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Reference ( gi|3 ) : ATTATATCAATAAACCTAGTATGTTCAAATTCAT-TA-ATCGTCTGCAGTCAAACAAAAAGTCTGT---CTTAAACA--A----ACTTGCATCA---TATTGTATCAACGCATTTAAAATGCGAGAACAGATGCTTA-ATG-CAAA-CACCTA-----ATT--AGATAAGA---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAGTCATATG--TAAATAACAAGTCAAGCAGCCATGTTATTCACTTTCACTATAATTACTATTACCA--CCATAATTATTA-------CTATTACTACCATATT-T-TCTAAAAATGT----TT--GT-ATTT----AATATTG--ATA--TTCAT-------TTTTGCAC-ATGCCTTATGTATTTGA-TTATA-TATTTGAATATTTTATTTATGGTGA-AT--AGCT-TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGA
gi|5 : ATTACATCAATAAACCTAGTATGTTCAAATTCAT-TA-ATCGTCTGCAGTCAAACAAAAAGTCTGT---CTTAAACA--A----ACTTGCATCA---TATTGTATCAACGCATTTAAAATGCGAGAACAGGTGCTTA-ATG-CAAA-CACCTA-----ATA--AGCTAATA---TTTTT---GA--TTA-TA-T-TA-TAA--AGTCATATG--TTAATAACAAGTCAACCAGCCATGTTATTCACTCTCACTATATTTACTATTACCA--CCATAATTATTA-------TTATTACTACCATATT-T-TCT-AAAATGT----TT--GT-ATTT----AATATTG--ATA--TGCAT-------TTTTGCAT-GTGCC
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gi|2 : acttcatgggttaaataataaatcttattaattagataagatttttgTATATCTGTAAACACAACAACTTCTAATTCATATATAT--TTTGGAGTCAAACAAAACGTCTGT----TTAGATT--A----AATATCATCA---TATTGTGTAAAACAATTTATAATACGTGCACGTATGCTTA-ATT-TAAA-CAACTACATATACTTAAGTTAATA---TT----------TTAGTA-A-TA-TCATTA-TCATATatgtt
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gi|6 : tacctatatgttataaatgattcatcaacaaaaatatttaataacattttgacggaaaaccTCAT-TT-ATTTTTTGCACTCAAACAAAAAGTCT---------------A----ACTTGTATCA---TGCTGTATCAAAGCATTTAAAATGCGAGAACAGAGGCTTA-ATG-CAAA-TAGCTA-----ATT--AGATATGA---TTTGT---GA--TTA-TG-T-TAGTAAT-AATCATATG--TGAATAACAAGTCAACCAGCCATATTATTCACTCTCACTATAATTACTA-----------------TTA-------------CTACCATTTT-T-TCT-TAAACGT----TT--GT-ATTT----TATATTG--ATA--TGTAT-------CTTTGCAT-GTCCCTTATGTATTTGA--TATG-TAATTGAAAATGTTATTTATGGTGA-AA--AGCT-TTTGTTATGCTTAAGCCAAATTAAAAGA
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gi|15 : atatatctgtaaacacaacaacttctaattcatatatattttggagtcaaacaaaacgtctgtttagattaaatatcatcatattgtgtaaaacaatttataatacgtgcacgtatgcttaatttaaacaactacatatacttaagttaatattttagtaatatcattatcatattttgattgttaacctcaatatattcatgttggtaatagtatcctatatttaaaaaacgaccacattgcaactatatgcgcatggaacatcaagttgatctttaagttATAATTA--GTCAACAAGCCATG-TTATTAACTCACTCTACTACTACCATATTGT-TC--AAATTAT----TT--GC-ATTT----ATTCTTG--ATA--TGTAC-------TATTGTATGGTGCTTCATGtatgcatgatc
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gi|17 : tattagtcaaattatcaaattttggttggctatatccaaatacacatgttggtatttatttaatgaaaaaagcgacaacaatgaaactgtatatgtgcataaatctaatgataaaatacaatgtttcaatatgatgtgaataattagtccggcccaactatgtcattcgctcCTACTACATT-TGTCCAAA--TGT----TT--GT-ATTT----ACTATT---ATA--TTTAC-------TTTTA----------TATGTA----ACTTACC-TATTTGGATATGCTATTTA-------AT-----T-TTT-TAATGTTTCAGCCAAAATACAAatgttc
gi|18 : TAAACCTGT----TT--GT-ATTC----ACTGTTGCTATG--TTC---------TGTTGCGT-GAGCCTTGTGTATTTGA--------------ATATGTTATGCATGGTTACATGCAG-----TGTCATGCTTAATCCAAAATAAAAAAacaagttcta
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gi|22 : TTTATGGTGA-AA--AGCGATTTGTAGTGCTTAAGCCAAAGTAAAatgttct
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTATTTCAAAAATTTCATGTTGATATTAAAAAAGCGATAACAACGAATATGCATATGCATAAACCTAGTGAAAAAAT
Unaligned ( gi|20 ): TATGAATATTAAGTGGACCAGCACTATTATATTCACTCTAACTACTGCTACAATATTGTTCAATATGATTG
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Alignments
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Reference ( family-1233 ) : ATTATATCAATAA-ACCCAGTATGTTCAAA-TTCATTTATCNTCTGCAGTCAAACAAAAAGTCTGT---CTTAAACA--A----ACTTGCATCATATTGTATCAAAGCATTTAAAATGCGAGAACAGATG---CT---TA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAATCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAACCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTA-T-A-TTAC--TATTACCACCATAA-TATTACTATTACTACCATATTT-TCT-AAAATGTTT--GT-ATTTAC----------TATTGATATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTATGTATTTGA-TATAT-ATT--G-ATATGTTATTTATGGTGA---ANAGCT-TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGA
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gi|10 : ttcctataatctgttgtaagcattatatcccaaaatatcatttcaataaacccagtatgttcaaattcatttatcttttgcagtcaaacaaaaagtctgtcttaaacaaacttgtatcatattgaatcaaagcatttaacatacaagaacagatgcttaaagcaaatggttaattcgataagatttgtgattatattagtaatatcattatcaaacttttcattgtcctttgccaaacattcatgttagcattaatgcaaaggtaacaacaacgagactaaacaaAAGTAGAAATTGTGT---TTTAAACA--C----GCTTAAAT-ATATTGTATCAAAGCATTTAAAATGCTAGAACAGAAA---CT---AA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGAT---------TTAT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAGTCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAACCAGCCATGTTTT--TCAATCACACAA-T-A-----------------------ATTGCTATTACTACAATATTT-TCT-AAAATGGTT--GT-Atatgttct
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gi|20 : atatatctgtaaacacaacaacttctaattcatatatattttggagtcaaacaaaacgtctgtttagattaaatatcatcatattgtgtaaaacaatttataatacgtgcacgtatgcttaatttaaacaactacatatacttaagttaatattttagtaatatcattatcatattttgattgttaacctcaatatattcatgttggtaatagtatcctatatttaaaaaacgaccacattgcaactatatgcgcatggaacatcaagttgatctttaagttTA-T-----GAATATTAAGTGGACCAGCACTATTATATTCACTCTAACTACT-G-CTACAATATTtatgcatgatc
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gi|4 : acttcatgggttaaataataaatcttatATTATATTAGTAATATC----ATGTTCAAACTTTGATTGTCCTTTTC---CAAACATTAA---TGTTAGCATAAACA--AGGAAACTAG--TCTTAGTATAT---AGTAT---AGATGC----ATAAATA----T---TA-TTA-AAAACA---A-----A----AAACAAA-ACGCTTTTC---AA--TTA-TA-T-T------TAATCAC-ATG-T-----GAATAACAAGTCAACCAGCCATGTTAT--TCACTCTCAC-------------------------------TACT-TT--TACCATATTT-TTT-AAAATGTTT--GT-ATTTAC----------TATTTATTTGTACTTTT-GTAT-GTGCCTTATGTATTTG--CATAT-A-----------TTATTTATGGTAA---AAGGC--TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGAtcaaactttgattgtccttttccaaacattaatgttagcataaacaaggaaactagtcttagtatatagtatagatgcataaatattattaaaaacaaaaaacaaaacgcttttcaattatatttaatcacatgtgaataacaagtcaaccagccatgttattcactctcactacttttaccatattttttaaaatgtttgtatttactatttatttgtacttttgtatgtgccttatgtatttgcatatattatttatggtaaaaggctttgtaatgcttaagccaaaataaaagaatgtt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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blockSeqs : . . A . AG . . T ATT A . . G G . . . . G . C TA G . . . . . G TTA . . . . . AATAATTGCTATTAC . . . . . . . . . A . . G AC CT
blockSeqs : . . T . AG . . T A T . . T G . . . . G . T A G . . . . . G TTA . . . . . TATAATAATTATTAC . . . . . . . . . A . . G AA CT
blockSeqs : . . A . AC . . C A A . . G T . . . . A . T A G . . . . . . TTA . . . . . TATATTTACTATTAC . . . . . . . . . . . . G AA CT
blockSeqs : . . T . GG . . C A C . . G G . . . . A . T A G . . . . . . TCA . . . . . TATAATTACTATTAC . . . . . . . . . . . . A AT T
blockSeqs : . . T . A . . C T C . . G A . . . . C . T A G . . . . . . CA . . . . . TCTACTAC . . . . . . . . . . . . G AA C
blockSeqs : . . A . . T A C . . G G . . . . C . T A T . . . . . . TT . . . . . ACTACCAC . . . . . . . . . . . . A AA C
blockSeqs : . . . . . A T . . G G . . . . G . A A T . . . . . . TA . . . . . ACTACTGC . . . . . . . . . . CC T
blockSeqs : . . . . . A T . . T G . . . . T . T A T . . . . . . TA . . . . . ACTATTAC . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : .
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originalCons : ATTATATCAGTAA-ACCCAGTATGTTCAAA---TTCATTT---ATCTTTTG-CAGTCA--AACAAAAAGTC-------TGT---CTTAAAC----A--AACTTGCATCATATTGTATCAA-AGC---ATTTAAAATGCGAGAACAGATG---CT---TA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAATCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTATAATTACTA---------------TTA------C---------TACCA---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAC----------TATTGATATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTATGTATTTGA-----------AAT-----ATGTT-ATTTATGGTGA---ANAGCT-TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGA
finalCons : ATTATATCAGTAA-ACCCAGTATGTTCAAA---TTCATTT---ATCTTTTG-CAGTCA--AACAAAAAGTC-------TGT---CTTAAAC----A--AACTTGCATCATATTGTATCAA-AGC---ATTTAAAATGCGAGAACAGATG---CT---TA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAATCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTATATTACTATTAC-------------------------------TACCA---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAC----------TATTGATATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTATGTATTTGA-----------AAT-----ATGTT-ATTTATGGTGA---ANAGCT-TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTATTTCAAAAATTTCATGTTGATATTAAAAAAGCGATAACAACGAATATGCATATGCATAAACCTAGTGAAAAAAT
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTCTTTCTAATCCTTTAGCTAAAATGAAATAATGGTCTGTTC
Alignments
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lowQualScore : . . . ... .... . .. .. ....... .... ....... . . ... . . ... ... . . . ..... ... ..... . ... .. . . . . ... . . ..... . .. .. . ......................... . ...... ......... ..................... . . . .. . .......... . . ............ ..... . . ..... ...
lowQualScore : 0 2 2 888 0000 6 55 00 8888888 2222 4444444 3 3 888 0 9 000 000 7 9 4 22222 000 99999 9 444 44 5 5 5 5 777 2 5 77777 7 22 22 5 9999999999999999999999999 4 222222 444444444 333333333333333333333 9 7 5 44 7 5555555555 1 1 444444444444 11111 4 5 66666 999
consensus : ATTATATCAGTAA-ACCCAGTATGTTCAAA---TTCATTT---ATCTTTTG-CAGTCA--AACAAAAAGTC-------TGT---CTTAAAC----A--AACTTGCATCATATTGTATCAA-AGC---ATTTAAAATGCGAGAACAGATG---CT---TA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAATCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTAT-A-------TTAC---------TATTA------C---------TACCA---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAC----------TATTGATATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTATGTATTTGA-----------AAT-----ATGTT-ATTTATGGTGA---ANAGCT-TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGA
Reference ( family-1233 ) : ATTATATCAGTAA-ACCCAGTATGTTCAAA---TTCATTT---ATCTTTTG-CAGTCA--AACAAAAAGTC-------TGT---CTTAAAC----A--AACTTGCATCATATTGTATCAA-AGC---ATTTAAAATGCGAGAACAGATG---CT---TA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAATCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTAT-A-------TTAC---------TATTA------C---------TACCA---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAC----------TATTGATATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTATGTATTTGA-----------AAT-----ATGTT-ATTTATGGTGA---ANAGCT-TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGA
gi|1 : ATCATTTCAATAA-ACCCAGTATGTTCAAA---TTCATTT---ATCTTTTG-CAGTCA--AACAAAAAGTC-------TGT---CTTAAAC----A--AACTTGTATCATATTGAATCAA-AGC---ATTTAACATACAAGAACAGATG---CT---TA-AAG-CAAATGGTTA-----ATT--CGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TAGTAAT--ATCAT-
gi|1 : ttcctataatctgttgtaagcattatatcccaaaatATTATATTAGTAA-TATCATTAT---CAAACTTTTCATT----GTCCTTTG-C---CA--AACA-----TT-------CAT---GTTAG-C----ATTAA--TGCA----AAGGTAACAACAACGAGACTAAACA-ACGTGAATACATG----T---TA-TTA-AAAACAA-------------AAACAAA-ACACTTTTT---AA--TT-----T-GA-TATTTAATCGT-ATG-T-----GAA------GTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTAC-A------------------------A------C---------TACCA---------------------CTTTT-TTT-AAAAATGTTT--GT-ATTTTC----------TATTGATATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTCTATAGTTG------------AAT-----ATGTT-ATTTATGATAA---AAAAGC-TTTGTAATATTTAAGCCAAAATAAAAGtatcaaacttttcattgtcctttgccaaacattcatgttagcattaatgcaaaggtaacaacaacgagactaaacaacgtgaatacatgttattaaaaacaaaaacaaaacactttttaatttgatatttaatcgtatgtgaagtcaaccagccatgttattcactctcactacaactaccactttttttaaaaatgtttgtattttctattgatatgtacttttgcatgtgccttctatagttgaatatgttatttatgataaaaaagctttgtaatatttaagccaaaataaaagtatgttct
gi|10 : ttcctataatctgttgtaagcattatatcccaaaatatcatttcaataaacccagtatgttcaaattcatttatcttttgcagtcaaacaaaaagtctgtcttaaacaaacttgtatcatattgaatcaaagcatttaacatacaagaacagatgcttaaagcaaatggttaattcgataagatttgtgTTTG-CA-TAA--AGAAAAAAGTAGAAATTGTGT---TTTAAAC----A--CGCTTAAAT-ATATTGTATCAA-AGC---ATTTAAAATGCTAGAACAGAAA---CT---AA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--AGAT---------TTAT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTAGTCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTTT--TCAATCACACAATAA-------TTGC---------TATTA------C---------TACAA---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGGTT--GT-Atatgttct
gi|11 : -----ATC--ATATAATTA---TCTGTAAAGA--ATA-TA-TACA-TA--CAGTCAT-ATG-T-----AAATAACAAGTCAA--TCAGACATGTTAT--TCACTCTCACTAT-AA------TTAC---------TATAA------CCACTTTAATTACTA---------------------TATTT-TCT-TAAA-TATTT--GT-ATTTAA----------TATTGATATGTATTTTT-GCAT-GTGCC
gi|12 : ttaatctaaataaatataacttaactcaataacaataccgatgcacAAAAGTC-------TGT---TTTAAAC----A--AACTTGCATCATATTGTATAAA-AGC---ATTTAAAATGCGAGAACTGATG---CC---TA-ATG-TTAACAGCTA-----ATT--ATATCAG-A---TTTGT---GAGGTTT-TAGT-TA-TAAT--AT-AT-ATGTT-----GAA
gi|13 : ctgcgtaagcaatatattccaaaatattagattaatAAAATGCTAGAACAGACA---CT---TA-ATG-CAAACAGCAA-----ATT--AGATAAG-A---TTTGT---GA--TTA-TA-T-TA-TAATTATTCAT-ATG-T-----GAAAAAAAAGTCAA--CAAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTATAA-------TAAT---------TATTA------C---------TACAA---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGATT--GT-Ac
gi|14 : CT-AAAA-CGTTTTCGTCATTTGCATAATGTTGTTATTGATGTGTTTTTTTTGCAC-GTGA-TTATGTATTTGA-----------ATT------TGTTTATTCACGGTGA---ATATCT-TT-ATAATGTTTAAGCCAAAATATAAGA
gi|15 : atacatgAATTAT-ATG-T-----GAATAATTAGTCAA--CAAGCCATGTTAT--TAACTC--ACT--------------C---------TACTA------C---------TACCA---------------------TATTG-TTC-AAAT-TATTT--GC-ATTTAT----------TCTTGATATGTACTATT-GTATGGTGCTTCATGatttt
gi|16 : tttcaatttgatcttaTTGTCACTCATTAAAAAACAGTC-------TGT---CGTAAAT----A--AACTCGCATCATATTGTATTAA-AGC---ATTTAAAA-------------G---CT---TA-ATA-CAAACAACGA-----AGT--ATATAAG--------GT---AA--ATA-TA-C-CAGTAAT--GTCAC-ATG-
gi|17 : a------C---------TACTA---------------------CATTTGTCC-AAA--TGTTT--GT-ATTTAC----------TATT-ATATTTACTTTT-ATAT-GTAACTTACCTATTTG------------GAT-----ATGCT-ATTTA-----A--------T-TTTTTAATGTTTCAGCCAAAATACAA
gi|18 : -TGTTT--GT-ATTCAC----------TGTTGCTATGTTCTGTT-GCGT-GAGCCTTGTGTATTTG------------AAT-----ATGTT-ATGCATGGTTACATGCAG-----TGTCATGCTTAATCCAAAATAAAAAAacaagttcta
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gi|20 : atatatctgtaaacacaacaacttctaattcatatatattttggagtcaaacaaaacgtctgtttagattaaatatcatcatattgtgtaaaacaatttataatacgtgcacgtatgcttaatttaaacaactacatatacttaagttaatattttagtaatatcattatcatattttgattgttaacctcaatatattcatgttggtaatagtatcctatatttaaaaaacgaccacattgcaactatatgcgcatggaacatcaagttgatctttaagttTA-T-----GAATATTAAGTGGA--CCAGCACTATTATATTCACTCT-A---------------AC---------TACTG------C---------TACAA---------------------TATTG-TTC-AATA-TGATT--Gtatgcatgatc
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gi|4 : TA-----ATT--AGATAAG-A---TTTTT---GA--TTA-TA-T-TAGTAAT--ATCAT-GT
gi|4 : acttcatgggttaaataataaatcttatATTATATTAGTAATATC----ATGTTCAAAC--TTTGATT---GTCCTTTT-C---CA--AACATTAA----------TGTTAGCATAAACAAGGA--AACTAG--TCTTAGTATAT----AGT---AT---AGATGC----ATAAATA----T---TA-TTA-AAAACA---A-----A----AAACAAA-ACGCTTTTC---AA--TTA-TA-T-------TTAATCAC-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCAC-------------TAC---------T-TT-----------------TACCA---------------------TATTT-TTT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAC----------TATTTATTTGTACTTTT-GTAT-GTGCCTTATGTATTTG------------CAT-----ATATT-ATTTATGGTAA---AAGGC--TTTGTAATGCTTAAGCCAAAATAAAAGAtcaaactttgattgtccttttccaaacattaatgttagcataaacaaggaaactagtcttagtatatagtatagatgcataaatattattaaaaacaaaaaacaaaacgcttttcaattatatttaatcacatgtgaataacaagtcaaccagccatgttattcactctcactacttttaccatattttttaaaatgtttgtatttactatttatttgtacttttgtatgtgccttatgtatttgcatatattatttatggtaaaaggctttgtaatgcttaagccaaaataaaagaatgtt
gi|5 : acttcatgggttaaataataaatcttattaattagataagatttttgATTACATCAATAA-ACCTAGTATGTTCAAA---TTCATTA---ATCGTCTG-CAGTCA--AACAAAAAGTC-------TGT---CTTAAAC----A--AACTTGCATCATATTGTATCAA-CGC---ATTTAAAATGCGAGAACAGGTG---CT---TA-ATG-CAAACACCTA-----ATA--AGCTAAT-A---TTTTT---GA--TTA-TA-T-TA-TAA--AGTCAT-ATG-T-----TAATAACAAGTCAA--CCAGCCATGTTAT--TCACTCTCACTAT-AT------TTAC---------TATTA------C---------CACCATAATTATTATTATTACTACCATATTT-TCT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAA----------TATTGATATGCATTTTT-GCAT-GTGCCatgtt
gi|6 : atgatctgcgcaagcaatatattccaaactTCATTT---ATTTTTTG-CACTCA--AACAAAAAGTC-------T-------------------AACTTGTATCATGCTGTATCAA-AGC---ATTTAAAATGCGAGAACAGAGG---CT---TA-ATG-CAAATAGCTA-----ATT--AGATATG-A---TTTGT---GA--TTA-TG-T-TAGTAA-TAATCAT-ATG-T-----GAATAACAAGTCAA--CCAGCCATATTAT--TCACTCTCACTATAA-------TTAC---------TATTA------C---------TACCA---------------------TTTTT-TCT-TAAA-CGTTT--GT-ATTTTA----------TATTGATATGTATCTTT-GCAT-GTCCCTTATGTATTTGATATGT------AATTGAAAATGTT-ATTTATGGTGA---AAAGCT-TTTGTTATGCTTAAGCCAAATTAAAAGA
gi|7 : AAAAAGCGACAACA-ATGAAACTGTATATGTG-CATAAATCTA-----AT----GATAAA-A---T--------A--CAA-TG-T-T-----TCAAT-ATGATG-T-----GAATAATTAGTCCGGCCCAACTATGTCAT--TCGCTCTCACT------------------------T-CTG------C---------TAGCA---------------------TATTG-T-T-AAAA-CATTT--GT-GTTTAC----------TACTGGAATGTACTTTT-GCAT-GTGCCTTATGTATTTG------------GAT-----ATGTT-GTTTATTGTAA---CCAG-T-TTTGTGGTTCTTAAACAAATATATAAGAatgtttggtt
gi|8 : tattagtcaaattatcaaattttggttggctatatccaaatacacatgttggtatttatttaatgaATTATATCAATAA-AACCAATATGCTCAAC---TTCCTTT---ATCTTTTG-CA------AACAAAA-------------------T---C----A--AACTTGCATCATATTGTATTAA-AGC---ATTTAAAATGCTAGAACAGATG---CT---TA-ATG-CAAACAGCTA-----ATT--TGATAAG-A---TTTGT---TT--TCA-TA-T-TAGTAA-TAATCAT-ATG-T-----GAATGGAGTGTCAA--CCAGCCATTTCAT--TCACTCTC----------------AC---------TATTA------C---------TACCG---------------------TATTT-TCT-AAAA-TGTTT--GT-ATTTAC----------TATTGATATGTTCTTTT-GCAT-GTGCCTatgttc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTATTTCAAAAATTTCATGTTGATATTAAAAAAGCGATAACAACGAATATGCATATGCATAAACCTAGTGAAAAAAT
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTCTTTCTAATCCTTTAGCTAAAATGAAATAATGGTCTGTTC