lowQualScore                  :                                                         
lowQualScore                  :                                                         
lowQualScore                  :                                                         
consensus                     :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Reference ( gi|3 )            :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCACTTTTTTTACCGT
gi|11                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGATTTAGGGTCTGTACCA
gi|19                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAt
gi|18                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|17                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|14                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAa
gi|13                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAac
gi|9                          :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGTTCTGTAACAtaa
gi|15                         :                   aatTATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTA
gi|10                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAAGGTCTGTAat
gi|5                          :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGTGTCTGTAtaac
gi|1                          :             gagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTCAGGCCTGTAC
gi|4                          : tgaatgcgaaggcagtgtaatTATGGGATACTTGAAAGGTTAAGGGTCTGTACTAt
gi|8                          :            ggagagcaatTATGGG-TACTTGAGCGGTTTAGGGCCTa
gi|2                          :            ggagtgcaatTAAGGGGTACTTGAGCGGATTAGGTTCTGTA
gi|7                          :       gcaaacgaagtgcaatATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTACAACattg
gi|16                         :                       ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTATCAatga
gi|12                         :                       ATGGGGTACTTGACCAGTTTAGGGTCTGTA
gi|6                          :                        TGGGGTACTTAAGTGGTTTAGGGTCTGTAGCAttcta





Alignments
lowQualScore                  :                                                         
lowQualScore                  :                                                         
lowQualScore                  :                                                         
consensus                     :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Reference ( family-145 )      :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
gi|1                          :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTCAGGCCTGTAC
gi|10                         : tgaatgcgaaggcagtgtaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAAGGTCTGTAt
gi|11                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGATTTAGGGTCTGTACCAtaac
gi|12                         :                       ATGGGGTACTTGACCAGTTTAGGGTCTGTAt
gi|13                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAttcta
gi|14                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAtaa
gi|15                         :                      TATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTAac
gi|16                         :                       ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTATCAat
gi|17                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|18                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAa
gi|19                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|2                          :                      TAAGGGGTACTTGAGCGGATTAGGTTCTGTA
gi|3                          :      gcaaacgaagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCACattg
gi|4                          :                      TATGGGATACTTGAAAGGTTAAGGGTCTGTACTAtttttttaccgt
gi|5                          :            ggagagcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGTGTCTGTAa
gi|6                          :               gagtgcaatTGGGGTACTTAAGTGGTTTAGGGTCTGTAGCA
gi|7                          :                       ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTACAACaaattat
gi|8                          :                      TATGGG-TACTTGAGCGGTTTAGGGCCTatga
gi|9                          :            ggagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGTTCTGTAACA




blockSeqCons                  :                      
originalCons                  :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
finalCons                     :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC





Alignments
lowQualScore                  :                                                         
lowQualScore                  :                                                         
lowQualScore                  :                                                         
consensus                     :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
Reference ( family-145 )      :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCAC
gi|1                          :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTCAGGCCTGTAC
gi|10                         : tgaatgcgaaggcagtgtaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAAGGTCTGTAt
gi|11                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGATTTAGGGTCTGTACCAtaac
gi|12                         :                       ATGGGGTACTTGACCAGTTTAGGGTCTGTAt
gi|13                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAttcta
gi|14                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAtaa
gi|15                         :                      TATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTAac
gi|16                         :                       ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTATCAat
gi|17                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|18                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTAa
gi|19                         :                      TATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTA
gi|2                          :                      TAAGGGGTACTTGAGCGGATTAGGTTCTGTA
gi|3                          :      gcaaacgaagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGGTCTGTACCACattg
gi|4                          :                      TATGGGATACTTGAAAGGTTAAGGGTCTGTACTAtttttttaccgt
gi|5                          :            ggagagcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGTGTCTGTAa
gi|6                          :               gagtgcaatTGGGGTACTTAAGTGGTTTAGGGTCTGTAGCA
gi|7                          :                       ATGGGGTACTTGAGTGGTTTAGGGTCTGTACAACaaattat
gi|8                          :                      TATGGG-TACTTGAGCGGTTTAGGGCCTatga
gi|9                          :            ggagtgcaatTATGGGGTACTTGAGCGGTTTAGGTTCTGTAACA