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6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|15 : gagg-A-CT--AGTCTA---T-C--T---ACC-AAC-T-T-G-GTTT-----A---TA---TGAAGTTG-G-CCTAGTTTTG-CACTaa
gi|16 : taaggccttaaaaatatGTTTA-TCG-A---G---------A-A-CTT-AGTCTA---T-T--T---ACT-TTC-A-T-T-GTCT-----A---TA---TTGAGTAA-G-CTCAGTTTTG-
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gi|45 : c---------A-G-CT--AGTATA---T-T--T---ACA-TTC-T-T-C-GTCT-----G---TA---TCGAGTTG-A-ACTAGTTTTG-AACT
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gi|47 : TTA-GCA-A---A---------A-A-TT--TGTCTA---T-A--T---ATC-TTC-T-T-T-GTCT-----G---TA---TTGAGTTG-A-ACTAGTTTTG-CACTta
gi|48 : aTTG-GCACA---A---------A-A-CT--AGTTTA---T-G--T---ACC-TTC-T-T-G-GTAC-----A---CA---TTAAATTA-G-ACTAGTTCTG-CATTa
gi|49 : CTCA-GTGCA---A---------A-A-CT--AGTCTATATT-A--T---ACT-TTC-A-T-A-TTGT-----A---TA---CTCAGTTA-G-ATTAGTTTa
gi|5 : gaaGCC---A---------A-A-CT--TGTCTA---T-C--A---ACT-TCC-TAT-A-GTCT-----A---TG---TTGAGGTA-G-ACAAGTTTTG-
gi|50 : atagttcaaggacatattTTA-GCG-G---A---------A-A-TT--AGTCTT---C-C--T---AC--TTC-T-T-T-GTGT-----A---TA---TCGAGTTC-T-ACTGGTCTTG-CACTacattaag
gi|51 : aatTTA-GTGCC---A---------A-A-CC--ATTCTA---T-C--T---GCC-TTC-T-T-G-TTCT-----A---TA---TTGAGTTG-T-ACCAGTTTTG-CA
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gi|53 : tGCTCG-GTGCC---A---------G-A-CA--CGTCCA---T-C--T---ACT-TTC-T-T-T--TTG-----A---CA---ATGAGTGAAG-ACTGGTTTTG-CACaaaataagcc
gi|54 : CA---A---------A-A-TTTAAGTCTG---T-A--T---ACC-TTC-T-T-T-GTTT-----C---TG---GTGAGATA-G-ACTAGTTTAG-CATT
gi|55 : GCTTA-CTGCA---T---------A-A-CT--AGTATA---T-T--T---ACC-TTC-G-T-A-GCTT-----G---TG---TTGAGTTA-G-ACCAGTTTaaac
gi|56 : ggTCA-GTGCA---A---------T-A-CT--AATATA---T-C--T---GCC-TTC-T-T-T-ATCT-----A---GA---TTGAGTTA-C-ATTTGTTTTG-CACTgc
gi|57 : GCTTA-GCAAA---A---------A-T-CT--AGTCTA---T-C--T---ACC-TTC-T-T-A-TTCT-----A---TA---TTGAGGT------TAGTTTTG-CA
gi|58 : tCGCA---A---------A-A-CT--AAACTA---T-C--T---ACC-CTC-T-T-T-GTCT-----T---TA---TTGAGTTA-G-GCTAGTTTTG-CATTtga
gi|59 : TA-GCGCT---A---------A-A-AT--AGGTTA---T-C--A---GCC-TTC-A-T-T-GTCT-----A---TA---TAAATCTA-G-GCTAGTTTTG-AACTaag
gi|6 : -GTGTA---A---------A-A-CT--AGTTTA---T-A--T----TC-TTT-T-C-T-ATCT-----T---TA---CTGAGTTA-C-ATTAGTTTT
gi|60 : atacatactggcactaagTA-GCTCA---A---------A-A-CA--GGTCTA---T-C--T---ACT-TTC-T-T-T-GTCT-----A---TT---TTGAGTTA-T-ACCAATATTA-CACTttacctag
gi|61 : GCTTA-GCGCG------------------T--AGTTTA---T-C--T---ATC-TTC-T-T-T-TTCT-----A---TA---TTGAGGTA---ACTAATCTTG-CA
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gi|63 : CA---A---------A-A-CT--GGTCTA---T-C--T---GCC-TTC-T-A-A-GTCT-----A---TG---TTGAGTTA-A-ACTAGTTATG-
gi|64 : gttcaataCA---A---------A-A-CT--AGTTTA---T-C--T---AC--TTC-T-T-T-GTCT-----A---AA---TTGAATTA-G-GTTA-TTTTA-CAC
gi|65 : gta---ACA-TTC-C-T-T-GTCT-----G---TA---TTGAGTTA-ACACTCGTTGTG-CACTgaaa
gi|66 : cattgaagagtttgacCA---A---------A-A-CT--AGTTTA---T-T--T---ACC-TTC-T-T-A-GTTT-----A---TA---CTGAGTTA-G-ACTAGTTGAG-CACagt
gi|67 : -GTGCA---A---------A-A-CT---GTCTA---C-C--T---ACC-TTA-T-T-T-ATCC-----G---TA---TTGAGTTA-A-ACTTGTTTTG-CACTcaag
gi|68 : TTG-GTACA---A---------A-A-TT--AGCCTA---T-C--T---AG--TTC-T-A-T-GCCT-----A---TA---TTGAGTTA-G-GCTa
gi|69 : TG-GTACA---A---------A-A-CT--AGTCCA---T-C--T---ACC-TTC-T-T-T-GTCT-----A---TA---CTGAGTTA-A-GCTAATTTTG-tggcacaa
gi|7 : GCA---A---------A-A-CT--ATTCTA---T-A--T---ACT-GTC-T-T-A-GT-------G---TA---TTGAGTTA-A-ACTAGTCTTA-CAC
gi|70 : aatataacttaatgcgaccagttCA---A---------A-A-GT--GATCTA---T-C--T---ACC-GTC-C-T-T-GTCT-----A---TA---TGGAGTT
gi|71 : a---A---------A-A-CT--AGCCTA---T-G--T---ACC-TTT-T-T-TCATCT-----A---TA---CTGAGTTA-G-ACTGGTTgcgttgcattaaacc
gi|72 : ctTA-GTGCA---A---------G-A-TT--AGTCTA---T---------CC-TTC-T-T-A-GCCA-----A---TG---CTG-----------AGTTTTG-CACTgaaca
gi|74 : --T---ACA-TTC-T-A-T-GTTA-----A---TA---TTGAGTTG-G-ACCAGTTGTG-CACTaaattc
gi|75 : aattttaGCTTG-ACACA---A---------A-A-CT--AGCCTA---T-C--T---A-C-TTC-T-A-T-GTCT-----A---T----TCGAGTTA-atgc
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gi|8 : CTTAAGTGCATATA---------A-A-AT---GTCCA---T-C--T---ACC-TTT-T-T-A-TTCT-----A---AA---CTGGACTA-A-ACTAGTATTG-CACT
gi|9 : tgaggaGCTTA-GAGCA---G---------T-A-CT--AGTCTA---T-CTTT---GCC--TC-T-T-T-GTCT-----A---TA---TT-AGTTA-G-ACTAATTTTG-CACcagag
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|73 ): TTTATTGCAAAATTAATCTGTCTGCCTACTTAGTATATAATTGCGTCAGAC
Unaligned ( gi|77 ): TATCTTCCACATGTAATTACAAACCTAGTCTATCTATCTTCTA
Unaligned ( gi|78 ): TATATTAGTCTATGTCTAAGGCTTAGTACAA