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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTTTT---TAAATAA-GTGAACTGTTTCCCTCGGAGTCTTACATGTATGTATGTAGAAATTATGAAGTGTTTGGTGTCGTTTATCATAAATG-ACAGTTTTAATTTTAGTTGT-TTAAATTTTAAACCCCA-TTGATTGCAATATCGTTAGATATCATATAAAGTTT--ATT-------------GTGATT--TTGTAGATAGGACTTGGTCA--A----ATATAA----------------TTCATTGTAAGTAAA------A-A-TATAGT-----G-AACGTTACT---AAAGAAATT-CTCTTA--AATG---TTATTGAGAACAATAATGAAGAGCA--G-GCTCAAACTTGGGTCGTCTTGCGTCAGTCC----CATTTGTA-----AGTC-AATAAAGTCCGtgagtttggttccaattaccgtttttaaataattgtattcctaagtacttaaatgatgtgactgtttctattggagtgttatatatgtagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaaatgaccgttttagtcttagttgcgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatatcatttaaaattgattgcaaggcaaatggtgattttgcaaatacaacttggtcatcggcacatataattaagaaaaacttcagttcgttgtagttaaaaatatcttgtaagttactattgatgttgtctttaatgtcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagcttggattcccttgctttactcccatgtgtgagtcgataaaatccgaatattccgtgttatacctgacgcatgcttttactactttgtacattgatttgatcgcttcaactactttacaacttatgttctcatttagtagtttttgccacagaaactgcctatcgatgctgtcgtaggctttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctcgagttaagaacttttgtaattatggcatgtaataagaatatgcagtcttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcagtaaaattcgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagccctgtagtttttttttcattcatatcatcttttttgtagattggtacaattataccacggccccatgtctctggatattcactgttgttgaacattctgttgtataattttaatagaaatggtgagattatgttgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaaattcatctaaaccacaacttttattatttttttgcgcaaatgttgcggtttgtagttcttgtaaacttatatctgcatctaaaatgggatcgttaaatattatgttatcattttcattatttattgagttgtctcttaaattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaattggttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatgtgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgttttcgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgttttattttgttatattttgtgcgtgatttggaaaatttaattctgttttcattgtttctattattgttgaacatgtttcttgtttttttgaattcttgttttgctttatggcattttccattaaaccaaggcttatttattctgtgtgcacgtggtttcactgtgttcttattttgcaagctgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcatgaactctgtgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaacaggtgtgacctgaattggtcagtttttgtttcgtcccatactattttgttgacaggttgactgtccgctcgtgcgttacttgagttgtgttggtatgctgttttattaaaacaaaataaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttggaagttgtacagggttgtaaaatcattaaaatttaataacaaataatcgactgtgctatttcctagttgtgattgatacgtatattcgccaacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacacatattaagcagacgacgcccatttgagtcgatcacgtggtctttgttagtgcgtaatggtatgtcgtgtgagattcagtgtatgaatgggtatttagatacttgtcataggtgataaagtcttgcatgttagcggttctactgtttagatctccgcaaataaatatatttccaagattacaatatttaattattcctaactctaattgttcgaaaacatcaaaattgtctgagttaattacttttgaacaaattggtggtatgtaaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaataaatcagcatcaattttcagccagattaatccatattgttctttctctataatatttatatatttacttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttttgtattttttgatttattacctacaatatgaacacttttatagccttttatatctaagttaagccacgtttcacaaagaaaaataatatcgtaactgttcaataaattgatgaaatctggatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagagattatttggagctgctcctcttgactttcctattattccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgagacaaaacgttgaccgttgatgaacagtttatctccaactagtttgacgttgttgtttccctttgctttttcttgctgcatgattggaaaaagctgtttccgagcgtcgcgcacctgttttggccattggatgattattccaagatttgtctgtttgagtgtttctgttttttcaaacgatt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCTTCGCAATAATAGAATGAAATACA-TTAT--ATAGAATCT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAAC-CAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cgtgtttaacTTGTAGTAT-GTATTTAACTGTTCAATATTACTAACTATCATTTGTTTAAATGATTCTACTTTTGTTTCATCCCATATGAGTTTCTTTTCGATA--TTAATACTATTCG-----------CATT---TTTTAT--GTGTATTGTCACATTTCTTCTTAAAACTGAAGTATAAT-GCCGCGTGATCAGAATGATTTGTCCAATT-TAAAATTTCAAAGTTCTGAATAGTATT-TAGATTAGGTGTATCAAA--TTAA----AGATAGTCCGTTACACTGAGACCAC------GTGGTGAGCAAAATGTATAATCACATATACCATTGTCCTTATGCATTCGACCATTGGCTATTACGTGGCCTGTAGTTTTACGCAAAGATAT-AAGT---TTACGCCCATTGTTATCGATAA--TGGTGTCCCGGTTGCACCGCGCATGAATGGTATTTTGACTTAATGTGATATCATCATCATCT---T---TATCCAGATATCTATCA--AATTCTAATATAT--CATATAAATTGCTTGTTCTCGTATTTTAGTCCCCCAT---TACATATGTCTTACCAAGTTT------GTTGAATT-TTTCAATACCTTTCTTGATTACTTCAACTTGAAAAAATCAAAATCTTTACCT---TTATAAACTTTCGAACTAATAGGTGGAATGT--ACGTGTTACAAATATAAACATCTTCAGTAAGGTAAAACTTATTTTGC-TTGATTTTCAGACAAATTCTACCATAGTCATTTTTTTTTTACAACAGAAATGTT-ATTT-T----TTAGTGTT-TTTTTGGTAATAAACAGAAATTCCTCCGCTATAGCGTCC--TTTCTTTTACCGTGAGATTTATTACCATA-AATGTGTGTAC--TATCAAACCCATTAATATTTAAGTCACAAAAAT-GTTTTTCACTG--ATCCATGTTTCACTTAGAAATATGATGTCATAGGACTGTATACTA--TTGATAAAATCTTCGTCAGTTAATTT-CGCAACAATCCATTAACATTTCATGATATGATTTGTAGCTCCTCCTTCTCG----TCCTA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCCCGCTGCTTTTTCT--CTGTCCATGATTGGATATAACTCTCGTTGTTT-TGAGCCTCGAGATCAC------TGACT-TTAGAATTGTTTACTCTGAAGTTCTATTTGTTTTATTTTTTttctgttacttcccggaacctgccagcgacactgtctcagagtagaagttttgcgccagcccattttactgattttcccgctgctttttctctgtccatgattggatataactctcgttgttttgagcctcgagatcactgactttagaattgtttactctgaagttctatttgttttatttttt
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTACACAAGCCTGGATGTTACTATATAATATAGACTTAATCGTAGCAACCATTTTGCAGCTGACACCTAACTGAATTAATTTGAACCATAATGTATATCTTAGAATAGTGGCAAATGCTTTCTCGTAATCGATGAATTTACAAAACCATTTAGAGTTCCTAGATAAAATATTGTGTATAACAGAGTGTAGAACAA
Unaligned ( gi|12 ): CTGTAAATGCTTTAATCATATTAAAACACTAACAACTTATACCTAACTGGGCAATGTTCACCCAAATCACATTCCAAAATGCAGTACCAAAACATTTTACAACCTATGAAAGCACAGTACAATGTATATCCTGAGTAAGTATTTTATAAATTTATAAATTGA
Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTGAATTATTGAATGCAAAATAAATATACACTCTGTAATACTATGACTATCGTGAAAGCCAAATTGTGCCTCGTTAAAAGTGTGTTCCGCCTCGCACCATTTATTTATTCTGTTACGTAGGGTGAGAGAGACT
Unaligned ( gi|15 ): CCATTGGTAATAAGGTAACCAGTGTTTAACACAGAGAAATACGTTTTTGCCCATAGTTGTCATTCATGGATTCCTGGTTGTGCCGTACATGGATAGCATTTTGCCTTAATGATACATATTCA
Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT






Alignments
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Reference ( family-1144 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGNTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATNACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATANTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATGATGTGAACTGTTTCCNTCGGAGTNTTACATGTATGTATGTAGAAATCNTGGNGTGTNTGGCGTCNTTTNTCA-AA-ATG-ACAGTTTTAGTTTTAGTTGCGTTNATTTTTAAACCCCATT-GGTTGCAATATCGTTNAATATCATATAAAGTTG--ATTGCAAGNCANNCG-GTGATT--TTGCAAATACGACTTGGTCATCGGCA--------CATATAATTAAAAATAACN--TNAGT-TCGTTGTAGGT-AAA-A-TATCNTGT--AAGTTACTATCGATGTTN-TCTTT--AATG---TCATTGANGAANANNATGAAGAGCA--G-GCTTGAGCTCGGG-TCCCCTTGCTTTANTCCNA----TGCGT-----GAGTC-GATAAAGTCCGGATATTC-CGAGTTGTACTTTACGCATGATTTNACG--ACCTC---GTACATCGCTTTNAT--CGC-T-TCAACTATTTTGCAACTTATGTTCTC-ATTTGATGAGTTTT-GCCGCAGGAA-TGC-CTAT---TGACGNT--ATCGTAAGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTANAATT-TTGCTCTCGAGTTAAGAACCTTCGTAATNATAGAATG-AA-TA-A-GAATATGCAAT-CT-TCG----ATAGATT-TACCTTTTTGATAANCAAATTGG---T-------CGTT-GATAATTTTNTCATATTTTTNTGNCCATGCAGTTCGATAGTCNGTTNAGTAGAATTCGNGAATATANCGTTCCTAGCATGTTNACGGGTGTGANNNCCCTGTAGTTTTTT-TTTCATTCATATCATCTTTTTTGTAGATTGGTACAATTATACCACGGCCCCATGTCTCTGGATATTCACTGTTGTTGAACATTCTGTTGTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTTGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAAATTCATCTAAACCACAACTTTTATTATTTTTTTGCGCAAATGTTGCGGTTTGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTGCATCTAAAATGGGATCGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATTGAGTTGTCTCTTAAATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATTGGTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATGTGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTCGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGTTTTATTTTGTTATATTTTGTGCGTGATTTGGAAAATTTAATTCTGTTTTCATTGTTTCTATTATTGTTGAACATGTTTCTTGTTTTTTTGAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTCCATTAAACCAAGGCTTATTTATTCTGTGTGCACGTGGTTTCACTGTGTTCTTATTTTGCAAGCTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCATGAACTCTGTGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTTAACTGTTCAATATTACNGGCTGTNACCTGTTTAANTGGTTCNGCTTTTGTTTCGTCCCATACGANTTTNTTTTCGACAGGTTGATACTGTCCGCTCGTGCGTTACATTGAGTTNTGTTGGTGTGCTGTCACATTTCTTNTTAAAACTGAAGTANAATTGNCGNGTGATCAGAATGATTCGTCCGGTTCTAGNATTTCGAAGTTNTGAACAGNGTTGTAGANTAGGTGCATCAAAATTTAATAACAGATAGTCCGTTACACTGNGACCACTTCCTAGTNGTGANCGANACGTATANTCGCNNATACCANTGTCNTTGTGCANCCNGCCATTNGCTATNACGNGNCCTGTGGNCTNACGCAAANATATTAAGCAGACGAC---GCCCATTNNNGTCGATNACGTGGTNTCCCGGTTGCACCGCGCGTGAATGGTATNTCGACTTAATGTGATGTNNTCANCGTNTGAATGGGTATCCAGATACCTGTCATAGGTNNTAANGTNTTGCATGTNAATTGCNTGTTCTNNTGTTTTAGNCCCCCGCAAATACATATGTNTTNCCAAGNTTACAATANTTGAATTATTCCNATACCTTTCTTGATTGCTTCGACTTGAAAANATCAAAATCGTTACCTGAGTTANNNACTTTCGAACNAATNGGTGGNATGTAAACGTGTTACAAATATAAACATCTTCANTAAGGTANNANTNANTCNGCATCGATTTTCAGNCAGATTNNNCCATAGTCGTTCTTTCTCTACAACAGAAATGTTTATNTATTTACTTAGCGTTATTTTTGGTAATAAACNGANANTCCNCCGCTGTAGCGTCCTTTTTCTTNTACCGTNNGATTTATTACCATACAATGTGNGCACTTTNNCAGACCCNTTNATATCTAAGTCACAAAAAT-GTTTTTCACTG--ANCCACGTTTCACNNAGAAANATGATGTCGTAGGACTGTNCANTAAATTGATGAAATCTNCGTCANNTAGTTTACGCNNCAGTCCGTTNACATTCCANGANATNATTTGNAGCTNCTCCTTCTCGACTT-TCCTATTA-TTCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGAGACAAAACGTTGACCGTTGATGAACAGTTTATCTCCAACTAGTTTGACGTTGTTGTTTCCCNCTGCTTTTTCTTGCTGTCCATGATTGGATANAACTCTCGCTGTTTCCGAGCNTCGNGATCACCTGTTTTGGCCATTGGAATTGNTTACTCCGAAGNTCTGTCTGTTTNANTNTTTCTGTTTTTTCAAACGA
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TTGAAATATTTTAAATATATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATGATGTGA-CTCTTTCTATTGGAGTGTTATATAATTTTATATAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTTTCA-AATATG-ACAGTTTTAGTATTGGTTGTGTTTATTTTTAGACCCCATT-GGTTACAATATCGTTCAATATAATTTAAAATTG--ATTGCAAGGCAAACG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCAGCA--------TATATAATTAAGAACAACT--TAAGT-TCATTGTAGGT-AAA-A-TATCTTGT--AAGTTGCTATTGATGTTG-TCTTT--AATA---TCATTAAGGAAAAGCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGTTTGGA-TCCCCTTGCTTTACTCCCT----TGTGC-----CAGTC-GATAATATCCGAATATTC-CGAGTTATACCTCACGCATGCTTTCACG--ACCTT---GTACATTGATTTGAT--CGC-T-TCAGCTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTAAC-CGTTTT-GCTACAGAAACTGC-CTAT---CAATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTAGAGCT-TTTCTCTCCAGTTAAGAACTTTTGTAATTATGGAATGTAA-TA-A-GAATATGCAGT-TT-TCA----ATAGATT-TACCTTTTTGGTAAGCAAATTGG---T-------TGTT-GATAATTTTGTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAATAAAAGCTGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCTCTATAGTTTTTTGTTTCGTTTATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGACCCCATGTCTCCGGATATTCACGGCTGTTGAACATTCTGTTTTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTT--CGTAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTACATCTAAAATGGGAACGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATAGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGTTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATATGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTTGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGATTTATTTTGATATATTTTGTGCGTGCTTTGGAAA----------------ATTGTTTCTATTATTATTGAACATGTTTCATGTTTTTTTAAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTTCATAAAACCAAGGTTTATTTATTCTGTATGCACGTGGTTTCAATTTGTTCTTATTTTGCAAGTTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTA-----ACTGG-TGTGACCTG---AAGTGG-TCAGTTTTTGTATCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAGTTTG--ACTGTCCGC------------TTGAGTTGTATTGGTGTGCTG-------TTTTATTAAAAC-AAACTAAAATTGGTGAGTGATCAGAA-AATTCATTTGGTTCTAGTATTTGAAAGTTAT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATGAAAATTTAACAACAAATAAT-CG----ACTGTG-CTATTTCTTAGTTGTGATTGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ATATATTAAGCAGACGAC---GCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTCTTTTTGTTA----GTGCGT-AATGTTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGTGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATGGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTG-TTTAGATCTTCACAAATATATATATATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCCA-AC---TC-TAATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCCT---CTGAGTTAGTTACTTTTGAACAAATTGGGGGTATGTTAACATG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATGAATCAGCATCAATTTT-AGCCAGATTAATCCATA-TTGCTCTTTCTCTAT------GATGTTTATATATTTA-----CATTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCACTGTAACGTCCTTT---TTGTATTTTTTTATTTATTACC-TACAATATGAACACTGTATTAG--CCTTTTATATCTAAGTT---AATATCGTTTATGTCTGCCAGCCACGTTTCACAAAGAAAAATTATATCGTA--ACTGTTCAATAACTCGATGAAATCTGTATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGAAATTATTTGGAGCTGCTTC-TCTTGACTT-TCCTAGTA-ATCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAACTGTATCTCCAACTAGTTTGACATTGTTGTTTCCCTTTGCCTTTTCTTGCTG--CATGATTGGG-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGTG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGCCTATTCC-AAGATTTGCTTGTTTTAATGTTTCTGTTTTTTC-AACGAttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttttgaaatattttaaatatattgtataatgcaaaacttccgtgttgtgctagatgttttacttaaatgatgtgactctttctattggagtgttatataattttatatagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaatatgacagttttagtattggttgtgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatataatttaaaattgattgcaaggcaaacggtgattttgcaaatacaacttggtcatcagcatatataattaagaacaacttaagttcattgtaggtaaaatatcttgtaagttgctattgatgttgtctttaatatcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagtttggatccccttgctttactcccttgtgccagtcgataatatccgaatattccgagttatacctcacgcatgctttcacgaccttgtacattgatttgatcgcttcagctactttgcaactcatgttctcatttaaccgttttgctacagaaactgcctatcaatgctgtcgtaggcttttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctccagttaagaacttttgtaattatggaatgtaataagaatatgcagttttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcaataaaagctgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagctctatagttttttgtttcgtttatatcaccttttttgtagactggtacaattataccacgaccccatgtctccggatattcacggctgttgaacattctgttttataattttaatagaaatggtgagattatgtcgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaggttcatctaaaccacaacttttgttattttttcgtaaatgttgcggttcgtagttcttgtaaacttatatctacatctaaaatgggaacgttaaatattatgttatcattttcattatttatagagttgtctcttggattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaatcgtttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatatgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgtttttgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgatttattttgatatattttgtgcgtgctttggaaaattgtttctattattattgaacatgtttcatgtttttttaaattcttgttttgctttatggcatttttcataaaaccaaggtttatttattctgtatgcacgtggtttcaatttgttcttattttgcaagttgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcacgaactctgcgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaactggtgtgacctgaagtggtcagtttttgtatcgtcccatactattttgttgacagtttgactgtccgcttgagttgtattggtgtgctgttttattaaaacaaactaaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttgaaagttatacagggttgtaaaatcatgaaaatttaacaacaaataatcgactgtgctatttcttagttgtgattgatacgtatattcgcctacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacatatattaagcagacgacgcccattcgagtcgatcacgtggtctttttgttagtgcgtaatgttatgtcgtgtgagtcttcagtgtatggatgggtatttagatacttgtcatgggtgataaagtcttgcatgtaagcggttctactgtttagatcttcacaaatatatatatatttccaagattacaatagttaattattcccaactctaattattcgaaaaaaatcaaaatcctctgagttagttacttttgaacaaattgggggtatgttaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaatgaatcagcatcaattttagccagattaatccatattgctctttctctatgatgtttatatatttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttgtatttttttatttattacctacaatatgaacactgtattagccttttatatctaagttaatatcgtttatgtctgccagccacgtttcacaaagaaaaattatatcgtaactgttcaataactcgatgaaatctgtatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagaaattatttggagctgcttctcttgactttcctagtaatccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgggacaaaacgttgaccgttgatgaaaactgtatctccaactagtttgacattgttgtttccctttgccttttcttgctgcatgattgggaaaagctgtttccgagcgtcgtgcacctgttttggccattggatgcctattccaagatttgcttgttttaatgtttctgttttttcaacgaat
gi|11                         : atatttattttcttttattgcgtctaagtattttctgttttaaagtcatgtttaaataagctataatactgtagtctggatgagttttttatttctgagtaccaggtttgtttatatgtatctaagatgcgttgttttatgatgggaaaatgtatatctatattaaattgctgtaccatatatcactaaatccatggttttggagaatagtttttatttgatatgcccagtttgtgttttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttTATTTATTTCTTCTATTCATAATTGTGTCTAATTAATTTTCTGTTGTAAAGGCATGTTTAAATAAGCAAC--AGTA-----GTCTTGCCGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGTTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGTATTGTTTTATAATGGGAAAAGGTATAGATCTCTATATat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCATTGGTAATAAGGTAACCAGTG-TTTAACACAGAGAAAT-------ACGTTTTTGCCCATAGTTGTC-ATT-CATGGATTCCTGGTTGTGCCGTACATGGATAGCATTTTGCCTTAATGa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTATTT--CCTTTG----AAT-----TA--TATGTTTATATTTTAAAATCGTGTTTAAATAAGCTGTCTAATACTGTAGTCAGGATGAGTTGTTTACTGATGAATACCAGTTTTGTTTATATGTGTATCTatacatattca
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatatagttttgattgtaatgcattttacaactttcgttcattttccagcattgtctctcttcgttttaaatattttataggcagttcatATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTTTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTGCTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTAATA--TGTATCTTAGATGCGCTTTTTTATGATGAGAAAATGTATA----TCTATATTGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATATTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGAACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATAACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGTGTTTAACACCTTCGCAATAATAGAATG-AAATACA-TTATATAGAAT-CT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAACCAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTACACAAGCCTGGATGTTACTATATAATATAGACTTAATCGTAGCAACCATTTTGCAGCTGACACCTAACTGAATTAATTTGAACCATAATGTATATCTTAGAATAGTGGCAAATGCTTTCTCGTAATCGATGAATTTACAAAACCATTTAGAGTTCCTAGATAAAATATTGTGTATAACAGAGTGTAGAACAA
Unaligned ( gi|12 ): CTGTAAATGCTTTAATCATATTAAAACACTAACAACTTATACCTAACTGGGCAATGTTCACCCAAATCACATTCCAAAATGCAGTACCAAAACATTTTACAACCTATGAAAGCACAGTACAATGTATATCCTGAGTAAGTATTTTATAAATTTATAAATTGA
Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTGAATTATTGAATGCAAAATAAATATACACTCTGTAATACTATGACTATCGTGAAAGCCAAATTGTGCCTCGTTAAAAGTGTGTTCCGCCTCGCACCATTTATTTATTCTGTTACGTAGGGTGAGAGAGACT
Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT






Alignments
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Reference ( family-1144 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAATATTTTAAATNTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTGTTTCTA---TCGGAGTGTT-ATATG---T---TAT--GTAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTTTTAGTTGCGTTNATTTTTAAACCCCATT-GGTTGCAATATCGTTCAATATCATNTAAAATTG--ATTGCAAGGCANGCG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCGGC--------ACATATAATTAGGAATAACT--TCAGT-TCGTTGTAAGT--AAA-ATATCNTGT--AAGTTACTATCGATGTTN-TCTTT--AATG---TCATTGAGGAAAANCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGCTTGGGTCCCCTTGCTTTACTCCCATGTGTGA-GTCGATAAAGTCCGA-------ATATTC-CGAGTTGTACCTTACGCATGNTTTNACG--ACCTT---GTACATCGNTTTGAT--CGC-T-TCAACTACTT-TGCAACTCATGTTCTC-ATTTGAC-ANNTTTTGCCACAGAAACTGCACTAT---CGATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTANAGCT-TTNCTCTCGAGTTAAGAACTTTCGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAAT-CT-TCG----ATAGATT-TACCTTTTTGATAACCAAATTGG---T-------CGTT-GATAATTTTNTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAGTAAAATTCGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCCCTATAGTTTTTTGTTTCGTTCATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGGCCCCATGTCTCCGGATATTCACNGCTGTTGAACATTCTGTTNTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTTTGCGCAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTGCATCTAAAATGGGANCGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATNGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGNTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATGTGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTCGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGNTTTATTTTGNTATATTTTGTGCGTGNTTTGGAAAATTTAATTCTGTTTTCATTGTTTCTATTATTGTTGAACATGTTTCNTGTTTTTTTGAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTCCATNAAACCAAGGCTTATTTATTCTGTGTGCACGTGGTTTCANTNTGTTCTTATTTTGCAAGCTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AANTGGT-CAGTTTTTGTTTCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAG-TTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-GAANTAAAATTGGCGAGTGATCAGAA-AATTCGTTCGGTTCTAGTATTTGAAAGTTNT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATNAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGTGCTATTTCCTAGTTGTGATCGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTNGCTATGAGGNGNCCTGTGGNCTGACGCAGANATATTAAGCAGACGACGCCCATTNNNGTCGATCACGTGGTCTCCCGGTTGCGCCGTGCGTGAATGGTATNTCG-CTTAATGTGA-GTCTTCAGCGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATAGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTCCGCAAATANATATGTATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCNA-AC---TCT-AATTA-TTCGA---GAAAAAATCAAAATCNT---CTGAGTTANTTACTTTCGAACAAATTGGTGGTATGTAAACGTG--ACAAATATAAACATCTTCATTAAA-TATCAATNAATCAGCATCGATTTTCAGCCAGATTAATCCATA-TCGTTCTTTCTCTAT------AATGTTTATATATTTACTTA-CGTTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCGCTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTGATTTATTACC-TACAATATGAACACT-TAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTC----AA-AT-GTTT---T---CTG--AGCCACGTTTCACAAAGAAAAATNATATCGTA--ACTGTTCAATAA-ATCGATGAAATCTGNATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGANATTATTTGGAGCTGCTCC-TCTCGACTT-TCCTATTA-TTCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAANAGTTTATCTCCAACTAGTTTGACGTTGTTGTTTCCCTTTGCTTTTTCTTGCTG--CATGATTGGA-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGCG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGNTTATTCC-AAGATTTGTTTGTTTTANTGTTTCTGTTTTTTCAAACGA
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TTGAAATATTTTAAATATATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTCTTTCTA---TTGGAGTGTT-ATATAATTT---TAT--ATAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTATTGGTTGTGTTTATTTTTAGACCCCATT-GGTTACAATATCGTTCAATATAATTTAAAATTG--ATTGCAAGGCAAACG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCAGC--------ATATATAATTAAGAACAACT--TAAGT-TCATTGTAGGT--AAA-ATATCTTGT--AAGTTGCTATTGATGTTG-TCTTT--AATA---TCATTAAGGAAAAGCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGTTTGGATCCCCTTGCTTTACTCCCTTGTGCCA-GTCGATAATATCCGA-------ATATTC-CGAGTTATACCTCACGCATGCTTTCACG--ACCTT---GTACATTGATTTGAT--CGC-T-TCAGCTACTT-TGCAACTCATGTTCTC-ATTTAAC--CGTTTTGCTACAGAAACTGC-CTAT---CAATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTAGAGCT-TTTCTCTCCAGTTAAGAACTTTTGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAGT-TT-TCA----ATAGATT-TACCTTTTTGGTAAGCAAATTGG---T-------TGTT-GATAATTTTGTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAATAAAAGCTGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCTCTATAGTTTTTTGTTTCGTTTATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGACCCCATGTCTCCGGATATTCACGGCTGTTGAACATTCTGTTTTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTT--CGTAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTACATCTAAAATGGGAACGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATAGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGTTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATATGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTTGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGATTTATTTTGATATATTTTGTGCGTGCTTTGGAAA----------------ATTGTTTCTATTATTATTGAACATGTTTCATGTTTTTTTAAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTTCATAAAACCAAGGTTTATTTATTCTGTATGCACGTGGTTTCAATTTGTTCTTATTTTGCAAGTTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AAGTGGT-CAGTTTTTGTATCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAGTTTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-AAACTAAAATTGGTGAGTGATCAGAA-AATTCATTTGGTTCTAGTATTTGAAAGTTAT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATGAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGTGCTATTTCTTAGTTGTGATTGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ATATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTCTTTTTGTTA----GTGCGT-AATGTTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGTGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATGGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTTCACAAATATATATATATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCCA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCCT---CTGAGTTAGTTACTTTTGAACAAATTGGGGGTATGTTAACATG--ACAAATATAAACATCTTCATTAAA-TATCAATGAATCAGCATCAATTTT-AGCCAGATTAATCCATA-TTGCTCTTTCTCTAT------GATGTTTATATAT----TTA-CATTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCACTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTTATTTATTACC-TACAATATGAACACTGTAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AATATCGTTTATGT---CTGCCAGCCACGTTTCACAAAGAAAAATTATATCGTA--ACTGTTCAATAA-CTCGATGAAATCTGTATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGAAATTATTTGGAGCTGCTTC-TCTTGACTT-TCCTAGTA-ATCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAACTGTATCTCCAACTAGTTTGACATTGTTGTTTCCCTTTGCCTTTTCTTGCTG--CATGATTGGG-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGTG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGCCTATTCC-AAGATTTGCTTGTTTTAATGTTTCTGTTTTTTC-AACGAttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttttgaaatattttaaatatattgtataatgcaaaacttccgtgttgtgctagatgttttacttaaatgatgtgactctttctattggagtgttatataattttatatagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaatatgacagttttagtattggttgtgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatataatttaaaattgattgcaaggcaaacggtgattttgcaaatacaacttggtcatcagcatatataattaagaacaacttaagttcattgtaggtaaaatatcttgtaagttgctattgatgttgtctttaatatcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagtttggatccccttgctttactcccttgtgccagtcgataatatccgaatattccgagttatacctcacgcatgctttcacgaccttgtacattgatttgatcgcttcagctactttgcaactcatgttctcatttaaccgttttgctacagaaactgcctatcaatgctgtcgtaggcttttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctccagttaagaacttttgtaattatggaatgtaataagaatatgcagttttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcaataaaagctgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagctctatagttttttgtttcgtttatatcaccttttttgtagactggtacaattataccacgaccccatgtctccggatattcacggctgttgaacattctgttttataattttaatagaaatggtgagattatgtcgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaggttcatctaaaccacaacttttgttattttttcgtaaatgttgcggttcgtagttcttgtaaacttatatctacatctaaaatgggaacgttaaatattatgttatcattttcattatttatagagttgtctcttggattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaatcgtttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatatgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgtttttgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgatttattttgatatattttgtgcgtgctttggaaaattgtttctattattattgaacatgtttcatgtttttttaaattcttgttttgctttatggcatttttcataaaaccaaggtttatttattctgtatgcacgtggtttcaatttgttcttattttgcaagttgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcacgaactctgcgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaactggtgtgacctgaagtggtcagtttttgtatcgtcccatactattttgttgacagtttgactgtccgcttgagttgtattggtgtgctgttttattaaaacaaactaaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttgaaagttatacagggttgtaaaatcatgaaaatttaacaacaaataatcgactgtgctatttcttagttgtgattgatacgtatattcgcctacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacatatattaagcagacgacgcccattcgagtcgatcacgtggtctttttgttagtgcgtaatgttatgtcgtgtgagtcttcagtgtatggatgggtatttagatacttgtcatgggtgataaagtcttgcatgtaagcggttctactgtttagatcttcacaaatatatatatatttccaagattacaatagttaattattcccaactctaattattcgaaaaaaatcaaaatcctctgagttagttacttttgaacaaattgggggtatgttaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaatgaatcagcatcaattttagccagattaatccatattgctctttctctatgatgtttatatatttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttgtatttttttatttattacctacaatatgaacactgtattagccttttatatctaagttaatatcgtttatgtctgccagccacgtttcacaaagaaaaattatatcgtaactgttcaataactcgatgaaatctgtatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagaaattatttggagctgcttctcttgactttcctagtaatccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgggacaaaacgttgaccgttgatgaaaactgtatctccaactagtttgacattgttgtttccctttgccttttcttgctgcatgattgggaaaagctgtttccgagcgtcgtgcacctgttttggccattggatgcctattccaagatttgcttgttttaatgtttctgttttttcaacgaat
gi|11                         : atatttattttcttttattgcgtctaagtattttctgttttaaagtcatgtttaaataagctataatactgtagtctggatgagttttttatttctgagtaccaggtttgtttatatgtatctaagatgcgttgttttatgatgggaaaatgtatatctatattaaattgctgtaccatatatcactaaatccatggttttggagaatagtttttatttgatatgcccagtttgtgttttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttTATTTATTTCTTCTATTCATAATTGTGTCTAATTAATTTTCTGTTGTAAAGGCATGTTTAAATAAGCAAC--AGTA-----GTCTTGCCGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGTTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGTATTGTTTTATAATGGGAAAAGGTATAGATCTCTATATat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTATTT--CCTTTG----AAT-----TA--TATGTTTATATTTTAAAATCGTGTTTAAATAAGCTGTCTAATACTGTAGTCAGGATGAGTTGTTTACTGATGAATACCAGTTTTGTTTATATGTGTATCTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatatagttttgattgtaatgcattttacaactttcgttcattttccagcattgtctctcttcgttttaaatattttataggcagttcatATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTTTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTGCTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTAATA--TGTATCTTAGATGCGCTTTTTTATGATGAGAAAATGTATA----TCTATATTGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATATTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGAACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATAACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTGTTTAACACCTTCGCAATAATAGAATGAAATACA-TTATATAGAAT-CT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAACCAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTACACAAGCCTGGATGTTACTATATAATATAGACTTAATCGTAGCAACCATTTTGCAGCTGACACCTAACTGAATTAATTTGAACCATAATGTATATCTTAGAATAGTGGCAAATGCTTTCTCGTAATCGATGAATTTACAAAACCATTTAGAGTTCCTAGATAAAATATTGTGTATAACAGAGTGTAGAACAA
Unaligned ( gi|12 ): CTGTAAATGCTTTAATCATATTAAAACACTAACAACTTATACCTAACTGGGCAATGTTCACCCAAATCACATTCCAAAATGCAGTACCAAAACATTTTACAACCTATGAAAGCACAGTACAATGTATATCCTGAGTAAGTATTTTATAAATTTATAAATTGA
Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTGAATTATTGAATGCAAAATAAATATACACTCTGTAATACTATGACTATCGTGAAAGCCAAATTGTGCCTCGTTAAAAGTGTGTTCCGCCTCGCACCATTTATTTATTCTGTTACGTAGGGTGAGAGAGACT
Unaligned ( gi|15 ): CCATTGGTAATAAGGTAACCAGTGTTTAACACAGAGAAATACGTTTTTGCCCATAGTTGTCATTCATGGATTCCTGGTTGTGCCGTACATGGATAGCATTTTGCCTTAATGATACATATTCA
Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT






Alignments
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Reference ( family-1144 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAATATTTTAAATNTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTGTTTCTA---TCGGAGTGTT-ATATA---T---TAT--GTAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTTTTAGTTGCGTTNATTTTTAAACCCCATT-GGTTGCAATATCGTTCAATATCATNTAAAATTG--ATTGCAAGGCANGCG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCGGCA--------CATATAATTAGGAATAACT--TCAGT-TCGTTGTAAGT--AAA-ATATCNTGT--AAGTTACTATCGATGTT-NTCTTT--AATG---TCATTGAGGAAAANCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGCTTGGGTCCCCTTGCTTTACTCCCATGTGTNA-GTCGATAAAGTCCGA-------ATATTC-CGAGTTGTACCTTACGCATGNTTTNAC-G--ACCTT---GTACATCGNTTTGAT--CGC-T-TCAACTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTGAC-ANTTTTTGCCACAGAAACTGCACTAT---CGATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTANAGCT-TTNCTCTCGAGTTAAGAACTTTCGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAAT-CT-TCG----ATAGATT-TACCTTTTTGATAACCAAATTGG---T-------CGTT-GATAATTTTNTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAGTAAAATTCGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCCCTATAGTTTTTTGTTTCGTTCATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGGCCCCATGTCTCCGGATATTCACNGCTGTTGAACATTCTGTTNTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTTTGCGCAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTGCATCTAAAATGGGANCGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATNGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGNTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATGTGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTCGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGNTTTATTTTGNTATATTTTGTGCGTGNTTTGGAAAATTTAATTCTGTTTTCATTGTTTCTATTATTGTTGAACATGTTTCNTGTTTTTTTGAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTCCATNAAACCAAGGCTTATTTATTCTGTGTGCACGTGGTTTCANTNTGTTCTTATTTTGCAAGCTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AANTGGT-CAGTTTTTGTTTCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAG-TTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-GAANTAAAATTGGCGAGTGATCAGAA-AATTCGTTCGGTTCTAGTATTTGAAAGTTNT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATNAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGCGCTATTTCCTAGTTGTGATCGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ANATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTC-TTTCG-TTA----GCGCGT-AATGGTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGCGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATAGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTCCGCAAATANATATGTATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCNA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCNT---CTGAGTTANTTACTTTCGAACAAATTGGTGGTATGTAAACGTG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATNAATCAGCATCGATTTTCAGCCAGATTAATCCATA-TCGTTCTTTCTCTAT------AATGTTTATATATTT-CTTA-CGTTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCGCTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTGATTTATTACC-TACAATATGAACACT-TAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AA-AT-GTTT---T---CTG--AGCCACGTTTCACAAAGAAAAATNATATCGTA--ACTGTTCAATAA-ATCGATGAAATCTGNATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGANATTATTTGGAGCTGCTCC-TCTCGACTT-TCCTATTA-TTCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAAGTTTATCTCCAACTAGTTTGACGTTGTTGTTTCCCTTTGCTTTTTCTTGCTG--CATGATTGGA-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGCG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGNTTATTCC-AAGATTTGTTTGTTTTANTGTTTCTGTTTTTTCAAACGA
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TTGAAATATTTTAAATATATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTCTTTCTA---TTGGAGTGTT-ATATAATTT---TAT--ATAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTATTGGTTGTGTTTATTTTTAGACCCCATT-GGTTACAATATCGTTCAATATAATTTAAAATTG--ATTGCAAGGCAAACG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCAGCA--------TATATAATTAAGAACAACT--TAAGT-TCATTGTAGGT--AAA-ATATCTTGT--AAGTTGCTATTGATGTT-GTCTTT--AATA---TCATTAAGGAAAAGCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGTTTGGATCCCCTTGCTTTACTCCCTTGTGCCA-GTCGATAATATCCGA-------ATATTC-CGAGTTATACCTCACGCATGCTTTCAC-G--ACCTT---GTACATTGATTTGAT--CGC-T-TCAGCTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTAAC-CGTTTT-GCTACAGAAACTGC-CTAT---CAATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTAGAGCT-TTTCTCTCCAGTTAAGAACTTTTGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAGT-TT-TCA----ATAGATT-TACCTTTTTGGTAAGCAAATTGG---T-------TGTT-GATAATTTTGTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAATAAAAGCTGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCTCTATAGTTTTTTGTTTCGTTTATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGACCCCATGTCTCCGGATATTCACGGCTGTTGAACATTCTGTTTTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTT--CGTAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTACATCTAAAATGGGAACGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATAGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGTTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATATGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTTGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGATTTATTTTGATATATTTTGTGCGTGCTTTGGAAA----------------ATTGTTTCTATTATTATTGAACATGTTTCATGTTTTTTTAAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTTCATAAAACCAAGGTTTATTTATTCTGTATGCACGTGGTTTCAATTTGTTCTTATTTTGCAAGTTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AAGTGGT-CAGTTTTTGTATCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAGTTTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-AAACTAAAATTGGTGAGTGATCAGAA-AATTCATTTGGTTCTAGTATTTGAAAGTTAT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATGAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGTGCTATTTCTTAGTTGTGATTGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ATATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTCTTTTTG-TTA----GTGCGT-AATGTTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGTGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATGGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTTCACAAATATATATATATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCCA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCCT---CTGAGTTAGTTACTTTTGAACAAATTGGGGGTATGTTAACATG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATGAATCAGCATCAATTTT-AGCCAGATTAATCCATA-TTGCTCTTTCTCTAT------GATGTTTATATAT----TTA-CATTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCACTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTTATTTATTACC-TACAATATGAACACTGTAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AATATCGTTTATGT---CTGCCAGCCACGTTTCACAAAGAAAAATTATATCGTA--ACTGTTCAATAA-CTCGATGAAATCTGTATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGAAATTATTTGGAGCTGCTTC-TCTTGACTT-TCCTAGTA-ATCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAACTGTATCTCCAACTAGTTTGACATTGTTGTTTCCCTTTGCCTTTTCTTGCTG--CATGATTGGG-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGTG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGCCTATTCC-AAGATTTGCTTGTTTTAATGTTTCTGTTTTTTC-AACGAttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttttgaaatattttaaatatattgtataatgcaaaacttccgtgttgtgctagatgttttacttaaatgatgtgactctttctattggagtgttatataattttatatagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaatatgacagttttagtattggttgtgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatataatttaaaattgattgcaaggcaaacggtgattttgcaaatacaacttggtcatcagcatatataattaagaacaacttaagttcattgtaggtaaaatatcttgtaagttgctattgatgttgtctttaatatcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagtttggatccccttgctttactcccttgtgccagtcgataatatccgaatattccgagttatacctcacgcatgctttcacgaccttgtacattgatttgatcgcttcagctactttgcaactcatgttctcatttaaccgttttgctacagaaactgcctatcaatgctgtcgtaggcttttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctccagttaagaacttttgtaattatggaatgtaataagaatatgcagttttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcaataaaagctgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagctctatagttttttgtttcgtttatatcaccttttttgtagactggtacaattataccacgaccccatgtctccggatattcacggctgttgaacattctgttttataattttaatagaaatggtgagattatgtcgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaggttcatctaaaccacaacttttgttattttttcgtaaatgttgcggttcgtagttcttgtaaacttatatctacatctaaaatgggaacgttaaatattatgttatcattttcattatttatagagttgtctcttggattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaatcgtttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatatgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgtttttgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgatttattttgatatattttgtgcgtgctttggaaaattgtttctattattattgaacatgtttcatgtttttttaaattcttgttttgctttatggcatttttcataaaaccaaggtttatttattctgtatgcacgtggtttcaatttgttcttattttgcaagttgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcacgaactctgcgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaactggtgtgacctgaagtggtcagtttttgtatcgtcccatactattttgttgacagtttgactgtccgcttgagttgtattggtgtgctgttttattaaaacaaactaaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttgaaagttatacagggttgtaaaatcatgaaaatttaacaacaaataatcgactgtgctatttcttagttgtgattgatacgtatattcgcctacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacatatattaagcagacgacgcccattcgagtcgatcacgtggtctttttgttagtgcgtaatgttatgtcgtgtgagtcttcagtgtatggatgggtatttagatacttgtcatgggtgataaagtcttgcatgtaagcggttctactgtttagatcttcacaaatatatatatatttccaagattacaatagttaattattcccaactctaattattcgaaaaaaatcaaaatcctctgagttagttacttttgaacaaattgggggtatgttaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaatgaatcagcatcaattttagccagattaatccatattgctctttctctatgatgtttatatatttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttgtatttttttatttattacctacaatatgaacactgtattagccttttatatctaagttaatatcgtttatgtctgccagccacgtttcacaaagaaaaattatatcgtaactgttcaataactcgatgaaatctgtatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagaaattatttggagctgcttctcttgactttcctagtaatccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgggacaaaacgttgaccgttgatgaaaactgtatctccaactagtttgacattgttgtttccctttgccttttcttgctgcatgattgggaaaagctgtttccgagcgtcgtgcacctgttttggccattggatgcctattccaagatttgcttgttttaatgtttctgttttttcaacgaat
gi|11                         : atatttattttcttttattgcgtctaagtattttctgttttaaagtcatgtttaaataagctataatactgtagtctggatgagttttttatttctgagtaccaggtttgtttatatgtatctaagatgcgttgttttatgatgggaaaatgtatatctatattaaattgctgtaccatatatcactaaatccatggttttggagaatagtttttatttgatatgcccagtttgtgttttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttTATTTATTTCTTCTATTCATAATTGTGTCTAATTAATTTTCTGTTGTAAAGGCATGTTTAAATAAGCAAC--AGTA-----GTCTTGCCGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGTTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGTATTGTTTTATAATGGGAAAAGGTATAGATCTCTATATat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTATTT--CCTTTG----AAT-----TA--TATGTTTATATTTTAAAATCGTGTTTAAATAAGCTGTCTAATACTGTAGTCAGGATGAGTTGTTTACTGATGAATACCAGTTTTGTTTATATGTGTATCTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatatagttttgattgtaatgcattttacaactttcgttcattttccagcattgtctctcttcgttttaaatattttataggcagttcatATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTTTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTGCTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTAATA--TGTATCTTAGATGCGCTTTTTTATGATGAGAAAATGTATA----TCTATATTGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATATTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGAACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATAACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTGTTTAACACCTTCGCAATAATAGAATGAAATACA-TTATATAGAAT-CT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAACCAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTACACAAGCCTGGATGTTACTATATAATATAGACTTAATCGTAGCAACCATTTTGCAGCTGACACCTAACTGAATTAATTTGAACCATAATGTATATCTTAGAATAGTGGCAAATGCTTTCTCGTAATCGATGAATTTACAAAACCATTTAGAGTTCCTAGATAAAATATTGTGTATAACAGAGTGTAGAACAA
Unaligned ( gi|12 ): CTGTAAATGCTTTAATCATATTAAAACACTAACAACTTATACCTAACTGGGCAATGTTCACCCAAATCACATTCCAAAATGCAGTACCAAAACATTTTACAACCTATGAAAGCACAGTACAATGTATATCCTGAGTAAGTATTTTATAAATTTATAAATTGA
Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTGAATTATTGAATGCAAAATAAATATACACTCTGTAATACTATGACTATCGTGAAAGCCAAATTGTGCCTCGTTAAAAGTGTGTTCCGCCTCGCACCATTTATTTATTCTGTTACGTAGGGTGAGAGAGACT
Unaligned ( gi|15 ): CCATTGGTAATAAGGTAACCAGTGTTTAACACAGAGAAATACGTTTTTGCCCATAGTTGTCATTCATGGATTCCTGGTTGTGCCGTACATGGATAGCATTTTGCCTTAATGATACATATTCA
Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT






Alignments
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Reference ( family-1144 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAATATTTTAAATNTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTGTTTCTA---TCGGAGTGTT-ATATA---T---TAT--GTAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTTTTAGTTGCGTTNATTTTTAAACCCCATT-GGTTGCAATATCGTTCAATATCATNTAAAATTG--ATTGCAAGGCANGCG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCGGCA--------CATATAATTAGGAATAACT--TCAGT-TCGTTGTAAGT--AAA-ATATCNTGT--AAGTTACTATCGATGTT-NTCTTT--AATG---TCATTGAGGAAAANCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGCTTGGGTCCCCTTGCTTTACTCCCATGTGTNA-GTCGATAAAGTCCGA-------ATATTC-CGAGTTGTACCTTACGCATGNTTTNAC-G--ACCTT---GTACATCGNTTTGAT--CGC-T-TCAACTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTGAC-AGTTTTTGCCACAGAAACTGCACTAT---CGATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTANAGCT-TTNCTCTCGAGTTAAGAACTTTCGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAAT-CT-TCG----ATAGATT-TACCTTTTTGATAACCAAATTGG---T-------CGTT-GATAATTTTNTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAGTAAAATTCGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCCCTATAGTTTTTTGTTTCGTTCATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGGCCCCATGTCTCCGGATATTCACNGCTGTTGAACATTCTGTTNTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTTTGCGCAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTGCATCTAAAATGGGANCGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATNGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGNTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATGTGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTCGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGNTTTATTTTGNTATATTTTGTGCGTGNTTTGGAAAATTTAATTCTGTTTTCATTGTTTCTATTATTGTTGAACATGTTTCNTGTTTTTTTGAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTCCATNAAACCAAGGCTTATTTATTCTGTGTGCACGTGGTTTCANTNTGTTCTTATTTTGCAAGCTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AANTGGT-CAGTTTTTGTTTCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAG-TTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-GAANTAAAATTGGCGAGTGATCAGAA-AATTCGTTCGGTTCTAGTATTTGAAAGTTNT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATNAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGCGCTATTTCCTAGTTGTGATCGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ANATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTC-TTTCG-TTA----GCGCGT-AATGGTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGCGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATAGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTCCGCAAATANATATGTATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCNA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCNT---CTGAGTTANTTACTTTCGAACAAATTGGTGGTATG-TAA-CGTG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATNAATCAGCATCGATTTTCAGCCAGATTAATCCATA-TCGTTCTTTCTCTAT------AATGTTTATATATTT-CTTA-CGTTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCGCTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTGATTTATTACC-TACAATATGAACACT-TAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AA-AT-GTTT---T---CTG--AGCCACGTTTCACAAAGAAAAATNATATCGTA--ACTGTTCAATAA-ATCGATGAAATCTGNATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGANATTATTTGGAGCTGCTCC-TCTCGACTT-TCCTATTA-TTCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAAGTTTATCTCCAACTAGTTTGACGTTGTTGTTTCCCTTTGCTTTTTCTTGCTG--CATGATTGGA-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGCG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGNTTATTCC-AAGATTTGTTTGTTTTANTGTTTCTGTTTTTTCAAACGA
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TTGAAATATTTTAAATATATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTCTTTCTA---TTGGAGTGTT-ATATAATTT---TAT--ATAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTATTGGTTGTGTTTATTTTTAGACCCCATT-GGTTACAATATCGTTCAATATAATTTAAAATTG--ATTGCAAGGCAAACG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCAGCA--------TATATAATTAAGAACAACT--TAAGT-TCATTGTAGGT--AAA-ATATCTTGT--AAGTTGCTATTGATGTT-GTCTTT--AATA---TCATTAAGGAAAAGCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGTTTGGATCCCCTTGCTTTACTCCCTTGTGCCA-GTCGATAATATCCGA-------ATATTC-CGAGTTATACCTCACGCATGCTTTCAC-G--ACCTT---GTACATTGATTTGAT--CGC-T-TCAGCTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTAAC-CGTTTT-GCTACAGAAACTGC-CTAT---CAATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTAGAGCT-TTTCTCTCCAGTTAAGAACTTTTGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAGT-TT-TCA----ATAGATT-TACCTTTTTGGTAAGCAAATTGG---T-------TGTT-GATAATTTTGTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAATAAAAGCTGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCTCTATAGTTTTTTGTTTCGTTTATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGACCCCATGTCTCCGGATATTCACGGCTGTTGAACATTCTGTTTTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTT--CGTAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTACATCTAAAATGGGAACGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATAGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGTTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATATGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTTGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGATTTATTTTGATATATTTTGTGCGTGCTTTGGAAA----------------ATTGTTTCTATTATTATTGAACATGTTTCATGTTTTTTTAAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTTCATAAAACCAAGGTTTATTTATTCTGTATGCACGTGGTTTCAATTTGTTCTTATTTTGCAAGTTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AAGTGGT-CAGTTTTTGTATCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAGTTTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-AAACTAAAATTGGTGAGTGATCAGAA-AATTCATTTGGTTCTAGTATTTGAAAGTTAT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATGAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGTGCTATTTCTTAGTTGTGATTGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ATATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTCTTTTTG-TTA----GTGCGT-AATGTTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGTGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATGGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTTCACAAATATATATATATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCCA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCCT---CTGAGTTAGTTACTTTTGAACAAATTGGGGGTATGTTAA-CATG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATGAATCAGCATCAATTTT-AGCCAGATTAATCCATA-TTGCTCTTTCTCTAT------GATGTTTATATAT----TTA-CATTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCACTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTTATTTATTACC-TACAATATGAACACTGTAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AATATCGTTTATGT---CTGCCAGCCACGTTTCACAAAGAAAAATTATATCGTA--ACTGTTCAATAA-CTCGATGAAATCTGTATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGAAATTATTTGGAGCTGCTTC-TCTTGACTT-TCCTAGTA-ATCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAACTGTATCTCCAACTAGTTTGACATTGTTGTTTCCCTTTGCCTTTTCTTGCTG--CATGATTGGG-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGTG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGCCTATTCC-AAGATTTGCTTGTTTTAATGTTTCTGTTTTTTC-AACGAttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttttgaaatattttaaatatattgtataatgcaaaacttccgtgttgtgctagatgttttacttaaatgatgtgactctttctattggagtgttatataattttatatagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaatatgacagttttagtattggttgtgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatataatttaaaattgattgcaaggcaaacggtgattttgcaaatacaacttggtcatcagcatatataattaagaacaacttaagttcattgtaggtaaaatatcttgtaagttgctattgatgttgtctttaatatcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagtttggatccccttgctttactcccttgtgccagtcgataatatccgaatattccgagttatacctcacgcatgctttcacgaccttgtacattgatttgatcgcttcagctactttgcaactcatgttctcatttaaccgttttgctacagaaactgcctatcaatgctgtcgtaggcttttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctccagttaagaacttttgtaattatggaatgtaataagaatatgcagttttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcaataaaagctgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagctctatagttttttgtttcgtttatatcaccttttttgtagactggtacaattataccacgaccccatgtctccggatattcacggctgttgaacattctgttttataattttaatagaaatggtgagattatgtcgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaggttcatctaaaccacaacttttgttattttttcgtaaatgttgcggttcgtagttcttgtaaacttatatctacatctaaaatgggaacgttaaatattatgttatcattttcattatttatagagttgtctcttggattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaatcgtttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatatgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgtttttgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgatttattttgatatattttgtgcgtgctttggaaaattgtttctattattattgaacatgtttcatgtttttttaaattcttgttttgctttatggcatttttcataaaaccaaggtttatttattctgtatgcacgtggtttcaatttgttcttattttgcaagttgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcacgaactctgcgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaactggtgtgacctgaagtggtcagtttttgtatcgtcccatactattttgttgacagtttgactgtccgcttgagttgtattggtgtgctgttttattaaaacaaactaaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttgaaagttatacagggttgtaaaatcatgaaaatttaacaacaaataatcgactgtgctatttcttagttgtgattgatacgtatattcgcctacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacatatattaagcagacgacgcccattcgagtcgatcacgtggtctttttgttagtgcgtaatgttatgtcgtgtgagtcttcagtgtatggatgggtatttagatacttgtcatgggtgataaagtcttgcatgtaagcggttctactgtttagatcttcacaaatatatatatatttccaagattacaatagttaattattcccaactctaattattcgaaaaaaatcaaaatcctctgagttagttacttttgaacaaattgggggtatgttaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaatgaatcagcatcaattttagccagattaatccatattgctctttctctatgatgtttatatatttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttgtatttttttatttattacctacaatatgaacactgtattagccttttatatctaagttaatatcgtttatgtctgccagccacgtttcacaaagaaaaattatatcgtaactgttcaataactcgatgaaatctgtatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagaaattatttggagctgcttctcttgactttcctagtaatccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgggacaaaacgttgaccgttgatgaaaactgtatctccaactagtttgacattgttgtttccctttgccttttcttgctgcatgattgggaaaagctgtttccgagcgtcgtgcacctgttttggccattggatgcctattccaagatttgcttgttttaatgtttctgttttttcaacgaat
gi|11                         : atatttattttcttttattgcgtctaagtattttctgttttaaagtcatgtttaaataagctataatactgtagtctggatgagttttttatttctgagtaccaggtttgtttatatgtatctaagatgcgttgttttatgatgggaaaatgtatatctatattaaattgctgtaccatatatcactaaatccatggttttggagaatagtttttatttgatatgcccagtttgtgttttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttTATTTATTTCTTCTATTCATAATTGTGTCTAATTAATTTTCTGTTGTAAAGGCATGTTTAAATAAGCAAC--AGTA-----GTCTTGCCGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGTTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGTATTGTTTTATAATGGGAAAAGGTATAGATCTCTATATat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTATTT--CCTTTG----AAT-----TA--TATGTTTATATTTTAAAATCGTGTTTAAATAAGCTGTCTAATACTGTAGTCAGGATGAGTTGTTTACTGATGAATACCAGTTTTGTTTATATGTGTATCTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatatagttttgattgtaatgcattttacaactttcgttcattttccagcattgtctctcttcgttttaaatattttataggcagttcatATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTTTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTGCTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTAATA--TGTATCTTAGATGCGCTTTTTTATGATGAGAAAATGTATA----TCTATATTGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATATTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGAACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATAACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTGTTTAACACCTTCGCAATAATAGAATGAAATACA-TTATATAGAAT-CT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAACCAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TTTACACAAGCCTGGATGTTACTATATAATATAGACTTAATCGTAGCAACCATTTTGCAGCTGACACCTAACTGAATTAATTTGAACCATAATGTATATCTTAGAATAGTGGCAAATGCTTTCTCGTAATCGATGAATTTACAAAACCATTTAGAGTTCCTAGATAAAATATTGTGTATAACAGAGTGTAGAACAA
Unaligned ( gi|12 ): CTGTAAATGCTTTAATCATATTAAAACACTAACAACTTATACCTAACTGGGCAATGTTCACCCAAATCACATTCCAAAATGCAGTACCAAAACATTTTACAACCTATGAAAGCACAGTACAATGTATATCCTGAGTAAGTATTTTATAAATTTATAAATTGA
Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTGAATTATTGAATGCAAAATAAATATACACTCTGTAATACTATGACTATCGTGAAAGCCAAATTGTGCCTCGTTAAAAGTGTGTTCCGCCTCGCACCATTTATTTATTCTGTTACGTAGGGTGAGAGAGACT
Unaligned ( gi|15 ): CCATTGGTAATAAGGTAACCAGTGTTTAACACAGAGAAATACGTTTTTGCCCATAGTTGTCATTCATGGATTCCTGGTTGTGCCGTACATGGATAGCATTTTGCCTTAATGATACATATTCA
Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT






Alignments
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Reference ( family-1144 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAATATTTTAAATNTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTGTTTCTA---TCGGAGTGTT-ATATA---T---TAT--GTAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTTTTAGTTGCGTTNATTTTTAAACCCCATT-GGTTGCAATATCGTTCAATATCATNTAAAATTG--ATTGCAAGGCANGCG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCGGCA--------CATATAATTAGGAATAACT--TCAGT-TCGTTGTAAGT--AAA-ATATCNTGT--AAGTTACTATCGATGTT-NTCTTT--AATG---TCATTGAGGAAAANCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGCTTGGGTCCCCTTGCTTTACTCCCATGTGTNA-GTCGATAAAGTCCGA-------ATATTC-CGAGTTGTACCTTACGCATGNTTTNAC-G--ACCTT---GTACATCGNTTTGAT--CGC-T-TCAACTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTGAC-AGTTTTTGCCACAGAAACTGCACTAT---CGATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTANAGCT-TTNCTCTCGAGTTAAGAACTTTCGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAAT-CT-TCG----ATAGATT-TACCTTTTTGATAACCAAATTGG---T-------CGTT-GATAATTTTNTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAGTAAAATTCGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCCCTATAGTTTTTTGTTTCGTTCATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGGCCCCATGTCTCCGGATATTCACNGCTGTTGAACATTCTGTTNTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTTTGCGCAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTGCATCTAAAATGGGANCGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATNGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGNTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATGTGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTCGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGNTTTATTTTGNTATATTTTGTGCGTGNTTTGGAAAATTTAATTCTGTTTTCATTGTTTCTATTATTGTTGAACATGTTTCNTGTTTTTTTGAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTCCATNAAACCAAGGCTTATTTATTCTGTGTGCACGTGGTTTCANTNTGTTCTTATTTTGCAAGCTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AANTGGT-CAGTTTTTGTTTCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAG-TTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-GAANTAAAATTGGCGAGTGATCAGAA-AATTCGTTCGGTTCTAGTATTTGAAAGTTNT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATNAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGCGCTATTTCCTAGTTGTGATCGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ANATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTC-TTTCG-TTA----GCGCGT-AATGGTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGCGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATAGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTCCGCAAATANATATGTATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCNA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCNT---CTGAGTTANTTACTTTCGAACAAATTGGTGGTATG-TAA-CGTG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATNAATCAGCATCGATTTTCAGCCAGATTAATCCATA-TCGTTCTTTCTCTAT------AATGTTTATATATTT-CTTA-CGTTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCGCTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTGATTTATTACC-TACAATATGAACACT-TAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AA-AT-GTTT---T---CTG--AGCCACGTTTCACAAAGAAAAATNATATCGTA--ACTGTTCAATAA-ATCGATGAAATCTGNATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGANATTATTTGGAGCTGCTCC-TCTCGACTT-TCCTATTA-TTCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAAGTTTATCTCCAACTAGTTTGACGTTGTTGTTTCCCTTTGCTTTTTCTTGCTG--CATGATTGGA-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGCG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGNTTATTCC-AAGATTTGTTTGTTTTANTGTTTCTGTTTTTTCAAACGA
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TTGAAATATTTTAAATATATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTCTTTCTA---TTGGAGTGTT-ATATAATTT---TAT--ATAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTATTGGTTGTGTTTATTTTTAGACCCCATT-GGTTACAATATCGTTCAATATAATTTAAAATTG--ATTGCAAGGCAAACG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCAGCA--------TATATAATTAAGAACAACT--TAAGT-TCATTGTAGGT--AAA-ATATCTTGT--AAGTTGCTATTGATGTT-GTCTTT--AATA---TCATTAAGGAAAAGCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGTTTGGATCCCCTTGCTTTACTCCCTTGTGCCA-GTCGATAATATCCGA-------ATATTC-CGAGTTATACCTCACGCATGCTTTCAC-G--ACCTT---GTACATTGATTTGAT--CGC-T-TCAGCTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTAAC-CGTTTT-GCTACAGAAACTGC-CTAT---CAATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTAGAGCT-TTTCTCTCCAGTTAAGAACTTTTGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAGT-TT-TCA----ATAGATT-TACCTTTTTGGTAAGCAAATTGG---T-------TGTT-GATAATTTTGTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAATAAAAGCTGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCTCTATAGTTTTTTGTTTCGTTTATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGACCCCATGTCTCCGGATATTCACGGCTGTTGAACATTCTGTTTTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTT--CGTAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTACATCTAAAATGGGAACGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATAGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGTTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATATGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTTGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGATTTATTTTGATATATTTTGTGCGTGCTTTGGAAA----------------ATTGTTTCTATTATTATTGAACATGTTTCATGTTTTTTTAAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTTCATAAAACCAAGGTTTATTTATTCTGTATGCACGTGGTTTCAATTTGTTCTTATTTTGCAAGTTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AAGTGGT-CAGTTTTTGTATCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAGTTTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-AAACTAAAATTGGTGAGTGATCAGAA-AATTCATTTGGTTCTAGTATTTGAAAGTTAT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATGAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGTGCTATTTCTTAGTTGTGATTGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ATATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTCTTTTTG-TTA----GTGCGT-AATGTTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGTGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATGGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTTCACAAATATATATATATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCCA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCCT---CTGAGTTAGTTACTTTTGAACAAATTGGGGGTATGTTAA-CATG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATGAATCAGCATCAATTTT-AGCCAGATTAATCCATA-TTGCTCTTTCTCTAT------GATGTTTATATAT----TTA-CATTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCACTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTTATTTATTACC-TACAATATGAACACTGTAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AATATCGTTTATGT---CTGCCAGCCACGTTTCACAAAGAAAAATTATATCGTA--ACTGTTCAATAA-CTCGATGAAATCTGTATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGAAATTATTTGGAGCTGCTTC-TCTTGACTT-TCCTAGTA-ATCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAACTGTATCTCCAACTAGTTTGACATTGTTGTTTCCCTTTGCCTTTTCTTGCTG--CATGATTGGG-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGTG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGCCTATTCC-AAGATTTGCTTGTTTTAATGTTTCTGTTTTTTC-AACGAttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttttgaaatattttaaatatattgtataatgcaaaacttccgtgttgtgctagatgttttacttaaatgatgtgactctttctattggagtgttatataattttatatagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaatatgacagttttagtattggttgtgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatataatttaaaattgattgcaaggcaaacggtgattttgcaaatacaacttggtcatcagcatatataattaagaacaacttaagttcattgtaggtaaaatatcttgtaagttgctattgatgttgtctttaatatcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagtttggatccccttgctttactcccttgtgccagtcgataatatccgaatattccgagttatacctcacgcatgctttcacgaccttgtacattgatttgatcgcttcagctactttgcaactcatgttctcatttaaccgttttgctacagaaactgcctatcaatgctgtcgtaggcttttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctccagttaagaacttttgtaattatggaatgtaataagaatatgcagttttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcaataaaagctgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagctctatagttttttgtttcgtttatatcaccttttttgtagactggtacaattataccacgaccccatgtctccggatattcacggctgttgaacattctgttttataattttaatagaaatggtgagattatgtcgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaggttcatctaaaccacaacttttgttattttttcgtaaatgttgcggttcgtagttcttgtaaacttatatctacatctaaaatgggaacgttaaatattatgttatcattttcattatttatagagttgtctcttggattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaatcgtttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatatgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgtttttgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgatttattttgatatattttgtgcgtgctttggaaaattgtttctattattattgaacatgtttcatgtttttttaaattcttgttttgctttatggcatttttcataaaaccaaggtttatttattctgtatgcacgtggtttcaatttgttcttattttgcaagttgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcacgaactctgcgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaactggtgtgacctgaagtggtcagtttttgtatcgtcccatactattttgttgacagtttgactgtccgcttgagttgtattggtgtgctgttttattaaaacaaactaaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttgaaagttatacagggttgtaaaatcatgaaaatttaacaacaaataatcgactgtgctatttcttagttgtgattgatacgtatattcgcctacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacatatattaagcagacgacgcccattcgagtcgatcacgtggtctttttgttagtgcgtaatgttatgtcgtgtgagtcttcagtgtatggatgggtatttagatacttgtcatgggtgataaagtcttgcatgtaagcggttctactgtttagatcttcacaaatatatatatatttccaagattacaatagttaattattcccaactctaattattcgaaaaaaatcaaaatcctctgagttagttacttttgaacaaattgggggtatgttaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaatgaatcagcatcaattttagccagattaatccatattgctctttctctatgatgtttatatatttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttgtatttttttatttattacctacaatatgaacactgtattagccttttatatctaagttaatatcgtttatgtctgccagccacgtttcacaaagaaaaattatatcgtaactgttcaataactcgatgaaatctgtatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagaaattatttggagctgcttctcttgactttcctagtaatccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgggacaaaacgttgaccgttgatgaaaactgtatctccaactagtttgacattgttgtttccctttgccttttcttgctgcatgattgggaaaagctgtttccgagcgtcgtgcacctgttttggccattggatgcctattccaagatttgcttgttttaatgtttctgttttttcaacgaat
gi|11                         : atatttattttcttttattgcgtctaagtattttctgttttaaagtcatgtttaaataagctataatactgtagtctggatgagttttttatttctgagtaccaggtttgtttatatgtatctaagatgcgttgttttatgatgggaaaatgtatatctatattaaattgctgtaccatatatcactaaatccatggttttggagaatagtttttatttgatatgcccagtttgtgttttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttTATTTATTTCTTCTATTCATAATTGTGTCTAATTAATTTTCTGTTGTAAAGGCATGTTTAAATAAGCAAC--AGTA-----GTCTTGCCGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGTTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGTATTGTTTTATAATGGGAAAAGGTATAGATCTCTATATat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTATTT--CCTTTG----AAT-----TA--TATGTTTATATTTTAAAATCGTGTTTAAATAAGCTGTCTAATACTGTAGTCAGGATGAGTTGTTTACTGATGAATACCAGTTTTGTTTATATGTGTATCTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatatagttttgattgtaatgcattttacaactttcgttcattttccagcattgtctctcttcgttttaaatattttataggcagttcatATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTTTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTGCTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTAATA--TGTATCTTAGATGCGCTTTTTTATGATGAGAAAATGTATA----TCTATATTGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATATTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTGTTTAACACCTTCGCAATAATAGAATGAAATACA-TTATATAGAAT-CT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAACCAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT


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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
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Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT






Alignments
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Reference ( family-1144 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAAATATTTTAAATNTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTGTTTCTA---TCGGAGTGTT-ATATA---T---TAT--GTAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTTTTAGTTGCGTTNATTTTTAAACCCCATT-GGTTGCAATATCGTTCAATATCATNTAAAATTG--ATTGCAAGGCANGCG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCGGCA--------CATATAATTAGGAATAACT--TCAGT-TCGTTGTAAGT--AAA-ATATCNTGT--AAGTTACTATCGATGTT-NTCTTT--AATG---TCATTGAGGAAAANCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGCTTGGGTCCCCTTGCTTTACTCCCATGTGTNA-GTCGATAAAGTCCGA-------ATATTC-CGAGTTGTACCTTACGCATGNTTTNAC-G--ACCTT---GTACATCGNTTTGAT--CGC-T-TCAACTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTGAC-AGTTTTTGCCACAGAAACTGCACTAT---CGATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTANAGCT-TTNCTCTCGAGTTAAGAACTTTCGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAAT-CT-TCG----ATAGATT-TACCTTTTTGATAACCAAATTGG---T-------CGTT-GATAATTTTNTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAGTAAAATTCGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCCCTATAGTTTTTTGTTTCGTTCATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGGCCCCATGTCTCCGGATATTCACNGCTGTTGAACATTCTGTTNTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTTTGCGCAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTGCATCTAAAATGGGANCGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATNGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGNTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATGTGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTCGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGNTTTATTTTGNTATATTTTGTGCGTGNTTTGGAAAATTTAATTCTGTTTTCATTGTTTCTATTATTGTTGAACATGTTTCNTGTTTTTTTGAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTCCATNAAACCAAGGCTTATTTATTCTGTGTGCACGTGGTTTCANTNTGTTCTTATTTTGCAAGCTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AANTGGT-CAGTTTTTGTTTCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAG-TTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-GAANTAAAATTGGCGAGTGATCAGAA-AATTCGTTCGGTTCTAGTATTTGAAAGTTNT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATNAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGCGCTATTTCCTAGTTGTGATCGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ANATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTC-TTTCG-TTA----GCGCGT-AATGGTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGCGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATAGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTCCGCAAATANATATGTATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCNA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCNT---CTGAGTTANTTACTTTCGAACAAATTGGTGGTATG-TAA-CGTG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATNAATCAGCATCGATTTTCAGCCAGATTAATCCATA-TCGTTCTTTCTCTAT------AATGTTTATATATTT-CTTA-CGTTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCGCTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTGATTTATTACC-TACAATATGAACACT-TAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AA-AT-GTTT---T---CTG--AGCCACGTTTCACAAAGAAAAATNATATCGTA--ACTGTTCAATAA-ATCGATGAAATCTGNATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGANATTATTTGGAGCTGCTCC-TCTCGACTT-TCCTATTA-TTCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAAGTTTATCTCCAACTAGTTTGACGTTGTTGTTTCCCTTTGCTTTTTCTTGCTG--CATGATTGGA-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGCG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGNTTATTCC-AAGATTTGTTTGTTTTANTGTTTCTGTTTTTTCAAACGA
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TTGAAATATTTTAAATATATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTTACTTAAATG-ATGTGA-CTCTTTCTA---TTGGAGTGTT-ATATAATTT---TAT--ATAGAAATCTTGGTGTGTATGGCGTCCTTTT-TCAAATATG-ACAGTTTTAGTATTGGTTGTGTTTATTTTTAGACCCCATT-GGTTACAATATCGTTCAATATAATTTAAAATTG--ATTGCAAGGCAAACG-GTGATT--TTGCAAATACAACTTGGTCATCAGCA--------TATATAATTAAGAACAACT--TAAGT-TCATTGTAGGT--AAA-ATATCTTGT--AAGTTGCTATTGATGTT-GTCTTT--AATA---TCATTAAGGAAAAGCATGAAGAGCA--G-GCTTGAGTTTGGATCCCCTTGCTTTACTCCCTTGTGCCA-GTCGATAATATCCGA-------ATATTC-CGAGTTATACCTCACGCATGCTTTCAC-G--ACCTT---GTACATTGATTTGAT--CGC-T-TCAGCTACTTTGCAACTCATGTTCTC-ATTTAAC-CGTTTT-GCTACAGAAACTGC-CTAT---CAATGCT--GTCGTAGGCTTTTTTCAAAATCTATGAAAACACAGTAGAGCT-TTTCTCTCCAGTTAAGAACTTTTGTAATTATGGAATGTAATA-A-GAATATGCAGT-TT-TCA----ATAGATT-TACCTTTTTGGTAAGCAAATTGG---T-------TGTT-GATAATTTTGTCATATTTTTGTGACCAT----TTCGATAGTCTGTTCAATAAAAGCTGCGAATATATTTTTCCTAATATGTTTACGAGTGTAATAGCTCTATAGTTTTTTGTTTCGTTTATATCACCTTTTTTGTAGACTGGTACAATTATACCACGACCCCATGTCTCCGGATATTCACGGCTGTTGAACATTCTGTTTTATAATTTTAATAGAAATGGTGAGATTATGTCGAAAGATGATTTAAATAGTTCGCTAAAAGGTTCATCTAAACCACAACTTTTGTTATTTTTT--CGTAAATGTTGCGGTTCGTAGTTCTTGTAAACTTATATCTACATCTAAAATGGGAACGTTAAATATTATGTTATCATTTTCATTATTTATAGAGTTGTCTCTTGGATTGTTTTCGTTAAACACAGTTTTAAAATGATCGTAAAAATCGTTTGCGTTTAATGTTTCAGTATTTTTATGTTTATTTTTATATATGCTTTTTATTTTCTTCCAAAATTGTCTTGGGTGTGTTTTTGCTAAATTACTTATGCGCTTTCCTTCTTTGAATTTAAATGCTCTCATTGACGTTTGATTTATTTTGATATATTTTGTGCGTGCTTTGGAAA----------------ATTGTTTCTATTATTATTGAACATGTTTCATGTTTTTTTAAATTCTTGTTTTGCTTTATGGCATTTTTCATAAAACCAAGGTTTATTTATTCTGTATGCACGTGGTTTCAATTTGTTCTTATTTTGCAAGTTGTGTGACTTACCGAATATATCGGACGCGTTATCGTGCACGAACTCTGCGAATGTTGAAACCACGTGGTTTAGCGGGTCAGTGGAGATACTATCAGTTAGTTGTTGTAGCGTAGTATTT--TTGTTTAA-----CTGG-TGTGACCTG---AAGTGGT-CAGTTTTTGTATCGTCCCATACTATTTTGTT---GACAGTTTGA--CTGTCCGC-T-----------TGAGTTGTATTGGTGTGCTGTT-------TTATTAAAAC-AAACTAAAATTGGTGAGTGATCAGAA-AATTCATTTGGTTCTAGTATTTGAAAGTTAT--ACAGGGTTGTAAAAT-----CATGAAAATTTAACAACAAATAATCGACTGTGCTATTTCTTAGTTGTGATTGATACGTATATTCGCCTA---CAGTATCATTGTATAGCCTGCCATTTGCTATGAGAAGTCCTGTGGACTGAC----ATATATTAAGCAGACGACGCCCATTCGAGTCGATCACGTGGTCTTTTTG-TTA----GTGCGT-AATGTTATGTCG------TGTGA-GTCTTCAGTGTATGGATGGGTATTTAGATACTTGTCATGGGTGATAAAGTCTTGCATGTAA---GCG-GTTCTACTGTTT-AGATCTTCACAAATATATATATATTTCCAAGATTACAATAGTT-AATTATTCCCA-AC---TCT-AATTA-TTCGA----AAAAAATCAAAATCCT---CTGAGTTAGTTACTTTTGAACAAATTGGGGGTATGTTAA-CATG--ACAAATATAAACATCTTCATTAA-ATATCAATGAATCAGCATCAATTTT-AGCCAGATTAATCCATA-TTGCTCTTTCTCTAT------GATGTTTATATAT----TTA-CATTATTTTTAA-AATAAACTGATAATCCGCCACTGTAACGTCCTTT-TT--GTATTTTTTTATTTATTACC-TACAATATGAACACTGTAT-TAG--CCTTTTATATCTAAGTT----AATATCGTTTATGT---CTGCCAGCCACGTTTCACAAAGAAAAATTATATCGTA--ACTGTTCAATAA-CTCGATGAAATCTGTATCACATAGTTTACGTTTTAGTCCGTTCACATTCCAAGAAATTATTTGGAGCTGCTTC-TCTTGACTT-TCCTAGTA-ATCCATGGTGGTTCCTGTCGCTTGGTTGGTCTTTGGGACAAAACGTTGACCGTTGATGAAAACTGTATCTCCAACTAGTTTGACATTGTTGTTTCCCTTTGCCTTTTCTTGCTG--CATGATTGGG-AAAA-----GCTGTTTCCGAGCGTCGTG--CACCTGTTTTGGCCATTGGA--TGCCTATTCC-AAGATTTGCTTGTTTTAATGTTTCTGTTTTTTC-AACGAttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttttgaaatattttaaatatattgtataatgcaaaacttccgtgttgtgctagatgttttacttaaatgatgtgactctttctattggagtgttatataattttatatagaaatcttggtgtgtatggcgtcctttttcaaatatgacagttttagtattggttgtgtttatttttagaccccattggttacaatatcgttcaatataatttaaaattgattgcaaggcaaacggtgattttgcaaatacaacttggtcatcagcatatataattaagaacaacttaagttcattgtaggtaaaatatcttgtaagttgctattgatgttgtctttaatatcattaaggaaaagcatgaagagcaggcttgagtttggatccccttgctttactcccttgtgccagtcgataatatccgaatattccgagttatacctcacgcatgctttcacgaccttgtacattgatttgatcgcttcagctactttgcaactcatgttctcatttaaccgttttgctacagaaactgcctatcaatgctgtcgtaggcttttttcaaaatctatgaaaacacagtagagcttttctctccagttaagaacttttgtaattatggaatgtaataagaatatgcagttttcaatagatttacctttttggtaagcaaattggttgttgataattttgtcatatttttgtgaccatttcgatagtctgttcaataaaagctgcgaatatatttttcctaatatgtttacgagtgtaatagctctatagttttttgtttcgtttatatcaccttttttgtagactggtacaattataccacgaccccatgtctccggatattcacggctgttgaacattctgttttataattttaatagaaatggtgagattatgtcgaaagatgatttaaatagttcgctaaaaggttcatctaaaccacaacttttgttattttttcgtaaatgttgcggttcgtagttcttgtaaacttatatctacatctaaaatgggaacgttaaatattatgttatcattttcattatttatagagttgtctcttggattgttttcgttaaacacagttttaaaatgatcgtaaaaatcgtttgcgtttaatgtttcagtatttttatgtttatttttatatatgctttttattttcttccaaaattgtcttgggtgtgtttttgctaaattacttatgcgctttccttctttgaatttaaatgctctcattgacgtttgatttattttgatatattttgtgcgtgctttggaaaattgtttctattattattgaacatgtttcatgtttttttaaattcttgttttgctttatggcatttttcataaaaccaaggtttatttattctgtatgcacgtggtttcaatttgttcttattttgcaagttgtgtgacttaccgaatatatcggacgcgttatcgtgcacgaactctgcgaatgttgaaaccacgtggtttagcgggtcagtggagatactatcagttagttgttgtagcgtagtatttttgtttaactggtgtgacctgaagtggtcagtttttgtatcgtcccatactattttgttgacagtttgactgtccgcttgagttgtattggtgtgctgttttattaaaacaaactaaaattggtgagtgatcagaaaattcatttggttctagtatttgaaagttatacagggttgtaaaatcatgaaaatttaacaacaaataatcgactgtgctatttcttagttgtgattgatacgtatattcgcctacagtatcattgtatagcctgccatttgctatgagaagtcctgtggactgacatatattaagcagacgacgcccattcgagtcgatcacgtggtctttttgttagtgcgtaatgttatgtcgtgtgagtcttcagtgtatggatgggtatttagatacttgtcatgggtgataaagtcttgcatgtaagcggttctactgtttagatcttcacaaatatatatatatttccaagattacaatagttaattattcccaactctaattattcgaaaaaaatcaaaatcctctgagttagttacttttgaacaaattgggggtatgttaacatgacaaatataaacatcttcattaaatatcaatgaatcagcatcaattttagccagattaatccatattgctctttctctatgatgtttatatatttacattatttttaaaataaactgataatccgccactgtaacgtcctttttgtatttttttatttattacctacaatatgaacactgtattagccttttatatctaagttaatatcgtttatgtctgccagccacgtttcacaaagaaaaattatatcgtaactgttcaataactcgatgaaatctgtatcacatagtttacgttttagtccgttcacattccaagaaattatttggagctgcttctcttgactttcctagtaatccatggtggttcctgtcgcttggttggtctttgggacaaaacgttgaccgttgatgaaaactgtatctccaactagtttgacattgttgtttccctttgccttttcttgctgcatgattgggaaaagctgtttccgagcgtcgtgcacctgttttggccattggatgcctattccaagatttgcttgttttaatgtttctgttttttcaacgaat
gi|11                         : atatttattttcttttattgcgtctaagtattttctgttttaaagtcatgtttaaataagctataatactgtagtctggatgagttttttatttctgagtaccaggtttgtttatatgtatctaagatgcgttgttttatgatgggaaaatgtatatctatattaaattgctgtaccatatatcactaaatccatggttttggagaatagtttttatttgatatgcccagtttgtgttttggatatttggtaaattatcggcatcatgttttagcatactctcccaagttagcggacgatttcctcttcgtttaatgacatagttatatacgaacgatgcaaaggagaatagttttagcattgaataaatatttttaactaaggagttttcgtctagtttgaggattttcatccggtattttatcatgttaatttttctgacaatttgtagtggaactcttcctagttctccattaagtgcattaaaatttgtagtttttttagcacacaatatagaaatttttaagcacacaatatagaaatttggtatgtactcgttcgatatcggtggttttatattcaccccatattccagagccaaagtctataattgatcctactaaacaatcaaacattttgcatttatcttttataggtaattcaatgttTATTTATTTCTTCTATTCATAATTGTGTCTAATTAATTTTCTGTTGTAAAGGCATGTTTAAATAAGCAAC--AGTA-----GTCTTGCCGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGTTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGTATTGTTTTATAATGGGAAAAGGTATAGATCTCTATATat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTATTT--CCTTTG----AAT-----TA--TATGTTTATATTTTAAAATCGTGTTTAAATAAGCTGTCTAATACTGTAGTCAGGATGAGTTGTTTACTGATGAATACCAGTTTTGTTTATATGTGTATCTa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAAATATTTTAAATTTATTGTATAATGCAAAACTTCCGTGTTGTGCTAGATGTTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaatatatagttttgattgtaatgcattttacaactttcgttcattttccagcattgtctctcttcgttttaaatattttataggcagttcatATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTTTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGTGCTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTAATA--TGTATCTTAGATGCGCTTTTTTATGATGAGAAAATGTATA----TCTATATTGAATTGCTGTAACCATATATCACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATATTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGTGTT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATTTATTT--TCTTTT----ATTGCGTCTAAGTATTTTTCTGTTTTAAAGTCATGTTTAAATAAGCTAT--AGAACTGTAGTCTGGATGAGTTGTTTATTTCTGAGTACCAGGTTTGTTTATA--TGTATCTAAGATGCGCTGTTTTATGATGGGAAAATGTATA----TCTATATCGAATTGCTGTAACCATATATAACTAAATCCATGGTTTTGGAGAATAGTTTTTATTTGATATGCCCAGTTTGT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CGTGTTTAACACCTTCGCAATAATAGAATGAAATACA-TTATATAGAAT-CT-ACG----GTAGATT-TACCTATTTGAAAACCAAATTGG---TTTAGAGATGTT-G-TTTTTTTTTTATATTTTTCTGCTCATGCAGTTCAA----CGATTGAGTAGAATTTGGGAATA-AACGTTCTTAGCATATTGATAGGTGTGAGTCCCCTATAATTTTT
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Unaligned ( gi|10 ): TTTACACAAGCCTGGATGTTACTATATAATATAGACTTAATCGTAGCAACCATTTTGCAGCTGACACCTAACTGAATTAATTTGAACCATAATGTATATCTTAGAATAGTGGCAAATGCTTTCTCGTAATCGATGAATTTACAAAACCATTTAGAGTTCCTAGATAAAATATTGTGTATAACAGAGTGTAGAACAA
Unaligned ( gi|12 ): CTGTAAATGCTTTAATCATATTAAAACACTAACAACTTATACCTAACTGGGCAATGTTCACCCAAATCACATTCCAAAATGCAGTACCAAAACATTTTACAACCTATGAAAGCACAGTACAATGTATATCCTGAGTAAGTATTTTATAAATTTATAAATTGA
Unaligned ( gi|13 ): TGTATTATGTGGGTTGAAGGCCTTATATCAAAATAAGCATTGTATTTTGTATTTTAAATTGCACAAAGTAATTTAGATTTAAACATAAATGTGCTCTGTATATATTGGAATGAAAAAAAAATTCGTGCTGTCATTGTCCCTGAGGCCAAATT
Unaligned ( gi|14 ): CTTTTGAATTATTGAATGCAAAATAAATATACACTCTGTAATACTATGACTATCGTGAAAGCCAAATTGTGCCTCGTTAAAAGTGTGTTCCGCCTCGCACCATTTATTTATTCTGTTACGTAGGGTGAGAGAGACT
Unaligned ( gi|15 ): CCATTGGTAATAAGGTAACCAGTGTTTAACACAGAGAAATACGTTTTTGCCCATAGTTGTCATTCATGGATTCCTGGTTGTGCCGTACATGGATAGCATTTTGCCTTAATGATACATATTCA
Unaligned ( gi|17 ): TTTTTATTCTTTAAAAAATATTTCTTGCTGTTTTAAACTCTTGTTTTGCTATAAAACAATTTTCATCAAACCATCGTGTTTTATTTTTTGCATTACTGTTTTTATTT
Unaligned ( gi|18 ): AATACAATCTGTTGTGCTATGATTGCCCCTGAAACGAAACTGGTGTCCGTTGAACACATTTTCAGAT
Unaligned ( gi|19 ): CTTGATCATGGTAACCATTTTGCAGCTGACAACAGACTGAATTAATTTGAACCTTAAT