lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 11 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111 222 66666666666666666666666666666666666666 1111111111111 11111111111111111 1 4444444444 1 111111 2222222222222222222222222222 1111 444444444 1 11 1 111 11111111 111111111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5555555555555555555555555555555555555555555 11111 1111111111 11111111111 111111111111111111111111111111111 1111111 2222222 1111111111 111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444444444444444444444444444444444444444444444 33333333333 777777777777777777777777777777 1111 111111111 11 44444444444444444
lowQualScore : 111 22 3 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 888888 6 1 222222222 0 000 44444 4 00000000000000000000000000000000000000 2 777 7777777777777 2 2 22 77777777777777777 0 22 0 1 4 2 22 22 2 3333333333 5555 5555 0 1 333333 8888888888888888888888888888 2 2 0000 111111111 6 777 55 4 22 3 4 3 999 11111111 1 999999999999999 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66666666 33 4444444 333333 1 444444 88888888888888 33 11 0000000000000000000000000000000000000000000 2 4444 44444 2 66 0000000000 1 0 1 11111111111 1 777777777777777777777777777777777 1 222 555555555 1 11 6666666 33333 1 1111111 1111 8888 1 2222222222 444444444444444444 2 1 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 2222 222 44444444 4444 222 444 1 33333 3333 66666666666666666666666666666666666666666666666 1 7 1 1 11111111111 1 1 333 1 3333 999999999999999999999999999999 2 2222 33 111111111 33 55 2 888 9 5 77777777777777777
lowQualScore : ... .. . .................................................................... ...... . . ......... . ... ..... . ...................................... . ... ............. . . .. ................. . .. . . . . .. .. . .......... .... .... . . ...... ............................ . . .... ......... . ... .. . .. . . . ... ........ . ............... ..................................................................................................................................................................................................... ........ .. ....... ...... . ...... .............. .. .. ........................................... . .... ..... . .. .......... . . . ........... . ................................. . ... ......... . .. ....... ..... . ....... .... .... . .......... .................. . . . ............................................................................ . .... ... ........ .... ... ... . ..... .... ............................................... . . . . ........... . . ... . .... .............................. . .... .. ......... .. .. . ... . . .................
lowQualScore : 111 33 3 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 666666 2 5 888888888 2 888 55555 0 33333333333333333333333333333333333333 0 888 1111111111111 0 1 99 33333333333333333 3 88 1 9 0 0 99 99 2 8888888888 0000 0000 9 8 444444 1111111111111111111111111111 7 7 0000 000000000 6 000 55 0 00 3 8 6 888 22222222 5 555555555555555 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00000000 11 3333333 777777 3 888888 77777777777777 00 77 5555555555555555555555555555555555555555555 5 4444 22222 5 66 8888888888 2 9 2 55555555555 2 333333333333333333333333333333333 1 000 666666666 1 55 1111111 99999 1 9999999 9999 0000 1 1111111111 888888888888888888 4 2 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 7777 333 88888888 2222 333 222 4 44444 0000 11111111111111111111111111111111111111111111111 4 0 3 3 99999999999 5 5 000 7 7777 333333333333333333333333333333 9 4444 99 444444444 99 88 9 999 4 4 22222222222222222
consensus : CCAAAATNTCATCAAAAT-ATCT--T-A-A-AG-A-A-A--CTATAG-TTA-TT--GA----GCGG--AAA----C----T-CATTTT-TTCT-----ATTTTTAGTAACA-GTGACC-TTGACT-TTGACCCGATT-----TACCTCA-----A-----A--T--AAAT--ANCC---A-GCTC--CCT-TTCCATGTTAG------G-----A-AC-CT--AT---------A-----A-ACAAA--ATTT-CAT-C-AAA--AT--A-T--CTT-----GA----A----ACTAAAGTT------ATTGAGC---GGA---A----A-CCG-N------T-TT-T----CTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGA-CCCNACTNTACCTCAAAAC---CA--A-TCTCAAGC-TTCCTT-TTC-ATGTC--------AGGA------A-N----N-TAT---CC--A--------C-----------GA-AA-------------CNTC------------A--------GTT-------------A-------T---------T--G---A---G------C--A--A-----A---------T------------T--T-------C--T---T----A-T----A--------GTAA--------C--AGTGACCT-------T------G-AC------C---C---GA-----T--TT--A--C-----------------A--T---AA--A---A-C---C-A-A----TCC----C-AAN-CTT-----CC--TT-TCCA-TGT-N---A-----GGA-AC-----C-----TA-T--A---CAC----A----A-A---A---------T-TT--CA-T-----CAAAA-----T-ATCTTA-AAG-GAAA-C--TN---AAGTT-A---T------TGA----A--C---G------AA-A-A-C------A--T--GT-----T--T------C------T----A--------------------TT----C-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGACC-T-----TGA----C----------C---C--A------TT-T-A----C-----NC-C---AA-ANC-AATC-CCAAGCT------TC---C-T-TTC---C-A----TGT-----------A--------A-----T---T-A--C-A--C---------AAAA--TTTCAT-C---AAAATATCTCAAAGGA-A-CTCATATATCATTTGAG
Reference ( gi|2 ) : CCAAAATATCACTAAAAT-ATCG--C-A-A-AG-A-A-A--CTATAG-TTA-TC--AC----GCGG--GAA----C----T-CATTTTATTCT-----GTTTTTAGCAACA-GTGACC-TTGACT-TTGACCCGGTT-----TACCTCA-----A-----A--T--AAAT--ATTC---A-GCGC--CCT-TTCTATGTTAA------A-----A-AT-CT--AT---------A-----A-ACAAA--ATGT-CAT-C-AAA--AT--A-T--C-------GA----A----ACTAAACTT------ATTGAGC---AGA---A----A-CCA-A------T-TT-T----CTATTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC---CA--A-TCTGAAGC-TTCCGT-TTG-ATGTC--------AGGA------A-A----T-TAT---CC--A--------C-----------GA-AA-------------CATC------------G--------GTT-------------A-------T---------T--G---A---G------C--A--A-----A---------T------------T--T-------C--T---T----A-T----A--------GTAA--------C--AGTGACCT-------T------G-AC------C---C---GA-----T--TT--A--T-----------------A--T---AA--A---G-T---T-A-A----TCA----C-AAT-CTC-----TC--TT-TCCA-TGT-A---A-----GGA-AC-----C-----TG-T--A---CAC----C----A-A---A---------T-TT--CA-A-----CAAAA-----T-ATCTCA-ACG-GAAA-C--TA---AAGTT-A---C------TGA----A--C---A------AA-A-A-C------A--T--GC-----T--T------C------T----G--------------------TT----C-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGACC-T-----TGA----C---A------C---C--A------TT-T-A----C-----AC-C---AA-ATC-AATC-CCAAGCT------GA---C-T-TTC---C-A----TGT-----------A--------A-----T---T-A--C-A--C---------AAAA--TGCCAT-C---AATATATCTCAAAGGAGGATTCATATAT-ATTTGAGTGAG
gi|1 : CCAAAA-ACCATAAAAAT-ATCT--C-A-A-AG-A-A-A--ATG-AG-TAA-TT--GA----GCAA--GA------------CAATTT-TTCT-----ATTTTTAGTAACA-ATGACC-TTGAT------CCC-ATT-----TAACTCAATACTA-----A--TCCAAAC--ATTC---G---------T-TTC-ATGCGAG------G-----A-AT-CT--TT---------A-----C-GCAAA--ATAT-TAT---AAA--AT--A-T--CTTAAAATGA----A----ACTAAATTT------ATT-AAC---AAATACA----A-CCG-T------T-TT-TTTTCCTATTCTATTTTT
gi|17 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaCAAAATTTCATCAAAAT-ATCA--T-A-A-A------------T---TCA-TG--A-----GCAG--AAA----C-------ATTT-GCTCT-----ATTTTCAGTAACA-GTGACC----A----TGACCAGATT-----TACCACA-----T-----A-----AAAC--A------A-GCTT--CCT-TTTCATATTAG------G-----A-AT-AT--AT---------A-----A-ACAAA--ATTT-CAT-C-CAA--ATTCA-T--C-------CA----A----GTTACCGTC------A--GACC---TGA---A----A---A-AGATTTTT-TT-T----CTATTTTagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|14 : ccaatacaCAAATTTTCATGAAAAT-ATCT--T-G-A-TG-ACA-A--TTTTAG-TTA-TTGAAC----AAAA--AAA----C----T-TATTT-----------ATTTGTAGC--TG-GTAACC---G-----TAACCCGATT-----TACCT-A-----A-----A-----AAATCAATCCCAAA-TTGC--CCA-TTCC-TGTTAA------A-----A-cagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|7 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctagctttagtaacattgaccacaacctgatttatctgggaaccaataccaagctttcattttttgttagaaagtcatacaAAAATGTCATCAAAAT-ATCT--T-A-A-GG-A-A-A--CT-TAATTTA-TT--GG----ACAG--ATA----CCATAC-CATTT--TTCT-----AATTTTAGTAACA-GTGAC----GA----TAACCCAATT-----TACCT-A-----A-----A-----AAAC--AATCCCAA-TCCC--CCT-TTTCATGTAAG------G-----A-AC-CT--AT---------------A-ATAAA--ATGT-CAT-C-AAA--AT--gcacttaa
gi|3 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagAAAGTA-CACCAAAAT-ATAT--T-G-A-AG-G-ATA--CTAATG-TTA-TA--AA----G-GG--AAAAAAAC----T--ATTTTTTTCT-----ATTTTTAGTAACA-ATGACC-TTGACT-GTGA-----TTAAAAACACATCA-----A-----A--T--CAAT--CCAA---A-GCTT--CCT-TTTTATG-TAAGG----A-----A-AC-CT--AT---------
gi|5 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaAAA-ACCATCAAAAT-ATCT--T-T-A-A----A-A--CTTTAG-TTA-TT--AA----ATGG--AAA----A----C-C-TTTT-TTCT-----ATTTTTAGTAAAA-GTGACCTTTGTCT-ATGACCC-----------CC--------A-----A--T---------CCC---ATGCTT--CAT-TTTAATGTCAA------G-----ACAT-CT--AT---------A-----C-GCAAC--ATTT-CAtatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|10 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAAATA-CAC-AAAATCATT---------AG-A-A-A--AGATAA-T-A-TT--GA----GCGG--AAA----C------CATGTT--TCT-----GTTTT------CA-GTAATT-TGGACT-TT-ATCCATTT-----CATCTTA-----A-----A------ACT--AATCCCAA-ACTA--CAT-TTCCATGCCAG------G-----A-AT-CT--ATATACATTGAA-----A-AAAAA--AT-C-CAT-CAAAA--AT--A-T--
gi|4 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcATTTCATCAAAAT-ATCT--CTA-A-GG-A-A-A--CCAATG-TAA-TT--GT----ACGG--AAA----C----T--ATTCTGT-CT-----ATTTTCAGTAACA-GTGACC-GTAAC------CCCACTT-----AACCTCA-----A-----A------ACC--AATCCAAA-ACTT--CCT-TTCCATGTCAG------G-----T-AC-AT--AT---------A-----T-ACAGA--ATTT-CAT-C-AAA--AT--A-T--C-------TA----A----ATTTAAGTT------ATTGAGA---AGA---A----A-ACT-T------T-TT-T----CTAATTTTTataa
gi|12 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaacctcaaatcaatctcaagtttcatttgtatgttacaaacctatacaccatTCATCAAAAT-AACT--T-ACA-GG-A-A-A--C-A-AG-TTA-TT--G-----ACAG--AAA----C----T--ATTTG--CCT-----ATATTTAG--GTT-GTGATT-ATGACT-TTCACCCACTA-----TACCTCA-----A-----A--A--CCAT--AACCA--A-GCTC--CCT-TTTCATGTTAG------G-----A-ATACT--AT---------T-----A-A--------G------------------------------GA----A----ACTTAAATT------ACTGAGT----GA---T----A-TCC-A------T-TT-T----CTATTTTagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|33 : TAAAAC-TTCATAC-A-A-AGGA-A-A--CTAAAG-TTA-TT--------------GAG----C----T-AACTTT---CT-----ATTTTCAGTAACA-GTGACatgtaaaagtgaccttgacccagttttcttaaaaaaatatttcaaaacttccttgccagtgaggaacttacataaaagttcataaatatcttag
gi|9 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttcccaatatgcataaaaaaccaaacctccttttttatgttagaaaccaaaaaAAACT-ATCT--T-A-A-AGTC-A-A--CTAAAA-TTA-TT--GA----GCGG--TAA----C----AACACTTT-TTCT-----AACTACAGTAACATATAGCC-T-GACTGTTGTCCCA-TT-----TACCTCAG----A-----A--C--AAgac
gi|6 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacattttttcttcaaaatagctaaaatgaaaaaagttattgtatggaaaacatttttgtaacaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcAT-ATCG--T-A-ATGG-A-A-A--C-A-AG-TTA-CC--GA----GCAC--AAA----C------CATGTT--TCT-----ATTTCTAGTAACA-GAGAC-----A----TGACCTGATT-----TACATCA-----A-----A--TC-AAGC--CTTC-----GCTT--CCT-TTCAATGTTAC------ATACATA-AT--T--AT---------A-----ACACCAA--ATTT-TAT-C-AAG--AT--A-T--CTCAAAG-GA----A----ACTAAAGTTGCCAGTATTGAAC---AAA---A----A-ACA-T------T-TT-T----CTATTTTgctcgacttcatttcc
gi|45 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggct-AG-A-A-AACCTA-AG-TTA-CT--ATCTGAGCGG--AAA----C----T--GTTTT--TCC-----ACTTTTAGTAAAA-AAGACA-TTGACT-TTagtaacagtgatcgtgaagcttatctgatttaccccaaaatcaacaccattattccttcccatgttagaaacctatacaccaaatatcatcaaaatatc
gi|42 : TAG-TTAGTT--A-----GCGG--GAA----C----T---TTTTTTTCT-----TTTTTTAGCAACA--------TTGATT-TTGACC---TT-----GACCTCA-----A-----A--T--CAAT---TTC---A-tttctacaaaaccaacc
gi|29 : tatcaacatatAA-TTA-CC---C----GCAGTTGAA----A----C-CTTTTTTTTTC-----GATTTTAGTAACA-GTGACC-GTGGCagctt
gi|27 : taaagacgaccgtaaaccgacttgctttacctcaaaatcaagtctaagcttcctcttcttgtcagaaatatatacacaaattttgtcttcG-TTA-----AA----GCGG--AAA----C----CATATTTCATTTTTAGTAATTTTTA--AGCA-GTGACC-TTGACA-TTA-----GTT-----AACATAA-----A-----A--G--AAAC---CCC---A-GGG-----T-TTCT--GTTAATGTCTCA-----A-AC-TT--AT---------C-----C-ACAAA--ATTT-CAG-C-AAA--AT--A-T--CTTTG---GA----A----ACTAAAGAT------ATTGAGC---GAA---A----A-TCG-T------T-TT-T----CTATcattcttatatgaaaataaa
gi|41 : CAG--AAA----C------CATTTT---TT-----GAATTAAGTAACA-GTGACC-TTGACT-TTTACCaata
gi|39 : agttattgattaaaG--AAA----A----T-TATTTT-TTCT-----ATTTTTGGTAATG-GCGATC-TTGACT-TTGATCacaaaatcaattaaattctagcttcattta
gi|14 : tttctttccatgatgagaacatatctacaaaattcatcaaaagtgttaagagt-CAGTTT-TTCT-----AGCTTTAGTAACA-TTGACC----AC----AACCTGATT-----TATCTGGG----A-----A--C--CAAT--ACCA---A-GCTT--TCA-TTTTTTGTTAG------A-----A-AG-TC--AT---------A-----C-ACAAA--TTTT-CAT-G-AAA--AT--A-T--CTT-----GATGACA----ATTTTAGTT------ATTGAAC---AAA---A----A---A-A------C-TTAT----TTATTTaaaagtacatgtaatc
gi|8 : aaataagtttgcataaaccaataaaATTTT--TCT-----ATATAAAGTAACA-GGGACC-TTGAAC-TTGACTAA--------TGCCT-G-----A-----A--C--AA-----TCC---A-GTGCTTCCG-TCTTACATTAG------G-----A-AT-CC--AT---------C-----T-ACATA---TTT-CAT-C-TGA--AA--A-T--C-------TA----A----ACTGAAGTT------ATTGAAT---GGA---A----A--CA-A---------T-T----CTATgtagctggtaaccgtaacccgatttacctaaaaaatcaatcccaaattgcccattcctgttaaaagcacttaa
gi|21 : acggatggacaTTTTGTTTT------TTTTTAGTAACA-ATTACT-ATGACA-CTGATTCTATT-----TATCTCA-----A-----A--T--CAAT---TTCA--A-GCCT--CCT-TTgtccttgacgttccatatcatccttgaaattgacccaattaagctcaaaatattattaagcttccttttcatgttaccaatcattccccaaagttattgaaaagaaccatttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|43 : gatccgaattatctcaaatcaatcccagttttttttccatgtttggaactaatacacgaatagcagctaaacaatataaatggaaaccttaacttaattagacgaaatcatgattgctgtatttttgtTCTTGTTCT-----GTTTTAAATAACA-ACAATC--------TTGACCCAATT-----TACCTCA-----A-----A--
gi|25 : agttaacacagtactctgacagcCT-----ATTTTTAGTAACA-GTGACC--------TTGACCCACTT-----TAGCT-A-----A-----------AAAT--CTCG---A-GCTC--CCT-TCACATTGTGA------A-----C-CT-CTTCAT---------AAAAATA-ATAAG--ATAT-TTTAC-AAA--A---A-T--G-------GA----A----ACCAaccaatttgaatcttcc
gi|30 : gtctttaagttactaatattatgcaaaacacacttg-----GTTATTATTAACA-GTGACC-TTGACT-----CC--ATT-----TACCCTA-----A-----A--T--TAAT--Agtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|36 : caatttacctcaaatcgatcccaatcttactttccatcttagaaacatatacaccaaataacattagtttctaagatatatcatttgaaactaaaTTTTTAGTAATT-GTAACC-TTGACT-GTGACCCAATA-----TGATTCA-----A-----------AACC--AGTCTGAA-GATC--CCT-TT-----TCAG------G-----A-GC-CT--AT---------C-----C-ATAAA--TTTT-CAA-C-AAACCAT--T-T--T-------AA----A----A-GAAACTT------Accaaccttactccaatgtg
gi|47 : ttattgaatagaaTAGCAACA-GTGACC-TTGACC-TTAAagttataac
gi|3 : -TTCACC-TTGACCAGATT-----TACCTCA-----ACACCAAGCT--GAA----------A-GCTT--CTC-TTCTTTGTT-----------------T-CC--A----------A-----A-ATAAA--AAGTACAC-C-AAA--AT--A-TATT-------GA----AGGATACTAATGTT------ATAAAGGGAAAAA---A----A-CTA-T------T-TT-TTT--CTATTTTTatccaaacgacaccgaaaacaatccatgcttccttttgagtaagaaagtccatt
gi|29 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttGACTTGCTT-----TACCTCA-----A-----AATC--AAGT---CTA---A-GCTT--CCTCTTCT-TGTCAG------A-----A-AT-AT--AT---------A-----C-ACAAATTTTGT-CTT-C-AAagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatcaaatcaatccaaagcttcctttttatgtaaggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|33 : taaagacgaccgtaaaccC--CTT-TTTTATGTTAG------A-----A-AC-CA--A----------A-----A-ATAAA--ACTT-CATAC-AAA--G----------------GA----A----ACTAAAGTT------ATTGAG-----------------CTA-A------C-TT-T----CTATTTTttacccgcagttgaaacctttttttttcgattttagtaacagtgaccgtggccattcttatatgaaaataaa
gi|5 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttcccaatatgcataaaaaaccaaacctC--CAT-TTCT-TGTCAG------G-----A-TC-CT--AC---------A-----A-TTAAA--AC---CAT-C-AAA--AT--A-T--CTTT----AA----A----ACTTTAGTT------ATTAAAT---GGA---A----AACCT-T------T-TT-T----CTATTTTTcagtaacagtgacgac
gi|7 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttTATATAAG------G-----A-AC-CT--AT---------A-----A-AGAAA--ATGT-CAT-C-AAA--AT--A-T--CTTAAG--GA----A----ACTTAATTT------ATTGGAC---AGAT--ACCATA-CCA-T------T-TT-T----CTAATTTTagtaaaagtgacctttgtctatgacccccaatcccatgcttcattttaatgtcaagacatctatacgcaacatttca
gi|16 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaaCAAA--ATTT-CAT-C-AAA--TT--A-T--CTTAAAG-GG----A----AC--AATTT------ACTGAGC----CA---A----A-CTGTA------T-TT-T-----TATTATTTTTTTagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|49 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgA--ATTT-CAT-C-AAA--AT--A-T--CTTT----GA----A----AACAAG-TC------ATTGAAT---GGA---A----A-CC--A------T-TT-caagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|22 : tgtgagtgtctggagcttgtatgccTAT-CAT-C-AAA--AT--ATT--T-------AA----A----ACAAAACTCCAGTA-ACTGAGT---GAA---A----A-CTT-A------CATT-T----CTATTTTT
gi|43 : acttccttttcaggtcaggaactCTTGA-CCCAAT-TTACCTCAAAAC---CA--A-TTTGAATC-TTCCgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|12 : agttaacacagtactctgacagctcttgttctgttttaaataacaacaatCCCACTATACCTCAAAAC---CATAA-CC--AAGC-TCCCTT-TTC-ATGTT--------AGGA------ATA----C-TAT---TA--A--------G-----------GA-AA-------------CTTA------------A--------ATT-------------A-------C---------T--G---A---G------T--G--ATATCCA---------T------------T--T-------T--C---T----A-TTTT-AT-------GTAA--------A--AGTGACCT-------T------G-AC------C---C---AG-----T--TTTCT--T-----------------A--A---AA--A---A-A---T-ATT----TCA----A-AA--CTT-----CC--TT-GCCA--GT-G---A-----GGA-AC-----T--------T--A---CAT----A----A-A---A---------G-TT--CA--------TAAA-----T-ATCTTA-
gi|30 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaTACCTCAA-AT---CG--A-TCCCAATC-TTACTT-TCC-ATCTT--------AGAA------A-C----A-TAT---AC--A--------C-----------CA-AATAA----------CATT------------A--------GTTTCTAAGATATATCA-------T---------TTGA---A---A------CT-A--A-----A---------G------------T--T-------A--T---T----A-T--------------TAA--------C--AGTGACCT-------T------G-AC------T---C---CA-----T--TT--A--C-----------------C--C---TA--A---A-T---T-A-A----TAC----C-AAC-CTg
gi|16 : caattTACCTCAACAC---CA--A-TCCCAAGC-TTCCTTCTCG-TTTTCCTTTACAGAGGA------A-C----T-TAT---TC--G--------C-----------AA-AA-------------TTTC-------------------------------------A-------T---------------------------C--A--A-----A---------T------------TA-T-------C--T---T----A-A----A--------Gtactccaatgtg
gi|29 : caatcTACCTCAAAAT---CA--AGTCT-AAGC-TTCCTC-TTC-TTGTC--------A-GA------A-A----TATAT---AC--A--------C------------A-AATTTTGT-------CTTC------------A--------ATT-------------ACCCGCAGT---------T--G-----------------A--A-----ACCTTTTTT-T------------T--T-------CGAT---T----T-T----A--------GTAA--------C--AGTGACCG-------T------G-GC------C--------A-----TTCTT--A--T-----------------A--T---GA--A---A-A---T-A-A----ggaacaatttactgagccaaactgtatttttattatttttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|4 : taaagacgaccgtaaaccgacttgcttACCTCAA-AT---CA--A-TCTCAAGT-TTC-AT-TTGTATGTT--------ACAA------A-C----C-TATACACC--ATATTTCATC-----------AA-AA-------------TATCTCTAAG------GAAACCAATGTA-------------A-------T---------T--G---T---A------CGGA--A-----A---------C------------TATT-------C--TGTCT----A-TTTTCA--------GTAA--------C--AGTGACCG-------T------A-AC------C---C---CA-----C--TT--A--------------------A--CCTCAA--A---A-C---C-A-A----TCC----A-AAA-CTT-----CC--TT-TCCA-TGT-C---A-----GGT-AC-----A-----TA-T--A---TAC----A----G-A---A---------T-TT--CA-T-----CAAAA-----T-ATCT--------AAA-T--TT---AAGTT-A---T------TGAG---A--A---G------AA-A-A-C------T--T--TT-----T--T------C------T----AATT-----------------TT----T-------A-G----C---AA--------C----A---G---TGACC-T-----TGG----C---C------T---T--A------TT-T-A----C-----CT-C---AATACC-AATT-TCAAGC----------------TTC---C-A----Ta
gi|3 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaACATCAA-AT---CA--A-TCCAAAGC-TTCCTT-TTT-ATGTA--------AGGA------A-ACCTAT-TAT-------A--------T-----------TATAG-------------TCTA------------G--------GCC-------------A-------T---------T--T---A---T------C--T--T-----A---------T------------T--T----------T---T----A-T--------------TAA--------C--AGAGACTT-------T------G-AT------C---C---AA-----T--TT--A--C-----------------A--T---GT--ACATG-TATGT-C-A----TCA----CTAAT-CT-------------------AT-A---G-----ATA-GC-----T-----TCCT--A---CGC----A----A-A---A---------A-TT--CA-T-----CAAAA-----T-A----A-AAG-GATA----TG---AAATT-G---CCATGATTGA----A--T---G------GACA-A-C------A--T--TT-----T--T------C------T----AGT------------------TT----T-------A-G----T---AA--------C----G---A---TGAAC-T-----TGA----C----------C-------------TT-G-A----CTTG--AC-T----G-ACC-AATC-CCATGCT------TT---C-C-TTT---C-A----GGT-----------ttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|1 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacCCTCA-TAT---CA--A-TTTTAAAC-TTCCAT-TC---CGTT--------ACAA------A-A----C-TAT---AC--A--------CCAAAAACCATAAA-AA-------------TATCTCAAAGAAAATGA--------GTA-------------A-------T---------T--G---A---G------C--A--AGACA-A---------T------------T--T-------T--TC--T----A-TTTTTA--------GTAA--------C--AATGACCT-------T------G-AT------C---C---CA-----T--TT--A--A-----------------C--T---CA--AT--A-C---T-A-A----TC-----C-AAA-CAT-----TC--GT-TTCA-TGC-G---A-----GGA-AT-----C-----TT-T--A---CGC----A----A-A---A---------TATT-----A-----TAAAA-----T-ATCTTA-AAATGAAA-C--TA---AATTT-A---T------T-A----A--C---A------AA-T-A-C------AACC--GT-----T--TTTTTTCC------T----A--------------------TT----CTATTTTTA-G----T---AA--------C----A---G---TAAC---------AA----A---A-------------A------TT-T-A----C-----CA-C---AA-AAC-AATC-CCAAACT------TC---C-T-TTT---C-A----Ttagaaatgcaa
gi|36 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgacTCAAAAC---CA--G-TCTGAAGA-TCCC-T-TT-----TC--------AGGA------G-C----C-TAT---CC--A--------T-----------AA-Atcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|5 : ttattgaatagaatttttagtaattgtaaccttgactgtgacccaatatgatAACACGTTCA--A-TTTCAATCCTTCCAT-TTC-TTGTC--------AGGATCCTACA-A----T-TAAAA-CC--AT-------C-----------AA-AA-------------TATCTTTAAAACTTT-A--------GTT-------------A-------T---------T--A---AATGG------A--A--A-----ACCTTT----T------------T--T-------C--TATTT----T-T----A--------GTAA--------A--AGTGACCTTTGTCTAT------G-AC------C---C-------------------------------------------------------C---C-A-A----TCC----C-ATG-CTT-----CA--TT-TTAA-TGTCA---A-----GAC-AT-----C-----TA-T--A---CGC----A----A-C---A---------T-TT--CA-ttttcaacaaaccattttaaaagaaacttaagttataac
gi|17 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaAAGC-TTCCTT-TTC-ATATT--------AGGA------A-T----A-TAT---AA--A--------C-----------AA-AATTTCATCCAAATTCATCCA----------A--------GTT-------------A-------CCGTCAGACCT--G---A---A------A--A--AG----A---------T------------T--T-------T--T---TTTCTA-TTTTCA--------GTTA--------C--AGTGACTT-------T------G-AC------C---C---AA-----T--TT--A--
gi|22 : ccaatacacaaaatttcatcaaaatatcataaattcatgagcagaaacatttgctctattttcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacC-TTCCTT-TTC-AGGTC--------AGGA------A-C----T-TAT---CA--T--------C-----------AA-AA-------------TAT-----------------------TT-------------A--------------------A---A---A------C--A--A-----A---------A------------C--T-------C-------------C----A--------GTAA--------CTGAGTGActtcaaaacaaatttcaaactgc
gi|7 : a-ATGTC--------ATCA------A-A----A-TAT---CTTAA--------G-----------GA-AA-------------CTTA------------A--------TTT-------------A-------T---------T--G---G---A------C--A--G-----A---------TACCATACCATTTT--T-------C--T---A----A-TTTT-A--------GTAA--------C--AGTGACGA-------T------A-AC------C---C---AA-----T--TT--A--C-----------------C--T---AA--A---A-AA--C-A-A----TCC----C-AAT-CCC-----CC--TT-TTCA-TGT-A---A-----GGA-AC-----C-----TA-T--A----AT----A----A-A---A---------T-GT--CA-T-----CAAAA-----T-aaacttacatttctatttttgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|14 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagaaaTC--------ATGA------A-A----A-TAT---CTTGA--------T-----------GACAA-------------TTTT------------A--------GTT-------------A-------T---------T--G---A---A------C--A--A-----AAAAAC----T------------T--A-------T--T---T----A-T----TT-------GTAG--------CT-GGTAACCG-------T------A-AC------C---C---GA-----T--TT--ACCT-----------------A--A---AA--A---A-T---C-A-A----TCC----CAAAT-TGC-----CC--AT-TCC--TGT-
gi|12 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctagctttagtaacattgaccacaacctgatttatctgggaaccaataccaagctttcattttttgttagaaagtcatacacaaatttC--A--------G-----------GA-AA-------------CA--------------A--------GTT-------------A-------T---------T--G---ACA-G------A--A--ACT---A---------T------------T--TG------C--C---T----A-T----ATTTAGGTTGTGA--------T--TATGACTT-------T------C-AC------C---C---AC-----T--AT--A--C-----------------C--T---CA--A-----------A-A----CCATAACC-AAG-CTC-----CC--TT-TTCA-TGT-T---A-----GGA-A---------------T--A---C----------------------------------------------------T-ATT--A-A-G-GAAA-C--TT---AAATT-A---C------TGA----G--T---G------AT-ATC-C------A--T---T-----T--T------C------T----A--------------------TT----TT------ATG----T---AA--------A----A---G---TGACC-T-----TGA----C----------C---C--AG-----TT-T-T----CTTA--AA-A---AA-AT--ATTT-CAAAACT------TC---C-T-TGC---C-A-----GT-----------G--------AGGAACT---T-A--C-A--T---------AAAA--GTTCAT-A---AATATtaaaagcacttaa
gi|6 : tcatcaaaataactta-----------GA-AA-------------CA--------------A--------GTT-------------A-------C---------C--G---A---G------C--ACAA-----ACCATG----T------------T--T-------C--TATTT----C-T----A--------GTAA--------C--AGAGACAT--------------G-AC------C---T---GA-----T--TT--A--C-----------------A--T---CA--A---A-T---C-A-AGCCTTCG----C------TT-----CC--TT-TCAA-TGT-T---A-----CAT-ACATAA-T-----TA-T--AA--CAC----C----A-A---A---------T-TT--TA-T-----CAAGA-----T-ATCTCA-AAG-GAAA-C--TA---AAGTT-G---CCAGTATTGA----A--CA--A------AA-A-A-C------A--T--TT-----T--T------C------T----AT-------------------TT----T-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGATC-G-----TGAAGCTT---A------T---CTGA------TT-T-A----C-----CC-CA--AA-ATC-AACA-CCA---T------TATTCC-T-TCC---C-A----TGTTAGA-------A--------A-----CCTAT-A--C-A--C---------CAAA--TATCAT-C---AAAATATCcttag
gi|9 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatg--------GTT-------------A-------T---------T--GTATG---G------A--A--A-----A---------CA-----------T--T-------T--T---T--------------------GTAA--------C--AATTACCT-------T------A-AT------C---C---CA-----T--TT--A--A-----------------G--T---AATGA---A-C---T-A-A----TTA----C-AAA-CTT-----CC--TTATAC--TGT-C---T-----GAC-AT-----T-----TA-T--A---CAC---------A-T---A---------T-TT--CA-AT----CAAAC-----T-ATCTTA-AAG-TCAA-C--TA---AAATT-A---T------TGA----G--CGGTA------AC-A-A-C------AC-T--TT-----T--T------C------T----AAC------------------TA----C-------A-G----T---AA--------CATATA---GCC-TGACTGT-----TGT----C----------C---C--A------TT-T-A----C-----CT-C---AG-A---A-----CAAGCTC-----GA---C-T-T
gi|33 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacattttttcttcaaaatagctaaaatgaaaaaa--------GTT-------------A-------T---------T--G---A---G------C--T--A-----A---------C------------T--T-------T--C---T----A-TTTTCA--------GTAA--------C--AGTGACcatttcc
gi|13 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttcccaatatgcataaaaaaccaaacctccttttttatgttagaaaccaaaaataaaacttcatacaaaggaaactaaa--------GTT-------------A-------T---------T--A---A---GAAGAAAC--A--A-----A---------T------------A--TATCAAGAC--T---T----G-T----A--------GTGA--------T--GGTGACCT-------T------G-AC------A---TGGGGA-----T--TT--A--G-----------------AC-T---AA--A---A-----T-A-A----TCC----C-A-----------TG--TT-TCCA-TTT-A---ACAAATGGACAC-----T-----TA-T--ATATCAC----CAACAA-A---A---------C-TT--CA-T-----AAAAA-----T-AACTTA-Agac
gi|41 : gaactggacccactttggttcaaaagcaattccaatttcctatcaattaataacatgtctaccaaatgtcatcaaaacacttaaaagcaaaatcaa--------GTT-------------A-------T---------T--G---A---T------T--A--A-----ACAGAAACCAT------------T--T-------T--T---TGA--A-TTA--A--------GTAA--------C--AGTGACCT-------T------G-AC------T--------------T--TT--AC-C-----------------A--C---AA--A---A-T---C-A-A----TTA----A-ATT-CTggcattaattattaagc
gi|36 : aTT-------------A-------T---------T--G---A---A------T--A--G-----A---------A------------T--T-------T--T---T----AGT----AATT-----GTAA--------C--CTTGACTG-------T------G-AC------C---C---AA-----TA-TG--A--T-----------------T--C---AA--A---A-C---C-A-G----TCT----G-AAG-ATC-----CC--TT-TTCA---------------GGA-GC-----C-----TA-T--C---CAT----A----A-A---T---------T-TT--CA-A-----CAAAC-----C-ATTTTA-AAA-GAAA-C--TT---AAGTT-A---agcttcattta
gi|4 : T-------------A-------T---------T--G---A---A------C--A--G-----AAAGTA----T------------T--C-------T--T---T----T-T----T--------GTAA--------C--AGTGATCT-------TAACACTG-AC------C---C---CA-----T--TT--A--CCTTGCAACCAACCCCAAA--C---AG--A---GAT---T-A-ACC--TCAAAT-C-AAT-CTCAAGTTTCA-TT-TGTA-TGT-T---A-----CAA-AC-----C-----TA-T--A---CAC----C----A-T---A---------T-TT--CA-T-----CAAAA-----T-ATCTCT-AAG-GAAA-C--CA---ATGTA-A---T------TGT----A--C---G------GA-A-A-CT-----A--T--TC-----TG-T------C------T----ATT------------------TT----C-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGACC-G-----TAA----C---C------C---C--A------CT-T-A----------AC-CTCAAA-ACC-AATC-CAAAACT------TC---C-T-TTC---C-A----TGTC----------AGGTAC---A-----TA--T-A--T-A--C---------AGAA--TTTCAT-C---AAAATATCTAAAtaac
gi|17 : ta---------T--G---A---G------C--A--G-----AAACA-----T------------T--TG------C--TC--T----A-TTTTCA--------GTAA--------C--AGTGACCA-------T------G-AC------C---A---GA-----T--TT--A--CCAC--------------A--T---AA--A--------------------A----C-AAG-CTT-----CC--TT-TTCA-TAT-T---A-----GGA-AT-----A-----TA-T--A---AAC----A----A-A---A---------T-TT--CA-T-----CCAAA-----T----TCA-TCC--AAG-T--TA---CCGTC-AGACC------TGA----A--A---A------AG-A-T-T------T--T--TT-----T--T------C------T----A--------------------TTTT--C-------A-G----T---TA--------C----A---G---TGACT-T-----TGA----C---C------C---A--A------TT-T-A----C-----TT-C---AA-AACAAATT-TCAAACT------Gtttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|8 : ccaatacacaaaatttcatcaaaatatcataaattca---------T--G---G---A------C--A--A-----T---------T------------T--T-------T--C---T----A-T----ATAAA----GTAA--------C--AGGGACCT-------T------GAAC------T---T---GA-----C--TA--A--T-----------------GCCT---GA--A---------C-A-A----TC-----C-AGTGCTT-----CC--GT-CTTA-CAT-T---A-----GGA-AT-----C-----CA-T--C---TA-----C----A-T---A---------T-TT--CA-T-----CTGAA-----A-ATCT--------AAA-C--TG---AAGTT-A---T------TGA----A--T---G------GA-A-A-CAATTCTA--T--G------T--C------C------TTGACG--------------------TT----C-------C-A----T---AT--------C----ATCCT---TGAAA-T-----TGA----C----------C---C--A------AT-T-A----A-----GCTC---AA-AAT-ATTA-TTAAGCT------TC---C-T-TTT---C-A----TGT-----------c
gi|34 : acgga--G---A---G------C--A--A-----A---------A------------T--T-------G--T---G----G-T-------------GTAA--------C--AGTGACTT-------T-------------------------A-----C--TT--------------------------C---AA--A---C-C---C-A-A----TCC----C-AAA-CTG-----CT--TT-TCC--TGT-A---T-----GGA-AA-----C-----TA-TTGA---CATT---C----ACA---A---------T-TTTTCA-T-----CAGAA-----T-GTCTTA-AAG-GAAA-C--TT---ATGTT-A---T------TGA----G--C---A------taccaatcattccccaaagttattgaaaagaaccatttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|27 : tattaccatcca------C--A--T-----A---------T------------T--T-------CATT---T----T-T----A--------GTAATTTTTAAGC--AGTGACCT-------T------G-ACA-----T---T---AG-----T--TA--A--C-----------------A--T---AA--A---A-G---A-A-A----CCC----C-AGG-GTT-----TC--TG-TTAA-TGT-C---T-----CAA-AC-----T-----TA-T--C---CAC----A----A-A---A---------T-TT--CA-G-----CAAAA-----T-ATCTT---TG-GAAA-C--TA---AAGAT-A---T------TGA----G--C---G------AA-A-ATC------G--T--TT-----T--T------C------T----A--------------------Tt
gi|10 : gttaaagcggaaac-----A---------T------------T--T-------CAAT---T----T-T----A--------TTAA--------A--AGTAATAT-------T------C-AT------C---C---GA-----T--TT--A--T--------------------TCC-AA--C---A-C---C-A-A----TCA----C-AAT-CTT--------------CA-TAT-C---A-----GTA-ACATATAC-----TA-T--A---TACAGTAC----A-GGCCA---------C-TG--CA-AATACACAAAA-----T-----CA-TTA-GAAA-AGATA---A---T-A---T------TGA----G--C---G------GA-A-A-CC-----A--T--GT-----T--T------C------T----GTT------------------TT----C-------A-G----T---AA--------T--------T---TGGAC-T-----TTA----T----------C---C--A------TT-T------C-----AT-CTTAAA-ACT-AATC-CCAAACT-------A---CAT-TTC---C-A----TGCCAGG-------A--------A-----TCTAT-A--T-A--CATTGAAAAAAAAA--T-CCAT-CAAAAATATATaata
gi|18 : aagatattgagaagaaaatttt---------T------------T--T-------T--C---T----A-T----G--------TTAAG-------T--AATGACAT-------T------G-AC------CAATC----A-----T--GC--A--TCCTC-------------A--T---CA--A---A-C---C-A-A----TCG------GAT-TTT-----TT--TT-TCCA-TGT-A---A-----GTA-AA-----C-----TA-T--A---CAC----A----A-A---A---------T-TT--CA-A-----TAAAAAGCGTT-AACGTA-AAG-GAAA-C--TG---AAGTT-A---C------TGA----G--T---A------AA-A-A-C---------T--GT-----T--T------TAA----T----T--------------------TT----CAGTTTT-A-G----T---AA--------C----A---A---ATACC-T-----TGC----CTAGA------C---G--T------TT-T-AACTTC-----AC-TG--AA-ACC-AATC-aa
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc---------T------------T--T-------T--T---T------T----A--------GTAA--------C--AGTGACAT--------------------------------AA-----T--TC--A--A-----------------A--T---CA--A---G-A---G-AGA----TTC----C-AAA-CTT-----TT--GT-TTGA-TTT-G---A-----GGA-AT-----C-----TA-T--C---C-C----C----A-A---AC--------T-TT--CA-T-----CAAAA-----T-AACTTGCAC--AAAA-C--T---------------------TGA----A--T---G------GA-A-A-CCA----A--T--GA-----T--C------CAT----T----A--------------------TTATTAC-------ATG----T---AA--------C----A---G---TGACC-TCATCATGG----C---C------C---C--A------TT-T-AG---CTAGAAAC-TTCAAA-AGC-AATC-CAAAGTT-----------C-T-TTt
gi|5 : tc--T-------C--T---T----A-A----A--------TTAA--------T----TTACCT-------T------A-AA------A---C---GAAT---C--TT--A--------------------A--C---AA--ACACG-T---TCA-A----TTT----C-AAT-CCT-----TCCATT-TCT--TGT-C---A-----GGA-TC-----C-----TA-C--A----AT----T----A-A---A---------A-C---CA-T-----CAAAA-----T-ATCTTT-A----AAA-C--TT---TAGTT-A---T------TAA----A--TGG-A------AA-A-C-C------T--T--TT-----T--T------C------T----A--------------------TT----TTT-----A-G----T---AA--------A----A---G---TGACC-T-----TTG----T----------C---T--A-------T-G-A----C-----CC-C--------C-AATC-CCATGCT------tacattaa
gi|14 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctga-------C--T---T------T----A--------GTAA--------C--ATTGACCA-------C------A-AC------C---T---GA-----T--TT--A--T-----------------C--T---GGG-A---A-C---C-A-A----TAC----C-AAG-CTT-----TC--AT-TTTT-TGT-T---A-----GAA-AG-----T-----CA-T--A---CAC----A----A-A---T---------T-TT--CA-T-----GAAAA-----T-ATCTTG-ATG-ACAA-T--TT---TAGTT-A---T------TGA----A--C---A------AA-A-A-A------A------C-----TTAT------T------T----A--------------------TT----T---------G----T---AG--------CT---G---G---TAACC-G-----TAA----C---C------C---G--A------TT-T-A----CCT---AA-A---AA-ATC-AATC-CCAAATT------GC---C-CATTC---C------TGT-----------tcattttaatgtcaagacatctatacgcaacatttca
gi|25 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag--T---T----T-T----A--------GTAA--------C--AGTGACCT-------T------G-AC------C---C---AC-----T--TT--A--G-----------------C--T---AA--A-----------A-A----TCT----C-GAG-CTC-----CC--TT-CACATTGT------------GA-AC-----C-----TC-T--T---CAT----A----A-A---A---------A-T----A-A-----TAAGA-----T-ATTTT--ACA-AAAA--------------------------TG------------G------AA-A-C-C------A-----G---------T------C------T----G--------------------TT----C-------A-G----TTTCAA--------G----A---A---TGACC-T-----TGtaaaagcacttaa
gi|47 : gtctttaagttactaatattatgcaaaacacacttgctat-T----A--------GCAA--------C--AGTGACCT-------T------G-AC------C---
gi|48 : --------GTAA--------C--AGTAATCT-------T------G-ACAGTGATC---C---AAAATTCC--TC--A--T-----------------A--C---AA--A---G-C---C-A-A----TGT----C-AAG-CCT-----TC--TT-TTCA-TGT-A---A-----GGttaaatccaaacgacaccgaaaacaatccatgcttccttttgagtaagaaagtccatt
gi|13 : ttttGAACT-------G------G-AC------C---C---AC-----T--TT--GG-T-----------------T--C---AA--A---A-G---C-A-A----TTC----C-AAT-TTC------C--TA-TCAA-T-T-A---A-----T-A-AC-----A-----TG-T--C---TAC----C----A-A---A---------T-GT--CA-T-----CAAAA-----C-ACTTAA-AAG-CAAA-A--TC---AAGTT-A---T------TAA----G--A---A------GA-A-A-C------AAAT--AT-----A--T------CAAGACTT----G--------------------T-------------A-G----T---GA--------T----G---G---TGACC-T-----TGA----C---A------TGGGG--A------TT-T-A----G-----AC-T---AA-AAT-AATC-CCA---T------G------T-TTC---C-A----T----------------------------T---T-A----A--C---------AAAT--GGACAC-T---TATATATCACCAACAAAACTTCATA
gi|21 : ------G-AT------C---C---GA-----A--TT--A--T-----------------C--T---CA--A---A-T---C-A-A----TCC----C-AGT-TTT-----T---TT-TCCA-TGT-T---T-----GGA-AC-----T-----AA-T--A---CA-----C----G-A---A---------T-AG--CA-G-----CTAAA-----CAATATAA-ATG-GAAACC--TT---AACTTAA---T------TAG----A--C---G------AA-A-T-C------A--T--GA-----T--TG-----C------T----GTATTTTTGTTTTTGTTTTTTTT----T-------A-G----T---AA--------C----A---A---TTACT-A-----TGA----C---ACTGATTC---T--A------TT-T-A----T-----CT-C---AA-ATC-AATT-TCAAGCC------TC---C-T-TTaaaataacttaaggcattaattattaagc
gi|33 : C------C---C---AA-----T--AT--G--C-----------------A--T---AA--A---A-------A-A----CCA------AAC-CTC-----CT--TT-TTTA-TGT-T---A-----GAA-AC-----C-----AA----A---AAT----A----A-A---A---------C-TT--CATA-----CAAA-----------------G-GAAA-C--TA---AAGTT-A---T------TGA----G--C-----------T-A-A-C-------------T-----T--T------C------T----ATT------------------TT----C-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGAC
gi|30 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatactt---C---AA-----T--TT--A--C-----------------C--T---CA--A---A-T---C-G-A----TCC----C-AAT-CTT-----AC--TT-TCCA-TCT-T---A-----GAA-AC-----A-----TA-T--A---CAC----C----A-A---ATAACATTAGT-TT--C--------TAAGA-----T-ATATCA-TTT-GAAA-C--TA---AAGTT-A---T------T----------------------------------A--T-------------------------------------------------------------------------T---AA--------C----A---G---TGACC-T-----TGA----C---T------C---C--A------TT-T-A----C-----CC-T---AA-ATT-AATA-CCAACCT------TA---C----TC---CAA----TGT-----------gac
gi|37 : -T---C-A-A----TCT----C-AAA-CTT-----CC--TT-TTCA-TGT-T---T-----GGA-AC-----CTGTAATG-T--A---CAC----A----A-A---A---------T-TT--C--A-----TTAGA-----T-ATTTTA-AAG-TTAA-C--TACTTAAGTT-A---A------TCA----AGTG---A------AA-A-C-C------C--T--GC--------C------C------T----G--------------------TT----g
gi|20 : ----C-ATT-CTT-----TT--TT-TC-A-T-------A-----GAA-AC-----T-----AA-T--G---CA------------A---A---------T-T-------------AAAA-----T-ATCTTA-AAG-GAAA-C--TA---AAGCT-A---T------TAA----ttacctcaaagccaatcccaagc
gi|16 : caaactttcttttT-CTC-----GT--TT-TCC--TTT-ACAGA-----GGA-AC-----T-----TA-T--T---CGC----A----A-A---A---------T-TT--CA-T-----CAAAT-----T-ATCTTA-AAG-GGAA-C-------AATTT-A---C------TGA----G--C---C------AA-A-C-T------G--T--AT-----T--T------T------T----A--------------------TT----gagaatactggtctttttaaagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttcct-CTT-----CC--TT-TTCA-GGT-C---A-----GGA-AC-----T-----TA-T----------------------------------------CA-T-----CAAAA-----T-ATTTAA-AAC-AAAA-C--TC---CAGTA-A---C------TGA----G--T---G------AA-A-A-C------T--T--ACAT---T--T------C------T----A--------------------TT----T---------T----T---GA--------C----A---ATCTTAGCT-T-----TG-----------------------A------TT-G-A----C-----TC-A---AA-AGC-AAGC-CCAAGCT------TA---A-T-TAT---C-AGGTTTGT-----------A--------A-----TC--T-ATCC-A--C---------AAAA--TTTCATAA---AAAAAATCTTGAAGAAatttttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|7 : aA-TAT-A---A-----GGA-AC-----C-----TA-T--A---AAG----A----A-A---A---------T-GT--CA-T-----CAAAA-----T-ATCTTA-A-G-GAAA-C--TT---AATTT-A---T------TGG----A--C---A------GATA-C-C------A--T--ACCATTTT--T------C------T----AAT------------------TT----T-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGACG-A-----TAA----C---C------C---A--A------TT-T-A----C------C-TAA-AA-AAC-AATC-CCAATCC------CC---C-T-TTT---C-A----TGT-----------A--------AGGAACC---T-A--TAA--T---------AAAA--TGTCAT-C---AAAATaatggaagtttgactg
gi|49 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaat-----GGA-GC-----T-----TG-T--A---TGC----C----A-A-------------T-TT--CA-T-----CAAAA-----T-ATCTT---TG-AAAA-C-------AAGTC-A---T------TGA----A--T---G------GA-A-A-C------
gi|51 : tgtgagtgtct-----TG-A--A---CAC----A----A-A---A---------T-TC--CA-T-----CAAAA-----T-ATCTCG-AAG-GAAA-C--TA---ATGTT-G---T------TGcattt
gi|17 : aatctgaagcttccttaaaa-T--A---CAC----A----A-A---A---------T-TT--CA-T-----CAAAA-----T-ATC-----------A----TA---AATTC-A----------TGA----G--C---A------GA-A-A-C------A--TTTGC-----TC-T------A------T----T--------------------TT----C-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGACC-A-----TGA----C---C------A---G--A------TT-T------------AC-C---AC-ATA-AA---ACAAGCT------TC---C-T-TTT---C-A----TATTAGG-------A--------A-----TATAT-A--A-A--C---------AAAA--TTTCAT-CCA-AATTCATC-CAAtat
gi|52 : ccaa---CAC----CTTA-A-A---A---------T-TT--CA-T-----CAAAAA----T-GTCTTG-AAG-GAAA-C--T----TAGTT-A---T------TGA----A--C---A------TA-A-A-C------gttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|9 : ---------T-TT--CT-T-----CAAAA-----T-AGCTAA-AAT-GAAA-----A---AAGTT-A---T------TGT----A--T---GG-----AA-A-A-C------A--T---------T--T------T------T----G--------------------T------------------------AA--------C----A---A---TTACC-T-----TAA----T---C------C---C--A------TT-T-AAG--T-----AA-T---GA-ACT-AATT-ACAAACTTCCTTATA---C-T-GTCTGAC-A----TTT-----------A------------------T-A--C-A--C---------ATAT--TTCAAT-C---AAACTATCTTAAAGc
gi|12 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttT--CA-T-----CAAAA-----T-AACTTA-CAG-GAAA-C-------AAGTT-A---T------TGA-------C---A------GA-A-A-CT-----A--TTTGC-----C--T------A------T----A--------------------TT----T-------A-GGTTGT---GA--------T----T---A---TGACT-T-----TCA----C----------C---C--A------CTAT-A----C-----CT-C---AA-AAC-CATAACCAAGCT------CC---C-T-TTT---C-A----TGT-----------tcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
gi|25 : ---AAGTT-A---C------T-A----A--T---ATTATGCAA-A-A-C------A--C--AC-----T--TG-----C------T----A--------------------TT----TTT-----A-G----T---AA--------C----A---G---TGACC-T-----TGA----C----------C---C--AC-----TT-T-A----------GC-T---AA-A---AATC-TCGAGCT------CC---C-T-TCA---C-A----Ttaggaatactattaaggaaacttaaattactgagtgatatccattttctattttatgtaaaagtgaccttgacccagttttcttaaaaaaatatttcaaaacttccttgccagtgaggaacttacataaaagttcataaatatcttag
gi|10 : gtcttt---AAATT-A---C------TGA----AAAC---A------GA-A-A-C------A--TG-GT-----T--T------C------C----G--------------------CT----C-------A-A----T---Atgtgaacctcttcataaaaataataagatattttacaaaaatggaaaccagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|41 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcaaatacacaaaatcattagaaaagataaAGTT-A---T------TGATTAAA--C---A------GA-A-A-CC-----A--T---T-----T--T------T------T----GAA------------------TT----A-------A-G----T---AA--------C----A---G---TGACC-T-----TGA-------------------C--T------TT-T-AC---C-----AC-A---AA-ATC-AATggactttatccatttcatcttaaaactaatcccaaactacatttccatgccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|27 : ------AA-A-C-C------A--T--AT-----T--T------CA-----T----T--------------------TT----T-------A-G----T---AATTTTTAAGC----A---G---TGACC-T-----TGA----C---A------T---T--A------GT-TAA----C-----AT-A---AA-AGA-AACC-CCAGGGT------TT---C-T-GTT---A-A----TGTCTC--------A--------AAC---T---T-ATCC-A--C---------AAAA--TTTCAG-C---AAAATATCTtaaattctagcttcattta
gi|42 : gttaaagcggC-----T--T------T------T-------------------------TT----T-------A-G----C---AA--------C----A---T---TGATT-T-----TGA----C--------------C---------TT-G-A----C-----CT-C---AA-ATC-AATT-TCAAGCT------ttggaaactaaagatattgagcgaaaatcgtttttctataata
gi|34 : tatcaacatattagttagttagcgggaactttttttt-G----T---AA--------C----A---G---TGACT-T-----T----------A------C-------------TT-C-A----A-----AC-C--------C-AATC-CCAAACT------G----C-T-TTT---C-C----TGT-----------ATGGAAACTA-----T---TGA--C-ATTC---------ACAATTTTTCAT-C---AGAATGTCTTAAAGGA-AACTTATGT-T-A-TTGAGt
gi|48 : tattaccatccagagcaaaattgtggt-G----T---AA--------C----A---G---TAATC-T-----TGA----C---AGTGAT-C---C--AAAATTCCT-C-A----T-----AC-A---AA-GCC-AATG-TCAAGCC------TT---C-T-TTT---C-A----TGT-----------A--------A-----cat
gi|30 : tttt--A------TT-T-A----C-----CT-C---AA-ATC-GATC-CCAATCT------TA---C-T-TTC---C-A----TCTTAGA-------A--------A-----CATAT-A--C-A--C---------CAAA--TAACAT-T---AGT-T-TCT--AAG--------ATATATCATTTGAgg
gi|37 : caTC-AATC-TCAAACT------TC---C-T-TTT---C-A----TGTTTGGAACCTGTA--------A-----TG--T-A--C-A--C---------AAAA--TTTCAT-T---AG-ATATTTTAAAGaactaaagttattattaacagtgaccttgactccatttaccctaaattaataccaaccttactccaatgtg
gi|51 : -AATC-TGAAGCT----------------TC---C-T----TAA-----------A--------A-----T---G-AA-C-A--C---------AAAA--TTCCAT-C---AAAATATCTCGAAGGAttaactacttaagttaatcaagtgaaaaccctgccctgttttacctcaaagccaatcccaagc
17 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|23 ): ACAAGAGGTCCAACAGAACATCATTTTTCAATTTTACAAGTTCAAGAAGTAGCTTGACAACTCGGAAGTTTGGTAAAAACTGAAAGTCCGTGACGTTTTCAATGCAGATATGAATTTTCTTTCTGACCTTGAACTGATTTCATCACAAACCAATCCCAACAAACACACATATTTTCATCAAAGTATCTTAAAG
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|26 ): AGGTCAGATAGACCCTGTATGACTATACTGTTCATTCTGGTCATGTTAGAGTTCAAGAATTATATTAAGATATTGAGATAATATGATAATCAACGTTCTTGTTTGGATAAAAACTACAGTAACGGTGTTCACAATTCCTGACTTTAAATTGATCTACCTCAAAATCAATTCTAA
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|31 ): GTTTGAAACTTATCCGAAAAAATTCATCAAAATATCTTAATTGAAACCAGTTTCTATTAGTATTTAGTAATGAAGACTGACCATAATCCAATTTGGCTCAAGAGCAATTCCAAGCCTATTTCTAGAGTCAAGAGCCTGCATTAAAAAATTCATCAAGAT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|50 ): CAAAGCTTCCTATTCTTGCCAGGAACTAATTCACAATATTTCATCAAAATATATTGAAGAAAATTTAAGTTAT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222222222222 222222222 11111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222 111111111111 1111111111 44444444444 111111 2 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 222
lowQualScore : 6 9999 2 88888888888888888 888888 6666 1 555555555 2 0 5555 33333333333333333 444 2 666666 9999999999999999999999999999999999999999 3 1 666666666666 3 3 3 2 5 1 1 4 9999 6666666666 2 4 66 0 77777777777 33 3 1 77 3 999999 5 0 1 666 5 5 00 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 33333 1 444444 66666666666666 33 11 1 111111111 1 33 333333 2 222 2222 33 1 22 3 222 3333333 7777777777 1 99999999999 11 11 1 11 66666666666666 0 11 1 3333333 111 33333 1 1 2 1 11 1 3 333333 444444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222 77777777777 1 33333 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 2 44 44 222 666 1 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 0000 2 3 66 4 77 0 7 999 3
lowQualScore : . .... . ................. ...... .... . ......... . . .... ................. ... . ...... ........................................ . . ............ . . . . . . . . .... .......... . . .. . ........... .. . . .. . ...... . . . ... . . .. . ............................................................................................................................................. . ..... . ...... .............. .. .. . ......... . .. ...... . ... .... .. . .. . ... ....... .......... . ........... .. .. . .. .............. . .. . ....... ... ..... . . . . .. . . ...... ...... ................................................................................................................. ... ........... . ..... ............................................................. .. . .. .. ... ... . ............................................................ . .... . . .. . .. . . ... .
lowQualScore : 6 0000 0 22222222222222222 111111 1111 1 777777777 5 4 0000 22222222222222222 444 5 111111 3333333333333333333333333333333333333333 1 9 777777777777 6 6 0 5 4 8 9 4 4444 9999999999 2 4 11 1 00000000000 33 9 4 33 0 444444 7 0 0 888 7 7 11 7 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 88888 4 111111 33333333333333 22 88 3 666666666 3 22 222222 7 333 8888 99 2 99 1 222 7777777 5555555555 1 00000000000 66 66 1 66 55555555555555 6 55 1 5555555 999 88888 1 1 2 1 55 1 9 000000 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 333 00000000000 3 33333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 9 33 77 444 000 6 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 9999 7 7 11 4 99 8 3 555 0
consensus : CCAAAATNTCATCAAAA--T-ATCTTAAA-GA-AA--CT-A-TAG-TTATT----GA----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------ACCC--------GATTTACCTCAAA--TA-AATCTCNA-GC-TTCCTTTTCATGTCAGGA-ACCT----AT--------AAACAAAATTTCATC-AAAAT--ATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGNGCGGAAANCG----TTTT-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCNACTNTACCTCAAAACCA-A-TCTNAAGCTTCCTTTTCATGTNAGGAA-NCTAT---CC--A--------CGAAA------CATC-------------A-G-------------TTA-------TTG---A--GC---A--A-----A--------T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-C------C-----CG-A-----T--T--T-A--C---NT-A-A--A-AC---C-A---A----TCCCAAN-C-TTCCTT--TCC-A-TG-------TN---------A-GGAAC-----C-----T--AT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CTNAAGT------T------ATT-----G---A----A---C--G--AA------A-A--C------A---------------------TN---TTT------C--T---A---------TT----T-------A-GT---AAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCC--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--AC--------AA-AATTTCAT--C-AAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTCATATATTATTNGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATNTCATCAAAA--T-ATCTTAAA-GA-AA--CT-A-TAG-TTATT----GA----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------ACCC--------GATTTACCTCAAA--TA-AATANCCA-GC-TCCCTTTCCATGTTAGGA-ACCT----AT--------AAACAAAATTTCATC-AAAAT--ATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGAGCGGAAACCG----NTTT-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGA-CCCNACTNTACCTCAAAACCA-A-TCTCAAGCTTCCTTTTCATGTCAGGAA-NNTAT---CC--A--------CGAAA------CNTC-------------A-G-------------TTA-------TTG---A--GC---A--A-----A--------T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-C------C-----CG-A-----T--T--T-A--C---AT-A-A--A-AC---C-A---A----TCCCAAN-C-TTCCTT--TCC-A-TG-------TN---------A-GGAAC-----C-----T--AT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CTNAAGT------T------ATT-----G---A----A---C--G--AA------A-A--C------A---------------------TG---TTT------C--T---A---------TT----C-------A-GT---AAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACNC--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--AC--------AA-AATTTCAT--C-AAAA-TATCTCAAA--G-GA--ACTCATATATCATTTGAG
gi|1 : T-TTATATCTTT----AGTAA--------T--------AGTG---A-C----T-TTAAA---------------TTT----------C--------AATTC----CAAG--T----TATC----------TTTACATGTAAGGA-ACCG----AT--------ACATCAAATCCCATC-AAAAA--A-------------AAAGTAAAATTATTGTGCGGAAAAC-----ATTT-TCTATTTTT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgCA-A-TTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-CCGAT---AC--A--------TCAAATCC---CATC-------------A-AAAAAAAAGTAAAATTA-------TTG---T--GCGGAA--A-----ACAT-----T-T--T-C--TATTTT---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CCT------------------------------------C---AT-A-------T---C-A---A----TTTTAAA-C-TTCCAT--TCC----G-------TT---------A-CAAAA-----C-----T--AT--A-CA--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AA---AAA-----T-ATCTCAAA-G-A-AA--A---TGAGT------A------ATT-----G---A----G---C-----AA------G-A--CA-----A---------------------TT---TTT------C--T---ATT-------TT----T-------A-GT---AAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-T-------T-----T--------AACT--C----A--ATA-CT--AA---T-CCAAACATTC---G-TT--T-------C-A----T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GC--------AA-AATATTAT----AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttAA-AATAT---CTCAA--------AGAAA-------ATG-------------A-G-------------TAA-------TTG---A--GC---A--AGACA-A--------T-T--T-T--TC--TA---TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-T------C-----CC-A-----T--T--TAA--C---TC-A-A--T-AC---T-A---A----TCCAAAC-A-TTCGTT--T-C-A-TG-------CG---------A-GGAAT-----C-----T--TT--A-CG--CA--------------AAATAT--TA-T--------A---AAA-----T-ATCTTAAA-ATG-AA--A-CTAAATT------T------ATT---------A----A---C--A--AA------T-A--C------AAC-------------------CG---TTTTTTTTCC--T---A---------TT----CTATTTTTA-GT---AAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-T-------T-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC--AA---TCCCAAACTTCC---T-TT--T-------C-A----TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGC--------AA-CATTTCATAAA-AAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataCAACATTTCATAAAAAAAT-ATTTTAAA-GAGAA--CTAA-AAG-TTACT----GA----GCTGAAACC-C------CTT-TTCTGTTTTC----Aaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttg-----A--------T-T--T-CAAT---TT---T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-T------C-----CG-A-----T--T--T-ATTC----C-A-A--C-AC---C-A---A----TCACAAT-C-TTC---------A-TA-------TC---------A-GTAACATATAC-----T--AT--A-TA--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CA---AAA-----TCATTAGAAA-A-G-A-------TAA--------T------ATT-----G---A----G---C--G--GA------A-A--CC-----A---------------------TG---TTT------C--T---G---------TTTT--C-------A-GT---AAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-T-------T-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACT-AA---TCCCAAACTACA---T-TT--C-------C-A----T--GCCAGGA----A-------TCTATA--T--ACATTGAAAAAA-AAATCCAT--CAAAAA-TATccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAA--TCATT----A-GA-AA--AG-A-TAA-T-ATT----GA----GCGGAAAC--CAT----GTT-T-CTGTTTT------------------C--------AGTA---A-T----T-TGGAC---------------TTT-------ATCC--------ATTTCATCTTAAAACTA-A-TCCCAA-AC-TACATTTCCATGCCAGGA-ATCT----ATATACATTGAAAAAAAAATCCATCAAAAAT--ATataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcAA-CTTA-----C--A--------GGAAA------CA---------------A-G-------------TTA-------TTG---ACAGA---A--ACT---A--------T-T--TGC--C---TA---T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-C------C-----CA-C-----T--A--T-A--C---CTCA-A--A-AC---C-A---T----AACCAAG-C-TCCCTT--TTC-A-TG-------TT---------A-GGAA----------------T--A-C---------------------------------------------------T-ATT---AA-G-G-AA--A-CTTAAAT------T------ACT-----G---A----G---T--G--AT------ATC--C------A---------------------T----TTT------C--T---A---------TT----TT------ATGT---AAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-G-------T-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA--AATATTTCAAAACTTCC---T-TG--C-------C-A-------GT----G----AGGAAC--T---TA--C--AT--------AA-AAGTTCAT-----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAACCATA-AC-CAAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATACTAT---TA--A--------GGAAA------CTTA-------------A-A-------------TTA-------CTG---A--GT---G--ATATCCA--------T-T--T-T--C---TATTTT----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-C------C-----CA-G-----T--T--T-T--C---TT-A-A--A-A------A---AATATTTCAAAA-C-TTCCTT--GCC-A--G-------TG---------A-GGAAC-----T---------T--A-CA--TA--------------AAAGTT--CA-T------------AAA-----T-ATCTTAg
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-C------C-----CA-C-----T--T--T-G--G---TTCA-A--A-AG---C-A---A----TTCCAAT---TTCCTA--TCA-A-T---------T---------A-ATAAC-----A-----T--GT--C-TA--CC--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----C-A-CTTAAA-A-GCAA--A-ATCAAGT------T------ATTAA---G---A----A------G--AA------ACA--A------A---------------------TA---TAT------C--A---AGAC------TTG---T-------A-GT---GAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-T-------T-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT--AA---TCCCATGTTTCCA--T-TTAACAAATGGAC-ACT--T--AT----AT---A-------T---CA--CCAAC--------AA-AACTTCAT--A-AAAA-TAACTTAAG--G-g
gi|14 : -C--T---T----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-C------C-----TG-A-----T--T--T-A--T---CT-G-GG-A-AC---C-A---A----TACCAAG-C-TTTCAT--TTT-T-TG-------TT---------A-GAAAG-----T-----C--AT--A-CA--CA--------------AATTTT--CA-T-------GA---AAA-----T-ATCTTGAT-G-A-CA--A-TTTTAGT------T------ATT-----G---A----A---C--A--AA------A-A--A------A---------------------CT---TAT------T--T---A---------TT----T---------GT---AGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-T-------T-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC--AA---TCCCAAATTGCC---CATT--C-------C------T--GT----cattaattattaagc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag-----CA-A-----T--C--T-A--C---CT-C-A--ACAC---C-A---A----TCCCAAG-C-TTCCTT--CTC-G-TT-------TTCCTTTACAGA-GGAAC-----T-----T--AT--T-CG--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAT-----T-ATCTTAAA-G-G-GA--A-C--AATT------T------ACT-----G---A----G---C--C--AA------A-C--T------G---------------------TA---TTT------T--T---A---------TT----taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAAT--T-ATCTTAAAGGG-AA--CA-A-T---TTACT----GA----GC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATTTTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC----C-TTGAT---------------TCAA------ACCT--------GA-TCAGGTCATA--TG-AATAatttttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCAAAATTTCATCAAAA--T-ATCATAAA-----------------TTCAT----GA----GCAGAAAC---AT----TTG-CTCTATTTTC----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----A------------------TG------ACCA--------GATTTACC--ACA--TA-AA--ACAA-GC-TTCCTTTTCATATTAGGA-ATAT----AT--------AAACAAAATTTCATC-CAAATTCATCC----------AAGTTACCGTCA--GACCTGAAAAAGATTTTTTT-TCTATTTTattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : ccaatacaTG---A--GC---A--G-----AAACA----T-T--TGC--TC--TA---TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-C------C-----AG-A-----T--T--T-A--CCACAT-A-A--A-AC------------------AAG-C-TTCCTT--TTC-A-TA-------TT---------A-GGAAT-----A-----T--AT--A-AA--CA--------------AAATTT--CA-T-------CC---AAA-----T--TC--------------A-TCCAAGT------T------ACC-----GTCAG----A---CCTG--AA------A-A---------AGATTT----------------TT---TTT------C--T---ATT-------TT----C-------A-GT---TAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACA-AA---TTTCAAACTcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaatttcatcaaaatatcataaattca--------T-T--T-T--C---TA---T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-C------CAATCATGCA-----T--C--C-T--C---AT-C-A--A-AC---C-A---A----TCG-GAT-T-TTTTTT--TCC-A-TG-------TA---------A-GTAAA-----C-----T--AT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-A-------TA---AAAAGCGTT-AACGTAAA-G-G-AA--A-CTGAAGT------T------ACT-----G---A----G---T--A--AA------A-A--C----------------------------TG---TTT---------T---AATTTTCAGTTT----T-------A-GT---AAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-T-------T-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC--AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc--------T-T--T-T--T---T----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT------------------A-A-----T--T--C-A--A---ATCA-A--G-AG---A-G---A----TTCCAAA-C-TTTTGT--TTG-A-TT-------TG---------A-GGAAT-----C-----T--AT--C-CC--CA--------------AACTTT--CA-T-------CA---AAA-----T-AACTTGCA-C-A-AA--A-C--------------------TT-----G---A----A---T--G--GA------A-A--CCA----A---------------------TG---ATC------CATT---A---------TTATTAC-------ATGT---AAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-T-------T-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC--AA---TCCAAAG-TTCT---T-TT--A-------C-A----T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAA--T-ATCGCAAA-GA-AA--CT-A-TAG-TTATC----AC----GCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTTTTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------ACCC--------GGTTTACCTCAAA--TA-AATATTCA-GC-GCCCTTTCTATGTTAAAA-ATCT----AT--------AAACAAAATGTCATC-AAAAT--ATC----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGAAACCA----ATTT-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACACCA-A-TCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-ATTAT---CC--A--------CGAAA------CATC-------------G-G-------------TTA-------TTG---A--GC---A--A-----A--------T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-C------C-----CG-A-----T--T--T-A--T---AT-A-A--A-GT---T-A---A----TCACAAT-C-TCTCTT--TCC-A-TG-------TA---------A-GGAAC-----C-----T--GT--A-CA--CC--------------AAATTT--CA-A-------CA---AAA-----T-ATCTCAAC-G-G-AA--A-CTAAAGT------T------ACT-----G---A----A---C--A--AA------A-A--C------A---------------------TG---CTT------C--T---G---------TT----C-------A-GT---AAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-T-------T-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC--AA---TCCCAAGCTGAC---T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--AC--------AA-AATGCCAT--C-AATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATAT-ATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAA-C-TTTCTT--TTC-A-TTCTTTTTTTC---------ATAGAAA-----C-----T--A---A-TG--CA--------------AA---------T-------TA---AAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CTAAAGC------T------ATT-----A---A----G---A--G--AA------T-A--C------tgag
gi|21 : GA-T------C-----CG-A-----A--T--T-A--T---CT-C-A--A-AT---C-A---A----TCCCAGT-T-TTT-TT--TCC-A-TG-------TT---------T-GGAAC-----T-----A--AT--A-CA--C---------------GAATAG--CA-G-------CT---AAA-----C-AATATAAATG-G-AA--ACCTTAACT------TA-----ATT-----A---G----A---C--G--AA------A-T--C------ATGATTGCTGTATTTTTGTTTTTG---TTT------T--T---T---------TT----T-------A-GT---AAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-T-------T-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC--AA---TTTCAAGCCTCC---T-TT--tggtctttttaaagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : -C-TTCCTT--TTC-A-GG-------TC---------A-GGAAC-----T-----T--AT--------------------------------CA-T-------CA---AAA-----T-ATTTAAAA-C-A-AA--A-CTCCAGT------A------ACT-----G---A----G---T--G--AA------A-A--CTT----A---------------------CA---TTT------C--T---A---------TT----T---------TT---GAC----A--------ATC-T-----TAG-------C-------T----TTG--A-T-------T-----G--------ACTC--A----A--A-A-GC--AA---GCCCAAGCTTAA---T-TA--T-------C-AGGTTT--GT----A----A-------TC--TATCC--AC--------AA-AATTTCATA-A-AAAA-AATCTTGAA--G-AA--A
gi|23 : aTGACGT------T-------TT-----C---A----A---T--G--CA------G-A--T------A---------------------TGAATTTT------C--T-------------TT----C----------------------------TGACC-T-----TGA-------A-------C----TG---A-T-------T-----TC-------ATCA--C----A--A-A-CC--AA---TCCCAA-----------------------C-A-------------A----A-----------CA--C--AC--------AT-ATTTTCAT--C-AAAG-TATCTTAAA--G-atggaagtttgactg
gi|23 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgTGAC-----CTTGA-A------C-----TG-A-----T--T--T----C---ATCACA--A-AC---C-A---A----TCCCAA--------------C-A-------------------------AAC------------------A-CA--CA--------------TATTTT--CA-T-------CA---AAG-----T-ATCTTAAA-G-
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttcTCTTTAA-GT-TA--CT-AATA--TTAT-----------GCA-AAACA-CAC----TTG---CTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----------------------TTG------ACCC--------ACTTTAGCT-AA----A-AATCTCGA-GC-TCCCTT--CACATTGTGA-ACCTCTTCAT--------AAAAATAAT-------AAGAT--ATTT----T-------ACAAAAAT--------GGAAACCA----GTCT-
gi|25 : gTTAAGT------T------ACT-----A---ATATTA---T--GC-AA------A-A--C------A---------------------CA---CTTG-----C--T---A---------TT----TTT-----A-GT---AAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----ACT-------T-----T--------A-GC--T----A--A-A-----AA---TCTCGAGCTCCC---T-TC--A-------C-AT---T--GT----G----A------------A--C--CT-------------CTTCAT--A-AAAA-TAgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|25 : gtct--T---TT---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-C------C-----CA-C-----T--T--T-A--G---CT-A-A--A--------A---A----TCTCGAG-C-TCCCTT--CAC-ATTG-------T-------------GAAC-----C-----T--CT--T-CA--TA--------------AAAAT----A-A-------TA---AGA-----T-ATTTTACA-A-A-AA--------------------------T-----G---------------G--AA------A-C--C------A----------------------G-----T------C--T---G---------TT----C-------A-GTTTCAAG----A---A--TGACC-T-----TGataagatattttacaaaaatggaaaccagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|26 : gtctttaagttactaatattatgcaaaacacacttgctat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATTC-CTGAC---------------TTTA------AATT--------GATCTACCTCAAA--
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------AA----GCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATTTTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------ATTA------G-------------TTAACATAAAA--GA-AAC-CCCA-GGGTTTCTGTTAATGTCTCAA-ACTT----AT--------CCACAAAATTTCAGC-AAAAT--ATCT----TTG--GAAACTAAAGATATTGAGCGAAAATCG----TTTT-TCTATatcaattctaa
gi|29 : CTTTACCTCAAAATCA-AGTCT-AAGCTTCCTCTTCTTGTCAGAAA-TATAT---AC--A--------C-AAATTTTGTCTTC-------------A-A-------------TTACCCGCAGTTG-----------A--A-----ACCTTTTTTT-T--T-CGAT---TT---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CGTGG-C------C--------A-----TTCT--T-A--T---AT-G-A--A-Aaata
gi|3 : taaagacgaccgtaaaccgacttgAC-----CTTGA-C------C-----AG-A-----T--T--T-A--C---CT-C-A--ACAC---C-A---A----GCTGAAAGC-TTCTCT--TCT-T-TG-------TT---------T-----C-----C-----A--AA--A-TA---A--------------AAAGTA--CA-C-------CA---AAA-----T-ATATTGAA-G-G-AT--A-CTAATGT------T------ATA-----A---A----G---G--G--AA------A-A--A------AACTATT---------------TT---TTT------C--T---ATT-------TT----T-------A-GT---AAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------CTG-----T----G----A-T-------TAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC--AA---TCCAAAGCTTCC---T-TT--T-------T-A----T--GT----A----A-------ataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAATCA-A-TCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA----AC---CT--A--------TTATA------TTAT-------------A-G-------------TC---------TA---G--GC---C--A-----T--------T-TA-T-C--T---TA---TTTTTA--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-T------C-----CA-A-----T--T--T-A--C---AT-G-T--A------C-ATGTA----TGTCA------TCACTAATCT-A-T-------------------A-GATAG-----C-----TTCCT--A-CG--CA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-A----AAA-G-G-AT--A--TGAAAT------TGCCATGATT-----G---A----A---T--G--GAC-----A-A--C------A---------------------TT---TTT------C--T---AGT-------TT----T-------A-GT---AAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------T-------T-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC--AA---TCCCATGCTTTC---C-TT--T-------C-A----G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc-----CA-A-----T--T--T-A--C---CT-C-A--A-AT---C-G---A----TCCCAAT-C-TTACTT--TCC-A-TC-------TT---------A-GAAAC-----A-----T--AT--A-CA--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTA---AGA-----T-ATATCATT-T-G-AA--A-CTAAAGT------T------ATT--------------------------------------------A---------------------T-----------------------------------------------T---AAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-T-------T-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT--AA---TACCAACCTTAC------T--C-------CAA----T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : G-------TT---------T-GAAAC-----T-----T--AT--C-CG--AA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTAAT-T-G-AA--A-CC--AGT------T-------TC------------------------------------------------------------------TA---TTA------G--T---A---------TT----T-------A-GT---AATGA--A---GACTGACC-A-----TAA-------T-------C----CA---A-T-------T-----TG-------GCTC--A----A--G-A-GC--AA---TTCCAAGCCT-A---T-TT--C-------T-A----GA-GTC---A----AGAGC---C---TG--C--ATTA------AA-AAATTCAT--C-AAGA-Tg
gi|33 : -C------C-----CA-A-----T--A--T-G--C---AT-A-A--A-A------A---A------CCAAA-C-CTCCTT--TTTTA-TG-------TT---------A-GAAAC-----C-----A--A---A-AA--TA--------------AAACTT--CA-T----------------------AC---AAA-G-G-AA--A-CTAAAGT------T------ATT-----G---A----G---C--T----------A-A--C---------------------------------TTT------C--T---ATT-------TT----C-------A-GT---AAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A--------A-T--T-G--T---GG---T-------------GTAA-CAGTGAC---------------------------------T--T--T-A--C---TT-C-A--A-AC---CCA---A----TCCCAAA-C-TGCTTT--TCC---TG-------TA---------T-GGAAA-----C-----T--ATTGA-CATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CA---GAA-----T-GTCTTAAA-G-G-AA--A-CTTATGT------T------ATT-----G---A----G---C--gac
gi|36 : tattaccatcca-------------TTA-------TTG---A--AT---AG-A-----A--------T-T--T-T--T---AG---T----AATT-----GTAA-CCTTGAC-----TGTGA-C------C-----CA-A-----TA-T--G-A--T---TC-A-A--A-AC---C-A---G----TCTGAAG-A-TCCCTT--T--------------TC---------A-GGAGC-----C-----T--AT--C-CA--TA--------------AATTTT--CA-A-------CA---AAC-----C-ATTTTAAA-A-G-AA--A-CTTAAGT------T------ATat
gi|37 : ---C-A---A----TCTCAAA-C-TTCCTT--TTC-A-TG-------TT---------T-GGAAC-----CTGTAAT--GT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-T-------T----AGA-----T-ATTTTAAA-GTT-AACTA-CTTAAGT------T------A-----------------------------------------------------------------------------------------A---------TC----A-------A-GT---GAA----A--------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTT-------T-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC--AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-A-TG-------AT---------G-AGAAC-----A-----T--AT--C-TA--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CA---AAA-------GTGTTAAG-A-G-TG--A----AAAT------T------ATT------------------------------------------------------------------T----TTT------C--T---ATT-------TT----T-------G-GT---AAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA----GTGTTAA---------------------------GA----GTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATTTTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T----C-TTGAC---------------TTTG------ATCtttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----GA----ACAGAAAGT--AT----TCT-TT-----TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAACCCCAAACAGAGATTAACCTCAAA--TC-AATCTCAA-GT-TTCATTTGTATGTTACAA-ACCT----AT--------ACACCATATTTCATC-AAAAT--ATCT----CTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGAAACTA----TTCTGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-TCA-A-TCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-CCTATACACC--ATATTTCATCAAAA------TATCTCTAAGGAAACCAATG-------------TAA-------TTG---T--ACGG-A--A-----A--------C-TATT-C--TGTCTA---TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-C------C-----CC-A-----C--T--T-AACC---TC-A-A--A-AC---C-A---A----TCCAAAA-C-TTCCTT--TCC-A-TG-------TC---------A-GGTAC-----A-----T--AT--A-TA--CA--------------GAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCT---------AA--A-TTTAAGT------T------ATT-----G---AG---A---A--G--AA------A-A--C------T---------------------TT---TTT------C--T---AATT------TT----T-------A-GC---AAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC--AA---TTTCAAGCTTCCA--T-TT--T-------T-T----T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GC--------AA-AATTTATT--C-AAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAG-TTATT----GATTAAACAGAAAC--CAT----TTT-TTGAATTA------AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTT------ACCA--------CA---AAATCAAT--TA-AAT-TCTA-GC-TTCATTT
gi|42 : -TAG-TTAGT----TA----GCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTTTTT----AGCAA--------C--------A---------------TTGAT---------------TTTG------ACC-----------TTGACCTCAAA--TC-AATTTCAA-GC-Ta
gi|43 : tatcaacatatAGCT-C------TTG-TTCTGTTTTA----AATAA--------C--------AACA---A-T----C-TTGAC---------------------------CC--------AATTTACCTCAAA--t
gi|43 : agttaacacagtactctgac--T-T--T---TA--------A--------ATAA-CAACAAT-----CTTGA-C------C-----CA-A-----T--T--T-A--C---CTCA-A--A-AC---C-A---A----TTTGAAT-C-TTCCaccaatttgaatcttcc
gi|43 : agttaacacagtactctgacagctcttgttctgCTTGA-CCCAA-TTTACCTCAAAACCA-A-TTTGAATCTTCC
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcttgttctgttttaaataacaacaatA-GA-AAACCT-A--AG-TTACTATCTGA----GCGGAAACT-G------TTT-TTCCACTTTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C----A-TTGAC---------------TTT
gi|45 : A-G-A-AA--A-CCTAAGT------T------ACTATCT-G---A----G---C--G--GA------A-A--C----------------------------TG---TTTTT----C--C---ACT-------TT----T-------A-GT---AAA----A---A--AGACA-T-----TGA-------C-------T----T----T-T-------T-----T--------CTAC--A----A--A-A-CC--AA---CCtttctacaaaaccaacc
gi|47 : -------A-GC---AAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----TTAA-A-T-------C-----CAAACG---ACAC--CG---A--A-A-AC--AA---T-CCATGCTTCC---T-TT--
gi|48 : t--------GTAA-CAGTAAT-----CTTGA-CAGTGATC-----CA-AAATTCC--T--C-A--T---AC-A-A--A-GC---C-A---A----TGTCAAG-C-CTTCTT--TTC-A-TG-------TA---------A-GGtgagtaagaaagtccatt
gi|49 : tttt-TG-------TC---------T-GGAGC-----T-----T--GT--A-TG--CC--------------AA-TTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTT--T-G-A-AA--A-C--AAGT------C------ATT-----G---A----A---T--G--GA------A-A--C------
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA---A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-A------A-----CG-AATC--T--T--A-A--C---A--A-A--C-ACGTTC-A---A----TTTCAAT-CCTTCCAT--TTC-T-TG-------TC---------A-GGATC-----C-----T--AC--A-AT--TA--------------AAAC----CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTTAA------A--A-CTTTAGT------T------ATT-----A---A----A---T--G--GA------A-AACC------T---------------------TT---TTT------C--T---A---------TT----TTT-----A-GT---AAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A-T-------G--------------ACCC--C------------C--AA---TCCCATGCTTCA---T-TT--T-------A-A----T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GC--------AA-CATTTCAcattt
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaCATCAAAA--T-ATCTTTAA----AA--CT-T-TAG-TTATT----AA----ATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C----CTTTGTC---------------TATG------ACCC--------------CC---AA--T------CCCATGC-TTCATTTTAATGTCAAGACATCT----AT--------ACGCAACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattaaaacAAG-C-TTCCTA--TTC-T-TG-------CC---------A-GGAAC-----T-----A--AT--T-CA--CA--------------ATATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATATTGAA-G-A-AA--A-TTTAAGT------T------AT
gi|51 : ca--AA---TCTGAAGCTTCC---T-TA--A-------A-A----T--G----------A------------A--C--AC--------AA-AATTCCAT--C-AAAA-TATCTCGAA--G-GA--A
gi|51 : --A-CA--CA--------------AAATTC--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTCGAA-G-G-AA--A-CTAATGT------T------GTT-----G---actaatgttgttgtat
gi|52 : aatctgaagcttccttaaaatgaA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAAA----T-GTCTTGAA-G-G-AA--A-CTT-AGT------T------ATT-----G---A----A---C--A--TA------A-A--C------tat
gi|6 : caccttGAAA------CA---------------A-G-------------TTA-------CCG---A--GC---ACAA-----ACCATG---T-T--T-C--TATTTC---T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-C------C-----TG-A-----T--T--T-A--C---AT-C-A--A-AT---C-A---A----GCCTTCG-C-TTCCTT--TCA-A-TG-------TT---------A-CATACATAA-T-----T--AT--AACA--CC--------------AAATTT--TA-T-------CA---AGA-----T-ATCTCAAA-G-G-AA--A-CTAAAGTTGCCAGT------ATT-----G---A----A---CA-A--AA------A-A--C------A---------------------TT---TTT------C--T---AT--------TT----T-------A-GT---AAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-T-------T-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC--AA---CACCATTATTCC---T-TC--C-------C-A----T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--AC--------CA-AATATCAT--C-AAAA-TATCc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgTTC--CA-T-------CATAGAAA-----T-ATTTTCAA-G-C-AA--G-TTTA--T------T------GTTTGTGGG---A----AAAGC--A--AA------A-A--C----------------------------CA---CTT------C--T---A-------------------------AC---AAC----A---C--TGACG-G-----T---------C-------C----C----A-TGCTGCAAT-----T--------AAGT--T----A--A-A-ACCCAA---TCCCAAGCTTATAAAT-AT--A-------T-A----A--GG----A----A-------CCTATA--A--AG--------AA-AATGTCAT--C-AAAA-TATCTTAAG--G-AA--ACTTA-AT-TTATTGGA
gi|7 : -C--T---TC---T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-T------G-----CA-A-----T--T--A-A--G---TT-A-A--A-AC---CCA---A----TCCCAAG-C-TTA-TA--AAT-A-TA-------TA---------A-GGAAC-----C-----T--AT--A-AA--GA--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTT-AA-G-G-AA--A-CTTAATT------T------ATT-----G---G----A---C--A--GATACCATA-C--C------A---------------------TT---TTT------C--T---AAT-------TT----T-------A-GT---AAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC--AA---TCCCAATCCCCC---T-TT--T-------C-A----T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-AT--------AA-AATGTCAT--C-AAAA-Tcagataccataccatttttctaattttagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAA--T-ATCTTAAG-GA-AA--CT---TAATTTATT----GG----ACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAATTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C--------GA------------------TA------ACCC--------AATTTACCTAAAA--AACAATCCCAA-TC-CCCCTTTTCATGTAAGGA-ACCT----AT---------AATAAAATGTCATC-AAAAT--
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T--------T-T--T-T--C---TA---T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAAC------T-----TG-A-----C--TAAT-G--C---CT-G-A--A------C-A---A----TCCAGTG-C-TTCCGT--CTT-A-CA-------TT---------A-GGAAT-----C-----C--AT--C-TA--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CT---GAA-----A-ATCT---------AA--A-CTGAAGT------T------ATT-----G---A----A---T--G--GA------A-A--CAATTCTA---------------------TG---TCC------T--TGACG---------TT----C-------C-AT---ATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----C----A-A-------T-----T--------AAGCT-C----A--A-A-AT--AT---TATTAAGCTTCC---T-TT--T-------C-A----T--G------------------T---TA--C---C--------AATCATTCC-C--C-AAAGTTAT-TGAAA--A-GA--AC-CAT
gi|9 : acggaTTTCTTC-AAAAT--AGCTAAAAT----GAAA--AAAGTTATTGTATGGAAAACA----TTTT-TGTAttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacattt-------------A-G-------------TTA-------TTGTATG--GA---A--A-----A--------CAT--T-T--T---T------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-T------C-----CC-A-----T--T--T-A--A---GT-A-ATGA-AC---T-A---A----TTACAAA-C-TTCCTTA-TAC---TG-------TC---------T-GACAT-----T-----T--AT--A-CA--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CA---AAC-----T-ATCTTAAA-G-T-CA--A-CTAAAAT------T------ATT-----G---A----G---C--GGTAAC-----A-A--C------AC--------------------TT---TTT------C--T---AAC-------TA----C-------A-GT---AACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC--AA---GCTCGA-CTTCA---T-TT--C-------C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333333 111111111111 2222 11111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333 11111 11111111 4444444444 111111 1 111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 2222222222222222222222222 11111111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 22222
lowQualScore : 99 1 6 5 1 22222222222222 111111111111 2222 3 2 5555 33333333333333333 444 2 5555 2 55555555555555555555555555555555555555555555555 55 11111 9999999 1 3 22 3 5 4 9999 66666666 4 4 55 0 4444444444 99 66 1 333333 5 5 1 555 7 77 55 1 1 6 77 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 33333 0 22 33333333 33333 1 11 1 11 3333 999 55 66666666 2 222 2222 33 1 22 3 222 3333333 7777777777 1 88888888888 11 11 1 11 11 66666666666666 11 1 3333333 111 55555 1 1 444444 1 11 1 44 333333 555555 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 1 333333 77777777777 4444444 3333333333333333333333333 1 5555555 33333 33 55555555555555555 22 4 33 55 222 666 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2222 3 66 5 66 3 33333 1
lowQualScore : .. . . . . .............. ............ .... . . .... ................. ... . .... . ............................................... .. ..... ....... . . .. . . . .... ........ . . .. . .......... .. .. . ...... . . . ... . .. .. . . . .. ........................................................................................................................................ . ..... . .. ........ ..... . .. . .. .... ... .. ........ . ... .... .. . .. . ... ....... .......... . ........... .. .. . .. .. .............. .. . ....... ... ..... . . ...... . .. . .. ...... ...... ..................................................................................... .. . ...... ........... ....... ......................... . ....... ..... .. ................. .. . .. .. ... ... . ............................................................ . .... . .. . .. . ..... .
lowQualScore : 66 7 7 1 9 55555555555555 444444444444 5555 1 8 3333 22222222222222222 444 5 3333 5 66666666666666666666666666666666666666666666666 00 66666 4444444 0 3 33 6 7 0 4444 11111111 6 0 55 9 8888888888 55 44 0 000000 7 5 0 000 3 99 33 8 0 7 77 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 8 88888 2 00 44444444 33333 3 88 3 88 3333 000 00 00000000 6 333 7777 88 1 88 2 666 7777777 5555555555 1 77777777777 66 55 1 55 55 44444444444444 44 1 4444444 888 11111 1 1 111111 1 55 1 44 222222 444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 88 3 333333 44444444444 1111111 5555555555555555555555555 5 0000000 88888 88 66666666666666666 22 8 22 22 777 888 8 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7 1111 1 99 0 99 2 66666 0
consensus : CCAAAATNTCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTA-TAGTTATT----GA----GCGGAAACT-CATTTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTCAAATA--AATC-----TCAA-GCTTCCTTTNCA-TGTCAGGA-ACCT----AT--------ANACAAAATTTCATC-AAAAT--ATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGAGCGGAAACCA----TTTT-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCNACTNTACCTCAAAACC--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGG-AA-NCTAT---NCA--------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC-----CG-A-----T-T--T-A--CC---T-A-A--A-AC-----C-A---A----TCCCAAN-C-TTCCTT--TCC-A-TG-------TT---------A-GGAAC-----C-----T--AT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATT-----G---A-G---C--G--AA------A-A--C--A---------------------TTT---TTC--T----A---------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--ACC---------T--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--GC--------AA-AATTTCAT--C-AAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTNATATATTATTNGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATNTCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTA-TAGTTATT----GA----GCGGAAACT-CATTTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTCAAATA--AATC-----TCNA-GCTTCCTTTTCA-TGTCAGGA-ACCT----AT--------AAACAAAATTTCATC-AAAAT--ATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGNGCGGAAANCG----TTTT-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCNACTNTACCTCAAAACC--AATCTNAAGCTTCCTTTTCATGTNAGG-AA-NCTAT---CCA--------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC-----CG-A-----T-T--T-A--CN---T-A-A--A-AC-----C-A---A----TCCCAAN-C-TTCCTT--TCC-A-TG-------TN---------A-GGAAC-----C-----T--AT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATT-----G---A-A---C--G--AA------A-A--C--A---------------------TNT---TTC--T----A---------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--ACC---------C--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--AC--------AA-AATTTCAT--C-AAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTCATATATTATTNGAG
gi|1 : T-TTATATCTTT----AGTAA--------T--------AGTG---A-C----T-TTAA--------------------------------------------ATTT----CAA-------TT-----CCAA-GTTATCTTTACA-TGTAAGGA-ACCG----AT--------ACATCAAATCCCATC-AAAAA--A-------------AAAGTAAAATTATTGTGCGGAAAACA-----TTT-TCTATTTTT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGG-AA-CCGAT---ACA--------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CCT-----------------------------CA---T-A-------T-----C-A---A----TTTTAAA-C-TTCCAT--TCC----G-------TT---------A-CAAAA-----C-----T--AT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AA---AAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATT-----G---A-G---C-----AA------G-A--C--AA--------------------TTT---TTC--T----A---------T--T-TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-T-------T-----T--AAC---------T--C----A--ATA-CT--AA---T-CCAAACATTC---G-TT--T-------C-A----T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GC--------AA-AATATTAT----AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATTagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttCCTCATA-TC--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACA-AA-ACTAT---ACA--------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC-----CC-A-----T-T--TAA--CT---C-A-A--T-AC-----T-A---A----TCCAAAC-A-TTCGTT--T-C-A-TG-------CG---------A-GGAAT-----C-----T--TT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------A---AAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT---------A-A---C--A--AA------T-A--C--AACCGTTTT-------------TTT---TCC--T----ATTCTATT--T--T-T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-T-------T-----T--ACC---------A--C----A--A-A-AC--AA---TCCCAAACTTCC---T-TT--T-------C-A----TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGC--------AA-CATTTCATAAA-AAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA---------A-A-----T-T--T-A--CC---A-C-A--A-AA-----C-A---A----TCCCAAA-C-TTCCTT--TTC-A-TT-------CT---------------T-----C-----T--TC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AA---AAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACT-----G---A-G---CT-G--AA------A-C--C--C---------------------CTT---TTC--T----G---------T--T-T--aaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC-----CG-A-----T-T--T-A--TT---C-C-A--ACAC-----C-A---A----TCACAAT-C-TTC---------A-TA-------TC---------A-GTAACATATAC-----T--AT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CA---AAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATT-----G---A-G---C--G--GA------A-A--CC-A---------------------TGT---TTC--T----G---------T--T-TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-T-------T-----TC-ATC---------T--T----A--A-A-ACT-AA---TCCCAAACTACA---T-TT--C-------C-A----T--GCCAGGA----A-------TCTATA--T--ACATTGAAAAAA-AAATCCAT--CAAAAA-TATtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-GAAA--AGA-TAAT-ATT----GA----GCGGAAAC--CA-TGT-TTCTGTTTT------------------C--------AGTA---A-T----T-TGGAC---------------TTT-------A--TC---C--------ATTTCATCTTAAA-ACTAATC-----CCAA-ACTACATTTCCA-TGCCAGGA-ATCT----ATATACATTGAAAAAAAAATCCATCAAAAAT--ATataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcTCATC-AAAAT--AACT----TACAGGAAAC--AAGTTATTGA-CAGAAACTA----TTTG-CCTATATTTataa
gi|12 : CA--------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC-----CA-C-----T-A--T-A--CC---TCA-A--A-AC-----C-A---T----AACCAAG-C-TCCCTT--TTC-A-TG-------TT---------A-GGAA----------------T--A-C-----------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACT-----G---A-G---T--G--AT------ATC--C--A---------------------T-T---TTC--T----A---------T--T-TT-AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-G-------T-----T--TTC---------T--T----A--A-A-AA--AATATTTCAAAACTTCC---T-TG--C-------C-A-------GT----G----AGGAAC--T---TA--C--AT--------AA-AAGTTCAT-----AAA-TATCTTAaggttgtgattatgactttcacccactatacctcaaaaccataaccaagctcccttttcatgttaggaatactattaaggaaacttaaattactgagtgatatccattttctattttatgtaaaagtgaccttgacccagttttcttaaaaaaatatttcaaaacttccttgccagtgaggaacttacataaaagttcataaatatcttag
gi|12 : tcatcaaaataacttaCCCACTATACCTCAAAACCATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGG-AATACTAT---TAA--------G-----------GAAA---CTT--A-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTT-T----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC-----CA-G-----T-T--T-T--CT---T-A-A--A-A--------A---AATATTTCAAAA-C-TTCCTT--GCC-A--G-------TG---------A-GGAAC-----T---------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T------------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC-----CA-C-----T-T--T-G--GT---TCA-A--A-AG-----C-A---A----TTCCAAT---TTCCTA--TCA-A-T---------T---------A-ATAAC-----A-----T--GT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATTAA---G---A-A------G--AA------ACA--A--A---------------------TAT---ATC--A----AGAC------T--TGT--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-T-------T-----T--AGA---------C--T----A--A-A-AT--AA---TCCCATGTTTCCA--T-TTAACAAATGGAC-ACT--T--AT----AT---A-------T---CA--CCAAC--------AA-AACTTCAT--A-AAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC-----TG-A-----T-T--T-A--TC---T-G-GG-A-AC-----C-A---A----TACCAAG-C-TTTCAT--TTT-T-TG-------TT---------A-GAAAG-----T-----C--AT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GA---AAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATT-----G---A-A---C--A--AA------A-A--A--A---------------------CTT---ATT--T----A---------T--T-T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-T-------T-----T--ACC---------TAAA----A--A-A-TC--AA---TCCCAAATTGCC---CATT--C-------C------T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag-----CA-A-----T-C--T-A--CC---T-C-A--ACAC-----C-A---A----TCCCAAG-C-TTCCTT--CTC-G-TT-------TTCCTTTACAGA-GGAAC-----T-----T--AT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACT-----G---A-G---C--C--AA------A-C--T--G---------------------TAT---TTT--T----A---------T--T-taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGGGAA--CAA-T--TTACT----GA----GC-CAAACTGTATTTT-TATTATTTTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC----C-TTGAT---------------TCAA------A--CC---T--------GATatttttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCAAAATTTCATCAAAAT-ATCATAAA--------------TTCAT----GA----GCAGAAAC---ATTTG-CTCTATTTTC----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----A------------------TG------A--CC---A--------GATTTACC--ACATA--AAAC-------AA-GCTTCCTTTTCA-TATTAGGA-ATAT----AT--------AAACAAAATTTCATC-CAAATTCATCC----------AAGTTACCGTCA--GACCTGAAAAAGATTTTTTT-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : ccaataca--------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC-----AG-A-----T-T--T-A--CCACAT-A-A--A-AC--------------------AAG-C-TTCCTT--TTC-A-TA-------TT---------A-GGAAT-----A-----T--AT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CC---AAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACC-----GTCAG-A---CCTG--AA------A-A-----AGATTT----------------TTT---TTC--T----A---------T--T-TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--ACT---------T--C----A--A-A-ACA-AA---TTTCAAACTcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaatttcat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATCATGCA-----T-C--C-T--CA---T-C-A--A-AC-----C-A---A----TCG-GAT-T-TTTTTT--TCC-A-TG-------TA---------A-GTAAA-----C-----T--AT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TA---AAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACT-----G---A-G---T--A--AA------A-A--C------------------------TGT---TT---T----AATTTTCAGTT--T-T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-T-------T-----TTAACT---------T--CACTGA--A-A-CC--AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT------------A-A-----T-T--C-A--AA---TCA-A--G-AG-----A-G---A----TTCCAAA-C-TTTTGT--TTG-A-TT-------TG---------A-GGAAT-----C-----T--AT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CA---AAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-C---------------------TT-----G---A-A---T--G--GA------A-A--CCAA---------------------TGA---TCCATT----A---------TTAT-T--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-T-------T-----T--AGCTAGAAACTTC--A----A--A-A-GC--AA---TCCAAAG-TTCT---T-TT--A-------C-A----T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-GAAA--CTA-TAGTTATC----AC----GCGGGAACT-CATTTTATTCTGTTTTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GGTTTACCTCAAATA--AATA-----TTCA-GCGCCCTTTCTA-TGTTAAAA-ATCT----AT--------AAACAAAATGTCATC-AAAAT--ATC----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGAAACCA----ATTT-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACACC--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGG-AA-ATTAT---CCA--------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC-----CG-A-----T-T--T-A--TA---T-A-A--A-GT-----T-A---A----TCACAAT-C-TCTCTT--TCC-A-TG-------TA---------A-GGAAC-----C-----T--GT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CA---AAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACT-----G---A-A---C--A--AA------A-A--C--A---------------------TGC---TTC--T----G---------T--T-C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-T-------T-----T--ACA---------C--C----A--A-A-TC--AA---TCCCAAGCTGAC---T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--AC--------AA-AATGCCAT--C-AATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAA-C-TTTCTT--TTC-A-TTCTTTTTTTC---------ATAGAAA-----C-----T--A---A-T--G--CA--------------AA---------T-------TA---AAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATT-----A---A-G---A--G--AA------T-A--CTGG---------------------TCT---TTT--T----A---------tgag
gi|21 : GA-TC-----CG-A-----A-T--T-A--TC---T-C-A--A-AT-----C-A---A----TCCCAGT-T-TTT-TT--TCC-A-TG-------TT---------T-GGAAC-----T-----A--AT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CT---AAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATT-----A---G-A---C--G--AA------A-T--C--ATGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGT---TTT--T----T---------T--T-T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-T-------T-----T--ATC---------T--C----A--A-A-TC--AA---TTTCAAGCCTCC---T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : -C-TTCCTT--TTC-A-GG-------TC---------A-GGAAC-----T-----T--AT----------------------------------CA-T-------CA---AAA-----T-ATTTAA-AA----C-A-AA--A-CT-CCAGT------A------ACT-----G---A-G---T--G--AA------A-A--CTTA---------------------CAT---TTC--T----A---------T--T-T------TTGAC----A--------ATC-T-----TAG-------C-------T----TTG--A-T-------T-----G--ACT---------C--A----A--A-A-GC--AA---GCCCAAGCTTAA---T-TA--T-------C-AGGTTT--GT----A----A-------TC--TATCC--AC--------AA-AATTTCATA-A-AAAA-AATCTTGAA--G-AA--A
gi|23 : aTGAC-----CTTGA-AC-----TG-A-----T-T--T----CA---TCACA--A-AC-----C-A---A----TCCCAA--------------C-A-------------------------AAC------------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CA---AAG-----T-ATCTTA-AA----G-atggaagtttgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttcTCTTTAA-GTTA--CTAATA-TTAT-----------GCA-AAACA-CACTTG---CTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----------------------TTG------A--CC---C--------ACTTTAGCT-AA--A--AATC-----TCGA-GCTCCCTTCACATTGT---GA-ACCTCTTCAT--------AAAAATAAT-------AAGAT--ATTT----T----
gi|25 : g--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC-----CA-C-----T-T--T-A--GC---T-A-A--A----------A---A----TCTCGAG-C-TCCCTT--CAC-ATTG-------T-------------GAAC-----C-----T--CT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TA---AGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-Cacaaaaatggaaaccagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|26 : gtctttaagttactaatattatgcaaaacacacttgctat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATTC-CTGAC---------------TTTA------A--AT---T--------GATCTACCTCAAAcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacGTTA------AA----GCGGAAAC--CATATT-TC--ATTTTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------ATTA------G------------------TTAACATAAAAGA--AACC-----CCAG-GGTTTCTGTTAA-TGTCTCAA-ACTT----AT--------CCACAAAATTTCAGC-AAAAT--ATCT----TTG--GAAACTAAAGATATTGAGCGAAAATCG----TTTT-TCTATatcaattctaa
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC-----CG-ACTTGCT-T--T-A--CC---TCA-A--A-AT-----C-A---A----GTCTAAG-C-TTCCTC--TTC-T-TG-------TC---------A-GAAAT-----A-----T--AT--A-C--A--C---------------AAATTT--------------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T---------------------------G--AA------A-C--C--T---------------------TTT---TTT--TTCG-AT--------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-T-------T-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC-----AG-A-----T-T--T-A--CC---T-C-A--ACAC-----C-A---A----GCTGAAAGC-TTCTCT--TCT-T-TG-------TT---------T-----C-----C-----A--AA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CA---AAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATA-----A---A-G---G--G--AA------A-A--A--AACTATT---------------TTT---TTC--T----ATT-------T--T-T--A---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------CTG-----T----G----A-T-------TAAAAAC--ACA---------T--C----A--A-A-TC--AA---TCCAAAGCTTCC---T-TT--T-------T-A----T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAATC--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAAA-CCTAT---T-------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC-----CA-A-----T-T--T-A--CA---T-G-T--A--------C-ATGTA----TGTCA------TCACTAATCT-A-T-------------------A-GATAG-----C-----TTCCT--A-C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATT-----G---A-A---T--G--GAC-----A-A--C--A---------------------TTT---TTC--T----AGT-------T--T-T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------T-------T-----G--ACT---------T--G----ACTG-A-CC--AA---TCCCATGCTTTC---C-TT--T-------C-A----G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc-----CA-A-----T-T--T-A--CC---T-C-A--A-AT-----C-G---A----TCCCAAT-C-TTACTT--TCC-A-TC-------TT---------A-GAAAC-----A-----T--AT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTA---AGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT-------------------------------------A---------------------T--------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-T-------T-----T--ACC---------C--T----A--A-A-TT--AA---TACCAACCTTAC------T--C-------CAA----T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : G-------TT---------T-GAAAC-----T-----T--AT--C-C--G--AA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTA-AT----T-G-AA--A-CC---AGT------T-------TC-----------------------------------------------------------TAT---TAG--T----A---------T--T-T--A---GTAATGA--A---GACTGACC-A-----TAA-------T-------C----CA---A-T-------T-----T--GGC---------T--C----A--AGA-GC--AA---TTCCAAGCCT-A---T-TT--C-------T-A----GA-GTC---A----AGAGC---C---TG--C--ATTA------AA-AAATTCAT--C-AAGA-Tg
gi|33 : -CC-----CA-A-----T-A--T-G--CA---T-A-A--A-A--------A---A------CCAAA-C-CTCCTT--TTTTA-TG-------TT---------A-GAAAC-----C-----A--A---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T----------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT-----G---A-G---C--T--AA-------------------------------------CT---TTC--T----A---------T--T-TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC---------------------------T-T--T-A--CT---T-C-A--A-AC-----CCA---A----TCCCAAA-C-TGCTTT--TCC---TG-------TA---------T-GGAAA-----C-----T--ATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CA---GAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATT-----G---A-G---C--gac
gi|36 : tattaccatcca-------------TTATTG---A--AT---AG-A-----A-----T-T--T-T--T---AG----T----AATT-----GTAA-CCTTGAC-----TGTGA-CC-----CA-A-----TAT--G-A--TT---C-A-A--A-AC-----C-A---G----TCTGAAG-A-TCCCTT--T--------------TC---------A-GGAGC-----C-----T--AT--C-C--A--TA--------------AATTTT--CA-A-------CA---AAC-----C-ATTTTA-AA----A-G-AA--A-CT-TAAGT------T------ATat
gi|37 : -----C-A---A----TCTCAAA-C-TTCCTT--TTC-A-TG-------TT---------T-GGAAC-----CTGTAAT--GT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T----AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATC-----A---A-G---T--G--AA------A-------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTT-------T-----T--ACC---------T--C----A--A-AGCC--AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-A-TG-------AT---------G-AGAAC-----A-----T--AT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CA---AAA-------GTGTTA-AG----A-G-TG--A-----AAAT------T------AT------------------------------------------------------------TTT---TTC--T----ATT-------T--T-T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA------------------------GA----GTGAAAATT--ATTTT-TTCTATTTTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T----C-TTGAC---------------TTTG------A--TC---tttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----GA----ACAGAAAGT--ATTCT-TT-----TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAA--CC---CCAAACAGAGATTAACCTCAAATC--AATC-----TCAA-GTTTCATTTGTA-TGTTACAA-ACCT----AT--------ACACCATATTTCATC-AAAAT--ATCT----CTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGAAACTA----TTCTGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-TC--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACA-AA-CCTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC-----CC-A-----C-T--T-AACCT---C-A-A--A-AC-----C-A---A----TCCAAAA-C-TTCCTT--TCC-A-TG-------TC---------A-GGTAC-----A-----T--AT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATT-----G---AGA---A--G--AA------A-A--C--T---------------------TTT---TTC--T----AATT------T--T-T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-T-------T-----T--ACC---------T--C----A--ATA-CC--AA---TTTCAAGCTTCCA--T-TT--T-------T-T----T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GC--------AA-AATTTATT--C-AAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAGTTATT----GATTAAACAGAAAC--CATTTT-TTGAATTA------AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTT------A--CC---A--------CA---AAATCAATTA--AAT------TCTA-GCTTCATTT
gi|42 : -TAGTTAGT----TA----GCGGGAACT-T-TTTT-TTCTTTTTTT----AGCAA--------C--------A---------------TTGAT---------------TTTG------A--CC--------------TTGACCTCAAATC--AATT-----TCAA-GCTTa
gi|43 : tatcaacatat--T-T--T---TA---------A--------ATAA-CAACAAT-----CTTGA-CC-----CA-A-----T-T--T-A--CC---TCA-A--A-AC-----C-A---A----TTTGAAT-C-TTCC
gi|43 : agttaacacagtactctgacagctcttgttctgCTTGA-CCCAA-TTTACCTCAAAACC--AATTTGAATCTTCC
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcttgttctgttttaaataacaacaatA-GAAAACCTA--AGTTACTATCTGA----GCGGAAACT-G--TTT-TTCCACTTTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C----A-TTGAC---------------TTT
gi|45 : A----G-A-AA--A-CC-TAAGT------T------ACTATCT-G---A-G---C--G--GA------A-A--CT-G---------------------TTT---TTC--C----ACT-------T--T-T--A---GTAAA----A---A--AGACA-T-----TGA-------C-------T----T----T-T-------T-----T--CTA---------C--A----A--A-A-CC--AA---CCtttctacaaaaccaacc
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------CTTA------AATCCAAAC--------GA--CACCGAAAACA--A--------TCCATGCTTCCTTTTGA--GTAAGAA-A
gi|48 : TTTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T----C-TTGAC---------------AGTG------A--TC---C--------AAAATTCCTCATACA--AAGCCAATGTCAA-GCCTTCTTTTCA-TGTAAGGgtccatt
gi|49 : -TGTCTGGA-GCTT----GT--------ATGCCAA-TTTCATC-AAAAT--ATCT----TTG--AAAAC--AAGTCATTGAATGGAAACCA----TTT
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA-----CG-A-----A-T-------CT---T-A-ACAA-ACACGTTC-A---A----TTTCAAT-CCTTCCAT--TTC-T-TG-------TC---------A-GGATC-----C-----T--AC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTT-AA---------A--A-CT-TTAGT------T------ATT-----A---A-A---T--G--GA------A-AACC--T---------------------TTT---TTC--T----A---------T--T-TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A---------T-----G--ACC---------C--C------------C--AA---TCCCATGCTTCA---T-TT--T-------A-A----T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GC--------AA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaCATCAAAAT-ATCTTTAA---AA--CTT-TAGTTATT----AA----ATGGAAAAC-C-TTTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C----CTTTGTC---------------TATG------A--CC---C--------------CC---------AATC-----CCAT-GCTTCATTTTAA-TGTCAAGACATCT----AT--------ACGCAACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattaaaacAAG-C-TTCCTA--TTC-T-TG-------CC---------A-GGAAC-----T-----A--AT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca--AA---TCTGAAGCTTCC---T-TA--A-------A-A----T--G----------A------------A--C--AC--------AA-AATTCCAT--C-AAAA-TATCTCGAA--G-GA--A
gi|51 : --A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTT-----G---actaatgttgttgtat
gi|52 : aatctgaagcttccttaaaatgaA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATT-----G---A-A---C--A--TA------A-A--C--tat
gi|6 : cacctt-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC-----TG-A-----T-T--T-A--CA---T-C-A--A-AT-----C-A---A----GCCTTCG-C-TTCCTT--TCA-A-TG-------TT---------A-CATACATAA-T-----T--AT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CA---AGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATT-----G---A-A---CA-A--AA------A-A--C--A---------------------TTT---TTC--T----AT--------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-T-------T-----T--ACC---------C--CA---A--A-A-TC--AA---CACCATTATTCC---T-TC--C-------C-A----T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--AC--------CA-AATATCAT--C-AAAA-TATCc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgTTC--CA-T-------CATAGAAA-----T-ATTTTC-AA----G-C-AA--G-TT-TA--T------T------GTTTGTGGG---A-AAAGC--A--AA------A-A--C------------------------CAC---TTC--T----A---------------------ACAAC----A---C--TGACG-G-----T---------C-------C----C----A-TGCTGCAAT-----T--AAG---------T--T----A--A-A-ACCCAA---TCCCAAGCTTATAAAT-AT--A-------T-A----A--GG----A----A-------CCTATA--A--AG--------AA-AATGTCAT--C-AAAA-TATCTTAAG--G-AA--ACTTA-AT-TTATTGGA
gi|7 : -C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG-----CA-A-----T-T--A-A--GT---T-A-A--A-AC-----CCA---A----TCCCAAG-C-TTA-TA--AAT-A-TA-------TA---------A-GGAAC-----C-----T--AT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATT-----G---G-A---C--A--GATACCATA-C--C--A---------------------TTT---TTC--T----AAT-------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--ACC---------TA-A----A--A-A-AC--AA---TCCCAATCCCCC---T-TT--T-------C-A----T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-AT--------AA-AATGTCAT--C-AAAA-Tcagataccataccatttttctaattttagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT-----TG-A-----C-TAAT-G--CC---T-G-A--A--------C-A---A----TCCAGTG-C-TTCCGT--CTT-A-CA-------TT---------A-GGAAT-----C-----C--AT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CT---GAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATT-----G---A-A---T--G--GA------A-A--C--AAT-------------------TCTATGTCC--TTGACG---------T--T-C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----A--AGC---------T--C----A--A-A-AT--AT---TATTAAGCTTCC---T-TT--T-------C-A----T--G------------------T---TA--C---C--------AATCATTCC-C--C-AAAGTTAT-TGAAA--A-GA--AC-CAT
gi|9 : acggaTTTCTTC-AAAAT--AGCTAAAAT----GAAA--AAAGTTATTGTATGGAAAACA----TTTT-TGTAttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttA--------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC-----CC-A-----T-T--T-A--AG---T-A-ATGA-AC-----T-A---A----TTACAAA-C-TTCCTTA-TAC---TG-------TC---------T-GACAT-----T-----T--AT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CA---AAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATT-----G---A-G---C--GGTAAC-----A-A--C--AC--------------------TTT---TTC--T----AAC-------T--A-C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-T-------T-----T--ACC---------T--C----A--G-A-AC--AA---GCTCGA-CTTCA---T-TT--C-------C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222 222222222 11111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 5555555555 1111 11 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111 2222222222222222222222222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 22222
lowQualScore : 7 0 5 3 0 999999999999999 888888 6666 222222222 2 1 4444 11111111111111111 333 2 4444 2 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999999 66 2 5 3 5 22222222 3 44 0000000000 2 1 66 0000 0 1 6 1 66 0 99 77 1 1 66 5 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 44444 1 22 222 3 33333 22 1 222 9999999 33 4 222 222 2222 222 44 222 444444444 22 1 3333333 1 999999999 99999999999 1111 11 11 66666666666666 11 1 3333333 111 55555 1 1 44444444 11 1 55 555555 555555 44444444444 88888888 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 222222 77777777777 4444444 2222222222222222222222222 3 5555555 33333 99999999 9999999 22 4 33 55 222 0 666 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 0 222 3 77 5 77 1 88888 1
lowQualScore : . . . . . ............... ...... .... ......... . . .... ................. ... . .... . ............................................................. ...... .. . . . . ........ . .. .......... . . .. .... . . . . .. . .. .. . . .. . . .................................................................................................................................. . ..... . .. ... . ..... .. . ... ....... .. . ... ... .... ... .. ... ......... .. . ....... . ......... ........... .... .. .. .............. .. . ....... ... ..... . . ........ .. . .. ...... ...... ........... ........ ................................................................................ .. ...... ........... ....... ......................... . ....... ..... ........ ....... .. . .. .. ... . ... . ........................................................... . . ... . .. . .. . ..... .
lowQualScore : 5 1 7 4 5 444444444444444 999999 5555 999999999 9 9 7777 66666666666666666 999 2 7777 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222 11 9 9 1 4 11111111 3 66 3333333333 4 5 00 6666 2 7 7 0 55 6 22 55 0 0 77 7 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 22222 3 66 555 1 66666 00 4 222 9999999 44 3 888 444 9999 333 00 111 888888888 99 6 3333333 2 444444444 77777777777 9999 66 66 55555555555555 55 1 5555555 999 33333 1 1 33333333 66 1 33 444444 777777 88888888888 44444444 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 555555 44444444444 1111111 4444444444444444444444444 1 0000000 88888 66666666 2222222 22 8 22 44 888 2 888 9 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 5 555 6 99 7 99 0 55555 0
consensus : CCAAAATNTCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTA-TAG-TTATT----GA----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTC-AAATA--AATC-----TCAAGCTTCCTTTNCA-TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCATC-AAAAT--ATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGNGCGGAA----ACCATTTT-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAATC--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-AC-TATNCA-----------C-----------GAAA---CATC-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-C-C----T-NA--A-ACC-A---A----TCC---CAAG-C---TTC---------CTT--TCC-A-----T-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATT--------G--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A------------T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTNGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATNTCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTA-TAG-TTATT----GA----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTC-AAATA--AATC-----TCAAGCTTCCTTTNCA-TGTCAGGA-ACCTATANAC--------AAAATTTCATC-AAAAT--ATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGAGCGGAA----ACCATTTT-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCNACTNTACCTCAAAACC--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-NC-TATNCA-----------C-----------GAAA---CATC-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-C-C----T-AA--A-ACC-A---A----TCC---CAAN-C---TTC---------CTT--TCC-A-----T-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATT--------G--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A------------T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTNATATATTATTNGAG
gi|1 : T-TTATATCTTT----AGTAA--------T--------AGTG---A-C----T-TTAA--------------------------------------------ATTT----C-AA-------TT-----CCAAGTTATCTTTACA-TGTAAGGA-ACCGATACAT--------CAAATCCCATC-AAAAA--A-------------AAAGTAAAATTATTGTGCGGAA----AACA-TTT-TCTATTTTT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-CC-GATACA-----------T-----------CAAATCCCATC-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C----------------------------C----T-CA--T-ATC-A---A----TTT---TAAA-C---TTC---------CAT--TCC---------GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AA---AAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATT--------G--AG---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-T-------T-----T--------AACT--C----A--ATA-CT--AA---T-CCAAACATTC---G-TT--T-------C-A------------T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATTagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttCCTCATA-TC--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-AC-TATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TATCTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA---TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-A-C----T-CA--ATACT-A---A----TCC---AAAC-A---TTC---------GTT--T-C-A-----T-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------A---AAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT-----------AA---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------T---T-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-T-------T-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC--AA---TCCCAAACTTCC---T-TT--T-------C-A------------TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT---T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-C-C----A-CA--A-AAC-A---A----TCC---CAAA-C---TTC---------CTT--TTC-A-----T-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AA---AAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACT--------G--AG---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------T---T-----TT-C--T----G-------TT--T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT---T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TTC----C-AA--C-ACC-A---A----TCA---CAAT-C---TTC------------------A-----T-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CA---AAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATT--------G--AG---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------G---T-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-T-------T-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACT-AA---TCCCAAACTACA---T-TT--C-------C-A------------T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-GAAA--AGA-TAA-T-ATT----GA----GCGGAAAC--CAT----GTT-T-CTGTTTT------------------C--------AGTA---A-T----T-TGGAC---------------TTT-------A--TC---C--------ATTTCATCTT-AAA-ACTAATC-----CCAAACTACATTTCCA-TGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCATCAAAAAT--ATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-AC-T-TACA-----------G-----------GAAA---CA---------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA---T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-C-C----TCAA--A-ACC-A---T----AAC---CAAG-C---TCC---------CTT--TTC-A-----T-GTT---------AGGAA--------------T--A-C-----------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACT--------G--AG---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------T---T-----TT-C--T----AT------TT--T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-G-------T-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA--AATATTTCAAAACTTCC---T-TG--C-------C-A---------------GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAACCATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATAC-TATTAA-----------G-----------GAAA---CTTA-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTTT----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T-T-C-T----T-AA--A-A---A---AATATTTC---AAAA-C---TTC---------CTT--GCC-A-------GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T------------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-G-T----TCAA--A-AGC-A---A----TTC---CAAT-----TTC---------CTA--TCA-A-----T---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATT--------A--AG---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------A---T-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-T-------T-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT--AA---TCCCATGTTTCCA--T-TTAACAAATGGAC-ACT----------T--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-T-C----T-GGG-A-ACC-A---A----TAC---CAAG-C---TTT---------CAT--TTT-T-----T-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GA---AAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATT--------G--AA---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------T---T-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-T-------T-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC--AA---TCCCAAATTGCC---CATT--C-------C--------------T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-C-C----T-CA--ACACC-A---A----TCC---CAAG-C---TTC---------CTT--CTC-G-----T-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACT--------G--AG---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------T---T-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGGGAA--CAA-T---TTACT----GA----GC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATTTTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC----C-TTGAT---------------TCAA------A--CC---T--------GATttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCAAAATTTCATCAAAAT-ATCATAAA---------------TTCAT----GA----GCAGAAAC---AT----TTG-CTCTATTTTC----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----A------------------TG------A--CC---A--------GATTTACC---ACATA--AAAC-------AAGCTTCCTTTTCA-TATTAGGA-ATATATAAAC--------AAAATTTCATC-CAAATTCATCC----------AAGTTACCGTCA--GACCTGAAAAAGATTTTTTT-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : ccaatacaTTCAT----------C-----------AAAA---TATC-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA---TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-C-CACA-T-AA--A-AC------------------AAG-C---TTC---------CTT--TTC-A-----T-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CC---AAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACC--------GTCAGACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACA-AA---TTTCAAACTcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA---T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-T-CCTCAT-CA--A-ACC-A---A----TCG----GAT-T---TTT---------TTT--TCC-A-----T-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TA---AAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACT--------G--AG---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------T---T-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-T-------T-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC--AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT-AA-TT---CAA-----------A-T-C------AA--G-AGA-G---A----TTC---CAAA-C---TTT---------TGT--TTG-A-----T-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CA---AAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-CT---------------------T--------G--AA---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------G---A-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-T-------T-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC--AA---TCCAAAG-TTCT---T-TT--A-------C-A------------T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-GAAA--CTA-TAG-TTATC----AC----GCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTTTTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GGTTTACCTC-AAATA--AATA-----TTCAGCGCCCTTTCTA-TGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCATC-AAAAT--ATC----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGAA----ACCAATTT-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACACC--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-AT-TATCCA-----------C-----------GAAA---CATC-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-T-A----T-AA--A-GTT-A---A----TCA---CAAT-C---TCT---------CTT--TCC-A-----T-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CA---AAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACT--------G--AA---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------G---C-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-T-------T-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC--AA---TCCCAAGCTGAC---T-TT--C-------C-A------------T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---CAAA-C---TTT---------CTT--TTC-A-----T-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------A---AAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATT--------A--AG---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------C---T-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-T-C----T-CA--A-ATC-A---A----TCC---CAGT-T---TTT----------TT--TCC-A-----T-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CT---AAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATT--------A--GA---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGT---T-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-T-------T-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC--AA---TTTCAAGCCTCC---T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : -C---TTC---------CTT--TTC-A-----G-GTC---------AGGAAC-----T-----TAT----------------------------------CA-T-------CA---AAA-----T-ATTTAA-AA----C-A-AA--A-CT-CCAGT------A------ACT--------G--AG---T-G--AA------A--A--C---------------T----------------------TACAT-----TT-C--T----A-------TT--T------TTGAC----A--------ATC-T-----TAG-------C-------T----TTG--A-T-------T-----G--------ACTC--A----A--A-A-GC--AA---GCCCAAGCTTAA---T-TA--T-------C-AGGTT--------T--GT----A----A-------TC--TATCC--ACAA-AATTTCATA-AAAAA-AATCTTGAA--G-AA--A
gi|23 : aTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-T-C----A-CA--A-ACC-A---A----TCC---CAA-------------------------C-A----------------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CA---AAG-----T-ATCTTA-AA----G-atggaagtttgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttcTCTTTAA-GTTA--CTAATA--TTAT-----------GCA-AAACA-CAC----TTG---CTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----------------------TTG------A--CC---C--------ACTTTAGCT--AA--A--AATC-----TCGAGCTCCCTTCACATTGT---GA-ACCTCTTCAT--------AAAAAT--AAT-AAGAT--ATTT----T-------ACAAAAAT--------GGAA----ACCA
gi|25 : g--T---TT---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CAC-----TT--T-A-G-C----T-AA--A-----A---A----TCT---CGAG-C---TCC---------CTT----C-A-----C-ATT---------GTGAAC-----C-----TCT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TA---AGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-Cgtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|26 : gtctttaagttactaatattatgcaaaacacacttgctat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATTC-CTGAC---------------TTTA------A--AT---T--------GATCTACCTC-AAAcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------AA----GCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATTTTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------ATTA------G------------------TTAACATA-AAAGA--AACC-----CCAGGGTTTCTGTTAA-TGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAGC-AAAAT--ATCT----TTG--GAAACTAAAGATATTGAGCGAAA----ATCGTTTT-TCTATatcaattctaa
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-C-C----TCAA--A-ATC-A---A----GTC---TAAG-C---TTC---------CTC--TTC-T-----T-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT--------------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T---------------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------T---T-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-T-------T-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-C-C----T-CA--ACACC-A---A----GCT---GAAAGC---TTC---------TCT--TCT-T-----T-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CA---AAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATA--------A--AG---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-T-------TAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC--AA---TCCAAAGCTTCC---T-TT--T-------T-A------------T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAATC--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATT-------------ATA-G-------------TC--TA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TA---TTTTTA--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-C-A----T-GT--A---C-ATGTA----TGT---CA--------TC---------ACTAATCT-A-----TAGAT---------AGCTTC-----C-----TA-----C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATT--------G--AA---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------T-------T-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC--AA---TCCCATGCTTTC---C-TT--T-------C-A------------G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-C-C----T-CA--A-ATC-G---A----TCC---CAAT-C---TTA---------CTT--TCC-A-----T-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTA---AGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT------------------------------------------A--------T---------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-T-------T-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT--AA---TACCAACCTTAC------T--C-------CAA------------T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : -GTT---------TGAAAC-----T-----TAT--C-C--G--AA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTA-AT----T-G-AA--A-CC---AGTTTC---T------ATT-----------AG-----------------------------------------------------------------------------T----A-------TT--T--A---GTAATGA--A---GACTGACC-A-----TAA-------T-------C----CA---A-T-------T-----T--------GGCT--C----A--AGA-GC--AA---TTCCAAGCCT-A---T-TT--C-------T-AGAGTCAAGAGCCT--GC---------A-------T---TA-------AA-AAATTCAT--CAAGA-Tg
gi|33 : -CC---CAA-----TA--T-G-C-A----T-AA--A-A---A---A------C---CAAA-C---CTC---------CTT--TTTTA-----T-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T----------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT--------G--AG---C-T--AA---------------------------------------------------C---T-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG---T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-C-T----T-CA--A-ACCCA---A----TCC---CAAA-C---TGC---------TTT--TCC-------T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CA---GAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATT--------G--AG---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATTTTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C----C-TTGAC---------------TGTG------A--CC---C--------AATATGATTCAAAACC--AGTC-----TGAAGATCCCTTT------TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAAC-AAACC--ATTT----TAAAAGAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaatagaC-A---A----TCT---CAAA-C---TTC---------CTT--TTC-A-----T-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T----AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATC--------A--AG---T-G--AA------A------------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTT-------T-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC--AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t---TTT---------CTT--TCC-A-----T-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CA---AAA-------GTGTTA-A-----------------------------------------------G--AG---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------T---T-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA-------------------------GA----GTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATTTTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T----C-TTGAC---------------TTTG------A--TC---tttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----GA----ACAGAAAGT--AT----TCT-TT-----TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAA--CC---CCAAACAGAGATTAACCTC-AAATC--AATC-----TCAAGTTTCATTTGTA-TGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCATC-AAAAT--ATCT----CTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGAA----ACTATTCTGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-TC--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-CC-TATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TATCTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA---TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AAC-C----TCAA--A-ACC-A---A----TCC---AAAA-C---TTC---------CTT--TCC-A-----T-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATT--------G--AGA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC--AA---TTTCAAGCTTCCA--T-TT--T-------T-T------------T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAG-TTATT----GATTAAACAGAAAC--CAT----TTT-TTGAATTA------AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTT------A--CC---A--------CA---AAATC-AATTA--AAT------TCTAGCTTCATTT
gi|42 : -TAG-TTAGT----TA----GCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTTTTT----AGCAA--------C--------A---------------TTGAT---------------TTTG------A--CC--------------TTGACCTC-AAATC--AATT-----TCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------T---G-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----C----AAT-------T-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC--AA---TTTGAATCTTCC---
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-GAAAACCTA--AG-TTACTATCTGA----GCGGAAACT-G------TTT-TTCCACTTTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C----A-TTGAC---------------TTT
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------CTTA------AATCCAAAC--------GA--CACCGA-AAAC---AATC------CATGCTTCCTTTTGA--GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : TTTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T----C-TTGAC---------------AGTG------A--TC---C--------AAAATTCCTC-ATACA--AAGCCAATGTCAAGCCTTCTTTTCA-TGTAAGGgtccatt
gi|49 : -TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCATC-AAAAT--ATCT----TTG--AAAAC--AAGTCATTGAATGGAA----ACCATTT
gi|5 : tgtgagTGAT-----CTTAA-AT---TAA-----TT--T-A-C-CT---T-AA--A-ACG-A---A----TCTTAACAAA-CACGTTCAATTTCAATCCT--TCC-ATTTCTT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAA--C--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTT-A---------AA--A-CT-TTAGT------T------ATT--------A--AA---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------T---T-----TT-C--T----ATT-----TT--T--A---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A---------T-----G--------ACCC--C------------C--AA---TCCCATGCTTCA---T-TT--T-------A-A------------T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttcCATCAAAAT-ATCTTTAA---AA--CTT-TAG-TTATT----AA----ATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C----CTTTGTC---------------TATG------A--CC---C--------------CC----------AATC-----CCATGCTTCATTTTAA-TGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattaaaacAAG-C---TTC---------CTA--TTC-T-----T-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca--AATC-----TGAAGCTTCCTTAAAA-TG-----A-AC------AC--------AAAATTCCATC-AAAAT--ATCT----CGAAGGAAACTAATGTTGTTG
gi|51 : --A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTT--------G--tat
gi|52 : aatctgaagcttccttaaaatgaA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATT--------G--AA---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : cacctt-----------GAAA---CA---------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC---T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-C-A----T-CA--A-ATC-A---A----GCC---TTCG-C---TTC---------CTT--TCA-A-----T-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CA---AGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATT--------G--AA---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-T-------T-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC--AA---CACCATTATTCC---T-TC--C-------C-A------------T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgTTC--CA-T-------CATAGAAA-----T-ATTTTC-AA----G-C-AA--G-TT-TA--T------T------GTTTGTGGGAAA--AG---C-A--AA------A--A--CC-----A--------C----------------------T---T-----CT------------------------A---ACAAC----A---C--TGACG-G-----T---------C-------C----C----A-TGCTGCAAT-----T--------AAGT--T----A--A-A-ACCCAA---TCCCAAGCTTATAAAT-AT--A-------T-A------------A--GG----A----A-------CCTATA--A--AGAA-AATGTCAT--CAAAA-TATCTTAAG--G-AA--ACTTA-AT-TTATTGGA
gi|7 : -C--T---TC---T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-G-T----T-AA--A-ACCCA---A----TCC---CAAG-C---TTA----------TA--AAT-A-----T-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATT--------G--GA---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC--AA---TCCCAATCCCCC---T-TT--T-------C-A------------T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tcagataccataccatttttctaattttagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-GAAA--CT--TAATTTATT----GG----ACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAATTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C--------GA------------------TA------A--CC---C--------AATTTACCTA-AAAAAC-AATC-----CCAATCCCCCTTTTCA-TGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCATC-AAAAT--
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA---T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-C-C----T-GA--A---C-A---A----TCC---AGTG-C---TTC---------CGT--CTT-A-----C-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CT---GAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATT--------G--AA---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------T---TCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT--AT---TATTAAGCTTCC---T-TT--T-------C-A------------T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--AC
gi|9 : acggaTTTCTTC-AAAAT--AGCTAAAAT----GAAA--AAAGTTATTGTATGGAA----AACATTTT-TGTAcatttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttA-----------T-----------GAAA---AA---------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-A-G----T-AATGA-ACT-A---A----TTA---CAAA-C---TTC---------CTTA-TAC-------T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CA---AAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATT--------G--AG---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------T---T-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC--AA---GCTCGA-CTTCA---T-TT--C-------C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111 111111111111 222222222 11111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222 1111 11111111 44444444444 1 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 1111111111 11111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222222222222222222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 22222
lowQualScore : 99 1 6 1 1 666 4444444444 000000000000 555555555 3 1 5555 33333333333333333 444 2 5555 2 66666666666666666666666666666666666666666666666 55 8888 888888 88 3 4 4 0 44444444 4 99999999999 0 5 4 0 33 3 888 5 444 99 77 1 1 5 5 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 55555555 33 22222 55555 22 1 5555555 1 33 222222222 2 333 2222 1 55 1 22 1 11 1 0000000000 0 00000000000 11 1 11 11 66666666666666 11 1 3333333 111 55555 1 33333 11 1 55 555555 555555 44444444444 88888888 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77777777777 4444444 2222222222222222222222222 3 5555555 33333 99999999 9999999 22 4 33 55 222 0 666 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 0 222 3 77 5 77 6 88888 1
lowQualScore : .. . . . . ... .......... ............ ......... . . .... ................. ... . .... . ............................................... .. .... ...... .. . . . . ........ . ........... . . . . .. . ... . ... .. .. . . . . . .................................................................................................................................. . ........ .. ..... ..... .. . ....... . .. ......... . ... .... . .. . .. . .. . .......... . ........... .. . .. .. .............. .. . ....... ... ..... . ..... .. . .. ...... ...... ........... ........ ........................................................................................... ........... ....... ......................... . ....... ..... ........ ....... .. . .. .. ... . ... . ........................................................... . . ... . .. . .. . ..... .
lowQualScore : 66 7 7 4 9 555 2222222222 555555555555 888888888 3 8 3333 22222222222222222 444 5 3333 5 00000000000000000000000000000000000000000000000 88 0000 444444 11 6 3 0 7 55555555 0 11111111111 1 2 1 1 44 0 777 5 333 22 55 0 0 7 7 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 22222222 44 99999 77777 00 5 8888888 5 55 444444444 8 888 9999 4 00 2 99 1 88 2 1111111111 1 44444444444 66 2 66 66 77777777777777 55 1 6666666 999 44444 1 33333 66 2 33 444444 777777 88888888888 44444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444444444 1111111 4444444444444444444444444 1 0000000 88888 66666666 2222222 22 8 22 44 888 2 888 9 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 5 555 6 99 7 99 7 22222 0
consensus : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTA-TAG-TTATT----GA----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTC-AAACA--AATC-----TCAAGCTTCCTTTTCA-TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCATC-AAAATATCT----T-G--GAAACTAAAGTTATTGAGCGGAAACCATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-AC-TATNCA-----------C-----------GAAA---CATC-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----TCA--A-A-C-----C-A---A----TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATT--------G--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A------------T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--AC-TAATATATTATTNGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATNTCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTA-TAG-TTATT----GA----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTC-AAATA--AATC-----TCAAGCTTCCTTTNCA-TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCATC-AAAATATCT----T----GAAACTAAAGTTATTGNGCGGAAACCATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-AC-TATNCA-----------C-----------GAAA---CATC-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----TNA--A-A-C-----C-A---A----TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATT--------G--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC--AA---TCCCAAGCTTCC---T-TT--C-------C-A------------T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--AC-TAATATATTATTNGAG
gi|1 : ACTTTAAATTTC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-CC-GATACA-----------T-----------CAAATCCCATC-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----TCA--T-A-T-----C-A---A----TT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AA---AAA-----T-ATCTCAAA-G-A-AA--A----TGAGT------A------ATT--------G--AG---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-T-------T-----T--------AACT--C----A--ATA-CT--AA---T-CCAAACATTC---G-TT--T-------C-A------------T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--AC-TAA-AT-TTATT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgCCTCATA-T-C--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-AC-TATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TATCTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA---TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----TCA--ATA-C-----T-A---A----T--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------A---AAA-----T-ATCTTAAA-ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT-----------AA---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------T---T-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-T-------T-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC--AA---TCCCAAACTTCC---T-TT--T-------C-A------------TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--AC-TAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT---T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-CC----ACA--A-A-A-----C-A---A----TC-CCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AA---AAAAA---T-ATTTTAAA-G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACT--------G--AG---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------T---T-----TT-C--T----G-------TT--T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT---T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----CCA--ACA-C-----C-A---A----TC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CA---AAA-----TCATTAGAAA-A-G-A--------TAA--------T------ATT--------G--AG---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------G---T-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-T-------T-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACT-AA---TCCCAAACTACA---T-TT--C-------C-A------------T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-GAAA--AGA-TAA-T-ATT----GA----GCGGAAAC--CA-----TGT-TTCTGTTTT------------------C--------AGTA---A-T----T-TGGAC---------------TTT-------A--TC---C--------ATTTCATCTT-AAA-ACTAATC-----CCAAACTACATTTCCA-TGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCATCAAAAATATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-AC-T-TACA-----------G-----------GAAA---CA---------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA---T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----TCA--A-A-A-----C-C---A----TAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C-----------------------------------------------------T-ATT---AA-G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACT--------G--AG---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------T---T-----TT-C--T----AT------TT--T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-G-------T-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA--AATATTTCAAAACTTCC---T-TG--C-------C-A---------------GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAAC-CATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATAC-TATTAA-----------G-----------GAAA---CTTA-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTTT----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T-T-CT----TAA--A-A---------A---AATATTT-CAAA-AC-TTCCTT--GCC-A--GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T------------AAA-----T-ATCTTAg
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----TCA--A-A-AG----C-A---A----TT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----C-A-CTTAAA-A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATT--------A--AG---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------A---T-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-T-------T-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT--AA---TCCCATGTTTCCA--T-TTAACAAATGGAC-ACT----------T--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--AT-TAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----TGGG-A-A-C-----C-A---A----TA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GA---AAA-----T-ATCTTGAT-G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATT--------G--AA---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------T---T-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-T-------T-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC--AA---TCCCAAATTGCC---CATT--C-------C--------------T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----TCA--ACA-C-----C-A---A----TC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAT-----T-ATCTTAAA-G-G-GA--A-C---AATT------T------ACT--------G--AG---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------T---T-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGGGAA--CAA-T---TTACT----GA----GC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATTTTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC----C-TTGAT---------------TCAA------A--CC---T--------GATttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCATC-AAAATATC-----------A---TAAATTCA-TGAGCAGAAA-CATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TATC-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA---TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CCACA-TAA--A-A-C---------------------AA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CC---AAA-----T--TC--------------A-TC-CAAGT------T------ACC--------GTCAGACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACA-AA---TTTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA---T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCATCA--A-A-C-----C-A---A----TC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TA---AAAAGCGTT-AACGTAAA-G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACT--------G--AG---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------T---T-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-T-------T-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC--AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----TCA--A-G-A-----G-AG--A----TT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CA---AAA-----T-AACTTGCA-C-A-AA--A-CT---------------------T--------G--AA---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------G---A-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-T-------T-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC--AA---TCCAAAG-TTCT---T-TT--A-------C-A------------T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-GAAA--CTA-TAG-TTATC----AC----GCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTTTTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GGTTTACCTC-AAATA--AATA-----TTCAGCGCCCTTTCTA-TGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCATC-AAAATATC----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGAAACCAATT-T-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC-C--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-AT-TATCCA-----------C-----------GAAA---CATC-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA---T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----TAA--A-G-T-----T-A---A----TC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CA---AAA-----T-ATCTCAAC-G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACT--------G--AA---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------G---C-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-T-------T-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC--AA---TCCCAAGCTGAC---T-TT--C-------C-A------------T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGAT-TCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-AC-TTTCTT--TTC-AT-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------A---AAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATT--------A--AG---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------C---T-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----TCA--A-A-T-----C-A---A----TC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CT---AAA-----C-AATATAAATG-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATT--------A--GA---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGT---T-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-T-------T-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC--AA---TTTCAAGCCTCC---T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : C-TTCCTT--TTC-AG-GTC---------AGGAAC-----T-----TAT----------------------------------CA-T-------CA---AAA-----T-ATTTAAAA-C-A-AA--A-CT-CCAGT------A------ACT--------G--AG---T-G--AA------A--A--C---------------T----------------------TACAT-----TT-C--T----A-------TT--T------TTGAC----A--------ATC-T-----TAG-------C-------T----TTG--A-T-------T-----G--------ACTC--A----A--A-A-GC--AA---GCCCAAGCTTAA---T-TA--T-------C-AGGTT--------T--GT----A----A-------TC--TATCC--ACAA-AATTTCATA-AAAAA-AATCTTGAA--G-AA--A
gi|23 : aTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----ACA--A-A-C-----C-A---A----TC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CA---AAG-----T-ATCTTAAA-G-atggaagtttgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttcTCTTTAA-GTTA--CTAATA--TTAT-----------GCA-AAACA-CAC----TTG---CTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C----------------------TTG------A--CC---C--------ACTTTAGCT--AA--A--AATC-----TCGAGCTCCCTTCACATTGT---GA-ACCTCTTCAT--------AAAAAT--AAT-AAGATATTT----T-------ACAAAAAT--------GGAAACCA
gi|26 : g----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATTC-CTGAC---------------TTTA------A--AT---T--------GATCTACCTC-AAAgtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------AA----GCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATTTTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------ATTA------G------------------TTAACATA-AAAGA--AACC-----CCAGGGTTTCTGTTAA-TGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAGC-AAAATATCT----TTG--GAAACTAAAGATATTGAGCGAAAATCGTTT-T-TCTATatcaattctaa
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----TCA--A-AAT-----C-A---A----GT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT--------------------------T-GTCTTCAA-T-T--A--C-CC-GCAGT------T---------------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------T---T-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-T-------T-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----TCA--ACA-C-----C-A---A----GC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CA---AAA-----T-ATATTGAA-G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATA--------A--AG---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-T-------TAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC--AA---TCCAAAGCTTCC---T-TT--T-------T-A------------T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAAT-C--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATT-------------ATA-G-------------TC--TA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TA---TTTTTA--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TGT--A---------C-ATGTA----TG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----TA-----C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-A----AAA-G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATT--------G--AA---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------T-------T-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC--AA---TCCCATGCTTTC---C-TT--T-------C-A------------G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----TCA--A-A-T-----C-G---A----TC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTA---AGA-----T-ATATCATT-T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT------------------------------------------A--------T---------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-T-------T-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT--AA---TACCAACCTTAC------T--C-------CAA------------T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : -GTT---------TGAAAC-----T-----TAT--C-C--G--AA--------------AAAATT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTAAT-T-G-AA--A-CC---AGTTTC---T------ATT-----------AG-----------------------------------------------------------------------------T----A-------TT--T--A---GTAATGA--A---GACTGACC-A-----TAA-------T-------C----CA---A-T-------T-----T--------GGCT--C----A--AGA-GC--AA---TTCCAAGCCT-A---T-TT--C-------T-AGAGTCAAGAGCCT--GC---------A-------T---TA-------AA-AAATTCAT--CAAGA-Tg
gi|33 : -CC---CAA-----TA--T-G-CA----TAA--A-A---------A---A-------CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T----------------------AC---AAA-G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT--------G--AG---C-T--AA---------------------------------------------------C---T-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG---T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----TCA--A-A-C-----CCA---A----TC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CA---GAA-----T-GTCTTAAA-G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATT--------G--AG---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATTTTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C----C-TTGAC---------------TGTG------A--CC---C--------AATATGATTCAAAACC--AGTC-----TGAAGATCCCTTT------TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAAC-AAACCATTT----TAAAAGAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A---A----TC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T----AGA-----T-ATTTTAAA-GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATC--------A--AG---T-G--AA------A------------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTT-------T-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC--AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CA---AAA-------GTGTTAA--------------------------------------------G--AG---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------T---T-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA-------------------------GA----GTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATTTTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T----C-TTGAC---------------TTTG------A--TC---tttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----GA----ACAGAAAGT--AT----TCT-TT-----TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAA--CC---CCAAACAGAGATTAACCTC-AAATC--AATC-----TCAAGTTTCATTTGTA-TGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCATC-AAAATATCT----CTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGAAACTATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-T-C--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-CC-TATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TATCTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA---TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----TCA--A-AAC-----C-A---A----TC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCT---------AA--A-TT-TAAGT------T------ATT--------G--AGA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC--AA---TTTCAAGCTTCCA--T-TT--T-------T-T------------T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAG-TTATT----GATTAAACAGAAAC--CAT----TTT-TTGAATTA------AGTAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------TTTT------A--CC---A--------CA---AAATC-AATTA--AAT------TCTAGCTTCATTT
gi|42 : -TAG-TTAGT----TA----GCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTTTTT----AGCAA--------C--------A---------------TTGAT---------------TTTG------A--CC--------------TTGACCTC-AAATC--AATT-----TCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------T---G-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----C----AAT-------T-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC--AA---TTTGAATCTTCC---
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-GAAAACCTA--AG-TTACTATCTGA----GCGGAAACT-G------TTT-TTCCACTTTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C----A-TTGAC---------------TTT
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C----C-TTGAC---------------CTTA------AATCCAAAC--------GA--CACCGA-AAAC---AATC------CATGCTTCCTTTTGA--GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : TTTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T----C-TTGAC---------------AGTG------A--TC---C--------AAAATTCCTC-ATACA--AAGCCAATGTCAAGCCTTCTTTTCA-TGTAAGGgtccatt
gi|49 : -TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCATC-AAAATATCT----TTG--AAAAC--AAGTCATTGAATGGAAACCATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA---A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGAAT---CT--T-A-AC------A--A-A-CACGTTC-A---A----TT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTTTAA------A--A-CT-TTAGT------T------ATT--------A--AA---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A---------T-----G--------ACCC--C------------C--AA---TCCCATGCTTCA---T-TT--T-------A-A------------T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaCATCAAAAT-ATCTTTAA---AA--CTT-TAG-TTATT----AA----ATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C----CTTTGTC---------------TATG------A--CC---C--------------CC----------AATC-----CCATGCTTCATTTTAA-TGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattaaaacAA-GC-TTCCTA--TTC-TT-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATATTGAA-G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca-A---A----TC-TGAA-GC-TTCCTT------------------------AAA-----A-----TGA--A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTCGAA-G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTT--------G--
gi|52 : A--------------AAATTT--CA-T-------CA---AAAA----T-GTCTTGAA-G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATT--------G--AA---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : cacctt-----------GAAA---CA---------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC---T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----TCA--A-A-T-----C-A---A----GC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CA---AGA-----T-ATCTCAAA-G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATT--------G--AA---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-T-------T-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC--AA---CACCATTATTCC---T-TC--C-------C-A------------T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgTTC--CA-T-------CATAGAAA-----T-ATTTTCAA-G-C-AA--G-TT-TA--T------T------GTTTGTGGGAAA--AG---C-A--AA------A--A--CC-----A--------C----------------------T---T-----CT------------------------A---ACAAC----A---C--TGACG-G-----T---------C-------C----C----A-TGCTGCAAT-----T--------AAGT--T----A--A-A-ACCCAA---TCCCAAGCTTATAAAT-AT--A-------T-A------------A--GG----A----A-------CCTATA--A--AGAA-AATGTCAT--CAAAA-TATCTTAAG--G-AA--ACTTAAT---TTATTGGA
gi|7 : -C--T---TC---T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----TAA--A-A-C-----CCA---A----TC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CA---AAA-----T-ATCTT-AA-G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATT--------G--GA---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-T-------T-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC--AA---TCCCAATCCCCC---T-TT--T-------C-A------------T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tcagataccataccatttttctaattttagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-GAAA--CT--TAATTTATT----GG----ACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAATTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C--------GA------------------TA------A--CC---C--------AATTTACCTA-AAAAAC-AATC-----CCAATCCCCCTTTTCA-TGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCATC-AAAAT
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA---T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----TGA--A---------C-A---A----TC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CT---GAA-----A-ATCT---------AA--A-CT-GAAGT------T------ATT--------G--AA---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------T---TCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-T-------T-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT--AT---TATTAAGCTTCC---T-TT--T-------C-A------------T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--AC-CA
gi|9 : acggaTTTCTTC-AAAATAGCTAAAAT----GAAA--AAAGTTATTGTATGGAAAACATTT-T-TGTAtttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttA-----------T-----------GAAA---AA---------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----TAATGA-A-C-----T-A---A----TT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CA---AAC-----T-ATCTTAAA-G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATT--------G--AG---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------T---T-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-T-------T-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC--AA---GCTCGA-CTTCA---T-TT--C-------C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333333333333333333333 333333333 11111111111111111 1111111 2222222222222222222222222222222222222222222 22222 111111 11111111 4444444444 1111 1 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222222222222222222 11111111 1111111 66666666666666666666666666666 111 22222
lowQualScore : 8 5 0 0 444444444444444444444444444444 0 333333333 3 1 6666 5555 44444444444444444 444 2 4444444 7777777777777777777777777777777777777777777 3 77 00000 222222 666 99 1 3 3 33333333 3 7777777777 55 0 5 2222 3 5 6 5 444 99 77 1 1 777 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 44444 1 22 22222 33333 22 1 22 3333 333 44 5 2222222 2 1 222 1 44 1 22 1 11 1 0000000000 00000000000 11 1 11 11 66666666666666 111 1 44444444 55555 1 0 1 55555555 11 1 33 333333 555555 11 8888888888888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4444 222222 1 33333 6666666666666666666666666 1 44444 00000000 1111111 22 3 33 3 222 3333 0 3 2 9999999999 2 8888 33 00000000000000000000000000000 3 0 777 4 0 99 6 99 00000 1
lowQualScore : . . . . .............................. . ......... . . .... .... ................. ... . ....... ........................................... . .. ..... ...... ... .. . . . ........ . .......... .. . . .... . . . . ... .. .. . . ... . ..................................................................................................................................... . ..... . .. ..... ..... .. . .. .... ... .. . ....... . . ... . .. . .. . .. . .......... ........... .. . .. .. .............. ... . ........ ..... . . . ........ .. . .. ...... ...... .. ............. ............................................................................................ .... ...... . ..... ......................... . ..... ........ ....... .. . .. . ... .... . . . .......... . .... .. ............................. . . ... . . .. . .. ..... .
lowQualScore : 4 0 1 2 333333333333333333333333333333 2 888888888 3 8 1111 3333 22222222222222222 444 5 4444444 3333333333333333333333333333333333333333333 0 00 11111 000000 444 11 0 6 5 22222222 6 1111111111 55 6 7 1111 0 7 7 5 333 22 55 0 0 000 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 22222 3 99 77777 66666 00 4 22 0000 999 88 7 4444444 7 3 333 3 66 2 88 5 55 2 1111111111 00000000000 66 2 66 66 77777777777777 999 1 11111111 66666 1 1 1 00000000 77 2 66 555555 999999 77 2222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6666 888888 5 88888 5555555555555555555555555 6 00000 00000000 0000000 33 3 22 3 999 5555 7 8 0 4444444444 2 2222 22 66666666666666666666666666666 6 1 000 4 1 22 7 22 33333 0
consensus : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTATAG-TTATT----G-----AGCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTNACCTC-AAA--CN-AATC-----CCAAGCTTCC---TTTTNATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCATC-AAAATATC-T----T-A-GGAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----ACCATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--A----G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---T----CCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-GAAA--CTATAG-TTATT----G-----AGCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GATTTACCTC-AAA--CA-AATC-----TCAAGCTTCC---TTTTCATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCATC-AAAATATC-T----T---GGAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----ACCATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--A----G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---T----CCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTNGAG
gi|1 : ACTTTAAATTTC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-C-CGATACA-----------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----T---CA--T-A-T-----C-A-A---TT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AAAAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATTG--A----G---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------T--T-TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-TT-----T--------AACT--C----A--ATA-CT-AA---T-----CCAAACATTC-G-TT--T-------C-A----T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgCCTCATA-T-C--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-A-CTATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----T---CA--ATA-C-----T-A-A---T--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------AAAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT---A----A---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------T---T-----TC-C--T----ATTCTATTT--T-T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-TT-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC-AA---T----CCCAAACTTCC-T-TT--T-------C-A----TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-CC----A---CA--A-A-A-----C-A-A---TC-CCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AAAAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACTG--A----G---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------T---T-----TT-C--T----G-------T--T-T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----C---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CAAAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATTG--A----G---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------G---T-----TT-C--T----G-------T--T-TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-TT-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACTAA---T----CCCAAACTACA-T-TT--C-------C-A----T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-GAAA--AGATAA-T-ATT----G-----AGCGGAAAC--CA-----TGT-TTCTGTT----TT------------------C--------AGTA---A-T-----T-TGGAC---------------TTT-------A--TC---C--------ATTTCATCTTAAAA--CT-AATC-----CCAAACTACA---TTTCCATGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCATCAAAAATATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-A-CT-TACA-----------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----T---CA--A-A-A-----C-C-A---TAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C--------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACTG--A----G---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------T---T-----TT-C--T----AT------T--T-T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-GT-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA-AATATT----TCAAAACTTCC-T-TG--C-------C-A-------GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAAC-CATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATA-CTATTAA-----------G-----------GAAA---CTT--A-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTT-T----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T---TC----T---TA--A-A-A-----A-A-ATATTT-CAAA-AC-TTCCTT--GCC-A--GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T---------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----T---CA--A-A-AG----C-A-A---TT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATTA--A----G---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------A---T-----AT-C--A----AGAC----T--TGT--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-TT-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT-AA---T----CCCATGTTTCCAT-TTAACAAATGGAC-ACT--T--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----T---GGG-A-A-C-----C-A-A---TA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GAAAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATTG--A----A---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------T---T-----AT-T--T----A-------T--T-T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-TT-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC-AA---T----CCCAAATTGCC-CATT--C-------C------T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACTG--A----G---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------T---T-----TTAT--T----A-------T--T-T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGGGAA--CAAT---TTACT----G-----AGC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATT----TTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC-----C-TTGAT---------------TCAA------A--CC---T--------GATttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCATC-AAAATATC------------A---TAAATTCA-TGAGCAGA-A----A-CATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----A---CAT-A-A---------A-A-------CAA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CCAAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACCGTCA----GACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------T--T-TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACAAA---T----TTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCAT---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TAAAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACTG--A----G---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------T---T-----TT-C-------AGT-----T--T-T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-TT-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC-AA---T----Cgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----T---CA--A-G-A-----G-AGA---TT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CAAAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-C---------------------TTG--A----A---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------G---A-----TC-CATT----A-------TTAT-T--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-TT-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC-AA---T----CCAAAG-TTCT-T-TT--A-------C-A----T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-GAAA--CTATAG-TTATC----A-----CGCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTT----TTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GGTTTACCTC-AAA--TA-AATA-----TTCAGCGCCC---TTTCTATGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCATC-AAAATATC-----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGA-A----ACCAATT-T-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC-C--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-A-TTATCCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----T---AA--A-G-T-----T-A-A---TC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CAAAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACTG--A----A---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------G---C-----TT-C--T----G-------T--T-C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-TT-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC-AA---T----CCCAAGCTGAC-T-TT--C-------C-A----T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-AC-TTTCTT--TTC-AT-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------AAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATTA--A----G---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------C---T-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----T---CA--A-A-T-----C-A-A---TC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CTAAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATTA--G----A---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGT---T-----TT-T--T------------T--T-T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-TT-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC-AA---T----TTCAAGCCTCC-T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : C-TTCCTT--TTC-AG-GTC---------AGGAAC-----T-----TAT----------------------------------CA-T-------CAAAA-----T-ATTTAA-AA----C-A-AA--A-CT-CCAGT------A------ACTG--A----G---T-G--AA------A--A--C---------------T----------------------TACAT-----TT-C--T----A-------T--T-T------TTGAC----A--------ATC-T-----TAG-------C-------T----TTG--A-TT-----G--------ACTC--A----A--A-A-GC-AA---G----CCCAAGCTTAA-T-TA--T-------C-AGGTTT--GT----A----A-------TC--TATCC--ACAA-AATTTCATA-AAAAA-AATCTTGAA--G-AA--A
gi|23 : aTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----A---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CAAAG-----T-ATCTTA-AA----G-atggaagtttgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttc-A-TTATGCA------------------------AAA---CA---C-------------A---C-------------TTGCT---------------------A-----T-T--T-T--T--------------A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CAC-----TT--T-A-GC----T----A--A-A---------A-A---TC-TCGA-GC-TCCCTT----C-AC-ATT---------GTGAAC-----C-----TCT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TAAGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-C
gi|26 : gtctttaagttactaat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATT-C-CTGAC---------------TTTA------A--AT---T--------GATCTACCTC-AAAATCA-ATTC-----Tcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------A-----AGCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATT----TTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------ATTA------G------------------TTAACATA-AAA--GA-AACC-----CCAGGGTTTC---TGTTAATGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAGC-AAAATATC-T----TT--GGAAACTAAAGATATTGAGCGAA-A----ATCGTTT-T-TCTATaa
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----T---CA--A-AAT-----C-A-A---GT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT-----------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T-----------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------T---T-----TT-T--TTCG-AT------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-TT-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---GC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATAA--A----G---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------T--T-TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-TTAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC-AA---T----CCAAAGCTTCC-T-TT--T-------T-A----T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAAT-C--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TG--TA--C-A-T-----G-T-A---TG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----T----A-C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATTG--A----A---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AGT-----T--T-T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------TT-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC-AA---T----CCCATGCTTTC-C-TT--T-------C-A----G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-T-----C-G-A---TC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTAAGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT--------------------------------------A--------T----------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-TT-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT-AA---T----ACCAACCTTAC----T--C-------CAA----T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : AAAAT-TCATCAAAAT-ATCTTAA------------------TT----G-----A-----AAC--CAG----TTT---CTATTAGTATTT----AGTAA--------T--------GAAG---A-C--------TGAC---------------CATA------A--TC---C--------AATTTGGCTC-AAGAGCA-ATTC------CAAGCCTAT---TTCTAGAGTCAAGA-GCCTGCATTA--------AAAAATTCATC-AAGATg
gi|33 : gtttgaaacttatccgaa-CC---CAA-----TA--T-G-CA----T---AA--A-A---------A-A------CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T-------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATTG--A----G---C-T--AA---------------------------------------------------C---T-----TT-C--T----A-------T--T-TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----T---CA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CAGAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATTG--A----G---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATT----TTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C-----C-TTGAC---------------TGTG------A--CC---C--------AATATGATTCAAAA--CC-AGTC-----TGAAGATCCC---TTT-----TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAAC-AAACCATT-T----TAAAAGAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A-A---TC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T-AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATCA--A----G---T-G--AA------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTTT-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC-AA---T----CCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CAAAA-------GTGTTA-A---------------------------------------G--A----G---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------T---T-----TT-C--T----ATT-----T--T-T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA------------------------G-----AGTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATT----TTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T-----C-TTGAC---------------TTTG------A--TC---tttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----G-----AACAGAAAGT--AT----TCT-TT---------TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T-----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAA--CC---CCAAACAGAGATTAACCTC-AAA--TC-AATC-----TCAAGTTTCA---TTTGTATGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCATC-AAAATATC-T----CTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGA-A----ACTATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-T-C--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-C-CTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----T---CA--A-AAC-----C-A-A---TC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATTG--A----GA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AATT----T--T-T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-TT-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC-AA---T----TTCAAGCTTCCAT-TT--T-------T-T----T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAGT------T------ATTG--ATTAAA---CAG--AA------A--C--C------A--------T----------------------T---T-----TT-T--G----A-------A--T-T--AA--GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------T-----------TT-----T--------ACCA--CA---A--A-A-TC-AA---TTAAATTCTAGCTTCA-T-TT--
gi|42 : TAG-TTAGT----T-----AGCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTT----TTT----AGCAA--------C--------A----------------TTGAT---------------TTTG------A--CC--------------TTGACCTC-AAA--TC-AATT-----TCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------T---G-----TT-C--T----G-------T--T-TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC-AA---T----TTGAATCTTCC-
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-GAAAACCTA-AG-TTACTATCTG-----AGCGGAAACT-G------TTT-TTCCACT----TTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C-----A-TTGAC---------------TTT
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------CTTA------AATCCAAAC--------GA--CACCGA-AAA--C--AATC------CATGCTTCC---TTTTGA-GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : T----TTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T-----C-TTGAC---------------AGTG------A--TC---C--------AAAATTCCTC-ATA--CA-AAGCCAATGTCAAGCCTTC---TTTTCATGTAAGGgtccatt
gi|49 : TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCATC-AAAATATCTT----T---GAAAAC--AAGTCATTGAATGGA-A----ACCATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGA-----------A-TC----TTAACA--A-A-CACGTTC-A-A---TT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTT-AA---------A--A-CT-TTAGT------T------ATTA--A----A---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------T---T-----TT-C--T----A-------T--T-TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A--T-----G--------ACCC--C------------C-AA---T----CCCATGCTTCA-T-TT--T-------A-A----T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaAAA-ACCATCAAAAT-ATCTTTAA---AA--CTTTAG-TTATT----A-----AATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C-----CTTTGTC---------------TATG------A--CC---C--------------CC-----------AATC-----CCATGCTTCA---TTTTAATGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAA-GC-TTCCTA--TTC-TT-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca-A-A---TC-TGAA-GC-TTCCTT------------------------AAA-----A-----TGA--A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTTG--
gi|52 : A--------------AAATTT--CA-T-------CAAAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATTG--A----A---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : cacctt-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----T---CA--A-A-T-----C-A-A---GC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CAAGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATTG--A----A---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AT------T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-TT-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC-AA---C----ACCATTATTCC-T-TC--C-------C-A----T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgATCATAGAAAT-ATTTTCAA-GCAAGTTTATTG-TTTGT----GGGAAAAGCAAAAACC----------------ACT----TCT----AACAA--------C--------ACTG---A-CGGTCCC-ATG------------------CTG--------------C--------AATTAAGTTA-AAA--CCCAATC-----CCAAGCTTATAAAT----ATATAAGGA-ACCTATAAAG--------AAAATGTCATC-AAAATATC-T----TAA-GGAAACTTAATTTATTGGACAGATACCATACCATTT-T-TCTAATTTT
gi|7 : ttcc-C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----T---AA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATTG--G----A---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------T---T-----TT-C--T----AAT-----T--T-T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC-AA---T----CCCAATCCCCC-T-TT--T-------C-A----T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-GAAA--CT-TAATTTATT----G-----GACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAAT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C---------GA------------------TA------A--CC---C--------AATTTACCTA-AAA--AACAATC-----CCAATCCCCC---TTTTCATGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCATC-AAAAT
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----T---GA--A---------C-A-A---TC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CTGAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATTG--A----A---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------T---TCTATGTC-C--TTGACG-------T--T-C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT-AT---T----ATTAAGCTTCC-T-TT--T-------C-A----T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--ACCA
gi|9 : acggaTTTCTTC-AAAATAGC-TAAAAT---GAAAA---AAGTTATTGTATGGA-A----AACATTT-T-TGTAtttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttA-----------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----T---AATGA-A-C-----T-A-A---TT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CAAAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATTG--A----G---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------T---T-----TT-C--T----AAC-----T--A-C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC-AA---G----CTCGA-CTTCA-T-TT--C-------C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 222222222 11111111111111111 1111111 33333333333333333333333333333333333333333333 1111 11111111 333333333 1111 1 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222222222222222222 11111111 1111111 66666666666666666666666666666 111 1111 11 22222
lowQualScore : 6 4 1 00000000000000000000000000000000 777777777 3 66 5555 5555 0 22222222222222222 444 2 3333333 22222222222222222222222222222222222222222222 2 4 999 2 1111 77777 2 2 6666 0 2 2 00000000 3 3 2 444444444 88 5 0000 5 5 5 5 444 99 77 1 1 777 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 44444 1 22 22222 33333 22 1 22 3333 333 44 5 2222222 2 1 222 1 44 1 22 1 11 1 0000000000 00000000000 11 1 11 11 66666666666666 11 1 44444444 55555 1 1 444444 1 11 1 44 333333 666666 11 9999999999999 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444 222 22 1 44444 5555555555555555555555555 1 44444 00000000 0000000 22 3 33 3 333 3333 1 4 2 9999999999 2 33 33 00000000000000000000000000000 4 1 222 5 2222 11 00000
lowQualScore : . . . ................................ ......... . .. .... .... . ................. ... . ....... ............................................ . . ... . .... ..... . . .... . . . ........ . . . ......... .. . .... . . . . ... .. .. . . ... . ..................................................................................................................................... . ..... . .. ..... ..... .. . .. .... ... .. . ....... . . ... . .. . .. . .. . .......... ........... .. . .. .. .............. .. . ........ ..... . . ...... . .. . .. ...... ...... .. ............. ........................................................................................ .... ... .. . ..... ......................... . ..... ........ ....... .. . .. . ... .... . . . .......... . .. .. ............................. . . ... . .... .. .....
lowQualScore : 4 4 9 99999999999999999999999999999999 000000000 1 22 7777 0000 2 88888888888888888 111 4 0000000 00000000000000000000000000000000000000000000 7 8 444 9 2222 11111 8 1 5555 6 9 4 44444444 1 1 1 111111111 55 0 6666 0 0 7 5 333 22 55 0 0 000 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 22222 3 99 77777 66666 00 4 22 0000 999 88 7 4444444 7 3 333 3 66 2 99 3 88 2 2222222222 11111111111 77 2 77 77 99999999999999 66 2 55555555 77777 2 2 555555 2 77 2 55 666666 111111 88 0000000000000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8888 777 11 6 00000 2222222222222222222222222 7 22222 44444444 8888888 44 5 33 5 000 7777 2 0 1 5555555555 4 44 44 99999999999999999999999999999 0 0 888 0 2222 00 33333
consensus : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAG-TTATT----G-----AGCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GAT-TNACCT-N-AA-A-CC-AATCC-----CAAGCTTCCTTTTNA---TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--A----G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---T----CCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAG-TTATT----G-----AGCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GAT-TNACCT-C-AA-A-CN-AATCC-----CAAGCTTCCTTTTNA---TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--A----G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---T----CCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
gi|1 : ACTTTAAATTTC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-C-CGATACA-----------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----T---CA--T-A-T-----C-A-A---TT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AAAAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATTG--A----G---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-TT-----T--------AACT--C----A--ATA-CT-AA---T-----CCAAACATTC-G-TT--T-------C-A--T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgCCTCATA-T-C--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-A-CTATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----T---CA--ATA-C-----T-A-A---T--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------AAAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT---A----A---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------TT-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-TT-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC-AA---T----CCCAAACTTCC-T-TT--T-------C-A--TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-CC----A---CA--A-A-A-----C-A-A---TC-CCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AAAAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACTG--A----G---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------TT-----TT-C--T----G-------TT--T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----C---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CAAAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATTG--A----G---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------GT-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-TT-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACTAA---T----CCCAAACTACA-T-TT--C-------C-A--T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-G--AAA--AGATAA-T-ATT----G-----AGCGGAAAC--CAT----GTT-T-CTGTT----TT------------------C--------AGTA---A-T-----T-TGGAC---------------TTT-------A--TC---C--------ATT-TCATCT-T-AA-AACT-AATCC-----CAAACTACATTTCCA---TGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCAT-CAAAAATATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-A-CT-TACA-----------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----T---CA--A-A-A-----C-C-A---TAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C--------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACTG--A----G---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-GT-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA-AATATT----TCAAAACTTCC-T-TG--C-------C-A-----GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAAC-CATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATA-CTATTAA-----------G-----------GAAA---CTT--A-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTT-T----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T---TC----T---TA--A-A-A-----A-A-ATATTT-CAAA-AC-TTCCTT--GCC-A--GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T---------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----T---CA--A-A-AG----C-A-A---TT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATTA--A----G---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------AT-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-TT-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT-AA---T----CCCATGTTTCCAT-TTAACAAATGGAC-ACTT--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----T---GGG-A-A-C-----C-A-A---TA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GAAAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATTG--A----A---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------TT-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-TT-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC-AA---T----CCCAAATTGCC-CATT--C-------C----T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACTG--A----G---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------TT-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGG--GAA--CAAT---TTACT----G-----AGC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATT----TTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC-----C-TTGAT---------------TCAA------A--CC---T--------GAT-ttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATC----A-----------TAAATTCA-TGAGCAGA-A----A--CATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----A---CAT-A-A---------A-A-------CAA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CCAAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACCGTCA----GACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACAAA---T----TTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCAT---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TAAAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACTG--A----G---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------TT-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-TT-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC-AA---T----Cgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----T---CA--A-G-A-----G-AGA---TT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CAAAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-CT---------------------TG--A----A---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------GA-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-TT-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC-AA---T----CCAAAG-TTCT-T-TT--A-------C-A--T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-G--AAA--CTATAG-TTATC----A-----CGCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTT----TTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTTG------A--CC---C--------GGT-TTACCT-C-AA-A-TA-AATAT-----TCAGCGCCCTTTCTA---TGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCAT-C-AAAATATC-----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGA-A----AC-CAATT-T-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC-C--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-A-TTATCCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----T---AA--A-G-T-----T-A-A---TC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CAAAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACTG--A----A---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------GC-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-TT-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC-AA---T----CCCAAGCTGAC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-AC-TTTCTT--TTC-AT-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------AAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATTA--A----G---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------CT-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----T---CA--A-A-T-----C-A-A---TC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CTAAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATTA--G----A---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGTT-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-TT-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC-AA---T----TTCAAGCCTCC-T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : CTTCCTTTTCA---GGTCAGGA-ACTTA-------------------TCAT-C-AAAATAT-TT--A--AAACAAAACTCCAGTAACTGAGTGAA-A----ACTTACAT-T-TCTATTTTT
gi|22 : aTATCATCAAAAT-AT-TTAAA-ACAAAA--CTCCAG-TAACT----G-----AGTGAAAACT-TAC----ATT-T-CTATT----TTT----G---A--------C--------AAT------------C-TTAGC---------------TTTG------A------------------T-TGACTC-A-AA-A-GC-AAGCC-----CAAGCTTAATTATCA---GGTTTGTA-ATCTATCCAC--------AAAATTTCATAA-AAAAAATCTTGAA--G---AAAATGGAAGTTgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|23 : acttccttttcaggtcaggaactTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----A---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CAAAG-----T-ATCTTA-AA----G-tgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttc-A-TTATGCA------------------------AAA---CA---C-------------A---C-------------TTGCT---------------------A-----T-T--T-T--T--------------A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CAC-----TT--T-A-GC----T----A--A-A---------A-A---TC-TCGA-GC-TCCCTT----C-AC-ATT---------GTGAAC-----C-----TCT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TAAGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-C
gi|26 : gtctttaagttactaat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATT-C-CTGAC---------------TTTA------A--AT---T--------GAT-CTACCT-CAAA-A-TC-AATTC-----TAAcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------A-----AGCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATT----TTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------ATTA------G------------------T-TAACAT-A-AA-A-GA-AACCC-----CAGGGTTTCTGTTAA---TGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAG-C-AAAATATCTT--T--G---GAAACTAAAGATATTGAGCGAA-A----AT-CGTTT-T-TCTAT
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----T---CA--A-AAT-----C-A-A---GT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT-----------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T-----------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------TT-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-TT-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---GC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATAA--A----G---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-TTAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC-AA---T----CCAAAGCTTCC-T-TT--T-------T-A--T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAAT-C--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TG--TA--C-A-T-----G-T-A---TG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----T----A-C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATTG--A----A---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------TT-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC-AA---T----CCCATGCTTTC-C-TT--T-------C-A--G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-T-----C-G-A---TC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTAAGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT--------------------------------------A--------T------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-TT-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT-AA---T----ACCAACCTTAC----T--C-------CAA--T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : GAA-ACTTATCCGA--------AAAAATTCAT-C-AAAATATCTT--A--ATT-GAAACCAg
gi|31 : gtttAAAAT-TCATCAAAAT-ATCTTAA--------------------TT----G-----A-----AAC--CAG----TTT---CTATTAGTATTT----AGTAA--------T--------GAAG---A-C--------TGAC---------------CATA------A--TC---C--------AAT-TTGGCT-C-AAGA-GC-AATTC-----CAAGCCTATTTCTAG---AGTCAAGA-GCCTGCATTA--------AAAAATTCAT-C-AAGATgtttctattagtatttagtaatgaagactgaccataatccaatttggctcaagagcaattccaagcctatttctagagtcaagagcctgcattaaaaaattcatcaagat
gi|33 : gtttgaaacttatccgaa-CC---CAA-----TA--T-G-CA----T---AA--A-A---------A-A------CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T-------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATTG--A----G---C-T--AA---------------------------------------------------CT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----T---CA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CAGAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATTG--A----G---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATT----TTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C-----C-TTGAC---------------TGTG------A--CC---C--------AATATGATTC-A-AA-A-CC-AGTCT-----GAAGATCCCTTT--------TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAA-C-AAACCATTTTAAA--A---GAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A-A---TC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T-AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATCA--A----G---T-G--AA------A---------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTTT-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC-AA---T----CCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CAAAA-------GTGTTA-A---------------------------------------G--A----G---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------TT-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA--------------------------G-----AGTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATT----TTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T-----C-TTGAC---------------TTTG------A--TC---tttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----G-----AACAGAAAGT--AT----TCT-TT---------TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T-----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAA--CC---CCAAACAGAGAT-TAACCT-C-AA-A-TC-AATCT-----CAAGTTTCATTTGTA---TGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCAT-C-AAAATATCTCTAA--G---GAAACCAATGTAATTGTACGGA-A----AC-TATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-T-C--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-C-CTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----T---CA--A-AAC-----C-A-A---TC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATTG--A----GA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-TT-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC-AA---T----TTCAAGCTTCCAT-TT--T-------T-T--T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAGT------T------ATTG--ATTAAA---CAG--AA------A--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-T--G----A-------AT--T--AA--GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------T-----------TT-----T--------ACCA--CA---A--A-A-TC-AA---TTAAATTCTAGCTTCA-T-TT--
gi|42 : TAG-TTAGT----T-----AGCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTT----TTT----AGCAA--------C--------A----------------TTGAT---------------TTTG------A--CC--------------T-TGACCT-C-AA-A-TC-AATTT-----CAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------TG-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC-AA---T----TTGAATCTTCC-
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-G--AAAACCTA-AG-TTACTATCTG-----AGCGGAAACT-G------TTT-TTCCACT----TTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C-----A-TTGAC---------------TTT
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------CTTA------AATCCAAAC--------GA---CACCG-A-AA-A-C--AAT-C-----CATGCTTCCTTTTGA----GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : T----TTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T-----C-TTGAC---------------AGTG------A--TC---CAA------AAT-T--CCT-C-AT-A-CA-AAGCCAATGTCAAGCCTTCTTTTCA---TGTAAGGgtccatt
gi|49 : ---TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCAT-C-AAAATATCTT--T--G---AAAAC--AAGTCATTGAATGGA-A----AC-CATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGA-----------A-TC----TTAACA--A-A-CACGTTC-A-A---TT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTT-AA---------A--A-CT-TTAGT------T------ATTA--A----A---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A--T-----G--------ACCC--C------------C-AA---T----CCCATGCTTCA-T-TT--T-------A-A--T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaAAA-ACCATCAAAAT-ATCTTTAA-----AA--CTTTAG-TTATT----A-----AATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C-----CTTTGTC---------------TATG------A--CC---C--------------------------CC-AATCC-----CATGCTTCATTTTAA---TGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAA-GC-TTCCTA--TTC-TT-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca-A-A---TC-TGAA-GC-TTCCTT------------------------AAA-----A-----TGA--A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTTG--
gi|52 : A--------------AAATTT--CA-T-------CAAAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATTG--A----A---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : caccttATATCGT--AATG---GAAAC--AAGTTACCGAGCACA-A----AC-CATGT-T-TCTATTTCTc
gi|6 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggct-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----T---CA--A-A-T-----C-A-A---GC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CAAGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATTG--A----A---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-TT-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC-AA---C----ACCATTATTCC-T-TC--C-------C-A--T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCagtaacagagacatgacctgatttacatcaaatcaagccttcgcttcctttcaatgttacatacataattataacaccaaattttatcaagatatctcaaaggaaactaaagttgccagtattgaacaaaaaacatttttctattttagtaacagtgatcgtgaagcttatctgatttaccccaaaatcaacaccattattccttcccatgttagaaacctatacaccaaatatcatcaaaatatc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgATCATAGAAAT-ATTTTCAA-G--CAAGTTTATTG-TTTGT----GGGAAAAGCAAAAACC----------------ACT----TCT----AACAA--------C--------ACTG---A-CGGTCCC-ATG------------------CTG--------------C--------AAT-TAAGTT-A-AA-A-CCCAATCC-----CAAGCTTA----TAAATATATAAGGA-ACCTATAAAG--------AAAATGTCAT-C-AAAATATCTTA-A--G---GAAACTTAATTTATTGGACAGATACCATAC-CATTT-T-TCTAATTTT
gi|7 : ttcc-C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----T---AA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATTG--G----A---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC-AA---T----CCCAATCCCCC-T-TT--T-------C-A--T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-G--AAA--CT-TAATTTATT----G-----GACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAAT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C---------GA------------------TA------A--CC---C--------AAT-TTACCTAA-AA-A-AC-AATCC-----CAATCCCCCTTTTCA---TGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCAT-C-AAAAT
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----T---GA--A---------C-A-A---TC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CTGAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATTG--A----A---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------TTCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT-AT---T----ATTAAGCTTCC-T-TT--T-------C-A--T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--ACCA
gi|9 : acggaA-----------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----T---AATGA-A-C-----T-A-A---TT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CAAAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATTG--A----G---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------TT-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC-AA---G----CTCGA-CTTCA-T-TT--C-------C-tttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 222222222 11111111111111111 1111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111 333333333 1111 1 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222222222222222222222 11111111 1111111 66666666666666666666666666666 111 1111 11 22222
lowQualScore : 6 4 1 00000000000000000000000000000000 777777777 3 66 5555 5555 0 22222222222222222 444 2 3333333 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 66 2 0 2 2 6666 0 2 2 00000000 3 3 2 444444444 88 5 0000 5 5 5 5 444 99 77 1 1 777 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 44444 1 22 22222 33333 22 1 22 3333 333 44 5 2222222 2 1 222 1 44 1 22 1 11 1 0000000000 00000000000 11 1 11 11 66666666666666 11 1 44444444 55555 1 1 444444 1 11 1 44 333333 666666 11 9999999999999 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4444 222 22 1 44444 5555555555555555555555555 1 44444 00000000 0000000 22 3 33 3 333 3333 1 4 2 9999999999 2 33 33 00000000000000000000000000000 4 1 222 5 2222 11 00000
lowQualScore : . . . ................................ ......... . .. .... .... . ................. ... . ....... ....................................................... . .. . . . . .... . . . ........ . . . ......... .. . .... . . . . ... .. .. . . ... . ..................................................................................................................................... . ..... . .. ..... ..... .. . .. .... ... .. . ....... . . ... . .. . .. . .. . .......... ........... .. . .. .. .............. .. . ........ ..... . . ...... . .. . .. ...... ...... .. ............. ........................................................................................ .... ... .. . ..... ......................... . ..... ........ ....... .. . .. . ... .... . . . .......... . .. .. ............................. . . ... . .... .. .....
lowQualScore : 4 4 9 99999999999999999999999999999999 000000000 1 22 7777 0000 2 88888888888888888 111 4 0000000 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 44 9 6 8 1 5555 6 9 4 44444444 1 1 1 111111111 55 0 6666 0 0 7 5 333 22 55 0 0 000 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 22222 3 99 77777 66666 00 4 22 0000 999 88 7 4444444 7 3 333 3 66 2 99 3 88 2 2222222222 11111111111 77 2 77 77 99999999999999 66 2 55555555 77777 2 2 555555 2 77 2 55 666666 111111 88 0000000000000 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8888 777 11 6 00000 2222222222222222222222222 7 22222 44444444 8888888 44 5 33 5 000 7777 2 0 1 5555555555 4 44 44 99999999999999999999999999999 0 0 888 0 2222 00 33333
consensus : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAG-TTATT----G-----AGCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GAT-TNAC-CT-----AAA-A-NC-AATCCCAAGCTTCCTTTTNA---TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--A----G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---T----CCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAG-TTATT----G-----AGCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GAT-TNAC-CT-----NAA-A-CC-AATCCCAAGCTTCCTTTTNA---TGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--A----G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---T----CCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
gi|1 : ACTTTAAATTTC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-C-CGATACA-----------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----T---CA--T-A-T-----C-A-A---TT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AAAAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATTG--A----G---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-TT-----T--------AACT--C----A--ATA-CT-AA---T-----CCAAACATTC-G-TT--T-------C-A--T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgCCTCATA-T-C--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-A-CTATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----T---CA--ATA-C-----T-A-A---T--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------AAAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT---A----A---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------TT-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-TT-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC-AA---T----CCCAAACTTCC-T-TT--T-------C-A--TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-CC----A---CA--A-A-A-----C-A-A---TC-CCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AAAAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACTG--A----G---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------TT-----TT-C--T----G-------TT--T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----C---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CAAAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATTG--A----G---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------GT-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-TT-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACTAA---T----CCCAAACTACA-T-TT--C-------C-A--T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-G--AAA--AGATAA-T-ATT----G-----AGCGGAAAC--CAT----GTT-T-CTGTT----TT------------------C--------AGTA---A-T-----T-TGGAC---------------TTT--------ATCC--------ATT-TCAT-CT-----TAA-AACT-AATCCCAAACTACATTTCCA---TGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCAT-CAAAAATATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-A-CT-TACA-----------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----T---CA--A-A-A-----C-C-A---TAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C--------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACTG--A----G---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-GT-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA-AATATT----TCAAAACTTCC-T-TG--C-------C-A-----GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAAC-CATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATA-CTATTAA-----------G-----------GAAA---CTT--A-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTT-T----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T---TC----T---TA--A-A-A-----A-A-ATATTT-CAAA-AC-TTCCTT--GCC-A--GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T---------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----T---CA--A-A-AG----C-A-A---TT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATTA--A----G---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------AT-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-TT-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT-AA---T----CCCATGTTTCCAT-TTAACAAATGGAC-ACTT--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----T---GGG-A-A-C-----C-A-A---TA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GAAAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATTG--A----A---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------TT-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-TT-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC-AA---T----CCCAAATTGCC-CATT--C-------C----T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACTG--A----G---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------TT-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGG--GAA--CAAT---TTACT----G-----AGC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATT----TTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC-----C-TTGAT---------------TCA-A------ACCT--------GAT-ttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATC----A-----------TAAATTCA-TGAGCAGA-A----A--CATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----A---CAT-A-A---------A-A-------CAA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CCAAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACCGTCA----GACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACAAA---T----TTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCAT---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TAAAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACTG--A----G---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------TT-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-TT-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC-AA---T----Cgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----T---CA--A-G-A-----G-AGA---TT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CAAAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-CT---------------------TG--A----A---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------GA-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-TT-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC-AA---T----CCAAAG-TTCT-T-TT--A-------C-A--T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-G--AAA--CTATAG-TTATC----A-----CGCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTT----TTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GGT-TTAC-CT-----CAA-A-TA-AATATTCAGCGCCCTTTCTA---TGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCAT-C-AAAATATC-----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGA-A----AC-CAATT-T-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC-C--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-A-TTATCCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----T---AA--A-G-T-----T-A-A---TC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CAAAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACTG--A----A---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------GC-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-TT-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC-AA---T----CCCAAGCTGAC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-AC-TTTCTT--TTC-AT-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------AAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATTA--A----G---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------CT-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----T---CA--A-A-T-----C-A-A---TC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CTAAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATTA--G----A---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGTT-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-TT-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC-AA---T----TTCAAGCCTCC-T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : CTTCCTTTTCA---GGTCAGGA-ACTTA-------------------TCAT-C-AAAATAT-TT--A--AAACAAAACTCCAGTAACTGAGTGAA-A----ACTTACAT-T-TCTATTTTT
gi|22 : aTATCATCAAAAT-AT-TTAAA-ACAAAA--CTCCAG-TAACT----G-----AGTGAAAACT-TAC----ATT-T-CTATT----TTT----G---A--------C--------AAT------------C-TTAGC---------------TTT-G------A-------------T-TGAC-TC-----AAA-A-GC-AAGCCCAAGCTTAATTATCA---GGTTTGTA-ATCTATCCAC--------AAAATTTCATAA-AAAAAATCTTGAA--G---AAAATGGAAGTTgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|23 : acttccttttcaggtcaggaactTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----A---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CAAAG-----T-ATCTTA-AA----G-tgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttc-A-TTATGCA------------------------AAA---CA---C-------------A---C-------------TTGCT---------------------A-----T-T--T-T--T--------------A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CAC-----TT--T-A-GC----T----A--A-A---------A-A---TC-TCGA-GC-TCCCTT----C-AC-ATT---------GTGAAC-----C-----TCT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TAAGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-C
gi|26 : gtctttaagttactaat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATT-C-CTGAC---------------TTT-A------AATT--------GAT-CTAC-CTC----AAA-A-TC-AATTCTAAcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------A-----AGCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATT----TTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------ATT-A------G-------------T-TAAC-AT-----AAA-A-GA-AACCCCAGGGTTTCTGTTAA---TGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAG-C-AAAATATCTT--T--G---GAAACTAAAGATATTGAGCGAA-A----AT-CGTTT-T-TCTAT
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----T---CA--A-AAT-----C-A-A---GT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT-----------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T-----------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------TT-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-TT-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---GC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATAA--A----G---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-TTAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC-AA---T----CCAAAGCTTCC-T-TT--T-------T-A--T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAAT-C--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TG--TA--C-A-T-----G-T-A---TG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----T----A-C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATTG--A----A---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------TT-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC-AA---T----CCCATGCTTTC-C-TT--T-------C-A--G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-T-----C-G-A---TC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTAAGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT--------------------------------------A--------T------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-TT-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT-AA---T----ACCAACCTTAC----T--C-------CAA--T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : GAA-ACTTATCCGA--------AAAAATTCAT-C-AAAATATCTT--A--ATT-GAAACCAg
gi|31 : gtttAAAAT-TCATCAAAAT-ATCTTAA--------------------TT----G-----A-----AAC--CAG----TTT---CTATTAGTATTT----AGTAA--------T--------GAAG---A-C--------TGAC---------------CAT-A------ATCC--------AAT-TTGG-CT-----CAAGA-GC-AATTCCAAGCCTATTTCTAG---AGTCAAGA-GCCTGCATTA--------AAAAATTCAT-C-AAGATgtttctattagtatttagtaatgaagactgaccataatccaatttggctcaagagcaattccaagcctatttctagagtcaagagcctgcattaaaaaattcatcaagat
gi|33 : gtttgaaacttatccgaa-CC---CAA-----TA--T-G-CA----T---AA--A-A---------A-A------CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T-------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATTG--A----G---C-T--AA---------------------------------------------------CT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----T---CA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CAGAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATTG--A----G---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATT----TTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C-----C-TTGAC---------------TGT-G------ACCC--------AATATGAT-TC-----AAA-A-CC-AGTCTGAAGATCCCTTT--------TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAA-C-AAACCATTTTAAA--A---GAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A-A---TC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T-AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATCA--A----G---T-G--AA------A---------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTTT-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC-AA---T----CCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CAAAA-------GTGTTA-A---------------------------------------G--A----G---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------TT-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA--------------------------G-----AGTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATT----TTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T-----C-TTGAC---------------TTT-G------ATCtttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----G-----AACAGAAAGT--AT----TCT-TT---------TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T-----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTT-GCAACCAACCCCAAACAGAGAT-TAAC-CT-----CAA-A-TC-AATCTCAAGTTTCATTTGTA---TGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCAT-C-AAAATATCTCTAA--G---GAAACCAATGTAATTGTACGGA-A----AC-TATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-T-C--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-C-CTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----T---CA--A-AAC-----C-A-A---TC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATTG--A----GA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-TT-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC-AA---T----TTCAAGCTTCCAT-TT--T-------T-T--T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAGT------T------ATTG--ATTAAA---CAG--AA------A--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-T--G----A-------AT--T--AA--GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------T-----------TT-----T--------ACCA--CA---A--A-A-TC-AA---TTAAATTCTAGCTTCA-T-TT--
gi|42 : TAG-TTAGT----T-----AGCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTT----TTT----AGCAA--------C--------A----------------TTGAT---------------TTT-G------ACC-----------T-TGAC-CT-----CAA-A-TC-AATTTCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------TG-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC-AA---T----TTGAATCTTCC-
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-G--AAAACCTA-AG-TTACTATCTG-----AGCGGAAACT-G------TTT-TTCCACT----TTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C-----A-TTGAC---------------TTT-
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------CTTAA------ATCC--------AAA-CGACACC-----GAA-A-AC-AAT-CCATGCTTCCTTTTGA----GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : T----TTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T-----C-TTGAC---------------AGT-G------ATCCAA------AAT-T--C-CTCATACAAA-G-CC-AATGTCAAGCCTTCTTTTCA---TGTAAGGgtccatt
gi|49 : ---TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCAT-C-AAAATATCTT--T--G---AAAAC--AAGTCATTGAATGGA-A----AC-CATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGA-----------A-TC----TTAACA--A-A-CACGTTC-A-A---TT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTT-AA---------A--A-CT-TTAGT------T------ATTA--A----A---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A--T-----G--------ACCC--C------------C-AA---T----CCCATGCTTCA-T-TT--T-------A-A--T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaAAA-ACCATCAAAAT-ATCTTTAA-----AA--CTTTAG-TTATT----A-----AATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C-----CTTTGTC---------------TAT-G------ACCC------------------------------CC-AATCCCATGCTTCATTTTAA---TGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAA-GC-TTCCTA--TTC-TT-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca-A-A---TC-TGAA-GC-TTCCTT------------------------AAA-----A-----TGA--A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTTG--
gi|52 : A--------------AAATTT--CA-T-------CAAAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATTG--A----A---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : caccttATATCGT--AATG---GAAAC--AAGTTACCGAGCACA-A----AC-CATGT-T-TCTATTTCTc
gi|6 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggct-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----T---CA--A-A-T-----C-A-A---GC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CAAGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATTG--A----A---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-TT-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC-AA---C----ACCATTATTCC-T-TC--C-------C-A--T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCagtaacagagacatgacctgatttacatcaaatcaagccttcgcttcctttcaatgttacatacataattataacaccaaattttatcaagatatctcaaaggaaactaaagttgccagtattgaacaaaaaacatttttctattttagtaacagtgatcgtgaagcttatctgatttaccccaaaatcaacaccattattccttcccatgttagaaacctatacaccaaatatcatcaaaatatc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgATCATAGAAAT-ATTTTCAA-G--CAAGTTTATTG-TTTGT----GGGAAAAGCAAAAACC----------------ACT----TCT----AACAA--------C--------ACTG---A-CGGTCCC-ATG------------------CT-G---------C--------AAT-TAAG-TT-----AAA-A-CCCAATCCCAAGCTTA----TAAATATATAAGGA-ACCTATAAAG--------AAAATGTCAT-C-AAAATATCTTA-A--G---GAAACTTAATTTATTGGACAGATACCATAC-CATTT-T-TCTAATTTT
gi|7 : ttcc-C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----T---AA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATTG--G----A---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC-AA---T----CCCAATCCCCC-T-TT--T-------C-A--T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-G--AAA--CT-TAATTTATT----G-----GACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAAT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C---------GA------------------T-A------ACCC--------AAT-TTAC-CTA----AAA-A-AC-AATCCCAATCCCCCTTTTCA---TGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCAT-C-AAAAT
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----T---GA--A---------C-A-A---TC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CTGAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATTG--A----A---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------TTCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT-AT---T----ATTAAGCTTCC-T-TT--T-------C-A--T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--ACCA
gi|9 : acggaA-----------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----T---AATGA-A-C-----T-A-A---TT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CAAAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATTG--A----G---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------TT-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC-AA---G----CTCGA-CTTCA-T-TT--C-------C-tttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222222222222222 222222222 11111111111111111 1111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 333333333 1111 1 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 2222222222222222222222222 11111111 1111111 66666666666666666666666666666 111 1111 11 22222
lowQualScore : 6 4 1 77777777777777777 2 8888888888 6666 555555555 2 66 5555 4444 11111111111111111 333 2 1111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 2 66666 3 7777 1 0 2 2 00000000 3 3 2 444444444 88 5 0000 5 5 5 5 444 99 77 1 1 777 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 44444 1 22 22222 33333 22 1 22 3333 333 44 5 2222222 2 1 222 1 44 1 22 1 11 1 0000000000 00000000000 11 1 11 11 66666666666666 11 1 44444444 55555 1 1 444444 1 11 1 44 333333 666666 11 77777777 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 555555 5555 222 22 1 44444 4444444444444444444444444 1 44444 00000000 0000000 22 3 33 3 333 1 4 2 9999999999 2 33 33 00000000000000000000000000000 4 1 222 5 2222 11 00000
lowQualScore : . . . ................. . .......... .... ......... . .. .... .... ................. ... . ....... ...................................................... . . ..... . .... . . . . ........ . . . ......... .. . .... . . . . ... .. .. . . ... . ..................................................................................................................................... . ..... . .. ..... ..... .. . .. .... ... .. . ....... . . ... . .. . .. . .. . .......... ........... .. . .. .. .............. .. . ........ ..... . . ...... . .. . .. ...... ...... .. ........ ............................................................................. .. ...... .... ... .. . ..... ......................... . ..... ........ ....... .. . .. . ... . . . .......... . .. .. ............................. . . ... . .... .. .....
lowQualScore : 4 4 9 44444444444444444 9 4444444444 1111 999999999 9 22 3333 7777 66666666666666666 999 2 7777777 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 7 66666 6 5555 5 6 9 4 44444444 1 1 1 111111111 55 0 6666 0 0 7 5 333 22 55 0 0 000 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 22222 3 99 77777 66666 00 4 22 0000 999 88 7 4444444 7 3 333 3 66 2 99 3 88 2 2222222222 11111111111 77 2 77 77 99999999999999 66 2 55555555 77777 2 2 555555 2 77 2 55 777777 333333 88 77777777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 111111 0000 888 22 7 22222 7777777777777777777777777 7 33333 99999999 0000000 55 6 55 6 222 7 2 2 7777777777 4 44 44 99999999999999999999999999999 0 0 888 0 2222 00 33333
consensus : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAG-TTATT----G-----A----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GAT-TNAC-CT-----AAAANC-AAT----CCCAAGCTTCCTTTT---CATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAG-TTATT----G-----A----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GAT-TNAC-CT-----AAAANC-AAT----CCCAAGCTTCCTTTT---NATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
gi|1 : ACTTTAAATTTC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-C-CGATACA-----------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----T---CA--T-A-T-----C-A-A---TT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AAAAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATTG--AG---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-TT-----T--------AACT--C----A--ATA-CT-AA---T-CCAAACATTC-G-TT--T-------C-A--T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgCCTCATA-T-C--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-A-CTATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----T---CA--ATA-C-----T-A-A---T--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------AAAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT---AA---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------TT-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-TT-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC-AA---TCCCAAACTTCC-T-TT--T-------C-A--TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-CC----A---CA--A-A-A-----C-A-A---TC-CCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AAAAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACTG--AG---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------TT-----TT-C--T----G-------TT--T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----C---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CAAAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATTG--AG---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------GT-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-TT-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACTAA---TCCCAAACTACA-T-TT--C-------C-A--T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-G--AAA--AGATAA-T-ATT----G-----A----GCGGAAAC--CAT----GTT-T-CTGTT----TT------------------C--------AGTA---A-T-----T-TGGAC---------------TTT--------ATCC--------ATT-TCAT-CTT----AAAACT-AAT----CCCAAACTACATTTC---CATGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCAT-CAAAAATATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-A-CT-TACA-----------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----T---CA--A-A-A-----C-C-A---TAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C--------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACTG--AG---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-GT-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA-AATATTTCAAAACTTCC-T-TG--C-------C-A-----GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAAC-CATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATA-CTATTAA-----------G-----------GAAA---CTT--A-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTT-T----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T---TC----T---TA--A-A-A-----A-A-ATATTT-CAAA-AC-TTCCTT--GCC-A--GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T---------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----T---CA--A-A-AG----C-A-A---TT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATTA--AG---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------AT-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-TT-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT-AA---TCCCATGTTTCCAT-TTAACAAATGGAC-ACTT--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----T---GGG-A-A-C-----C-A-A---TA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GAAAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATTG--AA---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------TT-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-TT-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC-AA---TCCCAAATTGCC-CATT--C-------C----T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACTG--AG---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------TT-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGG--GAA--CAAT---TTACT----G-----A----GC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATT----TTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC-----C-TTGAT---------------TCA-A------ACCT--------GAT-ttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATC----A-----------TAAATTCA-TGAGCAGA-A----A--CATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----A---CAT-A-A---------A-A-------CAA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CCAAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACCGTCAGACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACAAA---TTTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCAT---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TAAAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACTG--AG---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------TT-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-TT-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC-AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----T---CA--A-G-A-----G-AGA---TT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CAAAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-CT---------------------TG--AA---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------GA-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-TT-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC-AA---TCCAAAG-TTCT-T-TT--A-------C-A--T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-G--AAA--CTATAG-TTATC----A-----C----GCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTT----TTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GGT-TTAC-CT-----CAAATA-AAT----ATTCAGCGCCCTTTC---TATGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCAT-C-AAAATATC-----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGA-A----AC-CAATT-T-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC-C--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-A-TTATCCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----T---AA--A-G-T-----T-A-A---TC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CAAAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACTG--AA---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------GC-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-TT-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC-AA---TCCCAAGCTGAC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-AC-TTTCTT--TTC-AT-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------AAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATTA--AG---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------CT-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----T---CA--A-A-T-----C-A-A---TC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CTAAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATTA--GA---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGTT-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-TT-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC-AA---TTTCAAGCCTCC-T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : CTTCCTTTT---CAGGTCAGGA-ACTTA-------------------TCAT-C-AAAATAT-TT--A--AAACAAAACTCCAGTAACTGAGTGAA-A----ACTTACAT-T-TCTATTTTT
gi|22 : aTATCATCAAAAT-AT-TTAAA-ACAAAA--CTCCAG-TAACT----G-----A----GTGAAAACT-TAC----ATT-T-CTATT----TTT----G---A--------C--------AAT------------C-TTAGC---------------TTT-G------A-------------T-TGAC-TC-----AAAAGC-AAG----CCCAAGCTTAATTAT---CAGGTTTGTA-ATCTATCCAC--------AAAATTTCATAA-AAAAAATCTTGAA--G---AAAATGGAAGTTgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|23 : acttccttttcaggtcaggaactTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----A---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CAAAG-----T-ATCTTA-AA----G-tgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttc-A-TTATGCA------------------------AAA---CA---C-------------A---C-------------TTGCT---------------------A-----T-T--T-T--T--------------A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CAC-----TT--T-A-GC----T----A--A-A---------A-A---TC-TCGA-GC-TCCCTT----C-AC-ATT---------GTGAAC-----C-----TCT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TAAGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-C
gi|26 : gtctttaagttactaat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATT-C-CTGAC---------------TTT-A------AATT--------GAT-CTAC-CTC----AAAATC-AAT----TCTAAcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacG-TTA------A-----A----GCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATT----TTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------ATT-A------G-------------T-TAAC-AT-----AAAAGA-AAC----CCCAGGGTTTCTGTT---AATGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAG-C-AAAATATCTT--T--G---GAAACTAAAGATATTGAGCGAA-A----AT-CGTTT-T-TCTAT
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----T---CA--A-AAT-----C-A-A---GT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT-----------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T-------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------TT-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-TT-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---GC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATAA--AG---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-TTAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC-AA---TCCAAAGCTTCC-T-TT--T-------T-A--T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAAT-C--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TG--TA--C-A-T-----G-T-A---TG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----T----A-C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATTG--AA---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------TT-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC-AA---TCCCATGCTTTC-C-TT--T-------C-A--G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-T-----C-G-A---TC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTAAGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT----------------------------------A--------T------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-TT-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT-AA---TACCAACCTTAC----T--C-------CAA--T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : GAA-ACTTATCCGA--------AAAAATTCAT-C-AAAATATCTT--A--ATT-GAAACCAg
gi|31 : gtttAAAAT-TCATCAAAAT-ATCTTAA--------------------TT----G-----A---------AAC--CAG----TTT---CTATTAGTATTT----AGTAA--------T--------GAAG---A-C--------TGAC---------------CAT-A------ATCC--------AAT-TTGG-CTC----AAGAGC-AAT----TCCAAGCCTATTTCT---AGAGTCAAGA-GCCTGCATTA--------AAAAATTCAT-C-AAGATgtttctattagtatttagtaatgaagactgaccataatccaatttggctcaagagcaattccaagcctatttctagagtcaagagcctgcattaaaaaattcatcaagat
gi|33 : gtttgaaacttatccgaa-CC---CAA-----TA--T-G-CA----T---AA--A-A---------A-A------CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T-------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATTG--AG---C-T--AA---------------------------------------------------CT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----T---CA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CAGAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATTG--AG---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATT----TTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C-----C-TTGAC---------------TGT-G------ACCC--------AATATGAT-TC-----AAAACC-AGT----CTGAAGATCCCTTT--------TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAA-C-AAACCATTTTAAA--A---GAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A-A---TC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T-AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATCA--AG---T-G--AA------A---------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTTT-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC-AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CAAAA-------GTGTTA-A---------------------------------------G--AG---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------TT-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA--------------------------G-----A----GTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATT----TTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T-----C-TTGAC---------------TTT-G------ATCtttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----G-----A----ACAGAAAGT--AT----TCT-TT---------TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T-----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTT-GCAACCAACCCCAAACAGAGAT-TAAC-CT-----CAAATC-AAT----CTCAAGTTTCATTTG---TATGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCAT-C-AAAATATCTCTAA--G---GAAACCAATGTAATTGTACGGA-A----AC-TATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-T-C--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-C-CTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----T---CA--A-AAC-----C-A-A---TC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATTG--AGA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-TT-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC-AA---TTTCAAGCTTCCAT-TT--T-------T-T--T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAG-TTATT----G-----ATTAAACAGAAAC--CAT----TTT-TTGAATT----A------AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-T------ACC---------------AC--------AAAATC-AATTAAATTCTAGCTTCATTT
gi|42 : TAG-TTAGT----T-----A----GCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTT----TTT----AGCAA--------C--------A----------------TTGAT---------------TTT-G------ACC-----------T-TGAC-CT-----CAAATC-AAT----TTCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------TG-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC-AA---TTTGAATCTTCC-
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-G--AAAACCTA-AG-TTACTATCTG-----A----GCGGAAACT-G------TTT-TTCCACT----TTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C-----A-TTGAC---------------TTT-
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------CTTAA------ATCC--------AAA-CGACACC-----GAAAAC-AAT-----CCATGCTTCCTTTT---GA-GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : T----TTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T-----C-TTGAC---------------AGT-G------ATCCAA------AAT-T--C-CTCATACAAAGCC-AAT----GTCAAGCCTTCTTTT---CATGTAAGGgtccatt
gi|49 : TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCAT-C-AAAATATCTT--T--G---AAAAC--AAGTCATTGAATGGA-A----AC-CATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGA-----------A-TC----TTAACA--A-A-CACGTTC-A-A---TT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTT-AA---------A--A-CT-TTAGT------T------ATTA--AA---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A--T-----G--------ACCC--C------------C-AA---TCCCATGCTTCA-T-TT--T-------A-A--T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaAAA-ACCATCAAAAT-ATCTTTAA-----AA--CTTTAG-TTATT----A-----A----ATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C-----CTTTGTC---------------TAT-G------ACCC----------------------------CC-AAT----CCCATGCTTCATTTT---AATGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAA-GC-TTCCTA--TTC-TT-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca-A-A---TC-TGAA-GC-TTCCTT------------------------AAA-----A-----TGA--A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTTG--
gi|52 : A--------------AAATTT--CA-T-------CAAAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATTG--AA---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : caccttATATCGT--AATG---GAAAC--AAGTTACCGAGCACA-A----AC-CATGT-T-TCTATTTCTc
gi|6 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggct-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----T---CA--A-A-T-----C-A-A---GC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CAAGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATTG--AA---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-TT-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC-AA---CACCATTATTCC-T-TC--C-------C-A--T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCagtaacagagacatgacctgatttacatcaaatcaagccttcgcttcctttcaatgttacatacataattataacaccaaattttatcaagatatctcaaaggaaactaaagttgccagtattgaacaaaaaacatttttctattttagtaacagtgatcgtgaagcttatctgatttaccccaaaatcaacaccattattccttcccatgttagaaacctatacaccaaatatcatcaaaatatc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgATCATAGAAAT-ATTTTCAA-G--CAAGTTTATTG-TTTGT----GGGAAAA----GCAAAAACC----------------ACT----TCT----AACAA--------C--------ACTG---A-CGGTCCC-ATG------------------CT-G---------C--------AAT-TAAG-TT-----AAAACCCAAT----CCCAAGCTTA----TAAATATATAAGGA-ACCTATAAAG--------AAAATGTCAT-C-AAAATATCTTA-A--G---GAAACTTAATTTATTGGACAGATACCATAC-CATTT-T-TCTAATTTT
gi|7 : ttcc-C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----T---AA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATTG--GA---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC-AA---TCCCAATCCCCC-T-TT--T-------C-A--T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-G--AAA--CT-TAATTTATT----G-----G----ACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAAT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C---------GA------------------T-A------ACCC--------AAT-TTAC-CTA----AAAAAC-AAT----CCCAATCCCCCTTTT---CATGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCAT-C-AAAAT
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----T---GA--A---------C-A-A---TC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CTGAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATTG--AA---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------TTCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT-AT---TATTAAGCTTCC-T-TT--T-------C-A--T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--ACCA
gi|9 : acggaA-----------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----T---AATGA-A-C-----T-A-A---TT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CAAAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATTG--AG---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------TT-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC-AA---GCTCGA-CTTCA-T-TT--C-------C-tttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222 222222222 11111111111111111 1111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 333333333 1 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 2222222222222222222222222 11111111 1111111 66666666666666666666666666666 111 1111 11 22222
lowQualScore : 6 4 1 666666666666666 2 2 8888888888 6666 555555555 2 66 5555 4444 11111111111111111 333 2 1111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33 2 66666 3 8888 1 0 2 2 00000000 2 2 1 555555555 88 4 9999 44 4 5 5 444 99 77 1 1 777 1 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 44444 1 22 22222 33333 22 1 22 3333 333 44 5 2222222 2 1 222 1 44 1 22 1 11 1 0000000000 00000000000 11 1 11 11 66666666666666 11 1 44444444 55555 1 1 444444 1 11 1 44 333333 666666 11 77777777 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 555555 5555 222 22 1 44444 4444444444444444444444444 1 44444 00000000 0000000 22 3 33 3 333 1 4 2 9999999999 2 33 33 00000000000000000000000000000 4 1 222 5 2222 11 00000
lowQualScore : . . . ............... . . .......... .... ......... . .. .... .... ................. ... . ....... ........................................................ .. . ..... . .... . . . . ........ . . . ......... .. . .... .. . . . ... .. .. . . ... . ..................................................................................................................................... . ..... . .. ..... ..... .. . .. .... ... .. . ....... . . ... . .. . .. . .. . .......... ........... .. . .. .. .............. .. . ........ ..... . . ...... . .. . .. ...... ...... .. ........ ............................................................................. .. ...... .... ... .. . ..... ......................... . ..... ........ ....... .. . .. . ... . . . .......... . .. .. ............................. . . ... . .... .. .....
lowQualScore : 4 4 9 111111111111111 9 9 4444444444 1111 999999999 9 22 3333 7777 66666666666666666 999 2 7777777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77 7 66666 6 7777 5 6 9 4 44444444 9 9 2 666666666 22 4 4444 66 4 0 5 333 22 55 0 0 000 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 22222 3 99 77777 66666 00 4 22 0000 999 88 7 4444444 7 3 333 3 66 2 99 3 88 2 2222222222 11111111111 77 2 77 77 99999999999999 66 2 55555555 77777 2 2 555555 2 77 2 55 777777 333333 88 77777777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 111111 0000 888 22 7 22222 7777777777777777777777777 7 33333 99999999 0000000 55 6 55 6 222 7 2 2 7777777777 4 44 44 99999999999999999999999999999 0 0 888 0 2222 00 33333
consensus : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAGTT-ATT----G-----A----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GA--T-TNAC-CT-----AAAAN-C-AAT----CCCAAGCTTCCTTTT---CATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAGTT-ATT----G-----A----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GA--T-TNAC-CT-----AAAAN-C-AAT----CCCAAGCTTCCTTTT---CATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
gi|1 : ACTTTAAATTTC--AATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAA-C-CGATACA-----------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A-----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----T---CA--T-A-T-----C-A-A---TT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-C--A--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AAAAA-----T-ATCTCA-AA----G-A-AA--A----TGAGT------A------ATTG--AG---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-TT-----T--------AACT--C----A--ATA-CT-AA---T-CCAAACATTC-G-TT--T-------C-A--T--GC----G----AGGAATCTT---TA--C--GCAA-AATATTAT---AAAA-TATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgCCTCATA-T-C--AATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAA-A-CTATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACA-A-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----T---CA--ATA-C-----T-A-A---T--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-C--G--CA--------------AAATAT--TA-T--------AAAA-----T-ATCTTA-AA----ATG-AA--A-CT-AAATT------T------ATT---AA---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------TT-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-TT-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC-AA---TCCCAAACTTCC-T-TT--T-------C-A--TTCTT----C----T-------T---CA--CTTGCAA-CATTTCATAAAAAAA-TATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgac--T---TT----T----A--------GTAA-CAGTAAC-----A--AA-------AA-----TT--T-A-CC----A---CA--A-A-A-----C-A-A---TC-CCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-TCT--------------T-----C-----TTC--A-CTTG--CA--------------ACATTT--CA-T-------AAAAAAA---T-ATTTTA-AA----G-A-GA--A-CTAAAAGT------T------ACTG--AG---CTG--AA------A--C--C------C--------C----------------------TT-----TT-C--T----G-------TT--T--aagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctat-----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----C---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-T--A--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CAAAA-----TCATTAGA-AA----A-G-A--------TAA--------T------ATTG--AG---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------GT-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-TT-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACTAA---TCCCAAACTACA-T-TT--C-------C-A--T--Gtcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAATCATT----A-G--AAA--AGATAAT--ATT----G-----A----GCGGAAAC--CAT----GTT-T-CTGTT----TT------------------C--------AGTA---A-T-----T-TGGAC---------------TTT--------ATCC--------AT--T-TCAT-CTT----AAAAC-T-AAT----CCCAAACTACATTTC---CATGCCAGGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCAT-CAAAAATATccaggaatctatatacattgaaaaaaaaatccatcaaaaatatataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcA-A-CT-TACA-----------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT---A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----T---CA--A-A-A-----C-C-A---TAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C--------------------------------------------------T-ATT----AA----G-G-AA--A-CT-TAAAT------T------ACTG--AG---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-GT-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA-AATATTTCAAAACTTCC-T-TG--C-------C-A-----GT----G----AGGAAC--T---TA--C--ATAA-AAGTTCAT----AAA-TATCTTAataa
gi|12 : tcatcaaaatCCCACTATACCTCAAAAC-CATAACC--AAGCTCCCTTTTCATGTTAGGAATA-CTATTAA-----------G-----------GAAA---CTT--A-------------A---A-------------TTACTG---A--GT---G--ATATCCA-----T-T--T-T--C---TATTT-T----AT-------GTAA-AAGTGAC-----CTTGA-CC---CAG-----TT--T---TC----T---TA--A-A-A-----A-A-ATATTT-CAAA-AC-TTCCTT--GCC-A--GTG---------AGGAAC-----T-------T--A-C--A--TA--------------AAAGTT--CA-T---------AAA-----T-ATCTTA-g
gi|13 : tcatcaaaataacttacaggaaacaagttattgacagaaactatttgcctatatttaggttgtgattatgactttcaGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----T---CA--A-A-AG----C-A-A---TT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-T--A--CC--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----C-A-CTTA-AA----A-GCAA--A-AT-CAAGT------T------ATTA--AG---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------AT-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-TT-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT-AA---TCCCATGTTTCCAT-TTAACAAATGGAC-ACTT--AT----AT---A-------T---CA--CCAACAA-AACTTCAT--AAAAA-TAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----T---GGG-A-A-C-----C-A-A---TA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-C--A--CA--------------AATTTT--CA-T-------GAAAA-----T-ATCTTG-AT----G-A-CA--A-TT-TTAGT------T------ATTG--AA---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------TT-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-TT-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC-AA---TCCCAAATTGCC-CATT--C-------C----T--GT----agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-C--G--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAT-----T-ATCTTA-AA----G-G-GA--A-C---AATT------T------ACTG--AG---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------TT-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAATT-ATCTTAAAGG--GAA--CAAT--TT-ACT----G-----A----GC-CAAACTGTAT----TTT-TATTATT----TTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC-----C-TTGAT---------------TCA-A------ACCT--------GA--T-ttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATC----A-----------TAAATTCA-TGAGCAGA-A----A--CATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G-----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----A---CAT-A-A---------A-A-------CAA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-A--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CCAAA-----T--TC------------------A-TC-CAAGT------T------ACCGTCAGACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACAAA---TTTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCAT---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-A-------TAAAAAGCGTT-AACGTA-AA----G-G-AA--A-CT-GAAGT------T------ACTG--AG---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------TT-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-TT-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC-AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----T---CA--A-G-A-----G-AGA---TT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-C--C--CA--------------AACTTT--CA-T-------CAAAA-----T-AACTTG-CA----C-A-AA--A-CT---------------------TG--AA---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------GA-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-TT-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC-AA---TCCAAAG-TTCT-T-TT--A-------C-A--T---T----A----A-------t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAAT-ATCGCAAA-G--AAA--CTATAGTT-ATC----A-----C----GCGGGAACT-CAT----TTTATTCTGTT----TTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GG--T-TTAC-CT-----CAAAT-A-AAT----ATTCAGCGCCCTTTC---TATGTTAAAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCAT-C-AAAATATC-----------GAAACTAAACTTATTGAGCAGA-A----AC-CAATT-T-TCTATTTTTTTTTT
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACAC-C--AATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAA-A-TTATCCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----T---AA--A-G-T-----T-A-A---TC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-C--A--CC--------------AAATTT--CA-A-------CAAAA-----T-ATCTCA-AC----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ACTG--AA---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------GC-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-TT-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC-AA---TCCCAAGCTGAC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--ACAA-AATGCCAT--CAATA-TATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-AC-TTTCTT--TTC-AT-TCTTTTTTTCATAGAAAC-----T-----AAT--G-C--A-------------------AATT---------------AAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGC------T------ATTA--AG---A-G--AA------T--A--CTG----G--------T----------------------CT-----TT-T--T----A-------tgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----T---CA--A-A-T-----C-A-A---TC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-C--A--C---------------GAATAG--CA-G-------CTAAA-----C-AATATA-AAT---G-G-AA--ACCT-TAACT------TA-----ATTA--GA---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGTT-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-TT-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC-AA---TTTCAAGCCTCC-T-TT--aagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : CTTCCTTTT---CAGGTCAGGA-ACTTA-------------------TCAT-C-AAAATAT-TT--A--AAACAAAACTCCAGTAACTGAGTGAA-A----ACTTACAT-T-TCTATTTTT
gi|22 : aTATCATCAAAAT-AT-TTAAA-ACAAAA--CTCCAGTA-ACT----G-----A----GTGAAAACT-TAC----ATT-T-CTATT----TTT----G---A--------C--------AAT------------C-TTAGC---------------TTT-G------A---------------T-TGAC-TC-----AAAAG-C-AAG----CCCAAGCTTAATTAT---CAGGTTTGTA-ATCTATCCAC--------AAAATTTCATAA-AAAAAATCTTGAA--G---AAAATGGAAGTTgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|23 : acttccttttcaggtcaggaactTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----A---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-C--A--CA--------------TATTTT--CA-T-------CAAAG-----T-ATCTTA-AA----G-tgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttc-A-TTATGCA------------------------AAA---CA---C-------------A---C-------------TTGCT---------------------A-----T-T--T-T--T--------------A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CAC-----TT--T-A-GC----T----A--A-A---------A-A---TC-TCGA-GC-TCCCTT----C-AC-ATT---------GTGAAC-----C-----TCT--T-C--A--TA--------------AAAAT----A-A-------TAAGA-----T-ATTTTACAAAAATG-G-AA--A-C
gi|26 : gtctttaagttactaat----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATT-C-CTGAC---------------TTT-A------AATT--------GA--T-CTAC-CTC----AAAAT-C-AAT----TCTAAcagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactacGTT-A------A-----A----GCGGAAAC--CAT----ATT-TC--ATT----TTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------ATT-A------G---------------T-TAAC-AT-----AAAAG-A-AAC----CCCAGGGTTTCTGTT---AATGTCTCAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAG-C-AAAATATCTT--T--G---GAAACTAAAGATATTGAGCGAA-A----AT-CGTTT-T-TCTAT
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----T---CA--A-AAT-----C-A-A---GT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-C--A--C---------------AAATTT-----------------------T-GTCTTC-AA----T-T--A--C-CC-GCAGT------T-------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------TT-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-TT-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-A---GC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-T--A---A--------------AAAGTA--CA-C-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-G-AT--A-CT-AATGT------T------ATAA--AG---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-TTAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC-AA---TCCAAAGCTTCC-T-TT--T-------T-A--T--GT----A----A-------cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAAT-C--AATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAA-ACCTATT----------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A-----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TG--TA--C-A-T-----G-T-A---TG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----T----A-C--G--CA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-A----A-AA----G-G-AT--A--T-GAAAT------TGCCATGATTG--AA---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------TT-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC-AA---TCCCATGCTTTC-C-TT--T-------C-A--G--GT----ggaaacctattatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-T-----C-G-A---TC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-C--A--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTAAGA-----T-ATATCA-TT----T-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATT----------------------------------A--------T------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-TT-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT-AA---TACCAACCTTAC----T--C-------CAA--T--GT----tagaaatgcaa
gi|31 : GAA-ACTTATCCGA--------AAAAATTCAT-C-AAAATATCTT--A--ATT-GAAACCAg
gi|31 : gtttAAAAT-TCATCAAAAT-ATCTTAA--------------------TT----G-----A---------AAC--CAG----TTT---CTATTAGTATTT----AGTAA--------T--------GAAG---A-C--------TGAC---------------CAT-A------ATCC--------AA--T-TTGG-CTC----AAGAG-C-AAT----TCCAAGCCTATTTCT---AGAGTCAAGA-GCCTGCATTA--------AAAAATTCAT-C-AAGATgtttctattagtatttagtaatgaagactgaccataatccaatttggctcaagagcaattccaagcctatttctagagtcaagagcctgcattaaaaaattcatcaagat
gi|33 : gtttgaaacttatccgaa-CC---CAA-----TA--T-G-CA----T---AA--A-A---------A-A------CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-A--A--TA--------------AAACTT--CA-T-------------------AC---A-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGT------T------ATTG--AG---C-T--AA---------------------------------------------------CT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A-----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----T---CA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-C--ATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CAGAA-----T-GTCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-TATGT------T------ATTG--AG---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATT----TTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C-----C-TTGAC---------------TGT-G------ACCC--------AA--TATGAT-TC-----AAAAC-C-AGT----CTGAAGATCCCTTT--------TCAGGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAA-C-AAACCATTTTAAA--A---GAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A-A---TC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------T-AGA-----T-ATTTTA-AA----GTT-AACTA-CT-TAAGT------TA-----ATCA--AG---T-G--AA------A---------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTTT-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC-AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-T--A--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CAAAA-------GTGTTA-A---------------------------------------G--AG---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------TT-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA--GTGTTAA--------------------------G-----A----GTGAAAATT--AT----TTT-TTCTATT----TTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T-----C-TTGAC---------------TTT-G------ATCtttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaT-ATT----G-----A----ACAGAAAGT--AT----TCT-TT---------TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T-----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTT-GCAACCAACCCCAAACAGAGA--T-TAAC-CT-----CAAAT-C-AAT----CTCAAGTTTCATTTG---TATGTTACAA-ACCTATACAC--------CATATTTCAT-C-AAAATATCTCTAA--G---GAAACCAATGTAATTGTACGGA-A----AC-TATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-T-C--AATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAA-C-CTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A-----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----T---CA--A-AAC-----C-A-A---TC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-T--A--CA--------------GAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCT-------------AA--A-TT-TAAGT------T------ATTG--AGA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-TT-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC-AA---TTTCAAGCTTCCAT-TT--T-------T-T--T--GTC---A----AAGAAAC-T---TATTT--GCAA-AATTTATT--CAAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagattaAGTT-ATT----G-----ATTAAACAGAAAC--CAT----TTT-TTGAATT----A------AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-T------ACC-----------------AC--------AAAAT-C-AATTAAATTCTAGCTTCATTT
gi|42 : TAGTT-AGT----T-----A----GCGGGAACT-T-T----TTT-TTCTTTT----TTT----AGCAA--------C--------A----------------TTGAT---------------TTT-G------ACC-------------T-TGAC-CT-----CAAAT-C-AAT----TTCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacatat--------T----------------------TG-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC-AA---TTTGAATCTTCC-
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcA-G--AAAACCTA-AGTT-ACTATCTG-----A----GCGGAAACT-G------TTT-TTCCACT----TTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C-----A-TTGAC---------------TTT-
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------CTTAA------ATCC--------AA--A-CGACACC-----GAAAA-C-AAT-----CCATGCTTCCTTTT---GA-GTAAGAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : T----TTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T-----C-TTGAC---------------AGT-G------ATCC--------AAAAT-T--C-CTCATACAAAGC-C-AAT----GTCAAGCCTTCTTTT---CATGTAAGGgtccatt
gi|49 : TGTCTGGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCAT-C-AAAATATCTT--T--G---AAAAC--AAGTCATTGAATGGA-A----AC-CATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGA-----------A-TC----TTAACA--A-A-CACGTTC-A-A---TT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-A--T--TA--------------AAAC----CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTT-AA---------A--A-CT-TTAGT------T------ATTA--AA---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A--T-----G--------ACCC--C------------C-AA---TCCCATGCTTCA-T-TT--T-------A-A--T--GTC---AAGACA-------TCTATA--C--GCAA-CATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaAAA-ACCATCAAAAT-ATCTTTAA-----AA--CTTTAGTT-ATT----A-----A----ATGGAAAAC-C-T----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C-----CTTTGTC---------------TAT-G------ACCC------------------------------C-C-AAT----CCCATGCTTCATTTT---AATGTCAAGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAA-GC-TTCCTA--TTC-TT-GCC---------AGGAAC-----T-----AAT--T-C--A--CA--------------ATATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATATTG-AA----G-A-AA--A-TT-TAAGT------T------AT
gi|51 : ca-A-A---TC-TGAA-GC-TTCCTT------------------------AAA-----A-----TGA--A-C--A--CA--------------AAATTC--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTCG-AA----G-G-AA--A-CT-AATGT------T------GTTG--
gi|52 : A--------------AAATTT--CA-T-------CAAAAA----T-GTCTTG-AA----G-G-AA--A-CT-T-AGT------T------ATTG--AA---C-A--TA------A--A--C------tat
gi|6 : caccttATATCGT--AATG---GAAAC--AAGTTACCGAGCACA-A----AC-CATGT-T-TCTATTTCTc
gi|6 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggct-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA-----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----T---CA--A-A-T-----C-A-A---GC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AAC--A--CC--------------AAATTT--TA-T-------CAAGA-----T-ATCTCA-AA----G-G-AA--A-CT-AAAGTTGCCAGT------ATTG--AA---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-TT-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC-AA---CACCATTATTCC-T-TC--C-------C-A--T--GTTAGAA----A-------CCTATA--C--ACCA-AATATCAT--CAAAA-TATCagtaacagagacatgacctgatttacatcaaatcaagccttcgcttcctttcaatgttacatacataattataacaccaaattttatcaagatatctcaaaggaaactaaagttgccagtattgaacaaaaaacatttttctattttagtaacagtgatcgtgaagcttatctgatttaccccaaaatcaacaccattattccttcccatgttagaaacctatacaccaaatatcatcaaaatatc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgATCATAGAAAT-ATTTTCAA-G--CAAGTTTATTGTT-TGT----GGGAAAA----GCAAAAACC----------------ACT----TCT----AACAA--------C--------ACTG---A-CGGTCCC-ATG------------------CT-G---------C--------AA--T-TAAG-TT-----AAAAC-CCAAT----CCCAAGCTTA----TAAATATATAAGGA-ACCTATAAAG--------AAAATGTCAT-C-AAAATATCTTA-A--G---GAAACTTAATTTATTGGACAGATACCATAC-CATTT-T-TCTAATTTT
gi|7 : ttcc-C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----T---AA--A-A-C-----CCA-A---TC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-A--A--GA--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTT--AA----G-G-AA--A-CT-TAATT------T------ATTG--GA---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC-AA---TCCCAATCCCCC-T-TT--T-------C-A--T--GT----A----AGGAAC--C---TA--TA-ATAA-AATGTCAT--CAAAA-Tagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|7 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaAAAATGTCATCAAAAT-ATCTTAAG-G--AAA--CT-TAATTTATT----G-----G----ACAGATAC--CATACCATTT-TTCTAAT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C---------GA------------------T-A------ACCC--------AA--T-TTAC-CT-----AAAAAAC-AAT----CCCAATCCCCCTTTT---CATGTAAGGA-ACCTATA-AT--------AAAATGTCAT-C-AAAAT
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccacttctaacaacactgacggtcccatgctgcaattaagttaaaacccaatcccaagcttataaatatataaggaacctataaagTG---G--AC---A--A-----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----T---GA--A---------C-A-A---TC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-T--A--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CTGAA-----A-ATCT-------------AA--A-CT-GAAGT------T------ATTG--AA---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------TTCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT-AT---TATTAAGCTTCC-T-TT--T-------C-A--T--G------------------T---TA--C---CAATCATTCC-C--CAAAGTTAT-TGAAA--A-GA--ACCA
gi|9 : acggaTTTCTT-C-AAAATAGCTA--A--AAT-GAAA--AAAGTTATTGTATGGA-A----AA-CATTT-T-TGTAtttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttA-----------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A-----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----T---AATGA-A-C-----T-A-A---TT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-C--A--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CAAAC-----T-ATCTTA-AA----G-T-CA--A-CT-AAAAT------T------ATTG--AG---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------TT-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC-AA---GCTCGA-CTTCA-T-TT--C-------C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
blockSeqs : T . C AACAAAACTCCA T C GGGAAA TTAA CATACCA A AT AGTA TTCA CCCAAGGGA TTC C GGTCCC ACTGACCCCATTTACCTTGCAACCAACCCCAAACAGAGATTAACCT AA C TAAAT C AAAT T C C . A . T AAAAC TA T CCAT CT . G . AC AT TT C T TA A CCATATTTCATCAAAATATCTCTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGAAACTATTCTGTCTATTTTCA G GGTCC T AC AATC CTTGC AA C AC CTCA TAA TG T CACGTT C G TAT A AG C AA T TA A TCCTTTACAG ATATAC TG A TT TT GTACAGGCCACTGC TT A TAGTTTCT AGCGT C C AAATG C CT C AA TGCCAG GCCATG TC ACCTG ATCATGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGTTTTTT AT ACAT ATAT TCC CC G CATCA CACTGATTCT T AAAAA AGCTAGAA CACTG CT T GC T TAT A A A AACAAATGGA A CT TC CAAAGAAACTTATTTG T T AAA T GA GG TTAT
blockSeqs : A . C AGCAAGTTTATT . T ATCTG . TGTAT . TC . . TTTTTAAGC . . AATTC AGTGATCCAAAATTCCTCATAC T . A C T G . A . . . T GAAG TC . . C . . AC . TG T T AC A CCAAAAACCATAAAAATATCTCAAAGAAAATGAGTAATTGAGCAAGACAATTTTTCTATTTTTA . . T T CC . . . A . G G C AG C . . . A . A T A . TTTTTTTCAT CTGTAA . . . . . . . A AA . . AT . . . A . A . CGGT TACAACCGTTTTTTTTCCTATTCTATT G TCA T . . . . AGCTTATCTG . . TA AAA . . A A . A A . T . . . CAAGACATCTATACG . T A . G . TATA
blockSeqs : A . C AGAAAACCTAA . C G . TCAT . TC . . C . . CT CTTAAATCCAAACGACACC G . C A C G . C . . . T AATT GG . . T . . AT . CA T C A T TCAAAATATCATAAATTCATGAGCAGAAACATTTGCTCTATTTTCA . . T T CG . . . C . . T C AT . . . . A . . T A . G ATAAT . . . . . . . C A . . TG . . . T . A . CTG AACAATTCTATGTCCTTGACG . TCA . . . . . CATGGGG . . C CA . . A . . A . . C . . . TAGAAACCTATACA . T C . G .
blockSeqs : A . G AGGGAACAAT . T A . TTAC . TG . . C . . C TTTAAATTGATCTACCTC T . T C C T . C . . . T AAAA TA . . C . . T . TC T A A T GGAAACAAGTTATTGACAGAAACTATTTGCCTATATTTAGGTT . . T C CA . . . T . . . C AC . . . . T . . C A . T C . . . . . . . C . . . GT . . . T . . . AAG TACCATACCATTTTTCTAAT . TTA . . . . . CCTAGAC . . . CA . . A . . G . . C . . . AAGGAACCTATAA . G C . A .
blockSeqs : A . C AGAAACTATA . T G . CAT . TC . . C . . C CATAATCCAATTTGGCTC G . C T A A . C . . . T TAAG CA . . C . . T . . G T A C GGAAACTTAAATTACTGAGTGATATCCATTTTCTATTTTAT . . T C CA . . . C . . . . C . . . . G . . C A . C C . . . . . . . G . . . G . . . C . . . CAA AACTGTTTTAATTTTCAGT . TCA . . . . . CTGTG . . . CA . . A . . A . . C . . . GAGGAACTTACA . T C .
blockSeqs : G . T GGAAACTTA . T A . CAG . TC . . T . . C TGTGACCCAATATGATTC G . T C A T . T . . . T AATG TT . . C . . A G ATATTATAGTCTAGGCCATTTATCTTATTTTTA . . A C CA . . . T . . . . A . . . . A . . T A . T T . . . . . . . C . . . A . . . T . . . CA AAAAACTATTTTTTTCTA . TAA . . . . . CCCG . . . AA . . T . . A . . A . . . ATATCACCAA . T C .
blockSeqs : . . C AAACTTTA . G G . TAT . TC . . T . . C TTTGACCCGGTTTACCT C . C A T T . C . . . T AAAT CA . . C . . C T CGAAACATCGGTTATTGAGCAAATTTCTTATA . . A C TG . . . G . . . . C . . . . G . . T A . G A . . . . . . . C . . . G . . . C . . . CG AACAAATATATCAAGAC . TTA . . . . . CCCA . . . C . . A . . G . . C . . . CTTCACTTG . A C .
blockSeqs : . . . . . C G . TAT . TC . . T . . C TAACCCAATTTACCT T . C A G T . C . . . G AAG TT . . A . A TGAAAAAAGTTATTGTATGGAAAACATTTTT . . T C CA . . . T . . . . A . . . . G . . T T . T T . . . . . . . T . . . A . . . G . . . TG AAAGATTTTTTTTCTA . AT . . . . . CCCC . . . T . . C . . G . . T . . . AATTACA . G .
blockSeqs : . . T G . CAT . C . . C . . C TTTGACCTTGACCT T . T C C T . T . . . T TG A AAACACACTTGCTATTTTTA . . T C AG . . . C . . . . A . . . . G . . C G . T T . . . . . . . C . . . G . . . A . . . AA AACCAATGATCCATTA . A . . . . . CACC . . . T . . G . . G . . T . . . TTAC . T
blockSeqs : . G G . TTT . C . . C . . C CTGCAATTAAGTT T . G C A T . C . . . T TG . . . T C CG . . . C . . . . C . . . . T . . T A . T A . . . . . . . C . . . G . . . A . . . CA ACCTTTTTTTTTCGAT . A . . . . . CTCC . . . T . . T . . G . . C . . .
blockSeqs : . T T . CCT . C . . C . . C TTTGATTGACTC A . C A C T . A . . . . . . . . T T CG . . . T . . . . C . . . . A . . C A . A C . . . . . . . C . . . G . . . T . . . CC AATTATTTTTTCTATT . A . . . . . CCTT . . . C . . T . . G . . T . . .
blockSeqs : . . A . TG . T . . A . . A ATTAGTTAACAT C . C C . . . . . . . . . T A TG . . . A . . . . C . . . . T . . T A . G C . . . . . . . C . . . C . . . G . . . TA CAACACTTTTTCTAAC . A . . . . . CCCA . . . C . . T . . C . . T . . .
blockSeqs : . . G . C . . . . C . . C TTTTACCAC C . C . . . . . . . . . G C CA . . . T . . . . A . . . . A . . C A . A C . . . . . . . T . . . G . . . A . . . TG ACTGTATTTTTATTA . A . . . . . CCCA . . . C . . C . . G . . C . . .
blockSeqs : . . C . . C TATGACCC C . . . . T A CG . . . T . . . . T . . . . G . . T A . T T . . . . . . . C . . . G . . . G . . . CA CAACATTTTTCTAGT . A . . . . . CCCA . . . C . . T . . G . . T . . .
blockSeqs : . . A . . . . . T C AG . . . T . . . . T . . . . G . . C A . T T . . . . . . . C . . . G . . . A . . . AG AACTTTTTTCTAATT . A . . . . . AAA . . . G . . C . . T . . T . . .
blockSeqs : . C . . . . . G T CA . . . G . . . . C . . . . G . . C A . C C . . . . . . . C . . . T . . . A . . . CG TACTGGTCTTTTTA . G . . . . . TCC . . . T . . C . . G . . C .
blockSeqs : . C . . . . . T C CA . . . C . . . . C . . . . T . . C A . T A . . . . . . . T . . . G . . . T . . . GG AAACCTTTTTTCTA . A . . . . . CCC . . . C . . T . . T . .
blockSeqs : . . T C CA . . . C . . . . T . . . . A . . T T . T C . . . . . . . C . . . G . . . T . . . TG AACCATGTTTCTG . A . . . . . CCT . . . C . . A . . T .
blockSeqs : . . A A CC . . . C . . . . T . . . . A . . C T . T C . . . . . . . C . . . T . . . T . . . CT ATCCATTTTCTAT . A . . . . . TCT . . . C . . A . . G
blockSeqs : . T C CG . . . C . . . . C . . . . A . . T A . T A . . . . . . . C . . . G . . . T . . . TG AACATTTTTCTAT . C . . . . . CCC . . . C . . A . . .
blockSeqs : . T T TG . . . C . . . . T . . . . A . . C A . A C . . . . . . . C . . . G . . . T . . . TG ACCCCTTTTCTG . A . . . . . CC . . . C . . . . .
blockSeqs : . . T CA . . . C . . . . C . . . . T . . C A . T C . . . . . . . C . . . G . . . A . . . TG AAAACTTATTTA . . . . . . . CC . .
blockSeqs : . . . TG . . . T . . . . C . . . . G . . T A . T A . . . . . . . C . . . G . . . T . . . CA AACATGCTTCTG . . . . . . .
blockSeqs : . CC . . . C . . . . . . . . . G . . T A . C A . . . . . . . C . . . G . . . A . . . CA CTTTCTA . . . . .
blockSeqs : . A . . . G . . . . . . . . . G . . C T . C C . . . . . . . C . . . G . . . T . . . TG AT .
blockSeqs : A . . . C . . . . . . . . . G . . A T . C T . . . . . . . C . . . G . . . G . . . G A .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . G . . T A . T A . . . . . . . C . . . G . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . A . . A A . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : AGAAACTTA****** TC ******** AAAG***** C* AC* C* CG*** C* A* CG****** A***** AGGAACCTATACG**************** C** G***
originalCons : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAA-G--AAA--CTATAGTT-ATT----G-----A----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GA--T-TNAC-CT-----AAAAN-C-AAT----CCCAAGCTTCCTTTT---CATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTT--A--G---GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAT-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--AG---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GT----A----A-------T---TA--C--GCAA-AATTTCAT--CAAAA-TATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
finalCons : CCAAAATATCATCAAAAT-ATCTTAAAGAAACTTA------GTT-ATT----G-----A----GCGGAAACT-CAT----TTT-TTCTATT----TTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GA--T-TNAC-CT-----AAAAN-C-AAT----CCCAAGCTTCCTTTT---CATGTCAGGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAATATCTTAAAG-----GAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-CATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAAC-C--AATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAA-A-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A-----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGAC-CCG---A-----TT--T-AC-C----T---CA--A-A-C-----C-A-A---TC-CCAA-GC-TTCCTT--TCCA-T-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-C--A--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTA-AA----G-G-AA--A-CT-NAAGT------T------ATTG--AGCG------AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TA-----GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TT--C-------C-A--T--GTAGGAACCTATACG----------------CAA-AATTTCATC--AAAA-TATCTTAAAG---GA--ACTAATATATTATTTGAG
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333333 111111111111 2222 11111111111111111 11111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 2222 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 11111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111 11111111 1111111 222222 22222222222222222 1111 11111111 22222
lowQualScore : 3 66 88 000000000000000 44 000000000000 6666 3333 2 66 4444 0 22222222222222222 444 2 00000 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 2 66666 444 0 1 8888888 333 2 0 99999999 0 2 2 2 5 00 88 3 7777 444 3 4 88 4444 33 1 1 1 2 77 1 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 44444 0 22 222 2 44444 22 1 4444444 444 55 111111111 3 1 22 66 1 33 0 22 1 555555555 11111111111 22 1 22 88888888888888 22 1 4444444 33333 1 0 55555 22 1 4 444444 999999 22 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 6666 222 44 1 33333 9999999999999999999999999 6 44444 00000000 0000000 22 5 44 3 222 0 1 2 333 2 222 7 222222 2 1 44 55555555555555555 0 3333 88888888 00000
lowQualScore : . .. .. ............... .. ............ .... .... . .. .... . ................. ... . ..... . ......................................................... . . ..... ... . . ....... ... . . ........ . . . . . .. .. . .... ... . . .. .... .. . . . . .. . . .................................................................................................................................... . ..... . .. ... . ..... .. . ....... ... .. ......... . . .. .. . .. . .. . ......... ........... .. . .. .............. .. . ....... ..... . . ..... .. . . ...... ...... .. ......................................................................................................... .... ... .. . ..... ......................... . ..... ........ ....... .. . .. . ... . . . ... . ... . ...... . . .. ................. . .... ........ .....
lowQualScore : 6 99 44 444444444444444 66 666666666666 5555 9999 9 33 7777 2 88888888888888888 111 4 99999 4 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 7 66666 444 5 6 1111111 888 7 8 11111111 2 5 5 4 6 77 44 3 1111 888 6 0 00 5555 44 0 0 0 5 33 4 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 88888 5 44 888 1 00000 22 6 0000000 444 44 666666666 1 5 00 11 5 55 2 33 4 777777777 66666666666 00 4 00 44444444444444 00 4 6666666 66666 4 9 66666 00 5 8 111111 555555 00 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7777 666 11 5 88888 4444444444444444444444444 4 00000 00000000 4444444 33 0 99 3 999 7 9 0 111 1 333 1 444444 9 5 22 00000000000000000 8 7777 55555555 33333
consensus : CCAAAATATCATCAAAA--TATC-TTAAAG--A-AA--CT--N-A--GTTACT----G-----A----GCGGAAACT-CATTTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GA--T-TGAC-CT-----AAAACC-AAT----CCCAAGCTTCC---TTTTCATG-------TCA-GGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAA-TATCTTAAAGGAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-C-ATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCANTNNACCTCAAAATCAATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNACGAAA-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-ATC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CTNAAGT------T------ATTG--A------G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TTC--C-A-T-G-T---A--GGA-ACCTAT--AC-------GC--------AAAATTTCAT--C-AAAATATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
Reference ( family-112 ) : CCAAAATATCATCAAAA--TATC-TTAAAG--A-AA--CT--T-A--GTTATT----G-----A----GCGGAAACT-CATTTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GA--T-TNAC-CT-----AAAANC-AAT----CCCAAGCTTCC---TTTTCATG-------TCA-GGA-ACCTATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAA-TATCTTAAAGGAAACTAAAGTTATTGAGCGGA-A----AC-C-ATTT-T-TCTATTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGATCCCCACTGTACCTCAAAACCAATCTNAAGCTTCCTTTNCATGTNAGGAAA-CTATNCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------A---G-------------TTATTG---A--GC---A--A----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-C-----C-A-ATC-CCAA-GC-TTCCTT--TCC-AT-GTT---------AGGAAC-----C-----TAT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTAAA-G-G-AA--A-CTNAAGT------T------ATTG--A------G---C-G--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--A-A-NC-AA---TCCCAAGCTTCC-T-TTC--C-A-T-G-T---A--GGA-ACCTAT--AC-------GC--------AAAATTTCAT--C-AAAATATCTTAAA--G-GA--ACTAATATATTATTTGAG
gi|1 : T-TTATATCTTT----AGTAA--------T--------AGTG---A-C-----T-TTAAA---------------TTT-------------------------------------------C-AAT----TCCAAGTTATC---TTTACATG-------TAA-GGA-ACCGATACAT--------CAAATCCCAT-C-AAAA-------AA---AAAGTAAAATTATTGTGCGGA-A----AA-C-A-TT-T-TCTATTTTT
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgCAATTCCAAGTTATCTTTACATGTAAGGAAC-CGATACA-----------T-----------CAAATCCCAT--C-------------A---AAAAAAAAGTAAAATTATTG---T--GCGGAA--A----ACAT--T-T--T-C--TATTTT----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----C---------------------------C----T---CA--T-A-T-----C-A-ATT-TTAA-AC-TTCCAT--TCC----GTT---------ACAAAA-----C-----TAT--A-CA--CC--------------AAAAAC--CA-T-------AAAAA-----T-ATCTCAAA-G-A-AA--A---TGAGT------A------ATTG--A------G---C----AA------G--A--C------AA-------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGAT------C-------C----C----A-TT-----T--------AACT--C----A--ATA-CT-AA---T-CCAAACATTC-G-TTT--C-A-T-G-CG--A--GGA-ATCTTT--AC-------GC--------AAAATATTAT----AAAATATCTTAAAATG-AA--ACTAA-AT-TTATTagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttCCTCATA-TCAATTTTAAACTTCCATTCC--GTTACAAAA-CTATACA-----------CCAAAAACCATAAAAA---TAT--CTCAAAGAAAATG-A---G-------------TAATTG---A--GC---A--AGACAA-----T-T--T-T--TC--TA----TTTTTA--------GTAA-CAATGAC-----CTTGA-TC---CCA-----TT--T-A-AC----T---CA--ATA-C-----T-A-AT--CCAA-AC-ATTCGT--TTC-AT-GCG---------AGGAAT-----C-----TTT--A-CG--CA--------------AAATAT--TA-T--------AAAA-----T-ATCTTAAA-ATG-AA--A-CTAAATT------T------ATT---A------A---C-A--AA------T--A--C------AACCGTTTTT----------------------TT-----TC-C--T----ATTCTATTTT--T--A---GTAAC----A---G--TAAC----------A-------A-------A----A----A-TT-----T--------ACCA--C----A--A-A-AC-AA---TCCCAAACTTCC-T-TTT--C-A-T---T-----------CTTCTTCACTT-----GC--------AACATTTCATAAA-AAAATATTTTAAA--GAGA--ACTAAaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttgcaacatttcataaaaaaatattttaaagagaactaaaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|1 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgacCAACATTTCATAAAAAAATATT-TTAAAG--AGAA--CTAAA-A--GTTACT----G-----A----GCTGAAACC-C--CTT-TTCTGTTTTC----Aaagttactgagctgaaaccccttttctgttttcaccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : agatatccaaagcaaattgtgtttatatctttagtaatagtgactttaaatttcaattccaagttatctttacatgtaaggaaccgatacatcaaatcccatcaaaaaaaaagtaaaattattgtgcggaaaacattttctatttttagtaacagtgaccctcatatcaattttaaacttccattccgttacaaaactatacaccaaaaaccataaaaatatctcaaagaaaatgagtaattgagcaagacaatttttctatttttagtaacaatgaccttgatcccatttaactcaatactaatccaaacattcgtttcatgcgaggaatctttacgcaaaatattataaaatatcttaaaatgaaactaaatttattaacaaatacaaccgttttttttcctattctatttttagtaacagtaacaaaaatttaccacaaaacaatcccaaacttccttttcattcttcttcacttg----A-----T-T--T-CAAT---TT----T----A--------TTAA-AAGTAAT-----ATTCA-TC---CGA-----TT--T-A-TT----C---CA--ACA-C-----C-A-ATC-ACAA-TC-TTC---------AT-ATC---------AGTAACATATAC-----TAT--A-TA--CAGTACAGGCCACTGCAAATA---CA---------CAAAA-----TCATTAGAAA-A-G-A-------TAA--------T------ATTG--A------G---C-G--GA------A--A--CC-----A--------T----------------------GT-----TT-C--T----G-------TT--TTCA---GTAAT--------T--TGGAC-T-----TTA-------T-------C----C----A-TT-----TC-------ATCT--T----A--A-A-ACTAA---TCCCAAACTACA-T-TTC--C-A-T-GCC---A--GGA-ATCTAT--AT-------ACATTGAAAAAAAAATCCAT--CAAAAATATccaaagaaaatggcaatgcgtgtattgtttcagaactgaatggaccgtttgaacaactcgtgttatacctatatagctgttgtacctataaacaatctgaccaagtttggttatagtttgacgaaacctaaatttgctacttcattagatgaaatcatcaatgttcaatcaatcaaggatcataactctgtctattccagtcccaaatgaccgagttataaaactcaaatgactgtctgaccacgtcacactctaatgaaaactgacgatatcacagtgctaataagagttaaatctgtacctccaaccaatcaagggccttagctgtcccctttttgtcccctataactgcaacatggactcctctgaacgatcgtggtatgtgataattgatgacgtttgatcatgacgtcatgacaactaaaatgataatgtgcttacaagggaaaagccaaccttttaaatcaaacaaggtcca
gi|10 : aagatattgagaagaaaattttAAATA-CA-CAAAA--T--CATTAGAA--A-AG--AT--A-A----TATT----G-----A----GCGGAAAC--CATGTT-T-CTGTTTT------------------C--------AGTA---A-T-----T-TGGAC---------------TTT--------ATCC--------AT--T-TCAT-CTT----AAAACT-AAT----CCCAAACTACA---TTTCCATG-------CCA-GGA-ATCTATATACATTGAAAAAAAAATCCAT-CAAAAA-TATataa
gi|12 : aagatattgagaagaaaattttatttcaattttattaaaagtaatattcatccgatttattccaacaccaatcacaatcttcatatcagtaacatatactatatacagtacaggccactgcAA-CT-TACA-----------G-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTATTG---ACAGA---A--ACT--A-----T-T--TGC--C---TA----T----ATTTAGGTTGTGA-TTATGAC-----TTTCA-CC---CAC-----TA--T-A-CC----T---CA--A-A-A-----C-C-ATAACCAA-GC-TCCCTT--TTC-AT-GTT---------AGGAA--------------T--A-C------------------------------------------------T-ATT---AA-G-G-AA--A-CTTAAAT------T------ACTG--A------G---T-G--AT------A--T--C------C--------A----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TT-AT--GTAAA----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----A-GT-----T--------TTCT--T----A--A-A-AA-AATATTTCAAAACTTCC-T-TGC--C-A---G-TG--A--GGA-ACT--T--AC-------AT--------AAAAGTTCAT-----AAATATCTTAataa
gi|13 : tcatcaaaatGAA-----CTGGA-CC---CAC-----TT--T-G-GT----T---CA--A-A-AG----C-A-ATT-CCAA--T-TTCCTA--TCA-AT---T---------AATAAC-----A-----TGT--C-TA--CC--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----C-A-CTTAAA-A-GCAA--A-ATCAAGT------T------ATTA--A------G---A-A--GA------A--A--C------AAA------T----------------------AT-----AT-C--A----AGAC----TTG-T--A---GTGAT----G---G--TGACC-T-----TGA-------C-------A----TGGGGA-TT-----T--------AGAC--T----A--A-A-AT-AA---TCCCATGTTTCC-A-TTTAAC-A-A-A-T---G--GAC-ACTTAT--ATATCACCAAC--------AAAACTTCAT--A-AAAATAACTT-AA--G-GC--ATTAAT-TATTAg
gi|14 : -C--T---T-----T----A--------GTAA-CATTGAC-----CACAA-CC---TGA-----TT--T-A-TC----T---GGG-A-A-C-----C-A-ATA-CCAA-GC-TTTCAT--TTT-TT-GTT---------AGAAAG-----T-----CAT--A-CA--CA--------------AATTTT--CA-T-------GAAAA-----T-ATCTTGAT-G-A-CA--A-TTTTAGT------T------ATTG--A------A---C-A--AA------A--A--A------A--------C----------------------TT-----AT-T--T----A-------TT--T------GTAGCT---G---G--TAACC-G-----TAA-------C-------C----CG---A-TT-----T--------ACCTAAA----A--A-A-TC-AA---TCCCAAATTGCC-CATTC--C---T-G-T---agc
gi|16 : aaataagtttgcataaaccaataaacagtttttctag---CAA-----TC--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-ATC-CCAA-GC-TTCCTT--CTC-GT-TTTCCTTTACAGAGGAAC-----T-----TAT--T-CG--CA--------------AAATTT--CA-T-------CAAAT-----T-ATCTTAAA-G-G-GA--A-C--AATT------T------ACTG--A------G---C-C--AA------ACTG--T------A--------T----------------------TT-----TTAT--T----A-------TT--T--taaaagcacttaa
gi|16 : CAAAATTTCATCAAAT--TATC-TTAAAG--G-GA--AC--A-A--TTTACT----G-----A----GC-CAAACTGTATTTT-TATTATTTTTTTCAAG-AA--------CCCAAGGGAAGTA---ACC-----C-TTGAT---------------TCA-A------ACCT--------GA--T-ttttcaagaacccaagggaagtaacccttgattcaaacctgatcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : caatctacctcaacaccaatcccaagcttccttctcgttttcctttacagaggaacttattcgCCAATACAC--------AAAATTTCAT-C-AAAA-TATCATAAA-----------TTCATGAGCAGA-A----AC---ATTTGC-TCTATTTTcaggtcatatgaataattcataagagtttctataacaataagtattcttaccaagatggttgaaatatgatgaaaa
gi|17 : TTCAT----------C-----------AAAA---TAT--C-------------ATAAA-------------TTCATG---A--GC---A--G----AAACA-T-T--TGC--TC--TA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CATGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----A---CAT-A-A---------A-A----CAA-GC-TTCCTT--TTC-AT-ATT---------AGGAAT-----A-----TAT--A-AA--CA--------------AAATTT--CA-T-------CCAAA-----T--TC--------------A-TCCAAGT------T------ACCGTCA------GACCT-G--AA------A--A---------AGATTT---T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTTAC----A---G--TGACT-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACTT--C----A--A-A-ACAAA---TTTCAAACTcagtaacagtgaccatgaccagatttaccacataaaacaagcttccttttcatattaggaatatataaacaaaatttcatccaaattcatccaagttaccgtcagacctgaaaaagattttttttctattttcagttacagtgactttgacccaatttacttcaaaacaaatttcaaactgc
gi|18 : ccaatacacaaaat-----T-T--T-T--C---TA----T----G--------TTAAGTAATGAC-----ATTGA-CCAATC-A-----TG--C-A-TCCTCAT---CA--A-A-C-----C-A-ATC-G-GA-TT-TTTTTT--TCC-AT-GTA---------AGTAAA-----C-----TAT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-A-------TAAAAAGCGTT-AACGTAAA-G-G-AA--A-CTGAAGT------T------ACTG--A------G---T-A--AA------A--A--CTGTTTTA--------A----------------------TT-----TT-C-------AGT-----TT--T--A---GTAAC----A---A--ATACC-T-----TG--------C-------CTAGAC----G-TT-----TTA------ACTT--CACTGA--A-A-CC-AA---TCgc
gi|19 : aagcagtcaatataagtaagataagacc-----T-T--T-T--T---T-----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----AT----------AA-----TT--C-A-AA----T---CA--A-G-A-----G-AGATT-CCAA-AC-TTTTGT--TTG-AT-TTG---------AGGAAT-----C-----TAT--C-CC--CA--------------AACTTT--CA-T-------CAAAA-----T-AACTTGCA-C-A-AA--A-CT--------------------TG--A------A---T-G--GA------A--A--CCA----A--------T----------------------GA-----TC-CATT----A-------TTATT--ACATGTAAC----A---G--TGACC-TCATCATGGC------C-------C----C----A-TT-----TAGCTAGAAACTT--CA---A--A-A-GC-AA---TCCAAAG-TTCT-T-TTA--C-A-T-t
gi|2 : tcCCAAAATATCACTAAAA--TATC-GCAAAG--A-AA--CTA-T-A--GTTATC----A-----C----GCGGGAACT-CATTTTATTCTGTTTTT----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-G------ACCC--------GG--T-TTAC-CT-----CAAATA-AAT----ATTCAGCGCCC---TTTCTATG-------TTA-AAA-ATCTATAAAC--------AAAATGTCAT-C-AAAA-TATC------GAAACTAAACTTATTGAGCAGA-A----AC-C-AATT-T-TCTATTTTTTTTTTtaa
gi|2 : CTTGATCCCTAC-GTACCTCAACACCAATCTGAAGCTTCCGTTTGATGTCAGGAAA-TTATCCA-----------C-----------GAAA---CAT--C-------------G---G-------------TTATTG---A--GC---A--A----A-----T-T--T-C--T---TA----T----A--------GTAA-CAGTGAC-----CTTGA-CC---CGA-----TT--T-A-TA----T---AA--A-G-T-----T-A-ATC-ACAA-TC-TCTCTT--TCC-AT-GTA---------AGGAAC-----C-----TGT--A-CA--CC--------------AAATTT--CA-A-------CAAAA-----T-ATCTCAAC-G-G-AA--A-CTAAAGT------T------ACTG--A------A---C-A--AA------A--A--C------A--------T----------------------GC-----TT-C--T----G-------TT--C--A---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CA------C----C----A-TT-----T--------ACAC--C----A--A-A-TC-AA---TCCCAAGCTGAC-T-TTC--C-A-T-G-T--------A-AT---T--AC-------AC--------AAAATGCCAT--C-AATATATCTCAAA--G-GAGGATTCATATA-TATTTGAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgatccctacgtacctcaacaccaatctgaagcttccgtttgatgtcaggaaattatccacgaaacatcggttattgagcaaatttcttatagtaacagtgaccttgacccgatttatataaagttaatcacaatctctctttccatgtaaggaacctgtacaccaaatttcaacaaaatatctcaacggaaactaaagttactgaacaaaaacatgcttctgttcagtaacagtgaccttgacaccatttacaccaaatcaatcccaagctgactttccatgtaattacacaaaatgccatcaatatatctcaaaggaggattcatatatatttgagtgag
gi|20 : ccaaaatatcactaaaatatcgcaaagaaactatagttatcacgcgggaactcattttattctgtttttagcaacagtgaccttgactttgacccggtttacctcaaataaatattcagcgccctttctatgttaaaaatctataaacaaaatgtcatcaaaatatcgaaactaaacttattgagcagaaaccaattttctatttttttttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAACTTTC---TTTTCATTCTTTTTTTCATAGA-AACTA-ATGC--------AAA------T-T-AAAA-TATCTTAAAGGAAACTAAAGCTATTAAGAGAA-T----AC-TGGTCT-T-TTTAtgag
gi|21 : GA-TC---CGA-----AT--T-A-TC----T---CA--A-A-T-----C-A-ATC-CCA--GT-TTTTTT--TCC-AT-GTT---------TGGAAC-----T-----AAT--A-CA--C---------------GAATAG--CA-G-------CTAAA-----C-AATATAAATG-G-AA--ACCTTAACT------TA-----ATTA--G------A---C-G--AA------A--T--C------A--------TGATTGCTGTATTTTTGTTTTTGTT-----TT-T--T------------TT--T--A---GTAAC----A---A--TTACT-A-----TGA-------CACTGATTC----T----A-TT-----T--------ATCT--C----A--A-A-TC-AA---TTTCAAGCCTCC-T-TTaagaacccaagggaaataactgattatttagaacagaatgggccgtatggacaactcatttaagctgttatgcttataaatattctgaacaagtctgctcacaatgtgatg
gi|22 : CTTCC---TTTTCAGG-------TCA-GGA-ACTTAT-------------------CAT-C-AAAA-TATTTAAAACAAAACTCCAGTAACTGAGTGAA-A----ACTT-ACAT-T-TCTATTTTT
gi|22 : aTATCATCAAAA--TAT--TTAAAACAA-AA--CT--CCA--GTAACT----G-----A----GTGAAAACT-TACATT-T-CTATTTTT----G---A--------C--------AAT------------C-TTAGC---------------TTT-G------A---------------T-TGAC-TC-----AAAAGC-AAG----CCCAAGCTTAA---TTATCAGG-------TTT-GTA-ATCTATCCAC--------AAAATTTCATAA-AAAA-AATCTTGAAGAAAATGGAAGTTgacaatcttagctttgattgactcaaaagcaagcccaagcttaattatcaggtttgtaatctatccacaaaatttcataaaaaaaatcttgaagaaaatggaagtttgactg
gi|23 : acttccttttcaggtcaggaactTGAC-----CTTGA-AC---TGA-----TT--TCA-TC----A---CA--A-A-C-----C-A-ATC-CCAA--------------C-A-----------------AAC----------------A-CA--CA--------------TATTTT--CA-T-------CAAAG-----T-ATCTTAAA-G-tgactg
gi|25 : acaagaggtccaacagaacatcatttttcaattttacaagttcaagaagtagcttgacaactcggaagtttggtaaaaactgaaagtccgtgacgttttcaatgcagatatgaattttctttcTTAAGT------T------ACTA--ATATTATG---C-A--AA------AC-A--C------A--------C----------------------TT-----G--C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------C-------C----C----ACTT-----T--------AGCT-------A--A-A----AA---TCTCGAGCTCCC-T-TCA--C-ATT-G-T-------GA-ACCTCT--TC-------AT--------AAAAAT--AA--T-AAGATATTTTA
gi|26 : gtct----AGTAA--------C--------GGTGTTCA-CAATT-C-CTGAC---------------TTT-A------AATT--------GA--T-CTAC-CTC----AAAATC-AAT----TCTAAcaaaaatggaaaccagtctgttcagtttcaagaatgaccttg
gi|27 : aggtcagatagaccctgtatgactatactgttcattctggtcatgttagagttcaagaattatattaagatattgagataatatgataatcaacgttcttgtttggataaaaactac--GTTA------A-----A----GCGGAAAC--CATATT-TC--ATTTTT----AGTAATTTTTAAGC--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------ATT-A------G---------------T-TAAC-AT-----AAAAGA-AAC----CCCAGGGTTTC---TGTTAATG-------TCT-CAA-ACTTATCCAC--------AAAATTTCAG-C-AAAA-TATCTTT--GGAAACTAAAGATATTGAGCGAA-A----AT-C-GTTT-T-TCTAT
gi|29 : GAC-----CGTAA-AC---CGACTTGCTT--T-A-CC----T---CA--A-AAT-----C-A-AGT-CTAA-GC-TTCCTC--TTC-TT-GTC---------AGAAAT-----A-----TAT--A-CA--C---------------AAATTT-----------------------T-GTCTTCAA-T-T--A--C-CCGCAGT------T-------------------------G--AA------A--C--C------T--------T----------------------TT-----TT-T--TTCG-AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACC-G-----TGG---------------C----C----A-TT-----aata
gi|3 : taaagacAC-----CTTGA-CC---AGA-----TT--T-A-CC----T---CA--ACA-C-----C-A-AGC-TGAAAGC-TTCTCT--TCT-TT-GTT---------T----C-----C-----AAA--A-TA---A--------------AAAGTA--CA-C-------CAAAA-----T-ATATTGAA-G-G-AT--A-CTAATGT------T------ATAA--A------G---G-G--AA------A--A--A------AACTATT--T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAC----A---A--TGACC-T-----TGA-------C-------T----GTG--A-TTAAAAAC--------ACAT--C----A--A-A-TC-AA---TCCAAAGCTTCC-T-TTT--T-A-T-G-T---AAGGAA-ACCTAT--cttatatgaaaataaa
gi|3 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcAAATCAATCCAAAGCTTCCTTTTTATGTAAGGAAACCTATT----------------------------A---TATTAT-------------A---G-------------T--CTA---G--GC---C--A----T-----T-TA-T-C--T---TATTTTT----A--------TTAA-CAGAGAC-----TTTGA-TC---CAA-----TT--T-A-CA----TG--TA--C-A-T-----G-T-ATG-TCA------TCACTAATCT-ATAGAT---------AGCTTC-----C-----T----A-CG--CA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-A----AAA-G-G-AT--A--TGAAAT------TGCCATGATTG--A------A---T-G--GAC-----A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AGT-----TT--T--A---GTAAC----G---A--TGAAC-T-----TGA-------C-------C-----------TT-----G--------ACTT--G----ACTG-A-CC-AA---TCCCATGCTTTC-C-TTT--C-A-G-GTT---A--GAA-Atatattatagtctaggccatttatcttatttttattaacagagactttgatccaatttacatgtacatgtatgtcatcactaatctatagatagcttcctacgcaaaaattcatcaaaataaaaggatatgaaattgccatgattgaatggacaacatttttctagttttagtaacgatgaacttgaccttgacttgactgaccaatcccatgctttcctttcaggttagaaatgcaa
gi|30 : tgatctttcatacttattcttattctaacatcaataagattccataggttttgataacaacagaaagatctgtggagtaacaaggcagaaattatctttttttcaccttgaccagatttacctcaacaccaagctgaaagcttctcttctttgtttccaaaataaaaagtacaccaaaatatattgaaggatactaatgttataaagggaaaaaaactatttttttctatttttagtaacaatgaccttgactgtgattaaaaacacatc---CAA-----TT--T-A-CC----T---CA--A-A-T-----C-G-ATC-CCAA-TC-TTACTT--TCC-AT-CTT---------AGAAAC-----A-----TAT--A-CA--CC--------------AAATAA--CA-TTAGTTTCTAAGA-----T-ATATCATT-T-G-AA--A-CTAAAGT------T------ATT----------------------------------------A--------T------------------------------------------------------------TAAC----A---G--TGACC-T-----TGA-------CT------C----C----A-TT-----T--------ACCC--T----A--A-A-TT-AA---TACCAACCTTAC----TC--CAA-T-G-T---tgcaa
gi|31 : -GTT---------TGAAAC-----T-----TAT--C-CG--AA--------------AAAATT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTAAT-T-G-AA--A-CC--AGT------TTCT---ATT---A------G--------------------------------------------------------------------------T----A-------TT--T--A---GTAATGA--A---GACTGACC-A-----TAA-------T-------C----C----AATT-----T--------GGCT--C----A--AGA-GC-AA---TTCCAAGCCTA--T-TTC--T-A-GAG-TC--A--AGA-GCCTGC--AT-------TA--------AAAAATTCAT--C-AAGATg
gi|33 : -CC---CAA-----TA--T-G-CA----T---AA--A-A---------A-A---CCAA-AC-CTCCTT--TTTTAT-GTT---------AGAAAC-----C-----AA---A-AA--TA--------------AAACTT--CA-T-------------------AC---AAA-G-G-AA--A-CTAAAGT------T------ATTG--A------G---C-T--AA---------------------------------------------------CT-----TT-C--T----A-------TT--TTCA---GTAAC----A---G--TGAC
gi|34 : agaaaatgtgtgcccatttgttttatacttG---A--GC---A--A----A-----A-T--T-G--T---GG----T-------------GTAA-CAGTGAC------------------------TT--T-A-CT----T---CA--A-A-C-----CCA-ATC-CCAA-AC-TGCTTT--TCC--T-GTA---------TGGAAA-----C-----TATTGA-CATTCA--------------CAATTTTTCA-T-------CAGAA-----T-GTCTTAAA-G-G-AA--A-CTTATGT------T------ATTG--A------G---C-gac
gi|36 : tattaccatccaATTTTT----AGTAA--------T--------TGTA---A-C-----C-TTGAC---------------TGT-G------ACCC--------AA--TATGAT-TC-----AAAACC-AGT----CTGAAGATCCC---TTTTCA-------------GGA-GCCTATCCAT--------AAATTTTCAA-C-AAAC-CATTTTAAAAGAAACTTAAGTTATat
gi|37 : ttattgaataga-----C-A-ATC-TCAA-AC-TTCCTT--TTC-AT-GTT---------TGGAAC-----CTGTAATGT--A-CA--CA--------------AAATTT--CA-T-------T-AGA-----T-ATTTTAAA-GTT-AACTA-CTTAAGT------TA-----ATCA--A------G---T-G--AA------A---------------------------------------------------------------------------------------------------ACC-C-----TGC-------C-------C----T----GTTT-----T--------ACCT--C----A--A-AGCC-AA---TCCCAAGCaac
gi|39 : t-TTTCTT--TCC-AT-GAT---------GAGAAC-----A-----TAT--C-TA--CA--------------AAA-TT--CA-T-------CAAAA-------GTGTTAA-----------------------------------G--A------G---T-G--AA------A--AT-T------AT-------T----------------------TT-----TT-C--T----ATT-----TT--T--G---GTAAT----G---G--CGATC-T-----TGA-------C-------
gi|39 : CAAAAT-TCATCAAAA---GTG-TTAA-----------------------------G-----A----GTGAAAATT--ATTTT-TTCTATTTTT----GGTAA--------T--------GGCG---A-T-----C-TTGAC---------------TTT-G------ATCtttgatcaaaagtacatgtaatc
gi|4 : tttctttccatgatgagaacatatctaTATT----G-----A----ACAGAAAGT--ATTCT-TT-----TTT-----GTAA--------C--------AGTG---A-T-----C-TTAACACTGACCCCATTTACCTT-GCAACCAACCCCAAACAGAGA--T-TAAC-CT-----CAAATC-AAT----CTCAAGTTTCA---TTTGTATG-------TTA-CAA-ACCTATACAC--------CATATTTCAT-C-AAAA-TATCTCTAAGGAAACCAATGTAATTGTACGGA-A----AC-T-ATTC-TGTCTATTTTaaaagtacatgtaatc
gi|4 : taACCTCAAA-TCAATCTCAAGTTTCATTTGTATGTTACAAAC-CTATACACCATATTTCATC-----------AAAA---TAT--CTCTAAGGAAACCAAT--G-------------TAATTG---T--ACGG-A--A----A-----C-TATT-C--TGTCTA----TTTTCA--------GTAA-CAGTGAC-----CGTAA-CC---CCA-----CT--T-AACC----T---CA--A-AAC-----C-A-ATC-CAAA-AC-TTCCTT--TCC-AT-GTC---------AGGTAC-----A-----TAT--A-TA--CA--------------GAATTT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCT---------AA--A-TTTAAGT------T------ATTG--A------GA--A-G--AA------A--A--C------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----AATT----TT--T--A---GCAAC----A---G--TGACC-T-----TGG-------C-------CT---T----A-TT-----T--------ACCT--C----A--ATA-CC-AA---TTTCAAGCTTCCAT-TTT--T-T-T-G-TCAAA--GAA-ACTTAT--TT-------GC--------AAAATTTATT--C-AAAcagtaacagtgaccgtaaccccacttaacctcaaaaccaatccaaaacttcctttccatgtcaggtacatatatacagaatttcatcaaaatatctaaatttaagttattgagaagaaaacttttttctaatttttagcaacagtgaccttggccttatttacctcaataccaatttcaagcttccatttttttgtcaaagaaacttatttgcaaaatttattcaaa
gi|41 : tatattgaacagaaagtattcttttttgtaacagtgatcttaacactgaccccatttaccttgcaaccaaccccaaacagagatta-A--GTTATT----G-----ATTAAACAGAAAC--CATTTT-TTGAATTA------AGTAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------TTT-T------ACC-----------------AC--------AAAATC-AATTAAATTCTAGCTTCA---TTT
gi|42 : T--T-A--GTTAGT----T-----A----GCGGGAACT-T-TTTT-TTCTTTTTTT----AGCAA--------C--------A----------------TTGAT---------------TTT-G------ACC-------------T-TGAC-CT-----CAAATC-AAT----TTCAAGCTTa
gi|43 : tatcaacata--------T----------------------TG-----TT-C--T----G-------TT--TTAA---ATAAC----A---A--CAATC-T-----TGA-------C-------C----C----AATT-----T--------ACCT--CA---A--A-A-CC-AA---TTTGAATCTTCC-
gi|45 : agttaacacagtactctgacagctcAG--A-AAACCT--A-A--GTTACTATCTG-----A----GCGGAAACT-G--TTT-TTCCACTTTT----AGTAA--------A--------AAAG---A-C-----A-TTGAC---------------TTT-
gi|47 : T----AGCAA--------C--------AGTG---A-C-----C-TTGAC---------------CTTAA------ATCC--------AA--A-CGACACC-----GAAAAC-AAT-----CCATGCTTCC---TTTTGA-G-------TAA-GAA-Atttctacaaaaccaacc
gi|48 : TTTT-----GTAA--------C--------AGTA---A-T-----C-TTGAC---------------AGT-G------ATCC--------AAAAT-T--C-CTCATACAAAGCC-AAT----GTCAAGCCTTC---TTTTCATG-------TAA-GGgtccatt
gi|49 : TG-------TCT-GGA-GCTTGTATGC--------CAA-TTTCAT-C-AAAA-TATCTT--TGAAAAC--AAGTCATTGAATGGA-A----AC-C-ATTT-
gi|5 : tgtgag--T-C--T---TA----A----A--------TTAA-T--TTAC-----CTTAA-AA---CGA-----------A-TC----TTAACA--A-A-CACGTTC-A-ATT-TCAA-TCCTTCCAT--TTC-TT-GTC---------AGGATC-----C-----TAC--A-AT--TA--------------AAAC----CA-T-------CAAAA-----T-ATCTTTAA------A--A-CTTTAGT------T------ATTA--A------A---T-G--GA------A--AACC------T--------T----------------------TT-----TT-C--T----A-------TT--TTTA---GTAAA----A---G--TGACC-T-----TTG-------T-------C----T----A--T-----G--------ACCC--C------------C-AA---TCCCATGCTTCA-T-TTT--A-A-T-G-TC--A--AGACATCTAT--AC-------GC--------AACATTTCA
gi|5 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgaAAA-ACCATCAAAA--TATC-TTTAA-----AA--CT--TTA--GTTATT----A-----A----ATGGAAAAC-C-TTTT-TTCTATTTTT----AGTAA--------A--------AGTG---A-C-----CTTTGTC---------------TAT-G------ACCC------------------------------CC-AAT----CCCATGCTTCA---TTTTAATG-------TCA-AGACATCTATACGC--------AACATTTCA
gi|50 : caagaggtccaaaagggcctgtatcaccctactggccattctaatcccattttatcagttcaagaaatagttttctgatcactaacatccctgacaagtttcgttaggtttggataaaaatcaaaggtcctattgctttaaggcaaatatttttctgatcttaaattaatttaccttaaaacgaatcttaacaaacacgttcaatttcaatccttccatttcttgtcaggatcctacaattAAGCTTCC---TATTCTTG-------CCA-GGA-ACTAATTCAC--------AATATTTCAT-C-AAAA-TATATTGAAGAAAATTTAAGTTAT
gi|51 : ca-AAT----CTGAAGCTTCC---TT-------------------A-AAATGAACAC--------AAAATTCCAT-C-AAAA-TATCTCGAAGGAAACTAATGTTGTTG
gi|52 : --------AAAATTTCAT-C-AAAAATGTCTTGAAGGAAACT-TAGTTATTGAACATA-A----AC-C-tat
gi|6 : caccttA-TATCGTAATGGAAAC--AAGTTACCGAGCACA-A----AC-C-ATGT-T-TCTATTTCT
gi|6 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggct-----------GAAA---CA-----------------A---G-------------TTACCG---A--GC---ACAA----ACCATGT-T--T-C--TATTTC----T----A--------GTAA-CAGAGAC-----AT-GA-CC---TGA-----TT--T-A-CA----T---CA--A-A-T-----C-A-AGC-CTTC-GC-TTCCTT--TCA-AT-GTT---------ACATACATAA-T-----TAT--AACA--CC--------------AAATTT--TA-T-------CAAGA-----T-ATCTCAAA-G-G-AA--A-CTAAAGTTGCCAGT------ATTG--A------A---CAA--AA------A--A--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AT------TT--T--A---GTAAC----A---G--TGATC-G-----TGAAGCTTATC-------T----G----A-TT-----T--------ACCC--CA---A--A-A-TC-AA---CACCATTATTCC-T-TCC--C-A-T-GTT---A--GAA-ACCTAT--AC-------AC--------CAAATATCAT--C-AAAATATCagtaacagagacatgacctgatttacatcaaatcaagccttcgcttcctttcaatgttacatacataattataacaccaaattttatcaagatatctcaaaggaaactaaagttgccagtattgaacaaaaaacatttttctattttagtaacagtgatcgtgaagcttatctgatttaccccaaaatcaacaccattattccttcccatgttagaaacctatacaccaaatatcatcaaaatatc
gi|7 : tgatacaggcatatataaatatattatatacggctatatcgtaatgATCATAGAAA--TATT-TTCAAGC-A-AG--TT--T-ATTGTTTGT----GGGAAAA----GCAAAAACC------------ACTTCT----AACAA--------C--------ACTG---A-CGGTCCC-ATG------------------CT-G---------C--------AA--T-TAAG-TT-----AAAACCCAAT----CCCAAGCTTATAAAT----ATA-------TAA-GGA-ACCTATAAAG--------AAAATGTCAT-C-AAAA-TATCTT-AAGGAAACTTAATTTATTGGACAGATACCATAC-C-ATTT-T-TCTAATTTT
gi|7 : ttcc-C--T---TC----T----A--------ACAA-CACTGACGGTCCCATGC-TG---CAA-----TT--A-A-GT----T---AA--A-A-C-----CCA-ATC-CCAA-GC-TT-ATA--AAT-AT-ATA---------AGGAAC-----C-----TAT--A-AA--GA--------------AAATGT--CA-T-------CAAAA-----T-ATCTT-AA-G-G-AA--A-CTTAATT------T------ATTG--G------A---C-A--GATACCATA--C--C------A--------T----------------------TT-----TT-C--T----AAT-----TT--T--A---GTAAC----A---G--TGACG-A-----TAA-------C-------C----CA---A-TT-----T--------ACCTA-A----A--A-A-AC-AA---TCCCAATCCCCC-T-TTT--C-A-T-G-TA--A--GGA-ACCTAT--A--------AT--------AAAATGTCAT--C-AAAATagtaacagtgacgataacccaatttacctaaaaaacaatcccaatcccccttttcatgtaaggaacctataataaaatgtcatcaaaat
gi|8 : ttccatcatagaaatattttcaagcaagtttattgtttgtgggaaaagcaaaaaccaTG---G--AC---A--A----T-----T-T--T-T--C---TA----T----ATAAA----GTAA-CAGGGAC-----CTTGAACT---TGA-----CTAAT-G-CC----T---GA--A---------C-A-ATC-CAGT-GC-TTCCGT--CTT-AC-ATT---------AGGAAT-----C-----CAT--C-TA--CA--------------TA-TTT--CA-T-------CTGAA-----A-ATCT---------AA--A-CTGAAGT------T------ATTG--A------A---T-G--GA------A--A--C------A--------A----------------------TTCTATGTC-C--TTGACG-------TT--C--C---ATATC----ATCCT--TGAAA-T-----TGA-------C-------C----CA---A-TT-----A--------AGCT--C----A--A-A-AT-AT---TATTAAGCTTCC-T-TTT--C-A-T-G-T---
gi|8 : acggaTTGA--CCCAATTAAGCTCAAAAT-ATTATTAAGCTTCCTTTTCATGTTACCAAT-C-ATTCC-----------C-----------CAA-----------------------A---G-------------TTATTG---A--taccaatcattccccaaagttattgaaaagaaccatttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : acggatggacaatttttctatataaagtaacagggaccttgaacttgactaatgcctgaacaatccagtgcttccgtcttacattaggaatccatctacatatttcatctgaaaatctaaactgaagttattgaatggaaacaattctatgtccttgacgttccatatcatccttgaaaTTTCTT-C-AAAA-TAGCTAAAATGAAA--AAAGTTATTGTATGGA-A----AA-C-ATTT-T-TGTAaaagaaccatttcacgatggatgagcagacacacaaacaaaca
gi|9 : caaaaatagttttaatagttaataatcatacatttA-----------T-----------GAAA---AA-----------------A---G-------------TTATTGTATG--GA---A--A----A-----CAT--T-T--T---T-------------------GTAA-CAATTAC-----CTTAA-TC---CCA-----TT--T-A-AG----T---AATGA-A-C-----T-A-ATT-ACAA-AC-TTCCTTA-TAC--T-GTC---------TGACAT-----T-----TAT--A-CA--CA--------------TA-TTT--CAAT-------CAAAC-----T-ATCTTAAA-G-T-CA--A-CTAAAAT------T------ATTG--A------G---C-GGTAAC-----A--A--C------AC-------T----------------------TT-----TT-C--T----AAC-----TA--C--A---GTAACATATA---GCCTGACTGT-----TGT-------C-------C----C----A-TT-----T--------ACCT--C----A--G-A-AC-AA---GCTCGA-CTTCA-T-TTC--C-acaattaccttaatcccatttaagtaatgaactaattacaaacttccttatactgtctgacatttatacacatatttcaatcaaactatcttaaagtcaactaaaattattgagcggtaacaacactttttctaactacagtaacatatagcctgactgttgtcccatttacctcagaacaagctcgacttcatttcc
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTCAAGTACCCAAGGGAAATAACTAATTTCAGAACTAGTCAGGCTGTATGAACAATTCAGGTGAGCTTCTATAACTATAAACATTCTGACCATGTTTGGTTACAATCTGATAAAAAGGTTATACAGTGTGTATACTGCAAATATCAGCACATTTCAATCAATCCAGGGCAATAACTCTGTCAATACCGACCTGATATGGCCATTTCAACTACTCACCCATGCCTACATGGTCAATATAATATATTCTGATGAATTAACTGAGATGAATG
Unaligned ( gi|15 ): TATAACTATATGATTATACCATAACATTCCGGCCAAGTTTAGCCTGAATTGGACAACATTTGAAGTAGCTACAAGAGGCAAATATCAAAATTTTTCAATCCAAGTCATGGGTCAAAACTTTGTTTTTATCGGTTCTGCATGGCCATGAAAAAACCTCACCAAGTTTCATCAGAATCAAACAAAACTGATGGTGCCATAGTGTTTATAGGCTGAAAGTGAAAATATTTCAAAATGATCAATGGCCCCAAC
Unaligned ( gi|24 ): CAAGAGACTCAAACGGGCATGTATCATTCTGGTCCAATTTGTGAAGCTCAAAAAAAATGGTTTAATATTTTATGATCAAAAACATCCTTGATAAATTATGTTTGGATTAAAACAGTAGGTCCTATGAGGTTACAATTTCAGTTGAAGTTAGCATTTTTCCGATCTTAAATTGATTGATCTCAAATCC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTAATCATCCAAGGGCAATAATCGTTGGTTTCTGGTTTATCAGGCTGTATAAACAACCCATCTGAGCTTGTACATATTTCGACAAAGTTTGGATACAATCTAATAAAACCTTGAGGTGGCACAGAGTTTAAAAGTCAAACAACTCAGCCATTTCAGCCTCAGT
Unaligned ( gi|32 ): ACGAGAGGTCAAAAAAGCCGGGAACCGTTCTACTGTTCATTCTTGCCCAAATTGACCATTTCAAAAAAAAAGAATTAATTTTATGATCATAAACGTGCCAATTTTCGTTAGGTTTGAAAAATCGCTGACGGTCCTGCGGTGTTTACTAT
Unaligned ( gi|35 ): ATAACATTAAATATAACAATAGAGGTCCAATAGCACCTGTAGTGCTCTCAGTACTTGCCAAATTTGACCAGTTCAAGAAACAGTTTGAGATTTCATGATCATAAACATCCATGACAAGTTTCATTATGTTGAGATAAAAA
Unaligned ( gi|38 ): GCTAAAATTATTCAAAGTGACACTGTTAACACTAAATTGCAAAGGAAATAACTCTCTTGTTCCAAAACTGATAGGAGTTGTATGAACAACTCATGTGAGCTTTTATGCCTATTAACATTCTGACT
Unaligned ( gi|40 ): CAAGAGACTCAAAAGGGCTTGTAATGCTGACTGCGACAGTTCATTCTAGTTCCATTTGACAAGTTCAAAAAAGGTCATGATCATCAACAGGCTTG
Unaligned ( gi|44 ): AATAGGCCCATTCAGTCCTATATTGCTCTACTGGTTCATTCCAGTCAAATTTGACTAGTTCAAAATCTAGTTTGAGACTTTATGA
Unaligned ( gi|46 ): ATTTTTACTTATTTTTTTTTCAAGAATCCAAGGGAAACACCACCTCCTTTTAAACTGATTGGGTCATATAAACATCTCATGTT
Unaligned ( gi|53 ): TAGGGTCATATGAAAAACTTGTGTGAGCTTTTATACCATAACATTCTGACTA
Unaligned ( gi|54 ): TGTCTGAGTGCAAAGATAACGTCTTTATATTTTGGTGGACATTTTT
Unaligned ( gi|55 ): TACTACTATATATACAAACTGTGTTTTCATTAGTGAG