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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1456 ) : TCCGCCACGGCTATGTGTGGTGTCCTTG--AGCAAGACAC-TTTNTCCGC----ATANGCT-TAG-TACTGGTT-CTACCCAGGAAG-ACTTCG--AG--CGCGAT-T-T------G-T------TGTAAGAAC-TTGT------TT--CACAATCGANGTA-AAAT-AAATAAGTT-TAAACTAAA--A--AATAT---NTNCTAAGACTGATTANNCCAC-TAGNTTCTATGAGTGAAATAAGATATAACAAAAAATTAAAGCAGCAATATATAT-GCCCCGCTTTTTATACTTGAGCAGTGTATTCGTCATTAGTTCTCCTTTTCTGTAGGTGCTTTGGATAAT-GT-TTTTTATACGATAA-----GTANTATTACGGACAATCAAGCAACTATAAAAGATTTCTCTCTAATTCCTTNGGAAAATGAACTTCATACGTTCATATGTTGACATCAATGATTNATATAGAATGTTTTATATATAATNCCNTGGTTGATATACCTATCGGTATTATTCTCATGTCTAAATAAAGA-TT-TA-TAA-CTCCCTATGCCATATATTGTTAATNTA---CT-ATTTACA----GGAAC--ATGTAGTGATANAAATCCTTGTATATTATGAT-TGTGTGACAGAGTAACAAAGAGAAACA-A-CTTTGTATTAACAAAATAAACACATAAACAAC-A-ATTTTATTTCTGCGTAAATCGATTAGAATTACAAAA-TGTCTTATCTTTCTGAATACAT-ATTTTTTATGAAATANA-TTTAAA-A---TTTTGGTCCTTTTTNCAGTTTTTCGCAAACACT-ATCACATTTTAGCGCATATTCGTAAGTGA----TAATCTTGATTACGGCTATATGTGTA-TTCTTGTTATCAGTATGCACC-A-TGCCTCGACCCTC-GGTCATAAGTTAATTGGTTTGTTTTATTGTTTCAATGATAATGAATTAATTGNTGTTTTTTTTAAATATATTNAACTTTATGAAATTANGAAAATATTGATCCTAAATTTTANGTTATATTTCTGCTTACNTAGTGTTGTNAGCACGAATTTCATATTACCGACGATAATACCCGAAGTANTANATGTAATTTTACCAGGTATATACATAAAATTAATCAGAANTATGTGTTACCTTAAATGAGGCGTGTATTTGATTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTA-AAATATGGATATATTAATATTAGATTATATTTT-TTTTTTTGTAAAACAATATTATTATAAA-ATACAAACAACTCGCAAATTAAGATAAAATACATATTTACAGAGGCTCCAAATTTTT--TCCAGTAATATTG---------AACCCCTCG---CACA---AACAAT-TTGAA----------ATACA---TGTATATATATATATAGGTTATTTTCTTTCATGAGATTAAAATGTTCTCCCTT-A--AAGGTTAAGTCACTTTAATTAAACAAAAAATGCATCATCATATAATGATTACAATTTTGTCAATTTCCTCAAAAGTATATTATTTAGTTTGGTTCTGTCAATAAATATAAATATCATCCATTACATAGGAAACAAATACTATGTAGTGTTTATTGTTTAAAGTATTATTCTGTGTTTTAGAGCATTTTGTTGTATATTGCTAGATAAATC
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gi|21 : tatagccctttttatacttgagcagtgtattcgtcattagttctccttttctgtagatgctttggataatgttttttatatgataagtagtataacggacaatcaagcaactataaaagatttctctctaattcctttggaaaatgaacttcatacgttcatatgttgacatcaatgatttatatagaatgttttatatataattccgtggttgatatacctatcggtgttattctcatttctaaataaagattttattaactccctgtgccagatattgttaatttactatttacatgataaaaatccttgaattttatgattgtgtgacagagtaacaaagagaaacacactttgtattaacaaaataaacacataaacaacaaattctatttcagcgtaaatcgattagaattacaaaatatcttattttttgaatacatattttttatgaaatagatttttggtccttttttcattttttcgtaaacactatcacattttagcgcatatttgtaagtgataattaattttgattattgctatatgtgtattcttgttatcagtatgcaccattgcctcgaccctcgggtcataagttaattggtcctataacagcagggtacccgtgatacattgataacgaagggtattttgcatagctttgttttattctttcaatgataatgaattaattgttgttttttttaatatattaaactttatgaaattaagaaaatattgatcctaaattttacgttatatttctacgtagtgttgtaagcacgaatttcatattaccgacgataatacccgaagtattaaatgtaattttatcaggtatatacataaattaattagaaatatatgttaccttaaatgaggcgtgtatttgatttaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTTTATTGTTTCAGTGATAATCAATTAATTG
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consensus : TCCGCCACGGCTATGTGTGGTGTCCTTG--AGCAAGACAC-TTTNTCCGC----ATANGCT-TAG-TACTGGTT-CTACCCAGGAAG-ACTTCG--AG--CGCGAT-T-T------G-T------TGTAAGAAC-TTGT------TT--CACAATCGANGTA-AAAT-AAATAAGTT-TAAACTAAA--A--AATAT---NTTCTAAGACTGATTAGGCCAC-TAGNTTCTATGAGTGAAATAAGATATAACAAAAAATTAAAGCAGCAATATATA--GCCCCGCTTTTTATACTTGAGCAGTGTATTCGTCATTAGTTCTCCTTTTCTGTAGGTGCTTTGGATAAT-GT-TTTTTATACGATAA-----GTANTATTACGGACAATCAAGCAACTATAAAAGATTTCTCTCTAATTCCTTNGGAAAATGAACTTCATACGTTCATATGTTGACATCAATGATTNATATAGAATGTTTTATATATAATNCCGTGGTTGATATACCTATCGGTATTATTCTCATGTCTAAATAAAGA-TT-TA-T-AACTCCCTATGCCATATATTGTTAATNTA---CT-ATTTACA-----GAA-T-ATGTAGTGATANAAATCCTTGTATATTATGAT-TGTGTGACAGAGTAACAAAGAGAAAC-A-ACTTTGTATTAACAAAATAAACACATAAACAAC-A-ATTTTATTTCTGCGTAAATCGATTAGAATTACAAAA-TGTCTTATCTTTCTGAATACAT-ATTTTTTATGAAATANA-TTTAAAA-A--TTTTGGTCCTTTTTNCAGTTTTTCGCAAACACT-ATCACATTTTAGCGCATATTCGTAAGTGA----TAATCTTGATTACGGCTATATGTGTA-TTCTTGTTATCAGTATGCACC-A-TGCCTCGACCCT-C-GGTCATAAGTTAATTGGTTTGTTTTATTGTTTCAATGATAATGAATTAATTGNTGTTTTTTTTAAATATATTNAACTTTATGAAATTANGAAAATATTGATCCTAAATTTTANGTTATATTTCTGCTTACNTAGTGTTGTNAGCACGAATTTCATATTACCGACGATAATACCCGAAGTANTANATGTAATTTTACCAGGTATATACATAAAATTAATCAGAANTATGTGTTACCTTAAATGAGGCGTGTATTTGATTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAATATGGATATATTNATATTAGATNATATNTTGTTTTTTTGTAAAACAATATTATTATAAACATGCAAACAACTCGCAAATTAAGATAAAATACATATCTACAGAGGCTCCAAATNTCTAGCCCAGTAATATTGGCTTAATGTAACNCCNCGAAACACATTGAACAATATTGAACCCCTCGCACANACAATTTGTANATATATATACGGGTNATTTTCTTTCATGAGATTAAAATGTTCCCCCTTCAACAANGTNNAGTCACTTTAATTAAACAAAAAATGCNTCATCATATAATGATTACAATNNNGTCAATTNCCTCAAAAGTATATTATCTAGTTTGGTTCTGTCAATAAATATAAATATCATCCATTACANAGGAAACAAATACTATGTAGTGTTTATTGTTTAAAGTATTATTCTGTGTTTNAGAGCATTTTGNTGTNTATNGCTAGATAAATC
Reference ( family-1456 ) : TCCGCCACGGCTATGTGTGGTGTCCTTG--AGCAAGACAC-TTTNTCCGC----ATANGCT-TAG-TACTGGTT-CTACCCAGGAAG-ACTTCG--AG--CGCGAT-T-T------G-T------TGTAAGAAC-TTGT------TT--CACAATCGANGTA-AAAT-AAATAAGTT-TAAACTAAA--A--AATAT---NTTCTAAGACTGATTAGGCCAC-TAGNTTCTATGAGTGAAATAAGATATAACAAAAAATTAAAGCAGCAATATATA--GCCCCGCTTTTTATACTTGAGCAGTGTATTCGTCATTAGTTCTCCTTTTCTGTAGGTGCTTTGGATAAT-GT-TTTTTATACGATAA-----GTANTATTACGGACAATCAAGCAACTATAAAAGATTTCTCTCTAATTCCTTNGGAAAATGAACTTCATACGTTCATATGTTGACATCAATGATTNATATAGAATGTTTTATATATAATNCCGTGGTTGATATACCTATCGGTATTATTCTCATGTCTAAATAAAGA-TT-TA-T-AACTCCCTATGCCATATATTGTTAATNTA---CT-ATTTACA-----GAA-T-ATGTAGTGATANAAATCCTTGTATATTATGAT-TGTGTGACAGAGTAACAAAGAGAAAC-A-ACTTTGTATTAACAAAATAAACACATAAACAAC-A-ATTTTATTTCTGCGTAAATCGATTAGAATTACAAAA-TGTCTTATCTTTCTGAATACAT-ATTTTTTATGAAATANA-TTTAAAA-A--TTTTGGTCCTTTTTNCAGTTTTTCGCAAACACT-ATCACATTTTAGCGCATATTCGTAAGTGA----TAATCTTGATTACGGCTATATGTGTA-TTCTTGTTATCAGTATGCACC-A-TGCCTCGACCCT-C-GGTCATAAGTTAATTGGTTTGTTTTATTGTTTCAATGATAATGAATTAATTGNTGTTTTTTTTAAATATATTNAACTTTATGAAATTANGAAAATATTGATCCTAAATTTTANGTTATATTTCTGCTTACNTAGTGTTGTNAGCACGAATTTCATATTACCGACGATAATACCCGAAGTANTANATGTAATTTTACCAGGTATATACATAAAATTAATCAGAANTATGTGTTACCTTAAATGAGGCGTGTATTTGATTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAATATGGATATATTNATATTAGATNATATNTTGTTTTTTTGTAAAACAATATTATTATAAACATGCAAACAACTCGCAAATTAAGATAAAATACATATCTACAGAGGCTCCAAATNTCTAGCCCAGTAATATTGGCTTAATGTAACNCCNCGAAACACATTGAACAATATTGAACCCCTCGCACANACAATTTGTANATATATATACGGGTNATTTTCTTTCATGAGATTAAAATGTTCCCCCTTCAACAANGTNNAGTCACTTTAATTAAACAAAAAATGCNTCATCATATAATGATTACAATNNNGTCAATTNCCTCAAAAGTATATTATCTAGTTTGGTTCTGTCAATAAATATAAATATCATCCATTACANAGGAAACAAATACTATGTAGTGTTTATTGTTTAAAGTATTATTCTGTGTTTNAGAGCATTTTGNTGTNTATNGCTAGATAAATC
gi|1 : TCTGCCACGGCTATGTGTGATGTCTTTG--AGCAAGACAC-TTTACCCGC----ATACGCT-AAG-TACTGGTT-CTA----------ACTTCG--AA--CGTGAT-T-T------G-T------TGTAAGAAC-TTGT------TT--CACAATCGAAGTA-AAAT-GAATAAGTT-TAAACTAAA--A--AATAT---TTTC-AAGATTGATTATGTCAC-T-GATTCTATGA-TGAAATAAGATATAATAAAAAATTAAAGCAACAATATATA--GCCCCGTTTTTTATGTTTGAGTAGTGTATTCGTCAGTAGTTCTCCTTTTCTGTAGGTGCTTTGGATAAT-GT-TTTTTATATGATAA-----GTAATATTATGGACACTCAAGCAACTATAAAAGATTTCTCTCTAATTCCTTGGGAAAATGAACTTCATACGTTCATATGTTGACATCAATGATTAATATAGAATGTTTTATATATAATGCCTTGGTTGATATACCTATCAGTATTATTCTCATGTCTAAATAAAGA-TTGTA-TAAACTCCCTATGCCATATATTATTAATCTA---CT-ATTTACATG---AAA-TAATATAGAGATACAAATCCTTGTATATTATGAT-TGTGTGACAGAGTAACAAAGAGAAACAA-ACTTTGTATTAACAAAATAAACACATGAACAAT-ACATTTTATTTCTGCGTAAATCGATTAGAATTACAAAA-TCTCTTATCTTTCTGAATACAT-ATTTTTTATGAAATAGA-TTTAAAACA--TTTTGGTCCTTTTTACAGTTTTTCACAAACACT-ATCACATTTGAGCGCATGTTCGTAAGTGA----TAA-CTTTATTATGGCTATATGTGTA-TTCTTGTTGTCAGT--------A-TGCCTCGACCCTCC-GGTCATAGGTTAATTGGTTTGTTTTATTGTTTCAATGATAATGAATTGATTGGTGTTTTTTTTAAATATATTTAACTTTATAAAATTACGAAAATATTGATCCTAAATTTTAGGTTATATTTCTGCTTACTTAGTGTTGTTAGCACGAATTTCATATTACCGACGATAATACTCGAAATAGTACATGTAATTTTACCAGGTATATACATAAAATTAATCAGAATTATGTGTTACCTTAAATAAAACGTGTATTTGATTTAAA
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gi|11 : aattgtgatcattaaagtttaaacaaaagatgtttaaaggagagttactatcttaagctcagtttaagtttgtgttgagctcgtgatgtagtggtaaagcatcaaacccatgaacagagggttgtggatttgatccTAGGCT-CAG---CTGCTT-CTACCCAGGATT-ACTTGG--AA--CGTGAT-T-T------G-TCAAAGTTTTAAGATC-TTGT------TT--CACAATCGATGTT-AAAT-AAATGAGTT-TA
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gi|14 : tcgggtcatgcgttaatcggccctgtaacaacagggcgcccttaatcagcttaggatgacgggcataaagcgccgcggtgtattttatggtgaatttatgggcTACCCAAGAA----TTCA--ATATCTTTAT-T-T------G-TGTAAACTGTAAGAAC-TTGT------T---CATAATCGACGTG-AAAT-AAATAAGTTCTAATTTCAA--ACCAATAaaattcc
gi|16 : catatgtgagtcctttagaatCATGGCCATTTGTTGTGTACTTGTGAGTTAAACG---TTATCCAC----ATCAGCT-GAG-TACTAGTTTCTCTCC--GAAGTATTTCAGTAG--CTAAATGTAT------A-T------TGTAAGTTC-TTTT------TC--TAGAATCGccatactgttttactatgctgttatttgtatttagatatgtttaaataatcgtaatatatgcat
gi|18 : gttcgatacccaa------TGTAAAAAC-TTGT------T---CACGATCAATGTA-AAAA-CAATAAGCT-TAAACTGAA--A--AAGGTCAACTTCTA--ACTA---AGGTCACATACATTCTAT
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gi|21 : tatagccctttttatacttgagcagtgtattcgtcattagttctccttttctgtagatgctttggataatgttttttatatgataagtagtataacggacaatcaagcaactataaaagatttctctctaattcctttggaaaatgaacttcatacgttcatatgttgacatcaatgatttatatagaatgttttatatataattccgtggttgatatacctatcggtgttattctcatttctaaataaagattttattaactccctgtgccagatattgttaatttactatttacatgataaaaatccttgaattttatgattgtgtgacagagtaacaaagagaaacacactttgtattaacaaaataaacacataaacaacaaattctatttcagcgtaaatcgattagaattacaaaatatcttattttttgaatacatattttttatgaaatagatttttggtccttttttcattttttcgtaaacactatcacattttagcgcatatttgtaagtgataattaattttgattattgctatatgtgtattcttgttatcagtatgcaccattgcctcgaccctcgggtcataagttaattggtcctataacagcagggtacccgtgatacattgataacgaagggtattttgcatagctttgttttattctttcaatgataatgaattaattgttgttttttttaatatattaaactttatgaaattaagaaaatattgatcctaaattttacgttatatttctacgtagtgttgtaagcacgaatttcatattaccgacgataatacccgaagtattaaatgtaattttatcaggtatatacataaattaattagaaatatatgttaccttaaatgaggcgtgtatttgatttaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTGTTTTATTGTTTCAGTGATAATCAATTAATTG
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gi|9 : aaaaaaagaataaaacgtaaatatgtagcctatactattaagaccgttctgttatttgacaaaatgacaattgtgactataagagtcgtacagataatcgcgtggtccggtggtagagtattaaacccaggatcggaggtttctgggctcaatcctacccctaGCCACGGCTATGTATGGTGTCCTTG--AGCAATACGC-CTTTTCCAC----ATATGCT-TAA-TACTGGTT-CTGCCAAGGAAG-ACTTCG--AG--CACGAT-G-T------G-TCTAAGCTGTAAGAACTTTTT------TT--CACAATCGAAGTA-AAAT-AAATAAGTT-TAAgtggctgcgtga
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-1456 ) : TCCGCCACGGCTATGTGTGGTGTCCTTG--AGCAAGACACTTTNT-CCGC----ATANGCT-TAG-TACTGGTT-CTACCCAGGAAG-ACTTCGAG--C-GCGA--TTTG-C---A-A--TTGTAAGAAC-TTGTTTCACAATCGANGTA-AAAT-AAATAAGTT-TAAACTAAA--A--AATAT---NTTCTAAGACTGATTAGGCCAC-TAGNTTCTATGAGTGAAATAAGATATAACAAAAAATTAAAGCAGCAATATATA--GCCCCGCTTTTTATACTTGAGCAGTGTATTCGTCATTAGTTCTCCTTTTCTGTAGGTGCTTTGGATAAT-GT-TTTTTATACGATAA-----GTANTATTACGGACAATCAAGCAACTATAAAAGATTTCTCTCTAATTCCTTNGGAAAATGAACTTCATACGTTCATATGTTGACATCAATGATTNATATAGAATGTTTTATATATAATNCCGTGGTTGATATACCTATCGGTATTATTCTCATGTCTAAATAAAGA-TT-TA-T-AACTCCCTATGCCATATATTGTTAATNTA---CT-ATTTACA-----GAA-T-ATGTAGTGATANAAATCCTTGTATATTATGAT-TGTGTGACAGAGTAACAAAGAGAAAC-A-ACTTTGTATTAACAAAATAAACACATAAACAAC-A-ATTTTATTTCTGCGTAAATCGATTAGAATTACAAAA-TGTCTTATCTTTCTGAATACAT-ATTTTTTATGAAATANA-TTTAAAA-A--TTTTGGTCCTTTTTNCAGTTTTTCGCAAACACT-ATCACATTTTAGCGCATATTCGTAAGTGA----TAATCTTGATTACGGCTATATGTGTA-TTCTTGTTATCAGTATGCACC-A-TGCCTCGACCCT-C-GGTCATAAGTTAATTGGTTTGTTTTATTGTTTCAATGATAATGAATTAATTGNTGTTTTTTTTAAATATATTNAACTTTATGAAATTANGAAAATATTGATCCTAAATTTTANGTTATATTTCTGCTTACNTAGTGTTGTNAGCACGAATTTCATATTACCGACGATAATACCCGAAGTANTANATGTAATTTTACCAGGTATATACATAAAATTAATCAGAANTATGTGTTACCTTAAATGAGGCGTGTATTTGATTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATAAATATGGATATATTNATATTAGATNATATNTTGTTTTTTTGTAAAACAATATTATTATAAACATGCAAACAACTCGCAAATTAAGATAAAATACATATCTACAGAGGCTCCAAATNTCTAGCCCAGTAATATTGGCTTAATGTAACNCCNCGAAACACATTGAACAATATTGAACCCCTCGCACANACAATTTGTANATATATATACGGGTNATTTTCTTTCATGAGATTAAAATGTTCCCCCTTCAACAANGTNNAGTCACTTTAATTAAACAAAAAATGCNTCATCATATAATGATTACAATNNNGTCAATTNCCTCAAAAGTATATTATCTAGTTTGGTTCTGTCAATAAATATAAATATCATCCATTACANAGGAAACAAATACTATGTAGTGTTTATTGTTTAAAGTATTATTCTGTGTTTNAGAGCATTTTGNTGTNTATNGCTAGATAAATC
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