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lowQualScore : 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333 444444444444444444 1 222 1111 22222 11 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333333333 1111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333 1111111111 55555555555555555555555555 555555555555555555555555555555555555555555555 111111
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lowQualScore : .. . . . ................................................................................................................................................................................................................................................................................................ . . . . .......... . . .................. . ... .... ..... . ... .. .. . ... . .......................................................... . ......... .... . ... ............ ........................................................................................................................................................ ... . . . .. ..... . . ...... .......... . . . .......................... . . .. ............................................. . . . ... . . ...... .. .
lowQualScore : 11 6 5 0 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 9 9 3333333333 0 1 777777777777777777 0 000 3333 11111 0 000 00 55 2 000 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 111111111 0000 0 666 222222222222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888 2 0 6 66 88888 6 5 222222 9999999999 0 4 7 66666666666666666666666666 0 1 44 111111111111111111111111111111111111111111111 9 6 6 444 1 7 444444 55 6
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Reference ( gi|3 ) : ACGTTATTTCAA-ACAACGCTGATCACAAAGGGG-------A-------C------A--G----------G--ACGT-A-CT--TGT------C----CTTTGAG---TTTGTT-T----AT-----AT---CT-CTAACACGCGATTGG-TCGATTCAG--TTGTTAGGC--------CGTTCT-CC-----TAT-----TCA-----GTTGTCAT---ACCTG----T--CAAACC------TAGTAA-------AT--ACAG-TA--------AC-T--A--G--T--GT-----ATG-T--------GT--------CG-ATTGGTTT-GGCTC-------GA-TGTTCCCAGAAAA---TTGC---------GACATCAACTCG-TAA-A--GATT-T--AAA-GA---TA-GTATCTCAGC-AATGATTTTA---G-AAAGT--TTAGTAT---TATTAC----GTTTAT-----A--AAAC--------T--C----AAA-CTGAAT--AG-TGA-AAATAATGTA-ATG-TAT--TCAGCACCGC-----GGT----CAATGA---------AAC-----------CAT--CGAAAATT--AA----TGTTTTCC--CA--TG-GAC---------------ACT-------------T--GCT---------------TTC--------------CT-----------------TTGG---CTATTTACCATGTC-GTGCGGATGGGGCTTTA-T------TACCTCT----------GACGT-TC----AATTACACTT---ATTCAGT-AAAACCAAAAGGGTCAAAGTAG----------------AGC-------A----G--AA--A--G-TCGTCGATTTTATTTGATACCG---A-TTGTTA-AAGCAACGTCGTAAACGT--TTGAAACA
gi|2 : ACGTCGCTGCGA-ATAACGCTGATTACGAAGAGAAATGTGTA-------C------G--G----------G--CCTT-A-TC--TCA------C----CTCTGAA---TATGTT-T----AT-----ACATATT-CTGACATCCAATGGGCTCAAAT-AG--TTGT
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gi|25 : ataaacaattttcagagtttcgatcttttaaacagagtgaaataatatgtagttagtattgttacattaaaaactgtaacagttaaatgaacatactactagaaactctgttttgCGCCATTTCAA-ACAATGTTGATAATAAAGTGA-------A-------CT-----A--ATTGTGTATGTG--ACAT-T-TT--TAC------T----CTCTGAA---TTTGCT-T----CTTGTGAAT----T-ATGCCATGCAACTCA-TCAATTCAG--TTGTTAGGG--------TGTTTC-CC-----TAT-----TTA-----GCTGTCAA---ACttctaatttgatatgcaagcgtag
gi|7 : ttCGTTATTTCAA-ACAACGCTTGTGGTGAAGGGAAATGTGAA-------C------A--A----------T--ATGC-A-CG--TGG------C--------AAA---TCT----------T-----AA---CT-CTGA-----GTTTGC-T---TTCA-------CGGGC--------CTTTTC-TC-----TAT-----TCA-----GCTACCAT---ATTTG----T--CTCTTT------TGGTAA------------TAG-TA--------ACAC--A--G--C--GT-----ATG-TCTAAATACAT--------TG-ATTGATTT-TGTTT-------G-------CTATAAA-------------------CATTACCTT--TAA-T--GATT-T--CGA--A---TC-ATGTCTCATC-GAT-ATTTTTTTTG-AAATTAATTCATATCCATATTACTGAAGTTGGT-----G--GAAT--------A--C----AAA-CTGAAT-----TAAGAAATCACCT--ATA-TAA--TCGGCACAGC-----GAT----CAATGT---------GCCG----------CAG--CGAGAATag
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gi|14 : tactactccttgcataacaagttagataaactctCAATGCTGATGACAAAGGGA-------A-------C------------------------TGT-G-TT--TGTATCTCAT----CTCTGAG---GTTTTT-T----AT-----ATA--TT-CTGACACCCGATTGG-CTGATTCAG--TTGTTTAGC--------CATTCT-TC-----CAT-----TCA-----GCTGTCAA---ACCTGGCTAT--CGAATA------TAGT----------------G-TA--------AG-T--------T--TT-----TTG-T--------AT--------CT-ATTGATTT-GGCTCTCACCATGACTGCTCCCAGAAAT---GTCT---------AACATAAACTC---AA-AGTGATT-G--CAA-GA---TC-GCATCGCAGC-GATGATTTTA---G-AAAAT--Tgtttgtttatatcgactgattttgatttgctgctccaagaaggttctaacacgaactcaaaataagttcaaagatcgtatctcagtgataattttggaaaattaagc
gi|10 : tctgtG-TCGGTTAAG--TTGTTAAAA--------CGTTCC-CC-----TAT-----T-A-----GCTGCCAT---a
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gi|9 : tactacaccttgcataactctgttttacgtcgctgcgaataacgctgattacgaagagaaatgtgtacgggccttatctcacctctgaatatgtttatacatattctgacatccaatgggctcaaatagttgtagctatgataatac--T--GT-----TTA-T--------AT--------CG-ACTGATTTTGATTT-------GC-TGCTCCCAGAAGG---TTCT---------AACACGAACTCA-AAATA--AGTT-C--AAA-GA---TC-GTATCTCAGT-GATAATTTTA---G-AAAAT--TAAGCTT---TAT-------GTTTAT-----AACAAATA-------T--C----AAATCCTAAT--AGCTGA-AAtcttaacttcacgtgcaaggcgta
gi|12 : tgctactccttgcataacaagttagataaactcttttttttcaaataacgctgacgaccaagggaattgtgtacgttaattatcttctctctgagtttgtttttacatattctgacatcccattggcggattcatttatttgaccgttctccattgtt--T--GT-----TTA-T--------AT--------CG-ACTGATTTTGATTT-------GC-TGCTCCAAGAAGG---TTCT---------AACACGAACTCA-AAATA--AGTT-C--AAA-GA---TC-GTATCTCAGT-GATAATTTTG---G-AAAAT--TAAGta
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gi|4 : -----A--AAAA--------T--C----AAA-CTGTATTTAC-T-A-AAATATTTTA-ATG-TAA--TCAGAACGGT-----GAT----CAATGA---------AAC-----------CTT--CCAAAAAG--GT----TGTTTGACAGCA--TG-AACTTCTGGGTTCAGGATACC-------------C--AGT---------------TTC--------------CA-----------------TTGG---CTGTTCATCTTGTT-GTGAGG-TGGAGCTTTA-T------TGCCTCT-----------ATAT-TC----GGACACACTTAA-ATTAAGTCAAAACTA
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gi|10 : AAT--AA-TTG-AAATAATTTA-ATG-T-TGGTCATTACCAT-----AGA----CAATGA---------AAC-----------CAT--CCTAAATG--AG----TGCTTTGCAGCA--CG-AAT---------------GTT-------------T--GCG---------------TTCAAGATACCAGTTGCCA-----------------TTGG---ATTTTCATCATGCC-GTGAGG-TGGAGCTTCA-T------TACCTCT----------GGCGT-TC----GATGACACTT---GAGCTGT-CAAAACAATAGTGTCAAGGTAG----------------TG--------A----A--AA--A------GCCGATTTAGTTTGATACCG---A-TTGTTT-AAttatgactcgaaactaactaacttgatatgtaacgt
gi|15 : cagattcttaaatgttatactacgtcggttaagttgttaaaacgttcccctattagctgccatt-TAC--TCAGCACCGC-----GAT----CAATTA---------AAT-----------TTT--CCAAAATT--AC----TGTTTTGCAGCG--TT-AAT---------------ATC-------------C--GCG---------------TTG--------------TTATACATGTAC-------CTGGTTTCCATTCATCATGTT-GTAAAG-TGGGGCTTAA-T------AACCTCT----------AGCGA-TG----AAATACATTT---GAACAGT-----CTAAA-----CAAA--------------------------------------AA--T--G-ACGCCGATTTGGTTTGATATCG---A-TTGTTA-AAGAAAGATCGTAAATGT--TTGAAA
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gi|16 : tgtca--TCAGCACCGC-----GAC----CAAAGA---------GGC-----------GTT--CCAAAATG--AC----TGTCTTGC-------A-GGT---------------GCT-------------C--GGT---------------TTC--------------CG-----------------TTAG---CTATCCATCATACT-ATGAGG-CGGTGCTTTT-G------TACCTAT----------GGCAT-TC----GTAGACCCTT---GGACAAT-CGAAACGAAAGGGTCAAAGAAG----------------TGC-------A----GAAAA--A--G-TCGCCGATTTTGTTTG-----------TTAT------CAACGTCGTAAATTT--TCGAAAaactaacttgaaatacaaggcgtaattttttgataaacatattttaaattgaagtatattttggcggcactgtgccaccgtagtaagcatccatgtgaagtctacttttaatttctcttttttctaaacctggtctggtaactactgagatttgaaacaggaaggttgaacacgacatttaatttttttttatcaaatttcgaaatttcgaaactgattttacatttgaa
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1592 ) : ACGTCATTTCAA-ACAA--CGCTGATGACGAAGGGAA-------C--A--GTG-----TACG-T---A-CTT----G-----T-C---T---C---TCT--G-AG-TTTGTT-T---------AT-----AT-TCTGACAC--GCGATTGG-NCGATTCAG--TTGTTNGGC--------CGTTCCCCTATTCAGCTGTCANACCTGTCA--------ANC----C------TAGT-AA-T-ACAGTG--------AC--T--A--G--TGTNTGT--------AT----CGATTGATTT-GGCTC--------GCTGCTCCCAGAAA---TTTNCAACAT-------AAACTCGA--AA-AGATT--C--A--AA-GATC----GTATCTCAGCGATGA---TTTTAG-AA---AA-TT-------AG-ATTATT-A-NG---TNTAT-----A--AA-AT--------TC----AAA-CTGAAT--AGTNA-AAATAATTTAATGT-AATCAGCA----CCGCGGTCA--ATGA--AACCTTCCAAAATNACTGTTTTGCAG----------------CA--------TG---------------GAT--------ACT--------CG----GT-------------T-TCC--GT-----TGG---CTATTCATCATGCC-GTGAGG-CGGGGCTTTGT------TACCTCTGGCGT-TC--GA-ANACACTTGGAC--A------GTCAA-AACAAAAGGGTCAAAGTAGTGC--A----A---------AA--A-G-C-------------CGCCGATTTTGTTTGATACCGATTGTTNAAGAAACGTCGTAAACGT--TCGAAAC
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1592 ) : ACGTCATTTCAA-ACAA--CGCTGATGACGAAGGGAACT----GTG-----TAC---G-T-A-C----TT-----A---------TC---T---C---TCT--G-AGTTTGTTT---T--------AT--AT-TCTGACAC--G--CGATTGGC-CGATTCAGTTGTTNGGC--------CGTTCCCCTATTCAGCTGTCAAACCTGTCA----------------ATCC-TA--GTAA-T-ATAGTG--------AC--T--A--G--TGTTTGT--------AT----CGATTGATTTGGCTC--------GCTGCTCCCAGAAA---TTTNCAACAT-------AAACTCGA--AA-AGATT--C--A--AA-GATC----GTATCTCAGCGATGA---TTTTAG-AA---AATT-------AG-ATTATT-A-GG---TTTAT-----A--AA-AT--------TC----AAA-CTGAAT--AGT-NGAAATAATTTAATGT-AATCAGCA----CCGCGGTCA--ATGA--AACNTTCCAAAATGACTGTTTTGCAG----------------CA--------TG---------------GAT--------ACT--------CG----GT-------------T-TCC--GT-----TGG---CTATTCATCATGTC-GTGAGG-CGGGGCTTTGT------TACCTCTGGCGTTCGGAGACACTTGAAC--A------GTCAA-----AACAAAAGGGTCAAAGTAGTGC--A----A---------AA--A-G-C-------------CGCCGATTTTGTTTGATACCGATTGTTTGAGAAACGTCGTAAACGT--TCGAAAC
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gi|22 : ATGA---TTTTAG-AC---AATC-------A--ATTATT-A-GG---CATATTAATGA--AA-ATGATGGTAATT----AAC-CTGAAT--AGC-TGAAAAAAGTTA-TGT-AATCAGCA----TCATTATCA--ATGC--AACTTTCCAAGTTAA-TGC----CAG----------------C---------TA---------------GA---------ACTTTTGTTTCTG----GT-------------T-TTC--AT-----TGG---CTA---ATCGTGTC-ATAAGG-CAGAGCTATTT------TACCTGTGGTGTTtctaactttatatgcaaggcatagtt
gi|23 : aT------CACCGCTGACATTCGAGAACACTTAAAC--A------GTGAA-----AA---AAG--TCAATATAGAAA--A----A---------AAGGA-G-T-------------CGTCGATTTTGTTTGATTCTGAGCATTTGAGAAATGCCGTAAACGT--TCGA
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gi|27 : ACGTCATTACAA-ATAA--TGTGGATTACAAAGGGAATT----ATG-----TAC---G-T-GTC----TT-----A---------TCTCAT---C---TCT--GAAATTTTTTT---TTAC-----AT--AT-ACTGACAC--C--CGATTGGA-CCATTTAGTTGtgtcttactttatatgcaagg
gi|28 : actacgttttgcataacaaaactgttttGTCATTTTGT-ACAA--CGCTGATAATGAAGGGAATT----ATG-----TAC---G-TGA-T----CT-----A---------TC---T---C---TCCCCG-AGCCTGTTA---C--------AT--AT-TCTGACAC--G--TGATTAAC-AAAGTCAGTTGTTAGACCGTTCCCACGTTCCCCTATTCAGCTGCCAAAgacc
gi|29 : ttAT--------ATC--------TG----GT-------------T-TCA--TT-----TGG---CTATTCATCATGTCAGT-------GGGCTTTATTGGGACTACCTCTAG
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gi|4 : tacaatgccttgtataacaaattaaagaaactctgttttata-----A--AA-AA--------TC----AAA-CTGTATTTACT-A-AAATATTTTAATGT-AATCAGAA----CGGTGATCA--ATGA--AACCTTCCAAAAAGGTTGTTTGACAG----------------CA--------TGAACTTCTGGGTTCAGGAT--------ACC--------CA----GT-------------T-TCC--AT-----TGG---CTGTTCATCTTGTT-GTGAGG-TGGAGCTTTAT------TGCCTCTA-TATTCGGACACACTTAAATTAA------GTCAA-----AACaaactgtatttactaaaatattttaatgtaatcagaacggtgatcaatgaaaccttccaaaaaggttgtttgacagcatgaacttctgggttcaggatacccagtttccattggctgttcatcttgttgtgaggtggagctttattgcctctatattcggacacacttaaattaagtcaaaactagtgacaaacaa
gi|5 : tacaatgccttgtataacaaattaaagaaactctgttttatatcatttcacacaatgccgatgatgatggaaactgtgaaagtggcttatctcgtctctggatgtgtacacattctgacccataattggcttgttcagtactttgttcattcccttaatgagctgtcaagcctgtcaatcagtaataatatcatgacagtgaatgtttgtatatactgattgatttgactcgctgttctcagaaatttgtaacataaactcgaaaagattccaACTTCATTTCAA-ACAA--TACTGATGACAAAGGGAAA-----GTG-----TAC---GTT-A-C----TT-----A---------TCACAT---C---TTC--A-TGTTAATTT---TTA------AT--AT-TCTGACAT--G--CA--------GATTTGGTTGTTTGTC--------CATTCCCC-ATTtagtgacaaacaa
gi|5 : ataaataagcaggaattcgctttttagaatgaagttaaaatgtcaacaaaatgtaattaaaagatatactacaccttgggcaagatgtacagaaactctgttttATCAATTAGGATC--------CCTGTTCCCAGACA---TGTGCAACAT-------AAACTC-A--AA-AGATT--C--C--AATGATT----AAATCTTAGCAATGG---TC-----AA---A--T-------A-----ATT-A-GG---AATAT-----A--GATAT----------------A-TTGAAT--AGC-TGATTTAATTGAATGT-AATCAGCC----AGGAGGCTA--ATGA--AACCTTCCAAAAtgtatgccaatcattacgattggcatacaaatggggaatggacaaacaaccaaattgtagtacttccccagcgcatcaattaggatccctgttcccagacatgtgcaacataaactcaaaagattccaatgattaaatcttagcaatggtcaaataattaggaatatagatatattgaatagctgatttaattgaatgtaatcagccaggaggctaatgaaaccttccaaaa
gi|6 : ataaataagcaggaattcgctttttagaatgaagttaaaatgtcaacaaaatgtaattaaaagatatactacaccttgggcaagatgtacagaaactctgttttacttcatttcaaacaatactgatgacaaagggaaagtgtacgttacttatcacatcttcatgttaatttttaatattctgacatgcagatttggttgtttgtccattccccatttgtatgccaatcattacgattggcatacaaatggggaatggacaaacaaccaaattgtagtacttccccagcgcTGT-CATCAGCA----CCGCGACCA--AAGA--GGCGTTCCAAAATGACTGTCTTGCAG--------------------------------------------AT--------GCT--------CG----GT-------------T-TAC--GT-----TAG---CTATCCATCATACT-ATGAGA-CGGTGCTTTGG------TACCTATGGCATTCGTAAACCCTTGGAC--A------ATCGA-----AACGAAAGGGTCAAAGAAGTACAGA----A---------AA--A-G-T-------------CACCGATTTTGTTTGTTATCGATTGTTTGAGAAACGTCGTAAATTT--TCGAAA
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gi|8 : acgttttgatgaaattacattctgtacattttatagcaagttgagaaactttgctttgTTTCAGGACAA--TGCTGA------AGGCAACT----GTT-----TAC---G-T---C----TC-----A---------TG---T-------TCT--G----TT-TTT---T--------AC--ATATCTGACTG--G--TGATTGGA-TAATTTAATTGTCATGC--------CCTTCCCCTGTTCAGATTTTAAACCTGTCA----------------ATCC-TA--ATAATT-GTAGTGAAAATGTTAC--TACA--G--TGCCTGT---------------GATTGATCTGGCTC--------ACTGTTACAATAAA---TGTACAACAT-------AAACTCGA--AA-AGATTA-T--A--AA-GATCGTATGTATCTAATCGATGA---TTTTAG-AA---AATT--------G-ATTATT-A-GG---TATATA----A--AA-AA--------TA----AAA-CAGAATC-AAT--GAAATATTTTAATGC-AATCAACA----CCGCCGAAA--ATGA--AACCTTCtgccgcagcgagaatattctctttcat
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blockSeqs : . .
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1592 ) : ACGTCATTTCAA-ACAA--CGCTGATGACGAAGGGAANT----G---------TGTACGT-----------GAC----TT-----ATC---T---C---T--CTG-AGTTTG-----TTT-TTACATAT-TCTGACAC--G--CGATTGGC-CGATTCAGTTGTTNGGC--------CGTTCCCCTATTCAGCTGTCAAACCTGTCA----------------ATCC-TA--GTAA-T-ATAGTGA--------C--T-A--G--TGTT----TGT------AT----CGATTGATTTGGCTC--------GCTGCTCCCAGAAA---TTTNCAACAT-------AAACTCGA--AA-AGATT--C--A--AA-GATCGTAT----CTCAGCGATGA---TTTTAG-AA---AATT-------AG-ATTATT-A-GGTTTAT-----A--AA-AT--------TCAAA---CTGAA-T--AGCTGAA-ATA-----ATTTAATGT-AATCAGCA----CCGCGGTCA--ATGA--AACNTTCCAAAATGACTGTTTTGCAG----------------CA--------TG---------------GAT--------ACT--------CG----GT-------------T-TCC--GT-----TGG---CTATTCATCATGTC-GTGAGG-CGGGGCTTTGT------TACCTCTGGCGTTCGGAGACACTTGAAC--A------GTCAA-----AACAAAAGGGTCAAAGTAGTGC--A----A---------AA--A-G-C-------------CGCCGATTTTGTTTGATACCGATTGTTTGAGAAACGTCGTAAACGT--TCGAAAC
gi|1 : CATCATTTCAA-ACAA--TGTTGGTGACAATGGGAAAT----G---------TGTACATTGCACATACATGAC----AA-----ATC---T---C---T--C---ACTCTG-----GTT---GC---T-TCTTACAC--AGTTGATT--C-CGACT----TGTTAGGT--------AGCTC-----------TGTCAAATCTGTCATTTGATGTAACAGAACATTT-TATAGCAA-TTATAATAT--------C--T-GT-A--TGTT----TATTATGATAT----TGATTGACTTGGATC--------ACTGGACGAAGAAAAAATTTACATTATGATTGACAAGCTCGATAAA-AGAT---C--ATGAA-AATCATAT----CTCAGCGATGG---TTTTAGTAA---AATT-------AA-A--AAT-A-AG-CCAT--------CA-AT--------TGAAAATGCTGGA-A--AACTGAATATACTTATATTT-ATGT-ATTCAGCAGTGCTTGCAGGCACTATAATGAACATTTCCAAATAACTGTTTCACAG----------------CA--------AG---------------AAC--------TTT--------CGCT--GTCATAGCATGTTGGT-TTC--AT-----TGG---CTAATTATCATGGT-TTGAGG-TGGAACTTTGT------TACCTCTGGCATTTGGAGATGCATGAAC--A------CTGAA-----AACAAAATGGT----G----GC--C----A---------AA--A-G-T-------------AGCTGATTTTGCTTGACGTTGAGCATTTTAAATATGGTTTAAACAT--TCAAAA
gi|10 : ataaacaattttcagagtttcgatcttttaaacagagtgaaataatatgtagttagtattgttacattaaaaactgtaacagttaaatgaacatactactagaaactctgttttgGT-CGGTTAAGTTGTTAAAA--------CGTTCCCCTATT-AGCTGCCAttctaatttgatatgcaagcgtag
gi|10 : cagattcttaaatgttatactacAA-T--AATTGAA-ATA-----ATTTAATGTTGGTCATTA----CCATAGACA--ATGA--AACCATCCTAAATGAGTGCTTTGCAG----------------CA--------CGAATGTTTGCGTTCAAGAT--------AC---------CA----GT-------------T-GCC--AT-----TGG---ATTTTCATCATGCC-GTGAGG-TGGAGCTTCAT------TACCTCTGGCGTTCGATGACACTTGAGC--T------GTCAA-----AACAATAGTGTCAAGGTAGTG---A----A---------AA--A------------------GCCGATTTAGTTTGATACCGATTGTTTAAttaataattgaaataatttaatgttggtcattaccatagacaatgaaaccatcctaaatgagtgctttgcagcacgaatgtttgcgttcaagataccagttgccattggattttcatcatgccgtgaggtggagcttcattacctctggcgttcgatgacacttgagctgtcaaaacaatagtgtcaaggtagtgaaaaagccgatttagtttgataccgattgtttaa
gi|11 : cagattcttaaatgttatactacgtcggttaagttgttaaaacgttcccctattagctgccattAAAAGGACTGTTTTGCAG----------------C---------TA---------------GATCTAAATAAACT--------CG----GT-------------T-TCA--AT-----AGG---CTACTAATCATGCC-ATGTGG-CGGGATTTTGT------TACCAATGGCTTTCGGAGATACTTGAAC--A------TTGAT-----AACAAACGGATCAAATTAGTGC--C----A---------AA--A-T-A-------------CGTCGATTTTGTTTGTTACCAATTATTTGAGAAACGTCGTAAACGT--
gi|12 : tgttgTTTCAA-ACAA--CGCTGACGACCAAGGGAATT----G---------TGTACGT-----------TAA----TT-----ATC---TTCTC---T--CTG-AGTTTG-----TTT-TTACATAT-TCTGACAT--C--CCATTGGG-GGATTCATTTATTTGAC--------CGTTCTCC-AT-----TGT-----TTGTT-------------------------------T-ATATCGA--------C--T-G--A--T-TT----T-------------------GATTT-------------GCTGCTCCAAGAAG---GTTCTAACAC-------GAACTCAA--AATAAGTT--C--A--AA-GATCGTAT----CTCAGTGATAA---TTTTGG-AA---AATT-------Aaaaaaaactctaacttgaaaaactattgaaacacattaaacggaaatgctttgtgagccacattatgtgttcctaccaatgagcgtttaagtaa
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gi|14 : CAA--TGCTGATGACAAAGGGAACT----G---------TGTTTGT-----------ATC----TC-----ATC---T---C---T----G-AGGTT-------TT-TTATATAT-TCTGACAC--C--CGATTGGC-TGATTCAGTTGTTTAGC--------CATTCTTCCATTCAGCTGTCAAACCTGGCT----------------ATC------G-AA-T-ATAGTG------------T-A--AGTTTTT----TGT------AT----CTATTGATTTGGCTCTCACCATGACTGCTCCCAGAAA---TGTCTAACAT-------AAACTCAA--AG-TGATT--G--C--AA-GATCGCAT----CGCAGCGATGA---TTTTAG-AA---AATT-------Agcttttaaattatgactcgaaactaactaacttgatatgtaacgt
gi|15 : tctgtT-ACTCAGCA----CCGCGATCA--ATTA--AATTTTCCAAAATTACTGTTTTGCAG----------------CG--------TT---------------AAT--------ATC--------CGCGTTGT-------------TATAC--ATGTACCTGGTTTCCATTCATCATGTT-GTAAAG-TGGGGCTTAAT------AACCTCTAGCGATGAAATACATTTGAAC--A------GTCTA-----AACA--------------------A----A---------AA--T-G-A-------------CGCCGATTTGGTTTGATATCGATTGTTAAAGAAAGATCGTAAATGT--TTGAAA
gi|16 : GT-CATCAGCA----CCGCGACCA--AAGA--GGCGTTCCAAAATGACTGTCTTGCAG--------------------------------------------GT--------GCT--------CG----GT-------------T-TCC--GT-----TAG---CTATCCATCATACT-ATGAGG-CGGTGCTTTTG------TACCTATGGCATTCGTAGACCCTTGGAC--A------ATCGA-----AACGAAAGGGTCAAAGAAGTGCAGA----A---------AA--A-G-T-------------CGCCGATTTTGTTTGTTATC------------AACGTCGTAAATTT--TCGAAAttctaactggatatgaaaagcgtaatac
gi|17 : --AA-GATCGCAT----CGCAGCGATGA---TTTTAG-AA---AATT-------Aaactaacttgaaatgcaaggcg
gi|17 : cT-----TAA---CTAATCAAAATGTC-ATGAGG-CGGTACTTTGT------TAGCTCTGGCCTTCTGAGAAACACGAAC--A------GTCAA-----AACAAAA-TGTAAACGTAATGCA-A----A---------AA--A-G-C-------------TGCCAATTTTGTTTGCTAATGATTGTTTGAGAAAactaatcaaaatgtcatgaggcggtactttgttagctctggccttctgagaaacacgaacagtcaaaacaaaatgtaaacgtaatgcaaaaaagctgccaattttgtttgctaatgattgtttgagaaaaaactctatacttgatacgcaaggcatagtattattaatggttttagt
gi|18 : caagatcgcatcgcagcgatgattttagaaaaACGTCATTTAAA-AAAAAACGCTGATATTTAAAGGAATT----G---------TGTACGT-----------TAC----TTTTTCGTTT---T---C---T--CTG-AACTTGTTTTTTTT-TTACATAT-TCTGGCATAAG--CGATaaactctatacttgatacgcaaggcatagtattattaatggttttagt
gi|18 : tattacgtcttgtgtgacaagttagagaaactctgttttAGCGATGA---TTTAAG-AA---AATT--------G-ATTACT-AGGGTTTAT-----C--AA-gatttaagaaaattgattactagggtttatcaagcacactccaattactgtacatcaactattacaa
gi|2 : tattacgtcttgtgtgacaagttagagaaactctgttttacgtcatttaaaaaaaaacgctgatatttaaaggaattgtgtacgttactttttcgttttctctgaacttgttttttttttacatattctggcataACGTCGCTGCGA-ATAA--CGCTGATTACGAAGAGAAAT----G---------TGTACGG-----------GCC----TT-----ATC---TCACC---T--CTG-AATATG-----TTT-ATACATAT-TCTGACAT--C--CAATGGGCTCAAAT-AGTTGTgcacactccaattactgtacatcaactattacaa
gi|2 : tactacaccttgcataactctgtttt-TA--ATAC-T-ACAGTG---------T--T-AATG--TGTT----TAT------AT----CGATTGAATTGGCTC--------GCTGCTCTCAGAAA---TTTCCAACAT-------AAATTCGA--AA--TATTTGC--A--TA-GATCATAT----CTCAGCGAATA---TTTAAG-AA---AATT-------AG--TAAAT-A-TGTTTAT-----A--AA-ATA-------ACAAA---ATGAA-T--GGTCTAA-ACA-----ATATAATGT-AATCAGCA----TCGCGGTCA--GTGA--TGTGTTCCGAAATGACTACTTTGCAGTGCGAACTTTGGCTTCCA--------T----------------GAT--------GTT--------CG----AT-------------T-TTCGTGT-----TGG---CTATGCATCATGTC-ATGAGG-CAGGGTTTTGT------CACCTCTAG------------CTTGAAC--A------ACCAT-----AACAAAAGGGACACAGTAGAGC--AAAATA---------AA--A-G----------------GCC-------------ACCGATTGTTTGAGAAACGTCGTAAACGT--TCGAAACagctatgataatactacagtgttaatgtgtttatatcgattgaattggctcgctgctctcagaaatttccaacataaattcgaaatatttgcatagatcatatctcagcgaatatttaagaaaattagtaaatatgtttataaaataacaaaatgaatggtctaaacaatataatgtaatcagcatcgcggtcagtgatgtgttccgaaatgactactttgcagtgcgaactttggcttccatgatgttcgattttcgtgttggctatgcatcatgtcatgaggcagggttttgtcacctctagcttgaacaaccataacaaaagggacacagtagagcaaaataaaaggccaccgattgtttgagaaacgtcgtaaacgttcgaaactcttaacttcacgtgcaaggcgta
gi|20 : tactacaccttgcataactctgttttacgtcgctgcgaataacgctgattacgaagagaaatgtgtacgggccttatctcacctctgaatatgtttatacatattctgacatccaatgggctcaaatagttgtagctatgaCAGCA----CCGCGGTTA--ATGA--GATGTTCCAAACTGACTGTGTTGCAG----------------CGCAAACTACTGCTTTCAC--------AAT--------ACT--------CG----GT-------------T-TCC--GT-----TGG---CTATTCGTCATGCC-ATGCGG-CGGCGCTTCGT------TACCTTTAGCTTCTCGAGACACTTGAAA--T------GTCAA-----AACAAAACGGTCAAAATAGAAC--A----A---------AA--ACC-C-------------CACCCGTTTTGTTTAAtcttaacttcacgtgcaaggcgta
gi|21 : TATTCATCATGTC-ATGAGA-TAGGGCTTTAA------TTCCTTTGGCGTTCAGAAATACTTGAAC--A------ACCAA-----ACCAAAAGTGTCAAAGCAGTGA--A----AAAATAATTCAA--A-G-CAATGCAAAAAAAATGCCACTTTTGTTTGATATAAACTGTTACA-AAATGATGTAAACAT--TAGAAACgaaac
gi|22 : ATGA---TTTTAG-AC---AATC-------A--ATTATT-A-GGCATATTAATGA--AA-ATGATGGTAATTAAC---CTGAA-T--AGCTGAA-AAA-----AGTTA-TGT-AATCAGCA----TCATTATCA--ATGC--AACTTTCCAAGTTAA-TGC----CAG----------------C---------TA---------------GA---------ACTTTTGTTTCTG----GT-------------T-TTC--AT-----TGG---CTA---ATCGTGTC-ATAAGG-CAGAGCTATTT------TACCTGTGGTGTTtctaactttatatgcaaggcatagtt
gi|23 : aT------CACCGCTGACATTCGAGAACACTTAAAC--A------GTGAA-----AA---AAG--TCAATATAGAAA--A----A---------AAGGA-G-T-------------CGTCGATTTTGTTTGATTCTGAGCATTTGAGAAATGCCGTAAACGT--TCGA
gi|24 : ttacattcgctttcacgatacatgtttttaaGGGGCTATAT------TACCTCTCGTATTCTAAGACACTCAAAT--ACAAGTAGTCAA-----AAC-AAAGGGTCAGAGTAGTGC--AT---A---------AA--A-A-C-------------CGCTGATTTTGTTTGATACTGATTATTCAAGAAACATCAGAAACAT--TCAAAACtaatttgatttgatatgcaagatgtagt
gi|25 : atCGCCATTTCAA-ACAA--TGTTGATAATAAAGTGAACTAATTG---------TGTATGT-----------GACATTTTT-----A-C---T---C---T--CTG-AATTTG-----CTTCTTGTGAAT-TATGCCAT--G--CAACTCAT-CAATTCAGTTGTTAGGG--------TGTTTCCCTATTTAGCTGTCAAACtccaaactagatagaaaagcaagga
gi|26 : ttACCTATCGTGTTCTGGGATA---GACT--A------GACAACCCCTGACAAAAGGGTCAAAGAAGTTT--A----A---------AA--A-GGC-------------CCCCGATTGTGTTTGATACCTAGTGTTTAAGAAACCTCGTAAACGTTCTCGAAACag
gi|27 : ACGTCATTACAA-ATAA--TGTGGATTACAAAGGGAATT----A---------TGTACGT-----------GTC----TT-----ATCTCAT---C---T--CTGAAATTTT-----TTT-TTACATAT-ACTGACAC--C--CGATTGGA-CCATTTAGTTGtgtcttactttatatgcaagg
gi|28 : actacgttttgcataacaaaactgttttGTCATTTTGT-ACAA--CGCTGATAATGAAGGGAATT----A---------TGTACGT-----------GAT----CT-----ATC---T---C---TCCCCG-AGCCTG---------TTACATAT-TCTGACAC--G--TGATTAAC-AAAGTCAGTTGTTAGACCGTTCCCACGTTCCCCTATTCAGCTGCCAAAgacc
gi|29 : ttAT--------ATC--------TG----GT-------------T-TCA--TT-----TGG---CTATTCATCATGTCAGT-------GGGCTTTATTGGGACTACCTCTAG
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gi|4 : TCATTTCAC-ACAA--TGCCGATGATGATGGAAACT----G---------TGAAAGT-----------GGC----TT-----ATC---T---CGTCT--CTG-GATGTG-----T-----ACACAT-TCTGACCC--A--TAATTGGC-TTGTTCAGTACTTTGTT--------CATTCCCTTAATGAGCTGTCAAGCCTGTCA----------------ATCAGTA--ATAA-T-ATCATGA--------CAGTGA--A--TGTT----TGT------ATATACTGATTGATTTGACTC--------GCTGTTCTCAGAAA---TTTGTAACAT-------AAACTCGA--AA-AGATT--CCAA--AA-AATCa
gi|4 : tacaatgccttgtataacaaattaaagaaactctgttttata-----A--AA-AA--------TCAAA---CTGTA-TTTA-CTAAA-ATA-----TTTTAATGT-AATCAGAA----CGGTGATCA--ATGA--AACCTTCCAAAAAGGTTGTTTGACAG----------------CA--------TGAACTTCTGGGTTCAGGAT--------ACC--------CA----GT-------------T-TCC--AT-----TGG---CTGTTCATCTTGTT-GTGAGG-TGGAGCTTTAT------TGCCTCTA-TATTCGGACACACTTAAATTAA------GTCAA-----AACaaactgtatttactaaaatattttaatgtaatcagaacggtgatcaatgaaaccttccaaaaaggttgtttgacagcatgaacttctgggttcaggatacccagtttccattggctgttcatcttgttgtgaggtggagctttattgcctctatattcggacacacttaaattaagtcaaaactagtgacaaacaa
gi|5 : tacaatgccttgtataacaaattaaagaaactctgttttatatcatttcacacaatgccgatgatgatggaaactgtgaaagtggcttatctcgtctctggatgtgtacacattctgacccataattggcttgttcagtactttgttcattcccttaatgagctgtcaagcctgtcaatcagtaataatatcatgacagtgaatgtttgtatatactgattgatttgactcgctgttctcagaaatttgtaacataaactcgaaaagattccaACTTCATTTCAA-ACAA--TACTGATGACAAAGGGAAA-----G---------TGTACGT-----------TAC----TT-----ATCACAT---C---T--TCA-TGTTAA-----TTT-TTA-ATAT-TCTGACAT--G--CA--------GATTTGGTTGTTTGTC--------CATTCCCC-ATTtagtgacaaacaa
gi|5 : ataaataagcaggaattcgctttttagaatgaagttaaaatgtcaacaaaatgtaattaaaagatatactacaccttgggcaagatgtacagaaactctgttttATCAATTAGGATC--------CCTGTTCCCAGACA---TGTGCAACAT-------AAACTC-A--AA-AGATT--C--C--AATGATTAAAT----CTTAGCAATGG---TC-----AA---A--T-------A-----ATT-A-GGAATAT-----A--GATAT------------A---TTGAA-T--AGCTGAT-TTA-----ATTGAATGT-AATCAGCC----AGGAGGCTA--ATGA--AACCTTCCAAAAtgtatgccaatcattacgattggcatacaaatggggaatggacaaacaaccaaattgtagtacttccccagcgcatcaattaggatccctgttcccagacatgtgcaacataaactcaaaagattccaatgattaaatcttagcaatggtcaaataattaggaatatagatatattgaatagctgatttaattgaatgtaatcagccaggaggctaatgaaaccttccaaaa
gi|6 : ataaataagcaggaattcgctttttagaatgaagttaaaatgtcaacaaaatgtaattaaaagatatactacaccttgggcaagatgtacagaaactctgttttacttcatttcaaacaatactgatgacaaagggaaagtgtacgttacttatcacatcttcatgttaatttttaatattctgacatgcagatttggttgtttgtccattccccatttgtatgccaatcattacgattggcatacaaatggggaatggacaaacaaccaaattgtagtacttccccagcgcTGT-CATCAGCA----CCGCGACCA--AAGA--GGCGTTCCAAAATGACTGTCTTGCAG--------------------------------------------AT--------GCT--------CG----GT-------------T-TAC--GT-----TAG---CTATCCATCATACT-ATGAGA-CGGTGCTTTGG------TACCTATGGCATTCGTAAACCCTTGGAC--A------ATCGA-----AACGAAAGGGTCAAAGAAGTACAGA----A---------AA--A-G-T-------------CACCGATTTTGTTTGTTATCGATTGTTTGAGAAACGTCGTAAATTT--TCGAAA
gi|7 : CGTTATTTCAA-ACAA--CGCTTGTGGTGAAGGGAAAT----GTGAACAATATGCACGT-----------GGC----AA-----ATC---TTAAC---T--CTG-AGTTTG-----CTT-T-------------CAC--G-------GGC-CTTTTC-TCTATTCAGC-----------TACCATATT----TGTC---TCTTTTG----------------GTAA-TA--GTAA-C-ACAGCG------------T-A-----TGTCTAAATAC------AT----TGATTGATTTTGTTT--------GCT----------A---T---AAACAT-------TACCTTTA--AT-GATTT--C--G--A---ATCATGT----CTCATCGAT-ATTTTTTTTG-AAATTAATTCATATCCAT-ATTACTGA-AGTTGGT-----G--GA-AT--------ACAAA---CTGAATT--AA--GAA-ATC-----ACCT-ATAT-AATCGGCA----CAGCGATCA--ATGaactaacttgaaatacaaggcgtaattttttgataaacatattttaaattgaagtatattttggcggcactgtgccaccgtagtaagcatccatgtgaagtctacttttaatttctcttttttctaaacctggtctggtaactactgagatttgaaacaggaaggttgaacacgacatttaatttttttttatcaaatttcgaaatttcgaaactgattttacatttgaa
gi|8 : acgttttgatgaaattacattctgtacattttatagcaagttgagaaactttgctttgTTTCAGGACAA--TGCTGA------AGGCAACT----G---------TTTACGT-------------C----TC-----ATG---T-------T--CTG-----T------TTT-TTACATAT--CTGACTG--G--TGATTGGA-TAATTTAATTGTCATGC--------CCTTCCCCTGTTCAGATTTTAAACCTGTCA----------------ATCC-TA--ATAA-TTGTAGTGAAAATGTTAC--T-ACAG--TGCC----TGT-------------GATTGATCTGGCTC--------ACTGTTACAATAAA---TGTACAACAT-------AAACTCGA--AA-AGATTA-T--A--AA-GATCGTATGTATCTAATCGATGA---TTTTAG-AA---AATT--------G-ATTATT-A-GGTATATA----A--AA-AA--------TAAAA---CAGAA-T--CAATGAA-ATA-----TTTTAATGC-AATCAACA----CCGCCGAAA--ATGA--AACCTTCtgccgcagcgagaatattctctttcat
gi|9 : tatactacgccttgcataatgagcttgagaaactttgttTTTCAA-ATAA--CGCTGACGACCAAGGGAATT----G---------TGTACGT-----------TAA----TT-----ATC---TTCTC---T--CTG-AGTTTG-----TTT-TTACATAT-TCTGACAT--C--CCATTGGC-GGATTCATTTATTTGAC--------CGTTCTCC-AT-----TGT-----TTGTT-------------------------------T-ATATCGA--------C--T-G--A--T-TT----T-------------------GATTT-------------GCTGCTCCCAGAAG---GTTCTAACAC-------GAACTCAA--AATAAGTT--C--A--AA-GATCGTAT----CTCAGTGATAA---TTTTAG-AA---AATT-------AA-GCT-TT-A-TGTTTAT-----AACAA-ATA-------TCAAAT--CCTAA-T--AGCTGAA-ATA-----
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