lowQualScore                  :                                              1                  1111                                  
lowQualScore                  :                2         66 1   4    111     3        4 3333  1 8888   4  3333 3333     3333          
lowQualScore                  :                .         .. .   .    ...     .        . ....  . ....   .  .... ....     ....          
lowQualScore                  :                0         22 0   8    777     3        8 1111  5 5555   4  3333 3333     5555          
consensus                     :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCGA----AG-TC---GGCGGG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
Reference ( gi|6 )            :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATAAGATTGGCAA----AG-TG---GGCGGG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|2                          :      ACCAGGTTTTTTCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATAAGATTGGTAA----AG-TC---GGCGGG----C----GGGCG----GATGGGCAGC
gi|2                          :      ACCAGGTTTT--CAACTTTGAAA-AAA-CCTG---GTat
gi|12                         :      ACCAGG-TTT-TCAACTTTGA-A-AAA-CCTG---Gtataagattggtaaagtcggcgggcgggcggatgggcagcat
gi|26                         :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCAA----AG-TC---GGCGGG----C----tataagattggtgaagtctgtgggcgggctgattggcggc
gi|26                         :      ACCAGGTTTT--CAACTTTG--A-AAAACCTG---GT
gi|22                         :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCCA----AG-TT---GGCGGG----C----GGACtattagattggcaaagtcggcgggc
gi|22                         :      ACCAGGTTTT--CAACTTTG--A-AAAACCTG---GT
gi|3                          :      ACCAGGTTTT-TCAAAGCTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGAATGGCGA----AG-TC---GGCGGG----T----GGGCG----GGTGGATGGtattagattggccaagttggcgggcggac
gi|3                          :    taACCAGGTTTT--CAGCTTTG--A-AAAACCTG---GTTAgc
gi|4                          :      ACCAGGTTTA-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCAA----AG-TC---GGCGGG----C----AGACA----AGCGGGCGGtattagaatggcgaagtcggcgggtgggcgggtggatgggc
gi|4                          :      ACCAGG-TTT-TCAACTTTG--ATAAA-CCTG---GTatg
gi|7                          :      ACCAGG-TTT-TCAACTTTGA-A-AAA-CCTG---Gtattagattggcaaagtcggcgggcagacaagcgggcggatg
gi|20                         :      ACCAGG-TTT-TCAACTTTGA-A-AAA-CCTG---Gtattagattggcgaagtcgacaggaaggcggattggcggtg
gi|11                         :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTAGGAGATTGGCGA----AG-CC---GGTGGG----T----GGAAT----GATGGGCAGtattagattggtgaagtcagtgggcggacgggcag
gi|11                         :      ACCAGGTTTT--CAACTTTG--A-AAAACCTG---GT
gi|15                         :      ACCAGGTGTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---ATTATTAGATTGGCGA----AG-TT---GGCAGG----C----GGATG----GAtaggagattggcgaagccggtgggtggaatgatgggcag
gi|14                         :      ACCAGG-TTT-TCAACTTTGA-A-AAA-CCTG---Gcagcg
gi|23                         :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCT----------AGATTGGCGA----AG-TC---GGCGGG----C----GGATG----GGTGGtattagatttgtaaagtcagcaggtagacgggcggata
gi|21                         :     aACCGGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTG--AA--------------TGGG----C----AGGCT----GATGGGCAGC
gi|21                         :     aACCAGG-TTT-TCAACTTTGA-A-AAA-CCCG---GTT
gi|10                         :      ACCAGGTTTT--CAACTTTA--A-AAA-CCTG---Gtattagattgaatgggcaggctgatgggcagc
gi|27                         :      ACCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTACTAGATTGGGGA----AG-TT---GGCGtattagattggcgatgccggcatgcgaatgggcggatgggc
gi|27                         :     aACCAGGTTTT--CAACTTTG--A-AAAACCTG---GTT
gi|18                         :      ACCAAGTTTT-TCAAGGTTA--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGAC-A----AG-TC---AGCTGG----T----GGGCA----GAtactagattggggaagttggcg
gi|9                          :     aACCAGGTTTT-TCAAAGTTA--A-AAA-CCTC---ATTATTAGATTGACGA----TG-T-------TGG----T----GGGCT----GATGGGCGGgt
gi|29                         :     aACGAGGTTTT-TCAAA-TTG--A-AAA-TCTG---GTTATTAGATTGGCggt
gi|30                         :      ACTAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCg
gi|8                          : tttttaCCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---ATTATGAGATTGGCGA----AG-TC---CGCGGG----C----GGGCG----AATGGGCGGC
gi|12                         :       CCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATAAGATTGGTGA----AG-TC---TGTGGG----C----GGGCT----GATTGGCGGCg
gi|7                          :       CCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCGA----AG-TC---GACAGG----A----AGGCG----GATTGGCGG
gi|20                         :       CCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGTGAAGTCAG-TG---GGCGGA----C----GGGCA----tg
gi|14                         :       CCAGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTTGTAA----AG-TC---AGCAGGTAGAC----GGGCG----GAT
gi|10                         :       CCAGGTTTT-T-AAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCGA----TG-CC---GGCATG----CGAATGGGCG----GATGGGCa
gi|16                         :       CCAGGTTTTTTCAAAGTTG--A-AAC-CCTGGTTGTTATTAGATTGGCGA----AG-TT---GGC-------C-----GGCG----GATGGG
gi|19                         :        CAGGTTTT-TTAAAGTTG--A-AAA-CTT------CATAAGATTGGCGA----AG-TC---AGCGGG----C----GGGCG----GATGGGCGGt
gi|5                          :        CAAGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTT---GTTATTAGATTGGGGA----AG-TC---GGCGGG----C----GGGTG----
gi|1                          :         AGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTA---GTTATTAGATTGGCGA----AGTTGGCTGGCTGG----C----GGGCG----GATGGGCGGCgcaatcaggcg
gi|17                         :         AGGTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCGA----AG-T----GAC-GA----C----GGGCG----GATGGGCGGat
gi|13                         :           aTTTT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGCGA----AG-TC---AGCGGG----T----GGGTGGTCCGATGGGCGGC
gi|24                         :              TT-TCAAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATTAGATTGGAGA----A-------GAC-GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|25                         :                   AAAGTTG--A-AAA-CCTG---GTTATCAGATTGGCGA----AG-TT---GGC-GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|28                         :                                 -CCTG---GTTATTAGATTGGCGG----AG-T------C-GG----C----GGGTG----GATGGGCGGC





Alignments
lowQualScore                  :                 1 1                   222                 0  55555  3333 3333     3333          
lowQualScore                  :                 . .                   ...                 .  .....  .... ....     ....          
lowQualScore                  :                 4 4                   444                 9  11111  1111 1111     4444          
consensus                     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
Reference ( family-1291 )     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|1                          :          AGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTAGTT---ATTAGATTGGCGAAGTTGGCTGGCTGG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|10                         :        CCAGGTTTT-T--AAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGATGCCGGC-A---TG----CGAATGGGCG----GATGGGCat
gi|11                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---AGGAGATTGGCGAAGCCGGT-G---GG----T----GGAAT----GATGGGCAG
gi|12                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGTGAAGTCTGT-G---GG----C----GGGCT----GATTGGCGGC
gi|13                         :             TTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCAGC-G---GG----T----GGGTGGTCCGATGGGCGGC
gi|14                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTTGTAAAGTCAGC-A---GGTAGAC----GGGCG----GAT
gi|15                         :       ACCAGGTGTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGATT---ATTAGATTGGCGAAGTTGGC-A---GG----C----GGATG----GAa
gi|16                         :        CCAGGTTTT-TTCAAAGTTGAAACCCTGGTTGTTATTAGATTGGCGAAGTTGGC-----------C-----GGCG----GATGGGcagcg
gi|17                         :          AGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGT-GAC-----GA----C----GGGCG----GATGGGCGGt
gi|18                         :      aACCAAGTTTT-T-CAAGGTTAAAAACCTGGTT---ATTAGATTGAC-AAGTCAGC-T---GG----T----GGGCA----GA
gi|19                         :        aCAGGTTTT-T-TAAAGTTGAAAACTT---C---ATAAGATTGGCGAAGTCAGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGgt
gi|2                          :       ACCAGGTTTTTT-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGTAAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCAGC
gi|20                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGTGAAGTCAGT-G---GG----C----GGACG----at
gi|21                         :       ACCGGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATT---GAA-----T-G---GG----C----AGGCT----GATGGGCAGCgcag
gi|22                         :      aACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCCAAGTTGGC-G---GG----C----GGAC
gi|23                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCT----------AGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGATG----GGTGG
gi|24                         :              aTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGAGAAGAC--------GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|25                         :                     AAAGTTGAAAACCTGGTT---ATCAGATTGGCGAAGTTGGC-----GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|26                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCAAAGTCGGC-G---GG----C----
gi|27                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ACTAGATTGGGGAAGTTGGC-G---
gi|28                         :                               aCCTGGTT---ATTAGATTGGCGGAGTC--------GG----C----GGGTG----GATGGGCGGC
gi|29                         :       ACGAGGTTTT-T-CAAA-TTGAAAATCTGGTT---ATTAGATTGGCGgt
gi|3                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGCTGAAAACCTGGTT---ATTAGAATGGCGAAGTCGGC-G---GG----T----GGGCG----GGTGGATGG
gi|30                         :     taACTAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCgc
gi|4                          : tttttaACCAGGTTTA-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCAAAGTCGGC-G---GG----C----AGACA----AGCGGGCGG
gi|5                          :         CAAGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTTGTT---ATTAGATTGGGGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGTG----atg
gi|6                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGCAAAGTGGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGCgcaatcaggcg
gi|7                          :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGAC-A---GG----A----AGGCG----GATTGGCGG
gi|8                          :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGATT---ATGAGATTGGCGAAGTCCGC-G---GG----C----GGGCG----AATGGGCGGCtg
gi|9                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTAAAAACCTCATT---ATTAGATTGACGATGTT--------GG----T----GGGCT----GATGGGCGGg





Alignments
lowQualScore                  :                 1 1                   222                 0  55555  3333 3333     3333          
lowQualScore                  :                 . .                   ...                 .  .....  .... ....     ....          
lowQualScore                  :                 4 4                   444                 9  11111  1111 1111     4444          
consensus                     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
Reference ( family-1291 )     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|1                          :          AGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTAGTT---ATTAGATTGGCGAAGTTGGCTGGCTGG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|10                         :        CCAGGTTTT-T--AAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGATGCCGGC-A---TG----CGAATGGGCG----GATGGGCat
gi|11                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---AGGAGATTGGCGAAGCCGGT-G---GG----T----GGAAT----GATGGGCAG
gi|12                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGTGAAGTCTGT-G---GG----C----GGGCT----GATTGGCGGC
gi|13                         :             TTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCAGC-G---GG----T----GGGTGGTCCGATGGGCGGC
gi|14                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTTGTAAAGTCAGC-A---GGTAGAC----GGGCG----GAT
gi|15                         :       ACCAGGTGTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGATT---ATTAGATTGGCGAAGTTGGC-A---GG----C----GGATG----GAa
gi|16                         :        CCAGGTTTT-TTCAAAGTTGAAACCCTGGTTGTTATTAGATTGGCGAAGTTGGC-----------C-----GGCG----GATGGGcagcg
gi|17                         :          AGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGT-GAC-----GA----C----GGGCG----GATGGGCGGt
gi|18                         :      aACCAAGTTTT-T-CAAGGTTAAAAACCTGGTT---ATTAGATTGAC-AAGTCAGC-T---GG----T----GGGCA----GA
gi|19                         :        aCAGGTTTT-T-TAAAGTTGAAAACTT---C---ATAAGATTGGCGAAGTCAGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGgt
gi|2                          :       ACCAGGTTTTTT-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGTAAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCAGC
gi|20                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGTGAAGTCAGT-G---GG----C----GGACG----at
gi|21                         :       ACCGGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATT---GAA-----T-G---GG----C----AGGCT----GATGGGCAGCgcag
gi|22                         :      aACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCCAAGTTGGC-G---GG----C----GGAC
gi|23                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCT----------AGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGATG----GGTGG
gi|24                         :              aTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGAGAAGAC--------GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|25                         :                     AAAGTTGAAAACCTGGTT---ATCAGATTGGCGAAGTTGGC-----GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|26                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCAAAGTCGGC-G---GG----C----
gi|27                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ACTAGATTGGGGAAGTTGGC-G---
gi|28                         :                               aCCTGGTT---ATTAGATTGGCGGAGTC--------GG----C----GGGTG----GATGGGCGGC
gi|29                         :       ACGAGGTTTT-T-CAAA-TTGAAAATCTGGTT---ATTAGATTGGCGgt
gi|3                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGCTGAAAACCTGGTT---ATTAGAATGGCGAAGTCGGC-G---GG----T----GGGCG----GGTGGATGG
gi|30                         :     taACTAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCgc
gi|4                          : tttttaACCAGGTTTA-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCAAAGTCGGC-G---GG----C----AGACA----AGCGGGCGG
gi|5                          :         CAAGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTTGTT---ATTAGATTGGGGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGTG----atg
gi|6                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGCAAAGTGGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGCgcaatcaggcg
gi|7                          :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGAC-A---GG----A----AGGCG----GATTGGCGG
gi|8                          :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGATT---ATGAGATTGGCGAAGTCCGC-G---GG----C----GGGCG----AATGGGCGGCtg
gi|9                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTAAAAACCTCATT---ATTAGATTGACGATGTT--------GG----T----GGGCT----GATGGGCGGg


blockSeqs                     :                 T T                   GTT                    A      TAGA GAAT     GTCC
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      A      .    .        .   
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blockSeqs                     :                 . .                   .                      T      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      A      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      G      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      .      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      .      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      .      .    .        .   
blockSeqs                     :                 . .                   .                      .      .    .            
blockSeqs                     :                 . .                   .                      .      .    .            
blockSeqs                     :                 . .                   .                      .                        
blockSeqs                     :                                       .                                               


blockSeqCons                  :                                                              G****
originalCons                  :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
finalCons                     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGCG----GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC





Alignments
lowQualScore                  :                 1 1                   222                 0  55555  3333 3333     3333          
lowQualScore                  :                 . .                   ...                 .  .....  .... ....     ....          
lowQualScore                  :                 4 4                   444                 9  11111  1111 1111     4444          
consensus                     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
Reference ( family-1291 )     :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|1                          :          AGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTAGTT---ATTAGATTGGCGAAGTTGGCTGGCTGG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|10                         :        CCAGGTTTT-T--AAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGATGCCGGC-A---TG----CGAATGGGCG----GATGGGCat
gi|11                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---AGGAGATTGGCGAAGCCGGT-G---GG----T----GGAAT----GATGGGCAG
gi|12                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGTGAAGTCTGT-G---GG----C----GGGCT----GATTGGCGGC
gi|13                         :             TTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCAGC-G---GG----T----GGGTGGTCCGATGGGCGGC
gi|14                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTTGTAAAGTCAGC-A---GGTAGAC----GGGCG----GAT
gi|15                         :       ACCAGGTGTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGATT---ATTAGATTGGCGAAGTTGGC-A---GG----C----GGATG----GAa
gi|16                         :        CCAGGTTTT-TTCAAAGTTGAAACCCTGGTTGTTATTAGATTGGCGAAGTTGGC-----------C-----GGCG----GATGGGcagcg
gi|17                         :          AGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGT-GAC-----GA----C----GGGCG----GATGGGCGGt
gi|18                         :      aACCAAGTTTT-T-CAAGGTTAAAAACCTGGTT---ATTAGATTGAC-AAGTCAGC-T---GG----T----GGGCA----GA
gi|19                         :        aCAGGTTTT-T-TAAAGTTGAAAACTT---C---ATAAGATTGGCGAAGTCAGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGgt
gi|2                          :       ACCAGGTTTTTT-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGTAAAGTCGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCAGC
gi|20                         :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGTGAAGTCAGT-G---GG----C----GGACG----at
gi|21                         :       ACCGGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATT---GAA-----T-G---GG----C----AGGCT----GATGGGCAGCgcag
gi|22                         :      aACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCCAAGTTGGC-G---GG----C----GGAC
gi|23                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCT----------AGATTGGCGAAGTCGGC-G---GG----C----GGATG----GGTGG
gi|24                         :              aTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGAGAAGAC--------GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|25                         :                     AAAGTTGAAAACCTGGTT---ATCAGATTGGCGAAGTTGGC-----GG----C----GGGCG----GATGGGCGGC
gi|26                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCAAAGTCGGC-G---GG----C----
gi|27                         :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ACTAGATTGGGGAAGTTGGC-G---
gi|28                         :                               aCCTGGTT---ATTAGATTGGCGGAGTC--------GG----C----GGGTG----GATGGGCGGC
gi|29                         :       ACGAGGTTTT-T-CAAA-TTGAAAATCTGGTT---ATTAGATTGGCGgt
gi|3                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGCTGAAAACCTGGTT---ATTAGAATGGCGAAGTCGGC-G---GG----T----GGGCG----GGTGGATGG
gi|30                         :     taACTAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCgc
gi|4                          : tttttaACCAGGTTTA-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCAAAGTCGGC-G---GG----C----AGACA----AGCGGGCGG
gi|5                          :         CAAGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTTGTT---ATTAGATTGGGGAAGTCGGC-G---GG----C----GGGTG----atg
gi|6                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATAAGATTGGCAAAGTGGGC-G---GG----C----GGGCG----GATGGGCGGCgcaatcaggcg
gi|7                          :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGGTT---ATTAGATTGGCGAAGTCGAC-A---GG----A----AGGCG----GATTGGCGG
gi|8                          :        CCAGGTTTT-T-CAAAGTTGAAAACCTGATT---ATGAGATTGGCGAAGTCCGC-G---GG----C----GGGCG----AATGGGCGGCtg
gi|9                          :       ACCAGGTTTT-T-CAAAGTTAAAAACCTCATT---ATTAGATTGACGATGTT--------GG----T----GGGCT----GATGGGCGGg