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gi|22 : A-ATGTCGGTCAAT---AG-C-T--------ATA---CATAGCT-AATG-T--TATCTC--TATTATGTactataaatatgtgt
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gi|27 : -ATGTCAGTCAAT---AG-C-T--------TTA---CATAGCT-AATA-T--T-------TATTGTGTGTTA-TGTCG
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1027 ) : ATTGTATCTACGAGATCACTA-----------TTTTA----GTCTAAATACACTGTCTGCGATCATTTTATTGCGTCC----G-GAANATAATGT-------TGATNAGTTCACAACA-AATCTGATTC-GAGGTGATATAGTT----TTTT------AG-AACATTTCTTCAT-TATACACACTAGTNTCTGTTT--G--AT----CTCAGTATTTTACA--CGTTTTT----TATAC--T--T-T---------T--------TAG-------G--------C--------AC--------GATTA---A---CATTA---TTTTC---GCG-GTTTTATTTCA--------TGTATAT-----------AACTTGCT------------T-------GTTGTA----A---T---ATTGTGCA---ATG-ACTTGGAT--CTA-G-T------TACAATTG-TTATTGAGNCACTGATTT---ATG-TGATAA---C-TCATGAAATG---AC-TTGT---AT---T-TNTAACTTG---------CTTATT----CAT--GTAAATGTCGGTCA-AT---AG-CTATAC-----ATA--------GCT-AA-TG-T--T-----T---ATTGTGTTATA-TC-------------TCATGCCGACT
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blockSeqs : . . TATT . A . . C . . . . AC . TATTTTCAGCCCAATGGTCAC G . GAA T . . CTT AA . N . T . . . . . A . . . . TC AC T T T T . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : TTTTTAGGCAC A . TCA T . . CTT AC . A . G . . . . . C . . . . TG AC G G A A . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-1027 ) : ATTGTATCTACGAGATCACTA-----------TTTTA----GTCTAAATACACTGTCTGCGATCATTTTATTGCGTCC----G-GAANATAATGT-------TGATNAGTTCACAACA-AATCTGATTC-GAGGTGATATAGTT----TTTT------AG-AACATTTCTTCAT-TATACACACTAGTNTCTGTTTCGCATCTCAGTATTTTACA--CGTTTTT----TATAC--T--T-T---------T--------TAG-------G--------C--------AC--------GATTA---A---CATTA---TTTTC---GCG-GTTTTATTTCA--------TGTATAT-----------AACTTGCT------------T-------GTTGTA----A---T---ATTGTGCA---ATG-ACTTGGAT--CTA-G-T------TACAATTG-TTATTGAGNCACTGATTT---ATG-TGATAA---C-TCATGAAATG---AC-TTGT---AT---T-TNTAACTTG---------CTTATT----CAT--GTAAATGTCGGTCA-AT---AG-CTATAC-----ATA--------GCT-AA-TG-T--T-----T---ATTGTGTTATA-TC-------------TCATGCCGACT
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gi|6 : caTA---A---TATCA---TTTTC---TGA-GTTTTGTT-----------------------------AACTTG-T------------T-------GTTATATT--A---T---GTTGAACATGTATGTAAT---AT--CTAAG-A------TACTATTG-TAATTGAGTTACAGATTT---ATG-CGAGAA---CCTCATAAGACG---AT-TTGT---AT---AATTTA--TCA---------CTTCTT----CAT--GT------CGGTCA-AT---AG-CTGTAC-----ATACATAGAGAGCT-AA-TG-T--T-----T---GTGGTGTTATA-AT-------------TCATGACAACTt
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gi|9 : ttggatctagttacaattgttctggagacactgatttatgtgataactcatgaCACTGATTT---ATG-TGATAA---C-TCATAAAATG---AC-TTGT---AT---T-TA-AACTTG---------CTTATT----TAT--GTAAGTGTCAGTCA-AT---AG-CTAAAC-----ATA--------GCT-AA-TG-T--T-----T---ATTGCGTTATA-TTATTGCGTTATATATCATGCCGACT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|31 ): TGATGTGCAGTACCTTATGATTTTTATCTCATTAAAGCGC