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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTCTTCATCCTTTAACTTCATTGAAAATGTATAAT--T-TTATTTAATGCCTAAGATTTTAAACATATGTGAATTGTTAAACCAAATTTCAAAACGCGATATGTTAACAGTAAAAAAATCCCATTGTTTTTGTGTTAAAGTAATGCAACCTGTTCAAGTGTATACCAGAACTGACGTGTGTTTAAGTTTAATTTGGTAGCAGA-----AAAAGTT-AATTTATGAGAGAAAGTTTTCATTT-CTTGGTCAGTTGTGTTGGTCAAATTGTAACCACAGAGTAACA--ATATTTTTATTTGCAAACTTTTCCGATACCAAACTCATCCATTAAATCAACTTGGTTTCATACCCGGCATCATGCGTATTTTAAATAAGTATTCTTTATCTTCAGTTTTAAGTGACTTTGTTTTTTCCGGACATTTTCCCATCTAAATTTAAATGGAAA----AAAAACTTATTCACACAAATATCGACAGAGTTGAAGAGAATAATTGGTCAA-ATAGAATATACCTAGATAGTACCATTACAGATTTTATTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTATGAGATTTGGCATCTATC---AACTCTA---------------TAAA-------------TATAT----TATGCCGTCTTTCCAGCGACACGTTCATGAAGACTGTCCAAAGTGTAAGAGATGTGTTATTT--GTAA-TATTCATCTTATTTTAGAATGTAGCGTATCAGAAACTTTT-AGAGAAAATCTAT----ATCAATATAA-ACGATAATCAGTCCTGATAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGTCATTTTCTTGGTCAATTGTGCCGGTCAACCTGCGACCACTTGGTC--AACACATTTGTATTTAC-GAC-------ACA-TAGT-TAATCCATCAAATCAACCTGTTTTCATACCC--TA-------TATTTTTAATGTATATTCTC----TTTAACTTTGAACGACTTCGTTGAATT-AGGCATTTGTTTGTCTAAATT-TAAT-TGAA-AGTAAA----TATTAATATCAATATTAACGGGGTAGAAGAGAATAATTTGTCAATAT-TGGTAGACTAAGATAAGACATTAACTGATTTTGTTTCAATTAAACCAATGTTGAATACTGTATGGGAATTTTG-CAGTTATC-AAAGCT-------------ACAAGTGGTTGTCAAAGTACTATattc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGACACCAAGCTCATGCATCAAATCAACTTGGTTT-------GATATCAT--GCTTATTGAATAAGTATTCTCTATCGTCAAATTTGAAGGAC-AAAATGTTTC-GGACATTTTC---TCTAA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATCGAAAACTATACCCTAGATATAGCACTTGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGT----------Ttgttttcgaaatgtgatggaaac
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTAA-TCTCTGGAAATCAAT-CTACACGATAATCGGTCCTG-TATCA
9 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAAGATACAAAAATTGCCCGATTAATGGCTTAAGGACAATTGTTACCAAGGATACAACAAATCATAAGTGTCTTGTAGTGGTTATTCGTGCACTGCACCAAATTTGGTCTTAAAACAGCATAAATGCGTAGTGTCATGTTGCTAAGGTTTACAAACATTTAACACATTTTAACAATACCGACATATTGTGTATAACACTGATTTCCTTCTAATATCGTGTATTTTGATTCGACAAGATTACATAATTGGGTATCATGTTGACATATTTATAAAATTACAAACATTGAATAAGTTTAATGAAGTATAACGTAATATTCTTTTTTCCTTGTGTTATATGTATTAGTATTGCTTTCTCTATTTATATTGCTATTGCTTTTTGTATTGTATGTATAGGTTATCTATGTAGGAAGAAATAAAGAATC
Unaligned ( gi|7 ): ATTTCCTTCTTACATCTTGTATTTCGTTTCAGAAAGACTTGTTGATCGGATGTCATGTCTTAATATGTATAAACTTATAAACAATTAACATGCTTACTAAAGTATAATTTTATTTTAGCATAACATTTATTTTGTTCATAACAAATGTATAAAATTTATATTCATTGTATGCTTTGTGTTATATGTAATTTCATTTCTGTATTTATATTGTAATTTGTTATTTTATTCTATGTGCTCTCCATATAAGAGGAAATAAAGGATCAAATC
Unaligned ( gi|8 ): TAAAAACTTAAAATATGTTTAAAATGTTTAATGAAATATTATTTAATTTTCTTAGCATAACATTTATTTTGCTCATAACAAATATTGCATTATATTACAGTATAAAAATTTCTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATATGTATTATTTCTTCCTCAATCTATATTGTGATTTGTTATTCTGTTGTATGTATGATTGTGTTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAGAATCAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): CAACATGTTTAATGAAATATAATGTATATTTTGAGTACAGCATTAATTTGCTCATAACATATATTGTATTATATTATGTAAAATTGTTGATCATTTTGCCTTGTGTTATATGTCATTATTTCAATATTTCTTTATATTGTAGTTTGTTGTTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAAAATCAAATAAA
Unaligned ( gi|10 ): AATGACGGTTTTATTTGATTTTTATACGCATGCCAAACTTTTGGTCTGTTTTTATTTTATAAAACTGTATACAGCAGACATATATGATACATGATAATGTGCAAGAACCCACATTTGGTGTCTGAATGATTCAGCGTCATGCAGGGCCAGACAATGGGAAAACAATTCACTTATTATATTT
Unaligned ( gi|11 ): TTTCATAAACTGCACTATATTGTGTAAAATTGTTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATGTTTTATTTCTTTCTTTATACTGTAATTTGTTATTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCACATAGGACGATAATAAAGAATCAAATCAC
Unaligned ( gi|12 ): ATTGCACCTAATTTGGTCTTAAACCAGAGTAAATATACATATTCTGTTTATACTGACATATCGTGTACAGAACTGATCTCCTTCTCACATCGTGTAGTTCCTTTCAACAACATTGGGTGATTGGATATCATGCC
Unaligned ( gi|14 ): TACTCATTTTGTTGTTTTATATATGTATCTTTTTTGTTTTTCTGCTTGTATTGTAATCTGTTATTTTATTGTATGTATATGTTCTCAACTTTGGAGGAAATAAAGAATCAAAT
Unaligned ( gi|15 ): AAATGACCCTTATAATTATAGAGCTATTTCTCTATCCCCAACTATACTTAACATACATGAGATTGTCCTATTAATATGTTCAAAGTCA






Alignments
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Reference ( family-1142 )     : GAAATGGAGAACAGTT----GTCATGGCATATGTATTTTTAATTGAA-AT------TACGACTCTCCAATTGTAGCTAACAATGTATCATTTAA-----------AAATATGGCCTAGACAAAATGTTTGATATATGCAATANTGTATGNCCATCAAAGCGGNGNTNCNNGTACAAT--CAGTAAAATGTNCAGTCATTGTATTTAATAAAACAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTTCATCCTTTAACTTCATTGAAAATGTATAAT--T-TTATTTAATGCCTAAGATTTTAAACATATGTGAATTGTTAAACCAAATTTCAAAACGCGATATGTTAACAGTAAAAAAATCCCATTGTTTTTGTGTTAAAGTAATGCAACCTGTTCAAGTGTATACCAGAACTGACGTGTGTTTAAGTTTAATTTGGTAGCAGA-----AAAAGTT-AATTTATGAGAGAAAGTTNTCATTTTCTTGGTCAGTTGTGCCGGTCAANCTGCGACCACNNGGTNACAACACATTTNTATTTGCAGACTTTTCCGACACCAANCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGGTATCAT--GTATTTTNAATAAGTATTCTCTATCTTCAANTTTGAACGACTTCGTTGTTT-CGGACATTTTCCCGTCTAA-ATTT---NAATGNGAA-AGTAAAAACTTATTNACACNAATATCGACGGGGTNGAAGAGAATAATTNGTCAATATANGGTANACCNAGATAGNACNNTNACNGATTTTGTTTCAGTCAAACCAATGTTGAACANTGTNTGNGAGNTTTGGCANCTATCAAAACT------TAAA-------TNGATGTCAAAGTACTGTANATATCATATGCCGTCTCTCCAGCGACACGTTCATGAAGACTGTCCAAAGTGTAAGAGATGTGTTATTT--GTAA-TATTCATCTTATTTTAGAATGTAGCGNATCAGAGACTNTCAGGGNNA-------------AATCTNTGGAA-------------ATCAATACNACACGATAATCGGTCCTGATACCA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCTCCATCCTATAACTTTAATGAAAATTTATAATAATGTTGTTT--TGCCTGAGGTTCTACACGGATGTGAAGTGTTAAACCAAATATCAAAACGTGATATTTTAACACTAGAAAAATCTCATCGTTTTTGTGTCAAA---ATGCAATCTGTACCAGCGTATACCAGAACTTATGTATGTTTAATTTTAATTGGGTCACATACTTTAGAAAGTTTAATTGATAAAATACAGTTGTCATTT-CTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAGACTGTAGCCACATAG-----A-ATATTTTTAGTTACAGACTTTTCCGATATTAATCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATACCATTGGTATTTTAAATAAATATTGTCGGTTTTCAATTTTGAACGACTTTGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCATCTAA-A-TT---AAATATAAACAACAAGAACTTGTTAACATCAATATCAACAGAGTTGAAAAGAGTAACTTGTCAA-ATATAATATACCTAGATAATTCCCTTACATATTTTGTTTCTGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGACATCTATCAAAACTCTACTCTAGATAACCACTAAATGTCAAAGTACTGTATATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGT----------TGCCCAAAGTGTACCAGAGGTGTTATTTGCGTAACTATTTATCGTATTCTAGAATGTAGCGAATCAGAAATTGTT-GAATAA-------------AATCTCTGGAA-------------ATTAAT-TAATACAATAATCGTTCCTG-TACCAcgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtggtctccatcctataactttaatgaaaatttataataatgttgttttgcctgaggttctacacggatgtgaagtgttaaaccaaatatcaaaacgtgatattttaacactagaaaaatctcatcgtttttgtgtcaaaatgcaatctgtaccagcgtataccagaacttatgtatgtttaattttaattgggtcacatactttagaaagtttaattgataaaatacagttgtcatttcttggtcagttgtgtcggtcagactgtagccacatagaatatttttagttacagacttttccgatattaatctcatccatcaaatcaacttggtttcatacccgataccattggtattttaaataaatattgtcggttttcaattttgaacgactttgttgtttcgggcattttcccatctaaattaaatataaacaacaagaacttgttaacatcaatatcaacagagttgaaaagagtaacttgtcaaatataatatacctagataattcccttacatattttgtttctgtcaaaccaatgttgaacaatgtttgtgaaatttgacatctatcaaaactctactctagataaccactaaatgtcaaagtactgtatatatcatatgccgtctcttcagcgacacgttgcccaaagtgtaccagaggtgttatttgcgtaactatttatcgtattctagaatgtagcgaatcagaaattgttgaataaaatctctggaaattaattaatacaataatcgttcctgtaccat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaatagaacgttctgagtacggcctatgatgtttatcgaacatcagttgtaatagtctcattgttgtcgacgatatgcttttaatatttttttctaaatacggactggacaaaatgattgacatatgtaataatacatactcagcaaaatggagatacttgtacaatgccaataaatgttcagttattgttctaatgaatccaaaacgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtgCGACACCAAGCTCATGCATCAAATCAACTTGGTTT-------GATATCAT--GCTTATTGAATAAGTATTCTCTATCGTCAAATTTGAAGGAC-AAAATGTTT-CGGACATTTTC---TCTAATGTTTTCGAAATGTGAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -------TTGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTtggaaac
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------------ATCGAT-CTACACGATAATCGGTCCTG-TATCAtatcgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtTTGTCATTTTCTTGGTCAATTGTGCCGGTCAACCTGCGACCACTTGGT--CAACACATTTGTATTTA----------CGACACATAGTTAATCCATCAAATCAACCTGTTTTCATACCC-------T--ATATTTTTAATGTATATTC----TCTTTAACTTTGAACGACTTCGTTGAAT-TAGGCATTTGTTTGTCTAA-ATTT----AAT-TGAA-AGTAAA----TATTAATATCAATATTAACGGGGTAGAAGAGAATAATTTGTCAATAT-TGGTAGACTAAGATAAGACATTAACTGATTTTGTTTCAATTAAACCAATGTTGAATACTGTATGGGAATTTT-GCAGTTATCAAAGCTA-----CAAG-------TGGTTGTCAAAGTACTATcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAAGATACAAAAATTGCCCGATTAATGGCTTAAGGACAATTGTTACCAAGGATACAACAAATCATAAGTGTCTTGTAGTGGTTATTCGTGCACTGCACCAAATTTGGTCTTAAAACAGCATAAATGCGTAGTGTCATGTTGCTAAGGTTTACAAACATTTAACACATTTTAACAATACCGACATATTGTGTATAACACTGATTTCCTTCTAATATCGTGTATTTTGATTCGACAAGATTACATAATTGGGTATCATGTTGACATATTTATAAAATTACAAACATTGAATAAGTTTAATGAAGTATAACGTAATATTCTTTTTTCCTTGTGTTATATGTATTAGTATTGCTTTCTCTATTTATATTGCTATTGCTTTTTGTATTGTATGTATAGGTTATCTATGTAGGAAGAAATAAAGAATC
Unaligned ( gi|7 ): ATTTCCTTCTTACATCTTGTATTTCGTTTCAGAAAGACTTGTTGATCGGATGTCATGTCTTAATATGTATAAACTTATAAACAATTAACATGCTTACTAAAGTATAATTTTATTTTAGCATAACATTTATTTTGTTCATAACAAATGTATAAAATTTATATTCATTGTATGCTTTGTGTTATATGTAATTTCATTTCTGTATTTATATTGTAATTTGTTATTTTATTCTATGTGCTCTCCATATAAGAGGAAATAAAGGATCAAATC
Unaligned ( gi|8 ): TAAAAACTTAAAATATGTTTAAAATGTTTAATGAAATATTATTTAATTTTCTTAGCATAACATTTATTTTGCTCATAACAAATATTGCATTATATTACAGTATAAAAATTTCTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATATGTATTATTTCTTCCTCAATCTATATTGTGATTTGTTATTCTGTTGTATGTATGATTGTGTTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAGAATCAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): CAACATGTTTAATGAAATATAATGTATATTTTGAGTACAGCATTAATTTGCTCATAACATATATTGTATTATATTATGTAAAATTGTTGATCATTTTGCCTTGTGTTATATGTCATTATTTCAATATTTCTTTATATTGTAGTTTGTTGTTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAAAATCAAATAAA
Unaligned ( gi|10 ): AATGACGGTTTTATTTGATTTTTATACGCATGCCAAACTTTTGGTCTGTTTTTATTTTATAAAACTGTATACAGCAGACATATATGATACATGATAATGTGCAAGAACCCACATTTGGTGTCTGAATGATTCAGCGTCATGCAGGGCCAGACAATGGGAAAACAATTCACTTATTATATTT
Unaligned ( gi|11 ): TTTCATAAACTGCACTATATTGTGTAAAATTGTTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATGTTTTATTTCTTTCTTTATACTGTAATTTGTTATTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCACATAGGACGATAATAAAGAATCAAATCAC
Unaligned ( gi|12 ): ATTGCACCTAATTTGGTCTTAAACCAGAGTAAATATACATATTCTGTTTATACTGACATATCGTGTACAGAACTGATCTCCTTCTCACATCGTGTAGTTCCTTTCAACAACATTGGGTGATTGGATATCATGCC
Unaligned ( gi|14 ): TACTCATTTTGTTGTTTTATATATGTATCTTTTTTGTTTTTCTGCTTGTATTGTAATCTGTTATTTTATTGTATGTATATGTTCTCAACTTTGGAGGAAATAAAGAATCAAAT
Unaligned ( gi|15 ): AAATGACCCTTATAATTATAGAGCTATTTCTCTATCCCCAACTATACTTAACATACATGAGATTGTCCTATTAATATGTTCAAAGTCA






Alignments
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Reference ( family-1142 )     : GAAATGGAGAACAGTTCTGAGTCACGGCNTATGTATNTTTAATCGAACATCAGTTGTANNANTCTCCAATTGTNGCCGACGATGTGTCNTTTAATATTTTTTTCTAAATACGGNCTGGACAAAATGNTTGACATATGCAATAATGTATACTCATCAAAACGGAGATACTTGTACAAT--CAGT-AAATGTTCAGTTATTGT-TTTAATGAANCNAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTCCATCCTNTAACTTCANTGAAAATNTATAATAATGTTGTTTAATGCCTGAGGTTCTANACGNATGTGAANTGTTAAACCAAATNTCAAAACGCGATATNTTAACANTAGAAAAATCCCATCGTTTTTGTGTCAAAGTAATGCAACCTGTNCNAGCGTATACCAGAACTNACGTGTGTTTAANTTTAATTNGGTCGCANACTTTAGAAAGTTTAATTNATGAGANANAGTTGTCATTTTCTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAAACTGTAACCACATAGTCA-A-ATATTTTTATTTACAGACTTTTCCGACACCAAGCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATATCAT--GTATTTTAAATAAGTATTCTCTATCTTCAATTTTGAACGACTTCGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCGTCTAA-ATTT---AAATGTGAA-AGCAAAAACTTATTAACATCAATATCGACGGAGTTGAAGAGAATAATTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATACCNTTACAGATTTTGTTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGGCATCTATCAAAACT-C------AGG-------TNGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTCATGAAGACTGCCCAAAGTGTANNAGANGTGTTATTTGCGTAACTATTCATCNTATTTTAGAATGTAGCGAATCAGAGACTGTCAGAGTNA-------------AATCTNTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTG-TACCA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCTCCATCCTATAACTTTAATGAAAATTTATAATAATGTTGTTT--TGCCTGAGGTTCTACACGGATGTGAAGTGTTAAACCAAATATCAAAACGTGATATTTTAACACTAGAAAAATCTCATCGTTTTTGTGTCAAA---ATGCAATCTGTACCAGCGTATACCAGAACTTATGTATGTTTAATTTTAATTGGGTCACATACTTTAGAAAGTTTAATTGATAAAATACAGTTGTCATTT-CTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAGACTGTAGCCACATAG----A-ATATTTTTAGTTACAGACTTTTCCGATATTAATCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATACCATTGGTATTTTAAATAAATATTGTCGGTTTTCAATTTTGAACGACTTTGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCATCTAA-A-TT---AAATATAAACAACAAGAACTTGTTAACATCAATATCAACAGAGTTGAAAAGAGTAACTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATTCCCTTACATATTTTGTTTCTGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGACATCTATCAAAACT-CTACTCTAGATAACCACTAAATGTCAAAGTACTGTATATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGT----------TGCCCAAAGTGTACCAGAGGTGTTATTTGCGTAACTATTTATCGTATTCTAGAATGTAGCGAATCAGAAATTGTT-GAATAA-------------AATCTCTGGAA-------------ATTAATTAATACAATAATCGTTCCTG-TACCAcgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtggtctccatcctataactttaatgaaaatttataataatgttgttttgcctgaggttctacacggatgtgaagtgttaaaccaaatatcaaaacgtgatattttaacactagaaaaatctcatcgtttttgtgtcaaaatgcaatctgtaccagcgtataccagaacttatgtatgtttaattttaattgggtcacatactttagaaagtttaattgataaaatacagttgtcatttcttggtcagttgtgtcggtcagactgtagccacatagaatatttttagttacagacttttccgatattaatctcatccatcaaatcaacttggtttcatacccgataccattggtattttaaataaatattgtcggttttcaattttgaacgactttgttgtttcgggcattttcccatctaaattaaatataaacaacaagaacttgttaacatcaatatcaacagagttgaaaagagtaacttgtcaaatataatatacctagataattcccttacatattttgtttctgtcaaaccaatgttgaacaatgtttgtgaaatttgacatctatcaaaactctactctagataaccactaaatgtcaaagtactgtatatatcatatgccgtctcttcagcgacacgttgcccaaagtgtaccagaggtgttatttgcgtaactatttatcgtattctagaatgtagcgaatcagaaattgttgaataaaatctctggaaattaattaatacaataatcgttcctgtaccat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaaatagaacgttctgagtacggcctatgatgtttatcgaacatcagttgtaatagtctcattgttgtcgacgatatgcttttaatatttttttctaaatacggactggacaaaatgattgacatatgtaataatacatactcagcaaaatggagatacttgtacaatgccaataaatgttcagttattgttctaatgaatccaaaacgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtgCGACACCAAGCTCATGCATCAAATCAACTTGGTTT-------GATATCAT--GCTTATTGAATAAGTATTCTCTATCGTCAAATTTGAAGGAC-AAAATGTTT-CGGACATTTTC---TCTAATGTTTTCGAAATGTGAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -------TTGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTtggaaac
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtaaacGTCTTCATCCTTTAACTTCATTGAAAATGTATAAT--T-TTATTTAATGCCTAAGATTTTAAACATATGTGAATTGTTAAACCAAATTTCAAAACGCGATATGTTAACAGTAAAAAAATCCCATTGTTTTTGTGTTAAAGTAATGCAACCTGTTCAAGTGTATACCAGAACTGACGTGTGTTTAAGTTTAATTTGGTAGCAG-----AAAAAG-TTAATTTATGAGAGAAAGTTTTCA-TTTCTTGGTCAGTTGTGTTGGTCAAATTGTAACCACAGAGTAACA-ATATTTTTATTTGCAAACTTTTCCGATACCAAACTCATCCATTAAATCAACTTGGTTTCATACCCGGCATCATGCGTATTTTAAATAAGTATTCTTTATCTTCAGTTTTAAGTGACTTTGTTTTTTCCGGACATTTTCCCATCTAA-ATTT---AAATG-GAA-A--AAAAACTTATTCACACAAATATCGACAGAGTTGAAGAGAATAATTGGTCAAATA-GAATATACCTAGATAGTACCATTACAGATTTTATTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTATGAGATTTGGCATCTATC--AACT--------------------------------CTATAAATATATTATGCCGTCTTTCCAGCGACACGTTCATGAAGACTGTCCAAAGTGTAAGAGATGTGTTATTT--GTAA-TATTCATCTTATTTTAGAATGTAGCGTATCAGAAACTTTTAGAG-AA-------------AATCTAT-----------------ATCAATATAAACGATAATCAGTCCTGATAC
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attaccccaataattatagagctattacctctactgtgctttaaatgtatgagatgtcctactaaatcgttcaaagtcaactatcataactgatttatatgcccagcatgggggttgcaagaaaatcttggctctgcgacgacatcggagtgtatactctacggaaaagaaaataatggcaatgttatcacttgtttttttaagacgcacgccaatttttcgaacgtctttatttttatagaactgtatgcatcaagaatatgctcgtataataaaacaacttatctagcgattgttaacaagtaccgtaacatgaaaagttacatttaaagtctgaatggttcagcgttatgcagggcaccagacaagggagtaaatgttcaccattgttatatttattatttcttcttcttccggttaaaggtcaggagtcttcttagactgtaaggttgaccttgtagtattggtggtcttatgaacTATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTA-------------A-TCTCTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTG-TATCA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -------------ATCGATCTACACGATAATCGGTCCTG-TATCAgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtTTGTCATTTTCTTGGTCAATTGTGCCGGTCAACCTGCGACCACTTGGTCA-ACACATTTGTATTTAC----------GACACATAGTTAATCCATCAAATCAACCTGTTTTCATACCC-------T--ATATTTTTAATGTATATTCTCT----TTAACTTTGAACGACTTCGTTGAAT-TAGGCATTTGTTTGTCTAA-ATTT---AA-T-TGAA-AGTAAA----TATTAATATCAATATTAACGGGGTAGAAGAGAATAATTTGTC-AATATTGGTAGACTAAGATAAGACATTAACTGATTTTGTTTCAATTAAACCAATGTTGAATACTGTATG-GGAATTTTGCAGTTATCAAAGCTAC------AAG-------TGGTTGTCAAAGTACTATtgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAAGATACAAAAATTGCCCGATTAATGGCTTAAGGACAATTGTTACCAAGGATACAACAAATCATAAGTGTCTTGTAGTGGTTATTCGTGCACTGCACCAAATTTGGTCTTAAAACAGCATAAATGCGTAGTGTCATGTTGCTAAGGTTTACAAACATTTAACACATTTTAACAATACCGACATATTGTGTATAACACTGATTTCCTTCTAATATCGTGTATTTTGATTCGACAAGATTACATAATTGGGTATCATGTTGACATATTTATAAAATTACAAACATTGAATAAGTTTAATGAAGTATAACGTAATATTCTTTTTTCCTTGTGTTATATGTATTAGTATTGCTTTCTCTATTTATATTGCTATTGCTTTTTGTATTGTATGTATAGGTTATCTATGTAGGAAGAAATAAAGAATC
Unaligned ( gi|7 ): ATTTCCTTCTTACATCTTGTATTTCGTTTCAGAAAGACTTGTTGATCGGATGTCATGTCTTAATATGTATAAACTTATAAACAATTAACATGCTTACTAAAGTATAATTTTATTTTAGCATAACATTTATTTTGTTCATAACAAATGTATAAAATTTATATTCATTGTATGCTTTGTGTTATATGTAATTTCATTTCTGTATTTATATTGTAATTTGTTATTTTATTCTATGTGCTCTCCATATAAGAGGAAATAAAGGATCAAATC
Unaligned ( gi|8 ): TAAAAACTTAAAATATGTTTAAAATGTTTAATGAAATATTATTTAATTTTCTTAGCATAACATTTATTTTGCTCATAACAAATATTGCATTATATTACAGTATAAAAATTTCTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATATGTATTATTTCTTCCTCAATCTATATTGTGATTTGTTATTCTGTTGTATGTATGATTGTGTTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAGAATCAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): CAACATGTTTAATGAAATATAATGTATATTTTGAGTACAGCATTAATTTGCTCATAACATATATTGTATTATATTATGTAAAATTGTTGATCATTTTGCCTTGTGTTATATGTCATTATTTCAATATTTCTTTATATTGTAGTTTGTTGTTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAAAATCAAATAAA
Unaligned ( gi|10 ): AATGACGGTTTTATTTGATTTTTATACGCATGCCAAACTTTTGGTCTGTTTTTATTTTATAAAACTGTATACAGCAGACATATATGATACATGATAATGTGCAAGAACCCACATTTGGTGTCTGAATGATTCAGCGTCATGCAGGGCCAGACAATGGGAAAACAATTCACTTATTATATTT
Unaligned ( gi|11 ): TTTCATAAACTGCACTATATTGTGTAAAATTGTTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATGTTTTATTTCTTTCTTTATACTGTAATTTGTTATTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCACATAGGACGATAATAAAGAATCAAATCAC
Unaligned ( gi|12 ): ATTGCACCTAATTTGGTCTTAAACCAGAGTAAATATACATATTCTGTTTATACTGACATATCGTGTACAGAACTGATCTCCTTCTCACATCGTGTAGTTCCTTTCAACAACATTGGGTGATTGGATATCATGCC
Unaligned ( gi|14 ): TACTCATTTTGTTGTTTTATATATGTATCTTTTTTGTTTTTCTGCTTGTATTGTAATCTGTTATTTTATTGTATGTATATGTTCTCAACTTTGGAGGAAATAAAGAATCAAAT
Unaligned ( gi|15 ): AAATGACCCTTATAATTATAGAGCTATTTCTCTATCCCCAACTATACTTAACATACATGAGATTGTCCTATTAATATGTTCAAAGTCA






Alignments
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Reference ( family-1142 )     : GAAATGGAGAACAGTTCTGAGTCACGGCNTATGTATNTTTAATCGAACATCAGTTGTANNANTCTCCAATTGTNGCCGACGATGTGTCNTTTAATATTTTTTTCTAAATACGGNCTGGACAAAATGNTTGACATATGCAATAATGTATACTCATCAAAACGGAGATACTTGTACAAT--CAGT-AAATGTTCAGTTATTGT-TTTAATGAANCNAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTCCATCCTNTAACTTCANTGAAAATNTATAATAATGTTGTTTAATGCCTGAGGTTCTANACGNATGTGAANTGTTAAACCAAATNTCAAAACGCGATATNTTAACANTAGAAAAATCCCATCGTTTTTGTGTCAAAGTAATGCAACCTGTNCNAGCGTATACCAGAACTNACGTGTGTTTAANTTTAATTNGGTCGCANACTTTAGAAAGTTTAATTNATGAGANANAGTTGTCATTTTCTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAAACTGTAACCACATAGT-A--A-ATATTTTTATTTACAGACTTTTCCGACACCAAGCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATATCAT--GTATTTTAAATAAGTATTCTCTATCTTCAATTTTGAACGACTTCGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCGTCTAA-ATTT---AAATGTGAA-AGCAAAAACTTATTAACATCAATATCGACGGAGTTGAAGAGAATAATTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATACCNTTACAGATTTTGTTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGGCATCTATCAAAACT-C------AGG-------TNGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTCATGAAGACTGCCCAAAGTGTANNAGANGTGTTATTTGCGTAACTATTCATCNTATTTTAGAATGTAGCGAATCAGAGACTGTCAGAGTNA-------------AATCTNTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCTCCATCCTATAACTTTAATGAAAATTTATAATAATGTTGTTT--TGCCTGAGGTTCTACACGGATGTGAAGTGTTAAACCAAATATCAAAACGTGATATTTTAACACTAGAAAAATCTCATCGTTTTTGTGTCAAA---ATGCAATCTGTACCAGCGTATACCAGAACTTATGTATGTTTAATTTTAATTGGGTCACATACTTTAGAAAGTTTAATTGATAAAATACAGTTGTCATTT-CTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAGACTGTAGCCACATAG-----A-ATATTTTTAGTTACAGACTTTTCCGATATTAATCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATACCATTGGTATTTTAAATAAATATTGTCGGTTTTCAATTTTGAACGACTTTGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCATCTAA-A-TT---AAATATAAACAACAAGAACTTGTTAACATCAATATCAACAGAGTTGAAAAGAGTAACTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATTCCCTTACATATTTTGTTTCTGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGACATCTATCAAAACT-CTACTCTAGATAACCACTAAATGTCAAAGTACTGTATATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGT----------TGCCCAAAGTGTACCAGAGGTGTTATTTGCGTAACTATTTATCGTATTCTAGAATGTAGCGAATCAGAAATTGTT-GAATAA-------------AATCTCTGGAA-------------ATTAATTAATACAATAATCGTTCCTGTACCAcgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtggtctccatcctataactttaatgaaaatttataataatgttgttttgcctgaggttctacacggatgtgaagtgttaaaccaaatatcaaaacgtgatattttaacactagaaaaatctcatcgtttttgtgtcaaaatgcaatctgtaccagcgtataccagaacttatgtatgtttaattttaattgggtcacatactttagaaagtttaattgataaaatacagttgtcatttcttggtcagttgtgtcggtcagactgtagccacatagaatatttttagttacagacttttccgatattaatctcatccatcaaatcaacttggtttcatacccgataccattggtattttaaataaatattgtcggttttcaattttgaacgactttgttgtttcgggcattttcccatctaaattaaatataaacaacaagaacttgttaacatcaatatcaacagagttgaaaagagtaacttgtcaaatataatatacctagataattcccttacatattttgtttctgtcaaaccaatgttgaacaatgtttgtgaaatttgacatctatcaaaactctactctagataaccactaaatgtcaaagtactgtatatatcatatgccgtctcttcagcgacacgttgcccaaagtgtaccagaggtgttatttgcgtaactatttatcgtattctagaatgtagcgaatcagaaattgttgaataaaatctctggaaattaattaatacaataatcgttcctgtaccat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaatagaacgttctgagtacggcctatgatgtttatcgaacatcagttgtaatagtctcattgttgtcgacgatatgcttttaatatttttttctaaatacggactggacaaaatgattgacatatgtaataatacatactcagcaaaatggagatacttgtacaatgccaataaatgttcagttattgttctaatgaatccaaaacgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtgCGACACCAAGCTCATGCATCAAATCAACTTGGTTT-------GATATCAT--GCTTATTGAATAAGTATTCTCTATCGTCAAATTTGAAGGAC-AAAATGTTT-CGGACATTTTC---TCTAATGTTTTCGAAATGTGAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -------TTGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTtggaaac
gi|17                         :                                                                                                                    atcgaaaactataccctagatatagcacTGTATAATCATCAAAACAGAGATACTTGTAC-----------AATGTTTAGTTATTGTATTTAATAAAACAAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtaaacGTCTTCATCCTTTAACTTCATTGAAAATGTATAAT--T-TTATTTAATGCCTAAGATTTTAAACATATGTGAATTGTTAAACCAAATTTCAAAACGCGATATGTTAACAGTAAAAAAATCCCATTGTTTTTGTGTTAAAGTAATGCAACCTGTTCAAGTGTATACCAGAACTGACGTGTGTTTAAGTTTAATTTGGTAGCAG-----AAAAAG-TTAATTTATGAGAGAAAGTTTTCA-TTTCTTGGTCAGTTGTGTTGGTCAAATTGTAACCACAGAGT-AACA-ATATTTTTATTTGCAAACTTTTCCGATACCAAACTCATCCATTAAATCAACTTGGTTTCATACCCGGCATCATGCGTATTTTAAATAAGTATTCTTTATCTTCAGTTTTAAGTGACTTTGTTTTTTCCGGACATTTTCCCATCTAA-ATTT---AAATG-GAA-A--AAAAACTTATTCACACAAATATCGACAGAGTTGAAGAGAATAATTGGTCAAATA-GAATATACCTAGATAGTACCATTACAGATTTTATTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTATGAGATTTGGCATCTATC--AACT--------------------------------CTATAAATATATTATGCCGTCTTTCCAGCGACACGTTCATGAAGACTGTCCAAAGTGTAAGAGATGTGTTATTT--GTAA-TATTCATCTTATTTTAGAATGTAGCGTATCAGAAACTTTTAGAG-AA-------------AATCTAT-----------------ATCAATATAAACGATAATCAGTCCTG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attaccccaataattatagagctattacctctactgtgctttaaatgtatgagatgtcctactaaatcgttcaaagtcaactatcataactgatttatatgcccagcatgggggttgcaagaaaatcttggctctgcgacgacatcggagtgtatactctacggaaaagaaaataatggcaatgttatcacttgtttttttaagacgcacgccaatttttcgaacgtctttatttttatagaactgtatgcatcaagaatatgctcgtataataaaacaacttatctagcgattgttaacaagtaccgtaacatgaaaagttacatttaaagtctgaatggttcagcgttatgcagggcaccagacaagggagtaaatgttcaccattgttatatttattatttcttcttcttccggttaaaggtcaggagtcttcttagactgtaaggttgaccttgtagtattggtggtcttatgaacTATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTA-------------A-TCTCTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -------------ATCGATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCAgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtTTGTCATTTTCTTGGTCAATTGTGCCGGTCAACCTGCGACCACTTGGTCA--ACACATTTGTATTTAC----------GACACATAGTTAATCCATCAAATCAACCTGTTTTCATACCC-------T--ATATTTTTAATGTATATTCTCT----TTAACTTTGAACGACTTCGTTGAAT-TAGGCATTTGTTTGTCTAA-ATTT---AA-T-TGAA-AGTAAA----TATTAATATCAATATTAACGGGGTAGAAGAGAATAATTTGTC-AATATTGGTAGACTAAGATAAGACATTAACTGATTTTGTTTCAATTAAACCAATGTTGAATACTGTATG-GGAATTTTGCAGTTATCAAAGCTAC------AAG-------TGGTTGTCAAAGTACTATtgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAAGATACAAAAATTGCCCGATTAATGGCTTAAGGACAATTGTTACCAAGGATACAACAAATCATAAGTGTCTTGTAGTGGTTATTCGTGCACTGCACCAAATTTGGTCTTAAAACAGCATAAATGCGTAGTGTCATGTTGCTAAGGTTTACAAACATTTAACACATTTTAACAATACCGACATATTGTGTATAACACTGATTTCCTTCTAATATCGTGTATTTTGATTCGACAAGATTACATAATTGGGTATCATGTTGACATATTTATAAAATTACAAACATTGAATAAGTTTAATGAAGTATAACGTAATATTCTTTTTTCCTTGTGTTATATGTATTAGTATTGCTTTCTCTATTTATATTGCTATTGCTTTTTGTATTGTATGTATAGGTTATCTATGTAGGAAGAAATAAAGAATC
Unaligned ( gi|7 ): ATTTCCTTCTTACATCTTGTATTTCGTTTCAGAAAGACTTGTTGATCGGATGTCATGTCTTAATATGTATAAACTTATAAACAATTAACATGCTTACTAAAGTATAATTTTATTTTAGCATAACATTTATTTTGTTCATAACAAATGTATAAAATTTATATTCATTGTATGCTTTGTGTTATATGTAATTTCATTTCTGTATTTATATTGTAATTTGTTATTTTATTCTATGTGCTCTCCATATAAGAGGAAATAAAGGATCAAATC
Unaligned ( gi|8 ): TAAAAACTTAAAATATGTTTAAAATGTTTAATGAAATATTATTTAATTTTCTTAGCATAACATTTATTTTGCTCATAACAAATATTGCATTATATTACAGTATAAAAATTTCTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATATGTATTATTTCTTCCTCAATCTATATTGTGATTTGTTATTCTGTTGTATGTATGATTGTGTTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAGAATCAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): CAACATGTTTAATGAAATATAATGTATATTTTGAGTACAGCATTAATTTGCTCATAACATATATTGTATTATATTATGTAAAATTGTTGATCATTTTGCCTTGTGTTATATGTCATTATTTCAATATTTCTTTATATTGTAGTTTGTTGTTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAAAATCAAATAAA
Unaligned ( gi|10 ): AATGACGGTTTTATTTGATTTTTATACGCATGCCAAACTTTTGGTCTGTTTTTATTTTATAAAACTGTATACAGCAGACATATATGATACATGATAATGTGCAAGAACCCACATTTGGTGTCTGAATGATTCAGCGTCATGCAGGGCCAGACAATGGGAAAACAATTCACTTATTATATTT
Unaligned ( gi|11 ): TTTCATAAACTGCACTATATTGTGTAAAATTGTTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATGTTTTATTTCTTTCTTTATACTGTAATTTGTTATTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCACATAGGACGATAATAAAGAATCAAATCAC
Unaligned ( gi|12 ): ATTGCACCTAATTTGGTCTTAAACCAGAGTAAATATACATATTCTGTTTATACTGACATATCGTGTACAGAACTGATCTCCTTCTCACATCGTGTAGTTCCTTTCAACAACATTGGGTGATTGGATATCATGCC
Unaligned ( gi|14 ): TACTCATTTTGTTGTTTTATATATGTATCTTTTTTGTTTTTCTGCTTGTATTGTAATCTGTTATTTTATTGTATGTATATGTTCTCAACTTTGGAGGAAATAAAGAATCAAAT
Unaligned ( gi|15 ): AAATGACCCTTATAATTATAGAGCTATTTCTCTATCCCCAACTATACTTAACATACATGAGATTGTCCTATTAATATGTTCAAAGTCA






Alignments
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Reference ( family-1142 )     : GAAATGGAGAACAGTTCTGAGTCACGGCNTATGTATNTTTAATCGAACATCAGTTGTANNANTCTCCAATTGTNGCCGACGATGTGTCNTTTAATATTTTTTTCTAAATACGGNCTGGACAAAATGNTTGACATATGCAATAATGTATACTCATCAAAACGGAGATACTTGTACAAT--CAGT-AAATGTTCAGTTATTGT-TTTAATGAANCNAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTCCATCCTNTAACTTCANTGAAAATNTATAATAATGTTGTTTAATGCCTGAGGTTCTANACGNATGTGAANTGTTAAACCAAATNTCAAAACGCGATATNTTAACANTAGAAAAATCCCATCGTTTTTGTGTCAAAGTAATGCAACCTGTNCNAGCGTATACCAGAACTNACGTGTGTTTAANTTTAATTNGGTCGCANACTTTAGAAAGTTTAATTNATGAGANANAGTTGTCATTTTCTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAAACTGTAACCACATAGT-A--A-ATATTTTTATTTACAGACTTTTCCGACACCAAGCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATATCAT--GTATTTTAAATAAGTATTCTCTATCTTCAATTTTGAACGACTTCGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCGTCTAA-ATTT---AAATGTGAA-AGCAAAAACTTATTAACATCAATATCGACGGAGTTGAAGAGAATAATTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATACCNTTACAGATTTTGTTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGGCATCTATCAAAACT-C------AGG-------TNGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTCATGAAGACTGCCCAAAGTGTANNAGANGTGTTATTTGCGTAACTATTCATCNTATTTTAGAATGTAGCGAATCAGAGACTGTCAGAGTNA-------------AATCTNTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCTCCATCCTATAACTTTAATGAAAATTTATAATAATGTTGTTT--TGCCTGAGGTTCTACACGGATGTGAAGTGTTAAACCAAATATCAAAACGTGATATTTTAACACTAGAAAAATCTCATCGTTTTTGTGTCAAA---ATGCAATCTGTACCAGCGTATACCAGAACTTATGTATGTTTAATTTTAATTGGGTCACATACTTTAGAAAGTTTAATTGATAAAATACAGTTGTCATTT-CTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAGACTGTAGCCACATAG-----A-ATATTTTTAGTTACAGACTTTTCCGATATTAATCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATACCATTGGTATTTTAAATAAATATTGTCGGTTTTCAATTTTGAACGACTTTGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCATCTAA-A-TT---AAATATAAACAACAAGAACTTGTTAACATCAATATCAACAGAGTTGAAAAGAGTAACTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATTCCCTTACATATTTTGTTTCTGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGACATCTATCAAAACT-CTACTCTAGATAACCACTAAATGTCAAAGTACTGTATATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGT----------TGCCCAAAGTGTACCAGAGGTGTTATTTGCGTAACTATTTATCGTATTCTAGAATGTAGCGAATCAGAAATTGTT-GAATAA-------------AATCTCTGGAA-------------ATTAATTAATACAATAATCGTTCCTGTACCAcgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtggtctccatcctataactttaatgaaaatttataataatgttgttttgcctgaggttctacacggatgtgaagtgttaaaccaaatatcaaaacgtgatattttaacactagaaaaatctcatcgtttttgtgtcaaaatgcaatctgtaccagcgtataccagaacttatgtatgtttaattttaattgggtcacatactttagaaagtttaattgataaaatacagttgtcatttcttggtcagttgtgtcggtcagactgtagccacatagaatatttttagttacagacttttccgatattaatctcatccatcaaatcaacttggtttcatacccgataccattggtattttaaataaatattgtcggttttcaattttgaacgactttgttgtttcgggcattttcccatctaaattaaatataaacaacaagaacttgttaacatcaatatcaacagagttgaaaagagtaacttgtcaaatataatatacctagataattcccttacatattttgtttctgtcaaaccaatgttgaacaatgtttgtgaaatttgacatctatcaaaactctactctagataaccactaaatgtcaaagtactgtatatatcatatgccgtctcttcagcgacacgttgcccaaagtgtaccagaggtgttatttgcgtaactatttatcgtattctagaatgtagcgaatcagaaattgttgaataaaatctctggaaattaattaatacaataatcgttcctgtaccat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaatagaacgttctgagtacggcctatgatgtttatcgaacatcagttgtaatagtctcattgttgtcgacgatatgcttttaatatttttttctaaatacggactggacaaaatgattgacatatgtaataatacatactcagcaaaatggagatacttgtacaatgccaataaatgttcagttattgttctaatgaatccaaaacgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtgCGACACCAAGCTCATGCATCAAATCAACTTGGTTT-------GATATCAT--GCTTATTGAATAAGTATTCTCTATCGTCAAATTTGAAGGAC-AAAATGTTT-CGGACATTTTC---TCTAATGTTTTCGAAATGTGAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -------TTGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTtggaaac
gi|17                         :                                                                                                                    atcgaaaactataccctagatatagcacTGTATAATCATCAAAACAGAGATACTTGTAC-----------AATGTTTAGTTATTGTATTTAATAAAACAAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtaaacGTCTTCATCCTTTAACTTCATTGAAAATGTATAAT--T-TTATTTAATGCCTAAGATTTTAAACATATGTGAATTGTTAAACCAAATTTCAAAACGCGATATGTTAACAGTAAAAAAATCCCATTGTTTTTGTGTTAAAGTAATGCAACCTGTTCAAGTGTATACCAGAACTGACGTGTGTTTAAGTTTAATTTGGTAGCAG-----AAAAAG-TTAATTTATGAGAGAAAGTTTTCA-TTTCTTGGTCAGTTGTGTTGGTCAAATTGTAACCACAGAGT-AACA-ATATTTTTATTTGCAAACTTTTCCGATACCAAACTCATCCATTAAATCAACTTGGTTTCATACCCGGCATCATGCGTATTTTAAATAAGTATTCTTTATCTTCAGTTTTAAGTGACTTTGTTTTTTCCGGACATTTTCCCATCTAA-ATTT---AAATG-GAA-A--AAAAACTTATTCACACAAATATCGACAGAGTTGAAGAGAATAATTGGTCAAATA-GAATATACCTAGATAGTACCATTACAGATTTTATTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTATGAGATTTGGCATCTATC--AACT--------------------------------CTATAAATATATTATGCCGTCTTTCCAGCGACACGTTCATGAAGACTGTCCAAAGTGTAAGAGATGTGTTATTT--GTAA-TATTCATCTTATTTTAGAATGTAGCGTATCAGAAACTTTTAGAG-AA-------------AATCTAT-----------------ATCAATATAAACGATAATCAGTCCTG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attaccccaataattatagagctattacctctactgtgctttaaatgtatgagatgtcctactaaatcgttcaaagtcaactatcataactgatttatatgcccagcatgggggttgcaagaaaatcttggctctgcgacgacatcggagtgtatactctacggaaaagaaaataatggcaatgttatcacttgtttttttaagacgcacgccaatttttcgaacgtctttatttttatagaactgtatgcatcaagaatatgctcgtataataaaacaacttatctagcgattgttaacaagtaccgtaacatgaaaagttacatttaaagtctgaatggttcagcgttatgcagggcaccagacaagggagtaaatgttcaccattgttatatttattatttcttcttcttccggttaaaggtcaggagtcttcttagactgtaaggttgaccttgtagtattggtggtcttatgaacTATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTA-------------A-TCTCTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTAATCTCTGGAAATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCAATCTACACGAAAATCGGTCCTGTATCatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -------------ATCGATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCAgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgt-------------ATCATTCTACACGATAATCGGTCATGCATCAttctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtTTGTCATTTTCTTGGTCAATTGTGCCGGTCAACCTGCGACCACTTGGTCA--ACACATTTGTATTTAC----------GACACATAGTTAATCCATCAAATCAACCTGTTTTCATACCC-------T--ATATTTTTAATGTATATTCTCT----TTAACTTTGAACGACTTCGTTGAAT-TAGGCATTTGTTTGTCTAA-ATTT---AA-T-TGAA-AGTAAA----TATTAATATCAATATTAACGGGGTAGAAGAGAATAATTTGTC-AATATTGGTAGACTAAGATAAGACATTAACTGATTTTGTTTCAATTAAACCAATGTTGAATACTGTATG-GGAATTTTGCAGTTATCAAAGCTAC------AAG-------TGGTTGTCAAAGTACTATtgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat


blockSeqs                     :      GG     A   .     C     A    T  T    A     .  .       CG C    CA     A            T A     .                  C            T                 G      C                      AATCAGTA                   A         A A                                                                                                                                                                                           T        T       G      T         AA              A   T       T             T              G      G                             GTA           T A                G            G       T   A   G           .      T      G A        T  T                                     TAACA                AA                                          C      GAT     GC       G              ATCG    A          TTT       C           CCA     T T  TCG  A GT   AGT    A                                             A    T                    A                                           T                 A     ACAAGTGGT                                                           TCATGAAGAC             AG   T         .     .        T                               A   TT ATCTCTGGAAATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGT
blockSeqs                     :                                                                                                                                                 .      .                      .                          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .  T                                     TCAAC                .                                           C      GGC     .        A              ATCT    T          TTC       .           TTG     . T  .    A G    A      .                                             .    .                    T                                           .                 .     .                                                                                                                                                        A   TT ATCTCTGGAA                           
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finalCons                     : GAAATGGAGAACAGTTCTGAGTCACGGCNTATGTATNTTTAATCGAACATCAGTTGTANNANTCTCCAATTGTNGCCGACGATGTGTCNTTTAATATTTTTTTCTAAATACGGNCTGGACAAAATGNTTGACATATGCAATAATGTATACTCATCAAAACGGAGATACTTGTACAAT--CAGT-AAATGTTCAGTTATTGT-TTTAATGAANCNAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTCCATCCTNTAACTTCANTGAAAATNTATAATAATGTTGTTTAATGCCTGAGGTTCTANACGNATGTGAANTGTTAAACCAAATNTCAAAACGCGATATNTTAACANTAGAAAAATCCCATCGTTTTTGTGTCAAAGTAATGCAACCTGTNCNAGCGTATACCAGAACTNACGTGTGTTTAANTTTAATTNGGTCGCANACTTTAGAAAGTTTAATTNATGAGANANAGTTGTCATTTTCTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAAACTGTAACCACATAGT-A--A-ATATTTTTATTTACAGACTTTTCCGACACCAAGCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATATCAT--GTATTTTAAATAAGTATTCTCTATCTTCAATTTTGAACGACTTCGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCGTCTAA-ATTT---AAATGTGAA-AGCAAAAACTTATTAACATCAATATCGACGGAGTTGAAGAGAATAATTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATACCNTTACAGATTTTGTTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGGCATCTATCAAAACT-C------AGG-------TNGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTCATGAAGACTGCCCAAAGTGTANNAGANGTGTTATTTGCGTAACTATTCATCNTATTTTAGAATGTAGCGAATCAGAGACTGTCAGAGTNA-------------AATCTNTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|7 ): ATTTCCTTCTTACATCTTGTATTTCGTTTCAGAAAGACTTGTTGATCGGATGTCATGTCTTAATATGTATAAACTTATAAACAATTAACATGCTTACTAAAGTATAATTTTATTTTAGCATAACATTTATTTTGTTCATAACAAATGTATAAAATTTATATTCATTGTATGCTTTGTGTTATATGTAATTTCATTTCTGTATTTATATTGTAATTTGTTATTTTATTCTATGTGCTCTCCATATAAGAGGAAATAAAGGATCAAATC
Unaligned ( gi|8 ): TAAAAACTTAAAATATGTTTAAAATGTTTAATGAAATATTATTTAATTTTCTTAGCATAACATTTATTTTGCTCATAACAAATATTGCATTATATTACAGTATAAAAATTTCTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATATGTATTATTTCTTCCTCAATCTATATTGTGATTTGTTATTCTGTTGTATGTATGATTGTGTTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAGAATCAAATAA
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Unaligned ( gi|11 ): TTTCATAAACTGCACTATATTGTGTAAAATTGTTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATGTTTTATTTCTTTCTTTATACTGTAATTTGTTATTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCACATAGGACGATAATAAAGAATCAAATCAC
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Unaligned ( gi|14 ): TACTCATTTTGTTGTTTTATATATGTATCTTTTTTGTTTTTCTGCTTGTATTGTAATCTGTTATTTTATTGTATGTATATGTTCTCAACTTTGGAGGAAATAAAGAATCAAAT
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Reference ( family-1142 )     : GAAATGGAGAACAGTTCTGAGTCACGGCNTATGTATNTTTAATCGAACATCAGTTGTANNANTCTCCAATTGTNGCCGACGATGTGTCNTTTAATATTTTTTTCTAAATACGGNCTGGACAAAATGNTTGACATATGCAATAATGTATACTCATCAAAACGGAGATACTTGTACAAT--CAGT-AAATGTTCAGTTATTGT-TTTAATGAANCNAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTCCATCCTNTAACTTCANTGAAAATNTATAATAATGTTGTTTAATGCCTGAGGTTCTANACGNATGTGAANTGTTAAACCAAATNTCAAAACGCGATATNTTAACANTAGAAAAATCCCATCGTTTTTGTGTCAAAGTAATGCAACCTGTNCNAGCGTATACCAGAACTNACGTGTGTTTAANTTTAATTNGGTCGCANACTTTAGAAAGTTTAATTNATGAGANANAGTTGTCATTTTCTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAAACTGTAACCACATAGT-A--A-ATATTTTTATTTACAGACTTTTCCGACACCAAGCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATATCAT--GTATTTTAAATAAGTATTCTCTATCTTCAATTTTGAACGACTTCGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCGTCTAA-ATTT---AAATGTGAA-AGCAAAAACTTATTAACATCAATATCGACGGAGTTGAAGAGAATAATTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATACCNTTACAGATTTTGTTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGGCATCTATCAAAACT-C------AGG-------TNGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTCATGAAGACTGCCCAAAGTGTANNAGANGTGTTATTTGCGTAACTATTCATCNTATTTTAGAATGTAGCGAATCAGAGACTGTCAGAGTNA-------------AATCTNTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCTCCATCCTATAACTTTAATGAAAATTTATAATAATGTTGTTT--TGCCTGAGGTTCTACACGGATGTGAAGTGTTAAACCAAATATCAAAACGTGATATTTTAACACTAGAAAAATCTCATCGTTTTTGTGTCAAA---ATGCAATCTGTACCAGCGTATACCAGAACTTATGTATGTTTAATTTTAATTGGGTCACATACTTTAGAAAGTTTAATTGATAAAATACAGTTGTCATTT-CTTGGTCAGTTGTGTCGGTCAGACTGTAGCCACATAG-----A-ATATTTTTAGTTACAGACTTTTCCGATATTAATCTCATCCATCAAATCAACTTGGTTTCATACCCGATACCATTGGTATTTTAAATAAATATTGTCGGTTTTCAATTTTGAACGACTTTGTTGTTT-CGGGCATTTTCCCATCTAA-A-TT---AAATATAAACAACAAGAACTTGTTAACATCAATATCAACAGAGTTGAAAAGAGTAACTTGTCAAATA-TAATATACCTAGATAATTCCCTTACATATTTTGTTTCTGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTGTGAAATTTGACATCTATCAAAACT-CTACTCTAGATAACCACTAAATGTCAAAGTACTGTATATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGT----------TGCCCAAAGTGTACCAGAGGTGTTATTTGCGTAACTATTTATCGTATTCTAGAATGTAGCGAATCAGAAATTGTT-GAATAA-------------AATCTCTGGAA-------------ATTAATTAATACAATAATCGTTCCTGTACCAcgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtggtctccatcctataactttaatgaaaatttataataatgttgttttgcctgaggttctacacggatgtgaagtgttaaaccaaatatcaaaacgtgatattttaacactagaaaaatctcatcgtttttgtgtcaaaatgcaatctgtaccagcgtataccagaacttatgtatgtttaattttaattgggtcacatactttagaaagtttaattgataaaatacagttgtcatttcttggtcagttgtgtcggtcagactgtagccacatagaatatttttagttacagacttttccgatattaatctcatccatcaaatcaacttggtttcatacccgataccattggtattttaaataaatattgtcggttttcaattttgaacgactttgttgtttcgggcattttcccatctaaattaaatataaacaacaagaacttgttaacatcaatatcaacagagttgaaaagagtaacttgtcaaatataatatacctagataattcccttacatattttgtttctgtcaaaccaatgttgaacaatgtttgtgaaatttgacatctatcaaaactctactctagataaccactaaatgtcaaagtactgtatatatcatatgccgtctcttcagcgacacgttgcccaaagtgtaccagaggtgttatttgcgtaactatttatcgtattctagaatgtagcgaatcagaaattgttgaataaaatctctggaaattaattaatacaataatcgttcctgtaccat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaatagaacgttctgagtacggcctatgatgtttatcgaacatcagttgtaatagtctcattgttgtcgacgatatgcttttaatatttttttctaaatacggactggacaaaatgattgacatatgtaataatacatactcagcaaaatggagatacttgtacaatgccaataaatgttcagttattgttctaatgaatccaaaacgcaatataaaataccaaacgtaaatggaaattaggtaatagatatgtggaagagacaacagaatatacacatctaggtgtgatgtgtttggcaaacaacgcattaagggcatgttctctaaacctagaggcatatttctagggctgcaaaattctggtattcacgaaggtgCGACACCAAGCTCATGCATCAAATCAACTTGGTTT-------GATATCAT--GCTTATTGAATAAGTATTCTCTATCGTCAAATTTGAAGGAC-AAAATGTTT-CGGACATTTTC---TCTAATGTTTTCGAAATGTGAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -------TTGATGTCAAAGTACTGTAAATATCATATGCCGTCTCTTCAGCGACACGTTtggaaac
gi|17                         :                                                                                                                    atcgaaaactataccctagatatagcacTGTATAATCATCAAAACAGAGATACTTGTAC-----------AATGTTTAGTTATTGTATTTAATAAAACAAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtaaacGTCTTCATCCTTTAACTTCATTGAAAATGTATAAT--T-TTATTTAATGCCTAAGATTTTAAACATATGTGAATTGTTAAACCAAATTTCAAAACGCGATATGTTAACAGTAAAAAAATCCCATTGTTTTTGTGTTAAAGTAATGCAACCTGTTCAAGTGTATACCAGAACTGACGTGTGTTTAAGTTTAATTTGGTAGCAG-----AAAAAG-TTAATTTATGAGAGAAAGTTTTCA-TTTCTTGGTCAGTTGTGTTGGTCAAATTGTAACCACAGAGT-AACA-ATATTTTTATTTGCAAACTTTTCCGATACCAAACTCATCCATTAAATCAACTTGGTTTCATACCCGGCATCATGCGTATTTTAAATAAGTATTCTTTATCTTCAGTTTTAAGTGACTTTGTTTTTTCCGGACATTTTCCCATCTAA-ATTT---AAATG-GAA-A--AAAAACTTATTCACACAAATATCGACAGAGTTGAAGAGAATAATTGGTCAAATA-GAATATACCTAGATAGTACCATTACAGATTTTATTTCAGTCAAACCAATGTTGAACAATGTTTATGAGATTTGGCATCTATC--AACT--------------------------------CTATAAATATATTATGCCGTCTTTCCAGCGACACGTTCATGAAGACTGTCCAAAGTGTAAGAGATGTGTTATTT--GTAA-TATTCATCTTATTTTAGAATGTAGCGTATCAGAAACTTTTAGAG-AA-------------AATCTAT-----------------ATCAATATAAACGATAATCAGTCCTG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attaccccaataattatagagctattacctctactgtgctttaaatgtatgagatgtcctactaaatcgttcaaagtcaactatcataactgatttatatgcccagcatgggggttgcaagaaaatcttggctctgcgacgacatcggagtgtatactctacggaaaagaaaataatggcaatgttatcacttgtttttttaagacgcacgccaatttttcgaacgtctttatttttatagaactgtatgcatcaagaatatgctcgtataataaaacaacttatctagcgattgttaacaagtaccgtaacatgaaaagttacatttaaagtctgaatggttcagcgttatgcagggcaccagacaagggagtaaatgttcaccattgttatatttattatttcttcttcttccggttaaaggtcaggagtcttcttagactgtaaggttgaccttgtagtattggtggtcttatgaacTATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTA-------------A-TCTCTGGAA-------------ATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATTTTAGAATGTAACGAATCAGAGACTGTCAGAGTTAATCTCTGGAAATCAATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCAATCTACACGAAAATCGGTCCTGTATCatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -------------ATCGATCTACACGATAATCGGTCCTGTATCAgatctacacgataatcggtcctgtatcattctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgt-------------ATCATTCTACACGATAATCGGTCATGCATCAttctacacgataatcggtcatgcatcatgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattttagaatgtaacgaatcagagactgtcagagttaatctctggaaatcaatctacacgataatcggtcctgtatcaatctacacgaaaatcggtcctgtatcgatctacacgataatcggtcctgtTTGTCATTTTCTTGGTCAATTGTGCCGGTCAACCTGCGACCACTTGGTCA--ACACATTTGTATTTAC----------GACACATAGTTAATCCATCAAATCAACCTGTTTTCATACCC-------T--ATATTTTTAATGTATATTCTCT----TTAACTTTGAACGACTTCGTTGAAT-TAGGCATTTGTTTGTCTAA-ATTT---AA-T-TGAA-AGTAAA----TATTAATATCAATATTAACGGGGTAGAAGAGAATAATTTGTC-AATATTGGTAGACTAAGATAAGACATTAACTGATTTTGTTTCAATTAAACCAATGTTGAATACTGTATG-GGAATTTTGCAGTTATCAAAGCTAC------AAG-------TGGTTGTCAAAGTACTATtgtgtagttcttattcctaagatgcaaattattgctctgattaatggcttaatgcctgttgtcaccaatgatacaaaaaaactataaaaggttgttgcgcactgcaacacatttggtctaaaatcagagtaaatgcgaagtacagtgtagctaaggtttaccaacatattaatacattttaacaatactgacatttttgtttctgatttctgtatttcgtttagacaagatcgggtatcacggcatcatatgtataaacttaaaaaaacatttaatatgcttattaaagtataaattagttttttagcataacatttattttgctcatcacaaataagctgcattatatttatttggtaaaattgttattcattttgccgtgtgttacttgtattatttctttctctatttatatttaatttgttattttattgtatgtatgtgatctctagataaaaggaaataaagaatcat
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TAAGATACAAAAATTGCCCGATTAATGGCTTAAGGACAATTGTTACCAAGGATACAACAAATCATAAGTGTCTTGTAGTGGTTATTCGTGCACTGCACCAAATTTGGTCTTAAAACAGCATAAATGCGTAGTGTCATGTTGCTAAGGTTTACAAACATTTAACACATTTTAACAATACCGACATATTGTGTATAACACTGATTTCCTTCTAATATCGTGTATTTTGATTCGACAAGATTACATAATTGGGTATCATGTTGACATATTTATAAAATTACAAACATTGAATAAGTTTAATGAAGTATAACGTAATATTCTTTTTTCCTTGTGTTATATGTATTAGTATTGCTTTCTCTATTTATATTGCTATTGCTTTTTGTATTGTATGTATAGGTTATCTATGTAGGAAGAAATAAAGAATC
Unaligned ( gi|7 ): ATTTCCTTCTTACATCTTGTATTTCGTTTCAGAAAGACTTGTTGATCGGATGTCATGTCTTAATATGTATAAACTTATAAACAATTAACATGCTTACTAAAGTATAATTTTATTTTAGCATAACATTTATTTTGTTCATAACAAATGTATAAAATTTATATTCATTGTATGCTTTGTGTTATATGTAATTTCATTTCTGTATTTATATTGTAATTTGTTATTTTATTCTATGTGCTCTCCATATAAGAGGAAATAAAGGATCAAATC
Unaligned ( gi|8 ): TAAAAACTTAAAATATGTTTAAAATGTTTAATGAAATATTATTTAATTTTCTTAGCATAACATTTATTTTGCTCATAACAAATATTGCATTATATTACAGTATAAAAATTTCTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATATGTATTATTTCTTCCTCAATCTATATTGTGATTTGTTATTCTGTTGTATGTATGATTGTGTTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAGAATCAAATAA
Unaligned ( gi|9 ): CAACATGTTTAATGAAATATAATGTATATTTTGAGTACAGCATTAATTTGCTCATAACATATATTGTATTATATTATGTAAAATTGTTGATCATTTTGCCTTGTGTTATATGTCATTATTTCAATATTTCTTTATATTGTAGTTTGTTGTTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCGCATAGGAGGAAATAAAAAATCAAATAAA
Unaligned ( gi|10 ): AATGACGGTTTTATTTGATTTTTATACGCATGCCAAACTTTTGGTCTGTTTTTATTTTATAAAACTGTATACAGCAGACATATATGATACATGATAATGTGCAAGAACCCACATTTGGTGTCTGAATGATTCAGCGTCATGCAGGGCCAGACAATGGGAAAACAATTCACTTATTATATTT
Unaligned ( gi|11 ): TTTCATAAACTGCACTATATTGTGTAAAATTGTTATTCATTTTGCCTTGTGTTATATGTTTTATTTCTTTCTTTATACTGTAATTTGTTATTCTATTGTATGTATGTGCTCTCCACATAGGACGATAATAAAGAATCAAATCAC
Unaligned ( gi|12 ): ATTGCACCTAATTTGGTCTTAAACCAGAGTAAATATACATATTCTGTTTATACTGACATATCGTGTACAGAACTGATCTCCTTCTCACATCGTGTAGTTCCTTTCAACAACATTGGGTGATTGGATATCATGCC
Unaligned ( gi|14 ): TACTCATTTTGTTGTTTTATATATGTATCTTTTTTGTTTTTCTGCTTGTATTGTAATCTGTTATTTTATTGTATGTATATGTTCTCAACTTTGGAGGAAATAAAGAATCAAAT
Unaligned ( gi|15 ): AAATGACCCTTATAATTATAGAGCTATTTCTCTATCCCCAACTATACTTAACATACATGAGATTGTCCTATTAATATGTTCAAAGTCA