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gi|17 : taatgtgacagcgtttactctgcgggtatggtaccgactacttctgcatcgaccggcgctgaacacattgcaacccacgttccacgatacaatgatgaggacgagaagcagttggaatttctcctctgaaattttcaggggataacgaataaacttacagcaagttctttttgaattttgttaataaatgttgacagaaacgtggatctcaaatattgcaaacattgacattgagaactttgatttttttttcatgcccaataccaaaatcaaaccgtaaagttaaaaggtacagtggatgtgttataattaatctcactaagaaatcttctaatgatatctaacttgctaattttaataataagggtattgtatggtttaaattagattgatgatcttatttcggaacggataatgatctgtatttctgtccatgctatattccaccagaggactctaatgactataaaagctctatttctcctcttaatgagttttatatttttcgaccagttacatattgatatcagtagatataataattaaggtgaggtttacttcacgggtgatctgaatgccagaacaggtaaacggtcagactcggttgatgacatctctagataatatttgTT-TGGCAACAAGCTCTT--AAATC--TCTGTAA-AGA----AA---ATAGCCTAGC-TATAGTGAACGGTCGCCTTGAGTAAGTT-AA----ATTT-ACCTG----C-TTTAATTTGATCAGAAACCG---C---G-----TCAAGTGTTGTGGATTATTTAATTACTGAGT-TGAATAA-CTTTA------CAAGTTTAT--C---GA------------ATAT-GAATGTACTGGATCTAAATGAAT-------TTTCAGATAATTGTCAGA-TAGAGTTTTCG------ATTGTTG------TGA----TA---AAATAAT-ATTATATA---AAACTGATAATTTAACGT-A---------TGATAAAATCATTTGGAAC-G-ATTCAGATTTAAATGATTTTAACAATT-CATTGCA---TGAAAATAAACATATATT------T---------GAGG---ATATTTGTGATAA-ATTATTACAAA-----AC--------GA-AATT----GA--TAT-TA-----ACACATG--TGT-TAATAA--TTTATCTAATATTATATATGATATTT-CTTTTAAATAAATGGGAG---AA-CATTTAAA------A----T---TAATTCAAAA-----TAT--AAA---TC---A--AAAAA--TCACAAT---GGTTTAATGAAACTTGTTGAAAT--GCC-AAAAAACAATTTCTAAATGATTAAAGGGTCTGTA----A---A----TTTAA-TCAAA-ATTTAATCAAAATGAAGA-AATA--GATTATTATTTTTGAAA--AGTAGAAGGGTA---TTCTGC-AATGCA-AAAAGAGTAGC-AAAATaactctgaaccacaggtgtttcaaaacatactaaaggagcgaaagtacttatctgatgaaatatcccagaagtttataacacatagtattgaaattaactcatgtatagaacatttttctgatttagtatataatatttcttttagaacgaatcgacgaacctttaatagaagcccgaaatatgattctattaaaaaggcatattggcttaatgatgaatgtaaaattattaaaactttttaacaataagagactatataaaatggatcctacggaagataataggttttatttattaactagaagaaatgattttgagaaagcaaagagaaaaggaaaatatgtttattttaaaaaaagataaaaacaaatttgtccaaatcaagtaaaagcaatacatgcaaattttgataatgtattaaaaaatatcgaacgaaaaaacttaaaagtattcggatgttaatttgaatgaatttttccagcattaaaaaaatctttcaaatacagctcatagccagttcaatccagctgaggatataaatacagactgagaatcgttggttggatatagatggactggcttgttcttttactattgctgaaataaaatatactatttcttcaatgaaacggcataaaag
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gi|22 : atttcccgggtcagccgtaaaccttgacacaggcatggttttagacgattatgttattacaaattttaacaattttccatataccggtataaata---GGAAATA-AGCACGTC---GA----------TAACGA-TTTT---AT-TGATGAATTTGTCTGGGAT-GCATCTGGGGCCGAA-GAACTAAATATTT-TACTTCGATC------TTAAAGT---TT------T---------AAAG---AGGTTACAAACAACATCAATG-AAA-----AG--------AA-A-------TAAGTAT-CA-----TTGGATGACAGCAAAATAAATTCCA-CAGA---AATAAACGATACATCCTTTACA--TATTTGAAAAGTAGTCTTTGAAA------TA-AGGA--CAA-GGTAAA-----TGT--ACG---AA---A--CAGAAGTCAG-TTT---GCGTTAACGAGACATGTTGAAAACCGCA-AAAA---CATTTcaactctgacccacaggtgtttcaaaacatattagaggaacgaaagtacttatttgatgaaatatcccagaagttgatatcaaacagcattgatgttaactcgtgtatagagattttttctgaattagtatataacatttcttttaagacgtacggacgtacttttaatagcagcccgaaacgtaagcttattaaaaaaacatcttggtttaatgatgaatgtaaaaatcttaaaactttattttataacaataagagactttataaaatggatcctactgaagataatagatttcgtttactaactagtagaaatgattttgcgaaagcaaagagaaaagcaaaatatgtttattttaaaaaagaaaaaaaaaatttgtcaaaattaagtaaaagcaatacacgtaaattttggaaatatattaaaaaatatcaaacgacaaaaggtaaaaaatattctgatattaatttgaattaattttttcgagcattttaaaaatacagcttatagccattttaacccagatgatgatataaatatagacagagaatctttggatat
gi|18 : ttgttcatatctccatcaagttggtttagaaagGTTACTGACAACATGACTG-AAA-----AT--------AA-A-------GA--T-T-CA-----ATAAATGACAGTATAATAAATTTTA-CAAATATAATATACGATACAT-TTTCCCATGTATTTGGAA---AATTCTTCAAA------AA-AGG---TAGTGTTAAG-----TGT--AAG---AA---A--AAGAAGGCCG-AAT---GGTTTAACGAAAATTGTAGGAAA--GCT-ATAACGGCATTTCT------TAA------TTCCAAAATA---A----TTT-T-TCAAAGA---AATCGAACTGAAAAGAACAAGAAGCATT-TTCTTG-AA--AGTAAA----TCTGCTTTTGCTAAAACT-AAAAGAAATGC-TAAATATGCGTTTTATTC---GAGAG-A--AAAAATGAACCTA-----ACTAAACTTAGTTAAA--AA-TGTCC-AAGAAA------ATTT------AGAGATTATC--A-----------------------AATAGC---CA--------------AAATA--------------TGGAGGAATTTGTAC-AGTACTTTACATATAT--CTCGAATACACCT------CTTG------TTAAGCTAAACTTTGGTGATATGAACTATCATAACAATATTGATAATAACAATCATGGCATAAATATAAATGATGAACATGTTAATAGACAACAGGTAAATTTAGAACTTTTAGAT-AAAAACTTTAAGGAGTCAGAAATAAGTaaatgtgattgtgctgaaatagaaaagaatacaaatagaattttatttagaagaaa
gi|9 : AAA-----CGT--AAGCTTAT---T--AAAAAGGC----ATCTTGGTTTAATGATGAATGTAA-AAA--TCTTAAAACTTTATTTTA------TAA------CAATA----A---AAGATTTT-T-TAAAATG---GATCCTACGGAAGATAATAGATTTCGTT-TACT---AACTAGTAGA----AATGATTTTGCGAAAGCA-AAGAGAAAAGC-AAAATATG---TTTATTT---TAAAAAAGTAAAAACAAATTTG-----TCAAAATTAAGAAAAAGCAA-TAT---ACGCAA------ATTTTGGA-AATATATTAAA--AAAT-------ATC--AAACGA--AAAAAA---AA--------TTC-T--GATA-TT-------AATTTGAATGAATTTTTCG-AGCATTTTAAAAATCT--CTCAAATACAGCT------CATAGCCATTTTAACCCAGA---TGATGATATAAAcacccagatgtgacgaaggtttagcagattttttcatagacgcaaaaactttta
gi|14 : catacttctgtttacagaaacgtggaactaaaaaaaatgcaaacgttgacatgcccaagacctaaatcaaaccgtaaagctaaaaggtatagtggaggtgttataatttattataataggaatatgcttataagattgaacttgttaatttaaatgataagggtattgtatggtctaaattaaatacatcttatttcggaacggacactgatctgtatttctgtacgtgctatattccaccagaggattcaaaggtctataaaagtgctatttctcctttttatgaatttgattttttcgaccaattaaatatcgatattagttggcatagtaatctaggtgatgtttacgtcacaggtgatctgaatgccagaacaggtaaaaggtcagacacggttgataacataaaccttcaacggtatgttaatattccacagagcgacattcacgtgcaagatatcccttcacggtcatctcccgatactatttgtaatagctttgggaacaaattattaagcctttttaaagaaaacggactaagtattgttaacggccgccttgaagaacgtaattttacgtgtcataatttaaatcgtaacagggtagctgcaagtgctgtcgattatgttattacaaattttaacaattttccatgtataaaaaatataaacgtttttgacttgaccaagttctcagaccattgtcctatccatttttcactaaatttcgataatttacagatgtataaaactgataatttaacttatgaaaaaatagtatgggacaactctgacctacaggtgtttcaaaacatattagaggaacaaaaatatttatttgatgaaatatcccaggagttgatatcaaacagcattgctattaactttcatttcattaattctgatttagtatacaacatttcttttaagacgaacggacgtacttttaatagcagcccgT---GGTTTAATGATGAATGTAA-AAA--TCTTAAAACTTTATTTTA------TAA------CAATA----AGAGA----CTT-TATAAAATG---GATCCTACTGAAGATAATAGATTTCGTT-TACT---AACTAGTAGA----AATGATTTTGCGAAAGCA-AAGAGAAAAGC-AAAATATG---TTTATTTTAAAAAAGAA--AAAAA-AAATTTG-----TCAAAATTAAGTAAAAGCAA-TAC---ACGTAA------ATTTTGGA-AATATATTAAA--AAAT-------ATC--AAACG----ACAAA----AGG-------TA-AAAAATATTCTGATATTAATTTGAATTAATTTTTTCGAGCATTTTAAAAATACAGCTT--ATA-GC--------CATT------TTAACCCAGA---TGATGATATAAAtatagacagagaatctttgggtatagctgaactggattgttct
gi|19 : atttcccgggtcagccgtaaaccttgacacaggcatggttttagacgattatgttattacaaattttaacaattttccatataccggtataaataatataaacgtatttgacttgaccgagttttcagaccattgtcctatccatttttcaataaatttcgataacttacagatgtataaaactgataatttaacttatgaaaaaatagtatgggacaactctgacccacaggtgtttcaaaacatattagaggaacgaaagtacttatttgatgaaatatcccagaagttgatatcaaacagcattgatgttaactcgtgtatagagattttttctgaattagtatataacatttcttttaagacgtacggacgtacttttaatagcagcccgaaacgtaagcttattaaaaaaacatct--AGTAGA----AATGATTATGCGAAAGCA-AAGAGAAAAGC-AAAATATG---TCTATTTTAAAAAAGAA--A-AAACAAATTTG-----TCAAAATTAAGTAAAAGTAA-TAC---ACGTAA------ATTTTGAA-AATATATTAAA--AAAT-------ATC--AAATG---AAAAAA---AAGGTAAAAATTATTCTGATA-TT-------AATTTGAATGAATTTTTCG-AGCATTTTAAAAATCT--CTCAAAAACAGCTTATAGCCATT------TTAACCTAGATT---ATGATATAAAtatagacagagaatctttggatat
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gi|10 : gttactgacaacatgactgaaaataaagattcaataaatgacagtataataaattttacaaatataatatacgatacattttcccatgtatttggaaaattcttcaaaaaaggtagtgttaagtgtaagaaaaagaaggccgaatggtttaacgaaaattgtaggaaagctataacggcatttcttaattccaaaataatttttcaaagaaatcgA--AAAAATGAACCTA-----GC-----------AAA--AA-TGCCC-AAGAAA------ATTCTGGA-AAAAAATTAAC--AATT----TTAAT---AAACGT--AATAAA---CAGG----GGTTA-TCAAATA-GCCCA----AATATGGAGGGATTTGTAC-AACACTTCACAGATAT--CTCGAATACACCT------CATG------TTAACCTATACTTTGATGATATGAACGATGATAACAATATTGATAATAACAAACATGGCATAAGTATGACTGATGAATATGTTAATAGACAACAGGTCAATATAGAATGTTTAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTC--AAATAAGTCAGGTGTTAACATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGACGTGACG
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9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TGAATGATCAATCCATGAATCAAGTGATCTTAAAAAAACCAGAATCCATTGAATGTAGTCAACGGTCGATTGATTATAGACTAAACAAGCTGGACACAATAGAAAGTCAGGTCACGTTATTGTCACAGAAATTCACCCAATTAGACTGCCGCATATCATCACTAGAATCAAAAGTGCACAATTCAGCTGCTAAAATGTTAGAAATAGAAACAAGTCGTAATTATGACAGTTGAAGTTGTGATGAATTGAGGGTAAAACAATTAGACCTAGATATGCAACTTAAAACTGAAAAATTACACAATACGCGATTAGCAGCGAGGCTAGATGGCATAACACGAGATAACAGTCAGTTGAACGAATCTCTTCTCGATATTCAGTCCCGCACAATGCGTGACAATCTATTGTTTTTCAATATTGAAGAGTGTGCACGTGATGCTGATCGCAAGGAAGAAAACTGTACCGACAAAATTCTAGGCTGTTGTGAAGATACACTCCAAATTCAGGACGCGCGCACGCTGGTGAAAATTGATCGTGCCCACAGAATCGGAAAATACGATACAGGGAAAAAGCGTCCGATTGTTGTGAAATTTAACTACTTCTGGGATAAAATTAACATAAAGCAGGCAGTCCAAGATAAATCGGAAACCACGGAAATTCGTGTGGGGGACCAGTACCATAAACCTATTTAGGAACGTCGCAAAAAACTTATCCCTATGCTGAAAAGAGCAAAAGAAGAAAATAAACGTGCAGTCTTAACGTATGATAAATTATACATTAACGGTCGAGTTTACACTGCGGACATGGTACCGACAACATTTGCACCTACCGGCGCAGAACCCATGGCTACCCATGCTCCATCATACTAGGATGAGGATGAGAAGCAGTTGAAATTTCTCCTCTGGAATGTCCAGGGGATTAGAAACAAACTTATGGACAGTGATTTCTTGAATTTTGTGAAT
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Unaligned ( gi|20 ): AAAAACCAGATTGATTTGATGATACCTGTAGGACTATTAAAACTCAATTTTATAATGATAAAAGAAATTATAAAAACAATCCATCAGAAACGAAATTCAATATAATACGTTTTATAAATAGTAGGAGTATGTTCTCTATAGCAAAGCGGAAAGCAAACAATTATTTTACCAAAAACACATATAACCTTTTTGGAAATATATAAAAAAAATACAATTCGCAAAAATTTACAAATACCTCTTGGATAAATGTAAACGATTTTTTCGAACACTTTCGATCATTATCGAATACACCACCCAACAAGTTCGTACCAGACACTGATGATAATAAGAGACAAGAGTCAATAAATATTGAAGAACTTGATTTCCCTTTTACTATATCTGAAATATCAAACACTATTTCATCTATAAAACGACATAAAA
Unaligned ( gi|21 ): CAGGGACAAAAGACAACCCCTTGTAAATTTAATCATTTTCACGACAAACAACACATAAAACAGGATGCGTTTGATCTATTGAAAGATCATATGGTATTTCCGCATCGGAGATCAGTTCCCAAAGGCAATCCAAAACAAGAGGAAGCAACTCGTCTTGACCCAAGGTTATAAAAGCTATTAAAGAAGGACGGTAAAAAAGCCTTGCTTTCTTATGACAAACTTTACATAAACATGGACACCGTGTCACGTGCCAACTATTTATGTGATTAGGACTACATACAGAAACAGTTAACGTTTCTTCTCTGGAATATATGGGTAATTAATTCGAAGCTAAATGGTAGTGATTTTATATCTACCTATGATGTATCGATATTAATAGAAACATGGAATTCAAAAGTTTCGATTGTACA
Unaligned ( gi|25 ): TGATATTAACTCGTGTATAGAGAATTTTTCTGAAATAGTATATAACATTTCTTTTAAGACGAACGGACGCACTTTTAATAGCAGCTCAAAACGTAAGCTTATTAAAAAGGCATCTTGGTTTAATGATGAATGTAAAAATCTTAAAACTCTATTTTATAACAATAAGAGACTTTATAAAATGGATCCTACGGAAGATAATAGATTTCATTTACTAACTAGTAGAAATGATTTTGCGAAAG
Unaligned ( gi|27 ): TGATGATACCTGTAGAACTCTTAAAACTCATTTTTTTAATGATAAAAGAAATTATAAAAACAATCGATCAGAAACAAATAGATTACGTTTCATAAATAGTAGGATTATGTTCTCTAAAGCAAAACGGAAAGCAAAAAACAAATATTTTTCCAAAGAAAAATATAATCAAAATTAAGTAA
Unaligned ( gi|28 ): AAGATGAAAACTGTATAAACAAAATATAAGATTTCTGTGTGAAACTGGATATGCCAAATTTAAAGGAAGCCGTGAATATTGATCGTGCGTAAAGAGTAATGTCATAGAAAAACGACCTATTGTTGTGAAATTTAGTTTCCATCAGGATAAACTT
Unaligned ( gi|29 ): TTAACTCGCTGCAAAGAGAATAATATTGTTATTGGGCGCCTGGAAGAGGTCAATGTACGTTTTGATCTCTGTTTAGAAGTCGACCGATATCCATTACTGTTGATTATTGAATTACCAATTATGATAATTTTTGTTTTATATATGATATG
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-146 ) : ATGACAATGATTTCTTAAACTTNATTAATAANTATGACGT---GCTTTTGTTNACGGAAACGTGGANCTCTAAANATTG-CAAATGTAAACATTGA------TGGTTATGN-GTATTT--C--A--TGCCCAAGACCGAAAT-CAA-TAAACCGTAAAGCTAAAAGG---NATAGTGGGGGTGTTATAAT--ATATTATAA-AGA-AA---AC-TTACNAATTAATAT---TGAACTTGTTA----A----AAC-AATTTTAAAT------GGCATTGTATGGTTTAAANT-AGA--NA--C-GAATTT--CTTA----GGNACTGATAATGATCTT--TATTTCTGCGCGTGTTACATTCC--ACCNGA-G------GACTCTAATGTNTATAAAAATGCGC--NTTCNCCTCTATATGAATNTGA-T-TTTTTCGANCAGTTAAATAATGATATTATGT-A-NT-AT-AGTAC-TNTAGGCGATGTTTACNTCACCGGT--GATCTGAATNCTAGGACAGGTAAAAGGTCAGA--T-A--A--CTGAGAAC-AT-TAACCTTG-ANCGATATGTTAACATGCCTCNGGGCG--ATNNACC-A-AA-TGTGCA----ATCGNTANA--A--G--AAAG-TCAT---C---T---GATAA-ACAAGT--TAATANNTTTGGGAACAAATTG-TT-A-G-TC-TT--TGTA--A-AGAAAA--NAA-TTTGAT-TATTGTTAACGGNCGNCTTGAGGAAGGTAANTTTACGT----GTCAC-NGTTTG-AACAGNAACCGGACGGCGGCGAGTGTTGTCGATTATTTGATTACT-AG-C-CG-AATAATCTTAACAA---TAT--C---T--GT----T-------ATA-------TGA-ACGTNTTGGACT--------TAACCGAGTTTTCNGACCATTGTCCTATNCAGTTTTCG-T-TAAGTTG-TCG-ATAAC-T---GGATA-TA-ATAAAACNGATAATNTAACNTATTG--ANAAAATTGTNTGGGAT-GCATCTAGGG--CCGAG-GAATTGAATACTTTACTTCAAT-C-AAA-GTTCAAA-GT---TT------T---------AAAG---A---TGTTACTGACAACATGACTG-AAA-----A-T--------AA-A-------GA--T-T-CA-----ATAAATGACAGTATAATAAATTTTA-CAAATATAATATACGATACATCTTTCA-AATTATTTGGA----------A---AATCCTTCA-A-AAAAG---G-TAAT---GTTAAA-----TGTAAG---AA---A--AAGAA--GGCC-G-AAT---GGTTTAACGANAANTGTAGAAA--TGCTAAAACNNCATTTTTT-AACGATAAAAG--------ANTTT-NTNAAA--NGGATCNNACNGAA--GA----NAATAGGTNNCGTT-TNCTTGAACTAGTAGAANTG-AT-TTTGCNAAAGCAAAAAGAAAAGCA-AAATATGC--GTTTTATTC---GAAAGA------A----AAAAACG---AACCTANC--NAAAT-TAAGTAAAA-G-AATGCCCAAGAAAATTCTGGAAANANATTAACAA-------TTT-AA-T-A---AACGTAANAAA--C--AGG----GGTTA-TCAAATAGCCC------A-----AATNTGGATGAATTTNTNC-AGCACTTTACAGAT-AT--C--TCGAATACACCT------CAT-----G------TT-AAC-----CTAGACTTTGATGAT-ATGAACGATNATAACAATATTGATAATAACAATCATGGCATAAATATAAATGATGAACATGTTAATAGACAACAGGTCAATGTAGAATTTTTAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTCAGAAATAAGTCAGGTGATATCATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGATGTGACGAAGTTTTAGCAGA--TTTTTTCATAGACGCGAAAACTTTTATAAC
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gi|11 : agtttcagttgcccaagaccgaattgtaataaaaaagccaaacgggatagtgggggccttgtggtatgttataaacaaaacgtacagactcatatggaacataacaaaacaaatttaaatggcattatattgttgaaaatagacatgaatttcttaagtactaataatgatgtttatttctgtgtttgttacattcctccctaagaatctaatgtatataagaatgtacgttcatttttatatgaatatgacttttttgaacagttaaatgatgacattatgcattatagtactttaagcgaggtttattgcactggcgatctgaatagtagggtaggagagagattgatcgatttgttaccatgccttcgggcgatgaaccataatatataattgttaaaagaaagtcatttgataaacatgttaatatattttaaaataaattgttgttattgtgtaaagaacaaaatttgatcattgttaatgagaggcttgaggaaggaaactttacatatcactgtttgaacagaaaccggacggaggcaagtgttgtcgactacttgataactagcgcgaataataacaatatctgttttatgaatgtgttggatttaatgaacttttctggccattgtcctatatagtttgcattaagttgtcgcatgactggaaataatcatacagataacgtatatattgacaaaattgtttgggatgcatctagggccgagtaattgaatactttacttcaatcaaaagttcaaagttttatagatgttactgacaacatgactgaaaataaagattcaataaatgacagtataataaagtttacaaatataatatacgatacatctttcaaattatttggacaatccttgaaaaaaggtaatcttaaatatA--A--G--AAAG-TCAC---T---T---GATAA-ATAAGT--TAATATGTTTGGAAATAAATTG-TT---G-TC-AT--TATCTCA-AGAACA--AAA-TTTGAT-CATTGTTAATGGGC---TTCAGGAAGGAAAATTTACAT----ATCAC-TGTATG-AACAGAAACCGGACAGGGGCGAGTGTTGTGGACTACTTGATAACT-AG-CGCG-AATAATCATAACAC---TAT--C---T--GT----T-------ATA-------TGA-ATGTGTTGGATT--------TAATGGAGTTTTCTGACCATAGTCCTATACAGTTTGCA-T-TAAGTTG-TCGCATGAC-T---GGATA-TA-ATCATACAGATAACGTA-TATATTG--ACGAAATTGTTTGGAAT-GCATCTAGGG--CCGAG-GAATTGAATACTTTACTTCAATAT-AAA-GTTCAAA-GT---TT------T---------AAAG---A---TGTTACTGACAACATGGCTG-AAA-----A-T--------AA-A-------GA--T-T-CA-----ATAAATGACAGTATAATAAATTTTA-CAAATATAATATACGATACATATTTCC-AATTATTTGGA----------A---AATCCTTCA-A-AAAAG---G-TATTAAAGTTAAA-----TGTAAG---AA---A--AAGAA--GGCC-A-AAT---GGTTTAACGAAAATTGTAGGAA--AGCTAAAACGGCATTTTTT-AACTCCAAAAG--------AATTT-TTCTAA--GAAATCAAACTTAA--GA----GAACAAGAAGCATT-TTCTTGAA--AGTAAATCTG-CT-TTTGCTAAAACTAAAAGAAAGGCTTAAATATGC--GTTTTATTC---GAGAGA------A----AAAA-TT---AACCTAGC--TAAAC-TTAGTAAA--T-AATGTCCAAGAAAATTCTGGAAAAAAATTAACAA-------TTTTAA-T-A---AACGTAATAAA--C--AGG----GGTTA-TCAAATAGCCC------A-----AATATGGAAGAATTTGTAC-AGCACTTTACAGAT-AT--C--TCGAATACACCT------CAT-----G------TT-AAC-----CTAAACTTTGATGAT-ATGAACGATCATAACAATCTTGATAATAACAATCATGGCATAAATATAAATGATGAACATGTAAATAGACAATAGGTCAATGTAGAATTTTAAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTCAGAAATAAGTCAGGTGATATCATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGATGTGACGAAG-TTTAGCAGA--TTTTTTCATAGACGCGAAAACTTTTATAAC
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gi|1 : GACAATGATTTTTTAAATTTTATTAACGACTACGATGT---GCTATTATTTACAGAAACATCAAACTTTAAA--TTGACAAATGTAAACATTGA------TAATTATGT-GCATTT--CTCC--TGTCCTAGACCAAAAT-CAAATAGA----AAGGCTAAGAGA---AACAGCGGTGGTGTTATAAT--ATATTATAA-AGAGAA---AT-TTTTCAATCAA-AT---TGAACTTGTTA----A----ATTGAATCTT-AAT------GGAATAGTGTGGTTTAAACTCAAA--AAGTC-GTATTT--T-------GGCACTGAAAATGATCTT--TATTTCTGCACGTGTTACATACC--ACCAGA-G------GACTCTAAGGTTTATAAAAATGCGT--CCTGCCCTCTATACGAATTTGA-T-TTTTTTGAGCATTTGAATAATGCTATT-TGTAA-TT-AT-AGCGCATTTGGG-GATATCTACATCTCCGGT--GACCTTAATTCTAGGACAGGTAAAAAGCCAAA--T----A--CTGTGAACAATATAAACTTACAACGGTATGTTAATATGCCTCATGATA--GTATACC------TGTGCA------CGATATACCG--G--CACGATCAT---CACGT---GATCATACTA-T--AAATAGTTTTGGGAACAAGTTATTT-A-G-TC-TT--TGTA--A-GGAAAA--TGA-TTT-ATGTATTGTTAACAGACGATTAAAAGAAGGTTATTTGACGT----GTCAC-AATTTT-AGCCACAATCATACCGCAGCAAGTGTTGTCTATTATTTGATTAC--A----------AATTTTAGCAA---TTTTCC---T--TT----TATTACAAATA-------TGA-AAGTAATCGAAA--------TAACAGAATTTTCGGACCATTGTCCTCTTAAATTTT-G-TGTAA-TT--TTG-AAAATAT---GAATA-TGTATAAAACGGATAATCTAACCCA-TA--ATAAAATTATATGGGA----AAATAGTGATCC------ACTG---GTTTT-------T-C-AAA-ATT-----GT---TTGGATGAT---------AAAAAACA---TATTTTTGACAATATTACTC-AAAATCTGA-T--------AACA-------AA--T-TATACTGATATAAATTCTTGAATAATTGATTTGT-CCGATTTGATATACGACATATCGTTCA-AAACAAATGGA-----------------C------G-AACAT---G-TAA----GTTAAACCCATTGCAAA---AACGTATTAAAAA--GGCA-G-ATC---GGTTTGATGATA
gi|10 : gagtgagcagtcattcaaccaggccatattaaataaattggataccactgaaagtagacaaaagacaatttagtattaattaggcaagcttgatattattgaaagtcgggtaaacaccttaacacagaaattgaaccagatggacaatcgtgtattttcactcgagtcaaagatcaatagctctgatcgcaaattatcggacattgaagcaagctgtaactatgatacaataatttgtgatgagctcaggtctaagcagctagatcttgataaacagttaaaatctgaaaaatctacaagcgcccgattattatcacaaatggacaatgtgaaacgtgatatcaaccagttgaacgaagatatcctggatttgcagacacgatccatgcgccacaaccttcttttttataatgttgaggaatgcacaacagagtcaaactgcagaaatgaggattgtggtgacaaaattctacatttctgtgaaaccactctacaaatgccagacgcacgttctaaagttaaattcgatagagcaaccctaccaaaaaacgtcctattgtcgtaaaattcaattactttcatgacaaagttgatgttaaacaattagtgcaagacaaatcagacagtacaacataccgagttagtgaccaatacccgaggcctatccaggaatgaagaaaaacactaattcagatgctgataaaggctaaaggagaaaacaaatgtgccatattatcgtacaataaactgtactgggtatatcaacggcgtcaagtacacggcagaagatattccgacaggatccacgtcgaccggaactgaaccaatggccacgtctgtgacacttgcataggatgatgctgagaagcagcttaaatttcttctgtggaatgttcaaggtttatcaaataaactttcgTTT--C--AGTTGCCCAAGACCGAATTGTAA-TAAA----AAAGCCAAACGG---GATAGTGGGGGCCTTGTGGT--ATGTTATAA-ACA-AA---AC-GTACAGACTCATAT---GGAACATAACA----A----AAC-AAATTTAAAT------GGCATTATATTGTTGAAAAT-AGA--CA--T-GAATTT--CTTA----AGTACTAATAATGATGTT--TATTTCTGTGTTTGTTACATTCC--TCCCTA-A------GAATCTAATGTATATAAGAATGTAC--GTTCATTTTTATATGAATATGA-C-TTTTTTGAACAGTTAAATGATGACATTATGC-A-TT-AT-AGTAC-TTTAAGCGAGGTTTATTGCACTGGC--GATCTGAATAGTAGGGTAGG---------AGA------------GAGA-----------TTG-ATCGATTTGTTACCATGCCTTCGGGCG--ATGAACC-ATAA-TATATA----ATTGTTAAA--A--G--AAAG-TCAT---T---T---GATAA-ACATGT--TAATATATTTTAAAATAAATTG-TT-G-T-TA-TTG-TGTA--A-AGAACA--AAA-TTTGAT-CATTGTTAATGAGAGGCTTGAGGAAGGAAACTTTACAT----ATCAC-TGTTTG-AACAGAAACCGGACGGAGGCAAGTGTTGTCGACTACTTGATAACT-AG-CGCG-AATAAT---AACAA---TAT--C---T--GT----T-------TTA-------TGA-ATGTGTTGGATT--------TAATGAACTTTTCTGGCCATTGTCCTATATAGTTTGCA-T-TAAGTTG-TCGCATGAC-T---GGAAA-TA-ATCATACAGATAACGTA-TATATTG--ACAAAATTGTTTGGGAT-GCATCTAGGG--CCGAG-TAATTGAATACTTTACTTCAAT-C-AAAAGTTCAAA-GT---TT------T---------ATAG---A---TGTTACTGACAACATGACTG-AAA-----A-T--------AA-A-------GA--T-T-CA-----ATAAATGACAGTATAATAAAGTTTA-CAAATATAATATACGATACATCTTTCA-AATTATTTGGA----------C---AATCCTTGA-A-AAAAG---G-TAAT---CTTAAA-----TATAAG---AA---A--AAGAA--GGCA-G-AAT-----------GAAAATTGTAGAAA--AGCTAAA
gi|10 : agAAG-AAAAAGAAG-GCA-GAATGAAA--ATTGTA------GAAAAGCTAAATA----AAAAATG---AACCTAGC--AAAA---------------ATGCCCAAGAAAATTCTGGAAAAAAATTAACAA-------TTTTAA-T-A---AACGTAATAAA--C--AGG----GGTTA-T-CAAATAGCCC------A-----AATATGGAGGGATTTGTAC-AACACTTCACAGAT-AT--C--TCGAATACACCT------CAT-----G------TT-AAC-----CTATACTTTGATGAT-ATGAACGATGATAACAATATTGATAATAACAAACATGGCATAAGTATGACTGATGAATATGTTAATAGACAACAGGTCAATATAGAATGTTTAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTC--AAATAAGTCAGGTGTTAACATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGACGTGACGtaaaaaatgaacctagcaaaaatgcccaagaaaattctggaaaaaaattaacaattttaataaacgtaataaacaggggttatcaaatagcccaaatatggagggatttgtacaacacttcacagatatctcgaatacacctcatgttaacctatactttgatgatatgaacgatgataacaatattgataataacaaacatggcataagtatgactgatgaatatgttaatagacaacaggtcaatatagaatgtttagataaaaactttgaggagtcaaataagtcaggtgttaacatcattatctcgaaataaatcacccggacgtgacg
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Reference ( family-146 ) : ATGACAATGATTTCTTAAACTTNATTAATAANTATGACGT---GCTTTTGTTNACGGAAACGTGGANCTCTAAANATTG-CAAATGTAAACATTGA------TGGTTATGN-GTATTT--C--A--TGCCCAAGACCGAAAT-CAA-TAAACCGTAAAGCTAAAAGG---NATAGTGGGGGTGTTATAAT--ATATTATAA-AGA-AA---AC-TTACNAATTAATAT---TGAACTTGTTA----A----AAC-AATTTTAAAT------GGCATTGTATGGTTTAAANT-AGA--NA--C-GAATTT--CTTA----GGNACTGATAATGATCTT--TATTTCTGCGCGTGTTACATTCC--ACCNGA-G------GACTCTAATGTNTATAAAAATGCGC--NTTCNCCTCTATATGAATNTGA-T-TTTTTCGANCAGTTAAATAATGATATTATGT-A-NT-AT-AGTAC-TNTAGGCGATGTTTACNTCACCGGT--GATCTGAATNCTAGGACAGGTAAAAGGTCAGA--T-A--A--CTGAGAAC-AT-TAACCTTG-ANCGATATGTTAACATGCCTCNGGGCG--ATNNACC-A-AA-TGTGCA----ATCGNTANA--A--G--AAAG-TCAT---C---T---GATAA-ACAAGT--TAATANNTTTGGGAACAAATTG-TT-A-G-TC-TT--TGTA--A-AGAAAA--NAA-TTTGAT-TATTGTTAACGGNCGNCTTGAGGAAGGTAANTTTACGT----GTCAC-NGTTTG-AACAGNAACCGGACGGCGGCGAGTGTTGTCGATTATTTGATTACT-AG-C-CG-AATAATCTTAACAA---TAT--C---T--GT----T-------ATA-------TGA-ACGTNTTGGACT--------TAACCGAGTTTTCNGACCATTGTCCTATNCAGTTTTCG-T-TAAGTTG-TCG-ATAAC-T---GGATA-TA-ATAAAACNGATAATNTAACNTATTG--ANAAAATTGTNTGGGAT-GCATCTAGGG--CCGAG-GAATTGAATACTTTACTTCAAT-C-AAA-GTTCAAA-GT---TT------T---------AAAG---A---TGTTACTGACAACATGACTG-AAA-----A-T--------AA-A-------GA--T-T-CA-----ATAAATGACAGTATAATAAATTTTA-CAAATATAATATACGATACATCTTTCA-AATTATTTGGA----------A---AATCCTTCA-A-AAAAG---G-TAAT---GTTAAA-----TGTAAG---AA---A--AAGAA--GGCC-G-AAT---GGTTTAACGANAANTGTAGAAA--TGCTAAAACTNCATTTTTT-AACGATAAAAGANTTTNTAAA-------ANG----GATCNNACNGAA--GA----NAATAGGNTNCGTT-TNCTTGAACTAGTAGAANTG-AT-TTTGCNAAAGCAAAAAGAAAAGCA-AAATATGC--GTTTTATTC---GAAAGA------A----AAAAACG---AACCTATC--NAAAT-TAAGTAAAA-G-AATGCCCAAGAAAATTCTGGAAANANATTAACAA-------TTT-AA-T-A---AACGTAANAAA--C--AGG----GGTTA-T-CAAATAGCCC------A-----AATNTGGATGAATTTNTNC-AGCACTTTACAGAT-AT--C--TCGAATACACCT------CAT-----G------TT-AAC-----CTAGACTTTGATGAT-ATGAACGATNATAACAATATTGATAATAACAATCATGGCATAAATATAAATGATGAACATGTTAATAGACAACAGGTCAATGTAGAATTTTTAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTCAGAAATAAGTCAGGTGATATCATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGATGTGACGAAGTTTTAGCAGA--TTTTTTCATAGACGCGAAAACTTTTATAAC
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gi|11 : agtttcagttgcccaagaccgaattgtaataaaaaagccaaacgggatagtgggggccttgtggtatgttataaacaaaacgtacagactcatatggaacataacaaaacaaatttaaatggcattatattgttgaaaatagacatgaatttcttaagtactaataatgatgtttatttctgtgtttgttacattcctccctaagaatctaatgtatataagaatgtacgttcatttttatatgaatatgacttttttgaacagttaaatgatgacattatgcattatagtactttaagcgaggtttattgcactggcgatctgaatagtagggtaggagagagattgatcgatttgttaccatgccttcgggcgatgaaccataatatataattgttaaaagaaagtcatttgataaacatgttaatatattttaaaataaattgttgttattgtgtaaagaacaaaatttgatcattgttaatgagaggcttgaggaaggaaactttacatatcactgtttgaacagaaaccggacggaggcaagtgttgtcgactacttgataactagcgcgaataataacaatatctgttttatgaatgtgttggatttaatgaacttttctggccattgtcctatatagtttgcattaagttgtcgcatgactggaaataatcatacagataacgtatatattgacaaaattgtttgggatgcatctagggccgagtaattgaatactttacttcaatcaaaagttcaaagttttatagatgttactgacaacatgactgaaaataaagattcaataaatgacagtataataaagtttacaaatataatatacgatacatctttcaaattatttggacaatccttgaaaaaaggtaatcttaaatatA--A--G--AAAG-TCAC---T---T---GATAA-ATAAGT--TAATATGTTTGGAAATAAATTG-TT---G-TC-AT--TATCTCA-AGAACA--AAA-TTTGAT-CATTGTTAATGGGC---TTCAGGAAGGAAAATTTACAT----ATCAC-TGTATG-AACAGAAACCGGACAGGGGCGAGTGTTGTGGACTACTTGATAACT-AG-CGCG-AATAATCATAACAC---TAT--C---T--GT----T-------ATA-------TGA-ATGTGTTGGATT--------TAATGGAGTTTTCTGACCATAGTCCTATACAGTTTGCA-T-TAAGTTG-TCGCATGAC-T---GGATA-TA-ATCATACAGATAACGTA-TATATTG--ACGAAATTGTTTGGAAT-GCATCTAGGG--CCGAG-GAATTGAATACTTTACTTCAATAT-AAA-GTTCAAA-GT---TT------T---------AAAG---A---TGTTACTGACAACATGGCTG-AAA-----A-T--------AA-A-------GA--T-T-CA-----ATAAATGACAGTATAATAAATTTTA-CAAATATAATATACGATACATATTTCC-AATTATTTGGA----------A---AATCCTTCA-A-AAAAG---G-TATTAAAGTTAAA-----TGTAAG---AA---A--AAGAA--GGCC-A-AAT---GGTTTAACGAAAATTGTAGGAA--AGCTAAAACGGCATTTTTT-AACTCCAAAAGAATTTTTCTA-------AGA----AATCAAACTTAA--GA----GAACAAGAAGCATT-TTCTTGAA--AGTAAATCTG-CT-TTTGCTAAAACTAAAAGAAAGGCTTAAATATGC--GTTTTATTC---GAGAGA------A----AAAA-TT---AACCTAGC--TAAAC-TTAGTAAA--T-AATGTCCAAGAAAATTCTGGAAAAAAATTAACAA-------TTTTAA-T-A---AACGTAATAAA--C--AGG----GGTTA-T-CAAATAGCCC------A-----AATATGGAAGAATTTGTAC-AGCACTTTACAGAT-AT--C--TCGAATACACCT------CAT-----G------TT-AAC-----CTAAACTTTGATGAT-ATGAACGATCATAACAATCTTGATAATAACAATCATGGCATAAATATAAATGATGAACATGTAAATAGACAATAGGTCAATGTAGAATTTTAAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTCAGAAATAAGTCAGGTGATATCATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGATGTGACGAAG-TTTAGCAGA--TTTTTTCATAGACGCGAAAACTTTTATAAC
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blockSeqs : A T C G TTT A T A G A T A GA GAACTTT AACGAA TT AGT G GTAATAAA GTATA G TA T . ACTTTTTCAAT T GAT ATTT AACAAATTTAAAT C A C G TTG TAAATCTTATTTC T T TCT G T GGA C A CGATGA A A A TAT A A T A A A A C GA T C CA T C G TT T TA A T TAAGG A A A AC T T C CC GA ATAA AGATATC T A CAGGCACGA TCCCTG A ACATG TG TA . GA A A AA TC T CGG C GAT G G C TTTG AA AT A A G AG C TAGCGCG C A GTT TCCTTTTATTACAA AATAATA C T G G T AATCGAAA G T A G A G G GG C C CTTAC T GT A G A A T AA C T T TCAC TTAAAT A A A AT A C C ATA TGATGATAAA . ACA G C . A CTGATAACAAATAATACT AG ATTA A T A A G T T CGAACATGTTA T C G C T CCC A TAAA CCCAT AACGTATT AA CACAAT C A T ACCG TCA T T G C A TTTAATC AAATTT CT T AC AATTC TTT A A TG CT AA T G G T TTAA T TTAAA . AGAT CATAT G TGG A T GC TC AA A A C ATACCTCTTG A C TCG T T AAGGTAAAAATTATTCT G TCTGGGATA A G A G A G C C AG TT G TATAGC AGCCATT C TTGTA CTT A C A A T TT
blockSeqs : C G G A C G A G A C T T G T GCGTG . TCC A CAAATAGA GG T . T . ACGTACAGAC T . . ATTGAATCTTAAT T T . A C TGATCTTATTTC C T T A G T A . . C T A TAT C T . . G A A T GA . . CA A T T CA C . T T CACGG A A C AC A A A . AT AAAA ATT A T CCCGCACGA CACGT A ATAAG . TG . AA . A G . . A . GAT G A A . T G A A A GG G TAGCGCG T A GTT TCCATGTATAAAAA . . T G G T . G T A G A . G G C C TTTAC T AT A G A A T . C T T TGC CCGAG A A A CT A C . . GGATGAT . . G . . . CTGATAACAAATAATACT . ATCA A . A A . T T AAGT T C C . . . . T . CTTATT . CAGATT T A C AG TTT A . A G G . TG AA T . T TTA . T TG CT AG . G T . CG T CG . GA TT T T . A GT CA AA T T A TTTT A C . T C GGTAAAAATTATTCT T CTGATATT T A T T T . T . . A G . AGCCAG . . CTT . C T . T .
blockSeqs : T G G A T G A G A C T A T T ATCTA . AGT T TAAACCGT AA A . . . ACTTACGGAC T . . TTTAAATAATAAG A C . A A TGAATTTCTTA A G T A A A A . . T C A TAT T A . . C T A T T . . C T T T CG A . A T TTTAG . . A G A A T . TC AAAA ATT A T CCTGTACG CACGT C TACTA . GT . GA . . A . . A . ATG A A T . T G C T A CT C AAATTTT T A . TTGTTTTAT . . A A A G . A G T A . . T G T C TTTAC . GT G C A C T . T T A TGC CCGAG A T G C A T . . T . . T . . . GAAATT . TCA C . C T . A A C C C T . . . . T . CTTATT . AGAAT T T A TC ACA T . G A T . GA GA T . G AAG . T TG AT TC . . G . CG T CG . GT TG A A . T TG TC AA G G C TTTT . C . T A CTTAAAAGTATTCG T CCA T A T T A . C . . . A . AG . . TAC . A A . . .
blockSeqs : C A A A . G T A A T T T G A GAGTA . A G CTAATCGG TC G . . . ATATGCTAA T . . TGTAAACTATAAC T T . A A GATCTTATTTC C T G A G A A . . C T A G C T . . G A G T A . . A A T T CA C . T T TTACA . . T C A A A . AT AAAA ATT A T AGAAAG CTCCC C TACTA . GT . AA . . G . . T . AGC C C T . A A A A C CG C TGAGTTG C A . ATAGATA . . C A T C . C A C T . . A T C C TTTAA . AT T T A T T . A A A TGC CCGAA A A A C . C . . T . . T . . . AAA . TCA A . T A . T A A T A T . . . . T . CTTATT . CAAAT T T T TC GGC T . T C A . TG CT G . T TTT . A TG CT AA . . T . TA T TT . . CA T T . A GG CA AA T T A TTTT . . . T A CAGGGGTTATCA C CCA T A T T C . T . . . A . G . . CTT . C T . . .
blockSeqs : C C G A . G A T T A . A . T GAGAG . A G GTTATAAA TG G . . . AAAAAGGAA T . . AACAATTTTAAAT T A . G A AGCAGAATTTT A G T A G A A . . T T A C T T . . C T A A A . . C A C T TG T . G T TTATA . . C G C A T . TA A ATT G T AGAAAG TT A TACAA . GT . AA . . . . . T . ATT T A A . A G C T G CA G AAGTTTT T T . ATAAATA . . C T T C . C A T T . . A G C C TTTAC . A T T A G T . T C T TGC CCGAG A A A G . C . . T . . G . . . AAA . TCA C . A A . G T G T C C . . . . T . AAA . AGATT C A T TG TCA A . A A A . AC CA A . T ATA . T TG AT AG . . G . AA C CC . . TA T A . A GC CT AA T T A TAC . . . T A CAGGGGTTATCA G CAA G G T G C . C . . . A . T . . CTT . A T .
blockSeqs : T G T A . G A G A C . T . T TT . A A CAAACCGT GT A . . . TCTTCTAA T . . AACAAATTTAAAT C A . G A TGAATTTCTTA T C G A G A C . . C C A C A A . . C C A C C . . C A C T TT A . T A TTATA . . C G T T C . GA . C T A AGAAAG TT A GCAAG . CG . AA . . . . . T . AGC A C T . T A A A T TA C CAGCGCG T A . ACCGGT . . T A G T . T A A G . . G G T . TAT . A T T T C T . T T A TGC TCGAG A A A C . C . . T . . T . . . AAA . TCA A . C T . A A A T T G . . . . T . AAA . CGAAT T A A AG TCT A . G C A . TG CT G . A TTT . A . CT AA . . T . CG T CC . . CA T A . A GC CA AA A A C TTT . . . T A CAGGGGTTATTA T CCA G A T T A . T . . . A . G . . CGT . A . .
blockSeqs : T T A A . . G A G T . A . . . . A T CAAACCGT GT A . . . TATGCTTA T . . TTTTAATAATAAG C T . G T TGAATTTCTTA T T G A A C T . . C T A G A A . . A A A C C . . C T T G TT T . A A CACGG . . C A T T T . GA . A T A AGAAAG TT A GCAAG . TG . G . . . . . T . GAT G C A . A G C T G CT T TGAGTTG T G . CTGTT . . A T C A . A G T A . . G G T . TAT . A G C A T T . T T C CG TCGAA A A . C . . . . T . . C . . . AAA . TCA A . A A . T T A T C C . . . . T . TCA . AGATT T T C TC TTT A . A A A . AC GA A . T TTA . C . CT AT . . G . CG T AA . . TG T A . A T CA AT T A A AAT . . . A A CAGGGATAATCA G ACA T G G G C . C . . . G . T . . CTT .
blockSeqs : . . . T A G A . . . . A C . . AACAAATTTAACT T A . G C TGAATTTCGTA T T T G T T C . . A A G G A A . . A A A T C . . A C T G CT T . A T TA . . C G T T C . TG . T T A AGAAAG CT A GCAAA . TG . A . . . . . T . GAT C C T . T G A T C GG C TAGCGCG C A . CTGTT . . C T G C . C A C T . . A G C . CT . A C G A T T . A A A CG ATCC A A . C . . . . T . . G . . . AAA . TCA A . A A . T T A T C T . . . . T . AAA . AGTTT T A C TA GGC T . G C A . TG CT A . G TTT . A . CT AA . . T . CG T CG . . TG T A . A A TC AA A T C TTT . . . . T AGGTAAAA G T A G G G A . C . . . T . T . . TT .
blockSeqs : G . . TTTAAATGATAAG C T . A C CATCTTATTTC A G T G T T C . . A A . G T T . . C T A C G . . A T T G TT G . G A TA . . . C A A A . AT . A C C CGG TT . ACTAT . GT . . . . . . . A . GAT T G A . A G A A A CA G TAGCGCA T A . TCCTT . . T G G T . T A A G . . G G C . CT . A T T A A . . T C T . . . . . A . . . . T . . G . . . AAA . . A . A T . C T G . C T . . . . . . AAA . ATCTT C T A TC GGC G . A A T . GA AA T . G AAG . T . A TA . . T . . T CG . . CA G T . T A TC . A A C AT . . . . T GGTTACA G . A A T T A . C . . . A . G . . C .
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blockSeqs : G A G A A . . T C . . . . . . . A . G C G T . A A A T G TT G TA C A . TTGTT . . T G T C . C A T T . . G . C . AA . . A G . T . . A A T . AAA . CGAAT T T A AG TC T . A T T . GA AA T . T AAG . T . . TC . . G . . . TT . . T G T . G . . . T A . . . . . . A GGG . . T . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . G C A . T . C A A GA C CA T . . CTGTT . . T T G T . G T A G . . A . C . CT . . T T . A . . C A A . TAA . ATATT C T T AG T T . T . T . TG CT G . . TTT . A . . AA . . . . . . . . . T T A . A . . . . T . . . . . .
blockSeqs : C . T . A . . T . CT G A . . . CGA . . C G T C . C A C T . . . . . . CT . . A G . T . . A A . . . . CGAAC C A T TA C A . A .
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blockSeqs : . T
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finalCons : ATGACAATGATTTCTTAAACTTNATTAATAANTATGACGT---GCTTTTGTTNACGGAAACGTGGANCTCTAAANATTG-CAAATGTAAACATTGA------TGGTTATGN-GTATTT--CA----TGCCCAAGACCGAAAT-CAA-TAAACCGTAAAGCTAAAAGG---NATAGTGGGGGTGTTATAAT--ATATTATAA-AGA-AAACNTNCNAAC----TAATAT---TGAACTTGTTA----A----AAC-AATTTTAAAT------GGCATTGTATGGTTTAAANT-AGA--NACGAATTNCTTA---------GGNACTGATAATGATCTT--TATTTCTGCGCGTGTTACATTCC--ACCNGA-G------GACTCTAATGTNTATAAAAATGCGC--NTTCNCCTCTATATGAATNTGA-T-TTTTTCGANCAGTTAAATAATGATATTATGC-A-NT-AT-AGTAN-TNTAGGCGATGTTTACNTCACCGGT--GATCTGAATNCTAGGACAGGTAAAAGGTCAGATNANG-----CTGAGAAC-AT-TAACCTTG-ANCGATATGTTAACATGCCTCNGGGCG--ATNNACCAAA---TGTGCAATT----GNTANAAGAAAG-------TCATTT---------GATAA-ACAAGT--TAATANNTTTGGGAACAAATTG-TTA--G-TC-TT--TGTA--A-AGAAAA--NAA-TTTGAT-TATTGTTAACGGNCGNCTTGAGGAAGGTAANTTTACGT----GTCAC-NGTTTG-AACAGNAACCGGACGGCGGCGAGTGTTGTCGATTATTTGATTACTAGCGCG---AATAATCTTAACAA---TATCTGTT------------------ATA-------TGA-ACGTNTTGGACT--------TAACCGAGTTTTCNGACCATTGTCCTATNCAGTTTTCG-T-TAAGTTG-TCG-ATAACT----GGATA-TA-ATAAAACNGATAATNTAACNTATTG--ANAAAATTGTNTGGGATGC-ATCTAGGGCCGAG---GAATTGAATACTTTACTTCAAT-C-AAA-GTTCAAA-GT---TTT---------------AAAG---A---TGTTACTGACAACATGACTG-AAA-----A-TAAA----------------GA--TTCA-------ATAAATGACAGTATAATAAATTTTA-CAAATATAATATACGATACATCTTTCA-AATTATTTGGAA-------------AATCCTTCA-A-AAAAG---G-TAAT---GTTAAA-----TGTAAGAAA--------AAGAA--GGCC-G-AAT---GGTTTAACGANAANTGTAGAAA--TGCTAAAACTNCATTTTTT-AACGATAAAAGANTTTNTAAA-------ANG----GATCNNACNGAA--GA----NAATAGGNTNCGTT-TNCT--AACTAGTAGAANTG-AT-TTTGCNAAAGCAAAAAGAAAAGCA-AAATATGC--GTTTTATTCG---AAAGA------A----AAAAACG---AACCTATC--NAAAT-TAAGTAAAAG--AATGCCCAAGAAAATTCTGGAAANANATTAACAATTT--------AA-T-A---AACGTAANAAA--C--AGG----GGTTA-T-CAAATAGCCC------A-----AATNTGGATGAATTTNTNC-AGCACTTTACAGAT-AT--C--TCGAATACACCT------CAT-----G------TT-AAC-----CTAGACTTTGATGAT-ATGAACGATNATAACAATATTGATAATAACAATCATGGCATAAATATAAATGATGAACATGTTAATAGACAACAGGTCAATGTAGAATTTTTAGAT-AAAAACTTTGAGGAGTCAGAAATAAGTCAGGTGATATCATCATTATCTCGAAATAAATCACCCGGATGTGACGAAGTTTTAGCAGA--TTTTTTCATAGACGCGAAAACTTTTATAAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): ATGAGAAGACATTTTACCAAAGCAAGATGTACTCGACAAACAGTTATCCGAGGCCGTAAACAATGACTTGAATATAGCTAAGGATCACACACTGTTGTTGCAAAACAATGCCCGTGTGTCCAACGAAATAATTGACCGACTATCACGATCCATGCCAGACATTTTCCTTATCTTCAAGAATGTGCAACGTCTGTAGAAAGAGTAGAACAGTTCACAGAAAGTGCTTGACTTTTGTTTAGAAAAACTCGAAATGCCAGATGCTTCGACCACTATAAAACTTAACCGCGCACACAGGATAAGCAGGTATGATCCTTTCAAAAAGTACCAATAGTGGTGAAGTTTGATTTCCACCAAGATAAAATCTCAGTTAAACAAAAGGTAAATACCATGTTGAAACATTCCGACTTTGGGGTTGTCGACAAATACCCGAAACCCACGGATGTTAACTCCATTACTTATCAAGGCCAAGGAGGGTAAGCGGGCTGTGCTTACTTATGATAAACTGTGCATTCACAGTGTGTAAATGAAGATAGGTCGACGCCACCACGGAAACATAACTCATGAGCTAGGTAACTGCCACTGATCAGTTGATTTTTTTACCTTGGAATGTGCAGGGTTCGAAATCTAAGTTAGACGACTGTGACCTTAAATTTTGTACATAATTTTGATAGTTTGCTTTTCCAGAATGTTGGCACTCAATTCTGTGTAATATAGATATATTAGATGGATATAAATAGTTTAGTTACCCACGTCCGAAATTTAACC
Unaligned ( gi|21 ): CAGGGACAAAAGACAACCCCTTGTAAATTTAATCATTTTCACGACAAACAACACATAAAACAGGATGCGTTTGATCTATTGAAAGATCATATGGTATTTCCGCATCGGAGATCAGTTCCCAAAGGCAATCCAAAACAAGAGGAAGCAACTCGTCTTGACCCAAGGTTATAAAAGCTATTAAAGAAGGACGGTAAAAAAGCCTTGCTTTCTTATGACAAACTTTACATAAACATGGACACCGTGTCACGTGCCAACTATTTATGTGATTAGGACTACATACAGAAACAGTTAACGTTTCTTCTCTGGAATATATGGGTAATTAATTCGAAGCTAAATGGTAGTGATTTTATATCTACCTATGATGTATCGATATTAATAGAAACATGGAATTCAAAAGTTTCGATTGTACA
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Unaligned ( gi|12 ): TGAATGATCAATCCATGAATCAAGTGATCTTAAAAAAACCAGAATCCATTGAATGTAGTCAACGGTCGATTGATTATAGACTAAACAAGCTGGACACAATAGAAAGTCAGGTCACGTTATTGTCACAGAAATTCACCCAATTAGACTGCCGCATATCATCACTAGAATCAAAAGTGCACAATTCAGCTGCTAAAATGTTAGAAATAGAAACAAGTCGTAATTATGACAGTTGAAGTTGTGATGAATTGAGGGTAAAACAATTAGACCTAGATATGCAACTTAAAACTGAAAAATTACACAATACGCGATTAGCAGCGAGGCTAGATGGCATAACACGAGATAACAGTCAGTTGAACGAATCTCTTCTCGATATTCAGTCCCGCACAATGCGTGACAATCTATTGTTTTTCAATATTGAAGAGTGTGCACGTGATGCTGATCGCAAGGAAGAAAACTGTACCGACAAAATTCTAGGCTGTTGTGAAGATACACTCCAAATTCAGGACGCGCGCACGCTGGTGAAAATTGATCGTGCCCACAGAATCGGAAAATACGATACAGGGAAAAAGCGTCCGATTGTTGTGAAATTTAACTACTTCTGGGATAAAATTAACATAAAGCAGGCAGTCCAAGATAAATCGGAAACCACGGAAATTCGTGTGGGGGACCAGTACCATAAACCTATTTAGGAACGTCGCAAAAAACTTATCCCTATGCTGAAAAGAGCAAAAGAAGAAAATAAACGTGCAGTCTTAACGTATGATAAATTATACATTAACGGTCGAGTTTACACTGCGGACATGGTACCGACAACATTTGCACCTACCGGCGCAGAACCCATGGCTACCCATGCTCCATCATACTAGGATGAGGATGAGAAGCAGTTGAAATTTCTCCTCTGGAATGTCCAGGGGATTAGAAACAAACTTATGGACAGTGATTTCTTGAATTTTGTGAAT
Unaligned ( gi|15 ): ATGAGAAGACATTTTACCAAAGCAAGATGTACTCGACAAACAGTTATCCGAGGCCGTAAACAATGACTTGAATATAGCTAAGGATCACACACTGTTGTTGCAAAACAATGCCCGTGTGTCCAACGAAATAATTGACCGACTATCACGATCCATGCCAGACATTTTCCTTATCTTCAAGAATGTGCAACGTCTGTAGAAAGAGTAGAACAGTTCACAGAAAGTGCTTGACTTTTGTTTAGAAAAACTCGAAATGCCAGATGCTTCGACCACTATAAAACTTAACCGCGCACACAGGATAAGCAGGTATGATCCTTTCAAAAAGTACCAATAGTGGTGAAGTTTGATTTCCACCAAGATAAAATCTCAGTTAAACAAAAGGTAAATACCATGTTGAAACATTCCGACTTTGGGGTTGTCGACAAATACCCGAAACCCACGGATGTTAACTCCATTACTTATCAAGGCCAAGGAGGGTAAGCGGGCTGTGCTTACTTATGATAAACTGTGCATTCACAGTGTGTAAATGAAGATAGGTCGACGCCACCACGGAAACATAACTCATGAGCTAGGTAACTGCCACTGATCAGTTGATTTTTTTACCTTGGAATGTGCAGGGTTCGAAATCTAAGTTAGACGACTGTGACCTTAAATTTTGTACATAATTTTGATAGTTTGCTTTTCCAGAATGTTGGCACTCAATTCTGTGTAATATAGATATATTAGATGGATATAAATAGTTTAGTTACCCACGTCCGAAATTTAACC
Unaligned ( gi|21 ): CAGGGACAAAAGACAACCCCTTGTAAATTTAATCATTTTCACGACAAACAACACATAAAACAGGATGCGTTTGATCTATTGAAAGATCATATGGTATTTCCGCATCGGAGATCAGTTCCCAAAGGCAATCCAAAACAAGAGGAAGCAACTCGTCTTGACCCAAGGTTATAAAAGCTATTAAAGAAGGACGGTAAAAAAGCCTTGCTTTCTTATGACAAACTTTACATAAACATGGACACCGTGTCACGTGCCAACTATTTATGTGATTAGGACTACATACAGAAACAGTTAACGTTTCTTCTCTGGAATATATGGGTAATTAATTCGAAGCTAAATGGTAGTGATTTTATATCTACCTATGATGTATCGATATTAATAGAAACATGGAATTCAAAAGTTTCGATTGTACA
Unaligned ( gi|28 ): AAGATGAAAACTGTATAAACAAAATATAAGATTTCTGTGTGAAACTGGATATGCCAAATTTAAAGGAAGCCGTGAATATTGATCGTGCGTAAAGAGTAATGTCATAGAAAAACGACCTATTGTTGTGAAATTTAGTTTCCATCAGGATAAACTT
Unaligned ( gi|31 ): TGCTGAAAAGGGTATAAGAATAAAACAAATGTGCAGTCTTATCTTATGATAAGTTATGCATTAACGGT