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Reference ( gi|7 )            :                                                                                                                                                             AATGATT-TACCTGGCACTC-AT--A--A---A-AT-TTCG-------C---C--AA--TAT--GT----------TCGGG-G-ATTT-GAACGCCT-TCTCCGTGCAGCTGT----TC-ATGGGT----GCGATA---C------GATGCC-GAT-TTG-AC-AAT--GCA-----T---TAATAT-C-G----G------TTTATCA--A--------A-----------GGTAGTA--TCAC-CATT----TA-CGTTCAT-----ACAC-CGC------A--A-ATC-AATTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCACGAGT-TACAGGTAAAACCTTACGGAC
gi|4                          :                                                                                                                                                             AATGTAT-TACCAGGCACTC-AT--A--A---ATAT-TTCG-------T---G--CA--TATCCGTAAATTAATTGTCGGT-G--TCC-GAACG------TCAATACTGATAT----TA-CT--GT-----TGATAAACC------GATACC-AATACTGTAC--AT--G-A-----T---CAA-AT-C-G----G--------CATCA----------------------------TA--TCG--CACT----TA-CG--AAT-----A-AC-TGCACGGAGA--A-AGC-A--TTAAAATGCCC----GA--GT-A-------TATTGA----C-----------GAAGA-TTTAATTAATGAGT-GCCAGGTAAAACCTTCCG
gi|10                         :                                                                                                                                                        tccgtAAGGATT-TACCTGGCGCTC-A---A--C---A-ATCTTCA-------C---C--AA--CGT--GC----------TGGGG-GCGTTT-AAACGCCT-TCTCAGTGCAGCT----------------------ATG---T------TATACC-GAT-TTA-AT-AAC--GAA-----A---TGGTAT-C-G----GT-----TTTACCG--A--------C-----------ACTTATA--TCAA-TATT----TA-CGTT--T-----GGAC-TGC------AACA-GTT-CATTTG-------C----GG--ATGA-------TGC--ATCTTT-----------GG--A-C---ATTCATGGGTGTA-AGGTAAATCCTGACGCAC
gi|30                         :                                                                                                                                                          cgtAACGTTT-TACCTGGCTCTC-AT--T--A---A-TC-TTCG-------C---C--AA--TAT--GT----------CCAAG-C-ATTT-AAACACCT-TCTCCGTGCCACTAT----TC-AAGAGT----GCGATA---T------AATGCT-GAT-TTG-AT-AAT--aa
gi|31                         :                                                                                                                                      agacacataattgtattgtccgtAAT-ATT-TAACCGGCACTT-AT--T--A---A-AC-TTCT-------T---C--AA--T----GT----------TCGAG-C-ATTT-AAACAC
gi|35                         :                                                                                                                                                     tatgtgtaAAT-ATTGTATCTTGCACTCGAT--C--ATTCA-TC-TTCG-------T---C--AA--TAT--GT----------TCGGC-C-ATTT-GGACACCTGTATTGGTACACCTAT----Taaatgttcgtgaattcttgagtaccagacaaatgcccatgcacattactttacaattcatccat
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gi|5                          :                                           ttaagcagttccattacctgaatatattacaaataccttaacttaattgatatctgtttatcaacagttatatccctatttatgtccaaacttcgaaaataaatttaaggatacacTGTTT-TACCTGGCGCTC-AT--T--A---A-TC-TTTG-------C---C--AA--TAT--GT----------TCGGC-C-GTTT-AAAC--TT-TCTCTGTGAAGCTAT----TT-GCGGGG----GCAATA---T------GATGCC-GAT-TTT-CT-AAG--GTA-----T---TAATAT-T-G----G------TTTATCA--A--------C-----------AGTAATG--TCAC-TACT----TA-CGTTCGA-----ACAG-CAA------A--A-A-C-AAATTA-------C----GG--GT-T-------TAC--A----C-----------CGA-A-T---ATTCATGATT-GTCAGATAAATCCTTACGCACaacgga
gi|15                         :                                                                                                                                                          ccgtatGATT-TACCTGGCATTC-AT--G--A---ATAT-TCCG-------T-------G--TAT--AT----------CCGat
gi|6                          : ccgtaaagttatacctgtcactcattaatcttcttcaatatgttcgtgcgtttaaacgtattctttgtgtatctattcgtgagtgcgctatgatgccgatacaatactgtatacggtttatccatagatataatattatggatgttcggacattgattttATT-TACCTGGCAATC-AT--T--A---G-TC-TTCG-------C---C--AA--T----GT----------TCGGA-G-------------T-TCCCCGTACAGCTAT----TT-GTGAAT----GCGATA---A------GATGCC-GAT-TTA-AT-TAT--GCA-----T---TGGTAT-C-G----G------TTAATCA--A--------C-----------AGCAAGA--TTAC-CATT----TA-CGTTCGG-----AATC-CGA------A--A-ATC-AGTTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----CGAGTATACATGGGA-C-T---ATTCATGTGT-CCCAGGTAAActaacgcac
gi|39                         :                                                                                                                                                         gcgtaagtATT-TACCCGGCACTC-AT--G--A---ATAT-TCCG-------T-------G--TAT--AT----------CCGtactaacaggt
gi|4                          :                                                                                                                                      ttacgttcggacagagacagttgatttaTT-TACCTGGCACTC-ATTAATTA---A-ATCTTCG-------T---C--AA--TAT--AC----------TCGGG-C-ATTT-TAATGCTT-TCTCCGTGCAGTTAT----TC-GTAAGT----GCGATA---T------GATGCC-GAT-TTG-AT-CAT--GTACAGTAT---TGGTAT-C-G----G------TTTATCA--A--------C-----------AGTAATA--TCAG-TATT----GA-CGTTCGG-----ACAC-CGA------C--A-ATT-AATTTA-------C----GG--AT-A-------TGC--A----C-----------GAA-A-T---ATTTATGAGT-GCCTGGTAATACATTACGGAtctaacgcac
gi|14                         :                                                                                                                                                                  TT-TACCTTGCACTA-AT--C--A---A-TC-TTTG-------C---C--AA--TAT--AT----------TCTGG-C-ATT--AAACGCCA-TCTCCGTGCAGCTAT----TC-GCGAAT----ACGATA---T------GATGCC-GAT-TAA-AT-AAT--GTA-----T---TTGTAT-C-G----G------TTTATCA--G--------C-----------AGAAATA--TCAC-TACT-------------T-----ACAC-CAA------A--A-ATT-AA-TAA-------C----TG--AT-A-------AAC--A----C-----------GGA-A-T---ATACATGAGT-GCAAGGTAAATCCTTACGAACaccttccg
gi|12                         :                                                                                                                                                           gtaaggtTT-TACCTGTCACTG-AT--T--A---A-TC-TTCA-------C---C--AA--TAT--GT----------TCAGGCG---TT-AAACGCCT-TCTCCGTGCAGCTAT----TT-GTGAGT----GGGATG---T------AATTCC-GAT-TAA-GT-AAT--GTA-----T---TGGCAT-C-G----G------TTTGTCA--A--------C-----------GGTAATA--TCAC-TA-C----TA-GGTTCTG-----GCAC-CGA------A--C-ATT-GATTTA-------C----GG--AC-A-------TAC--A----G-----------AGA-C-T---ATTCGTCAAT-GTCAGGTAAATCCTAACGCACa
gi|3                          :                                                                                                                                                              atctTT-TACCTGGCAGTC-AG--T--A---A-TC-TTCG-------C---C--AG--TAT--GT----------TCGGA-C-GTTT-ATACGCAT-CCTCCGTGCAGCTAT----TC-GTGGGT----CCGAGA---T------GGTGCC-GAT-TTG-AT-AAC--GTA-----T---TGGTAT-C-G----G------TTTATTT--A--------ACATTTTTTTACTATAAAA--TCAC-TACT----TA-TATTCTG-----GCAC-CGA------A--A-ATA-AATTTA-------C----GG--AT-A-------AAC--A-----------------GA-A-T---ATTCATGAGT-GCTAAGTAAATACTAACGCACa
gi|20                         :                                                                                                                                                        accgtaaggtTT-TACCAGGCACAC-AT------------C-TTTG-------C---C--AA--TAT--G--------------------------ATGCTT-TCTCCATGCAGCTAT----TC-TTGAGT----GCAATA------------TGCC-GAT-TTA-AT-AAT--GTA-----T---TGGTAT-C-A----G------TTTATCA--A--------C-----------AGTATTG--TCAC-TATT----TA-CATTTGG-----ACAC-C--------A--A-A---AATTTA-------CAAATGG--AT-A-------TAC--A----C-----------AGA-A-C---ATTCCTGAGT-GCCATGTAAAACCTTACAGACaat
gi|19                         :                                                                                                                                                          cgcaaggtTT-TACCTGTCACTC-GT--T--A---A-TC-TTCG-------C---A--AA--TAT--GT----------TCGGG-C-GTTT-AATGGCAT-TCTCCGTACAGCTAT----TC-GTGCAT----TCGTTA---T------GATACC-AAT-TT-----------------------AATAT---G----G------TTTAATA--AC-------A-----------ACTA-TA--TCAC-TATT----TA-CGTTCGG-----ACAC-CGA------A--ACAT--AATTTA-------C----GG--AT-A-------CAC--A----C-----------GGA-A-C---ATTCATGAGT-GCCAGGTAAGACCGAGCGGACaa
gi|22                         :                                                                                                                                                               agtTT-TACCTGGCACTC-AT--T--A---A-TC-TACG-------T---C--AA--TAT--GT----------TCGAG------T-G--------TTTCCGTGCAGCTAT----TC-GTGTGT----GCGATA---T------TATGCC-GAT-TTA-AT-AAC--GAT-----T---TTGTAT-T-G----G------TTAAACA--A--------C-----------AGTGATA--TCAA-TATT----TA-CGTTTGG-----ACAC-AAA------A--A-ATC-AAGTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------AGA-A-T---ATTCATGa
gi|13                         :                                                                                                                                                           gtaaggtTT-TTTCTGGCACTC-----------------TTCG-------C---C--AA--TTT--GT----------TCGGG-C-GTTT-AAACGCCT-TCTCCATGCAGCCAT----TA-GTGAAT----GCGATA---A------TATGAC-GA--TTA-ACTAAT--GCAT----T---TTGCAT-C-G----G--------TATCA--A--------C-----------AGTTGTA--GCAC-TGTT----CG-CGTTCGT-----ACAC-CGA------T--A-ATT-AATTTA-------C----GG--AT-A-------TAT--A----A-----------GGA-A-T---AGCCTTGATT-GTCAGATCAATCTTTACG
gi|17                         :                                                                                                                                                             gatatTT-TACCTGGCACTA-AT--C--C---A-CC-TTTG-------C---G--GG--TAT--GT----------TC---------T-GA---CCT-TCTCCGTACAGCTAA----TA-GTGAAT----GCATTA---T------GATGCT-GAT-TTA-AT-AAC--GCG-----T---TGGTTT-T-G----G------TTTATCA--A--------C-----------TGTAATA--TCAT---TT----TA-CATTCAG-----ACAA-AGA------A--A-ATT-AATTTA-------C----GG--AT-T-------TAC--A----C-----------AGA-A-T---ATTCACAAGT-GTCAGGTAAAcataa
gi|21                         :                                                                                                                                                         gcgtaagctTT-TACCTGGTACT-------------A-AT-TT---------------------AT--GT----------CCTGG-C-GGTT-AAACGCCT-TCTCCATGCAACTAT----TC-TTGAGT----GCGATC---T------GATCCC-GAT-TT-----AATTGGTA-----C---TGATAT-A-G----G------TTTGTCT--A--------T-----------AGTAATA--TCAC-TATT----TA-CGGTCGG-----ACCC-CGA------A--A-ATT-AATTTA-------T----CG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCATAAAT-GCCATATAATGCCTtactaacgc
gi|18                         :                                                                                                                                                            tcaggtTT-TACCTGGCACTC-GT--C--A---A-TC-TTCG-------C---A--AA--TGT--GT----------T-GGG-C-GTTTAAAATGGCT-TCTCCGTACAAC-AT----TC-GCGAAT----GCGATA---T------GATGCC-GTT-TTA-AT-AAC--GTA-----T---TGGTAT-A-G----G------TTTGTCA--A----------------------CAATA--TCA--CGTT----TAGCGTTCGG-----ACAC-CGG------A--A-A-C-AATTTA-------C----GA--AT-A-------TAC--T----C-----------TAC-T-T---ATACATGAAT-T-CAGGTGATTACTAACGGACa
gi|16                         :                                                                                                                                                                 tTT-TATCTGGCACTC-AT--T--A---A-----TCG-------TTTGC--AA--TAT--AT----------TCGCG-C-GTTT-GAACACCT-TCTCTGTA------------------AT----GCGACG---T------GA-ACCAGAT-TTA-AT-AAT--GTA-----T---TGGTAT-CAG----G------TCTATTA--A--------C-----------AGTTATA--TTAC-TATT----TA-TGGTCGG-----ACAA-CAA------G--A-GTT-AATTTA-------C----GG--AT-A-------CTC--A----C-----------GGA-A-T---ATCCATGAGT-TCCGGACAAAACCTGACGGAC
gi|11                         :                                                                                                                                                           gtaacatTT-TATCTGGCATTC-AT--T--A---A-TC-TTTG-------C---C--AA--TGT--AA----------TCGGG-------------TCT-TTTCCGCGCAGCTAT----TC-GAGAGT----ACGACA---CTGTCATAATGCT-TAT-TTA-AT-AAT--GTC-----T---TGGTAT-C-G----G------TTTTTCA--A--------C-----------AGTAATA--TCAG-TACC----TA-CGTACGG-----ACAC-CGA------A--A-ATT-AATAAG-------C----AGGTAT-A-------TAT--A----C-----------GGA-A-T---AGTCATG-----CCAGGTAAAACCTAACGGACag
gi|9                          :                                                                                                                                                         ccgttaagtTT-TAAATGGCACTC-GT--T--A---A-TC-ATCG-------T---C--AA--TAT--GT----------TTGGG-C-GTTT-AAACGCCT-TTTCCGTACAGCTAT----TC-GTGAGT----GCAATA---T------GACACC-AAT-TTA-AT-AAT--G--------------TGT-C-G----GGGTAAATTTGTCA--G--------C-----------AGTCATGC-TTA--TATT----TA-AGTTCGA-----ACA----C------A--A-AGA-GA-TTA-------C----AG--AG-T-------TAC--A----T-----------GAA-A-T---ATCCATGAAT-GCAAGGTAAAACCTTACGGAC
gi|24                         :                                                                                                                                                           ggaaggtTT-TACCTTGCACTA-AT--T--A---A-CC-TTGG-------C---C--AA--TAT--GT----------CCGGG-C-GTTT-AAACGC----CTCCGTGCAGCTCT----CC-GTGAGT----GCGATA---T------AAGGCC-G-----------------------------ATAT-C-G----G------TTTGTCA--A--------C-----------AGTTATA--TCCC-TATA----TA-CGTTCAA-----ACAA-TGA------G--A-ACT-AATTGA-------C----GT--GT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATa
gi|23                         :                                                                                                                                                        tccgtaaggtTT-TACCCGGCACTC-AT--T--A---A-TC-TTCG-------C---A--AA--TAT--GT----------TCGGG-C-GTTA-AAACACAT-TCTTCGTGCAGCTAT----TC-GTGAAT----ACGATA---T------GATGCC-GAT-TTA-AC-AAT--TTA-----T---TTATAT-C-G----G------TTCCTCA--A--------C-----------AAAAATA--------ATT----TA-CGGATAT-----ACAC-
gi|25                         :                                                                                                                                                       gtgcgtaagttTT-TACCTGGTACCC-AT--T--A---A-TC-TTCG-------C---C--AA--TGT--AT----------TC-----------GAA--CCG-TCT-CGTGCAGCTAT----TC-GTGAGT----ACGACA---T------GATCCC-GAT-----AT-AA---GT-------------TAT-T-G----G------GTTATCATCA--------A--------------AATA--TCAC-TATT----TA-CATTCGG-----ACAC-CAA------A--C-ATT-AATTTA-------T----GG--AT-A-------TTC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCgagtgtcaggtatatactgacacaca
gi|1                          :                                                                                                                                                         ccgtaaggtTT-TACCTGGCACTC-AT--G--A---ATAT-T
gi|28                         :         ttcatcgatgttaatctgtgctctcaacgctacagtgtaatgaatgcgatatgatgccaaattaattttttattggtaagaccgtatcgtttatcaacaaaaacggcaatatttacattcagacaccaaaaattaatttacagatatacacagTT-TACTTGGCACTC-AT--T--A---TTCT-TCCG-------C---C--AA--TAT--GT----------TCGGG-C-ATTatgtgatggatattatacgctgtttatcaagtcatacaacatttttcatttcacatttttaattccatgggataaaat
gi|8                          :                                                                attttccatgtatatccataaattgttttcagtgtccgaacgtaaatagttatattactgttgacaaaccgataccaatataattacactcacaaattTT-TACCTGGCACTC-AT--T--A---A-TC-TTCG-------C---C--AA--TAT--GT----------TCAGG----T--------CC---CTCCGTACAGCTAT----TC-ATGAAT----ACGATA---T------Ggccttacgg
gi|2                          :                                                                                                                                                         gcgtaagttTT-TCCCTGTAACTC-AT--T--T---A-TC-TTGG-------C---C--AA--TAT--GT----------TCGAA-T-GTTT-AAACGCCC-TCTCCGTGTATCTATCTTATCTATCTGTAAGGGCGTTA---T------GATGCC-AAT-TTA-AC-GAT--A-A-----TAA-TAATACAT-G----G------AATATTA--ATGGGTGCCA-----------GATAATACCTCACACGTTGAAATA-CGCT-AT-----AGAC-C-CTTCTT-A--ATATT-ACTTCA-------T----GA--AT-A-------TTT--A----T-----------GAG-A-T---ATCCAcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|40                         :                                                                                                                                        cataaacacaatattgtccgtaaggtTT-TACCTGGCACTG-AT--T--A---A-----TC-------------------------T----------TCGGG-------------CCT-TCTCCGCACAGTTAC----TC-GTGAGT----GCGATA---T------GATGTC-Ggaacga
gi|19                         :                                                                                                                                                                   T-TACCTGGCACTC-AT--G--A---ATGT-TCCGTGTGTATC---CGTAAATTAT--GT----------TTCGG-T-GTCC-GAACGac
gi|15                         :                                   agttttacctgtcactcgttaatcttcgcaaatatgttcgggcgtttaatggcattctccgtacagctattcgtgcattcgttatgataccaatttaatatggtttaataacaactatatcactattta-TACCTGTCACTC-AT--T--A---A-TC-TTCT-------T---C--AA--TAT--GT----------TCGTG-C-GTTT-AAACGTAT-TCTTTGTGTATCTAT----TC-GTGAGT----GCGCTA---T------GATGCC-GAT-----AC-AAT--AC------T---GTATA--C-G----G------TTTATCC--AT-------A-----------GATA-TA--ATAT-TATG----GA-TGTTCGG-----ACAT-TG-----------------ATTTT-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCATGAAT-GCCAGGTAAATCCTAACGCACgaccgagcggaca
gi|26                         :                                                                                                                                                            ccgtaaagttaCCTGGCACTC-GT--A--T---A-TC-TTCG-------C---C--AA--TGT--GT----------TTGGG-C-GTTT-TCATGTGT-TCTCCATGCAATTAT----T---TGG------------------------TGCC-GAT-TTA-AT-AAT--GCA-----T---TGGTAT-C-G----G------TTGATC------------------------------A--TCAG-TTTT----TT-CATTCAA-----ACAC-CG-------A--T-GTCTAATTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----
gi|41                         :                                                                                                                                                                        tTGGCACTC-CT--T--A---G-TT-TTCA-------C---C--AA--TAT--GT----------TCGGG-atgctaggtaaatgttaatgca
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                           attattgtgcataagtatgtgttCCATTCAGCTAT----TT-TTGAAT----GTGATA---T------GATTCC-CAT-TTA-GT-AAT--GTA-----T---T--------G----G------T--AGCA--A--------C-----------AGTTATA--TCAC-TTTT----TA-CGCTTGA-----ACAT-CGA------A--A-ACG-AAATTA-------C----GA--AT-A-------TAC--A----C-----------GAA-G-T---ATTCACAAGT-GTCAGGTAAATACTTATGCACc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ag-ATGAAT----GCGATA---T------GATGCC-AAA-TTA-AT-TTT--TTA-----TTGGTAAGAC-C-GTATCG------TTTATCA--A--------C-----------AAAAACG--GCAA-TATT----TA-CATTCAG-----ACAC-CAA------A--A-ATT-AATTTA-------C----AG--AT-A-------TAC--A----C-----------AGA-A-T---ATTCATGAGT-GCCAGGTAAAATGTGATGGA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                  ttcatcgatgttaatctgtgctctcaacgctacagtgtaGT----ACGATA---T------GATGCT-GGT-TAA-AT-ATT--GTA-----T---TGATGT-C-G----G------TTTATTA--A--------------------------------C-TGTT----AA-CGATCGG-----ACAC-CGG------A--C-ATT-AGTTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------Gtattatacgctgtttatcaagtcatacaacatttttcatttcacatttttaattccatgggataaaat
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                          gcgtaagtttttacctggcactcattaatcttcgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatT--GTA-----T---TGATAT-C-G----G------TTTATTA--A--------C-----------CGTAATA--TTAC-TATT----TA-AGATCGG-----ACAC-CGA------A--A-ATT-AATTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCATGAAT-GCCGGGTTAATCCTAACGta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatA-----T---TGATAT-C-T----G------TTTATCA--A--------C-----------AGTTATA--TCCC-TATT----TA-TGTCCAA-----ACTT-CGA------A--A-ATA-AATTTA-------A----GG--AT-A-------CAC--G----C-----------GGA-A-T---GTTCATGAGT-GCCAGGTAAAACATAACGGAta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttaagcagttccattacctgaatatattacaaataccttaacttaA-----T---TGGTAT-C-G----G------TTTGTCA--A--------C-----------AGTAATA--TAAC-TATT----TA-CGTTCGG-----ACAC-TGA------A--A-A-C-AATTTA-------T----GG--AT-A-------TAC--A----T-----------GGA-A-A---AT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAT-T-G----G------TTTATCG--A--------T-----------AGTAATA--TCAC-CGTT----TG-CGTTCG------ACGC-CGA------A--G-ATA-AATTAA-------C----CG--AC-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCATGAGT-GCCAGATataattacactcacaaattaatgcccgaacatattggcggaagaataatgagtgccaagtaaagccttacgg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtg-CATT----TA-TCTTCGT-----AAAT----------A--T-GTT-AATTTA-------C----AG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ACTCATGAGT-GCTAGATAAATCCTAACGCACtagtggctacgg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cctgtcaggttttacctgctattT----TA-CGTTCGG-----ACAG-AGA------C--A-GTT-GATTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-A-T---ATTCATGAGT-GCCGGGTAAATTCTAACGCACaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTCATCTCTGACAC-CGA------A--C-ATT-AATTTA-------C----GG--AT-A-------TAC--A----C-----------GGA-CTT---GTTCATGAGT-ACCAGGT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gatttatgaatagaaaaataaaaT-----ACACTCAC------A--A-ATT-AATGCC-------C----GA--AC-A-------TATTGG----C-----------GGA-A-G---AATAATGAGT-GCCAAGTAAAGCCTTACGGcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attttccatgtatatccataaattgttttcagtgtccgaacgtaaatagttatattactgttgacaaaccgataccaatataatC-AATTTA-------A----CG--AT-AATAATAATAC--A----T-----------GGA-A-T---ATTAATGGGT-GCCAGATAATACCTCAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cataaacacaatattgtccgtaaggttttccctgtaactcatttatcttggccaatatgttcgaatgtttaaacgccctctccgtgtatctatcttatctatctgtaagggcgttatgatgcGA-A-G---ATTAACGAGT-GACAGGTAAAACacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aGA-A-G---ATTAATGAGT-GACAGGTATAACTTTACGGgcaaatatgttcgggcgtttaatggcattctccgtacagctattcgtgcattcgttatgataccaatttaatatggtttaataacaactatatcactatttacgttcggacaccgaaacataatttacggatacacacggaacattcatgagtgccaggtaagaccgagcggaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GA-A-G---ATTAATGGGT-ACCAGGTAAAACCTTACGGttcaatatgttcgtgcgtttaaacgtattctttgtgtatctattcgtgagtgcgctatgatgccgatacaatactgtatacggtttatccatagatataatattatggatgttcggacattgattttcggatatacacggaatattcatgaatgccaggtaaatcctaacgcac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GA-A-G---ATTAATGAGA-GCCAGGTAAAACGTTACGGACgccaatgtattcgaaccgtctcgtgcagctattcgtgagtacgacatgatcccgatataagttattgggttatcatcaaaatatcactatttacattcggacaccaaacattaatttatggatattcacggaatattc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agacacataattgtattGA-A-G---ATTAATGAGT-GCCAGGTAAAAACTTACGgccaatatgtccaagcatttaaacaccttctccgtgccactattcaagagtgcgatataatgctgatttgataat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gATGAGT-TACAGGGAAAACCTTACGGACgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cataaacacaatattCAGGTAAAACCTTACGGttatcttggccaatatgttcgaatgtttaaacgccctctccgtgtatctatcttatctatctgtaagggcgttatgatgccaatttaacgataataataatacatggaatattaatgggtgccagataatacctcacacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGGTAAAACCTTACGGAgcagtcagtaatcttcgccagtatgttcggacgtttatacgcatcctccgtgcagctattcgtgggtccgagatggtgccgatttgataacgtattggtatcggtttatttaacatttttttactataaaatcactacttatattctggcaccgaaaataaatttacggataaacagaatattcatgagtgctaagtaaatactaacgcacaat
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|38 ): TACATTTACAATTTCTATAAGGCAATTCATAACGTACGTAATAATTTATATTCGCACTTTTCATCATATGATAGAA
Unaligned ( gi|42 ): CTGGTAAATTAATTATTAAAACAATCTTTGACTATTGCTTATATGTAATTGT
Unaligned ( gi|43 ): GTACTGGTTGTATATTGATTTTATTGTTGTGTTTTTGTAAATAT
Unaligned ( gi|44 ): AATGTGTATATATAATTCGTACACTATTATTTTATATAA
Unaligned ( gi|45 ): AGACATATAAACATGTAATTTAGTCACTGGTA






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Reference ( family-832 )      :                                                                                                                                         AATGATT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTTCGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAGTGC--GATA------TGATGCC-GATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATA-TCACTATTTA-CGTTCGGACACCGAAAATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCAGGTAAAACCTNACGGAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                              TGAATGC--GATA------TGATGCC-AAATTAATTTTT-TA-----TTGGTAAGACC-GTATCG-TTTA-TCAACA----------A---AAACG-GCAATATTTA-CATTCAGACACCAAAAATTAATTTACAG--AT-ATACA----C-----------AGAA-TATTCATGAGTGCCAGGTAAAATGTGATGGA
gi|10                         :                                                                                                 ttcatcgatgttaatctgtgctctcaacgctacagtgtaaAAGGATT-TACCTGGCGCTC----AACAAT-----C-TTC-ACCAACGTGCTGGGGGCGTTT-AAACGC-CT-TCTCAGTGCAGCT-------------------------ATG------TTATACC-GATTTAATAACG-AA-----ATGGTA---TC-G----GTTTTA-CCGACA----------C---TTATA-TCAATATTTA-CGTTTGGACTGCAACAGTTCATTTGCGG--ATGATGCATCTTT-----------GG-A-CATTCATGGGTGTAAGGTAAATCCTGACGCACtattatacgctgtttatcaagtcatacaacatttttcatttcacatttttaattccatgggataaaat
gi|11                         :                                                                                                                                           cgtTT-TATCTGGCATTC----ATTAAT-----C-TTT-GCCAATGTAATCGGG-T------------CT-TTTCCGCGCAGCTAT----T-C-----GAGAGTAC--GACACTGTCATAATGCT-TATTTAATAATG-TC-----TTGGTA---TC-G----G-TTTT-TCAACA----------G---TAATA-TCAGTACCTA-CGTACGGACACCGAAAATTAATAAGCAGGTAT-ATATA----C-----------GGAA-TAGTCA----TGCCAGGTAAAACCTAACGGACaa
gi|12                         :                                                                                                                                     ccgttaagtTT-TACCTGTCACTG----ATTAAT-----C-TTC-ACCAATATGTTCAGG-CGTT--AAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTAT----T-T-----GTGAGTGG--GATG------TAATTCC-GATTAAGTAATG-TA-----TTGGCA---TC-G----G-TTTG-TCAACG----------G---TAATA-TCACTA-CTA-GGTTCTGGCACCGAACATTGATTTACGG--AC-ATACA----G-----------AGAC-TATTCGTCAATGTCAGGTAAATCCTAACGCAC
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gi|14                         :                                                                                                                                         gatatTT-TACCTTGCACTA----ATCAAT-----C-TTT-GCCAATATATTCTGG-CATT--AAACGC-CA-TCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GCGAATAC--GATA------TGATGCC-GATTAAATAATG-TA-----TTTGTA---TC-G----G-TTTA-TCAGCA----------G---AAATA-TCACTACTT---------ACACCAAAAATTAA-TAACTG--AT-AAACA----C-----------GGAA-TATACATGAGTGCAAGGTAAATCCTTACGAACcataa
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gi|16                         :                                                                                                                                   ccgtaaagttaTT-TATCTGGCACTC----ATTAAT-----CGTTT-GC-AATATATTCGCG-CGTTT-GAACAC-CT-TCTCTGT-----------------------AATGC--GACG------TGA-ACCAGATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TCAG----G-TCTA-TTAACA----------G---TTATA-TTACTATTTA-TGGTCGGACAACAAGAGTTAATTTACGG--AT-ACTCA----C-----------GGAA-TATCCATGAGTTCCGGACAAAACCTGACGGAC
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gi|18                         :                                                                                                                                     gcgtaagctTT-TACCTGGCACTC----GTCAAT-----C-TTC-GCAAATGTGTT-GGG-CGTTTAAAATGG-CT-TCTCCGTACAAC-AT----T-C-----GCGAATGC--GATA------TGATGCC-GTTTTAATAACG-TA-----TTGGTA---TA-G----G-TTTG-TCAAC----------------AATA-TCAC-GTTTAGCGTTCGGACACCGGAAA-CAATTTACGA--AT-ATACT----C-----------TACT-TATACATGAAT-TCAGGTGATTACTAACGGACc
gi|19                         :                                                                                                                                             tTT-TACCTGTCACTC----GTTAAT-----C-TTC-GCAAATATGTTCGGG-CGTTT-AATGGC-AT-TCTCCGTACAGCTAT----T-C-----GTGCATTC--GTTA------TGATACC-AATTTAATA---------------------T-G----G-TTTA-ATAACA----------A---CTATA-TCACTATTTA-CGTTCGGACACCGAAACATAATTTACGG--AT-ACACA----C-----------GGAA-CATTCATGAGTGCCAGGTAAGACCGAGCGGAC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agtATGAGTTACAGGGAAAACCTTACGGACa
gi|2                          :                                                                                                                               cataaacacaatattTT-TCCCTGTAACTC----ATTTAT-----C-TTG-GCCAATATGTTCGAA-TGTTT-AAACGC-CC-TCTCCGTGTATCTATCTTAT-CTATCTGTAAGGGC--GTTA------TGATGCC-AATTTAACGATttatcttggccaatatgttcgaatgtttaaacgccctctccgtgtatctatcttatctatctgtaagggcgttatgatgccaatttaacgataataataatacatggaatattaatgggtgccagataatacctcacacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cataaacacaatattgtccgtaaggt-ATACA----T-----------GGAA-TATTAATGGGTGCCAGATAATACCTCACaataataatacatggaatattaatgggtgccagataatacctcacacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|20                         : cataaacacaatattgtccgtaaggttttccctgtaactcatttatcttggccaatatgttcgaatgtttaaacgccctctccgtgtatctatcttatctatctgtaagggcgttatgatgccaatttaacgataataataTT-TACCAGGCACAC----AT---------C-TTT-GCCAATATG---------------ATGC-TT-TCTCCATGCAGCTAT----T-C-----TTGAGTGC--AATA------TG---CC-GATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TC-A----G-TTTA-TCAACA----------G---TATTG-TCACTATTTA-CATTTGGACACCAAAAATTTACAAATGG--AT-ATACA----C-----------AGAA-CATTCCTGAGTGCCATGTAAAACCTTACAGACacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|21                         :                                                                                                                                      cgcaaggtTT-TACCTGGTACTA----ATT-------------------TATGTCCTGG-CGGTT-AAACGC-CT-TCTCCATGCAACTAT----T-C-----TTGAGTGC--GATC------TGATCCC-GATTTAAT--TGGTA-----CTGATA---TA-G----G-TTTG-TCTATA----------G---TAATA-TCACTATTTA-CGGTCGGACCCCGAAAATTAATTTATCG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATAAATGCCATATAATGCCTaa
gi|22                         :                                                                                                                                        tcaggtTT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TAC-GTCAATATGTTCGAG-TGTTT--------------CCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGTGTGC--GATA------TTATGCC-GATTTAATAACG-AT-----TTTGTA---TT-G----G-TTAA-ACAACA----------G---TGATA-TCAATATTTA-CGTTTGGACACAAAAAATCAAGTTACGG--AT-ATACA----C-----------AGAA-TATTCATGa
gi|23                         :                                                                                                                                       gtaaggtTT-TACCCGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCAAATATGTTCGGG-CGTTA-AAACAC-AT-TCTTCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAATAC--GATA------TGATGCC-GATTTAACAATT-TA-----TTTATA---TC-G----G-TTCC-TCAACA----------A---AAATA------ATTTA-CG
gi|24                         :                                                                                                                                   gtgcgtaagttTT-TACCTTGCACTA----ATTAAC-----C-TTG-GCCAATATGTCCGGG-CGTTT-AAACGC-----CTCCGTGCAGCTCT----C-C-----GTGAGTGC--GATA------TAAGGCC-GA----------------------TA---TC-G----G-TTTG-TCAACA----------G---TTATA-TCCCTATATA-CGTTCAAACAATGAGAACTAATTGACGT--GT-ATACA----C-----------GGAA-TATgatatacacgagtgtcaggtatatactgacacaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tccgtaaggtGAA-GATTAATGGGTACCAGGTAAAACCTTACGG
gi|25                         :                                                                                                                                              TT-TACCTGGTACCC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATGTATTCG---------AACCGT-CT-----CGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAGTAC--GACA------TGATCCC-GAT---ATAA-G-T----------TA---TT-G----G-GTTA-TCATCA----------A----AATA-TCACTATTTA-CATTCGGACACCAAACATTAATTTATGG--AT-ATTCA----C-----------GGAA-TATTCgccaatgtattcgaaccgtctcgtgcagctattcgtgagtacgacatgatcccgatataagttattgggttatcatcaaaatatcactatttacattcggacaccaaacattaatttatggatattcacggaatattc
gi|26                         :                                                                                                                                          ccgtaaggtCCTGGCACTC----GTATAT-----C-TTC-GCCAATGTGTTTGGG-CGTTT-TCATGT-GT-TCTCCATGCAATTAT----T---------------------------TGGTGCC-GATTTAATAATG-CA-----TTGGTA---TC-G----G-TTGA-TCATCA----------G---T---------TTTTT--CATTCAAACACCGATGTCTAATTTACGG--AT-ATACA----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tA-----TTGATA---TC-T----G-TTTA-TCAACA----------G---TTATA-TCCCTATTTA-TGTCCAAACTTCGAAAATAAATTTAAGG--AT-ACACG----C-----------GGAA-TGTTCATGAGTGCCAGGTAAAACATAACGGAatgctaggtaaatgttaatgca
gi|28                         :                                                                                                 ttaagcagttccattacctgaatatattacaaataccttaacttaTT-TACTTGGCACTC----ATTATT-----C-TTCCGCCAATATGTTCGGG-CATT---------------------A---AT----T-T-----GTGAGTG-------------------------TAAT--TA-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTG-TCAACA----------G---TAATA-TAACTATTTA-CGTTCGGACACTGAAAA-CAATTTATGG--AT-ATACA----T-----------GGAA-AAT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                     CCATTCAGCTAT----T-T-----TTGAATGT--GATA------TGATTCC-CATTTAGTAATG-TA-----TTGGTA-----------G-------CAACA----------G---TTATA-TCACTTTTTA-CGCTTGAACATCGAAAACGAAATTACGA--AT-ATACA----C-----------GAAG-TATTCACAAGTGTCAGGTAAATACTTATGCACgccttacgg
gi|3                          :                                                                                                                                            agTT-TACCTGGCAGTC----AGTAAT-----C-TTC-GCCAGTATGTTCGGA-CGTTT-ATACGC-AT-CCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGGGTCC--GAGA------TGGTGCC-GATTTGATAACG-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTATTTAACATTTTTTTACTA---TAAAA-TCACTACTTA-TATTCTGGCACCGAAAATAAATTTACGG--AT-AAACA-----------------GAA-TATTCATGAGTGCTAAGTAAATACTAACGCAC
gi|30                         :                                                                                                                               accgtaaggtAACGTTT-TACCTGGCTCTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTCCAAG-CATTT-AAACAC-CT-TCTCCGTGCCACTAT----T-C-----AAGAGTGC--GATA------TAATGCT-GATTTGATAATaat
gi|31                         :                                                                                                                  agacacataattgtattgtccgtAAT-ATT-TAACCGGCACTT----ATTAAA-----C-TTC-TTCAAT--GTTCGAG-CATTT-AAACACAAA-TGTTCGTG-A---AT----T-C-----TTGAGTACCAGACA-------AATGCC-CAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        tatgtgtaTATTG-TA-----TTGATA---TC-G----G-TTTA-TTAACC----------G---TAATA-TTACTATTTA-AGATCGGACACCGAAAATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAATGCCGGGTTAATCCTAACGgcacattactttacaattcatccat
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTA---TT-G----G-TTTA-TCGATA----------G---TAATA-TCACCGTTTG-CGTTCG-ACGCCGAAGATAAATTAACCG--AC-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCAGATta
gi|34                         :                                                                                                                                           tgtTT-TACCTGCTATTC----ATTTAT-----C-TTC-GTAAATATGTTtagtggctacgg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cctgtcaggtTTAATTTACAG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TACTCATGAGTGCTAGATAAATCCTAACGCACaatttacagatatacacggaatactcatgagtgctagataaatcctaacgcacaa
gi|35                         :                                                                                              cctgtcaggttttacctgctattcatttatcttcgtaaatatgAAT-ATTGTATCTTGCACTCGATCATTCAT-----C-TTC-GTCAATATGTTCGGC-CATTT-GGACAC-CTGTATTGGTACACCTAT----TAC-----GTAAaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccgt-G----A-TTTA-TGAATA----------G---AAAAA-TAAAAGTTCA-T-CTCTGACACCGAACATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGACTTGTTCATGAGTACCAGGT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                               GG-CTTTT-AAACAA-CA-TTTCCGTGCAGCT-T----------------ATGT--GGTA------TGA------A------AATG-TA-----AT-GTA---TC-A----G-TTTA-TAAACA----------G---TAATA-TCACTATTTcc
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTA-CGTTCGGACAGAGACAGTTGATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCGGGTAAATTCTAACGCAC
gi|4                          :                                                                                                                                              TT-TACCTGGCACTC----ATTAATTAAATC-TTC-GTCAATATACTCGGG-CATTT-TAATGC-TT-TCTCCGTGCAGTTAT----T-C-----GTAAGTGC--GATA------TGATGCC-GATTTGATCATG-TACAGTATTGGTA---TC-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATA-TCAGTATTGA-CGTTCGGACACCGACAATTAATTTACGG--AT-ATGCA----C-----------GAAA-TATTTATGAGTGCCTGGTAATACATTACGGA
gi|40                         :                                                                                                                                              TT-TACCTGGCACTG----ATTAAT-----C-TTC-G----------------G--------GC-CT-TCTCCGCACAGTTAC----T-C-----GTGAGTGC--GATA------TGATGTC-Gaccttccg
gi|41                         :                                                                                                                                                     TGGCACTC----CTTAGT-----T-TTC-ACCAATATGTTCGGG-Cac
gi|5                          :                                                                                                                    attattgtgcataagtatgtgttTGTTT-TACCTGGCGCTC----ATTAAT-----C-TTT-GCCAATATGTTCGGC-CGTTT-AAAC---TT-TCTCTGTGAAGCTAT----T-T-----GCGGGGGC--AATA------TGATGCC-GATTTTCTAAGG-TA-----TTAATA---TT-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATG-TCACTACTTA-CGTTCGAACAGCAAAAA-CAAATTACGG--GT-TTACA----C-----------CGAA-TATTCATGATTGTCAGATAAATCCTTACGCAC
gi|6                          :                                                                                                                                       ccgtatATT-TACCTGGCAATC----ATTAGT-----C-TTC-GCCA--ATGTTCGGA--G------------T-TCCCCGTACAGCTAT----T-T-----GTGAATGC--GATA------AGATGCC-GATTTAATTATG-CA-----TTGGTA---TC-G----G-TTAA-TCAACA----------G---CAAGA-TTACCATTTA-CGTTCGGAATCCGAAAATCAGTTTACGG--AT-ATACA----CGAGTATACATGGGAC-TATTCATGTGTCCCAGGTAAATACTAACAGat
gi|7                          :                                                                                                                                 gcgtaagtAATGATT-TACCTGGCACTC----ATAAAA-----T-TTC-GCCAATATGTTCGGG-GATTT-GAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTGT----T-C-----ATGGGTGC--GATA------CGATGCC-GATTTGACAATG-CA-----TTAATA---TC-G----G-TTTA-TCAAAG----------G---TAGTA-TCACCATTTA-CGTTCATACACCGCAAATCAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCACGAGTTACAGGTAAAACCTTACGGACgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-GATTAATGAGTGCCAGGTAAAAACTTACG
gi|8                          :                                                                                                                                             gTT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTTCAGG-T----------C-C---CTCCGTACAGCTAT----T-C-----ATGAATAC--GATA------TGgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                        gcgtaagttGTAC--GATA------TGATGCT-GGTTAAATATTG-TA-----TTGATG---TC-G----G-TTTA-TTA-------------------------ACTGTTAA-CGATCGGACACCGGACATTAGTTTACGG--AT-ATACA----C-----------Gcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|9                          :                     gcgtaagtttttacctggcactcattaatcttcgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatTT-TAAATGGCACTC----GTTAAT-----C-ATC-GTCAATATGTTTGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TTTCCGTACAGCTAT----T-C-----GTGAGTGC--AATA------TGACACC-AATTTAATAATG-TG-----TCGGGG---TA-A----A-TTTG-TCAGCA----------G---TCATGCTTA-TATTTA-AGTTCGAACAC--AAAG--AGATTACAG--AG-TTACA----T-----------GAAA-TATCCATGAATGCAAGGTAAAACCTTACGGACta
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-832 )      :                                                                                                                                         AATGATT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTTCGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAGTGC--GATA------TGATGCC-GATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATA-TCACTATTTA-CGTTCGGACACCGAAAATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCAGGTAAANCCTNACGGAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                              TGAATGC--GATA------TGATGCC-AAATTAATTTTT-TA-----TTGGTAAGACC-GTATCG-TTTA-TCAACA----------A---AAACG-GCAATATTTA-CATTCAGACACCAAAAATTAATTTACAG--AT-ATACA----C-----------AGAA-TATTCATGAGTGCCAGGTAAAATGTGATGGA
gi|10                         :                                                                                                 ttcatcgatgttaatctgtgctctcaacgctacagtgtaaAAGGATT-TACCTGGCGCTC----AACAAT-----C-TTC-ACCAACGTGCTGGGGGCGTTT-AAACGC-CT-TCTCAGTGCAGCT-------------------------ATG------TTATACC-GATTTAATAACG-AA-----ATGGTA---TC-G----GTTTTA-CCGACA----------C---TTATA-TCAATATTTA-CGTTTGGACTGCAACAGTTCATTTGCGG--ATGATGCATCTTT-----------GG-A-CATTCATGGGTGTAAGGTAAATCCTGACGCACtattatacgctgtttatcaagtcatacaacatttttcatttcacatttttaattccatgggataaaat
gi|11                         :                                                                                                                                           cgtTT-TATCTGGCATTC----ATTAAT-----C-TTT-GCCAATGTAATCGGG-T------------CT-TTTCCGCGCAGCTAT----T-C-----GAGAGTAC--GACACTGTCATAATGCT-TATTTAATAATG-TC-----TTGGTA---TC-G----G-TTTT-TCAACA----------G---TAATA-TCAGTACCTA-CGTACGGACACCGAAAATTAATAAGCAGGTAT-ATATA----C-----------GGAA-TAGTCA----TGCCAGGTAAAACCTAACGGACaa
gi|12                         :                                                                                                                                     ccgttaagtTT-TACCTGTCACTG----ATTAAT-----C-TTC-ACCAATATGTTCAGG-CGTT--AAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTAT----T-T-----GTGAGTGG--GATG------TAATTCC-GATTAAGTAATG-TA-----TTGGCA---TC-G----G-TTTG-TCAACG----------G---TAATA-TCACTA-CTA-GGTTCTGGCACCGAACATTGATTTACGG--AC-ATACA----G-----------AGAC-TATTCGTCAATGTCAGGTAAATCCTAACGCAC
gi|13                         :                                                                                                                                          atctTT-TTTCTGGCACTC-----------------TTC-GCCAATTTGTTCGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TCTCCATGCAGCCAT----T-A-----GTGAATGC--GATA------ATATGAC-GATTAACTAATG-CAT----TTTGCA---TC-G----G---TA-TCAACA----------G---TTGTA-GCACTGTTCG-CGTTCGTACACCGATAATTAATTTACGG--AT-ATATA----A-----------GGAA-TAGCCTTGATTGTCAGATCAATCTTTACGa
gi|14                         :                                                                                                                                         gatatTT-TACCTTGCACTA----ATCAAT-----C-TTT-GCCAATATATTCTGG-CATT--AAACGC-CA-TCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GCGAATAC--GATA------TGATGCC-GATTAAATAATG-TA-----TTTGTA---TC-G----G-TTTA-TCAGCA----------G---AAATA-TCACTACTT---------ACACCAAAAATTAA-TAACTG--AT-AAACA----C-----------GGAA-TATACATGAGTGCAAGGTAAATCCTTACGAACcataa
gi|15                         :                                                                                                                                         gtaaggt-TACCTGTCACTC----ATTAAT-----C-TTC-TTCAATATGTTCGTG-CGTTT-AAACGT-AT-TCTTTGTGTATCTAT----T-C-----GTGAGTGC--GCTA------TGATGCC-GATACAATACTG-TA---------TA----C-G----G-TTTA-TCCATA----------GATATAATA-T---TATGGA-TGTTCGGAC-------ATTGATTTTCGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAATGCCAGGTAAATCCTAACGCACa
gi|16                         :                                                                                                                                   ccgtaaagttaTT-TATCTGGCACTC----ATTAAT-----CGTTT-GC-AATATATTCGCG-CGTTT-GAACAC-CT-TCTCTGT-----------------------AATGC--GACG------TGA-ACCAGATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TCAG----G-TCTA-TTAACA----------G---TTATA-TTACTATTTA-TGGTCGGACAACAAGAGTTAATTTACGG--AT-ACTCA----C-----------GGAA-TATCCATGAGTTCCGGACAAAACCTGACGGAC
gi|17                         :                                                                                                                                       gtaacatTT-TACCTGGCACTA----ATCCAC-----C-TTT-GCGGGTATGTTC--------T-GA---C-CT-TCTCCGTACAGCTAA----T-A-----GTGAATGC--ATTA------TGATGCT-GATTTAATAACG-CG-----TTGGTT---TT-G----G-TTTA-TCAACT----------G---TAATA-TCAT--TTTA-CATTCAGACAAAGAAAATTAATTTACGG--AT-TTACA----C-----------AGAA-TATTCACAAGTGTCAGGTAAATACTAACGag
gi|18                         :                                                                                                                                     gcgtaagctTT-TACCTGGCACTC----GTCAAT-----C-TTC-GCAAATGTGTT-GGG-CGTTTAAAATGG-CT-TCTCCGTACAAC-AT----T-C-----GCGAATGC--GATA------TGATGCC-GTTTTAATAACG-TA-----TTGGTA---TA-G----G-TTTG-TCAAC----------------AATA-TCAC-GTTTAGCGTTCGGACACCGGAAA-CAATTTACGA--AT-ATACT----C-----------TACT-TATACATGAAT-TCAGGTGATTACTAACGGACc
gi|19                         :                                                                                                                                             tTT-TACCTGTCACTC----GTTAAT-----C-TTC-GCAAATATGTTCGGG-CGTTT-AATGGC-AT-TCTCCGTACAGCTAT----T-C-----GTGCATTC--GTTA------TGATACC-AATTTAATA---------------------T-G----G-TTTA-ATAACA----------A---CTATA-TCACTATTTA-CGTTCGGACACCGAAACATAATTTACGG--AT-ACACA----C-----------GGAA-CATTCATGAGTGCCAGGTAAGACCGAGCGGAC
gi|2                          :                                                                                                                                           agtTT-TCCCTGTAACTC----ATTTAT-----C-TTG-GCCAATATGTTCGAA-TGTTT-AAACGC-CC-TCTCCGTGTATCTATCTTAT-CTATCTGTAAGGGC--GTTA------TGATGCC-AATTTAACGATa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cataaacacaatattgtccgtaaggt-ATACA----T-----------GGAA-TATTAATGGGTGCCAGATAATACCTCACaataataatacatggaatattaatgggtgccagataatacctcacacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|20                         : cataaacacaatattgtccgtaaggttttccctgtaactcatttatcttggccaatatgttcgaatgtttaaacgccctctccgtgtatctatcttatctatctgtaagggcgttatgatgccaatttaacgataataataTT-TACCAGGCACAC----AT---------C-TTT-GCCAATATG---------------ATGC-TT-TCTCCATGCAGCTAT----T-C-----TTGAGTGC--AATA------TG---CC-GATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TC-A----G-TTTA-TCAACA----------G---TATTG-TCACTATTTA-CATTTGGACACCAAAAATTTACAAATGG--AT-ATACA----C-----------AGAA-CATTCCTGAGTGCCATGTAAAACCTTACAGACacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|21                         :                                                                                                                                      cgcaaggtTT-TACCTGGTACTA----ATT-------------------TATGTCCTGG-CGGTT-AAACGC-CT-TCTCCATGCAACTAT----T-C-----TTGAGTGC--GATC------TGATCCC-GATTTAAT--TGGTA-----CTGATA---TA-G----G-TTTG-TCTATA----------G---TAATA-TCACTATTTA-CGGTCGGACCCCGAAAATTAATTTATCG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATAAATGCCATATAATGCCTaa
gi|22                         :                                                                                                                                        tcaggtTT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TAC-GTCAATATGTTCGAG-TGTTT--------------CCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGTGTGC--GATA------TTATGCC-GATTTAATAACG-AT-----TTTGTA---TT-G----G-TTAA-ACAACA----------G---TGATA-TCAATATTTA-CGTTTGGACACAAAAAATCAAGTTACGG--AT-ATACA----C-----------AGAA-TATTCATGa
gi|23                         :                                                                                                                                       gtaaggtTT-TACCCGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCAAATATGTTCGGG-CGTTA-AAACAC-AT-TCTTCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAATAC--GATA------TGATGCC-GATTTAACAATT-TA-----TTTATA---TC-G----G-TTCC-TCAACA----------A---AAATA------ATTTA-CG
gi|24                         :                                                                                                                                   gtgcgtaagttTT-TACCTTGCACTA----ATTAAC-----C-TTG-GCCAATATGTCCGGG-CGTTT-AAACGC-----CTCCGTGCAGCTCT----C-C-----GTGAGTGC--GATA------TAAGGCC-GA----------------------TA---TC-G----G-TTTG-TCAACA----------G---TTATA-TCCCTATATA-CGTTCAAACAATGAGAACTAATTGACGT--GT-ATACA----C-----------GGAA-TATgatatacacgagtgtcaggtatatactgacacaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tccgtaaggtGAA-GATTAATGGGTACCAGGTAAAACCTTACGG
gi|25                         :                                                                                                                                              TT-TACCTGGTACCC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATGTATTCG---------AACCGT-CT-----CGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAGTAC--GACA------TGATCCC-GAT---ATAA-G-T----------TA---TT-G----G-GTTA-TCATCA----------A----AATA-TCACTATTTA-CATTCGGACACCAAACATTAATTTATGG--AT-ATTCA----C-----------GGAA-TATTCgccaatgtattcgaaccgtctcgtgcagctattcgtgagtacgacatgatcccgatataagttattgggttatcatcaaaatatcactatttacattcggacaccaaacattaatttatggatattcacggaatattc
gi|26                         :                                                                                                                                          ccgtaaggtCCTGGCACTC----GTATAT-----C-TTC-GCCAATGTGTTTGGG-CGTTT-TCATGT-GT-TCTCCATGCAATTAT----T---------------------------TGGTGCC-GATTTAATAATG-CA-----TTGGTA---TC-G----G-TTGA-TCATCA----------G---T---------TTTTT--CATTCAAACACCGATGTCTAATTTACGG--AT-ATACA----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tA-----TTGATA---TC-T----G-TTTA-TCAACA----------G---TTATA-TCCCTATTTA-TGTCCAAACTTCGAAAATAAATTTAAGG--AT-ACACG----C-----------GGAA-TGTTCATGAGTGCCAGGTAAAACATAACGGAatgctaggtaaatgttaatgca
gi|28                         :                                                                                                 ttaagcagttccattacctgaatatattacaaataccttaacttaTT-TACTTGGCACTC----ATTATT-----C-TTCCGCCAATATGTTCGGG-CATT---------------------A---AT----T-T-----GTGAGTG-------------------------TAAT--TA-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTG-TCAACA----------G---TAATA-TAACTATTTA-CGTTCGGACACTGAAAA-CAATTTATGG--AT-ATACA----T-----------GGAA-AAT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                     CCATTCAGCTAT----T-T-----TTGAATGT--GATA------TGATTCC-CATTTAGTAATG-TA-----TTGGTA-----------G-------CAACA----------G---TTATA-TCACTTTTTA-CGCTTGAACATCGAAAACGAAATTACGA--AT-ATACA----C-----------GAAG-TATTCACAAGTGTCAGGTAAATACTTATGCACgccttacgg
gi|3                          :                                                                                                                                            agTT-TACCTGGCAGTC----AGTAAT-----C-TTC-GCCAGTATGTTCGGA-CGTTT-ATACGC-AT-CCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGGGTCC--GAGA------TGGTGCC-GATTTGATAACG-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTATTTAACATTTTTTTACTA---TAAAA-TCACTACTTA-TATTCTGGCACCGAAAATAAATTTACGG--AT-AAACA-----------------GAA-TATTCATGAGTGCTAAGTAAATACTAACGCAC
gi|30                         :                                                                                                                               accgtaaggtAACGTTT-TACCTGGCTCTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTCCAAG-CATTT-AAACAC-CT-TCTCCGTGCCACTAT----T-C-----AAGAGTGC--GATA------TAATGCT-GATTTGATAATaat
gi|31                         :                                                                                                                  agacacataattgtattgtccgtAAT-ATT-TAACCGGCACTT----ATTAAA-----C-TTC-TTCAAT--GTTCGAG-CATTT-AAACACAAA-TGTTCGTG-A---AT----T-C-----TTGAGTACCAGACA-------AATGCC-CAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        tatgtgtaTATTG-TA-----TTGATA---TC-G----G-TTTA-TTAACC----------G---TAATA-TTACTATTTA-AGATCGGACACCGAAAATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAATGCCGGGTTAATCCTAACGgcacattactttacaattcatccat
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTA---TT-G----G-TTTA-TCGATA----------G---TAATA-TCACCGTTTG-CGTTCG-ACGCCGAAGATAAATTAACCG--AC-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCAGATta
gi|34                         :                                                                                                                                           tgtTT-TACCTGCTATTC----ATTTAT-----C-TTC-GTAAATATGTTtagtggctacgg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cctgtcaggtTTAATTTACAG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TACTCATGAGTGCTAGATAAATCCTAACGCACaatttacagatatacacggaatactcatgagtgctagataaatcctaacgcacaa
gi|35                         :                                                                                              cctgtcaggttttacctgctattcatttatcttcgtaaatatgAAT-ATTGTATCTTGCACTCGATCATTCAT-----C-TTC-GTCAATATGTTCGGC-CATTT-GGACAC-CTGTATTGGTACACCTAT----TAC-----GTAAaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccgt-G----A-TTTA-TGAATA----------G---AAAAA-TAAAAGTTCA-T-CTCTGACACCGAACATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGACTTGTTCATGAGTACCAGGT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                               GG-CTTTT-AAACAA-CA-TTTCCGTGCAGCT-T----------------ATGT--GGTA------TGA------A------AATG-TA-----AT-GTA---TC-A----G-TTTA-TAAACA----------G---TAATA-TCACTATTTcc
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTA-CGTTCGGACAGAGACAGTTGATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCGGGTAAATTCTAACGCAC
gi|4                          :                                                                                                                                              TT-TACCTGGCACTC----ATTAATTAAATC-TTC-GTCAATATACTCGGG-CATTT-TAATGC-TT-TCTCCGTGCAGTTAT----T-C-----GTAAGTGC--GATA------TGATGCC-GATTTGATCATG-TACAGTATTGGTA---TC-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATA-TCAGTATTGA-CGTTCGGACACCGACAATTAATTTACGG--AT-ATGCA----C-----------GAAA-TATTTATGAGTGCCTGGTAATACATTACGGA
gi|40                         :                                                                                                                                              TT-TACCTGGCACTG----ATTAAT-----C-TTC-G----------------G--------GC-CT-TCTCCGCACAGTTAC----T-C-----GTGAGTGC--GATA------TGATGTC-Gaccttccg
gi|41                         :                                                                                                                                                     TGGCACTC----CTTAGT-----T-TTC-ACCAATATGTTCGGG-Cac
gi|5                          :                                                                                                                    attattgtgcataagtatgtgttTGTTT-TACCTGGCGCTC----ATTAAT-----C-TTT-GCCAATATGTTCGGC-CGTTT-AAAC---TT-TCTCTGTGAAGCTAT----T-T-----GCGGGGGC--AATA------TGATGCC-GATTTTCTAAGG-TA-----TTAATA---TT-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATG-TCACTACTTA-CGTTCGAACAGCAAAAA-CAAATTACGG--GT-TTACA----C-----------CGAA-TATTCATGATTGTCAGATAAATCCTTACGCAC
gi|6                          :                                                                                                                                       ccgtatATT-TACCTGGCAATC----ATTAGT-----C-TTC-GCCA--ATGTTCGGA--G------------T-TCCCCGTACAGCTAT----T-T-----GTGAATGC--GATA------AGATGCC-GATTTAATTATG-CA-----TTGGTA---TC-G----G-TTAA-TCAACA----------G---CAAGA-TTACCATTTA-CGTTCGGAATCCGAAAATCAGTTTACGG--AT-ATACA----CGAGTATACATGGGAC-TATTCATGTGTCCCAGGTAAATACTAACAGat
gi|7                          :                                                                                                                                 gcgtaagtAATGATT-TACCTGGCACTC----ATAAAA-----T-TTC-GCCAATATGTTCGGG-GATTT-GAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTGT----T-C-----ATGGGTGC--GATA------CGATGCC-GATTTGACAATG-CA-----TTAATA---TC-G----G-TTTA-TCAAAG----------G---TAGTA-TCACCATTTA-CGTTCATACACCGCAAATCAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCACGAGTTACAGGTAAAACCTTACGGACgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-GATTAATGAGTGCCAGGTAAAAACTTACG
gi|8                          :                                                                                                                                             gTT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTTCAGG-T----------C-C---CTCCGTACAGCTAT----T-C-----ATGAATAC--GATA------TGgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                        gcgtaagttGTAC--GATA------TGATGCT-GGTTAAATATTG-TA-----TTGATG---TC-G----G-TTTA-TTA-------------------------ACTGTTAA-CGATCGGACACCGGACATTAGTTTACGG--AT-ATACA----C-----------Gcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|9                          :                     gcgtaagtttttacctggcactcattaatcttcgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatTT-TAAATGGCACTC----GTTAAT-----C-ATC-GTCAATATGTTTGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TTTCCGTACAGCTAT----T-C-----GTGAGTGC--AATA------TGACACC-AATTTAATAATG-TG-----TCGGGG---TA-A----A-TTTG-TCAGCA----------G---TCATGCTTA-TATTTA-AGTTCGAACAC--AAAG--AGATTACAG--AG-TTACA----T-----------GAAA-TATCCATGAATGCAAGGTAAAACCTTACGGACta


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blockSeqs                     :                                                                                                                                            G   .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  T          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                            G   .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    AA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      A  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TT      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      T  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     G   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      A  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TG      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      G  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TT      A  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TG      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    TA      C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    A       T  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    A       C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    T       T  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     T   T
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                .            .         .     .   .               .    .       C  .               .    . .            .     .            .            .  .          .    . .    .    .      .          .       .          .                            .   .     .    .              .                     A   T
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-832 )      :                                                                                                                                         AATGATT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTTCGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAGTGC--GATA------TGATGCC-GATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATA-TCACTATTTA-CGTTCGGACACCGAAAATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCAGGTAAANCCTNACGGAC
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gi|11                         :                                                                                                                                           cgtTT-TATCTGGCATTC----ATTAAT-----C-TTT-GCCAATGTAATCGGG-T------------CT-TTTCCGCGCAGCTAT----T-C-----GAGAGTAC--GACACTGTCATAATGCT-TATTTAATAATG-TC-----TTGGTA---TC-G----G-TTTT-TCAACA----------G---TAATA-TCAGTACCTA-CGTACGGACACCGAAAATTAATAAGCAGGTAT-ATATA----C-----------GGAA-TAGTCA----TGCCAGGTAAAACCTAACGGACaa
gi|12                         :                                                                                                                                     ccgttaagtTT-TACCTGTCACTG----ATTAAT-----C-TTC-ACCAATATGTTCAGG-CGTT--AAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTAT----T-T-----GTGAGTGG--GATG------TAATTCC-GATTAAGTAATG-TA-----TTGGCA---TC-G----G-TTTG-TCAACG----------G---TAATA-TCACTA-CTA-GGTTCTGGCACCGAACATTGATTTACGG--AC-ATACA----G-----------AGAC-TATTCGTCAATGTCAGGTAAATCCTAACGCAC
gi|13                         :                                                                                                                                          atctTT-TTTCTGGCACTC-----------------TTC-GCCAATTTGTTCGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TCTCCATGCAGCCAT----T-A-----GTGAATGC--GATA------ATATGAC-GATTAACTAATG-CAT----TTTGCA---TC-G----G---TA-TCAACA----------G---TTGTA-GCACTGTTCG-CGTTCGTACACCGATAATTAATTTACGG--AT-ATATA----A-----------GGAA-TAGCCTTGATTGTCAGATCAATCTTTACGa
gi|14                         :                                                                                                                                         gatatTT-TACCTTGCACTA----ATCAAT-----C-TTT-GCCAATATATTCTGG-CATT--AAACGC-CA-TCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GCGAATAC--GATA------TGATGCC-GATTAAATAATG-TA-----TTTGTA---TC-G----G-TTTA-TCAGCA----------G---AAATA-TCACTACTT---------ACACCAAAAATTAA-TAACTG--AT-AAACA----C-----------GGAA-TATACATGAGTGCAAGGTAAATCCTTACGAACcataa
gi|15                         :                                                                                                                                         gtaaggt-TACCTGTCACTC----ATTAAT-----C-TTC-TTCAATATGTTCGTG-CGTTT-AAACGT-AT-TCTTTGTGTATCTAT----T-C-----GTGAGTGC--GCTA------TGATGCC-GATACAATACTG-TA---------TA----C-G----G-TTTA-TCCATA----------GATATAATA-T---TATGGA-TGTTCGGAC-------ATTGATTTTCGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAATGCCAGGTAAATCCTAACGCACa
gi|16                         :                                                                                                                                   ccgtaaagttaTT-TATCTGGCACTC----ATTAAT-----CGTTT-GC-AATATATTCGCG-CGTTT-GAACAC-CT-TCTCTGT-----------------------AATGC--GACG------TGA-ACCAGATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TCAG----G-TCTA-TTAACA----------G---TTATA-TTACTATTTA-TGGTCGGACAACAAGAGTTAATTTACGG--AT-ACTCA----C-----------GGAA-TATCCATGAGTTCCGGACAAAACCTGACGGAC
gi|17                         :                                                                                                                                       gtaacatTT-TACCTGGCACTA----ATCCAC-----C-TTT-GCGGGTATGTTC--------T-GA---C-CT-TCTCCGTACAGCTAA----T-A-----GTGAATGC--ATTA------TGATGCT-GATTTAATAACG-CG-----TTGGTT---TT-G----G-TTTA-TCAACT----------G---TAATA-TCAT--TTTA-CATTCAGACAAAGAAAATTAATTTACGG--AT-TTACA----C-----------AGAA-TATTCACAAGTGTCAGGTAAATACTAACGag
gi|18                         :                                                                                                                                     gcgtaagctTT-TACCTGGCACTC----GTCAAT-----C-TTC-GCAAATGTGTT-GGG-CGTTTAAAATGG-CT-TCTCCGTACAAC-AT----T-C-----GCGAATGC--GATA------TGATGCC-GTTTTAATAACG-TA-----TTGGTA---TA-G----G-TTTG-TCAAC----------------AATA-TCAC-GTTTAGCGTTCGGACACCGGAAA-CAATTTACGA--AT-ATACT----C-----------TACT-TATACATGAAT-TCAGGTGATTACTAACGGACc
gi|19                         :                                                                                                                                             tTT-TACCTGTCACTC----GTTAAT-----C-TTC-GCAAATATGTTCGGG-CGTTT-AATGGC-AT-TCTCCGTACAGCTAT----T-C-----GTGCATTC--GTTA------TGATACC-AATTTAATA---------------------T-G----G-TTTA-ATAACA----------A---CTATA-TCACTATTTA-CGTTCGGACACCGAAACATAATTTACGG--AT-ACACA----C-----------GGAA-CATTCATGAGTGCCAGGTAAGACCGAGCGGAC
gi|2                          :                                                                                                                                           agtTT-TCCCTGTAACTC----ATTTAT-----C-TTG-GCCAATATGTTCGAA-TGTTT-AAACGC-CC-TCTCCGTGTATCTATCTTAT-CTATCTGTAAGGGC--GTTA------TGATGCC-AATTTAACGATa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cataaacacaatattgtccgtaaggt-ATACA----T-----------GGAA-TATTAATGGGTGCCAGATAATACCTCACaataataatacatggaatattaatgggtgccagataatacctcacacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|20                         : cataaacacaatattgtccgtaaggttttccctgtaactcatttatcttggccaatatgttcgaatgtttaaacgccctctccgtgtatctatcttatctatctgtaagggcgttatgatgccaatttaacgataataataTT-TACCAGGCACAC----AT---------C-TTT-GCCAATATG---------------ATGC-TT-TCTCCATGCAGCTAT----T-C-----TTGAGTGC--AATA------TG---CC-GATTTAATAATG-TA-----TTGGTA---TC-A----G-TTTA-TCAACA----------G---TATTG-TCACTATTTA-CATTTGGACACCAAAAATTTACAAATGG--AT-ATACA----C-----------AGAA-CATTCCTGAGTGCCATGTAAAACCTTACAGACacgttgaaatacgctatagacccttcttaatattacttcatgaatatttatgagatatccagaacga
gi|21                         :                                                                                                                                      cgcaaggtTT-TACCTGGTACTA----ATT-------------------TATGTCCTGG-CGGTT-AAACGC-CT-TCTCCATGCAACTAT----T-C-----TTGAGTGC--GATC------TGATCCC-GATTTAAT--TGGTA-----CTGATA---TA-G----G-TTTG-TCTATA----------G---TAATA-TCACTATTTA-CGGTCGGACCCCGAAAATTAATTTATCG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATAAATGCCATATAATGCCTaa
gi|22                         :                                                                                                                                        tcaggtTT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TAC-GTCAATATGTTCGAG-TGTTT--------------CCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGTGTGC--GATA------TTATGCC-GATTTAATAACG-AT-----TTTGTA---TT-G----G-TTAA-ACAACA----------G---TGATA-TCAATATTTA-CGTTTGGACACAAAAAATCAAGTTACGG--AT-ATACA----C-----------AGAA-TATTCATGa
gi|23                         :                                                                                                                                       gtaaggtTT-TACCCGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCAAATATGTTCGGG-CGTTA-AAACAC-AT-TCTTCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAATAC--GATA------TGATGCC-GATTTAACAATT-TA-----TTTATA---TC-G----G-TTCC-TCAACA----------A---AAATA------ATTTA-CG
gi|24                         :                                                                                                                                   gtgcgtaagttTT-TACCTTGCACTA----ATTAAC-----C-TTG-GCCAATATGTCCGGG-CGTTT-AAACGC-----CTCCGTGCAGCTCT----C-C-----GTGAGTGC--GATA------TAAGGCC-GA----------------------TA---TC-G----G-TTTG-TCAACA----------G---TTATA-TCCCTATATA-CGTTCAAACAATGAGAACTAATTGACGT--GT-ATACA----C-----------GGAA-TATgatatacacgagtgtcaggtatatactgacacaca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tccgtaaggtGAA-GATTAATGGGTACCAGGTAAAACCTTACGG
gi|25                         :                                                                                                                                              TT-TACCTGGTACCC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATGTATTCG---------AACCGT-CT-----CGTGCAGCTAT----T-C-----GTGAGTAC--GACA------TGATCCC-GAT---ATAA-G-T----------TA---TT-G----G-GTTA-TCATCA----------A----AATA-TCACTATTTA-CATTCGGACACCAAACATTAATTTATGG--AT-ATTCA----C-----------GGAA-TATTCgccaatgtattcgaaccgtctcgtgcagctattcgtgagtacgacatgatcccgatataagttattgggttatcatcaaaatatcactatttacattcggacaccaaacattaatttatggatattcacggaatattc
gi|26                         :                                                                                                                                          ccgtaaggtCCTGGCACTC----GTATAT-----C-TTC-GCCAATGTGTTTGGG-CGTTT-TCATGT-GT-TCTCCATGCAATTAT----T---------------------------TGGTGCC-GATTTAATAATG-CA-----TTGGTA---TC-G----G-TTGA-TCATCA----------G---T---------TTTTT--CATTCAAACACCGATGTCTAATTTACGG--AT-ATACA----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      tA-----TTGATA---TC-T----G-TTTA-TCAACA----------G---TTATA-TCCCTATTTA-TGTCCAAACTTCGAAAATAAATTTAAGG--AT-ACACG----C-----------GGAA-TGTTCATGAGTGCCAGGTAAAACATAACGGAatgctaggtaaatgttaatgca
gi|28                         :                                                                                                 ttaagcagttccattacctgaatatattacaaataccttaacttaTT-TACTTGGCACTC----ATTATT-----C-TTCCGCCAATATGTTCGGG-CATT---------------------A---AT----T-T-----GTGAGTG-------------------------TAAT--TA-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTG-TCAACA----------G---TAATA-TAACTATTTA-CGTTCGGACACTGAAAA-CAATTTATGG--AT-ATACA----T-----------GGAA-AAT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                     CCATTCAGCTAT----T-T-----TTGAATGT--GATA------TGATTCC-CATTTAGTAATG-TA-----TTGGTA-----------G-------CAACA----------G---TTATA-TCACTTTTTA-CGCTTGAACATCGAAAACGAAATTACGA--AT-ATACA----C-----------GAAG-TATTCACAAGTGTCAGGTAAATACTTATGCACgccttacgg
gi|3                          :                                                                                                                                            agTT-TACCTGGCAGTC----AGTAAT-----C-TTC-GCCAGTATGTTCGGA-CGTTT-ATACGC-AT-CCTCCGTGCAGCTAT----T-C-----GTGGGTCC--GAGA------TGGTGCC-GATTTGATAACG-TA-----TTGGTA---TC-G----G-TTTATTTAACATTTTTTTACTA---TAAAA-TCACTACTTA-TATTCTGGCACCGAAAATAAATTTACGG--AT-AAACA-----------------GAA-TATTCATGAGTGCTAAGTAAATACTAACGCAC
gi|30                         :                                                                                                                               accgtaaggtAACGTTT-TACCTGGCTCTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTCCAAG-CATTT-AAACAC-CT-TCTCCGTGCCACTAT----T-C-----AAGAGTGC--GATA------TAATGCT-GATTTGATAATaat
gi|31                         :                                                                                                                  agacacataattgtattgtccgtAAT-ATT-TAACCGGCACTT----ATTAAA-----C-TTC-TTCAAT--GTTCGAG-CATTT-AAACACAAA-TGTTCGTG-A---AT----T-C-----TTGAGTACCAGACA-------AATGCC-CAT
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        tatgtgtaTATTG-TA-----TTGATA---TC-G----G-TTTA-TTAACC----------G---TAATA-TTACTATTTA-AGATCGGACACCGAAAATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAATGCCGGGTTAATCCTAACGgcacattactttacaattcatccat
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTA---TT-G----G-TTTA-TCGATA----------G---TAATA-TCACCGTTTG-CGTTCG-ACGCCGAAGATAAATTAACCG--AC-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCAGATta
gi|34                         :                                                                                                                                           tgtTT-TACCTGCTATTC----ATTTAT-----C-TTC-GTAAATATGTTtagtggctacgg
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cctgtcaggtTTAATTTACAG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TACTCATGAGTGCTAGATAAATCCTAACGCACaatttacagatatacacggaatactcatgagtgctagataaatcctaacgcacaa
gi|35                         :                                                                                              cctgtcaggttttacctgctattcatttatcttcgtaaatatgAAT-ATTGTATCTTGCACTCGATCATTCAT-----C-TTC-GTCAATATGTTCGGC-CATTT-GGACAC-CTGTATTGGTACACCTAT----TAC-----GTAAaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ccgt-G----A-TTTA-TGAATA----------G---AAAAA-TAAAAGTTCA-T-CTCTGACACCGAACATTAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGACTTGTTCATGAGTACCAGGT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                               GG-CTTTT-AAACAA-CA-TTTCCGTGCAGCT-T----------------ATGT--GGTA------TGA------A------AATG-TA-----AT-GTA---TC-A----G-TTTA-TAAACA----------G---TAATA-TCACTATTTcc
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTA-CGTTCGGACAGAGACAGTTGATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCATGAGTGCCGGGTAAATTCTAACGCAC
gi|4                          :                                                                                                                                              TT-TACCTGGCACTC----ATTAATTAAATC-TTC-GTCAATATACTCGGG-CATTT-TAATGC-TT-TCTCCGTGCAGTTAT----T-C-----GTAAGTGC--GATA------TGATGCC-GATTTGATCATG-TACAGTATTGGTA---TC-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATA-TCAGTATTGA-CGTTCGGACACCGACAATTAATTTACGG--AT-ATGCA----C-----------GAAA-TATTTATGAGTGCCTGGTAATACATTACGGA
gi|40                         :                                                                                                                                              TT-TACCTGGCACTG----ATTAAT-----C-TTC-G----------------G--------GC-CT-TCTCCGCACAGTTAC----T-C-----GTGAGTGC--GATA------TGATGTC-Gaccttccg
gi|41                         :                                                                                                                                                     TGGCACTC----CTTAGT-----T-TTC-ACCAATATGTTCGGG-Cac
gi|5                          :                                                                                                                    attattgtgcataagtatgtgttTGTTT-TACCTGGCGCTC----ATTAAT-----C-TTT-GCCAATATGTTCGGC-CGTTT-AAAC---TT-TCTCTGTGAAGCTAT----T-T-----GCGGGGGC--AATA------TGATGCC-GATTTTCTAAGG-TA-----TTAATA---TT-G----G-TTTA-TCAACA----------G---TAATG-TCACTACTTA-CGTTCGAACAGCAAAAA-CAAATTACGG--GT-TTACA----C-----------CGAA-TATTCATGATTGTCAGATAAATCCTTACGCAC
gi|6                          :                                                                                                                                       ccgtatATT-TACCTGGCAATC----ATTAGT-----C-TTC-GCCA--ATGTTCGGA--G------------T-TCCCCGTACAGCTAT----T-T-----GTGAATGC--GATA------AGATGCC-GATTTAATTATG-CA-----TTGGTA---TC-G----G-TTAA-TCAACA----------G---CAAGA-TTACCATTTA-CGTTCGGAATCCGAAAATCAGTTTACGG--AT-ATACA----CGAGTATACATGGGAC-TATTCATGTGTCCCAGGTAAATACTAACAGat
gi|7                          :                                                                                                                                 gcgtaagtAATGATT-TACCTGGCACTC----ATAAAA-----T-TTC-GCCAATATGTTCGGG-GATTT-GAACGC-CT-TCTCCGTGCAGCTGT----T-C-----ATGGGTGC--GATA------CGATGCC-GATTTGACAATG-CA-----TTAATA---TC-G----G-TTTA-TCAAAG----------G---TAGTA-TCACCATTTA-CGTTCATACACCGCAAATCAATTTACGG--AT-ATACA----C-----------GGAA-TATTCACGAGTTACAGGTAAAACCTTACGGACgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-GATTAATGAGTGCCAGGTAAAAACTTACG
gi|8                          :                                                                                                                                             gTT-TACCTGGCACTC----ATTAAT-----C-TTC-GCCAATATGTTCAGG-T----------C-C---CTCCGTACAGCTAT----T-C-----ATGAATAC--GATA------TGgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                        gcgtaagttGTAC--GATA------TGATGCT-GGTTAAATATTG-TA-----TTGATG---TC-G----G-TTTA-TTA-------------------------ACTGTTAA-CGATCGGACACCGGACATTAGTTTACGG--AT-ATACA----C-----------Gcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatgtacgatatgatgctggttaaatattgtattgatgtcggtttattaactgttaacgatcggacaccggacattagtttacggatatacacgta
gi|9                          :                     gcgtaagtttttacctggcactcattaatcttcgccaatatgttcaggtccctccgtacagctattcatgaatacgatatgcaatcgtacatactcagccaactggcgaggtggtccgaatTT-TAAATGGCACTC----GTTAAT-----C-ATC-GTCAATATGTTTGGG-CGTTT-AAACGC-CT-TTTCCGTACAGCTAT----T-C-----GTGAGTGC--AATA------TGACACC-AATTTAATAATG-TG-----TCGGGG---TA-A----A-TTTG-TCAGCA----------G---TCATGCTTA-TATTTA-AGTTCGAACAC--AAAG--AGATTACAG--AG-TTACA----T-----------GAAA-TATCCATGAATGCAAGGTAAAACCTTACGGACta
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|38 ): TACATTTACAATTTCTATAAGGCAATTCATAACGTACGTAATAATTTATATTCGCACTTTTCATCATATGATAGAA
Unaligned ( gi|42 ): CTGGTAAATTAATTATTAAAACAATCTTTGACTATTGCTTATATGTAATTGT
Unaligned ( gi|43 ): GTACTGGTTGTATATTGATTTTATTGTTGTGTTTTTGTAAATAT
Unaligned ( gi|44 ): AATGTGTATATATAATTCGTACACTATTATTTTATATAA
Unaligned ( gi|45 ): AGACATATAAACATGTAATTTAGTCACTGGTA