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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAATTCG-TGGGC-GTATCGAGTAAAAAA-CTATTAAATGATCGTTGTTTTAATTATCTTTGGAACAACACAGATGT-----------AAGTAGAAAAAAGTAAGTGAACGAAT--CATTGATCAATA--T-TT--ACAATCA-TGGTACTCTCAAATA--AATACTTCATCAAAACTAGAA--TCA---TATAAGTTA----TTTAAAACAGCCTATGAACTGGAAAAA--TAT---TTA-T-TAATAATATGTAATACAAATCA
gi|3                          : taatgaaaaaactgtcgttatgactttcaaaactggaacaagaaggcataatgttgatatgttttacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaaAATCG-TGATC-ACATCAAGTAAAGATAAGGTTAAACAGCCTAGGATTTAATTATCTATGGCATAATGCCAATATAACAAATATGCAAATTGATAG-AGTTATTAAACGAAC--ATTTGAT--AAGTAT-TT--ACAATCA-TGGT--------GTA--GAAGCATCGCGTAAACTTAAA--TGT---TATAAAATA----CTTAAATCTTTATATAAAGCTAAAAAATATAT---TTG-T-T--CGGTAAGTAATGTTAATTAAAGAAAATCATTAACCCGTTTTAGATGCTCTGt
gi|9                          :        cagtgacaaaatcgttgccttgttttttaaaccggaacaagaatggaaaatgttgatatatgttatgataggaaaaattattattaaaaataattgttaatacatttacatatttaggagtaatattatccgctaaaggttcgttttatcaataactaaaagcgctattttcactaaattctttgttttatattgtctcacttgaaatatcagaaaaaaggaaattgtttgatgtaatcgttggtcctatattaaactatggctccgaaatatggggatttcgttatacttttttatattgaacacgttcatatacaattttaaaacaaatataatgagaaagaagtcaaatttctaataatgttgtagatggttaattaggtagaatgccattttctgtcatgagactgattaaaataataaaatagtggtttaaagtaatgactaagcctcgaaagtttaatatataaagttaataataatgatatagatgtaaatgggaatgtactgaataattAATTGCTGGTCTATCT-AAGTAAGACACATGTTGAATGATCAATGTTTCAGTTTCCTGTGGGATAATGAACGCGTAACCAATATTCAGATAGAAAG-AGTTATTGAA-AAACTGCACT-ACC--AG--TATT--ACCAAAACTGG-TAT-TCAACTCTTAATACTTCATC--AATTAGCA--ACA---TACAAGATA----ATCAAAAATACCTACAAAGTTGAAAAATATATAGACTG-TATTACAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttaatttctcttatatactctaatatacaaaacttttaaagaccaaatacatataaaccaaaatgaaattaacaatAATGATCTTGGTTTTGATTATCTTTGGAACAACACAAATGTTACAAATATCCAAGTAGAAAA-AGTAAGTGAACGAAT--TATTGATCCATT--T-TT--ACAATTA-TGGTACTCTCAAATA--GATACTTCATCAAAACTAAAA--TCA---TATAAATTA----AATAAAACAGCCTATGAACCGGAAGAAA-TAC---AAAAT-TTACAATAAGTAATACAAATCATCGTGTAGCATTAACATAATTTAGATGTTCTGCTCATA--AATCAATAATAGAGGAAGGGAGATTTCGTAATACTGATCGTAACCTAATA--AAATGTATACATTGTAACATGAATGTCATCGAAAACGA--ATATCACTTCCTCGTGATATGCC-TAAA-AACAGAAC-CTA----AAG--GATTGAGTGTTTACCTAGGTACAACTGTTCTTTTCCCTCAAAACAAA----AATGTATGTCTCTTATGAAA----A----GC-TGTCAGGTACTTTAAA-----AGGGTTAGC-AAAGTT-TATATTTTTA-G-CAATTGA------AATAAGAAACGCCCAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACTATACAACCTTAAATGTTACAAT--TTTTATAATTGTAGTAATATATTAGGTAATAA-GT--ATACATTTTCAAAAAAC--T-AACCCTTTAAAAATAATATGTTAGTTAAAAAGTG-ATAA------AATCGAATCAA-ATATATCAATATGTTTATATATCTTGTTTCTCTCG--TTATGCATTTTTTAACTAA-CTGTAAA-------------TTTCAATCAAAAACTGTATGCTACTTTCAAAAAGAATGCA-TATTTAAGGCTTTACA----TTGTA----TCAT----ATT------G-GATCGGTGTTGATATAT--TTAC-----------TGTTAAGTTAAAAAGAAAAAAGAAACATTTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAGT---T---ATAAATAACCATAAAAAACAAATAT--------GTAGAATATAGCTAA--CAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATGTATA--TCA-ATGATTAT-----------ATGTGTGTTTTGTCTCTTCTCTGTA--ATTTGTGAG-TG--ATTTGTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AAACAATATGTATATGTTATGTTGAAT-AAGATATTGAATTGat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AGTTATTGAATGAAT--AATTGATTT--G--T-TTTGACAATCA-TGGTATTCACAATTA--CATGCATCGCCTAAACTTAAACGTTATACAATAAATTAAATCTTTA--------TATTAAGCTAAAATATATAC---TTG-T-T--CAGTAAGTAATGTTAATCATAGAAAATCATCAACACGTTGTAGATGCTCTGC--ATACTAATTAGCTATAGAAGAA---AGATTC-GTGATATAAATCGTAATTTAAGA--ATGGGTGGCCATTGTAATAGGAATATTGTTGAAAA-AA--GTAT-AATTTTTAATGGTTTGCCCCAAATTATAA-ACATTTGCGCAAGATGATT---TGCCTA-A-AAATAATA--ACTCCTTGCCAACAATACAAC----AATTCAACTTATTTATGAAA----TCTGATT-GATCGGGTATGTTAAA-----AAGATTAGCTAAA-TC-TGTGTTTT-T-GACAAATGAATTATTAATAAGAAAaattaaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AGAATTAACACGTGTTAGATGCTCTGCACATA--AAGTAGCTATAAAAGAAAGTATTTATCGTAATA--GATAGTAATTTAAGA--GTGTATGTCTA-TGTAATATGAATATTGTCGGATATGA--GTATCATTTTCTGATGATTTGACCCAAA-TA---TAC--------AA----ATT-------TACATA---AATAATGT-----------AAAACAAAGCACCATT----TCTCTTATGAAATCTGACAAATTGGGTC-TG----TTTAAAATATAAGCTTAGT---A-TG-TGT-TTTT-G-G-CAAATGA------ATTAAGAAAt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaataatgaaaatcctaatagaaaAATACAATCTAGATGCTCTGTTCATA--AACTAGAGACAGAAGAAGGTAGGCATTGAAATAGTGAT--AAA---AAGATTAAGTA-----ATTGTAATATAAACGTAACTGAGAACGA--A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGAAGAAGGAAGATT-----ACA--GATCGTAACATAAGA--GTGTGTCCTCATTGTAACATTAATGTTTTTGAGAAT-ATTATATAATTTTCTAATAATTTGCCCAAAA-TATAGAAA-TTG----ACG--TATAGAAATTTTGCCTAAGTA-TACTaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aGTGTCTCTTATGAAA----ACAGAAC-AGTCAGGTACATCAAA-----AGGGTTAGC-AAA-ATATATATTTT-AAG-CAACTGA------AATAAGAAGCGCCGAATAAAACTGTTAAAGTATATTTTAGATAACAATACAACGTTAAATGTTACAACTTTT--ATAACTGTAGTAATATATT-TGTATTGGTGTTGATATATTT-------ACTGTTAATAC-----------TATGTTAATTTAAAA----ATCA------AAT------AA-ACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGTTAGTTAAAAAATGCATAACGAGAGAAAC-----AAGATATATAAACATATTGATATAT----TTGATTCGATTTTAT-CACTTTTTAACTAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatgatcttggttttgattatctttggaacaacacaaatgttacaaatatccaagtagaaaaagtaagtgaacgaattattgatccatttttacaattatggtactctcaaatagatacttcatcaaaactaaaatcatataaattaaataaaacagcctatgaaccggaagaaatacaaaatttacaataagtaatacaaatcatcgtgtagcattaacataatttagatgttctgctcataaatcaataatagaggaagggagatttcgtaatactgatcgtaacctaataaaatgtatacattgtaacatgaatgtcatcgaaaacgaatatcacttcctcgtgatatgcctaaaaacagaacctaaaggattgagtgtttacctaggtacaactgttcttttccctcaaaacaaaaatgtatgtctcttatgaaaagctgtcaggtactttaaaagggttagcaaagtttatatttttagcaattgaaataagaaacgcccaataaaactgttaaagtatatttcagataactatacaaccttaaatgttacaatttttataattgtagtaatatattaggtaataagtatacattttcaaaaaactaaccctttaaaaataatatgCATAACAGAATGCTTCTTTCATAATGAAGGAG-TATTTAACGATTTGCA----TTATACTTAATTA----AGA------GTGATCGATGTTGATATGTGTTTA--GAAAACAGTATGTTGAGTTATTGA-AA--AATGAACA-ATCG----C---CATATGGCAATTGTTATT---ATATGTTAACAAATA---TA---GAATAT--------GTtgtaaatttcaatcaaaaactgtatgctactttcaaaaagaatgcatatttaaggctttacattgtatcatattggatcggtgttgatatatttactgttaagttaaaaagaaaaaagaaacatttcggtttcggacatatgacaattgttagttataaataaccataaaaaacaaatatgtagaatatagctaacatatttgaacatatatatgtatgtatatcaatgattatatgtgtgttttgtctcttctctgtaatttgtgagtgatttgtaacccgcctagtataaggcaaacaatatgtatatgttatgttgaataagatattgaattgaattaaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttatTACGTTCACGATAAAT-CAGTATATAATGCTTCAC-----TTATA-----CTA----AATTTGA--GTGATCGGTTTTAATATAT--TAACTGTA----------------------AACAA-----CATGACGGTTTCCGACATATGACAATTGTTA----------TC------CA---TAAGCAACTATTTTTTTCTGTAGAATATAGCTAATTAATTAATTTGTCATCAATTGTTTATAACATAAATATGTA----TA--TCATATCATATT-----------ATGTGTGTTATATATTTTCTCTGTA--ATTTATGAG-TG--TTTTGTAACCCGTCTAGTATAAGGC-AATACACATGTATATGTTATACCGAAT-AAAAAATTGAATTGcttttctgtaggatttatcttattaactatttgtcatcaatttgttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctctctgttatttgcgagttatttttgtaactgtttagtataaggcattaaacatgtatatgctatgctgaatagagtatttaattgaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTACAACTTTTATA----ACTGTAGTAATATATTTG-TATTGGTGTTGATATAT--TTACTGTTAATACTATGTTAATTT-AAAA-ATCAAATAAACATaattg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggtgtctcttatgaaaacagaacagtcaggtacatcaaaagggttagcaaaatatatattttaagcaactgaaataagaagcgccgaataaaactgttaaagtatattttagataacaatacaacgttaaatgT------G-TATTGGTGTTGATATAT--TTACTGTTAATACTATGTTAATTTAAAAA-T-CAAATAAACATGTTGGTTTTGGACATATGACA-TTGTAAGTTTTA---AGTAACAAACA---AAAACAAATAT--------GTAGAATATTTCTAA--AAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATG--TACATCA-ATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTA--ATTTGTGAG-TG--TTTTGTAACCCGCCTGGTATAAGGC-ACAAAACATGTATATGTTATACTGAAT-AACATATTGAATTG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacaacttttataactgtagtaatatattAA--AAT--ATATA---------------TGTAT-------------A---TCATAGGATAAT-----------TTGTGTATTATTTATCTTCTATGTAGTATTTG--AGTTT--TTTTGTAACCTACCTTGTGTAAGGC-AATAAATATGTATATTTTAAGCTGAATAAAAAAATTGAATTaattgaag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatacgaatgtgaaagagtattgctttaatatagcctttaatacctgattaatttgtcatcaaaatgttgAT--ATATG---------------TATAT-------------T----AA-ATGATAATTAAAAAAAAGTATGTGTGTTATGTAACTTCTCTGTA--ATTTGTGAG-AG--TATCGTAACCCGCTTAGTATAAGGC-AATAAACATATATATGTAATGCTGAAT-AAACTATTGAATTGtgagtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacatTCCTCTCTGTT--ATTTGCGAG-TTATTTTTGTAACT-GTTTAGTATAAGGCATTAAA-CATGTATATGCTATGCTGAAT-AGAGTATTTAATTGaattgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttatcataacagaatgcttctttcataatgaaggagtatttaacgatttgcattatacttaattaagagtgatcgatgttgatatgtgtttagaaaacagtatgttgagttattgaaaaatgaacaatcgccatatggcaattgttattatatgttaacaaatatagaatatgtcttttctgtaggatttatcttattaactatttgtcatcaatttgttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGGCAATAAA-CATGCATATATTATGCC-AAT-AATATATCGAATTGaa
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ATCTAAATATATAAATGTTTGATATAATGGTTACTCCTGTATTAAAGCATGGTTCTGAAATATGGGGATTTCATAATGTTACTGATATCGGATGCGTTCATCTTAAAACAGATATTATAAGTAAGAAGTCAAATTTCTATTAATACCGCAAATGGTGAATTAGGTAGAATGCCATTTTCTGTCAGGATACAGATTGGAGCAAAAAACATTAGCTTAAAATAATGAAAATCCTAATAG






Alignments
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Reference ( family-105 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAAATCG-TGGTCGTATC-AAGTAAAAA-A-A-TGTTAAACGATCNNNGTTTTAATTATCTNTGGAACAACGCAAATGTAACAAATATNCAAGTAGAAAGA-GTTATTGAACGAAT-NATTGATC-AN-G--T-TT--AC--AATCATGGTACT---CTCAANTAGATACTTCGTCNAAACTAAAATCATATA-AATTANTTAAAACNGCCTATGAAGCTGAA-AAATATAT---TTGT-TTACAATAAGTAATGCNAATC---ATAGAAAANCATTAACACGTTTTAGATGCTCTGCTCATA--AATTAGCNATAGAAGAAGGNAGATTTCGTAATA-T-GATCGTAACTTAAGAATGTGTGTCCATTGTAATATGAATGTCGTCGAAAACGA--ATATCATTTTCTAATGATTTGCCCCAAA-TATAGA-ACTT---NAAGGATTGAGTGTTTACNT--AAGTAATACTGTTCCTT---CCC---AA-A--ACAAAAATTCATGTCTCTTATGAAAACAGANCGGTCGGGTACG-TTAAA----AGGGTTAGC-AAA-TT-TGTA-TTTTA-G-CAANTGA------AATAAGAAACGCCNAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACNATACAACNTTAAATGTTACAACTTTTTTATAACTGTAGTAATATATTANGTANTGGTGTTGATACATTTTCAAAAAACTGTTAACNCTTTAAAAATAATATGTTAGTTAAAAAGTGATAA-----AATCAAATATATNAACATGTTNATATATCTTGTTNNTCCCGTTTTATGCACTTTTTAACTAA-CTGTAAA-------------TTTCAATCGANAACNGNATGCTACTTTCANAATGAATGCGTATTTAACGCTTTACATTATAACTAAATT----GTGATCGGTGTTGATATAT--TTACTGTNAATACTATGTTAANTTAAAAAAACAAATAAACATGTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAGT---A---ATTAACAAAC---ANAAACAAATA---------T--------GTAGAATATAGC-TA--A--AAT--ATTTG---------------AAC-------ATATATATGTATG--TA--TCATATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTAATTTGTGAGT--GTTTT-GTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AANAAACATGTATATGTTATGCCGAAT-AAAATATTGAATTG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggA--A--AAT--GTT-G---------------AAA-------ATATATATGTAT----A--TCATAGGATAAT-----------TTGTGTATTATTTATCTTCTATGTAGTATTTGAGT--TTTTTTGTAACCTACCTTGTGTAAGGC-AATAAATATGTATATTTTAAGCTGAATAAAAAAATTGAATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGAAGAAGGAAGATT-----ACA---GATCGTAACATAAGAGTGTGTCCTCATTGTAACATTAATGTTTTTGAGAAT-ATTATATAATTTTCTAATAATTTGCCCAAAA-TATAGA-AATT---GACGTATAGAAATTTTGCCT--AAGT-ATACTaattgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAATACAATCTAGATGCTCTGTTCATA--AACTAGAGACAGAAGAAGGTAGGCATTGAAATAGT-GATA--AA---AAGATTAAGTA---ATTGTAATATAAACGTAACTGAGAACGA--A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAGGC-AATAAACATGCATATATTATGCC-AAT-AATATATCGAATTGaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttcAATGATCTTGGTTTTGATTATCTTTGGAACAACACAAATGTTACAAATATCCAAGTAGAAAAA-GTAAGTGAACGAAT-TATTGATCCAT-T--T-TT--AC--AATTATGGTACT---CTCAAATAGATACTTCATCAAAACTAAAATCATATA-AATTAAATAAAACAGCCTATGAACCGGAAGAAATACA----AAAT-TTACAATAAGTAATACAAATC---ATCGTGTAGCATTAACATAATTTAGATGTTCTGCTCATA--AATCAATAATAGAGGAAGGGAGATTTCGTAATACT-GATCGTAACCTAATAAAATGTATACATTGTAACATGAATGTCATCGAAAACGA--ATATCACTTCCTCGTGATATGCCTAAAA--ACAGA-ACCT---AAAGGATTGAGTGTTTACCT--AGGTACAACTGTTCTTTTCCCTC---AA-A--ACAAAAATGTATGTCTCTTATGAAA----AGCTGTCAGGTACT-TTAAA----AGGGTTAGC-AAAGTT-TATATTTTTA-G-CAATTGA------AATAAGAAACGCCCAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACTATACAACCTTAAATGTTACAA--TTTTTATAATTGTAGTAATATATTAGGTAATAA-GT--ATACATTTTCAAAAAAC---TAACCCTTTAAAAATAATATGTTAGTTAAAAAGTGATAAAATCGAATCAAATATATCAATATGTTTATATATCTTGTTTCTCTCG--TTATGCATTTTTTAACTAA-CTGTAAA-------------TTTCAATCAAAAACTGTATGCTACTTTCAAAAAGAATGCATATTTAAGGCTTTACATTGTATC-ATATT----G-GATCGGTGTTGATATAT--TTACTGTTAA------GTTAA---AAAGAAA-AAAGAAACATTTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAGT---T---ATAAATAACCATAAAAAACAAATA---------T--------GTAGAATATAGC-TA--A--CAT--ATTTG---------------AAC-------ATATATATGTATGTATA--TCA-ATGATTAT-----------ATGTGTGTTTTGTCTCTTCTCTGTAATTTGTGAGT--GATTT-GTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AAACAATATGTATATGTTATGTTGAAT-AAGATATTGAATTGaattgaattga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATCG-TGATCACATC-AAGTAAAGATA-A-GGTTAAACAGCCTAGGATTTAATTATCTATGGCATAATGCCAATATAACAAATATGCAAATTGATAGA-GTTATTAAACGAAC-ATTTGAT--AA-GTAT-TT--AC--AATCATGGT-----------GTAGAAGCATCGCGTAAACTTAAATGTTATA-AAATACTTAAATCTTTATATAAAGCTAAA-AAATATAT---TTGT-T--CGGTAAGTAATGTTAATT---AAAGAAAATCATTAACCCGTTTTAGATGCTCTGaattaaat
gi|4                          : cagtgacaaaatcgttgccttgttttttaaaccggaacaagaatggaaaatgttgatatatgttatgataggaaaaattattattaaaaataattgttaatacatttacatatttaggagtaatattatccgctaaaggttcgttttatcaataactaaaagcgctattttcactaaattctttgttttatattgtctcacttgaaatatcagaaaaaaggaaattgtttgatgtaatcgttggtcctatattaaactatggctccgaaatatggggatttcgttatacttttttatattgaacacgttcatatacaattttaaaacaaatataatgagaaagaagtcaaatttctaataatgttgtagatggttaattaggtagaatgccattttctgtcatgagactgattaaaataataaaatagtggtttaaagtaatgactaagcctcgaaagtttaatatataaagttaataataatgatatagatgtaaatgggaatgtactgaataattCAATTCG-TGGGCGTATC-GAGTAAAAA-A-C-TATTAAATGATCGTTGTTTTAATTATCTTTGGAACAACACAGATGTAA-----------GTAGAAAAAAGTAAGTGAACGAAT-CATTGATC-AATA--T-TT--AC--AATCATGGTACT---CTCAAATAAATACTTCATCAAAACTAGAATCATATA-AGTTATTTAAAACAGCCTATGAA-CTGGA-AAA-ATAT---TTAT-TAATAATATGTAATACAAATC---AT
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttTACGTTCACGATAAATCAGTATATAATGCTTCAC-TTATA-CTAAATTTGA-GTGATCGGTTTTAATATAT--TAACTGT---------------------AAACAA-----CATGACGGTTTCCGACATATGACAATTGTTA----------TC------C---ATAAGCAACTA---------TTTTTTTCTGTAGAATATAGC-TA--ATTAATTAATTTGTCATCAATTGTTTATAAC-------ATAAATATGTA----TA--TCATATCATATT-----------ATGTGTGTTATATATTTTCTCTGTAATTTATGAGT--GTTTT-GTAACCCGTCTAGTATAAGGC-AATACACATGTATATGTTATACCGAAT-AAAAAATTGAATTGaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TACAACTTTT--ATAACTGTAGTAATATATT-TGTATTGGTGTTGATATATTT-------ACTGTTAATACT-----------ATGTTAATTTA--------AA-----AATCAAATA----AACATGTTGGTaattg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TT----GT-ATTGGTGTTGATATAT--TTACTGTTAATACTATGTTAATTTAAAAAT-CAAATAAACATGTTGGTTTTGGACATATGACA-TTGTAAGTTTTA---AGTAACAAAC---AAAAACAAATA---------T--------GTAGAATATTTC-TA--A--AAT--ATTTG---------------AAC-------ATATATATGTATG--TACATCA-ATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTAATTTGTGAGT--GTTTT-GTAACCCGCCTGGTATAAGGC-ACAAAACATGTATATGTTATACTGAAT-AACATATTGAATTGtttggacatatgacattgtaagttttaagtaacaaacaaaaacaaatatgtagaatatttctaaaatatttgaacatatatatgtatgtacatcaatgataatatgtgtgttatgtatcttctctgtaatttgtgagtgttttgtaacccgcctggtataaggcacaaaacatgtatatgttatactgaataacatattgaattgaattgaag
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ATCTAAATATATAAATGTTTGATATAATGGTTACTCCTGTATTAAAGCATGGTTCTGAAATATGGGGATTTCATAATGTTACTGATATCGGATGCGTTCATCTTAAAACAGATATTATAAGTAAGAAGTCAAATTTCTATTAATACCGCAAATGGTGAATTAGGTAGAATGCCATTTTCTGTCAGGATACAGATTGGAGCAAAAAACATTAGCTTAAAATAATGAAAATCCTAATAG






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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacgaatgtgaaagagtattgctttaatatagcctttaatacctgattaatttgtcatc---------------AACATATATATGTATA--T---TAA-ATGATAATTAAAAAAAAGTATGTGTGTTATGTAACTTCTCTGTAATTTGTGAG-A--GTATCGTAACCCGCTTAGTATAAGGC-AATAAACATATATATGTAATGCTGAAT-AAACTATTGAATTGtgagtt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAAGAAGGAAGATT-----ACA---GATCGTAACATAAGAGTGTGTCCTCATTGTAACATTAATGTTTTTGAGAAT-ATTATATAATTTTCTAATAATTTGCCCAAAA-TATAGA-AATT---GACGTATAGAAATTTTGCCT--AAGT-ATACTaattgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAATACAATCTAGATGCTCTGTTCATA--AACTAGAGACAGAAGAAGGTAGGCATTGAAATAGT-GATA--AA---AAGATTAAGTA---ATTGTAATATAAACGTAACTGAGAACGA--A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGGC-AATAAACATGCATATATTATGCC-AAT-AATATATCGAATTGaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gttcAATGATCTTGGTTTTGATTATCTTTGGAACAACACAAATGTTACAAATATCCAAGTAGAAAAA-GTAAGTGAACGAAT-TA-TTGATCCA-T--T-TTT-AC--AATTATGGTACT---CTCAAATAGATACTTCATCAAAACTAAAA--TCATATAAATTAAATAAAACAGCCTATGAACCGGAAGAAATACAA---A-AT-TTACAATAAGTAATACAAATC---ATCGTGTAGCATTAACATAATTTAGATGTTCTGCTCATA--AATCAATAATAGAGGAAGGGAGATTTCGTAATACT-GATCGTAACCTAATAAAATGTATACATTGTAACATGAATGTCATCGAAAACGA--ATATCACTTCCTCGTGATATGCCTAAAA--ACAGA-ACCT---AAAGGATTGAGTGTTTACCT--AGGTACAACTGTTCTTTTCCCTC---AA-A--ACAAAAATGTATGTCTCTTATGAAA----AGCTGTCAGGTACT-TTAAA----AGGGTTAGC-AAAGTT-TATATTTTTA-G-CAATTGA------AATAAGAAACGCCCAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACTATACAACCTTAAATGTTACAATTTTTATAATTGTAGTAATATATTAGGTAATAA-GT--ATACATTTTCAAAAAAC---TAACCCTT-TAAAAATAA-TATGTTAGTTAAAAAGTGATAAAATCGAATCAAATATATCAATATGTTTATATATCTTGTTTCTCTCG--TTATGCATTTTTTAACT-AACTGTA-------------AATTTCAATCAAAAACTGTATGCTACTTTCAAAAAGAATGCATATTTAAGGCTTTACATTGTA-TCATATT----G-GATCGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAA------GTTAA---AAAGAAA-AAAGAAACATTTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAGT---T---ATAAATAACCATAA-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATAGC-TA--A--CAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATGTATA--TCA-ATGATTAT-----------ATGTGTGTTTTGTCTCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GATTTGTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AAACAATATGTATATGTTATGTTGAAT-AAGATATTGAATTGaattgaattga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATCG-TGATCACATC-AAGTAAAGATA-A-GGTTAAACAGCCTAGGATTTAATTATCTATGGCATAATGCCAATATAACAAATATGCAAATTGATAGA-GTTATTAAACGAA--CATTTGAT-AA-GTAT-TT--AC--AATCATGGT-----------GTAGAAGCATCGCGTAAACTTAAA--TGTTATAAAATACTTAAATCTTTATATAAAGCTAAA-AAATATAT---TTGT-T--CGGTAAGTAATGTTAATT---AAAGAAAATCATTAACCCGTTTTAGATGCTCTGaattaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cagtgacaaaatcgttgccttgttttttaaaccggaacaagaatggaaaatgttgatatatgttatgataggaaaaattattattaaaaataattgttaatacatttacatatttaggagtaatattatccgctaaaggttcgttttatcaataactaaaagcgctattttcactaaattctttgttttatattgtctcacttgaaatatcagaaaaaaggaaattgtttgatgtaatcgttggtcctatattaaactatggctccgaaatatggggatttcgttatacttttttatattgaacacgttcatatacaattttaaaacaaatataatgagaaagaagtcaaatttctaataatgttgtagatggttaattaggtagaatgccattttctgtcatgagactgattaaaataataaaatagtggtttaaagtaatgactaagcctcgaaagtttaatatataaagttaataataatgatatagatgtaaatgggaatgtactgaataattAAACATATCAACAT-----TATGCCTTCTTGTTCCAGTTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatgaaaaaactgtcgttatgactttcCAATTCG-TGGGCGTATC-GAGTAAAAA-A-C-TATTAAATGATCGTTGTTTTAATTATCTTTGGAACAACACAGATGTAA-----------GTAGAAAAAAGTAAGTGAACGAAT-CA-TTGATCAATA--T-TT--AC--AATCATGGTACT---CTCAAATAAATACTTCATCAAAACTAGAA--TCATATAAGTTATTTAAAACAGCCTATGAA-CTGGA-AAA-ATAT---TTAT-TAATAATATGTAATACAAATC---ATtacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaacaattcgtgggcgtatcgagtaaaaaactattaaatgatcgttgttttaattatctttggaacaacacagatgtaagtagaaaaaagtaagtgaacgaatcattgatcaatatttacaatcatggtactctcaaataaatacttcatcaaaactagaatcatataagttatttaaaacagcctatgaactggaaaaatatttattaataatatgtaatacaaatcat
gi|5                          : taatgaaaaaactgtcgttatgactttcaaaactggaacaagaaggcataatgttgatatgttttacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaaA-GTTATTGAATGAAT-AA-TTGATTT--G--T-TTTGAC--AATCATGGTATT---CACAATTACATGCATCGCCTAAACTTAAACGTTATACAA-TAAATTAAATCTTTATATTAAGCTAAA-ATATATAC---TTGT-T--CAGTAAGTAATGTTAATC---ATAGAAAATCATCAACACGTTGTAGATGCTCTG--CATACTAATTAGCTATAGAAGAA---AGA-TTCGTGATA-TAAATCGTAATTTAAGAATGGGTGGCCATTGTAATAGGAATATTGTTGAAAA-AA--GTATAATTTT-TAATGGTTTGCCCCAAATTATAAACATTTGCGCAAGA--TGA---TTTGCCTAAAAATAATA--ACTCCTTGC---C---AACAATACAACAATTCAACTTATTTATGAAATCTGATTGATCGGGTATG-TTAAA----AAGATTAGCTAAA-TC-TGTG-TTTTT-GACAAATGAATTATTAATAAGAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATC-ATAACAGAATGCTTCTTTCATAATGAAGGAGTATTTAACGATTTGCATTATA-CTTAATTAAGAGTGATCGATGTTGATATGTGTTTA--GAAAACAGTATGTTGAGTTATTGAA--AAATGAACA-ATCG----C---CATATGGCAATTGTTATT---ATATGTTAACAAAT---ATAGAATATGTCTTTTCT--------GTAGGATTTATCTTATTA--ACT--ATTTGTCATCAATTTGTT--GANNNNNNNNNNNNNN--NN--NNN-NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNTCCTCTCTGTTATTTGCGAG-TTATTTTTGTAA-CTGTTTAGTATAAGGC-ATTAAACATGTATATGCTATGCTGAAT-AGAGTATTTAATTGt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttTACGTTCACGATAAATCAGTATATAATGCTTCAC-TTATA-CTAAATTTGA-GTGATCGGTTTTAATA--TATTAACTGT---------------------AAACAA-----CATGACGGTTTCCGACATATGACAATTGTTA----------TC------C---A-TAAGCAAC-----TATTTTTTTCTGTAGAATATAGC-TA--ATTAATTAATTTGTCATCAATTGTTTATAACATAAATATGTA----TA--TCATATCATATT-----------ATGTGTGTTATATATTTTCTCTGTAATTTATGAG-T--GTTTTGTAACCCGTCTAGTATAAGGC-AATACACATGTATATGTTATACCGAAT-AAAAAATTGAATTGaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TT----GT-ATTGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAATACTATGTTAATTTAAA-AATCAAATAAACATGTTGGTTTTGGACATATGACA-TTGTAAGTTTTA---AGTAACAAAC---A-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATTTC-TA--A--AAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATG--TACATCA-ATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GTTTTGTAACCCGCCTGGTATAAGGC-ACAAAACATGTATATGTTATACTGAAT-AACATATTGAATTGggttttggacatatgacattgtaagttttaagtaacaaacaaaaacaaatatgtagaatatttctaaaatatttgaacatatatatgtatgtacatcaatgataatatgtgtgttatgtatcttctctgtaatttgtgagtgttttgtaacccgcctggtataaggcacaaaacatgtatatgttatactgaataacatattgaattgaattgaag
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): ATCTAAATATATAAATGTTTGATATAATGGTTACTCCTGTATTAAAGCATGGTTCTGAAATATGGGGATTTCATAATGTTACTGATATCGGATGCGTTCATCTTAAAACAGATATTATAAGTAAGAAGTCAAATTTCTATTAATACCGCAAATGGTGAATTAGGTAGAATGCCATTTTCTGTCAGGATACAGATTGGAGCAAAAAACATTAGCTTAAAATAATGAAAATCCTAATAG






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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatacgaatgtgaaagagtattgctttaatatagcctttaatacctgattaatttgtcatc---------------AACATATATATGTATA--T---TAA-ATGATAATTAAAAAAAAGTATGTGTGTTATGTAACTTCTCTGTAATTTGTGAG-A--GTATCGTAACCCGCTTAGTATAAGGC-AATAAACATATATATGTAATGCTGAAT-AAACTATTGAATTGtgagtt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAAGAAGGAAGATT-----ACA---GATCGTAACATAAGAGTGTGTCCTCATTGTAACATTAATGTTTTTGAGAAT-ATTATATAATTTTCTAATAATTTGCCCAAAA-TATAGA-AATT---GACGTATAGAAATTTTGCCT--AAGT-ATACTaattgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAATACAATCTAGATGCTCTGTTCATA--AACTAGAGACAGAAGAAGGTAGGCATTGAAATAGT-GATA--AA---AAGATTAAGTA---ATTGTAATATAAACGTAACTGAGAACGA--A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGGC-AATAAACATGCATATATTATGCC-AAT-AATATATCGAATTGaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gttcAATGATCTTGGTTTTGATTATCTTTGGAACAACACAAATGTTACAAATATCCAAGTAGAAAAA-GTAAGTGAACGAAT-TA-TTGATCCA-T--T-TTT-AC--AATTATGGTACT---CTCAAATAGATACTTCATCAAAACTAAAA--TCATATAAATTAAATAAAACAGCCTATGAACCGGAAGAAATACAA---A-AT-TTACAATAAGTAATACAAATC---ATCGTGTAGCATTAACATAATTTAGATGTTCTGCTCATA--AATCAATAATAGAGGAAGGGAGATTTCGTAATACT-GATCGTAACCTAATAAAATGTATACATTGTAACATGAATGTCATCGAAAACGA--ATATCACTTCCTCGTGATATGCCTAAAA--ACAGA-ACCT---AAAGGATTGAGTGTTTACCT--AGGTACAACTGTTCTTTTCCCTC---AA-A--ACAAAAATGTATGTCTCTTATGAAA----AGCTGTCAGGTACT-TTAAA----AGGGTTAGC-AAAGTT-TATATTTTTA-G-CAATTGA------AATAAGAAACGCCCAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACTATACAACCTTAAATGTTACAATTTTTATAATTGTAGTAATATATTAGGTAATAA-GT--ATACATTTTCAAAAAAC---TAACCCTT-TAAAAATAA-TATGTTAGTTAAAAAGTGATAAAATCGAATCAAATATATCAATATGTTTATATATCTTGTTTCTCTCG---TTATGCATTTTTTAACT-AACTGTA-------------AATTTCAATCAAAAACTGTATGCTACTTTCAAAAAGAATGCATATTTAAGGCTTTACATTGTA-TCATATT----G-GATCGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAA------GTTAA---AAAGAAA-AAAGAAACATTTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAGT---T---ATAAATAACCATAA-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATAGC-TA--A--CAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATGTATA--TCA-ATGATTAT-----------ATGTGTGTTTTGTCTCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GATTTGTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AAACAATATGTATATGTTATGTTGAAT-AAGATATTGAATTGaattgaattga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATCG-TGATCACATC-AAGTAAAGATA-A-GGTTAAACAGCCTAGGATTTAATTATCTATGGCATAATGCCAATATAACAAATATGCAAATTGATAGA-GTTATTAAACGAA--CATTTGAT-AA-GTAT-TT--AC--AATCATGGT-----------GTAGAAGCATCGCGTAAACTTAAA--TGTTATAAAATACTTAAATCTTTATATAAAGCTAAA-AAATATAT---TTGT-T--CGGTAAGTAATGTTAATT---AAAGAAAATCATTAACCCGTTTTAGATGCTCTGaattaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cagtgacaaaatcgttgccttgttttttaaaccggaacaagaatggaaaatgttgatatatgttatgataggaaaaattattattaaaaataattgttaatacatttacatatttaggagtaatattatccgctaaaggttcgttttatcaataactaaaagcgctattttcactaaattctttgttttatattgtctcacttgaaatatcagaaaaaaggaaattgtttgatgtaatcgttggtcctatattaaactatggctccgaaatatggggatttcgttatacttttttatattgaacacgttcatatacaattttaaaacaaatataatgagaaagaagtcaaatttctaataatgttgtagatggttaattaggtagaatgccattttctgtcatgagactgattaaaataataaaatagtggtttaaagtaatgactaagcctcgaaagtttaatatataaagttaataataatgatatagatgtaaatgggaatgtactgaataattAAACATATCAACAT-----TATGCCTTCTTGTTC-CAGTTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatgaaaaaactgtcgttatgactttcCAATTCG-TGGGCGTATC-GAGTAAAAA-A-C-TATTAAATGATCGTTGTTTTAATTATCTTTGGAACAACACAGATGTAA-----------GTAGAAAAAAGTAAGTGAACGAAT-CA-TTGATCAATA--T-TT--AC--AATCATGGTACT---CTCAAATAAATACTTCATCAAAACTAGAA--TCATATAAGTTATTTAAAACAGCCTATGAA-CTGGA-AAA-ATAT---TTAT-TAATAATATGTAATACAAATC---ATtacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaacaattcgtgggcgtatcgagtaaaaaactattaaatgatcgttgttttaattatctttggaacaacacagatgtaagtagaaaaaagtaagtgaacgaatcattgatcaatatttacaatcatggtactctcaaataaatacttcatcaaaactagaatcatataagttatttaaaacagcctatgaactggaaaaatatttattaataatatgtaatacaaatcat
gi|5                          : taatgaaaaaactgtcgttatgactttcaaaactggaacaagaaggcataatgttgatatgttttacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaaA-GTTATTGAATGAAT-AA-TTGATTT--G--T-TTTGAC--AATCATGGTATT---CACAATTACATGCATCGCCTAAACTTAAACGTTATACAA-TAAATTAAATCTTTATATTAAGCTAAA-ATATATAC---TTGT-T--CAGTAAGTAATGTTAATC---ATAGAAAATCATCAACACGTTGTAGATGCTCTG--CATACTAATTAGCTATAGAAGAA---AGA-TTCGTGATA-TAAATCGTAATTTAAGAATGGGTGGCCATTGTAATAGGAATATTGTTGAAAA-AA--GTATAATTTT-TAATGGTTTGCCCCAAATTATAAACATTTGCGCAAGA--TGA---TTTGCCTAAAAATAATA--ACTCCTTGC---C---AACAATACAACAATTCAACTTATTTATGAAATCTGATTGATCGGGTATG-TTAAA----AAGATTAGCTAAA-TC-TGTG-TTTTT-GACAAATGAATTATTAATAAGAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATC-ATAACAGAATGCTTCTTTCATAATGAAGGAGTATTTAACGATTTGCATTATA-CTTAATTAAGAGTGATCGATGTTGATATGTGTTTA--GAAAACAGTATGTTGAGTTATTGAA--AAATGAACA-ATCG----C---CATATGGCAATTGTTATT---ATATGTTAACAAAT---ATAGAATATGTCTTTTCT--------GTAGGATTTATCTTATTA--ACT--ATTTGTCATCAATTTGTT--GANNNNNNNNNNNNNN--NN--NNN-NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNTCCTCTCTGTTATTTGCGAG-TTATTTTTGTAA-CTGTTTAGTATAAGGC-ATTAAACATGTATATGCTATGCTGAAT-AGAGTATTTAATTGt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTACGTTCACGATAAATCAGTATATAATGCTTCAC-TTATA-CTAAATTTGA-GTGATCGGTTTTAATA--TATTAACTGT---------------------AAACAA-----CATGACGGTTTCCGACATATGACAATTGTTA----------TC------C---A-TAAGCAAC-----TATTTTTTTCTGTAGAATATAGC-TA--ATTAATTAATTTGTCATCAATTGTTTATAACATAAATATGTA----TA--TCATATCATATT-----------ATGTGTGTTATATATTTTCTCTGTAATTTATGAG-T--GTTTTGTAACCCGTCTAGTATAAGGC-AATACACATGTATATGTTATACCGAAT-AAAAAATTGAATTGaa
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Unaligned ( gi|11 ): ATCTAAATATATAAATGTTTGATATAATGGTTACTCCTGTATTAAAGCATGGTTCTGAAATATGGGGATTTCATAATGTTACTGATATCGGATGCGTTCATCTTAAAACAGATATTATAAGTAAGAAGTCAAATTTCTATTAATACCGCAAATGGTGAATTAGGTAGAATGCCATTTTCTGTCAGGATACAGATTGGAGCAAAAAACATTAGCTTAAAATAATGAAAATCCTAATAG






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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatacgaatgtgaaagagtattgctttaatatagcctttaatacctgattaatttgtcatc---------------AACATATATATGTATA--T---TAA-ATGATAATTAAAAAAAAGTATGTGTGTTATGTAACTTCTCTGTAATTTGTGAG-A--GTATCGTAACCCGCTTAGTATAAGGC-AATAAACATATATATGTAATGCTGAAT-AAACTATTGAATTGtgagtt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGAAGAAGGAAGATT-----ACA---GATCGTAACATAAGAGTGTGTCCTCATTGTAACATTAATGTTTTTGAGAAT-ATTATATAATTTTCTAATAATTTGCCCAAAA-TATAGA-AATT---GACGTATAGAAATTTTGCCT--AAGT-ATACTaattgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAATACAATCTAGATGCTCTGTTCATA--AACTAGAGACAGAAGAAGGTAGGCATTGAAATAGT-GATA--AA---AAGATTAAGTA---ATTGTAATATAAACGTAACTGAGAACGA--A
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGGC-AATAAACATGCATATATTATGCC-AAT-AATATATCGAATTGaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gttcAATGATCTTGGTTTTGATTATCTTTGGAACAACACAAATGTTACAAATATCCAAGTAGAAAAA-GTAAGTGAACGAAT-TA-TTGATCCA-T--T-TTT-AC--AATTATGGTACT---CTCAAATAGATACTTCATCAAAACTAAAA--TCATATAAATTAAATAAAACAGCCTATGAACCGGAAGAAATACAA---A-AT-TTACAATAAGTAATACAAATC---ATCGTGTAGCATTAACATAATTTAGATGTTCTGCTCATA--AATCAATAATAGAGGAAGGGAGATTTCGTAATACT-GATCGTAACCTAATAAAATGTATACATTGTAACATGAATGTCATCGAAAACGA--ATATCACTTCCTCGTGATATGCCTAAAA--ACAGA-ACCT---AAAGGATTGAGTGTTTACCT--AGGTACAACTGTTCTTTTCCCTC---AA-A--ACAAAAATGTATGTCTCTTATGAAA----AGCTGTCAGGTACT-TTAAA----AGGGTTAGC-AAAGTT-TATATTTTTA-G-CAATTGA------AATAAGAAACGCCCAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACTATACAACCTTAAATGTTACAATTTTTATAATTGTAGTAATATATTAGGTAATAA-GT--ATACATTTTCAAAAAAC---TAACCCTT-TAAAAATAA-TATGTTAGTTAAAAAGTGATAAAATCGAATCAAATATATCAATATGTTTATATATCTTGTTTCTCTCG---TTATGCATTTTTTAACT-AACTGTA-------------AATTTCAATCAAAAACTGTATGCTACTTTCAAAAAGAATGCATATTTAAGGCTTTACATTGTA-TCATATT----G-GATCGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAA------GTTAA---AAAGAAA-AAAGAAACATTTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAGT---T---ATAAATAACCATAA-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATAGC-TA--A--CAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATGTATA--TCA-ATGATTAT-----------ATGTGTGTTTTGTCTCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GATTTGTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AAACAATATGTATATGTTATGTTGAAT-AAGATATTGAATTGaattgaattga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATCG-TGATCACATC-AAGTAAAGATA-A-GGTTAAACAGCCTAGGATTTAATTATCTATGGCATAATGCCAATATAACAAATATGCAAATTGATAGA-GTTATTAAACGAA--CATTTGAT-AA-GTAT-TT--AC--AATCATGGT-----------GTAGAAGCATCGCGTAAACTTAAA--TGTTATAAAATACTTAAATCTTTATATAAAGCTAAA-AAATATAT---TTGT-T--CGGTAAGTAATGTTAATT---AAAGAAAATCATTAACCCGTTTTAGATGCTCTGaattaaat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cagtgacaaaatcgttgccttgttttttaaaccggaacaagaatggaaaatgttgatatatgttatgataggaaaaattattattaaaaataattgttaatacatttacatatttaggagtaatattatccgctaaaggttcgttttatcaataactaaaagcgctattttcactaaattctttgttttatattgtctcacttgaaatatcagaaaaaaggaaattgtttgatgtaatcgttggtcctatattaaactatggctccgaaatatggggatttcgttatacttttttatattgaacacgttcatatacaattttaaaacaaatataatgagaaagaagtcaaatttctaataatgttgtagatggttaattaggtagaatgccattttctgtcatgagactgattaaaataataaaatagtggtttaaagtaatgactaagcctcgaaagtttaatatataaagttaataataatgatatagatgtaaatgggaatgtactgaataattAAACATATCAACAT-----TATGCCTTCTTGTTC-CAGTTTT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatgaaaaaactgtcgttatgactttcCAATTCG-TGGGCGTATC-GAGTAAAAA-A-C-TATTAAATGATCGTTGTTTTAATTATCTTTGGAACAACACAGATGTAA-----------GTAGAAAAAAGTAAGTGAACGAAT-CA-TTGATCAATA--T-TT--AC--AATCATGGTACT---CTCAAATAAATACTTCATCAAAACTAGAA--TCATATAAGTTATTTAAAACAGCCTATGAA-CTGGA-AAA-ATAT---TTAT-TAATAATATGTAATACAAATC---ATtacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaacaattcgtgggcgtatcgagtaaaaaactattaaatgatcgttgttttaattatctttggaacaacacagatgtaagtagaaaaaagtaagtgaacgaatcattgatcaatatttacaatcatggtactctcaaataaatacttcatcaaaactagaatcatataagttatttaaaacagcctatgaactggaaaaatatttattaataatatgtaatacaaatcat
gi|5                          : taatgaaaaaactgtcgttatgactttcaaaactggaacaagaaggcataatgttgatatgttttacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaaA-GTTATTGAATGAAT-AA-TTGATTT--G--T-TTTGAC--AATCATGGTATT---CACAATTACATGCATCGCCTAAACTTAAACGTTATACAA-TAAATTAAATCTTTATATTAAGCTAAA-ATATATAC---TTGT-T--CAGTAAGTAATGTTAATC---ATAGAAAATCATCAACACGTTGTAGATGCTCTG--CATACTAATTAGCTATAGAAGAA---AGA-TTCGTGATA-TAAATCGTAATTTAAGAATGGGTGGCCATTGTAATAGGAATATTGTTGAAAA-AA--GTATAATTTT-TAATGGTTTGCCCCAAATTATAAACATTTGCGCAAGA--TGA---TTTGCCTAAAAATAATA--ACTCCTTGC---C---AACAATACAACAATTCAACTTATTTATGAAATCTGATTGATCGGGTATG-TTAAA----AAGATTAGCTAAA-TC-TGTG-TTTTT-GACAAATGAATTATTAATAAGAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATC-ATAACAGAATGCTTCTTTCATAATGAAGGAGTATTTAACGATTTGCATTATA-CTTAATTAAGAGTGATCGATGTTGATATGTGTTTA--GAAAACAGTATGTTGAGTTATTGAA--AAATGAACA-ATCG----C---CATATGGCAATTGTTATT---ATATGTTAACAAAT---ATAGAATATGTCTTTTCT--------GTAGGATTTATCTTATTA--ACT--ATTTGTCATCAATTTGTT--GANNNNNNNNNNNNNN--NN--NNN-NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNTCCTCTCTGTTATTTGCGAG-TTATTTTTGTAA-CTGTTTAGTATAAGGC-ATTAAACATGTATATGCTATGCTGAAT-AGAGTATTTAATTGt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTACGTTCACGATAAATCAGTATATAATGCTTCAC-TTATA-CTAAATTTGA-GTGATCGGTTTTAATA--TATTAACTGT---------------------AAACAA-----CATGACGGTTTCCGACATATGACAATTGTTA----------TC------C---A-TAAGCAAC-----TATTTTTTTCTGTAGAATATAGC-TA--ATTAATTAATTTGTCATCAATTGTTTATAACATAAATATGTA----TA--TCATATCATATT-----------ATGTGTGTTATATATTTTCTCTGTAATTTATGAG-T--GTTTTGTAACCCGTCTAGTATAAGGC-AATACACATGTATATGTTATACCGAAT-AAAAAATTGAATTGaa
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT----GT-ATTGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAATACTATGTTAATTTAAA-AATCAAATAAACATGTTGGTTTTGGACATATGACA-TTGTAAGTTTTA---AGTAACAAAC---A-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATTTC-TA--A--AAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATG--TACATCA-ATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GTTTTGTAACCCGCCTGGTATAAGGC-ACAAAACATGTATATGTTATACTGAAT-AACATATTGAATTGggttttggacatatgacattgtaagttttaagtaacaaacaaaaacaaatatgtagaatatttctaaaatatttgaacatatatatgtatgtacatcaatgataatatgtgtgttatgtatcttctctgtaatttgtgagtgttttgtaacccgcctggtataaggcacaaaacatgtatatgttatactgaataacatattgaattgaattgaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tacaacttttataactgtagtaatatatAATTGCTGGTC-TATCTAAGTAAGAC-ACA-TGTTGAATGATCAATGTTTCAGTTTCCTGTGGGATAATGAACGCGTAACCAATATTCAGATAGAAAGA-GTTATTGAAAAACTGCA-CT-ACC-A-G--TATT--ACCAAAAC-TGGTATTCAACTC--TTA-ATACTTCATC--AATTAGCA--ACATACAAGATAATCAAAAATACCTACAAAGTTGAA-AAATATATAGACTGTATTACAAaattgaag


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Reference ( family-105 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAAATCG-TGGTCGTATC-GAGTAAAAA-A-A-TGTTAAATGATCTTGGTTTTAATTATCTTTGGAACAACGCAAATGTAACAAATATCCAAGTAGAAAAA-GTNANTGAACGAAT-CA-TTGATCAGTGTTTAC--AATCATGGTACT---CTCAANTAGATACTTCGTCAAAACTAGAA--TCATATAAGTTANTTAAAACNGCCTATGAAGCTGAA-AAATATAT---TTGT-TTACAATAAGTAATGCAAATC---ATAGAAAAGCATTAACACGNTTTAGATGCTCTGCTCATA--AATTAGCNATAGAAGAAGGNAGATTTCGTAATA-T-GATCGTAACCTAAGAATGTGTACNCATTGTAACATGAATGTCGTCGAAAACGA--ATATCATTTTCTNATGATTTGCCCNAAA-TATAGA-ACTT---NAAGGATTGAGTGTTTACCT--AAGTAC-A--T-GTTCTTTTC---C---AA-A--ACAAAAATTCATGTCTCTTATGAAANCNGANCGGTCGGGTACG-TTAAA----AGGGTTAGC-AAA-TT-TATA-TTTTA-G-CAANTGA------AATAAGAAACGCCGAATAAAACTGTTAAAGTATATTTTAGATAACAATACAACGTTAAATGTTACAACTTTTATAACTGTAGTAATATATTANGTANTGGTGTTGATACATTTTCAAAAAACTGTTAACAC-T-TAAAAA-AA-TATGTTAGTTNAAAAGTGATAA-----AATCAAATA---CAACATGTTTATATACCTTGTTGCTC-CGGTTTTATGCGNTTTTTAACTAAACTGTAAAACTTATAAAAGAATTTCAATC-AAAACGGTATGCTACTTTCACGATGAATGCGTATTTAANGCTTTACATTATA-CTAAATT--GGGTGATCGGTGTTGATA--TATTTACTGTNAATACTATGTTAA---G----A--GAAACAAATAAACATGTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTA---TTA----TTAACAAAC---A-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATAGC-TA--A--AAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATG--TA--TCA-ATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GTTTTGTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AATAAACATGTATATGTTATGCTGAAT-AAAATATTGAATTG
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggA--A--AAT--GTT-G---------------AAAATATATATGTA----TA--TCATAGGATAAT-----------TTGTGTATTATTTATCTTCTATGTAGTATTTGAGTT--TTTTTGTAACCTACCTTGTGTAAGGC-AATAAATATGTATATTTTAAGCTGAATAAAAAAATTGAATT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacgaatgtgaaagagtattgctttaatatagcctttaatacctgattaatttgtcatc---------------AACATATATATGTATA--T---TAA-ATGATAATTAAAAAAAAGTATGTGTGTTATGTAACTTCTCTGTAATTTGTGAG-A--GTATCGTAACCCGCTTAGTATAAGGC-AATAAACATATATATGTAATGCTGAAT-AAACTATTGAATTGtgagtt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGAAGAAGGAAGATT-----ACA---GATCGTAACATAAGAGTGTGTCCTCATTGTAACATTAATGTTTTTGAGAAT-ATTATATAATTTTCTAATAATTTGCCCAAAA-TATAGA-AATT---GACGTATAGAAATTTTGCCT--AAGTAT-A--aattgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aAATACAATCTAGATGCTCTGTTCATA--AACTAGAGACAGAAGAAGGTAGGCATTGAAATAGT-GATA--AA---AAGATTAAGTA---ATTGTAATATAAACGTAACTGAGAACGA--Act
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAGGC-AATAAACATGCATATATTATGCC-AAT-AATATATCGAATTGaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttcAATGATCTTGGTTTTGATTATCTTTGGAACAACACAAATGTTACAAATATCCAAGTAGAAAAA-GTAAGTGAACGAAT-TA-TTGATCCATTTTTAC--AATTATGGTACT---CTCAAATAGATACTTCATCAAAACTAAAA--TCATATAAATTAAATAAAACAGCCTATGAACCGGAAGAAATACA----AAAT-TTACAATAAGTAATACAAATC---ATCGTGTAGCATTAACATAATTTAGATGTTCTGCTCATA--AATCAATAATAGAGGAAGGGAGATTTCGTAATACT-GATCGTAACCTAATAAAATGTATACATTGTAACATGAATGTCATCGAAAACGA--ATATCACTTCCTCGTGATATGCCTAAAA--ACAGA-ACCT---AAAGGATTGAGTGTTTACCT--AGGTAC-AACT-GTTCTTTTCCCTC---AA-A--ACAAAAATGTATGTCTCTTATGAAA----AGCTGTCAGGTACT-TTAAA----AGGGTTAGC-AAAGTT-TATATTTTTA-G-CAATTGA------AATAAGAAACGCCCAATAAAACTGTTAAAGTATATTTCAGATAACTATACAACCTTAAATGTTACAATTTTTATAATTGTAGTAATATATTAGGTAATAA-GT--ATACATTTTCAAAAAAC---TAACCCTT-TAAAAATAA-TATGTTAGTTAAAAAGTGATAAAATCGAATCAAATATATCAATATGTTTATATATCTTGTTTCTCTCG---TTATGCATTTTTTAACT-AACTGTA-------------AATTTCAATCAAAAACTGTATGCTACTTTCAAAAAGAATGCATATTTAAGGCTTTACATTGTA-TCATATT--G---GATCGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAA------GTTAA---A----A--AGAAAAAAGAAACATTTCGGTTTCGGACATATGACAATTGTTAG--TTA----TAAATAACCATAA-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATAGC-TA--A--CAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATGTATA--TCA-ATGATTAT-----------ATGTGTGTTTTGTCTCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GATTTGTAACCCGCCTAGTATAAGGC-AAACAATATGTATATGTTATGTTGAAT-AAGATATTGAATTGaattgaattga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATCG-TGATCACATC-AAGTAAAGATA-A-GGTTAAACAGCCTAGGATTTAATTATCTATGGCATAATGCCAATATAACAAATATGCAAATTGATAGA-GTTATTAAACGAA--CATTTGATAAGTATTTAC--AATCATGGT-----------GTAGAAGCATCGCGTAAACTTAAA--TGTTATAAAATACTTAAATCTTTATATAAAGCTAAA-AAATATAT---TTGT-T--CGGTAAGTAATGTTAATT---AAAGAAAATCATTAACCCGTTTTAGATGCTCTGaattaaat
gi|4                          : cagtgacaaaatcgttgccttgttttttaaaccggaacaagaatggaaaatgttgatatatgttatgataggaaaaattattattaaaaataattgttaatacatttacatatttaggagtaatattatccgctaaaggttcgttttatcaataactaaaagcgctattttcactaaattctttgttttatattgtctcacttgaaatatcagaaaaaaggaaattgtttgatgtaatcgttggtcctatattaaactatggctccgaaatatggggatttcgttatacttttttatattgaacacgttcatatacaattttaaaacaaatataatgagaaagaagtcaaatttctaataatgttgtagatggttaattaggtagaatgccattttctgtcatgagactgattaaaataataaaatagtggtttaaagtaatgactaagcctcgaaagtttaatatataaagttaataataatgatatagatgtaaatgggaatgtactgaataattCAATTCG-TGGGCGTATC-GAGTAAAAA-A-C-TATTAAATGATCGTTGTTTTAATTATCTTTGGAACAACACAGATGTAA-----------GTAGAAAAAAGTAAGTGAACGAAT-CA-TTGATCAATATTTAC--AATCATGGTACT---CTCAAATAAATACTTCATCAAAACTAGAA--TCATATAAGTTATTTAAAACAGCCTATGAA-CTGGA-AAA-ATAT---TTAT-TAATAATATGTAATACAAATC---AT
gi|5                          :                                                                                              taatgaaaaaactgtcgttatgactttcaaaactggaacaagaaggcataatgttgatatgttttacgatggtataaaattaaaaaatgttgataaatttacataatattatttaggtgtaactttatctgctaatgggtcattttgtcaggcacagaaagcccttgctcaacaagctatgaaagcattattttctctttattctatatttgatattgttccattgggaattaatgaaaaggtaaaattatttgacacaatggttgcacccattttagataatggttgtgaaatctagggatttcataatgccccagatattgaacgtgttcatattaaatcttaggtgttagaagcgagacgtccaataatgctctttatggtgaactggcgagataacctttctctgttataagagctatacgaatattaaaatattatttcaaaatattgaaatcctctagtagattaatgtttaaagtttaacggtctgatattgatgctaacggaaatgttattaacaaA-GTTATTGAATGAAT-AA-TTGATTTGTTTTGAC--AATCATGGTATT---CACAATTACATGCATCGCCTAAACTTAAACGTTATACAA-TAAATTAAATCTTTATATTAAGCTAAA-ATATATAC---TTGT-T--CAGTAAGTAATGTTAATC---ATAGAAAATCATCAACACGTTGTAGATGCTCTG--CATACTAATTAGCTATAGAAGAA---AGA-TTCGTGATA-TAAATCGTAATTTAAGAATGGGTGGCCATTGTAATAGGAATATTGTTGAAAA-AA--GTATAATTTT-TAATGGTTTGCCCCAAATTATAAACATTTGCGCAAGA--TGA---TTTGCCTAAAAATA--A--TAACTCCTTGC---C---AACAATACAACAATTCAACTTATTTATGAAATCTGATTGATCGGGTATG-TTAAA----AAGATTAGCTAAA-TC-TGTG-TTTTT-GACAAATGAATTATTAATAAGAAA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATC-ATAACAGAATGCTTCTTTCATAATGAAGGAGTATTTAACGATTTGCATTATA-CTTAATTAAGAGTGATCGATGTTGATATGTGTTTA--GAAAACAGTATGTTGA---GTT--ATTGAA--AAATGAACA-ATCG----C---CATATGGCAATTGTTA---TTATATGTTAACAAAT---ATAGAATATGTCTTTTCT--------GTAGGATTTATCTTATTA--ACT--ATTTGTCATCAATTTGTT--GANNNNNNNNNNNNNN--NN--NNN-NNNNNNNN-----------NNNNNNNNNNNNNNTCCTCTCTGTTATTTGCGAG-TTATTTTTGTAA-CTGTTTAGTATAAGGC-ATTAAACATGTATATGCTATGCTGAAT-AGAGTATTTAATTGt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttTACGTTCACGATAAATCAGTATATAATGCTTCAC-TTATA-CTAAATTT-GAGTGATCGGTTTTAATA--TATTAACTGT--------------------------AAACAA-----CATGACGGTTTCCGACATATGACAATTGTTA---TC-------------C---A-TAAGCAAC-----TATTTTTTTCTGTAGAATATAGC-TA--ATTAATTAATTTGTCATCAATTGTTTATAACATAAATATGTA----TA--TCATATCATATT-----------ATGTGTGTTATATATTTTCTCTGTAATTTATGAG-T--GTTTTGTAACCCGTCTAGTATAAGGC-AATACACATGTATATGTTATACCGAAT-AAAAAATTGAATTGaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACAACTTTTATAACTGTAGTAATATATT-TGTATTGGTGTTGATATATTT-------ACTGTTAATAC-------------TATGTTAATTTA--------AA-----AATCAAATA----AACATGTTaattg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTGGTGTTGATA--TATTTACTGTTAATACTATGTTAATTTA----A--AAATCAAATAAACATGTTGGTTTTGGACATATGACA-TTGTAAGTTTTAA---GTAACAAAC---A-AAAACAAA-----TAT--------GTAGAATATTTC-TA--A--AAT--ATTTG---------------AACATATATATGTATG--TACATCA-ATGATAAT-----------ATGTGTGTTATGTATCTTCTCTGTAATTTGTGAG-T--GTTTTGTAACCCGCCTGGTATAAGGC-ACAAAACATGTATATGTTATACTGAAT-AACATATTGAATTGggttttggacatatgacattgtaagttttaagtaacaaacaaaaacaaatatgtagaatatttctaaaatatttgaacatatatatgtatgtacatcaatgataatatgtgtgttatgtatcttctctgtaatttgtgagtgttttgtaacccgcctggtataaggcacaaaacatgtatatgttatactgaataacatattgaattgaattgaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacaacttttataactgtagtaatatatttgtAATTGCTGGTC-TATCTAAGTAAGAC-ACA-TGTTGAATGATCAATGTTTCAGTTTCCTGTGGGATAATGAACGCGTAACCAATATTCAGATAGAAAGA-GTTATTGAAAAACTGCA-CT-ACCAGTA-TTACCAAAAC-TGGTATTCAACTC--TTA-ATACTTCATC--AATTAGCA--ACATACAAGATAATCAAAAATACCTACAAAGTTGAA-AAATATATAGACTGTATTACAAaattgaag
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Unaligned ( gi|11 ): ATCTAAATATATAAATGTTTGATATAATGGTTACTCCTGTATTAAAGCATGGTTCTGAAATATGGGGATTTCATAATGTTACTGATATCGGATGCGTTCATCTTAAAACAGATATTATAAGTAAGAAGTCAAATTTCTATTAATACCGCAAATGGTGAATTAGGTAGAATGCCATTTTCTGTCAGGATACAGATTGGAGCAAAAAACATTAGCTTAAAATAATGAAAATCCTAATAG