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lowQualScore : . ... . .. . .......................... . ..... ... ......... . ... . . . .. . ............. .. .. .... . . .. .............................................................. ........ . . . .. .... .... ....... ........................................................... ..... ..... . ... .. ............................................. .. .... .. ..
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Reference ( gi|10 ) : TATTTTA-AAAAATGAACTGG-T--ACGTCACCTAAATATA--------------------------TA-AC-----AC---T---------T-C---ATTATGCCCCAACTGTG-TATTAA-A--A-A-A---CT----T-CAG-AG--AGTAACGTGGTCTTA-TT-TTCT--AC---------CG--------------TT-----------G--TTA------TG---------ATA--------T-GATGATCATAAAGTGA--TG----T----C-------TC---------C----------C--T---TT-TTTT-C--------A-------T------T-----TGCC-----GAATCT-G-AGA--ATCTGG-------------A---------------T---------------A--ATGT-TC-GC--A--TCAAAATACA
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gi|26 : actTATTTTA-AAAACTAAACTGG-C--ATGCCACCAAAATATA--------------------------TA-
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gi|7 : gttct-AAAAATAAACTGG-T--ACGTCACTTGAATATA--------------------------AT-AC-----AC---T---------G-C---ATTACGCCCCAATCGTG-TAATAA-A--ATA-AT--CT----A-CAG-TG--AGTAAAGTTGTCTTA-AT-TTCT--ACGAAATGAATCG--------------AA-----------G--TGA------TGTCAGGCTCTGTA--------T-CCTATTCATAAAGTGA--T-----T----C-------TT---------C----------T--A---TA-TCTA-C----------------T------T-----TGCC-----GAATCA-A-AGA--AGCTTG-------------ATACCATTTCAAAATGT---------------A--ATGT-GC-GC--A--TCAAAATAC
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gi|26 : taTAA-GTTGTCTTA-TT-TTCT--AC---------TGAAATAAGTGTTAAATT-----------G--TAA------TG---------TTA--------T-GATGCTCATAAAGTGA--TG----T----C-------T
gi|17 : cttattttaaaaactaaactggcatgccaccaaaatatatattaCTTA-TT-TTCT--ACGGGAAG---AG--------------TT-----------G--ATAAAT---TG---------TAA--------T-GATGCTCGTAAA-------G----T----C-------TC---------A----------C--T---CTGTTTT-C-----------------------------TGTCTCTAAGAATATCG-ATACCATCTCGAT-----------A---------------T---------------A--ATGT-GT-GC--A--TCAAACTAt
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1039 ) : TATTTTA-AAAAATAAACTGG-T--ACGTCACCTGA------------------------ATA--T-A-TAAC-----AC---T---------T-C---A---TTATGCCCCAACCGTGTAATAA-AA-A---AT-CTT------C----AG-AGAGTA---A----AGTTGTCTT-ATT-TTCT--AC-------CG--------------TT---G--TA-A--T---GTTA--TGATGA-------------T---C---ATAAAGTG-A--TG----T----C-------TC---------C----------C--T-------------TT-TTTT-C--------A-------T------T-----TGCC-----GAATCT-G-AGA--ATCTG--G-------------A---------------T---------------A--ATGTGCGC--ATCAAAATACA
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