATA-----TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAAAA----AAAA-TCA-AGTGGAAA-CAGT----T-T---------T-A--------A-GCAA----C-AC----TGA--------CCTTGAACCAGTA---T-ATTTC-T-TA--CGCA-A-TT-------CCAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTACATG-T----T--------T-TG-A-----A------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TGT-GTC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGG-----CATAC-A--Atatgagcatataaaaaa
gi|9 : -A--AA-AAAGG-GT---------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-------C-AA--------CCT----TATGA-AT-AA--A--TT-CAAA-TG-A-----AACT-AGG----AAACG-A---TTG---TTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 1111 11111 111111 111111 222222222222 1111 111111111 2222222 11111 111111111111 11111111 22222222222222222 22222222222222222222 1111 22222222 1111 111111111 11111 11111111 1111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222222 111111111 2222222 3333333333333333333333333333 11111 1111111111111 11111111111 1111111 11111 111111 222 2222
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 66 2222 0 1 99 66666 5 999999 5 1 66 4 4 2 4 4 3 111111 0 55 55 4 55 8 55 99999 8888 222222222222 5555 55 55 1 4 4 3 4 3 1 2 1111 999999999 7777 3 3 1 55 3 0 6666666 55 4 444 2 6666 55 3 00000 0 555555555555 0 777 00 4 3 55 22222222 888 88888 55 7777 55 0 666 1 55 1 88888888888888888 55555 44 33333333333333333333 44 4 11 555 5555 22222222 3 1 3 4 5555 9999 222222222 888888 222 55 2 2 2 33 2 777 5 33333 66666666 55 0 555 55555 0 2 2 2 2 9999999999999999999999999999999999 9999 2 77777 88888888 4 2 000000000000000000000000000000000000000000000000 4 666666 2 888888888888888888888888 77777 33 333333333 22 22 2 2 2 2 1 4444 333 444 33 888 2 2222222 1 3 99999 99999 2 33 5 2 8888888888888888888888888888 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 6666666666666 22 1 1 33333333333 1 1 44 1 1 1 9999999 2 5 6666 00000 444444 000 3 3333 1
lowQualScore : ..................................... .. .... . . .. ..... . ...... . . .. . . . . . . ...... . .. .. . .. . .. ..... .... ............ .... .. .. . . . . . . . . .... ......... .... . . . .. . . ....... .. . ... . .... .. . ..... . ............ . ... .. . . .. ........ ... ..... .. .... .. . ... . .. . ................. ..... .. .................... .. . .. ... .... ........ . . . . .... .... ......... ...... ... .. . . . .. . ... . ..... ........ .. . ... ..... . . . . . .................................. .... . ..... ........ . . ................................................ . ...... . ........................ ..... .. ......... .. .. . . . . . .... ... ... .. ... . ....... . . ..... ..... . .. . . ............................ . ..... ... .. . ....... . . ............. .. . . ........... . . .. . . . ....... . . .... ..... ...... ... . .... .
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777 11 1111 7 7 66 44444 7 999999 0 0 11 4 0 1 0 0 9 555555 6 55 55 0 55 0 55 99999 5555 000000000000 1111 44 55 4 0 0 6 3 6 2 4 2222 555555555 7777 6 6 8 00 6 4 4444444 00 5 555 3 6666 77 6 00000 1 777777777777 7 888 22 0 9 55 11111111 666 66666 00 7777 00 5 444 2 00 3 77777777777777777 11111 22 22222222222222222222 66 2 77 888 9999 11111111 3 0 2 5 8888 6666 555555555 888888 222 22 7 7 0 77 7 333 0 66666 55555555 00 9 222 22222 1 4 4 4 7 4444444444444444444444444444444444 1111 4 22222 55555555 3 4 777777777777777777777777777777777777777777777777 4 333333 1 444444444444444444444444 55555 00 888888888 88 88 0 0 0 0 3 2222 555 111 22 777 9 2222222 4 5 77777 11111 7 44 0 5 7777777777777777777777777777 4 44444 111 11 1 9999999 1 1 4444444444444 22 6 6 44444444444 7 7 00 7 0 8 5555555 9 1 1111 22222 111111 555 2 5555 0
consensus : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAA-ANTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAA--AA----T---CT--CA-A---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATTATACA-AAA-------------GTTTCA--A--A--GAAA---------CT--ANAN---TTATTGAG--CGGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAA-C-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAATA-A---TTG---CAAAAGCTATTGTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGAAA-ANTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAA--AA----T---CT--CA-A---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATTATACACAAA-------------GTTTCA--A--A--GAAA---------CT--ANAN---TTATTGAG--CGGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACATT--AGGAA-C-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAATA-A---TTG---CAAAAGCTATTGTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTA--TTTCATCAAAATA-TCTTATAG-ACAGAAA-AAGGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGAAA------TCTTAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTATT-TT-CCTGAA--GGAAGCC-AAT-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATC-A--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TCAGCGGAAACTG-T--AATTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----TAGTGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCAT--AA----T---CT--CA-A---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATTATACACAAA-------------GTTTCA--A--A--GAAA---------CT--ACAT---TTATTGAG--CAGAAACCCTT---TTTAT-CTATG-TTTG--ATAACATTGAACTTGATCTTGACCATATT----AACCTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-TT-TACATT--AGGAA-C-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACA--AAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-T--GT----T-TTT----TTCT-A--TAT---AAGTTA----C-AG----AAA--------CCATGACCCGATT---T-A--CC-TTAA--ATCA-A-ATC--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-C-----AT----CTC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TTT-TAA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGG-----TATAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : CT--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AAGTATACAAAAA-------------GTTTCC--A--G--GAAA---------CT--AAAA---CTATTGAG--CAGAAACTGTT---TAT---CTATG-CTTG--GTTACAATGAATTTGATATTGACCTTATT----AACTTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-AA-TACATT--AGGAA-C-A-TATACCC-AAC--G--TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACA--GAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-C--GT----T-TTT----TT-T-ATTT-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------Ca
gi|10 : -AGGAA-ACTAAAACTATTGA--GCAGA-AACTG-TTTATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATATTGACC--T--T-ATTAACT-TTGAA----ATC----CCAA------GA---TTC--T-AT-AATACATTAGGAACA-TAT-ACC-CAACGTTTCA-T--AATTAGT--AT-------T-A----A-CGAAAACAGAAGTT--AC-TGAGAGGAAAC-G-T----TTT--T-TTT----ATTT---TA--G-TAA-----CAGTGACACAAAAT-----TTCGT---AAAAT-TAACTTAAAAGAA----A---CT--AA-A---GTT-----A------TC--GAGAT---AAGA--AACTATacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|10 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccG-A--A-A----CG-TTT-----TTTTTATT-T-------------T-AG-T-----AA----CAG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-ACT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGG-----TATAT-A--AA-AAAAG-G----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-C-AA-----------TATTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AA--AATATT-ATG----CAATA-A---CTG---CAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT----TTCT-G--T-T---G-TTAA----CCAG----TGA--------CCATGACC-GGTT---T-C--TC-T-------CA-A-AT---------AG-A--A-G----TT-TCG-----TTTTTATT-T-------------T-AG-ACATATAC----CTG-T----ATA--CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TCT-TAA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GGATAACTCATGT-A------------G---------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : gA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-C-GA-----------CCATGTGT-AC------T-TTGAAA-AG-------AATT-GTG----CACTA-T---TTG---TTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaa-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-T-AA-----------CCTTGTGT-AT-AG--AT-ATAAAA-A--------AATC-AGG----CAATA-T---TTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-AG-T-----AT----CCA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TCCATAA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAG-----CATATGA--AA-AAAGG-GGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-CAAA-----------CCTTGTGT-AT-CATTTT-TTTTAA-AG-AA--TTAGGTAACA----TAATATA---TTG---AAATAACT-TTGTtgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccAT-A--AA-AATGGAGG---------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-C-AATCCAGTTA---CCCTGTGT-AC-AA--AT-TTAAAA-AT-A-----AATT-ACA----CAATA-T---CTG---Cttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA----CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTAT--TACAAAACCTATACA-AT-A--TGTTATCAAAATAATCTTACA-------AA-ACTTAAGTTAT-GA--AC-GATAATAG-TGTTTTTAT-TTGAAGCAACAATAG------TCGTGGC----------C--CGATT--A----ACC----TCAAAACGAATA---CTAATT-TT-CATATT--AGAAATC-TAT-ACA-CAAAGTTTCA-TCGAACTA-CTTAT-------G-A----ACGGAAAAT-AATGTT--AT-TGAGCAGAAATTG-T----TTTCCTATTTCT-AA------CAT-A-AAT-----CA-CGAC------C-----T---------GGT-GTACTTCAA--AACTAGT---CC--CA-C---GCT--TCCC----TTTC--ATAAT---A--------TATAT---AA-------------GTTAGG--A--A--GGGG---------CT--ATAA---CTtcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-C-AA-----------TTATGGGT-AA-AA--AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgTTAT---CAAA-------------ATATCACAA--ATGAAAA---------CT-----G---TTATTAAG--CTTAGATCTTTCATTTT-T-CTAT--TT-A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTC----TACATCATGATCAA------TTGCAAGCTTTCAT-TT-CA-ATT--TGGAAGC-C-TATGCAC-AAA--A--TAACATT-AAGATATC-TGAACAGATACT--TAA----GTTA-TAG-AGTGGAAA-T--TT----T-TTTAAAATTTT-A--T--------TAA----C-AC----TGATTTTTTACTCTTGACCCGA-----------C-T-AAACATCA-A-ATC--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTTCATT-TTCAAA--------TGAA-C-----AA----CTT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TTT-TAA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatGTGATGTTGACCAACTATC-------------CTCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-ATAAATTATGATGTTATTTA--GC-AA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTATCAAT-A------CCTGAAAT--T--T-TTC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTTTA-TT-TACGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATATCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----AAGTGAC------C-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAA--AA----T---Cc
gi|16 : --TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAA--AAATATACATAAACTTTCAATTAACTGTTTTA--A--A--GAAAAC-------TT--AGACCGGTTATTGAG--CAGAATTTATT---TT--T-CTAT--TTTT--CTTACAGTGACCATGGCATTGGGC-TGTTA---AACCTC--GC--AG------TTTCGAACTTCTAT-TT-CAGGTTGAAAAAA-C---TATACAC-ACT--A--TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT---------GTCA-TTG-
gi|16 : TT---T-A--C----AA--AT-A-T-ATCGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGTTGGG-T----A--------T-AG-TT----AT----GTG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TCT-TTA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGG-----CTTAT-G--AA-AAAGG-GGA--------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA--A--TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACT--AAATAAAGTGA-CTG-AGCAGAAA-C--GTATTCT-TTT----TTTT-AA-T-T---A-ATAATGCCC-TT----TGA--------CAATGACTCCATT---T-A--CCGC-AA--ATCA-A-ACCC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTCAATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TCT-CGA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCT--AAAATCTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-AGAAAAA-AATGACGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTTA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTTTA-TT-TATGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAAGTT--AC-TAAGCGGAAACTGCT--A-TTT--TATTGATCAATAT---TAT-G-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : tA--A--A--GAGA---------TTC-AGAG---TT-TT-AG--GGAGAACCGTT---TTT-TTCTAT--TTT-------TAGTAAGGCTGACCTAAA----AT--------------A--AA------TC--AAGCTT-TAT-TTTCAGGAT--AGAAA-C-A-TATACATTAAA--A-----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACT--GAA----ATTG-TTGCAATGATAT-CT-AT----T-TTTGG--TTTT-A--T-T------T-A----C-AA----TGA--------CCTTGACC----------G--TC-------ATCA-A-A----A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTTCATGTT----ATTAATTTCT-AGAA-----AA----ATG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTTT-TAA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AG-----TA-AC-A--AATAAAGG-AG---------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-C-AT-----------TATTGTGT-AC-AA--AT-TTGCAA-AA-AA----AATC-GCA----CAGTA-T---TTG---
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-A-AA-----------CTTTATAT-AC-AC--AT-TTGAtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-C-AT-----------CATTGTGT-AA-AA--AA-TCTAAA-AG-AA--tcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGA-AC-AA--AT-TTTCAA-AG------T-ATC-AGG----CAACA-AGTGTTA---CAAAgcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctatt--AA-AAGGG-GG---------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-T-AA-----------CCTTGT-T-ATGAA--AT-TTGAAA-AA-AA--gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcg-TGACCCCAA--AA----C---CTATCA-C---GTGAATCAT----TTTC--ACGTT---AGGA--AACTATACA---A-------------TTTTTA--C--A-----A---------TT---------TTATTGAG--AAGCAACTGTT---TTCGG-TTAT--TT----GTAATAGCGAACCTGA-----ATCG--TT----AACTTC--AA--AAAAACACTTTCAATCTTCTATATC-CACG-T--AGAAT-C-G-TATGCAC-ACACTGTCTTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCC--A---------------AGCGGAAA-CT-GT----T-TTT----Ttcggacaacttttaattgagttct
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccaAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-C-AA-----------CATTCTGT-AC-AA--TT-CTGAAG-AG-------AATT-GGG----CAATT-A---CTGTTTC--AAGCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TT-CATGTT--GGAAA-C-A-TATACAC-AAAT-G--TCT-ATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCT--AAA----GTTA-TGA-AGAAGAAA-T--GT----A-TTA----TT------T-T---A-GTAA----C-AA----TGA--------CCTTGACCCAAAT---A-A--CC-T-AA--A--A-A-A-C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTGAATG-T----G----------AG-A-----AA----CTT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TAA-CAA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAAC---AAG----ATTAATTA-AGCAGAAAAT--AT----T-TCA----TTCT-A--T-TTTTA-GTAA----T-GG----GGA--------CC-TGACCTGGTT---TTA--CT-G-AA--ATTT-A-ACC--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTTCATA-T----A--------A-GG-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggT-A--AA-AAAAG-GGTTGTACCT-CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-C-CA-----------C---------------AT-TTGCAA-AG-AA--ATGA---ATG-------TA-G---TTG---TTTAAGTTATTGg
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAG-T-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGT--C-TA--AT-TTAGAACAG-AA--agaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttattatcTT-------------CCCAA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAA-AGAAA-AATGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTTTGT-TTTGAGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTCTA-TT-TATGCA--TGAAGAC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TAAGCGGAAACTG-TTAA-TTT--T-TTAATCAATTG---TAT-G-TAA-----TAGGGAC------C-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAA--AA----T---CG--CA-A---GCT--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AATTATACAAAAA-------------GTTTCA--A--A--GAAA---------CT--GCAT---TTATTGAG--C---AACTG-T---TTA-T-CAATG-TTTG--GTTACAATGAACTTGATTTTGATCTTATT----TACCTT--GA--AA------TCCCATGATTTTAT-AT-TACATT--AGAAA-C-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TCAA-------T--GAA-----------G-AGAGGAAA-CT-AT----TATTT----TTAT-T--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACACGATT---T-A--CCTT-AA--ATCT-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTTCATG-T----T--------A-AG-T-----AT----CTA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TCT-TGA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-C-AA-----------TCTTGTGT-AT-AG--AT-TTTAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccat-----TTTTCAGG-T----A--------T-GT-T-----AGGTTTCTA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TGG-TAA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG-----------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-T-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTTAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaAAGCTCC-GT-GT-CATGTT--AGCAA-CCACTATACAC-AAT--G--TT--ATCAAAATA-TC-TCAAAGGAACTT--AAA----GCTA-TTT-ACCATAAA-CCAGT----TATTC----ATTT-A--T-C---A-ACAATGG-C-AT----TGA--------CCTTGA-CCGATT---T-C--CT-T-AA--AACC-A-ACT--G---CAAG-A--ATG----TT-TTG-----TTTT
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACT--TGA----TTTA-TTG-AGAGGAAA-C--AT----T-TTT----TTCTAA--T-TTA-A-ATAA----C-AGACCTTGA--------ATGTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATTC-A-ATC------C--A-A--A-A----CTGTCTTTATATTTTCATG-T----A--------T-atattaata
gi|36 : --T-T---A-GTAG----C-AT----TTT--------CTTTAACCAGATT---A-A--CC-C-------TA-A-AAC--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTTCGTG-TT---A--------T-C--A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TCA-T-G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : ctatt---A-GTAA----C-AT----TGA--------CTGTGACCTGATTAGGT-A--CA-C-AT--ATCATA-ATT--ATA-CTCA-A--A-A----CT-CC-----------ATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTT-G----AA---CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TTT-TAA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taacTA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TCT-TTATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taCA-CAAAAT-TCAATCAAAATATC--TT-------T-ATTTTA-GGCAACT-GAAGTTTAAT-TGAGTGGAAACTT-C--C-CTT--TACTTCCCAGTTCACACAT-GATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatatcGATCTAAACCAGATT----AACGTT--AA--AA--------CCAATCTTCCTT-TT-C-TATC--AGAAA-T-T-TATAAACGAAA--A--TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACT--TAA----GTCA-TTG-TGCTAAAA-C---T----A-TTT----TTCT-A--T--------------------------------------GACCTGATT---T-ATACC-T-A-----------------------------G----CT-TCC-----CTTTCATG-T-------------T-AG-GT----AT----CTA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TCT------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGG-----TGTAT-AAGAA-AAAGG-GG---------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-C-AA-----------CCTTATG---C-AAT-ATCTTAAAA-AG-AA--cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-C-AT-----------TCCTGTATCAC------T-CTTAAA-AG-AGTTATAATC-ATGATATCAAT------TTG---T-TGAGTTATTGGTCAGATGTtcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CATTGTTT-GC-AA--AT-AAGAAA-AG-tgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTGT-A--AACAAAGG-GG---------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-C-AA-----------TCTTcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGTC-AA-----------CAGTGTGT-AC-GC--TT-TTAAAA-GG-AAG-ATAacgaa
gi|42 : TCATG-T-------------T-AG-G-----AA----CCC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GTT-AAA----AAGAAACT----TAG---TT--AT
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-T-AA------------CTTGTGC-AC-AA--TC-CTAAAA-CG-AA--
gi|5 : tgTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGGGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA-------A---CTTTTTATT-GATACA--AGAAGCG-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TACAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGCT--AT-TAAGCGGAAACTGTT--A-TTG--TATTTATCAAATT---TAT-G-TAA-----TAGGGAC------C-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAA--AA----T---CC--CA-A---GCT--TCCA----TCCC--GTGAT---AGGA--AATTATACA---------------------CA--A--A--GAAA---------CT--ACAT---TTATTGAG--CAGAAA-CATT---TTA-T-CTATA-TTTG--GTTACAATGAACTTGATCTTGACCTTATT----AACCTT--GA--AA------TCCAAACTTTCTAT-AT-TACACT--AGGAA-C-A-TATACCC-AAA--G--TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACA--AAA----GTTA-CTG-A------------T----T----------------T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACCCAATT---T-AG-CT-T-AA--ATCC-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTTCATT-T----A--------A-AG-T-----AT----CTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TCT-TTA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGG-----CGTAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AAG-ATAATT-ATG----CAATA-
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA---------------CACAT-------------TTTACCT-AAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACA--AGCCTTCATTAAAACT-TCTTA----A-AGGAA-ACTTAAGTTACTGATTG--GA-AACTA-TTTTTTAAT-ATTTAGTAACAGTGA------CACTGACC--T--TAAAC--TGCTC--A----ACC----TCAA------AA-----TCAC-TC-CA---A--AGAA----AACTATATTGAAATTTAA-TCAAAACA-T--ATTAATATAT-A----A-AGAGAAC-ATGGTT--AT-TCAACGGACACCG-T----TTT--TA-ATATCAA----------G-TAAAATTTCATTGAA------C-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAA--AA----CCAACT--GA-A---TGT--TCCT----TCTCAGGTTAT---ACAAACAATTTCATA-AAA-------------ATCTAA--A--A--GAAAACTATGGTTCT--ATGG---TTTTTGAG--TGAAAACAGTT---TCT-T-GTA---------GTGAAAGTAACCTTGATC--------AAT----AAC---------AA------TTT--ACCCT---T-TT-TATATT--AGATA-C-A-TATAAAC-AAA--AC-CTTTATCAAAA-------TAAA--AAACT--AAA----TTTA-TCA-AGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttCAGA-------------GTT-CA--ATAA--AAAA---------CTTTAGAA---TTATTGAG--CGGATATTATC---TTT---CTAT--TTTA--GTAACAGAGACCATG-CCTAGAC-TTATTTCAAAACC--------AA------TCCCAAGCTTC-AT-TT-CACACT--GGGAA-C-C-TATACAC-AA---------C------------------GGAAACT--GAA----GTAA-TTG-AACAAAAA-C--AA----T-TCT----T-CT-G--T-T------TA-----T-AG----TGA--------CTTTGACTAG-TT---A-A--CTAT-AA--ATCA-ATGTC--A-----------A-A----CT-TCT-----TTTTCATG-T----A--------A-AC-A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-AT-GACATCCTGTTA-TAT-TAA----AGG---------AAG---TT--ACCGAGT--GGAAACC-ATTTtgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttGACCA-TG--C-------------CTAGA-------------CTTATTT-CA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA----------------------------A-CGGAA-ACTGAAGTAATTGA--AC-AA-AAACAATTCTTCTGT-TT------ATAGTGA------CTTTGACTAGT--T-AAC--TA-TA--A----ATCAATGTCAA-------A---CTTCTT-TTTCATGTA--AACAACC-TTT-ACA-CAAAATGACA-TCCTGTTA-T--AT-------T-A----A-AG------GAAGTT--AC-CGAGTGGAAACC-----A-TTT--TTTTTA---ATTC---CA--A-TAA-----CAATGAC------CATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAA--AA----T---C---CACA---ACT--TTAG----TTTT--GTGCT---TAGA--ATTT---CATAAAAT-----------GTTTTA---------------------------AG---TTACTGAGCTCAGAAACTTTT---TTT-T-CTATAATTTGTAGTGACAG-GAACC---CCT--ACTCAATT----AACCTA--AA--TA------TACTAAGTTTACAT-TT-AGCGTG--AGGAA-C-T-TCTACCT-AAA--A--CTTCAGCAAAAtttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagaA-AACCG-TTCTTTTCA-TTTTAGTAGTAAGGA------TGCTGAAT--TAAT-GTC--C--TC--AACACTTA----TCAC------TGGACTTCCTT-TT-TATGTA--AGCAACCTAAC-----CATAATATCC-ATCAA----------------T-A----G-GGAAACT-CAAGCT--AT-TGAGCGGAAACT----------------------TTT---TGTAG-TGA-----TAGTGAC------C-----ATGAC---CC-AT-T-----------A----T---CT--CA-ATTGGTT--TTTACATATTTC--TTTAT---AATA--ATTT-----------------------CTTTA--A--G--GAAA---------CT--AACT---GTATTGAT--CGGAAACTGAC---TTT---CTA------------AAAATGACATTGACCTTGACTCGATT----ATTTTC--AG--TA------TATGAAGTTTCCAA-TT-CGTACT--AGGAA-C-A-TGTGCAT-ATA-----TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAAAA----AAAA-TCA-AGTGGAAA-CA-GT----T-T---------T-A--------A-GCAA----C-AC----TGA--------CCTTGAACCAGTA---T-ATTTC-T-TA--CGCA-A-TT-------CCAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTACATG-T----T--------T-TG-A-----A------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TGT-GTC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGG-----CATAC-A--Atatgagcatataaaaaa
gi|9 : -A--AA-AAAGG-GT---------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-C-AA-----------CCTTATGA-AT-AA--A--TTCAAA-TG-A-----AACT-AGG----AAACG-A---TTG---TTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 1111 11111 222222222 111111 222222222222 1111 111111111 2222222 11111 1111111111111 111111111111 44444444444444444444 111111111 111111111 1111 22222222 1111 111111111 11111 11111111 1111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222222 111111111 2222222 3333333333333333333333333333 11111 1111111111111 11111111111 1111111 11111 111111 11 2222
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 66 2222 0 1 99 66666 5 000000000 777 66 4 4 2 4 4 3 111111 0 55 55 4 55 8 55 99999 8888 222222222222 5555 55 55 1 4 4 3 4 3 1 2 1111 999999999 7777 3 3 1 55 3 0 6666666 55 4 444 2 6666 55 3 00000 0 6666666666666 11 5555 888888888888 8888 55 99999 55 5 666 2 55 3 00000000000000000000 0 66666 555555555 000000000 33 999999 22 555 5555 22222222 3 1 3 4 5555 9999 222222222 888888 222 55 2 2 00 33 0 777 5 33333 66666666 55 0 555 55555 0 2 2 2 2 9999999999999999999999999999999999 9999 2 77777 88888888 4 2 000000000000000000000000000000000000000000000000 4 666666 2 888888888888888888888888 77777 33 333333333 22 22 2 2 2 2 1 4444 333 444 33 888 2 2222222 1 3 99999 99999 2 33 5 2 8888888888888888888888888888 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 6666666666666 22 1 1 33333333333 1 1 44 1 1 1 8888888 2 7 5555 00000 999999 33 0 3333 1
lowQualScore : ..................................... .. .... . . .. ..... . ......... ... .. . . . . . . ...... . .. .. . .. . .. ..... .... ............ .... .. .. . . . . . . . . .... ......... .... . . . .. . . ....... .. . ... . .... .. . ..... . ............. .. .... ............ .... .. ..... .. . ... . .. . .................... . ..... ......... ......... .. ...... .. ... .... ........ . . . . .... .... ......... ...... ... .. . . .. .. . ... . ..... ........ .. . ... ..... . . . . . .................................. .... . ..... ........ . . ................................................ . ...... . ........................ ..... .. ......... .. .. . . . . . .... ... ... .. ... . ....... . . ..... ..... . .. . . ............................ . ..... ... .. . ....... . . ............. .. . . ........... . . .. . . . ....... . . .... ..... ...... .. . .... .
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777 11 1111 7 7 66 44444 7 555555555 999 11 4 0 1 0 0 9 555555 6 55 55 0 55 0 55 99999 5555 000000000000 1111 44 55 4 0 0 6 3 6 2 4 2222 555555555 7777 6 6 8 00 6 4 4444444 00 5 555 3 6666 77 6 00000 1 6666666666666 22 6666 888888888888 9999 00 22222 00 1 444 0 00 3 55555555555555555555 7 22222 444444444 333333333 99 888888 55 444 9999 11111111 3 0 2 5 8888 6666 555555555 888888 222 22 7 7 55 77 2 333 0 66666 55555555 00 9 222 22222 1 4 4 4 7 4444444444444444444444444444444444 1111 4 22222 55555555 3 4 777777777777777777777777777777777777777777777777 4 333333 1 444444444444444444444444 55555 00 888888888 88 88 0 0 0 0 3 2222 555 111 22 777 9 2222222 4 5 77777 11111 7 44 0 5 7777777777777777777777777777 4 44444 111 11 1 9999999 1 1 4444444444444 22 6 6 44444444444 7 7 00 7 6 8 5555555 7 5 7777 77777 000000 66 8 5555 0
consensus : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----T---CC--CAA---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAATA-N---TTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----T---CT--CAA---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAATA-A---TTG---CAAAAGCTATTGTACAGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTA--TTTCATCAAAATA-TCTTATAG-ACAGAAAA--AGGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGAAA------TCTTAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTATT-TT-CCTGAA--GGAAGCC-AAT-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATC-A--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TCAGCGGAAACTG-T--AATTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----TAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCATAA----T---CT--CAA---GCT--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-ACAAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ACAT---TT--ATTGAG--C--AGAAACCCTT---TTTAT-CTATG-TTTG--ATAACATTGAACTTGATCTTGACCATATT----AACCTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-TT-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACA--AAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-T--GT----T-TTT----TTCT-A--TAT---AAGTTA----C-AG----AAA--------CCATGACCCGATT---T-A--CC-TTAA--ATCA-A-ATC--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-C-----AT----CTC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TTT-TAA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGG-----TATAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : CT--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AAGT-ATAC-A-AAAA------------GTTTCCA--G--GAAA---------CT--AAAA---CT--ATTGAG--C--AGAAACTGTT---TAT---CTATG-CTTG--GTTACAATGAATTTGATATTGACCTTATT----AACTTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-AA-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAC--G--TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACA--GAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-C--GT----T-TTT----TT-T-ATTT-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------Ca
gi|10 : -AGGAAA--CTAAAACTATTGA--GCAGA-AACTG-TTTATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATATTGACC--T--T-ATTAACT-TTGAA----ATC----CCAA------GA---TTC--T-AT-AATACATTAGGAACA-TAT-ACC-CAACGTTTCA-T--AATTAGT--AT-------T-A----A-CGAAAACAGAAGTT--AC-TGAGAGGAAAC-G-T----TTT--T-TTT----ATTT---TA--G-TAA-----CAGTGAC-----------------A--------CAAAA-------------------------------TTTC--GT--------AA--AATT-A-AC---------------------TTAAA--A--GAAA---------CT--AAAG---TT--ATCGAGATA--AGAAACTATT---Tacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|10 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccG-A--A-A----CG-TTT-----TTTTTATT-T-------------T-AG-T-----AA----CAG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-ACT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGG-----TATAT-A--AA-AAAAG-G----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-C-AA-----------TATTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AA--AATATT-ATG----CAATA-A---CTG---CAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT----TTCT-G--T-T---G-TTAA----CCAG----TGA--------CCATGACC-GGTT---T-C--TC-T-------CA-A-AT---------AG-A--A-G----TT-TCG-----TTTTTATT-T-------------T-AG-ACATATAC----CTG-T----ATA--CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TCT-TAA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GGATAACTCATGT-A------------G---------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : gA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-C-GA-----------CCATGTGT-AC------T-TTGAAA-AG-------AATT-GTG----CACTA-T---TTG---TTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaa-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-T-AA-----------CCTTGTGT-AT-AG--AT-ATAAAA-A--------AATC-AGG----CAATA-T---TTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-AG-T-----AT----CCA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TCCATAA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAG-----CATATGA--AA-AAAGG-GGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-CAAA-----------CCTTGTGT-AT-CATTTT-TTTTAA-AG-AA--TTAGGTAACA----TAATATA---TTG---AAATAACT-TTGTtgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccAT-A--AA-AATGGAGG---------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-C-AATCCAGTTA---CCCTGTGT-AC-AA--AT-TTAAAA-AT-A-----AATT-ACA----CAATA-T---CTG---Cttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA----CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTAT--TACAAAACCTATACA-AT-A--TGTTATCAAAATAATCTTACA-------AAA--CTTAAGTTAT-GA--AC-GATAATAG-TGTTTTTAT-TTGAAGCAACAATAG------TCGTGGC----------C--CGATT--A----ACC----TCAAAACGAATA---CTAATT-TT-CATATT--AGAAATC-TAT-ACA-CAAAGTTTCA-TCGAACTA-CTTAT-------G-A----ACGGAAAAT-AATGTT--AT-TGAGCAGAAATTG-T----TTTCCTATTTCT-AA------CAT-A-AAT-----CA-CGACC-----T---------GGT-GTACTTCAAAACTAGT---CC--CAC---GCT--TCCC----TTTC--ATAAT---A--------T-ATAT----AA-------------GTTAGGA--A--GGGG---------CT--ATAA---CT--tcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-C-AA-----------TTATGGGT-AA-AA--AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgTT-AT-C-A-AAAT------------ATCACAA--ATGAAAA---------CT-----G---TT--ATTAAG--C--TTAGATCTTTCATTTT-T-CTAT--TT-A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTC----TACATCATGATCAA------TTGCAAGCTTTCAT-TT-CAATTT--GGAAGC-C-TATGCAC-AAA--A--TAACATT-AAGATATC-TGAACAGATACT--TAA----GTTA-TAG-AGTGGAAA-T--TT----T-TTTAAAATTTT-A--T--------TAA----C-AC----TGATTTTTTACTCTTGACCCGA-----------C-T-AAACATCA-A-ATC--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTTCATT-TTCAAA--------TGAA-C-----AA----CTT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TTT-TAA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatGTGATGTTGACCAACTATC-------------CTCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-A-TAAATTATGATGTTATTTA--GC-AA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTATCAAT-A------CCTGAAAT--T--T-TTC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTTTA-TT-TACGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATATCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----AAGTGACC-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAAAA----T---Cc
gi|16 : --TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAA--AAAT-ATAC-ATAAACTTTCAATTAACTGTTTTAA--A--GAAAAC-------TT--AGACCGGTT--ATTGAG--C--AGAATTTATT---TT--T-CTAT--TTTT--CTTACAGTGACCATGGCATTGGGC-TGTTA---AACCTC--GC--AG------TTTCGAACTTCTAT-TT-CAGGTTGAAAAAAC---TATACAC-ACT--A--TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT---------GTCA-TTG-
gi|16 : TT---T-A--C----AA--AT-A-T-ATCGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGTTGGG-T----A--------T-AG-TT----AT----GTG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TCT-TTA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGG-----CTTAT-G--AA-AAAGG-GGA--------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA--A--TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACT--AAATAAAGTGA-CTG-AGCAGAAA-C--GTATTCT-TTT----TTTT-AA-T-T---A-ATAATGCCC-TT----TGA--------CAATGACTCCATT---T-A--CCGC-AA--ATCA-A-ACCC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTCAATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TCT-CGA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCT--AAAATCTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-AGAAAAAA--ATGACGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTTA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTTTA-TT-TATGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAAGTT--AC-TAAGCGGAAACTGCT--A-TTT--TATTGATCAATAT---TAT-G-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : tAA--A--GAGA---------TTC-AGAG---TT---TT-AG--G--GAGAACCGTT---TTT-TTCTAT--TTT-------TAGTAAGGCTGACCTAAA----AT--------------A--AA------TC--AAGCTT-TAT-TTTCAGGAT--AGAAAC-A-TATACATTAAA--A-----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACT--GAA----ATTG-TTGCAATGATAT-CT-AT----T-TTTGG--TTTT-A--T-T------T-A----C-AA----TGA--------CCTTGACC----------G--TC-------ATCA-A-A----A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTTCATGTT----ATTAATTTCT-AGAA-----AA----ATG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTTT-TAA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AG-----TA-AC-A--AATAAAGG-AG---------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-C-AT-----------TATTGTGT-AC-AA--AT-TTGCAA-AA-AA----AATC-GCA----CAGTA-T---TTG---
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-A-AA-----------CTTTATAT-AC-AC--AT-TTGAtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-C-AT-----------CATTGTGT-AA-AA--AA-TCTAAA-AG-AA--tcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGA-AC-AA--AT-TTTCAA-AG------T-ATC-AGG----CAACA-AGTGTTA---CAAAgcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctatt--AA-AAGGG-GG---------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-T-AA-----------CCTTGT-T-ATGAA--AT-TTGAAA-AA-AA--gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcg-TGACCCCAAAA----C---CTATCAC---GTGAATCAT----TTTC--ACGTT---AGGA--AACT-ATAC-A-A----------------TTTT---------------------T--ACAA---TTTTATTGAG--A--AGCAACTGTT---TTCGG-TTAT--TT----GTAATAGCGAACCTGA-----ATCG--TT----AACTTC--AA--AAAAACACTTTCAATCTTCTATATC-CACG-T--AGAATC-G-TATGCAC-ACACTGTCTTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCC--A---------------AGCGGAAA-CT-GT----T-TTT----Ttcggacaacttttaattgagttct
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccaAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-C-AA-----------CATTCTGT-AC-AA--TT-CTGAAG-AG-------AATT-GGG----CAATT-A---CTGTTTC--AAGCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TT-CATGTT--GGAAAC-A-TATACAC-AAAT-G--TCT-ATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCT--AAA----GTTA-TGA-AGAAGAAA-T--GT----A-TTA----TT------T-T---A-GTAA----C-AA----TGA--------CCTTGACCCAAAT---A-A--CC-T-AA--A--A-A-A-C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTGAATG-T----G----------AG-A-----AA----CTT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TAA-CAA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAAC---AAG----ATTAATTA-AGCAGAAAAT--AT----T-TCA----TTCT-A--T-TTTTA-GTAA----T-GG----GGA--------CC-TGACCTGGTT---TTA--CT-G-AA--ATTT-A-ACC--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTTCATA-T----A--------A-GG-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggT-A--AA-AAAAG-GGTTGTACCT-CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-C------------------------C-AC--AT-TTGCAA-AG-AA--ATGA---ATG-------TA-G---TTG---TTTAAGTTATTGg
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAG-T-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGT--C-TA--AT-TTAGAACAG-AA--agaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttattatcTT-------------CCCAA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAA-AGAAAA--ATGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTTTGT-TTTGAGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTCTA-TT-TATGCA--TGAAGAC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TAAGCGGAAACTG-TTAA-TTT--T-TTAATCAATTG---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAAAA----T---CG--CAA---GCT--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATACAA-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--GCAT---TT--ATTGAG--C-----AACTG-T---TTA-T-CAATG-TTTG--GTTACAATGAACTTGATTTTGATCTTATT----TACCTT--GA--AA------TCCCATGATTTTAT-AT-TACATT--AGAAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TCAA-------T--GAA-----------G-AGAGGAAA-CT-AT----TATTT----TTAT-T--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACACGATT---T-A--CCTT-AA--ATCT-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTTCATG-T----T--------A-AG-T-----AT----CTA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TCT-TGA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-C-AA-----------TCTTGTGT-AT-AG--AT-TTTAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAATA-A---TTG---CAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccat-----TTTTCAGG-T----A--------T-GT-T-----AGGTTTCTA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TGG-TAA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG-----------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-T-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTTAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaAAGCTCC-GT-GT-CATGTT--AGCAACCACTATACAC-AAT--G--TT--ATCAAAATA-TC-TCAAAGGAACTT--AAA----GCTA-TTT-ACCATAAA-CCAGT----TATTC----ATTT-A--T-C---A-ACAATGG-C-AT----TGA--------CCTTGA-CCGATT---T-C--CT-T-AA--AACC-A-ACT--G---CAAG-A--ATG----TT-TTG-----TTTT
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACT--TGA----TTTA-TTG-AGAGGAAA-C--AT----T-TTT----TTCTAA--T-TTA-A-ATAA----C-AGACCTTGA--------ATGTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATTC-A-ATC------C--A-A--A-A----CTGTCTTTATATTTTCATG-T----A--------T-atattaata
gi|36 : --T-T---A-GTAG----C-AT----TTT--------CTTTAACCAGATT---A-A--CC-C-------TA-A-AAC--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTTCGTG-TT---A--------T-C--A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TCA-T-G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : ctatt---A-GTAA----C-AT----TGA--------CTGTGACCTGATTAGGT-A--CA-C-AT--ATCATA-ATT--ATA-CTCA-A--A-A----CT-CC-----------ATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTT-G----AA---CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TTT-TAA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taacTA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TCT-TTATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taCA-CAAAAT-TCAATCAAAATATC--TT-------T-ATTTTA-GGCAACT-GAAGTTTAAT-TGAGTGGAAACTT-C--C-CTT--TACTTCCCAGTTCACACAT-GATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatatcGATCTAAACCAGATT----AACGTT--AA--AA--------CCAATCTTCCTT-TT-C-TATC--AGAAAT-T-TATAAACGAAA--A--TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACT--TAA----GTCA-TTG-TGCTAAAA-C---T----A-TTT----TTCT-A--T--------------------------------------GACCTGATT---T-ATACC-T-A-----------------------------G----CT-TCC-----CTTTCATG-T-------------T-AG-GT----AT----CTA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TCT------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGG-----TGTAT-AAGAA-AAAGG-GG---------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-C-AA-----------CCTTATG---C-AAT-ATCTTAAAA-AG-AA--cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-C-AT-----------TCCTGTATCAC------T-CTTAAA-AG-AGTTATAATC-ATGATATCAAT------TTG---T-TGAGTTATTGGTCAGATGTtcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CATTGTTT-GC-AA--AT----AAG-AA-AA--GCGTCT-G-G----CAACA-T---GTG-------AGCTATTGAGCGGGTGTtgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTGT-A--AACAAAGG-GG---------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-C-AA-----------TCTTtcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGTC-AA-----------CAGTGTGT-AC-GC--TT-TTAAAA-GG-AAG-ATAacgaa
gi|42 : TCATG-T-------------T-AG-G-----AA----CCC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GTT-AAA----AAGAAACT----TAG---TT--AT
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-T-AA------------CTTGTGC-AC-AA--TC-CTAAAA-CG-AA--
gi|5 : tgTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGGGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA-------A---CTTTTTATT-GATACA--AGAAGCG-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TACAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGCT--AT-TAAGCGGAAACTGTT--A-TTG--TATTTATCAAATT---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAAAA----T---CC--CAA---GCT--TCCA----TCCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A---------------------CAA--A--GAAA---------CT--ACAT---TT--ATTGAG--C--AGAAA-CATT---TTA-T-CTATA-TTTG--GTTACAATGAACTTGATCTTGACCTTATT----AACCTT--GA--AA------TCCAAACTTTCTAT-AT-TACACT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACA--AAA----GTTA-CTG-A------------T----T----------------T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACCCAATT---T-AG-CT-T-AA--ATCC-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTTCATT-T----A--------A-AG-T-----AT----CTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TCT-TTA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGG-----CGTAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AAG-ATAATT-ATG----CAATA-
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA---------------CACAT-------------TTTACCT-AAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACA--AGCCTTCATTAAAACT-TCTTA----A-AGGAAA--CTTAAGTTACTGATTG--GA-AACTA-TTTTTTAAT-ATTTAGTAACAGTGA------CACTGACC--T--TAAAC--TGCTC--A----ACC----TCAA------AA-----TCAC-TC-CA---A--AGAA----AACTATATTGAAATTTAA-TCAAAACA-T--ATTAATATAT-A----A-AGAGAAC-ATGGTT--AT-TCAACGGACACCG-T----TTT--TA-ATATCAA----------G-TAAAATTTCATTGAAC-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAAAA----CCAACT--GAA---TGT--TCCT----TCTCAGGTTAT---ACAAACAATT-TCAT-A-AAA-------------ATCTAAA--A--GAAAACTATGGTTCT--ATGG---TT--TTTGAG--T--GAAAACAGTT---TCT-T-GTA---------GTGAAAGTAACCTTGATC--------AAT----AAC---------AA------TTT--ACCCT---T-TT-TATATT--AGATAC-A-TATAAAC-AAA--AC-CTTTATCAAAA-------TAAA--AAACT--AAA----TTTA-TCA-AGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttTTCAATAA--AAAA---------CTTTAGAA---TT--ATTGAG--C--GGATATTATC---TTT---CTAT--TTTA--GTAACAGAGACCATG-CCTAGAC-TTATTTCAAAACC--------AA------TCCCAAGCTTC-AT-TT-CACACT--GGGAAC-C-TATACAC-AA---------C------------------GGAAACT--GAA----GTAA-TTG-AACAAAAA-C--AA----T-TCT----T-CT-G--T-T------TA-----T-AG----TGA--------CTTTGACTAG-TT---A-A--CTAT-AA--ATCA-ATGTC--A-----------A-A----CT-TCT-----TTTTCATG-T----A--------A-AC-A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-AT-GACATCCTGTTA-TAT-TAA----AGG---------AAG---TT--ACCGAGT--GGAAACC-ATTTtgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttcagagGACCA-TG--C-------------CTAGA-------------CTTATTT-CA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA----------------------------A-CGGAAA--CTGAAGTAATTGA--AC-AA-AAACAATTCTTCTGT-TT------ATAGTGA------CTTTGACTAGT--T-AAC--TA-TA--A----ATCAATGTCAA-------A---CTTCTT-TTTCATGTA--AACAACC-TTT-ACA-CAAAATGACA-TCCTGTTA-T--AT-------T-A----A-AG------GAAGTT--AC-CGAGTGGAAACC-----A-TTT--TTTTTA---ATTC---CA--A-TAA-----CAATGACCATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAAAA----T---CCA-CAA----CT--TTAG----TTTT--GTGCT---TAGA--ATTTCATA--A-AAT-------------GTTTTAA-------------------------G---TT--ACTGAG--CTCAGAAACTTTT---TTT-T-CTATAATTTGTAGTGACAG-GAACC---CCT--ACTCAATT----AACCTA--AA--TA------TACTAAGTTTACAT-TT-AGCGTG--AGGAAC-T-TCTACCT-AAA--A--CTTCAGCAAAAtttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagaA-AACCG-TTCTTTTCA-TTTTAGTAGTAAGGA------TGCTGAAT--TAAT-GTC--C--TC--AACACTTA----TCAC------TGGACTTCCTT-TT-TATGTA--AGCAACCTAAC-----CATAATATCC-ATCAA----------------T-A----G-GGAAACT-CAAGCT--AT-TGAGCGGAAACT----------------------TTT---TGTAG-TGA-----TAGTGACC-----ATGAC---CC-AT-T---------A----T---CT--CAATTGGTT--TTTACATATTTC--TTTAT---AATA--ATTT-------------------------CTTTAA--G--GAAA---------CT--AACT---GT--ATTGAT--C--GGAAACTGAC---TTT---CTA------------AAAATGACATTGACCTTGACTCGATT----ATTTTC--AG--TA------TATGAAGTTTCCAA-TT-CGTACT--AGGAAC-A-TGTGCAT-ATA-----TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAAAA----AAAA-TCA-AGTGGAAA-CA-GT----T-T---------T-A--------A-GCAA----C-AC----TGA--------CCTTGAACCAGTA---T-ATTTC-T-TA--CGCA-A-TT-------CCAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTACATG-T----T--------T-TG-A-----A------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TGT-GTC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGG-----CATAC-A--Atatgagcatataaaaaa
gi|9 : -A--AA-AAAGG-GT---------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-C-AA-----------CCTTATGA-AT-AA--A--TTCAAA-TG-A-----AACT-AGG----AAACG-A---TTG---TTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 1111 11111 222222222 111111 222222222222 1111 111111111 2222222 11111 1111111111111 22222222222 44444444444444444444 111111111 111111111 1111 22222222 1111 111111111 11111 11111111 1111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222222 111111111 2222222 3333333333333333333333333333 11111 1111111111111 11111111111 1111111 111111 11 2222
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 66 2222 0 1 99 66666 5 000000000 777 66 4 4 2 4 4 3 111111 0 55 55 4 55 8 55 99999 8888 222222222222 5555 55 55 1 4 4 3 4 3 1 2 1111 999999999 7777 3 3 1 55 3 0 6666666 55 4 444 2 6666 55 3 00000 0 6666666666666 11 5555 22222222222 00 4 55 99999 55 5 666 2 55 3 00000000000000000000 0 66666 555555555 000000000 33 999999 22 555 5555 22222222 3 1 3 4 5555 9999 222222222 888888 222 55 2 2 00 33 0 777 5 33333 66666666 55 0 555 55555 0 2 2 2 2 9999999999999999999999999999999999 9999 2 77777 88888888 4 2 000000000000000000000000000000000000000000000000 4 666666 2 888888888888888888888888 77777 33 333333333 22 22 2 2 2 2 1 4444 333 444 33 888 2 2222222 1 3 99999 99999 2 33 5 2 8888888888888888888888888888 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 6666666666666 22 1 1 33333333333 1 1 44 1 1 1 8888888 2 7 5555 2 7777 999999 66 0 3333 1
lowQualScore : ..................................... .. .... . . .. ..... . ......... ... .. . . . . . . ...... . .. .. . .. . .. ..... .... ............ .... .. .. . . . . . . . . .... ......... .... . . . .. . . ....... .. . ... . .... .. . ..... . ............. .. .... ........... .. . .. ..... .. . ... . .. . .................... . ..... ......... ......... .. ...... .. ... .... ........ . . . . .... .... ......... ...... ... .. . . .. .. . ... . ..... ........ .. . ... ..... . . . . . .................................. .... . ..... ........ . . ................................................ . ...... . ........................ ..... .. ......... .. .. . . . . . .... ... ... .. ... . ....... . . ..... ..... . .. . . ............................ . ..... ... .. . ....... . . ............. .. . . ........... . . .. . . . ....... . . .... . .... ...... .. . .... .
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777 11 1111 7 7 66 44444 7 555555555 999 11 4 0 1 0 0 9 555555 6 55 55 0 55 0 55 99999 5555 000000000000 1111 44 55 4 0 0 6 3 6 2 4 2222 555555555 7777 6 6 8 00 6 4 4444444 00 5 555 3 6666 77 6 00000 1 6666666666666 22 6666 22222222222 88 0 00 22222 00 1 444 0 00 3 55555555555555555555 7 22222 444444444 333333333 99 888888 55 444 9999 11111111 3 0 2 5 8888 6666 555555555 888888 222 22 7 7 55 77 2 333 0 66666 55555555 00 9 222 22222 1 4 4 4 7 4444444444444444444444444444444444 1111 4 22222 55555555 3 4 777777777777777777777777777777777777777777777777 4 333333 1 444444444444444444444444 55555 00 888888888 88 88 0 0 0 0 3 2222 555 111 22 777 9 2222222 4 5 77777 11111 7 44 0 5 7777777777777777777777777777 4 44444 111 11 1 9999999 1 1 4444444444444 22 6 6 44444444444 7 7 00 7 6 8 7777777 5 9 3333 5 9999 000000 44 8 5555 0
consensus : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAA-TA---NTTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAA-TA---NTTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTA--TTTCATCAAAATA-TCTTATAG-ACAGAAAA--AGGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGAAA------TCTTAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTATT-TT-CCTGAA--GGAAGCC-AAT-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATC-A--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TCAGCGGAAACTG-T--AATTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----TAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCATAA----TC--T--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-ACAAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ACAT---TT--ATTGAG--C--AGAAACCCTT---TTTAT-CTATG-TTTG--ATAACATTGAACTTGATCTTGACCATATT----AACCTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-TT-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACA--AAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-T--GT----T-TTT----TTCT-A--TAT---AAGTTA----C-AG----AAA--------CCATGACCCGATT---T-A--CC-TTAA--ATCA-A-ATC--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-C-----AT----CTC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TTT-TAA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGG-----TATAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAA-TA---ATTG---CAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : C-T--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AAGT-ATAC-A-AAAA------------GTTTCCA--G--GAAA---------CT--AAAA---CT--ATTGAG--C--AGAAACTGTT---TAT---CTATG-CTTG--GTTACAATGAATTTGATATTGACCTTATT----AACTTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-AA-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAC--G--TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACA--GAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-C--GT----T-TTT----TT-T-ATTT-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------Ca
gi|10 : -AGGAAA--CTAAAACTATTGA--GCAGA-AACTG-TTTATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATATTGACC--T--T-ATTAACT-TTGAA----ATC----CCAA------GA---TTC--T-AT-AATACATTAGGAACA-TAT-ACC-CAACGTTTCA-T--AATTAGT--AT-------T-A----A-CGAAAACAGAAGTT--AC-TGAGAGGAAAC-G-T----TTT--T-TTT----ATTT---TA--G-TAA-----CAGTGAC-----------------A--------CAAAA----------------------------TTTC--GT--------AA--AATT-A-AC---------------------TTAAA--A--GAAA---------CT--AAAG---TT--ATCGAGATA--AGAAACTATT---Tacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|10 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccG-A--A-A----CG-TTT-----TTTTTATT-T-------------T-AG-T-----AA----CAG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-ACT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGG-----TATAT-A--AA-AAAAG-G----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-C-AA-----------TATTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AA--AATATT-ATG----CAA-TA---ACTG---CAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT----TTCT-G--T-T---G-TTAA----CCAG----TGA--------CCATGACC-GGTT---T-C--TC-T-------CA-A-AT---------AG-A--A-G----TT-TCG-----TTTTTATT-T-------------T-AG-ACATATAC----CTG-T----ATA--CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TCT-TAA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GGATAACTCATGT-A------------G---------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : gA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-C-GA-----------CCATGTGT-AC------T-TTGAAA-AG-------AATT-GTG----CAC-TA---TTTG---TTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaa-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-T-AA-----------CCTTGTGT-AT-AG--AT-ATAAAA-A--------AATC-AGG----CAA-TA---TTTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-AG-T-----AT----CCA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TCCATAA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAG-----CATATGA--AA-AAAGG-GGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-CAAA-----------CCTTGTGT-AT-CATTTT-TTTTAA-AG-AA--TTAGGTAACA----TAA-TAT--ATTG---AAATAACT-TTGTtgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccAT-A--AA-AATGGAGG---------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-C-AATCCAGTTA---CCCTGTGT-AC-AA--AT-TTAAAA-AT-A-----AATT-ACA----CAA-TA---TCTG---Cttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA----CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTAT--TACAAAACCTATACA-AT-A--TGTTATCAAAATAATCTTACA-------AAA--CTTAAGTTAT-GA--AC-GATAATAG-TGTTTTTAT-TTGAAGCAACAATAG------TCGTGGC----------C--CGATT--A----ACC----TCAAAACGAATA---CTAATT-TT-CATATT--AGAAATC-TAT-ACA-CAAAGTTTCA-TCGAACTA-CTTAT-------G-A----ACGGAAAAT-AATGTT--AT-TGAGCAGAAATTG-T----TTTCCTATTTCT-AA------CAT-A-AAT-----CA-CGACC-----T---------GGT-GTACTTCAAAACTAGTC--C--CACGC-T--TCCC----TTTC--ATAAT---A--------T-ATAT----AA-------------GTTAGGA--A--GGGG---------CT--ATAA---CT--tcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-C-AA-----------TTATGGGT-AA-AA--AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgTT-AT-C-A-AAAT------------ATCACAA--ATGAAAA---------CT-----G---TT--ATTAAG--C--TTAGATCTTTCATTTT-T-CTAT--TT-A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTC----TACATCATGATCAA------TTGCAAGCTTTCAT-TT-CAATTT--GGAAGC-C-TATGCAC-AAA--A--TAACATT-AAGATATC-TGAACAGATACT--TAA----GTTA-TAG-AGTGGAAA-T--TT----T-TTTAAAATTTT-A--T--------TAA----C-AC----TGATTTTTTACTCTTGACCCGA-----------C-T-AAACATCA-A-ATC--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTTCATT-TTCAAA--------TGAA-C-----AA----CTT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TTT-TAA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatGTGATGTTGACCAACTATC-------------CTCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-A-TAAATTATGATGTTATTTA--GC-AA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTATCAAT-A------CCTGAAAT--T--T-TTC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTTTA-TT-TACGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATATCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----AAGTGACC-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAAAA----TC--c
gi|16 : --TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAA--AAAT-ATAC-ATAAACTTTCAATTAACTGTTTTAA--A--GAAAAC-------TT--AGACCGGTT--ATTGAG--C--AGAATTTATT---TT--T-CTAT--TTTT--CTTACAGTGACCATGGCATTGGGC-TGTTA---AACCTC--GC--AG------TTTCGAACTTCTAT-TT-CAGGTTGAAAAAAC---TATACAC-ACT--A--TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT---------GTCA-TTG-
gi|16 : TT---T-A--C----AA--AT-A-T-ATCGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGTTGGG-T----A--------T-AG-TT----AT----GTG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TCT-TTA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGG-----CTTAT-G--AA-AAAGG-GGA--------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA--A--TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACT--AAATAAAGTGA-CTG-AGCAGAAA-C--GTATTCT-TTT----TTTT-AA-T-T---A-ATAATGCCC-TT----TGA--------CAATGACTCCATT---T-A--CCGC-AA--ATCA-A-ACCC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTCAATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TCT-CGA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCT--AAAATCTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-AGAAAAAA--ATGACGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTTA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTTTA-TT-TATGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAAGTT--AC-TAAGCGGAAACTGCT--A-TTT--TATTGATCAATAT---TAT-G-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : tAA--A--GAGA---------TTC-AGAG---TT---TT-AG--G--GAGAACCGTT---TTT-TTCTAT--TTT-------TAGTAAGGCTGACCTAAA----AT--------------A--AA------TC--AAGCTT-TAT-TTTCAGGAT--AGAAAC-A-TATACATTAAA--A-----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACT--GAA----ATTG-TTGCAATGATAT-CT-AT----T-TTTGG--TTTT-A--T-T------T-A----C-AA----TGA--------CCTTGACC----------G--TC-------ATCA-A-A----A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTTCATGTT----ATTAATTTCT-AGAA-----AA----ATG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTTT-TAA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AG-----TA-AC-A--AATAAAGG-AG---------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-C-AT-----------TATTGTGT-AC-AA--AT-TTGCAA-AA-AA----AATC-GCA----CAG-TA---TTTG---
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-A-AA-----------CTTTATAT-AC-AC--AT-TTGAtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-C-AT-----------CATTGTGT-AA-AA--AA-TCTAAA-AG-AA--GCAGT----G-----AA-TA---TTTG---tcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGA-AC-AA--AT-TTTCAA-AG------T-ATC-AGG----CAA-CAAGTGTTA---CAAAtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctatt--AA-AAGGG-GG---------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-T-AA-----------CCTTGT-T-ATGAA--AT-TTGAAA-AA-AA--gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcg-TGACCCCAAAA----CC--TATCACGT-GAATCAT----TTTC--ACGTT---AGGA--AACT-ATAC-A-A----------------TTTT---------------------T--ACAA---TTTTATTGAG--A--AGCAACTGTT---TTCGG-TTAT--TT----GTAATAGCGAACCTGA-----ATCG--TT----AACTTC--AA--AAAAACACTTTCAATCTTCTATATC-CACG-T--AGAATC-G-TATGCAC-ACACTGTCTTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCC--A---------------AGCGGAAA-CT-GT----T-TTT----Ttcggacaacttttaattgagttct
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccaAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-C-AA-----------CATTCTGT-AC-AA--TT-CTGAAG-AG-------AATT-GGG----CAA-TT---ACTGTTTC--AAGCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TT-CATGTT--GGAAAC-A-TATACAC-AAAT-G--TCT-ATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCT--AAA----GTTA-TGA-AGAAGAAA-T--GT----A-TTA----TT------T-T---A-GTAA----C-AA----TGA--------CCTTGACCCAAAT---A-A--CC-T-AA--A--A-A-A-C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTGAATG-T----G----------AG-A-----AA----CTT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TAA-CAA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAAC---AAG----ATTAATTA-AGCAGAAAAT--AT----T-TCA----TTCT-A--T-TTTTA-GTAA----T-GG----GGA--------CC-TGACCTGGTT---TTA--CT-G-AA--ATTT-A-ACC--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTTCATA-T----A--------A-GG-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggT-A--AA-AAAAG-GGTTGTACCT-CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-C------------------------C-AC--AT-TTGCAA-AG-AA--ATGA---ATG--------TA---GTTG---TTTAAGTTATTGg
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAG-T-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGT--C-TA--AT-TTAGAACAG-AA--agaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttattatcTT-------------CCCAA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAA-AGAAAA--ATGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTTTGT-TTTGAGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTCTA-TT-TATGCA--TGAAGAC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TAAGCGGAAACTG-TTAA-TTT--T-TTAATCAATTG---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAAAA----TC--G--CAAGC-T--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATACAA-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--GCAT---TT--ATTGAG--C-----AACTG-T---TTA-T-CAATG-TTTG--GTTACAATGAACTTGATTTTGATCTTATT----TACCTT--GA--AA------TCCCATGATTTTAT-AT-TACATT--AGAAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TCAA-------T--GAA-----------G-AGAGGAAA-CT-AT----TATTT----TTAT-T--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACACGATT---T-A--CCTT-AA--ATCT-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTTCATG-T----T--------A-AG-T-----AT----CTA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TCT-TGA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-C-AA-----------TCTTGTGT-AT-AG--AT-TTTAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAA-TA---ATTG---CAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccat-----TTTTCAGG-T----A--------T-GT-T-----AGGTTTCTA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TGG-TAA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG-----------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-T-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTTAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaAAGCTCC-GT-GT-CATGTT--AGCAACCACTATACAC-AAT--G--TT--ATCAAAATA-TC-TCAAAGGAACTT--AAA----GCTA-TTT-ACCATAAA-CCAGT----TATTC----ATTT-A--T-C---A-ACAATGG-C-AT----TGA--------CCTTGA-CCGATT---T-C--CT-T-AA--AACC-A-ACT--G---CAAG-A--ATG----TT-TTG-----TTTT
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACT--TGA----TTTA-TTG-AGAGGAAA-C--AT----T-TTT----TTCTAA--T-TTA-A-ATAA----C-AGACCTTGA--------ATGTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATTC-A-ATC------C--A-A--A-A----CTGTCTTTATATTTTCATG-T----A--------T-atattaata
gi|36 : --T-T---A-GTAG----C-AT----TTT--------CTTTAACCAGATT---A-A--CC-C-------TA-A-AAC--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTTCGTG-TT---A--------T-C--A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TCA-T-G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : ctatt---A-GTAA----C-AT----TGA--------CTGTGACCTGATTAGGT-A--CA-C-AT--ATCATA-ATT--ATA-CTCA-A--A-A----CT-CC-----------ATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTT-G----AA---CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TTT-TAA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taacTA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TCT-TTATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taCA-CAAAAT-TCAATCAAAATATC--TT-------T-ATTTTA-GGCAACT-GAAGTTTAAT-TGAGTGGAAACTT-C--C-CTT--TACTTCCCAGTTCACACAT-GATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatatcGATCTAAACCAGATT----AACGTT--AA--AA--------CCAATCTTCCTT-TT-C-TATC--AGAAAT-T-TATAAACGAAA--A--TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACT--TAA----GTCA-TTG-TGCTAAAA-C---T----A-TTT----TTCT-A--T--------------------------------------GACCTGATT---T-ATACC-T-A-----------------------------G----CT-TCC-----CTTTCATG-T-------------T-AG-GT----AT----CTA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TCT------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGG-----TGTAT-AAGAA-AAAGG-GG---------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-C-AA-----------CCTTATG---C-AAT-ATCTTAAAA-AG-AA--cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-C-AT-----------TCCTGTATCAC------T-CTTAAA-AG-AGTTATAATC-ATGATATCAATTT---GTTG-------AGTTATTGGTCAGATGTtcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CATTGTTT-GC-AA--AT----AAG-AA-AA--GCGTCT-G-G----CAA-CA---TGTG-------AGCTATTGAGCGGGTGTtgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTGT-A--AACAAAGG-GG---------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-C-AA-----------TCTTtcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGTC-AA-----------CAGTGTGT-AC-GC--TT-TTAAAA-GG-AAG-ATAacgaa
gi|42 : TCATG-T-------------T-AG-G-----AA----CCC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GTT-AAA----AAGAAACT----TAG---TT--AT
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-T-AA------------CTTGTGC-AC-AA--TC-CTAAAA-CG-AA--
gi|5 : tgTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGGGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA-------A---CTTTTTATT-GATACA--AGAAGCG-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TACAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGCT--AT-TAAGCGGAAACTGTT--A-TTG--TATTTATCAAATT---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TCCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A---------------------CAA--A--GAAA---------CT--ACAT---TT--ATTGAG--C--AGAAA-CATT---TTA-T-CTATA-TTTG--GTTACAATGAACTTGATCTTGACCTTATT----AACCTT--GA--AA------TCCAAACTTTCTAT-AT-TACACT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACA--AAA----GTTA-CTG-A------------T----T----------------T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACCCAATT---T-AG-CT-T-AA--ATCC-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTTCATT-T----A--------A-AG-T-----AT----CTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TCT-TTA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGG-----CGTAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AAG-ATAATT-ATG----CAA-TA---
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA---------------CACAT-------------TTTACCT-AAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACA--AGCCTTCATTAAAACT-TCTTA----A-AGGAAA--CTTAAGTTACTGATTG--GA-AACTA-TTTTTTAAT-ATTTAGTAACAGTGA------CACTGACC--T--TAAAC--TGCTC--A----ACC----TCAA------AA-----TCAC-TC-CA---A--AGAA----AACTATATTGAAATTTAA-TCAAAACA-T--ATTAATATAT-A----A-AGAGAAC-ATGGTT--AT-TCAACGGACACCG-T----TTT--TA-ATATCAA----------G-TAAAATTTCATTGAAC-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAAAA----CCAAC--TGAATGT--TCCT----TCTCAGGTTAT---ACAAACAATT-TCAT-A-AAA-------------ATCTAAA--A--GAAAACTATGGTTCT--ATGG---TT--TTTGAG--T--GAAAACAGTT---TCT-T-GTA---------GTGAAAGTAACCTTGATC--------AAT----AAC---------AA------TTT--ACCCT---T-TT-TATATT--AGATAC-A-TATAAAC-AAA--AC-CTTTATCAAAA-------TAAA--AAACT--AAA----TTTA-TCA-AGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttTTCAATAA--AAAA---------CTTTAGAA---TT--ATTGAG--C--GGATATTATC---TTT---CTAT--TTTA--GTAACAGAGACCATG-CCTAGAC-TTATTTCAAAACC--------AA------TCCCAAGCTTC-AT-TT-CACACT--GGGAAC-C-TATACAC-AA---------C------------------GGAAACT--GAA----GTAA-TTG-AACAAAAA-C--AA----T-TCT----T-CT-G--T-T------TA-----T-AG----TGA--------CTTTGACTAG-TT---A-A--CTAT-AA--ATCA-ATGTC--A-----------A-A----CT-TCT-----TTTTCATG-T----A--------A-AC-A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-AT-GACATCCTGTTA-TAT-TAA----AGG---------AAG---TT--ACCGAGT--GGAAACC-ATTTtgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttcagagGACCA-TG--C-------------CTAGA-------------CTTATTT-CA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA----------------------------A-CGGAAA--CTGAAGTAATTGA--AC-AA-AAACAATTCTTCTGT-TT------ATAGTGA------CTTTGACTAGT--T-AAC--TA-TA--A----ATCAATGTCAA-------A---CTTCTT-TTTCATGTA--AACAACC-TTT-ACA-CAAAATGACA-TCCTGTTA-T--AT-------T-A----A-AG------GAAGTT--AC-CGAGTGGAAACC-----A-TTT--TTTTTA---ATTC---CA--A-TAA-----CAATGACCATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAAAA----TC--CA-CAA-C-T--TTAG----TTTT--GTGCT---TAGA--ATTTCATA--A-AAT-------------GTTTTAA-------------------------G---TT--ACTGAG--CTCAGAAACTTTT---TTT-T-CTATAATTTGTAGTGACAG-GAACC---CCT--ACTCAATT----AACCTA--AA--TA------TACTAAGTTTACAT-TT-AGCGTG--AGGAAC-T-TCTACCT-AAA--A--CTTCAGCAAAAtttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagaA-AACCG-TTCTTTTCA-TTTTAGTAGTAAGGA------TGCTGAAT--TAAT-GTC--C--TC--AACACTTA----TCAC------TGGACTTCCTT-TT-TATGTA--AGCAACCTAAC-----CATAATATCC-ATCAA----------------T-A----G-GGAAACT-CAAGCT--AT-TGAGCGGAAACT----------------------TTT---TGTAG-TGA-----TAGTGACC-----ATGAC---CC-AT-T-ATCTCAA------TT-------GGT-T--TTTACATATTTC--TTTAT---AATA--ATTT-------------------------CTTTAA--G--GAAA---------CT--AACT---GT--ATTGAT--C--GGAAACTGAC---TTT---CTA------------AAAATGACATTGACCTTGACTCGATT----ATTTTC--AG--TA------TATGAAGTTTCCAA-TT-CGTACT--AGGAAC-A-TGTGCAT-ATA-----TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAAAA----AAAA-TCA-AGTGGAAA-CA-GT----T-T---------T-A--------A-GCAA----C-AC----TGA--------CCTTGAACCAGTA---T-ATTTC-T-TA--CGCA-A-TT-------CCAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTACATG-T----T--------T-TG-A-----A------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TGT-GTC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGG-----CATAC-A--Atatgagcatataaaaaa
gi|9 : -A--AA-AAAGG-GT---------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-C-AA-----------CCTTATGA-AT-AA--A--TTCAAA-TG-A-----AACT-AGG----AAA-CG---ATTG---TTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 1111 11111 222222222 111111 222222222222 1111 111111111 2222222 11111 1111111111111 22222222222 44444444444444444444 111111111 111111111 1111 22222222 1111 111111111 11111 11111111 1111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222222222222222 111111111 2222222 3333333333333333333333333333 11111 1111111111111 11111111111 1111111 111111 11 2222
lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555 66 2222 0 1 99 66666 5 000000000 777 66 4 4 2 4 4 3 111111 0 55 55 4 55 8 55 99999 8888 222222222222 5555 55 55 1 4 4 3 4 3 1 2 1111 999999999 7777 3 3 1 55 3 0 6666666 55 4 444 2 6666 55 3 00000 0 6666666666666 11 5555 22222222222 00 4 55 99999 55 5 666 2 55 3 00000000000000000000 0 66666 555555555 000000000 33 999999 22 555 5555 22222222 3 1 3 4 5555 9999 222222222 888888 222 55 2 2 00 33 0 777 5 33333 66666666 55 0 555 55555 0 2 2 2 2 9999999999999999999999999999999999 9999 2 77777 88888888 4 2 000000000000000000000000000000000000000000000000 4 666666 2 888888888888888888888888 77777 33 333333333 22 22 2 2 2 2 1 4444 333 444 33 888 2 2222222 1 3 99999 99999 2 33 5 2 8888888888888888888888888888 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 6666666666666 22 1 1 33333333333 1 1 44 1 1 1 8888888 2 7 5555 2 7777 999999 66 0 3333 1
lowQualScore : ..................................... .. .... . . .. ..... . ......... ... .. . . . . . . ...... . .. .. . .. . .. ..... .... ............ .... .. .. . . . . . . . . .... ......... .... . . . .. . . ....... .. . ... . .... .. . ..... . ............. .. .... ........... .. . .. ..... .. . ... . .. . .................... . ..... ......... ......... .. ...... .. ... .... ........ . . . . .... .... ......... ...... ... .. . . .. .. . ... . ..... ........ .. . ... ..... . . . . . .................................. .... . ..... ........ . . ................................................ . ...... . ........................ ..... .. ......... .. .. . . . . . .... ... ... .. ... . ....... . . ..... ..... . .. . . ............................ . ..... ... .. . ....... . . ............. .. . . ........... . . .. . . . ....... . . .... . .... ...... .. . .... .
lowQualScore : 7777777777777777777777777777777777777 11 1111 7 7 66 44444 7 555555555 999 11 4 0 1 0 0 9 555555 6 55 55 0 55 0 55 99999 5555 000000000000 1111 44 55 4 0 0 6 3 6 2 4 2222 555555555 7777 6 6 8 00 6 4 4444444 00 5 555 3 6666 77 6 00000 1 6666666666666 22 6666 22222222222 88 0 00 22222 00 1 444 0 00 3 55555555555555555555 7 22222 444444444 333333333 99 888888 55 444 9999 11111111 3 0 2 5 8888 6666 555555555 888888 222 22 7 7 55 77 2 333 0 66666 55555555 00 9 222 22222 1 4 4 4 7 4444444444444444444444444444444444 1111 4 22222 55555555 3 4 777777777777777777777777777777777777777777777777 4 333333 1 444444444444444444444444 55555 00 888888888 88 88 0 0 0 0 3 2222 555 111 22 777 9 2222222 4 5 77777 11111 7 44 0 5 7777777777777777777777777777 4 44444 111 11 1 9999999 1 1 4444444444444 22 6 6 44444444444 7 7 00 7 6 8 7777777 5 9 3333 5 9999 000000 44 8 5555 0
consensus : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAA-TA---NTTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAA-TA---NTTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTA--TTTCATCAAAATA-TCTTATAG-ACAGAAAA--AGGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGAAA------TCTTAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTATT-TT-CCTGAA--GGAAGCC-AAT-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATC-A--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TCAGCGGAAACTG-T--AATTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----TAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCATAA----TC--T--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-ACAAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ACAT---TT--ATTGAG--C--AGAAACCCTT---TTTAT-CTATG-TTTG--ATAACATTGAACTTGATCTTGACCATATT----AACCTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-TT-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACA--AAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-T--GT----T-TTT----TTCT-A--TAT---AAGTTA----C-AG----AAA--------CCATGACCCGATT---T-A--CC-TTAA--ATCA-A-ATC--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-C-----AT----CTC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TTT-TAA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGG-----TATAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAA-TA---ATTG---CAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : C-T--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AAGT-ATAC-A-AAAA------------GTTTCCA--G--GAAA---------CT--AAAA---CT--ATTGAG--C--AGAAACTGTT---TAT---CTATG-CTTG--GTTACAATGAATTTGATATTGACCTTATT----AACTTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-AA-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAC--G--TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACA--GAA----GTTA-CTG-AGAGGAAA-C--GT----T-TTT----TT-T-ATTT-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------Ca
gi|10 : -AGGAAA--CTAAAACTATTGA--GCAGA-AACTG-TTTATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATATTGACC--T--T-ATTAACT-TTGAA----ATC----CCAA------GA---TTC--T-AT-AATACATTAGGAACA-TAT-ACC-CAACGTTTCA-T--AATTAGT--AT-------T-A----A-CGAAAACAGAAGTT--AC-TGAGAGGAAAC-G-T----TTT--T-TTT----ATTT---TA--G-TAA-----CAGTGAC-----------------A--------CAAAA----------------------------TTTC--GT--------AA--AATT-A-AC---------------------TTAAA--A--GAAA---------CT--AAAG---TT--ATCGAGATA--AGAAACTATT---Tacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|10 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccG-A--A-A----CG-TTT-----TTTTTATT-T-------------T-AG-T-----AA----CAG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-ACT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGG-----TATAT-A--AA-AAAAG-G----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-C-AA-----------TATTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AA--AATATT-ATG----CAA-TA---ACTG---CAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT----TTCT-G--T-T---G-TTAA----CCAG----TGA--------CCATGACC-GGTT---T-C--TC-T-------CA-A-AT---------AG-A--A-G----TT-TCG-----TTTTTATT-T-------------T-AG-ACATATAC----CTG-T----ATA--CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TCT-TAA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GGATAACTCATGT-A------------G---------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : gA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-C-GA-----------CCATGTGT-AC------T-TTGAAA-AG-------AATT-GTG----CAC-TA---TTTG---TTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaa-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-T-AA-----------CCTTGTGT-AT-AG--AT-ATAAAA-A--------AATC-AGG----CAA-TA---TTTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-AG-T-----AT----CCA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TCCATAA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAG-----CATATGA--AA-AAAGG-GGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-CAAA-----------CCTTGTGT-AT-CATTTT-TTTTAA-AG-AA--TTAGGTAACA----TAA-TAT--ATTG---AAATAACT-TTGTtgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccAT-A--AA-AATGGAGG---------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-C-AATCCAGTTA---CCCTGTGT-AC-AA--AT-TTAAAA-AT-A-----AATT-ACA----CAA-TA---TCTG---Cttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA----CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTAT--TACAAAACCTATACA-AT-A--TGTTATCAAAATAATCTTACA-------AAA--CTTAAGTTAT-GA--AC-GATAATAG-TGTTTTTAT-TTGAAGCAACAATAG------TCGTGGC----------C--CGATT--A----ACC----TCAAAACGAATA---CTAATT-TT-CATATT--AGAAATC-TAT-ACA-CAAAGTTTCA-TCGAACTA-CTTAT-------G-A----ACGGAAAAT-AATGTT--AT-TGAGCAGAAATTG-T----TTTCCTATTTCT-AA------CAT-A-AAT-----CA-CGACC-----T---------GGT-GTACTTCAAAACTAGTC--C--CACGC-T--TCCC----TTTC--ATAAT---A--------T-ATAT----AA-------------GTTAGGA--A--GGGG---------CT--ATAA---CT--tcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-C-AA-----------TTATGGGT-AA-AA--AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgTT-AT-C-A-AAAT------------ATCACAA--ATGAAAA---------CT-----G---TT--ATTAAG--C--TTAGATCTTTCATTTT-T-CTAT--TT-A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTC----TACATCATGATCAA------TTGCAAGCTTTCAT-TT-CAATTT--GGAAGC-C-TATGCAC-AAA--A--TAACATT-AAGATATC-TGAACAGATACT--TAA----GTTA-TAG-AGTGGAAA-T--TT----T-TTTAAAATTTT-A--T--------TAA----C-AC----TGATTTTTTACTCTTGACCCGA-----------C-T-AAACATCA-A-ATC--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTTCATT-TTCAAA--------TGAA-C-----AA----CTT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TTT-TAA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatGTGATGTTGACCAACTATC-------------CTCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-A-TAAATTATGATGTTATTTA--GC-AA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTATCAAT-A------CCTGAAAT--T--T-TTC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTTTA-TT-TACGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATATCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----AAGTGACC-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAAAA----TC--c
gi|16 : --TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAA--AAAT-ATAC-ATAAACTTTCAATTAACTGTTTTAA--A--GAAAAC-------TT--AGACCGGTT--ATTGAG--C--AGAATTTATT---TT--T-CTAT--TTTT--CTTACAGTGACCATGGCATTGGGC-TGTTA---AACCTC--GC--AG------TTTCGAACTTCTAT-TT-CAGGTTGAAAAAAC---TATACAC-ACT--A--TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT---------GTCA-TTG-
gi|16 : TT---T-A--C----AA--AT-A-T-ATCGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGTTGGG-T----A--------T-AG-TT----AT----GTG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TCT-TTA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGG-----CTTAT-G--AA-AAAGG-GGA--------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA--A--TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACT--AAATAAAGTGA-CTG-AGCAGAAA-C--GTATTCT-TTT----TTTT-AA-T-T---A-ATAATGCCC-TT----TGA--------CAATGACTCCATT---T-A--CCGC-AA--ATCA-A-ACCC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTCAATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TCT-CGA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCT--AAAATCTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-AGAAAAAA--ATGACGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTTA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTTTA-TT-TATGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAAGTT--AC-TAAGCGGAAACTGCT--A-TTT--TATTGATCAATAT---TAT-G-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : tAA--A--GAGA---------TTC-AGAG---TT---TT-AG--G--GAGAACCGTT---TTT-TTCTAT--TTT-------TAGTAAGGCTGACCTAAA----AT--------------A--AA------TC--AAGCTT-TAT-TTTCAGGAT--AGAAAC-A-TATACATTAAA--A-----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACT--GAA----ATTG-TTGCAATGATAT-CT-AT----T-TTTGG--TTTT-A--T-T------T-A----C-AA----TGA--------CCTTGACC----------G--TC-------ATCA-A-A----A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTTCATGTT----ATTAATTTCT-AGAA-----AA----ATG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTTT-TAA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AG-----TA-AC-A--AATAAAGG-AG---------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-C-AT-----------TATTGTGT-AC-AA--AT-TTGCAA-AA-AA----AATC-GCA----CAG-TA---TTTG---
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-A-AA-----------CTTTATAT-AC-AC--AT-TTGAtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-C-AT-----------CATTGTGT-AA-AA--AA-TCTAAA-AG-AA--GCAGT----G-----AA-TA---TTTG---tcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGA-AC-AA--AT-TTTCAA-AG------T-ATC-AGG----CAA-CAAGTGTTA---CAAAtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctatt--AA-AAGGG-GG---------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-T-AA-----------CCTTGT-T-ATGAA--AT-TTGAAA-AA-AA--gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcg-TGACCCCAAAA----CC--TATCACGT-GAATCAT----TTTC--ACGTT---AGGA--AACT-ATAC-A-A----------------TTTT---------------------T--ACAA---TTTTATTGAG--A--AGCAACTGTT---TTCGG-TTAT--TT----GTAATAGCGAACCTGA-----ATCG--TT----AACTTC--AA--AAAAACACTTTCAATCTTCTATATC-CACG-T--AGAATC-G-TATGCAC-ACACTGTCTTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCC--A---------------AGCGGAAA-CT-GT----T-TTT----Ttcggacaacttttaattgagttct
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccaAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-C-AA-----------CATTCTGT-AC-AA--TT-CTGAAG-AG-------AATT-GGG----CAA-TT---ACTGTTTC--AAGCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TT-CATGTT--GGAAAC-A-TATACAC-AAAT-G--TCT-ATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCT--AAA----GTTA-TGA-AGAAGAAA-T--GT----A-TTA----TT------T-T---A-GTAA----C-AA----TGA--------CCTTGACCCAAAT---A-A--CC-T-AA--A--A-A-A-C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTGAATG-T----G----------AG-A-----AA----CTT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TAA-CAA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAAC---AAG----ATTAATTA-AGCAGAAAAT--AT----T-TCA----TTCT-A--T-TTTTA-GTAA----T-GG----GGA--------CC-TGACCTGGTT---TTA--CT-G-AA--ATTT-A-ACC--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTTCATA-T----A--------A-GG-A-----AC----CTA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggT-A--AA-AAAAG-GGTTGTACCT-CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-C------------------------C-AC--AT-TTGCAA-AG-AA--ATGA---ATG--------TA---GTTG---TTTAAGTTATTGg
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAG-T-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGT--C-TA--AT-TTAGAACAG-AA--agaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttattatcTT-------------CCCAA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAA-AGAAAA--ATGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTTTGT-TTTGAGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTCTA-TT-TATGCA--TGAAGAC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TAAGCGGAAACTG-TTAA-TTT--T-TTAATCAATTG---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAAAA----TC--G--CAAGC-T--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATACAA-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--GCAT---TT--ATTGAG--C-----AACTG-T---TTA-T-CAATG-TTTG--GTTACAATGAACTTGATTTTGATCTTATT----TACCTT--GA--AA------TCCCATGATTTTAT-AT-TACATT--AGAAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TCAA-------T--GAA-----------G-AGAGGAAA-CT-AT----TATTT----TTAT-T--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACACGATT---T-A--CCTT-AA--ATCT-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTTCATG-T----T--------A-AG-T-----AT----CTA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TCT-TGA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-C-AA-----------TCTTGTGT-AT-AG--AT-TTTAAA-AGAAA--ATAATT-ATG----CAA-TA---ATTG---CAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccat-----TTTTCAGG-T----A--------T-GT-T-----AGGTTTCTA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TGG-TAA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG-----------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-T-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTTAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaAAGCTCC-GT-GT-CATGTT--AGCAACCACTATACAC-AAT--G--TT--ATCAAAATA-TC-TCAAAGGAACTT--AAA----GCTA-TTT-ACCATAAA-CCAGT----TATTC----ATTT-A--T-C---A-ACAATGG-C-AT----TGA--------CCTTGA-CCGATT---T-C--CT-T-AA--AACC-A-ACT--G---CAAG-A--ATG----TT-TTG-----TTTT
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACT--TGA----TTTA-TTG-AGAGGAAA-C--AT----T-TTT----TTCTAA--T-TTA-A-ATAA----C-AGACCTTGA--------ATGTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATTC-A-ATC------C--A-A--A-A----CTGTCTTTATATTTTCATG-T----A--------T-atattaata
gi|36 : --T-T---A-GTAG----C-AT----TTT--------CTTTAACCAGATT---A-A--CC-C-------TA-A-AAC--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTTCGTG-TT---A--------T-C--A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TCA-T-G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : ctatt---A-GTAA----C-AT----TGA--------CTGTGACCTGATTAGGT-A--CA-C-AT--ATCATA-ATT--ATA-CTCA-A--A-A----CT-CC-----------ATG-T-------------T-AG-G-----AA----CTT-G----AA---CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TTT-TAA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taacTA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TCT-TTATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taCA-CAAAAT-TCAATCAAAATATC--TT-------T-ATTTTA-GGCAACT-GAAGTTTAAT-TGAGTGGAAACTT-C--C-CTT--TACTTCCCAGTTCACACAT-GATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatatcGATCTAAACCAGATT----AACGTT--AA--AA--------CCAATCTTCCTT-TT-C-TATC--AGAAAT-T-TATAAACGAAA--A--TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACT--TAA----GTCA-TTG-TGCTAAAA-C---T----A-TTT----TTCT-A--T--------------------------------------GACCTGATT---T-ATACC-T-A-----------------------------G----CT-TCC-----CTTTCATG-T-------------T-AG-GT----AT----CTA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TCT------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGG-----TGTAT-AAGAA-AAAGG-GG---------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-C-AA-----------CCTTATG---C-AAT-ATCTTAAAA-AG-AA--cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-C-AT-----------TCCTGTATCAC------T-CTTAAA-AG-AGTTATAATC-ATGATATCAATTT---GTTG-------AGTTATTGGTCAGATGTtcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CATTGTTT-GC-AA--AT----AAG-AA-AA--GCGTCT-G-G----CAA-CA---TGTG-------AGCTATTGAGCGGGTGTtgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTGT-A--AACAAAGG-GG---------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-C-AA-----------TCTTtcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGTC-AA-----------CAGTGTGT-AC-GC--TT-TTAAAA-GG-AAG-ATAacgaa
gi|42 : TCATG-T-------------T-AG-G-----AA----CCC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GTT-AAA----AAGAAACT----TAG---TT--AT
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-T-AA------------CTTGTGC-AC-AA--TC-CTAAAA-CG-AA--
gi|5 : tgTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGGGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA-------A---CTTTTTATT-GATACA--AGAAGCG-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TACAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGCT--AT-TAAGCGGAAACTGTT--A-TTG--TATTTATCAAATT---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TCCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A---------------------CAA--A--GAAA---------CT--ACAT---TT--ATTGAG--C--AGAAA-CATT---TTA-T-CTATA-TTTG--GTTACAATGAACTTGATCTTGACCTTATT----AACCTT--GA--AA------TCCAAACTTTCTAT-AT-TACACT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACA--AAA----GTTA-CTG-A------------T----T----------------T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCATGACCCAATT---T-AG-CT-T-AA--ATCC-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTTCATT-T----A--------A-AG-T-----AT----CTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TCT-TTA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGG-----CGTAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG-AAG-ATAATT-ATG----CAA-TA---
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA---------------CACAT-------------TTTACCT-AAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACA--AGCCTTCATTAAAACT-TCTTA----A-AGGAAA--CTTAAGTTACTGATTG--GA-AACTA-TTTTTTAAT-ATTTAGTAACAGTGA------CACTGACC--T--TAAAC--TGCTC--A----ACC----TCAA------AA-----TCAC-TC-CA---A--AGAA----AACTATATTGAAATTTAA-TCAAAACA-T--ATTAATATAT-A----A-AGAGAAC-ATGGTT--AT-TCAACGGACACCG-T----TTT--TA-ATATCAA----------G-TAAAATTTCATTGAAC-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAAAA----CCAAC--TGAATGT--TCCT----TCTCAGGTTAT---ACAAACAATT-TCAT-A-AAA-------------ATCTAAA--A--GAAAACTATGGTTCT--ATGG---TT--TTTGAG--T--GAAAACAGTT---TCT-T-GTA---------GTGAAAGTAACCTTGATC--------AAT----AAC---------AA------TTT--ACCCT---T-TT-TATATT--AGATAC-A-TATAAAC-AAA--AC-CTTTATCAAAA-------TAAA--AAACT--AAA----TTTA-TCA-AGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttTTCAATAA--AAAA---------CTTTAGAA---TT--ATTGAG--C--GGATATTATC---TTT---CTAT--TTTA--GTAACAGAGACCATG-CCTAGAC-TTATTTCAAAACC--------AA------TCCCAAGCTTC-AT-TT-CACACT--GGGAAC-C-TATACAC-AA---------C------------------GGAAACT--GAA----GTAA-TTG-AACAAAAA-C--AA----T-TCT----T-CT-G--T-T------TA-----T-AG----TGA--------CTTTGACTAG-TT---A-A--CTAT-AA--ATCA-ATGTC--A-----------A-A----CT-TCT-----TTTTCATG-T----A--------A-AC-A-----AC----CTT-T----A----CA--CA--AA-AT-GACATCCTGTTA-TAT-TAA----AGG---------AAG---TT--ACCGAGT--GGAAACC-ATTTtgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttcagagGACCA-TG--C-------------CTAGA-------------CTTATTT-CA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA----------------------------A-CGGAAA--CTGAAGTAATTGA--AC-AA-AAACAATTCTTCTGT-TT------ATAGTGA------CTTTGACTAGT--T-AAC--TA-TA--A----ATCAATGTCAA-------A---CTTCTT-TTTCATGTA--AACAACC-TTT-ACA-CAAAATGACA-TCCTGTTA-T--AT-------T-A----A-AG------GAAGTT--AC-CGAGTGGAAACC-----A-TTT--TTTTTA---ATTC---CA--A-TAA-----CAATGACCATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAAAA----TC--CA-CAA-C-T--TTAG----TTTT--GTGCT---TAGA--ATTTCATA--A-AAT-------------GTTTTAA-------------------------G---TT--ACTGAG--CTCAGAAACTTTT---TTT-T-CTATAATTTGTAGTGACAG-GAACC---CCT--ACTCAATT----AACCTA--AA--TA------TACTAAGTTTACAT-TT-AGCGTG--AGGAAC-T-TCTACCT-AAA--A--CTTCAGCAAAAtttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagaA-AACCG-TTCTTTTCA-TTTTAGTAGTAAGGA------TGCTGAAT--TAAT-GTC--C--TC--AACACTTA----TCAC------TGGACTTCCTT-TT-TATGTA--AGCAACCTAAC-----CATAATATCC-ATCAA----------------T-A----G-GGAAACT-CAAGCT--AT-TGAGCGGAAACT----------------------TTT---TGTAG-TGA-----TAGTGACC-----ATGAC---CC-AT-T-ATCTCAA------TT-------GGT-T--TTTACATATTTC--TTTAT---AATA--ATTT-------------------------CTTTAA--G--GAAA---------CT--AACT---GT--ATTGAT--C--GGAAACTGAC---TTT---CTA------------AAAATGACATTGACCTTGACTCGATT----ATTTTC--AG--TA------TATGAAGTTTCCAA-TT-CGTACT--AGGAAC-A-TGTGCAT-ATA-----TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAAAA----AAAA-TCA-AGTGGAAA-CA-GT----T-T---------T-A--------A-GCAA----C-AC----TGA--------CCTTGAACCAGTA---T-ATTTC-T-TA--CGCA-A-TT-------CCAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTACATG-T----T--------T-TG-A-----A------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TGT-GTC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGG-----CATAC-A--Atatgagcatataaaaaa
gi|9 : -A--AA-AAAGG-GT---------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-C-AA-----------CCTTATGA-AT-AA--A--TTCAAA-TG-A-----AACT-AGG----AAA-CG---ATTG---TTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
blockSeqs : ACTATCCTCAAAGCAATGTCACAA CA ATTC A AC AGC A TATAGAAA TTA TT A T T A G G ATTTGA AG AA A AA A GA ACACT AATG AACGAATAC TTTA TC TT A T T T T A C T CTT TAATATAT TTTT C A A TA T GTTAA CC A ATC T CACA TA A AATTT ATGACTTTGA CG TCTA CTAGTCC G AA ACATA AG G TCA G AC C ATAAACTTTCAATTAACTG ATG ACTATGGTT AGACCGG TT ATAA TG CAT TTT AATTTGTA T A T T CCTT TCAA ATCATGATC AAACAC CCC CT A T GA CAC T CTGTC CAAATATA GG AAA TAAAG A C A A GTATTCTTTTTTTTAATTAA TGCC C GACCT TTTTTTAC A C AGGTACACATATCATAATTATACTCAAAA G TTTATA T ATTAATTTCTAGAA GGTTT TA ATTTG AT TC T G C A A TTTT TAA AAT TA ATA C CTCGTT T T CGTTT TAACT G AG T A GAAATATCTCATGCAG T TTCAT ATA AA A TATATG T A ACAGAGCTGGAC TG T A TAAGCAGCCTT C G TT C A C AGTTAT A T ATAT T AGTG TTTC CA . C
blockSeqs : ATGATCCTCAAAGCCATTACCCGA G . G T TA . TATAAAGA C . . . A . . A . . . . . C . A . TGGACT ATT A . A . . . T . T C GT TA . . . T . . GTTA . A ATC T T T . . TTTGCCCG CG TGT CCTAT . . A . A . G . . AAAAAG TAA AC TTAGAA . CTCA TA . CGG GCTTG A T A T TGCA A TTTGA . TGC TC . . . A G TG TGGAAATG A G G . . T . ATTTCATTCTATTTTTAG TGG . G . T C TTACTGAAATTTAACCAATCCAACA G T . TCAAATGAAC A G CATGA . . . . . . A . . . . T . GTGT T C C . . . C . TTGTACCTCATGTA . GA A . . TT T A AATGTC . . . TCCAGTTA . . T . G . AAAAT . T . . TA CAA CG
blockSeqs : AGACACAT G . G A GA . TATAAT C . . . T . . T . . . . . . . A . GAT TTA C . G . . . A . T A TC TA . . . C . . GCTA . A ATC T T T . . ATTGC CG CTG CCAAC . . C . G . G . . AAAATA G . CAGAG . CA CT . TT GTTTG T C C T TCTT . CTCGC . TTC CT . . . C . AC AAAAAAAA C T G . . C . CAGTTATTCATTTATCAA . . G . A C TACCTTAAATCTAATCACTAGTAAG . G . TAGACATAT C G GGACA . . . . . . A . . . . C . CGCG T C T . . . . . AATAACCTATGTC . AT . . . GT . . CAT . . . . . . . . A . AAGAT . G . . A TTG CA
blockSeqs : TGCCTAGA G . A A TA . AAGG A . . . T . . A . . . . . . . T . TCT TTA T . G . . . G . C A C TA . . . A . . GTTA . A CCC T T T . . TTTGC TG TTG TCCA . . A . G . G . . AAAAAG A . AAAA . CT TA . AT ATTTG A G C A CCAG . TTCAA . TTC CT . . . A . G GAGATTAC C A G . . T . ATTTTTTTCTAATTTAAA . . C . T T TAGCTTAAATCCAATCACTAGTAAG . G . ATAGTT T A ATA . . . . . . A . . . . A . GTGG T T C . . . . . CGTAACTCATGT . TT . . . T . . A . . . . . . . . T . AAGAT . C . . T AAA .
blockSeqs : A . G G TA . ACGG A . . . T . . A . . . . . . . T . TAT CTA T . G . . . G . C A C TA . . . G . . TCC . A ATC T G T . . TTGAC AC TTG TCG . . T . G . G . . AAAAA A . AAAG . CA CG . AT TTTT T A T T CCTT . CTTGA . CCC TT . . . G . A TCACAATA C G A . . C . TATTATTTTTATTTTAG . . T . T C TATTTCTTACGCAATTCCAGGTTAG . A . AAGGA A T GA . . . . . . T . . . . C . GCGG T G A . . . . . CACAACTCATTT . TT . . . T . . C . . . . . . . . A . AAAA . C . . T CAA
blockSeqs : C . . . . . CA C . . . C . . G . . . . . . . T . TCT CAC T . G . . . G . A A C T . . . A . . GT . A ATC A T T . . ATGAC G ATA TCC . . A . T . C . . AAATG A . ATAA . GG TG . TT TTTA T A T A CTCA . GTTAA . CCA CC . . . A . A TAAGATA A A G . . A . GTTTTTTTTATTTTAG . . A . A C TACCGCAAATCAAACCCACCAACA . C . TAAGT T G AA . . . . . . G . . . . T . CCTG A G C . . . . . CATGCTATAC . TG . . . T . . A . . . . . . . . G . AATT . C . . T TTT
blockSeqs : C . . . T . . G . . . . . . . T . AC CTT G . A . . . T . C A C G . . . G . . GT . T CT T C T . . T C TT TT . . A . G . A . . AAG A . ACAA . AA TG . TT TTA G A T T CTCG . CTTGA . CCC CT . . . A . A AAAAATG T A A . . C . TTTTTTAAAATTTTAT . . A . T C TCCTTAAAACCAACTGCAAGAATG . C . ATGTT A G A . . . . . . A . . . . A . GCGG T T T . . . . . CATAA . TG . . . T . . C . . . . . . . . G . AAGC . G . . T CAA
blockSeqs : . . . C . . G . . . . . . . A . AA CTT C . A . . . G . C A T T . . . G . . GT . . A T T . . . . . . . . . T . T . A . . AA A . GCAT . CA CA . T TTT A C T A GCT . CTAAA . ACT AC . . . T . A CAAAATA T A G . . A . TATTTTTGGTTTTATT . . G . G A CTAAACATCAAATCAATGCCAGA . C . TATCA A T A . . . . . . A . . . . T . . C C C . . . . . CTTAA . GC . . . T . . C . . . . . . . . T . AAAT . G . . T TTG
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . A . AC T T . . . . . A . T T T T . . . A . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . A A . ACAT . TG AG . T TT G C C T TCG . TTCAG . ATG CC . . . A . G AAGAAAA A G T . . C . GTATTATTTTAG . . G . T T TACAAATATATCGTACAGGAAA . C . TAGGT A A A . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . CATAA . GC . . . T . . T . . . . . . . . T . AAGC . T . . A .
blockSeqs : . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . ATGG . CG TA . T . . A C . CTT . A . CC T . . . A . G AATTAG C A G . . A . AATTCTTCTGTT . . T . G T GTCATCAAAACTATGAGTAAT . C . AAAGT C A A . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . CATAA . GC . . . A . . C . . . . . . . . G . AA . T . . G .
blockSeqs : . . G . AACT . CG TT . T . . C C . . . C . TT C . . . C . A TCAAAA G T G . . C . TATTTTTCTAT . . T . A C AACCTAAAAAACATTCTGAAT . G . AAACA T A A . . . . . . A . . . . T . . . . . CATAA . CA . . . G . . C . . . . . . . . G . A . T . . A
blockSeqs : . . G . C TG . . . . . . . C C . . . T . G CAAAA T T T . . C . AGTTTTAAG . . T . T A TACCTAAATTCAATCCAAAA . C . TTTGA C T G . . . . . . A . . . . . . . . . . CAT . AT . . . A . . A . . . . . . . . G . T . T . . G
blockSeqs : . . G . . . . . A . A TT A A G . . C . TTTTAG . . G . T C AACTATAAATCAATGTCAAA . C . TAGT A T A . . . . . . T . . . . . . . . . . TAT . GC . . . G . . C . . . . . . . . A . A . G . . T
blockSeqs : . . . . . . . C A A . . T . . . G . . . AACCCTAAAACACTTAG . C . TAGG T A C . . . . . . A . . . . . . . . TTG . TA . . . T . . C . . . . . . . . T . . . . . . A
blockSeqs : . . . G . . . . . . C . . . TCTCTCAAATAGAAG . T . GAGA A A A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TATACCTAG . C . TAGG T C A . . . . . . A . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . TAGG C A A . . . . . . T . . . . . A . . A . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . T A . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . A .
blockSeqs : A A . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . A .
blockSeqs : G . . C . . . . . . . . A .
blockSeqs : T . . C . . . . . . . . C .
blockSeqs : T . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ACGACCTCAAGATA*********************** TA*** GTA**** TCC******** T*** GTTTTTTTTATTTTAG****************** AAT**** CG
originalCons : AGTGATGTTGACCAATGATC-------------CCCGA-------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT-T-CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-C--GT----T-TTT----TTCT-A--T-T---A-GTAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG-AA--ATAATT-ACG----CAA-TA---NTTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
finalCons : AGTGATGTTGACCAACGACCTCAAGATA-----------------------TTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACATA---TTTCATCAAAATA-TCTTATAT-A-AGGAAA--NTGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTGTA----TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAATCC--------CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANAN---TT--ATTGAG--C--GGAAACCGTT---TTT---CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTG-AGCGGAAA-CGTTTTTTTTATTTTAG------------------TAA----C-AG----TGA--------CCNTGACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-AG-N-----AN----CTN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AGAAT----AATT-ACG----CAA-TA---NTTG---CAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111
lowQualScore : 00000000000000000000000 1111 11111 11111111 1111 111111 222222222222 1111 111111111 2222222 11111 1111111111111 22222222222 44444444444444444444 1111111111111111111111 111111 11 11 1111 1111 111111111 11111 11111111 1111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222222222222222222 111111111 1111111 3333333333333333333333333333 11111 1111111111111 11111111111 222222222222222 111111 111 11 2222
lowQualScore : 22222222222222222222222 66 2222 0 1 5 66666 5 44444444 2222 66 4 4 2 4 4 3 111111 0 55 55 4 55 8 55 99999 8888 222222222222 5555 55 55 1 4 4 3 4 3 1 2 1111 999999999 7777 3 3 1 55 3 0 6666666 55 4 444 2 6666 55 3 00000 0 6666666666666 11 5555 22222222222 00 4 55 99999 55 5 666 2 55 3 00000000000000000000 3 66666 7777777777777777777777 999999 000000 77 77 0000 3 1 3 4 5555 9999 222222222 888888 222 55 2 2 00 33 0 777 5 33333 66666666 55 0 555 55555 0 2 33 8888888888888 2 777 2 666 2 2 55555 88888888 3 7777777 444444444444444444444444444444444444444444444444 4 666666 2 9999999999999999999999999 77777 22 22 000000000 22 22 1 1 1 1 222 4444 333 333 33 888 2 9999999 1 3 99999 99999 2 33 5 2 8888888888888888888888888888 2 22222 666 33 2 7777777 3 3 6666666666666 22 1 1 33333333333 1 1 44 1 1 1 111111111111111 33 000000 2 8888 444 66 0 3333 1
lowQualScore : ....................... .. .... . . . ..... . ........ .... .. . . . . . . ...... . .. .. . .. . .. ..... .... ............ .... .. .. . . . . . . . . .... ......... .... . . . .. . . ....... .. . ... . .... .. . ..... . ............. .. .... ........... .. . .. ..... .. . ... . .. . .................... . ..... ...................... ...... ...... .. .. .... . . . . .... .... ......... ...... ... .. . . .. .. . ... . ..... ........ .. . ... ..... . . .. ............. . ... . ... . . ..... ........ . ....... ................................................ . ...... . ......................... ..... .. .. ......... .. .. . . . . ... .... ... ... .. ... . ....... . . ..... ..... . .. . . ............................ . ..... ... .. . ....... . . ............. .. . . ........... . . .. . . . ............... .. ...... . .... ... .. . .... .
lowQualScore : 55555555555555555555555 11 1111 7 7 7 44444 7 88888888 9999 11 4 0 1 0 0 9 555555 6 55 55 0 55 0 55 99999 5555 000000000000 1111 44 55 4 0 0 6 3 6 2 4 2222 555555555 7777 6 6 8 00 6 4 4444444 00 5 555 3 6666 77 6 00000 1 6666666666666 22 6666 22222222222 88 0 00 22222 00 1 444 0 00 3 55555555555555555555 3 22222 5555555555555555555555 888888 999999 11 99 2222 3 0 2 5 8888 6666 555555555 888888 222 22 7 7 55 77 2 333 0 66666 44444444 00 9 222 22222 1 4 66 1111111111111 4 444 4 111 2 2 77777 11111111 3 6666666 000000000000000000000000000000000000000000000000 2 777777 0 6666666666666666666666666 22222 66 99 000000000 66 66 9 9 9 0 222 0000 333 999 11 222 7 1111111 4 5 77777 11111 7 44 0 5 7777777777777777777777777777 4 44444 111 11 1 9999999 1 1 4444444444444 22 6 6 44444444444 7 7 00 7 0 8 111111111111111 77 333333 7 3333 000 44 8 5555 0
consensus : AGTGATGTTGACCAACGATCCTCGAAGC-AT------ATTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATA-AGGAAA--N-TGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANA--N---TTATTGAG--C--GGAAACT----GTTTTT--CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTGAGCGGAAA-C--GTTTT-T--TT-T---ATT-TT---AGT-AAC-AG----TGA--------CCNT-------GACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-A-G-----N-AN----C--TN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG--A---AT-----A-A--TTACG----CAA-TA---NTTGCAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
Reference ( family-1612 ) : AGTGATGTTGACCAACGA-CCTCAAG---AT------ATTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAAACCTATACACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATA-AGGAAA--N-TGAAGTTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTGA------TCTTGACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTCTT-TT-CATGCA--AGAAGCC-AAC-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TGAGCGGAAACTG-T--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----CAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTCAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ANA--N---TTATTGAG--C--GGAAACC----GTTTTT--CTAT--TTTG--GTNACAGTGANCTTGACCTTGACCNTATT----AACCTC--GA--AA------TCCCAAGCTTCTAT-TT-CACGTT--AGGAAC-A-TATACAC-AAA--G--TTTCATNAAAAAAATN-TTAAAGGAAACT--AAA----GTTA-TTGAGCGGAAA-C--GTTTT-T--TT-T---ATT-TT---AGT-AAC-AG----TGA--------CCNT-------GACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATCA-A-ATC--A---CTAG-A--A-G----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-A-G-----N-AN----C--TN-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGN--AGAAACT-ATTTGCG-G--CCTGCANCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---NNAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTNAAA-AG--A---AT-----A-A--TTACG----CAA-TA---NTTGCAAAAGCTATTGTACGGATGTCTTTTTGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGNAAT
gi|1 : AGTGATGTTGACCAATTATCCCCGA-------------TTTACCT-AA----CAGCTAATCACAAGCTTTTATTTTCACGCTA-AAAATATATATACATTA--TTTCATCAAAATA-TCTTATAGACAGAAAA--A-GGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGAAA------TCTTAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTATT-TT-CCTGAA--GGAAGCC-AAT-ACA-CAAAATGTCG-TCCAAATC-A--AT-------T-A----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TCAGCGGAAACTG-T--AATTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----TAGTGACC-----TTTGC---CCGAT-TATCCTCATAA----TC--T--CAAGC-T--TCCA----TTTC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-ACAAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--ACA--T---TTATTGAG--C--AGAAACC----CTTTTTATCTATG-TTTG--ATAACATTGAACTTGATCTTGACCATATT----AACCTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-TT-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TTAACGAAAACA--AAA----GTTA-CTGAGAGGAAA-T--GTTTT-T--TTCT---ATA-TA---AGT-TAC-AG----AAA--------CCAT-------GACCCGATT---T-A--CC-TTAA--ATCA-A-ATC--A---CTAGTA--A-A----CT-TCC-----TTTTCATG-T----A--------T-A-G-----C-AT----C--TC-T----T----CA--CA--AA-AT-GTCATCAAAATA-TTT-TAA----AAGCAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AGAAACT-TTTTGTG-G--CCTGCAGCC----GGG-----TATAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GGAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCCAGTG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AGAAA---AT-----A-A--TTATG----CAA-TA---ATTGCAAAAAATATTTTA---ATGTCTTTTGGACAAAAAAAAACCCCCATCTTTTATTGAAAT
gi|10 : C-T--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AAGT-ATAC-A-AAAA------------GTTTCCA--G--GAAA---------CT--AAA--A---CTATTGAG--C--AGAAACT----GTTTAT--CTATG-CTTG--GTTACAATGAATTTGATATTGACCTTATT----AACTTT--GA--AA------TCCCAAGATTCTAT-AA-TACATT--AGGAAC-A-TATACCC-AAC--G--TTTCAT--AATTAGTA-TTAACGAAAACA--GAA----GTTA-CTGAGAGGAAA-C--GTTTT-T--TT-T---ATT-TT---AGT-AAC-AG----TGA--------Ca
gi|10 : -AGGAAA--C-TAAAACTATTGA--GCAGA-AACTG-TTTATCTATGCTTG-GTTACAATGAATTTGATATTGACC--T--T-ATTAACT-TTGAA----ATC----CCAA------GA---TTC--T-AT-AATACATTAGGAACA-TAT-ACC-CAACGTTTCA-T--AATTAGT--AT-------T-A----A-CGAAAACAGAAGTT--AC-TGAGAGGAAAC-G-T----TTT--T-TTT----ATTT---TA--G-TAA-----CAGTGAC-----------------A--------CAAAA----------------------------TTTC--GT--------AA--AATT-A-AC---------------------TTAAA--A--GAAA---------CT--AAA--G---TTATCGAGATA--AGAAACT----ATTTacaaaatttcgtaaaattaacttaaaagaaactaaagttatcgagataagaaactatttgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|10 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccG-A--A-A----CG-TTT-----TTTTTATT-T-------------T-A-G-----T-AA----C--AG-TG---A----CA--CA--AA-AT-TTCGTAAAATTA-ACT-TAA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGATAAGAAACT-ATTTGTG-T--CCTGCATCC----AGG-----TATAT-A--AA-AAAAG-G----------CAT-----A-A--------A-AAT---GAAG---T--GCGGTGT-AGAAAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGCAATGTCTAATG--ATAAG-C-AA-----------TATTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG--A---AA-----ATA--TTATG----CAA-TA---ACTGCAAATATTAATTTA---ATGTCTTTTTGACAAAAAAA----CCCATCTTTTATTACAATgtgtcctgcatccaggtatataaaaaaaggcataaaaatgaagtgcggtgtagaaatttaatccaatgcaatgtctaatgataagcaatattgtgtataaatttaaaaagaaaatattatgcaataactgcaaatattaatttaatgtctttttgacaaaaaaacccatcttttattacaat
gi|11 : cttccattccgtgataggaaagtatacaaaaagtttccaggaaactaaaactattgagcagaaactgtttatctatgcttggttacaatgaatttgatattgaccttattaactttgaaatcccaagattctataatacattaggaacatatacccaacgtttcataattagtattaacgaaaacagaagttactgagagTT-T--TC-T---GTT-GT-----T-AACCAG----TGA--------CCAT-------GA-CCGGTT---T-C--TC--------TCA-A-A---------TAG-A--A-G----TT-TCG-----TTTTTATT-T-------------T-A-GACATAT-AC----CTGTA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTTATCAAATTA-TCT-TAA----CGGCAACT---AAAA---AT--ATTGAGT--AGAAACT-ATTTCTC-GTTCCTGC--CT----GGATAACTCATGT-A------------G---------CAT--------------------T---ATAG---T--GCAGTAT-TGAAAT-T-----CA-ATC-
gi|11 : gA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCTTTATG--ATGAA-C-GA-----------CCATGTGT-AC------T-TTGAAA-AG-------------A-A--TTGTG----CAC-TA---TTTGTTGGAGCTACTttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|11 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaa-A--------A-AAT------G---T--GCAGAAC-TGATAT-T-----TA-ATC-C-A-----------ATGAATGGTCGAGCA--ATAAG-T-AA-----------CCTTGTGT-AT-AG--AT-ATAAAA-A--------------A-A--TCAGG----CAA-TA---TTTaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaatttaaaatgtgcagaactgatatttaatccaatgaatggtcgagcaataagtaaccttgtgtatagatataaaaaaatcaggcaatattttgttaaaa
gi|12 : gttttctgttgttaaccagtgaccatgaccggtttctctcaaatagaagtttcgtttttattttagacatatacctgtatacacaaaattttatcaaattatcttaacggcaactaaaaatattgagtagaaactatttctcgttcctgcctggataactcatgtagcattatagtgcagtattgaaattcaatcttgtaacatacgagcctaaagtaaaatcccatacaaggctttatgatgaacgaccatgtgtactttgaaaagaattgtgcactatttgttggagctactaagtggttgttgaacaatacgttttacattaaaagaaggaaaataactcatgaatatcaattt--------T-A-G-----T-AT----C--CA-T----A----TA--CATCAA-AC-TTCATCAAAATA-TCCATAA----GA-AAACC---AAAG---TT--ATCAAGC--AGAAATC-ATTT-------CC--CACCC----AAG-----CATATGA--AA-AAAGG-GGGAAATATCTCATGC---A-G--------A-AAT---TTAG---T--GCGGTGT-TAAAAT-T-----CA-ATC-G-C-----------ATGCTAGGTCTAGTG--ATGAG-CAAA-----------CCTTGTGT-AT-CATTTT-TTTTAA-AG--A---AT-----T-AGGTAACA----TAA-TAT--ATTGAAATAACT-TTGTtgttaaaa
gi|12 : tactgtagcccAT-A--AA-AATGGAGG---------CTT-----A-A--------C-ACT---TTA----T--ATG-----TAAAAT-T-----AT-ACC-C-C-----------ATACAGGGTCTAATG--ATGAG-C-AATCCAGTTA---CCCTGTGT-AC-AA--AT-TTAAAA-AT--A----------A-A--TTACA----CAA-TA---TCTGCttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaataaaaatggaggcttaacactttatatgtaaaattataccccatacagggtctaatgatgagcaatccagttaccctgtgtacaaatttaaaaataaattacacaatatctgctcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : tactgtagccctagtatccatatacatcaaacttcatcaaaatatccataagaaaaccaaagttatcaagcagaaatcatttcccacccaagcatatgaaaaaagggggaaatatctcatgcagaaatttagtgcggtgttaaaattcaatcgcatgctaggtctagtgatgagcaaaccttgtgtatcattttttttaaagaattaggtaacataatatattgaaataactttgtttttgagcgattgttgaataaaacataattttagaACCTCAA----CA-CCACTCATAGACTTTCTTTTTTAT--TACAAAACCTATACA-AT-A--TGTTATCAAAATAATCTTACA------AAA--C-TTAAGTTAT-GA--AC-GATAATAG-TGTTTTTAT-TTGAAGCAACAATAG------TCGTGGC----------C--CGATT--A----ACC----TCAAAACGAATA---CTAATT-TT-CATATT--AGAAATC-TAT-ACA-CAAAGTTTCA-TCGAACTA-CTTAT-------G-A----ACGGAAAAT-AATGTT--AT-TGAGCAGAAATTG-T----TTTCCTATTTCT-AA------CAT-A-AAT-----CA-CGACC-----T---------GGT-GTACTTCAAAACTAGTC--C--CACGC-T--TCCC----TTTC--ATAAT---A--------T-ATAT----AA-------------GTTAGGA--A--GGGG---------CT--ATA--A---CTtcgagtggatgttgaataaaacataattttatattttaacaat
gi|13 : aGAATT-T-----CA-ATC-C-T-----------ATACAAGGTCTAGTA--ATATG-C-AA-----------TTATGGGT-AA-AA--AT-Tcatggaatttcaatcctatacaaggtctagtaatatgcaattatgggtaaaaattataga
gi|14 : aacctcaacaccactcatagactttcttttttattacaaaacctatacaatatgttatcaaaataatcttacaaaacttaagttatgaacgataatagtgtttttatttgaagcaacaatagtcgtggcccgattaacctcaaaacgaatactaattttcatattagaaatctatacacaaagtttcatcgaactacttatgaacggaaaataatgttattgagcagaaattgttttcctatttctaacataaatcacgacctggtgtacttcaaaactagtcccacgcttccctttcataatatatataagttaggaaggggctataactcatgTT-AT-C-A-AAAT------------ATCACAA--ATGAAAA---------CT-------G---TTATTAAG--C--TTAGATCTTTCATTTTT--CTAT--TT-A--ATAACAGTGATCTTAAATGTGATGCAGTC----TACATCATGATCAA------TTGCAAGCTTTCAT-TT-CAATTT--GGAAGC-C-TATGCAC-AAA--A--TAACATTAAGATA-TC-TGAACAGATACT--TAA----GTTA-TAGAGTGGAAA------TTT-T--TT-TAAAATT-TT---ATT-AAC-AC----TGATTTTTTACTCTT-------GACCCGA-----------C-T-AAACATCA-A-ATC--AATGCCAG-A---------TT-TTG-----TTTTCATT-TTCAAA--------TGA-A-----C-AA----C--TT-C----A----CA--T------ATGTTAATCAAATTA-TTT-TAA----AAGAAACTTAAAAAGAATTT--ATTGAGA--AGAAACT-ataga
gi|15 : gatGTGATGTTGACCAACTATCCTCAAAGCAATGTCACAATTTACCT-GA----CAGACAATCACAAGCTTTCATTTTCACGTTT-AAAATCTTTATACAG-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATA-A-TAAATTA-TGATGTTATTTA--GC-AA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTATCAAT-A------CCTGAAAT--T--T-TTC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTTTA-TT-TACGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATATCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GACGTT--ACTTAAGCGGAAACTGTT--A-TTT--TATTTATCAATTT---TAT-G-TAA-----AAGTGACC-----ATTGC---CCGAC-TGATCTCAAAA----TC--c
gi|16 : --TCCA----TTTC--GT--TTCAAGAA--AAAT-ATAC-ATAAACTTTCAATTAACTGTTTTAA--A--GAAAAC-------TT--AGA--CCGGTTATTGAG--C--AGAATTT----ATTTTT--CTAT--TTTT--CTTACAGTGACCATGGCATTGGGC-TGTTA---AACCTC--GC--AG------TTTCGAACTTCTAT-TT-CAGGTTGAAAAAAC---TATACAC-ACT--A--TTTTA-CAAATATATC-GTACAGGAAACT---------GTCA-TTG
gi|16 : TT---T-A--C----AA--AT-A-T-ATCGTA---CAGG-A--A-A----CTGTCA-----TTGTTGGG-T----A--------T-A-G-----TTAT----G--TG-T----ATTTGCA--CG--TG-AT-TCCATCAAAATG-TCT-TTA----CGAAAACT---AAAA---TT--ATCGAGC--AGAAAAC-ATTC-CGCG--CCTACACAA----GGG-----CTTAT-G--AA-AAAGG-GGA--------CAT-----A-ttgggtatagttatgtgtatttgcacgtgattccatcaaaatgtctttacgaaaactaaaattatcgagcagaaaacattccgcgcctacacaagggcttatgaaaaaggggacata
gi|17 : tccatttcgtttcaagaaaaatatacataaactttcaattaactgttttaaagaaaacttagaccggttattgagcagaatttatttttctatttttcttacagtgaccatggcattgggctgttaaacctcgcagtttcgaacttctatttcaggttgaaaaaactatacacactatTACGC-AGA--A--TTTC-TTGGAAATGTC-TTACAGGAAACT--AAATAAAGTGA-CTGAGCAGAAA-C--GTATT-C--TT-T---TTT-TT---AATTAAT-AA----TGC--------CCTTTGACAATGACTCCATT---T-A--CCGC-AA--ATCA-A-ACCC-A---CCAA-C--A-------T-TTC-----TTTCAATG-T-------------T-A-G-----G-AA----C--TTAT----A----TA--CC--AA-AT-TTCATAAGAATA-TCT-CGA----AAGGAACC---A
gi|19 : catacattgtgcaagaaacagtttgtcagtgcaggtttggataaaatctgaaggtctttgtatgatcttttctgatcttgatttaatttaacaaataaaataatccaaaatAGTGATGTTGACCAATGATCCTCAAAGCCATTACCCGATTTACCT-GA----CAGCCAATCACAAGCTTTCATTTTCACGCTA-AAA-TCTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATAGAAAAAA--A-TGACGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTCTGT-TTTGAGTAACAGTTA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TA---TTTTTA-TT-TATGCA--AGAAGCC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TTCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAAGTT--AC-TAAGCGGAAACTGCT--A-TTT--TATTGATCAATAT---TAT-G-TAtccactgttgaatatcaaagatc
gi|2 : tAA--A--GAGA---------TTC-AGA--G---TT-TT-AG--G--GAGAACC----GTTTTTTTCTAT--TTT-------TAGTAAGGCTGACCTAAA----AT--------------A--AA------TC--AAGCTT-TAT-TTTCAGGAT--AGAAAC-A-TATACATTAAA--A-----CAT-AAAAATGTA-TTAAAGGAAACT--GAA----ATTG-TTGCAATGATA-T--CTATT-T--TT-G---GTT-TT---ATT-TAC-AA----TGA--------CCTT-------GACC----------G--TC-------ATCA-A-A----A---CTAT-G--A-GTAATCT-TCC-----TTTTCATGTT----ATTAATTTCT-A-GA----A-AA----A--TG-TCATGA----CA--C---AA-AT-TTCATAAAAATACTTT-TAA----GAAAAA-T---AAAG---TT--ATCTAGT--GGAAACC-AT-----------------------AG-----TA-AC-A--AATAAAGG-AG---------TAT----------------A-ACT---TGCG---T--AACATATATGATAT-A-----CA-ATC-C-C-----------TTGCAAGATCTAGTA--ATGAA-C-AT-----------TATTGTGT-AC-AA--AT-TTGCAA-AA--A---A------A-A--TCGCA----CAG-TA---TTTG
gi|2 : ataattcatG---T--GCAGAGT-TGAAAT-G-----TA-ATA-C-C-----------ATGCAATGCCTAATA--AAAAG-A-AA-----------CTTTATAT-AC-AC--AT-TTGAtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|2 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacGT-TGAAAT-A-----TG-GTC-CCAT----------ATACAAGGTATTGTG--ATTAT-C-AT-----------CATTGTGT-AA-AA--AA-TCTAAA-AG--A---Atcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatccagttgaaatatggtcccatatacaaggtattgtgattatcatcattgtgtaaaaaatctaaaagaagcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : ataattcataaagagattcagagttttagggagaaccgtttttttctatttttagtaaggctgacctaaaataaatcaagctttattttcaggatagaaacatatacattaaaacataaaaatgtattaaaggaaactgaaattgttgcaatgatatctatttttggttttatttacaatgaccttgaccgtcatcaaaactatgagtaatcttccttttcatgttattaatttctagaaaaatgtcatgacacaaatttcataaaaatacttttaagaaaaataaagttatctagtggaaaccatagtaacaaataaaggagtataacttgcgtaacatatatgatatacaatcccttgcaagatctagtaatgaacattattgtgtacaaatttgcaaaaaaaatcgcacagtatttgtttgagtaattgagagaatggtgaattaaacctaagtttacgtttgaaagtatggacataactcgtgattatacgtgcagagttgaaatgtaataccatgcaatgcctaataaaaagaaactttatatacacatttgatcataacatgtttcaatttcttaaacggaagtttattaaaatgcaatcttgctacggtaaataaatgggtaatggtatgggtatagctcctgaatatcca-AAT---TGAA---T--GCGGAAT-TGAAAT-TT----CATGTT-C-A------------TGCAAGATCCCATG--ATAGG-C-AA-----------CCTTGTGA-AC-AA--AT-TTTCAA-AG-------T-------A--TCAGG----CAA-CAAGTGTTACAAAgcagtgaatatttgtccgagttaatgttgaataaaacgtattgttgtgtttaaaattgatataaagctcatgtaaataaatatgtgcaggactgactttcaatc
gi|20 : aacgtatttttaaaaacacaagctatt--AA-AAGGG-GG---------CATGCTATA-C--------A-AAT---GCGA---T--A-GGAGA-CAACAT-G-----CA-ATC-A-C-----------ATGCAAAGTCTAGTG--ATATG-T-AA-----------CCTTGT-T-ATGAA--AT-TTGAAA-AA--A---AT-----gcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgaaaagggggcatgctatacaaatgcgataggagacaacatgcaatcacatgcaaagtctagtgatatgtaaccttgttatgaaatttgaaaaaaatcggacaacttttaattgagttct
gi|22 : aacgtatttttaaaaacacaagctattaattgaatgcggaattgaaatttcatgttcatgcaagatcccatgataggcaaccttgtgaacaaattttcaaagtatcaggcaacaagtgttacaaagcggccgtaaaataaaacttaattgttagtgcgT-T---ATT-TTTTAAGA-AAC-AG----AGG--------CCAT-------GACCCCA---------------AA--ACC--T-ATC--A---CGTG-A--A---------TCA-----TTTTCACG-T-------------T-AGG-----A-AA----C--TA-T----A----C--------A-AT-TT--TTACAAT--T----------------------------TT--ATTGAGA--AGCAACT-GTTTTCG-G--cggacaacttttaattgagttct
gi|22 : a-TGACCCCAAAA----CC--TATCACGT-GAATCAT----TTTC--ACGTT---AGGA--AACT-ATAC-A-A----------------TTT---------------------TT--ACAATT---TTATTGAG--A--AGCAACT----GTTTTCGGTTAT--TT----GTAATAGCGAACCTGA-----ATCG--TT----AACTTC--AA--AAAAACACTTTCAATCTTCTATATC-CACG-T--AGAATC-G-TATGCAC-ACACTGTCTTTCATT------TTT-TTGAAGGAATCC--A--------------AGCGGAAA-CT-GTTTT-T--Tttatttgtaatagcgaacctgaatcgttaacttcaaaaaaacactttcaatcttctatatccacgtagaatcgtatgcacacactgtctttcatttttttgaaggaatccaagcggaaactgtttttt
gi|23 : attattttttaagaaacagaggccaAAAT-T-----CATATC-C-ACAGAGCTGGACAT-CAA--TCCAATG--ATAAG-C-AA-----------CATTCTGT-AC-AA--TT-CTGAAG-AG--A---ATTGGGCA-A--TTAC---------TG---TTT-C--AAGCTATT
gi|25 : tggggctccttattagccagctatttgcagatccaaggtattgtgacaagtgtgaataaattaaaaaaattatccagtaatatttgtggagttgtgtagatgttgaataaaatgtaattttacatttaagggacattactcatgtT-TT-CATGTT--GGAAAC-A-TATACAC-AAAT-G--TCT-ATTCAAAA--TGGTTACAGGAATCT--AAA----GTTA-TGAAGAAGAAA-T--GTATT-----------ATT-TT---AGT-AAC-AA----TGA--------CCTT-------GACCCAAAT---A-A--CC-T-AA--A--A-A-A-C--ATT-CT-G-A--A-T----CT-TCC-----TTTGAATG-T----G----------A-G-----A-AA----C--TT-TGGACA----TA--CA--AC-AT-TTCATCAACGTA-TAA-CAA----AGAAAACT---A
gi|26 : ctttgtAAAGTT-TTAAAGAAAAC---AAG----ATTAATTAAGCAGAAAAT--ATTTCAT--TC-T---ATT-TTT--AGT-AAT-GG----GGA--------CC-T-------GACCTGGTT---TTA--CT-G-AA--ATTT-A-ACC--A---ATCC-A--ACA----CT-TGC-----TTTTCATA-T----A--------A-G-G-----A-AC----C--TA-T----A----CA--CA--CG-AT-TTCATCAAAATA-TCT-TAA----AGAAAACT---AAccttactgagttgataccgcttttg
gi|28 : aagaaaatgaaataatttagacactttaagagtggT-A--AA-AAAAG-GGTTGTACCT-CAT-----GTA--------A-AAT------G---T--GTCGTGT-GCAACT-TATATGCA-ATC-C-C-----------ATACAAGGCCAAGTGTGATAAG-C-CA-----------CATT---T-GC-AA--A----GAAA-TG--A---AT---------------------G-TA---GTTGTTTAAGTTATTGg
gi|29 : agtgatgtatgtgaaaaccattaagtA-AAAGG-GG---------CAT-----A-A--------CTCAT---GCAG---T--TTAGTGT-CA-----------CG-ACT-C-C-----------GTGCAAGATCTAGTA--ATAAG-T-AATAAGCAGCCTTCCCTGTGT--C-TA--AT-TTAGAACAG--A---Aagaggacattgaataaaacacgattttaag
gi|3 : acattatcataactgattttaatttcgagaggatgtcgaataaaagataatttattatc------ATTTACCT-GA----CAGCCAATCACAA-CTTTCATTTTCACGCTA-AAAATTTATATACAT-A--TTTCATCAAAATA-TCTTATATA-AAGAAA--AATGAAGTTATTGA--GC-GA-AATTG-TTTTTTTGT-TTTGAGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA------TC---TTTCTA-TT-TATGCA--TGAAGAC-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TCCAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGTT--AC-TAAGCGGAAACTG-TTAA-TTT--T-TTAATCAATTG---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGCCCGCCGAT-TGACCTCAAAA----TC--G--CAAGC-T--TCCA----TTCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATACAA-AAA-------------GTTTCAA--A--GAAA---------CT--GCA--T---TTATTGAG--C-----AACT----GTTTAT--CAATG-TTTG--GTTACAATGAACTTGATTTTGATCTTATT----TACCTT--GA--AA------TCCCATGATTTTAT-AT-TACATT--AGAAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCATAAAAAAAATA-TCAA-------T--GAA-----------GAGAGGAAA-CT-ATTAT-T--TT-T---ATT-TT---AGT-AAC-AG----TGA--------CCAT-------GACACGATT---T-A--CCTT-AA--ATCT-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TGTTCATG-T----T--------A-A-G-----T-AT----C--TA-A----A----CA--CA--AA-AT-TCCATCAAAATA-TCT-TGA----AAGAAACT---AAAG---TT--ATCGAGA--AAAAAAT-ATTTGTG-G--CCTGCATCC----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTTG-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAC-C-AA-----------TCTTGTGT-AT-AG--AT-TTTAAA-AGAAA---AT-----A-A--TTATG----CAA-TA---ATTGCAAAgcggacattatttgcttaag
gi|30 : tatcctcaaagccatttccca-----TTTTCAGG-T----A--------T-G-T-----T-AGGTTTC--TA-T----G----GA--CA--AA-AT-TTCATCA------TGG-TAA----CAGAAACT---TAAT---TA--AT--------GAA--------GCG-G--TCTGAAGT-----GGG-----CATAT-A--AA-AAAGA-GG-----------T-----T-G--------A-ATT---CAAG---T--A-AATTT-T-AAGTGT-----CT-ATT---A-----------ATGTAAGGATTAGTG--ATAAT-T-AA-----------CCTTGTGT-AC-AA--AT-TTTAAA-ttaagtaagtgctg
gi|31 : aaAAGCTCC-GT-GT-CATGTT--AGCAACCACTATACAC-AAT--G--TT--ATCAAAATA-TC-TCAAAGGAACTT--AAA----GCTA-TTTACCATAAA-CCAGTTAT-TCATT-T---ATCAAC---AAT-GGC-AT----TGA--------CCTT-------GA-CCGATT---T-C--CT-T-AA--AACC-A-ACT--G---CAAG-A--ATG----TT-TTG-----TTTT
gi|33 : taAAATG-TTAAAGGAGACT--TGA----TTTA-TTGAGAGGAAA-C--ATTTT-T--TT-CTA-ATT-TA---AAT-AAC-AGACCTTGA--------ATGT-------GACCCGATT---T-A--CC-T-AA--ATTC-A-ATC------C--A-A--A-A----CTGTCTTTATATTTTCATG-T----A--------T-atattaata
gi|36 : -T---ATT-TT---AGT-AGC-AT----TTT--------CTTT-------AACCAGATT---A-A--CC-C-------TA-A-AAC--A---CTT-----A-G----TT-TCC-----CTTTCGTG-TT---A--------T-C-------A-AC----C--TT-T----A----CA--CA--AA-GT-TTCATC-AAACA-TCA-T-G----AAGAAATT---AAAG---TT--ATAGAGtatgactcgggttcaaaaactcttccaa
gi|37 : c---AGT-AAC-AT----TGA--------CTGT-------GACCTGATTAGGT-A--CA-C-AT--ATCATA-ATT--ATA-CTCA-A--A-A----CT-CC-----------ATG-T-------------T-A-G-----G-AA----C--TT-G----AA---CA--CC--AC-AT-TTCCTCCAAAAG-TTT-TAA----AAGAAACT---GCAG---TT--ATa
gi|38 : taac--TA-T----C----CA--CA--AA-AT-TCAATCAAAATA-TCT-TTATTTTAGGCAACT---GAAG---TTTAATTGAGT--GGAAACT-
gi|38 : taCA-CAAAAT-TCAATCAAAATATC--TT-------T-ATTTTA-GGCAACT-GAAGTTTAAT-TGAGTGGAAACTT-C--C-CTT--TACTTCCCAGTTCACACAT-GATAA-----CAtccctttacttcccagttcacacatgataacacttttatgtgaagt
gi|4 : tatatcGATCTAAACCAGATT----AACGTT--AA--AA--------CCAATCTTCCTT-TT-C-TATC--AGAAAT-T-TATAAACGAAA--A--TCTCATGAGATTACCT-TTTAAGGAAACT--TAA----GTCA-TTGTGCTAAAA-C--------------T---ATT-TT-----------------T----------CTAT-------GACCTGATT---T-ATACC-T-A-----------------------------G----CT-TCC-----CTTTCATG-T-------------T-A-G-----GTAT----C--TA-T----A----TAATCA--AG------TGTCACAACA-TCT------------AACT---CAAG---TT--ATCAAGT--GGAAATT-ATTTCCT-G--CCATCAGCT----GGG-----TGTAT-AAGAA-AAAGG-GG---------AAT-----A-ACCTATGTCA-AATTTCATAG------GCAGTTT-TGAAAT-T-----CA-ATCAC-AATGTC------ATGCAAGATGTAGTG--ACAGG-C-AA-----------CCTTATG---C-AAT-ATCTTAAAA-AG--A---AT-----cttttatgtgaagt
gi|4 : AT-A-----CA-ATC-C-A-----------ATGCACGGCCCAATC--ATGAG-C-AT-----------TCCTGTATCAC------T-CTTAAA-AG--AGTTAT-----A-A--TCATGATATCAATTT---GTTG----AGTTATTGGTCAGATGTcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacGAAAT-A-----TG-ATCAC-A-----------ATGCAACAGCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CATTGTTT-GC-AA--AT-AAGAAA-AG--C---GT----------CTG-G----CAA-CA---TGTG----AGCTATTGAGCGGGTGTtgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|4 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacaTGT-A--AACAAAGG-GG---------CGT-----A-ACTCATGT-A-AAT---ATAAA--TAAGCTTCCT-TTAAAT-A-----CA-ATC-T-C-----------ATGAAAGGTCTTGTA--ATATG-C-AA-----------TCTTtcatgctgttttactgtaaacaaaggggcgtaactcatgtaaatataaataagcttcctttaaatacaatctcatgaaaggtcttgtaatatgcaatcttacgaa
gi|41 : gatctaaaccagattaacgttaaaaccaatcttccttttctatcagaaatttataaacgaaaatctcatgagattaccttttaaggaaacttaagtcattgtgctaaaactatttttctatgacctgatttatacctagcttccctttcatgttaggtatctatataatcaagtgtcacaacatctaactcaagttatcaagtggaaattatttcctgccatcagctgggtgtataagaaaaaggggaataacctatgtcaaatttcataggcagttttgaaattcaatcacaatgtcatgcaagatgtagtgacaggcaaccttatgcaatatcttaaaaagaatcgggtaacctttggttgagttactgtgcaatgctgaaaaaagtaattttacaaaaactaagtggacattactcatgtaagagcctaacatacaatccaatgcacggcccaatcatgagcattcctgtatcactcttaaaagagttataatcatgatatcaatttgttgagttattggtcagatgttgaataaaatattacatttaaaaaaaaggggtgtaacttttatttacaattaaattaattaaaagatgtgaaacagaaatatgatcacaatgcaacagctagtgataagcaacattgtttgcaaataagaaaagcgtctggcaacatgtgagctattgagcgggtgttcatgctgttttacGAAGT-G-----CA-ATC-C-C-----------ATGCAAGGTCTAG-----TACGTC-AA-----------CAGTGTGT-AC-GC--TT-TTAAAA-GG--A---Aacgaa
gi|42 : TCATG-T-------------T-A-G-----G-AA----C--CC-A----A----CA--CA--AC-AT-TTCATCAAAATA-GTT-AAA----AAGAAACT----TAG---TT--ATgata
gi|44 : A-ATC-T-A-----------ATGCAAGGTTTGGTA--ATAAG-T-AA------------CTTGTGC-AC-AA--TC-CTAAAA-CG--A---A
gi|5 : tgTATTGA--GC-GA-AATCG-TTTTTCTGT-TTTGGGTAACAGTAA------TCTGAACT--T--T-ATC--CG-TT--A----TTC----TCAA-------A---CTTTTTATT-GATACA--AGAAGCG-AAC-ATA-CAAAATGTCG-TACAAATA-C--AT-------TAA----A-GGAAAAC-GAGGCT--AT-TAAGCGGAAACTGTT--A-TTG--TATTTATCAAATT---TAT-G-TAA-----TAGGGACC-----TTTGC---CCGAT-TGACCTAAAAA----TC--C--CAAGC-T--TCCA----TCCC--GTGAT---AGGA--AATT-ATAC-A---------------------CAA--A--GAAA---------CT--ACA--T---TTATTGAG--C--AGAAACA----TTTTAT--CTATA-TTTG--GTTACAATGAACTTGATCTTGACCTTATT----AACCTT--GA--AA------TCCAAACTTTCTAT-AT-TACACT--AGGAAC-A-TATACCC-AAA--G--TTTCAT-AAGAAAATA-TTAACAAAAACA--AAA----GTTA-CTG----------------------------ATT-TT---AGT-AAC-AG----TGA--------CCAT-------GACCCAATT---T-AG-CT-T-AA--ATCC-A-ATC--A---CTAGTA--A-G----CT-TCC-----TTTTCATT-T----A--------A-A-G-----T-AT----C--TA-T----A----CA--CA--AA-AT-TTCATCAAATTA-TCT-TTA----AAGAAACT---AAAG----T--ATCGAGA--AGAAACC-ATTTGCG-G--CCTACATCC----GGG-----CGTAT-C--AA-AAAGA-GG---------CAT-----A-A--------A-AAT---GCAG---T--GCGGTGT-TGAAAT-T-----CA-ATC-C-A-----------ATGCAAGGTCTAGTG--ATAAG-C-AA-----------CCTTGTGT-AT-AA--AT-TTAAAA-AG--AAG-AT-----A-A--TTATG----CAA-TA---
gi|6 : aAGTGATAGTGACCGA-GA-C----AC---AT-------TTTACCT-AAATTCCAG--AACCA--AACTTTCTTTTTCACGTTA-GAAACCTACACACA--AGCCTTCATTAAAACT-TCTTA---A-AGGAAA--C-TTAAGTTACTGATTG--GA-AACTA-TTTTTTAAT-ATTTAGTAACAGTGA------CACTGACC--T--TAAAC--TGCTC--A----ACC----TCAA------AA-----TCAC-TC-CA---A--AGAA----AACTATATTGAAATTTAA-TCAAAACA-T--ATTAATATAT-A----A-AGAGAAC-ATGGTT--AT-TCAACGGACACCG-T----TTT--TA-ATATCAA----------G-TAAAATTTCATTGAAC-----TTGAC---CTGAA-TAATCTCAAAA----CCAAC--TGAATGT--TCCT----TCTCAGGTTAT---ACAAACAATT-TCAT-A-AAA-------------ATCTAAA--A--GAAAACTATGGTTCT--ATG--G---TTTTTGAG--T--GAAAACA----GTTTC------T--TGTA--GTGAAAGTAACCTTGATC--------AAT----AAC---------AA------TTT--ACCCT---T-TT-TATATT--AGATAC-A-TATAAAC-AAA--AC-CTTTATCAAAA-------TAAA--AAACT--AAA----TTTA-TCAAGCAAAA
gi|7 : taaatatttccacttgatttTTCAATAA--AAAA---------CTTTAGA--A---TTATTGAG--C--GGATATT----ATCTTT--CTAT--TTTA--GTAACAGAGACCATG-CCTAGA-CTTATTTCAAAACC--------AA------TCCCAAGCTTC-AT-TT-CACACT--GGGAAC-C-TATACAC-AA---------C------------------GGAAACT--GAA----GTAA-TTGAACAAAAA-C--AATTC-T--TC-T---GTT-T---------AT-AG----TGA--------CTTT-------GACTAG-TT---A-A--CTAT-AA--ATCA-ATGTC-----------A--A-A----CT-TCT-----TTTTCATG-T----A--------A-A-C-----A-AC----C--TT-T----A----CA--CA--AA-AT-GACATCCTGTTA-TAT-TAA----AGG---------AAG---TT--ACCGAGT--GGAAACC-ATTTtgaaaagggacataactcatattatatatcagttaacagttatcatg
gi|7 : aactggaataaagcacttcagag------ACTTATTT-CA----AAACCAATCCCAAGCTT-CATTT-CACACTG-GGAACCTATACACA---------------------------A-CGGAAA--C-TGAAGTAATTGA--AC-AA-AAACAATTCTTCTGT-TT------ATAGTGA------CTTTGACTAGT--T-AAC--TA-TA--A----ATCAATGTCAA-------A---CTTCTT-TTTCATGTA--AACAACC-TTT-ACA-CAAAATGACA-TCCTGTTA-T--AT-------T-A----A-AG------GAAGTT--AC-CGAGTGGAAACC-----A-TTT--TTTTTA---ATTC---CA--A-TAA-----CAATGACCATGACTTTGA---CACATCTAACCTCAAAA----TC--CA-CAA-C-T--TTAG----TTTT--GTGCT---TAGA--ATTTCATA--A-AAT-------------GTTTTAA---------------------------G---TTACTGAG--CTCAGAAACT----TTTTTTT-CTATAATTTGTAGTGACAG-GAACC---CCT--ACTCAATT----AACCTA--AA--TA------TACTAAGTTTACAT-TT-AGCGTG--AGGAAC-T-TCTACCT-AAA--A--CTTCAGCAAAAtttttaattccaataacaatgaccatgactttgacacatctaacctcaaaatccacaactttagttttgtgcttagaatttcataaaatgttttaagttactgagctcagaaacttttttttctataatttgtagtgacaggaacccctactcaattaacctaaatatactaagtttacatttagcgtgaggaacttctacctaaaacttcagcaaaatatgagcatataaaaaa
gi|8 : aactggaataaagcacttcagagttcaataaaaaactttagaattattgagcggatattatctttctattttagtaacagagaccatgcctagA-AACCG-TTCTTTTCA-TTTTAGTAGTAAGGA------TGCTGAAT--TAAT-GTC--C--TC--AACACTTA----TCAC------TGGACTTCCTT-TT-TATGTA--AGCAACCTAAC-----CATAATATCC-ATCAA----------------T-A----G-GGAAACT-CAAGCT--AT-TGAGCGGAAACT----------------------TTT---TGTAG-TGA-----TAGTGACC-----ATGAC---CC-AT-T-ATCTCAA------TT-------GGT-T--TTTACATATTTC--TTTAT---AATA--ATTT-------------------------CTTTAA--G--GAAA---------CT--AAC--T---GTATTGAT--C--GGAAACT----GACTTT--CTA------------AAAATGACATTGACCTTGACTCGATT----ATTTTC--AG--TA------TATGAAGTTTCCAA-TT-CGTACT--AGGAAC-A-TGTGCAT-ATA-----TTTCTTTCACAATATC-TTAAAGGAAAATAAAAA----AAAA-TCAAGTGGAAA-CA-G-----T--TT-T---A--------AGC-AAC-AC----TGA--------CCTT-------GAACCAGTA---T-ATTTC-T-TA--CGCA-A-TT-------CCAG-GTTA-G----TT-TCC-----TTTACATG-T----T--------T-T-G-----A-A--------TA-T----A----TA--CA--AATCT-TTCATCAAAATA-TGT-GTC----AGGAAACT---ATAG---TT--ATCGAG---AGAAATTCATTT-------CCCGCGCCCGTTTGGG-----CATAC-A--Atatgagcatataaaaaa
gi|9 : -A--AA-AAAGG-GT---------CAC-----A-ACTCATTT-A-AAT---TAAAATAC--GCGGTGC-TAAACA-T-----CA-AGC-C-A-----------ATTCAAGGTATAAAG--ATAAC-C-AA-----------CCTTATGA-AT-AA--A--TTCAAA-TG--A----------A-A--CTAGG----AAA-CG---ATTGTTGAAGCTATTGTACAGATG-----TTGATAAAAA
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): ATTCAAATAGAATCAACAAACATGGTTGAAGTTATTGAGCGAATGTTGATAAAATTGAAATATATTATTAAAAAAGGGCCATAACTCATGTAAAATTTGAAATGCGGAGTTGAATTCTAGTAACTAGTACCAATTCAAAATAAATAGGGTAATATTTCTTCAAGTTATTGACCAGACGTTACATGTGGGATACCGTCGCTGACTAACAGCTTATCTCAAAAGTTCAACTATTTGTAGAATAGGCGCATGAAAAATGAACACCTAGTCCACCATTCTTACATACATGTATTTATTTCTTTAGTTTCATTTCACAAAAT
Unaligned ( gi|21 ): TTTTTGAGCGATTGTTGAATTAAGCATAATTCTAAAATAAATACTGGGACATAACTCATGTATCATTACACTCGAGAAACGAAAATACATTGCCAGGACAGTTTCAATGAGAAGCGACTTCAACTGAGTACAAAGAATTGTCCAATTATTTATAGTTATTTAGCAGATGTTGAATTAAACATAATTTTATATTTACAAAAAGGATATAAATCATGTTGATTAATACGTACAGCTGTAGTG
Unaligned ( gi|24 ): AAAGGGGTCATAATTCAATTTAGATTTTAATATACTGAGCTTGCAAGATAAGCAACCATCTGTTTAAATTAAACCAGAATTAGGAAACAATTCCTGTAAGTTAATAAGCAGATGTTAAATAAATTGCTTTTTTTACTTAAAAAGGGCAATAACTCATATAAAATTAGAGATGTAAATATCAATTCCATGCACGCGGTTGTGATAAGGAGTAATGTAAACAAAAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTATTGAGTGAATTTAAATGCAACCTTTAGTTAAAGAATAACATGCGGATTTGAAAAGCGCTCTGATGGAATGCAATAAGCATTGTGTATCAATTCAAAATAAATAGGGCAATGTTAGTTTGAGTTTTTAGCCAATGTTAGATGTGGGATGCAGACAAATAGTTGATTACAAAAGTTCACCTATTCAGAGAA
Unaligned ( gi|32 ): ATTTAAAAACAATCAGCAAACAATTGTGTTAGTTATTGCGTGGAAGTTGATAAAAATGAAAATTCTGGTTTATAAAGGGTTTCAAATGATGTAAAATTTGAGATGCCTACTTGAGGTTAAAAAATGAATAAGTTAACATTTGTTCAAATCATGAGCGGATGT
Unaligned ( gi|34 ): ATACCATTGCAAAGAATTGTGAGAGGCAATTTAAAAATAATAAGGCAATATTTGTAAATAGTTACTGAGTAGATGGTGAATAAAACGTAAATTTACATTAAAATAGGATACAACTCATGTAAATTTAGACGTGCAGATGCGAGTG
Unaligned ( gi|35 ): AAGGGCCATCACCTAAGCAAAATTTGAGATGCGAGGTTGAATTTCAATCCCTTATAAATAGGATCTGATCATTAGGGATGCTGATGAACAGGTAATTCCAACAAAAGCTCACCTATTCATGGAATAGTCAAGCTAAAA
Unaligned ( gi|39 ): AAGATGTTTATACATACAAACTCTACACAATAATTCGATATGTCAATAAACTGAATTGGCAGCCCGGGATTTGCTATCATGAAGTATTTTATTTTTTGGTTATGC
Unaligned ( gi|40 ): TATTTACCATTATTCTAGAAACTGTTCATGTATAAAATCATCATGACTAAAACCAAAGACTTTCACATGCAATCAACTGTAGATGTTGTTTG
Unaligned ( gi|43 ): GATGCCATAAAGGAGTGATTCCAAAGCTCAGCTATTCCTAGAATAGTCCAGCTAAA
Unaligned ( gi|45 ): AAATTTTACACGAGCAGTCGTCTTGTTTCTGTCT