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lowQualScore : . . . . . ... . . . ........ .. . . . . ......... . .................................................................................................................................. . . .. . .. . . . . ............... ... .... .. ..... ...... . . . ..... .. . . . . . ... . . ... . ...... . . . .. .. ... ...... . . ................... ........ . . .. ... . .... .................. . ..... .. . ............. ............... .. .. ... .................................................................................... .............. ........ .... .. ... .... . ... . . ........... ....... ...... . . .
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Reference ( gi|1 ) : TGATATACACCATTGCATTTTATTGTCATTTGTCTCTCATCACTGATTCAAGTGGGAAAGTTAACAGTTA-TTGCAGAAAT-GGTTGTGCTCAAGTACTGGTTAACCATTCCAGGATT----------CCCGGAAAGAGTGGTTAGGTTAGTT--GATCGTA--TATAAGCCTTCGACTGCATAAAATAGTGCTAAATATTCCCCAACCACAACAATAAGCAGTCATTAAAACAATATACCAGAACTGACGCCTGAATGTCTC-AC--TACACAGTTACGCTCCTT-TT-TTCCC------------ACGG---TAACAT---AATTCTTAAGCTTTAA--AAAAAA------AAGGCCTATGTAATTAGGTTTTGA-----AATATTTT--CAAAA-TGGTTCGTAGGGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGC---ATATACTGCAGTAAGACATCACTGGTGTT--TAAA-AAGG-GACTTTTTATAAGATATT--AAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGACTTCT-TTTT---------------CTCAAA----A---AT-CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTC-TTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-C-TGGTCAACCTACCAGTTATT----TTGCAAT-TT------T------ATGTAG---GTAA------A--CA--TTCCTGCT---ATG----------------A-A--------A--A-A--A------------A--------------------A-----T--------TCTA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--T---ACCATGGAAATCCTA----GACCTTA-TTTT---A-TGTAGA-----------ACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTATTGATACCT
gi|3 : TGATGTACAACATTGCATCTCATTATCATTTGTCTCTCACAGCTTATTCAAGTGAGAAATTTATTGGTAACTTGTGGAGATGGGGTGTGCTCGAGTACAAATTG---ATTCCAAGATTGATGTGTATCCCTTTAAAAAATGATTTCACTAGTTTAGCTTGTACTTATAAGAAT--GGCTTCATCATATA-TGCTA
gi|14 : tatatagttatctagttatcatgtgttgcatatataattatgtaacgataaaatttgtacttgacattactttgtatagcttgcacctctgtaaggtttattcaaatcagaaaccctgcattatatttgaccatgcccttggtatcaatattaagctttatttgagaagccgggaccgataagcttagttggtagctcgtccgactatcaatccaggcgtcacgagcccgaatccccactctgcaaaagtttccttgatgatACAA-ATAC----ACAAACACTT-AATATCTC-ACACTATAAAGTTGCGCCCCTTGTT-TTGCC------------ACGG---CAACAT---GATTCTTGCACTT-----AAAAAA------AAGTTCTATGTAAATTGGTTT-GA-----AATGTTTT--CGAAA-TGGTTCATAGAATTTGTG-ATTTCTTGCTTAAGATGAGTAGGG-AAAA-GCTGGCAGAGTATAATATACTGCAATTAGACACCACTGGTG-T--TATA-AAGC-GAC-TTTAACAGGATTTT--AAC--AT--ATACATA------TAtagtgttacattcatca
gi|30 : gtgattaattctTGTACGTCTC-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-Tacagttattgtacatgttatgtgttgatacattcttgttattaaaaat
gi|10 : ttatacccgttgtcataACGTCTT-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-TA-TTCCC------------ACGG---TTGCAT---GATTCTTACGCTCTGA--AAA-----------GTCCTATGTAAT-ATGGTTTGA-----AATATTTT--CAAAG-TGGTTTTTAGTAGATGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGAAGAGCTAAA-CCTGGCATAGC---ATATACTGCAATAAGTCATCATTAGTG-T--TAAA-AAGT-GAC-TTTTATAAGATATT--AAC--AG--ATACATG------CA-TTATGAGCATTTGAGGATTTTC-TTTT---------------AAAAAA----A---AT-CTTAGGG-TGTCACTGAACC--CTC-TTT---ATT----AA-A-AAC--ATA-A-TGGTCTTCCTACGAGTTATT----ATGCATT-TT------A------ATGC------TGA------A--TATGTTTTTGCC---GTG----------------G-A--------A--A-gt
gi|28 : TGTCTC-AC--TACACAGTTGCGGCCCTT-TG-TCTCC------------ACGG---TGACAT---GATTCTTACGCTT--------AAA------AAGTCCTATGTAATtcttagaccttatttcatataaaacaaagatcaaaattgcactgtgtagtgagacctt
gi|2 : GTCTT-AC--TACACAGTTACTCTTTTT-TT-TCCCC------------ACGG---TAACAT---GATTCTTACACTT-------AAAA------AAGGCCTATGTAATTTGGTTTTGA-----AATATTGT--TAAAT-TGGTTCATAGTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GTTAGCATAGC---ATATACTGCAATAAGACATCACTGGTGTT--AAAA-AAAT-GAC-TGTAATAGGATTTC--AGC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGACTTCT-TTTT---------------C-AAAA----A---GT-CTCGGAG-TGTCACTGCACC--CTC-TTTTAAAAA----AA-A-AAC--A-ACC-TGGTCAACTTACCAGTTATTGTGATTAAAAC-ATAAAACATAAAAAAATGTGG---GTAT------A--CA--TTCTTGCT---ATGAAAAAAAAAGATACTTA-A--------A--A-A--A------------A--------------------A-----T--------TCTA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--TTTGACCATGGAAATCCAA----GACCTTA-TTTT---A-TATAGA-----------ACAA-------AGAACA------AAATTAAA-CTGTGTAGTGAGACC
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gi|6 : cGTCTC-AC--TACACAATTATGCCCCTT-TT-TTTC-------------ATGG---TAACTT---GATACTTACGCTTAAA--AAAAAA------AAGGCCTATGTAATTTGGTTTTGA-----AATATGTT--CAAAA-TGGTTCATATTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGTTGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGCAT-ATATACTGCAATAAGACATAACTGGTGTT--AAAA-AAGT-GAC-TTTTATAGGAT-TT--AAC--AT--GTGCATG------AATTTATGAGCATTTGAGGAC--------------------------------------AT-TT--G------CAC----CC--TCT-TTA---AAA-------A-AAC--A-AGC-TGGTCAACCTACCAGTTATT----GTGC-AT-TT------T------ATGTGG---GTAT------A--AA--TTCCTGCT---ATGAAAAAAAAATACTT--A-A--------A--A-A--A------------A--------------------A-----T--------TCTT--------------TGTTGAATTATT--T----TTT--T---ACCATGGAAATCCTA----GACCTTA-TTTT---A-TATGGA-----------ACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGA
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gi|7 : GTCTC-AC--TACACAGTTGCACCCCTT-TA-TCGCC------------ATGA---TAACAT---GATTCTTGCACTT-------AAAA------AAATCTTATTTAATTTGGTTT-GA-----AATATTTT--CAAAAATGGTTCAAAGGGGCTGTG-ATTTCATGCCGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCCAGCATAGA---ATATACTGCAAAAAGACATCACTGGTGTT--AAAA-AAGT-GAC-TTGTATAAGATATT--AAC--AG--ATGCATG------TATTTATGAGCACTTGAGGACT--T-TTAT---------------TAAAAA----A---AT-CTGAAGG-TGTCACTGCA-C--GTC--------------------------------ATCAACTTACCAGTTATT----GTGC-------------------ATGTTG---ATAAGCCGATA--CA--TTCCTGTT---ATG----------------A-A--------A--A-AAGA------------A--------------------A-----T--------TC-A--------------TGTG---------------CTT--T---AAAATAG--ATTCTATGTGGA--TTA-TTTTTTAA-TGTGGATATCTTGTTTCACAC-------AG-ACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTG
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gi|12 : cTCTC-AT--GACAGAGTTGCATACCTT-TT-TTAGAG-----------AAAG---TAACAC---GATTCTT--GC---AATTAGAAAG------AAGTCACATGTAATT-TGTTTCAT-----AATATTTT--CAAAA-TGGGTCAAAGGGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCGGATGAGTAGAGCCAAG-GTTGACATAAT---ATATACCGCAAGAAGACATCACTGGTGTT--TAAACGAGT-GAC-TTTTATTGGATGTT--TACGGATGGATGCGTGTACTACTATTTAAGGATGTTTGAGGACTTCT-TTT----------------------------------TTAG------CACTG-------TC-TTA---AAA----AAGA-AAC--A-----TAATCAATCCATCAGGTGTT----GTGC-TT-TT------T------A-ATGG---G-AAGAT---A--CA--TTCC-------ATG----------------G-A--------AATA-A--A------------A--------------------A-----T--------TCT---------------T-TAAAAT--TT--T----Tgtggactttttttcaaaaattctcaggtgtcacagcaccctcttttaaaaacaacctggtcaacctaccagttaaggtgcatttcaatgtggttatacgttcatgctatgaaaaaaatactaaaaaaattctatgtggaattctttttttaccatggaaatcctctaccttattttatatagaactaaagacaaaattcaactgtgaagtgaaacct
gi|35 : caTCTCCGC--TACACAGTTGCACCCCTT-TTATTGTC------------ACGG---TAACAatata
gi|22 : TC-AC--CACAGAGTTTTGCCCCTT-GT--------------------GGGGTTGATAC---AATTCTTGTGCT------AAAAAATCTTGTAA---CTGTATACTGATATTTTGGTGTGGAATATTTT--CAAAA-TAATTTGTAGAGAAAGTG-ATTTTTTcga
gi|24 : tacactAAAA-TGGTTCATAGA---TACGAATGTCTTTTTGCAGATAAG--GAGAAGAA-TCTTGCATAGC---ATAT-CTG
gi|13 : ctttttttaaTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAAAGCTGGCATAGC---ATATAGTGCAATAAGACATCACTGCTGTT--AAAA-AATT-GAC-TTGTATAGGATTTC--AAC--AT--ATGCTTG------TATTTACGAGCATTTGAGGACTgctatagga
gi|15 : cgtctcactacacagtaacgcacctttttccctacggttacacgattgctacgctcaaaacaatgtcctgtgtaagtgA-GCTGGTATAGC---ATATACTTCAATAA----TCA-TGGT-----TAAA-AAAT-GACTTTT-ATAGGATTTC--AAC--AT--ATGCGTG------TATTTACGAGCACTTGAGGACTTCT-TTTT---------------GAAAAA----A---AT-ATCAGGG-AGTCACTGCACC--CTCTTTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-CGTGGTCAACTTACCAGTTATT----GTGCATT-TT------T------ATTTTG---GTTT------A--CAT-TTCCTGCT---ATGA---------------A-A--------A--A-A--A------------A--------------------A-----TCAAAAAAATCTA--------------TATGGACT--TCTTT----TTT--T---ACCATGGACATCCTA----GACCTTA-TTTT---A-TATAAA-----------ACAA-------AGAACA------CAATTCAA-CTGTGTTTTGAGACCggtcaacataacagttattgtgcattttatgcgggtataaattcctgctatgaaaaaaaattctatgtggatttttttaccttattttatttttattttgaacaaagaacaaaattcaactgtgaagtgagacc
gi|16 : CTGCAATAAGGCATCACTGGTGTT--AAAA-ATGT-GAC-TCTAATTAGATTTA--AACAGATAGATGGATG------TATGCTTGAGCATTTGAAGACTT-T-ATTTAAAAAAACAACAACACTTAAA----A---ACACTTAGGGATGTATCTGCAC---------------------------T--A-G-C-TGGTCTACATATCAGTTATT----TTACATT-CT------T------ATG--A---GCAG------A--CACGTTTCTAAT---ATG----------------ATAAAATACTTA--A-A--A------------A--------------------A-----CGTG-----TGTA--------------CGTTGA----TA--T----TTT--T---ACCGTTCAAATCCCA----AACTTCA-TTTT---A-TATAGA-----------TCAT-------TGAGCA------A
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gi|9 : gACTTGTGGACTTTT-TTT------------------CAAA----A---ATTCTCAGG--TGTCACAGCACC--CTC-TTTT--AAA----AA-C-AAC------C-TGGTCAACCTACCAGTTAAG----GTGCATT-TC------A------ATGTGG---TTAT------A--CG--TTCATGCT---ATG----------------A-A--------A--A-A--A------------ATACTAAAAAA----------A-----T--------TCTA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTTTTT---ACCATGGAAATCCTC----TACCTTA-TTTT---A-TATAGA-----------ACTA-------AAGACA------AAATTCAA-CTGTGAAGTGAAACCTttaaaatagattttatgtgaga
gi|23 : ctctcactacacagttacgcccattttttcacacggtattctttcgattctttcgcttaaaaaaaaggcctttgtaatttggttttgaaatattttcaaaatggtctatagtggttgtgatttcttgccgcagatgcttagagcaaaagtttgcctaaaatacactgaaattaaacattactggtgttaaaaaagtgGA-TGTCTCTGCACA--TTC-TTT---AAA----AA-ACCAC--A-AGC-TGTTCAACTCGCC
gi|13 : taagacatcacttgtgttataacagtgactattagggacattagca-A-C-TGGTCAACATAACAGTTATT----GTGCA-T-TT------T------ATGCGG---GTAT------A--AA--TTCCTGCT---ATG----------------A-A--------A--A-A--A------------A--------------------A-----T--------TCTA--------------TGTGGA----TT--T----TTT--T---ACCTT---------------ATTTTATTTTT---A-TTTTGA-----------ACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGAAGTGAGACC
gi|19 : cgtctcactacacagtaacgcacctttttccctacggttacacgattgctacgctcaaaacaatgtcctgtgtaagtgtgctgcagatgagtagagcaaaaagctggcatagcatatagtgcaataagacatcactgctgttaaaaaattgacttgtataggatttcaacatatgcttgtatttacgagcatttgagg-TAGTTAACCTACCTGTTATT----GTGTATTATT------T------ATGCGC---GGAG------A--CA--TTTCTGTT---ATG----------------G-A--------A--ATA--ATTATG-------A--------------------A-----TA-------TTTA--------------TGTAG-AT--TC--TTTAGTTT--T---ACTGTGTTAATCATC----AACTTTA-TTTA---A-TATTGA-----------ACAA-------GGAACATAGAATAAGCTTAAGCTGTGTGTTAA
gi|14 : TAACAGTTATT----GTAC-AT-GT------T------ATGT-G---TTGAT-----A--CA--TTCTTGTT---ATT----------------A-A--------A--A-A--a
gi|21 : gtgattaattctacaaatacacaaacacttaatatctcacactataaagttgcgccccttgttttgccacggcaacatgattcttgcacttaaaaaaaagttctatgtaaattggtttgaaatgttttcgaaatggttcatagaatttgtgatttcttgcttaagatgagtagggaaaagctggcagagtataatatactgcaattagacaccactggtgttataaagcgactttaacaggattttaacatatacataTGCAAT-TT------C------AT-TAG---A-AG------ATGCA--TACCTGCT---ATG----------------A-A--------A--A-G--T------------A--------------------ATACTTT--------TCTA--------------AGAG--AT--TT--T----TTT--A---ACAGTGGGAAAACTA----GACTCTA-T--------CATAGA-----------ACAACAATAATAGTGCA------AAATTCAA-C--TGTATTGGGACCt
gi|10 : --------------------A-----T--------TTTAA-------------TGCTGAATA-TG--T----TTT--T---GCCGTGGAAATCTTA----GACCTTA-TTTC---A-TATAAA-----------ACAA-------AGATCA------AAATTGCA-CTGTGTAGTGAGACCT
gi|34 : acgtcttactacacagttgcgcccctttattcccacggttgcatgattcttacgctctgaaaagtcctatgtaatatggtttgaaatattttcaaagtggtttttagtagatgtgatttcttgctgcagatgagaagagctaaacctggcatagcatatactgcaataagtcatcattagtgttaaaaagtgacttttataagatattaacagatacatgcattatgagcatttgaggattttcttttaaaaaaaatcttagggtgtcactgaaccctctttattaaaaacataatggtcttcctacgagttattatgc--TC--G----TTT--T---ACCGTTGAAATCCTA----GACCTTA-TTTT---A-TTTAGA-----------ACAA-------At
gi|27 : --T----TTT--T---AATATGGAAATCTTA----AATTTT--TTTT---A-TATAGA-----------ACAT-------AGATCA------ATATTCAA-CTGTGTGGTGAGACC
gi|29 : atatTCCTA----AACCTTA-TTTT---A-TAAAGA-----------AAAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGCGAGACCT
gi|32 : atCCTTA-TTTT---A-TATAGA-----------ACAA-------AGAACA------AGATTCAA-CTGTG
gi|31 : TTT---AGTATGGA-----------ACAT-------AGAGCA------AATTTTAA-CTGTGCACTAATACCTaagttgga
gi|37 : tgCAA-------AGAACA------CAGTTCAA-CCGTGTTTTGt
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|5 : TCTC-AC--TACACAGTTACGACCCTT-TT-TTCCCC-----------ATGG---TAACAT---GATTCTTACACT-TA--AAAAAA-AA---GGCCTAT----GTA-------ATTTAGTTTTGACA-A--TTTTC-AAAATGGTTCATAGTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGC---ATAAACT-GCAATAAGACATCACA-----GGTG-TT--AAAAAAGT--TTTTT-------TTTTA--------------G------GATTTATGAGCACTTGAGGA-T-TTC--TTTTT-C-A--AAA----C-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTCTTTT---AAAAAACAA-A-AAC--A-ACC-TGGTCAACCTACAAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATGTGG---ATATACA-TACCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------T-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAA--TC--T----TTTTAT---ACCACGGAAATCTTAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
gi|6 : GTCTC-AC--TACACAATTATGCCCCTT-TT-TTTC-------------ATGG---TAACTT---GATACTTACGCT-T---AAAAAA-AAAAAGGCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TGTTC-AAAATGGTTCATATTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGTTGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGCAT-ATATACT-GCAATAAGACATAACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTTT-ATAGGA-TTTAAC--AT--GTGCATG------AATTTATGAGCATTTGAGGA-C--------------------------AT-----------------TT-------------GCACC--CTC-TTT----AA----AA-A-AAC--A-AGC-TGGTCAACCTACCAGTTATTGTGCA-T----TTT-------------ATGTGG---GTATAAA-TTCCTGCT---ATG-A-AAAAAAAATACTTAAA----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TT--------------TGTTGAATTATT--T----TTT--T---ACCATGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATGGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAG
gi|7 : GTCTC-AC--TACACAGTTGCACCCCTT-TA-TCGCC------------ATGA---TAACAT---GATTCTTGCACT-T---AAAAAA-A-----TCTTAT----TTA-------ATTTGG-TTTGAAATA--TTTTCAAAAATGGTTCAAAGGGGCTGTG-ATTTCATGCCGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCCAGCATAGA---ATATACT-GCAAAAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTGT-ATAAGATATTAAC--AG--ATGCATG------TATTTATGAGCACTTGAGGA-C-TT---TTATT-A-A--AAA----A-AT-----------------CTGAAGG-TGTCACTGCA-C--GTC--------------------------------ATCAACTTACCAGTTATTGTGCATG----TTG-------------ATAAGC---CGATACA-TTCCTGTT---ATG-A-A--------------A----------------A-AAGA------------A--------------------A-----T--------TCATGTGCTTTAAAATAGATTCTA--------------TGTGGATT--AT--T----TTT--T---AATGTGGATAT-------CTTG-TTTCA-CACAG---------------ACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGTGACC
gi|8 : GTCTC-AC--TACACAGTCGCGCCCCTT-TT-TTGTC------------ACGG---AAGCAA---GAATCTCGTTCT-T---------------GTCATAT----ATG-------A----GTT--GAAATA--TTTTC-AAAATGGT--------GCTGTG----TCTTGTAGCTGGTCAGTAAAACAATA-GATGGCATTGC---ATATACT-TCAACAAGACATCACT-----GGTA-TT---AGGAAGTGTCGTGT-ATAGGATTTTAAC--AG--GTGCACG------TA--TAT------------A-C-TTCCGTTTTC-G-A--AAAGAATA-AT-----------------CTTAAAG-TGTCACTGCACT--GTC-TTT----AA----AA-A-AAT--A-A-C-TTGCCAACCTACCAATTAGTGTGCATT----TTT-------------ATGTAT---GGATACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------ATACAAAACTTTTTATATAAGA-----T--------TA--------------------TA--------------TGTGGAAA--CG--T----TGT--T---ACCGTGAAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-CATAGAACAA-------AGAACG------AAATTCAG-CTGTGTAGTGAG
gi|9 : TCTC-AC--TACACAGTTACGCCCATT-TT-TTCAC------------ACGG---TATTCTTTCGATTCTTTCGCT-T---AAAAAA-AA---GGCCTTT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTCTATAGTGGTTGTG-ATTTCTTGCCGCAGATGCTTAGAGCAAAA-GTTTGCCTAAA---ATACACT-GAAATTAAACATTACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTGT----GGACTTT
gi|9 : cACTTGTGGA-C-TT---TTTTT-C-A--AAA----A-TT-----------------CTCAGG--TGTCACAGCACC--CTC-TTTT--AAA----AA-C-AAC------C-TGGTCAACCTACCAGTTAAGGTGCATT----TCA-------------ATGTGG---TTATACG-TTCATGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------ATACTAAAAAA----------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--TTT-ACCATGGAAATCCTCTACCTTA-TTTTA-TATAGAACTA-------AAGACA------AAATTCAA-CTGTGAAGTGAAACCTttttcaaaaattctcaggtgtcacagcaccctcttttaaaaacaacctggtcaacctaccagttaaggtgcatttcaatgtggttatacgttcatgctatgaaaaaaatactaaaaaaattctatgtggaattctttttttaccatggaaatcctctaccttattttatatagaactaaagacaaaattcaactgtgaagtgaaacct
blockSeqs : A A T T T A C GG A . GATGTGTATC TT TC TA C CT AA . T C T . . . A G C AC G A CCCCCCCCCCCCACG GGT TTC C A AAAAA T AACT TACTGAT C TT A T A A ATA G GGACA T AAA . GG TGG TACTAC T G CCG AAAC GAAT T AACAACACTTAAAAACA T GA TT T TAAA AAAC G C TA TA G AAAA TAAAACATAAAAAA GGGCGG T TAA A T AAAAGAAATTCATGTGCTTTAAAATAGATTCTA TA TT TTAG TA TTG T G CAATAAT TAGAAT G
blockSeqs : . . . . . AGAG . . . . TAA T . . T . . C . . AT . . . A . AG TAG . . . C GAA TA . . T G . T TA . . . . AC G A A TGA . . . C AAAAATACAAAACTTTTTATATAAGATTATA A T . . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . CCCC . . . . CAA T . . T . . G . . . . . . A . . G . . . C AA . . . C A . . A . . . . AG . . T GAG . . . . AAAAAAAGATACTTAAAAAAAATTCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CCC . . . . AA T . . T . . A . . . . . . A . . A . . . C TA . . . T G . . A . . . . AC . . A AAG . . . . AAAAAATATATATATAAATAATGCTT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CCT . . . . AT T . . T . . C . . . . . . A . . T . . . C AA . . . T T . . A . . . . AG . . T GGT . . . . AAAAAAATACTTAAAAAAAATTCTT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GCC . . . . AA G . . T . . T . . . . . . A . . T . . . C AA . . . C G . . A . . . . G . . T TTG . . . . AAAACTACTTTAAAACAATTCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CCC . . . . AA T . . T . . A . . . . . . A . . T . . . C CA . . . C A . . A . . . . A . . T GGT . . . . AAATACTTAAAAAACGTGTGTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CCC . . . . AA T . . T . . A . . . . . . A . . G . . . C TC . . . C G . . A . . . . A . . T CAG . . . . AAAAATACTAAAAAAATTCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TCC . . . . AA T . . T . . T . . . . . . A . . T . . . . CA . . . G G . . A . . . . G . . C CGG . . . . AAAAAATCAAAAAAATCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GTC . . . . AA G . . T . . T . . . . . . A . . G . . . . AA . . . T G . . . . . . . G . . T GGT . . . . AATAATTATGAATATTTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GTC . . . . A G . . . . . T . . . . . . A . . T . . . . GA . . . C G . . . . . . . A . . T AAG . . . . AAGTAATACTTTTCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GCC . . . . A G . . . . . G . . . . . . A . . T . . . . CA . . . . . . . . . . . . A . . T GAT . . . . AATAAAAATTCT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GTC . . . . . T . . . . . T . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GGT . . . . AAAAAATTCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CAC . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T CCG . . . . ATAAAATTCTA . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . A TGG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : *** NA****
originalCons : TGATGTACANCATTGCATCTCATTGTCATTTGTCTCTCACCGCTNATTCAAGTGGGAAANTTANCGGTNACTTGCGGAGATGGNGTGTGCTCGAGTACNGGTTGACCATTCCAGGATTGATGTGTATCCCCGNAAAGAGTGGTTNCGCTAGTTTAGNTCGTACTTATAAGNNTTCGGCTNCATNANATAGTGCTAAATATTCCCCAACCACAACAATAAGCAGTCATTAAAACAATATACCAGAACNGACGCCTGAACGTCTC-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-TT-TTCCC------------ACGG---TAACAT---GATTCTTGCGCT-T---AAAAAA-AA---GTCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTTCATAGNGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCTGGCATAGC---ATATACT-GCAATAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTTT-ATAGGATTTTAAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGA-C-TTC--TTTTT-N-A--AAA----A-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTC-TTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-C-TGGTCAACCTACCAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATGTGG---GGATACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--T---ACCGTGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
finalCons : TGATGTACANCATTGCATCTCATTGTCATTTGTCTCTCACCGCTNATTCAAGTGGGAAANTTANCGGTNACTTGCGGAGATGGNGTGTGCTCGAGTACNGGTTGACCATTCCAGGATTGATGTGTATCCCCGNAAAGAGTGGTTNCGCTAGTTTAGNTCGTACTTATAAGNNTTCGGCTNCATNANATAGTGCTAAATATTCCCCAACCACAACAATAAGCAGTCATTAAAACAATATACCAGAACNGACGCCTGAACGTCTC-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-TT-TTCCC------------ACGG---TAACAT---GATTCTTGCGCT-T---AAAAAA-AA---GTCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTTCATAGNGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCTGGCATAGC---ATATACT-GCAATAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTTT-ATAGGATTTTAAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGA-C-TTC--TTTTTNA----AAA----A-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTC-TTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-C-TGGTCAACCTACCAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATGTGG---GGATACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--T---ACCGTGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): ATATATAGTTATCTTGTAAAATAACAGATGTGTTGCATGTATATGTAACCACAAAAGTTGTACTTGACATTATTTTGTATAGCTTGCACCTCTGTAAGGTTTATTCAAATCAGAAACCCTGCATTATATTTGACCATGCC
Unaligned ( gi|26 ): AAGATAATTACATAAGTGATTGTCTATGTAGTCGCAACAAAAATTGCATAAAAGGATCCACTATTATTTTTATAT
Alignments
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lowQualScore : . . . . . . . .. . ... .......... .. .. .. . .. .. .. . . . . . .... . . . .. . . ............... ... ... . ... ...... . .... ....... . . .. . . . . ... . ..... . ... . . .. ... ...... . . ... ...... .... . ................. . .. .. . .... .... . . .. ... . .... .............. . ...... . ... . . ........................................................................................................................... . .. .. .... .. ... . . ....... ...... .
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consensus : TGATGTACANCATTGCATCTCATTGTCATTTGTCTCTCACCGCTNATTCAAGTGGGAAANTTANCGGTNACTTGCGGAGATGGNGTGTGCTCGAGTACNGGTTGACCATTCCAGGATTGATGTGTATCCCCGNAAAGAGTGGTTNCGCTAGTTTAGNTCGTACTTATAAGNNTTCGGCTNCATNANATAGTGCTAAATATTCCCCAACCACAACAATAAGCAGTCATTAAAACAATATACCAGAACNGACGCCTGAACGTCTC-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-TT-TTCCC------------ACGG---TAACAT---GATTCTTGCGCT-T---AAAAAA-AA---GTCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTTCATAGNGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCTGGCATAGC---ATATACT-GCAATAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTTT-ATAGGATTTTAAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGA-C-TTC--TTTTT-N-A--AAA----A-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTC-TTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-C-TGGTCAACCTACCAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATGTGG---GGATACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--T---ACCGTGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
Reference ( family-620 ) : TGATGTACANCATTGCATCTCATTGTCATTTGTCTCTCACCGCTNATTCAAGTGGGAAANTTANCGGTNACTTGCGGAGATGGNGTGTGCTCGAGTACNGGTTGACCATTCCAGGATTGATGTGTATCCCCGNAAAGAGTGGTTNCGCTAGTTTAGNTCGTACTTATAAGNNTTCGGCTNCATNANATAGTGCTAAATATTCCCCAACCACAACAATAAGCAGTCATTAAAACAATATACCAGAACNGACGCCTGAACGTCTC-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-TT-TTCCC------------ACGG---TAACAT---GATTCTTGCGCT-T---AAAAAA-AA---GTCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTTCATAGNGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCTGGCATAGC---ATATACT-GCAATAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTTT-ATAGGATTTTAAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGA-C-TTC--TTTTT-N-A--AAA----A-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTC-TTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-C-TGGTCAACCTACCAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATGTGG---GGATACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--T---ACCGTGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
gi|1 : TGATATACACCATTGCATTTTATTGTCATTTGTCTCTCATCACTGATTCAAGTGGGAAAGTTAACAGTTA-TTGCAGAAATGGT-TGTGCTCAAGTACTGGTTAACCATTCCAGGATT----------CCCGGAAAGAGTGGTTAGGTTAGTT--GATCGTA--TATAAGCCTTCGACTGCATAAAATAGTGCTAAATATTCCCCAACCACAACAATAAGCAGTCATTAAAACAATATACCAGAACTGACGCCTGAATGTCTC-AC--TACACAGTTACGCTCCTT-TT-TTCCC------------ACGG---TAACAT---AATTCTTAAGCT-TTAAAAAAAA-AA---GGCCTAT----GTA-------ATTAGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTTCGTAGGGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGC---ATATACT-GCAGTAAGACATCACT-----GGTG-TT--TAAAAAGGGACTTTTTATAAGATATTAAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGA-C-TTC--TTTTT-CTC--AAA----A-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTC-TTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-C-TGGTCAACCTACCAGTTATTTTGCAAT----TTT-------------ATGTAG---GTAAACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--T---ACCATGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TGTAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTATTGATACCT
gi|10 : ACGTCTT-AC--TACACAGTTGCGCCCCTT-TA-TTCCC------------ACGG---TTGCAT---GATTCTTACGCTCT---GAAAA-------GTCCTAT----GTA-------ATATGGTTT-GAAATA--TTTTC-AAAGTGGTTTTTAGTAGATGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGAAGAGCTAAA-CCTGGCATAGC---ATATACT-GCAATAAGTCATCATT-----AGTG-TT---AAAAAGTGACTTTT-ATAAGATATTAAC--AG--ATACATG------CA-TTATGAGCATTTGAGGATT-TTC--TTTTA-A-A--AAA----A-AT-----------------CTTAGGG-TGTCACTGAACC--CTC-TTT---ATT----AA-A-AAC--ATA-A-TGGTCTTCCTACGAGTTATTATGCATT----TTA-------------ATGC-T---GAATATG-TTTTTGCC---GTG-G-A--------------A----------------A-
gi|10 : --------------------A-----T--------TT--------------------TAA-------------TGCTGAATA-TG--T----TTT--T---GCCGTGGAAATCTTAGACCTTA-TTTCA-TATAAAACAA-------AGATCA------AAATTGCA-CTGTGTAGTGAGACCTtcttagaccttatttcatataaaacaaagatcaaaattgcactgtgtagtgagacctt
gi|11 : acgtcttactacacagttgcgcccctttattcccacggttgcatgattcttacgctctgaaaagtcctatgtaatatggtttgaaatattttcaaagtggtttttagtagatgtgatttcttgctgcagatgagaagagctaaacctggcatagcatatactgcaataagtcatcattagtgttaaaaagtgacttttataagatattaacagatacatgcattatgagcatttgaggattttcttttaaaaaaaatcttagggtgtcactgaaccctctttattaaaaacataatggtcttcctacgagttattatgcGTCTC-AC--CACACAGTTGTCCCCCTT-GC-CCCCCCCCCCCCCCACGACGG---TAACAT---GATTCTTGTGCT-T---AAAATA-A----GTCCTAT----GTA-------AGTTGGTTT-GGACTA--TTTTC-AAAATGGTTCATAGCGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-ACTGGCATAGC---ATGTACT-GCAATAAGACATCCCT-----GGTG-GA--AAAAAGGTGATTTTT-ATAGGATTTTAAC--AA--ATGTATG------TATTTGTGAGAATTTGAGGC-C-TT---TTTTT-A-AACAAA----A-AT-----------------CTTATGA-TGTCACTGTACC--CT--GTT---AAA----AA-A-A----A-G-C-CGGTCAACCTACCAGTTATTATGCATT----TTT-------------CTGTGG---AGATACA-TTTCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--ACTACTTTAAAACA--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGt
gi|12 : CATCTC-AT--GACAGAGTTGCATACCTT-TT-TTAGAG-----------AAAG---TAACAC---GATTCTTGCAAT-T---AGAAAG-AA---GTCACAT----GTA-------ATTTG-TTTCATAATA--TTTTC-AAAATGGGTCAAAGGGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCGGATGAGTAGAGCCAAG-GTTGACATAAT---ATATACC-GCAAGAAGACATCACT-----GGTGTTT--AAACGAGTGACTTTT-ATTGGATGTTTACGGATGGATGCGTGTACTACTATTTAAGGATGTTTGAGGA-C-TTC--TTTTT-T-A--G--------------------------------------CACTG-------TC-TTA---AAA----AAGA-AAC--A-----TAATCAATCCATCAGGTGTTGTGCTTT----TTA-------------ATGGGA---AGATACA-TTCC-------ATG-G-A--------------AAT--------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------T---------------T-TAAAAT--TT--T----T
gi|13 : CGTCTC-AC--TACACAGTAACGCACCTT-TT-TCCCT------------ACGG---TTACAC---GATTGCTACGCT-C---AAAACA-AT---GTCCTGT----GTA-------Aatata
gi|13 : TGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAAAGCTGGCATAGC---ATATAGT-GCAATAAGACATCACT-----GCTG-TT--AAAAAATTGACTTGT-ATAGGATTTCAAC--AT--ATGCTTG------TATTTACGAGCATTTGAGGA-C-Tgtgtgctgcagatgagtagagcaaaaagctggcatagcatatagtgcaataagacatcactgctgttaaaaaattgacttgtataggatttcaacatatgcttgtatttacgagcatttgaggactggtcaacataacagttattgtgcattttatgcgggtataaattcctgctatgaaaaaaaattctatgtggatttttttaccttattttatttttattttgaacaaagaacaaaattcaactgtgaagtgagacc
gi|13 : cgtctcactacacagtaacgcacctttttccctacggttacacgattgctacgctcaaaacaatgtcctgtgtaagtg-A-C-TGGTCAACATAACAGTTATTGTGCATT----TT--------------ATGCGG---GTATAAA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGA----TT--T----TTT--T---ACCTT-----------ATTTTATTTTTA-TTTTGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGAAGTGAGACCggtcaacataacagttattgtgcattttatgcgggtataaattcctgctatgaaaaaaaattctatgtggatttttttaccttattttatttttattttgaacaaagaacaaaattcaactgtgaagtgagacc
gi|14 : cgtctcactacacagtaacgcacctttttccctacggttacacgattgctacgctcaaaacaatgtcctgtgtaagtgtgctgcagatgagtagagcaaaaagctggcatagcatatagtgcaataagacatcactgctgttaaaaaattgacttgtataggatttcaacatatgcttgtatttacgagcatttgaggACAA-ATAC----ACAAACACTT-AATATCTC-ACACTATAAAGTTGCGCCCCTTGTT-TTGCC------------ACGG---CAACAT---GATTCTTGCACT-T---AAAAAA-AA---GTTCTAT----GTA-------AATTGG-TTTGAAATG--TTTTC-GAAATGGTTCATAGAATTTGTG-ATTTCTTGCTTAAGATGAGTAGGG-AAAA-GCTGGCAGAGTATAATATACT-GCAATTAGACACCACT-----GGTG-TT---ATAAAGCGACTTTA-ACAGGATTTTAAC--AT--ATACATA------TA
gi|14 : gtgattaattctTAACAGTTATTGTACATG----TT--------------ATGTGT---TGATACA-TTCTTGTT---ATT-A-A--------------A----------------A-A--acagttattgtacatgttatgtgttgatacattcttgttattaaaaat
gi|15 : gtgattaattctacaaatacacaaacacttaatatctcacactataaagttgcgccccttgttttgccacggcaacatgattcttgcacttaaaaaaaagttctatgtaaattggtttgaaatgttttcgaaatggttcatagaatttgtgatttcttgcttaagatgagtagggaaaagctggcagagtataatatactgcaattagacaccactggtgttataaagcgactttaacaggattttaacatatacataA-GCTGGTATAGC---ATATACT-TCAATAA----TCA-T-----GGT---T--AAAAAA-TGACTTTT-ATAGGATTTCAAC--AT--ATGCGTG------TATTTACGAGCACTTGAGGA-C-TTC--TTTTTGA-A--AAA----A-AT-----------------ATCAGGG-AGTCACTGCACC--CTCTTTT---AAA----AA-A-AAC--A-A-CGTGGTCAACTTACCAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATTTTG---GTTTACATTTCCTGCT---ATGAA-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----TCAAAAAAATC--------------------TA--------------TATGGACT--TCTTT----TTT--T---ACCATGGACATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATAAAACAA-------AGAACA------CAATTCAA-CTGTGTTTTGAGACCt
gi|16 : CT-GCAATAAGGCATCACT-----GGTG-TT--AAAAATGTGACTCTA-ATTAGATTTAAACAGATAGATGGATG------TATGCTTGAGCATTTGAAGA-C-TT---TATTT-A-A--AAA----A-ACAACAACACTTAAAAACACTTAGGGATGTATCTGCAC---------------------------T--A-G-C-TGGTCTACATATCAGTTATTTTACATT----CTT-------------ATGAGC---AGACACG-TTTCTAAT---ATG-ATAAAATACTT------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----CGTG-----TG--------------------TA--------------CGTTGA----TA--T----TTT--T---ACCGTTCAAATCCCAAACTTCA-TTTTA-TATAGATCAT-------TGAGCA------A----C---CTGTGTTGTGAGAC
gi|17 : tGTCTC-AC--TACACAGTAATGCCCCTT-TT-TCCCC------------ACGG---TAACAT---GAATCTTACGCT-T---AAAAAATAA---G-CCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTAAAATATTTTTTC-ACAATGGTTTATAGCGGTTGTG-ATTTCATGTTGCAGATGAGAAGAGCAAAA-GTTGACATAGC---ATAAATT-GCAATAAGACATCACTGGACAGGTG-TC--AAA-----------C-AT---ATTTCAAC--A----------------TATTTATGAGCATTTCAG
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gi|19 : -TAGTTAACCTACCTGTTATTGTGTATTA---TTT-------------ATGCGC---GGAGACA-TTTCTGTT---ATG-G-A--------------A----------------ATA--ATTATG-------A--------------------A-----TA-------TT--------------------TA--------------TGTAG-AT--TC--TTTAGTTT--T---ACTGTGTTAATCATCAACTTTA-TTTAA-TATTGAACAA-------GGAACATAGAATAAGCTTAAGCTGTGTttaaaatagattttatgtgaga
gi|2 : CGTCTT-AC--TACACAGTTACTCTTTTT-TT-TCCCC------------ACGG---TAACAT---GATTCTTACACT-T---AAAAAA------GGCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTGTT-AAATTGGTTCATAGTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GTTAGCATAGC---ATATACT-GCAATAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAATGACTGTA-ATAGGATTTCAGC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCATTTGAGGA-C-TTC--TTTTT-C-A--AAA----A-GT-----------------CTCGGAG-TGTCACTGCACC--CTC-TTTTAAAAA----AA-A-AAC--A-ACC-TGGTCAACTTACCAGTTATTGTG-ATTAAAACATAAAACATAAAAAAATGTGG---GTATACA-TTCTTGCT---ATG-A-A--------------AAAAAAAGATACTTAAAA-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--TTTGACCATGGAAATCCAAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTAAA-CTGTGTAGTGAGACCgttaaa
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gi|23 : tTAAGACATCACT-----TGTG-TT--ATAACAGTGACTATT-A-GGGACATTAGC--AG--ATG
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gi|31 : ttatacccgttgtcataTTTAGTATGGAACAT-------AGAGCA------AATTTTAA-CTGTGCACTAATACCTgt
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gi|33 : TTA-TTCTA-TATCGAACAT-------AAGGCG------AAATTCAA-AAGTGTAGTGAAACtgga
gi|34 : --TC--G----TTT--T---ACCGTTGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TTTAGAACAA-------A
gi|35 : TCTCCGC--TACACAGTTGCACCCCTT-TTATTGTC------------ACGG---TAACAC---GA
gi|36 : GCCTC-AC--CACACAGTTGCG--CCTT-TT-TTGTC------------ACGG---AAGCAA---GA
gi|37 : tagCAA-------AGAACA------CAGTTCAA-CCGTGTTTTGTGATCT
gi|4 : CGTCTC-AC--TACACAAATACGACCCTT-TT-TTC--------------GCGG---TCACAT---GATTCTTACGCT-T---AAAAAACAA---GGCCTAT----GCA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC--AAATGGTTCATAGTAGTTGTG-ATTTCTTGCTGGGGATGGGTAGAGCAAAA-GTTGGTTTAGC---ATATACT-GCCATAAGACATCACT-----GGTG-TTAAAAAAAAGTGACTTTT-ATAGGAATTAAAC--AT--ATGCATG------TATTTATGAGCTTTTGAGGA-T-TTC--TTTTT-T-C--AAA----ATAT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACCTTCTT-TTT---AAA----GA-A-ATC--A-A-CGTGCTCAACCTATCAGTTATTGTTCATT----TTT-------------ATGTGG---G--TAAA-TTCCTGCT---AAG-A-A--------------A----------------A-A--A------------A--------------------A-----TA-------TA--------------------TATATAAATAATGCTTTGTGGAAT--TCT-T----TTT--T---ACTATGGACATCCTAGAATTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACG------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
gi|5 : TCTC-AC--TACACAGTTACGACCCTT-TT-TTCCCC-----------ATGG---TAACAT---GATTCTTACACT-TA--AAAAAA-AA---GGCCTAT----GTA-------ATTTAGTTTTGACA-A--TTTTC-AAAATGGTTCATAGTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGC---ATAAACT-GCAATAAGACATCACA-----GGTG-TT--AAAAAAGT--TTTTT-------TTTTA--------------G------GATTTATGAGCACTTGAGGA-T-TTC--TTTTT-C-A--AAA----C-AT-----------------CTCAGGG-TGTCACTGCACC--CTCTTTT---AAAAAACAA-A-AAC--A-ACC-TGGTCAACCTACAAGTTATTGTGCATT----TTT-------------ATGTGG---ATATACA-TACCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------T-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAA--TC--T----TTTTAT---ACCACGGAAATCTTAGACCTTA-TTTTA-TATAGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAGACCT
gi|6 : GTCTC-AC--TACACAATTATGCCCCTT-TT-TTTC-------------ATGG---TAACTT---GATACTTACGCT-T---AAAAAA-AAAAAGGCCTAT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TGTTC-AAAATGGTTCATATTGGTTGTG-ATTTCTTGCTGCAGTTGAGTAGAGCAAAA-GTTGGCATAGCAT-ATATACT-GCAATAAGACATAACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTTT-ATAGGA-TTTAAC--AT--GTGCATG------AATTTATGAGCATTTGAGGA-C--------------------------AT-----------------TT-------------GCACC--CTC-TTT----AA----AA-A-AAC--A-AGC-TGGTCAACCTACCAGTTATTGTGCA-T----TTT-------------ATGTGG---GTATAAA-TTCCTGCT---ATG-A-AAAAAAAATACTTAAA----------------A-A--A------------A--------------------A-----T--------TC--------------------TT--------------TGTTGAATTATT--T----TTT--T---ACCATGGAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-TATGGAACAA-------AGAACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGAG
gi|7 : GTCTC-AC--TACACAGTTGCACCCCTT-TA-TCGCC------------ATGA---TAACAT---GATTCTTGCACT-T---AAAAAA-A-----TCTTAT----TTA-------ATTTGG-TTTGAAATA--TTTTCAAAAATGGTTCAAAGGGGCTGTG-ATTTCATGCCGCAGATGAGTAGAGCAAAA-GCCAGCATAGA---ATATACT-GCAAAAAGACATCACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTGT-ATAAGATATTAAC--AG--ATGCATG------TATTTATGAGCACTTGAGGA-C-TT---TTATT-A-A--AAA----A-AT-----------------CTGAAGG-TGTCACTGCA-C--GTC--------------------------------ATCAACTTACCAGTTATTGTGCATG----TTG-------------ATAAGC---CGATACA-TTCCTGTT---ATG-A-A--------------A----------------A-AAGA------------A--------------------A-----T--------TCATGTGCTTTAAAATAGATTCTA--------------TGTGGATT--AT--T----TTT--T---AATGTGGATAT-------CTTG-TTTCA-CACAG---------------ACA------AAATTCAA-CTGTGTAGTGTGACC
gi|8 : GTCTC-AC--TACACAGTCGCGCCCCTT-TT-TTGTC------------ACGG---AAGCAA---GAATCTCGTTCT-T---------------GTCATAT----ATG-------A----GTT--GAAATA--TTTTC-AAAATGGT--------GCTGTG----TCTTGTAGCTGGTCAGTAAAACAATA-GATGGCATTGC---ATATACT-TCAACAAGACATCACT-----GGTA-TT---AGGAAGTGTCGTGT-ATAGGATTTTAAC--AG--GTGCACG------TA--TAT------------A-C-TTCCGTTTTC-G-A--AAAGAATA-AT-----------------CTTAAAG-TGTCACTGCACT--GTC-TTT----AA----AA-A-AAT--A-A-C-TTGCCAACCTACCAATTAGTGTGCATT----TTT-------------ATGTAT---GGATACA-TTCCTGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------ATACAAAACTTTTTATATAAGA-----T--------TA--------------------TA--------------TGTGGAAA--CG--T----TGT--T---ACCGTGAAAATCCTAGACCTTA-TTTTA-CATAGAACAA-------AGAACG------AAATTCAG-CTGTGTAGTGAG
gi|9 : TCTC-AC--TACACAGTTACGCCCATT-TT-TTCAC------------ACGG---TATTCTTTCGATTCTTTCGCT-T---AAAAAA-AA---GGCCTTT----GTA-------ATTTGGTTTTGAAATA--TTTTC-AAAATGGTCTATAGTGGTTGTG-ATTTCTTGCCGCAGATGCTTAGAGCAAAA-GTTTGCCTAAA---ATACACT-GAAATTAAACATTACT-----GGTG-TT--AAAAAAGTGACTTGT----GGACTTT
gi|9 : cACTTGTGGA-C-TT---TTTTT-C-A--AAA----A-TT-----------------CTCAGG--TGTCACAGCACC--CTC-TTTT--AAA----AA-C-AAC------C-TGGTCAACCTACCAGTTAAGGTGCATT----TCA-------------ATGTGG---TTATACG-TTCATGCT---ATG-A-A--------------A----------------A-A--A------------ATACTAAAAAA----------A-----T--------TC--------------------TA--------------TGTGGAAT--TC--T----TTT--TTT-ACCATGGAAATCCTCTACCTTA-TTTTA-TATAGAACTA-------AAGACA------AAATTCAA-CTGTGAAGTGAAACCTttttcaaaaattctcaggtgtcacagcaccctcttttaaaaacaacctggtcaacctaccagttaaggtgcatttcaatgtggttatacgttcatgctatgaaaaaaatactaaaaaaattctatgtggaattctttttttaccatggaaatcctctaccttattttatatagaactaaagacaaaattcaactgtgaagtgaaacct
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