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lowQualScore                  :                                                                           33   0 2        6        22  0000000  4  1 8    6       222 1 1   0     222       1                444  5  1 5555 555555  1 22222  222 4444444 99999 55555555555 4    222 00000000000        1    3333333    4        77  222  1    2222 11 333 66  444444444444444444 4      111111                
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lowQualScore                  :                                                                           22   8 1        5        55  3333333  2  5 2    3       333 3 2   4     999       4                555  9  4 0000 222222  2 99999  111 2222222 77777 44444444444 4    000 44444444444        1    7777777    7        99  111  6    7777 99 999 55  777777777777777777 8      111111                
consensus                     :                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TTTACATTCTGATGTGG--TC----NG-ATGAC-ATTCTGNTGTGGTT---A-C-TTTTCATTC-TGATGTGGT-CACTTTACATTATGAT---GTGGT-TC-GAT--G-T-CA-T-----TC---T-------GN----T-----------G-TGGT---T-NNA--TTT--CATTCTGA-TGTG-------GTCACTTTACATT-NTG---ATGTGGT----T--A---C-NTT-C----------------CATTCTGA--CGT-GGTCACTTTACATTAT
Reference ( gi|4 )            :                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TTTACATTTTGATGTGG--TC----TG-ATGAC-AGTCTGCTGTGGTT---A-C-TTTTCATTC-GAATGTGGT-CACTTTACATTATGAT---GTAGT-TC-GAT--G-T-CA-T-----TC---T-------GT----T-----------G-TGGT---T-CGA--TGT--CATTCTGA-TGTG-------GTCATTTTACATT-TTG---ATATGGT----T--A---C-ATT-C----------------CGTTCTGA--CGA-GGTCACTTTACATTATA
gi|6                          :                                                 ATGAAACGTCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TTTACATTCTGATGTGG--TC----CG-ATGAC-AGTCTGCTGTGGTT---A-C-TTTTCATTC-GGATGTGGT-CACTTTACATGATGAT---GTAGT-TC-GAT--G-T-CA-T-----TC---T-------GT----T-----------G-TGGT---T-CGA--TGT--CATTCTGA-T----------GNNNNNNNNNNTT-CTG---ATGTGGT----
gi|11                         :                                               atATGGAACGCAAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TTTACATTCTGATGTGG--TC----AG-ATGAC-AGTCTGCTGTGGTT---A-C-CTTTCATTC-AGATGTGGT-CACTTTAc
gi|10                         :                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TTTACATTCTGATGTGG--TC----AG-ATGAC-AGTCTGCTGTAGTT---A-CTTTTTCATTC-GGATGGGGT-CACTTT
gi|13                         :                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TTTACATTCTGATGTGG--T------------C-AGTCTGCTGTGGTT---A-C-TTTTCATTC-GGATGTGGT-CACTTTA
gi|19                         :                                                tATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTAG-TTTTTATTATGATGTGG--TC----CG-ATGAC-ATTATGCTGAGGTT---A-C-TT
gi|17                         :                                                 ATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA--GATTA-TTAACATTCTGATGTGG--TC----AG-ATGAC-AGTCTGCTGTGGTC---A-C-TTT
gi|28                         :                                                tATGGAACGCTACACACGACTTTGATG--GTTCA-TTTACATTCTGCAGTGG--a
gi|32                         :                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTT
gi|8                          :                                                tATGGAACGCCTAACGTGACTTT----------------CATTCTGATTTGG--CC----CG-ATTAC-GTTATGATACGATT---A-C-TTTTCATTC-TTAC---AT-CACTTTTCATTCAGAT---G
gi|14                         :                                            caactATGGAACGCCTAGCAAGCCTTTAGTG--GTTAACTTTAC--TACGATGTGG--TC----AC-ATTAC-A---TAATGTGGTT---C-C-TGTTTATTC-cgat
gi|2                          :                                                 tTGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG--GTTCA-TTTCCGTTCCGATGGTG--TCACT-TGCATCAC-GAGATGGTGTC-CT---A-C-T----GTTC-GGAAAAGGT-CACTTTATGTTATGGC---GTTCT-TC-TTTTTG-T-CA-C-----TC---TACATTAAGA----T-----------G-TGGG---T-CCA--TTC--CATTCC---TGT-----------------CGTT-CTG---ATATGGT----C--A---C-TTT-T----------------CATTATGA--TCT-GATCACTTTATATtga
gi|20                         :                                                 tgGGAACGCTAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TTTACATTCTGAT---G--TC----AG-ATAAC-ATTCTGCTGTGGTT---A-C-TTTTCatgatgtggttcactttcgttttgattgtttcctcttacattatgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|16                         :                                                   GGAACGCCAAACACGACTTTGATG--ATCCA-TTTTCATTCTGATGTTG--TC----AA-ATTAC-ATTATAATATCGTT---A-C-ATTTCATT
gi|12                         :                                                    cAACAACAAACTCGACTTTGATG--GTTTA-TTTACATTCTGATGTGG--TC----AG-ATGAC-AGTCTGCTGTGGTT---A-C-TTTTCATTC-GGATGTGGT-CACTTTA
gi|1                          :                                                   gcAACACTTAACATGACTTCGGTG--GTTCA-TTTTCATTCCGACGAGG--TCACTTTGCATTACGAGAC------GGTT---T-C-TTATTGTTC-GGATAAGGT-CACTATATGTTATGGC---GTTCT-TC-TTT--T-T-CA-T-----TC---T-------CA----T-----------A-TGGTCACT-CGG--CGT--TA---TGA-TATG-------CTTCCTTTCCATTAATG---A-GTGAT----T--T---C-CTT-T----------------CGTTTTGA--TGT-GCTCACTTTTCATTAT
gi|29                         :                                                        GCCAAACACAACTTTGATG--GTTTA-TTTTCATTCTGATGTgatgtgatcgctttacattatggtgagatgctctgatgtggttcccgttcatcttgatgtttttattttacattacgataaggttcctttacattctgatatggttatgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|5                          :                                                                aaATTCTGATGTGGTCCC-TTTACATTACGGTGTAG--TT----CG-GTATC-ATCCTTAAATGGTTCAAA-G-T---CATTC-TGATGTGGT-TACTTTACATTATGAT---GTGGT-TC-GTT--A-T-CA-G-----TC---T--------TAAAAT-----------G-TGGT---T-CAA--
gi|3                          :                           atggtgtggttcattgtcataattatttgttatcgtccttatgtggctcaatgtc-TTTATATTATGATGCGG--TC----CT-TTG-C-ACTTTA--GAGCTT---C-C-TTTTCATTT-TGATGTTTT-CATTTTGCGTTATGAT---GTGGT-TC-C-T--T-T-CAAT-----TCGAGT-------GG----T-----------G-TA-T---C-C----TTT--TATT-TGG-TGTT-------GTCCCTTTTCATT-TT------ATGGC----T--A------------------------------------------TCACTTTACATTAT
gi|18                         : acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatcctttttttctgatatggtcacttaacgttatgatgtggtagc-TTTACATTTTGATGTGG--TT----AC-ATTCC-ATTATGATATGGTC---A-C-TTTGCATTA-TTATGTGGT-TACgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|7                          :                                                                                  -TTTACACTATGATGTGGTATC----TT-AT--C-ATTCGGCGGTGGTA---A-C-TTGTCATTC-GACTGTGTT-AACATGTCATTAGGCA---GTGGT-TG-TTT--A-T-CA-T-----TC---ccgtcattcggc
gi|26                         :                                                         tggttacattccattctgacgaggtcacTACATTTTGATGTGG--TT----AC-ATTCC-ATTCTGATGTGGTC---A-T-TTTACATTgtcaacggtgacttgtctttcggcagt
gi|21                         :                                                                                       CATTTTGATGTGA--TT----CG-ATGTC-ATTCTGATGAAGTT---C-G-ATGTCATTC-TGATGatgat
gi|30                         :                                                                                       CATTCTGATGTGG--TC----AG-ACGAC-AGTCTGCTGTGGTT---A-C-TTnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                             GATGTGG--TC----AC-TTAAC-ATTATGATGTGGTT---T-A-TTTATATTC-TCATTTGGT-CACTTTACAT
gi|25                         :                                                                                                                  AC-ATTTTGATATGGTT---A-C-ATTCCATTC-TGACGAGGT-CACTTTACATTATGA
gi|23                         :                                                                                                                ttAC-ATTTTGATATGGTT---A-C-ATTCCATTC-TGACGAGGT-CACTTAACATCATGA
gi|26                         :                                                                                                             attttAC-ATTTTGATGTGGTT---A-C-ATTCCATTC-TGATGTGGT-CATTTTACATTATGAT---
gi|15                         :                                                                                                                 tAC-ATTTTGACATGGTT---A-C-ATTCCATTCCGACTA-GTT-CACTTTAATTTATGATGTGGTAGC-T----T--G-T-CA-T-----TC---G-------GC----G-----------G-TG
gi|18                         :                                                                                                            cattttAC-ATTTTGATGTGGTT---A-C-ATTCCATTA-TGATATGGT-CACTTTGCATTATTAT---GTGGT-TA-CCC--G-T-CA-T-----TC---
gi|24                         :                                                                                                                tttC-ATTCTATTGTGGTT---C-G-ATGTCTTTC-TGATGTGGT-CATTTTACATTTTGAT---GTggc
gi|9                          :                                                                                                                            TATGGTT---A-C-ATTCCATTC-TGACGAAGT-CACTTTACATTATGATGTGGTAGC-T----T--G-T-CA-T-----TC---G-------GC----G-----------G-TAGT---
gi|14                         :                                                                                                            tttttatattttggttaGTGGTT---AAC-TTTAC-TAC-GA-TGTGGT-CACATTAC---ATAAT---GTGGT-TC--CT--GTT-TA-T-----TC---T-------Gaacttgcgactgtgt
gi|7                          :                                                                                                      tatggaacgcctagcaagcctttaTGGTT---A-C-ATTCCATTC-TGACGAGGT-CACTTTACACTATGAT---GTGGTATC-T-T--A-T-CA-T-----TC---G-------GC----G-----------G-TGGT------AACTTGT--CATTC-GACTGTGTTAACATGTCATTa
gi|16                         :                                                                                                                                         -TTTTCATTC-TGATGTTGT-CAAATTACATTATAAT---ATCGT-TA-CAT--T-T-CA-T-----Taggcagtggttgtttatcattcgtcaacggtgacttgtctttcggcagt
gi|18                         :                                                                                                           cggaacgccaaacacgactttgatgatcca-TTTACATTT-TGATGTGGT-TACATTCCATTATGAT---ATGG--TC-ACT--T-TGCA-T-----TA---T-------TA----T-----------G-TGGT---T-ACC--CGT--CATTC
gi|5                          :                                                                                                                                             TCATTC-TGATGTGGT-CCCTTTACATTACGGT---GTAGT-TC-GGT--A-T-CA-T-----CC---T-------TA----A-----------A-TGGT---T-CAA--AGT--CATTCTGA-TGTG-------GTTACTTTACATT-ATG---ATGTGGT----T--ggc
gi|22                         :                                                                                                 atggtgtggttcattgtcataattatttgttatcgtccttatgtggctcaatgATGTGGT-CACTTAACATTATGAT---GTGGT-TT--AT----T-TA-T----------------------------------------------------------ATTCTCA-TTTG-------GTCACTTTACATcgttatcagtcttaaaatgtggttcaa
gi|20                         :                                                                                                                                                        gTGGTTCA-TTTACATTCTGAT---G-----TCAGAT--A-A-CA-T-----TC---T-------GC----T-----------G-TGGT---T-
gi|19                         :                                                                                                                                   ggaacgctaaacacgactttgaTGGT-TAGTTTTTATTATGAT---GTGGT-CC-GAT--G-A-CA-T-----TA---T-------GC----T-----------G-AGGT---T-acttttc
gi|6                          :                                                                                                                                         atggaacgccaaacacgactttgaTTTACATTCTGAT---GTGGT-CC-GAT--G-A-CA-G-----TC---T-------GC----T-----------G-TGGT---T-ACT--TTT--CATTCGGA-TGTG-------GTCACTTTACATG-ATG---ATGTAGT----TCGATGTC-ATT-C----------------TGTTGTGGTTCGA-TGTCATTCTactt
gi|11                         :                                                                                                                                atatgaaacgtcaaacacgactttgatggtttaTTTACATTCTGAT---GTGGT-CA-GAT--G-A-CA-G-----TC---T-------GC----T-----------G-TGGT---T-ACC--TTT--CATTCAGA-TGTG-------GTCACTTTAgatgnnnnnnnnnnttctgatgtggtc
gi|10                         :                                                                                                                                  atggaacgcaaaacacgactttgatggtttaTTTACATTCTGAT---GTGGT-CA-GAT--G-A-CA-G-----TC---T-------GC----T-----------G-TAGT---TACTT--TTT--CATTCGGA-TGGG-------GTCACTTT
gi|13                         :                                                                                                                                  atggaacgccaaacacgactttgatggtttaTTTACATTCTGAT---GTGGT-------------CA-G-----TC---T-------GC----T-----------G-TGGT---T-ACT--TTT--CATTCGGA-TGTG-------GTCACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                 tatggaacgccaaacacgactttgatggtttaTTTACATTCTGAT---GTGGT-CA-GAT--G-A-CA-G-----TC---T-------GC----T-----------G-TGGT---T-ACT--TTT--CATTCGGA-TGTG-------GTCACTTTA
gi|24                         :                                                                                                                                        gcaacaacaaactcgactttgatggtttaCATTCTATT---GTGGT-TC-GAT--G-T-CT-T-----TC---T-------GA----T-----------G-TGGT---C---A--TTTTACATTTTGA-TGT
gi|21                         :                                                                                                                                                                     CATTTTGAT---GTGAT-TC-GAT--G-T-CA-T-----TC---T-------GA----T-----------G-AAGT---T-CGA--TGT--CATTCTGA-TG
gi|5                          :                                                                                                                                                                         ATGGT---GTGGT-TC-ATT--G-T-CA-TAATTATT---T-------GT----TATCGTCCTTATG-TGGC---T-CAA--TGT--CATTCTGA-TGTG-------GTCCCTTTACATT-ACG---GTGTAGTTCGGT--AT--C-ATC-CTTAAATGGTTCAAAGTCATTCTGA--TGT-GGTTACTTTACATTATnnnnnnnnnntgatg
gi|11                         :                                                                                                                                                                          TGAT---G--GT-TT--AT--T-TACA-T-----TC---T-------GA----T-----------G-TGGT---C-AGA--TGA--CAGTCTGC-TGTG-------GTTACCTTTCATT-CAG---ATGTGGT----C--A---C-TTT-gatgtggttcgttatcagtcttaaaatgtggttcaa
gi|12                         :                                                                                                                                                     atggaacgcaaaacacgacttTGAT---G--GT-TT--AT--T-TACA-T-----TC---T-------GA----T-----------G-TGGT---C-AGA--TGA--CAGTCTGC-TGTG-------GTTACTTTTCATT-CGG---ATGTGGT----C--A---C-TTT-a
gi|31                         :                                                                                                                                                          gcaacaacaaactcgacttT---GTGGT-TC-GAT--G-T-CA-T-----TC---T-------Ga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                  -CA-T-----TC---T-------GA----T-----------G-TGGT---C-AGA--TGA--CAGTCTGC-TGTG-------GTCACTTTAataaggtcgttttatattt
gi|25                         :                                                                                                                                                              tatggaacttaaaacacaactttgatagattattaa-CA-T-----TT---T-------GA----T-----------A-TGGT---T-ACA--TTC--CATTCTGA-CGAG-------GTCACTTTACATT-ATG---A
gi|23                         :                                                                                                                                                                                               tta-CA-T-----TT---T-------GA----T-----------A-TGGT---T-ACA--TTC--CATTCTGA-CGAG-------GTCACTTAACATC-ATG---A
gi|24                         :                                                                                                                                                                                            atttta-CA-T-----TC---T-------AT----T-----------G-TGGT---T-CGA--TGT--CTTTCTGA-TGTG-------GTCATTTTACATT-TTG---ATGT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                  -CA-T-----TT---T-------GA----T-----------G-TGGT---T-ACA--TTC--CATTCTGA-TGTG-------GTCATTTTACATT-ATG---AT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                ta-CA-T-----TT---T-------GA----T-----------G-TGGT---T-ACA--TTC--CATTATGA-TATG-------GTCACTTTGCATT-ATT---ATGTGGT----T--A---C-----C----------------CGT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                      tttaT----T-----------GATGGT---T-T-A--TTTA-CATTCTGA-TGTG-------GTCAGATGACAGT-CTG---CTGTGGT----T--A---C-CTT-T----------------CATTCAGA--TGT-GGTCACTTTAcattcggc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                      atggaacgcaaaacacgactT----T-----------GATGGT---T-T-A--TTTA-CATTCTGA-TGTG-------GTCAGATGACAGT-CTG---CTGTAGT----T--A---CTTTT-T----------------CATTCGGA--TGG-GGTCACTTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                      atggaacgccaaacacgactT----T-----------GATGGT---T-T-A--TTTA-CATTCTGA-TGTG-------GTCAGTCTGC-----------TGTGGT----T--A---C-TTT-T----------------CATTCGGA--TGT-GGTCACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                     tatggaacgccaaacacgactT----T-----------GATGGT---T-T-A--TTTA-CATTCTGA-TGTG-------GTCAGATGACAGT-CTG---CTGTGGT----T--A---C-TTT-T----------------CATTCGGA--TGT-GGTCACTTTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                         gcaacaacaaactcgact----T-----------A-TGGT---T-ACA--TTC--CATTCTGA-CGAA-------GTCACTTTACATT-ATG---ATGTGGT----
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                          tttttatattttggtta----T-----------G-TGGT---T-CGA--TGT--CATTCTGA-TAAG-------GTCGTTTTATATT-Tagcttgtcattcggcggtagtaacttgcgactgtgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                            -TGGT---T-ACA--TTC--CATTCTGA-CGAG-------GTCACTTTACACT-ATG---ATGTGG-----T--A---T-CTTAT----------------CATTC-GG--CGGTGGTAACTTGTCATT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                             T--CATTCTGA-TGTT-------GTCAAATTACATT-ATA---ATATCGT----T--A---C-ATT-T----------------CATTcgactgtgttaacatgtcattaggcagtggttgtttatcattcgtcaacggtgacttgtctttcggcagt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                            cggaacgccaaacacgactttgatgatccatttT--CATTCTGA-TTTG-------GCCCGATTACGTT-ATG---ATACGAT----T--A---C-TTT-T----------------CATTCTTA--C----ATCACTTTTCATT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                    caactatggaacgcctaacgtgactt--CATTTTGA-TGTG-------GTTACATTCCATT-CTG---ATGTGGT----C--A---T-TTT-A----------------CATTATGA--cagatgcgat
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                    tatggaacttaaaacacaGA-TGTG-------GTCACTTAACATT-ATG---ATGTGGT----T------T-ATT-TA---------------TATTCTCA--TTT-GGTCACTTTACAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTTTACATT-TTG---ACATGGT----T--A---C-ATT-C----------------CATTCCGA--CTA-GTTCACTTTAATTTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTTACATT-TTG---ATATGGT----T--A---C-ATT-C----------------CATTCTGA--CGA-GGTCACTTAACATCATgatgtggtagcttgtcattcggcggtg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTATATT-TTGGTTATATGGT----T--A---C-ATT-C----------------CATTCTGA--CGA-AGTCACTTTACATTATga
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTTTACATT-TTG---ATGTGGT----T--A---C-ATT-C----------------CATTATGA--TAT-GGTCACTTTGCATTATgatgtggtagcttgtcattcggcggtagtaacttgcgactgtgt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           TACATT-TTG---ATGTGGT----T--A---C-ATT-C----------------CATTCTGA--TGT-GGTCATTTTACATTATga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATT-CTA---TTGTGGT----T--C---G-ATG-T----------------CTTTCTGA--TGT-GGTCATTTTACATTgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGT----T--A---C-ATT-C----------------CATTCTGA--CGA-GGTCACTTTACACTATttgatgt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TATGTGATTCTATGTTTTTTTAACCTGTTATTTAACCAGTACACTGTCA






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Reference ( family-1219 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTCA-TT-TACATTC-TGATGTGG-T--CN------------G----AT----GACAT--TCTGNTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTATG-------------ATGTGG-----T-TC--------------GA---T----GT---------C--ATTC-T-------GNT---GTG------GTTNNA-------TTT--C-----ATT----CTGA-T--G-TG-------------G---TCACTTTACAT-T-NTGATGTGGTT--ACNT------T-CCATTCT---GA-CGTGG--TCACT-TTACATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACACTTAACATGACTTCGGTG-GTTCA-TT-TTCATTC-CGACGAGG-T--CA------------C----TT----TGCAT--TACGAGAC--------GGTTTC-TTATTGTTCGG-----AT-AAG---------GT-CACTATATGTTATG-------------GCGTTC-----T-TC--------------TT---T----TT---------C--ATTC-T-------CAT---ATG------GT--CA-------CTCGGC-----GTT----ATGA-T--A-TG-------------C---TTCCTTTCCAT-TAATGA-GTGATT--TCCT------T-TCGTTTT---GA-TGTGC--TCACT-TTTCATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATG-CTTCC-TT-TCCATTAATGA-GTGA-T--TT------------C----CT----TTCGT--TTTGATGT--------GCTCAC-TTTTCATTATG-----AT-GTG---------AT-CGCTTTACATTATGGTGAGATGCTCTGATGTGG-----T-TC--------------CC---G----TT---------C--ATCT-T-------GAT---GT--------TTTTA-------TTTTAC-----ATT----ACGA-T--A-AG-------------G---TTCCTTTACAT-T-CTGATATGGTT--ATGT------T-gatgtgatcgctttacattatggtgagatgctctgatgtggttcccgttcatcttgatgtttttattttacattacgataaggttcctttacattctgatatggttatgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                                                 aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatTTTGATGTGCTCACTT-TTCATTA-TGATGTGA-T--CGCTTTACATTAT-G----GT----GAGATGCTCTGATGT--------GGTTCC-CGTTCATCTTG-----AT-GTT---------TT-TATTTTACATTACG-------------ATAAGG-----T-TC--------------CT---T----TA---------C--ATTC-T-------GAT---ATG------GTTATG-------TTT--TGTTAGGTT----GTGA-TTCG-TGTTGGAACGATAGTG---TCACTTGACCT-G-ATGATGTTGTC---CTT------T-CCAttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                                   aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgtTC-TGATGTGG-TTCCC------------G----TT------CAT--CTTGATGT--------TTTTAT-TTTACATTACG-----AT-AAG---------GT-TCCTTTACATTCTG-------------ATATGG-----T-T----------------A---T----GT---------TTTGTTA-G-------GTT---GTGATTCGTGTTGGAACGATAGTGT--C-----ACTTGACCTGA-T--GATGTT-----------G---TC-CTTTCCAAAT-ATGATGTCGTTTTAGGTGTTGTCT-CTTTTCTTT-GATCGTTA--TCACT-TTACATTATaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                            aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgcG-GTTCC-TT-TACATTC-TGATATGG-T--T------------------AT----G---T--TTTGTTA---------GGTTGT-GATTCGTGTTGGAACGATAGTG----------T-CACTTGACCTGATG-------------ATGTTG-----T-CCTTTCCAAATAT---GA---T----GT---------C--GTTT-TA------GGT---GTT------GTCTCT-------TTT--C-------T----TTGA-TC-G-TT-------------A---TCACTTTACAT-T-ATGATGTGGTT--TTAT------T-TCATTAC---GA-AGTTG--TCACT-TTATAgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|10                         : aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgctctgatgtggttcccgttcatcttgatgtttttattttacattacgataaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTC-TGATGTGG-T--CA------------G----AT----GACAG--TCTGCTGT--------AGTTACTTTTTCATTCGG-----AT-GGG---------GT-CACTTTactcatata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCAAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTC-TGATGTGG-T--CA------------G----AT----GACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-CTTTCATTCAG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACAACAAACTCGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTC-TGATGTGG-T--CA------------G----AT----GACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTC-TGATGTGG-T--CA------------G-----------------TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tATGGAACGCCTAGCAAGCCTTTAGTG-GTTAACTT-TAC--TA-CGATGTGG-T--CA------------C----AT----TACA-----TAATGT--------GGTTCC-TGTTTATTCTG-----A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tACAT--TTTGACAT--------GGTTAC-ATTCCATTCCG-----AC-TAG---------TT-CACTTTAATTTATG-------------ATGTGG-----T------------------AGCTT----GT---------C--ATTC-G-------GCG---GTG------
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           cattttGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-ATCCA-TT-TTCATTC-TGATGTTG-T--CA------------A----AT----TACAT--TATAATAT--------CGTTAC-ATTTCATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              cATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA-GATTA-TT-AACATTC-TGATGTGG-T--CA------------G----AT----GACAG--TCTGCTGT--------GGTCAC-TTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-TT-TACATTT-TGATGTGG-T--a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------C--ATTT-T-------GAT---GTG------GTTACA-------TTC--C-----ATT----ATGA-T--A-TG-------------G---TCACTTTGCAT-T-ATTATGTGGTT--ACCC------G-TCATTCtacattccattatgatatggtcactttgcattattatgtggttacccgtcattcggc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           tttaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTAG-TT-TTTATTA-TGATGTGG-T--CC------------G----AT----GACAT--TATGCTGA--------GGTTAC-TTggc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG-GTTCA-TT-TCCGTTC-CGATGGTG-T--CACTTGCATCACGAG----AT----GGTGT--CCTACTGTTCGGAAAAGGTCAC-TTTATGTTATG-----GC-GTTCTTCTTTTTGT-CACTCTACATTAAG-------------ATGTGGGTCCAT-TC--------------CA---TTCCTGT---------C--GTTC-T-------GAT---ATG------GTCACT-------TTT--C-----ATT----ATGA-T--C-TG-------------A---TCACTTTATA--T-ATGATGTGGTTC-ACTT------T--CGTTTT---GA-T-TGT--TTCCTCTTACATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgTCA-CTCTACATTA-AGATGTGGGT--CC------------ATTCCATTCCTGTCGT--TCTGATAT--------GGTCAC-TTTTCATTATG-----AT-CTG---------AT-CACTTTATA-TATG-------------ATGTGG-----T-TCACTTTCGTTTT---GAT--T----GTTTCCTCTTAC--ATTA-T-------GAT---GGG------ATTGTATCT----TTT--T-----ATT----C-GT-T--G-TT-------------G---TCACTTTTCAT-A-ATATCGTTATC--ACTT------T-TCATTCT---GA-TGTGGTTTCATT-TTgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|20                         :                                                                                                                                                                         tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgGGAACGCTAAACACGACTTTGATG-GTTCA-TT-TACATTC-TGAT---G-T--CA------------G----AT----AACAT--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CATTTTG-------------ATGTGA-----T-TC--------------GA---T----GT---------C--ATTC-T-------GAT---GAA------GTTCGA-------TGT--C-----ATT----CTGA-T--G-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTTTG-----AT-GTG---------ATTCGATGT-CATTCTG-------------ATGAAG-----T-TC--------------GA---T----GT---------C--ATTC-T-------GAT---GNN------NNNNNN-------NNT--G-----ATnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GA-T--G-TG-------------G---TCACTTAACAT-T-ATGATGTGGTT--TATT------T-ATATTCT---CA-TTTGG--TCACT-TTACATg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTTTACAT-T-TTGATATGGTT--ACAT------T-CCATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TAACATCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------C--ATTC-T-------ATT---GTG------GTTCGA-------TGT--C-----TTT----CTGA-T--G-TG-------------G---TCATTTTACAT-T-TTGATGTga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTACAT-T-TTGATATGGTT--ACAT------T-CCATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TACAT-T-TTGATGTGGTT--ACAT------T-CCATTCT---GA-TGTGG--TCATT-TTACATTATga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCTACACACGACTTTGATG-GTTCA-TT-TACATTC-TGCAGTGG-gat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCCAAACACAACTTTGATG-GTTTA-TT-TTCATTC-TGATGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaACATTATG-------------ATATGG-----T-TC--------------CA---T----AC---------C--ATTTAT-------G-T---GTG------ATATCC-------TTT--T-----TTT----CTGA-T--A-TG-------------G---TCACTTAACGT-T-ATGATGTGGTA--GCTT------T-ATATTAT---GA-TGCGG--TC-CT-TTGCACT
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTt
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Reference ( family-1219 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTCA-TT-TACATTCTGATGTGG-T--CA------------GATGACAT--TCTGNTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTGG-----T-TC--------------GA---T----GT---------CAT-TC-T-------GNT---G------TGGTTNCAT---TT--C-----ATTC--TGA-T--GTG-------------G---TCACT-TTACAT-T-A-------------TGATGTGGTT--A---CNT------T-CCATTCT---GA-CGTGG--TCACT-TTACATTAT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                      aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttCGT--TTTGATGT--------GCTCAC-TTTTCATTATG-----AT-GTG---------AT-CGCTTTACATTA-TG--GTGA-----------------------GA---T----GC-------------TC-T-------GAT---G------TGGTTCCCG---TT--C-----ATCT--TGA-T--GTT-------------T---TTATT-TTACAT-T-A-------------CGATAAGGTT--C---CTT------T-ACATTCT---GA-TATGG--TTAcgataaggttcctttacattctgatatggttatgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttTTTGATGTGCTCACTT-TTCATTATGATGTGA-T--CGCTTTACATTAT-GGTGAGATGCTCTGATGT--------GGTTCC-CGTTCATCTTG-----AT-GTT---------TT-TATTTTACATTA-CGATAAGG-----T-TC--------------CT---T----TA---------CAT-TC-T-------GAT---A------TGGTTATGT---TT--TGTTAGGTTG--TGA-TTCGTGTTGGAACGATAGTG---TCACT-TGACCT-G-A-------------TGATGTTGTC------CTT------T-CCAtgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                                   aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgtTCTGATGTGG-TTCCC------------GTT--CAT--CTTGATGT--------TTTTAT-TTTACATTACG-----AT-AAG---------GT-TCCTTTACATTC-TGATATGG-----T-TATGTTTTGTTAG---GT---T----GT---------GAT-TCGT-------GTT---GGAACGATAGTGTCAC---TT--G-----ACCTGATGA-T--GTT-------------G---TC-CT-TTCCAAAT-A-------------TGATGTCGTTTTA---GGTGTTGTCT-CTTTTCTTT-GATCGTTA--TCACT-TTACATTATaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                            aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgcG-GTTCC-TT-TACATTCTGATATGG-T--TA--------------TG---T--TTTGTTA---------GGTTGT-GATTCGTGTTGGAACGATAGTG----------T-CACTTGACCTGA-TGATGTTG-----T-CCTTTCCAAATAT---GA---T----GT---------CGT-TT-TA------GGT---G------TTGTCTCTT---TT--C-------TT--TGA-TC-GTT-------------A---TCACT-TTACAT-T-A-------------TGATGTGGTT--T---TAT------T-TCATTAC---GA-AGTTG--TCACT-TTATAgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|10                         : aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgctctgatgtggttcccgttcatcttgatgtttttattttacattacgataaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-T--CA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------AGTTACTTTTTCATTCGG-----AT-GGG---------GT-CACTTTactcatata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCAAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-T--CA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-CTTTCATTCAG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACAACAAACTCGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-T--CA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             gcATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-T--CA------------G---------TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tATGGAACGCCTAGCAAGCCTTTAGTG-GTTAACTT-TAC--TACGATGTGG-T--CA------------CATTACA-----TAATGT--------GGTTCC-TGTTTATTCTG-----A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tACAT--TTTGACAT--------GGTTAC-ATTCCATTCCG-----AC-TAG---------TT-CACTTTAATTTA-TGATGTGG-----T------------------AGCTT----GT---------CAT-TC-G-------GCG---G------TG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           cattttGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-ATCCA-TT-TTCATTCTGATGTTG-T--CA------------AATTACAT--TATAATAT--------CGTTAC-ATTTCATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              cATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA-GATTA-TT-AACATTCTGATGTGG-T--CA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTCAC-TTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t---------CAT-TT-T-------GAT---G------TGGTTACAT---TC--C-----ATTA--TGA-T--ATG-------------G---TCACT-TTGCAT-T-A-------------TTATGTGGTT--A---CCC------G-TCATTCa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           tttaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTAG-TT-TTTATTATGATGTGG-T--CC------------GATGACAT--TATGCTGA--------GGTTAC-TTggc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG-GTTCA-TT-TCCGTTCCGATGGTG-T--CACTTGCATCACGAGATGGTGT--CCTACTGTTCGGAAAAGGTCAC-TTTATGTTATG-----GC-GTTCTTCTTTTTGT-CACTCTACATTA-AGATGTGGGTCCAT-TC--------------CA---TTCCTGT---------CGT-TC-T-------GAT---A------TGGTCACTT---TT--C-----ATTA--TGA-T--CTG-------------A---TCACT-TTATAT---A-------------TGATGTGGTTC-A---CTT------T--CGTTTT---GA-T-TGT--TTCCTCTTACATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgTCA-CTCTACATTAAGATGTGGGT--C------------------CAT--TCCATT---------------C-CTGTCGTTCTG-----AT-ATG---------GT-CACTTTTCATTA-TGATCTGA-----T-C----------------A---C----TT---------TATATA-T-------GAT---G------TGGTTCACT---TT--C-----GTTT--TGA-T---TG-------------T---TTCCTCTTACAT-T-A-------------TGATGGGATT--GTATCTT------T-TTATTC----GT-TGTTG--TCACT-TTTCATAATgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                              tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgTGTCGT--TCTGATAT--------GGTCAC-TTTTCATTATG-----AT-CTG---------AT-CACTTTATA-TA-TGATGTGG-----T-TCACTTTCGTTTT---GAT--T----GTTTCCTCTTACAT-TA-T-------GAT---G------GGATTGTATCTTTT--T-----ATTC---GT-T--GTT-------------G---TCACT-TTTCAT-A-A-------------TATCGTTATC--A---CTT------T-TCATTCT---GA-TGTGGTTTCATT-TTatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|20                         :                                                                                                                                      tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattccGGAACGCTAAACACGACTTTGATG-GTTCA-TT-TACATTCTGAT---G-T--CA------------GATAACAT--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATTT-TGATGTGA-----T-TC--------------GA---T----GT---------CAT-TC-T-------GAT---G------AAGTTCGAT---GT--C-----ATTC--TGA-T--G
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATTTTG-----AT-GTG---------ATTCGATGT-CATTC-TGATGAAG-----T-TC--------------GA---T----GT---------CAT-TC-T-------GAT---G------NNNNNNNNN---NT--G-----ATnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-T--GTG-------------G---TCACT-TAACAT-T-A-------------TGATGTGGTT--T---ATT------T-ATATTCT---CA-TTTGG--TCACT-TTACATg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATT-TTACAT-T-T-------------TGATATGGTT--A---CAT------T-CCATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TAACATCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---------CAT-TC-T-------ATT---G------TGGTTCGAT---GT--C-----TTTC--TGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACAT-T-T-------------TGATGTga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTACAT-T-T-------------TGATATGGTT--A---CAT------T-CCATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---------CAT-TT-T-------GAT---G------TGGTTACAT---TC--C-----ATTC--TGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACAT-T-A-------------TGATga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             taATGGAACGCTACACACGACTTTGATG-GTTCA-TT-TACATTCTGCAGTGG-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCCAAACACAACTTTGATG-GTTTA-TT-TTCATTCTGATGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaACATTA-TGATATGG-----T-TC--------------CA---T----AC---------CAT-TTAT-------G-T---G------TGATATCCT---TT--T-----TTTC--TGA-T--ATG-------------G---TCACT-TAACGT-T-A-------------TGATGTGGTA--G---CTT------T-ATATTAT---GA-TGCGG--TC-CT-TTGCACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--TCTGATAT--------GGTCAC-TTAACGTTATG-----AT-GTG---------GT-AGCTTTATATTA-TGATGCGG-----T-CC--------------TT---T----G----------CAC-TT-T-------A-----G------AGCTTCCTT---TT--C-----ATTT--TGA-T--GTT-------------T---TCATT-TTGCGT-T-A-------------TGATGTGGTT--C---CTT------T-CAATTC----GA--GTGG--Tttagagcttccttttcattttgatgttttcattttgcgttatgatgtggttcctttcaattcgagtggtgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatccttttt-TT-TATATTATGATGCGG-T--CC------------TTTG-CAC--TTTA--GA--------GCTTCC-TTTTCATTTTG-----AT-GTT---------TT-CATTTTGCGTTA-TGATGTGG-----T-TCCTTTCAATTCGAGTGG---T----GT----------AT-CC-TTTTATTTGGT---G------TTGTCCCTT---TT--C-----ATTT--TA------TG-------------GCTATCACT-TTACAT-T-A-------------TGATGTGGTT--T---CAT------A-TCACTGT---GA-CGTTG--TCACT-TTgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                    acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatcctttttttctgatatggtcacttaacgttatgatgtggtagcCATTCTGATGTGG-T--CA------------GACGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTGG-----T-TC--------------GA---T----GT---------CAT-TC-T-------GAT---A------AGGT--CGT---TT--T-----AT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTattt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTTTGATGTGG-T--CT------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGA-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTAG-----T-TC--------------GA---T----GT---------CAT-TC-T-------GTT---G------TGGTTCGAT---GT--C-----ATTC--TGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACAT-T-T-------------TGATATGGTT--A---CAT------T-CCGTTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TG-GTTCA-TT-GTCATAATTATTTGT-T-----------------AT--CGT--CCTTATGT--------GGCTCA-ATGTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CCCTTTACATTA-CGGTGTAG-----T-TC--------------GG---T----AT---------CAT-CC-T-------TAA---A------TGGTTCAAA---GT--C-----ATTC--TGA-T--GTG-------------G---TTACT-TTACAT-T-A-------------TGATGTGGTT------CGT------TATCAGTCTTAAAA-TGTGG--Ta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                         atggtgATGAAACGTCAAACACGACTTTGATG-GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-T--CC------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATGA-TGATGTAG-----T-TC--------------GA---T----GT---------CAT-TC-T-------GTT---G------TGGTTCGAT---GT--C-----ATTC--TGA-T------------------G---NNNNN-NNNNNT-T-C-------------TGATGTGGTtcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atT--------GGTTAC-ATTCCATTCTG-----AC-GAG---------GT-CACTTTACACTA-TGATGTGG-----TATC--------------T----T----AT---------CAT-TC-G-------GCG---G------TGGTAACTT---GT--C-----ATTC---GACT--GTG-------------T---TAACA-TGTCAT-T-A-------------GGCAGTGGTT--G---TTT------A-TCATTCc
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caactAT-TT-T-------GGTTATA------TGGTTACAT---TC--C-----ATTC--TGA-C--GAA-------------G---TCACT-TTACAT-T-A-------------TGATGTGGTA--G---CTT------G-TCATTCG---GC-GGTAG--TAACT-
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TATGTGATTCTATGTTTTTTTAACCTGTTATTTAACCAGTACACTGTCA






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Reference ( family-1219 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAT--TCTGNTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTGG-----T-TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-------T-G---ATG-TGGTTN---CNTTTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTN---CNTT-TC--ATTCT---GA-CGTGG--TCACT-TTACATTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACAACAAACTCGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------G---------TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATGGAACGCCTAGCAAGCCTTTAGTG--GTTAACTT-TAC--TACGATGTGG-TCA------------CATTACA-----TAATGT--------GGTTCC-TGTTTATTCTG-----A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---------CAT-T----T-------T-G---ACA-TGGTTA---CATTCC-----ATTCCGA-C--TAG-------------T---TCACT-TTAATTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTG-TC--ATTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cattttaGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--ATCCA-TT-TTCATTCTGATGTTG-TCA------------AATTACAT--TATAATAT--------CGTTAC-ATTTCATTggcggtg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA--GATTA-TT-AACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTCAC-TTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t---------CAT-T----T-------T-G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTATGA-T--ATG-------------G---TCACT-TTGCATT-A-------------TTATGTGGTTA---CCCG-TC--ATTCa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTAG-TT-TTTATTATGATGTGG-TCC------------GATGACAT--TATGCTGA--------GGTTAC-TTggc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG--GTTCA-TT-TCCGTTCCGATGGTG-TCACTTGCATCACGAGATGGTGT--CCTACTGTTCGGAAAAGGTCAC-TTTATGTTATG-----GC-GTTCTTCTTTTTGT-CACTCTACATTA-AGATGTGGGTCCAT-TC--------------C-------------ATTCCTGT---------CGT-T----C-------T-G---ATA-TGGTCA---CTTTTC-----ATTATGA-T--CTG-------------A---TCACT-TTATAT--A-------------TGATGTGGTTC---ACTT-TC--GTTTT---GA-T-TGT--TTCCTCTTACATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgTCA-CTCTACATTAAGATGTGGGTC------------------CAT--TCCATT---------------C-CTGTCGTTCTG-----AT-ATG---------GT-CACTTTTCATTA-TGATCTGA-----T-C-----------------------------AC----TT---------TATAT----A-------T-G---ATG-TGGTTC---ACTTTC-----GTTTTGA-T---TG-------------T---TTCCTCTTACATT-A-------------TGATGGGATTGTATCTTT-TT--ATTC----GT-TGTTG--TCACT-TTTCATAATgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgTGTCGT--TCTGATAT--------GGTCAC-TTTTCATTATG-----AT-CTG---------AT-CACTTTATAT-A-TGATGTGG-----T-TCACTTTCGTTTT---G-------------ATT---GTTTCCTCTTACAT-T----A-------T-G---ATG-GGATTGTATCTTTTT-----ATTC-GT-T--GTT-------------G---TCACT-TTTCATA-A-------------TATCGTTATCA---CTTT-TC--ATTCT---GA-TGTGGTTTCATT-TTatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattccCAT--TCTGATGT--------GGTTTCATTTTCGCTATG-----AC-GTT---------GT-CGCTGTAcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|20                         : tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattcctgtcgttctgatatggtcacttttcattatgatctgatcactttatatatgatgtggttcactttcgttttgattgtttcctcttacattatgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttGGAACGCTAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGAT---G-TCA------------GATAACAT--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCgaattcgtata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTT-TGATGTGA-----T-TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-------T-G---ATG-AAGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--G
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATTTTG-----AT-GTG---------ATTCGATGT-CATTC-TGATGAAG-----T-TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-------T-G---ATG-NNNNNN---NNNNTG-----ATnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GA-T--GTG-------------G---TCACT-TAACATT-A-------------TGATGTGGTTT---ATTT-AT--ATTCT---CA-TTTGG--TCACT-TTACATg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TAACATCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---------CAT-T----C-------T-A---TTG-TGGTTC---GATGTC-----TTTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATGTga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---------CAT-T----T-------T-G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-A-------------TGATga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taATGGAACGCTACACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGCAGTGG-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCAAACACAACTTTGATG--GTTTA-TT-TTCATTCTGATGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaACATTA-TGATATGG-----T-TC--------------C-------------AT----AC---------CAT-T----TA------T-G----TG-TGATAT---CCTTTT-----TTTCTGA-T--ATG-------------G---TCACT-TAACGTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTT-AT--ATTAT---GA-TGCGG--TC-CT-TTGCACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--TCTGATAT--------GGTCAC-TTAACGTTATG-----AT-GTG---------GT-AGCTTTATATTA-TGATGCGG-----T-CC--------------T-------------TT----G----------CAC-T----T-------TAG---A----GCTTC---CTTTTC-----ATTTTGA-T--GTT-------------T---TCATT-TTGCGTT-A-------------TGATGTGGTTC---CTTT-CA--ATTC----GA--GTGG--Tttagagcttccttttcattttgatgttttcattttgcgttatgatgtggttcctttcaattcgagtggtgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatccttttt-TT-TATATTATGATGCGG-TCC------------TTTG-CAC--TTTA--GA--------GCTTCC-TTTTCATTTTG-----AT-GTT---------TT-CATTTTGCGTTA-TGATGTGG-----T-TCCTTTCAATTCGAGTG-------------GT----GT----------AT-C----CTTTTATTT-G---GTG-TTGTCC---CTTTTC-----ATTT----T--ATG-------------GCTATCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTT---CATA-TC--ACTGT---GA-CGTTG--TCACT-TTgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatcctttttttctgatatggtcacttaacgttatgatgtggtagcCATTCTGATGTGG-TCA------------GACGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTGG-----T-TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-------T-G---ATA-AGGT-----CGTTTT-----AT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTattt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTTTGATGTGG-TCT------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGA-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTAG-----T-TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-------T-G---TTG-TGGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--GTTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TG--GTTCA-TT-GTCATAATTATTTGT-T---------------AT--CGT--CCTTATGT--------GGCTCA-ATGTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CCCTTTACATTA-CGGTGTAG-----T-TC--------------G-------------GT----AT---------CAT-C----C-------T-T---AAA-TGGTTC---AAAGTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TTACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTT----CGTTATC--AGTCTTAAAA-TGTGG--Ta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atggtgATGAAACGTCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCC------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATGA-TGATGTAG-----T-TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-------T-G---TTG-TGGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T------------------G---NNNNN-NNNNNTT-C-------------TGATGTGGTtcaa
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                       aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttCGT--TTTGATGT--------GCTCAC-TTTTCATTATG-----AT-GTG---------AT-CGCTTTACATTA-TG--GTGA---------------------------------G-------------AT----GC-------------T----C-T-------G---ATG-TGGTTC---CCGTTC-----ATCTTGA-T--GTT-------------T---TTATT-TTACATT-A-------------CGATAAGGTTC---CTTT-AC--ATTCT---GA-TATGG--TTAcgataaggttcctttacattctgatatggttatgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                                  aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttTTTGATGT-GCTCACTT-TTCATTATGATGTGA-TCGCTTTACATTAT-GGTGAGATGCTCTGATGT--------GGTTCC-CGTTCATCTTG-----AT-GTT---------TT-TATTTTACATTA-CGATAAGG-----T-----------TC--------------C-------------TT----TA---------CAT-T----C-T-------G---ATA-TGGTTA---TGTTTTGTTAGGTTGTGA-TTCGTGTTGGAACGATAGTG---TCACT-TGACCTG-A-------------TGATGTTGT-----CCTT-TCCAAATAT---GA-TGTCG--T---T-TTAtgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                              aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgtCTCTGATGTGGTTCC-CG-TTCATCTTGATGTTT-TTA------------TTTTACAT--TACGATAA--------GGTTCC-TTTACATTCTG-----AT-ATG---------GT-TATGTTTTGTTA-GGTTGTGA-----T-----------TC--------------GTGTTGGAACGATAGT----GT---------CAC-TTGACC-T-------G---ATGATGTTGT---CCTTTCCA---AATATGA-T--GTC-------------G---T---T-TTA--------------------GGTGTTGTCT---CTTT-TC----TTT---GATCGTTA--TCACT-TTACATTATggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                               aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgG--GTTCC-TT-TACATTCTGATATGG-TTA--------------TG---T--TTTGTTA---------GGTTGT-GATTCGTGTTGGAACGATAGTG----------T-CACTTGACCTGA-TGATGTTG-----T-----------CCTTTCCAAATAT---G-------------AT----GT---------CGT-T----T-TA------G---GTG-TTGTCT---CTTTTC-------TTTGA-TC-GTT-------------A---TCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTT---TATT-TC--ATTAC---GA-AGTTG--TCACT-TTATAgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|10                         :                   aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgctctgatgtggttcccgttcatcttgatgtttttattttacattacgataaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------AGTTACTTTTTCATTCGG-----AT-GGG---------GT-CACTTTactcatata
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCAAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-CTTTCATTCAG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACAACAAACTCGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------G---------TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATGGAACGCCTAGCAAGCCTTTAGTG--GTTAACTT-TAC--TACGATGTGG-TCA------------CATTACA-----TAATGT--------GGTTCC-TGTTTATTCTG-----A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---------CAT-T----T-T-------G---ACA-TGGTTA---CATTCC-----ATTCCGA-C--TAG-------------T---TCACT-TTAATTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTG-TC--ATTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cattttaGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--ATCCA-TT-TTCATTCTGATGTTG-TCA------------AATTACAT--TATAATAT--------CGTTAC-ATTTCATTggcggtg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA--GATTA-TT-AACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTCAC-TTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---------CAT-T----T-T-------G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTATGA-T--ATG-------------G---TCACT-TTGCATT-A-------------TTATGTGGTTA---CCCG-TC--ATTCa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTAG-TT-TTTATTATGATGTGG-TCC------------GATGACAT--TATGCTGA--------GGTTAC-TTggc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG--GTTCA-TT-TCCGTTCCGATGGTG-TCACTTGCATCACGAGATGGTGT--CCTACTGTTCGGAAAAGGTCAC-TTTATGTTATG-----GC-GTTCTTCTTTTTGT-CACTCTACATTA-AGATGTGGGTCCAT-----------TC--------------C-------------ATTCCTGT---------CGT-T----C-T-------G---ATA-TGGTCA---CTTTTC-----ATTATGA-T--CTG-------------A---TCACT-TTATAT--A-------------TGATGTGGTTC---ACTT-TC--GTTTT---GA-T-TGT--TTCCTCTTACATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgTCA-CTCTACATTAAGATGTGGGTC------------------CAT--TCCATT---------------C-CTGTCGTTCTG-----AT-ATG---------GT-CACTTTTCATTA-TGATCTGA-----T-----------C-----------------------------AC----TT---------TATAT----A-T-------G---ATG-TGGTTC---ACTTTC-----GTTTTGA-T---TG-------------T---TTCCTCTTACATT-A-------------TGATGGGATTGTATCTTT-TT--ATTC----GT-TGTTG--TCACT-TTTCATAATgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgTGTCGT--TCTGATAT--------GGTCAC-TTTTCATTATG-----AT-CTG---------AT-CACTTTATAT-A-TGATGTGG-----TTCACTTTCGTTTT--------------G-------------ATT---GTTTCCTCTTACAT-T----A-T-------G---ATG-GGATTGTATCTTTTT-----ATTC-GT-T--GTT-------------G---TCACT-TTTCATA-A-------------TATCGTTATCA---CTTT-TC--ATTCT---GA-TGTGGTTTCATT-TTatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattccCAT--TCTGATGT--------GGTTTCATTTTCGCTATG-----AC-GTT---------GT-CGCTGTAcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|20                         : tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattcctgtcgttctgatatggtcacttttcattatgatctgatcactttatatatgatgtggttcactttcgttttgattgtttcctcttacattatgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttGGAACGCTAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGAT---G-TCA------------GATAACAT--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCgaattcgtata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTT-TGATGTGA-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-AAGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--G
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATTTTG-----AT-GTG---------ATTCGATGT-CATTC-TGATGAAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-NNNNNN---NNNNTG-----ATnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-T--GTG-------------G---TCACT-TAACATT-A-------------TGATGTGGTTT---ATTT-AT--ATTCT---CA-TTTGG--TCACT-TTACATg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TAACATCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------CAT-T----C-T-------A---TTG-TGGTTC---GATGTC-----TTTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATGTga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------CAT-T----T-T-------G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-A-------------TGATga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taATGGAACGCTACACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGCAGTGG-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCAAACACAACTTTGATG--GTTTA-TT-TTCATTCTGATGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaACATTA-TGATATGG-----T-----------TC--------------C-------------AT----AC---------CAT-T----TAT-------G----TG-TGATAT---CCTTTT-----TTTCTGA-T--ATG-------------G---TCACT-TAACGTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTT-AT--ATTAT---GA-TGCGG--TC-CT-TTGCACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--TCTGATAT--------GGTCAC-TTAACGTTATG-----AT-GTG---------GT-AGCTTTATATTA-TGATGCGG-----T-----------CC--------------T-------------TT----G----------CAC-T----T-TA------G---A----GCTTC---CTTTTC-----ATTTTGA-T--GTT-------------T---TCATT-TTGCGTT-A-------------TGATGTGGTTC---CTTT-CA--ATTC----GA--GTGG--Tttagagcttccttttcattttgatgttttcattttgcgttatgatgtggttcctttcaattcgagtggtgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatccttttt-TT-TATATTATGATGCGG-TCC------------TTTG-CAC--TTTA--GA--------GCTTCC-TTTTCATTTTG-----AT-GTT---------TT-CATTTTGCGTTA-TGATGTGG-----T-----------TCCTTTCAATTCGAGTG-------------GT----GT----------AT-C----C-TTTTATTTG---GTG-TTGTCC---CTTTTC-----ATTTTA------TG-------------GCTATCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTT---CATA-TC--ACTGT---GA-CGTTG--TCACT-TTgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
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gi|1                          :                                                                                                                                                  aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttTTTGATGT-GCTCACTT-TTCATTATGATGTGA-TCGCTTTACATTAT-GGTGAGATGCTCTGATGT--------GGTTCC-CGTTCATCTTG-----AT-GTT---------TT-TATTTTACATTA-CGATAAGG-----T-----------TC--------------C-------------TT----TA---------CAT-T----C-T-------G---ATA-TGGTTA---TGTTTTGTTAGGTTGTGA-TTCGTGTTGGAACGATAGTG---TCACT-TGACCTG-A-------------TGATGTTGT-----CCTT-TCCAAATAT---GA-TGTCG--T---T-TTAtgttttgttaggttgtgattcgtgttggaacgatagtgtcacttgacctgatgatgttgtcctttccaaatatgatgtcgttttaggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                                                                              aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgtCTCTGATGTGGTTCC-CG-TTCATCTTGATGTTT-TTA------------TTTTACAT--TACGATAA--------GGTTCC-TTTACATTCTG-----AT-ATG---------GT-TATGTTTTGTTA-GGTTGTGA-----T-----------TC--------------GTGTTGGAACGATAGT----GT---------CAC-TTGACC-T-------G---ATGATGTTGT---CCTTTCCA---AATATGA-T--GTC-------------G---T---T-TTA--------------------GGTGTTGTCT---CTTT-TC----TTT---GATCGTTA--TCACT-TTACATTATggtgttgtctcttttctttgatcgttatcactttacattatgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|1                          :                                                                                               aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgG--GTTCC-TT-TACATTCTGATATGG-TTA--------------TG---T--TTTGTTA---------GGTTGT-GATTCGTGTTGGAACGATAGTG----------T-CACTTGACCTGA-TGATGTTG-----T-----------CCTTTCCAAATAT---G-------------AT----GT---------CGT-T----T-TA------G---GTG-TTGTCT---CTTTTC-------TTTGA-TC-GTT-------------A---TCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTT---TATT-TC--ATTAC---GA-AGTTG--TCACT-TTATAgatgtggttttatttcattacgaagttgtcactttataactcatata
gi|10                         :                   aacacttaacatgacttcggtggttcattttcattccgacgaggtcactttgcattacgagacggtttcttattgttcggataaggtcactatatgttatggcgttcttctttttcattctcatatggtcactcggcgttatgatatgcttcctttccattaatgagtgatttcctttcgttttgatgtgctcacttttcattatgatgtgatcgctttacattatggtgagatgctctgatgtggttcccgttcatcttgatgtttttattttacattacgataaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------AGTTACTTTTTCATTCGG-----AT-GGG---------GT-CACTTTactcatata
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------G---------TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---------CAT-T----T-T-------G---ACA-TGGTTA---CATTCC-----ATTCCGA-C--TAG-------------T---TCACT-TTAATTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTG-TC--ATTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cattttaGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--ATCCA-TT-TTCATTCTGATGTTG-TCA------------AATTACAT--TATAATAT--------CGTTAC-ATTTCATTggcggtg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA--GATTA-TT-AACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTCAC-TTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---------CAT-T----T-T-------G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTATGA-T--ATG-------------G---TCACT-TTGCATT-A-------------TTATGTGGTTA---CCCG-TC--ATTCa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTAG-TT-TTTATTATGATGTGG-TCC------------GATGACAT--TATGCTGA--------GGTTAC-TTggc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG--GTTCA-TT-TCCGTTCCGATGGTG-TCACTTGCATCACGAGATGGTGT--CCTACTGTTCGGAAAAGGTCAC-TTTATGTTATG-----GC-GTTCTTCTTTTTGT-CACTCTACATTA-AGATGTGGGTCCAT-----------TC--------------C-------------ATTCCTGT---------CGT-T----C-T-------G---ATA-TGGTCA---CTTTTC-----ATTATGA-T--CTG-------------A---TCACT-TTATAT--A-------------TGATGTGGTTC---ACTT-TC--GTTTT---GA-T-TGT--TTCCTCTTACATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgTCA-CTCTACATTAAGATGTGGGTC------------------CAT--TCCATT---------------C-CTGTCGTTCTG-----AT-ATG---------GT-CACTTTTCATTA-TGATCTGA-----T-----------C-----------------------------AC----TT---------TATAT----A-T-------G---ATG-TGGTTC---ACTTTC-----GTTTTGA-T---TG-------------T---TTCCTCTTACATT-A-------------TGATGGGATTGTATCTTT-TT--ATTC----GT-TGTTG--TCACT-TTTCATAATgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgTGTCGT--TCTGATAT--------GGTCAC-TTTTCATTATG-----AT-CTG---------AT-CACTTTATAT-A-TGATGTGG-----TTCACTTTCGTTTT--------------G-------------ATT---GTTTCCTCTTACAT-T----A-T-------G---ATG-GGATTGTATCTTTTT-----ATTC-GT-T--GTT-------------G---TCACT-TTTCATA-A-------------TATCGTTATCA---CTTT-TC--ATTCT---GA-TGTGGTTTCATT-TTatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattccCAT--TCTGATGT--------GGTTTCATTTTCGCTATG-----AC-GTT---------GT-CGCTGTAcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|20                         : tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattcctgtcgttctgatatggtcacttttcattatgatctgatcactttatatatgatgtggttcactttcgttttgattgtttcctcttacattatgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttGGAACGCTAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGAT---G-TCA------------GATAACAT--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCgaattcgtata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTT-TGATGTGA-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-AAGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--G
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATTTTG-----AT-GTG---------ATTCGATGT-CATTC-TGATGAAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-NNNNNN---NNNNTG-----ATnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-T--GTG-------------G---TCACT-TAACATT-A-------------TGATGTGGTTT---ATTT-AT--ATTCT---CA-TTTGG--TCACT-TTACATg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TAACATCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------CAT-T----C-T-------A---TTG-TGGTTC---GATGTC-----TTTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATGTga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------CAT-T----T-T-------G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-A-------------TGATga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taATGGAACGCTACACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGCAGTGG-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCAAACACAACTTTGATG--GTTTA-TT-TTCATTCTGATGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaACATTA-TGATATGG-----T-----------TC--------------C-------------AT----AC---------CAT-T----TAT-------G----TG-TGATAT---CCTTTT-----TTTCTGA-T--ATG-------------G---TCACT-TAACGTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTT-AT--ATTAT---GA-TGCGG--TC-CT-TTGCACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--TCTGATAT--------GGTCAC-TTAACGTTATG-----AT-GTG---------GT-AGCTTTATATTA-TGATGCGG-----T-----------CC--------------T-------------TT----G----------CAC-T----T-TA------G---A----GCTTC---CTTTTC-----ATTTTGA-T--GTT-------------T---TCATT-TTGCGTT-A-------------TGATGTGGTTC---CTTT-CA--ATTC----GA--GTGG--Tttagagcttccttttcattttgatgttttcattttgcgttatgatgtggttcctttcaattcgagtggtgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatccttttt-TT-TATATTATGATGCGG-TCC------------TTTG-CAC--TTTA--GA--------GCTTCC-TTTTCATTTTG-----AT-GTT---------TT-CATTTTGCGTTA-TGATGTGG-----T-----------TCCTTTCAATTCGAGTG-------------GT----GT----------AT-C----C-TTTTATTTG---GTG-TTGTCC---CTTTTC-----ATTTTA------TG-------------GCTATCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTT---CATA-TC--ACTGT---GA-CGTTG--TCACT-TTgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatcctttttttctgatatggtcacttaacgttatgatgtggtagcCATTCTGATGTGG-TCA------------GACGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTGG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATA-AGGT-----CGTTTT-----AT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTattt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTTTGATGTGG-TCT------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGA-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---TTG-TGGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--GTTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TG--GTTCA-TT-GTCATAATTATTTGT-T---------------AT--CGT--CCTTATGT--------GGCTCA-ATGTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CCCTTTACATTA-CGGTGTAG-----T-----------TC--------------G-------------GT----AT---------CAT-C----C-T-------T---AAA-TGGTTC---AAAGTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TTACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTT----CGTTATC--AGTCTTAAAA-TGTGG--Ta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atggtgATGAAACGTCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCC------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATGA-TGATGTAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---TTG-TGGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T------------------G---NNNNN-NNNNNTT-C-------------TGATGTGGTtcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atT--------GGTTAC-ATTCCATTCTG-----AC-GAG---------GT-CACTTTACACTA-TGATGTGG-----TA----------TC--------------T--------------T----AT---------CAT-T----C-G-------G---CGG-TGGTAA---CTTGTC-----ATTC-GACT--GTG-------------T---TAACA-TGTCATT-A-------------GGCAGTGGTTG---TTTA-TC--ATTCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCTAACGTGACTTT-----------------CATTCTGATTTGG-CCC------------GATTACGT--TATGATAC--------GATTAC-TTTTCATTCTT-----AC-------------AT-CACTTTTCATTC-AGATGCGA-----T-----------gtcaacggtgacttgtctttcggcagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caactAT-T----T-T-------GGTTATA-TGGTTA---CATTCC-----ATTCTGA-C--GAA-------------G---TCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTG-TC--ATTCG---GC-GGTAG--TAACT-


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG     C  C T             G  ACTTGCATCACGAGA GA  TGC    A   TCGGAAAA      T     G     GAACG  A   CTTCTTTTT  T            A        GTCCA TCCTTTCAATTCGAGTGG                         TGTTTCCTCTTA      A TGAC A TTTATTT GTT   A     GTAT T    GTTAG       C TC   TTGGAACGATAGTG        C       . TGGTGAGATGCTC          GTAT C  A  CA     TAA  TC    TT     C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T      C  . T             .  GCTTTACATTATGG  TA  T      A   .             A     A     .      .   .          .            .        .     TCGTGTTGGAACGATAG                          TCCTGT            . .    . A       .     .     A    C    CA          . C    GCTA                  .       . .                      C    T  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  ATT             GA  T      A   .             .     A     .      .   .          .            .        .     CCTTTCCAAATATGA                            TT                . .    . A       .     .     C    G    .           . .    A                     .       . .                      C    C  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  AGA             GA  T      A   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCACTTTCGTTTTGA                            GC                . .    . .       .     .     A    C    .           . .    T                     .       . .                      T    T  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  AGA             GA  T      T   .             .     G     .      .   .          .            .        .     TTCC                                       TA                . .    . .       .     .     T    T    .           . .    G                     .       . .                      T    A  .  .      .    A     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  AGA             TA  G      C   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCCT                                       GT                . .    . .       .     .     T    A    .           . .    A                     .       . .                      G    T  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  ACA             TA  G      C   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCCA                                       GT                . .    . .       .     .     A    A    .           . .    T                     .       . .                      A    C  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  AAA             GA  G      C   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCGA                                       TT                . .    . .       .     .     A    T    .           . .    G                     .       . .                      C    C  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . T             .  AGA             GA  T      C   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCGA                                       GT                . .    . .       .     .     A    C    .           . .    A                     .       . .                      A    T  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  CGA             GG  G      A   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCCA                                       GT                . .    . .       .     .     C    T    .           . .    T                     .       . .                      T    T  .  .      .    C     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . T             .  AGA             GT  T      A   .             .     A     .      .   .          .            .        .     CCTT                                       AC                . .    . .       .     .     C    A    .           . .    G                     .       . .                      A    T  .  .      .    C     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . C             .  CTT             AA  T      C   .             .     G     .      .   .          .            .        .     TCGA                                       GT                . .    . .       .     .     N    N    .           . .    G                     .       . .                      A    A  .  .      .    T     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  AGA             GA  T      C   .             .     G     .      .   .          .            .        .     TCGA                                       GT                . .    . .       .     .     C    A    .           . .    G                     .       . .                      G    A  .  .      .    C     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  TGA             GA  T      C   .             .     A     .      .   .          .            .        .     TCGG                                       GT                . .    . .       .     .     A    A    .           . .    G                     .       . .                      C    T  .  .      .    C     .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  CGA             GA  T      T   .             .     G     .      .   .          .            .        .     TCGA                                       AT                . .    . .       .     .     T    C    .           . .    G                     .       . .                      T    T  .  .      .    T     .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . T             .  CGA             TA  T      A   .             .     A     .      .   .          .            .        .     ATCT                                       GT                . .    . .       .     .     C    T    .           . .    T                     .       . .                      A    A  .  .      .    G     .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  AG              G   T      A   .             .     G     .      .   .          .            .        .     GA                                         AT                . .    . .       .     .     C    T    .           . .    G                     .       . .                      G    A  .  .      .    .     .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      .  . A             .  A               G   C      C   .             .     A     .      .   .          .            .        .     CA                                         G                 . .    . .       .     .     C    G    .           . .    G                     .       . .                      G    G  .  .                         
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Reference ( family-1219 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAT--TCTGNTGT--------GGTTAC-TTTTCGTTCTG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTGG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-TGGTTN---CNTTTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTN---CNTT-TC--ATTCT---GA-CGTGG--TCACT-TTACATTAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACAACAAACTCGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gcATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCA------------G---------TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATGGAACGCCTAGCAAGCCTTTAGTG--GTTAACTT-TAC--TACGATGTGG-TCA------------CATTACA-----TAATGT--------GGTTCC-TGTTTATTCTG-----A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---------CAT-T----T-T-------G---ACA-TGGTTA---CATTCC-----ATTCCGA-C--TAG-------------T---TCACT-TTAATTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTG-TC--ATTC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cattttaGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--ATCCA-TT-TTCATTCTGATGTTG-TCA------------AATTACAT--TATAATAT--------CGTTAC-ATTTCATTggcggtg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cATGGAACTTAAAACACAACTTTGATA--GATTA-TT-AACATTCTGATGTGG-TCA------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTCAC-TTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t---------CAT-T----T-T-------G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTATGA-T--ATG-------------G---TCACT-TTGCATT-A-------------TTATGTGGTTA---CCCG-TC--ATTCa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttaATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTAG-TT-TTTATTATGATGTGG-TCC------------GATGACAT--TATGCTGA--------GGTTAC-TTggc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGAACGCCAAACACGGTTTTGGTG--GTTCA-TT-TCCGTTCCGATGGTG-TCACTTGCATCACGAGATGGTGT--CCTACTGTTCGGAAAAGGTCAC-TTTATGTTATG-----GC-GTTCTTCTTTTTGT-CACTCTACATTA-AGATGTGGGTCCAT-----------TC--------------C-------------ATTCCTGT---------CGT-T----C-T-------G---ATA-TGGTCA---CTTTTC-----ATTATGA-T--CTG-------------A---TCACT-TTATAT--A-------------TGATGTGGTTC---ACTT-TC--GTTTT---GA-T-TGT--TTCCTCTTACATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgTCA-CTCTACATTAAGATGTGGGTC------------------CAT--TCCATT---------------C-CTGTCGTTCTG-----AT-ATG---------GT-CACTTTTCATTA-TGATCTGA-----T-----------C-----------------------------AC----TT---------TATAT----A-T-------G---ATG-TGGTTC---ACTTTC-----GTTTTGA-T---TG-------------T---TTCCTCTTACATT-A-------------TGATGGGATTGTATCTTT-TT--ATTC----GT-TGTTG--TCACT-TTTCATAATgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgTGTCGT--TCTGATAT--------GGTCAC-TTTTCATTATG-----AT-CTG---------AT-CACTTTATAT-A-TGATGTGG-----TTCACTTTCGTTTT--------------G-------------ATT---GTTTCCTCTTACAT-T----A-T-------G---ATG-GGATTGTATCTTTTT-----ATTC-GT-T--GTT-------------G---TCACT-TTTCATA-A-------------TATCGTTATCA---CTTT-TC--ATTCT---GA-TGTGGTTTCATT-TTatcgttatcacttttcattctgatgtggtttcattttcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattccCAT--TCTGATGT--------GGTTTCATTTTCGCTATG-----AC-GTT---------GT-CGCTGTAcgctatgacgttgtcgctgtagaattcgtata
gi|20                         : tgtggaacgccaaacacggttttggtggttcatttccgttccgatggtgtcacttgcatcacgagatggtgtcctactgttcggaaaaggtcactttatgttatggcgttcttctttttgtcactctacattaagatgtgggtccattccattcctgtcgttctgatatggtcacttttcattatgatctgatcactttatatatgatgtggttcactttcgttttgattgtttcctcttacattatgatgggattgtatctttttattcgttgttgtcacttttcataatatcgttatcacttttGGAACGCTAAACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGAT---G-TCA------------GATAACAT--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCgaattcgtata
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CATTT-TGATGTGA-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-AAGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--G
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATTTTG-----AT-GTG---------ATTCGATGT-CATTC-TGATGAAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATG-NNNNNN---NNNNTG-----ATnnnnnnnnnntgatg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GA-T--GTG-------------G---TCACT-TAACATT-A-------------TGATGTGGTTT---ATTT-AT--ATTCT---CA-TTTGG--TCACT-TTACATg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TAACATCAT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------CAT-T----C-T-------A---TTG-TGGTTC---GATGTC-----TTTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATGTga
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--ATTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTAT
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---------CAT-T----T-T-------G---ATG-TGGTTA---CATTCC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-A-------------TGATga
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taATGGAACGCTACACACGACTTTGATG--GTTCA-TT-TACATTCTGCAGTGG-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCCAAACACAACTTTGATG--GTTTA-TT-TTCATTCTGATGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaACATTA-TGATATGG-----T-----------TC--------------C-------------AT----AC---------CAT-T----TAT-------G----TG-TGATAT---CCTTTT-----TTTCTGA-T--ATG-------------G---TCACT-TAACGTT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTT-AT--ATTAT---GA-TGCGG--TC-CT-TTGCACT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--TCTGATAT--------GGTCAC-TTAACGTTATG-----AT-GTG---------GT-AGCTTTATATTA-TGATGCGG-----T-----------CC--------------T-------------TT----G----------CAC-T----T-TA------G---A----GCTTC---CTTTTC-----ATTTTGA-T--GTT-------------T---TCATT-TTGCGTT-A-------------TGATGTGGTTC---CTTT-CA--ATTC----GA--GTGG--Tttagagcttccttttcattttgatgttttcattttgcgttatgatgtggttcctttcaattcgagtggtgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatccttttt-TT-TATATTATGATGCGG-TCC------------TTTG-CAC--TTTA--GA--------GCTTCC-TTTTCATTTTG-----AT-GTT---------TT-CATTTTGCGTTA-TGATGTGG-----T-----------TCCTTTCAATTCGAGTG-------------GT----GT----------AT-C----C-TTTTATTTG---GTG-TTGTCC---CTTTTC-----ATTTTA------TG-------------GCTATCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTTT---CATA-TC--ACTGT---GA-CGTTG--TCACT-TTgtatccttttatttggtgttgtcccttttcattttatggctatcactttacattatgatgtggtttcatatcactgtgacgttgtcacttt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       acattatgatatggttccataccatttatgtgtgatatcctttttttctgatatggtcacttaacgttatgatgtggtagcCATTCTGATGTGG-TCA------------GACGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGTGG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---ATA-AGGT-----CGTTTT-----AT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTattt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tATGGAACGCCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTTTGATGTGG-TCT------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGA-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATTA-TGATGTAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---TTG-TGGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TCATT-TTACATT-T-------------TGATATGGTTA---CATT-CC--GTTCT---GA-CGAGG--TCACT-TTACATTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TG--GTTCA-TT-GTCATAATTATTTGT-T---------------AT--CGT--CCTTATGT--------GGCTCA-ATGTCATTCTG-----AT-GTG---------GT-CCCTTTACATTA-CGGTGTAG-----T-----------TC--------------G-------------GT----AT---------CAT-C----C-T-------T---AAA-TGGTTC---AAAGTC-----ATTCTGA-T--GTG-------------G---TTACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTT----CGTTATC--AGTCTTAAAA-TGTGG--Ta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atggtgATGAAACGTCAAACACGACTTTGATG--GTTTA-TT-TACATTCTGATGTGG-TCC------------GATGACAG--TCTGCTGT--------GGTTAC-TTTTCATTCGG-----AT-GTG---------GT-CACTTTACATGA-TGATGTAG-----T-----------TC--------------G-------------AT----GT---------CAT-T----C-T-------G---TTG-TGGTTC---GATGTC-----ATTCTGA-T------------------G---NNNNN-NNNNNTT-C-------------TGATGTGGTtcaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atT--------GGTTAC-ATTCCATTCTG-----AC-GAG---------GT-CACTTTACACTA-TGATGTGG-----TA----------TC--------------T--------------T----AT---------CAT-T----C-G-------G---CGG-TGGTAA---CTTGTC-----ATTC-GACT--GTG-------------T---TAACA-TGTCATT-A-------------GGCAGTGGTTG---TTTA-TC--ATTCc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAACGCCTAACGTGACTTT-----------------CATTCTGATTTGG-CCC------------GATTACGT--TATGATAC--------GATTAC-TTTTCATTCTT-----AC-------------AT-CACTTTTCATTC-AGATGCGA-----T-----------gtcaacggtgacttgtctttcggcagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caactAT-T----T-T-------GGTTATA-TGGTTA---CATTCC-----ATTCTGA-C--GAA-------------G---TCACT-TTACATT-A-------------TGATGTGGTAG---CTTG-TC--ATTCG---GC-GGTAG--TAACT-
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Unaligned ( gi|27 ): TATGTGATTCTATGTTTTTTTAACCTGTTATTTAACCAGTACACTGTCA