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gi|13                         :                                                                                                                                                                          --CGGATGACCGGA----AC---A--CCACATATA----GCTCGAACCACTTA----TCT-GGTCC------C--G---G--CTG-GTT-CC----------TAT----T----TCGATG----------T-A-----T------AT---A--CATG----TATG-GTAT-GAT-G--TTGAACAAT-A--CTT-GGCTC-GAAC-AACCATTAA----CT----CGAAC-------G-T-TT----TG----TC-CAGT-CC---CGTCG-GGTTCGAGCTATCGAAGTTCTACTGTa
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                cg----------C-A-----T------GT---A--CATG----TATG-GTAT-AAT-G--TGGAA-AAT-A--CTT-GGCTT------------TAA----GT----CAAAC------TA-T-TT----TG----TC-CAGT-TC---TGTCA-GATTCAAGCCATCGAAGTTCTACTGTa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atgtttatataatGAA-AAT-A--TTT-GGCAC-GAAC-AACCCTTAA----CT----CGAAC------TACT-TT----TT----TC-CAGT-CC---CGTCG-GGTT----CTACTGTAGTTCTAatat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatttaatgataaccatactatgaattaataacgctctataT----CGAAC------TA-T-ATGTAATG----TTTCAG--CT---ATCCG-TGTTCGAGCCAACGAAGTTATACT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T----CGAAC------TA-C-TT----TG----TT-TAGG-CC---CGTCG-GGTTCGA-CGATCGAAATTCTACTGTaccatttatttggtgccgactgagtcctatttatatccatatatatgtatgatatgatgtttaacaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                      tagaacttcgttggctcgaacacggatggctggaacaccactcatggctcgaaccacttatctggttccggtagaaatactatttaaattctattattctacctccgattgctagaacaccgagtcgaactagaaataaggtccagccaacatatttacctgtattttgatagtcttcct-TT----TG--------AGT-C----ATTCG-TATTCGAGCCAGCGAAGTTCTACTat
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----TC-CAG--CC---ATCCG-TGTTCGAGCCAACGAAGTTCTAtaccacatacagctcgaacttatcttggtcccgggaagaattcctatttcgatatatacacatgtatggtatgatgttgaacaactcttaacgagaactagtttgtccagtcccgttttgttcgagccactgaagttcaacggta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -CGGT-CC---CGTCG-GGTTTGAGCTATCAAAGTTCTGCTGTacaccactcatggctcgaaccacttatctggttccggtagaaatactatttaaattctattattctacctccgattgctagaacaccgagtcgaactagaaataaggtccagccaacatatttacctgtattttgatagtcttccttcgaactactttgtttaggcccgtcgggttcgacgatcgaaattctactgtat
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TGTTTGAGCCAACGAAGTTCTACTcacagtacatgtattaagcgtttaacctcaataaaca
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-812 )      :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTCGTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGGAACACCACATATAGCTCGAACCACTTATCT-GGTCC------CGGCC-GAATNCC----------TAT----T----T----A----------CA-----TGTACA--TG----TATG-GTAT-GAT-G-TTGAACAATAC--TTGGCTCGAACAACCCTTA--AC-TCGAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGCCATCGAAGTTCTACTGT
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Reference ( family-812 )      :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTCGTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGGAACACCACATATAGCTCGAACCACTTATCT-GGTCC------CGGCC-GAATTCC----------TAT----T----T----A----------CA-----TGTACA--TG----TATG-GTAT-GAT-G-TTGAACAATAC--TTGGCTCGAACAACCCTTA--AC-TCGAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGCCATCGAAGTTCTACTGT
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gi|10                         : tagaacttcgttggctcgaacacggatggctggaacaccactcatggctcgaaccacttatctggttccggtagaaatactatttaaattctattattctacctccgattgctagaacaccgagtcgaactagaaataaggtccagccaacatatttacctgtattttgatagtcttcctAGTAGAACTTCGTTGGCTCAAACA--CTGATAGCTGGAACACCATATATATCTCCAACAACTT-------------------CC-TAATTTGATG-------TAT----A----T----G----------CA-----TGTACA--TG----TATG-GTAT-GAT-G-TTGAACAATAC--TTGGCTCGAACAAGCCTTA--AC-TTGAAC------TA-TTTTGTCCAGTTCCATCAGGTTCATGCCATTGCAGTTCTACTGTat
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatttaatgataaccatactatgaattaataacgctctataCGGTCCCGTCGGGTTTGAGCTATCAAAGTTCTGCTGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gctcgaaca----------CA-----TGTACA--TG----TATG-GTAT-AAT-G-TGGAA-AATAC--TTGGCT----------TTA--AG-TCAAAC------TA-TTTTGTCCAGTTCTGTCAGATTCAAGCCATCGAAGTTCTACTGTatatcaaactaatcaataaacaatcgatttatctttaggaagtggttgcctccattcactcccttcatcactccctttcatgcatcctttcattctatttttactttattcttgtcaaaatatccctcctcctacgtttcttaaattatctcctctctacctgcctgcctgc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgtttatataatCCTGTCCAGTTTGAGCTATCGAAGTTCTACTatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                     AGTAAAACTTCGTTGGCTCGAATA--CGGGTGGCTGGAACACCACATATAGCTCGAACCACTTATCT-GGTTC------CGGCC-GAATTCCTTTTTCGATGTAT----T----T----A----------CA-----TATACA--TG----TATG-ACAT-G-T-GCTTGAACAATAC--TTGTCTCGAACAACCCTTA--AC-TCGAACTTCTTTTA-TTTGGTACAGTCCCGACGGGTTCGAGTCATCGAAGTTCTACTGTcacagtacatgtattaagcgtttaacctcaataaaca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACCCCGTTGGTTCGAACA--CCGAGGGCTGGAACACCACATATAGCTCGGACAACTTAGCT-GGTCG------AAGCC-AAATTCC----------AAT----TTTGAT----A----------AA-----TATACA--TGTA--TATG-GTAT-GAC-G-TTGAACAATAT--TTGGTTCGAACAACGTTT---AC-TTAGAC------TG-TTTTGTCAAGTCCCGTCGGGTTAGAGTCATCGAAGTTCTACTGag
gi|6                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTTGTTGGCTCGAACA--CGGACGGCTGGAACACCACATATATCTCGGGCCGGTTAATT---TCC------T-------ATTTC----------TATGTAAC----T----A----------CA-----TGTTCA--TGAATACATG-GTAA-GAT-A-TTGAACGATAC--TTGGTTCGAGCAACAGTTA--GC-TCGAGC------AA-TTTTGTCCAGTTCTGTCGGGTTCGAGCCATCGAAGTTCTACGGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTGGTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGGAACACCATATATAGCTCGAACCTCTTATCT-GGTCC------TGACT-GAATACC----------TAT----T----T----G----------CA-----TGTACA--TG----TATG-GTAT-GAT-G-TTGAACAATAA--TTGGCTTGAACAACCCTTA--AC-TCAAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCAGTCTTGTTTGAGCCATCGAAGTTCTACTGTatgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTCGTTAACTAATACA--TGGATGACTGGAACACAACCTATAGCTCAAACAAATGATCT-GGTCC------CGACT-GAATG------------TAT----A----T----A----------CA-----TATACA--TG----TACG-GTAT-GAT-G-TTAAACAATAC--CTGGTTCAAACAACCCTGA--AC-TCAAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCCATTGGGTTC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                          cACTTCCTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGTAACACTACATACAGCTCAAACTACTTATCT-TGTCCATTAATTGATT-GAA--------------TAT----T----T----AG---------CA-----T---CAGTTT----TATG-CCATCGACGG-CT--ACGAGACGATCAG-TC-AACCACCCTT---AT-TTAAAC------TT-TTTT-----GTCCCTTCGGGTTTGAGCAATCGAAGTTCTACTGTtactatagttaaatata


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                             .                                 C        .     .         C        ATGTATATG                               .     A    .   .       .    .   . .           .                    .   .      .       .
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-812 )      :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTCGTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGGAACACCACATATAGCTCGAACCACTTATCT-GGTCC------CGGCC-GAATTCCTATTTNG------A------T------A--CATGTACA--TG----TATG-GTAT-GAT-G-TTGAACAATAC--TTGGCTCGAACAACCCTTA--AC-TCGAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCCGTCGGGTTCGAGCCATCGAAGTTCTACTGT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTTGTTGGCTGGAAAAAACGGATGGCTCGAATACTACATATAGCTCGAATCACTTATCT-GGTTC------ACGCC-GAATTCCAATTTTGATGTATA------T------A--AATGTACA--TG----TATG-TTAT-GAT-G-TTGAACAATAA--TTGGCTCGAATAACCTGTAAGACATCGAAgttat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                     AATATAAATCCGTTCGCTCGAATA--CGAATTGCAGGAACACCATATATAGCTCGAAGAATTTATCT-GTTCC------CTGCC-GAGTTCCTTTTACA------G------T------G--TTTGTTCA--TG----TACATGTAT-GAT-G-TTGAACAATAC--TTCGCTgc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         tacATTCCTATTTCG------A------T------G--TATATACA--TG----TATG-GCAT-GAT-G-TTGAACAATGC--TTGTCTCGAACAACCCTCA--AT-TAGAAC------TA-GTTTGCCCAATCCCATCGTGTACGAACCATCGAAGTTCTACTGTataagttatactttagtatttt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                   cgAGTATAACTTCGTTGGCTCGAACA--CGGATAGCTGAAACATTACATATAGTTCGAACCATTTATTT-GGTGC------CGACT-GAG-TCCTATTTAT------A------T------C--CATATATA--TG----TATG-ATAT-GAT-G-TTTAACAAa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AATAT--TTGGCACGAACAACCCTTA--AC-TCGAAC------TACTTTTTTCCAGTCCCGTCGGGTT----CTACTGTAGTTCTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatttaatgataaccatactatgaattaataacgctctataCGGTCCCGTCGGGTTTGAGCTATCAAAGTTCTGCTGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        gctcgaacaTGTTTAT------A------T------AATCATGTACA--TG----TATG-GTAT-AAT-G-TGGAA-AATAC--TTGGCT----------TTA--AG-TCAAAC------TA-TTTTGTCCAGTTCTGTCAGATTCAAGCCATCGAAGTTCTACTGTatatcaaactaatcaataaacaatcgatttatctttaggaagtggttgcctccattcactcccttcatcactccctttcatgcatcctttcattctatttttactttattcttgtcaaaatatccctcctcctacgtttcttaaattatctcctctctacctgcctgcctgc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aCCTGTCCAGTTTGAGCTATCGAAGTTCTACTatat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                     AGTAAAACTTCGTTGGCTCGAATA--CGGGTGGCTGGAACACCACATATAGCTCGAACCACTTATCT-GGTTC------CGGCC-GAATTCCTTTTTCG------ATGTATTT------A--CATATACA--TG----TATG-ACAT-G-T-GCTTGAACAATAC--TTGTCTCGAACAACCCTTA--AC-TCGAACTTCTTTTA-TTTGGTACAGTCCCGACGGGTTCGAGTCATCGAAGTTCTACTGTcacagtacatgtattaagcgtttaacctcaataaaca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACCCCGTTGGTTCGAACA--CCGAGGGCTGGAACACCACATATAGCTCGGACAACTTAGCT-GGTCG------AAGCC-AAATTCCAATTTTG------A------T------A--AATATACA--TGTA--TATG-GTAT-GAC-G-TTGAACAATAT--TTGGTTCGAACAACGTTT---AC-TTAGAC------TG-TTTTGTCAAGTCCCGTCGGGTTAGAGTCATCGAAGTTCTACTGag
gi|6                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTTGTTGGCTCGAACA--CGGACGGCTGGAACACCACATATATCTCGGGCCGGTTAATT---TCC------T-------ATTTCTATGTAA------C------T------A--CATGTTCA--TGAATACATG-GTAA-GAT-A-TTGAACGATAC--TTGGTTCGAGCAACAGTTA--GC-TCGAGC------AA-TTTTGTCCAGTTCTGTCGGGTTCGAGCCATCGAAGTTCTACGGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTGGTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGGAACACCATATATAGCTCGAACCTCTTATCT-GGTCC------TGACT-GAATACCTATTTG------------------------CATGTACA--TG----TATG-GTAT-GAT-G-TTGAACAATAA--TTGGCTTGAACAACCCTTA--AC-TCAAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCAGTCTTGTTTGAGCCATCGAAGTTCTACTGTatgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                     AGTAGAACTTCGTTAACTAATACA--TGGATGACTGGAACACAACCTATAGCTCAAACAAATGATCT-GGTCC------CGACT-GAATG--TAT----------A------T------A--CATATACA--TG----TACG-GTAT-GAT-G-TTAAACAATAC--CTGGTTCAAACAACCCTGA--AC-TCAAAC------TA-TTTTGTCCAGTCCCATTGGGTTC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                          cACTTCCTTGGCTCGAACA--CGGATGGCTGTAACACTACATACAGCTCAAACTACTTATCT-TGTCCATTAATTGATT-GAA----TATTTAG-----------------------CAT---CAGTTT----TATG-CCATCGACGG-CT--ACGAGACGATCAG-TC-AACCACCCTT---AT-TTAAAC------TT-TTTT-----GTCCCTTCGGGTTTGAGCAATCGAAGTTCTACTGTtactatagttaaatata
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): CAGTAGAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAACTAATCAATAAACAATCGATTTACCTTTAGGGGGTGGTTGACTCCACTCACTCCCCTCGTCACTCCCTTTGATGCACCCTTTCATTCTATTTTTACTTTATTCTTGTCAAAATATCCATCCTCCTACGTTTCTTAAATTCTCTCCTCTCTGCCTGCCTGCCTGC