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Reference ( gi|5 ) : CATGTGAA-A--TC-T-G-AAGCTCCAT----C-A-TAAA-G-TGT-ATA-TACCTCATAACTCA--GTGTACCAACATAACCAAAA-ATATAGTGCAAA-G-AAA-T-T-CC--TAACA-GTA-CA-------TA-------AT-------A-------T---ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTAATTTAAGCACCCCAAAAAAATAATAT-TCCTT---TGTT---TGC---TTCAAA-TGTG---T--AGAT----AGCATCTG-T---TG-AA----TGTA--A---A-TA-------ACA----TC-------TG----------TTG--A----------------------A---T-----------TG-A-----A-AT--CT-TA-G--ATT----------------GTGC--A-----------C------A---TTTA--T--GAATG---AAATAC--------ACAGTG----TTGT-----AGC----A--TG--TAGTGT-TGGTCCATAAATTGAACA----ATA----G--CAGATGA-TAAAATACTGCTTATTA---GTAT--CTTTTG----------ATCTAGCCAATA-ATGTATAAG---TAA-TAGTGT--TAGTGAAGTATCCTTTCCCA-TT-------ATT-T-A--T-TAG--TAAATTTAG------------AAAGG---A-TA---------------TAT---ACAG-CTAA----CCATAAA---C-----TGTGTTAC-----ATA-GTGAAA----------------------T--AACACAA-----------ACACGTTT---TC-CTCTTACGCCCTGCTGTGTG-T----ATTTCTGATACTGC----AAA-----TTTATG------CTG-TA----TGGTCTAGCCCGAATGTGCATTGGTCCTGTT-ATAGCCGGATAGCCATTAAT----TAAA----TA---TTATTACAAATTTAAACCATACT--------------TTTT-------------ATTGGAAGGTACCAAATA--------------TACAT-AATTT-CAAACTTTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TATAATATCAATTGCTGTCAAAA-GAGGATAAAAAAT-T----T-ACTATTGAAACTCTTCTCAATCA---T--------------------TA-AAATT--------GC---GA------TAA-----------------CTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAAG-T-ATTTGCAATG
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gi|17 : tttcatacgatgatgcggatgcaaaaatacacaaaaagttatcgaatctgggaaaatcaattttttggtgggttgcgttaaccggtgttgct-TAAA-GCTGT-AAA-TGCCTCATAACACA--GTTTACCACCGCAAT-AAAA-ATAAATTGCAAACG-AAC-T-T-CC--CAGAA-GTA-CA-------TA-------AT-------G-------T---TTA----ATAAAT------AA--A---------AA--TTATTTTACGTA-ACCAAAATGATTATATGTTATG---TGTA---CACAAATT-ACA-TGTG---T--TAAT----AGCCTGTT-T---TG-AA----TGCA--AT--A-TA-------attgtatcatagtgacgtgtgcataacatacatgacagtgtaaagatactatataaagacaagatacggtcatttgttgctttaaatgtgtcaagagcatgtattgaatacgatatatttctgagattactacgccattattgtgtcgtaatgatggcattttccggaatgaaagatccgacactataaagcaggagtttatttgtaaggtaaaaagataaaacagtccaaacgataaaatgctacttacgctgttatatatacatgtataagtaatactgttggtatcttttcctattatctcacctgtgtactaaaatgttatatttatacttatagattttaaaagtcagcatttaat
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consensus : CATGC-GAAA--TC-T-G-AAGNTCGGT-AN-------AAAG---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCAA---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----A-------T---ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAA---TTATTAT-T-CATTTGTTTGC---TTCAAA-TGT----G---TGAATAGC--ATG--TG-T-TGAA---TGTAA---ATA-----ATA----TNTG----------T-T-----GA---------------------CAT-----------T-----G------AA-AT----C-----TTNG----------------ATCG------TG----TA---C-----GA-------------T----TTA--T---GAA---T--GAA-A-----GACTACGA--CGCTG-----TA------GGA---------TG--TATT-GT-N--G-GTCTA---TAAATNGAACAG-TA-----GCAGACGA-TAAAATACTGCTTA----CTAGTAT--CTTTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCTA---------------------A----C--CATAAA-----T-----TGTGTTACATA-GTGCAAT--AACGCAA-----------ACACGCTTTC-CTCTTACGCCCTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACA-ATTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT----------CA----TTG-GAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCAT-AAN-TNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TAT-AT-AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
Reference ( family-1274 ) : CATGC-GAAA--TC-T-G-AAGCTCCGT-AN-------AAAG---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCNA---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----A-------T---ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTANTTTAGGTANCCGAATAAA---TTANTAT-T-CATTTGTTTGC---TTCAAA-TGT----G---TGAATAGC--ATG--TG-T-TGAA---TGTAA---ATA-----ACA----TNTG----------T-T-----GA---------------------TAT-----------T-----G------AA-AT----C-----TTNG----------------ATCG------TG----CA---C-----GA-------------T----TTA--T---GAA---T--GAA-A-----NACTACGA--CGTTG-----TA------GNA---------TG--TANT-GT-T--G-GTCTA---TAAATNGAACAG-TA-----GCAGACGA-TAAAATACTGCTTA----CTAGTAT--CTTTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCTA---------------------A----C--CATAAA-----T-----TGTGTTACANA-GTGNAAT--AACGCAA-----------ACACGCTTTC-CTTTTACGCCCTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACAAATTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTNCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT----------CA----TTG-GAACGTACCAAATAG-TTG-CG--GCGTTTGCAT-AAT-TTCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TAT-AT-AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNNAAAAC--C---T-ACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-N-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
gi|1 : ATGC-GGAA--GC-T-GGAAGCTTTGT-AGCTCAGTAAAAG---TGTAAA-------TA---CCTCATTACTCA--GTGTACCA-CACG-CCAAAAAT-ATAGCGC-AAA-G-AAAATTCCAACACATGCAAAAAGTT-CA----------------AT-----A-------T---ATAA-AAACAAATGCTTAAAA--A--------CAAACTTATTTTAGTTATCCGAATAAA---TTATTAT-T-CATTTGTTTGC---TTCAAA-TGT----GAAAAAAATGGC--ACG--TGTT-TTAA------AA---ATA-----A--------TA----------C-T-----GA---------------------AAT-----------T-----ACTAAGCAA-ATCAACC-----TGTG----------------ATCG------TG----TATTTT-----GATAGGCCCTGGAATT----TTGATT---GAA---T--GGA-A-----TGCT-------TTTG-----TATATC--GGAAAGCGGAAGTG--TATT--T-CAGG-GTCTA---TAAATTGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AACTACTG----------GGTAC--C--TTG----------A--AAGCT-ATACATGTATTAGTAA-TGTTGT--TAATAACGGATCCTTTCCCA-TCCT-T--------T-T--TATAGTT-------------TTT-TTAAA-----AAC--TA--A--------C-A--------------ACA--CTA---------------------A--------AT-CA-----C-----TGTA-TACATA--TAC-AT--A----AA-----------AC-TG--TTC-CTTTTACACCCTGCTG---------TCTGAAACTACA-------ACTGTAT------ACTAAAA-GTGTATTGATCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AAATAGA----T-A---TTGTTCCAA
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gi|10 : gtatgcggaagctggaagctttgtagctcagtaaaagtgtaaatacctcattactcagtgtaccacacgccaaaaatatagcgcaaagaaaattccaacacatgcaaaaagttcaatatataaaaacaaatgcttaaaaacaaacttattttagttatccgaataaattattattcatttgtttgcttcaaatgtgaaaaaaatggcacgtgttttaaaaataatactgaaattactaagcaaatcaacctgtgatcgtgtattttgataggccctggaattttgattgaatggaatgcttttgtatatcggaaagcggaagtgtatttcagggtctataaattgaacagtagcagacgataactactgggtaccttgaaagctatacatgtattagtaatgttgttaataacggatcctttcccatcctttttatagtttttttaaaaactaacaacactaaatcactgtatacatatacataaaactgttccttttacaccctgctgtctgaaactacaactgtatactaaaagtgtattgatcccgttatcgcctgatagccattaaatagatattgttccaatgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttCATGC-GAAA--TT-TTG-ATGGTCGGT-AG-------AAAA---TGTAAA-------TG---CTTTATAACTCA--GTGTACTAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGG-AAA-ATAAC-TTCACA---------GAAGTA-CAT-------A-------ATCTTCAA-------TGA-ATAA-AGATAAAC----------A--------CAT-CCTATTTTAGATAACTGATTAAA---TTA--AG-T-CATTTGTTTGC---TTTAGA-TGT----G---TGAAAAGC--ATG--TG-T-TGAA---TG-------TA-----ATA----TATG----------T-CG----GA---------------------AATTACTACGCCGGT-----G------AA-AC----C-----TTTG----------------ATCG------TG----TA---------GT-------------TA---TTA--T---GGGCCCT--GGA-ATTT--GAC--CGA--A--TG-----GA------ATAC--------TA--TAGT-GT-G--C-GTGTATTCTAAATAGAGCAA-TAATAT-GCAGACGA-Tagag
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gi|3 : tttacaaatatgttttttattggtgggttgcgttactcaacagtgttgacatgcgagattttgagcatagataaattgtcataattcctcataacaaagtgtaccaacacaccaaaaatgaagtgcaaaaaaaaatccaaaaagtacacaatgctctatacataaatacaaatacaacctattgtagataaccgaatatattattagtcatttgtcaaatgtttgaaaagcatgaatgtaaaacattgtataaaaatttggaaattactacgctattaaacctgtggtcgtgggctctgggatttgtctgagtaaatattatccattacaatgtgtcggaaagcgcgaatgtattttatggtctatacatcgaatagcaaatatgcaggcatgaaacttttgtataccttttaatctattcatgtataagtaatattgttagtgtaggattatctcctatttactcattagtttaaatgaaaagttcattatatatagtctatgagcgtcagaatgcaataagcatacatgaacaacaagtaaccatatcatttaatcaaacaatataaatggtatatactgcaataacacaaacacgcttattttttgtgatatttctgatactactttacacttgttatccggccagaatatgtatttgtcccgttgatgtatgataatcattaatatgataattattatttttcccataatgacgggaaagtttcagtttgacttatcacattaaagaaatagttcgatacattgtaagtatattagagcattgcaatgtgtgtctaaaataaatttcatgaaatgtttc-G-AAGCTCGCT-AA-------AACG---TGTACA-------TA---CCTCATAACTCAAAGTGTACAAACACA-ATAAAAAC-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTTAAAT--------AAAGTA-C-----------------AG-----A-------T---ATAA-AGAAAGAA------AC--A--------CAA-CTTAATTTATGTACCTGAATATATGTTTAA-AT-TACATGTG-TTG-------AAA-TGTGATCG---TGAATa
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consensus : CATGC-GAAA--TT-T-GAAGN-TCGGT-A-AAAG---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----AT-------ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATT--ATT-CGTT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGT----G---TGAATAGC--ATG--TG-T-TGAA---TGTAA---ATAATATN----T-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----C-----TTTG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------G-AA---TGAA-A---G------ACTACGACGC---T-----G-----TA----GG---------A---------TG-TAT--T-G-----T--A-G-GTCTA---TAAATNGAACAG-TA-----GCAGACGA-TAAAATACTGCTTA----CTAGTAT--CTTTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TAT-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A----C--CA---TAAA-----C-----TGTGTTACA------TAGTG-CAA---TAACG-----------CAA-----------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTAC-A-ATTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-GGAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCATGAAA-TNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TAT-AT-AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
Reference ( family-1274 ) : CATGC-GAAA--TC-T-GAAGN-TCGGT-ANAAAG---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----AT-------ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATT--ATT-CATT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGT----G---TGAATAGC--ATG--TG-T-TGAA---TGTAA---ATAATATN----T-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----C-----TTNG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------G-AA---TGAA-A---G------ACTACGACGC---T-----G-----TA----GG---------A---------TG-TAT--T-G-----T--N-G-GTCTA---TAAATNGAACAG-TA-----GCAGACGA-TAAAATACTGCTTA----CTAGTAT--CTTTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TAT-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A----C--CA---TAAA-----T-----TGTGTTACA------TAGTG-CAA---TAACG-----------CAA-----------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTAC-A-ATTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-GGAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCAT-AAN-TNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TAT-AT-AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
gi|1 : --TT-T-GTAGC-TCAGT-A-AAAG---TGTAAA-------TA---CCTCATTACTCA--GTGTACCA-CACG-CCAAAAAT-ATAGCGC-AAA-G-AAAATTCCA-ACACATGCAAAAAGTT-CA----------------AT-----AT-------ATAA-AAACAAATGCTTAAAA--A--------CAAACTTATTTTAGTTATCCGAATAAATTATT--ATT-CATT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGT----GAAAAAAATGGC--ACG--TGTT-TTAA------AA---ATAATA-----------------------C-T-----G--A---------------------A---AT-----------TACTAAGCAA-ATCAACC-----TGTG----------------ATCGTG----T----ATTTT-----------GA-----TAGGCCCTGGAATTT--T------G-AT---TGAATG---G------A-----ATGCTTTT-----G-----TATATCGG---------AAAGCGGAAGTG-TAT--T-------TCAG-G-GTCTA---TAAATTGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AACTACTG----------GGTAC--C--TTG----------A--AAGCT-ATACATGTATTAGTAA-TGTTGT--TAATAACGGATCCTTTCCCA-TCCT-T--------T-T--TATAGTT-------------TTT-TTAAA-----AAC--TA--AC-A--------------ACA--CT-----A---------------------A--------A---T-CA-----C-----TGTA-TACA------TA-TA-C-A---TA---------------AA-----------A---C-TG--TTC-C-TTTT-ACACC-CTGCTG---------TCTGAAACTAC-A-------ACTGTAT------ACTAAAA-GTGTATTGATCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AAATAGA----T-A---TTGTTCCAA
gi|1 : gtatgcggaagctggaagcCATG-----AATTAGAGATGT-ACATTTATTTTAGATTTAAAACATTTTTTTTCACAATATA--------------TTT-------------AATT-GGAATGTAACACATAA-TTGGCG--GCGTTCGTAT-AAAATGCAAGTTATGCTTTTATGATAAATATATCAAACTA-TAT-ATTAT-CAATTGTTGGAAAAACGAGGATCTAAAAC--G---T-ACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TGACT-AATT--------TGGAGTTCAATGTAATATAGCA-TTGACA---GACTAAT---------TTATAC-ATATCTGCGGATAAACCAAGTT-AATCGCAATGtgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttcatgaattagagatgtacatttattttagatttaaaacattttttttcacaatatatttaattggaatgtaacacataattggcggcgttcgtataaaatgcaagttatgcttttatgataaatatatcaaactatatattatcaattgttggaaaaacgaggatctaaaacgtactgttgaaactcttttcaatcatgactaatttggagttcaatgtaatatagcattgacagactaatttatacatatctgcggataaaccaagttaatcgcaatgagag
gi|10 : gtatgcggaagctggaagctttgtagctcagtaaaagtgtaaatacctcattactcagtgtaccacacgccaaaaatatagcgcaaagaaaattccaacacatgcaaaaagttcaatatataaaaacaaatgcttaaaaacaaacttattttagttatccgaataaattattattcatttgtttgcttcaaatgtgaaaaaaatggcacgtgttttaaaaataatactgaaattactaagcaaatcaacctgtgatcgtgtattttgataggccctggaattttgattgaatggaatgcttttgtatatcggaaagcggaagtgtatttcagggtctataaattgaacagtagcagacgataactactgggtaccttgaaagctatacatgtattagtaatgttgttaataacggatcctttcccatcctttttatagtttttttaaaaactaacaacactaaatcactgtatacatatacataaaactgttccttttacaccctgctgtctgaaactacaactgtatactaaaagtgtattgatcccgttatcgcctgatagccattaaatagatattgttccaatgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttCATGC-GAAA--TT-TTGATGG-TCGGT-AGAAAA---TGTAAA-------TG---CTTTATAACTCA--GTGTACTAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGG-AAA-A-TAA-CTTCACA---------GAAGTA-CAT-------A-------ATCTTCAATGA-----ATAA-AGATAAAC----------A--------CAT-CCTATTTTAGATAACTGATTAAATTA----AGT-CATT-TGTTTGC-----TTTAGA-TGT----G---TGAAAAGC--ATG--TG-T-TGAA---TG-------TAATATA----T-----G----------T-CG----G--A---------------------A---ATTACTACGCCGGTG------AA-AC----C-----TTTG----------------ATCGTG----T----A---------------GT-----TA----------TTA--T------G-GGCCCTGGA-ATTTG------AC--CGA------------A-----TG----GA---------A---------TACTATAGT-G-----T--G-C-GTGTATTCTAAATAGAGCAA-TAATAT-GCAGACGA-Tagag
gi|11 : tttgaaatgaatgatgacaatacccattttgacagggttgtgttagcagctcaccggtgttgaGTGT--TAGTGAAGGATTCATTCCAA-TTAT-TGTAAATTGT-A--A-TAGTTAATTTAATAAGGATATATTAAAGTATAAAG--TC-TAT-AAAGGTTTATGCT--ACAG-CT-----A---------------------A----C--CA---CAAA-----TCTTATTGTGTTACC------TAGTG-CAG---TTACG-----------CAA-----------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACACT-CTGATGTGTG-TATTTCTGATACTAC-ACATTTATACTGTACGATCCAGCCAGAATGCGTATTGGTCGTTTTATTGCCTGATAGACATT-----AAATAG-----------TTGTTCCATATTTAAA-------------CGATACTTTTTCCAATATATGTTT-------------TATT-GGAAGGTACCAAATAGTTTG-CG--GCATTTGCATGAAA-TACAAGTTCTGCTTTAGTGATGGATTTACCAAATTA-TAT-Acccttgtatgtgttgaatgtaatatata
gi|12 : CATGT-GAAA--TC-T-GAAGA-ACCGT-CAAAAC---TGTATA-------TA---CCTTATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTAC-AAA-G-ACA-TTCCA-A---------AAAATA-TATATTGGTCA-------AT-----AT-------ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTAATTTAGCTTCTCGAAT-AATT-TT--TTT-TAAT-TCTTT-C-----TACAAA-TAT----G---TAAATAGC--ATC--TG-T-TGAA---TGTAA---ATAACATC----T-----GTAAAATGTATT-T-----G--AACTTACTACGC----------C---AT-----------TG------AA-AT----C-----TTAG----------------ATTGCG----T----A---C------------A-----T-----------TTA--T------G-AT---TGAA-A---G------AA-ACGACGC---T-----G-----T
gi|13 : tattctgttattttatcattagtaatatattgttttattttggtggtgggctgcctcagagttga-------ATAA-AGACAAAC------A------------CAA-CTTATTTTGTGTACCCGAATAAATT------TT-CATT-TGTGAGC-----TTCAAAATGT----T---TTAAAGGT--ATG--TG-T-TGAA---TGTAATATATATTACT----T-----GCCA-------T-T-----G--AGAA------------------T---AT-----------TG------GACATTA--C-----TTTGCCATTTAACACCTGTAACCGTG----T----G---CT----------GACAAATT-----------TTA--TTGAACTG-AA---TAAA-A---G----------CA--GG---T-----G-----TA----C--------------------TG-TAT--T-A-----T--A------TA---TAACTAGAACAG-TA-----GCAGA--------ATAC--CTTGTAATCT-GTAT--GTGTTGGCAGTGGCATATCTA--CAGT-CAT---TAAGTCACTTGTGT--TAGTGAATGATTCTTTCCCA-TTAT-TG-------C-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----
gi|14 : ataatcgcattgaattggaaGTCTGAAAGACATTTCGTGAAATAGC----T-----TTGTTTTGAATTTAAA-------------CGATACT--------------Tgt
gi|14 : cccatgagaacgggacagcaacattttcaaagctattttgacaacatattaaattaaaataaatacacttaattgcattaaaatgacagtttaaAC-TTCAAGTTGTGCCTTTATGATTGATTTACCAAATTACTAT-A--AT-CAATTGTTGTAAAAA-AATGAT--AAAAC--T---T-AATATAGAAACTGTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GAAAG----------------T-TC---A---AA-GAA-----------------ATGTTTCTTGTTAAACCAA-TTAATTTGCAATGcaagttgtgcctttatgattgatttaccaaattactataatcaattgttgtaaaaaaatgataaaacttaatatagaaactgttttcaatcattataattgaaagttcaaagaaatgtttcttgttaaaccaattaatttgcaatgagactgagatt
gi|15 : cccatgagaacgggacagcaacattttcaaagctattttgacaacatattaaattaaaataaatacacttaattgcattaaaatgacagtttaagtctgaaagacatttcgtgaaatagctttgttttgaatttaaacgatTGCTGAAT--TT-T-GAGGG-TCGGT-A---AGCTTTGTAAA-------TA---CCACATAACT-------------CACA-CC-AAAAT-ATAGTTC-AAG-C-AAATTTCCT-A---------AAAGTA-CAT-------C-------AT-----GTTCA----ATAA-AAGAAGAT------AAAGA--------CAA-CTAATTTTCGTTAACCGTATAATCTATT--AGT-TGTT-CGTAT-------TT--AC-TGT----G---AGAATAGCATATA--TG-T-TT-A---TCTGA---ATAATTTT----T-----T----------T-T-----T--T---------------------C----------------TG------AA-AT----agactgagatt
gi|16 : gcattttcaatgttacgttcgttattattttatatgtggtgggtcaccagtgcttactTTGATATTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTAGTCCTGTTATTACCTGATGGCCATT-----AATTAGA----T-A---TT-----AA--TTA----------------GATATTG-------------TTT-------------CATT-GGAACATATCGAATA------------ATTTGCA-------CCA---TTTG----TATGACGGATTTACCAAATTT-TAT-A--AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGAAACTAAAAT--C---TAACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-A-AATT--------GTGAGTTAAAAGTAATAAAACA-TT---A---TCTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATACACTAG-CT-ATTTGCAATGtaatccgccattgaagtatccataaaggttgttt
gi|17 : -T-GACGG-TCGGT-A--AAGC--TGTAAA-------TG---CCTCATAACACA--GTTTACCACCGCA-ATAAAAAT-AAATTGC-AAACG-AAC-TTCCC-A---------GAAGTA-CAT-------A-------AT-----GT-------TTA----ATAAAT------AA--A---------AA--TTATTTTACGTAACCA---AAATGATT--ATA-TGTTATGTGTACACAAATT-ACA-TGT----G---TTAATAGC--CTG--TT-T-TGAA---TGC-A---AT-ATATT----T-----ag
gi|18 : acgattatgtttaggtgggtttgataagcaatccaccagtgttgaactatgtTAT-TA-------C-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----T-G--TA-TGC-A-----------T--AAAGTCT-----A---------------------AAAAAT--CA----GAA-----T-----TCTGTTAC----------TG-TAA---TTACA-----------TAC-----------A---CACGCGTTCTC-TTTT-AC--T-CTGCTGTG----------GAGA-TGC-C-ATTTTTGC-G-ATGATCAAGCCAGAATGTGTACTGGTTCCGTTATCGCCcggaaattactacgt
gi|19 : aatttcactg---TTATTTCAAACTCAAA-------------CGATGTT--------------TTTTCTTCGATAACATCATTTGAAACGTATCGCATA--TTT-GGACGCATTTGCACGAAA-TACAAGCTGTGTTTTTattagtgtactattacagtgaccgtaactgggtcacatccttaa
gi|2 : tccatgagttttatttaaactaaaacgataaataagaataaaacgtaaaacaaagcattaaaatggtagtttttttctgaaagaaatttcatggtatatttCATGC-GAGA--TT-T-TGAGC-ATAG--ATAAAT---TGT-CA-------TAATTCCTCATAACAAA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-GAAGTGCAAAA-A-AAA-ATCCA-A---------AAAGTA-CAC-------AATGCTCTAT-----AC-------ATAA-ATACAAAT----------A--------CAA-CCTATTGTAGATAACCGAATATATTATT--AGT-CATT-TG-----------TCAAA-TGT----T---TGAAAAGC--ATGAATG-T-AAAACATTGTAT---A-AAAATT----T-----GGAAA------T-T-----ACTA---------------------CGCTAT-----------T-------AA-AC----C-----TGTG----------------GTCGTG----G----G---CTCTGG------GA-----T-----------TTGTCT------G-AG---TAAA-T---ATTATCCATTACAATG----T-----G-----TC----GGAAAGCGCGAA---------TG-TAT--T-T-----TA-T-G-GTCTA---TACATCGAATAG-CAAATATGCAGGC-A-TGAAA-----CTT------TTGTATACCTTTTA----------ATCT-----ATTCATGTATAAGTAA-TATTGT--TAGTGTAGGATTATCTCCTATTTAC-T--------C-A--T-TAGTT-------------TAA-ATGAA-----AAGTTCATTAT-A-----------T--ATAGTCT------------------------------------A---TGA-------------GCGT--CA------GAATG-CAA---TAA-G-----------CAT-----------A---CATG
gi|2 : tttacaaatatgttttttattggtgggttgcgttactcaacagtgttga-----AAC--CA-TATCA-----------T--TTAATCA-----A---------------------A----CAATA---TAAA-----T-----GGTAT---A------TACTG-CAA---TAACA-----------CAA-----------A---CACGCTTAT-T-TTTT------------GTG-A-TATTTCTGATACTAC----TTTACACT-TGTTATCCGGCCAGAATATGTATTTGTCCCGTTGATGTATGATAATCATT-----AATATGA----TAA---TTATTaacaacaagtaaccatatcatttaatcaaacaatataaatggtatatactgcaataacacaaacacgcttattttttgtgatatttctgatactactttacacttgttatccggccagaatatgtatttgtcccgttgatgtatgataatcattaatatgataattattatttttcccataatgacgggaaagtttcagtttgacttatcacattaaagaaatagttcgatacattgtaagtatattagagcattgcaatgtgtgtctaaaataaatttcatgaaatgtttcatttcaaattagttgcaattgttgtgaaaagggaatgatactcctttttaaatcattttacttggagttatgaattacgaaatcattgatttcatgtgtattatgtctctaggtaaaccattcattagcaatga
gi|2 : tttacaaatatgttttttattggtgggttgcgttactcaacagtgttgacatgcgagattttgagcatagataaattgtcataattcctcataacaaagtgtaccaacacaccaaaaatgaagtgcaaaaaaaaatccaaaaagtacacaatgctctatacataaatacaaatacaacctattgtagataaccgaatatattattagtcatttgtcaaatgtttgaaaagcatgaatgtaaaacattgtataaaaatttggaaattactacgctattaaacctgtggtcgtgggctctgggatttgtctgagtaaatattatccattacaatgtgtcggaaagcgcgaatgtattttatggtctatacatcgaatagcaaatatgcaggcatgaaacttttgtataccttttaatctattcatgtataagtaatattgttagtgtaggattatctcctatttactcattagtttaaatgaaaagttcattatatatagtctatgagcgtcagaatgcaataagcatacatgaacaacaagtATTT--CAAATTA-GTT-G-----CAATTGTTGTGAAAA-GGGAATGATA-----C---T-CCTTTTTAAA-TCATTTTACTTGGAGTTA-TGAATT--------ACGAA----------------A-TC---ATTGATTTCAT---------GTGTATTATGTCTCTAGGTAAACCAT-TC-ATTAGCAATGatttttcccataatgacgggaaagtttcagtttgacttatcacattaaagaaatagttcgatacattgtaagtatattagagcattgcaatgtgtgtctaaaataaatttcatgaaatgtttcatttcaaattagttgcaattgttgtgaaaagggaatgatactcctttttaaatcattttacttggagttatgaattacgaaatcattgatttcatgtgtattatgtctctaggtaaaccattcattagcaatga
gi|3 : tttacaaatatgttttttattggtgggttgcgttactcaacagtgttgacatgcgagattttgagcatagataaattgtcataattcctcataacaaagtgtaccaacacaccaaaaatgaagtgcaaaaaaaaatccaaaaagtacacaatgctctatacataaatacaaatacaacctattgtagataaccgaatatattattagtcatttgtcaaatgtttgaaaagcatgaatgtaaaacattgtataaaaatttggaaattactacgctattaaacctgtggtcgtgggctctgggatttgtctgagtaaatattatccattacaatgtgtcggaaagcgcgaatgtattttatggtctatacatcgaatagcaaatatgcaggcatgaaacttttgtataccttttaatctattcatgtataagtaatattgttagtgtaggattatctcctatttactcattagtttaaatgaaaagttcattatatatagtctatgagcgtcagaatgcaataagcatacatgaacaacaagtaaccatatcatttaatcaaacaatataaatggtatatactgcaataacacaaacacgcttattttttgtgatatttctgatactactttacacttgttatccggccagaatatgtatttgtcccgttgatgtatgataatcattaatatgataattattatttttcccataatgacgggaaagtttcagtttgacttatcacattaaagaaatagttcgatacattgtaagtatattagagcattgcaatgtgtgtctaaaataaatttcatgaaatgtttc-GAAGC-TCGCT-AAAACG---TGTACA-------TA---CCTCATAACTCAAAGTGTACAAACACA-ATAAAAAC-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTTAA-AT--------AAAGTA-C-----------------AG-----AT-------ATAA-AGAAAGAA------AC--A--------CAA-CTTAATTTATGTACCTGAATATATGTTTAAATTACATG-TG-TTG---------AAA-TGTGATCG---TGAATa
gi|3 : acacttattttacggtttgagttattgcacgcttgtgttagtgggttgcgtaagtggtgtatgttaagattaA-TGT----ACC-TGAATA-----TA--TG-T-T--------TAA---ATTACATG----T-----G----------T-T-----G--A-----------------------------------------------A-AT----G-----T--G----------------ATCGTG--------------------------A-------------------A--T------G-AA---TGAA-A----------AGTA---------------------TA----G--------------------TG-TAT--C-GGAAAGC--A-A-GTCTA---TAAACTGCACAA-TT-----GCGAATGA-TAAAATAATGCTTA----Cgaatgaaaagtatagtgtatcggaaagcaagtctataaactgcacaattgcgaatgataaaataatgcttacgctctgatcgttttaaaaatataatttctcattttataatttagtttatttaaaaaggatatattaatataaatagtctacaaatgtcaagttcaacaccatattatgtgctgcactctcttcttttacaccctgctgtgtgatatttctgatactataatttatacctatgatccagcaagaataaatattggtaccgctgtcgccatttagttattaatccatgataacgggacaggctctctaattccttgattttgacatttaagattaataaaaacagcttcaattcattacattaaaattacatgtaaagcttttgttagaaaaagatttcatgatgtttatccataatgtttttatttcgatcgtatcaagtaattggcgacactagtatgagatacgagagattaccaaattatatataaacacttgttgtaaaaaagacgataaaaaacatcaagtactattgaaattattttcactcattatgattagggaggggcgggatttaaagtaataaagcataagagtatatgtctctggtaaaccgattatttgcaatgagagcaaga
gi|3 : acacttattttacggtttgagttattgcacgcttgtgttagtgggttgcgtaagtggtgtatgttaagattagaagctcgctaaaacgtgtacatacctcataactcaaagtgtacaaacacaataaaaacatagtgcaaagaaatttaaataaagtacagatataaagaaagaaacacaacttaatttTTTCTCA-TTTT-A--------T-AATT-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--GA-TAT-A-----------T--------T-----A---------------------A----T---A---TAAA-----T-----AGT-CTACA-------AATGTCAAGTTCAACA-----------CCATATTATGTGCTG---CACTCTCTT-C-TTTT-ACACC-CTGCTGTGTGATATTTCTGATACTAT-A-ATTTATACC-TATGATCCAGCAAGAATAAATATTGGTACCGCTGTCGCCATTTAGTTATT-----AATgctctgatcgttttaaaaatataatttctcattttataatttagtttatttaaaaaggatatattaatataaatagtctacaaatgtcaagttcaacaccatattatgtgctgcactctcttcttttacaccctgctgtgtgatatttctgatactataatttatacctatgatccagcaagaataaatattggtaccgctgtcgccatttagttattaatccatgataacgggacaggctctctaattccttgattttgacatttaagattaataaaaacagcttcaattcattacattaaaattacatgtaaagcttttgttagaaaaagatttcatgatgtttatccataatgtttttatttcgatcgtatcaagtaattggcgacactagtatgagatacgagagattaccaaattatatataaacacttgttgtaaaaaagacgataaaaaacatcaagtactattgaaattattttcactcattatgattagggaggggcgggatttaaagtaataaagcataagagtatatgtctctggtaaaccgattatttgcaatgagagcaaga
gi|3 : acacttattttacggtttgagttattgcacgcttgtgttagtgggttgcgtaagtggtgtatgttaagattagaagctcgctaaaacgtgtacatacctcataactcaaagtgtacaaacacaataaaaacatagtgcaaagaaatttaaataaagtacagatataaagaaagaaacacaacttaatttatgtacctgaatatatgtttaaattacatgtgttgaaatgtgatcgtgaatgaatgaaaagtatagtgtatcggaaagcaagtctataaactgcacaattgcgaatgataaaataatgcttacgctctgatcgttttaaaaatataaTACGAGAGATT-ACCAAATTA-TAT-AT-AAACACTTGTTGTAAAAAAGACGATAAAAAACATCAAGT-ACTATTGAAATTATTTTCACTCA---TTA-T-GATTAGGGAGGGGCGGG----------------ATTT---A---AAGTAATAAAGCATAAGAGTAT-ATGTCTCTGG-TAAACCGA-TT-ATTTGCAATGccatgataacgggacaggctctctaattccttgattttgacatttaagattaataaaaacagcttcaattcattacattaaaattacatgtaaagcttttgttagaaaaagatttcatgatgtttatccataatgtttttatttcgatcgtatcaagtaattggcgacactagtatgagatacgagagattaccaaattatatataaacacttgttgtaaaaaagacgataaaaaacatcaagtactattgaaattattttcactcattatgattagggaggggcgggatttaaagtaataaagcataagagtatatgtctctggtaaaccgattatttgcaatgagagcaaga
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gi|1 : gtatgcggaagctggaagcCATG-----AATTAGAGATGT-ACATTTATTTTAGATTTAAAACATTTTTTTTCACAATATA--------------TTT-------------AATT-G-GAATGTAACACATAA-TTGGCG--GCGTTCGTATAA-AATGCAAGTTATGCTTTTATGATAAATATATCAAACTA-TATATTAT-CAATTGTTGGAAAAACGAGGATCTAAAAC--G---T-ACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TGACT-AATT--------TGGAGTTCAATGTAATATAGCA-TTGACA---GACTAAT---------TTATAC-ATATCTGCGGATAAACCAAGTT-AATCGCAATGtgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttcatgaattagagatgtacatttattttagatttaaaacattttttttcacaatatatttaattggaatgtaacacataattggcggcgttcgtataaaatgcaagttatgcttttatgataaatatatcaaactatatattatcaattgttggaaaaacgaggatctaaaacgtactgttgaaactcttttcaatcatgactaatttggagttcaatgtaatatagcattgacagactaatttatacatatctgcggataaaccaagttaatcgcaatgagag
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lowQualScore : 6 3 66 7 0 22222 0 8888888 888 66 3 3 3 3 7 7 3 777777777 3 8888888888888888888888888888888888 1 2 6666666666666666666 3 0 5 0 7 1 1 77777 8 1 555 7 6 22 22 2 33 444 55555555 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 66 9999 6 000 555 0 55555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 0 11 1 0 6 2222222222 00 0 0000000000000 0 11111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 8 77777777 9 11111111111111111111111111111 66 000 1 0 4 0 888 9 7777 0 77 1 9 00000 7777777777 4 7 4444444444444 2222222222222222222222222222222 7 7 7 4 4 333333333333 0 1 22 0 2 0 7 0 0 2 7 99999 3 22 333333 7 3 0 777 000 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 7 7
consensus : CATGCGAGATT-T-GAAGN-TCGGT-A-AAA-G---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----A-------T---ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATTATTCGTT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGTG---TGAATAGC--ATG--TG-T--TGAA---TG--TAA---ATAATA----T-NT-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------GAA---TGA-AA---GA--------CACGACGCT-----G-----TA----GG---------A---------TG---------------------TAT--T-GTA-G-GTCTA---TAAAT--AGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AAAATACT-CT-TA--C-T--GTATCTGTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A-----C--CA---TAAA-----C-----TGTGTTACA------TAGTGCAATAACG-----------CA--A------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACA-A-TTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-G-GAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCATGA-AATNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TATA-TAT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
Reference ( family-1274 ) : CATGCGAGATT-T-GAAGN-TCGGT-A-AAA-G---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----A-------T---ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATTATTCGTT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGTG---TGAATAGC--ATG--TG-T--TGAA---TG--TAA---ATAATA----T-NT-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------GAA---TGA-AA---GA--------CACGACGCT-----G-----TA----GG---------A---------TG---------------------TAT--T-GTA-G-GTCTA---TAAAT--AGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AAAATACT-CT-TA--C-T--GTATCTGTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A-----C--CA---TAAA-----C-----TGTGTTACA------TAGTGCAATAACG-----------CA--A------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACA-A-TTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-G-GAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCATGA-AATNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TATA-TAT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
gi|1 : AGCTT-T-GTAGC-TCAGT-A-AAA-G---TGTAAA-------TA---CCTCATTACTCA--GTGTACCA-CACG-CCAAAAAT-ATAGCGC-AAA-G-AAAATTCCA-ACACATGCAAAAAGTT-CA----------------AT-----A-------T---ATAA-AAACAAATGCTTAAAA--A--------CAAACTTATTTTAGTTATCCGAATAAATTATTATTCATT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGTGAAAAAAATGGC--ACG--TGTT--TTAA--------AA---ATAATA------------------------C-T-----G--A---------------------A---AT-----------TACTAAGCAA-ATCAACCTGTG----------------ATCGTG----T----ATTTT-----------GA-----TAGGCCCTGGAATTT--T------GAT---TGA-AT---GG--------AATGCTTTT-----G-----TATATCGG---------AAAGCGGAAGTG---------------------TAT--T-TCAGG-GTCTA---TAAAT--TGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AA--------C-TA--C-TGGGTACC--TTG----------A--AAGCT-ATACATGTATTAGTAA-TGTTGT--TAATAACGGATCCTTTCCCA-TCCT-T--------T-T--TATAGTT-------------TTT-TTAAA-----AAC--TA--A--------C-A--------------ACA--CT-----A---------------------A---------A---T-CA-----C-----TGTA-TACA------TA-TAC-ATA---------------A--A------A---C-TG--TTC-C-TTTT-ACACC-CTGCTG---------TCTGAAACTACA--------ACTGTAT------ACTAAAA-GTGTATTGATCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AAATAGA----T-A---TTGTTCCAA
gi|1 : gtatgcggaagctggaCATG-----AATTAGAGATGT-ACATTTATTTTAGATTTAAAACATTTTTTTTCACAATATA--------------TTT-------------AATT-G-GAATGTAACACATAA-TTGGCG--GCGTTCGTATAA-AATGCAAGTTATGCTTTTATGATAAATATATCAAACTA-TATATTAT-CAATTGTTGGAAAAACGAGGATCTAAAAC--G---T-ACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TGACT-AATT--------TGGAGTTCAATGTAATATAGCA-TTGACA---GACTAAT---------TTATAC-ATATCTGCGGATAAACCAAGTT-AATCGCAATGtgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttcatgaattagagatgtacatttattttagatttaaaacattttttttcacaatatatttaattggaatgtaacacataattggcggcgttcgtataaaatgcaagttatgcttttatgataaatatatcaaactatatattatcaattgttggaaaaacgaggatctaaaacgtactgttgaaactcttttcaatcatgactaatttggagttcaatgtaatatagcattgacagactaatttatacatatctgcggataaaccaagttaatcgcaatgagag
gi|10 : gtatgcggaagctggaagctttgtagctcagtaaaagtgtaaatacctcattactcagtgtaccacacgccaaaaatatagcgcaaagaaaattccaacacatgcaaaaagttcaatatataaaaacaaatgcttaaaaacaaacttattttagttatccgaataaattattattcatttgtttgcttcaaatgtgaaaaaaatggcacgtgttttaaaaataatactgaaattactaagcaaatcaacctgtgatcgtgtattttgataggccctggaattttgattgaatggaatgcttttgtatatcggaaagcggaagtgtatttcagggtctataaattgaacagtagcagacgataactactgggtaccttgaaagctatacatgtattagtaatgttgttaataacggatcctttcccatcctttttatagtttttttaaaaactaacaacactaaatcactgtatacatatacataaaactgttccttttacaccctgctgtctgaaactacaactgtatactaaaagtgtattgatcccgttatcgcctgatagccattaaatagatattgttccaatgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttCATGCGAAATT-TTGATGG-TCGGT-AGAAA-A---TGTAAA-------TG---CTTTATAACTCA--GTGTACTAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGG-AAA-A-TAA-CTTCACA---------GAAGTA-CAT-------A-------ATCTTCAA-------TGA-ATAA-AGATAAAC----------A--------CAT-CCTATTTTAGATAACTGATTAAATTA--AGTCATT-TGTTTGC-----TTTAGA-TGTG---TGAAAAGC--ATG--TG-T--TGAA---TG---------TAATA----T-AT-----G----------T-CG----G--A---------------------A---ATTACTACGCCGGTG------AA-AC----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---------------GT-----TA----------TTA--T------GGGCCCTGG-AATTTGA--------C-CGA---------A-----TG----GA---------A---------TAC--------------------TATAGT-GTG-C-GTGTATTCTAAAT--AGAGCAA-TAATAT-GCAGACGA-T-------CC-CT-------T--GTATGTGTTG----------Aagag
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gi|14 : ataatcgcattgaattggaaGTCTGAAAGACATTTCGTGAAATAGC----T-----TTGTTTTGAATTTAAA-------------CGATACT--------------Tgt
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gi|15 : cccatgagaacgggacagcaacattttcaaagctattttgacaacatattaaattaaaataaatacacttaattgcattaaaatgacagtttaagtctgaaagacatttcgtgaaatagctttgttttgaTT-T-GAGGG-TCGGT-A-A---GCTTTGTAAA-------TA---CCACATAACT-------------CACA-CC-AAAAT-ATAGTTC-AAG-C-AAATTTCCT-A---------AAAGTA-CAT-------C-------AT-----G-------TTCAATAA-AAGAAGAT------AAAGA--------CAA-CTAATTTTCGTTAACCGTATAATCTATTAGTTGTT-CGTAT-------TT--AC-TGTG---AGAATAGCATATA--TG-T--TT-A---TC--TGA---ATAATT----T-TT-----T----------T-T-----T--T---------------------C----------------TG------AA-AT----agactgagatt
gi|16 : gcattttcaatgttacgttcgttattattttatatgtggtgggtcaccagtgcttacttgctgaat-TTGATATTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTAGTCCTGTTATTACCTGATGGCCATT-----AATTAGA----T-A---TT-----AA--TTA----------------GATATTG-------------TTT-------------CATT-G-GAACATATCGAATA------------ATTTGCA-------CCA---TTTG----TATGACGGATTTACCAAATTT-TATA--AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGAAACTAAAAT--C---TAACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-A-AATT--------GTGAGTTAAAAGTAATAAAACA-TT---A---TCTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATACACTAG-CT-ATTTGCAATGtaatccgccattgaagtatccataaaggttgttt
gi|17 : T-T-GACGG-TCGGT-A-AAG-C---TGTAAA-------TG---CCTCATAACACA--GTTTACCACCGCA-ATAAAAAT-AAATTGC-AAACG-AAC-TTCCC-A---------GAAGTA-CAT-------A-------AT-----G-------T---TTA----ATAAAT------AA--A---------AA--TTATTTTACGTAACCA---AAATGATTATATGTTATGTGTACACAAATT-ACA-TGTG---TTAATAGC--CTG--TT-T--TGAA---TG--C-A---AT-ATA----T-TT-----ag
gi|18 : acgattatgtttaggtgggtttgataagcaatccaccagtgttgaactatgTAT-TA-------C-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----T-G--TA-TG--------C-A-----------T--AAAGTCT-----A---------------------AAAAA-T--CA----GAA-----T-----TCTGTTAC----------TGTAATTACA-----------TA--C------A---CACGCGTTCTC-TTTT-AC--T-CTGCTGTG----------GAGA-TGCC-A-TTTTTGC-G-ATGATCAAGCCAGAATGTGTACTGGTTCCGTTATCGCCcggaaattactacgt
gi|19 : aatttcactg---TTATTTCAAACTCAAA-------------CGATGTT--------------TTTTCTTCGATAACATCATTTG-AAACGTATCGCATA--TTT-GGACGCATTTGCACGA-AATACAAGCTGTGTTTTTattagtgtactattacagtgaccgtaactgggtcacatccttaa
gi|2 : tccatgagttttatttaaactaaaacgataaataagaataaaacgtaaaacaaagcattaaaatggtagtttttttctgaaagaaatttcatggtatatttCATGCGAGATT-T-TGAGCATAGAT-A-AA--T---TGT-CA-------TAATTCCTCATAACAAA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-GAAGTGCAAAA-A-AAA-ATCCA-A---------AAAGTA-CAC-------AATGCTCTAT-----A-------C---ATAA-ATACAAAT----------A--------CAA-CCTATTGTAGATAACCGAATATATTATTAGTCATT-TG-----------TCAAA-TGTT---TGAAAAGC--ATGAATG-T--AAAACATTG--TAT---A-AAAA----T-TT-----GGAAA------T-T-----ACTA---------------------CGCTAT-----------T-------AA-AC----CTGTG----------------GTCGTG----G----G---CTCTGG------GA-----T-----------TTGTCT------GAG---T-A-AA---TATTATCCATTACAATG-T-----G-----TC----GGAAAGCGCGAA---------TG---------------------TAT--T-TTATG-GTCTA---TACAT--CGAATAG-CAAATATGCAGGC-A-T-GAA--ACT-TT-TG----T--ATACCTTTTA----------ATCT-----ATTCATGTATAAGTAA-TATTGT--TAGTGTAGGATTATCTCCTATTTAC-T--------C-A--T-TAGTT-------------TAA-ATGAA-----AAGTTCATTA--------T-A-----------T--ATAGTCT-------------------------------------A---TGAG-----C------GT----CA------GAATGCAATAA-G-----------CA--T------A---CATG
gi|2 : tttacaaatatgttttttattggtgggttgcgttactcaacagtgttga-----AAC--CA-TA--------TCA-----------T--TTAATCA-----A---------------------A-----CAATA---TAAA-------------TGGTATA------TACTGCAATAACA-----------CA--A------A---CACGCTTAT-T-TTTT------------GTG-A-TATTTCTGATACTAC----TTTACACT-TGTTATCCGGCCAGAATATGTATTTGTCCCGTTGATGTATGATAATCATT-----AATATGA----TAA---TTATTaacaacaagtaaccatatcatttaatcaaacaatataaatggtatatactgcaataacacaaacacgcttattttttgtgatatttctgatactactttacacttgttatccggccagaatatgtatttgtcccgttgatgtatgataatcattaatatgataattattatttttcccataatgacgggaaagtttcagtttgacttatcacattaaagaaatagttcgatacattgtaagtatattagagcattgcaatgtgtgtctaaaataaatttcatgaaatgtttcatttcaaattagttgcaattgttgtgaaaagggaatgatactcctttttaaatcattttacttggagttatgaattacgaaatcattgatttcatgtgtattatgtctctaggtaaaccattcattagcaatga
gi|2 : tttacaaatatgttttttattggtgggttgcgttactcaacagtgttgacatgcgagattttgagcatagataaattgtcataattcctcataacaaagtgtaccaacacaccaaaaatgaagtgcaaaaaaaaatccaaaaagtacacaatgctctatacataaatacaaatacaacctattgtagataaccgaatatattattagtcatttgtcaaatgtttgaaaagcatgaatgtaaaacattgtataaaaatttggaaattactacgctattaaacctgtggtcgtgggctctgggatttgtctgagtaaatattatccattacaatgtgtcggaaagcgcgaatgtattttatggtctatacatcgaatagcaaatatgcaggcatgaaacttttgtataccttttaatctattcatgtataagtaatattgttagtgtaggattatctcctatttactcattagtttaaatgaaaagttcattatatatagtctatgagcgtcagaatgcaataagcatacatgaacaacaagtATTT--CAAATTA-GTTG-----CAATTGTTGTGAAAA-GGGAATGATA-----C---T-CCTTTTTAAA-TCATTTTACTTGGAGTTA-TGAATT--------ACGAA----------------A-TC---ATTGATTTCAT---------GTGTATTATGTCTCTAGGTAAACCAT-TC-ATTAGCAATGatttttcccataatgacgggaaagtttcagtttgacttatcacattaaagaaatagttcgatacattgtaagtatattagagcattgcaatgtgtgtctaaaataaatttcatgaaatgtttcatttcaaattagttgcaattgttgtgaaaagggaatgatactcctttttaaatcattttacttggagttatgaattacgaaatcattgatttcatgtgtattatgtctctaggtaaaccattcattagcaatga
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Reference ( family-1274 ) : CATGCGAGATT-T-GAAGN-TCGGT-A-AAA-G---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A---------AAAGTA-CAT-------A-------AT-----A-------T---ATAA-AGACAAAT------AA--A--------CAA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATTATTCGTT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGTG---TGAATAGC--ATG--TG-T--TGAA---TG--TAA---ATAATA----T-NT-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------GAA---TGA-AA---GA--------CACGACGCT-----G-----TA----GG---------A---------TG---------------------TAT--T-GTA-G-GTCTA---TAAAT--AGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AAAATACT-CT-TA--C-T--GTATCTGTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A-----C--CA---TAAA-----C-----TGTGTTACA------TAGTGCAATAACG-----------CA--A------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACA-A-TTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-G-GAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCATGA-AATNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TATA-TAT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
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gi|7 : tttcatacgatgatgcggatgcaaaaatacacaaaaagttatcgaatctgggaaaatcaattttttggtgggttgcgttaaccggtgttgctatgtgagattatgaaggtcgatacaattgtaaaatcctcataactcgttgtaccaacacactaaaaatatagtgcaaagaaaattccaaaaaagagcacaatgtttaatcaataaattaatattgtatcatagtgacgtgtgcataacatacatgacagtgtaaagatactatataaagacaagatacgg-T-GAGAC-TTTGT-A-AAA-G---TGTACA-------AA---CCTCATAACTCG--GTGTATTGACACA-CCAAAGAT-ATAGTGC-AAA-GAAAA-TACCA-A---------AAAGTA-CAT-------AATGTTCGAT-----A-------T---ATAA-AAAAAAAC----------A--------CAA-CTTATTT--AGTATCTGAATAAATTATTAGTCATC-TGTTTGC-----TTTAAA-TGTA---CGAATAGT--ATG--TGTT--TCAA---TG--TAT---A-AATA----T-AT-----T----------T-C-----G--AAATCACTACGC----------C---AT-----------TG------GA-AG----ATGTG----------------ATAGTGAATTT----A---TGATTGGCCTTGGA-----T-----------TTAATT------GAA---TGA-AA---GA--------CTCGACACT-----GGGATTTATC--GG---------A---------AG---------------------TAT--T-GTA-G-GTGTA---TAAAT--AGAACAG-CA-----GCAGTCGAGTAAAAATAAA-CTATA--CAT--GTATttatacttatagattttaaaagtcagcatttaat
gi|8 : aatattatgttgtacttattactattatatgtattagtattatcattattgtcattatttattattatttaaatcattattattctattttgtgtgtcatcatcattatttatatcatcatttttggtggtttccgttagcaactcaccggtgttaacacgCATGCTAGATT-TTGAGGG-TCGGT-AGAAA-A---TGTAAAAACAATGTA---CCGCATAACTCA--GTAAACCAACACA-CCAAAATTTATAGTGC-AAC-A-AAC-TTCCC-A---------GAAGTA-CAT-------G-------AT-----G-------T---TCAATAAATAAAT------AA--AGCTGAACTCAA-CTTGTTTTAGGTAACCGAATACATTATTAGTAATT-ATTTTGC-----TGTACA-TGTG---TGAATATC--ATA--TT-TC-CGAA---TG--T-A---AT-ATA----T-TTCTAAAA----------T-TACTACG--C---------------------C---AT-----------TG------AA-AC----C---G----------------GT--TA----T----T---C-----------G-------------------CC--T------GAA---TCA-AA---GA--------CCTGACACT-----A-----TG----CG---------A---------TGAATTGGGAAGCGGCGGGAGTGTAT--T-CTA-GTGTCTA---TAAAT--AGAACTGTTATTT--GCAGACAA-C-AAAA-------------------ATCTGCTG----------ACC-----------------AGTAA-ACGTGA--TAGCCAAAGATCCTTTCCTG-TTAT-T--------T-A--a
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lowQualScore : . . .. . . ..... . ....... ... .. . . . . . . . . . ..... . . . .......... .. . . . . . . . ..... . . ... . . .. .. . .. . ... ........ . ............................................................................................................................................................................................................................................................................. .. .. .... . ... ... . ..... ........................................................ . . .. . . . .......... .. . ............. . ..... ................................................................................................ . ........ . ............................. .. ... . . . . ... . .... . .. . . ..... .......... . . ............. ............................... . . . . . ............ . . .. . . . . . . . . ..... . .. ...... . . . ... ... ........................................................ . . . .
lowQualScore : 6 3 66 7 0 22222 0 8888888 888 66 3 3 3 3 7 7 3 3 3 77777 5 8 1 8888888888 66 3 0 5 0 7 1 1 77777 8 1 555 7 6 22 22 2 22 1 444 77777777 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 66 9999 6 000 555 0 55555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 0 11 1 0 6 2222222222 00 0 0000000000000 0 11111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 8 77777777 9 11111111111111111111111111111 66 000 1 0 4 0 888 9 7777 0 77 1 9 00000 7777777777 4 7 4444444444444 2222222222222222222222222222222 7 7 7 4 4 333333333333 0 1 22 0 2 0 7 0 0 2 7 99999 3 22 333333 7 3 0 777 333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 7 7
consensus : CATGCGAGATT-T-GAAGN-TCGGT-A-AAA-G---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A-AAAGTA-CATAAT-G-T-CAATATATAAAGACAAAT------AA--AC--AA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATTATTCGTT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGTG---TGAATAGC--ATG--TG-T--T-GAA---TG--TAA---ATAATA----T-NT-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------GAA---TGA-AA---GA--------CACGACGCT-----G-----TA----GG---------A---------TG---------------------TAT--T-GTA-G-GTCTA---TAAAT--AGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AAAATACT-CT-TA--C-T--GTATCTGTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A-----C--CA---TAAA-----C-----TGTGTTACA------TAGTGCAATAACG-----------CA--A------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACA-A-TTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-G-GAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCATGA-AATNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TATA-TAT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-T-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
Reference ( family-1274 ) : CATGCGAGATT-T-GAAGN-TCGGT-A-AAA-G---TGTANA-------TA---CCTCATAACTCA--GTGTACCAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGC-AAA-G-AAA-TTCCA-A-AAAGTA-CATAAT-G-T-CAATATATAAAGACAAAT------AA--AC--AA-CTTATTTTAGGTANCCGAATAAATTATTATTCGTT-TGTTTGC-----TTCAAA-TGTG---TGAATAGC--ATG--TG-T--T-GAA---TG--TAA---ATAATA----T-NT-----G----------T-T-----G--A---------------------C---AT-----------TG------AA-AT----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---C-----------GA-----T-----------TTA--T------GAA---TGA-AA---GA--------CACGACGCT-----G-----TA----GG---------A---------TG---------------------TAT--T-GTA-G-GTCTA---TAAAT--AGAACAG-TA-----GCAGACGA-T-AAAATACT-CT-TA--C-T--GTATCTGTTG----------ATCTAGCCAATACATGTATAAGTAA-TAGTGT--TAGTGAAGGATCCTTTCCCA-TTAT-T--------T-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----AAG--NA-TA--------T-A-----------T--ACAGTCT-----A---------------------A-----C--CA---TAAA-----C-----TGTGTTACA------TAGTGCAATAACG-----------CA--A------A---CACGCTTTC-C-TCTT-ACGCC-CTGCTGTGTG-TATTTCTGATACTACA-A-TTTATACTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTGGTCCCGTTATCGCCTGATAGCCATT-----AATTAGA----T-A---TTGTTCCAAATTTAAA-------------CGATACT--------------TTT-------------CATT-G-GAACGTACCGAATA--TTG-CG--GCATTTGCATGA-AATNCAAGTTNTGCTTTTATGACGGATTTACCAAATTA-TATA-TAT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGGATNAAAAAC--C---T-ACTATTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-N-AATT--------GCGAG----------------A-TT---A---ANTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATAAACCAA-TT-ATTTGCAATG
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gi|1 : gtatgcggaagctggaCATG-----AATTAGAGATGT-ACATTTATTTTAGATTTAAAACATTTTTTTTCACAATATA--------------TTT-------------AATT-G-GAATGTAACACATAA-TTGGCG--GCGTTCGTATAA-AATGCAAGTTATGCTTTTATGATAAATATATCAAACTA-TATATTAT-CAATTGTTGGAAAAACGAGGATCTAAAAC--G---T-ACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TGACT-AATT--------TGGAGTTCAATGTAATATAGCA-TTGACA---GACTAAT---------TTATAC-ATATCTGCGGATAAACCAAGTT-AATCGCAATGtgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttcatgaattagagatgtacatttattttagatttaaaacattttttttcacaatatatttaattggaatgtaacacataattggcggcgttcgtataaaatgcaagttatgcttttatgataaatatatcaaactatatattatcaattgttggaaaaacgaggatctaaaacgtactgttgaaactcttttcaatcatgactaatttggagttcaatgtaatatagcattgacagactaatttatacatatctgcggataaaccaagttaatcgcaatgagag
gi|10 : gtatgcggaagctggaagctttgtagctcagtaaaagtgtaaatacctcattactcagtgtaccacacgccaaaaatatagcgcaaagaaaattccaacacatgcaaaaagttcaatatataaaaacaaatgcttaaaaacaaacttattttagttatccgaataaattattattcatttgtttgcttcaaatgtgaaaaaaatggcacgtgttttaaaaataatactgaaattactaagcaaatcaacctgtgatcgtgtattttgataggccctggaattttgattgaatggaatgcttttgtatatcggaaagcggaagtgtatttcagggtctataaattgaacagtagcagacgataactactgggtaccttgaaagctatacatgtattagtaatgttgttaataacggatcctttcccatcctttttatagtttttttaaaaactaacaacactaaatcactgtatacatatacataaaactgttccttttacaccctgctgtctgaaactacaactgtatactaaaagtgtattgatcccgttatcgcctgatagccattaaatagatattgttccaatgatattttactgaagtatataacaataaaacagctttaataaattgtaaatttataagagcattaaactttaatttgtctgaaagaaatttCATGCGAAATT-TTGATGG-TCGGT-AGAAA-A---TGTAAA-------TG---CTTTATAACTCA--GTGTACTAACACA-CCAAAAAT-ATAGTGG-AAA-A-TAA-CTTCACA-GAAGTA-CATAATCT-T-CAATGAATAAAGATAAAC----------AC--AT-CCTATTTTAGATAACTGATTAAATTA--AGTCATT-TGTTTGC-----TTTAGA-TGTG---TGAAAAGC--ATG--TG-T--T-GAA---TG---------TAATA----T-AT-----G----------T-CG----G--A---------------------A---ATTACTACGCCGGTG------AA-AC----CTTTG----------------ATCGTG----T----A---------------GT-----TA----------TTA--T------GGGCCCTGG-AATTTGA--------C-CGA---------A-----TG----GA---------A---------TAC--------------------TATAGT-GTG-C-GTGTATTCTAAAT--AGAGCAA-TAATAT-GCAGACGA-T-------CC-CT-------T--GTATGTGTTG----------Aagag
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gi|14 : ataatcgcattgaattggaaGTCTGAAAGACATTTCGTGAAATAGC----T-----TTGTTTTGAATTTAAA-------------CGATACT--------------Tgt
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gi|15 : cccatgagaacgggacagcaacattttcaaagctattttgacaacatattaaattaaaataaatacacttaattgcattaaaatgacagtttaagtctgaaagacatttcgtgaaatagctttgttttgaTT-T-GAGGG-TCGGT-A-A---GCTTTGTAAA-------TA---CCACATAACT-------------CACA-CC-AAAAT-ATAGTTC-AAG-C-AAATTTCCT-A-AAAGTA-CATCAT-GTT-CAATA---AAAGA-AGAT------AAAGAC--AA-CTAATTTTCGTTAACCGTATAATCTATTAGTTGTT-CGTAT-------TT--AC-TGTG---AGAATAGCATATA--TG-T--T-T-A---TC--TGA---ATAATT----T-TT-----T----------T-T-----T--T---------------------C----------------TG------AA-AT----agactgagatt
gi|16 : gcattttcaatgttacgttcgttattattttatatgtggtgggtcaccagtgcttacttgctgaat-TTGATATTGTATGATCCAGCCAGAATGTGTATTAGTCCTGTTATTACCTGATGGCCATT-----AATTAGA----T-A---TT-----AA--TTA----------------GATATTG-------------TTT-------------CATT-G-GAACATATCGAATA------------ATTTGCA-------CCA---TTTG----TATGACGGATTTACCAAATTT-TATA--AT-CAATTGTTGTAAAAA-GAGAAACTAAAAT--C---TAACTGTTGAAACTCTTTTCAATCA---TTA-A-AATT--------GTGAGTTAAAAGTAATAAAACA-TT---A---TCTTAAT---------GTGTAT-ATGTCTCTGGATACACTAG-CT-ATTTGCAATGtaatccgccattgaagtatccataaaggttgttt
gi|17 : T-T-GACGG-TCGGT-A-AAG-C---TGTAAA-------TG---CCTCATAACACA--GTTTACCACCGCA-ATAAAAAT-AAATTGC-AAACG-AAC-TTCCC-A-GAAGTA-CATAAT-G-T-T------TAA---TAAAT------AA--A---AA--TTATTTTACGTAACCA---AAATGATTATATGTTATGTGTACACAAATT-ACA-TGTG---TTAATAGC--CTG--TT-T--T-GAA---TG--C-A---AT-ATA----T-TT-----ag
gi|18 : acgattatgtttaggtgggtttgataagcaatccaccagtgttgaactatgTAT-TA-------C-A--T-TAGTT-------------TAT-TTAAA-----T-G--TA-TG--------C-A-----------T--AAAGTCT-----A---------------------AAAAA-T--CA----GAA-----T-----TCTGTTAC----------TGTAATTACA-----------TA--C------A---CACGCGTTCTC-TTTT-AC--T-CTGCTGTG----------GAGA-TGCC-A-TTTTTGC-G-ATGATCAAGCCAGAATGTGTACTGGTTCCGTTATCGCCcggaaattactacgt
gi|19 : aatttcactg---TTATTTCAAACTCAAA-------------CGATGTT--------------TTTTCTTCGATAACATCATTTG-AAACGTATCGCATA--TTT-GGACGCATTTGCACGA-AATACAAGCTGTGTTTTTattagtgtactattacagtgaccgtaactgggtcacatccttaa
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