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Reference ( gi|1 ) : TGAT--CACC--T--TGT-----GTCCTTTGTC---CG-TCTGTGA-A----GTTT-T--GTT--GTCTGCAC-TCCAGCAC-CTGCATTTTTC-A--TAAG-GTCTTCACCAAACTTAG----GT--A---GTAGTTAT---AT---AACCA--TAAT--ATCTCGAACAA-A-T-T-TTAAACTGGACAAATCGG---ATA-ATTAA-AT-TAGGAGTTATG-GCCATTGAAAAATAAAAAAAAGCACTATT-AAAA--TTTTG-ACCTTTA----G----TGCA-CTC-TAGCAC---C-TGCATTTTTCATTTGATCCTCACCAAACT---------TAC--ACAAT--TGCTAT---ATAACCA--TAAT--ATCTCAGACA-ATTTTTTGAACTGGCCAATTTGGATAGTTAATGT--C----AG--TTATGGCCCTTGAAACA-TCAAA--AACTGCACTATTTGACTTTGTGTGCA-CTCTAGTGTCTGCATTTTCCATTTGATCCTCTCCAAACT---------TACA-C-AAT--A------GT-T---AT---AT---AACC--A--TTATATCTTGGACAAGTGTGT-GAA-CTGGCA--AAA-TTGG----A----TAA---T--T------A------GT----G------T------TG------TGGCCCTTGA--ATCA-TC--A---A-A---------A-T-T--G---TA-T------A---C-G----TG---T-GTGT-G--CTCT---TG-----CATTC-T-CAG-TT-TTCATTTGATATT--AATTAAACT------TA-TAC-AGTTGTT---AT---ATAACCAAA-A-TA--TCCCA-CACAAAT----TTTTGAACTGGCTAAAT----CAG-----TTCAT---TT-T---TGTCACAGTT-ATGGCCCTTGAATCATA-AAAAAATA-TGC--TATTTAATCTTATGTGTA---C--TCTAGCACTCACAG-TT--AT-C--TTT--TGA--TCTT-CAC-CAATCT---------TACA-CAGT--A------GTT---AT---AT---AACCA--TAATATCTTAGACAA--GTT-TTAG-AGCTGGCCAAA-TCAG----AT-AACTTTTGTTGTA-GTT-AAGGCACTTGAATTGTCAAA--AATTGC---ATTATTTG-AAGTTATGTGCA-TTCTAGCAC---C-TGCAGTTTTCATTTGATATTCACCAAACTTACACA--GTA--------GTAA----TATATCT-ATA-ATA------------TCTC-AACTGACCAA--ATTTGA------ATGTCTGAGGTA-TGG--CC-TTG-CATT-ATCGTCA---AA---T-G-CCTTC-TA--TAGCATTGTCTCCTCTGTTTGGGGTGAGCGTTTTAGGTACAATCTGGCCCTCTTGTTCAACTTTGTTTCTTGTCCACAAACAGGTAGT
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gi|2 : tcagagcaaaggtgagctattctgattacctgtgtctgtcgacgatctgAA--TTTT-----TTTATTATG----TGCA-CTC-TAGCAC---T-TGCATTTTTCATTGTTTCTTCACTAAACT---------TAT--ATAGT--AGTTAT---ATAACCA--TGAA--ATCTCGGACA-AGTTCTTGAACTGGCCAAATCGGATTATTGATGT--CAA--AA--TTATTGCCCTTGAAACA-TTAAA--AATT-CACTATTTAACATTGTGTGCA-CTCTAGCACCCGCAGTTTTCATTTGATCCTTACCAAACT---------TGCC-C-AGT--A------GT------T---AT---AACC--A--TTATATCTCGGACAATTTCTT-GAA-CTGGCC--AAA-TCAG----A----TTT---T--T------A------AT----G------T------CGGAGTTATGGCCCTTGA--AACA-TT--A---A-A---------A-A-T--GCACTA-T------T---C-GACCTTG---T-GTAC-A--CTCT---AG-----AACAC-G-CAC-TT-TTCATTTGATCCT--CACCATACT------TG-CAC-AGTAGTT---AT---ATAACCATT-A-TA--T-CTA-GTCATAT----TCTTGAGCTGGCCAAAT----GGG-----AATATAAATT-------TCAGAGGT-ATGGCTCTTGAAACTTT-AAAAAATG-CAC--TATTTTACCTTGTGTGCA---C--TCTAGCcaatggtataaaatgatgctaaatatttaaacaaacatttaatggtattgt
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gi|7 : ttctgatcgcctgttgtccgtgatccggtacattttgttgtgttgt----G----TACG-CTC-TAGCAC---C-CGCATTTTTCAATTGATGCTCACCAAACT---------TGT--ACAGT--AGTTAT---ATAACCA--TAAT--ATCTCAGACA-AGTGTTTGAACTAGCCAAATCGGATTATTAATAT--C----AAATTTGTGATCCTTGGAACA-TTAGA--AAATGCAATATTTGACCTTGTTTACA-GTCGAGCACCTGCAccaaatttaaatgcattaagtattggcccttgcattatcaaaaattgccttctttggcaatgtctccattgtcacaggtcagcgcattagggccaatgtggcccttttgttg
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gi|6 : cattgatta----AA--TTATGACCCTTGAATTG-TCAAT--AATTACATTA---GA----ATGTATA-CTCTAGCAACCGTAGTTTTCAGTTGATCTTCACCAAAGC---------TACA-C-AAT--A------TT-T---ATTTGAT---AATG--A--TTATATTTCATACACATTCTT-GAA-CTTGCC--AAA-TTAA----A----TCA---T--T------T------AT----GTATGGTT------TA------CGGCCCTTTA--ATTG-TC--A---C-AT--------A-G-T--GCCCTA-T------C---T-GACCTTA---T-GTGCAG--CTCC---AG-----CAACC-G-TAT-TT-TTCACTGGATATT--TACTAAACT------T
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gi|5 : ttttagctcacctgagcaaaactcaaggtgtgctattctgattgcctattgtccgtcatccatcgtccttctgtgaactttACTTTTT---CA-CTTTAGCATCCACATTTTTCATTGGATCTTTAACAAACTAATGAATAGTAC--C-AGT--A------GT-TTATAT---AT---GACC--A--CAATATCTCAGACAAAT-TCT-AAAACTGGCC--ACA-TTGG----G----TAA---A--T------A------AT----G------TCAGATTTA------TGGCCTTTGA--ATTG-TC--A---A-AT--------A-T-T--GCTTTA-T------A---T-GATATTG---T-GTGC-G--CGCT---AG-----CGTCC----AG-TT-TTCATTTTATCTTCGCAT--AACT------TA-CAC-AGTAGTT---AT---ATAACCATA-T-TA--TCaatgcaatatttgaccttgtttacagtcgagcacctgcaaaaattgccatctaaggcattgtctcctcagccacaggtgagcgatttagggccattgtgaccctcttgttatgtatacaccaacataagaagatcactatattagatagataatgattcttcataat
gi|2 : ttctattttctcatcccattttttcaataacattttctgctcacccgagtaaagctcatgacgagatattctgattccctgctgtccgtcgtccgtaaTTATGTGCA-CTCTAGCACTTGCATTTTTCATTGTTTCTTCACTAAACT---------TATA-T-AGT--A------GT-T---AT---AT---AACC--A--TGAAATCTCGGACAAGTTCTT-GAA-CTGGCC--AAA-TCGG----A----TTA---T--T------G------AT----GTCAAAAT------TA------TTGCCCTTGA--AACA-TTA-A---A-A---------A-T-TCAC---TA-TTTA---A---C-AT---TG---T-GTGC-A--CTCT---AG-----CACCC-G-CAG-TT-TTCATTTGATCCT--TACCAAACT------TG-CCC-AGTAGT-----T---ATAACCATT-A-TA--TCTCG-GACAATT----TCTTGAACTGGCCAAAT----CAG--------AT---TT-TTAATGTCGGAGTT-ATGGCCCTTGAAACAT--TAAAAATG-CAC--TATTCGACCTTGTGTACA---C--TCTAGAACACGCAC-TT--TT-C--ATT--TGA--TCCT-CAC-CATACT---------TGCA-CAGT--A------GTT---AT---AT---AACCA--TTATATC-TAGTCAT--ATT-CTTG-AGCTGGCCAAA-TGGGAAT-AT-AAATTTCA--G-A-GGT-ATGGCTCTTGAAACTTTAAA--AAATGC---ACTATTTT-ACCTTGTGTGCA-CTCTAGCTG---C-TGCCTTTTTttgtgagcactctagcacagttttcatttgattttaccaaattaacacagtacatgtagttatattataagcaagatctcttatatgatatcttaaactggtcaaattagtaaaataatgttggagtccttgaataatcacatttgaccttgtgtgcacttgtagcacagtcatgcagttttctttgatcttcatcaaactcttacaattgttgtataagtataataggttggacacattttgaactggccaaatttgataatgaatgttggcattattgtccttgaagcattgtgccagtctgg
gi|4 : aaatgccattatgatatcctaccacttacatttatttatttgaaacttatacagtgattatataaccatatgatccttaacaacttcctaaactgaccgaattgtactattaatgtccaagtgtttgccatttaatcttgtctctctgtgctctccagcttcagcagcatttatggtatctttatttgactttaaagcatgtatataatcataaaatattggacaactttacataaacatcaataaataacaatacaaatggattgcagtggaggataatagtttactgatgttcctctcatttgaaagtttaaaatacatagatggccttctgatttctattgaacattactattttactcaaatgtgtacctgtttgtaatattaatatttcacatagaaaatgtatttatctgatcacctgtagttggtcatctgtcagtcgtccgtgaatttttttaTTGTGTGCA-CTCTAGCACCCACATTTTTCATTGTATCTTCACCAAACT---------TATA-T-AGT--A------GT-T---AT---AT---AACC--A--CAATATCTCGGACAAGTTCTT-GAA-CTGGCC--AAA-TTGG----A----CAA---T--T------A------AT----G------TTAGATCTA------TGGCCCTTGA--AACA-TCA-A---A-A---------A-T-T--G---CATT------A---T-T----TGAC-A-GGGT-G---------TG-----CACTC-T-----TT-TTTATTTGATTCT--CACCAAAGT------TA-CAC-AATAGTT---AA---ATAACCACA-A-TA--TCTCT-TTCAAGT----TATTGAACTGGCCAAAT----CGG-----ATAAT---TA-A---CACCAGAGTT-GTTGTTCTTGAACCTTC-AGAAAATG-TGT--TATTTGA-CT--TGAGCA---C--TCAAGAATCTGCAT-TT--TT-C--ATT--TGA--TTTT-CAC-CAA-------------AC----------------TT---GT---AT---AACCA--TATTATCTTGGACAATCTTT-TTAA-A--TAGCCAAATTTTT----AT-AATTAATGTTGGA-GTT-ATGTCCGTTTAATTGTCAAA--AAATGT---GTAAATTG-ATGTAATGTGAA-CTTTAGCAC---A-TGCAGTTTTCATTTTATATTCACCAAA-TTACATA--GAA--------GT------TAC----------------------------------ACCAA--ATTTAA------ATGCATTAAGTATTGGC-CC-TTG-CATT-ATCAAAA---AT---T-G-CCTTC-TT--TGGCAATGTCTCCATTGTCACAGGTCAGCGCATTAGGGCCAATGTGGCCCTTTTGTTagctcgtagaatag
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gi|33 : tcagagcaaaggtgagctattctgattacc------TGACCCTTGA--ATTA-TC--A---A-A---------A-ataataaatcaatggtataaaatgatgctaaatatttaaacaaacatttaatggtattgt
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gi|5 : ttttagctcacctgagcaaaactcaaggtgtgctattctgattgcctattgtccgtcatccatcgtccttctgtgaacttttttgt--CTTT---AG-----CATCC-A-CAT-TT-TTCATTGGATCTT--TAACAAACTAATGAATAGTACCAGTAGTTTATAT---ATGACCACA-A-TA--TCTCA-GACAAAT----TCTAAAACTGGCCACAT----TGG-----GTAAA---TA-A---TGTCAGATTT-ATGGCCTTTGAATTGT----CAAATATTGCTTTATATGATATTGTGTGCG---C--GCTAGCG-TC-CAG-TT--TT-C--ATT--TTA--TCTT-CGCATAA-CT---------TACA-CAGT--A------GTT---AT---AT---AACCA--TATTATCTTaaaattgccatctaaggcattgtctcctcagccacaggtgagcgatttagggccattgtgaccctcttgttatgtatacaccaacataagaagatcactatattagatagataatgattcttcataat
gi|37 : ttctattttctcatcccattttttcaataacattttctgctcacccgagtaaagctcatgacgagatattctgattccctgctgtccgtcgtccgtaaactttttcaT---AT---ATAACCAGA-A-TT--TCTCT-CAGAAGT----TCTTAACCTGGTCAAAT----gtgagcactctagcacagttttcatttgattttaccaaattaacacagtacatgtagttatattataagcaagatctcttatatgatatcttaaactggtcaaattagtaaaataatgttggagtccttgaataatcacatttgaccttgtgtgcacttgtagcacagtcatgcagttttctttgatcttcatcaaactcttacaattgttgtataagtataataggttggacacattttgaactggccaaatttgataatgaatgttggcattattgtccttgaagcattgtgccagtctgg
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