lowQualScore : 11 2222222 1 22222222222222222222222 333333333333 111 444444444444444444444444444444444444444444 4444444444444 444444444444444444444 1111111 111 3333333333333333333333 222 1 333333 2222222
lowQualScore : 8 33 5555555 4 6 0 44 44444444444444444444444 6666 666666666666 3 1 2 0 33 333 7777 2 888 77 444444444444444444444444444444444444444444 4 4444444444444 77 1 888888888888888888888 2 44 77 4 1 66 5 6666666 444 888 0 66 8888888888888888888888 222 66 9 4 1 1 77 666666 3 3 3 77777 1111111
lowQualScore : . .. ....... . . . .. ....................... .... ............ . . . . .. ... .... . ... .. .......................................... . ............. .. . ..................... . .. .. . . .. . ....... ... ... . .. ...................... ... .. . . . . .. ...... . . . ..... .......
lowQualScore : 0 66 8888888 0 7 0 22 22222222222222222222222 5555 333333333333 1 4 7 7 77 555 8888 9 111 11 000000000000000000000000000000000000000000 0 0000000000000 22 1 555555555555555555555 5 55 22 4 1 88 6 2222222 111 888 2 99 5555555555555555555555 888 99 3 0 4 4 99 444444 3 5 2 00000 4444444
consensus : TTTA-A--CATTTATTCCACT--TTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGCATAGTTCTAA----TCAAATAACAAATTATC--ANTA-T-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-A-TTCTCCAG---T-TT--AAAAGAGGTGTAG-------------ATTTTTTTTTTATT-------------TTGTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N--ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ANGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTACACAATGTTCTCCAT-GTACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCANA-TTCTGTGAGTG--TCCTAACATTG-T----TTATTAAAGATTATTTTACATATTNTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
Reference ( gi|2 ) : TTTA-A--CATTTATTCCACT--TTC-CAT-TT-ACATTATAAATACA--TA---G---TAT---AGCATAGTTGTAA----TCAAATAACAAATTATC--AATA-T-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-T-TTCTCCAA---T-TT--AAAAAAGGTGTAG-------------ATTTTTTTTTTATT-------------TTGTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--C--ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCAT-ATACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATTG------TTATTAAAGATTATTTTACATATTTTTATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
gi|1 : TTTT-A--CATTTATTCCACT--TTT-CAT-TT-ACATTGTTAATACA--TA---G---TAT---AGCATAATTCTAA----TCAAATAACAAATTATA--ATTA-T-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTTTCTCTCTCAGTC-T-TTCTCCAG---T-TT--AAAAAAGGTGTAG-------------ATTTTTCTTTTATTATTATTATTTATTTTGTTACAAT-TTTTTA-G--A--T--ATAATTGTTTTTCTTGTGGGAAATAAATGGTAAATTTAAT------A------G-AAGT--TGACTAAGTTAAAT-AT-ATTACACATTGTTCTCCAT-GTACGGTCTTGTG-------GTA--ATAA---TTCAC--TGATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCAATA-TTTTTCGAGTG--CCCTAACATTA------TTATTGAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTGTCACTTTA----TATGTTATTCTAATTTAAATATTCAGAA
gi|7 : tTTTA-A--CATTTATTCCACT--TTT-CAT-TT-ACATTATAAATACA--TA---G----------------------------AAATAACAAATTATC--ATTA-T-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-T-TTCTCCAA---T-TT--AAAAAAGGTGTAG-------------ATTTTTTTTTTATT-------------TTGTTACAGT-TTTCTA-G--A--TATC--ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCAT-ATACAGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TCCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATG
gi|3 : tttttttataTTTA-ATCCATTTATTCCTCT--TTTACAT----ATATTATA--TACA--T----G---TAT---A---TAATC-TAA----TCAAATAACAAA--A----AAGC-T-CTTTCTCATTATAA-AGCATATATCTCTTACTCTCATTC-A-TTCTCCAG---T-TT--CAAAG-GGTGTA----------------------TTT-CT-------------TTGTTACAAT-TTTCTA-AGTA--T--T--ATTGCTTTTCTTATGGAGGATAAATGACAAATTTGAC------A---------------------ATTAAAA-AT-GTTAAACAATATTCTCCATAATG-GGTCCTGTA-------GTA--TTAA---TACAC--AAATATA------AT-----TTATATTGAAAAAA--GT--GTC--GTGCCAGGG-CCAAATTTCTGTGG--G--TCCTAACATTGTTT---TTATAAGAGATTATTTTACATATTGTCATTATCAAG-----------CATT------------GTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|11 : tttTTTATA--CATTTATTCCACT--TTT-CAA-TT-ATATTATTAATACA--TA---G---TAC---AGCATAATTCTAA----TCAAATAACAAATTAAC--ATTG-T-CTTTCACGCTATAA-ATCATAT--GTCTTTCTCTCAGTCTT-TTCTCTAG---T-TT--AAAAAAGCTGTAGATATTTTTTTATTATTTTTTTTTTATT-------------TTGTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--
gi|10 : ttttTTTA-AT-CATTTATTCAAAT--ATT-AGT-TT-ACATTA--AACTCG--TA-------TAT---A-CATATTT-TAG----T--ATTGATAAACTA-----------------CACTATAATAGCATAT--CTCTTTCACTCAGTC-A-TTCT--AATATT-TT--CCGAGAGGT-TAT-------------A----TTTCTTA-----------------GTTACAAT-TGTCTA-A--G--TAGT--ATTGTTCTTCTA-----AAATAAACAGTAAA-TTAAT------A------TCATGT--T--CT---TCAAATCATAATTACACat
gi|14 : t--CATTTCTTCCTCT--ATT-CTT-TT-ACATTATATATACACATA---A---TAA---AGTATAGTTCTAA----TCAAATAA---GTTATC--TTTA-TTCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-A-TTTCCCA
gi|8 : atttttatatc--CATTTACTCCAATA-TT---AT-TTCACATTATATATATA--TAT--G---TATTTCATTATAGCTCTTA----TGAAATAACAAA--AT---AAT------TTCTCACTTTAA-GGTATAT--CTCTTTCTCCCGGTC-A-TTCTCCAG---T-TT--TAAAGGGG-GC---------------ATTTTTTTg
gi|15 : aatttTTTATTCCAATA-TT---ATGTT-ACATTATATATATA--TATATA---TATTTCAGTATAGTTCTAA----TCATATA------TACCGAAATA-T-CTTTCTCACTTTAA-AACACA----TCTTTCTCTC-GTT-TATTCTCCAG---T-TT--AAAgtaacacttttaaaagtaaaaagtattattgttttattgctttgagttataactgtgtatgtttcagggttttttaaaagcaattgtaaacagtattccatttagtcgtcttgtagaaaatatgtaatattttatttcgaaaa
gi|16 : TTTATTCCAATAAT----AT-TTCACACTATATATATT--TA-------TATTTCAGTAGAGTTCTAA----TCATATAACAAA--------ATA-T-CTTTCTAACTATAA-AACATA----TCTTTCTCCCGGTC-A-TTCTCCAG---T-TT--
gi|18 : tttttTATCCCACT--TTT-GTT-TT-ACATTACAAATTCA--TA---G---TAT---AGTATAATTCTAA----TCAGATAACt
gi|4 : T-ATATTATATATAGA--GA---GAAATAG---AGAA-AGT-GTGAGAGATAAAATAACAAA--------ATA-T-CTTTCTCACTATAT-AAAACAT--CTCTTTCTCTCAATC-A-TTTTCCAG---T-TTTGAAGGGGGGGGGGG-------------GGGTGTTG---------------------GGTACAAT-TTTATA-AGTA--T--A--ATTGTTTTTCTTCTGGAAGATAAATGGTGAATTTAAT------AGTAAAAT-AAGTGGTGACTAGGTTTAAC-AT-GCTAAACAATGTTCTCCAT-GTTGAGTTCTGCAAATACATGTAT-ATAA---TT-------ATATA------GG-----T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAAGCCCCAAC-TTCTGTGCATG--TCCTAACATTACTGTTATTATTAAAGATTGTTTTACATATTATCATTACCAAGATAAAGTGATCTCTTTtata
gi|13 : T-ACATTATA--TACC--TA-------TAT-----CA-------AA----TCGAATAACAAA-------AAAACT-GTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCATTC-G-TTCTCCAG---T-TT---CAAAAGATGT---------------ATTTTT------TT-------------TTGTTACAAT-TTTCTA-A--GTTT--T--ATTGTTTTTCTta
gi|5 : aA--TA---G---TAT---AGCATAGTTGTAA----TCAAATAACAAATTATC--ATTA-T-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-T-TTCTCCAA---T-TT--ACAAAAGGTGTAG-------------ATTTTTTTTTTCTT-------------TTGTTACAGT-TTTCTA-G--A--TATC--AATGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCAT-ATACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCTAGTG--TCCTAACATTG------TTA--AAAGATTATTTTTCATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAt
gi|17 : -CTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTATTCTCATTC-A-TTCTCCAG---T-TT--CAAA
gi|6 : ataacaaaagacgCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCCTTC-A-TTCTCTAG---T-TT--CAAAG-GGTGT----------------TTTTTGTACAATT-------------TT-CTA-AGT-ATTATA-AT-A--T--TT-ATTGTTTT-CTAAAGGAAGATAAATGGTAAATTTGAC------A---------------------ATTAAA--GT-GTCAAACAATGTTCTTCAT-GTTGGGTCCTGTA-------GTAAAGTAAACGTTTA---TAAT-TA------ATGC---T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAGGG-CCAGATTTCTGTGAGTG--TTCTAGCATTGTTT---TTATTAGAGATTATTTTACATATTGTTATTATCAA-----------------------ACGTCGTATTGATTTAAATATTCAGAAggg
gi|9 : -AGCATAT--CTCTTTCTTTCAGCC-A-TTCTCCAG---TGTT--AAAG--GGAGACG-------------ATTTTCTGCTT----------------------CAATGTTTCTATGT-A--T--G--ATTGTTTCTCTATTGGAAAATAATTGTTAAATTTAATGGTAAAA------T-AAGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTAAACAATGTTTTCCAT-TTAAGGTCTTGTA-------GCA--TTAA---TATACGTTTATACATGT---ATTTAGGT--------GAAAA--GTGCGTCATGTGTAAGGGCCTAAA-TTCTGTACGTGCCCCCTAACATTG------CTGTTA
gi|12 : T-ATTACACAATGTTCTCTAT-GTACGGTCTTATG-------GTA--ATAA---TTCAC--TAATATACTGGTAAT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCACA-TTTTGTGAGTG--TCTTAACATTG------TTATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCACTTTATGATTATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAtt
Alignments
lowQualScore : 11 11 1111111 111 222222222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444444444 333333333333333333333 1111111 3333333333333333333333 1 333333333 1111
lowQualScore : 6 11 2 11 3 6 55 44 5555555 555 33 1 1 555 555555555 3 0 2 33 22 2 2 555 3 1 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 1111111111111111111111 4 222222222222222222222 1 11 55 4 4 3 4444444 66 55 777 66 1111111111111111111111 66 66 66 7 1 0 66 888888888 66 1 1 1 33 4444
lowQualScore : . .. . .. . . .. .. ....... ... .. . . ... ......... . . . .. .. . . ... . . . .................................................... . ...................... . ..................... . .. .. . . . ....... .. .. ... .. ...................... .. .. .. . . . .. ......... .. . . . .. ....
lowQualScore : 7 99 8 88 6 2 77 22 9999999 000 66 4 7 000 888888888 1 7 5 44 66 5 7 111 2 2 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 3 3333333333333333333333 7 333333333333333333333 1 99 44 0 4 9 4444444 11 33 888 11 2222222222222222222222 11 11 11 0 0 0 99 888888888 99 0 4 3 77 2222
consensus : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANAT--ACATA---G---TAT---AGCATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTA-TCTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A-----------T--N--ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GT--A-GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------G--AAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
Reference ( family-131 ) : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTATANAT--ACATA---G---TAT---AGCATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTA-TCTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A-----------T--N--ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ANGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GT--A-GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------G--AAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCANA-TTCTGTGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTNTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
gi|1 : TTTT-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTGTTAAT--ACATA---G---TAT---AGCATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTATA--ATTA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTTTCTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAGT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTCTTTTA----TTATTATTATTTATTTT----GTTACAAT-TTTTTA-G--A-----------T--ATAATTGTTTTTCTTGTGGGAAATAAATGGTAAATTTAAT------A------G-AAGT--TGACTAAGTTAAAT-AT-ATTACACATTGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GT--A-ATAA---TTCAC--TGATATA------AT-----T--------G--AAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCAATA-TTTTTCGAGTG--CCCTAACATT---A-----T--TATTGAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTGTCACTTTA----TATGTTATTCTAATTTAAATATTCAGAA
gi|10 : tTTTA-AT-CATTTATTCAAATATT-AGT-TT-ACATTA--AAC--TCGTA-------TAT---A-CATA-TTTTA---GT--ATTGATAAACTA----------------CACTATAATAGCATAT--CTCTTTCACTCAGTC-ATTCTAATATT-TT--CCGAGAGGT-TA-T-------------A----TTTCTTA-------------------------GTTACAAT-TGTCTA-A--G-----------TAGT--ATTGTTCTTCTA-----AAATAAACAGTAAA-TTAAT------A------TCATGT--T--CT---TCAAATCATAATTACAC
gi|11 : tTTTATA--CATTTATTCCACTTTT-CAA-TT-ATATTATTAAT--ACATA---G---TAC---AGCATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTAAC--ATTG-TCTTTCACGCTATAA-ATCATAT--GTCTTTCTCTCAGTCTTTTCT-CTAGT-TT--AAAAAAGCTGTA-GATATTTTTTTATTATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A-----------T--
gi|12 : ttttT-ATTACACAATGTTCTCTATG-TACGGTCTTATG-------GT--A-ATAA---TTCAC--TAATATACTGGTAAT-----T--------G--AAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCACA-TTTTGTGAGTG--TCTTAACATT---G-----T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCACTTTATGATTATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAat
gi|13 : T-ACATTAT--AT--ACCTA-------TAT-----CA-------A---ATCGAATAACAAA--AAA--ACTG---TTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCATTC-GTTCT-CCAGT-TT--CAAA-AGATGT----------------ATTTTT----------TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-A--GTT---------T--T--ATTGTTTTTCT
gi|14 : a--CATTTCTTCCTCTATT-CTT-TT-ACATTATATATACACATA---A---TAA---AGTATAGTTCTA---ATCAAAT---AAGTTATC--TTTATTCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTTC-CCAGt
gi|15 : atttttatatcTTTATTCCAATATT--ATGTT-ACATTATATAT--ATATATATA---TATTTCAGTATAGTTCTA---ATCATATA------TACCGAAATA-TCTTTCTCACTTTAA-AACACAT--CT--TTCTCTCGTTT-ATTCT-CCAGT-TT--AAA
gi|16 : TTTATTCCAATAAT--AT-TTCACACTATATAT--ATTTA-------TATTTCAGTAGAGTTCTA---ATCATATAACAAA--------ATA-TCTTTCTAACTATAA-AACATAT--CT--TTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--
gi|17 : tttttCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTATTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAGGGt
gi|18 : ataacaaaagacgTATCCCACTTTT-GTT-TT-ACATTACAAAT--TCATA---G---TAT---AGTATAATTCTA---ATCAGATAAC
gi|2 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTC-CAT-TT-ACATTATAAAT--ACATA---G---TAT---AGCATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--AATA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A-----------T--C--ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GT--A-GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------G--AAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G-----T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTTATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAtata
gi|3 : TTTA-ATCCATTTATTCCTCTTTTACAT----ATATTATA--T--ACAT----G---TAT---A---TAAT-CTA---ATCAAATAACAAAAAAGC-------TCTTTCTCATTATAA-AGCATATATCTCTTACTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAG-GGTGTA-----------------------TTT-----CT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-AGTA-----------T--T--ATTGCTTTTCTTATGGAGGATAAATGACAAATTTGAC------A---------------------ATTAAAA-AT-GTTAAACAATATTCTCCATAATG-GGTCCTGTA-------GT--A-TTAA---TACAC--AAATATA------AT-----TTATATTGAA--AAAA--GT--GTC--GTGCCAGGG-CCAAATTTCTGTGG--G--TCCTAACATT---GTTT--T--TATAAGAGATTATTTTACATATTGTCATTATCAAG----------CA-------------TTGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|4 : tttT-ATATTATATAT--AGAGA---GAAATAG---AGAA-AGTGTGAGAGATAAAATAACAAA--------ATA-TCTTTCTCACTATAT-AAAACAT--CTCTTTCTCTCAATC-ATTTT-CCAGT-TTTGAAGGGGGGGGGG-G-------------GGGTGTTG-----------------------------GGTACAAT-TTTATA-AGTA-----------T--A--ATTGTTTTTCTTCTGGAAGATAAATGGTGAATTTAAT------AGTAAAAT-AAGTGGTGACTAGGTTTAAC-AT-GCTAAACAATGTTCTCCATG-TTGAGTTCTGCAAATACATGT--ATATAA---TT-------ATATA------GG-----T--------G--AAAAAAGT--GTCATGTGCCAAGCCCCAAC-TTCTGTGCATG--TCCTAACATTACTG--T--TATTATTAAAGATTGTTTTACATATTATCATTACCAAGATAAAGTGATCTCTTT
gi|5 : ATA---G---TAT---AGCATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--ATTA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--ACAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTC----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A-----------T--ATCAATGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GT--A-GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------G--AAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCTAGTG--TCCTAACATT---G-----T--TA--AAAGATTATTTTTCATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAta
gi|6 : CTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCCTTC-ATTCT-CTAGT-TT--CAAAG-GGTG----------------------TTTTTTG---------------------------TACAAT-TTTCTA-A--GTATTATAATATT--T--ATTG-TTTTCTAAAGGAAGATAAATGGTAAATTTGAC------A---------------------ATTAAA--GT-GTCAAACAATGTTCTTCATG-TTGGGTCCTGTA-------GTAAA-GTAAACGTTTA---TAAT-TA------ATGC---T--------GAAAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGG-CCAGATTTCTGTGAGTG--TTCTAGCATT---GTTT--T--TATTAGAGATTATTTTACATATTGTTATTATCAA-----------------------ACGTCGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|7 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTATAAAT--ACATA---G---------------------------AAATAACAAATTATC--ATTA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A-----------T--ATCATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACAGTCTTGTG-------GT--A-GTAA---TCCAC--TAATATA------AT-----T--------G--AAAA--TT--GTCATG
gi|8 : tttttttata--CATTTACTCCAATATT--AT-TTCACATTATATAT--ATATAT--G---TATTTCATTATAGCTCTT---ATGAAATAACAAA--ATA--A------TTTCTCACTTTAA-GGTATAT--CTCTTTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--TAAAGGGG-GCA-----------------TTTTTTTGTAACACTT-------------TTAAAAGTAAAAAG-T---------A-----------T--T--ATTGTTTT
gi|9 : aattt-AGCATAT--CTCTTTCTTTCAGCC-ATTCT-CCAGTGTT--AAAGGGAG---ACG-------------ATTTTCTGCTT------------------------------CAATGTTTCTATGT-A-----------T--G--ATTGTTTCTCTATTGGAAAATAATTGTTAAATTTAATGGTAAAA------T-AAGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTAAACAATGTTTTCCATT-TAAGGTCTTGTA-------GC--A-TTAA---TATACGTTTATACATGT---ATTTAGGT--------G--AAAA--GTGCGTCATGTGTAAGGGCCTAAA-TTCTGTACGTGCCCCCTAACATT---G--CTGT--TATTattgctttgagttataactgtgtatgtttcagggttttttaaaagcaattgtaaacagtattccatttagtcgtcttgtagaaaatatgtaatattttatttcgaaaa
Alignments
lowQualScore : 11 11 1111111 111 222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444444444 333333333333333333333 1111111 111 3333333333333333333333 11 1 333333333 1111
lowQualScore : 6 11 1 11 3 6 4 33 3333333 555 666 3 555 222222222 2 0 2 33 22 2 2 555 3 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 2222222222222222222222 4 333333333333333333333 1 11 55 4 4 3 4444444 111 777 66 1111111111111111111111 22 66 7 2 0 66 222222222 66 1 1 1 33 4444
lowQualScore : . .. . .. . . . .. ....... ... ... . ... ......... . . . .. .. . . ... . . ..................................................... . ...................... . ..................... . .. .. . . . ....... ... ... .. ...................... .. .. . . . .. ......... .. . . . .. ....
lowQualScore : 7 99 0 88 6 7 2 99 4444444 000 444 5 000 111111111 9 7 5 44 66 5 7 111 2 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 8888888888888888888888 7 999999999999999999999 1 99 44 0 4 9 4444444 444 888 11 2222222222222222222222 22 11 0 2 0 99 666666666 99 6 4 3 77 2222
consensus : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTAT-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
Reference ( family-131 ) : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTAT-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
gi|1 : TTTT-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTGTTAATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTATA--ATTAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTTTCTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAGT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTCTTTTA----TTATTATTATTTATTTT----GTTACAAT-TTTTTA-G--A--T--ATA---------ATTGTTTTTCTTGTGGGAAATAAATGGTAAATTTAAT------A------G-AAGT--TGACTAAGTTAAAT-AT-ATTACACATTGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--ATAA---TTCAC--TGATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCAATA-TTTTTCGAGTG--CCCTAACATT---A-----T--TATTGAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTGTCACTTTA----TATGTTATTCTAATTTAAATATTCAGAA
gi|10 : tTTTA-AT-CATTTATTCAAATATT-AGT-TT-ACATTA--AACTCG--TA-------TAT---A-C-ATA-TTTTA---GT--ATTGATAAACTA----------------CACTATAATAGCATAT--CTCTTTCACTCAGTC-ATTCTAATATT-TT--CCGAGAGGT-TA-T-------------A----TTTCTTA-------------------------GTTACAAT-TGTCTA-A--G--TAGT-----------ATTGTTCTTCTA-----AAATAAACAGTAAA-TTAAT------A------TCATGT--T--CT---TCAAATCATAATTACAC
gi|11 : tTTTATA--CATTTATTCCACTTTT-CAA-TT-ATATTATTAATACA--TA---G---TAC---AGC-ATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTAAC--ATTGT-CTTTCACGCTATAA-ATCATAT--GTCTTTCTCTCAGTCTTTTCT-CTAGT-TT--AAAAAAGCTGTA-GATATTTTTTTATTATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--
gi|12 : ttttT-ATTACACAATGTTCTCTATG-TACGGTCTTATG-------GTA--ATAA---TTCAC--TAATATACTGGTAAT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCACA-TTTTGTGAGTG--TCTTAACATT---G--T--T---ATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCACTTTATGATTATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAat
gi|13 : ATACA--TT---A---TAT---ACCTATA--TCAA---ATCGAATAACAAA--AAA--ACTGT---TTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCATTC-GTTCT-CCAGT-TT--CAAA-AGATGT----------------ATTTTT----------TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-A--GTTT--T-----------ATTGTTTTTCT
gi|14 : --CATTTCTTCCTCTATT-CTT-TT-ACATTATATATACACATA---A---TAA---AGT-ATAGTTCTA---ATCAAATAA---GTTATC--TTTATTCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTTC-CCAGt
gi|15 : atttttatatcTTTATTCCAATATT--ATGTT-ACATTATATATATA--TATATA---TATTTCAGT-ATAGTTCTA---ATCATATA------TACCGAAATAT-CTTTCTCACTTTAA-AACACA----TCTTTCTCTCGTTT-ATTCT-CCAGT-TT--AAA
gi|16 : TTTATTCCAATAAT--AT-TTCACACTATATATATT--TA-------TATTTCAGT-AGAGTTCTA---ATCATATAACAA--------AATAT-CTTTCTAACTATAA-AACATA----TCTTTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--
gi|17 : ttttt-CTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTATTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAGGGt
gi|18 : ataacaaaagacgTATCCCACTTTT-GTT-TT-ACATTACAAATTCA--TA---G---TAT---AGT-ATAATTCTA---ATCAGATAAC
gi|2 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTC-CAT-TT-ACATTATAAATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--AATAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--C-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G-----T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTTATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAtata
gi|3 : TTTA-ATCCATTTATTCCTCTTTTACAT----ATATTATA--TACA--T----G---TAT---A----TAAT-CTA---ATCAAATAACAAAAAAGC------T-CTTTCTCATTATAA-AGCATATATCTCTTACTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAG-GGTGTA-----------------------TTT-----CT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-AGTA--T--T-----------ATTGCTTTTCTTATGGAGGATAAATGACAAATTTGAC------A---------------------ATTAAAA-AT-GTTAAACAATATTCTCCATAATG-GGTCCTGTA-------GTA--TTAA---TACAC--AAATATA------AT-----TTATATTGAAAAAA--GT--GTC--GTGCCAGGG-CCAAATTTCTGTGG--G--TCCTAACATT---GTTT--T--TATAAGAGATTATTTTACATATTGTCATTATCAAG----------CA-------------TTGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|4 : tttT-ATATTATATATAGA--GA---GAAATAG---AGA-A-AGTGTGAGAGATAAAATAACAAA--------ATAT-CTTTCTCACTATAT-AAAACAT--CTCTTTCTCTCAATC-ATTTT-CCAGT-TTTGAAGGGGGGGGGG-G-------------GGGTGTTG-----------------------------GGTACAAT-TTTATA-AGTA--T--A-----------ATTGTTTTTCTTCTGGAAGATAAATGGTGAATTTAAT------AGTAAAAT-AAGTGGTGACTAGGTTTAAC-AT-GCTAAACAATGTTCTCCATG-TTGAGTTCTGCAAATACATGTAT-ATAA---TT-------ATATA------GG-----T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAAGCCCCAAC-TTCTGTGCATG--TCCTAACATTACTG--T--TATTATTAAAGATTGTTTTACATATTATCATTACCAAGATAAAGTGATCTCTTT
gi|5 : A--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--ATTAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--ACAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTC----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--ATC---------AATGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCTAGTG--TCCTAACATT---G-----T--TA--AAAGATTATTTTTCATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAta
gi|6 : CTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCCTTC-ATTCT-CTAGT-TT--CAAAG-GGTGT----------------------TTTTTG----T-----------------------ACAAT-TTTCTA-A--G--T--ATTATAATATTTATTGTTTT-CTAAAGGAAGATAAATGGTAAATTTGAC------A---------------------ATTAAA--GT-GTCAAACAATGTTCTTCATG-TTGGGTCCTGTA-------GTAAAGTAAACGTTTA---TAAT-TA------ATGC---T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAGGG-CCAGATTTCTGTGAGTG--TTCTAGCATT---GTTT--T--TATTAGAGATTATTTTACATATTGTTATTATCAA-----------------------ACGTCGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|7 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTATAAATACA--TA---G----------------------------AAATAACAAATTATC--ATTAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--ATC---------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACAGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TCCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATG
gi|8 : tttttttata--CATTTACTCCAATATT--AT-TTCACATTATATATATA--TAT--G---TATTTCATT-ATAGCTCTT---ATGAAATAACAAA--ATA--A------TTTCTCACTTTAA-GGTATAT--CTCTTTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--TAAAGGGG-GCA-----------------TTTTTTTGTAACACTT-------------TTAAAAGTAAAAAG-T---------A--T--T-----------ATTGTTTT
gi|9 : aattt-AGCATAT--CTCTTTCTTTCAGCC-ATTCT-CCAGTGTT--AAAGGGAG---ACG-------------ATTTTCTGCTT------------------------------CAATGTTTCTATGT-A--T--G-----------ATTGTTTCTCTATTGGAAAATAATTGTTAAATTTAATGGTAAAA------T-AAGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTAAACAATGTTTTCCATT-TAAGGTCTTGTA-------GCA--TTAA---TATACGTTTATACATGT---ATTTAGGT--------GAAAA--GTGCGTCATGTGTAAGGGCCTAAA-TTCTGTACGTGCCCCCTAACATT---G--CTGT--TATTattgctttgagttataactgtgtatgtttcagggttttttaaaagcaattgtaaacagtattccatttagtcgtcttgtagaaaatatgtaatattttatttcgaaaa
Alignments
lowQualScore : 11 11 1111111 111 222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444444444 333333333333333333333 1111111 111 3333333333333333333333 11 1 333333333 1111
lowQualScore : 6 11 1 11 3 6 4 33 3333333 555 666 3 555 222222222 2 0 2 33 22 2 2 555 3 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 2222222222222222222222 4 333333333333333333333 1 11 55 4 4 3 4444444 111 777 66 1111111111111111111111 22 66 7 2 0 66 222222222 66 1 1 1 33 4444
lowQualScore : . .. . .. . . . .. ....... ... ... . ... ......... . . . .. .. . . ... . . ..................................................... . ...................... . ..................... . .. .. . . . ....... ... ... .. ...................... .. .. . . . .. ......... .. . . . .. ....
lowQualScore : 7 99 0 88 6 7 2 99 4444444 000 444 5 000 111111111 9 7 5 44 66 5 7 111 2 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 8888888888888888888888 7 999999999999999999999 1 99 44 0 4 9 4444444 444 888 11 2222222222222222222222 22 11 0 2 0 99 666666666 99 6 4 3 77 2222
consensus : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTAT-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
Reference ( family-131 ) : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTAT-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
gi|1 : TTTT-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTGTTAATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTATA--ATTAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTTTCTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAGT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTCTTTTA----TTATTATTATTTATTTT----GTTACAAT-TTTTTA-G--A--T--ATA---------ATTGTTTTTCTTGTGGGAAATAAATGGTAAATTTAAT------A------G-AAGT--TGACTAAGTTAAAT-AT-ATTACACATTGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--ATAA---TTCAC--TGATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCAATA-TTTTTCGAGTG--CCCTAACATT---A-----T--TATTGAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTGTCACTTTA----TATGTTATTCTAATTTAAATATTCAGAA
gi|10 : tTTTA-AT-CATTTATTCAAATATT-AGT-TT-ACATTA--AACTCG--TA-------TAT---A-C-ATA-TTTTA---GT--ATTGATAAACTA----------------CACTATAATAGCATAT--CTCTTTCACTCAGTC-ATTCTAATATT-TT--CCGAGAGGT-TA-T-------------A----TTTCTTA-------------------------GTTACAAT-TGTCTA-A--G--TAGT-----------ATTGTTCTTCTA-----AAATAAACAGTAAA-TTAAT------A------TCATGT--T--CT---TCAAATCATAATTACAC
gi|11 : tTTTATA--CATTTATTCCACTTTT-CAA-TT-ATATTATTAATACA--TA---G---TAC---AGC-ATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTAAC--ATTGT-CTTTCACGCTATAA-ATCATAT--GTCTTTCTCTCAGTCTTTTCT-CTAGT-TT--AAAAAAGCTGTA-GATATTTTTTTATTATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--
gi|12 : ttttT-ATTACACAATGTTCTCTATG-TACGGTCTTATG-------GTA--ATAA---TTCAC--TAATATACTGGTAAT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCACA-TTTTGTGAGTG--TCTTAACATT---G--T--T---ATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCACTTTATGATTATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAat
gi|13 : ATACA--TT---A---TAT---ACCTATA--TCAA---ATCGAATAACAAA--AAA--ACTGT---TTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCATTC-GTTCT-CCAGT-TT--CAAA-AGATGT----------------ATTTTT----------TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-A--GTTT--T-----------ATTGTTTTTCT
gi|14 : --CATTTCTTCCTCTATT-CTT-TT-ACATTATATATACACATA---A---TAA---AGT-ATAGTTCTA---ATCAAATAA---GTTATC--TTTATTCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTTC-CCAGt
gi|15 : atttttatatcTTTATTCCAATATT--ATGTT-ACATTATATATATA--TATATA---TATTTCAGT-ATAGTTCTA---ATCATATA------TACCGAAATAT-CTTTCTCACTTTAA-AACACA----TCTTTCTCTCGTTT-ATTCT-CCAGT-TT--AAA
gi|16 : TTTATTCCAATAAT--AT-TTCACACTATATATATT--TA-------TATTTCAGT-AGAGTTCTA---ATCATATAACAA--------AATAT-CTTTCTAACTATAA-AACATA----TCTTTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--
gi|17 : ttttt-CTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTATTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAGGGt
gi|18 : ataacaaaagacgTATCCCACTTTT-GTT-TT-ACATTACAAATTCA--TA---G---TAT---AGT-ATAATTCTA---ATCAGATAAC
gi|2 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTC-CAT-TT-ACATTATAAATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--AATAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--C-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G-----T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTTATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAtata
gi|3 : TTTA-ATCCATTTATTCCTCTTTTACAT----ATATTATA--TACA--T----G---TAT---A----TAAT-CTA---ATCAAATAACAAAAAAGC------T-CTTTCTCATTATAA-AGCATATATCTCTTACTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAG-GGTGTA-----------------------TTT-----CT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-AGTA--T--T-----------ATTGCTTTTCTTATGGAGGATAAATGACAAATTTGAC------A---------------------ATTAAAA-AT-GTTAAACAATATTCTCCATAATG-GGTCCTGTA-------GTA--TTAA---TACAC--AAATATA------AT-----TTATATTGAAAAAA--GT--GTC--GTGCCAGGG-CCAAATTTCTGTGG--G--TCCTAACATT---GTTT--T--TATAAGAGATTATTTTACATATTGTCATTATCAAG----------CA-------------TTGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|4 : tttT-ATATTATATATAGA--GA---GAAATAG---AGA-A-AGTGTGAGAGATAAAATAACAAA--------ATAT-CTTTCTCACTATAT-AAAACAT--CTCTTTCTCTCAATC-ATTTT-CCAGT-TTTGAAGGGGGGGGGG-G-------------GGGTGTTG-----------------------------GGTACAAT-TTTATA-AGTA--T--A-----------ATTGTTTTTCTTCTGGAAGATAAATGGTGAATTTAAT------AGTAAAAT-AAGTGGTGACTAGGTTTAAC-AT-GCTAAACAATGTTCTCCATG-TTGAGTTCTGCAAATACATGTAT-ATAA---TT-------ATATA------GG-----T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAAGCCCCAAC-TTCTGTGCATG--TCCTAACATTACTG--T--TATTATTAAAGATTGTTTTACATATTATCATTACCAAGATAAAGTGATCTCTTT
gi|5 : A--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--ATTAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--ACAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTC----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--ATC---------AATGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCTAGTG--TCCTAACATT---G-----T--TA--AAAGATTATTTTTCATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAta
gi|6 : CTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCCTTC-ATTCT-CTAGT-TT--CAAAG-GGTGT----------------------TTTTTG----T-----------------------ACAAT-TTTCTA-A--G--T--ATTATAATATTTATTGTTTT-CTAAAGGAAGATAAATGGTAAATTTGAC------A---------------------ATTAAA--GT-GTCAAACAATGTTCTTCATG-TTGGGTCCTGTA-------GTAAAGTAAACGTTTA---TAAT-TA------ATGC---T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAGGG-CCAGATTTCTGTGAGTG--TTCTAGCATT---GTTT--T--TATTAGAGATTATTTTACATATTGTTATTATCAA-----------------------ACGTCGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|7 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTATAAATACA--TA---G----------------------------AAATAACAAATTATC--ATTAT-CTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--ATC---------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACAGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TCCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATG
gi|8 : tttttttata--CATTTACTCCAATATT--AT-TTCACATTATATATATA--TAT--G---TATTTCATT-ATAGCTCTT---ATGAAATAACAAA--ATA--A------TTTCTCACTTTAA-GGTATAT--CTCTTTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--TAAAGGGG-GCA-----------------TTTTTTTGTAACACTT-------------TTAAAAGTAAAAAG-T---------A--T--T-----------ATTGTTTT
gi|9 : aattt-AGCATAT--CTCTTTCTTTCAGCC-ATTCT-CCAGTGTT--AAAGGGAG---ACG-------------ATTTTCTGCTT------------------------------CAATGTTTCTATGT-A--T--G-----------ATTGTTTCTCTATTGGAAAATAATTGTTAAATTTAATGGTAAAA------T-AAGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTAAACAATGTTTTCCATT-TAAGGTCTTGTA-------GCA--TTAA---TATACGTTTATACATGT---ATTTAGGT--------GAAAA--GTGCGTCATGTGTAAGGGCCTAAA-TTCTGTACGTGCCCCCTAACATT---G--CTGT--TATTattgctttgagttataactgtgtatgtttcagggttttttaaaagcaattgtaaacagtattccatttagtcgtcttgtagaaaatatgtaatattttatttcgaaaa
blockSeqs : T TC A AC G C A CA TATA TTC CCT A GAG TACCGAAA T T AT TT A G TGA A T AGATATTTTTTTATTATTTTTTTTTTATTTT G AGTATTATAATATTT G AGTAAAATAAGTGG G AG TC A A C AATACAT AAG ACG GT ATTTATATTGA AA GC T C T CC ACTGT AT T A T AC TGAT
blockSeqs : . T T A . C A . GAAA TTC GC G . TTAACAT . . . A . . C A T ATTTTTTTGTAACACTTTTAAAA . AGTAGT A GGTAAAATAAGT G AG T . . C . TA . . TGTATTTAGGT AA . T G T . GTTT . T A T CC .
blockSeqs : . . A C . . T . TG TTC GT G . TTATCTT . . . G . . A A T AGATTTTTTTTTTATTTT . AGTTTT C ATCATGT G AG A . . G . A . . CTGGTAATT . . C A . . GTTT . G A G TC .
blockSeqs : . . A C . . T . G . GT G . TTATCAA . . . A . . C G T AGATTTTTTTTTTCTTTT . AGTATT G ATACTT G AG C . . C . G . . ATGCT . . T A . . GCTG . A A T CC .
blockSeqs : . . A G . . T . A . GT A . TTATCAT . . . A . . A A T AGATTTTTTTTTTATTTT . AGTATA A ATACTT G AG T . . G . T . . ATT . . C G . . GT . T . . A .
blockSeqs : . T C . . A . A . GT G . TTATCAT . . . A . . C G G ACGATTTTCTGCTT . GATATC G ATACTT . . T . . C . G . . GGT . . . G . . G . G . . .
blockSeqs : . T C . . A . G . GC A . AAAAC . . . A . . A A T ATATTTCTTA . GATATC T A . . T . . A . G . . ATT . . . A . . G .
blockSeqs : T . . . T . G . GA G . AAAGC . . . T . . C A T ATTTTTTTTT . TGTATG . A . . . . . . . T . . ATT . .
blockSeqs : T . . . A . G . GC G . ATAA . . . A . . A G T GGGGGTGTTG . GATC .
blockSeqs : A . . . T . G . TT G . CTA . . . A . . C G . ATTTCTTT . ATT
blockSeqs : . . . G . C . . AA . . . T . . A . . TTTTTGT .
blockSeqs : . . . . . . A . . . A . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . A
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A .
blockSeqCons : GCTT*****
originalCons : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTAT-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATT---G--T--T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
finalCons : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANATACA--TA---G---TAT---AGC-ATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTAT-CTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TTCTGCGAGTG--TCCTAACATTGCTT-----T--TATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
Alignments
lowQualScore : 11 11 1111111 111 222222222 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444444444444444444444 333333333333333333333 1111111 111 3333333333333333333333 11 333333 1111
lowQualScore : 6 11 1 11 3 6 55 44 5555555 555 33 1 1 555 555555555 3 0 2 33 22 2 2 555 3 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 2222222222222222222222 4 333333333333333333333 1 11 55 4 4 3 4444444 111 777 66 1111111111111111111111 22 66 7 2 5 5 66 999999 1 1 1 33 4444
lowQualScore : . .. . .. . . .. .. ....... ... .. . . ... ......... . . . .. .. . . ... . . ..................................................... . ...................... . ..................... . .. .. . . . ....... ... ... .. ...................... .. .. . . . . .. ...... . . . .. ....
lowQualScore : 7 99 0 88 6 2 77 22 9999999 000 66 4 7 000 888888888 1 7 5 44 66 5 7 111 2 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 8888888888888888888888 7 999999999999999999999 1 99 44 0 4 9 4444444 444 888 11 2222222222222222222222 22 11 0 2 0 0 99 999999 6 4 3 77 2222
consensus : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANAT--ACATA---G---TAT---AGCATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTA-TCTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TT-CTGCGAGTG--TCCTAACATTGCT--T-TTATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
Reference ( family-131 ) : TTTA-A--CATTTATTCCACTNTT-CAT-TT-ACATTATANAT--ACATA---G---TAT---AGCATAGTTCTA---ATCAAATAACAAATTATC--ANTA-TCTTTCTCGCTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTCT-CCAGT-TT--AAAAGAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-G--A--T--N-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TT-CTGCGAGTG--TCCTAACATTGCT--T-TTATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCNCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAA
gi|1 : TTTT-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTGTTAAT--ACATA---G---TAT---AGCATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTATA--ATTA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTTTCTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAGT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTCTTTTA----TTATTATTATTTATTTT----GTTACAAT-TTTTTA-G--A--T--ATA---------ATTGTTTTTCTTGTGGGAAATAAATGGTAAATTTAAT------A------G-AAGT--TGACTAAGTTAAAT-AT-ATTACACATTGTTCTCCATG-TACGGTCTTGTG-------GTA--ATAA---TTCAC--TGATATA------AT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCAATA-TT-TTTCGAGTG--CCCTAACATTA------TTATTGAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTGTCACTTTA----TATGTTATTCTAATTTAAATATTCAGAA
gi|10 : tTTTA-AT-CATTTATTCAAATATT-AGT-TT-ACATTA--AAC--TCGTA-------TAT---A-CATA-TTTTA---GT--ATTGATAAACTA----------------CACTATAATAGCATAT--CTCTTTCACTCAGTC-ATTCTAATATT-TT--CCGAGAGGT-TA-T-------------A----TTTCTTA-------------------------GTTACAAT-TGTCTA-A--G--TAGT-----------ATTGTTCTTCTA-----AAATAAACAGTAAA-TTAAT------A------TCATGT--T--CT---TCAAATCATAATTACAC
gi|11 : tTTTATA--CATTTATTCCACTTTT-CAA-TT-ATATTATTAAT--ACATA---G---TAC---AGCATAATTCTA---ATCAAATAACAAATTAAC--ATTG-TCTTTCACGCTATAA-ATCATAT--GTCTTTCTCTCAGTCTTTTCT-CTAGT-TT--AAAAAAGCTGTA-GATATTTTTTTATTATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--
gi|12 : ttttT-ATTACACAATGTTCTCTATG-TACGGTCTTATG-------GTA--ATAA---TTCAC--TAATATACTGGTAAT-----T--------GAAAA--GT--GTCATGTGCCAGGGTCCACA-TT-TTGTGAGTG--TCTTAACATTG------TTATTAAAGATTATTTTACATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCACTTTATGATTATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAat
gi|13 : T-ACATTAT--AT--ACCTA-------TAT-----CA-------A---ATCGAATAACAAA--AAA--ACTG---TTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCATTC-GTTCT-CCAGT-TT--CAAA-AGATGT----------------ATTTTT----------TT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-A--GTTT--T-----------ATTGTTTTTCT
gi|14 : a--CATTTCTTCCTCTATT-CTT-TT-ACATTATATATACACATA---A---TAA---AGTATAGTTCTA---ATCAAAT---AAGTTATC--TTTATTCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-ATTTC-CCAGt
gi|15 : atttttatatcTTTATTCCAATATT--ATGTT-ACATTATATAT--ATATATATA---TATTTCAGTATAGTTCTA---ATCATATA------TACCGAAATA-TCTTTCTCACTTTAA-AACACAT--CT--TTCTCTCGTTT-ATTCT-CCAGT-TT--AAA
gi|16 : TTTATTCCAATAAT--AT-TTCACACTATATAT--ATTTA-------TATTTCAGTAGAGTTCTA---ATCATATAACAAA--------ATA-TCTTTCTAACTATAA-AACATAT--CT--TTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--
gi|17 : tttttCTTTCTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTATTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAGGGt
gi|18 : ataacaaaagacgTATCCCACTTTT-GTT-TT-ACATTACAAAT--TCATA---G---TAT---AGTATAATTCTA---ATCAGATAAC
gi|2 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTC-CAT-TT-ACATTATAAAT--ACATA---G---TAT---AGCATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--AATA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--C-----------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TT-CTGCGAGTG--TCCTAACATTG------TTATTAAAGATTATTTTACATATTTTTATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAtata
gi|3 : TTTA-ATCCATTTATTCCTCTTTTACAT----ATATTATA--T--ACAT----G---TAT---A---TAAT-CTA---ATCAAATAACAAAAAAGC-------TCTTTCTCATTATAA-AGCATATATCTCTTACTCTCATTC-ATTCT-CCAGT-TT--CAAAG-GGTGTA-----------------------TTT-----CT-------------TT----GTTACAAT-TTTCTA-AGTA--T--T-----------ATTGCTTTTCTTATGGAGGATAAATGACAAATTTGAC------A---------------------ATTAAAA-AT-GTTAAACAATATTCTCCATAATG-GGTCCTGTA-------GTA--TTAA---TACAC--AAATATA------AT-----TTATATTGAAAAAA--GT--GTC--GTGCCAGGG-CCAAA-TTTCTGTGGGT----CCTAACATTGTT--T-TTATAAGAGATTATTTTACATATTGTCATTATCAAG----------CA-------------TTGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|4 : tttT-ATATTATATAT--AGAGA---GAAATAG---AGAA-AGTGTGAGAGATAAAATAACAAA--------ATA-TCTTTCTCACTATAT-AAAACAT--CTCTTTCTCTCAATC-ATTTT-CCAGT-TTTGAAGGGGGGGGGG-G-------------GGGTGTTG-----------------------------GGTACAAT-TTTATA-AGTA--T--A-----------ATTGTTTTTCTTCTGGAAGATAAATGGTGAATTTAAT------AGTAAAAT-AAGTGGTGACTAGGTTTAAC-AT-GCTAAACAATGTTCTCCATG-TTGAGTTCTGCAAATACATGTAT-ATAA---TT-------ATATA------GG-----T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAAGCCCCAAC-TT-CTGTGCATG--TCCTAACATTACTGTTATTATTAAAGATTGTTTTACATATTATCATTACCAAGATAAAGTGATCTCTTT
gi|5 : ATA---G---TAT---AGCATAGTTGTA---ATCAAATAACAAATTATC--ATTA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--ACAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTC----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--ATC---------AATGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACGGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TTCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATGTGCCAGGGTCCAGA-TT-CTGCTAGTG--TCCTAACATTG------TTA--AAAGATTATTTTTCATATTTTCATTACCAGGATAAAGTTATCCCTTTA----TATGTCGTATTAATTTAAATATTCAGAAta
gi|6 : CTCACTATAA-AGCATAT--CTCTTACTCTCCTTC-ATTCT-CTAGT-TT--CAAAG-GGTGT----------------------TTTTTG----T-----------------------ACAAT-TTTCTA-A--G--T--ATTATAATATTTATTGTTTT-CTAAAGGAAGATAAATGGTAAATTTGAC------A---------------------ATTAAA--GT-GTCAAACAATGTTCTTCATG-TTGGGTCCTGTA-------GTAAAGTAAACGTTTA---TAAT-TA------ATGC---T--------GAAAAAAGT--GTCATGTGCCAGGG-CCAGATTT-CTGTGAGTG--TTCTAGCATTGTT--T-TTATTAGAGATTATTTTACATATTGTTATTATCAA-----------------------ACGTCGTATTGATTTAAATATTCAGAA
gi|7 : TTTA-A--CATTTATTCCACTTTT-CAT-TT-ACATTATAAAT--ACATA---G---------------------------AAATAACAAATTATC--ATTA-TCTTTCTCGCTATAA-AACATAT--CTCTTTCTCTCAGTC-TTTCT-CCAAT-TT--AAAAAAGGTGTA-G-------------ATTTTTTTTTTA----TT-------------TT----GTTACAGT-TTTCTA-G--A--T--ATC---------ATTGTTTTTCTAGTGGGAAATAAATGGTAAATTTGAT------A------T-ACTT--TGACTAGGTTAAAT-AT-ATTACACAATGTTCTCCATA-TACAGTCTTGTG-------GTA--GTAA---TCCAC--TAATATA------AT-----T--------GAAAA--TT--GTCATG
gi|8 : tttttttata--CATTTACTCCAATATT--AT-TTCACATTATATAT--ATATAT--G---TATTTCATTATAGCTCTT---ATGAAATAACAAA--ATA--A------TTTCTCACTTTAA-GGTATAT--CTCTTTCTCCCGGTC-ATTCT-CCAGT-TT--TAAAGGGG-GCA-----------------TTTTTTTGTAACACTT-------------TTAAAAGTAAAAAG-T---------A--T--T-----------ATTGTTTT
gi|9 : aattt-AGCATAT--CTCTTTCTTTCAGCC-ATTCT-CCAGTGTT--AAAGGGAG---ACG-------------ATTTTCTGCTT------------------------------CAATGTTTCTATGT-A--T--G-----------ATTGTTTCTCTATTGGAAAATAATTGTTAAATTTAATGGTAAAA------T-AAGT--TGACTAGGTTAAAT-AT-GTTAAACAATGTTTTCCATT-TAAGGTCTTGTA-------GCA--TTAA---TATACGTTTATACATGT---ATTTAGGT--------GAAAA--GTGCGTCATGTGTAAGGGCCTAAA-TT-CTGTACGTGCCCCCTAACATTGCT--G-TTATTattgctttgagttataactgtgtatgtttcagggttttttaaaagcaattgtaaacagtattccatttagtcgtcttgtagaaaatatgtaatattttatttcgaaaa