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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-ATT--GTTAT---TTTCT-G-ATCCTTATTCAGATTG--AATATTCAGT-A-GG----GAATTGGT---TCTTTATTTATTCCTTAT
gi|6                          :                                                                                                    ttaaatagatttccttattcgacttttggaatcctgtcagaatgaaaatgtgagatataagagctaacgaatatgttttaattatcttaaacattactataaacactttcaaacgtatgtttgtcatataaataaaaaattgaagaaaaaaaatcgttgtgtaagatatgaacttttcttcaaattgccaactatcatcacagtgtgttccaaattattttaacattgcgctatATCAATTTCCTA-TTCGTTATTCAATCCG--AGTAAGGAAT---GG----AAATTGAT---
gi|9                          :                                        ggtcagatagttccatttattattcgacattttgggcagtgtataatgaaggtacaagatgaaaagcctaataaatgtttttcattaccataaaaatactattaaatgcatttcagtgcacatttgtagtaaaatgaaagtttaaaacaatcgaaaaaaataggtttacaacttttaggggtaggatatgttatatatttttttaattttcaataatcatcacaattgttccaaatgttttattttgttgtattgtttcttaaataccagatgtttaaaacgttaagaatcgttATAAATTTC--G-TTCCTTACTCGTTGTG--AATAAGGAAT-ATGG----AAtccttattccttattagtggtgaataatgaacccaatttatttcatatttttaatattgaatcttcctaaattgtatcagcatat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taagaaaccagttatctcttccttattaaatcctagaactggAATATTT-G-TTCCTTATT--GGCCGCCAATAAAGAAT-A-AG----GAACCAAT---TC----CCTATTTCCTATTTAATC-TGAATAAGGAACttcatattttgaagattgcatcttcctgaaagtgtatctgcatatgtctcaggtcgatggagttcatcatgcaaatgttttcatgttgttatttatgtttaaccaaattttttaaaagcactttcggaattctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaa
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtccaATTTCC-T-TTCCTT--TT---TTG--AATAAAGAACCA-GGGAATAAATCGGTATTTC----CTTATTCCTTATT-tttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gctgAAT-A-TG----AAATAAAT---TT----C--GTTCCTTACT-CGTTGTGAATAAGGAAaaggaataa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taagaaaccagttatctcttccttattaaatcctagaactggttccataTGTATTTTCCC-GAA-TTGTAGCAGCATATGTCTGAGGTCGGTAGAA-GTTTTCAT--AGAAGTATTTACTCTATATTGGA--CATTTACCAAGTCATTGAAAAGATACTTATTTCAGTTCTTTGCTCGA--TTTTGGAAGCC--Tttgaagattgcatcttcctgaaagtgtatctgcatatgtctcaggtcgatggagttcatcatgcaaatgttttcatgttgttatttatgtttaaccaaattttttaaaagcactttcggaattctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTCTCAGGTCGGT-GAAATTCGTCATGCAAATATTTTCATTTTGTACTGtt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaacCAAGTTATT-AAACA-TACCAGTTCCAGTTTTTTGTTTGACTTTT-GGAATCC--T---TGAGGAAAGAAAGCACGAAAACAAAGAGCCTACTAAATATGTTTA-ATTACC-TTAA-----A---AATTGCATTTTAAACACTTTCCAAC-C-CATAAT-----TGTCATA-AAAATAGAAT-TTTAAAAAAT-GTA-ACATTTAAGTCTACGCC-AACGGGGGTAGGATAagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taggacatgattttttttcaaattgtcaatgatcatcacaatttattccgaacgattctaaaattgcagtatatcaaattttgctgcattattgtcttaattataagacatttaaaacttttaaaatcgttataaatatccagttccttatttaaattgaataagaaatagggaactggttcttattccttattcgcgacaaattaggaaccacttttttcaattgcagcttaatgaacttgtatcagttgtaTC-AGATAGTTCCATTTA-------TTATTCGACATTTTGGG---CAGTGTAT-AATGAAGGTA-CAAGATG--AAA-AGCCTAATAAATGTTTTTC-ATTACCATAAA-----AA--TACTA----TTAAATGCATTTCAGTGCACAT--T-----TGTAGTA-AAATGAAAGT-TTAAAACAATCGAA-AAAAATAGGTTTACAACTTTTAGGGGTAGGATAtgttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggTACTGAGCCTTATTCGACTTTT-GGTATCC--TGTTTGAAT--ATATA-GAAGATG--AAAGAACCAAACAGATGTGTTTA-AATATTATAAAAAAGCA---TATCA----TTGAATGCATTTCAAAGCACGTCTT--TTGTG----A-AATTGAAAGTA-AGAAAAAATCGAACAAATCTAGGtgttatatatttttttaattttcaataatcatcacaattgttccaaatgttttattttgttgtattgtttcttaaataccagatgtttaaaacgttaagaatcgttatcaatttccattccttactcggattgaataacgaataggaaattgattccttattccttattagtggtgaataatgaacccaatttatttcatatttttaatattgaatcttcctaaattgtatcagcatat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgCCTTATTCGACTTTT-GGAATCC--TGTCAGAATGAAAATG-TGAGATA--TAAGAGC-TAACGAATATGTTTTAATTATC-TTAA-----ACATTACTA-----TAAACAC-TTTCAA---ACGT-AT-GTT-TGTCATATAAATAAAAA-ATTGAAGAAA---AA-AAATC
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): ATCTTACATTCGTAAGCATATTTTACAATTAAGCAGACTTTGTTTTGCAGTAGGATTCATCATATATTTTATGTTTCATCAACATATTGAAAAACATCTGCTTATTTCGGTATCTTAACTGATTTCGGATTATCATTGTTCAATGAATAATTACAAAGAGAGTGATTTTTTTCTGTAAATCATTTATACATAGTTGAAATCAGTTAATTACTGGGTATTTCTCTTTAAGTTGAATAAGGAACTAAGGGTGTATTCCTGGTTCCTTATTCGAAAAAGAAATTAGGAATTAATGATGTATTTCCTGGTTCCTTATTTGAAAAAGAAATAAGGAACTAACTTTACACTCTTGTCAGAATAACTACATGGTTATCGCATGAT
Unaligned ( gi|8 ): TTACATTTTAAAAGCTTATTTATTAAATAAATATACTTTATTTTGCACTAAATTTATCATATACGTATTTGACGTTTTATCAAAATATTGAAATGTAATTATTTCTGTATCTTAACCGATTTTACATTAGCTTTATTAAATCAATAATTAGCTTAAACGCGTTTAAATATTTTTATAGCATAATTTATAAATAATAAATATATAAATGATTTTAATTAGTTATTATTAATATTTTAGTTGAACAATGATCAAAGAACTAATTATGGGTTTCTTTTATACTCGTTCGAAAAAGGAATAAGGAAAAAGGGGCTATTTTTGCGTTCAT
Unaligned ( gi|11 ): TATTCAGTTATATTTCAAATTTATCTTACAATTCATATTGTTCAATTAATTTAAGCTTTATTTTGCACTAGGATTCATCATATATTTCATGTTTCATCCAATTATTGAAAAAAAAATAATTTCGGTATCTTTACAGATTTTGGACTAGCTTTGTTCAATCAATAATTACACAGAGAGTGATCATTTTTTTCTATAAAATCATGTATACATTATTGAAATCATTGTAATTAGTGCGTATTTCTATTTTAGTTGAATAAGGAAAACA
Unaligned ( gi|12 ): TCTTCTAAGTAATATTTTAAGTAATATTTTTCTTACAATTTTATATATAAGTAGTCTCTGAGATATATTATATATTTTAGGTTTCATGAATCTATTGAAATATAATTATTTCGGCATCTTTACCGATTTCGAATTAGCTTTGTTTAATCAATTATTAAACTTACATTGAAAAGTGTTCAAATACTTCTATAAAAACAGTTATACTTTATCAAAATTACTATTTTAGTTGAATAAGGAATA
Unaligned ( gi|13 ): CGTTATGAGTGTCCAGTTTATGTTTATCTTACCGTTTATAAGCGTATTTTATAAGTAGACTTTATTTTGCAATAGGATTCATCATATATTGTACGTCTCATCCAAATATCGAAAAACGCTTATTTCGGCATCTTACCGATTTTGGATTAGCTTTGTTTAATCAATATTTACATAGAGAGTG
Unaligned ( gi|15 ): ATGATTTTTTAACAAATTGTCAACTATATTCACAATGTTAATGTCAATTTCAACATTGCTCTACATCACATTTTCATCATAATTGCTTTAATATCAAACGTTTAAATTTTTAAGGATCATTGTGAATTTCAAGTTA
Unaligned ( gi|16 ): ATTTTTAATTGTCAATTATCATTCCAAGTGTATTCCAATGATTTTTTTAAACATTGCTCTACATCACATTTTGCAGCATGATTGATGAAATATTAGACGTATAAAATATTTTAAAATCGTTATGAGTGTCCA
Unaligned ( gi|17 ): AGTTGAATAAGTAATAAAAAACTGAGGACATATTTCCTGGTTCCTAATTCGAAAAAGGAATAGGGACTAAGTAATAAGGAACTAAGTTTATGCTCATGTGTTCAAGCATATTTTAAT
Unaligned ( gi|18 ): TTTATTTCTATAAACTCATTTATACATAATTTAAATCGGTTTAATTAGAGAGTATTACTATATTATTTGAATAAGGAATAAGTAACTAACTTTACA
Unaligned ( gi|19 ): TGTTGGAATGAATGTACGTGTTGAAAGAGTCTAATTAATATGAATACTCACAACTGAATATATTCCAACGCTGTTATATATAGGA






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Reference ( family-1368 )     :                                                                                                                                                                             GGGGTAGGATATGT-----ATTTTT---TT---AATT-T-CAATAATCATCACAATT-CGTTCCGAA-CG----TTTTAAA-----------A-TCAC-----------T-----------TTTGCTGCATTATT-TC--TTAAATATTAGACGTTTAAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATNAATNTCC--GTTCCTTATT-----CGGATT---GAATAAGGAA-T--AGGGA-------AT----CGGT---TC----CTTATTCCTTATTCGCGGCGAAT----AAGGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAA-ATTGCATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATGTCTCAGGTCGGTGGAATTCGTCA---TGCA--AATGTTTTCATT-TTGTANTGNATGCNTTNACCAAGTTATTAAANAG-TACCANTTNCAGTTCCTTATTCGAC-TTTTCGGAATCCTGTCTGAATGAAGA---TACAAGATGAAAGAGCCTAACAAATGTG-TTTAATTATCATNAAA----AT---ATTAT--TAAACGCATTTCAANGCACGT----AT-TTTGTCGTA-AAATGAAAGTATTGAAAAAATCGAA-AAATCTAGGTCTACGNCTNNCGGGGGTAGGATA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aATTTCCTGGTTCCTAATT-----CG--------AAAAAGGAA-T--AGGGA-------CT----AAGT-----------------------------AAT----AAGGAACT--AA-G-TT-TATGCTCA---TGTGTTCAA----GCATATTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                             agttgaataagtaataaaaaactgaggacatAATATTAGAAGTTTAAAACA--T---TT-TGATATCGTTATGACTGTCCA-GTTCCTTATT-----CAGATT---AAATAGGAAA-T--AGGGA-------AT----TGGT---TC----CTTATTCTTTATTGGCGGCCAAT----AAGGAACttaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTGTT-TCAGTTGAAT--TAGAAATATAAAAAC--T---TA-GGC-AT-GC-ATGTAGTTCCTGGTTCCTTATTAAAAACGGAATAGGGAATAAGGAA-T--AAGGA-------Aaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|20                         : aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtccagttccttattcagattaaataggaaatagggaattggttccttattctttattggcggccaataaggaacaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaATTTCC--TTTCCTT-TT---------TT---GAATAAAGAA-CC-AGGGA-------ATAAATCGGTATTTC----CTTATTCCTTATTCcttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctCTGCCTGAATGAAGG---TACAAGATGAAAGAGTCTATCATATCT--TTTAATTATCA--AAACT--AT---ATTAT--TGAATATATTTCAAAGCACA--------TTTGGAGCA-AAATGAAAaaggaataa
gi|3                          :                                                                                                                                                                             GGGATAGGGTAT-T-----ATTTTTAAACA---AAAA-T-CAAATATTATCACAATT-CACTCCAAA-TG----GTTTAAA-----------AATTAC-----------TCAACATCCCATTTTGCTGCATTATT-GC------ATATTAGACATTGAAAAC---T---TATAAA-ATCGTTATGAAT-------------------------TT---AAATAAGGAA-T--AGGAA-------Aagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccagTGTCTCAGGTCGGTGAAATTCGTCA---TGCA--AATATTTTCATT-TTGTACTGA--GCCTTctgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaacCCTTATTCGAC-TTTT-GGTATCCTGTTTGAAT--ATA---TAGAAGATGAAAGAACCAAACAGATGTG-TTTAAATATTATAAAAAAGCAT---ATCAT--TGAATGCATTTCAAAGCACGT----CT-TTTGT-G-A-AATTGAAAGTA-AGAAAAAATCGAACAAATCTAGGattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|4                          : ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagTTAAAACA--TACATA-ATG-ATCGTTATTAAGGCCC--ATTCCTTATT-----CGCATT---GAATAATGAG-T--AGGGA-------AT----AGGC---CC----CTTATTCTTAATTTGCGGCCAAT----AAGAAACCAACA-AGTTATAT-TTCAAGTTATTTTTA-----------TCTT-ACA-TTTTATAAGCGTATTATTCAAACAGGTAGA---CGTTATTTTGCACCAA-GATTTAATTATTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                 TAGGACATG------ATTTTT---TTTCAAATTGT-CAATGATCATCACAATT-TATTCCGAA-CGA---TTCTAAA-----------A-TTGCAGTATATCAAAT-----------TTTGCTGCATTATTGTC--TTAATTATAAGACATTTAAAACT--T---TT-AAA-ATCGTTATAAATATCCA-GTTCCTTATT-----TAAATT---GAATAAGAAA-T--AGGGA-------AC----TGGT---TC-----TTATTCCTTATTCGCGACAAAT----TAGGAACC-----A-CT--------------TTTTTCA-ATTGCAGCTTAAT-GAACTTGTATCAGttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttccttgtttcttatttaaaaaacggaataggaaatatggaataaggaactaactttatgttcatgattaataacata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAGTTATTAAACA--TACCAGTTCCAGTTTTTTGTTTGAC-TTTT-GGAATCCT---TGAGGAAAGAAAGCACGAAAACAAAGAGCCTACTAAATATG-TTTAATTACCTTAAAA----ATTGCATT-T--TAAACACTTTCCAACCCA--T----A--ATTGTCATA-AAAATAGAAT-TTTAAAAAAT-GTA-ACATTTAAGTCTACGCC-AACGGGGGTAGGATAttgtacaagttattaaacataccagttccagttttttgtttgacttttggaatccttgaggaaagaaagcacgaaaacaaagagcctactaaatatgtttaattaccttaaaaattgcattttaaacactttccaacccataattgtcataaaaatagaattttaaaaaatgtaacatttaagtctacgccaacgggggtaggatatgttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taggacatgattttttttcaaattgtcaatgatcatcacaatttattccgaacgattctaaaattgcagtatatcaaattttgctgcattattgtcttaattataagacatttaaaacttttaaaatcgttataaatatccagttccttatttaaattgaataagaaatagggaactggttcttattccttattcgcgacaaattaggaaccacttttttcaattgcagcttaatgaacttgtatcagttgtaAGTTCCA-TTTATTATTCGACATTTTGGGCAG--TGTAT-AATGAAGG---TACAAGATGAAA-AGCCTAATAAATGTT-TTTCATTACCATAAAA----AT---ACTAT--TAAATGCATTTCAGTGCACA--------TTTGTAGTA-AAATGAAAGT-TTAAAACAATCGAA-AAAAATAGGTTTACAACTTTTAGGGGTAGGATAtgttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                     ggtcagatGGGGTAGGATATGTTATATATTTTT---TT---AATT-TTCAATAATCATCACAATT--GTTCCAAA-TG----TTTTA------------------------------T-----------TTTGTTGTATTGTT-TC--TTAAATACCAGATGTTTAAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATCAATTTCC--ATTCCTTACT-----CGGATT---GAATAACGAA-T--AGGAA-------AT----TGAT---TC----CTTATTCCTTATTAGTGGTGAAT----AATGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAATATTGAATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATtgttatatatttttttaattttcaataatcatcacaattgttccaaatgttttattttgttgtattgtttcttaaataccagatgtttaaaacgttaagaatcgttatcaatttccattccttactcggattgaataacgaataggaaattgattccttattccttattagtggtgaataatgaacccaatttatttcatatttttaatattgaatcttcctaaattgtatcagcatat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                 ggtcagatagttccatttattattcgacattttgggcagtgtataatgaaggtacaagatgaaaagcctaataaatgtttttcattaccataaaaatactattaaatgcatttcagtgcacatttgtagtaaaatgaaagtttaaaacaatcgaaaaaaataggtttacaacttttaTT---GAATAAGGAA-CTAAGGGT-------GT------AT---TC----CTGGTTCCTTATTCG
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gi|8                          :                                                                                                                                                                         atcttacattcgtaagcatattttacaattaagcagactttgttttgcagtaggattcatcatatattttatgtttcatcaacatattgaaaaacatctgcttatttcggtatcttaactgatttcggattatcattgttcaatgaataattacaaagagagtgatttttttctgtaaatcatttatacatagttgaaatcagttaattactgggtatttctctttaagttgaataaggaactaagggtgtattcctT---TC----CTTATTCCTTTTTCG-AACGAGTATAAAAGAAACC--CATA-AT-TAG-TTCtaactttacactcttgtcagaataactacatggttatcgcatgat
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6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                                                                                                      ttaaatagatGTAAGATATG----AACTTTTCT--TCA-AA----TTGCCAACTATCATCACAGTG-TGTTCCAAATTA----T----TTTA--------------------------------AC----------A----------TTGCGCTATAATT--GTT---------gttgtgtaagatatgaacttttcttcaaattgccaactatcatcacagtgtgttccaaattattttaacattgcgctataattgttattttctgatccttattcagattgaatattcagtagggaattggttctttatttattccttat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                              ttaaatagatttccttattcgacttttggaatcctgtcagaatgaaaatgtgagatataagagctaacgaatatgttttaattatcttaaacattactataaacactttcaaacgtatgtttgtcatataaataaaaaattgaagaaaaaaaatcgttgtA-ATTGTTAT---TTTCT--GATCCTTATT-----CAGATT---G--AATATTCAGT-AGGGAAT----TGG--------T---TCTTTATTTATTCCTTATattttctgatccttattcagattgaatattcagtagggaattggttctttatttattccttat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaaatagatttccttattcgacttttggaatcctgtcagaatgaaaatgtgagatataagagctaacgaatatgttttaattatcttaaacattactataaacactttcaaacgtatgtttgtcatataaataaaaaattgaagaaaaaaaatcgttgtgtaagatatgaacttttcttcaaattgccaactatcatcacagtgtgttccaaattattttaacattgcgctatTGTATTTTCCC-GAA-TTGTAGCAGCATATGTCTGAGGTCGGTAGAAGTTTTCA---TAGA--AGTATTT--ACT-CTATATTGGA--CATTTACCAAGTCATTGAAAAGATACTTATTTCAGTTCTTTGCTCGA--TTTTGGAAGCC--T
gi|15                         :                                                                                                                                                                  TTTTT--T---AACAAATTGTCAACTATATTCACAAT---GTT---AA-TG----TCAATTTCAAC-----------A-T-----TGCTCTACATCAC----------A----------TTTTCAT-C-ATA--ATT---------GC--TTTAA-TATCAAACGTTT---AAATTT--T---TA-AGG-ATCATTGTGAATTTCtt
gi|16                         :                                                                                                                                                               atgaTTTT--T---AA----TTGTCAATTATCATTCCAAGTGTATTCCAA--TGATTTT----TTTAAACATTGCTCTACA-T-----C----------AC----------A----------TTTTGCAGC-ATG--ATT---------GA--TGAAA-TATTAGACGTAT---AAAATATTT---TA-A-A-ATCGTTATGAGTGTCC--aagtta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATTTCCTGGTTCCTAATT-----CG----------AAAAAGGAAT-AGGGACT----AAG--------T--------------------------------AAT----AAGGAACT--AA-G-TT-TATGCTCA---TGTGTTCAA----GCATATTa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agttgaataagtaataaaaaactgaggacat--TGTTGGAATGAATGTACGTGTTGAAAGAGTCTAATTAATATG----AATACTCACA----------------ACTGAATATATTCCAACGCttaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA-TATTAGAAGTTT---AAAACA--T---TT-TGATATCGTTATGACTGTCCA-GTTCCTTATT-----CAGATT---A--AATAGGAAAT-AGGGAAT----TGG--------T---TC----CTTATTCTTTATTGG---CGGCCAAT----AAGGAACtgttatatatagga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     ----T----TTTAAA-----------A-TCCACTT----------AC----------A----------ATTTG-TAT-ATTAGGTTACAGATATATC--TTAAAATATCA--CTTTTTGGGAGAC--------A-AAA-AT--------ATTT----GTTCCTTATT-------GGCC---GCCAATAAAGAAT-AAGGAAC----CAA--------T---TC----CCTATTTCCTATTTA---ATCTGAAT----AAGGAACaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                      aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtcca-ACT--GTT---------TCAGTTGAA-T--TAGAAATAT---AAAAAC--T---TA-GGC-AT-GC-ATGTAGTTCCTGGTTCCTTATTAAAAACGGAATAGGG--AATAAGGAAT-AAGGAAC----Tttaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|20                         :    aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtccagttccttattcagattaaataggaaatagggaattggttccttattctttattggcggccaataaggaacaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaATTTCC--TTTCCTT-TT---------TT---G--AATAAAGAACCAGGGAATAAATCGG--------TATTTC----CTTATTCCTTATTCtactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gctC--TGCCTGAATGAAGGTACAAGATGAAAGAGTCTATCATATCT--TTTAATTATCAAAACT----A-T---ATTATTGAATATATTTCAAAGCACA--------TTTGGAGCA-AAATGAAAAaaggaataa
gi|3                          :                                                                                                                                             GGGATAGGGTAT------TATTTTTAAAC---AA----AAATCAAATATTATCACAATT-CACTCCAAA-TG----G----TTTAAA-----------AAT-----T----------ACTCAACATCCCA----------TTTTGCTGC-ATT--ATT---------GC------A-TATTAGACATTG---AAAAC---T---TATAAA-ATCGTTATGAAT-------------------------TT---A--AATAAGGAAT-AGGAAAC----TGgtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccagTGTCTCAGGTCGGTGAAATTCGTCA---TGCA--AATATTTTCATT-TTGTACTGA--GCCTTAtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaacCCTTATTCGAC-TTTTGGTATCC--TGTTTGAAT--ATATAGAAGATGAAAGAACCAAACAGATGTG-TTTAAATATTATAAAAAAGCA-T---ATCATTGAATGCATTTCAAAGCACGT----CT-TTTGTG--A-AATTGAAAGTA-AGAAAAAATCGAACAAATCTAGGttcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|4                          : ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagTT---AAAACA--TACATA-ATG-ATCGTTATTAAGGCCC--ATTCCTTATT-----CGCATT---G--AATAATGAGT-AGGGAAT----AGG--------C---CC----CTTATTCTTAATTTG---CGGCCAAT----AAGAAACCAACA-AGTTATAT-TTCAAGTTATTTTTA-----------TCTT-ACA-TTTTATAAGCGTATTATTCAAACAGGTAGA---CGTTATTTTGCACCAA-GATTTAATTATTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                 TAGGACATG------ATTTTTT--TTCAAA----TTGTCAATGATCATCACAATT-TATTCCGAA-CGA---T----TCTAAA-----------A-T-----T----------GC----------AGTATATCAAATTTTGCTGC-ATT--ATTG--------TC--TTAAT-TATAAGACATTT---AAAACT--T---TT-AAA-ATCGTTATAAATATCCA-GTTCCTTATT-----TAAATT---G--AATAAGAAAT-AGGGAAC----TGG--------T---TC-----TTATTCCTTATTCG---CGACAAAT----TAGGAACC-----A-CT--------------TTTTTCA-ATTGCAGCTTAAT-GAACTTGTATCAGttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttccttgtttcttatttaaaaaacggaataggaaatatggaataaggaactaactttatgttcatgattaataacata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAGTTATTAAACA--TACCAGTTCCAGTTTTTTGTTTGAC-TTTTGGAATCC--TTGAGGAAAGAAAGCACGAAAACAAAGAGCCTACTAAATATG-TTTAATTACCTTAAAA----A-TTGCATT-TTAAACACTTTCCAACCCA--T----A--ATTGTCATA-AAAATAGAAT-TTTAAAAAAT-GTA-ACATTTAAGTCTACGCC-AACGGGGGTAGGATAttgtacaagttattaaacataccagttccagttttttgtttgacttttggaatccttgaggaaagaaagcacgaaaacaaagagcctactaaatatgtttaattaccttaaaaattgcattttaaacactttccaacccataattgtcataaaaatagaattttaaaaaatgtaacatttaagtctacgccaacgggggtaggatatgttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taggacatgattttttttcaaattgtcaatgatcatcacaatttattccgaacgattctaaaattgcagtatatcaaattttgctgcattattgtcttaattataagacatttaaaacttttaaaatcgttataaatatccagttccttatttaaattgaataagaaatagggaactggttcttattccttattcgcgacaaattaggaaccacttttttcaattgcagcttaatgaacttgtatcagttgtaAGTTCCA-TTTATTATTCGACATTTTGGG---CAGTGTAT-AATGAAGGTACAAGATGAAA-AGCCTAATAAATGTT-TTTCATTACCATAAAA----A-T---ACTATTAAATGCATTTCAGTGCACA--------TTTGTAGTA-AAATGAAAGT-TTAAAACAATCGAA-AAAAATAGGTTTACAACTTTTAGGGGTAGGATAtgttt
gi|6                          :                                                                                                                                     ggtcagatGGGGTAGGATATGTTATATATTTTTT--T---AA----TTTTCAATAATCATCACAATT--GTTCCAAA-TG----T----TTTA-------------------------------------------------------TTTTGTTGT-ATT--GTT---------TC--TTAAA-TACCAGATGTTT---AAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATCAATTTCC--ATTCCTTACT-----CGGATT---G--AATAACGAAT-AGGAAAT----TGA--------T---TC----CTTATTCCTTATTAG---TGGTGAAT----AATGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAATATTGAATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATtgttatatatttttttaattttcaataatcatcacaattgttccaaatgttttattttgttgtattgtttcttaaataccagatgtttaaaacgttaagaatcgttatcaatttccattccttactcggattgaataacgaataggaaattgattccttattccttattagtggtgaataatgaacccaatttatttcatatttttaatattgaatcttcctaaattgtatcagcatat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                           ggtcagatagttccatttattattcgacattttgggcagtgtataatgaaggtacaagatgaaaagcctaataaatgtttttcattaccataaaaatactattaaatgcatttcagtgcacatttgtagtaaaatgaaagtttaaaacaatcgaaaaaaataggtttacaacttttaTTCCTGGTTCCTTATT-----C--------G--AAAAAGAAAT-TAGGAAT----TAATGATGTATT---TC----CTGGTTCCTTATTTGAAAAAG-AAAT----AAGGAACT--AA-C-TT-TA
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAAC----TGG--------T---TC----CATATTCCTTATTCA---CAACGAGT----AAGGAACG--AA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTGAAGATTGCATCTTCCTGAAA-GTGTATCTGCATATGTCTCAGGTCGATGGAGTTCATCA---TGCA--AATGTTTTCATG-TTGTTATTTATG-TTTAACCAAATTTTTTAAAAG-C----------------------AC-TTTCGGAATTC--TGCCTGAATGAAGGTACAAGATGAAAGAGTCTATCATATCT--TTTAATTATCAAAACT----A-T---ATTATTGAATATATTTCAAAGCACA--------TTTGGAGCA-AAATGAAAtagaactggttccatattccttattcacaacgagtaaggaacgaaatttatttcatattttgaagattgcatcttcctgaaagtgtatctgcatatgtctcaggtcgatggagttcatcatgcaaatgttttcatgttgttatttatgtttaaccaaattttttaaaagcactttcggaattctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): TCTTCTAAGTAATATTTTAAGTAATATTTTTCTTACAATTTTATATATAAGTAGTCTCTGAGATATATTATATATTTTAGGTTTCATGAATCTATTGAAATATAATTATTTCGGCATCTTTACCGATTTCGAATTAGCTTTGTTTAATCAATTATTAAACTTACATTGAAAAGTGTTCAAATACTTCTATAAAAACAGTTATACTTTATCAAAATTACTATTTTAGTTGAATAAGGAATA
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Reference ( family-1368 )     :                                                                                                                                             GGGGTAGGATATGTTATATATTTTTT--T---AA----TTGTCAATTATCATCACAATT-TGTTCCAAA-TG----T----TTT-AAA-----------AT-----T----------A----------CA----------TTTTGCTGC-ATT--GTT---------TC--TTAAA-TATCAGACGTTT---AAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATGAATTTCC--GTTCCTTATT-----CGGATT---G--AATAAGGAAT-AGGGAAC----TGG--------T---TC----CTTATTCCTTATTCG---CGGCGAAT----AAGGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAA-ATTGCATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATGTCTCAGGTCGGTGGAATTCGTCA---TGCA--AATGTTTTCATT-TTGTACTGGATGCNTTAACCAAGTTATTAAANAG-TACCAGTTCCAGTTCCTTATTCGAC-TTTTGGAATCC--TGTCTGAATGAAGGTACGAGATGAAAGAGCCTAACAAATGTG-TTTAATTATCATAAAA----A-T---ACTATTGAATACATTTCAACGCACGT----AT-TTTGTAGTA-AAATGAAAATATTGAAAAAATCGAA-AAATCTAGGTNTACGCCTAACGGGGGTAGGATA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATTTCCTGGTTCCTAATT-----CG----------AAAAAGGAAT-AGGGA---------------------------CTAAGT-----------------AAT----AAGGAACT--AA-G-TT-TATGCTCA---TGTGTTCAA----GCATATTa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agttgaataagtaataaaaaactgaggacat--TGTTGGAATGAATGTACGTGTTGAAAGAGTCTAATTAATATG----AATACTCACA----------------ACTGAATATATTCCAACGCttaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA-TATTAGAAGTTT---AAAACA--T---TT-TGATATCGTTATGACTGTCCA-GTTCCTTATT-----CAGATT---A--AATAGGAAAT-AGGGAAT----TGG--------T---TC----CTTATTCTTTATTGG---CGGCCAAT----AAGGAACtgttatatatagga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     ----T----TTT-AAA-----------ATCCACTT----------A----------CA----------ATTTG-TAT-ATTAGGTTACAGATATATC--TTAAAATATCA--CTTTTTGGGAGAC--------A-AAA-AT--------ATTT----GTTCCTTATT-------GGCC---GCCAATAAAGAAT-AAGGAAC----CAA--------T---TC----CCTATTTCCTATTTA---ATCTGAAT----AAGGAACaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                      aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtcca-ACT--GTT---------TCAGTTGAA-T--TAGAAATAT---AAAAAC--T---TA-GGC-AT-GC-ATGTAGTTCCTGGTTCCTTATTAAAAACGGAATAGGG--AATAAGGAAT-AAGGAAC----Tttaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|20                         :    aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtccagttccttattcagattaaataggaaatagggaattggttccttattctttattggcggccaataaggaacaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaATTTCC--TTTCCTT-TT---------TT---G--AATAAAGAACCAGGGAATAAATCGG--------TATTTC----CTTATTCCTTATTCtactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gctC--TGCCTGAATGAAGGTACAAGATGAAAGAGTCTATCATATCT--TTTAATTATCAAAACT----A-T---ATTATTGAATATATTTCAAAGCACA--------TTTGGAGCA-AAATGAAAAaaggaataa
gi|3                          :                                                                                                                                             GGGATAGGGTAT------TATTTTTAAAC---AA----AAATCAAATATTATCACAATT-CACTCCAAA-TG----G----TTTAAAA-----------AT-----T----------ACTCAACATCCCA----------TTTTGCTGC-ATT--ATT---------GC------A-TATTAGACATTG---AAAAC---T---TATAAA-ATCGTTATGAAT-------------------------TT---A--AATAAGGAAT-AGGAAAC----TGgtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccagTGTCTCAGGTCGGTGAAATTCGTCA---TGCA--AATATTTTCATT-TTGTACTGA--GCCTTAtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaacCCTTATTCGAC-TTTTGGTATCC--TGTTTGAAT--ATATAGAAGATGAAAGAACCAAACAGATGTG-TTTAAATATTATAAAAAAGCA-T---ATCATTGAATGCATTTCAAAGCACGT----CT-TTTGTG--A-AATTGAAAGTA-AGAAAAAATCGAACAAATCTAGGttcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|4                          : ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagTT---AAAACA--TACATA-ATG-ATCGTTATTAAGGCCC--ATTCCTTATT-----CGCATT---G--AATAATGAGT-AGGGAAT----AGG--------C---CC----CTTATTCTTAATTTG---CGGCCAAT----AAGAAACCAACA-AGTTATAT-TTCAAGTTATTTTTA-----------TCTT-ACA-TTTTATAAGCGTATTATTCAAACAGGTAGA---CGTTATTTTGCACCAA-GATTTAATTATTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                 TAGGACATG------ATTTTTT--TTCAAA----TTGTCAATGATCATCACAATT-TATTCCGAA-CGA---T----TCT-AAA-----------AT-----T----------G----------CAGTATATCAAATTTTGCTGC-ATT--ATTG--------TC--TTAAT-TATAAGACATTT---AAAACT--T---TT-AAA-ATCGTTATAAATATCCA-GTTCCTTATT-----TAAATT---G--AATAAGAAAT-AGGGAAC----TGG--------T---TC-----TTATTCCTTATTCG---CGACAAAT----TAGGAACC-----A-CT--------------TTTTTCA-ATTGCAGCTTAAT-GAACTTGTATCAGttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttccttgtttcttatttaaaaaacggaataggaaatatggaataaggaactaactttatgttcatgattaataacata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAGTTATTAAACA--TACCAGTTCCAGTTTTTTGTTTGAC-TTTTGGAATCC--TTGAGGAAAGAAAGCACGAAAACAAAGAGCCTACTAAATATG-TTTAATTACCTTAAAA----A-TTGCATT-TTAAACACTTTCCAACCCA--T----A--ATTGTCATA-AAAATAGAAT-TTTAAAAAAT-GTA-ACATTTAAGTCTACGCC-AACGGGGGTAGGATAttgtacaagttattaaacataccagttccagttttttgtttgacttttggaatccttgaggaaagaaagcacgaaaacaaagagcctactaaatatgtttaattaccttaaaaattgcattttaaacactttccaacccataattgtcataaaaatagaattttaaaaaatgtaacatttaagtctacgccaacgggggtaggatatgttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taggacatgattttttttcaaattgtcaatgatcatcacaatttattccgaacgattctaaaattgcagtatatcaaattttgctgcattattgtcttaattataagacatttaaaacttttaaaatcgttataaatatccagttccttatttaaattgaataagaaatagggaactggttcttattccttattcgcgacaaattaggaaccacttttttcaattgcagcttaatgaacttgtatcagttgtaAGTTCCA-TTTATTATTCGACATTTTGGG---CAGTGTAT-AATGAAGGTACAAGATGAAA-AGCCTAATAAATGTT-TTTCATTACCATAAAA----A-T---ACTATTAAATGCATTTCAGTGCACA--------TTTGTAGTA-AAATGAAAGT-TTAAAACAATCGAA-AAAAATAGGTTTACAACTTTTAGGGGTAGGATAtgttt
gi|6                          :                                                                                                                                     ggtcagatGGGGTAGGATATGTTATATATTTTTT--T---AA----TTTTCAATAATCATCACAATT--GTTCCAAA-TG----T----TTT-A------------------------------------------------------TTTTGTTGT-ATT--GTT---------TC--TTAAA-TACCAGATGTTT---AAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATCAATTTCC--ATTCCTTACT-----CGGATT---G--AATAACGAAT-AGGAAAT----TGA--------T---TC----CTTATTCCTTATTAG---TGGTGAAT----AATGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAATATTGAATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATtgttatatatttttttaattttcaataatcatcacaattgttccaaatgttttattttgttgtattgtttcttaaataccagatgtttaaaacgttaagaatcgttatcaatttccattccttactcggattgaataacgaataggaaattgattccttattccttattagtggtgaataatgaacccaatttatttcatatttttaatattgaatcttcctaaattgtatcagcatat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                           ggtcagatagttccatttattattcgacattttgggcagtgtataatgaaggtacaagatgaaaagcctaataaatgtttttcattaccataaaaatactattaaatgcatttcagtgcacatttgtagtaaaatgaaagtttaaaacaatcgaaaaaaataggtttacaacttttaTTCCTGGTTCCTTATT-----C--------G--AAAAAGAAAT-TAGGAAT----TAATGATGTATT---TC----CTGGTTCCTTATTTGAAAAAG-AAAT----AAGGAACT--AA-C-TT-TA
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Reference ( family-1368 )     :                                                                                                                                             GGGGTAGGATATGTTATATATTTTTT--T---AA----TTGTCAATTATCATCACAATT-TGTTCCAAA-TG----T----TTT-AAA-----------AT-----T----------A----------CA----------TTTTGCTGC-ATT--GTT---------TC--TTAAA-TATCAGACGTTT---AAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATGAATTTCC--GTTCCTTATT-----CGGATT---G--AATAAGGAAT-AGGGAAC----TGG--------T---TC----CTTATTCCTTATTCG---CGGCGAAT----AAGGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAA-ATTGCATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATGTCTCAGGTCGGTGGAATTCGTCA---TGCA--AATGTTTTCATT-TTGTACTGGATGCNTTAACCAAGTTATTAAANAG-TACCAGTTCCAGTTCCTTATTCGAC-TTTTGGAATCC--TGTCTGAATGAAGGTACGAGATGAAAGAGCCTAACAAATGTG-TTTAATTATCATAAAA----A-T---ACTATTGAATACATTTCAACGCACGT----AT-TTTGTAGTA-AAATGAAAATATTGAAAAAATCGAA-AAATCTAGGTNTACGCCTAACGGGGGTAGGATA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCCTTATTCGAC-TTTTGGAATCC--TGTCAGAATGAAAATGTGAGATATAAGAG-CTAACGAATATGTTTTAATTATCTTAAAC----ATT---ACTA-TAAACAC-TTTCAA---ACGT----ATGTTTGTCATATAAATAAAAA-ATTGAAGAAA---AA-AAATCgtattg
gi|10                         :                                                                                                                                      ttaaatagatGTAAGATATG----AACTTTTCT--TCA-AA----TTGCCAACTATCATCACAGTG-TGTTCCAAATTA----T----TTT-A-------------------------------A----------CA----------TTGCGCTATAATT--GTT---------gttgtgtaagatatgaacttttcttcaaattgccaactatcatcacagtgtgttccaaattattttaacattgcgctataattgttattttctgatccttattcagattgaatattcagtagggaattggttctttatttattccttat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                              ttaaatagatttccttattcgacttttggaatcctgtcagaatgaaaatgtgagatataagagctaacgaatatgttttaattatcttaaacattactataaacactttcaaacgtatgtttgtcatataaataaaaaattgaagaaaaaaaatcgttgtA-ATTGTTAT---TTTCT--GATCCTTATT-----CAGATT---G--AATATTCAGT-AGGGAAT----TGG--------T---TCTTTATTTATTCCTTATattttctgatccttattcagattgaatattcagtagggaattggttctttatttattccttat
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     ----T----TTT-AAA-----------ATCCACTT----------A----------CA----------ATTTG-TAT-ATTAGGTTACAGATATATC--TTAAAATATCA--CTTTTTGGGAGAC--------A-AAA-AT--------ATTT----GTTCCTTATT-------GGCC---GCCAATAAAGAAT-AAGGAAC----CAA--------T---TC----CCTATTTCCTATTTA---ATCTGAAT----AAGGAACaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
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gi|3                          :                                                                                                                                             GGGATAGGGTAT------TATTTTTAAAC---AA----AAATCAAATATTATCACAATT-CACTCCAAA-TG----G----TTTAAAA-----------AT-----T----------ACTCAACATCCCA----------TTTTGCTGC-ATT--ATT---------GC------A-TATTAGACATTG---AAAAC---T---TATAAA-ATCGTTATGAAT-------------------------TT---A--AATAAGGAAT-AGGAAAC----TGgtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taggacatgattttttttcaaattgtcaatgatcatcacaatttattccgaacgattctaaaattgcagtatatcaaattttgctgcattattgtcttaattataagacatttaaaacttttaaaatcgttataaatatccagttccttatttaaattgaataagaaatagggaactggttcttattccttattcgcgacaaattaggaaccacttttttcaattgcagcttaatgaacttgtatcagttgtaAGTTCCA-TTTATTATTCGACATTTTGGG---CAGTGTAT-AATGAAGGTACAAGATGAAA-AGCCTAATAAATGTT-TTTCATTACCATAAAA----A-T---ACTATTAAATGCATTTCAGTGCACA--------TTTGTAGTA-AAATGAAAGT-TTAAAACAATCGAA-AAAAATAGGTTTACAACTTTTAGGGGTAGGATAtgttt
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                          .            T       .           T           TT         .  T           . AAATTGCAGTATATCAAA                                         C   .   .    .          .      .            .       AT       . G .        G   T   A           CGC        A               .       .      .        .    .                T CGGCC      .           A   A    .   .    .           .    A        .   .                           G  .   A   .      .   .         .                                           .  .   T         .           .                              C      G  G G              ACTAT         T                 C    A              G  .         TT         .    .                     
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1368 )     :                                                                                                                                             GGGGTAGGATATGTTATATATTTTTT--T---AA----TTGTCAATTATCATCACAATT-TGTTCCAAA-TG----T----TTT-AAA-----------AT-----T----------A----------CA----------TTTTGCTGC-ATT--GTT---------TC--TTAAA-TATCAGACGTTT---AAAACG--T---TA-AGA-ATCGTTATGAATTTCC--GTTCCTTATT-----CGGATT---G--AATAAGGAAT-AGGGAAC----TGG--------T---TC----CTTATTCCTTATTCG---CGGCGAAT----AAGGAACC--CA-A-TT-TAT-TTCA---TATTTTTAA-ATTGCATCTTCCT-AAA-TTGTATCAGCATATGTCTCAGGTCGGTGGAATTCGTCA---TGCA--AATGTTTTCATT-TTGTACTGGATGCNTTAACCAAGTTATTAAANAG-TACCAGTTCCAGTTCCTTATTCGAC-TTTTGGAATCC--TGTCTGAATGAAGGTACGAGATGAAAGAGCCTAACAAATGTG-TTTAATTATCATAAAA----A-T---ACTATTGAATACATTTC-AACGCACAT--T-----TGTAGTA-AAA-TGAAAAT-TTGAAAAAATCGAA-AAATCTAGGTNTACGCCTAACGGGGGTAGGATA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aATTTCCTGGTTCCTAATT-----CG----------AAAAAGGAAT-AGGGA---------------------------CTAAGT-----------------AAT----AAGGAACT--AA-G-TT-TATGCTCA---TGTGTTCAA----GCATATTa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agttgaataagtaataaaaaactgaggacat--TGTTGGAATGAATGTACGTGTTGAAAGAGTCTAATTAATATG----AATACTCACA----------------ACTGAATATATTCC-AACGCttaat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA-TATTAGAAGTTT---AAAACA--T---TT-TGATATCGTTATGACTGTCCA-GTTCCTTATT-----CAGATT---A--AATAGGAAAT-AGGGAAT----TGG--------T---TC----CTTATTCTTTATTGG---CGGCCAAT----AAGGAACtgttatatatagga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     ----T----TTT-AAA-----------ATCCACTT----------A----------CA----------ATTTG-TAT-ATTAGGTTACAGATATATC--TTAAAATATCA--CTTTTTGGGAGAC--------A-AAA-AT--------ATTT----GTTCCTTATT-------GGCC---GCCAATAAAGAAT-AAGGAAC----CAA--------T---TC----CCTATTTCCTATTTA---ATCTGAAT----AAGGAACaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                      aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtcca-ACT--GTT---------TCAGTTGAA-T--TAGAAATAT---AAAAAC--T---TA-GGC-AT-GC-ATGTAGTTCCTGGTTCCTTATTAAAAACGGAATAGGG--AATAAGGAAT-AAGGAAC----Tttaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaactgtttcagttgaattagaaatataaaaacttaggcatgcatgtagttcctggttccttattaaaaacggaatagggaataaggaataaggaacttactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|20                         :    aatattagaagtttaaaacattttgatatcgttatgactgtccagttccttattcagattaaataggaaatagggaattggttccttattctttattggcggccaataaggaacaaatatttttgtctcccaaaaagtgatattttaagatatatctgtaacctaatatacaaattgtaagtggattttaaaattaattattttgcactagtattcatcatataattttaaataatttcagtatagttaccgatttttttgattagcctttttcaatcaataatttcatagaaagtgtagaacttatttctataaaataatttatacatagctgaaatcagcttaattagtgagttcaATTTCC--TTTCCTT-TT---------TT---G--AATAAAGAACCAGGGAATAAATCGG--------TATTTC----CTTATTCCTTATTCtactttacgctcatcacattttgatcttcgc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gctC--TGCCTGAATGAAGGTACAAGATGAAAGAGTCTATCATATCT--TTTAATTATCAAAACT----A-T---ATTATTGAATATATTTC-AAAGCACAT--T-----TGGAGCA-AAA-TGAAAAG-TTTACAAAaaggaataa
gi|3                          :                                                                                                                                             GGGATAGGGTAT------TATTTTTAAAC---AA----AAATCAAATATTATCACAATT-CACTCCAAA-TG----G----TTTAAAA-----------AT-----T----------ACTCAACATCCCA----------TTTTGCTGC-ATT--ATT---------GC------A-TATTAGACATTG---AAAAC---T---TATAAA-ATCGTTATGAAT-------------------------TT---A--AATAAGGAAT-AGGAAAC----TGcacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccagTGTCTCAGGTCGGTGAAATTCGTCA---TGCA--AATATTTTCATT-TTGTACTGA--GCCTTAtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagccttattcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaacCCTTATTCGAC-TTTTGGTATCC--TGTTTGAAT--ATATAGAAGATGAAAGAACCAAACAGATGTG-TTTAAATATTATAAAAAAGCA-T---ATCATTGAATGCATTTC-AAAGCACGT--C-----TTTTGTG-AAATTGAAAGT-AAGAAAAAATCGAACAAATCTAGGttcgacttttggtatcctgtttgaatatatagaagatgaaagaaccaaacagatgtgtttaaatattataaaaaagcatatcattgaatgcatttcaaagcacgtcttttgtgaaattgaaagtaagaaaaaatcgaacaaatctagg
gi|4                          : ctgcctgaatgaaggtacaagatgaaagagtctatcatatcttttaattatcaaaactatattattgaatatatttcaaagcacatttggagcaaaatgaaaagtttacaaacacctccaggggatagggtattatttttaaacaaaaatcaaatattatcacaattcactccaaatggtttaaaaattactcaacatcccattttgctgcattattgcatattagacattgaaaacttataaaatcgttatgaatttaaataaggaataggaaactgtctcaggtcggtgaaattcgtcatgcaaatattttcattttgtactgagTT---AAAACA--TACATA-ATG-ATCGTTATTAAGGCCC--ATTCCTTATT-----CGCATT---G--AATAATGAGT-AGGGAAT----AGG--------C---CC----CTTATTCTTAATTTG---CGGCCAAT----AAGAAACCAACA-AGTTATAT-TTCAAGTTATTTTTA-----------TCTT-ACA-TTTTATAAGCGTATTATTCAAACAGGTAGA---CGTTATTTTGCACCAA-GATTTAATTATTGT
gi|5                          :                                                                                                                                                 TAGGACATG------ATTTTTT--TTCAAA----TTGTCAATGATCATCACAATT-TATTCCGAA-CGA---T----TCT-AAA-----------AT-----T----------G----------CAGTATATCAAATTTTGCTGC-ATT--ATTG--------TC--TTAAT-TATAAGACATTT---AAAACT--T---TT-AAA-ATCGTTATAAATATCCA-GTTCCTTATT-----TAAATT---G--AATAAGAAAT-AGGGAAC----TGG--------T---TC-----TTATTCCTTATTCG---CGACAAAT----TAGGAACC-----A-CT--------------TTTTTCA-ATTGCAGCTTAAT-GAACTTGTATCAGttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttccttgtttcttatttaaaaaacggaataggaaatatggaataaggaactaactttatgttcatgattaataacata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAAGTTATTAAACA--TACCAGTTCCAGTTTTTTGTTTGAC-TTTTGGAATCC--TTGAGGAAAGAAAGCACGAAAACAAAGAGCCTACTAAATATG-TTTAATTACCTTAAAA----A-TTGCATT-TTAAACACTTTCC-AACCCATAA--T-----TGTCATA-AAA-ATAGAAT-TTTAAAAAAT-GTA-ACATTTAAGTCTACGCC-AACGGGGGTAGGATAttgtacaagttattaaacataccagttccagttttttgtttgacttttggaatccttgaggaaagaaagcacgaaaacaaagagcctactaaatatgtttaattaccttaaaaattgcattttaaacactttccaacccataattgtcataaaaatagaattttaaaaaatgtaacatttaagtctacgccaacgggggtaggatatgttt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taggacatgattttttttcaaattgtcaatgatcatcacaatttattccgaacgattctaaaattgcagtatatcaaattttgctgcattattgtcttaattataagacatttaaaacttttaaaatcgttataaatatccagttccttatttaaattgaataagaaatagggaactggttcttattccttattcgcgacaaattaggaaccacttttttcaattgcagcttaatgaacttgtatcagttgtaAGTTCCA-TTTATTATTCGACATTTTGGG---CAGTGTAT-AATGAAGGTACAAGATGAAA-AGCCTAATAAATGTT-TTTCATTACCATAAAA----A-T---ACTATTAAATGCATTTC-AGTGCACAT--T-----TGTAGTA-AAA-TGAAAGT-TTAAAACAATCGAA-AAAAATAGGTTTACAACTTTTAGGGGTAGGATAtgttt
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                           ggtcagatagttccatttattattcgacattttgggcagtgtataatgaaggtacaagatgaaaagcctaataaatgtttttcattaccataaaaatactattaaatgcatttcagtgcacatttgtagtaaaatgaaagtttaaaacaatcgaaaaaaataggtttacaacttttaTTCCTGGTTCCTTATT-----C--------G--AAAAAGAAAT-TAGGAAT----TAATGATGTATT---TC----CTGGTTCCTTATTTGAAAAAG-AAAT----AAGGAACT--AA-C-TT-TA
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): TCTTCTAAGTAATATTTTAAGTAATATTTTTCTTACAATTTTATATATAAGTAGTCTCTGAGATATATTATATATTTTAGGTTTCATGAATCTATTGAAATATAATTATTTCGGCATCTTTACCGATTTCGAATTAGCTTTGTTTAATCAATTATTAAACTTACATTGAAAAGTGTTCAAATACTTCTATAAAAACAGTTATACTTTATCAAAATTACTATTTTAGTTGAATAAGGAATA
Unaligned ( gi|13 ): CGTTATGAGTGTCCAGTTTATGTTTATCTTACCGTTTATAAGCGTATTTTATAAGTAGACTTTATTTTGCAATAGGATTCATCATATATTGTACGTCTCATCCAAATATCGAAAAACGCTTATTTCGGCATCTTACCGATTTTGGATTAGCTTTGTTTAATCAATATTTACATAGAGAGTG
Unaligned ( gi|18 ): TTTATTTCTATAAACTCATTTATACATAATTTAAATCGGTTTAATTAGAGAGTATTACTATATTATTTGAATAAGGAATAAGTAACTAACTTTACA