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Reference ( gi|23 ) : TATCA--T-AT--CA-TTC-TG---T--ATT-A---T----------A-G--A-------ACATA----A-TAAA--G----C-G-----G------G-G--T------A-A--T---A---C-AA-AGTTT----TGC---T---TTA---T------CGG-C---------A-G--GTA---A--A-------G---TT----TA--------TC---CT-GCA-GC--AA--C-A--CA-A-GAAC------TGATGA-CGT---C-AT--T--G----TT----T--G--CAA--TG------TG-TTAA--T-CACAAG----AAC-------TGA----TGACGTC-A---TT-G---T----T----T---G-CAA--TGT-GT-TA-A-ACA-----------C-A-AG--AAC----T-GATGA-CGTCACT-G---TT--------T----GCAA--T-G-T---G---TTAAAC--AC---ACG-ACT-T--A-A---C-A---C---T--T---T-CT--------G-G--A--CCG-------T--------TG-------A--------C--------A---------A-------------T-----TA-------TG--------T-T---------G---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-T-----T--AAT-A-------A---T--C------A----TAA-----ATG--AG-T-C---GAAC---T-GT--------TT---CC-C-TA----A---A---A-----------A----------A-----C-------A--------A-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-C---A-T---TT-CAT-C----T--AT------------C-GA-A-TTT------G----GA-----ACA---------AT-TTT--------CAGGCGC-----ATTTAC--C-TC---TGAT-TA---AC--AC--ACA----TGCATT--TGTTTGT
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gi|2 : gTCA--T-AT--CA-TTA-TT---T--ATC-A---T----------T-C--T-------CCGTA----A-TAAA--G----C-A-----G------G-G--T------A-A--G---A---T-AA-ACTTT----AGC---T---TTA---T------CAG-C---------A-G--GGA---A--A-------A---TT----TA--------TC---AG-GCA-GC--AA--C-A--AA-C-AAAT------TTGTAA-TGT---C-AT--T--AT---TT----T--G--CGT--TG------TG-TTGA--tttctataaaaattacattttatttgttttaatttcaccaatcaaatattccaaacgcatttactgcagatatacacccatgcgtttctttgttcggctaaaatcagttattgtttttaaataaaaataaataaaacacatacttaatgacatgataaatag
gi|4 : CA--T-AC--TG-TTC-TG---T--ATT-A---T----------T-C--A-------ACGTT----A-TAAA--G----C-G-----G------A-G--T------A-A--G---A---T-AA-ACGTT----TGC---T---TTA---T------TGG-C---------A-G--GGA---A--G-------G---TT----TA--------TC---AG-GCA-GC--AA--C-A--CA-T-AAAT------TGGTGA-CGT---C-AT--T--GTT--TT----T--G--CGT--AG------TG-TTAA--acccacttttaaacacttttttattatcgttgttaaactatgttaattaatataacttataattataacaaagtcaaacagcttccataaaaactgctgttttaatttcattaatcaaatttggaactttgatctcagatatacactcatgagtttgtttgctggacttaaatcagttgttgtattattatttttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattaagcacttgccaaggctcgtgccttttttttttttcttctctagatatacctcacctgtaaatttcagattatcaggcacttacattgtatcctct
gi|18 : aCA--TCAT--CA-TCA-TG---C--ATT-A---T----------T-C--A-------GCATA----A-TAAA--C----C-G-----G------A-G--T------A-A--G---A---T-AA-ACTTT----TGC---T---TTA---T------CAG-C---------A-G--GGA---A--G-------G---TT----TA--------TC---TG-GCT-GT--AA--C-A--CA-A-AACC------TGATGA-CGT---T-------------TT----T--G--CGT--TA------TG-TTacctgcgtttaatcacatttactgttaattatgtcgtcaacaaatataaataataattataacagagtcgcacagcttccacgaaaactacatttgttttctttttatttcatcaatcaaatttggaactattttcaggcgtatttaccgcagatgtacacacatgcgtttattcgctggattgtaatcagttgttagtgtaaactgtttaaaaaaaaacaaaaacatattaatcacgcaattaaagacatgatcaatagacagtcaagataaatcgaaattatttaaaaactcgccaaatctcgggcctaaatttttgtctacctcacctcattatgagaaaccaacacgatattctctgtta
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gi|67 : g--T-AT--CT-TTA-TG---T--ATT-A---T----------T-C--C-------ACATA----A-TAAA--G----C-----------------------------------------------------TGC---T---TTA---T------TGG-C---------A-G--GGA---A--G-------G---TT----TA--------TC---TT-GTA-GC--AT--C-A--CA-C-AAAG------TGATGA-TTT---C-AT--T--A----TT----T--G--CGT--TG------TG-TTAA--ttgggttatgtaagacttacgtttaaacacttaaatttacaactgctgataaactgtttgttatgttgataattataaactaat
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gi|89 : t--T-AT--CA-TT---A---T--ATT-A---T----------T-C--T-------ACGTA----A-TAAA--G----C-G-----G------G-G--T------A-A------A---T-AA-A----------C---TC--TTA---T------CGA-C---------A-G--AGA---A--T-------G---CG----TA--------TC---AG-GCA-AT--AA--C-A--CA-C-ACAT------TGTTGA-CGT---C-AC----------TT----T--G--TAA--TG------Tacccgcgtttaaacacattttcgactgttgataaactgtatataatgtcaaaaatatacacttataattccaactgagtcaaa
gi|94 : --T-AT--CG-TT---G---T--ATC-A---T----------A-TC-A-------ATATG-------------------G-----A------G-G--T------A-A--G---A---T-AA-ATTTT----TGC---T---TTA---T------CAT-C---------A-G--TGG---A--T-------G---TT----TA--------TC---TT-GCA-G----A--C-A--------AAT------TGATGA-TGT---T-AT--T--G----TT----T--tt
gi|108 : cagtt--T-AT--TA-CTA-TG---T--ATT-AC--T----------C-T--A-------A-ATA----A-TTAA--G----C-G-----G------G-GG-T------A-A--G---A---T-AA-ATGTT----TGG---T---TTA---T------CGG-C---------A-t
gi|51 : tat-A---T----------G-G--A-------A-GTA----A-CAAA--G----T-G-----G------G-G--TT-----A-A--G---A---T-AA-ACATT----TGC---T---TTA---T------CAG-C---------A-G--GTA---A----------G---TT----TA--------TC---TT-GCA-GG--AA--T-A--CA-C-AAAT------TGATGA-CAT---C-AT--T--G----TT----TTAG--CCT--TG------TG-TCAA--tggaa
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gi|8 : tatcattttattatgtattattctacataataaaacggccgagggtaaagtaattatttgtttcatcagcagagaggttaatattgcagcaacacgcaaattga-------TGA----TGACGTC-A---TT-G---T----TTC--T---G-TGT--GGT-GT-TA-A-ACttacgtttaaacaggtttttttttaccgttgataatttgttaattatgccaatagttctaaacttatagttataactgagtcgatcagttttcataaaatctagcctactttaaattgtgttttgttttaatatcatcaatcaaatctagactgtgaccattttcaggcgccgcaaatgtaccgatgtgtacacacgtgtttgtttgctggact
gi|16 : tgtcatatcattatgtattattctacgtaataaaacaggacaaaataaactttttgcagcaacacacataaGAAGTC-A---TT-G---T----T----TTTTG-CGT--TGT-GT-TA-A-ACC-----------C-A-cggcgtttgaacacatttaccgttagttgacaaaacggttatgtcaataacaaaatcgaacagcttccataaaaactgcatttgttttgttttagttccttcattcaaatttggaactattttcagaagcattgaccccgcgaatgtgcagacacatgagtttgtttgctgggctaaaatcaattttgatgtttaaataaaacataaatcaaacatgcaaataaagacatggtacccgatagtcttaaatttatcagcttcggctcgactcgccaaagcttgtgccttatttttatctctacctcacctgattaaataattaattgatatttgatgtttttaat
gi|9 : agttaatcgtatcgctatgtattattctatatgctaaatcggggtggggataagataattttttgctttatcggcagg---TT-G---T----T----T---T-CA-----T-CC-TACA-ACA-----------C-A-CA--TAT----T-GAAGA-CGTCATT-GTTTTT--------T----ACGT--T-C-T---G---TTAAAT--CC---CTG-TTT-A--A-A---G-A---C---T--T---T-GT--------C-T--A--ACG-------T--------TGTTAAATTG--------CT-------A---------A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---G-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-C-----T--AAT-A-------A---TAAT------A----TAA-----CTG--AG-T-C---GAAC---A-GT--------TT---CC-A-TA----A---A---A-----------CCT--------A-----T-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-C----A--GT------------C-AA-A-TTT------G----GA-------A---------ATATAT--------CGGGTGC-----AATTTC--T-TC---AGAT-GT---AC--AT--ACA----TACGTT--TGTTTGtgttcaattactttttcgacgttcggaaaccgttaactattccataaacatacattaataattgtaactgagtcgaaattttccataacataaaatctatatttgatttgttttaatgtcatcaatcagaagttgaactattttcaggcacatttgccgcagatgtccacacattggtttgcttgctgatctacatacaaccaagcgttgtattttcaaacaaaaataataaacaagcaaataacggcatgatggatataataccatgtcaatgataatttaaagtttatcaggt
gi|47 : aggagattacatttttattcaaaattgaacgctctttgtgtat-G---T----T----T---A-TCA--TGCAGC-TA-C-ACA-----------C-A-A----AT----T-GATGA-CATCATT-GTT-TT--------T----GCGC--T-G-T---A---CTAAAC--TT---GTG--TT-T--AGA---C-A---T---T--T---T-TT----------A--A--CCA-------T--------TG-------A--------T--------A---------AATT----------T-----TA-------TG--------T-T---------A---T-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------A--------T--AAT-G-------A---T--T------A----AAA-----CGG--AG-T-C---GAACAGAT-GTTAAACAGCTT---CC-A-TA----A---A---ACTACATTACCCA----------G-----T-------A--------G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-C----A--AA------------C-AA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CAGctgaataaaaatcagttgtacattttttaaataaaaataaattaaaaactcaattaatgccattttgaatagaatgtcataattggttcgaaaataattaagcaatcaacaagtcacgcgcttaaactatccggcaataacatggtattctcta
gi|64 : ttatcacataattatgtattattctccgtaataaagttggcggggtaagataaacttttgctttatcagtcaggaag---T----T----T---G-CA--------T-TA-ACACA-----------C-A-AT----T----T-AATGA-CGTCATT-A---TT--------TTT--GCGT--T-G-T---G---TTAAAC--AT---ACG-TTT-C--A-A---C-A---CTA-T--T---T-CT-------------A--CTG-------T--------TG-------A--------TAAACTGTAA---------A-------------T-----TG-------TT--------T-T---------A---A-----C-T----A--------G--------T--------G----T-------AG-T-----C--AAT-T-------A---T--T------A----CTA-----TTG--AG-T-C---GA
gi|20 : caactttatcatacgaattattctaccacttaaaggggtggtaatgtaaaattttgctttatcgacagggaaggtttat----T----T---G-CAG--TG----------ACA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-CGCCATT-A---TT--------TTT--GTGT--G-G-T---G---CTAAAC---C----CG------------------------T--T---T-TT-------------A--CCA-------T--------TG-------G-----------------------------------------T-----GG-------TG--------T-T---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------A----CG------AA-T--------GAT-A-------G---T--T------T----TAA-------G--AG-T-T---CAAC---A-GC--------TT---CC-A-TG----A---A---A-----------ACT--------A-----C-------ATTTT----A-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-CTT------G----AA-----ACT---------AT-TTT--------CAGGCAT-----ATTTGC--T-GC---AGAT-CA---AC--AC--ACG----AG-A-T--TGTTTG
gi|49 : tatcatattgttttatattattctccatatttaggcaagagtaagataaacttttgctttattggcagggaaggtttatc--TGG-GT-TA-A-ACA-----------C-A-AC--AACAAAAC-AATGA-CGTCAT----------------------CAA--T-T-T---G---TTctggactaaaatcagttgttgatgccaaaataaaaatagatcaaacacacattccggtacacctaataaattttagactatcagacatttacatggtgttctctat
gi|10 : gcagcA-A-ACA-----------C-A--G--AA-----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------T----TGAA--TTG-T---A---TCAAAC--CT---ACG-TTT-A--A-A---C-A---TAG-T--T---T-C-----------G--A--CCG-------T--------TG-------A--------T--------A---------AGCTG---------T-----TAATTT---TG--------T-T---------G---A-----T-A----A--------A--------T--------A----AA------AACT-----T--AA--A-------A---T--T------T----TGA-----CCG--AT-T-C---GAAC---A-AT--------TT---CC-A-TA----A---A---A-----------A------------------------A--------A-------C------T----T--------A----A-----TTT-----G-C---A---------A--C----A--AT------------C-AA-A-TTT------T----GA-----ACT---------AC-TTT--------CAGGCAC-----ATTTA------C---TG---------C--AG--ACA----TGCGTG--TGTTcgttttaacccttttctaacgttaattaacttaaattatatcaataaatgtatatataaattaatatttataattgaatcgaacagttttaaaaataaagttcattcgtttggtaataatattatcaataaaattgaactaaacaaaaaaaaatatttttagtggcaactgtacacacatgcatttgtttgctgtactaaaacagttgctttttttttt
gi|84 : tatcatatcgttatgtatttttctacagaatatagcggggatttgataaacttttgctttttcggcagagaaggtttatcatacaggaA-A-ACA-----------C-A-A----AT----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------agctggactaaaacaagttgttgcatttttaaataaaatatataaaatatgcaaataatggcatgataaataatgatggatcaaaattgatgaagtaagttttttatgttcccttcctcacccgatacatttaagacaataaggcact
gi|63 : tatcttgtcattatgtattattgtacgtaatccagcggaataagataaactttttcattatcggcagggaaggtttatcaggtagccA-A-ACA-----------C-A-TA--AAT----T-GATGA-CATCATTCA---TT--------T----CCCT--T-G-T---G---TTAAAC--CC---AC--ATT-TA-A-A---C-T---C---T--T---T-TT--------T-G--A--CCA-------T--------TG-------A--------T--------G---------AACTG---------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-T----A--------A--------G--------A----TA------AA-C-----T--AAT-T-------A---T--T------A----TAA-----CTG--AA-T-G---GAAC---A-GT--------TT---CC-A-TA----A---C---A-----------ACT--------A-----C-------A--------A-------
gi|42 : tctacataataaaacagtggcccagtaagatcaacctttggtttatcggcagggaaggtttatcttgcggA-A-ACA-----------C-A-A----AC----T-G-T-----TTATT-G---T---------------CAT--T-C-T---G---TTAAAT--CT---GAG-ATC-A--A-A---T-A---C---T--T---T--T--------A-G--A--GTG-------T--------TA-------A--------T--------G---------AACTGTGGA-----T-----TA-------TGTCACTAAAT-T---------T---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-C-----G--GAC-A-------A---T--T------A----TA-----------AG-T-C---AAAT---A-GT--------TA---AC-A-TA----A---A---A-----------AC---------A-----C-------A--------AATTTG--T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-TAT-C----C--AT------------A-AA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CAGGCAT-----ATTTGA--A-AC---AGAT-CT---AC--AC--ACG----TG--TT--TGTTT
gi|55 : tttatcatataacaattctacattatacagtgggggcaagatgaaattttgctttatcagcagggaaggtttatcttgcagaaA-A-ACA-------------------AAC----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------TTG--GTGT--T-G-T---G---TT------------TG-ACC----------C-A---C---TC-T---T-CT--------T-C--A--CTG----------------TG-------------------------A---------A-------------T-----TA-------TA--------T-C---------A---A-----T-A----AATGTTTAGA--------T--------A----TA------AA----------AAT-A-------GAT-T--T------A----TAG-----ATT--AG-T-C---GAAC---A-GC--------TT---TC-------------A---A-----------A----------A-----T-------A--------A-------A------T----T--------C----A-----TTactcgactagaatca
gi|66 : aA-A-ACA-----------CTA-A----------T-GATGA-CGTCATT-A---TA--------T----GCGT--T-G-A---T---TTAAAC---CGTTACG-TTT-A--A-A---C-G---C---C--T---A-TA--------C-G--A--CTG-------A--------CG-------A--------T--------A---------AATGTTAC------T-----TA-------TG--------T-C---------A---T-----T-A----A--------A--------T--------A----CA------AA-C-----T--GAT-A-------A---T--T------A----TAG-----CTG--AG-T-------AC---A-GT--------TT---CT-A-TAT---A---A---A-----------A----------A-----C-------G--------A-------T------T----cgctttgaaataatatcagcaataaaattgaactaaactaaaaaaaaaactattttcagaggcaggtgcatttaattgctgtactaaaacagtaattgttgttgt
gi|19 : acaaaatattgccttacgtcgcataataccgattccatctg-A-ACAT----------C-A-AA--AAC----T-GATGA-CATCACT-GCT-TT--------T----GCAT--T-G-T---G---TTAAAC--CC---ATG-TTT-A--A-A---C-A---C---T--T---T-TT--------C-G--A--CCA-------T--------TG-------A--------T--------A---------AACTGTTACATACATG----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-G----A--------A--------T--------A----TA------AA-T-----C--AAT-A-------A---T--C------A----TAA-----CTG--AG-T-T---GAAC---A-GT--------TT---CC-A-TA----A---A---A-----------A----------A-----C-------T--------G-------T------A----T--------T----GTTTCTTTT-----T-A---A-T---TT-CAA-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----TCA---------AT-TTT--------CAGGTTC-----TTTTAC--C-GC---AGAT-TT---AC--A-----------GAGTT--TGTTTGatttt
gi|31 : atcatatcattatgtattattttacattttaaagcacttttgctttattggcgaagaaggtttatcttgtagc-A-ACA-----------C-A-AC--AAC----T-GATGA-CATCATT-G---TT--------TTT--GTGT--T-G-T---G---ATTTAC--CC---AAG-TTT-A--A-A---C-A---C---A--T---T-TT--------T-G--A--CCA-------T--------TG-------AT-------C--------A---------ACTGTTTA------T-----TA-------TG--------T-C---------T---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-T-----T--AAT-A-------A---T--C------G----TAA-----CTG--AA-T-C---TAAT---A-GT--------TT---A-----A----A---A---A-----------A----------A-----C-------A--------A-------C------TACATT--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----ATA---------AT-TTT--------CAGCCAC-----ATTTAC--C-CC---AGATGTA---GCCTACTAACA----AACGTT--TGTTTGctggactaaatttagttgtttcttttttagataaaaatacatgtaaataaaacatgcaaataatgaaattgtaaatagaataaaatgctagt
gi|4 : tttatcatatcattatgtattattcaacataacaaatcagcagtaaaaacattttctttatcagtagggaaggttaatcttgcagc-A-ACA-----------C-A-TA--AAT----T-GGTGA-CGTCATT-G---TT--------TTT--GCGT--A-G-T---G---TTAAAC--CT---GCG--TT-T--A-AT--C-A---CA--T--T---T----------------A--CTG-------T--------T--------------------------A---------A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------GTCAA-----C-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-T--------AAT-A-------A---T--T------A----TAA-----CAG--AG-T-C---GCAC---A-GC--------TT---CC-A-CG----A---A---A-----------ACT--------A-----C-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----C-----TTT-----T-T---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CAGGCGT-----ATTTAC--C-GC---AGAT-GT---AC--AC--ACA----TGCGTT--TATTCGcttgactaaaattagttggtgcttt
gi|25 : acatactgttctgtattattcaacgttataaagcggagtaagataaacgtttgctttattggcagggaaggtttatcaggcagc-A-ACA-----------C-A-AA--AAC----T-GATGA-CGTCGTT-G---TT--------T----TC-------------------------C---ACC-TTT-T--A-A---C-A---C---A--T---T-TT--------C-G--A--CCG-------TCGATAAACTG-------G--------T--------A---------A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----G-A----A--------T--------T--------A----TA------AA-T-----T--GAT-A-------A---T--C------A----CAG-----CCG--AG-T-C---AAAC------A--------TT---CT-A-TA----T---ATT-A-----------A----------A-----C---------------------------------------------T----A-----CAT-----T-A---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----ATA---------TT-TTT--------CAGGCGC-----AATTAC--C-CC---TGAT-GT---AC--AC--ACA----TACGTT--TGTTctggattgtaatcagttgttagtgtaaactgtttaaaaaaaaacaaaaacatattaatcacgcaattaaagacatgatcaatagacagtcaagataaatcgaaattatttaaaaactcgccaaatctcgggcctaaatttttgtctacctcacctcattatgagaaaccaacacgatattctctgtta
gi|39 : ttatcattattattatgtattaattattcaacatagtatggtgagggtaggaaaaactttaatttgctttatcgggagggatggtttatcttgcagc-A-ACA-----------C-A-AA--ACC----T-GATGA-CGTT--------TT--------T----GCGT--T-G-T---G---TTAAAC--TC---ACG-TTT-A--A-A---C-A---C---T--A---T-TT--------A-G--A--CTG-------T--------TG-------ATAAACTGGT--------A---------A-------------T-----CG-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A-----------------A----TG------GA-T-----G--AAT-A-------A---T--A------A----TTA-----CTG--AG-T-G---GAAC---A-GT--------TT---CC-A-T-----A---G---A-----------A----------A-----CTT-----AGGCTCTTTA-------T------T----TGTTG----T----A-----TTT-----T-A---A-T---TG-TAT-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------A----GA-----ACA---------AT-TTT--------CAGGCGC-----ATTTAC--T-TC---AGA--TA---A---------A----TGCGTT--TGTgattagactaacagattaagttgttgcttcttttgtaaataaaaataaataaaacatgcaaa
gi|45 : tcatcattatcatgcattattcagcataataaaccggagtaagataaacttttgctttatcagcagggaaggtttatctggctgt-A-ACA-----------C-A-AA--AAC----T-GATGA-TGTCATT-G---TT--------T----TTAT--T-G-TTTTG---TTAAGT--CC---A-G-ATT-T--G-AT--C-A---A---T--T---G-TT--------T-T--A--CCA-------T--------TGGTAA---A--------CTGTT----A---------A-------------T-----TA-------TG--------C-C---------A---A-----C-A----G--------G--------T--------A----TA------GA-T-----T--AAT-A-------C---T--C------T----TAA-----CCG--AG-TTC---GAAC---A-GT--------TC---CA-T-TA----A---A---C-----------T----------A-----C-------A-----------------------T----T--------T----G-----TTT-----------AGT---TT-CAT-C----A--AT------------CAGATA-TTT------G----G-------CC---------AT-TTT--------CAGGCGC-----ATTTAC--C-AC---AGAT-AT---AC--AC--GCA----CGTCTT--TGTTTGaaaattagtcgtcgtt
gi|21 : ggttaagataaacattagctttattgctagaaaagaagtatgttgcagc-A-ACA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-TGTCATT-G---TT--------TTT--GTT---T-G-T---G---TTAAAC--TC---GCG--TT-T--A-AATGC-A---A---TG-T---T----------------A--CCA-------T--------TG-------ATAAACTGTT--------A---------A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TG------AA-TGATTAT--AAT-A-------A---T--T------A----TGATGATTATAACAG-T-T---GAAC---A-GC--------TT---CT-CATA----A---A---A-----------ACT--------A-----C----------------A-------T------T----TGTGG----T----G-----TTT-----A-A---A-T---T---AT-C----A--GT------------T-AG-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CAGGCGC-----ATTTAC--C-GC---AGAT-GT---AC--AC--ACA----TGAGTT--TGCTTGctgggttaaaatcagaagttgttgcttt
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gi|22 : tttatcatattacatatttctccataatacagcggggaaagatacagttttacttaatgtttatcctgcagg-A-ACT-----------C-A-GA--AAT----T-GATGA-CGCCATT-GAT-TT--------T----GCAT--T-G-T---G---TTAAAC--CC---CAG-TTT-T--A-A---C-T---T---T--T---G-TT--------T-G--A--CCA-------T--------TG-------A--------T--------A---------AACAGTTAA-----T-----TA-------TT--------T-C---------A---A-----T-A----ATT------A--------G--------A----TA------AA-C-----T--CAT-A-------T---T--T------A----TAA-----CTG--AG-T-C---GAAC---A-CT--------TT---CT-A-TA----A---A---A-----------ATT--------A-----C-------A--------T-------TTTA---T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAC-C----A--AT------------C-AA-A-T--------------A--------------------TTC--------CAAACGC-----ATTTAC--T-GC---AGAT-AT---AC--AC--CCA----TGCGTT--TCTTTGTcggggaaacatcagatgatgtttttttttttt
gi|18 : gtcacgtcattacgtttaataccacataattaagcgggggataataaacactgttgccttatcggtagagaaggtttatcttgcagc-A-ACA-----------C-A-AA--ACC----T-GATGA-CGTT--------TT--------T----GCGT--T-A-T---G---TTTAAC--TC---TCG-TTT-A--A-A---C-A---C---T--A---T-TT--------A-G--A--CCG-------T--------TG-------ATAAACTGGT--------A---------A-------------T-----CG-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A-----------------A----TG------GA-T-----G--AAT-A-------A---T--A------A----TTA-----CTG--AG-T-G---GAAC---A-GT--------TT---CA-A-TA----G---A---A-----------A----------C-----T-------A--------AGGGGCTCT------T----TATTTGTTGT----A-----TTT-----T-A---A-T---TG-TAT-C----A--AT------------C-AT-A-TTT------A----GA-----ACA---------AT-TTT--------CAGGCGC-----ATTTA------------AT-CA---G---AT--ACA----TGCATT--TGTtcggctaaaatcagttattgtttttaaataaaaataaataaaacacatacttaatgacatgataaatag
gi|15 : aacatcatcatcatgcattattcagcataataaaccggagtaagataaacttttgctttatcagcagggaaggtttatctggctgt-A-ACA-----------C-G-CA--AAT----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------TTT--GCGT--T-G-T---G---TTCAAG--CC---ACG-TTT-A--A-A---T-T---C---T--T---T-CT--------C-G--A--CCG-------T--------TG-------A--------TGAACTGTTA---------A-------------A-----TA-------TG--------T-G---------A---A-----T-A----A--------C--------T--------A----TG------AA-C-----T--AAT-A-------A---C--T------A----TAA-----ATG--AG-T-A---GAAA---A-GT--------TT---CCAT-TA----T---A---A-----------ACT--------A-----C-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----G-G---A-T---TG-TAT-T----A--AT------------A-AA-A-TCT------G----A--------A---------AT-TTT--------TA--CGC-----AGTTG---------------TA---A---AC--ACA----TGCGTT--TGTTTaaaattagtcgtcgttgttgtaattaaaataataaaatatgcaaataatgacatgatacatataatagcatgttattgtctgatatgcttaa
gi|12 : ttttatcattatcattatgcattattctacataatgaagcaggggtaatagacgtttctttatcggaagggaatgtttaacttgcagc-A-ACA-----------C-A-CA--AAT----T-GATAA-CGTCA----------------------------------------TTCAACCAAC---ATG---T-T--A-A---C-A---C---T--T---T-TT--------C-G--A--CCG-------T--------TG-------A--------T--------A---------AACAGTTAA-----T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----T--------A--------T--------A----TC------AA-C-----T--AAT-T-------A---T--A------A----TG--------G--AG-T-C---AAAC---A-GT--------TT---TC-A-TA----A---A---A-----------A----------A-----CTAC----ATTT-----A-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---GT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----GCT---------AT-ATT--------TAAGCAC-----AGTTACAGC-ACA--TG-T-T-----C--AC--ACA----TGGTTT--GGTTTGccttgattaaaattagttgttgcctattttctaaaaaaaatgctttgtatttttctttatctcaccaaaaacattttagactattagtaactaacatgatgttctctat
gi|13 : catagtaaagcgggatatgataaatgttaactttatcggcagggaaggttaaccttgcagc-A-ACA-----------C-A-CA--AAA----T-GATGA-CGTCATT-GTT-TT--------T----GCGT--T-T-T---G---TTAAAT--CC---TCG-TTT-A--A-A---C-ACAGC---T--T---T----------------A--CCG-------T--------TA-------A--------C------------------A-------------T-----TATATAAACTG--------T-TAAGAATGCCA---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-T-----T---AT-A-------A---T--T------A----TAA-----ATG--AG-T-C---AAAC---A-GC--------TT---CG-A-TA----A---T---A-----------A----------C-----C-------AC-------A-------T------T----TG-------TTTGGG-----TTT-----T-A---A-T---AT-AAT-T----A--AT------------C-CA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AC-TTT--------CAGGCGC-----GTTTAT--C-GC---AGTT-GC---AC--AC--ACctggatcacaatcagttgctgttttttaaacaaagtaaaaacttattaaacagcaaatactaacatgataactataatacattgttagtgccaaggcttgtgcttaatttgtttctctacctcactcagtcaattttagattattgtactctaacatggtatt
gi|24 : ttatcatattattacgtagtattctgcgtaataaagcagagtaagcttaacttttgctttatcgataggaaaggtttatcaaactgc-A-ACA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-TATCATT-A---TT--------TTT--GCGT--T-T-T---G---TTAAAC--CC---AC--ATT-T--A-AA--C-A---C---A--T---T-AT--------T----A--CCG-------A--------TG-------A--------T--------AGTTA-----A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-T----A--------A--------T--------A----TA------AA-------T--GAT-A-------A---T--T------A----TAA-----tggactaaaagaagttgttggtatttgaatgaaaactgatgaaacaggcaaataaagacataataaatagaaaaccattttagtgccttatgttctaaaaggcatttaccag
gi|51 : tgttacatcattatgtattattcttcatgataaaatggggtaagataaacttttgctttaacagcaggtaatgtttattaggcagc-A-ATA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-CATCATT-G---TT--------TTA--GCCT--T-G-T---G---TCAAAC---C---AGC-ATT-TA-A-A---T-A---C---T--C---T-TT--------A-G--A--GCA-------T--------TG-------AT-------T--------AACTGTTT--A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-G----A--------C--------T--------A----TATT----AA-C-----T--CAT-A-------G---C--T------A----TAG-----TTG--AG-T-C---TAAC---ctattttcaggcccatttactgcagatgtacacacatgagtctgtttgctgagctaaaatcagttgtttatgtttaaatgaaaatatatcaaactggcaaacggagacatgataaatagagcacctaatcactgttcctgaaatctgccatgcagttaaccttcatctactt
gi|2 : tttgatcacatcattatgtattattctaagttgggttaagataaacatttgctttatcggcatggaagtaacaaagtggggttaagataaacatttgctttatcagcaggtaagtttatcttgcagg-A-ACA-----------A-A-CA--AAT----T-TGTAA-TGTCATT-A---TT--------TT---GCGT--T-G-T---G---TTGAAC--CC---ACT-TTT-A--A-A---C-A---C---T--T---T-TT--------T-ATTA--TCG-------T--------TGTT-----A-----------------A---------A-------------C-----TA-------TG--------T-T---------A---A-----T-T----A--------A--------T--------A----TA------AC-T-----T--A-T-A-------A---T--T------A----TAA-----CAA--AG-T-C---AAAC---A-GC--------TT---CC-A-TA----A---A---A-----------A----------------C------------------------T------G----C--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-T----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----AC-----------T-TT-----------G-------------AT--C-TC---AGAT-AT---AC--AC--TCA----TGAGTT--TGTTTG
gi|68 : tcatatcattatttatcattctccgtaataaagcagggtaagataaactttagctttatcagcagggaaaatttatcaggcagc-A-ACA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-TGTTAAT-A---TT--------TTT--GCAT--T-G-C---A---TTAAAC--A----GTG-TTT-A--A-A---C-A---CA--T--T---T-GT----------T--A--CCG-------T--------TG-------A--------T--------A---------A--------------------AC------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------ctggacttaaatcagttgttgtattattatttttagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattaagcacttgccaaggctcgtgccttttttttttttcttctctagatatacctcacctgtaaatttcagattatcaggcacttacattgtatcctct
gi|48 : ttatcatgtcatttttctattattctgcccattataaataaagtggggtaagaaaaacctttgctttataggcagggaatgtttatcttgaaac-A-ACA-----------C-A-AA--AGC----T-GATGG-CATCATT-G---TCAAACTTTGT----GCCT--T-G-T---A---TTAAAC--GC---GAG-TCT-T--A-A---C-A---A---T--T---T--T--------GTA--A--CCG-------T--------TG-------A--------T--------A---------AACTGT--------T-----TA-------TC--------A-T---------G---T-----C-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-T-----T--AAT-A-------A---T--C------A----TAA-----ATA--TGTT-C---AAAC---A-AT--------TT---CC-A-TA----G---A---A-----------ACTAGAGCCCTA-----T-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-G---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------C-
gi|35 : gatatatttatgcattattcaacataataaagaaggggtaaggaaaatatttgctgtatcagcagggaatgtgtatgttgcaac-A-ACA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGG-CGTCATT-GCT-TT--------T----GTAG--T-G-T---G---TGAAAC--CC---A-A-ATT-T--A-A---C-C---CA--T--T---T-TT-------------A--CCG-------C--------TG-------A--------T--------A---------AACTGTAAA-----T-----TA-------TGATA-----T-T---------G---AATTCAT-A----C--------A--------T--------A----CA------TA-C-----T--AAT-A-------A---T--T------A----TAG-----TTT--A--T-A---GA------------------T---CA-C-TT----G---A---A-----------A----------A-----T-------A-----------------------T----T--------T----G-----TTT-----T-T---A-T---TT-T----------------------------------------------GA-----ACA---------AT-TTT--------CAAGCA-----------------C---TGAT-GA---CT--GC--GCA----GGCATT--
gi|43 : atatcatatcgtcatgtgttgttctacataataaagtggaggtaagataatttgtagtcttgtcgacatggtatgtttatcttgcatc-A-ACA-----------C-A-CA--CAT----T--ATGA-TGTCATT-G---TTAT------T----GCGT--T-TCT---G---TTAAAC--TC---TTG--TT-T--ATA---C-A---T---T--T---T-CT--------C-G--A--CAG-------T--------TG-------A--------T--------A---------AACTGTTAA-----T-----TA-------TA--------C-A---------A---A-----T-A----C--------A--------T--------A----TA------AA-C-----T--AATCA-------A---T---------A----TAG-----CTG--AG-T-T---GAAC---A-AT--------AT---CC-A-TA----A---A---A-----------ACT--------G-----C-------A--------T-------T------TGGT-T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-GAC-C----T--AT------------C-AA-C-TTT------A----AA-----ACT---------AT-TTT--------CAGACGT-----ATTAAC--T-GC---AGAT-CT---AC--TT--ATATTGGTGTATT--TGCTtatttctgccctaaaatcagttgttacttttttaaacaacacttaataaaa
gi|8 : atcggcagggaaggtttatcttgacgc-A-ACA-----------C-ACAT--AA-----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------T-----CTG--T-G-T---GGTGTTAAAC--CG---GCG-TTT-G--A-A---C-A---CA--T--T---T----------------A--CCG-------T--------TA-----------------------------------------------------------------G--------T-T---------G---A-----C-A----A--------AACGGT---T--------A----TG---------T-----C--AAT-A-------A------C------A-----AA-----AT--------C---GAAC---A-GC--------TT---CC-A-TA----A---A---A-----------ACT--------G-----C-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---G-T---TC-CTT-C----A--TT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CAGAAGC-----ATTGAC--C-CCG--CGAA-TGTGCAG--AC--ACA----TGAGTT--TGTTTGggatttagaaatgtatactttaaataagtgtttcatgtaaacaagtaca
gi|59 : tgtcatatcattatgtattattctacgtaataaaacaggacaaaataaactttttgcagc-A-ACA-----------C-A-A---AAC----T-GATGA-TATCATT-GCT-TT--------T----TCTC--T-G-T---A---TT---C---C---ATG---T-T--G-A---T-A----------------------------A--A--TTG-------T--------T--------------------------A---------G-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------TA-T-----T--GAT-A-------A---C--C------A----TAA-----ATG--AA-T-C---TAAC---A-GT--------TC---CC-G-TA----A---G---A-----------A----------A-----C-------T--------A-------CA-----T----T--------T----G-----TTT-----T-----G-T---TT-GAT-T----T--ctgggctaaaatcaattttgatgtttaaataaaacataaatcaaacatgcaaataaagacatggtacccgatagtcttaaatttatcagcttcggctcgactcgccaaagcttgtgccttatttttatctctacctcacctgattaaataattaattgatatttgatgtttttaat
gi|91 : atcatagaatgatttattattcaacataataaagcgggattaagataaccgtttgctttttcgacagggactgtttgtcttgaagt-A-ACA-----------C-T-AA--AAT----T-GATGA-CGTCATT-A---TT--------T----caca
gi|1 : ttctaccgtaccattatgttttagtaaacattataaagcagggtaagataaacttttgctttcttatcttgcagt-A-ACG-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-AGTTATT-GAT-TT--------T----GCAT--T-G-T---G---TTAAAC---C---ACC-GTA-T--A-A-----A---C---TC-T---T-TT--------C-G--A--CCG-------T--------TG-------C--------C--------A---------A--------------------AC------TG--------T-T---------G---A-----T------------------------T--------A----TA---------T-----C--AAT-A-------A---A--T------A----TAA-----A---------C---CAAT---G-GT--------TTTATCC-A-TA----C---T---A-----------A----------C-----T-------G--------A-------A------T----T--------T----G-----TTT-----T-----A-T---TT-AATGC----T--ATCAAATTTTAAACC-AA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------ATTGCGC-----ATTTAC--C-AC---T----------T--AC--AGG----TGCTTT--TGTTTttgcg
gi|89 : aagcttagtatcagatggtgatctgggcgtaagttattctaaaggaccagtaaaggagagtaaatatcttttagaactttgaatatacttatccttatctagcagc-A-ACA-----------C-A-CA--CAT----T-GTTGA-CGTCAC------TT--------T----GTAA--T-G-T---actggactaaaatcagttgttgtatttttaaattaaaacaataaaacacacaaataatgaaattatcaataaaatacatataccatgtgttagtacctgatagcctaaaactttattagtgtcgcctcgaaaacagctacgcactcgccaaagttagtgcttaattatttgctctaacccaccttgtaaattaagacaaccaggcacttacatggtatcgtc
gi|29 : tatcattatattattctacgtaataaagcggggtaaataaactcttatcgacagagaatgcgtatcaggcaat-ACA-----------C-A-A-----T----T-GATGA-CATCAAT-A---TT--------TTTGTGTA-----G-T---G---TTAAAC--CC---AC--ATT-TTAA-A---C-A---C---T--T---T-TT--------G----A--CTG-------T--------TG-------AT-------C--------A---------ACTGCTGA------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------AA-------T--------A----TA------AA-C-----T--TAT-A-------A---T--T------A----TAA-----CTG--AG-T-C---ATAC---A-GT--------TT---CA-T-TA----G---A---A-----------A----------A-----T-------AC-------A-------T------TTGTCT--------T----G-----TTC-----T-A---A-T---TT-CAT-CAATTT--AT------------T-GT-T-TTT------------------ACT---------AG-TTT--------CCGGTGC-----ATTTCC--G-GC---AGAT-GT---AC--AC--ACA----AGC-TT--TGTTTGtt
gi|73 : ttttatctaacattatgtattattctacatactgaatagggggtaagataaactattgctttatcggtagtgaaggtttatcttgcagcatc-ACA-----------C-A-AG----T----T-GATGA-CATCATT-GTT-TT--------T----GCAT--T-G-T---G---TTGAAC--CC---ACG-TTT-A--A-A---C-A---ctgcactaaaatcaaattttgttctttt
gi|34 : catatcaagtacatttgtattacgttacattataaagcgtggaaatgttaaacttttgctttatcgacagggattgtttatcttgcagcagcCA-----------C-A-CA--AAT----T-GATGA-CATCATT-G---TT--------TTT--GCGC--T-G-T---G---TTAAAC--CC---AC---------A-A---C-A---C---T--T---T-TT--------C-A--A--CCT-------T--------TA-------A--------C--------A---------AACAGTTAG-----T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------T----TA------AA-C-----T--AAT-A-------A---T--T------A----TAA-----CCG--AA-T-C---
gi|56 : tttatcatatcattatgtattattctacataatacagcgagggtaatataaatttctgcttttttgttttcgacagggaaggtttatcttgcagcacCA-----------C-A-CA--AAC----T-GATGA-TGTCATT-A---TT--------TTT--GTGT--T-G-T---G---TTAAAC--AA---GTG--CT-T--A-AA--C-A---C---T--T---T-TT--------T-G--A--CCA-------T--------TATAA----A--------CTGTT----A---------A-------------T-----TA-------TG--------A-C---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TA------AA-C-----T--GAT-A-------A---T--T------A----TAA-----ATG--AG-T-C---GAAC---A-GT--------TT---CC-A-TA----A---A---A-----------AAAT-------A-----C-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-AGT-C----A--AT------------C----A-TTT------A----Gatacacacgtgtttgtgtttgctggattcaaatcaattgttgcatttttaaaacaaaaataaataagacacacaaataatgacatgataannnnnnnnnnaagtaaaataaatatgttta
gi|67 : tttatcgtatcatcatgtattattctacataataaagcggaggtaagatttaagttttttgCA-----------C-A-CA--AAG----T-GATGA-TTTCATT-A---TT--------T----GCGT--T-G-T---G---TTAAAC--CC---GTG-TTT-A--A-A---C-T---C---T--T---T-TT--------A-G--A--CCA-------T--------TG-------ATAAACTGTC--------A---------G-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---G-----T-G----A--------A--------T--------A----
gi|60 : tatctttatgtattattccacataataaagctgctttattggcagggaaggtttatcttgtagcatA-----------C-A-AGCAAAT----T-GATGA-TGTCGTT-G---TT--------TTTTTGCGT--T-G-T---C---TTAAAC--CC---GCG-TTT-A--A-A---C-A---C---A--T---T-TT--------C-G--A--CTG-------T--------TG-------A--------T--------A---------AACTGTATA-----T-----AA-------TG--------T-C---------A---A-------A----A--------A--------T--------A----TA------CA-C-----T--TAT-A-------A---T--T------C----CAA-----CTG--AG-T-C---AAAaaccagagacataatacacatta
gi|5 : ttatcaccgtattatgtatttttctacatacaaaacgggaataaaataaacgtttgctttattgacagggaacgaagttttatcttgcaga--AAT----T-GATGA-CGTAGTT-G---TT--------TTTGTGTA-----G-T---A---TTAAGT--A------GTATT-T------------------T--T---T-TT--------C-A--A--CCG-------T--------TG-------A--------TTAAGCGTTA---------A-------------T-----GG-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------A----TC------AA-C-----A--AGT-A-------A---T--T------A----TAA-----CTG--AG-T-C---GAAC---A-GT--------TT---TC-A-TA----A---A---A-----------AATCT------A-----C-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----TAA---A-T---TT-TGT-T----A--AT------------C-AA-C-TTT------G----GA-----ACT---------TT-TTG--------CAATCAC-----ACTTTC--C-TC---AGATGTA---A---AC--ACA----TGCATT--
gi|49 : tttatcacatcattatgtattattctacataataaagcgggggtaaaataaacttttgctttattgacagca--AAT----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------TTGTTGT----T-G-T---G---TTTAAC--CC---ACG-TTT-T--A-A---C-C---C---T--T---TTCT-------------A--ACG-------T--------TA-------A--------TTAACTTA-A---------A-------------T-----TA-------TA--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------TGTATAT--A----TA------AA-T-----T--AAT-A-------T---T--T------A----TAA-----TTG--AA-T-C---GAAC---A-GT--------TT--------TA----A---A---A-----------AT---------A-----A-------A--------G-------TTCA---T----T--------C----G-----TTTGGTAAT-A---A-T---AT-TAT-C----A--AT------------A-AA-A--TT------GAACTAA-----ACAAAAAAAAATAT-TTT--------TAGTGGC-----A---A------C---TG-T------AC--AC--ACA----TGCATT--TGTTTGtattcgctggattataaatcagttgttggtgttttgaaacaaaaataaataacacccaaataatgacatgataaaaaagaacaccattatcagtgcctgataatctaaaatttatcagtttgtctcattttttttattctacctcacctgataaattttagactatcggacacttttatggta
gi|3 : gcagcaacaAT----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------TTTT-GCGT--T-G-T---A---CTAAAC--CC---GCG-TTT-A--A-A---C-A---CA--T--T---T-TT-------------A--TCG-------T--------TG-------A--------TTAACTGTTA---------A-------------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------A--------A----AA------AA-C--------GAT-G-------A---T--T------A----TGA-----CAA--AG-T-C---GA-C---TAGT--------TT--------TG----A---G---A-----------A----------AGCCTAC-------ATTT-----G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----G-A---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-TTT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CGGGCGC-----ATTTAC--C-GC---AGAT-ctgtactaaaacagttgctttttttttt
gi|11 : tcatagcattatgtattctacgtaataaagtggggtaagataaatgtttgctttatcggcaggaaaggtttatcttgcagcaacccacatAT----T-GATGA-CGTCATT-G---TTAC------T----GCGT--T-G-T---C---CTAAAC--CC---AC--ATT-T--A-AG--C-A---CCGGT--T---T-------------A--A--CCA-------C--------TG-------A--------C--------A---------A-----------------------------A--------C-T---------G---A-----C-A----A--------A-----------------A---------------------T--AAT-A-------A---T--C------A----TAA-----AAG--AA-T-C---GAAT---G-AC--------TT---CC-A-TG----A---A---A-----------ACT--------A-----C-------ATTT-----G-------T------T----T--------C----G-----TTT-----T-A---A-----TT-CAT-CA---A--AT------------C-AA-A-TGT------G----GA-----ACT---------AT-TTT--------CAGGCAC-----ATATAC--C-Tgtgctggacttgaatcagtggttggtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatgaagcaatggccaagttccgtgcctctttttctctaccttacctgattatatagattatcaatcactgacatggtat
gi|65 : tatcaatcattttgtattattctgcataccggtacatatgtaataaagcagggtgaaataagcttttgctttttcggcagggacagtttatcttgcagcaactcacatAT----T-GATGA-CGTCATT-GTT-TT--------T----GGGT--T-A-T---G---TAAGAC--TT---ACG-TTT-A--A-A---C-A---C---T--TAAAT-TT--------ACA--A--CTG-------C--------TG-------A--------T--------A---------AACTGTTTG-----T-----TA-------TG--------T-T---------G---A-----T-A----A--------T--------T--------A----TA------AA-C-----T--AAT-aaaagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaagcacttgccaaggtttgtgcataatttttctctaccttacctgataaatctaagactatcagacactgacat
gi|28 : gtatcagtatgtattagtctgcataataaagcgggggtaaagataaacgtttgctttatctgcagggacggtttatcttgcagtaacacttac----T-GATGA-CGTCATT-G---TT--------T----TAGAGTT-G-T---A---TTAAAC--TT---ACG-TTT-A--A-A---C-AGGTT---T--T---T-TT--------T-T--A--CCG-------T--------TG-------A--------T--------A---------A-------------T-----T--------TG--------T-T---------A---A-----TTATGCCA--------A--------T--------AGTTCTA------AA-C-----T--TAT-A-------G---T--T------A----TAA-----CTG--AG-T-C---GATC---A-GT--------TT---TC-A-TA----A---A---ATCT--------A----------G-----CCTACTTTA--------AATTGTG-T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---AT-CAT-C----A--AT------------C-AA-A-TCT------A----GACTGTGACC---------AT-TTT--------CAGGCGCCGCAAATGTAC--C-------GAT-GT---GT--AC--ACA----CGTGTT--TGTTTG
gi|52 : tatcattttattatgtattattctacataataaaacggccgagggtaaagtaattatttgtttcatcagcagagaggttaatattgcagcaacacgcaaattgaATGA-CGTCATT-G---TT--------TTT--ACGT--T-G-T---GAG-TTAAAC--CA---ACG--TT-C--A-AATCT-A---C---T--T---T-TT--------C-G--A--CCG-------T--------CA-------A--------C--------A---------A-------------G-----C--------TG--------T-T---------A---A-----T-ATT--A--------A--------T--------G----TATCAATCAA-T-----TTAAAC-ATACGTGTA---T--T------A----TAA-----ATG--AG-T-C---TAA---------------------------A----A---A---A-----------A----------A-----CTTT----G--------T-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-C----A--AT------------A-AC-A-TTT------G----CA-----ATT---------AT-TTC--------CAGACGT-----ATTTGC--C-GC---AGAT-TT---AC--AA--ACA----TGCGTT--TGctggact
gi|16 : gtGA-AGTCATT-G---TT--------TTTT-GCGT--T-G-T---G---TTAAAC--CC---ATG--TT-C--A-A---TTA---C---T--T---T-TTCGACGTTCG-G--AAACCG-------T--------TA-------A--------C--------------------------------------TA-------T---------T-C---------C---A-----T-A----A--------A--------C--------A----TA------CA-T-----T--AAT-A-------A---T--T------G----TAA-----CTG--AG-T-C---GAAA---T--T--------TT---CC-A-TA----ACATA---A-----------A----------AT----C-------T--------A-------TATTTGAT----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---GT-CAT-C----A--AT------------CAGA-A-GTT------G-----A-----ACT---------AT-TTT--------CAGGCAC-----ATTTGC--C-GC---AGAT-GT---CC--AC--ACA----TTGGTT--TGCTTGcattcggagctcctcgggcactattcgcacttttt
gi|17 : agttaatcgtatcgctatgtattattctatatgctaaatcggggtggggataagataattttttgctttatcggcaggGA-CTTCATT-GAT-TT--------T----GT----T-G-T---GGTTTTAAGC--CC---CCT-TTT-A--A-A---C-A---C---T--T---T-TT--------C-A--A--CCC-------T--------TG-------A--------T--------A---------AGCTTAA-------T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----C-A----A--------A--------T--------A----TT------AA-C-----T--TAT-A-------A---T--T------A----TAA-----CCA--AG-T-C---GAAC---A-GT--------TT---CC-A-TA----A---ATT-C-----------T----------A-----T-------A--------T-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-TTTAG-T---TT-TGT-T----T---T---------------A-A-TTTCAATAAG----AA-----AAA---------AA-TTT--------CATGCGC-----ATTTAC--T-GC---AGAT-GT---AC--AA--ACA----TGTGTT--TGctgatctacatacaaccaagcgttgtattttcaaacaaaaataataaacaagcaaataacggcatgatggatataataccatgtcaatgataatttaaagtttatcaggt
gi|6 : attgtataattatgtatcattctacataatagagcgagagtaacacaaactactgctatatcagcagggaaggttttgtgGTTACC-----TT--------T----GCAT--T-G-T---A---TTGAAC--CC---ATA-ATT-A--A-A---T-A---C---T--T---T-TT--------T-A--C--CTG-------T--------AG-------A--------T--------A---------AATTGTTTA-----T-----TA-------TG--------T-C---------A---A-----T-A----A--------T--------T--------A----TA------AA-C-----T--GAT-A-------A---T--A------ACTATTAA-----CTC--AG-T-C---AAAC---A-AT--------TT---CC-A-TA----A---A---ATCTAT------A----------G-----T-------G--------G-------T------T----T--------T----G-----TTT-----T-G---A-T---TA-TAT-A----A--AT------------C-AG-T-TTT------G----GA-----ACT---------GT-NNN--------NNNNNNN-----ATCTAaccgcaatgtacaaacatgtgtttgtttgatggcttaaaatcagttgttattttttttaaataaaaataaataaaacacaaaattaatgacatgaaaaatagaataccatg
gi|27 : tttgcattatcaacagggaatatttatcttgcagcaacacacaaatagatgatgtctattttgttgtgttaatccaacatttaaacagttttttgactgtggtgaacctttaattatttcattaaacgttaacattaattatctatgaatcaaacaatttccattaaatctaca---TT--------T----TCAT--T-G-T---G---ATAAAC--TT---GCG-TTT-A--A-A---C-A---CG--T--T---T-TT-------------A--CCA-------T--------TA-------A--------TCAACTGTTA---------A-------------T-----TA-------TG--------T-T---------A---A-----T-A----A--------A--------T--------A-----A------AG----------GAT-A-------A---T--T------G----TAA-----CAG--AG-T-C---AAAC-----AT--------CT---TC-C-TA----A---A---A-----------A----------C-----T-------A-----------------------T----A--------T----G-----TTT-----T-T---G-TAAGTT-CAT-C----A--AT------------G-AA-A-ATT------G----GA-----ACtagtggttttgttttgattatataaatcagttttggaactgttttcaggcgcatttattccagatttacacacatccattcattagccagactaaatcatttacttcttt
gi|30 : tctT--------T----GCGG--T-G-T---G---TTAAA---AC---A-G-CCTGT--A-A---G-A---T---TGAT---T-TC--------G-A--A--CTA-------T--------TT-------A--------C--------A---------A-------------T---------------G--------T-T---------G---A-----T-G----A--------A--------TTTTAAGATA----TA------AC-C-----G--AAT-A-------A---T--T------A----AAA-----TTG--AG-T-C---GAAC---T-G---------TT---CA-C-AAAAATA---A---A-----------A----------A-----C-------A--------AATTG---T------T----T--------T----G-----TTT-----T-A---T-T---TT-CAT-T----A--AT-----------------A-TTT------G----GA-----AAT---------AT-TTC--------CATGCGC-----ATTTGT--C-GC---AGAT-GT---GT--GC--ACA----GACGTT--TGTtgttggtatgctggtctaaattcagtatcggtttctataaaaagtgatccagcacggtgttaatgacataatacacagaataccgtgttagtgcctgatagtctaggtctaaaattcataaagttcggctcgaaaacaaaaatgaacaatcgcctactcgtacatacatttgtctctacctctcctgataaagataagactatcaggcac
gi|46 : --A-A---C-A---C---T--T---T-TT--------T-G--A--CCA-------T--------TGCTTT---A--------C--------TGCCCGGTTTA-------------G-----TA-------TA--------T-C---------A---A-----T-A----G--------A--------T--------A----CA------AA-T-----T--AGT-T-------A---T--C------A----TAAAGGT-ATG--AG-T-T---GAAC---A-GA--------TA---CC-G-TA----A---A---A-----------ACT--------A-----C-------A--------A-------CTGTCAGT----T--------T----G-----TTT-----T-A---A-T---TT-CAT-T------------------------A-A-TCT-----------GA-----ACA---------CA-TTT--------CAGATGC-----A-CTGT--C-CC---AGAT-GT---AC--CT--ACA----TGAGTT--TGCTTGggctagaaacagcttttgatatgatcactgaaacaacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgacttctttttctgaaccgcatctgatcaaa
gi|53 : ta--A--CTG-------T--------TA-------A--------C--------------------------------------TA-------TA--------T-C---------A---A-----T-A----A--------A--------C--------A----TA------AA-C-----T--ACC-A-----------T--CTGCTGTA----TAA-----CTG--AA-T-T---GAAC---T-GT--------TT---CC-A-CA----A---A---A-----------A------------------------A--------A-------C------T----A--------C----A-----TTT-----G-A---A-T---TT-AAT-C----A--AT------------C-AA-A-TAT------G----GA-----ACT---------GT-TGC--------CAGctaatagttgttattttcgtaataaaaataaataaaaaaatgcaattaatggcaagatacaataccatgttttataactagtgcacgagagtttaaaatgtatcatgtt
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30 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1417 ) : TATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----G-AAGG---T--T----TATCTTG---CA-GCA--ACA-CANAAA------TTGATGACGT---C---A--T--T--G------T--T--T--GCG--TTG------TG------------TT-AA--NCACA------A--------AAATTGAT---GA-CG-TC-----ATTGT----TT--GCGTT-G-T-GT-TA-A-ACA-CAN-AAATTGATGA---CGT---CA---TT-G--T------T--T----GC-G--TT-G-T---G---TTAAACC--CGCGTT--TNAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----A--------T--------A--------A-------------T-----------T--------A----TG---------TC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--T------TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------A--------A-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--ACATGCGTTT-GTTTGT
gi|1 : --T----TATCTAG---CA-GCA--ACG-CACAAA------TTGATGAAGT---T---A--T--T--GAT----T--T--T--GCA--TTG------TG------------TT-AA--AC
gi|1 : aagcttagtatcagatggtgatctgggcgtaagttattctaaaggaccagtaaaggagagtaaatatcttttagaactttgaatatacttatcc-A-ACG-CAC-AAATTGATGA---AGT---TA---TT-GATT------T--T----GC-A--TT-G-T---G---TTAAACC--ACCGTA--TAAA--C--T---C--TT---TT--CG--A--CCGT--------T-------GCCAAACTGT----T--------G--------A-------------T-----------T--------A----TA---------TC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----CAA----TG-----G--T------TT-TA--------------------------------------------TC-CATA-C---T----A-----------A----------C------------T-------G--------A-------A------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-ATTTAATGCTAT-CAAATTTTA-AACCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTATTGCGC-----ATT---------TA--CCA-------C---T------T--AC--AGGTGCTTTT-GTTTcaccgtataaactcttttcgaccgttgccaaactgttgattatatcaataaatataaaccaatggttttatccatactaactgaatttgttttatttaatgctatcaaattttaaaccaaatttggaactattttattgcgcatttaccacttacaggtgcttttgtttactggactaaaatcagttgttgtatttttaaattaaaacaataaaacacacaaataatgaaattatcaataaaatacatataccatgtgttagtacctgatagcctaaaactttattagtgtcgcctcgaaaacagctacgcactcgccaaagttagtgcttaattatttgctctaacccaccttgtaaattaagacaaccaggcacttacatggtatcgtc
gi|10 : aagcttagtatcagatggtgatctgggcgtaagttattctaaaggaccagtaaaggagagtaaatatcttttagaactttgaatatacttatccttatctagcagcTATCA--T-ATCGTT--A-TG-T-ATTT----TTCTA-C-----A-GA--------------A-TAT---A--G----C-G-G------G-GAT------T-T-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTTT------CGGC--------AGA----G-AAGG---T--T----TATCATA---CA-GGA--AAA-CACAGA------ATGATGACGT---C---A--T--T--GT-----T--T--T--GAA--TTG------TA------------TC-AA--ACactggactaaaatcagttgttgtatttttaaattaaaacaataaaacacacaaataatgaaattatcaataaaatacatataccatgtgttagtacctgatagcctaaaactttattagtgtcgcctcgaaaacagctacgcactcgccaaagttagtgcttaattatttgctctaacccaccttgtaaattaagacaaccaggcacttacatggtatcgtc
gi|10 : A-A-ACA-CAG-AA--TGATGA---CGT---CA---TT-G--T------T--TT---GA-A--TT-G-T---A---TCAAACC--TACGTT--TAAA--C--A---T--AG---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----A--------T--------A--------AGCTG---------T-----------T--------AATTTTG---------TT---G---------AT----A--A--------A--------T------AA------A--AAC-----TTA----AA-----A--T------TT-TGAC----CGA--------T-T-CGAAC--AA-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A--------------------A------------------------------------------------------C--T-----T-AATT-------TGCA-----AC-AATCA-A--A-T-TTT--GA-----AC--------------TA---C-TTTCAGGCAC-----ATT---------TA--CTG-------CAG---------------ACATGCGTGT-GTTctacgtttaaacatagtttcgaccgttgataagctgttaattttgttgataaataaaaacttaaaattttgaccgattcgaacaatttccataaaaaaacttaatttgcaacaatcaaattttgaactactttcaggcacatttactgcagacatgcgtgtgttagctggactaaaacaagttgttgcatttttaaataaaatatataaaatatgcaaataatggcatgataaataatgatggatcaaaattgatgaagtaagttttttatgttcccttcctcacccgatacatttaagacaataaggcact
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gi|19 : aacatcatcatcatgcattattcagcataataaaccggagtaagataaacttttgctttatcagcagggaaggtATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTTTA-C-----A-TT--------------T-TAA---A--G----C------------------------------------AC--TTT----TGCT---TTAT------TGGC--------GAA----G-AAGG---T--T----TATCTTG---TA-GCA--ACATCAAAAA------CTGATGACAT---C---A--C--T--GCT----T--T--T--GCA--TTG------TG------------TT-AA--ACCCA------aaaattagtcgtcgttgttgtaattaaaataataaaatatgcaaataatgacatgatacatataatagcatgttattgtctgatatgcttaa
gi|19 : -A-ACATCAA-AAACTGATGA---CAT---CA---CT-GCTT------T--T----GC-A--TT-G-T---G---TTAAACC--CATGTT--TAAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCAT--------T-------G----A--------T--------A--------AACTGTTACATACATG----------T--------A----TG---------TC---A---------AT----G--A--------A--------T------AT------A--AAT-----CAA----TA-----A--T------CA-TAAC----TGA--------G-T-TGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------T--------G-------T------A---------T--------TGTTTCTT----T--T-----T-AATT-------T-CA-----AC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----TC--------------AA---T-TTTCAGGTTC-----TTT---------TA--CCG-------CAGATTTA---C--A-------GAGTTT-GTTTGtgtttaaacactttttcgaccattgataaactgttacatacatgtatgtcaatgaatataaatcaataatcataactgagttgaacagtttccataaaaaactgtattgtttctttttaatttcaacaatcaaatttggatcaattttcaggttcttttaccgcagatttacagagtttgtttgctggactaaatttagttgtttcttttttagataaaaatacatgtaaataaaacatgcaaataatgaaattgtaaatagaataaaatgctagt
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gi|10 : aagcttagtatcagatggtgatctgggcgtaagttattctaaaggaccagtaaaggagagtaaatatcttttagaactttgaatatacttatccTATCA--T-ATCGTT--A-TG-T-ATTT----TTCTA-C-----A-GA--------------A-TAT---A--G----C-G-----G------G-GAT------T-T-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTTT------CGGC--------AGA----GAAGG---TT----TATCATACA-GGAAAA-CAC--AGA--------A---TGATGACGT---C---A--T--T--GT-----TT--T--GAA--TTG------TA---TCAAACCTAactggactaaaatcagttgttgtatttttaaattaaaacaataaaacacacaaataatgaaattatcaataaaatacatataccatgtgttagtacctgatagcctaaaactttattagtgtcgcctcgaaaacagctacgcactcgccaaagttagtgcttaattatttgctctaacccaccttgtaaattaagacaaccaggcacttacatggtatcgtc
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gi|70 : tatcataccattatgtattattctacatagtaacgcgaaattaagataaacttttgctttatctgcaaggaatgctaatcttgttggtaaaactgtttgT---------TA--TCA-------CAGATGTT---C--AC--AGATGCGTTT-GTTTGctggattaaaaccagttgttgctttttttaaaacaaaacgaaatataacacgcaaataataacatgataactaaaatacatgttagtgcctgctagtcttaagattatcaaagtcagtacgaaaagattaagtactcggcatggctcctacttaatttttgtctttacctcacctgacaagtttcaggctatcagatacttacatgatattct
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gi|72 : -----T-GATT-------T-CA-----CC-AATTA-G--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTCCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--TCGTGCGTTT-GTcataccccaacatgtctaaacttctgatttttatca
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23 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1417 ) : TATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATCTTG---CA-GCA-ACA-CAC--AAA-----------T---TGATG----------ACGT-----C---A--T--T--G------TT--T--GCG--TTG------TG---TTAAAC-----CCA-A--------A--A-------T-TTGATCA--C--G-T---C-----AT----TGT---TTATC-T-TG----CA----GC------AACA-CA-CAAATTG-ATGA---CGTC-ATT-G-T-----T----T-T---G--C-G--TTG-TG---TTAAACC--CGCGTT--T-AAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----A--------T--------A--------A-------------T-----------T--------A----TG---------TC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--T------TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------A--------A-------T------T------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--ACATGCGTTT-GTTTGT
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gi|10 : GT---TTATC-A-TA----CA----GG------AAAA-CA-CAGAATG-ATGA---CGTC-ATT-G-T-----T----T-T---G--A-A--TTG-TA---TCAAACC--TACGTT--T-AAA--C--A---T--AG---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----A--------T--------A--------AGCTG---------T-----------T--------AATTTTG---------TT---G---------AT----A--A--------A--------T------AA------A--AAC-----TTA----AA-----A--T------TT-TGAC----CGA--------T-T-CGAAC--AA-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A--------------------A---------------------------------------------------C--T-----T-AATT-------TGCA-----AC-AATCA-A--A-T-TTT--GA-----AC--------------TA---C-TTTCAGGCAC-----ATT---------TA--CTG-------CAG---------------ACATGCGTGT-GTTcgtttaaacatagtttcgaccgttgataagctgttaattttgttgataaataaaaacttaaaattttgaccgattcgaacaatttccataaaaaaacttaatttgcaacaatcaaattttgaactactttcaggcacatttactgcagacatgcgtgtgttagctggactaaaacaagttgttgcatttttaaataaaatatataaaatatgcaaataatggcatgataaataatgatggatcaaaattgatgaagtaagttttttatgttcccttcctcacccgatacatttaagacaataaggcact
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gi|70 : tatcataccattatgtattattctacatagtaacgcgaaattaagataaacttttgctttatctgcaaggaatgctaatcttgttggtaaaactgtttgT---------TA--TCA-------CAGATGTT---C--AC--AGATGCGTTT-GTTTGctggattaaaaccagttgttgctttttttaaaacaaaacgaaatataacacgcaaataataacatgataactaaaatacatgttagtgcctgctagtcttaagattatcaaagtcagtacgaaaagattaagtactcggcatggctcctacttaatttttgtctttacctcacctgacaagtttcaggctatcagatacttacatgatattct
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gi|79 : atataacgttgtttgTATCA--T-ATCATT--T-TG-T-ATT------TATA-C-----A-TA--------------A-TAC---A--G----C-T-----T------G-G-C------A-A-GATGA------AG--TTT----TGCT---TCAT------CGGC--------AGA----AAAAC---TT----TATCTTG---CA-ACA-ACA--AC--AAA-----------A---TGATG----------ACCT-----C---A--T--T--G------TT--TTATTG--TTG------TG---TTGAgaaagt
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23 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|56 : ttCA-CA-CAAACTG-ATGA---TGTC-ATT-A-T-----T----T-TT--G--T-G--TTG-TG---TTAAACA--AGTGCT--T-AAA--C--A---C--TT---TTT-TG--A--CCAT--------TATAAACTG----T--------T--------A--------A-------------T-----------T--------A----TG---------AC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TGA----TA-----A--T------TA-TAAA----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------AAAT-------A------------C-------ATTT-----G-------T------T------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-AG-----TC-AATC-----A-T-TTA--Gttttttgaccattataaactgttaattatgacaataaatataaactgataattataaatgagtcgaacagtttccataaaaaaatacatttgttttgttttaatttagtcaatcatttag
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Reference ( family-1417 ) : TATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATCTTGCA-GCAACA-CAC--AAA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--G----T------T--T--G------CG--TTG------TG---TTAAAC--CCA-AC--GTT--T----AAACA----------C---G---TT-----AT-TGT---TT--ATC-TTG-CAGC------AACA-CA-CAAATTGATGA---CGTCATT-G-T-----T-T-T---G--C-G--TTG-TG---TTAAACC--CGCGTT--T-AAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----A--------T--------A--------A-------------T-----------T--------A----TG---------TC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--T------TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------A--------A-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--ACATGCGTTT-GTTTGT
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gi|17 : agttaatcgtatcgctatgtattattctatatgctaaatcggggtggggataagataattttttgctttatcggcaggATTG--T-ATAATT--A-TG-T-ATCA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAG---A--G----C-GA----G------A-G-T------A-A-CACAA------AC--TAC----TGCT---ATAT------CAGC--------AGG----GAAGG---TT--------TTG------------------------------TG--GACTT---C---A--T--T--G----A------T--T--T------TG--TTG------TGGTTTTAAGC--CC--CC--TTT--T----AAACA----------C---T---TT-----ctgatctacatacaaccaagcgttgtattttcaaacaaaaataataaacaagcaaataacggcatgatggatataataccatgtcaatgataatttaaagtttatcaggt
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gi|70 : tatcataccattatgtattattctacatagtaacgcgaaattaagataaacttttgctttatctgcaaggaatgctaatcttgttggtaaaactgtttgT---------TA--TCA-------CAGATGTT---C--AC--AGATGCGTTT-GTTTGctggattaaaaccagttgttgctttttttaaaacaaaacgaaatataacacgcaaataataacatgataactaaaatacatgttagtgcctgctagtcttaagattatcaaagtcagtacgaaaagattaagtactcggcatggctcctacttaatttttgtctttacctcacctgacaagtttcaggctatcagatacttacatgatattct
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23 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|56 : ttCA-CA-CAAACTGATGA---TGTCATT-A-T-----T-T-TT--G--T-G--TTG-TG---TTAAACA--AGTGCT--T-AAA--C--A---C--TT---TTT-TG--A--CCAT--------TATAAACTG----T--------T--------A--------A-------------T-----------T--------A----TG---------AC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TGA----TA-----A--T------TA-TAAA----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------AAAT-------A------------C-------ATTT-----G-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-AG-----TC-AATC-----A-T-TTA--Gaccattataaactgttaattatgacaataaatataaactgataattataaatgagtcgaacagtttccataaaaaaatacatttgttttgttttaatttagtcaatcatttag
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gi|70 : tatcataccattatgtattattctacatagtaacgcgaaattaagataaacttttgctttatctgcaaggaatgctaatcttgttggtaaaactgtttgT---------TA--TCA-------CAGATGTT---C--AC--AGATGCGTTT-GTTTGctggattaaaaccagttgttgctttttttaaaacaaaacgaaatataacacgcaaataataacatgataactaaaatacatgttagtgcctgctagtcttaagattatcaaagtcagtacgaaaagattaagtactcggcatggctcctacttaatttttgtctttacctcacctgacaagtttcaggctatcagatacttacatgatattct
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gi|80 : tgtcatatcattatgtattattctacgtaataaaacaggacaaaataaactACCA--T-AACATT-----G-T-ATTA----TTTTG-C-----A-TA--------------G-TAA---A--G----C-A-----AA-----G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT-------------AT------TGGC--------AAG----GAAGG---TTAAATTATCTTGCA-GCAACA-CACATAAA--------T---TGATGACAT---T---G--T--T-------T------T--T--A------CG--TTG------GG---TTAAActgggctaaaatcaattttgatgtttaaataaaacataaatcaaacatgcaaataaagacatggtacccgatagtcttaaatttatcagcttcggctcgactcgccaaagcttgtgccttatttttatctctacctcacctgattaaataattaattgatatttgatgtttttaat
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . TC . . CA T . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . CG . . . . TCAACTGTTTA . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . ACTACATTTTATT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . AC . . TG A . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . CG . . . . TATACCGTTTA . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . CCCTACATTTGAC . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . CC . . CG A . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . TT . . . . CAAACAGTTAG . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . AACTACATTTATT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . TC . . CT A . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . CG . . . . TAAACTGTAAA . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . ACACAAATTTGTT . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . AT . . CT A . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . TG . . . . TAAACTGGTAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AAATACATTTGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . AC . . CA A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CG . . . . TGAACTGTGGA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . ACTACATTTGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . GC . . CT A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CA . . . . TAAACTGTTAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . ATTACATTTTAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . CA . . CA T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CG . . . . TAAACTGTTAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AATACATTTGTC . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . AC . . TC G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AG . . . . TAAACTGTTTA . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . CCTACATTTGTT . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . CA A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AG . . . . TTAAGCGTTAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . ACTACATTTGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . C T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CG . . . . TTAACTGTTTA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . ACTGCATTTGGT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . C T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . TAAATTGTTTA . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . TCTATAGTGGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . G A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TG . . . . TAAACTGTATA . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . ACTGCATTTGTT . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . C A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TA . . . . TAAACTGTAAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . CCTATATTTGTT . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . C A . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CT . . . . TAAACTGTTTG . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . AACAAATTGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CA . . . . TAAACTGTCAG . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AACAACTACAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AG . . . . TTAACTTAAA . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . ACTACAAACAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CG . . . . TAAATGTTAC . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . ATAAAGTTCAT . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . TG . . . . AACCGTTAA . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . AACTTTGTTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . TG . . . . TAAGCTTAA . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . AGCGTTAGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TA . . . . ACCTTTAA . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . ACCACATT . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CG . . . . CAAAACGG . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . ACTATATG . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . TG . . . . TAAGCTG . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . AACTACAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CT . . . . TAGTTAA . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . AACTTGTT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CG . . . . TGAACTG . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AACTGTA . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AG . . . . TTGCTAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . ACTACAT . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . TAAATT . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . AACAATT . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CT . . . . TTTAC . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . ACTATAT . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . TAAA . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . AATTCAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . CAA . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . AACGATT . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . TGG . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . CTACAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . CAA . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . AACTG . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . TACAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . C . . . A . . . . . AATAT . . . . . . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AAACT . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AAC . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . AAC . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : **** AC**** CN**************** **** TAAACTGTTAA***************************** C**** ******* *****
originalCons : TATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATCTTGCA-GCAACA-CAC--AAA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--G----T------T--T--G------CG--TTG------TG---TTAAAC--CCA-AC--GTT--T----AAACA----------C---G---TT-----AT-TGT---TT--ATC-TTG-CAGC------AACA-CA-CAAATTGATGA---CGTCATT-G-T-----T-T-T---G--C-G--TTG-TG---TTAAACC--CGCGTT--T-AAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----A--------T--------A--------A-------------T-----------T--------A----TG---------TC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--T------TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------A--------A-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--ACATGCGTTT-GTTTGT
finalCons : TATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATCTTGCA-GCAACA-CAC--AAA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--G----T------T--T--G------CG--TTG------TG---TTAAAC--CCAC----GTT--T----AAACACN----------------TT-----AT-TGT---TT--ATC-TTG-CAGC------AACA-CA-CAAATTGATGA---CGTCATT-G-T-----T-T-T---G--C-G--TTG-TG---TTAAACC--CGCGTT--T-AAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGT--------T-------G----ATAAACTGTTAA-----------------------------T-----------T--------A----TG---------TC---A---------AT----A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--T------TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------A--------A-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--ACATGCGTTT-GTTTGT
23 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78 ): ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATTAGCACTTGACAAAGCTGTTGCTTATTTTTGT
Unaligned ( gi|85 ): TCACCACAAATAAAATGCAAATATTGTGTACTGCATTGTGCACATTACAAATATGTTTAAACAAATTTTTCTCTTTTAATTTCAAAACAAAACAAAAATATATAATATCATA
Unaligned ( gi|87 ): ATGCCTGATAATTAAATGTGATCGCTTATAAGTCAATAAGCACTCGCCACGGCTTTTGGTTATTTTTTTCTCTACCTCACCAATGTTAGACTAACATTGTAAATGTATTCT
Unaligned ( gi|88 ): TAAACTTTATCAGGTTCGGTCGGCTGGTCAAGATTCGTGTCTATTTATTTCTCTACCCCAACTGATAAAGTTAACTAACCTGATATTATCTATAACGGTTTTGACATTG
Unaligned ( gi|97 ): CTGCATTTACATCACATGATGTTATTTGCTAGAATAAAATAAGTTGCTGTTTTTTGTAATAAAAATTGATAAAACATGCAAAA
Unaligned ( gi|100 ): ATTAAGCTAAAATGACATAATTTCATAAGTATTGAAAAGATAAAAAATATGCTTGTTTTCCGTTTTGAATTTAAATTAA
Unaligned ( gi|101 ): TCATCAGGTCGGCTAAATAAAAATTAATCGTTGATTGATTTTTATTCTACCTTACCTGATATATTTTAGACTATCGG
Unaligned ( gi|103 ): AAAGACACATGCTTATTCTATTTCTACCTTACCTAATACATTTTAGAGTATTAGGTACTAACATAGTATTGTTTAT
Unaligned ( gi|109 ): TTACAAAAGGTAAGAACTGGTATTTCGTGTCAGTATGAAAACTTTTCAACTTGTGTGTAAACATGTGCTG
Unaligned ( gi|110 ): GGCTTGTGCTTAATTGTTTTTTTTCATCGCCTCACCTGATACGTTTTAGACTATCAGACACTAACA
Unaligned ( gi|111 ): GCTTGTGCTTAATTCTTTTTTTCATCACCTCGTCAGATAAATTTTAGACTATCAGACACCAACATT
Unaligned ( gi|112 ): GCTTGTGCTTAATACTGTTTTCCATCACCTCATCTGATAAATTTTAGACTATCAGGCACCAACATT
Unaligned ( gi|114 ): TGCACCTCCCCCCACCACCAAAAAAACAAACAAACAAATAAAAAAACACCCAAACAATTTGACA
Unaligned ( gi|115 ): CTCATGCTTATATTTTTCTTTACCTCGTCTCATAAATAAACTATCAGGCACTTTCATGGTATT
Unaligned ( gi|117 ): ATAGAAAATTTATCTGGTATGGCTCGAAAATAATTAAGCACTCGCCAAGGCTTGTGTCT
Unaligned ( gi|119 ): TTTATCTCACCTGATAAGTTTTAAACTATCAGGAACTGAGATGGTATTCTCTATT
Unaligned ( gi|120 ): CTACCTCTCTTGATAAAGTTTAGATTATAAGGCACTTATATGGTATTCT
Unaligned ( gi|121 ): AATTGCCATGTCTAGCTCTCATGACATGTGAAGCAAATATCATG
Unaligned ( gi|122 ): AAATATACTGCAACTGTAATCTGTTGGTCACTGCAAATTTTT
Unaligned ( gi|123 ): ATAGAGTTCAGTACAGGTTATTGACTGAAGCAGTTGTTCTTG
Unaligned ( gi|124 ): CTTATGTTTGGGGAATCAATCTTTGTAGGTTAGCAACATA
Unaligned ( gi|125 ): ATATATTCGCATACATGCTGAGTCTAATCAAAGAAACT
Unaligned ( gi|126 ): GAAAAGAATTAAGCACTCGCCAAGGCTTGTACCTA
Alignments
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Reference ( family-1417 ) : TATCA--T-ATCATT--A-TG-T-ATTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATCTTGCA-GCAACA-CAC--AAA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--G------TT--T--GCG--TTG------TG---TTAAACCCACG-TT--TAAAC-----A----------C-N-TT-----ATTGT---T----------T--ATC-TTG-CAGC------AACA-CA-CAAATTG---ATGA---CGTC-ATT-G-T-----T-T-T---G--C-G--TTG--------TG---TTAAACC--CGCG-TTTAAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGTT----GA-------TAAA--CTG-----T--TA-----AT-----T------A-T---G---------TCA---------AT-A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--T------TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A----------A------------C-------A--------A-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTTCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--ACATGCGTTT-GTTTGT
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gi|12 : GT---T----------A--ACC-TTG-CAGC------AACA-CA-CAAATTG---ATAA---CGTC-ATT--------------------C-----------------------AACC--AACA-TGTTAA--C--A---C--TT---TTT-CG--A--CCGTT----GA-------TAAA--CAG-----T--TA-----AT-----T------A-T---G---------TCA---------AT-A--T--------A--------T------AT------C--AAC-----TAA----T----------------TA-TAAT----GGA--------G-T-CAAAC--AG-----------T-TTT-CATA-A---A----A-----------A----------A------------CTAC----ATTT-----A-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATG-------T-CA-----TC-AATCA-A--A-T-TTG--GA-----GC--------------TA---T-ATTTAAGCAC-----AGT---------TA--CAG-------CACATGTT---C--AC--ACATG-GTTTGGTTTGcaaccaacatgttaacactttttcgaccgttgataaacagttaattatgtcaatatatatcaactaattataatggagtcaaacagttttcataaaaaactacatttattttgttttaatgtcatcaatcaaatttggagctatatttaagcacagttacagcacatgttcacacatggtttggtttgctggatcacaatcagttgctgttttttaaacaaagtaaaaacttattaaacagcaaatactaacatgataactataatacattgttagtgccaaggcttgtgcttaatttgtttctctacctcactcagtcaattttagattattgtactctaacatggtatt
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gi|13 : tGT---T----------T--ATC-AAA-CTGC------AACA-CA-CAAAATG---ATGA---CGTC-ATT-G-T-----T-T-TT--G--C-G--TTT--------TG---TTAAATC--CTCG-TTTAAA--C--A---CAGCT---TT------A--CCGTT----AACATTATATAAA--CTG-----T--TA-----AG-----A------A-T---G---------CCA---------AT-A--A--------A--------T------AT------A--AAT-----TA-----TA-----A--T------TA-TAAA----TGA--------G-T-CAAAC--AG-----------C-TTC-GATA-A---T----A-----------A----------C------------C-------AC-------A-------T------T---------TGTT-----TGGG---T----T--T-----T-AATA-------T-AA-----TT-AATCC-A--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---C-TTTCAGGCGC-----GTT---------TA--TCG-------CAGTTGCA---C--AC--ACaacattatataaactgttaagaatgccaataaatataaattataattataaatgagtcaaacagcttcgataataaccacatttgtttgggttttaatataattaatccaatttggaactactttcaggcgcgtttatcgcagttgcacacactggactaaaagaagttgttggtatttgaatgaaaactgatgaaacaggcaaataaagacataataaatagaaaaccattttagtgccttatgttctaaaaggcatttaccag
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gi|14 : --------TG-----T----T--T-----G-AATT-------T-CA-----TT-CATTA-C--A-T-TTG--GA-----AC--------------GA---T-TTttctcgcaaataaaattttagtcataacgaatatttttaagtgggattatttacaaactgcatgtgtttgaatttcattcattacatttggaacgatttacgtttgttttctggactagaatcagttttaacattttgaaatgaaaacaaataatacaatacaaatgatgacatgatatatttaatactattaagtatctggttatttaaagtttatcatcttctgctcgtacaaaactcacacacttttttatctgcctccatctgatacattttagagttatccccactaacacggtagtctctac
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gi|72 : -----T-GATT-------T-CA-----CC-AATTA-G--A-T-TTG--GA-----AC--------------TA---T-TTCCAGGCGC-----ATT---------TA--CCG-------CAGATGTA---C--AC--TCGTGCGTTT-GTcataccccaacatgtctaaacttctgatttttatca
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gi|83 : ccgattatgacaaaacatgTCA--T-ATCATTTCA-TT-C-ATTA----TTCCA-C-----T-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GGCAA------AC--CTT----TGCT---TTAT------TGGC--------AGG----GAAGG---TT----AATCTTGCA-GCAACA-CAC--AAA--------actggactaaaatcagttgttgc
gi|84 : TATCT--T-GTCATT--A-TG-T-ATTA----TTGTA-C-----G-TA--------------A-TCC---A--G----C-G-----G------A-A-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TTCA---TTAT------CGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATCAGGTA-GCCAAA-CAC--AAA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--G------TT--actgtttttttgtgtgtg
gi|86 : TT--A--G-T-ATCA----TTCCA-C-----G-AA--------------A-TAACATA--GA---C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TTAT------CGGC--------AGG----GATGG---TT----TATCATGCA-GCAACA-CAC--ACA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--GA-----TT--T--
gi|89 : tat--T-ATCATT--A-T----ATTA----TTCTA-C-----G-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A--ATAA------AC--TCT----T--------AT------CGAC--------AGA----GAATG---CG----TATCAGGCA-ATAACA-CAC--ACA--------T---TGTTGACGT---C---ACTT--T--G------T
gi|9 : TTGT---T----------TTCATC-CTA-CA---------ACA-CA-CATATTG---AAGA---CGTC-ATT-G-T-----T-T-TTT-A--C-G--TTC--------TG---TTAAATC--CCTG-TTTAAA--G--A---C--TT---TGT-CT--A--ACGTT----GT-------TAAA--TTG-----C--TA-----AT-----T------A-T---G---------TCA---------GT-A--A--------A--------T------AT------A--AAC-----TAA----TA-----A--TAA----TA-TAAC----TGA--------G-T-CGAAC--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------CCT--------A------------T-------ATTT-----G-------T------T---------T--------TG-----T----T--T-----T-AATT-------T-CA-----TC-AGTCA-A--A-T-TTG--GA-----AA--------------TA-----TATCGGGTGC-----AAT---------TT--CTT-------CAGATGTA---C--AT--ACATACGTTT-GTTTGaatgttt
gi|90 : aggagattacatttttattcaaaattgaacgctctttgtgtatTATCA--T-ATCAGT--A-TG-A-AATA----TTCTA-C-----G-AA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----AGCT---TTAT------TGGC--------AGG----GAAGG---TT----TATTAGGCA-GCAACA-CAC--AAA--------C---TGATGACAT---C---ctgaataaaaatcagttgtacattttttaaataaaaataaattaaaaactcaattaatgccattttgaatagaatgtcataattggttcgaaaataattaagcaatcaacaagtcacgcgcttaaactatccggcaataacatggtattctcta
gi|91 : tTACCG--T-ACCATT--A-TG-T-TTTA----GTAAA-C-----A-TT--------------A-TAA---A--G----C-A-----G------G-G-T------A-A-GATAA------AC--TTT----TGCT---TT-----------------------------------CT----TATCTTGCA-GTAACA-CTA--AAA--------T---TGATGACGT---C---A--T--T--A------TT--T--
gi|92 : ttc--T-ATTATC--A-TG-TCATTA----TTCTT-C-----A-TA--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-GAT------A-A-AATAA------AC--GTT----TGCT---TAAT------CAGC--------AGG----AAAGT---TT----AATCTTGCA-GCAATA-TAC--AAA--------T---Tttgcg
gi|93 : tattgatTATCA--A-GTCAGT--G-TG-T-TTTA----TTCTA-C-----A-TA--------------A-TAA---A--AA---T-G-----T------T-G-T------A-T-GATAA------AC--ATT----TGCT---TTAT------CGAC--------ATG----GAAGG---TT----TATCTTGAA-GCAACA-CGC--ATA--------T---Tca
gi|94 : -T-ATCG----TTGTATC-----A-TA--------------T-CAA---T--A----T-G-----GA-----G-G-T------A-A-GATAA------AT--TTT----TGCT---TTAT------CATC--------AGT----GGATG---TT----TATCTTGCA-G-------AC--AAA--------T---TGATGATGT---T---A--T--T--G------TT--T--taac
gi|95 : cagtt--AG-----------T-TTC-CATA-A---A----A-----------A-----------------------C-------A---------------------------------T--------TG-----T----T--T-----T-AAC----------------------------------------------C--------------TA---T-TT-AAGTTGC-----ATT---------TA--ACT-------CCGATGTT---C--AC--ACGTGCGTTT-GTTTGTt
gi|96 : --T-ACCATT--A-TG-T-GTT-------CCA-C-----A-TA--------------C-T---------------------------------------------CAA------AC--TTC----TGCT---G-AT------CGGC--------ATG----GAAGG---TC----TATCCCGCA-GCAACA-CAC--ACA--------T---TGTGGACGT---C---tggactaaaatccgttgttgcttt
gi|98 : TCA-A--A-T-TTG--AA-----AT--------------AG---T-TTTCAGGCGC-----AT--------------------------GATAAT---C--AA--ACATGCGTTT-GTTTG
gi|99 : --T-ATCATT--A-CA-A-GTCC----TTCTA-T-----A-TG--------------A-TAA---A--G----C-G-----G------G-G--------A-A-GGTGA------AA--TTT-----GCT---TTAT------CGGC--------AAG----GAATG---TT----TATTTTcttaactaaaattagttgttgcgtttat
23 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78 ): ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATTAGCACTTGACAAAGCTGTTGCTTATTTTTGT
Unaligned ( gi|85 ): TCACCACAAATAAAATGCAAATATTGTGTACTGCATTGTGCACATTACAAATATGTTTAAACAAATTTTTCTCTTTTAATTTCAAAACAAAACAAAAATATATAATATCATA
Unaligned ( gi|87 ): ATGCCTGATAATTAAATGTGATCGCTTATAAGTCAATAAGCACTCGCCACGGCTTTTGGTTATTTTTTTCTCTACCTCACCAATGTTAGACTAACATTGTAAATGTATTCT
Unaligned ( gi|88 ): TAAACTTTATCAGGTTCGGTCGGCTGGTCAAGATTCGTGTCTATTTATTTCTCTACCCCAACTGATAAAGTTAACTAACCTGATATTATCTATAACGGTTTTGACATTG
Unaligned ( gi|97 ): CTGCATTTACATCACATGATGTTATTTGCTAGAATAAAATAAGTTGCTGTTTTTTGTAATAAAAATTGATAAAACATGCAAAA
Unaligned ( gi|100 ): ATTAAGCTAAAATGACATAATTTCATAAGTATTGAAAAGATAAAAAATATGCTTGTTTTCCGTTTTGAATTTAAATTAA
Unaligned ( gi|101 ): TCATCAGGTCGGCTAAATAAAAATTAATCGTTGATTGATTTTTATTCTACCTTACCTGATATATTTTAGACTATCGG
Unaligned ( gi|103 ): AAAGACACATGCTTATTCTATTTCTACCTTACCTAATACATTTTAGAGTATTAGGTACTAACATAGTATTGTTTAT
Unaligned ( gi|109 ): TTACAAAAGGTAAGAACTGGTATTTCGTGTCAGTATGAAAACTTTTCAACTTGTGTGTAAACATGTGCTG
Unaligned ( gi|110 ): GGCTTGTGCTTAATTGTTTTTTTTCATCGCCTCACCTGATACGTTTTAGACTATCAGACACTAACA
Unaligned ( gi|111 ): GCTTGTGCTTAATTCTTTTTTTCATCACCTCGTCAGATAAATTTTAGACTATCAGACACCAACATT
Unaligned ( gi|112 ): GCTTGTGCTTAATACTGTTTTCCATCACCTCATCTGATAAATTTTAGACTATCAGGCACCAACATT
Unaligned ( gi|114 ): TGCACCTCCCCCCACCACCAAAAAAACAAACAAACAAATAAAAAAACACCCAAACAATTTGACA
Unaligned ( gi|115 ): CTCATGCTTATATTTTTCTTTACCTCGTCTCATAAATAAACTATCAGGCACTTTCATGGTATT
Unaligned ( gi|117 ): ATAGAAAATTTATCTGGTATGGCTCGAAAATAATTAAGCACTCGCCAAGGCTTGTGTCT
Unaligned ( gi|119 ): TTTATCTCACCTGATAAGTTTTAAACTATCAGGAACTGAGATGGTATTCTCTATT
Unaligned ( gi|120 ): CTACCTCTCTTGATAAAGTTTAGATTATAAGGCACTTATATGGTATTCT
Unaligned ( gi|121 ): AATTGCCATGTCTAGCTCTCATGACATGTGAAGCAAATATCATG
Unaligned ( gi|122 ): AAATATACTGCAACTGTAATCTGTTGGTCACTGCAAATTTTT
Unaligned ( gi|123 ): ATAGAGTTCAGTACAGGTTATTGACTGAAGCAGTTGTTCTTG
Unaligned ( gi|124 ): CTTATGTTTGGGGAATCAATCTTTGTAGGTTAGCAACATA
Unaligned ( gi|125 ): ATATATTCGCATACATGCTGAGTCTAATCAAAGAAACT
Unaligned ( gi|126 ): GAAAAGAATTAAGCACTCGCCAAGGCTTGTACCTA