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Reference ( gi|1 ) : ATCTTCCCAGATTCACTGGTCATCTATGGTTATTGGTACCGGGTACGGTAATCTTCCCAGATTCACTGGTAATCTATGGTTAGTGGTACGGTCATCTTCCCAGATTCACTGGTAATTTATGGTCAGTTGTACGGAAATGGAATAGTTCTAGTGGCAGAATACTTGGTAGAATTTTCAAATATGGTTCTAGTTGTAATTTTGGACTTAAT---A---CTGAAGT---------ACTT----AGATGA-CATACCAA-------TAGTGGCGAACTTGATCTGAGAGGTTTTGTTTCATCAGTTTTACTGTGTTTTTAAGATAA-ACGGTTTTCTGGTTG----ATCCAAATGTAATC---ATTAC-CG---GCATTGTCTCAAAT----ATTATTCGCGTCATT--TA-GACTT-TAAACTTTTTTT----TTAGAC-TTTA-ATAGTTTATTAGA-----GTGTCACATAT--AAAAGTTACATCAAAATAAGT-T-CAAGT--ATAT---GTAC-AT------TAAAACTTCTATATCAGGCCGT--TT--ATTTCGACCTACGAGACA-C-TAAAACA----TT----ATT---AT--CACTT-CATG------TT-AC----TATA----AAAAA--TCAACATACACAATATA-T--A-A----TTA---TACTATT----AT-----CAC-TGTGTCATATA-----TAC---------ATACAACA-A-CAACAAAAAATAAAAGAATATCA-----CAGAA----CATATTAATTTCAATCAAACATT-AGCTAT----AT-AA--AT--TAG------AAACAAGAA-------TTAAAATTAGCCCAGCCAATGTTAATCGCAATAAACGTTGCATTGTCATTTAAAA--AATAGCAATGCAATTTTTATCAT--AAAATCTCATTAAGATAATTATTATTACTTCTCTGATAATATGTATGTACATTGCAATAGGGCGTTGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCACCATGTTTTTTTTTCTATAATTTT-CAATAATATAGTA----TATA-----T--ATTGTTACATTAAGAATAAAATACCTTGAAAATTATGATACAATATTGTT---AATGCTCACTTTACAAATA-C--T--GTTGA-TGATTAAAAT-ATATTGACTCTATGTAGCATGTTTCCTTCTTTTGAAC-ATG--CTAAGTAAGATGTTTGCAAGACAAAA---TTGTATTGCATCACTGTTCATTTATATATTAAA-TTTATCACAGGAAGAGTGAACATTGAAATTTAAATT
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|7 : t----TTACAA-TTTT-ATACTTTTTTAGACTTGTGTGTCACATAT--AAAACTTAAATCAAAATAAAG-T-CCTGA--AAAG---GTAC-AA------TAAAA---CTATATCAGTCCG---TAAATCCAACCTACGAAAC--------ACA----TT----AT------------TTAC-A-T--AA---------------------TAT-T---TA------CA---TGCTGTT----AT------TAC-TATGTCGT---------------------AAGAATA--------TCACAG---AA---AT--TGAT---AATTACACACTCATCCAT----AT-AA--ATACTAT------ATACAAGAC-------ATAACACTAACCCAGCCAATATtacacttatacttaaaaaaaatac
gi|7 : aaCAATATAACTATCATTA---AAAATTTTTTTAAAGATTCTT-TTATCACATCGCTGATAATATGTATGTAC-TCGTACAT-TTGCGTTGA-------TAAGA----------AATGTCAGAT-TTGTAATGA--C--------CTGACTAACTATGGCTGCTCTACGGTTTTTTTTTTA-ATTTTTCAATA--------------TA-----TCTTTTAACATTATGAAAAAAAAACAATTAAAAA-AATAACACAA-AT--ACAGTGTTGA----AC-AA-------TTGAAGTGAT------------AA---ATGTAGCAAGTT-CCTTCTTTTGAAC-ATAGTTTAAGTAAGGTGTTTACAAGAAAAAAAAATTGCATTGTATCACTGTTCATTAGAAAATT--AAGTTTAaactatcattaaaaatttttttaaagattcttttatcacatcgctgataatatgtatgtactcgtacatttgcgttgataagaaatgtcagatttgtaatgacctgactaactatggctgctctacggttttttttttaatttttcaatatatcttttaacattatgaaaaaaaaacaattaaaaaaataacacaaatacagtgttgaacaattgaagtgataaatgtagcaagttccttcttttgaacatagtttaagtaaggtgtttacaagaaaaaaaaattgcattgtatcactgttcattagaaaattaagtttaac
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|7 : t----TTACAA-TTTT-ATACTTTTTTAGACTTGTGTGTCACATAT--AAAACTTAAATCAAAATAAAG-T-CCTGA--AAAG---GTAC-AA------TAAAA---CTATATCAGTCCG---TAAATCCAACCTACGAAAC--------ACA----TT----AT------------TTAC-A-T--AA-----------------------TAT-------T---TA------CA---T----------------GCTGTT----AT----TAC-TATGTCGT------------------------------AAG-----AATA--------TCACAGAA-------ATTGAT---AATTACACACTCATCCATATAAATACTATATACAAGACATAACACTAACCCAGCCAATATtacacttatacttaaaaaaaatac
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gi|14 : AC-TTCA-ATATTTTATTATTGTGTCACATAT--AAAAGTTACA--AATATAA-T-A-C------ATAT---GTACAATCTTTCATAAAACTTCTATATCCGGCCGT--TTG-TTCGACCTACGAGACA-CTTAAGAC-----TTGAAAATT----CTTT-TGTTGACA-T--AACATAAAA-AAATTATATAAA--ATTT------AC---TAATAGTTTA---C----------------ACTTTTAAACATAAGATACTTATGCCATAAAGACATTTTTAATATATGGCAA--T-CAATA-----AAAAT--TAATAGAACAGAATTTTTATATTAA
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gi|20 : ACAATAATTAAAAATAGCCCAGCCAATGTTAATCACAATAAACGTTGCACTGTCATTTATGAAA--TAGTAATAACACTTTTATTATAAAAAAAATAATT-A-GATAATGTTTATTACTTTGCTTATAATATGTATGTACACTGCA-ATATGGCGTTGA-
gi|22 : aaatatatAGACTTT------AGAC-TTTA-ATAGTTTATTAGAGTGTCACATAT--AAAAGTTACATCAAAGTAAGT-C-CAAGT--ATAT---GTAC-AT------TAAAACTTCTATAACCGGCCAT--TTATTTCAACCTACGAGACA-C-TAAAACA----TT----ATTATCA
gi|23 : AATGCTCACTTTAC-AATTA-CTGTTGA--T---TAAGATATAATTAATCTATGTAGCATGTTACATACTTTTGAAC-ATG--CTAAGTAAGGTGTTTGCAAGACA--------------TACCACTCTGCA--GATATATTTAAAGTTTA
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gi|26 : TTTTTCTATAATTTTCAATAATATAGTA----TATAATTTATATTGTTACATAAAGAATAAAATACC-TTAAATATAATAATACAATATTGATCATGTTCACTTTAC-AAATA-CTGTTGA--Tcagaaaaaaaatgta
gi|27 : AAAATATATTGAATCTATGTAGCATGTTTCCTTCTTTTGAAA-ATG--CTAAGTAAGGTGTTTGCCAAACAAA
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gi|30 : AC-TACA-ATACTTTATTATAGTGTCACATAT--AAAAGTTACA--AATATAAtttatataaagctttgcgaaactattcgtaacgtaaatctgagtaaaacgtacaatctatcaaaaatgtatttcatcctcagttgtatgagtgtcacagtatttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttgcattaccatttctcatcagagcatctaaccattttgttttatcaatattttggaattttaattttgctcgctttaaacatacagtttcacagggtttctcaacaaaaatatagtcatttaagtcaaaagagttaaacagttttgttacatattttcccatggtttatttatattacaggagtgattatgaacatagtgcattattctgttagtgggtatgtttctcagtcggaaccataatctaacaacttccagtttttgtttaatttagctgaaaaccagcccatgtcccccttggtagcaacattagcagcatgtttacgtactccgagaaatagcctacaggctttaattaagtacggcttcaatttcac
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gi|5 : T-TAGACTTT------AGAC-TTTA-ATAGTTTATTAGAGTGTCACATAT--AAAAGTTACATCAAAGTAAGT-T-CAAGT--ATAT---GTAC-AT------TAAAACTTCTATATCCGACCAT--TTATTTCGACCTACGAGACA-C-TAAAACA----TT----ATTATCACTTCATGTTATTA-T--AA---AAAAATAAACATACACA--ACAT------AT---TA-----CAA---T----------------ACTATT----AT----CAC-TATGTCATATATACA--TTCAA-------CAAC-T----AA-----AATATAAGAATATCACAGAA----AATATTAATTTCAATCAAACA-TTAGCTATATAAAT--TAGAAACAAGAATTAAAATTAGCTCAGCCAATGTTAATCGCAATAAACGTTGCATTGTCATTAAAAAAAAATAGCAATGCAACTTTAATCAT--AAAATCTCATTAA-GATATTTATCATTACTTCTCTGATAATATGTATGTACATTGCA-ATAGGGCGTTGA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTTTTTTTTCTATAATTTTCAATAATATAGTA----TATA-----TATTGTTACATTAAGAATAAAATACC-TTAAAAATAATAATACAATATTGATAATGCTCACTTTAC-AAATA-CTGTTGA--TGATTAAAATATATTGAATCTATGTAGCACGTTTCCTTCTTTTGAAC-ATG--CTAAGTAAGATGTTTGGAAGACAAAA---TTGTATttcataaaaaagctttgggaaataattcgtaacgtaaatctgagtaaaacgtaaaatatatcaaaaaatgtatttcatcttcagttgtatgagtgtcacagtatttgcaaatacggtcattaacaggagtttcaggtctagttcaaatagcttatgggagatggcaacttctaaatttggataatataggacgttggtctctgctcatatttgatttaacataagtttctgttttaaaattaatcttatacaaccgatatgttctgagtttatttccattattttcattaccatttctcatcagagcatccaacaattttgttttatctatatcttgcgattttaattttgctcgctttaaacatacagttttacacggtttataaacaagaatacggtcatttaagtcaaaagcgttaaacagttttttacacatttttccagcgatttatttatattacaggagtagttatgaacatagtgcattattctattagtgggcatgtttctcagtcggcaccataatctaacaacttctagtttttgtttaatttcagctgaaaaccagcccatgtcccattggtagcaacattagcagcatgttaacttacttcgaaaagtagcctacaggctttattaagtacggcttcaattacacaat
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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