lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Reference ( gi|3 ) : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCACTTTTTTTACCGT
gi|11 : TATGGGGTACTTGAGCGATTTAGGGTCTGTACCA
gi|19 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAt
gi|18 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|17 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|14 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAa
gi|13 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAac
gi|9 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGTTCTGTAACAtaa
gi|15 : aatTATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTA
gi|10 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAAGGTCTGTAat
gi|5 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGTGTCTGTAtaac
gi|1 : gagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTCAGGCCTGTAC
gi|4 : tgaatgcgaaggcagtgtaatTATGGGATACTTGAAAGGTTAAGGGTCTGTACTAt
gi|8 : ggagagcaatTATGGG-TACTTGAGCGGTTTAGGGCCTa
gi|2 : ggagtgcaatTAAGGGGTACTTGAGCGGATTAGGTTCTGTA
gi|7 : gcaaacgaagtgcaatATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTACAACattg
gi|16 : ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTATCAatga
gi|12 : ATGGGGTACTTGACCAGTTTAGGGTCTGTA
gi|6 : TGGGGTACTTAAGTGGTTTAGGGTCTGTAGCAttcta
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Reference ( family-145 ) : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
gi|1 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTCAGGCCTGTAC
gi|10 : tgaatgcgaaggcagtgtaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAAGGTCTGTAt
gi|11 : TATGGGGTACTTGAGCGATTTAGGGTCTGTACCAtaac
gi|12 : ATGGGGTACTTGACCAGTTTAGGGTCTGTAt
gi|13 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAttcta
gi|14 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAtaa
gi|15 : TATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTAac
gi|16 : ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTATCAat
gi|17 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|18 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAa
gi|19 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|2 : TAAGGGGTACTTGAGCGGATTAGGTTCTGTA
gi|3 : gcaaacgaagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCACattg
gi|4 : TATGGGATACTTGAAAGGTTAAGGGTCTGTACTAtttttttaccgt
gi|5 : ggagagcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGTGTCTGTAa
gi|6 : gagtgcaatTGGGGTACTTAAGTGGTTTAGGGTCTGTAGCA
gi|7 : ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTACAACaaattat
gi|8 : TATGGG-TACTTGAGCGGTTTAGGGCCTatga
gi|9 : ggagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGTTCTGTAACA
blockSeqCons :
originalCons : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
finalCons : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Reference ( family-145 ) : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
gi|1 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTCAGGCCTGTAC
gi|10 : tgaatgcgaaggcagtgtaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAAGGTCTGTAt
gi|11 : TATGGGGTACTTGAGCGATTTAGGGTCTGTACCAtaac
gi|12 : ATGGGGTACTTGACCAGTTTAGGGTCTGTAt
gi|13 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAttcta
gi|14 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAtaa
gi|15 : TATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTAac
gi|16 : ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTATCAat
gi|17 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|18 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAa
gi|19 : TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|2 : TAAGGGGTACTTGAGCGGATTAGGTTCTGTA
gi|3 : gcaaacgaagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCACattg
gi|4 : TATGGGATACTTGAAAGGTTAAGGGTCTGTACTAtttttttaccgt
gi|5 : ggagagcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGTGTCTGTAa
gi|6 : gagtgcaatTGGGGTACTTAAGTGGTTTAGGGTCTGTAGCA
gi|7 : ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTACAACaaattat
gi|8 : TATGGG-TACTTGAGCGGTTTAGGGCCTatga
gi|9 : ggagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGTTCTGTAACA