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gi|11                         :                                                                                                                                       tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaATTG-TTATCTATCTATT--AATATACGTTTTATA--------------T--TTGTAA--CAC-TGTTGTCACT--GTTCACTATATATTTATAAATG--AA-ATTTTGTATATGGGCCGG-AGGCCTAGATTGCTTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAAA-TATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCAT-GTTATAGTAAAGACCA-------ATCACTCACACAGTTCT-TAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaagcaTCCCAA-GTAATAGCAGAGATCA-------ATCATTCACACAGTTCT-TGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGTTAAA-ATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCAATGTACTAGCAGAGATCATATTAGTATCATGCA-AGAACTGTGTGAATGAT-------TGATCTCTGCTATTAC-TTGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcGATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACATGTCCTGCatatgtgcaccggtgcttcatcagcctttgtatcctacgatggaaagtgtgaatcacttattgattttatcattttgccagttgagaaaacagattgtattactcattgtgtaatagtagatgacgattgtctaaatgtttcaagacttggacctattaaatgtagtctgaatatgccttcgactggttataatgacgatgtgtcgaatgtaaatatttcgcaatcataaaatattaactggaaaaaagtaagacaagttgatattacatcctatcaaaacatgctcaatgcatcagaagatttgataaaagcacaaaattgtccgttaaaatgtcctgctgaaattgataatatgtataaaattttaagcgagactgttgttttttgctcagataactgttttcgcaagacgagatttagcactttttaaaaccgtattggaattcagagttatctaatttacataaagtcatgttagaaaaacggaaaatctggattcaaaatgatagaccaagagatcaatcacattattcttataaaagttataaaacagcaaaatgttatttcagaaaaaaacgcaggtattttgccaatgagtatttaaacaatcttgatgaagaaattgacacaaccgctgaacttgataaagaacaattttggaaattagtgaattcgcgaagaaaacggttatcaagtagagcaggcgctgaaagaaaattcaatggcgtaatgtatagggataacgacagtattacagagcaatggaaacaatattttgaatcgttatataccccgtcaattgatagtaattatgataatatttggaaagcttctgttgacgaaaaattaaattctgttatatcgcagtctagattttgtattgatgacgtcattaatgtgtcacaggaagaagtaagaacctcaatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTACTTGAGTTCAGAATTATCTTATTTACATAAAAATCATGTTCTAAAAAAGGAAAGTCTGGATTCAAAATGATAGACCATTTAATAAATTATATTATTTGTATTAAAACTATAAAACAGCA---TGTTTCATTTTTTTAAGAAAAAGGCA-AGGTATCATGCCAACGAATTTTTAAACTA-CTTGATGAAGAAATGGACACAACCGCTGAAATAGATACAGAAATGTTTTAGAAATTAGTAAAT--GCG--------------CAAGTAGAACAGGTTTTGAAATTATATTCAATGGTGTATTGTATAGAGATAACGACAGTAATACAGAACAATGGAAACAATATTTTGAATCATTATATACCCCATTAATTGATAGTAAATATGATTAGATTTGGAAA------GTTGACGAAGAAATAAACTCTGTTCTATCGCAGTTCAGATTGTGTATTGATGACGTCATATTATTTAATGTGTCACACGAAGAAGTAAGAACATTAATGGCATCGTAAACACGCAACAAACCTGGTGAAATAGACACTGTTT-TTACGAACGTTA-ATCTTTTGCGGAAA-----TTATTGA-----AATATG----TTAGCAATACT-TATTTCAGTTATGCTT----TCCCAAAGTTACATTCTACAAAGCA--TT--GCCAATGGTGTCAATATAAC-ACGTT-----ATAAAAGTGG-GGGTAA------ACGTAAGGATGATCCAAATAACTATAGGACAAT--CATTA----CTATCACTCTTAAACTATATGAATAAACACTTCTTTT-C-------GTTTTAAA---CAAAAATTATTTAACAAT------TTAAATAATCAACAAGGTG----------------TGA-------TGATGACTTCCTTTGCCATAAAA-AATGTTTTCTA----TAT--GGTAGGGAACACAATAGTAAG--TATTTTGTTTGCTTTATGGATGTTAACCAAGATTTTGATAAGGTATGGTATAAATAATTGTGGATTTTTTACTC---------AAATTGTTT-------GA--TACCGAC--T-TACAAA--TTATATA------T-TTATGGTATGCCTTAA--TTTG-TACCGAAACATGCA--AAGTTGCATGCGAA-ACCAAGGT----TCGGTA-TCCGAGTTGTTCAT--TGTCCTTCAAGGAATAAGACAAG--G--CGGTAAA-AAAT---CAACAATATT--TTATCTT--CTTTTCATTGA---CCTGATCAAATAAATAGAA--AGTA-GC---GG----TTT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-CAAATTAAAGGTTGGTGC---TCCTACCATTGCGGATGATATG-GTTCTTG-AAT---------CGTATTCAAAGTTCGGTATAGGCCAAATGCTTGATATTTGCTAC------TCTATAA-A-AATGGAGAAACGATTATAATC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCCAG--GGAT-GACAAAGTATGTTTTGAACATT-------TG----ATATATAGTAATTGCGTTGTAAGACAACTACTGGTGCAATTTTA-TAATGCTATGTTAAATCTCTCA----TATACTCC--CAAACAAATG--AATAAAGGT---ATTATAA-----TTACTCTATAAATA-GG-GGTTAAGAAGTCACGT---GATGGTCCGTACATTTATCGGGCCATCACATTATCATCTGTTTATGTTAGACTGTATGG------ACTTATGTTACTAGAAAGGTT--AAAGGGTAAAGAC--------AATATAGAATTAAATAGACAGCAGGGTGGTTTCCAAGAA--AATTTGTCCTGTTAAATGACGTCATTTTTACTAAAAGAGTGTATTCAC----TTT--GGTAAAGAATGTGATTTCAAACTATATATATTTGCATCTGAGATGATAAACAGGCCTTCGATACAATATGGCAAGA-------T-AA-GTTAT-TTCTTTTTAATTAAATGATTTAACAGCAGA--TAGAAGT-GTATACAAGGCCTTTACA------T-TGATGTtatgctagtgttggttttaatgaatccaaatatcactttactaaaaacagccagtcatggaagcaaggacctagtaacgttattctttaaactgaaaagtatatacatctaggagttata
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atggggtagatactttgctgacaccatctaataaacacaattttgacaatacctttaaggaagatatttctgaaaaggtcggtcatttgcatagtcgcttatttcaagattacggtagtggccgcagttgttatatattctcaaacgacgatataacgaatgcatttagtaaagtgaagagatcaaaagccATATACCACCAAACA--TATAAACAGAAGT---ATTATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAG-AAGTC---ACGT---GATGACCCGAACA--------GCTATCACAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAAagaaagtcccgtttaattttgtgatcgtttatctgactgattccctgctaaagacccagatagggtggggtcagcagccctgtactgtacttattttttatcaatggtttaataaaagaactacgcgaccctggtctagggatattagtttatgatttaaattgatccccatcgttgcagaagatatgtgtttgatttcaatttcaaaacatgcattggataaaatgatggatatttgttatagatactcatgctgatggaagtttgaatacaatgctaataaatgtgcttttattgtctttattgaatctgatcgtgattttaaattatgtaaccatgtctggatattaggatatggtcatgttaaagaaacagatacgtatgctctttttgggtattgtttgtaaaaacaatatgagtagcctgcccaatatcaatgaagctaattctaaactgcatggagcgttagcgttctttagcctaatgagtagttnnnnnnnnnngttctaaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTCTTCTGCAC---GAGA--GTATTTTACGAATATTTGGCAAAGAAAACCACAGTAAA--GTTTTTGTATGCTTCCTTGATGCCCGCCAAGCTTTCGAGAATGTATGGCATGA-------CGAA-CTTCTATAT---------AAGCTATTG-------CA--GACCAGC-ATCTACCAA---TACACG------CATTATG---CTTTTGAAACTATG-TACCATTCTATGGA--GAGTTGTGTGCGTA-ATC---GGCACTTTTATT-T-TGACTGGTTCAG--AGTTTTACAGGGTACAAG---------------AA-AGTT---CTCCATTGTT--ATACATC--CTCTACAAAAATGTGCTGCT------CATTGAACTCG-A-GA---AT----TCTCACTATGGC---AT-GCGCG--TG-TA-TAACATAAAGGT---TACATGTCCAAATGTAGCTGACGATATG-CTTCTTA-TAT---------CATATTCAAAATGCGGTCTAGAAAGAATGTTTGCGATTTGTTATGAATA--CTAT-A-G-Attatgttattagacaggttaaaggggttatgccaatataaaaacagatagacagcagggttgtttccaacaaaagttgtcgcgtgtcggtgatgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gTATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGA-------TGGG--TTATTTTTTT-------AAATTAAAT-------GAACTAAAAATAGT-TG-AAA--GTATTTACAAGGCT-TTCT-TTAGTCTTTAC--AATGATGTCGAGAGACGCGTTAAATTTCGT--GAACACT-------------TT-TCTGACTGGTTCCC--TGTTAAACATGGTACCAGACAGGTTG--GGATCAGCAGC------CCGGCACT--GCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACTTCGCC--ACT---CT--GG----TCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATA---ATTTTTA-TGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CAT-GCC-GATGGAGGTTTGAATACAATtgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acgtgattctaaattataGA----TCGTTTATCTGACTGATTCCC--TGCT----AAAGACCCAGATAGG--GTGGGGTCAGCAGC------CCTGTACT--GTACTTA--TTTTTTATCAATGGTTTAATAAAAGAACTAC-----GCG-ACCCTGG----TCT-----AGGG---AT-AT-TA--GT-TTATGATTTAAA--TTGAT-----CCCCATCGTTGCAGAAGATATGTGTT--TGATTT---------CAATTTCAAAACATGCATTGGATAAAATGATGGATATTTGTTATAGATACT-CAT-G-CTGATGGAAGTTTGAATACAATgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atggggtagatactttgctgacaccatctaataaacacaattttgacaatacctttaaggaagatatttctgaaaaggtcggtcatttgcatagtcgcttatttcaagattacggtagtggccgcagttgttatatattctcaaacgacgatataacgaatgcatttagtaaagtgaagagatcaaaagccgccagggatgacaaagtatgttttgaacatttgatatatagtaattgcgttgtaagacaactactggtgcaattttataatgctatgttaaatctctcatatactcccaaacaaatgaataaaggtattataattactctataaataggggttaagaagtcacgtgatggtccgtacatttatcgggccatcacattatcatctgtttatgttagactgtatggacttatgttactagaaaggttaaagggtaaagacaatatagaattaaatagacagcagggtggtttccaagaaaatttgtcctgttaaatgacgtcatttttactaaaagagtgtattcactttggtaaagaatgtgatttcaaactatatatatttgcatctgagatgataaacaggccttcgatacaatatggcaagataagttatttctttttaattaaatgatttaacagcagatagaagtgtatacaaggcctttacattgatgtagaaagtcccgtttaattttgtATT-TCTGACTGGG--AACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTTGGCACTG-TATTTAATAT------TTGTCA---ACAATTAGATAAAAAA-----AA--ACTATGC---AAGTGATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATGTGTGTTTGAG-T-T---------CATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTATTCgctaataaatgtgcttttattgtctttattgaatctgatcgtgattttaaattatgtaaccatgtctggatattaggatatggtcatgttaaagaaacagatacgtatgctctttttgggtattgtttgtaaaaacaatatgagtagcctgcccaatatcaatgaagctaattctaaactgcatggagcgttagcgttctttagcctaatgagtagttnnnnnnnnnngttctaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aattgttgaaagcatttatgtgtatatatatatttactatattacgtctttacaccgttttagagagtcgcattaaatttcctgatcacTT-TCTGAGTGGTTCAA--TGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTT---CACCAATATT--ATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACATAGAA--AGTA-GC---AG----TCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATATG-GTTCTTG-TAT---------CGTATTCAAAGTCAGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATCatgtcgttggaggtttgaaagcaatgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
18 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
Unaligned ( gi|15 ): AGTCGCTTAGTTAAATAAGGTATTAATTGACACTGGTATTTTAATGTCTCAATTACTTATAGTTGTAACGAATGCATATAGTAAAGTGATGGAAGCAAAAATGTCGGCAAGACAACATATATTAACTGTTAACAAAGGTGTACTGGTACATGGCGGGTTAACGTTCTCTCATACACCTAAACAAGTGATATTATGGTATTATGATAATTCAATTTATAGGGGACAAGATGACAACGTGCTATGACATTACCTTCTCTTTGTCAGACAAAATGAACATATGTTACTAGATGGGTTGAAGGATAATAAAACTAATGTGATACAAACAGTCAACAAGATGTTTTCTATGTCAGGTTGTCTTGCGGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTATCAGATCAAGAGGGTGATTT
Unaligned ( gi|17 ): CTTTGTGTTAAGCTCTCTCGGTGTTACTTCAATTGAAACGGCAATCGACTACAGAAAACTACAGTTCTTTGGTCAGGAATGCATACTTTCGATTACGTATATAGCTAAGCAGTTATTTGTTAATATATAGTTCGGTCAGATCTCTTAGTAACGATAAACAAACATTATATTTTAGTTTTAATATCTATACACTATTAACGAAATATTGTACTCTTTTGTTAGCTATTCAATGCCATATTTCCGTCTTAGTAGTATGGAGATATCCTCAGACAGAAA
Unaligned ( gi|18 ): CCTGACATCTATAGAATATTAACGAAGTATGATCTATATAATTATTTGGTTAATTATTCTAAAACGGCAATATTACCATCCAAGTATGCATGGAAATATATTCTTAGACAAAAAGTGCTAATACATTACTCAAATACAATGTTAATGAGGTTAGGTGACAAGATAGGTCCATTATATGTCATGAATATGTTTAGCATAAATAGGCCTTGCTTCCTATGGCAATTAAGTAGGAAAAATCAGTATGTAAAAGC
Unaligned ( gi|19 ): TTTTGATGTCTGTGAAAGCCTGGTTTCTTATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCGTGCACATGTTTGTACAATAAAGCATTCTGGAATTTGAATGTTAATTAACTGTCCTGCATGCTTTATTCGTTTTAATAACATCTTTTGTGTACTGTACTTGATTTGCCGTTCACATCTGTCTTATACTTTATGTTTATGTAATAACAAGTATGCTGCACTGGGATACTGGAGAAAATAGAA
Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
Unaligned ( gi|21 ): CTATACGTTTTTGTGTGTACATATTCAAGCATGTGGATATGTATGTGTGTCTCAGTTAATACATTTGTATGTGAGATTAATGCGATGGAGTGATCTGCAATTTAAATGTTAAATACTTGTCTGGTATGCTATACTCTATTTAGTAACTATAT
Unaligned ( gi|23 ): GCAATTCAAATGTTAAGCATTTGTCCTGTTTGCTTTACCCTATTTGATAATGATAACTTTTTGTATGTGATTTGCTATTAATATTCATTTGAACTGTTCTTTATATAATCCGCTAATGGAGGAAATA
Unaligned ( gi|24 ): CTTTCTATTGATTTATGTTTTATATTTGTAAAACTGTTTACACAATTATGTATTATGGGCCAGAGGCTTAATAAAACATTTGTCATTGTCATTATCATTTGTCGTGATATACG
Unaligned ( gi|25 ): TGACAAGATGGGTCCATCATATGTCATGAATATGTTTAACATAAATAGACATTGCTTCCTATGGCAATTAAGTAGGAAAAATCAGTATGTAAAAACA
Unaligned ( gi|26 ): TGATATATTTTTGTATGTGATTTGCTGTTCATATTATTGTTTACTTTGTTCTATATGCAATGACATATGTTGCTCTCTGTTATTGAAGGAAATAA
Unaligned ( gi|27 ): TCATATGTCATGAATATGTTTAGCATAAATAGGCCTTGCTTCCTATGGCAATTAAGTAGGAAAAATCAGTATGTAAAAGC
Unaligned ( gi|28 ): AATGAGTAGTGGTAAACATGAAAATCGGTAAACCCGATCACTTTAAATAAAATATATAAATCAGTTAT
Unaligned ( gi|29 ): GTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGGCTATTGGTGAAATTACATTATGCTAT
Unaligned ( gi|30 ): TCATGTTCATGTTTACTATATTATTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAA






Alignments
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTAGTTG---TACTTATCAGTGCTGTTTT--GAAAT---ATTGCTTACGTAGCTATAAAGCACACGTGATTGATAGAGTGTTTTGCAACTGTTAACTGAATGATGTAATATTGATTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTNATCTANNTANTAGAATATACGCNTTATNAATTCTACAGACAATAACTGTAAA-CAC-TGTTGTCACTTANTTCACTNCNTGTTTATAAA--TGTT-ANTNNNTT--GCAT-ATGGGCCGGCAGGCCTAGGTNGNNTAGCTAAACATTTGTCATTGCCATNGTCATNTGTCTTCAAATTATGNTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATAC-AATATGATCTCTGCTANTAC-TTGGNTACGTGCACNGGTGCTTCGTCGNCCTTTGTATCCTACGGTGGAAAGTGTNANTCNCTCATTGATTTTNTCATTTNNCCNGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCNAATGTAAATATTTCGCNATCATANAATATTAACTGGAAAAAATGTAAGACNAGTNGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCNGANNANTTGATAAAAGCACGAANTTGTCNGTTNAACATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTACTNGAGTTCAGAGTTATCTNATTTACATAAAGATCATGTTNNAAAAANGGAAAGTCTGGATTCAAAATGATAGACCANNNGATNAATCACATTATTCGTATNAAAGCTATAAAACAGCAAAATGTTTCATTTCTTTAAGAAAAAGGCGCAGGTATCNTGCCAACGAGTNTTTAAACNATCTTGATGAAGAAATNGACACAACCGCTGAANTNGATANAGAANNGTTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAANNANATTCAATGGCGTANTGTATAGGGATAACGACAGTANTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAANTATGATNANATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAGAANTAAACTCTGTTNTATCGCAGTCCAGATTNTGTATTGATGACGTCATATTATTTAATGTGTCACANGAAGAAGTAAGAACNTCAATNGCATCGTAAACACGCAACAAANCCGGT-GGGATAGACANNGTNTGTTNCGAACGTTA-ATCTTTNGCGGANATATAGTNATTGNGTTGTAANACGACTACTGGCGNNACTTTATTNNNGCTATGCTNAATCTCCCAAAGTTATATTCCACCAAACA--TN--AACAAAGGT---AT---TATAAC-A-TT-C--TCTATAAANGTGGGGGTAAG--A-----CGT---GATGATCCGAAC-A-CT-AT-GG-GCNATCA-CATTATCATCTGTTTNTGTTAGACTATATGAATAAACACTTNTNTTACTAGAAAGGTTTTAAAGGGCA--AAGACTATTTAACAATATAGAATTAAATAGNCAGCAGGGTGGTTTCCAAGAA--AATTNGTCCTGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAGGCCTTCGATAAAGTATGGCANGA-------TGG---ANTTNTATTC--TTAAATTATTTGA--TANNAGC-GT-TACAAA-NTAT--ACA----T-TTA---TGTTAN-TCTTTA--A---T--ATGTACCGANANACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTNTNCAAGGNACNAGACAGG--G--GGGTCAGCAGTTCACCGGTATTATATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAANTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTNTTCAAAATNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGTTATAGATACTCCAT-A-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAATA--ATATACATTTTATAAGTTCTCTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGACT---CTA---GTTTA--AA--TGTT-AA-AGGTA--GCAG-ACGAGTCGGTAA----AGGTGGCGTAGCT------------TTGCTATGG-CATAT-----TAAAT-ATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-ATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCAT------TAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAATGTTTCTTACGAACATTACATTTTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC----ATTAGCAAAACTGTAT-ACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACCAAACA--TG--AACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A-TTAC-----ATAAAGGCGGAGGTAA---A-----CGTAAGGATGATCCCAAT-AATT-AT-AGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC-------GTTCCAAA---CA--AAAACTTCTTTCTAAT------TTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGGT--TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACTT--ATGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTAT--ATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTTA--A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATTA--ATATACGTTTTAT--ATT--------------TGTAA--CAC-TGTTGTCACT--GTTCACTATATATTTATAAA--TG---AA-ATTTT--GTAT-ATGGGCCGG-AGGCCTAGATTGCTTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAAAT-ATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAATTCTACAGACAATAACTA-AAA--------TGTTACTTAT---ACTCCC-----GTAAA--TGTT-ACTTGG----GCAT-------TGACAA----AGGTGAAGTAGCT------------TTACTATGG-CATA-----TCAAATTATGcaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTAT--ATA----T-TTACTATATTACGTCTTTA------------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aattgttgaaagcatttatgtgtataGGT---AT---TATGAT-AATT-CAATTTATA-----GGGGACAAG--A-----TG--------------AC-A----AC-GT-GCTATGA-CATTACCTTCTCTTT--GTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAGATGGG--TTGAAGGATAATAAAACT-------AATGT-GATACAAACAGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC--AGGTTGTCTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcatacacctaaacaagtgatattatATATACCACCAAACA--TATAAACAGAAGT---AT---TATAATTA-TT-C--TTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCA-----CGT---GATGACCCGAAC-A----------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAAT-------TATGTTATTAGACAGGTT--AAAGGG-------GTTATGC--CAATATAAAAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA--AAGTTGTCGCGTGTCGGTGAtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACGTGATTCTAAATT-A-TATATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGA-------TGG----GTTATTTTT--TTAAATTAAATGAACTAAAAATAGT-TG-AAA-GTATTTACAAGGCT-TTC---T-TTAG-TCTTTACAA---TG-ATGT--CGAGAGACGCGTT-A-AATTTCGTG---AA----C----A----CT----TT-TCTGACTGGTTCCCTGTTAAACATGGTACCAGACAGGTTG--GGATCAGCAGC---CCGGCACTGCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACT--TC-GCCACT--CT--GGTCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATAATTTTTATGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CAT-GCC-GATGGAGGTTTGAATACAATtgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAGTT-AACATGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTATATTTGTAAAACTGTTTACACAATTATGTATTATGGGCCAG-AGGCTTA------ATA---AAACATTTGTCATTGTCATTATCATTTGTC
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGTTAAA-ATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTATAAA-CAC-TGTTGTTACTANT-ACTNTATATTTGTAAA--TGTT---A-NNGGT-TGCA-TACGGGCCGGCAGGCCTAGGTGGCGTAGCTAAACATTTGTCATTGCCATNGTCATNTGTCTT-AA-ATATGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTC-----ATTTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA--TG--A-ACAAAGG---TAT---TATAAC-A--TTACTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGTAA-G-GATGATCCGAAC-ATT-AT-GGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATGAATAAACACTTATGTTACTAGA-A-GGTTTTAAAGGGCAA--AAAC-TATTT--C-AATATAGAATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGA-------TGG---ACTTCTNTNC--TTAAATTATTTGA--TANCGGC-GT-TACAAA-NTA--TACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTT--A-A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACAGG--G--GGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCAT-G-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTG---ACTCTA-GTTT--AAA--TGTT---A-AAGGT-AGCA-GACGAGTCGGTAA----AGGTGGCGTAGCT------------TTGCTATGG-CATA----TT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTC-----A-TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA--TG--A-ACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A--TTAC---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGTAA-G-GATGATCCCAATAATT-ATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC--------GTTCCAAA---CAA--AAACTTCTTT--CTAAT------TTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACT--TATGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTA--TATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTT--A-A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT-----------------AA-CAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----A-AATTT-TGTA-TATGGGCCGG-AGGCCTAGATTGCTTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA-AAA--------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---ACTTGG---GCA-T------TGACAA----AGGTGAAGTAGCTcaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTA--TATA----T-TTACTATATTACGTCTTT--A-----------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACAAGTG--ATATTATGG---TAT---TATGAT-AATTCAATTTATA-----GGGGACAAG--A----------TGAC---AAC-GT-------GCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAGA-T-GGGTT-GAAGGATAATAAAAC-TAATG--T-GATACA------AACAGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACA--TATAA-ACAGAAG---TAT---TATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAAC-A--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAA-------TTATGTTATTAGACA-GG--TTAAAGGG-------GT-TATGC--C-AATATAAAAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TATTG--ATTTAT-GTTTTATATTTGTAAAACTGTTTACA-CAATTATGTATTATGGGCCAG-AGGCTTA------ATA---AAACATTTGTCATTGTCATTATCATTTGTCGT-GATATACG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCG-TTAA-AATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTC-----A-TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATatagatgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTA--AAACAC-TGTTGTTACTNAT-ACTCTATATTTGTAAA--TGTT---ANAGNT-TGCAT-ACGGGCCGGCAGGCCTAGGTGGCGTAGCTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTT-AA-ATACGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA-A-TGA-ACAAAGG---TAT---TATAAC-A--TTACTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGTAA-G-GATGATCCGAACAATTATAGGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATGAATAAACACTTATGTTACTAG-A-AGGTTTTAAAGGGCAA--AAAC-TATTT--CAATAT-A-AATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGA-------TGG---ACTTCTTTNC--TTAAATTATTTGA--TANCGGC-GT-TACAAA-NTAT--ACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTTA--A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACAGG--G--GGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCAT-G-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGA---CTCTA-GTTT--AAA--TGTT---AAAGGT-AGCAG-ACGAGTCGGTAA----AGGTGGCGTAGCT------------TTGCTATGG-CAT----ATT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAAC--A-TGA-ACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A--TTAC---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGTAA-G-GATGATCCCAATAATTATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC--------GTTCCAAA---CAA--AAACTTCTTT--C----T-A-ATTTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACTTA--TGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTAT--ATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTTA--A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT------------------AACAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----AAATTT-TGTAT-ATGGGCCGG-AGGCCTAGATTGCTTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA--AAA-------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---Acaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTAT--ATA----T-TTACTATATTACGTCTTTA------------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATcttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACA-AGTGATATTATGG---TAT---TATGAT-AATTCAATTTATA-----GGGGACAAG--ATG----------------ACAAC----GTGCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAG-A-TGGGTT-GAAGGATAATAAAAC-TAATG--TGATAC-A-AAC-----AGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACATA-TAA-ACAGAAG---TAT---TATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAACA--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAA-------TTATGTTATTAG-ACAGG--TTAAAGGG-------GT-TATGC--CAATATAA-AAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGTGATTCTAAATT-A-TATATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGA-------TGG---G-TTATTTTT--TTAAATTAAATGAACTAAAAATAGT-TG-AAA-GTATTTACAAGGCT-TTC---T-TTAG-TCTTTACAA---TG-ATGT--CGAGAGACGCGTT-A-AATTTCGTG---AA----C----A----CT----TT-TCTGACTGGTTCCCTGTTAAACATGGTACCAGACAGGTTG--GGATCAGCAGC---CCGGCACTGCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACT--TC-GCCACT--CT--GGTCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATAATTTTTATGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CAT-GCC-GATGGAGGTTTGAATACAATtgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TATTG--ATTTAT-GTTTTATATTTGTAAAACTGTTTACACAATTATGTATTATGGGCCAG-AGGCTTAA------TA---AAACATTTGTCATTGTCATTATCATTTGTCGT-GATATACG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCG-TTAA-AATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATatagatgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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Unaligned ( gi|18 ): CCTGACATCTATAGAATATTAACGAAGTATGATCTATATAATTATTTGGTTAATTATTCTAAAACGGCAATATTACCATCCAAGTATGCATGGAAATATATTCTTAGACAAAAAGTGCTAATACATTACTCAAATACAATGTTAATGAGGTTAGGTGACAAGATAGGTCCATTATATGTCATGAATATGTTTAGCATAAATAGGCCTTGCTTCCTATGGCAATTAAGTAGGAAAAATCAGTATGTAAAAGC
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Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTA--AAACAC-TGTTGTTACTNAT-ACTCTATATTTGTAAA--TGTT---AAANTT-TGTA-TACGGGCCGG---AGGCCTAGGT-GCT-AGCTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTT-AA-ATACGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA-A-TGA-ACAAAGG---TAT---TATAAC-A--TTACTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGTAA-G-GATGATCCGAACAACTATAGGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATGAATAAACACTTATGTTACTAG-A-AGGTTTTAAAGGGCAA--AAAC-TATTTCGATAT-A-AATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGA-------TGG---ACTTNTTTNC--TTAAATTATTTGA--TANCGGC-GT-TACAAA-NTAT--ACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTTA--A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACAGG--G--GGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCAT-G-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGA---CTCTA-GTTT--AAA--TGTT---AAAGGT-AGCA-GACGAGTCGGTAAAGGT---GGC-G-T-AGCT------------TTGCTATGG-CAT----ATT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAAC--A-TGA-ACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A--TTAC---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGTAA-G-GATGATCCCAATAATTATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC--------GTTCCAAA---CAA--AAACTTCTTTC----T-A-ATTTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACTTA--TGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTAT--ATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTTA--A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT------------------AACAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----AAATTT-TGTA-TATGGGCCGG---AGGCCTAGATTGCTTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA--AAA-------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---Acaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTAT--ATA----T-TTACTATATTACGTCTTTA------------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATcttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACA-AGTGATATTATGG---TAT---TATGAT-AATTCAATTTATA-----GGGGACAAG--ATG----------------ACAAC----GTGCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAG-A-TGGGTT-GAAGGATAATAAAAC-TAATGTGATAC-A-AAC-----AGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACATA-TAA-ACAGAAG---TAT---TATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAACA--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAA-------TTATGTTATTAG-ACAGG--TTAAAGGG-------GT-TATGCCAATATAA-AAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGTGATTCTAAATT-A-TATATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGA-------TGG---G-TTATTTTT--TTAAATTAAATGAACTAAAAATAGT-TG-AAA-GTATTTACAAGGCT-TTC---T-TTAG-TCTTTACAA---TG-ATGT--CGAGAGACGCGTT-A-AATTTCGTG---AA----C----A----CT----TT-TCTGACTGGTTCCCTGTTAAACATGGTACCAGACAGGTTG--GGATCAGCAGC---CCGGCACTGCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACT--TC-GCCACT--CT--GGTCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATAATTTTTATGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CAT-GCC-GATGGAGGTTTGAATACAATtgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TATTG--ATTTAT-GTTTTATATTTGTAAAACTGTTTACACAATTATGTATTATGGGCCAG---AGGCTTAA-----T-A---AAACATTTGTCATTGTCATTATCATTTGTCGT-GATATACG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCG-TTAA-AATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATatagatgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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Unaligned ( gi|18 ): CCTGACATCTATAGAATATTAACGAAGTATGATCTATATAATTATTTGGTTAATTATTCTAAAACGGCAATATTACCATCCAAGTATGCATGGAAATATATTCTTAGACAAAAAGTGCTAATACATTACTCAAATACAATGTTAATGAGGTTAGGTGACAAGATAGGTCCATTATATGTCATGAATATGTTTAGCATAAATAGGCCTTGCTTCCTATGGCAATTAAGTAGGAAAAATCAGTATGTAAAAGC
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Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTA--AAACAC-TGTTGTTACTNAT-ACTCTATATTTGTAAA--TGTT---AAANTT-TGTAT-ACGGGCCGG---AGGCCTAG---GCGTAGCTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTT-AA-ATACGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA-A-TGA-ACAAAGG---TAT---TATAAC-A--TTACTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGTAA-G-GATGATCCGAACAACTATAGGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATGAATAAACACTTATGTTACTAG-A-AGGTTTTAAAGGGCAA--AAAC-TATTTCGATAT-A-AATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGA-------TGG---ACTTNTTTNC--TTAAATTATTTGA--TANCGGC-GT-TACAAA-NTAT--ACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTTA--A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACAGG--G--GGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCAT-G-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGA---CTCTA-GTTT--AAA--TGTT---AAAGGT-AGCAG-ACGAGTCGGTAAAGGT---G---GCGTAGCT------------TTGCTATGG-CAT----ATT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAAC--A-TGA-ACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A--TTAC---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGTAA-G-GATGATCCCAATAATTATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC--------GTTCCAAA---CAA--AAACTTCTTTC----T-A-ATTTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACTTA--TGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTAT--ATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTTA--A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT------------------AACAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----AAATTT-TGTAT-ATGGGCCGG---AGGCCTAGATTGCTTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA--AAA-------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---Acaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTAT--ATA----T-TTACTATATTACGTCTTTA------------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATcttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACA-AGTGATATTATGG---TAT---TATGAT-AATTCAATTTATA-----GGGGACAAG--ATG----------------ACAAC----GTGCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAG-A-TGGGTT-GAAGGATAATAAAAC-TAATGTGATAC-A-AAC-----AGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACATA-TAA-ACAGAAG---TAT---TATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAACA--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAA-------TTATGTTATTAG-ACAGG--TTAAAGGG-------GT-TATGCCAATATAA-AAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-TATTG--ATTTAT-GTTTTATATTTGTAAAACTGTTTACACAATTATGTATTATGGGCCAG---AGGCTTAA------TA---AAACATTTGTCATTGTCATTATCATTTGTCGT-GATATACG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCG-TTAA-AATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATatagatgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTA--AAACAC-TGTTGTTACTNAT-ACTCTATATTTGTAAA--TGTT---AAANTT-TGTAT-ACGGGCCGG---AGGCCTAG---GC-T-AGCTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTT-AA-ATACGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA-A-TGA-ACAAAGG---TAT---TATAAC-A--TTACTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGTAA-G-GATGATCCGAACAACTATAGGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATGAATAAACACTTATGTTACTAG-A-AGGTTTTAAAGGGCAA--AAAC-TATTTCGATAT-A-AATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGA-------TGG---ACTTNTTTNC--TTAAATTATTTGA--TANCGGC-GT-TACAAA-NTA--TACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTT--A-A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACAGG--G--GGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCAT-G-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGA---CTCTA-GTTT--AAA--TGTT---AAAGGT-AGCAG-ACGAGTCGGTAAAGGT---G---GCGT-AGCT------------TTGCTATGG-CAT----ATT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAAC--A-TGA-ACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A--TTAC---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGTAA-G-GATGATCCCAATAATTATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC--------GTTCCAAA---CAA--AAACTTCTTTC----T-A-ATTTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACTTA--TGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTA--TATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTT--A-A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT------------------AACAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----AAATTT-TGTAT-ATGGGCCGG---AGGCCTAGATTGC-TTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA--AAA-------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---Acaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTA--TATA----T-TTACTATATTACGTCTTT--A-----------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATcttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACA-AGTGATATTATGG---TAT---TATGAT-AATTCAATTTATA-----GGGGACAAG--ATG----------------ACAAC----GTGCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAG-A-TGGGTT-GAAGGATAATAAAAC-TAATGTGATAC-A-AAC-----AGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACATA-TAA-ACAGAAG---TAT---TATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAACA--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAA-------TTATGTTATTAG-ACAGG--TTAAAGGG-------GT-TATGCCAATATAA-AAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTGATTCTAAATT-A-TATATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGA-------TGG---G-TTATTTTT--TTAAATTAAATGAACTAAAAATAGT-TG-AAA-GTATTTACAAGGCT-TTC---T-TTAG-TCTTTACA-A---TG-ATGT--CGAGAGACGCGTT-A-AATTTCGT--GAA------C---A----CT----TT-TCTGACTGGTTCCCTGTTAAACATGGTACCAGACAGGTTG--GGATCAGCAGC---CCGGCACTGCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACT--TC-GCCACT--CT--GGTCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATAATTTTTATGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CAT-GCC-GATGGAGGTTTGAATACAATtgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCG-TTAA-AATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATatagatgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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Unaligned ( gi|20 ): TGACAACCCGTTTAATAAAAGAGGGTTTATATCTGATATATATAACTTATTAAGACATTTTAATTTAGTTTACATAAATGAAAAAAAATATTGAATCGAGTGTATTCCCTTAAAAACAGCTTTGCAAATGTATCAAAATGTATCATTAGACAATATTTAGATACATCCGAGCACTTATCATTGTGCAAGATTGATTTCCATCGTTTTAGTTTTTTTTGTCACTAATCGCTGATTCGGTCCCTT
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTA--AAACAC-TGTTGTTACTNAT-ACTCTATATTTGTAAA--TGTT---AAANTT-TGTAT-ACGGGCCGG---AGGCCTAG---GC-T-AGCTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTT-AA-ATACGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACA-A-TGA-ACAAAGG---TAT---TATAAC-A--TTACTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGTAA-G-GATGATCCGAACAACTATAGGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATGAATAAACACTTATGTTACTAG-A-AGGTTTTAAAGGGCAA--AAAC-TATTTCGATAT-A-AATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGA-------TGG---ACTTNTTTNC--TTAAATTATTTGA--TANCGGC-GT-TACAAA-NTA--TACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTT--A-A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAA----CC---G----NTCG-ATT-TCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACAGG--G--GGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCAT-G-C-GATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGA---CTCTA-GTTT--AAA--TGTT---AAAGGT-AGCAG-ACGAGTCGGTAAAGGT---G---GCGT-AGCT------------TTGCTATGG-CAT----ATT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAAC--A-TGA-ACAAAGGCGTCAT---TATAAC-A--TTAC---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGTAA-G-GATGATCCCAATAATTATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAAATATACTTCTTTCAC--------GTTCCAAA---CAA--AAACTTCTTTC----T-A-ATTTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAA-------TGG---ACTTA--TGC--TCAAATTGTTTGA--TAGCGGC-GT-TACAAA-CTA--TATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTT--A-A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAA----CCAAGG----GTCG-ATT-TCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACAAG--G--GGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCAT-A-A-AATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT------------------AACAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----AAATTT-TGTAT-ATGGGCCGG---AGGCCTAGATTGC-TTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA--AAA-------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---Acaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTA--TATA----T-TTACTATATTACGTCTTT--A-----------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCCT---G----ATCACATT-TCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACAGG--GTGGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCAT-GTC-GTTGGAGGTTTGAAAGCAATcttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACA-AGTGATATTATGG---TAT---TATGAT-AATTCAATTTATA-----GGGGACAAG--ATG----------------ACAAC----GTGCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAA----AATGAACA--TATGTTACTAG-A-TGGGTT-GAAGGATAATAAAAC-TAATGTGATAC-A-AAC-----AGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACATA-TAA-ACAGAAG---TAT---TATAATTA--TT-CTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAACA--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATGAA-------TTATGTTATTAG-ACAGG--TTAAAGGG-------GT-TATGCCAATATAA-AAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACGTGATTCTAAATT-A-TATATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGA-------TGG---G-TTATTTTT--TTAAATTAAATGAACTAAAAATAGT-TG-AAA-GTATTTACAAGGCT-TTC---T-TTAG-TCTTTACA-A---TG-ATGT--CGAGAGACGCGTT-A-AATTTCGT--GAA------C---A----CT----TT-TCTGACTGGTTCCCTGTTAAACATGGTACCAGACAGGTTG--GGATCAGCAGC---CCGGCACTGCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACT--TC-GCCACT--CT--GGTCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATAATTTTTATGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CAT-GCC-GATGGAGGTTTGAATACAATtgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
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blockSeqs                     :                 G   .     TT  C  T C      .    A .                     AG   A G  A      G     T T        T   T    G     A    G                                                                                                                                               C             AA   A T       T          T   G                          T                A    T   T G                          T     T AG              CAA     ACAGACAATAACTA      CAC      TC   G TCA  ATATA   A    AC  TTTAC   T  A     T         .      CTAGATTGCTTAATTA                     T   T      TAA      T  C   .             A             T                C A A C   T      C         C                      A   A                 C TA    C C  G       .   .                  G     .        .                 T                 T                                                                                                                                          T                       C                                                                   T                                                                                                    T                                                                              .    CA                                                                  C                      .                                                  A                                                                                      A      TC     TTTA          GC                             T                                                               T    A          T                                                                                                                                           G                                                               TATTAT                                  G        A C               CA     A     AGTA     . T         AATCTTTT   C     T         GCGTTGT     AA   CTG                       AAATC     A              T    AAG   AT    T  .     CAA     TAAT     T       GGT    A   GAAGTCACGT          GA   ACTATA T  T    T       TT  GCTTT               ATAAACAC         TAGATGGGTTGAAGGATAATAAAACTAATGTGATAC      G AAC      T          TT     TGTCAGGTTGTCT     GTC      A  G           TT A       CTTA    CGAA C TT         G     T     T ATA A                 G   A             GA        A  ATAATTGTGGA      ATT TTAA             AC  A    AGT   C   TG  TT    AGGCTTTCTTTAGTCTTTACAATG                C  TTTT CCCGTTTA     G   GC   ATTTCCTGATCACA         A            CC    AAC     T  C       GTG      C  T   TCA  GG       T  TAA     T  CA                AAACTAT C    GACCCT     CACTAT  GATAT A  A  AG  A  A   T        TGGTGCT              T       ATTTT  T  T    ATT    T        GT CA            A A                 C T   GTC           T   A
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16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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Reference ( family-135 )      :          ATATTTGNTTGGCATACTTATCAGTGNTGTTCTTCGAANTCGGACTGCTTACGTGGCTATAANNCACNCGTGNTTGATANAGTGTNCNGCAGCTGTNAACNGAATNACGTANTATTNACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATNAATCTTAAGAAGCNNAACNTNTTATCGTNGAATGCAACANGTTNAATGTCCAGTAGCACTTACCTATGCANCTCTTTGAACGGACTANCGATNGATNCGTGTGGTGTTTCGGAACATCGGTTATC-AGATANT--AATATACGTTTTAT-AA-TTCT-C-AGACAATAACTA--AAACAC-TGTTGTTACTNAT-ACTCTATATTTGTAAA--TGTT---AAANTT-TGTAT-ACGGGCCGG---AGGCCTAG---GC-T-AGCTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTT-AA-ATACGNTANGTTTGTGACACCGATAANCATTGACGATGATNGAATAGTTGGTATACANANTNANTATNCACACANTCATTCTTTNTTTATATTTCAAGTGTATTCACNATGNAGTAACCATCCCATTGANANNTATACGNATNACATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTNGTATTCAGAAAGTGGTTTTGTTATATTTATGGNCGACTTCAACGCAACCTNTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATACGTGCACCGGTGCTTCGTCGTCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTTATCATTTTGCCCGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACNTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACGAAATTGTCCG-TTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAANTGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAACGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATNGCATCGTGNANACGCGGCAAAGCCGGC-GGGAT-GACAA----TGTTT-TTACGAACGTTA-ATC-TTT-GCGGAAATATAGTTATTG------AATACGATTA---GCGAAACTTTATACAGCTATGCTN----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAACAAATGA-ACAAAGG---TAT---TAT---AAC-TTA--CTTTATAAAGGCGGGGGTAAG--ACGT-AAG-GATGATCCGAACAACTATAGGGCNATCA-CATTATCATCTGCTTCTGTTAGACTATATG-AA-T-TATG-TTACTAGACGGGTTAAA-GGGTA--AAAAC------GAT---AC-----A-AATTAAATAGTCAACAAGGTGGTTTCCAAGAA-AANTTGT-C-TGT-TNGATGACTTCNTTTGCACTAAA--AGAGTGTAT----TCTA----TAT--GGTAAAGAACGCGATAGTAAANT-T-TTTGTTTGCTTCTTAGATGNTAANCAAGCTTTCGATAGGGTATGGCATGACGA------G---CTTCTTTNC--TTAAATTATTTGA--------TANCGGC--CTACAAA-NTAT--ACA----T-TTA---TGTTAT-TCTTTA--A---T--ATGTACCGNNATACGCG---A-AGTTGCGTGCGAAAT---C--GG--CACTGT--TTCTGACTGGTTCANTGTTCTNCAAGGNACAAGACA-GG-T-GGGGTNAG-AGTTCACCGGTACTGTATCTT--CTTTTCATCGATGGTCTGATAAAAGAAA--TA-GAAAGTAGC---GGTCT-----NGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTAAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TGTGTTCTTG-TATCGTNTTCAAAGTNCGGTTTGGACAAAATGNTNGATATTTGCTATAGATACTCCATGCCGATGGAGGTNTGANTACAATC
gi|1                          :          ATATTTGCTTGGCATAC--AT-AG-GATGTTCTTCGAACTCGGACTGCTTATGTGGCTATAACTTACCTTTGTTTGATACAGTATGCAGCAGCTATAAACGGAATTACGTATTATTTACTCAAGCGTCTTTAGTTTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTAATCTGCAATCATGATAAATCTTAAGAAACTTAACCTATTATCGTGGAATGCAACAGGTTTAATGTCTAGTAGCACTTACCTATGCAATTCTTTGAACGGACTATCGATAGATATTTGTGGTGTTTCAGAACATTGGTTATC-AGATAAT--AATATACATTTTAT-AAGTTCT-CTAGACAATAATTATAAAGCACATGTTGTTACTGA---CTCTA-GTTT--AAA--TGTT---AAAGGT-AGCAG-ACGAGTCGGTAAAGGT---G---GCGT-AGCT------------TTGCTATGG-CAT----ATT-AA-ATATGATAGGTTTGTGACACCGATAACTATTGATGATGATAGAATAGTTGGTATACAAATTCAATATACACACAGTCATTTTTTGTTTATATTTCAAGTGTATTTACCATGCAGTAACCATCCCATTGAAAGCTATAGGAATTATATTGACAAGCTTTTCAATTTATGGAGTTTATATTCAGAAAATGGTTTTGTTATATTTATGGGCGACTTCAATGCAACCTGTTCAAAATTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGAATGATACTAATATGATCTCTGCTAATACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCATCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCGCTTATTGATTTCATCATTTTGCCTGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACATAGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATATAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCGCTTAA-A-TGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTCTTGCTCAGATAAATGTTTTCGCAAGACGAGATTTAAGCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACACAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAAAAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTCATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAATAAAATTCAAAGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAAATAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATTGCATCGTGTAAACGCGGCAAAGCCAGT-GGGATCGATAA----TGTTTCTTACGAACATTACATT-TTTGGCGGAAATATAGTTATT-------AATAC-ATTA---GCAAAACTGTATACAGCTATGCTG----TCCCAAAGTTACATTCCACC-AAAC--ATGA-ACAAAGGCGTCAT---TAT---AACATTA--C---ATAAAGGCGGAGGTAA---ACGT-AAG-GATGATCCCAATAATTATAGAGCAATCA-CATTAACTCCTACTGCTCTTAAACTATATGAAA-A-TATACTTCTTTCACGTTCCAAA----CA--AAAAC--------T---TCTTTCTA-ATTTAAGTAATCAACAAGGGGGGTTTCAGGAAGGACTTGG-T-TGT-TTGATGACTTCCTTCGCACTAAA--AGAATGTAT----TTTA----TAT--GGCAGAGAGCACAAGAGCAAGGT-T-TTTGTTTGCTTTTTAGATGCTCGTCAAGCTTTTGATAGGGTGTGGCATAATGG------A---CTTA--TGC--TCAAATTGTTTGA--------TAGCGGCG-TTACAAA-CTAT--ATA----T-TTA---TGTCAT-TCTTTA--A---T--ATGTATCGTAATATGCA---A-AGCTGCGTACGAAAC---CAAGG--GTCGAT--TTCTGAGTGGTTCAATGTTCTTCAAGGAACAAGACA-AG---GGGGTAAA-AGTTCACCAATATTATATCTT--CTTTTCATTGATGGTCTGATAAAAGACA--TA-GAAAGTAGC---AGTCT-----TGGG---TT-GTGTA--TT-TT-TAACTTGAAGGTTGGTAC---CCCTACCGTCGCGGATGATA-----TG-GTTCTTG-TATCGTATTCAAAGTCTGGTTTAGACAAAATGCTAGATATTTGCTACAAATATTCCATA-AAATGGAGATATGATTATAATC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATCTATCTATT--AATATACGTTTTAT-AT-TTGT------------------AACAC-TGTTGTCACTGTTCACTATATATTTATAAA--TG-----AAATTT-TGTAT-ATGGGCCGG---AGGCCTAGATTGC-TTAATTAAACATTTGTCATTGCCATTGTCATTTGTCTTTAA-ATATGTTACGTT------------AAACATTGACGATGATTGAATAATTGGTATACACAATAACTATTTACACACTCATTCTTTCTTTATATTTCAAGTGTATTCACAATGAAGTAACCATCCCATTGACATATATACACATGACATTGA-AAG-------------GGAGTTGGTATT---AAAGTG--TTTGTTATATTTATGGTCGACTTCAACGCAACCTTTTCAAAATTCCCATGTTATAGTAAAGACCAATCACTCACACAGTTCTTAAATGATATAAATATAGTCTCTGCTAATACTTTGTCTACTTGCACAGGTGTTTCGTCGTCCTTTGTATCCTATGGTGGAAAGTGTTACTCTCTCATTGATTTTTTTATTTATCCCGTTGAAAAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaAATCATGATCAATCTTAAGAAGCAAAACATTTTATCGTTGAATGCAACATGTTGAATATCCAGTAGTACTTACTTATGCATCTCTTTGAATGGACTAACGATTGATTCGTGTGGTATTTCGGAACATCGGTAATC-AGATAGTAGAATATACACATTATCAA-TTCTAC-AGACAATAACTA--AAA-------TGTTACTTAT-ACTC-----CCGTAAA--TGTT---Acaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaaatcatgatcaatcttaagaagcaaaacattttatcgttgaatgcaacatgttgaatatccagtagtacttacttatgcatctctttgaatggactaacgattgattcgtgtggtatttcggaacatcggtaatcagatagtagaatatacacattatcaattctacagacaataactaaaatgttacttatactcccgtaaatgttacttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tattatcatggaataagactggtgtaatatttagttgtacttatcagtgctgttttgaaatattgcttacgtagctataaagcacacgtgattgatagagtgttttgcaactgttaactgaatgatgtaatattgattccaattttgttaatatgtactttgagcgtgttggttttaaaatattttggtgcaaaatgttgttttaattgaaagttataagaaatatgcaattatatatttaaTAT--ATA----T-TTACTATATTACGTCTTTA------------CACCGTTTTA---G---AGAGTCGCATT--AAATTTCC--TGATCAC-AT--TTCTGACTGGGAACCTGATAACCAAGGTACCAGACA-GGGT-GGGGTCAGTAGTTT---GGCACTGTATTTA--ATATTTGTCAACAATTAGATAAAAAAAAACTATGCAAGT------GATCT-----AGG-----T-GTATAAGTT-TA-TGATTTAAAG-TCG----------TACAGACGCTGATGATG-----TGTGTTTGAG-T-TCATTTTCAACATGTG--TTGGGTAAAAGGATAGATATTTATTGTAGGTA-TTCATGTCGTTGGAGGTTTGAAAGCAATcttgggcattgacaaaggtgaagtagctttactatggcatatcaaattatga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattgttgaaagcatttatgtgtataCACCTAAACAAGTGATATTATGG---TAT---TATGATAAT-TCA--ATTTATA-----GGGGACAAG--ATG----------------ACAAC----GTGCTATGA-CATTACCTTCT-CTT-TGTCAGACAAAATG-AA-CATATG-TTACTAGATGGGTTGAA-GGATAATAAAACTAATGTGAT---AC-----------AAACAGTCAACAAGATGTTTTCTATGTC-AGGTTGT-CTTGC-GGCATGTCATCGTTTTCAATAAATTAAAGTATATCTTATCTA----TCA--GATCAAGAGGGTGATgctattaaatgtgctgttatattctttaataaatctgttcataatttttaaattatgtaactgtgtttggaaattaggatctgagcatattaaagaaacatacgtatgttcattt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtcgcttagttaaataaggtattaattgacactggtattttaatgtctcaattacttatagttgtaacgaatgcatatagtaaagtgatggaagcaaaaatgtcggcaagacaacatatattaactgttaacaaaggtgtactggtacatggcgggttaacgttctctcataATATACCACC-AAACATATAA-ACAGAAG---TAT---TAT---AA--TTATTCTTTATAAAGGTGGCAAGAAGTCACGT-----GATGACCCGAACA--------GCTATCA-CAGTATCATCTGCTTTTGTTCGATTATATG-AA-T-TATG-TTATTAGACAGGTTAAAGGGGTT--ATGCC------AAT---ATA----A-AAACAGATAGACAGCAGGGTTGTTTCCAACAA-AAGTTGT-CGCGTGTCGGTGAtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACGTGATTCTAAATT-A-TATATTTGCTTCTTAGATGGTAAACAGGCCTTCGATAGAATGTGGCAAGATGG------G----TTATTTTT--TTAAATTAAATGAACTAAAAATAGTTG-------AAA-GTATTTACAAGGCT-TTC---T-TTAG-TCTTTACAA---TG-ATGT--CGAGAGACGCGTT-A-AATTTCGTG---AA-----------CACT-T--TTCTGACTGGTTCCCTGTTAAACATGGTACCAGACA-GG-TTGGGATCAGCAGC---CCGGCACTGCA-CTTAACTTTT-ATCAATGGTTTAATAAAAAACT--TC-GCCACT--CT--GGTCT-----AGGGATATTAGTTCA--TTATT-TAAATTTAAAGT----------CCCACTGTCGCAGATGATAATTTTTATGTGTTTGATTTCATTTTCAAAAAATGCATTGGACAAAATGATGGATATTTGTTATAGGTACT-CATGCCGATGGAGGTTTGAATACAATtgggttacccggcattttccctgatagtattggaagcaggcaaggatgtatccgaagccctgtgatttgtgtcggtgatgggtaatccggcct
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATATATCCAATGTAAATATTTCGCCATCATATAATATTAACTGGAAAAAATGTAAAACCAGTGGATATTACATCCTATCAAAATATACTCAATACATCCGACCAGTTAATAAAAGCACGAACTTATTAG-TTAACA-TGTCCTGCgctaataaatgtgatgttattgtctttaatgaatccgatcgtgactttaaagtatgttaccgtgattggaaattaggatctgagcatgttaaagaaacagatacgtatgttcatttgggtattgtttgtgaaaaatatatgagtagcctgcccaatattagtgaagttaattctaaactacgtggagcgttctttagcttaatgagtagtggtatacatgaaaaagggttaaacccgattacttcaattaaaatatataactcagttgtgcttcctaaagcgttgtatggttatgagtttggtccggtcttcattatgcacacattataaggctggaacgttctcatagattgtgtataaagtatatacagtactttccctcaaagtcttattgggtccaatataattaagagcgaattaattacagaaagctgtcgtttttcggcctgttgtgtaatttaccatcgcattacttggcaaaagtagacttatacgttatattgacgacccgtataataaaagagggtttattcctgatatatataacttattaagacattacaacttagttcacatttataacgttttatcgaatcgggtgtctttccttcaaaacatgtttggaaatgaatcattaaatgatatgtagatacatctgagcaagtatcattgagcttgagatgagagtctctatcgttttagtttttatcactcatcgcttgacattatctcgccgatttggtcccttagcaaagaatatccttttttactcgaaaaatgtaggagcactataaaaaaatattaagtattacctactctcatgcttaccggcaaacgtgtaataagtgaggagttagaacaaatgaactatctctccatttagtgtttgactgtgcagttaatgaaactaaccgacaaatgctttggaataatattcattcagtatttggattcgagtgttctctacgattcatatctaacaatatgcactcccaaaaaactcgtctttgctataggttaaacaaaatgcttcagatgaaaactgagcaagacttttgtctgaaaatagttgtaaattcatttcacaatatactcatgaattctttcatttgatatttacagacatggttaaaactcttttcagtttttccatttttactcggtgaaaagaaataaccattgtaatatttctgtgtttagctaattcatattctgattccgtctgtgccttatattacgtgtttcgataaggttttcaataatgttggaatcctgatagt
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gTCCCAAGTAATAGCAGAGATCAATCATTCACACAGTTCTTGCATGATACTAATATGATCTCTGCTAGTACATTGGATATGTGCACCGGTGCTTCATCAGCCTTTGTATCCTACGATGGAAAGTGTGAATCACTTATTGATTTTATCATTTTGCCAGTTGAGAAAACAGATTGTATTACTCATTGTGTAATAGTAGATGACGATTGTCTAAATGTTTCAAGACTTGGACCTATTAAATGTAGTCTGAATATGCCTTCGACTGGTTATAATGACGATGTGTCGAATGTAAATATTTCGCAATCATAAAATATTAACTGGAAAAAA-GTAAGACAAGTTGATATTACATCCTATCAAAACATGCTCAATGCATCAGAAGATTTGATAAAAGCACAAAATTGTCCG-TTAA-AATGTCCTGCTGAAATTGATAATATGTATAAAATTTTAAGCGAGACTGTTGTTTTTTGCTCAGATAACTGTTTTCGCAAGACGAGATTTA-GCACTTTTTAAAACCGTATTGGAATTCAGAGTTATCTAATTTACATAAAG-TCATGTTAGAAAAACGGAAAATCTGGATTCAAAATGATAGACCAAGAGATCAATCACATTATTCTTATAAAAGTTATAAAACAGCAAAATGTT--ATTTC----AGAAAAAAACGCAGGTATTTTGCCAATGAGTATTTAAACAATCTTGATGAAGAAATTGACACAACCGCTGAACTTGATAAAGAACAATTTTGGAAATTAGTGAATTCGCGAAGAAAACGGTTATCAAGTAGAGCAGGCGCTGAAAGAAAATTCAATGGCGTAATGTATAGGGATAACGACAGTATTACAGAGCAATGGAAACAATATTTTGAATCGTTATATACCCCGTCAATTGATAGTAATTATGATAATATTTGGAAAGCTTCTGTTGACGAAAAATTAAATTCTGTTATATCGCAGTCTAGATTTTGTATTGATGACGTCA------TTAATGTGTCACAGGAAGAAGTAAGAACCTCAATatagatgctaataaattgtgcgtcattggttcaacgaaaataagtctgactacgataagcaacaaagagtatggaatttaggcgcggacactattctagaacagtatacgcatttaggtttaacatgtgacaaatatgtgcccagctagttctattcataatgtatttactaaacgtcgtgggtcattgctaagcataataaacaattctataaatcaacaggaaattacccagtgtcttgtgctaaaatttatatgtcagcaattattcccaaagaactttacttgcgtgaattatgaaaataatgtttctccttcaagtagactacaacttgaacgtagtcaccgcttctgtgtgaaactcattcagaacattcctatttacgccaattctgactaatgttgtctaggattatcctcaattgaaaccgaaaaagactacaggaaaatgcaatttctaggtcagctattcaggttactcattacctatccaaataaatgttcactaaaagacttgtacacacttctataatgaagaccgacaagtatttggtttcatacccgacatgcacaggacttaaagtaaacataatcctaccaaacatgttgattattt
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTGTCTGTACTTTTATTGATATCCTGTTTAATGAAACGAACAGACAAATGCTCTGGAATAATTTTCACTCCGTTCTTGGATTCGACTGTTTTTCTAAATTTATATCTACCTACACAGGTAAAAATGCCACGTATGCTAAACATACCTGTGTATATGCAATCATCAAATAAATCATCTTTGCAATGGGTTAAACAAAATACTTCATTTGAAAACTGAGCATGACTTATGTCTGAAAAAAGTCGTAACATTCAAATGAATTAATCTTCTAACGAGCAAAAACTCTTCCGTGAATGCCTATTTAGAGTAATAGACTCATACTAATGTAACTTTCATTAAAAGATAAAAGACAATGTTATTTTCCCCTATTTACTCAATGAAAAGAGTGTACAAGAAACAGCCATTGTAATATGTTTTCGTTTAACTACTTTATATTCAGATTCCGTCTGTGCACCTTATATTTAGTTTCGATAAGGTTGTCAATCGTGTCGGAATCCCGGTCGTTTGTGTTTGCTTTGTTTTTTCACTATTCTTTTTTCTTTCATTATTTGTATTACTTCACTTTATTTTGTATAGTTATTAAACATAGCTTTAAGCTGAGGCTCAGTCTGTGTATGTATGTACCTATTGATGATTATGTTCATATCCAAGTATATGCACGTATGTGCTCGTAATTTATCCGTGTGTCCTCTTTTATCTAATCATGCTTCTGTTTATTTATTGATGCCTGCAATTGCAAGTTGTTAGTGTTAGTGCAATGTGGCACTCTGTAATTCAATTGTTAAGAGTAATGTTTGCTTTACTCTATGTAATATTGATATATATTTGTATGCGATATAATGCTCATACTTATGTTTATTACGTCCTTTATTTAATAACATATATGTTGCTCTCAGCTAATGGAGGAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): ATTGACATTGGCTTTCAATCACTAAATGATAAATTATGTGACACACTTCTTATATCTCTATTAATAGCGTCTGAACCGAAGGCAAAGTTTATAAAGTTCTTGAAACCCTACTGGAATAACAACTTATCCTCGTTACATAACAAAATGAAACAAGGTTACACTACTTGGATAAATAACTTCGTCCTCATTTGTTTACTACAAAAATGCAAAAAGAAAATTTCGAAGAATTCATAGGATAGATGTTGAAAACTATTTAAAATAATTTATCACGAACTAGACCAGGCTGCTGAATTGAACAGAAAGCTGCTTTGGAAAATTATTATTACTATGATGAGAAAAAGCAAATATAATCATTTAATCGGTAATGAAATGAAGTTTGACGGTAAGCTTTATCTGGATTCTAACAGTATTACATATGAATGGGGTAAGTACTTTGCTGACTTGTATACACCATATTATATTCAACATTGACCTTACCTTTATAGACGATATTTCTGAAAAGGTGCGTCAATTGTATAGTCGCTTATTTCAAGGTAACATTACTGGGCGCAGTTTTTTGCATTCTTAAACGACGATATAATGAATGCATTAAGTAAAGGGAAGAAATCAAAAGCCGCCGGTGATGACAAAGTGTGTTATGAATATTTGATATATTATCATTGCGTTGTATGACTATTGGTGAAATTACATTATGCTA
Unaligned ( gi|10 ): GTCGTAAATTCATTTCACAATATGCTTATGAATTAATCTTCTAACGAGCGGGATATCATCAGTGAATGCATATTAAGTGTTATATAGTCATACTGATGTAACTTTCATTTAATATTTACAGATATTGTTAAAACTCTTTTCAGTTTTTCCCCTGTTTATTCGGTGAAAAGATTGTACAAGAAATAACCATTGTAATATGCCTGTGTTTATTTACTTTATTTTGTATAGTGATTAAACATAGCATTGAGTTGACTCTAAAACTGTGGATGTATGTATTCATGTTTGTGTTCATATGCATGTGTCTGTGAAGGCGTTAGTATATGTGCATGTTTCCTTTTCAGTCTGTATGCGTGTCTGCTTGTACCACATCACGCTTGATTCATGTATGTCTATAATTGCGTATATCTGCGAGTGTTAGTACAGGGGTGTAATGTTTTGCAATTCAAATGTTAAGTGTCCTGTATGCTTTACTCTATTTAATATTGATAAACTTTTGTATGTTTTTTTTGCTACTCATGTTCATGTTTAATATGTTCTTTATGTAATAACATATATGTCGCTCTCCGCTAATGGAGGAAAT
Unaligned ( gi|13 ): AATATGTAGATACACCCGAGCAATTATCATTGAGCTTAAGATTTAGCGATGATGAGAATCTCCATCGTTTTAGTTTTTATCACTCATCGCTTGGAATTATCTCGCCGATTTGGTCCCTTAGCAAGGAATATCCTCTTTTACTTGAAAAATGTACGAGCACTATAAAAATATAAAGTTTTACCTACTCTCATGCTTATCGGCAAACGTGTCATAAGTGCGGACTTAGTACAAATGATCTATCTCTTCATTTAGTGTTTGACTGTGCGGTTAATGAAACTAACAGACAAATGCTTTGGAATAATATTCATTCAGTATTTGTATTCGAGTGTTTTCTATGATTCATATCTACCGATATGCAATCCCAAACAACTCATCTTTGCTATGTATTAAACAAAATACTTCAGCTGAAAACTGAGCAAGACTTATGTCTGAAAATAGTCGTAAATTCATTTCACAATATACTTTTGAAT
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