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Reference ( family-1153 ) : TATGGCTCAGTCTCTTATATTAA-GAAGATTCAGGGAATTCATAAC-TGATACAGGAACAGGAATTTTACAACTAATTCACTTTCACCTTTAAGTTATTAAAATGAAGTTGTATGGTTTGAAGTAAGTGACATA------------TACTGTAGTTAT-GTTTTTTTGTAATGTTACATTTCACCAATATTAGTGACAAGTATTGTAGATTTTACACTTAAGAAATTATATATGCCCAACATTGACTTCATTTCCACAAA--CAC--AC--TTAATTTGTTATTTTCTCATCTACAAATT-TAAAAAA-AATAATTCAAATGTAGTTTTATCATATTTAATCACGTTGCAAAACTACCATGATGAATTTAATTTATATAAAAAACGAATGAAAACTAAATG-CACTCAATAC-TTTTTCAAAAAATAAA---------CAGTAAAACCAA--------AA-----AAATGCCTTAAGGTTACTTTTGAGACAACCCCTTT----AAACCATG-CT--TGGCTA-AATTCAACGGACC-AAGTTATCTTTATCAACACACTTATATTTATAAGCATTTAGC-AATATATTTAAGTACGAAATGATGCA-TGAATAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTAATTAAGAAATAAATCGT----TTTCC-CATTGA-TTAAAAAAA-ATAAA-TTGA--AACAGCTTCTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCACAG-GAAGCCGAATTATTCGATATTTCTTTAACATATACTGGAT-TAAACTGTAGGCCTTCCATAACGGACATGAAAAACTACGTACAATCATCTATGTACCATAAACGAGTATTTTCATTTGTTTTTT----CCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTCGATAATTCAGATCTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATTAATGTTTCTATTGAATTAAACGAATTAAACATGCACTTACCCTATTGTTTATAATAATCCATCATCAGAAACTATTACAAAAGCATTCATGAGCAACTTTTT-----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTCGTATATTGGTGCTTCCTTCTTGTCAAAATATGTAAACAAAAATGGCGTGTCATCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-G-TTCCCCGTTGTTCC-A-TACTAGGCTATATAAAATTGTCGATCGAAATAATTTTTGACCAATTTGATATAG-----TTTTTATTTTATTAACGTATTTGATTGAAATAGCCAAACTTTTGTTTATTCAAATATGTTTGTTATAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTACTGTCAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTTGGACGGGTACCATCTTTCAAAAGGCGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTAATTTT--TTC-AAAAACGGCAGNTAAGGTA--T--AA-AAC-TA--TATATTCTG-AAAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTTTCAG--A-AA-ACG--------C--CAAAA-TTACGAAACGGCCGACGGCG-CTACAAATATAAAATCCAACGA--GCTTT---GAAT--CAGT-TATATTTATACATTGCGTCATTTTTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--TATTAAAATTTCGAGGACTTT-GGTTATGTCANTATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTG-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGACT
gi|1 : TATGGCTCAGTCTCTTATATTAA-GAAGATTCAGGGAATTCATAAC-TGATACAGGAACAGGAATTTTACAACTAATTCACTTTCACCTTTAAGTTATTAAAATAAAGTTGTATGGTTTGAAGT----GACATA------------TACTGTAGTTAT-ATTTTTTTGTAATGTTACATTTCACCAATATTAGTGACAAGTATTGTAGATTTTACACTTAAGAAATTATATATGCCCAACATTGACTTCATTTCCACAAA--CAC--AC--TTAATTTGTTATTTTCTCATCTACAAATT-TAAAAAA-AATAATTCAAATGTAGTTTTATCATATCTAATCACGTTGCAAAACTACCATGATGAATTTAATTTATATAAAAAACGAATGAAAACTAATTG-CACTCAATAC-TTTTTCAAAAAATAAA---------CAGTAAAACCAA--------AA-----AAATGCCTTACGGTTACTTTTGAGACAACCCCTTT----AAAACATG-AT--TGGCTA-AATTCAACGGACC-AAGTTATCTTTATCAACACACTTATATTCATAA-CATTTAGC-AATATATTTAAGTACGAAATGATGCA-TGAATAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTGATTTAGAAATAAATCGT----TTTCT-TATTGA-TTAAAAAAACATAAA-TTGA--AACAGCTTCTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCACAG-GAATCCGAGTTATTCGATATTTCTTTAACATATACTGGAT-TAAACTGTAGGCCTTCCACAACGGACATGAAAAACTACGTTCAATCATCTATGTACCATAAACGAGTATTTTCATTTGTTTTTT----CCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTCGATAATTCAGATCTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATTAATGTTTCTATTGAATTAAACGAATTAAACATGTACTTACCCTATTGTTTATAATAATCCATCATCAGAAACTATTACAAAAGCATTCATGAGCAACTTTTT-----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTCGTATATTGGTGCTTCCGTCTTGTCAAAATATGTAAACAAAAATGGCGTGTCATCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-G-TTCCCCGTTGTTCC-A-TACAAGGCTATATAAAATTGCCGATCGAAATAATTTTTGACCAATTTGATATAG-----TTTTTATTTTATTAACGTATTTGATTGAAATAGCCAAACTTTTGTTTATTGAAATATGTTTGTTATAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTGCTGTCAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTTGGACGGGTACCATCTTTCAAAAGGCGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTATTTTT--TTC-AAAAACGGCAAATAAGGTA--T--AA-AAC-TA--TAGATTCTG-AAAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTTTCAG--A-AA-ACG--------C--CAAAA-TTACGAAACGTCCGACGGCG-TTACAAATATAAAACCCAACGA--ACTTT---GAAT--CAGT-TATATTTATATATTGCATCATTATTC-AATATATTTT----G----AAACA---TT--AATTAAAATTTCGAGGACTTA-AGTTATGTCATTATCTCT-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTA-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGACT
gi|10 : GGTTGCCATCTTTCAAAAGACGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGCATCTAATTTT--TTC-ATAAATGGTAGTTAAGATATTT--AA-AAA-TACTTATA-TCT--AAAT-TTTAAAAAAATTTTGATTTTACTCATTTTTGCTACGCCTTTTG--AAGTTTTTGCT-GCTTTAGATTTAAAA--A-AA-ACC--------CCGCAAAACTTATAAAACAGCTGACGGTG-CTACAAA---AAA------------CTTT---TAAC--CAGG-AATATTTAT--ATTA----AT------ATTATTTTTT----G----AAACA---GA--TATCAAAATTTCTAGGACGTT-GGTTATGCGAATATGTCA-A----TATATGGAATTTAATA---TGGTACTA-C--AATTTCA-AAT-AAAAA-GTGCGCA------C-CATT----AAATGCG---TT-TT-TTGTGTT----GAA-CTATTGTAGAAAC--ATGAACTTGTAC--TTT------GGTTAAAATT------CG-TT---TAATT-GTTCTCGTGTGTCCCGg
gi|11 : tATTTTTTAAAAACTCCAAAACAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTAATTTT--TTC-AAATACGGCAAATAAGGTA--T--AA-AAC-TA--CAGATTCT--CAAA-TTTAAAGAAAATATGAAGATACCCATTTTTG-TA----------------------AATTTTACATTTTCAG--A-AA-ATG--------C--CAAAA-GTATGAAACGGCTGACGGCG-CTACAAATATAAAATCCAACAT--GCTTT---GAAT--CAGT-TTTATTTAAATAGCATATCATTTTTC-AATATATTTT----G----AAATAATTTG--TATTAAAATTTCAAGGACTTT-GGTTATAACAATATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---AGGAACTG-A--AATTTCA-ATT-AAAAA-GCGTGCT------CTCCTT----TAATGGGATTTT-TT-TTGCGTT----AAA-CTACTGTA-GAAA--ATGAGCAAGTAA--TTC------TGT--GAATCT----ATGTTT---TTTTT-GTTCACGTGGGTTCTGACT
gi|12 : ATTTTTAATGCACCTTTTGTCAAG-GTTTGTCAATTTTACATTTTCAA--A-AC-ATG--------C--CAAAA-TTACGAAAAAGTTGACGGTAATTACAAATATCAAATCCAAGAA--GCTAA---GAATATC-GT-T-TATTTATACATTGCGTCATGTTCC-AATATATTTT------------------------------TT--AGGGTTTC-GGTTCTGTCAATATTTCA-A----TATATTGAATTAAATA---AGGTACTG-A--AATTTGA-ATT-AAAAAAGCGCGCG------CTCCTT----TTATTGGT-TTT-TTTTTGTGTT----TAA-CTACTGTAGAAAA--ATGTGCAGGTAC--ATC------GGT--GAAGGC----ACG-TT---CTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCAACT
gi|13 : t--CAAAA-TTACAAAACAGCCGACGATG-TTACAAAAATCAAATCCCACAA--GCTT----AAATA-CAAG-TATATTTATACGTTGCATCATTTTTC-AATATATTAT----G----AAATA---TG--TATTGAAATTTCGAGGACGTC-GGTTATGCCACTATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---TGAAACTG-C--AATTTTA-ATT-AAAAA-GCGCGCC------CTCCTT----TTATGGGA-C-T-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGAGGCCCAAC
gi|14 : tgaaaaaagtccacagTTT--CCC-TAAAACGGTAGTTAGGATA--A--TA-AAC-TA--CCT-TTATGCAAAA-TTTGAAGAAAATTTAAAGATTCTCATTTTTGTTGCACATTTTG--AAG-TTTTGTTAATATTACATTTAAAA--ACAA-ATGAAACCTCTC--CAAAAATTACGAAACAGTCGACGGCA-TTACACATATCAAATTTCAGAA--GCTTT---GACT--CTCG-TATTTTTATACATTATGTCATTTTCC-AAATTATTTT----T----AATTA---TGCATATTGAAAT
gi|15 : TTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--AATTAAAATTTCGAGGACTTT-AGTTATGTCATTATCTCT-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTA-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGAgagaagtgaccatctaaatggtgagctcaatgacaaatgcgatttt
gi|16 : gatatgaaatcatattggtcaaaactgttaaatgtatcgtattctccaaactataTTTTTC-AATATATTTTTTATGTATTAGCTA---TG--TATTAAAATATTTAGGAGTTT-GATAATGTCAATATCTTA-A----TGTATTGAATTTACTG---AGGTAATA-A-----TTCA-ATT-AAAAT-GCG-----------TCCTT----CAATGGAA-CAT-AT-TTGTGTTTGGCTAA-GTACTATAGAAAA--ATGGGCAGGTAA--TTC------AGT--TAA---------G-TT---GTTTT-ATTCTCATGGGTCCCGAC
gi|17 : TT--TTC-AAAAACTGCAGCTAAAGTA--TTGAACAACATAA-TGTATTCT--AAAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATAGCCACTTTTGCTGCGCATTTTG--GAG-TTTAGCCAA--TTACATTTTCAGAAA-AA-ACG--------C--CAAAA-TTACGAAACAGCCAA
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gi|2 : aactacTATGGCCCAGTCTCTTATATTAA-GAAGATTCAGGGAATTCATAAC-TGATACAGGAACAGGAATTTTACAACTAATTCACTTTCACCTTTAAGTTATTAAAATGAAGTTGTATGGTTTGAAGT----GACATA------------TACTGTAGTTAT-ATTTTTTTGTAATGTTACATTTCACCAATATTAGTGACATGTATTGTAGATTTTACACTTAAGAAATTATATATGCCCAACATTGACTTCATTTCCACAAA--CAC--AC--TTAATTTGTTATTTTCTCATCTACAAATT-TAAAAAA-AATAATTCAAATGTAGTTTTATCATATCTAATCACGTTGCAAAACTACCATGATGAATTTAATTTATATAAAAAACGAATGAAAACTAATTG-CACTCAATAC-TTTTTCAAAAAATAAA---------CAGTAAAACCAA--------AA-----AAATGCCTGACGGTTACTTTTGAGACAACCCCTTT----AAACCATG-CT--TGGCTA-AATTCAACGGACC-AAGTTATCTTTATCAACACACTTATATTCATAA-CATTTAGC-AATATATTTAAGTACGAAATGATGCA-TGAATAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTGATTTAGAAATAAATCGT----TTTCC-TATTGA-TTAAAAAAC-ATAAT-TTGA--AACAGCTTCTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCACAG-GAAGCCGAATTATTCGATATTTCTTTAACATATACTGGAT-TAAACTGTAGGCCTTTCACAACGGACATGAACAACAACGTACAATCATCTATGTACCATAAACGAGTATTTTCATTTGTTTTTT----CCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTCGATAATTCAGATCTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATTAATGTTTCTGTTGAATTAAACGAATTAAACATGTACTTACCCTATTGTTTATAATAATCCATCATCAGAATCTATTACAAAAGCATTCATGAGCAACTTTCT-----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTCGTATATTGGTGCTTCCGTCTTGTCAAAATATGTAAACAAAAATGGCGTGTCATCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-G-TTCCCCATTATTCC-A-TACAAGGCTATATAAAATTGCCGATCGAAATAATTTTTGACCAGTTTGATATAG-----TTTTTATTTTATTAACGTATTTGATTGAAATAGCCAAACTTTTGTTTATTGAAATATGTTTGTTATAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTACTGTCAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTTGGACGGGTACCATCTTTCAAAAGGCGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTAATTTT--TTC-AAAAACGGCAAATAAGGTA--T--AA-AAC-TA--TAGATTCTG-AAAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTTTCAG--A-AA-ACG--------C--CAAAA-TTACGAAACGTCCGACGGCG-TTACAAATATAAAACCCAACGA--ACTTT---GAAT--CAGT-TATATTTATATATTGCATCATTATTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--AATTAAAATTTCGAGGACTTT-AGTTATGTCATTATCTCT-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTATTA-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGACT
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gi|21 : agtgcaca-TATATTTATGCATTGCGTCATTTTCC-CATTGATTTT----G----AAATA---TG--TATTAAAATTTTGAAAACTTT-GGTTCTGTTTATATCTTA-A----TATATTGAATTTGATA---GGGTACTG-g
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gi|24 : --ATAAGCATGTAC--TTCTGAATCGGT--GAATGC----ACG-TT---ATTTT--TTCTCGTGGGTCCC
gi|25 : GAGCTGGTTC--TTC------GGT--TAATCC----ACG--------TTT-GTTTTCATAGGTTTCGACTtga
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Reference ( family-1153 ) : TATGGCTCAGTCTCTTATATTAA-GAAGATTCAGGGAATTCATAAC-TGATACAGGAACAGGAATTTTACAACTAATTCACTTTCACCTTTAAGTTATTAAAATGAAGTTGTATGGTTTGAAGTAAGTGACATA------------TACTGTAGTTAT-GTTTTTTTGTAATGTTACATTTCACCAATATTAGTGACAAGTATTGTAGATTTTACACTTAAGAAATTATATATGCCCAACATTGACTTCATTTCCACAAA--CAC--AC--TTAATTTGTTATTTTCTCATCTACAAATT-TAAAAAA-AATAATTCAAATGTAGTTTTATCATATTTAATCACGTTGCAAAACTACCATGATGAATTTAATTTATATAAAAAACGAATGAAAACTAAATG-CACTCAATAC-TTTTTCAAAAAATAAA---------CAGTAAAACCAA--------AA-----AAATGCCTTAAGGTTACTTTTGAGACAACCCCTTT----AAACCATG-CT--TGGCTA-AATTCAACGGACC-AAGTTATCTTTATCAACACACTTATATTTATAAGCATTTAGC-AATATATTTAAGTACGAAATGATGCA-TGAATAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTAATTAAGAAATAAATCGT----TTTCC-CATTGA-TTAAAAAAA-ATAAA-TTGA--AACAGCTTCTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCACAG-GAAGCCGAATTATTCGATATTTCTTTAACATATACTGGAT-TAAACTGTAGGCCTTCCATAACGGACATGAAAAACTACGTACAATCATCTATGTACCATAAACGAGTATTTTCATTTGTTTTTT----CCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTCGATAATTCAGATCTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATTAATGTTTCTATTGAATTAAACGAATTAAACATGCACTTACCCTATTGTTTATAATAATCCATCATCAGAAACTATTACAAAAGCATTCATGAGCAACTTTTT-----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTCGTATATTGGTGCTTCCTTCTTGTCAAAATATGTAAACAAAAATGGCGTGTCATCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-G-TTCCCCGTTGTTCC-A-TACTAGGCTATATAAAATTGTCGATCGAAATAATTTTTGACCAATTTGATATAG-----TTTTTATTTTATTAACGTATTTGATTGAAATAGCCAAACTTTTGTTTATTCAAATATGTTTGTTATAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTACTGTCAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTTGGACGGGTACCATCTTTCAAAAGGCGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTAATTTT--TTC-AAAAACGGCAGNTAAGGTA--T--AA-AAC-TA--TATATTCTG-AAAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTTTCAG--A-AA-ACG--------C--CAAAA-TTACGAAACGGCCGACGGCG-CTACAAATATAAAATCCAACGA--GCTTT---GAAT--CAGT-TATATTTATACATTGCGTCATTTTTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--TATTAAAATTTCGAGGACTTT-GGTTATGTCANTATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTG-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGACT
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gi|10 : GGTTGCCATCTTTCAAAAGACGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGCATCTAATTTT--TTC-ATAAATGGTAGTTAAGATATTT--AA-AAA-TACTTATA-TCT--AAAT-TTTAAAAAAATTTTGATTTTACTCATTTTTGCTACGCCTTTTG--AAGTTTTTGCT-GCTTTAGATTTAAAA--A-AA-ACC--------CCGCAAAACTTATAAAACAGCTGACGGTG-CTACAAA---AAA------------CTTT---TAAC--CAGG-AATATTTAT--ATTA----AT------ATTATTTTTT----G----AAACA---GA--TATCAAAATTTCTAGGACGTT-GGTTATGCGAATATGTCA-A----TATATGGAATTTAATA---TGGTACTA-C--AATTTCA-AAT-AAAAA-GTGCGCA------C-CATT----AAATGCG---TT-TT-TTGTGTT----GAA-CTATTGTAGAAAC--ATGAACTTGTAC--TTT------GGTTAAAATT------CG-TT---TAATT-GTTCTCGTGTGTCCCGg
gi|11 : tATTTTTTAAAAACTCCAAAACAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTAATTTT--TTC-AAATACGGCAAATAAGGTA--T--AA-AAC-TA--CAGATTCT--CAAA-TTTAAAGAAAATATGAAGATACCCATTTTTG-TA----------------------AATTTTACATTTTCAG--A-AA-ATG--------C--CAAAA-GTATGAAACGGCTGACGGCG-CTACAAATATAAAATCCAACAT--GCTTT---GAAT--CAGT-TTTATTTAAATAGCATATCATTTTTC-AATATATTTT----G----AAATAATTTG--TATTAAAATTTCAAGGACTTT-GGTTATAACAATATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---AGGAACTG-A--AATTTCA-ATT-AAAAA-GCGTGCT------CTCCTT----TAATGGGATTTT-TT-TTGCGTT----AAA-CTACTGTA-GAAA--ATGAGCAAGTAA--TTC------TGT--GAATCT----ATGTTT---TTTTT-GTTCACGTGGGTTCTGACT
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gi|15 : TTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--AATTAAAATTTCGAGGACTTT-AGTTATGTCATTATCTCT-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTA-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGAgagaagtgaccatctaaatggtgagctcaatgacaaatgcgatttt
gi|16 : gatatgaaatcatattggtcaaaactgttaaatgtatcgtattctccaaactataTTTTTC-AATATATTTTTTATGTATTAGCTA---TG--TATTAAAATATTTAGGAGTTT-GATAATGTCAATATCTTA-A----TGTATTGAATTTACTG---AGGTAATA-A-----TTCA-ATT-AAAAT-GCG-----------TCCTT----CAATGGAA-CAT-AT-TTGTGTTTGGCTAA-GTACTATAGAAAA--ATGGGCAGGTAA--TTC------AGT--TAA---------G-TT---GTTTT-ATTCTCATGGGTCCCGAC
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gi|21 : agtgcaca-TATATTTATGCATTGCGTCATTTTCC-CATTGATTTT----G----AAATA---TG--TATTAAAATTTTGAAAACTTT-GGTTCTGTTTATATCTTA-A----TATATTGAATTTGATA---GGGTACTG-g
gi|22 : CGTG------CTCCAT----AAATGGTA-CTT-TT-CAGTGTT----AAA-CTACTGTAATATA--ATTAGCAAGAAC--TTC------GGA--TTATCCTCGAAGG-TT---CCTAT-GTTCTCTTGTGCTCC
gi|23 : T-TTGTGTT----AAA-CTAGTGTAGAAAC--ATGAACAGGTAC--TTC------GGT--TAATCC----GCG-TT---TTTTT-GTTCTAGTGTGTCCCGACTa
gi|24 : --ATAAGCATGTAC--TTCTGAATCGGT--GAATGC----ACG-TT---ATTTT--TTCTCGTGGGTCCC
gi|25 : GAGCTGGTTC--TTC------GGT--TAATCC----ACG--------TTT-GTTTTCATAGGTTTCGACTtga
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gi|4 : TATGGTTCATTCTCTTATATAAAAGAAGATTCAGGGAATTCATAAC-TGATACAGGAACAGGAATTTTATAACAATTTCACTTTCAACTTTAAGTTATTCAAATGAAGTTGTATGGTTTGAGGT----GACATA------------TACTGTA--TAT--TTTTTTTGTAATGTTCCATTTCACCAA------------GTATTGTAGATTTTACACTTAAGAAATTAAATATGCCCAACATTGACTTAATTTCCACAAAGACAC--AC--TTAATTTGTTATTTTCTCATCTACAAATT-TAAAAAA-AATAATTCAAATGTAGTTTTATCATATTTAATCACGTTGCAAAATTACCATGATGAATTTAATTTATATAAAAA-CGAATGAAAACTAAATG-CACTCAATAC-TTTTTCAAAAAATAAA---------AAATAAAACCAA--------AA-----AA-TGCCTTAAGGTTACTTTTGAGACAACCCCTTT----AAACCATG-CT--TGGCTA-AATTCAACGGACC-AAGTTATCTTTGC------------------AAGCATTTAAC-AATATATTTAAGTACAAAATGATGCA-TGGATAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTAATAAAGAAATAAATCGT----TTACC-CATTGA-TTAAAAAAA-A-AAA-TTGA--AACAGCTTCTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCACAG-GAAGCCGAATTATTCGATATTTCTTTAACATATACAGGAT-TAAACTGTAGGCCTTCCATAACAGACATGAAAAACTACGTACAATCATCTATGTACCATAAACGAGTATTTTCATTTGTTTTTTTTTTCCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTTGATAATTCAGATTTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATTAATGTTTCTATTGAATTAAACGAATTAAACATGCACTTACCCTAATGTTTATAATAATCCATCATCAAAAACTATTTAAAAAGCATTCATGGGCAACTTTTTT----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTGGTATATCGGTGCTTCCTTCTTGTCAAAATATGTAAACAAAAATGGCGTGTCATCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-GGTTCCCCGTTGTTCC-A-TACTAGGCTATATAAAATTGTCGATCGAAATAATTTTTGACCAATTTGATATAG-----TTTTTATTTTATTAACATATCCGATTGAAATACTCAAACTTTTGTTTATTGAAATATGTTTGTTATAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTACTGTAAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTAGGACGGGTACCATCTTTCAAAAGGCGCAGTGAAAATACGACGCTTGCCTGGTATCTATTTTT--TTC-AAAAACGGCAAATAAGGTA--T--AA-AAC-TA--TATATTCTG-AAAATTTTAAAAAAAAAATGAAGATACCCACTTTTTCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTTTCTG--A-AA-ACT--------C--CAAAA-TTACGAAACGTCCGACGGCG-TTTCAAATATAAAACCCAATGA--ACTTT---GAAT--CAGT-TATATTTATATATTGCATTATTATTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--AATTAAAATTTCGAGGACTTT-AGTTATGTCATTATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTA-C--GATTTCA-ATT-AAAAA-ACGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAT--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACGTTT---TTTTT-GTTCTCATGCGTCCCGACT
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gi|7 : AACAACAAATAAAA--TAAAAA-CAATTAAAAC-TCTTGCAATAAATCAAGATGGGCTTCA--AAAACCAATACAATTCAAGTACTAAATGCCTTCAAATTACTTTTGAGTCAACCCCTT-------ATTATT-CTGCTGGTTATCCTTGAAC-GACCAAAGT--TTTTTAACAACAGAAATTTATTTACAAGCG-TAAACAAACATATTCAAGTGC---ATAA-GTATTTAATGATGA---------TGCTATGTTTCTTTAT--AATTAAATTGTGTTTTAAACACGATAC---TTGTCAAATTTCA-CTTCGATTTCAATCAA-ATAAA-TTTGTCAACAG---CACACATTCAACTTACTTCGACTC-CGGAGGAGACGAA
gi|7 : ttttatcaaattactaaaacatttatttctagactcaacTGCCATCTTTCAAAAGGCGCTGTGAAAATACGACGTTCGTCTGGTAGCTGTTTTTATTTC-AAAAATGGTAGTTAATGTA--T--TA-AAC-TACTTATATTTC---AAA-TTTAAAGAAAATTTGAAAATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTTACAATTTTACGTTTAAAA--A-AA-ACT--------G--CAAAA-TTACGAAACAGCCGACGACG-CTACAAAAATCAAATCC--CGAAAGCTTTAATGAAG--GAATATTTATTTATACATTTCGTCATTTTTC-AATATATTTT----G----AAATA---TG--TATTAAAATTTAGAGGACGTT-GGTTATGCCACTATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---TGGGACTG-C--AATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CAT-TT-CTATGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCCGGTAA---TC------GGT--GAATCG----ACG--T---TTTTT-GTTCTCGTGAGTCCCGACTaatggaaaattttcaaacaaataacgataacggatttaaaattttcagctaatcaaaaaatattttttataattactctgatgaaacgttatgaaaaaggtgcgatttttaaaaaaacaaaaaaaaacacgaaaaatgagaaaatgtttccatttccgattccgtaaatattttaacaatcagttttctgcataacggcattatatttacattttattccaatttaaataaatgaaaacaccaattaccgtttgtaatgatactactccatctgatcgatgaacaaacacacacatttgccgaatattttagcgaatgtaatatgaattgtaatatttcgtccttcctcccgacacacaaaataaacaaaatggcggttgacaattgagggctaacattcggagtttttttcgagtagcggttatgggcctaggaaataaaatacttttactatactttttttgtagagtctatgaacatcttaaaaagtattcgaagtaaattctgcatatatagatataatattgtacctttataaggtaactttgtggttggtgaccactccacatttacgtcgctgttaagatctttgatgttactggctcccgctctaatagttgccatctttcaaaaggcgctgtgaaaatacgacgttcgtctggtagctgtttttatttcaaaaatggtagttaatgtattaaactacttatatttcaaatttaaagaaaatttgaaaatacccatttttgctgcgccttttgaagtttttacaattttacgtttaaaaaaaactgcaaaattacgaaacagccgacgacgctacaaaaatcaaatcccgaaagctttaatgaaggaatatttatttatacatttcgtcatttttcaatatattttgaaatatgtattaaaatttagaggacgttggttatgccactatctcaatatattgaatttaatatgggactgcaatttcaattaaaaagcgcgcgctcctttaatgggacatttctatgttaaactactgtacaaaaatgagccggtaatcggtgaatcgacgttttttgttctcgtgagtcccgact
gi|8 : ttttatcaaattactaaaacatttatttctagactcaacaacaacaaataaaataaaaacaattaaaactcttgcaataaatcaagatgggcttcaaaaaccaatacaattcaagtactaaatgccttcaaattacttttgagtcaaccccttattattctgctggttatccttgaacgaccaaagttttttaacaacagaaatttatttacaagcgtaaacaaacatattcaagtgcataagtatttaatgatgatgctatgtttctttataattaaattgtgttttaaacacgatacttgtcaaatttcacttcgatttcaatcaaataaatttgtcaacagcacacattcaacttacttcgactccggaggagacgaaaatggaaaattttcaaacaaataacgataacggatttaaaattttcagctaatcaaaaaatattttttataattactctgatgaaacgttatgaaaaaggtgcgatttttaaaaaaacaaaaaaaaacacgaaaaatgagaaaatgtttccatttccgattccgtaaatattttaacaatcagttttctgcataacggcattatatttacattttattccaatttaaataaatgaaaacaccaattaccgtttgtaatgatactactccatctgatcgatgaacaaacacacacatttgccgaatattttagcgaatgtaatatgaattgtaatatttcgtccttcctcccgacacacaaaataaacaaaatggcggttgacaattgagggctaacattcggagtttttttcgagtagcggttatgggcctaggaaataaaatacttttactatactttttttgtagagtctatgaacatcttaaaaagtattcgaagtaaattctgcatatatagatataatattgtacctttataaggtaactttgtggttggtgaccactccacatttacgtcgctgttaagatctttgatgttactggctcccgctctaatagtA-AATTCAACGGACC-AAG---------------CACTTATATTTATAAGCATTAAGC-AATATATTTAAGTACAAAATGATGCA-TAAGTAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTAATTAATAAATAAATCGT----TTTCC-TGTTGA-CTGAAAAAA-ATAAA-TTGA--AACAGCTTTTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCAAAG-GAAGCCGATTTTTTCGATATTTCTTTAAAATATACTGGAT-TAAAGTGTAGGCCTTCCATAACGGACACGAAAAACTACGTATTATCATCTATGTACCATGAACGAGTATTTTCATAT-TTTTTT----TCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTCGATAATTCAGATCTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATCAATGTTTCTACTAAAT--------TTAAACACGCACTTACCCTATTGTTTATAATAATCCATCATCAGAAACTATTACAAAAGCATTCATAAGCAACTTTTT-----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTCGTATATTGGTGCTTCTTTCTTTTCAAAATATGTTAACAAAAATGGCTTGTCCTCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-GTTTCCCCGTTGCTCC-A-TACTAGGCTATATAAAATTGTCGATCGAAATAATTTTTGACCAATTTTATATTGTTTTTTTTTTATTTTATTAACTTATTTGATTGAAATAGTCAAACTTTTGTTTATTCAAATATGTTTGTTTTAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTACTGTCAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTTGGACG
gi|9 : GACGGTTTCCGTCTTTCAAAAGGCGC-------------CGTTTGTCTGGTATCTATTTTT--TTAGAAAAACGGCACTTACGGTA--T--TA-AAC-TA--CATATTCTC-AGAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTAAAAA--A-AACACG--------C--TAAAA-TTACGAAACAGCCGACGGCG-CTACAAATATGAAATCCAACAA--GCTTT---GAAT--CGGG-GAC-TGAATATATTGCTTCTTTTTTTAAATATAATTT----G----AAACA---CG--TATTAAAACTTCGAGGACTTT-TGTTATGCCAGTATCTTA-ATACTTATATTGAATTAAGTA---TAGTAATG-T--AATTTCA-ATA-AAAAA-GCGTGCA------CTTCTT----TGATGGAA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTTTATAAAA--ATGAGCTAGTAC--TTC------GGT--TAATCC----ACG-TT---TTCAT-G-TCTGGTGGGTCCctat
blockSeqs : A A T TAC T AAGT ATTTTTTTTTTA AG GA AC AC A T A A T GATGGGCTT T TACAATTC GTACT TATT T GC T A C G A G T AACTAACAA TT CAAA TA T . T A TC A A TTTT CATGA A CT A A G G G TTTTT G A AT G GT TT TG C A CT T GC T TC T AA C C AAACCTCT CG C A A AA AAT AT TA A A TTATGTATT ATT CAT A A C TACT TAT TATTG T A A ACTAGA ATAT T C T TGGC A G TT ACT TGAATC TAA TCGA T ATG A
blockSeqs : . . T TAT T AAGT . A . . . . . A . . . T . . . . . . . T G . C . . . . C . . T . . . . T T A . . . T . . . T A . . AA . . . . CT G G . . . . . . . . A . A . . A G G . G . T . A . . . CA . . . . . . . . . . G . C . G . T . .
blockSeqs : . . T CGC T AAGT . G . . . . . A . . . T . . . . . . . C G . A . . . . C . . A . . . . . . A . . . . . . . A A . . GT . . . . A T A . . . . . . . . . . C . . . T A . G . T . A . . . AA . . . . . . . . . . C . A . G . . . .
blockSeqs : . . C . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . C A . C . . . . A . . T . . . . . . A . . . . . . . A A . . GC . . . . . T G . . . . . . . . . . C . . . T G . G . T . C . . . AA . . . . . . . . . . C . C . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C G . A . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . A T . . AA . . . . . G G . . . . . . . . . . A . . . G A . T . A . T . . . CA . . . . . . . . . . G . A . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . GT . . . . . T G . . . . . . . . . . C . . . G G . G . T . A . . . AG . . . . . . . . . . G . A . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . AA . . . . . T C . . . . . . . . . . A . . . T G . G . A . T . . . AG . . . . . . . . . . G . A . C . . . .
blockSeqs : T . . AA . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . G A . G . T . A . . . AA . . . . . . . . . . C . T . G . . . .
blockSeqs : T . . AA . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . T A . T . T . A . . . CG . . . . . . . . . . A . A . T . . . .
blockSeqs : . . GT . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . T A . G . A . T . . . AG . . . . . . . . . . G . A . T . . . .
blockSeqs : . . CT . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T G . G . A . T . . . AG . . . . . . . . . . C . C . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G T . G . A . T . . . CA . . . . . . . . . . C . C . G . . . .
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blockSeqs : . G . T . G . . . A . . . . . . . . . . C . C . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . A . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . G . . . .
blockSeqs : . . . . . A . G . . . .
blockSeqs : . A . T . . . .
blockSeqs : C . . . . . .
blockSeqCons : AAGT
originalCons : TATGGCTCAGTCTCTTATATTAA-GAAGATTCAGGGAATTCATAAC-TGATACAGGAACAGGAATTTTACAACTAATTCACTTTCACCTTTAAGTTATTAAAATGAAGTTGTATGGTTTGAAGTAAGTGACATA------------TACTGTAGTTAT-GTTTTTTTGTAATGTTACATTTCACCAATATTAGTGACAAGTATTGTAGATTTTACACTTAAGAAATTATATATGCCCAACATTGACTTCATTTCCACAAA--CAC--AC--TTAATTTGTTATTTTCTCATCTACAAATT-TAAAAAA-AATAATTCAAATGTAGTTTTATCATATTTAATCACGTTGCAAAACTACCATGATGAATTTAATTTATATAAAAAACGAATGAAAACTAAATG-CACTCAATAC-TTTTTCAAAAAATAAA---------CAGTAAAACCAA--------AA-----AAATGCCTTAAGGTTACTTTTGAGACAACCCCTTT----AAACCATG-CT--TGGCTA-AATTCAACGGACC-AAGTTATCTTTATCAACACACTTATATTTATAAGCATTTAGC-AATATATTTAAGTACGAAATGATGCA-TGAATAATAC---------AACTACATTTGTATATTGAA--ACACCGTGTACTAATTAAGAAATAAATCGT----TTTCC-CATTGA-TTAAAAAAA-ATAAA-TTGA--AACAGCTTCTCACAATCGGCTTGCTTCAAATCACAG-GAAGCCGAATTATTCGATATTTCTTTAACATATACTGGAT-TAAACTGTAGGCCTTCCATAACGGACATGAAAAACTACGTACAATCATCTATGTACCATAAACGAGTATTTTCATTTGTTTTTT----CCGCCAAAAAAGGAAGACTATTGCAGCCATTTCGATAATTCAGATCTGACGGCAATCACTGCTCACATGGCCGCATTAAAATTAATGTTTCTATTGAATTAAACGAATTAAACATGCACTTACCCTATTGTTTATAATAATCCATCATCAGAAACTATTACAAAAGCATTCATGAGCAACTTTTT-----GCAGAAACAGCGAAGCAAATTCGTATATTGGTGCTTCCTTCTTGTCAAAATATGTAAACAAAAATGGCGTGTCATCCAAGGTCAACAAA--C-TGGG-G-TTCCCCGTTGTTCC-A-TACTAGGCTATATAAAATTGTCGATCGAAATAATTTTTGACCAATTTGATATAG-----TTTTTATTTTATTAACGTATTTGATTGAAATAGCCAAACTTTTGTTTATTCAAATATGTTTGTTATAGTGATTTTTGGCATGGTGTCGAGGCTACTGTCAAATCAGCTGACAGCATTTCGTTGTCGTTGACAACACTTGGACGGGTACCATCTTTCAAAAGGCGCAGTGAAAATACGACGTTTGCCTGGTATCTAATTTT--TTC-AAAAACGGCAGNTAAGGTA--T--AA-AAC-TA--TATATTCTG-AAAA-TTTAAAGAAAATTTGAAGATACCCATTTTTGCTGCGCCTTTTG--AAG-TTTTGCCAATTTTACATTTTCAG--A-AA-ACG--------C--CAAAA-TTACGAAACGGCCGACGGCG-CTACAAATATAAAATCCAACGA--GCTTT---GAAT--CAGT-TATATTTATACATTGCGTCATTTTTC-AATATATTTT----G----AAACA---TG--TATTAAAATTTCGAGGACTTT-GGTTATGTCANTATCTCA-A----TATATTGAATTTAATA---AGGTACTG-A--GATTTCA-ATT-AAAAA-GCGCGCG------CTCCTT----TAATGGGA-CTT-TT-TTGTGTT----AAA-CTACTGTACAAAA--ATGAGCAGGTAA--TTC------GGT--GAATCC----ACG-TT---TTTTT-GTTCTCGTGGGTCCCGACT
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Alignments
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