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Reference ( family-1599 )     :                                                                                        TTGTTGTAGTACAGTTTCATTTT-AAAAACGTTTGGGNTACACTGAGGCAGGGTAGACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAGAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACCGTTTTAGCTGTACAAGCNTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGCAAGTTAGAGCAAAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACGATATTTATTAAGAAAATC-----TATTTTATCGTTTCGT-CA--Atatttattaagaaaatctattttatcgtttcgtcaa
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gi|5                          :                                                                                            TGTAGTACAGTTTCATTTTTAAAAATGTTTGGGATACACTGAGGCAGGGTAGATCGC-GTAATGTGAAACACGGGGTAAATAGGAAAAAGGACAGGAAATGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATATGACAAAGTATATATAGGCGCCATCATTATTAATGATCATAAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAGCGATATTTATTAA--AAAAA-----TATTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCAATGTTTTAGGGTTTCAAGCTTTTAGTATCAATTATATGGAATACAATTATCTTTAATTTTAGTTTACTCGAATCAAATCTGCATATCTGCAAAAAAATATATGT-T---TTGTTCAAAC---TTATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGCAAGTTAGAGCAAATAGACGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|6                          :                                                                                      ggTTGTTGCAGTA--GTTTCATTTT-AAAAGCGTTTGG-TTACAGTGAGGCAGGGTAGACCAC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAGCAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATATATTAAG-AAAAA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGCACAAGCGTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATTTTTAATTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGTATATATGCAAGATA--ATATCT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGT-GTCGAGACAAATTAGTGCAAAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|7                          :                                                                                        TTGTTGTAGTACAGTTTCATTTT-AAAATCGTTTTGGATACACTGAGACAGGGTAGACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGAAACAAGGGCAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAATATAGATAGGCGCCATCATTACTAGTGATCAACACACATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAAG----CAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATGGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGTACAAGCGTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATCTTTAGTTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGTATATCTGCAAGATAATATATATATATATTGTTCAATC---TAATGTCACAGCTAATTTGTGGTCGAGGCAAGTTAGAACAAAGTGGTGGAGGCATGTTTCAACAGAATTTCA
gi|8                          :                                                                                                     GTTTCATTTT-AAAAACGTTTGGGATACACTGAGGCAGAGTAGACCGC-GCAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTCACGAAGTATAGATAGGCACAATCATTACAGGTGATCAACAAATATTGGAATGTTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TATTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCGTTGTTTTAGCTGTACAAGCTTTTAGTATAAATTAAATGGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTCTACACGAACTAAATCTGCATATCTGCAAGATACTATATAT-T---TTGTAAAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTAGAGGCAAGTTGGAACAGAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|9                          :                                                                                       tTTGTTGGAGTACAGTTTTATCTT-AAAAACGTTTGGGTTACAGTGAGGCAGGGTAAACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTAATATA--GTAATGTTCCTATTTAATCTATTTGACGAAGAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACACATATTGGAATG-------------AGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGTACAAGCGTTTACTATGAATTATATGGAATACAGCTATCTTTAATTTTAGCATACACGAATTTAATGTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGCAAATTAGAGCAAAGTGGTGGAGGCCTGTTGTTACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA


blockSeqs                     :                                                                                                               T             T    G                  G                                                                                                                     T                                                  TTTTT      A         G  TT                               G                                           T                                        A ATA          .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             A    T                  .                                                                                                                     T                                                  G          A         .  .                                T                                           C                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             T    C                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                G                                           A                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             T    C                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                G                                           T                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             T    G                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                T                                           A                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             A    C                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                G                                           C                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             A    C                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                T                                           T                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             T    G                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                T                                           T                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             T    G                  .                                                                                                                     T                                                  .          .         .  .                                G                                           C                                        . .            .  
blockSeqs                     :                                                                                                               .             A    C                  .                                                                                                                     C                                                  .          .         .  .                                T                                           T                                        . .            .  
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Reference ( family-1599 )     :                                                                                        TTGTTGTAGTACAGTTTCATTTT-AAAAACGTTTGGGNTACACTGAGGCAGGGTAGACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAGAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACCGTTTTAGCTGTACAAGCGTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGCAAGTTAGAGCAAAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
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gi|14                         :                                                                                        TTGTTGTAGTACAGTTTCATTTT-AAAAATGTTTGGGTTACAGTGAGGCAGGGTAGACTGC-GTAAAGTGAATCACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATAAAGTATTATTCCCATTTAATCCATTTGACAAAGAATAGATAGGCACCATCATTATAAGTGATCAACAAATATTGGAATGATGGCACATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TAATTT-TCATTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACCGTTTTAGCTGTACAAGCTTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATTTTTAATTTTAGTT-------------TTTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGG
gi|15                         :                                                                                                                                                              AAACACGGGGTTAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAGAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACAAA-ATTGGAAAGGTAGCAGATGAAGAGTGCTAACGATGTTTATTAA-AAAAAA-----TAGTTT-TCGTTTTGT-CA--ATAGTATTTTCACCGTTT----------AGTGTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATCTTTTATTTTAGTATACACGAGTTAAATCTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATTTCACAGGTAATTTTTGGTCGAGGCAAGTTAGAGCAAAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aACGATATTTATTAAGAAAATC-----TATTTTATCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACTGTTTCAGCTGTACAGGTTTTTAGTATCAATTATAT-----ACAGTTATCTTTAATTTTAGCCCACACGAATTAAATCTGCATATCTGCAATATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---CAATGTCACAGATAACTTGTGGTAGATGCAAGTTGGAACAAAGTGGTGGATGCATGTTGTAACAG
gi|17                         :                                                                                            TGTAGTACAGTTTGTTTTT-AAAAATGTTTGGGATACACTGAGGCATGGTAGACTGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACCGGAAATGATATATAGTAATATTCCAATTTAATCCATTTGACGAAGTATATATAGGCGCCATCATTATTAATGATCAACTAATATTGGAATGGTGGCAGATGAA
gi|18                         :                                                                                        TTGTTTTAGTACAGTTTCATTTT-AAAAACTTTTGGAATACACTGAGGCAAAATAGACCGCGGTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACGA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACGATATTTATTAAGAAAATC-----TATTTTATCGTTTCGT-CA--Atatttattaagaaaatctattttatcgtttcgtcaa
gi|2                          : ttgttttagtacagtttcattttaaaaacttttggaatacactgaggcaaaatagaccgcggtaaagtgaaacacggggtaagtaggTTGTTGTAGTACAGTTTCATTTT-AAAAATGTTTGGGTTACAGTGAGGCAGGGTAGGCTGC-GTAAAGTAAATCACGGGGTAAGTAGGAACAAAGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAGAATAGATATACACCATCATTATAAGAGATCAACACATATTGGAATGATGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAG----AATTTTTTTTTTT-TCATTTTGT-CA--AAAGTGTTTTCACCGTTTTAGCTGTACAAGCTTTTAGTATCAATAATATGGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTTTACACGAACTAAATCTGTATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGACAAGTTAGAGCAAAGTGGTGGAGACATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|3                          :                                                                                       aTTGTTATAGTACAGTTTCGTTTT-AAAAATGTTTGGGTTACAGTGAGGCAGGGTAGACTGC-GTAAAGTGAATCACGGGGTACGTAGGAACAAGGACAGAAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACAAAGAATAGATAGGCACCATCATTACAAGTGATCAACAAATATTGGAATGATGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAATA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACCATTTTAGCTGTGCAAGCGTTTAGTATCAATAACATCGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTTTACACGAATTAAATCTTCATATATGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGTAAGTTAGAGCAAAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|4                          :                                                                                         TGTTGTTGTACAGCTTCATTCT-TAAAACGTTTGAGATACACTGAGGCAGAGTTGACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGATATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAGAATAGATAGGCACCATCATTATAAGTGATCAACAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATCAAGAAAACA-----TATTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGTACAAGCTTTTAGTGTCAATTATATGGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAACTTGTGGTCGAGGCAATTTAGAGGAAAGTGTTGTAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|5                          :                                                                                            TGTAGTACAGTTTCATTTTTAAAAATGTTTGGGATACACTGAGGCAGGGTAGATCGC-GTAATGTGAAACACGGGGTAAATAGGAAAAAGGACAGGAAATGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATATGACAAAGTATATATAGGCGCCATCATTATTAATGATCATAAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAGCGATATTTATTAA--AAAAA-----TATTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCAATGTTTTAGGGTTTCAAGCTTTTAGTATCAATTATATGGAATACAATTATCTTTAATTTTAGTTTACTCGAATCAAATCTGCATATCTGCAAAAAAATATATGT-T---TTGTTCAAAC---TTATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGCAAGTTAGAGCAAATAGACGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|6                          :                                                                                      ggTTGTTGCAGTA--GTTTCATTTT-AAAAGCGTTTGG-TTACAGTGAGGCAGGGTAGACCAC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAGCAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACAAATATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATATATTAAG-AAAAA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGCACAAGCGTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATTTTTAATTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGTATATATGCAAGATA--ATATCT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGT-GTCGAGACAAATTAGTGCAAAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|7                          :                                                                                        TTGTTGTAGTACAGTTTCATTTT-AAAATCGTTTTGGATACACTGAGACAGGGTAGACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGAAACAAGGGCAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTGACGAAATATAGATAGGCGCCATCATTACTAGTGATCAACACACATTGGAATGGTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAAG----CAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATGGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGTACAAGCGTTTAGTATCAATTATATGGAATACAGTTATCTTTAGTTTTAGTCTACACGAATTAAATCTGTATATCTGCAAGATAATATATATATATATTGTTCAATC---TAATGTCACAGCTAATTTGTGGTCGAGGCAAGTTAGAACAAAGTGGTGGAGGCATGTTTCAACAGAATTTCA
gi|8                          :                                                                                                     GTTTCATTTT-AAAAACGTTTGGGATACACTGAGGCAGAGTAGACCGC-GCAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTGATATATAGTAATATTCCTATTTAATCCATTTCACGAAGTATAGATAGGCACAATCATTACAGGTGATCAACAAATATTGGAATGTTGGCAGATGAAGAGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TATTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCGTTGTTTTAGCTGTACAAGCTTTTAGTATAAATTAAATGGAATACAGTTATCTTTAATTTTAGTCTACACGAACTAAATCTGCATATCTGCAAGATACTATATAT-T---TTGTAAAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTAGAGGCAAGTTGGAACAGAGTGGTGGAGGCATGTTGTAACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA
gi|9                          :                                                                                       tTTGTTGGAGTACAGTTTTATCTT-AAAAACGTTTGGGTTACAGTGAGGCAGGGTAAACCGC-GTAAAGTGAAACACGGGGTAAGTAGGAACAAGGACAGTAACTAATATA--GTAATGTTCCTATTTAATCTATTTGACGAAGAATAGATAGGCACCATCATTATTAGTGATCAACACATATTGGAATG-------------AGTGCTAACGATATTTATTAAGAAAAAA-----TAGTTT-TCGTTTCGT-CA--ATAGTGTTTTCACTGTTTTAGCTGTACAAGCGTTTACTATGAATTATATGGAATACAGCTATCTTTAATTTTAGCATACACGAATTTAATGTGCATATCTGCAAGATAATATATAT-T---TTGTTCAATC---TAATGTCACAGATAATTTGTGGTCGAGGCAAATTAGAGCAAAGTGGTGGAGGCCTGTTGTTACAGTATTTCAACTCAGTAAATATA