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gi|23                         :               tattttttcTTCT-AT-TCACATCAAATATTTACAAAGTTTTGCATGTGTAATTTACAGCATTGACATA----T----------------TTGAGATA--GAATGTACATACA----TA--TATA--TACACATAT--ATTATTACA-AT-CATAT-ATA
gi|19                         :                            -AT-TTATATCAAATATCAACAAAGTTTTGCTTGTATAATTTACAGCACTGAC---------------------CCTTTTT--------AT--ACACACA----TA--TATG--TTTACACAT--ACTATTACA-AT-CATAT-ATATATAA-TTTATATA-TT---TTA-A------TTATG----TTTTTCGGAATAATGCTT-T-C------CATAATATAAAGCTATT
gi|17                         :                                                                                                               TG--AAAA--ACA-AAA----GA--TATG--GTCAAGTAT-CATTAT---------ATAT-ATATGTTACTTT---T--TT---TTA-AA----GGTTTG----TTTTTCGGAAATATGCTT-T-CGCTTTCTATAATATATGGCTTTTCACATATCGCTCGTAATA-ACTCT-TA-AT---------A-GTAACCCTATAAAAGAGATGTCACTT-TAGTTACAAAATTAAAGTATTTATTTAATGC-AAC--T---------A---T-TTTT--T-------AATAATAtg
gi|15                         :                                                                                                                                                         ACTATTACA-AT-CATATTATATACTA-TTTT-AT--TT--------------GT--G----TC---CGGAATTATGCTT-T-C------TATAATTTAAGGTTATTCACATATCGCGAGTAATATTC-CT-GC-ATT-----------CAAACCTATAATATAGATGTTACTA-AAGTTACAAAACTTAAATATTTATTTGATG
gi|10                         :                                                                                 catacagcattgacaaattttagatagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncCA-AT-CATAT-ACATA-------A-AT--AT---TTA-AAAAAAGGTTTG----TTTTTCGGAATTATGCTT-T-T------TATATTATAAAGCTGTTATCATATCGCTAGTAATATGC-AT-TA-AT---------A-GTAAACCTATACTATAGATGTCCCTA-AAGTTACAGAACAAAAATATTTATTTGATGCAACC-ATTTTGTTTTTA---T--TTT--T-------AATTATAGAAGGATAGCTTAAAGATGTTTAGAATAGAA-ACAAAGAGGA------TCGA---T-----AGTGAAAG----GGTA-----------------------ATGTC-TC-GGT----TG--TT-TTTTTTAAA--TGTTTATTTT----GAAGA-TAT--------TTTTTCTA-------ACAT---AGCA-----TTTTAG-AAATTAAAAGGTGTCCATTTCCGGTTATGTATTTCTAATTTATC-TT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                  TATGCTT-T-T------TATGAT-TAAGGCTATTCGCATATCGTTAGTTATATTC-AC-TA-AT---------A-GTAAATCTATAATATAGATGTCCCTT-AAGCTGCAAAACTTAAGGATTTATTTGTTTCAAAC-AT-------------T-TTTT--T-------AACTATAGGA------------GATGTTTAGAACA-GACACAGAGAGGA------TCGACAGTGACAAAGTGAAAGTTGTAGTTGA---TGAA----AATTGCCAAGATGTC-TC-GGT----T---GT-TTTTTTAAA--CGTTTATATT----GA---------------------------------------CA-----TCTTAG-AAATTGATAGATGCCCATTTTCAGTTATGTATTTCTAACTTATC-TTTCAAATTGTTA-AAAGCGATGCG-TTTTTCAATT--TCAA----TTC----TTTCTTTCATATATTGTT-T-AAA-ATATTTTAACATGG--TGTTGTATTT----ATATTGTTGCTTCTAAAAATAAAG-TATTTACGGTCAATT---ATAAT-AAATTGGT-T----GTGCATTTTTGTTAACATTTCCCTTTTATACCA-ATGTAACAG
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                       taatatgtttttatttacatcaaacatttatacagttttgtacatgtaatttacggcaatgaaatatttatgatagaacacacatatgtatacacataataatacaatcatagtgtcttgtttacatggttttagTATAGGAGGATAGCTTATAGATGTTTAGATTAGAA-ACAAAGATGG------TCAATAGTGAAAAAGTAAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTC-TC-GTTGGTGT---TT-TTTTTTTAAAACATTTATTTT----TAAGA-TATTATTTTC-T------A-------ACAT---AACA-----TAATAG-AAATTAAAGGT-GCCCACTTCTGGTCATGTATTTCTAATTTATCTTTT------GTTA-AGAGTGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA----TAC----TTTTGTTCAAATAGGTTT-TAAAA-ATATTTAACCATGG--GGTTGTATTTTATAATATATTTGCTTCTGAAAATAAAGTTATTTACCACTTATT---ATA
gi|16                         :                                                             tccaataatatgtttttattcacatcaaacatttacaagttttgcatttataatttagaggactgacatatttttatataatacacacatagttttacaatcatatatatataaaaaaaatttaaggtatgtttttcggaattatgctttctataatataaggctatttacatattactagtaatattcatatagtaaaccagtcctataatacagatgtccctaaagttacaaaacttaggtatctatttgatgcaaatattttttttataattataggaggatatttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaataatacaaaatattgAGGAAGATAGCTTAAA-ATGTTTAGAA-A-AG-A-AAATAAGGCCTGGATCGATAATTAAAAAGTGAAAGTTGTAGTA------GAA----AACTACCAAGATGAC-TCAGTTGGA-T---TT-TGTTTTGAAAAnnnnnnnnnnattttt
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1200 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAAACATTTACAAAGTTTTGCATGTATAATTTACAGCACTGACA------TAT--------------A----TTT--TTT---A-TAGA----A--TACA---ACATA----TACA--N-ACACATAT-TATTATTACAATCAT-A-TATAT-A--T-AT-TT-A---AT--TTT-T---A-AAGGTNTG--TTTTTCGGAATTATGC-TT-TC------TATAATA-TAAGGCTATTCACATATCGCTAGTAATA--T-CA-T-TA-ATTA-----AGTAA-A-----CCTATAATATAGATGTCCCTAAAGT-TACAAAACTAAAGTATTTATTTGATGCAAACA---TA-T--T--------TTT--T-------AA-TTATAGGAGGATAGCTTAGAGATGTTTAGAATAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTGAAAAAGTGAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTC-TC-G-T---T---G--TTTT-TTTTTAAAAACGTTTATTTTGAAGATA--TT-TTTTCTAACAT---AACA-----TA----TT--AGAAATTAAAAGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGT-ATTTCTAATTTATC-T------TTGTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTNTTTTNTTCAAAT-A-GT-TT-T-AAA-ACATTTAAACATGGAGTTGTAT----TNATGTACTTGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCGCTTATTATAA---TAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTGTAAACGTTTCCCTTTTACACCAAANGTAACAGTTAAAAG--ATCAAANGATATGTTAATATTTAAATTTGAT--AAAAAGTGTTTNGATNTTACNGACCAAAACTGTTGAGTATTTTGACATTCCC-AAAACTATTATTTACCGTTTTAATATAACTACTGCAAACCTCACA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCCCAAATAATACGTTTTT-AT-ACAGATCA-----TTACATAGTTTTACATGTATAATTTACAGCACTGACA------TATCCGAGATAGANNNNN----NNN--NNN---N-NNNN----N--NNNN---NNNNN----NNNN--N-NNNNNNNN-NNNNNNNACACACAC-A-CACAT-A--T-AT-AT-ATATAT--ATT-T---G-AAAGTTTG--TTATTCGGAATTATGT-TT-TC------TATAATG-TAAGGCTACT---ATA--------AAT----------------------AGTAA-A-----CCTATGATATAGATGACCCTAAAGT-TACAAAACTAAAGTATTAATTTGATGCAAACC---AA-T--T--------TGT--T-------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTTTTC--AAGTATATGTCTTT-AT-TCACATCAAATATTT--------TTGCATGTATAATTTACAACACTGACA------TA-------------------------------A-TAGA----A--TACAC--ACATA----TACA--C-ACACATAC-TATTAT---AGTCAT-A-AATAT-A--T-A---------AT--TTT-T---ATAAGGTTTG--TTTTTTCGAAATATGC-TT-TC------T-TAATA-TAAGGCTATTCACATTTCGCTAGTAATA--TTCA-TGTA---TACCGGTAGTAA-A-----CCTAGAATATAGATGTCACTAAAGT-TACAAAACTTCAGTATTTATTTGATGCGAACA---ttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAATATTTTTTT-AAAGAAAATCAAACATTTACAAAGTTTTTCATGTATACGTTACAGCACTGACA------TAT--------------T----TCA--GCT---A-TAAA----A--CACGT--ACACA----CACA--C-GCACACACATACTATTACAACCAT-A-T---------------------T--TTT-T---A-AAGATA-----TTTTCGGAATTATG---T-TT------TA----A-TAAGGCTGTTCACATATCGCTAGTAATA--T----T-TA-TTTAT----AGTAA-A-----CCTATAATATAGATGT-------GTCTACAAGACTATAGTATTTATTTGATACAAGCC---TA-T--G--------TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttgTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTAAATT-------------------------GAAT-G--------------CATTTAAACATGGGGAAGTGT----TAATGTA-TTGCTTCTGAAGATAAA--------------------A---CGAAATCGA----TAAGCGCA-TTTCCTTTACGTTTTTCATTTACACCAAAGGTAATAGTTAAAAG--ATTAAAAGATACGTGAATATATAAATT-----------GTATTTAAATGTTACA-ACCAAAACTGTTGA-----CTGA-ATTTCC-GAA------GTTTGATGTTTTAA-ACAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTATTACAATCAT-A-T-TAT-A--T-AC-T------AT--TTT----------ATTTG--TGTC-CGGAATTATGC-TT-TC------TATAATT-TAAGGTTATTCACATATCGCGAGTAATA--T-TC-C-TGCATT--------CAA-A-----CCTATAATATAGATGTTACTAAAGT-TACAAAACTTAAATATTTATTTGATGgaatttcaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catacagcattgacaaattttagatagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGGAAGATAGCTTAAA-ATGTTTAGAAAAGAAAATAAGGCCTGGATCGATAATTAAAAAGTGAAAGTTGTAGTA------GAA----AACTACCAAGATGAC-TCAG-T---T---GGATTTTGTTTTGAAAAAC--------------TA--GT-ATTTCTAACAT---TATC-----TA-----A--AAAAAAAAAAAGGTGACTAATTCAACAGTAACATGTGAATTC-AATTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCATTA-TATAT-A--T-ATGTT-A---CT--TTT-TTTTA-AAGGTTTG--TTTTTCGGAAATATGC-TT-TCGCTTTCTATAATA-TATGGCTTTTCACATATCGCTCGTAATAACT-C--T-TA-AT-------AGTAA-C-----CCTATAAAAGAGATGTCACTTTAGT-TACAAAATTAAAGTATTTATTTAATGC-AAC----TA-T--T--------TTT--T-------AA-TAATAaaaagctattgtataaatgtttcgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaaaaacaaaagatatggtcaagtTAATATGTTTTT-AT-TTACATCAAACATTTATACAGTTTTGTACATGTAATTTACGGCAATGA-A-------AT--------------A----TTT--ATG---A-TAGA----A--CAC----ACATA----TGTA--T-ACACATA---A-TAATACAATCAT-AGTGTCT----T-GT-TT-AC--ATGGTTT-T---A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTATTTACATATTGTTA-TACTA--T----------TT-------GTA----------TATGGTA--GATATCTCTC-------CAAAACTAAAACATTTGTTGGATGgctatttacatattgttatactatttgtatatggtagatatctctccaaaactaaaacatttgttggatg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                            taatatgtttttatttacatcaaacatttatacagttttgtacatgtaatttacggcaatgaaatatttatgatagaacacacatatgtatacacataataatacaatcatagtgtcttgtttacatggtttta-AT-TTATATCAAATATCAACAAAGTTTTGCTTGTATAATTTACAGCACTGAC------------------------C----CTT--TTT---A-T-------A--CAC----ACATA----TATG--T-TTACACA--TACTATTACAATCAT-A-TATAT-A--TAAT-TT-AT--ATA-TTT-T---A-A--TTATG--TTTTTCGGAATAATGC-TT-TC------CATAATA-TAAAGCTATT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAAACATTTACAA-GTTTTGCATTTATAATTTAGAGGACTGACA------TAT---------------------T--TTT---A-TATA----A--TACA---------------------CACATA---GTT-TTACAATCAT-A-TATAT-A--T-AA-AA-A---AA--ATT-T---A-A-GGTATG--TTTTTCGGAATTATGC-TT-TC------TATAATA-TAAGGCTATTTACATATTACTAGTAATAT-T-CA-T----AT-------AGTAA-ACCAGTCCTATAATACAGATGTCCCTAAAGT-TACAAAACTTAGGTATCTATTTGATGCAAATA---TT-T--T--------TTTTAT-------AA-TTATAGGAGGATAtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTAATACAAA-A---TA-T--T--------GT----------------ATAGGAGGATAGCTTATAGATGTTTAGATTAGAAACAAAGA---TGGTCAATAGTGAAAAAGTAAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTC-TC-G-TTGGT---G--TTTT-TTTTTTAAAACATTTATTTTTAAGATA--TTATTTTCTAACAT---AACA-----TA----AT--AGAAATT-AAAGGTGCCCACTTC--TGGT--CATGT-ATTTCTAATTTATCTT------TTGTTA-AGAGTGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TACTTTTGTTCAAAT-AGGT-TT-TAAAA-ATATTTAACCATGGGGTTGTATTTTATAATATATTTGCTTCTGAAAATAAAGTTATTTACCACTTATTATAtttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaataatacaaaatattgtataggaggatagcttatagatgtttagattagaaacaaagatggtcaatagtgaaaaagtaaaagttgtagtagaagatgaaaattgccaagatgtctcgttggtgttttttttttaaaacatttatttttaagatattattttctaacataacataatagaaattaaaggtgcccacttctggtcatgtatttctaatttatcttttgttaagagtgatgtgtttttcaatttcaatacttttgttcaaataggttttaaaaatatttaaccatggggttgtattttataatatatttgcttctgaaaataaagttatttaccacttattatannnnnnnnnnattttt
gi|20                         : tccaataatatgtttttattcacatcaaacatttacaagttttgcatttataatttagaggactgacatatttttatataatacacacatagttttacaatcatatatatataaaaaaaatttaaggtatgtttttcggaattatgctttctataatataaggctatttacatattactagtaatattcatatagtaaaccagtcctataatacagatgtccctaaagttacaaaacttaggtatctatttgatgcaaatattttttttataattataggaggatatttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaaTAATATGTTTTT-CT-TCATATCAATTATTTACAAATTTGTGCAAGTATAACTTACGACAATGGC--------AT--------------A----TTT--TAG---A-TAGA----T--CAC----ACATA----TATATCA-ACACACAT-nnnnnnnnnnattttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atatAGAAACAAAGA---GGATCAAAAGTGAAAAAATGAAAGTTGTAGTAGAAGTTGTAGGTTAATTGCCAAGTTGTC-TCAG-T---T---A--TGTT-GTATCAAATA---TTATTTTGAAGA------------TAACAT---AACA-----TACCGGTTTAAGAAAATAGAAacaaatacactgttgttgtttttgcgtgcgtgtttttgttgtttgttattatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATTATATGTTTT--AT-TCACATCAAATAT-----AAATTTTACAAAT---GTTTGCA-CACTGACA------TA-------------------------TTTAAAA-TAGA----A--TACAC--ACATA----TAAA--C-ATACACA--TACTATTACAATCAT-A-TA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTTCT-AT-TCACATCAAATATTTACAAAGTTTTGCATGTGTAATTTACAGCATTGAC--------AT--------------A----TTT--GAG---A-TAGA----ATGTACAT--ACATA----TATA--T-ACACATA--TATTATTACAATCAT-A-TATA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATAT-TTTTT-AT-ACACATCAAATATTTACTAAGTTTTGCATGTAT-------AGCACTGATATATTTGTAT--------------A----TTTAATTC---ACCAGA----A---ACA---AGATA----
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tattttttcAGGTGTTTAGATTAGAAACAAAGA---GGATCGATAATGAAGAGGTcctgcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aC--AATTATATGTTTTG-AT-TCACATCAAACATTTACATACTTTTGCATGTATAATTTACAACAATGA--------TAT--------------A----TTT--TAT---G-TAAA----A--CACAC--ACATT----TTTA--T-ACAAATAT-AACAAT-ACACTCAT-A-T---------------------T--TTT-T---A-A---CTTG--TTTTTCGGAATTATGC-TT-TT------TAT--TT-TA-GGTTATTCATGTATCGCTAGTACTT--T-CAAT-TA---TA-----TGTAATA-------TATAATATATATGTCTCTACAA---ACACAAGTAAA-----TATTTGGTGTCAACA---AAAT--T--------TTT--TCCCAAGAAA-TAATATGAGAATAGCTAAGAGATGTTAAGAAAAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTTAAAAAGTGAAAGTTGGAGTA-AAGTTGAA----ACTTGCCAAGATGAC-TC-G---------G--TCGG-ATTCGATAAAATTTCATTATGAGAGTA--CT-ATTACTAAACT---AACA-----CA----TT--AGAAAT-AAACGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGA-ATTTCTAACTTATC-T------TTATCA-AGGGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTATTTTATTCA---------------------TTTAAGCATGGGGTTGTAT----TAATGTACTTGCTTATGAAAA--AAA-TATTTACCACTTATTATAATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTTAAAACCTTTCACCTTTACACCGAACGTAACAGCGGAAAG--ATCAAATGAAATGTTAATATTTAAATTTGAT--AAAAA-TATTTTG
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttTTTTC--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAAACATTTACAAAGTTTTGCATGTATAATTTAGAGCACTGAC--------AT--------------A----GTT--TTT---A-TATA----A--TGC----ACACA----TCCA--C-ACACA----------TACAATCAT-A-TATATAA--C-AT---------T--TTT-T---A-AAGGTATGCTTTTTTATGAATTATGC-TT-TC------TATAATA-TAAGGATATTTACATATCGCTAGTAATAT-T-CA-T-TA-ATT-------GTAA-A-----CATGTAATATAGGTCTCCCTAAAGT-TACAAAACTAAAATATTTTTTTGATGCAAACA---AA-TTGT--------TTT--C-------AA-TTATAGGCGGATAGCTTAGATATGTTTAGAATAGAGACAAGAA-----ATCGATAGTGAAAAGGTGAAAG-----------------------TTGCCAAGATGTCTTT-G-T---T---G--TTTT-ATT----AATCGTTTATTTTGAAGATA--TTATTTTCTAACATATAAACATAATTTA----TT--AGAAATTATAAGGTGCCGATTTC--TGGT--AATAT-ATTTCTAATTTATC-T------tta
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Reference ( family-1200 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATAATATGTTTT-TAT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAGCACTGACATATAT----TTTNNATAGA----A--CAC--ACACATA--TAT--A---CACACATA-T-TACTATTACAATCAT-A-TATATA--T-AT-TT-A-AT--TTTT---A-AAGGTT-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATA-TAAGGCTATTCACATATCGCTAGTA---ATA--T-C-ATTA-AT-----TA--GTAAA-----CCTATAATATAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTTATTTGATGCAAAC-A---TAT--T--------TTT--T-------AA-TTATAGGAGGATAGCTTAGAGATGTTTAGAATAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTGAAAAAGTGAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCG--GTT-GTT-TTTT-TT---AAA--CGTTTATTTTGAAGA--TA--TT-TTTTCTAACAT---AACA-----TA----TT--AGAAATTAAAAGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGT-ATTTCTAATTTATC-T------TTGTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTNTTTTNTTCAAAT-A-G-T-TT-T-AAA-ACATTTAAACATGGGGTTGTAT----TNATGTACTTGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCGCTTATT---ATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTGTAAACGTTTCCCTTTTACACCAAANGTAACAGTTAAAAG--ATCAAANGATATGTTAATATTTAAATTTGAT--AAAAAATGTTTNGATNTT-CAGACCAAAACTGTTGAGTATTTTGACATTCCC---GAAA--ATTGTTTACCGTTTTAATATAACTACTNNAAANNTCACA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCCCAAATAATACGTTTT-TAT-ACAGATCATTACATAGTTTTACATGTATAATTTACAGCACTGACATATCCGAGATAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNN----N--NNN--NNNNNNN--NNN--N---NACACACA-C--------ACA--CAT-A-TATATA--T-AT-AT-A------TTT---G-AAAGTT-TG--TTATTCGGAATTATGT-TT------TCTATAATG-TAAGGCTA-----------CTA-----------------TA-AA-----TA--GTAAA-----CCTATGATATAGATGACCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTAATTTGATGCAAAC-C---AAT--T--------TGT--T-------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTTTTC--AAGTATATGTCTT-TAT-TCACATCAA-ATAT----TT------------T-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACACTGACATA------------ATAGA----A--TAC--ACACATA--TAC--A---CACACATA-----CTATTATAGTCAT-A-AATATA--T-A-------AT--TTTT---ATAAGGTT-TG--TTTTTTCGAAATATGC-TT------TCT-TAATA-TAAGGCTATTCACATTTCGCTAGTA---ATA--TTC-ATGT-ATACCGGTA--GTAAA-----CCTAGAATATAGATGTCACTA-AAGT-TACAAAACTTCAGTATTTATTTGATGCGAAC-A---ttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAATATTTTTT-TAAAGAAAATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TT-CATGT-----ATA-CGTTACAGCACTGACATATTT----CAGCTATAAA----A--CACGTACACACA--CAC--G---CACACACA---TACTATTACAACCAT-A-T------------------T--TTTT---A-AAGAT------ATTTTCGGAATTATG---T------TTTA----A-TAAGGCTGTTCACATATCGCTAGTA---ATAT-T-T-ATTT-A------TA--GTAAA-----CCTATAATATAGATGT--------GTCTACAAGACTATAGTATTTATTTGATACAAGC-C---TAT--G--------TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTAAATT-------------------------GAAT-G---------------CATTTAAACATGGGGAAGTGT----TAATGTA-TTGCTTCTGAAGATAAA-----------------------ACGAAATCGA----TAAGCGCA-TTTCCTTTACGTTTTTCATTTACACCAAAGGTAATAGTTAAAAG--ATTAAAAGATACGTGAATATATAAATT-----------GTATTTAAATGTTACA-ACCAAAACTGTTGA-----CTGA-ATTTCC---GAA------GTTTGATGTTTTAA-ACAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTATTACAATCAT-A-T-TATA--T-AC-T----AT--TTT---------ATT-TG--TGTC-CGGAATTATGC-TT------TCTATAATT-TAAGGTTATTCACATATCGCGAGTA---ATA--T-T-CCTGCAT-----T----CAAA-----CCTATAATATAGATGTTACTA-AAGT-TACAAAACTTAAATATTTATTTGATGgaatttcaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           catacagcattgacaaattttagatagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGGAAGATAGCTTAAA-ATGTTTAGAAAAGAAAATAAGGCCTGGATCGATAATTAAAAAGTGAAAGTTGTAGTA------GAA----AACTACCAAGATGACTCA--GTT-GGA-T----------------TTTGTTTTGAAAAACTA--GT-ATTTCTAACAT---TATC-----TA-----A--AAAAAAAAAAAGGTGACTAATTCAACAGTAACATGTGAATTC-AATTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATCATTA-TATATA--T-ATGTT-A-CT--TTTTTTTA-AAGGTT-TG--TTTTTCGGAAATATGC-TTTCGCTTTCTATAATA-TATGGCTTTTCACATATCGCTCGTA---ATAACT-C--TTA-A------TA--GTAAC-----CCTATAAAAGAGATGTCACTT-TAGT-TACAAAATTAAAGTATTTATTTAATGC-AAC-----TAT--T--------TTT--T-------AA-TAATAaaaagctattgtataaatgtttcgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaaaaacaaaagatatggtcaagtTAATATGTTTT-TAT-TTACATCAA-ACAT----TTATA---C-AGTTT-------TG-TACAT-----GTA-ATTTACGGCAATGA-A-ATAT----TTATGATAGA----A--CAC--ACATATG--TAT--A---CACA-------TAATAATACAATCAT-AGTGTCT---T-GT-TT-ACATGGTTTT---A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCTATTTACATATTGTTA-TA---CTA--T---------T-----T---GTA---------TATGGTA--GATATCTCTC--------CAAAACTAAAACATTTGTTGGATGgctatttacatattgttatactatttgtatatggtagatatctctccaaaactaaaacatttgttggatg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             taatatgtttttatttacatcaaacatttatacagttttgtacatgtaatttacggcaatgaaatatttatgatagaacacacatatgtatacacataataatacaatcatagtgtcttgtttacatggttttaAT-TTATATCAA-ATAT----CAACA---A-AGTTT-------TG-CTTGT-----ATA-ATTTACAGCACTGAC----CC----TTTTTAT-------A--CAC--ACATATA--TGT--T---TACACA-----TACTATTACAATCAT-A-TATATA--TAAT-TT-ATATA-TTTT---A-A---TTATG--TTTTTCGGAATAATGC-TT------TCCATAATA-TAAAGCTATT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C--AATAATATGTTTT-TAT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A--GTTT-------TG-CATTT-----ATA-ATTTAGAGGACTGACATAT-T----TTTATATA------------------------AT--A---CACACATAGT-T----TTACAATCAT-A-TATATA--T-AA-AA-A-AA--ATTT---A-A-GGTA-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATA-TAAGGCTATTTACATATTACTAGTA---ATAT-T-C-A-TA--------TA--GTAAACCAGTCCTATAATACAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTTAGGTATCTATTTGATGCAAAT-A---TTT--T--------TTTTAT-------AA-TTATAGGAGGATAtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcTAATACAAA--A---TAT--T--------GT----------------ATAGGAGGATAGCTTATAGATGTTTAGATTAGAAACAAAGA---TGGTCAATAGTGAAAAAGTAAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCGTTGGT-GTT-TTTT-TTTTAAAA--CATTTATTTTTAAGA--TA--TTATTTTCTAACAT---AACA-----TA----AT--AGAAATT-AAAGGTGCCCACTTC--TGGT--CATGT-ATTTCTAATTTATCTT------TTGTTA-AGAGTGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TACTTTTGTTCAAAT-AGG-T-TT-TAAAA-ATATTTAACCATGGGGTTGTATTTTATAATATATTTGCTTCTGAAAATAAAGTTATTTACCACTTATT---ATAtttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaataatacaaaatattgtataggaggatagcttatagatgtttagattagaaacaaagatggtcaatagtgaaaaagtaaaagttgtagtagaagatgaaaattgccaagatgtctcgttggtgttttttttttaaaacatttatttttaagatattattttctaacataacataatagaaattaaaggtgcccacttctggtcatgtatttctaatttatcttttgttaagagtgatgtgtttttcaatttcaatacttttgttcaaataggttttaaaaatatttaaccatggggttgtattttataatatatttgcttctgaaaataaagttatttaccacttattatannnnnnnnnnattttt
gi|20                         : tccaataatatgtttttattcacatcaaacatttacaagttttgcatttataatttagaggactgacatatttttatataatacacacatagttttacaatcatatatatataaaaaaaatttaaggtatgtttttcggaattatgctttctataatataaggctatttacatattactagtaatattcatatagtaaaccagtcctataatacagatgtccctaaagttacaaaacttaggtatctatttgatgcaaatattttttttataattataggaggatatttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaaTAATATGTTTT-TCT-TCATATCAA-TTAT----TTACA---A-ATTTG-------TG-CAAGT-----ATA-ACTTACGACAATGGC--ATAT----TTTAGATAGA----T--CAC--ACATATA--TATCAA---CACACATA-nnnnnnnnnnattttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atatAGAAACAAAGA---GGATCAAAAGTGAAAAAATGAAAGTTGTAGTAGAAGTTGTAGGTTAATTGCCAAGTTGTCTCA--GTT-ATG-TTGTATC---AAA--TA-TTATTTTGAAGA--------------TAACAT---AACA-----TACCGGTTTAAGAAAATAGAAcaaatacactgttgttgtttttgcgtgcgtgtttttgttgtttgttattatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATTATATGTTTT--AT-TCACATCAA-ATAT------------A-AATTT-------TA-CAAAT-----GT----TTGCA-CACTGACATAT------TTAAAATAGA----A--TAC--ACACATA--TAA--A---CATACACA---TACTATTACAATCAT-A-TA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTTC-TAT-TCACATCAA-ATAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----GTA-ATTTACAGCATTGAC--ATAT----TTGAGATAGA----ATGTAC--ATACATA--TAT--A---TACACATA---TATTATTACAATCAT-A-TATA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATAT-TTTT-TAT-ACACATCAA-ATAT----TTACT---A-AGTTT-------TG-CATGT-----AT--------AGCACTGATATA-------TTTGTATA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tattttttcAGGTGTTTAGATTAGAAACAAAGA---GGATCGATAATGAAGAGGTtttaattcaccagaaacaagatacctgcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aC--AATTATATGTTTT-GAT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---T-ACTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACAATG--ATATAT----TTTATGTAAA----A--CAC--ACACATT--TTT--A---TACAAATA-T-AAC-AATACACTCAT-A-T------------------T--TTTT---A-A---CT-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TTTAT--T--TTAGGTTATTCATGTATCGCTAGTA---CTT--T-CAATTATATG----TA--ATA---------TATAATATATATGTCTCTACAA----ACACAAGTAAA-----TATTTGGTGTCAACAA---AAT--T--------TTT--TCCCAAGAAA-TAATATGAGAATAGCTAAGAGATGTTAAGAAAAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTTAAAAAGTGAAAGTTGGAGTA-AAGTTGAA----ACTTGCCAAGATGACTCG--GTC-GGA-TTCG-AT---AAA--ATTTCATTATGAGAG--TA--CT-ATTACTAAACT---AACA-----CA----TT--AGAAA-TAAACGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGA-ATTTCTAACTTATC-T------TTATCA-AGGGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTATTTTATT----------------------CATTTAAGCATGGGGTTGTAT----TAATGTACTTGCTTATGAAA--AAAA-TATTTACCACTTATTATAATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTTAAAACCTTTCACCTTTACACCGAACGTAACAGCGGAAAG--ATCAAATGAAATGTTAATATTTAAATTTGAT---AAAAATATTTTG
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Reference ( family-1200 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAGCACTGACATATAT----TTTA--NATAGA----A--CAC--ACACATA--TAT--A---CACACATA-T-TACTATTACAATCAT-A-TATATA--T-AT-TT-A-AT--TTTT---A-AAGGTT-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATA-TAAGGCTATTCACATATCGCTAGTA---ATA--T-C-ATTA-AT-----TA--GTAAA-----CCTATAATATAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTTATTTGATGCAAAC-A---TAT--T--------TTT--T-------AA-TTATAGGAGGATAGCTTAGAGATGTTTAGAATAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTGAAAAAGTGAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCG--GTT-GTT-TTTT-TT---AAA--CGTTTATTTTGAAGA--TA--TT-TTTTCTAACAT---AACA-----TA----TT--AGAAATTAAAAGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGT-ATTTCTAATTTATC-T------TTGTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTNTTTTNTTCAAAT-A-G-T-TT-T-AAA-ACATTTAAACATGGGGTTGTAT----TNATGTACTTGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCGCTTATT---ATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTGTAAACGTTTCCCTTTTACACCAAANGTAACAGTTAAAAG--ATCAAANGATATGTTAATATTTAAATTTGAT--AAAAAATGTTTNGATGTT-CAGACCAAAACTGTTGAGTATTTTGACATTCCC---GAAA--ATTGTTTACCGTTTTAATATAACTACTNNAAANNTCACA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCCCAAATAATACGTTTTT-AT-ACAGATCATTACATAGTTTTACATGTATAATTTACAGCACTGACATATCCGAGATAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNN--NNNNNN----N--NNN--NNNNNNN--NNN--N---NACACACA-C--------ACA--CAT-A-TATATA--T-AT-AT-A------TTT---G-AAAGTT-TG--TTATTCGGAATTATGT-TT------TCTATAATG-TAAGGCTA-----------CTA-----------------TA-AA-----TA--GTAAA-----CCTATGATATAGATGACCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTAATTTGATGCAAAC-C---AAT--T--------TGT--T-------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTTTTC--AAGTATATGTCTTT-AT-TCACATCAA-ATAT----TT------------T-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACACTGACATA--------------ATAGA----A--TAC--ACACATA--TAC--A---CACACATA-----CTATTATAGTCAT-A-AATATA--T-A-------AT--TTTT---ATAAGGTT-TG--TTTTTTCGAAATATGC-TT------TCT-TAATA-TAAGGCTATTCACATTTCGCTAGTA---ATA--TTC-ATGT-ATACCGGTA--GTAAA-----CCTAGAATATAGATGTCACTA-AAGT-TACAAAACTTCAGTATTTATTTGATGCGAAC-A---ttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAATATTTTTTT-AAAGAAAATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TT-CATGT-----ATA-CGTTACAGCACTGAC--ATAT----TTCAGCTATAAA----A--CACGTACACACA--CAC--G---CACACACA---TACTATTACAACCAT-A-T------------------T--TTTT---A-AAGAT------ATTTTCGGAATTATG---T------TTTA----A-TAAGGCTGTTCACATATCGCTAGTA---ATAT-T-T-ATTT-A------TA--GTAAA-----CCTATAATATAGATGT--------GTCTACAAGACTATAGTATTTATTTGATACAAGC-C---TAT--G--------TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTAAATT-------------------------GAAT-G---------------CATTTAAACATGGGGAAGTGT----TAATGTA-TTGCTTCTGAAGATAAA-----------------------ACGAAATCGA----TAAGCGCA-TTTCCTTTACGTTTTTCATTTACACCAAAGGTAATAGTTAAAAG--ATTAAAAGATACGTGAATATATAAATT-----------GTATTTAAATGTTACA-ACCAAAACTGTTGA-----CTGA-ATTTCC---GAA------GTTTGATGTTTTAA-ACAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACAGCATTGACA-A-AT----TTTA--GATAGA----gaatttcaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caACTATTACAATCAT-A-T-TATA--T-AC-T----AT--TTT---------ATT-TG--TGTC-CGGAATTATGC-TT------TCTATAATT-TAAGGTTATTCACATATCGCGAGTA---ATA--T-T-CCTGCAT-----T----CAAA-----CCTATAATATAGATGTTACTA-AAGT-TACAAAACTTAAATATTTATTTGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactattacaatcatattatatactattttatttgtgtccggaattatgctttctataatttaaggttattcacatatcgcgagtaatattcctgcattcaaacctataatatagatgttactaaagttacaaaacttaaatatttatttgatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catacagcattgacaaattttagatagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGGAAGATAGCTTAAA-ATGTTTAGAAAAGAAAATAAGGCCTGGATCGATAATTAAAAAGTGAAAGTTGTAGTA------GAA----AACTACCAAGATGACTCA--GTT-GGA-T----------------TTTGTTTTGAAAAACTA--GT-ATTTCTAACAT---TATC-----TA-----A--AAAAAAAAAAAGGTGACTAATTCAACAGTAACATGTGAATTC-AATTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCATTA-TATATA--T-ATGTT-A-CT--TTTTTTTA-AAGGTT-TG--TTTTTCGGAAATATGC-TTTCGCTTTCTATAATA-TATGGCTTTTCACATATCGCTCGTA---ATAACT-C--TTA-A------TA--GTAAC-----CCTATAAAAGAGATGTCACTT-TAGT-TACAAAATTAAAGTATTTATTTAATGC-AAC-----TAT--T--------TTT--T-------AA-TAATAaaaagctattgtataaatgtttcgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaaaaacaaaagatatggtcaagtTAATATGTTTTT-AT-TTACATCAA-ACAT----TTATA---C-AGTTT-------TG-TACAT-----GTA-ATTTACGGCAATGAAATA-------TTTAT-GATAGA----A--CAC--ACATATG--TAT--A---CACA-------TAATAATACAATCAT-AGTGTCT---T-GT-TT-ACATGGTTTT---A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCTATTTACATATTGTTA-TA---CTA--T---------T-----T---GTA---------TATGGTA--GATATCTCTC--------CAAAACTAAAACATTTGTTGGATGgctatttacatattgttatactatttgtatatggtagatatctctccaaaactaaaacatttgttggatg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                            taatatgtttttatttacatcaaacatttatacagttttgtacatgtaatttacggcaatgaaatatttatgatagaacacacatatgtatacacataataatacaatcatagtgtcttgtttacatggtttta-AT-TTATATCAA-ATAT----CAACA---A-AGTTT-------TG-CTTGT-----ATA-ATTTACAGCACTGAC-CCT-T----TTTA--T---------A--CAC--ACATATA--TGT--T---TACACA-----TACTATTACAATCAT-A-TATATA--TAAT-TT-ATATA-TTTT---A-A---TTATG--TTTTTCGGAATAATGC-TT------TCCATAATA-TAAAGCTATT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A--GTTT-------TG-CATTT-----ATA-ATTTAGAGGACTGACATAT-T----TTTA--TATA------------------------AT--A---CACACATAGT-T----TTACAATCAT-A-TATATA--T-AA-AA-A-AA--ATTT---A-A-GGTA-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATA-TAAGGCTATTTACATATTACTAGTA---ATAT-T-C-A-TA--------TA--GTAAACCAGTCCTATAATACAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTTAGGTATCTATTTGATGCAAAT-A---TTT--T--------TTTTAT-------AA-TTATAGGAGGATAtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcTAATACAAA--A---TAT--T--------GT----------------ATAGGAGGATAGCTTATAGATGTTTAGATTAGAAACAAAGA---TGGTCAATAGTGAAAAAGTAAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCGTTGGT-GTT-TTTT-TTTTAAAA--CATTTATTTTTAAGA--TA--TTATTTTCTAACAT---AACA-----TA----AT--AGAAATT-AAAGGTGCCCACTTC--TGGT--CATGT-ATTTCTAATTTATCTT------TTGTTA-AGAGTGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TACTTTTGTTCAAAT-AGG-T-TT-TAAAA-ATATTTAACCATGGGGTTGTATTTTATAATATATTTGCTTCTGAAAATAAAGTTATTTACCACTTATT---ATAtttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaataatacaaaatattgtataggaggatagcttatagatgtttagattagaaacaaagatggtcaatagtgaaaaagtaaaagttgtagtagaagatgaaaattgccaagatgtctcgttggtgttttttttttaaaacatttatttttaagatattattttctaacataacataatagaaattaaaggtgcccacttctggtcatgtatttctaatttatcttttgttaagagtgatgtgtttttcaatttcaatacttttgttcaaataggttttaaaaatatttaaccatggggttgtattttataatatatttgcttctgaaaataaagttatttaccacttattatannnnnnnnnnattttt
gi|20                         : tccaataatatgtttttattcacatcaaacatttacaagttttgcatttataatttagaggactgacatatttttatataatacacacatagttttacaatcatatatatataaaaaaaatttaaggtatgtttttcggaattatgctttctataatataaggctatttacatattactagtaatattcatatagtaaaccagtcctataatacagatgtccctaaagttacaaaacttaggtatctatttgatgcaaatattttttttataattataggaggatatttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaaTAATATGTTTTT-CT-TCATATCAA-TTAT----TTACA---A-ATTTG-------TG-CAAGT-----ATA-ACTTACGACAATGGC--ATAT----TTTA--GATAGA----T--CAC--ACATATA--TATCAA---CACACATA-nnnnnnnnnnattttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatAGAAACAAAGA---GGATCAAAAGTGAAAAAATGAAAGTTGTAGTAGAAGTTGTAGGTTAATTGCCAAGTTGTCTCA--GTT-ATG-TTGTATC---AAA--TA-TTATTTTGAAGA--------------TAACAT---AACA-----TACCGGTTTAAGAAAATAGAAcaaatacactgttgttgtttttgcgtgcgtgtttttgttgtttgttattatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATTATATGTTTT--AT-TCACATCAA-ATAT------------A-AATTT-------TA-CAAAT-----GT----TTGCA-CACTGACATAT------TTAA--AATAGA----A--TAC--ACACATA--TAA--A---CATACACA---TACTATTACAATCAT-A-TA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTTCT-AT-TCACATCAA-ATAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----GTA-ATTTACAGCATTGAC--ATAT----TTGA--GATAGA----ATGTAC--ATACATA--TAT--A---TACACATA---TATTATTACAATCAT-A-TATA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATAT-TTTTT-AT-ACACATCAA-ATAT----TTACT---A-AGTTT-------TG-CATGT-----AT--------AGCACTGATATAT-T----TGTA--TAT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattttttcAGGTGTTTAGATTAGAAACAAAGA---GGATCGATAATGAAGAGGTttaattcaccagaaacaagatacctgcaa
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Reference ( family-1200 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAGCACTGACATATAT----TTTA--NATAGA----A--CAC--ACACATA--TAT--A---CACACATA-T-TACTATTACAATCAT-A-TATATA--T-AT-TT-A-AT--TTTT---A-AAGGTT-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATA-TAAGGCTATTCACATATCGCTAGTA---ATA--T-C-ATTA-AT-----TA--GTAAA-----CCTATAATATAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTTATTTGATGCAAAC-A---TAT--T--------TTT--T-------AA-TTATAGGAGGATAGCTTAGAGATGTTTAGAATAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTGAAAAAGTGAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCG--GTT-GTT-TTTT-TT---AAA--CGTTTATTTTGAAGA--TA--TT-TTTTCTAACAT---AACA-----TA----TT--AGAAATTAAAAGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGT-ATTTCTAATTTATC-T------TTGTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTNTTTTNTTCAAAT-A-G-T-TT-T-AAA-ACATTTAAACATGGGGTTGTAT----TNATGTACTTGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCGCTTATT---ATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTGTAAACGTTTCCCTTTTACACCAAANGTAACAGTTAAAAG--ATCAAANGATATGTTAATATTTAAATTTGAT--AAAAAATGTTTNGATGTT-CAGACCAAAACTGTTGAGTATTTTGACATTCCC---GAAA--ATTGTTTACCGTTTTAATATAACTACTNNAAANNTCACA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCCCAAATAATACGTTTTT-AT-ACAGATCATTACATAGTTTTACATGTATAATTTACAGCACTGACATATCCGAGATAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNN--NNNNNN----N--NNN--NNNNNNN--NNN--N---NACACACA-C--------ACA--CAT-A-TATATA--T-AT-AT-A------TTT---G-AAAGTT-TG--TTATTCGGAATTATGT-TT------TCTATAATG-TAAGGCTA-----------CTA-----------------TA-AA-----TA--GTAAA-----CCTATGATATAGATGACCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTAATTTGATGCAAAC-C---AAT--T--------TGT--T-------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTTTTC--AAGTATATGTCTTT-AT-TCACATCAA-ATAT----TT------------T-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACACTGACATA--------------ATAGA----A--TAC--ACACATA--TAC--A---CACACATA-----CTATTATAGTCAT-A-AATATA--T-A-------AT--TTTT---ATAAGGTT-TG--TTTTTTCGAAATATGC-TT------TCT-TAATA-TAAGGCTATTCACATTTCGCTAGTA---ATA--TTC-ATGT-ATACCGGTA--GTAAA-----CCTAGAATATAGATGTCACTA-AAGT-TACAAAACTTCAGTATTTATTTGATGCGAAC-A---ttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAATATTTTTTT-AAAGAAAATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TT-CATGT-----ATA-CGTTACAGCACTGAC--ATAT----TTCAGCTATAAA----A--CACGTACACACA--CAC--G---CACACACA---TACTATTACAACCAT-A-T------------------T--TTTT---A-AAGAT------ATTTTCGGAATTATG---T------TTTA----A-TAAGGCTGTTCACATATCGCTAGTA---ATAT-T-T-ATTT-A------TA--GTAAA-----CCTATAATATAGATGT--------GTCTACAAGACTATAGTATTTATTTGATACAAGC-C---TAT--G--------TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTAAATT-------------------------GAAT-G---------------CATTTAAACATGGGGAAGTGT----TAATGTA-TTGCTTCTGAAGATAAA-----------------------ACGAAATCGA----TAAGCGCA-TTTCCTTTACGTTTTTCATTTACACCAAAGGTAATAGTTAAAAG--ATTAAAAGATACGTGAATATATAAATT-----------GTATTTAAATGTTACA-ACCAAAACTGTTGA-----CTGA-ATTTCC---GAA------GTTTGATGTTTTAA-ACAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACAGCATTGACA-A-AT----TTTA--GATAGA----gaatttcaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caACTATTACAATCAT-A-T-TATA--T-AC-T----AT--TTT---------ATT-TG--TGTC-CGGAATTATGC-TT------TCTATAATT-TAAGGTTATTCACATATCGCGAGTA---ATA--T-T-CCTGCAT-----T----CAAA-----CCTATAATATAGATGTTACTA-AAGT-TACAAAACTTAAATATTTATTTGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactattacaatcatattatatactattttatttgtgtccggaattatgctttctataatttaaggttattcacatatcgcgagtaatattcctgcattcaaacctataatatagatgttactaaagttacaaaacttaaatatttatttgatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catacagcattgacaaattttagatagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGGAAGATAGCTTAAA-ATGTTTAGAAAAGAAAATAAGGCCTGGATCGATAATTAAAAAGTGAAAGTTGTAGTA------GAA----AACTACCAAGATGACTCA--GTT-GGA-T----------------TTTGTTTTGAAAAACTA--GT-ATTTCTAACAT---TATC-----TA-----A--AAAAAAAAAAAGGTGACTAATTCAACAGTAACATGTGAATTC-AATTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCATTA-TATATA--T-ATGTT-A-CT--TTTTTTTA-AAGGTT-TG--TTTTTCGGAAATATGC-TTTCGCTTTCTATAATA-TATGGCTTTTCACATATCGCTCGTA---ATAACT-C--TTA-A------TA--GTAAC-----CCTATAAAAGAGATGTCACTT-TAGT-TACAAAATTAAAGTATTTATTTAATGC-AAC-----TAT--T--------TTT--T-------AA-TAATAaaaagctattgtataaatgtttcgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaaaaacaaaagatatggtcaagtTAATATGTTTTT-AT-TTACATCAA-ACAT----TTATA---C-AGTTT-------TG-TACAT-----GTA-ATTTACGGCAATGAAATA-------TTTAT-GATAGA----A--CAC--ACATATG--TAT--A---CACA-------TAATAATACAATCAT-AGTGTCT---T-GT-TT-ACATGGTTTT---A-
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCTATTTACATATTGTTA-TA---CTA--T---------T-----T---GTA---------TATGGTA--GATATCTCTC--------CAAAACTAAAACATTTGTTGGATGgctatttacatattgttatactatttgtatatggtagatatctctccaaaactaaaacatttgttggatg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                            taatatgtttttatttacatcaaacatttatacagttttgtacatgtaatttacggcaatgaaatatttatgatagaacacacatatgtatacacataataatacaatcatagtgtcttgtttacatggtttta-AT-TTATATCAA-ATAT----CAACA---A-AGTTT-------TG-CTTGT-----ATA-ATTTACAGCACTGAC-CCT-T----TTTA--T---------A--CAC--ACATATA--TGT--T---TACACA-----TACTATTACAATCAT-A-TATATA--TAAT-TT-ATATA-TTTT---A-A---TTATG--TTTTTCGGAATAATGC-TT------TCCATAATA-TAAAGCTATT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A--GTTT-------TG-CATTT-----ATA-ATTTAGAGGACTGACATAT-T----TTTA--TATA------------------------AT--A---CACACATAGT-T----TTACAATCAT-A-TATATA--T-AA-AA-A-AA--ATTT---A-A-GGTA-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATA-TAAGGCTATTTACATATTACTAGTA---ATAT-T-C-A-TA--------TA--GTAAACCAGTCCTATAATACAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTTAGGTATCTATTTGATGCAAAT-A---TTT--T--------TTTTAT-------AA-TTATAGGAGGATAtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcTAATACAAA--A---TAT--T--------GT----------------ATAGGAGGATAGCTTATAGATGTTTAGATTAGAAACAAAGA---TGGTCAATAGTGAAAAAGTAAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCGTTGGT-GTT-TTTT-TTTTAAAA--CATTTATTTTTAAGA--TA--TTATTTTCTAACAT---AACA-----TA----AT--AGAAATT-AAAGGTGCCCACTTC--TGGT--CATGT-ATTTCTAATTTATCTT------TTGTTA-AGAGTGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TACTTTTGTTCAAAT-AGG-T-TT-TAAAA-ATATTTAACCATGGGGTTGTATTTTATAATATATTTGCTTCTGAAAATAAAGTTATTTACCACTTATT---ATAtttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaataatacaaaatattgtataggaggatagcttatagatgtttagattagaaacaaagatggtcaatagtgaaaaagtaaaagttgtagtagaagatgaaaattgccaagatgtctcgttggtgttttttttttaaaacatttatttttaagatattattttctaacataacataatagaaattaaaggtgcccacttctggtcatgtatttctaatttatcttttgttaagagtgatgtgtttttcaatttcaatacttttgttcaaataggttttaaaaatatttaaccatggggttgtattttataatatatttgcttctgaaaataaagttatttaccacttattatannnnnnnnnnattttt
gi|20                         : tccaataatatgtttttattcacatcaaacatttacaagttttgcatttataatttagaggactgacatatttttatataatacacacatagttttacaatcatatatatataaaaaaaatttaaggtatgtttttcggaattatgctttctataatataaggctatttacatattactagtaatattcatatagtaaaccagtcctataatacagatgtccctaaagttacaaaacttaggtatctatttgatgcaaatattttttttataattataggaggatatttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaaTAATATGTTTTT-CT-TCATATCAA-TTAT----TTACA---A-ATTTG-------TG-CAAGT-----ATA-ACTTACGACAATGGC--ATAT----TTTA--GATAGA----T--CAC--ACATATA--TATCAA---CACACATA-nnnnnnnnnnattttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatAGAAACAAAGA---GGATCAAAAGTGAAAAAATGAAAGTTGTAGTAGAAGTTGTAGGTTAATTGCCAAGTTGTCTCA--GTT-ATG-TTGTATC---AAA--TA-TTATTTTGAAGA--------------TAACAT---AACA-----TACCGGTTTAAGAAAATAGAAcaaatacactgttgttgtttttgcgtgcgtgtttttgttgtttgttattatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATTATATGTTTT--AT-TCACATCAA-ATAT------------A-AATTT-------TA-CAAAT-----GT----TTGCA-CACTGACATAT------TTAA--AATAGA----A--TAC--ACACATA--TAA--A---CATACACA---TACTATTACAATCAT-A-TA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTTCT-AT-TCACATCAA-ATAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----GTA-ATTTACAGCATTGAC--ATAT----TTGA--GATAGA----ATGTAC--ATACATA--TAT--A---TACACATA---TATTATTACAATCAT-A-TATA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATAT-TTTTT-AT-ACACATCAA-ATAT----TTACT---A-AGTTT-------TG-CATGT-----AT--------AGCACTGATATAT-T----TGTA--TAT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattttttcAGGTGTTTAGATTAGAAACAAAGA---GGATCGATAATGAAGAGGTttaattcaccagaaacaagatacctgcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aC--AATTATATGTTTTG-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---T-ACTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACAATG--ATATAT----TTTA--TGTAAA----A--CAC--ACACATT--TTT--A---TACAAATA-T-AAC-AATACACTCAT-A-T------------------T--TTTT---A-A---CT-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TTTAT--T--TTAGGTTATTCATGTATCGCTAGTA---CTT--T-CAATTATATG----TA--ATA---------TATAATATATATGTCTCTACAA----ACACAAGTAAA-----TATTTGGTGTCAACAA---AAT--T--------TTT--TCCCAAGAAA-TAATATGAGAATAGCTAAGAGATGTTAAGAAAAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTTAAAAAGTGAAAGTTGGAGTA-AAGTTGAA----ACTTGCCAAGATGACTCG--GTC-GGA-TTCG-AT---AAA--ATTTCATTATGAGAG--TA--CT-ATTACTAAACT---AACA-----CA----TT--AGAAA-TAAACGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGA-ATTTCTAACTTATC-T------TTATCA-AGGGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTATTTTATT----------------------CATTTAAGCATGGGGTTGTAT----TAATGTACTTGCTTATGAAA--AAAA-TATTTACCACTTATTATAATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTTAAAACCTTTCACCTTTACACCGAACGTAACAGCGGAAAG--ATCAAATGAAATGTTAATATTTAAATTTGAT---AAAAATATTTTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTA--AATAAAATGTTTTTTAT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A--GTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATATACAGCACTGAC--ATGT----TTTA--GATAGA----A--CAC--ACACATAATTAT--ATAGTACACAAA-CATACTACTACAATCAT--------------T-TT-A-CTA-TTAC---A-CAAGTT-TG--TTTTTCGGAATTATGC-TT------TCTATAATAGTAA--------ACATA----TAATAAAGATA--T-C-CCTA-A-------A--GT-----------------TACATG--ACTA-AA---------------GTATTTACTTGATGCGAAC-A---CAT--T--------TTT--T-------AA--TATAGCAGGACAGCTCGGAGATGTTTAGAATAGAAACAAGGA---TGATCGAAAGCGAACAAGTGAAAGTTGAAGAAGAAGATGAT----AATTACCATGGTGTCTCA--GTT-AGG-GTTG-TT---AAA--TGTTTATTTTGAAGA--TA--TTATTTTCTAATAT---AACA-----TA----TA--AGAAA--AAGAAA-------------AGT--TATGA-ATTTTTTACTTGTC-T------TCATC----AGCGATGTGTTTTTTCAGTTTGTCGATGTGCTTGTTGTTTTTTT--AATAA-G-T-TTCT-AAA-ACATTTAAACATTGATTTGTAT----CTATATGCTAGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCATTTATT---ATAATAAAACTGATATTTAAGTGCA-TTTTGTAAACATTTACCTTTTACACTAAATGTAACAATTAAAAG--ATCAAACGTTATGTTGAT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttTATGC-TT------TTTATGAT--TAAGGCTATTCGCATATCGTTAGTT---ATAT-T-C-ACTA-A------TA--GTAAA-----TCTATAATATAGATGTCCCTT-AAGC-TGCAAAACTTAAGGATTTATTTGTTTCAAAC-A---T-T--T--------TTT--T-------AA-CTATAG------------GAGATGTTTAGAACAGACACAGAGA---GGATCGACAGTGACAAAGTGAAAGTTGTAGT---TGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCG--GTT-G-T-TTTT-TT---AAA--CGTTTATATTG----------------------------ACA-----TC----TT--AGAAATTGATAGATGCCCATTTT--CAGT--TATGT-ATTTCTAACTTATC-TTTCAAATTGTTA-AAAGCGATGCG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTCTTTCTTTCATAT-A-T-TGTT-T-AAA-ATATTTTAACATGGTGTTGTAT----TTATATTGTTGCTTCTAAAAATAAAG-TATTTACGGTCAATT---ATAAT-AAATTGG----T-TGTGCATTTTTGTTAACATTTCCCTTTTATACC-AATGTAACAGcatatattattttatagaatgtgtgtc
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TACAGATACAAACAAAACTGTTTGACTTATTA






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Reference ( family-1200 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAGCACTGACATAT------TT-T-AN--ATAGA----A--CAC--ACACATATAT--ACACACATAT-ANTATTACAATCAT-ATATATA-T-----A---T---AT---T-------TTTA-AA--GGTT-TG--TTTTTCGGAATTATGCTT------T-CTATAATATAAG---GCTATTCACA--TATCGCTAGTAAT-ATTCAT---TA---AT---A-GTAAA-----CCTATAATATAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTTATTTGATGCAAAC-A---TATT--------TTT--T-------AA-TTATAGGAGGATAGCTTAGAGATGTTTAGAATAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTGAAAAAGTGAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCG--GTTG-NNTTTT-TT---AAA--CGTTTATTTTGAAGA--TA-TTATTTTCTAACAT---AACA-----TA----TT--AGAAATTAAAAGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGT-ATTTCTAATTTATC-T------TTGTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTNTTTTNTTCAAAT-A--G--TT--T--AAAACATTTAAACATGGGGTTGTAT----TNATGTACTTGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCGCTTATT---ATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTGTAAACGTTTCCCTTTTACACCAAANGTAACAGTTAAAAG--ATCAAANGATATGTTAATATTTAAATTTGAT--AAAAAATGTTTNGATGTT-CAGACCAAAACTGTTGAGTATTTTGACATTCCC---GAAA--ATTGTTTACCGTTTTAATATAACTACTNNAAANNTCACA
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCCCAAATAATACGTTTTT-AT-ACAGATCATTACATAGTTTTACATGTATAATTTACAGCACTGACATATCCGAGATAGANNNNNNNNNNNNNNNNNN------NN-N-NN--NNNNN----N--NNN--NNNNNNNNNN--NNNNACACAC-AC----ACA--CAT-ATATATA-T-----A---T---AT---A-------TTTG-AA--AGTT-TG--TTATTCGGAATTATGTTT------T-CTATAATGTAAG---GCTACT-----------------AT-A---------A---AT---A-GTAAA-----CCTATGATATAGATGACCCTA-AAGT-TACAAAACTAAAGTATTAATTTGATGCAAAC-C---AATT--------TGT--T-------
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTTTTC--AAGTATATGTCTTT-AT-TCACATCAA-ATAT----TT------------T-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACACTGACATA----------------ATAGA----A--TAC--ACACATATAC--ACACACATA---CTATTATAGTCAT-AAATATA-T-----A-------AT---T-------TTTATAA--GGTT-TG--TTTTTTCGAAATATGCTT------T-CT-TAATATAAG---GCTATTCACA--TTTCGCTAGTAAT-ATTCATGTATACCGGT---A-GTAAA-----CCTAGAATATAGATGTCACTA-AAGT-TACAAAACTTCAGTATTTATTTGATGCGAAC-A---ttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAATATTTTTTT-AAAGAAAATCAA-ACAT----TTACA---A-AGTTT-------TT-CATGT-----ATA-CGTTACAGCACTGACATAT------TT-C-AGCTATAAA----A--CACGTACACACACAC--GCACACACAT-ACTATTACAACCAT-AT---------------------T---T-------TTTA-AA--GATA-T-----TTTCGGAATTATGTTT------T------A-ATAAG---GCTGTTCACA--TATCGCTAGTAAT-ATTTAT---TT---AT---A-GTAAA-----CCTATAATATAGATGT--------GTCTACAAGACTATAGTATTTATTTGATACAAGC-C---TATG--------TT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttgTTA-AGAGCGATGTG-TTTTTAAATT-------------------------GAAT-G----------------CATTTAAACATGGGGAAGTGT----TAATGTA-TTGCTTCTGAAGATAAA-----------------------ACGAAATCGA----TAAGCGCA-TTTCCTTTACGTTTTTCATTTACACCAAAGGTAATAGTTAAAAG--ATTAAAAGATACGTGAATATATAAATT-----------GTATTTAAATGTTACA-ACCAAAACTGTTGA-----CTGA-ATTTCC---GAA------GTTTGATGTTTTAA-ACAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACAGCATTGACAAAT------TT-T-AG--ATAGA----gaatttcaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ca-ACTATTACAATCAT-AT-TATA-T-----AC--T---AT---T-------TT--------ATT-TG--TGTC-CGGAATTATGCTT------T-CTATAATTTAAG---GTTATTCACA--TATCGCGAGTAAT-ATTCCT---GC---AT-----TCAAA-----CCTATAATATAGATGTTACTA-AAGT-TACAAAACTTAAATATTTATTTGATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactattacaatcatattatatactattttatttgtgtccggaattatgctttctataatttaaggttattcacatatcgcgagtaatattcctgcattcaaacctataatatagatgttactaaagttacaaaacttaaatatttatttgatg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               catacagcattgacaaattttagatagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGGAAGATAGCTTAAA-ATGTTTAGAAAAGAAAATAAGGCCTGGATCGATAATTAAAAAGTGAAAGTTGTAGTA------GAA----AACTACCAAGATGACTCA--GTTG-GAT----------------TTTGTTTTGAAAAACTA-GTA-TTTCTAACAT---TATC-----TA-----A--AAAAAAAAAAAGGTGACTAATTCAACAGTAACATGTGAATTC-AATTTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCATTATATATA-T-----A---T---GT---TACTTTTTTTTA-AA--GGTT-TG--TTTTTCGGAAATATGCTTTCGCTTT-CTATAATATATG---GCTTTTCACA--TATCGCTCGTAATAACTC-T---TA---AT---A-GTAAC-----CCTATAAAAGAGATGTCACTT-TAGT-TACAAAATTAAAGTATTTATTTAATGC-AAC-----TATT--------TTT--T-------AA-TAATAaaaagctattgtataaatgtttcgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgaaaaacaaaagatatggtcaagtTAATATGTTTTT-AT-TTACATCAA-ACAT----TTATA---C-AGTTT-------TG-TACAT-----GTA-ATTTACGGCAATGAAATAT------TT-A-TG--ATAGA----A--CAC--ACATATGTAT--ACAC----AT-AATAATACAATCAT-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---GCTATTTACA--TATTGTTA-TACT-ATTT-----------------GTA---------TATGGTA--GATATCTCTC--------CAAAACTAAAACATTTGTTGGATGgtgtcttgtttacatggttttagctatttacatattgttatactatttgtatatggtagatatctctccaaaactaaaacatttgttggatg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                            taatatgtttttatttacatcaaacatttatacagttttgtacatgtaatttacggcaatgaaatatttatgatagaacacacatatgtatacacataataatacaatcatagtgtcttgtttacatggtttta-AT-TTATATCAA-ATAT----CAACA---A-AGTTT-------TG-CTTGT-----ATA-ATTTACAGCACTGACCCTT------TT-T-AT---------------AC--ACACATATAT--GTTTACACAT-ACTATTACAATCAT-ATATATA-T-----AATTT---ATATAT-------TTTA-A-----TTATG--TTTTTCGGAATAATGCTT------T-CCATAATATAAA---GCTATT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C--AATAATATGTTTTT-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A--GTTT-------TG-CATTT-----ATA-ATTTAGAGGACTGACATAT------TT-TTAT--ATA----------------------AT--ACACAC--AT-AGTTTTACAATCAT-ATATATA-TAAAAAA---A---AT---T-------T----AA--GGTA-TG--TTTTTCGGAATTATGCTT------T-CTATAATATAAG---GCTATTTACA--TATTACTAGTAAT-ATTCAT--------AT---A-GTAAACCAGTCCTATAATACAGATGTCCCTA-AAGT-TACAAAACTTAGGTATCTATTTGATGCAAAT-A---TTTT--------TTTTAT-------AA-TTATAGGAGGATAtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcTAATACAAA--A---TATT--------GT----------------ATAGGAGGATAGCTTATAGATGTTTAGATTAGAAACAAAGA---TGGTCAATAGTGAAAAAGTAAAAGTTGTAGTAGAAGATGAA----AATTGCCAAGATGTCTCGTTGGTG-TTTTTT-TTTTAAAA--CATTTATTTTTAAGA--TA-TTATTTTCTAACAT---AACA-----TA----AT--AGAAATT-AAAGGTGCCCACTTC--TGGT--CATGT-ATTTCTAATTTATCTT------TTGTTA-AGAGTGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TACTTTTGTTCAAAT-AG-G--TT--TTAAAAATATTTAACCATGGGGTTGTATTTTATAATATATTTGCTTCTGAAAATAAAGTTATTTACCACTTATT---ATAtttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaataatacaaaatattgtataggaggatagcttatagatgtttagattagaaacaaagatggtcaatagtgaaaaagtaaaagttgtagtagaagatgaaaattgccaagatgtctcgttggtgttttttttttaaaacatttatttttaagatattattttctaacataacataatagaaattaaaggtgcccacttctggtcatgtatttctaatttatcttttgttaagagtgatgtgtttttcaatttcaatacttttgttcaaataggttttaaaaatatttaaccatggggttgtattttataatatatttgcttctgaaaataaagttatttaccacttattatannnnnnnnnnattttt
gi|20                         : tccaataatatgtttttattcacatcaaacatttacaagttttgcatttataatttagaggactgacatatttttatataatacacacatagttttacaatcatatatatataaaaaaaatttaaggtatgtttttcggaattatgctttctataatataaggctatttacatattactagtaatattcatatagtaaaccagtcctataatacagatgtccctaaagttacaaaacttaggtatctatttgatgcaaatattttttttataattataggaggatatttttttctactttggagattcgtacccacaagtaggaaTAATATGTTTTT-CT-TCATATCAA-TTAT----TTACA---A-ATTTG-------TG-CAAGT-----ATA-ACTTACGACAATGGCATAT------TT-T-AG--ATAGA----T--CAC--ACATATATATCAACACACATAC-Annnnnnnnnnattttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atatAGAAACAAAGA---GGATCAAAAGTGAAAAAATGAAAGTTGTAGTAGAAGTTGTAGGTTAATTGCCAAGTTGTCTCA--GTTA-TGTTGTATC---AAA--TA-TTATTTTGAAGA-------------TAACAT---AACA-----TACCGGTTTAAGAAAATAGAAaatacactgttgttgtttttgcgtgcgtgtttttgttgtttgttattatt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCTC--AATTATATGTTTT--AT-TCACATCAA-ATAT------------A-AATTT-------TA-CAAAT-----GT----TTGCA-CACTGACATAT------TT-A-AA--ATAGA----A--TAC--ACACATATAA--ACATACACAT-ACTATTACAATCAT-ATA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tTTCT-AT-TCACATCAA-ATAT----TTACA---A-AGTTT-------TG-CATGT-----GTA-ATTTACAGCATTGACATAT------TT-G-AG--ATAGA----ATGTAC--ATACATATAT--ATACACATAT-ATTATTACAATCAT-ATATA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATAT-TTTTT-AT-ACACATCAA-ATAT----TTACT---A-AGTTT-------TG-CATGT-----AT--------AGCACTGATATAT------TTGT-AT--AT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattttttcAGGTGTTTAGATTAGAAACAAAGA---GGATCGATAATGAAGAGGTttaattcaccagaaacaagatacctgcaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aC--AATTATATGTTTTG-AT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---T-ACTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATTTACAACAATGATATAT------TT-T-AT--GTAAA----A--CAC--ACACATTTTT--ATACAAATAT-AACAATACACTCAT-AT---------------------T---T-------TTTA-A-----CT-TG--TTTTTCGGAATTATGCTT------T-TTAT--T-TTAG---GTTATTCATG--TATCGCTAGTACT--TTCAA---TT---AT---ATGT-AA-----TATATAATATATATGTCTCTACAA----ACACAAGTAAA-----TATTTGGTGTCAACAA---AATT--------TTT--TCCCAAGAAA-TAATATGAGAATAGCTAAGAGATGTTAAGAAAAGAAACAAAGA---GGATCGATAGTTAAAAAGTGAAAGTTGGAGTA-AAGTTGAA----ACTTGCCAAGATGACTCG--GTCG-GATTCG-AT---AAA--ATTTCATTATGAGAG--TA-CTA-TTACTAAACT---AACA-----CA----TT--AGAAA-TAAACGGTGCCCATTTC--CGGT--TATGA-ATTTCTAACTTATC-T------TTATCA-AGGGCGATGTG-TTTTTCAATT--TCAA--------TTATTTTATT-----------------------CATTTAAGCATGGGGTTGTAT----TAATGTACTTGCTTATGAAA--AAAA-TATTTACCACTTATTATAATAATAAAATTGA----TAAGCGCA-TTTTTAAAACCTTTCACCTTTACACCGAACGTAACAGCGGAAAG--ATCAAATGAAATGTTAATATTTAAATTTGAT---AAAAATATTTTG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTA--AATAAAATGTTTTTTAT-TCACATCAA-ACAT----TTACA---A--GTTT-------TG-CATGT-----ATA-ATATACAGCACTGACATGT------TT-T-AG--ATAGA----A--CAC--A--------------CACATA--ATTAT----ATAGT-ACACAAA-C-----A---T---AC---T-------ACTA-------------------C--AATCAT--TT------TACTATTACACAAGTTTGTTTTTCGGAATTAT-GCT--------TTCTA---TA---AT---A-GTAAA-----CATATAATAAAGATATCCCTA-AAGT-TACATGACTAAAGTATTTACTTGATGCGAAC-A---CATT--------TTT--T-------AA-T-ATAGCAGGACAGCTCGGAGATGTTTAGAATAGAAACAAGGA---TGATCGAAAGCGAACAAGTGAAAGTTGAAGAAGAAGATGAT----AATTACCATGGTGTCTCA--GTTA-GGGTTG-TT---AAA--TGTTTATTTTGAAGA--TA-TTATTTTCTAATAT---AACA-----TA----TA--AGAAA--AAGAAA-------------AGT--TATGA-ATTTTTTACTTGTC-T------TCATC----AGCGATGTGTTTTTTCAGTTTGTCGATGTGCTTGTTGTTTTTTT--AATAA--G--TTTCT--AAAACATTTAAACATTGATTTGTAT----CTATATGCTAGCTTCTGAAGATAAAG-TATTTACCATTTATT---ATAATAAAACTGATATTTAAGTGCA-TTTTGTAAACATTTACCTTTTACACTAAATGTAACAATTAAAAG--ATCAAACGTTATGTTGAT
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