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Reference ( gi|1 )            :                                                 TATATAAATAAT-TATGTTT-TTC-AA-AGA-C-T-GTCGATGTA-CAA-------GTTTATGGAAATGCTTAAATCAAATAACAAAAG-CAATTTAGTCGGATTTGCTCAATATA-TTA-AAAA---AATC-TCT--G---AAATT-AAGAAACAGCATTTTAAATGTTT--AACATGATATGTAA--ATATATT-----------GAATATCT----TTTATTTAA---TCTATTTTCGGAAACAATCTCTGATGT-AGA--TGC-CA--------A--GTATATAAAGTTGGCAA----CGA---AAGA--A-------A---A-----TCA----TTTAAATAT---TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGCAA-T-ACTTCGA-TA-TTGATATTAA---GAA---AA-ATA-A-GAGTTTACT
gi|2                          :                                                 TATATAAATAGA-CATGTTT-TTC-AA-AGA-C-C-GTCTCTGTA-CAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA-TTA-AAAA---A-TC-TCT--G---AAATA-AAGAA---------TAGGT-------------TATGTAA--ATATATT-----------GAATATCT----TTTAT--------CTATTTTTGGAAACAAT----------------------------------ATATGAAG----CAA----TGA---AAGA--A-------A---A-----TCA----TTTAAATAT---TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGT-AACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGCAT-T-ATTTCGA-TA-TTGATAATAA---AAA---AATATA-T-GAACTTA
gi|3                          :      tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgTATACAAACA-T-T-TTTTT-TCC-AA-ATA-C-C-TTTCATCCG-CCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA--TA-AAAC---GTTA-TCT--A---AAACT-TAGAAATAACATTTTAAATGTTT--AATGTGAGATTTAA--ATATAT
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gi|5                          :                                                 aATATATATATT-T---TTT-CCC-TA-AGATC-T-TCCAAGGTA-CAA-------GCTTATTGAATTCCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATATTAATCGGATTTACTCGGTATA--TA-AAAC---GTTT-TCT--G---AAA-T-GAGAAATAACATTTTAAATGTGT--AATGTGACGTTTAGCTATATATTTGGCGATGGTAGAATATTTATTGTTTATTTAA---T-TATTTT--GAAG-AATTTTGGAT
gi|20                         : cacttaatttttaacttttatctgttcttgcttcagatatttggagaggATCTACATAAA-CAT-TTT-GTA-AA-AGA-C-C-GTCCATGTA-TAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTC-ATATA-tgaaaagtacttcttgtattattttgacatttatatgtataacctaaattaatattaaat
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gi|6                          :                              aagaagattttaccttttgttctaatctAAA-TATTTTT-TTCTAA-AGA-C-C-TTCAATTTA-CAA-------GCTTATCGAATTGCTAAATTTAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATCTGCTCAGTATA-GCA-AACG---T-TG-TCT--G---AAATT-AAGAAATAATATTTTA----TCTGAAACTTATTAT-TAAT-ATATATT-----------aaaataaatgaact
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gi|4                          :                  ctacttcatttttatctgtttttgctgcactgatttaagaaaaaaatatgtaaaagaaaaGA-C-C-TTCCATTTA-CAA-------GCTTTTTGAATTGCTTGAATCAAATGGCAAAA--TAAATTAATCATATTTGCTCAGTATAATTATAAAA---CATTGTCT--G---AAAAT-AAGAAATAACATTTTAAATGTTT--AATATGAAATTTAG--ATATAagttggcaaagaaagactactaatcattt
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gi|25                         :                                                                                                                         AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA-T----AAATTTATTT-TCTATG---AAATT-AAAAATAAACATTTTAAGAGTTT--ATCGTGAAATTTAA--ATATGTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|9                          :                                                                                                                                      AAAG-TATTTTAATCAGATTTACTCAGTATA-TTA-AAAT---A-TC-TCT--G---AAATT-AAGACACAGCATTTCAAATGTTC--AATATGTTATGTAA--ATATATT-----------GAATATCT----TTT-----G---TCTATTTTCGGAAACAATCTCTGA------A--T------------------------------CAA----TGA---AAGA--A-------A---A-----TCA----TTTAACTAA---TTTATCAA-TTTATTCA---TCC---TTTT-ATTT---TT-AGG-AATA-----TATGAC--T-T-A-AAGTTTTTTTCA-TGCAT-T-ATTTCGA-TA-TTGATAATAA---AAT---AA-AT----GAACTTACTatttggc
gi|32                         :                                                                                                                                              TTTAATCCGATTTGCTCAGTAAA-T-A-AAAC---TCTC-TCT--G---AAATT-AAGAGGTAACATTATTAATGTTC--A
gi|12                         :                                                                                                                                                  tTCGGATTTGGTCAGTATA-TTT-AACG---T-TT-TCT--A---AAATT-AAGAAA-AATATTTTAAATGTTT--AATGTGAAATTTAG--ATATAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                        A-AAAA---AAT-----------GAATT-AAGAAACAGCATTTTAAACGTTT--AATATGATATGTAA--ATATATT-----------TAATATAT----TTTAT--------CTATTTTTGGAAACAATCTCTGACGT-AGT--TGT-CA--------ATTGTATATAA--TTGAGAA----TGA---AAAG--A-------A---A-----GCA----TTTAAATAT---TAAATAAA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-AAAT---TT-TGA-AATT-----TAGGACA-T-A-A-AGG--TATTTCA-TGCAT-T-ATTTCGA-TG-TTGATAATAA---GAA---AA-ACATA-GA-TTTACTatttggcaatgatagaagaataatcatttgaatgtttaataaatgtgttcatccctttcttcttcttgaagaacttaggattgaaaagtattttttgcattgttttaacatttatattaaaaacataactaaatacttta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                 taTC-TCT--G---AAATT-AATAAATAACATTTTACGTGTTT--AATGTGAAATTTAA--ATGT
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                           A--ATATGTT-----------GAATAGAT----TTTAT--------CTATTTTGGAAAATAATCT-TAAT-T-AAAGCTGC-CATAAGTACCG--GTATATAAAGTTGGCAG----TGC---AA-------------------------------TAAAGAT---C--------TGTGTTCA---TCC---TCTT-ATTC---GC-GGGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAA-TCATTTTGT-CA-TTTATATatgaactgact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                               TATATT-----------GAATATCT----TGTAT--------CTATTTTGGGAACCAATCTCTGACGT-AGA--TGC-CA--------A--GTATATACAGTTGGCAA----TGA---AATA--A-------A---A-----TCA----TTTAAATAT---TTAATAAA-TGTGTTCA---TCC---CCTT-ATTG---TT-AGG-AATT-----AATGACTTT-A-A-AAG--TATTTCA-TGCAT-T-ATTATGA-TA-TTGCTATTAC---GAAG--AA-ATT-T-GAATTTACT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TT-----------GA-TATCTG---TTTATATGACATTCAATTT---AAAATAAT-TATCAAGT-A----TGTTCA--------A--GTATATCTAGTTGGCAA----TGA---AAGA--A-------C---A-----TCA----TTTAAATAT---TTAATAAT-TTTTTTCG---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-ATG--TTTTTCA-TACAT-T-ATTTCGA-TA-TTGATAATAATATAAA---AA-AAA-T-GAATTTACt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGGAAACAATCTCTGATGT-AG-------C-------------TATATAAAGTTGACAATGAACGA---AAGA--A-------ATC-A-----TAA----TTTAAGTGT---TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGA-AATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TACAT-T-ATTTCGA-AA-TTGATATTAA---G-A---AA-ATA-ATGTATTTACTc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATGTTTAATGTGAGA--T-T-TA--------A--ATATATA--TTTGGAGA----TAA---AAGA--ATAAT---A---A-----TCA----TTTTATTGT---TTAATACA-TGTGTTCA---TCA---TTTT-CTTC---TT-AG-----------TATG------A-A-AAG--TATATAATTATAT-T-ATATTGA-CA-TTGATATTTA---AAATATAA-TTA-A-GTATTTA
gi|11                         :                                                                                                                   tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccaaatacctttcatccgccagcttattgaaatgcttaaatcaaatgacaaaaatatttcaatcggatttgttcagtatataaaacgttatctaaaacttagaaataacattttaAATGTTTAATGTGAAA--T-T-TA--------A--ATATATA--GTTGGCAA----AGA---AAGACTACT-----A---A-----TCA----TTTgatatatat
gi|21                         :                                                                                                                                          ctacttcatttttatctgtttttgctgcactgatttaagaaaaaaatatgtaaaagaaaattctaaagacctatcatgtacaaagctaattgaaatcaaattataaaaataatttaatcggattgcttagcatatttaaccttgtctaaattcaagaaatcacatttta-AGC--TGC-CA--------A--GTACATGAAGTCGGCAA----TGA---ATGA--ACGTGTG-A---A-----TTATCATTTTGAATATAA-TCAATAAA--TTAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGG-GGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGTAT-T-AATTCGA-TAGTTTATTTTTA---AAA---GA-GT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --GTATGTATATTTGGCAA----TGA---AAGA--A-----------------TAA----TTTAAATGT---TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAG-AACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTC--TTTAATT-ATTTTGA-TT-TTtcat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taataatttattgcttaaacctcttctttcttATATACATTTGGCCA----TGA---AAGA--ATAATAATA---G-----TCA----TTTGAATGT---TAAGTG-----TGTTAA---TCC---TTTT-CTTTGTCTTGAAG-AACT-----TGAAAG--T-A-ATAAA--T-TTT---TGTAT-T-ATTTTGA-CA-TTTATATTTA---AAACATAG-ATA-A-ATATTTAtttataaatttttaatatata
gi|6                          :                                                                                                                                                 gatcttaacaaaacttagtagttatattactgtaagatatctgtttctatcatgaccttccatttacaagctttttgaattgcttgaatcaaatggcaaaataaattaatcatatttgctcagtataattataaaacattgtctgaaaataagaaataacattttaaatgtttaatatgaaatttagATATATATTTGGCAA----TGA---AAGA--ATAAT---A---A-----TCA----TTTAAAAGT---TTAATGAA-TGTATTCATTCTCC---TCTTCATCT---TG-ATA-AACTAAGGCTTTGAT--G-G-A-AAG--TATGTCT-TATAT-T-GTTTTGACTT-TTTAT-TTA-----AA---AC-ATA-A-A---TTACTa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                      tttcaaaaatatttttttctaaagaccttcaatttacaagcttatcgaattgctaaatttaaatgacaaaaatattttaatcggatctgctcagtatagcaaacgttgtctgaaattaagaaataatattttatctgaaacttattattaATATATATTTGGCAA----TGATAGAAGA--AT------A---A-----TCA----TTTGAATGT---TTAATAAA-TGTGTTCA---TCCCTTTCTT-CTTC---TTGAAG-AACT-----TAGGAT--TGA-A-AAG--TATTTTT-TGCAT-T-GTTTTAA-CA-TTTATATTAA----AA---AC-ATA-A-attgaatattt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               tcggatttggtcagtatatttaacgttttctaaaattaagaaaaatattttaaatgtttaatgtgaaatttagCAA----TGG---AAGA--A-------A---A-----TCA----TTTAAATAT---ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGCAT-C-ATTTCGA-TA-TTGATAATAA---AAA---GT-ATA-T-GAACTTACTctaaatacttta
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cattcagttaatCAA----TGA---AAGT--A-------A---A-----TCA----TTTAAATAT---TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggaaacatttcacttaatAA----TGA---AAGA--A-------A---A-----TCA----TTTAAATAT---TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGCAT-T-ATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---AAGA--A-------A---AAATTGTCA----ATTAAATGA---TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGCCT-T-ACTTTGA-TA-TCGGTATTAA---GAA---AA-AAG-T-GAATTTACT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atacattgAATAT---T---TA----TTGTTTA---TTT---AATT-ATTT---TG-AAG-AATT-----TTGGAT--TGA-A-AAG--TACTTCT-TGTAT-T-ATTTTGA-CA-TTTATATt
gi|31                         :                                                                                                                                                                             cacttaatttttaacttttatctgttcttgcttcagatatttggagaggatatatatattttttccctaagatcttccaaggtacaagcttattgaattccttaaatcaaatgacaaaaatatattaatcggatttactcggtatataaaacgttttctgaaatgagaaataacattttaaatgtgtaatgtgacgtttagctatatatttggcgatggtagAT---TAA-TAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATTTTA--TATGACG-T-A-A-AAgtataacctaaattaatattaaat
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           a--T-A-A-AAG--TTTCTCA-TGCAT-T-ATTCCGA-TA-TTGATAATAA---AAAT--AA-AT----GAACTTACTaaaaaatatctgttct
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCCA-TGCAT-T-ATTTCGA-TA-TTGATAATAA----AA---AT-ATA-T-GAACTTGCTt
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TTTATCCTTTTCTTTTTTCTTGAAGAACTAACGACTATAAAGAATTTCCATTATTATTGTGACATTTATATAAAAACATAAATAAATATTTGACATA
Unaligned ( gi|29 ): CAAATGGTTAATGTGAAATTTAGGTAAACATGTATGAAAGAATTCAAATCATTTTAATGTATAATATATGTGTTCATCCTCTTCTTCTCT
Unaligned ( gi|33 ): AACTTCAGATTGAAAAGTATTTTTTATACCATTTTGACATTTTTATTTAAAACATAAACAAATATT
Unaligned ( gi|34 ): ACTTCATTTGTATCTGTTCTTGCTACAGTGATTTAAGGAGGATATATAAAATAATTATG
Unaligned ( gi|38 ): TGCATCTGTCTTTGCTACAGTGATTTAATGAAGAAGTATATCAATA






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Reference ( family-1060 )     :                                                                                                                                                                                TATANAAATAATTAT-TTTT-TCA--AAGACCNTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATTTGCTCAGTATA--T-TAA---AANG-TC-TCTGAAATTAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGANAT-TTA-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T---AT------CTATTTTCGGAAACAATCTCTGATGT-AGA--TGC-CA--------AGTATATANAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATANTA-A---AAA---AA-ATANGAATTTACT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-----G--ATAAATT------------AA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTGTCGGAAACAATCTCT---------------------------TA-ACAAA-----CAATGA---AAAATA-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAGTAAA-TTTGTTCA---TCT---TATT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATAATA-A---AAG---AT-AAATGAACTGACTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatgaGTATGTATATTTGGCAATGA---AAGA-A----------------TAA----T---TTAAATGT--TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAG-AACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTCT-TTA-ATTATTTTGA-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taataatttattgcttaaacctcttctttctt-----A--ATATGTT-----------GAA---TAGAT----TTTA----T-----------CTATTTTGGAAAATAATCT-TAAT-T-AAAGCTGC-CATAAGTACCGGTATATAAAGTTGGCAGTGC---AA--------------------------------TAAAGAT--CTG--------TGTTCA---TCC---TCTT-ATTC---GC-GGGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAATCATTTTGT-CA-TTTATAtttataaatttttaatatata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGAAACAATCTCTGATGT-AG-------C-----------TATATAAAGTTGACAATGA---ACGA-A-------AGAAA----TCA----TAATTTAAGTGT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGA-AATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TAC-ATTATTTCGA-AA-TTGATATTA-A---GAA---AA-TAATGTATTTACTt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                TATATAAATAGACATGTTTT-TCA--AAGACCGTCTC-TGTACAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA--T-TAA---AAAA-TC-TCTGAAATAAAGAA----------TAG--GTT---ATGT--------A-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTTTTGGAAACAAT--------------------------------ATATGAAG----CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGT-AACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATAATA-A---AAA---AATATATGAACTTA
gi|20                         :                                                                                                                                            tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgATAAACAT-TTTG-TAA--AAGACCGTCCA-TGTATAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTCA-TATA--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actttatttttatctttggcctttgctacagaagcatttagagtctacatctac-AGC--TGC-CA--------AGTACATGAAGTCGGCAATGA---ATGA-ACGTGTG-A---A----TTATCATT---TTGAATATAATCAATAAA--TTAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGG-GGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGT-ATTAATTCGA-TAGTTTATTTTT-A---AAA---GA-GTa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATGG---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATCATTTCGA-TA-TTGATAATA-A---AAA---GT-ATATGAACTTACTtcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cattcagttaatCATTGA---AGAA-A-------A---AATTGTCA----A---TTAAATGA--TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGC-CTTACTTTGA-TA-TCGGTATTA-A---GAA---AA-AAGTGAATTTACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataTGAAAT-TTA-----A--ATCTATT-----------GAA---TAAAT----TTTA----T---AT--------ATTTTCGGAAACAATCTCTGAT-T-AAAC-TGC-CA--------GGTGTATATAATTGGCAATAA---AAGA-AAGC----A---A----TCA----T---t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                    AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA--T-AAATTTATTT-TC-TATGAAATTAA-AAATAAACATTTTAAGAGTTT-ATCGTGAAAT-TTA-----A--ATATGTcctttcaggatgaataaataaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAATGA---AAGT-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TAatttggc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggaaacatttcacttaatAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGC-ATTATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGA---AAGA-ATTCA---A---A----TCA----T---TTTAATGT--ATAATATA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-CTTC---T
gi|3                          :                                                                                                                                               caaatggttaatgtgaaatttaggtaaacatgtTATACAAACATTT-T-TTTT-CCA--AATACCTTTCA-TCCGCCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA----TAA---AACG-TTATCTAAAACTTAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGAGAT-TTA-----A--ATATATct
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gi|30                         :                                                                                                             tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccTATAAAAACAATT-T-TTTT-CTA--AAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGTTTAAATCAAATGACAAAAA-TAGTTTAATCGGAgatatatat
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1060 )     :                                                                                                                                                                                           TATANAAATANTTAT-TTTTCCAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATTTGCTCAGTATA--T-TAA---AANN-TC-TCTGAAATTAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGANAT-TTA-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T---AT------CTATTTTCGGAAACAATCTCTGATGT-AGA--TGC-CA--------AGTATATANAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TNTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATANTA-A---AAAAA-ATATGAACTTACT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-----G--ATAAATT------------AA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTGTCGGAAACAATCTCT---------------------------TA-ACAAA-----CAATGA---AAAATA-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAGTAAA-TTTGTTCA---TCT---TATT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATAATA-A---AAGAT-AAATGAACTGACTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatgaGTATGTATATTTGGCAATGA---AAGA-A----------------TAA----T---TTAAATGT--TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAG-AACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTCT-TTA-ATTATTTTGA-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taataatttattgcttaaacctcttctttctt-----A--ATATGTT-----------GAA---TAGAT----TTTA----T-----------CTATTTTGGAAAATAATCT-TAAT-T-AAAGCTGC-CATAAGTACCGGTATATAAAGTTGGCAGTGC---AA--------------------------------TAAAGAT--CT--------GTGTTCA---TCC---TCTT-ATTC---GC-GGGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAATCATTTTGT-CA-TTTATAtttataaatttttaatatata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGAAACAATCTCTGATGT-AG-------C-----------TATATAAAGTTGACAATGA---ACGA-A-------AGAAA----TCA----TAATTTAAGTGT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGA-AATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TAC-ATTATTTCGA-AA-TTGATATTA-A---GAAAA-TAATGTATTTACTt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                           TATATAAATAGACATGTTTTTCAAAGACCGTCTC-TGTACAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA--T-TAA---AAAA-TC-TCTGAAATAAAGAA----------TAG--GTT---ATGT--------A-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTTTTGGAAACAAT--------------------------------ATATGAAG----CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGT-AACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATAATA-A---AAAAATATATGAACTTA
gi|20                         :                                                                                                                                                       tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgATAAACAT-TTTGTAAAAGACCGTCCA-TGTATAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTCA-TATA--
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actttatttttatctttggcctttgctacagaagcatttagagtctacatctac-AGC--TGC-CA--------AGTACATGAAGTCGGCAATGA---ATGA-ACGTGTG-A---A----TTATCATT---TTGAATATAATCAATAAA-T-TAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGG-GGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGT-ATTAATTCGA-TAGTTTATTTTT-A---AAAGA-GTa
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAATGG---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATCATTTCGA-TA-TTGATAATA-A---AAAGT-ATATGAACTTACTtcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cattcagttaatCATTGA---AGAA-A-------A---AATTGTCA----A---TTAAATGA--TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGC-CTTACTTTGA-TA-TCGGTATTA-A---GAAAA-AAGTGAATTTACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataTGAAAT-TTA-----A--ATCTATT-----------GAA---TAAAT----TTTA----T---AT--------ATTTTCGGAAACAATCTCTGAT-T-AAAC-TGC-CA--------GGTGTATATAATTGGCAATAA---AAGA-AAGC----A---A----TCA----T---t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA--T-AAATTTATTT-TC-TATGAAATTAA-AAATAAACATTTTAAGAGTTT-ATCGTGAAAT-TTA-----A--ATATGTcctttcaggatgaataaataaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAATGA---AAGT-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TAatttggc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ggaaacatttcacttaatAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGC-ATTATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGA---AAGA-ATTCA---A---A----TCA----T---TTTAATGT--ATAATATA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-CTTC---T
gi|3                          :                                                                                                                                                          caaatggttaatgtgaaatttaggtaaacatgtTATACAAACATTT-T-TTTTCCAAATACCTTTCA-TCCGCCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA--T-AAA---ACGT-TA-TCTAAAACTTAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGAGAT-TTA-----A--ATATATct
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gi|30                         :                                                                                                                        tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccTATAAAAACAATT-T-TTTTCTAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGTTTAAATCAAATGACAAAAA-TAGTTTAATCGGAtataattaagtatttagatatatat
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1060 )     :                                                                                                                                                                                           TATANAAATANTTAT-TTTTCCAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---ACGN-TCTCTGAAATTAAGAAATAA-CATTTTAAATGTTT-AATGTGANAT-TTA-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T---AT------CTATTTTCGGAAACAATCTCTGATGT-AGA--TGC-CA--------AGTATATANAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TNTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-NTA-A---AAAAA-ANATGAACTTACT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                              TTATTGAATTGCTTACATCAATCGACAAAAAATAGTTTAATCGAATTGACTCAGTATA-TT-A---A---ACGC-TCTCTAAAATTAAGAAAAAA-CATTTt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-----G--ATAAATT------------AA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTGTCGGAAACAATCTCT---------------------------TA-ACAAA-----CAATGA---AAAATA-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAGTAAA-TTTGTTCA---TCT---TATT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAGAT-AAATGAACTGACTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatgaGTATGTATATTTGGCAATGA---AAGA-A----------------TAA----T---TTAAATGT--TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAG-AACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTCT-TTA-ATTATTTTGA-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taataatttattgcttaaacctcttctttctt-----A--ATATGTT-----------GAA---TAGAT----TTTA----T-----------CTATTTTGGAAAATAATCT-TAAT-T-AAAGCTGC-CATAAGTACCGGTATATAAAGTTGGCAGTGC---AA--------------------------------TAAAGAT--CT--------GTGTTCA---TCC---TCTT-ATTC---GC-GGGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAATCATTTTGT-CA-TTTATA-tttataaatttttaatatata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAAACAATCTCTGATGT-AG-------C-----------TATATAAAGTTGACAATGA---ACGA-A-------AGAAA----TCA----TAATTTAAGTGT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGA-AATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TAC-ATTATTTCGA-AA-TTGATA-TTA-A---GAAAA-TAATGTATTTACTt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                           TATATAAATAGACATGTTTTTCAAAGACCGTCTC-TGTACAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---AAAA-TCTCTGAAATAAAGAA----------TAG--GTT---ATGT--------A-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTTTTGGAAACAAT--------------------------------ATATGAAG----CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGT-AACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAAATATATGAACTTA
gi|20                         :                                                                                                                                                       tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgATAAACAT-TTTGTAAAAGACCGTCCA-TGTATAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTCA-TATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actttatttttatctttggcctttgctacagaagcatttagagtctacatctac-AGC--TGC-CA--------AGTACATGAAGTCGGCAATGA---ATGA-ACGTGTG-A---A----TTATCATT---TTGAATATAATCAATAAA-T-TAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGG-GGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGT-ATTAATTCGA-TAGTTTATT-TTT-A---AAAGA-a
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGG---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATCATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAGT-ATATGAACTTACTgttcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cattcagttaatCATTGA---AGAA-A-------A---AATTGTCA----A---TTAAATGA--TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGG-AATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGC-CTTACTTTGA-TA-TCGGTA-TTA-A---GAAAA-AAGTGAATTTACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ataTGAAAT-TTA-----A--ATCTATT-----------GAA---TAAAT----TTTA----T---AT--------ATTTTCGGAAACAATCTCTGAT-T-AAAC-TGC-CA--------GGTGTATATAATTGGCAATAA---AAGA-AAGC----A---A----TCA----T---t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA-TA-A---ATTTATTT-TCTATGAAATTAA-AAATAAACATTTTAAGAGTTT-ATCGTGAAAT-TTA-----A--ATATGTcctttcaggatgaataaataaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGA---AAGT-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TAatttggc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggaaacatttcacttaatAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATG-AATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGC-ATTATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGA---AAGA-ATTCA---A---A----TCA----T---TTTAATGT--ATAATATA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-CTTC---T
gi|3                          :                                                                                                                                                          caaatggttaatgtgaaatttaggtaaacatgtTATACAAACATTT-T-TTTTCCAAATACCTTTCA-TCCGCCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA-TA-A---A---ACGT-TATCTAAAACTTAGAAATAA-CATTTTAAATGTTT-AATGTGAGAT-TTA-----A--ATATATct
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gi|30                         :                                                                                                                        tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccTATAAAAACAATT-T-TTTTCTAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGTTTAAATCAAATGACAAAAA-TAGTTTAATCGGAtataattaagtatttagatatatat
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1060 )     :                                                                                                                                                                                           TATANAAATANTTAT-TTTTCCAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---ACGT-TCTCTGAAATTAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGANAT-TTA-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T---AT------CTATTTTCGGAAACAATCTCTGATGT-AGA--TGC-CA--------AGTATATANAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TNTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-NTA-A---AAAAA-ANATGAACTTACT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-----G--ATAAATT------------AA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTGTCGGAAACAATCTCT---------------------------TA-ACAAA-----CAATGA---AAAATA-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAGTAAA-TTTGTTCA---TCT---TATT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAGAT-AAATGAACTGACTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatgaGTATGTATATTTGGCAATGA---AAGA-A----------------TAA----T---TTAAATGT--TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAGAACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTCT-TTA-ATTATTTTGA-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taataatttattgcttaaacctcttctttctt-----A--ATATGTT-----------GAA---TAGAT----TTTA----T-----------CTATTTTGGAAAATAATCT-TAAT-T-AAAGCTGC-CATAAGTACCGGTATATAAAGTTGGCAGTGC---AA--------------------------------TAAAGAT--C--------TGTGTTCA---TCC---TCTT-ATTCG--CG-GGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAATCATTTTGT-CA-TTTATA-tttataaatttttaatatata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAAACAATCTCTGATGT-AG-------C-----------TATATAAAGTTGACAATGA---ACGA-A-------AGAAA----TCA----TAATTTAAGTGT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGAAATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TAC-ATTATTTCGA-AA-TTGATA-TTA-A---GAAAA-TAATGTATTTACTt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                           TATATAAATAGACATGTTTTTCAAAGACCGTCTC-TGTACAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---AAAA-TCTCTGAAATAAAGAA----------TAG--GTT---ATGT--------A-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTTTTGGAAACAAT--------------------------------ATATGAAG----CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGTAACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAAATATATGAACTTA
gi|20                         :                                                                                                                                                       tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgATAAACAT-TTTGTAAAAGACCGTCCA-TGTATAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTCA-TATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actttatttttatctttggcctttgctacagaagcatttagagtctacatctac-AGC--TGC-CA--------AGTACATGAAGTCGGCAATGA---ATGA-ACGTGTG-A---A----TTATCATT---TTGAATATAATCAATAAA-T-TAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGGGGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGT-ATTAATTCGA-TAGTTTATT-TTT-A---AAAGA-a
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGG---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATCATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAGT-ATATGAACTTACTgttcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cattcagttaatCATTGA---AGAA-A-------A---AATTGTCA----A---TTAAATGA--TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGGAATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGC-CTTACTTTGA-TA-TCGGTA-TTA-A---GAAAA-AAGTGAATTTACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ataTGAAAT-TTA-----A--ATCTATT-----------GAA---TAAAT----TTTA----T---AT--------ATTTTCGGAAACAATCTCTGAT-T-AAAC-TGC-CA--------GGTGTATATAATTGGCAATAA---AAGA-AAGC----A---A----TCA----T---t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA-TA-A---ATTTATTT-TCTATGAAATTAA-AAATAAACATTTTAAGAGTTT-ATCGTGAAAT-TTA-----A--ATATGTcctttcaggatgaataaataaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGA---AAGT-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TAatttggc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggaaacatttcacttaatAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGC-ATTATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGA---AAGA-ATTCA---A---A----TCA----T---TTTAATGT--ATAATATA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-CTTC---T
gi|3                          :                                                                                                                                                          caaatggttaatgtgaaatttaggtaaacatgtTATACAAACATTT-T-TTTTCCAAATACCTTTCA-TCCGCCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA-TA-A---A---ACGT-TATCTAAAACTTAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGAGAT-TTA-----A--ATATATct
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gi|30                         :                                                                                                                        tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccTATAAAAACAATT-T-TTTTCTAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGTTTAAATCAAATGACAAAAA-TAGTTTAATCGGAtataattaagtatttagatatatat
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1060 )     :                                                                                                                                                                                           TATANAAATANTTAT-TTTTCCAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---ACGT-TCTCTGAAATTAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGANAT-TTA-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T---AT------CTATTTTCGGAAACAATCTCTGATGT-AGA--TGC-CA--------AGTATATANAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TNTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-NTA-A---AAAAA-ANATGAACTTACT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-----G--ATAAATT------------AA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTGTCGGAAACAATCTCT---------------------------TA-ACAAA-----CAATGA---AAAATA-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAGTAAA-TTTGTTCA---TCT---TATT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAGAT-AAATGAACTGACTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatgaGTATGTATATTTGGCAATGA---AAGA-A----------------TAA----T---TTAAATGT--TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAGAACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTCT-TTA-ATTATTTTGA-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taataatttattgcttaaacctcttctttctt-----A--ATATGTT-----------GAA---TAGAT----TTTA----T-----------CTATTTTGGAAAATAATCT-TAAT-T-AAAGCTGC-CATAAGTACCGGTATATAAAGTTGGCAGTGC---AA--------------------------------TAAAGAT--C--------TGTGTTCA---TCC---TCTT-ATTCG--CG-GGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAATCATTTTGT-CA-TTTATA-tttataaatttttaatatata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGAAACAATCTCTGATGT-AG-------C-----------TATATAAAGTTGACAATGA---ACGA-A-------AGAAA----TCA----TAATTTAAGTGT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGAAATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TAC-ATTATTTCGA-AA-TTGATA-TTA-A---GAAAA-TAATGTATTTACTt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                           TATATAAATAGACATGTTTTTCAAAGACCGTCTC-TGTACAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---AAAA-TCTCTGAAATAAAGAA----------TAG--GTT---ATGT--------A-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TTTA----T-----------CTATTTTTGGAAACAAT--------------------------------ATATGAAG----CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGTAACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAAATATATGAACTTA
gi|20                         :                                                                                                                                                       tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgATAAACAT-TTTGTAAAAGACCGTCCA-TGTATAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTCA-TATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actttatttttatctttggcctttgctacagaagcatttagagtctacatctac-AGC--TGC-CA--------AGTACATGAAGTCGGCAATGA---ATGA-ACGTGTG-A---A----TTATCATT---TTGAATATAATCAATAAA-T-TAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGGGGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGT-ATTAATTCGA-TAGTTTATT-TTT-A---AAAGA-a
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGG---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATCATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAGT-ATATGAACTTACTgttcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cattcagttaatCATTGA---AGAA-A-------A---AATTGTCA----A---TTAAATGA--TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGGAATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGC-CTTACTTTGA-TA-TCGGTA-TTA-A---GAAAA-AAGTGAATTTACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ataTGAAAT-TTA-----A--ATCTATT-----------GAA---TAAAT----TTTA----T---AT--------ATTTTCGGAAACAATCTCTGAT-T-AAAC-TGC-CA--------GGTGTATATAATTGGCAATAA---AAGA-AAGC----A---A----TCA----T---t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                            AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA-TA-A---ATTTATTT-TCTATGAAATTAA-AAATAAACATTTTAAGAGTTT-ATCGTGAAAT-TTA-----A--ATATGTcctttcaggatgaataaataaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGA---AAGT-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TAatttggc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggaaacatttcacttaatAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGC-ATTATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGA---AAGA-ATTCA---A---A----TCA----T---TTTAATGT--ATAATATA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-CTTC---T
gi|3                          :                                                                                                                                                          caaatggttaatgtgaaatttaggtaaacatgtTATACAAACATTT-T-TTTTCCAAATACCTTTCA-TCCGCCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA-TA-A---A---ACGT-TATCTAAAACTTAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGAGAT-TTA-----A--ATATATct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                           tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacataAAA-TACCTT--TC--ATCCGC-CAGCTTA-TTGA---A---ATG-----CTTAAATCAA---AT-GACAA---AAATATTTCAATCGGATTTGTTC-----A--GTATATA-----------AAACGTTATCTAAAACTTAGAAAT---AA------C-ATTTT-----A-AATGTTTAATGTGAGA--T-T-TA--------AATATATAT--TTGGAGATAA---AAGA-ATAAT---A---A----TCA----T---TTTATTGT--TTAATACA-TGTGTTCA---TCA---TTTT-CTTC---TT-AG----------TATG------A-A-AAG--TATATAATTAT-ATTATATTGA-CA-TTGATA-TTT-A---AAAatttggagataaaagaataataatcattttattgtttaatacatgtgttcatcattttcttcttagtatgaaaagtatataattatattatattgacattgatatttaaaatataattaagtatttagatatatat
gi|30                         :                                                                                                                        tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccTATAAAAACAATT-T-TTTTCTAAAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGTTTAAATCAAATGACAAAAA-TAGTTTAATCGGAtataattaagtatttagatatatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATTTTA--TATGACG-T-A-A-AA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              aaTTTTAATCCGATTTGCTCAGTAAA-TA-A---A---ACTC-TCTCTGAAATTAAGAGGT-AACATTATTAATGTTC-Aaaaaaatatctgttct
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---ACGT-TCTCTGAAATTAATAAAT-AACATTTTACGTGTTT-AATGTGAAAT-TTA-----A--ATGT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --T-A-A-AAG--TTTCTCA-TGC-ATTATTCCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAATA-A-ATGAACTTACT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-AT--A---AAAAT-ATATGAACTTGCTt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                            gttgAGATATCTGT-TTCTATCATGACCTTCCA-TTTACAA-------GCTTTTTGAATTGCTTGAATCAAATGGCAAAA--TAAATTAATCATATTTGCTCAGTATAATT-ATAAA---ACAT-TGTCTGAAAATAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATATGAAAT-TTA-----G--ATATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gatcttaacaaaacttagtagttatattactgtaATATACATTTGGCCATGA---AAGA-ATAATAATA---G----TCA----T---TTGAATGT------TAAG-TGTGTTAA---TCC---TTTT-CTTTGTCTTGAAGAACT-----TGAAAG--T-A-ATAAA--T-TTT---TGT-ATTATTTTGA-CA-TTTATATTTA-A---AACAT-AGATAAAcatttggccatgaaagaataataatagtcatttgaatgttaagtgtgttaatccttttctttgtcttgaagaacttgaaagtaataaatttttgtattattttgacatttatatttaaaacatagataaatatttaa
gi|5                          : gatcttaacaaaacttagtagttatattactgtaagatatctgtttctatcatgaccttccatttacaagctttttgaattgcttgaatcaaatggcaaaataaattaatcatatttgctcagtataattataaaacattgtctgaaaataagaaataacattttaaatgtttaatatgaaatttagATATATATATTT---TTTCCCTAAGATCTTCCAAGGTACAA-------GCTTATTGAATTCCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATATTAATCGGATTTACTCGGTATA-TA-A---A---ACGT-TTTCTGAAA-TGAGAAAT-AACATTTTAAATGTGT-AATGTGACGT-TTA-----GCTATATATTTGGCGATGGTAGAA---TATTTATTGTTTA----TTTAAT-------TATTTT--GAAG-AATTTTGGATtatttaa
gi|6                          :                                                                                                                                             cacttaatttttaacttttatctgttcttgcttcagatatttggagaggAAAAATATTT---TTTTCTAAAGACCTTCAA-TTTACAA-------GCTTATCGAATTGCTAAATTTAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATCTGCTCAGTATA-GC-A---A---ACGT-TGTCTGAAATTAAGAAAT-AATATTTT----------ATCTGAAAC-TTATTATTA--ATATATtgaaaagtacttcttgtattattttgacatttatatgtataacctaaattaatattaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcATATATATTTGGCAATGA---AAGA-ATAAT---A---A----TCA----T---TTAAAAGT--TTAATGAA-TGTATTCATTCTCC---TCTTCATCT---TG-ATAAACTAAGGCTTTGAT--G-G-A-AAG--TATGTCT-TAT-ATTGTTTTGACTT-TTTAT--TT--------AAA-ACATAAA-TTACTatttggcaatgaaagaataataatcatttaaaagtttaatgaatgtattcattctcctcttcatcttgataaactaaggctttgatggaaagtatgtcttatattgttttgactttttatttaaaacataaattactattgaatattt
gi|7                          :                                            tttcaaaaatatttttttctaaagaccttcaatttacaagcttatcgaattgctaaatttaaatgacaaaaatattttaatcggatctgctcagtatagcaaacgttgtctgaaattaagaaataatattttatctgaaacttattattaATATTTAT-ACTT---AAGACTGTCCA-TGTGCAC-------GCTTATGGAATTGCTTAAGATAAATGACAAAAG-TACTTTAGTCACATTTGCTCCGT-TT-TT-A---A---CAGA-TCTCTGAAATTAAGACAC-AGCTTTTTAAATATTT-AATAGGTTAT-GTT-----A--ATATTGT-----------GAA---TATCT----TT------T---AT------CAATTTTCGGAAACAATCGTTGA------A--T----------------------------CAATGA---AAGA-A-------A---A----TC-----T---TTAAATAG--TTTATAAA-TATGTTCA---TCCT--TTTT-TTTT---TT-AGGAATA-----TAT-AT--T-A-A-GAattgaatattt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                     aagaagattttaccttttgttctaatctACAA-------GCTTGTGGAACTGCTTAAATTAAATAGCAAAAT-CATTTAAGACGGGTTTGCTCAGTATA-GT-A---AC--ACGT-TCTCTAAAATTACAAGAC-AACATTTAAAATGAGT--ATATGAAAT-TTA-----A--ATATTTT-----------GAA---TAAAT----TT------T---AT------CTATTTTCGGAAACAATCTC-------AGA--T-------------------TAAA-TTGGCAATGA---AAGA-A-------AAACA----TCATC--T---TTAACTAT--TCAATAAAGTTTG--CA---TTC---GCTT-GTTC---TT-aaaataaatgaact
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                               tttaaaaaaaatgtatctttgtttaatagatttataaatctaAAAG-TATTTTAATCAGATTTACTCAGTATA-TT-A---A---AATA-TCTCTGAAATTAAGACAC-AGCATTTCAAATGTTC-AATATGTTAT-GTA-----A--ATATATT-----------GAA---TATCT----TT------T---GT------CTATTTTCGGAAACAATCTCTGA------A--T----------------------------CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAACTAA--TTTATCAA-TTTATTCA---TCC---TTTT-ATTT---TT-AGGAATA-----TATGAC--T-T-A-AAGTTTTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AATAA---ATGAACTTACTgat


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               A     T  GT     TA            .       .            T                          .                          .  . .   .     C                  T                 .       A  .   .     .        .             .       ATTGTTTATTTAAT                 C             G CGTAGATGCCAAG                  T G          .      . TTCAA       .      .    .          .  T      . T      .     T      .    .    A       .          T  A . .   .  T     .   .          .  .      T   . .       . T     T
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                             .                          .  . .   .     A                  C                 .       T  .   .     .                                                                                                            T .          .      . A           .      .    .          .  T      . G      .     .      .    .    .       .          .  . . .   .  T     .   .          .  .      A   . .       .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .        .     .                  .                 .       .  .   .     .                                                                                                            A .          .      . A           .      .    .          .  T      . G      .     .      .    .    .       .          .  . . .   .  A     .   .          .  .      T   . .                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .                                .     .                                                                                                            . .          .      . A           .      .    .          .  T      . T      .     .      .    .    .       .          .  . . .   .  T     .   .          .  .      A   . .                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .     .                                                                                                            . .          .      . A           .      .    .          .  T      . G      .     .      .    .    .       .          .  . . .   .  A     .   .          .  .                             
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .      . A           .      .    .          .  T      . T      .     .      .    .    .       .          .  . . .                                                            
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1060 )     :                                                                                                                                                                                           TATANAAATAN---TT-T-TTTTCCA--AAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---ACGT-TCTCTGAAATTAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGANAT-TTA-----A--ATATATT-----------GAATATCTTTTAT-----CTAT--TTTCGGAA--ACA------ATCTCTGATGT-AGA--TGCCA--------AGTATATANAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TNTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGAC--T-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-NTA-A---AAAAA-ANATGAACTTACT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcggatttggtcagtatatttaacgttttctaaaattaagaaaaatattttaaatgtttaatgtgaaatttagCA--------AGTATATCTAGTTGGCAATGA---AAGA-A-------C---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAT-TTTTTTCG---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-ATG--TTTTTCA-TAC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-ATATAAAAA-AAATGAATTTACcataactaaatacttta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttgatatctgtttatatgacattcaatttaaaataattatcaagtatgttTATATT-----------GAATATCTTGTAT-----CTAT--TTTGGGAA--CCA------ATCTCTGACGT-AGA--TGCCA--------AGTATATACAGTTGGCAATGA---AATA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TGTGTTCA---TCC---CCTT-ATTG---TT-AGGAATT-----AATGACTTT-A-A-AAG--TATTTCA-TGC-ATTATTATGA-TA-TTGCTA-TTACG---AAGAA-ATTTGAATTTACTc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTATTGAATTGCTTACATCAATCGACAAAAAATAGTTTAATCGAATTGACTCAGTATA-TT-A---A---ACGC-TCTCTAAAATTAAGAAAA-AACATTTt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-----G--ATAAATT------------AATATCTTTTAT-----CTAT--TGTCGGAA--ACA------ATCTCT--------------------------TA-ACAAA-----CAATGA---AAAATA-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAGTAAA-TTTGTTCA---TCT---TATT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAGAT-AAATGAACTGACTgtgttcacactcttccttttcttcttttataacttaagattgaaaagtattacttatatcatttgactttttttttcttaaaactaaataaatatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatgaGTATGTATATTTGGCAATGA---AAGA-A----------------TAA----T---TTAAATGT--TTAATAAA-TATATTTA---TCTTCGTCTT-CTTC---TTGAAGAACG-----TAAGAT--TGA-A-AAG--TATTTCT-TTA-ATTATTTTGA-TT-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taataatttattgcttaaacctcttctttctt-----A--ATATGTT-----------GAATAGATTTTAT-----CTAT--TTTGGAAA--ATA------ATCT-TAAT-T-AAAGCTGCCATAAGTACCGGTATATAAAGTTGGCAGTGC---AA--------------------------------TAAAGAT--C--------TGTGTTCA---TCC---TCTT-ATTCG--CG-GGGAACT-----TCTGAT--T-A-A-AAG--TATTTCT-TGCAATCATTTTGT-CA-TTTATA-tttataaatttttaatatata
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGAA--ACA------ATCTCTGATGT-AG------C-----------TATATAAAGTTGACAATGA---ACGA-A-------AGAAA----TCA----TAATTTAAGTGT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-A-TT---TT-AGAAATT-----TATTAT--TAA-A-AAG--TATTTCA-TAC-ATTATTTCGA-AA-TTGATA-TTA-A---GAAAA-TAATGTATTTACTt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                           TATATAAATAGACATG-T-TTTTC-A--AAGACCGTCTC-TGTACAA-------GCTTATGGAATTGCTTAAAACAAATGACAACAG-TATTTTAGTCAGATTTGCTCAGTATA-TT-A---A---AAAA-TCTCTGAAATAAAGAA----------TAG--GTT---ATGT--------A-----A--ATATATT-----------GAATATCTTTTAT-----CTAT--TTTTGGAA--ACA------AT-------------------------------ATATGAAG----CAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGTAACT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TCTTTCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAAATATATGAACTTA
gi|20                         :                                                                                                                                                tttattttgcatctgtccttgctacagtgattttagaaagacgTACATAAACAT---TT-T-GT---AA--AAGACCGTCCA-TGTATAATCTGAAAGCTTGTTGAATTGCT-AAATCAAATGAAAGAAA-TATTTTAGTAGGATTTACTCA-TATA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             actttatttttatctttggcctttgctacagaagcatttagagtctacatc-AGC--TGCCA--------AGTACATGAAGTCGGCAATGA---ATGA-ACGTGTG-A---A----TTATCATT---TTGAATATAATCAATAAA-T-TAATCA----CC---CCTT-GTTC---TTAAGGGGCT-----TATGAT--T-A-C-AA---TATTTGT-TGT-ATTAATTCGA-TAGTTTATT-TTT-A---AAAGA-a
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAATGG---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--ATAATAAA-TGTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTCA-TGC-ATCATTTCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAAGT-ATATGAACTTACTgttcat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cattcagttaatCATTGA---AGAA-A-------A---AATTGTCA----A---TTAAATGA--TAAATACA-TTTATTCA---TCA---TCTT-ATTT---TT-AGGAATA-----GATAAT--T-ATA-TAG--TATCTTA-TGC-CTTACTTTGA-TA-TCGGTA-TTA-A---GAAAA-AAGTGAATTTACT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataTGAAAT-TTA-----A--ATCTATT-----------GAATAAATTTTAT-----ATAT--TTTCGGAA--ACA------ATCTCTGAT-T-AAAC-TGCCA--------GGTGTATATAATTGGCAATAA---AAGA-AAGC----A---A----TCA----T---t
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 AAATCAAATGACAAAAA-TATTTTGTTTGGATTTGCTTGTTATA-TA-A---ATTTATTT-TCTATGAAATTAA-AAATAAACATTTTAAGAGTTT-ATCGTGAAAT-TTA-----A--ATATGTcctttcaggatgaataaataaa
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAATGA---AAGT-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-ATGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAA--TAatttggc
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggaaacatttcacttaatAATGA---AAGA-A-------A---A----TCA----T---TTAAATAT--TAAATAAA-TTTGTTCA---TTC---TCTT-ATTT---TT-ATGAATT-----TATGACT-T-A-A-AAG--TTTTTTA-TGC-ATTATTTCGA-TA-Taaaagaactttct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGA---AAGA-ATTCA---A---A----TCA----T---TTTAATGT--ATAATATA-TGTGTTCA---TCC---TCTT-CTTC---T
gi|3                          :                                                                                                                                                          caaatggttaatgtgaaatttaggtaaacatgtTATACAAACAT---TT-T-TTTTCCA--AATACCTTTCA-TCCGCCA-------GCTTATTGAAATGCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATTTCAATCGGATTTGTTCAGTATA-TA-A---A---ACGT-TATCTAAAACTTAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATGTGAGAT-TTA-----A--ATATATct
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacataAAA-TACCTT--TC--ATCCGC-CAGCTTA-TTGA---A---ATG-----CTTAAATCAA---AT-GACAA---AAATATTTCAATCGGATTTGTTC-----A--GTATATA-----------AAACGT----TAT-----CTAAAACTTAGAAATAACATTTTAAATGTTTAATGTGAGA--T-TTA--------AATATATAT--TTGGAGATAA---AAGA-ATAAT---A---A----TCA----T---TTTATTGT--TTAATACA-TGTGTTCA---TCA---TTTT-CTTC---TT-AG----------TATG------A-A-AAG--TATATAATTAT-ATTATATTGA-CA-TTGATA-TTT-A---AAAatttggagataaaagaataataatcattttattgtttaatacatgtgttcatcattttcttcttagtatgaaaagtatataattatattatattgacattgatatttaaaatataattaagtatttagatatatat
gi|30                         :                                                                                                                        tgcttcattttcaccttttccagctacagtgatttaaggaggacatatatacaaacattttttttccTATAAAAACAA---TT-T-TTTTCTA--AAGACCTTCCA-TGTACAA-------GCTTATTGAATTGTTTAAATCAAATGACAAAAA-TAGTTTAATCGGAtataattaagtatttagatatatat
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   a--TTAATAAA-TTTGTTCA---TCC---TCTT-ATTT---TT-AGGAATTTTA--TATGACG-T-A-A-AA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaTTTTAATCCGATTTGCTCAGTAAA-TA-A---A---ACTC-TCTCTGAAATTAAGAGGT-AACATTATTAATGTTC-Aaaaaaatatctgttct
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ---ACGT-TCTCTGAAATTAATAAAT-AACATTTTACGTGTTT-AATGTGAAAT-TTA-----A--ATGT
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T-A-A-AAG--TTTCTCA-TGC-ATTATTCCGA-TA-TTGATA-ATA-A---AAATA-A-ATGAACTTACT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCCA-TGC-ATTATTTCGA-TA-TTGATA-AT--A---AAAAT-ATATGAACTTGCTt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                            gttgAGATA----TC-T-GTTTCTATCATGACCTTCCA-TTTACAA-------GCTTTTTGAATTGCTTGAATCAAATGGCAAAA--TAAATTAATCATATTTGCTCAGTATAATT-ATAAA---ACAT-TGTCTGAAAATAAGAAAT-AACATTTTAAATGTTT-AATATGAAAT-TTA-----G--ATATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatcttaacaaaacttagtagttatattactgtaATATACATTTGGCCATGA---AAGA-ATAATAATA---G----TCA----T---TTGAATGT------TAAG-TGTGTTAA---TCC---TTTT-CTTTGTCTTGAAGAACT-----TGAAAG--T-A-ATAAA--T-TTT---TGT-ATTATTTTGA-CA-TTTATATTTA-A---AACAT-AGATAAAcatttggccatgaaagaataataatagtcatttgaatgttaagtgtgttaatccttttctttgtcttgaagaacttgaaagtaataaatttttgtattattttgacatttatatttaaaacatagataaatatttaa
gi|5                          : gatcttaacaaaacttagtagttatattactgtaagatatctgtttctatcatgaccttccatttacaagctttttgaattgcttgaatcaaatggcaaaataaattaatcatatttgctcagtataattataaaacattgtctgaaaataagaaataacattttaaatgtttaatatgaaatttagATATATATA----TT-T-TTTCCCT--AAGATCTTCCAAGGTACAA-------GCTTATTGAATTCCTTAAATCAAATGACAAAAA-TATATTAATCGGATTTACTCGGTATA-TA-A---A---ACGT-TTTCTGAAA-TGAGAAAT-AACATTTTAAATGTGT-AATGTGACGT-TTA-----GCTATATATTTGGCGATGGTAGAATATTTATTGT-----TTAT--TTtatttaa
gi|6                          :                                                                                                                                             cacttaatttttaacttttatctgttcttgcttcagatatttggagaggAAAAATA----TT-T-TTTTCTA--AAGACCTTCAA-TTTACAA-------GCTTATCGAATTGCTAAATTTAAATGACAAAAA-TATTTTAATCGGATCTGCTCAGTATA-GC-A---A---ACGT-TGTCTGAAATTAAGAAAT-AATATTTT----------ATCTGAAAC-TTATTATTA--ATATATaattattttgaagaattttggattgaaaagtacttcttgtattattttgacatttatatgtataacctaaattaatattaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttcATATATATTTGGCAATGA---AAGA-ATAAT---A---A----TCA----T---TTAAAAGT--TTAATGAA-TGTATTCATTCTCC---TCTTCATCT---TG-ATAAACTAAGGCTTTGAT--G-G-A-AAG--TATGTCT-TAT-ATTGTTTTGACTT-TTTAT--TT--------AAA-ACATAAA-TTACTatttggcaatgaaagaataataatcatttaaaagtttaatgaatgtattcattctcctcttcatcttgataaactaaggctttgatggaaagtatgtcttatattgttttgactttttatttaaaacataaattactattgaatattt
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