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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                tgccacagaaaagttatgaggatgcaaaaacaatacaatgcatgtgcctagttatttttaaatgaataattttgtaagtcgtagtgatatgatgaagcataacactacataccagtgctatttataattgattttcctattacactc---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTT--CAA-TAAAT-TTCCGT-CTTAAAG-TATT---GTA-ACATGAACATTTAAT---GATGAAATGATATTCATCTTCAATATCTC---GATT-----TCT-ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTGCAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTAATTTTACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT----AAAAACATTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTGTTCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTA--C-CAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA--------TT-TGTACATAACTTTTAATAAT-ATATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---TGAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTTA-CTATATC-CCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTGGCAAGC-GAT--TTT-CGG-CTTGACTTTTATCTTTTTA---CAGTT---AATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAA-AGCTTTACCA-AC-TAGGTGTTC------T--TGATTAAGAGCAAAAGT-TCCTGTATAGTTAAAAACTG-TCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCAAT-----TGATTTCCATTATAAGTAAAACATTCGT--TTGGCAAT-ATTCT----TCCACGCTTTCG--AAACACCATAACT-TTAGTTTTTTGTGCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTA-----TG----AATTTAACAAATTTA---AGCTG---TTCTGTA-AGTTTTCTGGTGAGTC--ACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCT-ATCTTCA---A-AC-----CCGACAAAACACTGTCC-TG--TAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAA-TCCAAC--TGCATAT-TCAAAAAAATCAG---A----GTAGCT-GTTGCAAGCCTTGACACACGATTTAACCTTATT--A--TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT-A---CCCGATATAATTTT-AACCATAATCCA-TTT-CGA-TAAAT-ACTATCAAATGCCTTTTT-A---AAATCTACAAAAACA-CAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATAT--TTT-TGTACAA-T---AGTGTATAACACAAACAAA---GTATCAGTAGTTGATTTTCCTT---TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGAAACTATGCTATTCTTTTCACA--GTA-----TGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATT------ATTTACA-TCACA--TTTA--TCCCCTTTTTTATGTAATGG----TATTAC--AACTCCTTCCGTCCATTTATCAGGGAA---AAAGCCACT--A---TCTAGA----ATT-----GCATT----AAA-AATA-TC-ACACA--GATGAGAGGCTAAAATGTCA-ATGCTTTCT--ATGAAATATTCA-TTAATt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttcaaacgtccaatgttacacTTGACACAA------ACTGTCTT--A--TTAATTGGCCGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAACCC-TCGA---GCTTATATAATTTC-CACTATAACGCATTTT-TTATAAACTGA--GTCAAaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CA-TTT-CTATAATCTAA--ATCAAATGCTTTTTT-TAAAAAATGTATAAAGGCG-CAAAAC-ATCT----TTTT-TTACTA-T-TAAAAAT--TCTATTTATAA-T---A----G-AGTGCAAA-ACAATTACG-CAACCTTTA-----CCTT---GTCTAAATCCAAATTG--A
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aatatgaaccaaattcCTGATTA--AGATTA-TTCCCCTATAGTT------AT-ATCG---ATCGTCTGG--TGATTTTTTTTGTGTACTGG----TATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTT-CGGAA---AAGTTT-TACAG---TTTAAT----ATT-----CTATT----AAATATTC-TCTCTA-ACGTAGGTGC---TATTATGTtggtctgataacaaatgcttttcctctgtccaattacgaagtcaactgtccaaaatttgagaaaatattttttttaaaaatact
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT
Unaligned ( gi|16 ): GTTAACTTGTAACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTGTTTTCACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGAGTACCAGTTTT
Unaligned ( gi|17 ): ATTAAACCCTGGCCATTTATCAGAGAAAATTATCGAGACTTGCATTAAAAATGTCAAAAATATGTGATAAATTGCATATTAATACTGTTTA
Unaligned ( gi|20 ): AACAAAACTCTGTTTTCACCAATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTATAGC






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---CA-TT--CACATGTCAGTTATCAGAANATAAATAACATGTATAACATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCGGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCTACGTCTAATAGCAAAAGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGNCTGCANCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-NCTCTTACGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGANATTCATCTTCNATATCGCCGGAATTA---ATTCT---ACAATAACGT---TCA-CGTCTCTCNACTCG---TGTTC--TTN-CGTANC----CG-CCGGTTTCGATNTTTAAGCT-ATGTGATGACAATC-T-AATCTNG-CAAATGCAAGTTNCGAAGNCGNCTTGTACTAAACANATCNAAATANTTTNCGTAACCAAACTNTAACTTN-ACCNNTTTATATANANNCAGCACTCGGNTNCTNTNNANGTCAGNCGTACCAGCTTTGANNAAANTCGTCNACCAAGCGTTGTCT----GAAC-AAAGACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTGTTCCTT----GTTGATTCCANACNNANGCGAATCCATNNCGNCNCAGTAGACGTTTGACGTGTTTTGTCAACCAACACTNTTTAACCACAGCTNTANCANNNGTCATANGACAAGTAGTGAATTATGTANATAACTTTTAGCAATAATGTTGTCNGNNTTNANNANCTTGGNCCAGTATTTNANNATNCNAACATATCTNNNATATGTACAAGGGGTATCTANCTAACTCTCCATANACACCNACATTACATGNNGNNTTAGTTCTAACATTNAGNANANATTTACAGNATTTCAAGNGNGTNCNTCCGATTTCCTTNNATTNAANNANATNACCCANATTTCGNAGGCGTANCCNAGAGTCGAGCCNACAAAGGCATCAAATAACTG--AAGC-GACAGTTT-A-GGTT-CGAC-T-AT-ATTTATTTAN---TATTTGCNAGTAAAACGTTTAATGCTTTAAGACCCTTTCC-----TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AATAGTTACCGGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCGTTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTAAAAGTCCAATTTTCATC-GNCANTCA-TNT-ACCCCGTTTT--CGAAATAC-AN-AACT-TTAGTTTTA-GCAGTATTCACCTCTAACCCCCAATTTTCACAATA---------ATAATTTAAAAGATTAATACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAATATCACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAAAAT-AGCGTNATGTCATCCAA-NTTCA---C-ACAGTT--CGA------ACTGTTC-CGCAAGTATAGCTCTAGATCTTCNAAATACAGTGAAAACAANANC---GGAGAAATTACTTCCCCTTGTTTTAAACCGATCGCACAT-TCAAAAAAA-TCGGAG-AGGCT-TTCACAGC-CCTTGACACACGNTTTNACCNT-TT--A-TACATGTCNCGAATGATTNNNAACATTTTACCATTAACAC-CT--A---TCGTATATAATTTTAAACCATAANCCA-TTTCGATTAAATAA-ATCAAATGCTTTTTT---NAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCNGT-ATTTT-TTANTATT-CATAAATTTT-TGTATAATG---GAANT---NAGTACAAA--TATTGCATCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCANANACGACATTATTNTTTTCGNANCA-ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTGAANATCTTNGATAAACAACTNACTAANNTTATACCCCTATAATTA-TTANCG-TCGTCCTNGTCATTTTT----TTTATATANTGGTATNACNA--CCCCNTCGGACCA--NTTATCGGGAAAAGNTCCAGAATTNAAAATTCCATTA---AAAA---TATCNACA-AGATGTGCG-GCCA--ATATGTCACANGA-TTCAA-TAAAATATTCATTTAGTA-TATTATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGATGA-GGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAACCAAATTCCA-TTTCTATAATCTAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAAC-ATCT----TTTT-TTACTATT-AA-AAATTCTATTTATAATA---G--------AGTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAAATGCTTTTCCTCTGTCCA-ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTTA-T-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCA--GTGCTTCGGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTA-----ACGTAGGTGCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTA-TGAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gCGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-CTCGA---GCTTATATAATTTC-CACTATAACGCATTTTTTATAAACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttgacacaaactgtcttattaattggcCTTGTA----ACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTGTTTTC-ACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gttaaGGCCA--TTTATCAGAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AAAA---TGTCAAAA-ATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                         attaaaccctA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTG---ACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTC-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGT-AACCTAA-AAAATGCAA--TACGAACACGTCTTGTACTAAATAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTATCTTA-ACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATATTTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATA---ACTGTCACCCA--ATTTTTTAATC-C--CTTT-TCACTT-TC---TG-CAAG-AGTGCGTT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTACTTGTAGTT---GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTTAGTTACAC--CCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTG--AAGC-GATGATTT-AGGGCT-TAAC-TCAT-ATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTC-ATCCTTTAAGAACTTTGTCACACATAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATT-GTCATTTACTTT-ACCCCTTTTT--CTAAAAACGAA-AACT-TTAGTTTTA-TATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATTAA---C-ACATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGCCAATCGCA-ATATCAAATATG-TCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTT--G-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC--A---TCATATATAACTTT-AACCATAAAGCA-TTTCTATTAAATGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATT-TATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAA--GGCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGAAATAATATTGTTGCGTTCGCACCA-ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATTG-TCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCA--ATCCTCTGGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AAAA---TGTCTGTA-ATATGTGCA-GATA--ATATGTCACATGA-CGAAA-TAAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAACAT-TTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT------TCT---ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-T-AATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTAATTTT-ACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT---------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTGTTCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTA--C-CAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA--------TT-TGTACATAACTTTTAATAATA-TATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---TGAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTTA-CTATATC-CCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTGGCAAGC-GAT--TTT-C-GGCT-TGAC-T-TTTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTACCAAC--TAGGTGTTC------T-T--GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAACATTCGTTTGGCAATAT-TCT-TCCACGCTTT--CGAAACACCAT-AACT-TTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTA---------TGAATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTAT-CTTCA---A-AC---C--CGACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATCCAACTGCATAT-TCAAAAAAA-TCAGAG-TAGCT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATT--A-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT--A---CCCGATATAATTTTAA-CCATAATCCA-TTTCGAT-AAATACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATATTTT-TGTACAATA---GTGTA---TAACACAAA--CAAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGAAACTATGCTATTCTTTTCACAGTA--TGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATTA-TTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCA--TTTATCAGGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AAAA---TATC-ACACAGATGAGAG-GCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTA-TGAAATATTCATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CA--TATAT----ATATATATAA-AACATA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATATATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTATTAAAATATTTCCTATTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATAAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGACTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAGAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAATGAAATTCGTCTTCTATATCACCAGAATTA---CATCTTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTG-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGGCAACCGT-AACCTAG-CAAATGCAA--TACGAAGACGTCTTGTACTAAATAAATTAAAATAGTTTGCGTAACCAAACTGTAACTTA-ACTTCTTTATATAAAATCAGTACTCTAATACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTGAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----A--AAGGGTTATATCAT--gtaggtcaccagcaaaggctttatttttctttaaacattttatacatttttctatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttcaaaagaacaattagttgaattaaaatcataaccattacaaaaagtctcagcatcagcatttggtgcgcttggcaacttctcattaagattagaaaaataatcataaaaagcttcattactaatattattacttttactagatttattttttttgaaaaaagctttcaaaaatcttttggtttaccaagacgtaatctttcaatatctttaattgttttatatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaagaaaaACAC-TCGAATACA-TCTAAT-AGACTGTTCAT-GC-GTTTTACGCACAATTTGACCTCGTT--A-TACATAGAACGAATTAGTGCGAATAGTTAACAGTCAATAC-CT--AATTTC----ATCAGTTTAAACCACAAGCAA-TAACGATTTAGTAA-ATCATATGCTTTTAG---ATAATCCACGAAGCAACAGTACAA-------TTTC-TTCTTATTACATAAATGCT--GTTCAATGAGTGAGTT---CAATATAAA--TATTGCATCCACGGT--ACTAT-AATTAGGTTTAAAACTAAATTGCAAGTCCGTTAGA-ATGTCATT-TTGT----GAAGAACATTTT-TAA-ATGCTCATTTAATATATCGGAAAAAAGCTTTGCAAAGCAGCTTATTAATGTTATTCCCCTGTAATTAATTGG-----GTCC-GATGATTCTCCTCGTTTATATAGTGGTATAACAA--CGCCAGTAGACCATGACAAT--GGAAATGTTTGAGTATTTAAAATATGATTAGTTAATA---TTTCCAAA-GAATG---A-GCTATGATTTGT-ATAT---TTCCCTTGAAATATTCATATAAAA-TATTATC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                       ttcaaacgtccaatgttAGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGATGA-CGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGATTT-C-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT
Unaligned ( gi|20 ): AACAAAACTCTGTTTTCACCAATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTATAGC






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGNTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATCGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAANGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-NCTCTTATGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGAAATTCGTCTTCTATATCGCCGGAATTA---ATCT---ACAANAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTN-CGTATC----CG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTNG-CAAATGCAA-TTNCGAANNCGTCTTGTACTAAACATATCTAAATANTTTTCGTAACCAAACTGTANTTTN-ACCANTTTATATATANNTAACACTCGGCTNCTTTCNATGTCAGNCGTACCAGTTTTGANTAAANTCGTCCACCAAGCGTTGTCT----GAAC-AAAGACA--TTAACAAAGCTTTTATCAT-ATCGNTGTTC-TT-----GTTGATTCCATACGTACGNAAATCCATNTNCGTNCAATAAATATTTAATAT---TTGTCA-CCAACACTTTTTAACCCCTTT-TCACTN-TCAT--GACAAG-AGTG-G-TT-CGTAAATAGCCTTTAACAATAATATTGTCAGTGTTAANNATTTTNANCCAATATTTNATAATNCTAACATATCTGNNA-ATATACAANGGGTATCTACCTAATTCTCCGTAAACACCCGCATTAC-T-GTAGTT--AGTTCTAACATTNAGNACGTATTTACAAAATTTTAAGTGNGTTCTTTCGATTTCTTTAGATTT-AGNTANA-CCCCANATTTCGNAGGCGTAATTAAGAATCGAGCCTACAAAGGCATCAAACAACTGAAGC-GA-CGA-TTTAGGGCTTAAC-T-ATATTTNTTTAN---TATTNGCTAGTAAAACGTTCAATGCTTTAAGANCCTTNCCA----TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AANAGTTACCNGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTANAAGTCCAATTTTCATCGCCNTTT-ANNN-A-------CCCCGTTTT--CGAAATAC-AA-AACT-TTAG-TTTTAGCAGTATTCACCTCTAGNCCCCANTTTTCACAGTANT---------AATNTAAAAGATTAANACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAANATNACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGAATAAGCGTNATGTCATCCAAGTTC-A-GC-ACAGTTT--GA------ACTATTCGCGCAAGTATAGCTCCAGATCTTCNAAANACAGTGAAAACANTANC---GGCGAAATTACCTCCCCTTGTTTTAAAC---CAATNGCACAT-TCAAAAAAA-TCGGAGTAGGCT-TTCACANC-CCTTGACACACGATTTCACCTTGTTA-TACATGTCTCGAATAATTCNNAACATTTTACCATTAACAC-CT-A---TCG-A---TATA-ANTTTAAACCATAANCCA-TTTCGAT-A-A-A-TAA-ATCAAATGCTTTTTT---AAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCG----TTTT-TTANCATT-CATAAATTTT-TGTACAATG---GAATTN---AGTACAAAN--ATTGCGTCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCAGA-NACGATATTATTNTTTTCGANNCA--ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTAAAAANCTTNGATAAACAACTGACTAANGTTATNCCCCTATAATTA-TTANCG-TCGTCCTGGTCATTTTT----TTTATGTANTGGTATNATAA--CCCCNTCNGACCAATTATCA--GGAAAANTTCCAGAATTNAAAATNNCATTA---AA-AATNTCNANAAGATGTGNAGCTA--ATATGTCACANGA-TTCNAT-GAAATATTCATTTAGTA-TATCATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGATGA-GGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAACCAAATTCCA-TTTCTAT-A-ATC-TAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAACA-TCT----TTTT-TTACTATT-AA-AAATTCTATTTATAATA---GA--------GTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAA-ATGCTTTTCCTCTGTCCA--ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTTA-T-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTTC--GGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTAACGTAGGT-GCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTAT-GAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTATTTCCTTGTTTCTGGAAAAA----ATATATC--TTTTTTATTATATGTTTATAGTTTTAGTATTGCTTTGTCCAACAGCAAAATATTCCACA-ATAAATTT-----AC-TTAAC-AAGTTACATGTTTACTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gTTGACACA-AACT--GTCTTATTA--AT-TGGC-CGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-C------TCG-AGCTTATATAATTTCCACTATAACGCATTTTTTAT-A-A-ACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTGTA----ACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTGTTTTC-ACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gttaaCTGGCCATTTATCA--GAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AA-AATGTCAAAAATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           attaaaccA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTG--ACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTC-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTAA-AAAATGCAA-T-ACGAACACGTCTTGTACTAAATAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTATCTTA-ACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATA-TTTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATAA---CTGTCA-CCCA-ATTTTTTAATCCCTTT-TCACTT-TC-T--G-CAAG-AGTGCG-TT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTAC-TTGTAGTT---GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTT-AGTTACA-CCCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTGAAGC-GA-TGA-TTTAGGGCTTAAC-TCATATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTCA-TCCTTTAAGAACTTTGTCACACATAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATTGTCATTT-ACTTTA-------CCCCTTTTT--CTAAAAACGAA-AACT-TTAG-TTTTATATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATT-A-AC-ACATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGC---CAATCGCA-ATATCAAATATG-TCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTTG-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC-A---TCATA---TATA-ACTTTAA-CCATAAAGCA-TTTCTATTA-A-A-TGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATT-TATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAAG--GCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGA-AATAATATTGTTGCGTTCGCACCA--ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATTG-TCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCAATCCTCT--GGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AA-AATGTCTGTAATATGTGCAGATA--ATATGTCACATGA-CGAAAT-AAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAACAT-TTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT-----TCT---ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTAATTTT-ACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT---------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTGTTCCTT-----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTACCAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA---------TT-TGTACATAACTTTTAATAATA-TATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---T-GAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTT-A-CTATATCCCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTG--GC-AAGCGA-TTTTCGGCTTGACTT-TTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTACCAAC--TAGGTGTTC------T--T-GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAA----CAT--TCGTTT-GGCA-ATATTCTTCCACGCTTT--CGAAACAC-CATAACT-TTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTATG---------AATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTATCTTC-A------AACCC--GACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATC---CAACTGCATAT-TCAAAAAAA-TCAGAGTA-GCT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATTA-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT-AC--CCG-A---TATA-ATTTT-AACCATAATCCA-TTTCGAT-A-A-A-TACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATATTTT-TGTACAATA---GTGTAT---AACACAAAC--AAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGA-AACTATGCTATTCTTTTC---ACAGTATGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATTA-TTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCATTTATCA--GGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AA-AATATCACACAGATGAGAGGCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTAT-GAAATATTCATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CA--TATAT----ATATATATAA-AACATA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATATATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTATTAAAATATTTCCTATTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATAAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGACTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAGAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAATGAAATTCGTCTTCTATATCACCAGAATTAC--ATCTTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTG-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGGCAACCGTAACCTAG-CAAATGCAA--TACGAAGACGTCTTGTACTAAATAAATTAAAATAGTTTGCGTAACCAAACTGTAACTTA-ACTTCTTTATATAAAATCAGTACTCTAATACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTGAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----A--AAGGGTTATATCAT-gtaggtcaccagcaaaggctttatttttctttaaacattttatacatttttctatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttcaaaagaacaattagttgaattaaaatcataaccattacaaaaagtctcagcatcagcatttggtgcgcttggcaacttctcattaagattagaaaaataatcataaaaagcttcattactaatattattacttttactagatttattttttttgaaaaaagctttcaaaaatcttttggtttaccaagacgtaatctttcaatatctttaattgttttatatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaagaaaaTTCAAACGTCCAATGTTACAC-TCGAATACA-TCTAA-TAGACTGTTCAT-GC-GTTTTACGCACAATTTGACCTCGTTA-TACATAGAACGAATTAGTGCGAATAGTTAACAGTCAATAC-CT-AATTTC-------ATC-AGTTTAAACCACAAGCAA-TAACGAT-TTA-G-TAA-ATCATATGCTTTTAG---ATAATCCACGAAGCAACAGTACAA-------TTTC-TTCTTATTACATAAATGCT--GTTCAATGAGTGAGTTC---AATATAAAT--ATTGCATCCACGGT--ACTAT-AATTAGGTTTAAAACTAAATTGCAAGTCCGTTAGA-----ATGTCATTTTGT--GAAGAAC-ATTTT-TAA-ATGCTCATTTAATATATCGGAAAAAAGCTTTGCAAAGCAGCTTATTAATGTTATTCCCCTGTAATTAATTGG-----GTCC-GATGATTCTCCTCGTTTATATAGTGGTATAACAA--CGCCAGTAGACCA--TGACAATGGAAATGTTTGAGTATTTAAAATATGATTAGTTAA-TATTTCCAAAGAATG---AGCTATGATTTGT-ATAT---TTCCCTTGAAATATTCATATAAAA-TATTATC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGATGA-CGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGATTT-C-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT
Unaligned ( gi|20 ): AACAAAACTCTGTTTTCACCAATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTATAGC






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGNTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATCGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAANGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-NCTCTTATGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGAAATTCGTCTTCTATATCGCCGGAATTACATCT---ACAANAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTN-CGTATC----CG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTNG-CAAATGCAA-TTNCGAANNCGTCTTGTACTAAACATATCTAAATANTTTTCGTAACCAAACTGTANTTTN-ACCANTTTATATATANNTAACACTCGGCTNCTTTCNATGTCAGNCGTACCAGTTTTGANTAAANTCGTCCACCAAGCGTTGTCT----GAAC-AAAGACA--TTAACAAAGCTTTTATCAT-ATCGNTG-T-T--TT----GTTGATTCCATACGTACGNAAATCCATNTNCGTNCAATAAATATTTAATAT---TTGTCA-CCAA-ACTTTTTACCACCTTT-TCACTN-TCAT--GACAAG-AGTG-G-TT-CGTAAATAGCCTTTAACAATAATATTGTCAGTGTTAANNATTTTNANCCAATATTTNATAATNCTAACATATCTGNNA-ATATACAANGGGTATCTACCTAATTCTCCGTAAACACCCGCATTAC-TGTAGTT--AGTTCTAACATTNAGNACGTATTTACAAAATTTTAAGTGNGTTCTTTCGATTTCTTTAGATTT-AGNTANA-CCCCANATTTCGNAGGCGTAATTAAGAATCGAGCCTACAAAGGCATCAAACAACTGAAGC-GA-CGA-TTTAGGGCTTAAC-T-ATATTTNTTTAN---TATTNGCTAGTAAAACGTTCAATGCTTTAAGANCCTTNC----CA--TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AANAGTTACCNGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTANAAGTCCAATTTTCATCGCCGTTT--AA-NGA-------CCCCGTTTT--CGAAATACAACAACTTTAG-TTTTAGCAGTATTCACCTCTAGNCCCCANTTTTCACAGTA---------NTAATNTAAAAGATTAANACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAANATNACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGAATAAGCGTNATGTCATCCAANTTC-A-G-C-ACAGTT--TGA------ACTATTCGCGCAAGTATAGCTCCAGATCTTCNAAANACAGTGAAAACANTANC---GGCGAAATTACCTCCCCTTGTTTTAAAC---CAATNGCACAT-TC-AAAAAAATCGGAGTAGGCT-TTCACANC-CCTTGACACACGATTTCACCTTGTTA-TACATGNCTCGAATAATTCNNAACATTTTACCATTAACAC-CT-A---TCG-A---TATA-AGTTTAAACCATAANCCA-TTTCGA-TA-A-A-TAA-ATCAAATGCTTTTTT---AAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCG----TTTT-TTANCATT-CATAAATTTT-TGTACAATG---GAATT---NAGTACAAAN--ATTGCGTCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCAGA-AACAATATTATTNTTTTCGATNCA--ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTAAAAANCTTNGATAAACAACTGACTAANGTTATNCCCCTATAATTA-TTANCG-TCGTCCTGGTCATTTTT----TTTATGTANTGGTATNATAA--CCCCNTCNGACCANTTATCA--GGAAAANTTCCAGAATTNAAAATNNCATTA---AA-AATNTCANAAANATGTGNAGCTA--ATATGTCACANGA-TTCNAT-GAAATATTCATTTAGTA-TATCATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGATGA-GGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAACCAAATTCCA-TTTCTA-TA-ATC-TAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAACA-TCT----TTTT-TTACTATT-AA-AAATTCTATTTATAATA---GA--------GTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAA-ATGCTTTTCCTCTGTCCA--ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTTA-T-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTTC--GGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTAACGTAGGT-GCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTAT-GAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTATTTCCTTGTTTCTGGAAAAA----ATATATC--TTTTTTATTATATGTTTATAGTTTTAGTATTGCTTTGTCCAACAGCAAAATATTCCACA-ATAAATTT-----AC-TTAAC-AAGTTACATGTTTACTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gTTGACACA-AACT--GTCTTATTA--AT-TGGC-CGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-C------TCG-AGCTTATATAATTTCCACTATAACGCATTTTTTA-TA-A-ACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGTA----ACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTGTTTTC-ACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gttaaCTGGCCATTTATCA--GAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AA-AATGTCAAAAATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           attaaaccA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTC-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTAA-AAAATGCAA--TACGAACACGTCTTGTACTAAATAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTATCTTA-ACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATAT--TTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATAA---CTGTCA-CCCA-ATTTTTTAATCCCTTT-TCACTT-TC-T--G-CAAG-AGTGCG-TT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTACTTGTAGTT---GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTT-AGTTACA-CCCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTGAAGC-GA-TGA-TTTAGGGCTTAAC-TCATATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTC-ATCCTTTAAGAACTTTGTCACACA--TAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATTGTCATTT--ACTTTA-------CCCCTTTTT--CTAAAAACGAAAACTTTAG-TTTTATATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATT-A-A-C-ACATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGC---CAATCGCA-ATATC-AAATATGTCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTTG-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC-A---TCATA---TATA-ACTTT-AACCATAAAGCA-TTTCTATTA-A-A-TGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATT-TATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAAG--GCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGA-AATAATATTGTTGCGTTCGCACCA--ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATTG-TCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCAATCCTCT--GGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AA-AATGTCTGTAATATGTGCAGATA--ATATGTCACATGA-CGAAAT-AAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAACAT-TTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT---TCT---ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTAATTTT-ACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT---------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTG-T-TCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTACCAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA---------TT-TGTACATAACTTTTAATAATA-TATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---TGAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTT-A-CTATATCCCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTG--GC-AAGCGA-TTTTCGGCTTGACTT-TTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTAC----CAACTAGGTGTTC------T--T-GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAA----CAT--TCGTTT--GG-CAATATTCTTCCACGCTTT--CGAAACACCATAACTTTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTA---------TGAATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTATCTTC-A-------AACC--CGACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATC---CAACTGCATAT-TC-AAAAAAATCAGAGTA-GCT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATTA-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT-AC--CCG-A---TATA-ATTTT-AACCATAATCCA-TTTCGA-TA-A-A-TACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATATTTT-TGTACAATA---GTGTA---TAACACAAAC--AAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGA-AACTATGCTATTCTTTTC---ACAGTATGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATTA-TTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCATTTATCA--GGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AA-AATATCACACAGATGAGAGGCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTAT-GAAATATTCATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CA--TATAT----ATATATATAA-AACATA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATATATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTATTAAAATATTTCCTATTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATAAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGACTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAGAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAATGAAATTCGTCTTCTATATCACCAGAATTACATCTTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTG-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGGCAACCGTAACCTAG-CAAATGCAA--TACGAAGACGTCTTGTACTAAATAAATTAAAATAGTTTGCGTAACCAAACTGTAACTTA-ACTTCTTTATATAAAATCAGTACTCTAATACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTGAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----A--AAGGGTTATATCAT-gtaggtcaccagcaaaggctttatttttctttaaacattttatacatttttctatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttcaaaagaacaattagttgaattaaaatcataaccattacaaaaagtctcagcatcagcatttggtgcgcttggcaacttctcattaagattagaaaaataatcataaaaagcttcattactaatattattacttttactagatttattttttttgaaaaaagctttcaaaaatcttttggtttaccaagacgtaatctttcaatatctttaattgttttatatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaagaaaaTTCAAACGTCCAATGTTACAC-TC-GAATACATCTAA-TAGACTGTTCAT-GC-GTTTTACGCACAATTTGACCTCGTTA-TACATAGAACGAATTAGTGCGAATAGTTAACAGTCAATAC-CT-AATTTC-------ATC-AGTTTAAACCACAAGCAA-TAACGA-TTTA-G-TAA-ATCATATGCTTTTAG---ATAATCCACGAAGCAACAGTACAA-------TTTC-TTCTTATTACATAAATGCT--GTTCAATGAGTGAGTT---CAATATAAAT--ATTGCATCCACGGT--ACTAT-AATTAGGTTTAAAACTAAATTGCAAGTCCGTTAGA-A----TGTCATTTTGT--GAAGAAC-ATTTT-TAA-ATGCTCATTTAATATATCGGAAAAAAGCTTTGCAAAGCAGCTTATTAATGTTATTCCCCTGTAATTAATTGG-----GTCC-GATGATTCTCCTCGTTTATATAGTGGTATAACAA--CGCCAGTAGACCA--TGACAATGGAAATGTTTGAGTATTTAAAATATGATTAGTTAA-TATTTCCAAAGAATG---AGCTATGATTTGT-ATAT---TTCCCTTGAAATATTCATATAAAA-TATTATC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGATGA-CGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGATTT-C-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT
Unaligned ( gi|20 ): AACAAAACTCTGTTTTCACCAATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTATAGC






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGNTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATCGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAANGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-NCTCTTATGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGAAATTCGTCTTCTATATCGCCGGAATTACATCTTTGACAANAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TT-NCGTATC----CG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTNG-CAAATGCAA-TTNCGAANNCGTCTTGTACTAAACATATCTAAATANTTTTCGTAACCAAACTGTA-NTTTNACCANTTTATATATANNTAACACTCGGCTNCTTTCNATGTCAGNCGTACCAGTTTTGANTAAANTCGTCCACCAAGCGTTGTC--TGAA---CAAAGACA--TTAACAAAGCTTTTATCAT-ATCGNTG-T-T--TT----GTTGATTCCATACGTACGNAAATCCATNTNCGTNCAATAAATATTTAATA---TTTGTCA-CCAA-ACTTTTTACCACCTTT-TCACTN-TCAT--GACAAG-AGTG-GTT-CGTAAATAGCCTTTAACAATAATATTGTCAGTGTTAANNATTTTNANCCAATATTTNATAATNCTAACATATCTGNNA-ATATACAANGGGTATCTACCTAATTCTCCGTAAACACCCGCATTAC-TGTAGTT--AGTTCTAACATTNAGNACGTATTTACAAAATTTTAAGTGNGTTCTTTCGATTTCTTTAGATTT-AGNTANA-CCCCANATTTCGNAGGCGTAATTAAGAATCGAGCCTACAAAGGCATCAAACAACTGAAGC-GA-CGA-TTTAGGGCTTAAC-T-ATATTTNTTTAN---TATTNGCTAGTAAAACGTTCAATGCTTTAAGANCCTTNC----CA--TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AANAGTTACCNGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTANAAGTCCAATTTTCATCGCCGTTT--AA-NGA-------CCCCGTTTT--CGAAATACGACAACCTTAG-TTTTAGCAGTATTCACCTCTAGNCCCCANTTTTCACAGTA---------NTAATNTAAAAGATTAANACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAANATNACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGAATAAGCGTNATGTCATCCAANTTC-A-G-C-ACAGTT--TGA------ACTATTCGCGCAAGTATAGCTCCAGATCTTCNAAANACAGTGAAAACANTANC---GGCGAAATTACCTCCCCTTGTTTTAAAC---CAATNGCACAT-TC-AAAAAAATCGGAGTAGGCT-TTCACANC-CCTTGACACACGATTTCACCTTGTTA-TACATGNCTCGAATAATTCNNAACATTTTACCATTAACAC-CT-A---TCG-A---TATA-AGTTTAAACCATAANCCA-TTTCGA-TA-A-A-TAA-ATCAAATGCTTTTTT---AAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCG----TTTT-TTANCATT-CATAAATTTT-TGTACAATG---GAATT---NAGTACAAAN--ATTGCGTCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCAGA-AACAATATTATTNTTTTCGATNCA--ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTAAAAANCTTNGATAAACAACTGACTAANGTTATNCCCCTATAATT-ATTANCG-TCGTCCTGGTCATTTTT----TTTATGTANTGGTATNATAA--CCCCNTCNGACCANTTATCA--GGAAAANTTCCAGAATTNAAAATNNCATTA---AA-AATNTCANAAANATGTGNAGCTA--ATATGTCACANGA-TTCNA-TGAAATATTCATTTAGTA-TATCATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGATGA-GGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAACCAAATTCCA-TTTCTA-TA-ATC-TAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAACA-TCT----TTTT-TTACTATT-AA-AAATTCTATTTATAATA---GA--------GTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAA-ATGCTTTTCCTCTGTCCA--ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTT-AT-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTTC--GGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTAACGTAGGT-GCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTA-TGAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTATTTCCTTGTTTCTGGAAAAA----ATATATC--TTTTTTATTATATGTTTATAGTTTTAGTATTGCTTTGTCCAACAGCAAAATATTCCACA-ATAAATTT-----AC-TTAAC-AAGTTACATGTTTACTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gTTGACACA-AACT--GTCTTATTA--AT-TGGC-CGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-C------TCG-AGCTTATATAATTTCCACTATAACGCATTTTTTA-TA-A-ACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGTA----ACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTG-TTTTCACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gttaaCTGGCCATTTATCA--GAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AA-AATGTCAAAAATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           attaaaccA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TT-CCGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTAA-AAAATGCAA--TACGAACACGTCTTGTACTAAATAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-TCTTAACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTC--TGAA---CAAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATAT--TTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATA---ACTGTCA-CCCA-ATTTTTTAATCCCTTT-TCACTT-TC-T--G-CAAG-AGTGCGTT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTACTTGTAGTT---GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTT-AGTTACA-CCCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTGAAGC-GA-TGA-TTTAGGGCTTAAC-TCATATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTC-ATCCTTTAAGAACTTTGTCACACA--TAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATTGTCATTT--ACTTTA-------CCCCTTTTT--CTAAAAACGAAAACTTTAG-TTTTATATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATT-A-A-C-ACATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGC---CAATCGCA-ATATC-AAATATGTCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTTG-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC-A---TCATA---TATA-ACTTT-AACCATAAAGCA-TTTCTATTA-A-A-TGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATT-TATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAAG--GCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGA-AATAATATTGTTGCGTTCGCACCA--ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATT-GTCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCAATCCTCT--GGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AA-AATGTCTGTAATATGTGCAGATA--ATATGTCACATGA-CGAAA-TAAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACAAAACTCTG-TTTTCACCA------ATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCGagc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAACAT-TTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT---TCT---ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTT-CC-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTA-ATTTTACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTT--T-------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTG-T-TCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACA---TTTGTTAACCAACACTTTTTACCAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA--------TT-TGTACATAACTTTTAATAATA-TATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---TGAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTT-A-CTATATCCCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTG--GC-AAGCGA-TTTTCGGCTTGACTT-TTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTAC----CAACTAGGTGTTC------T--T-GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAA----CAT--TCGTTT--GG-CAATATTCTTCCACGCTTT--CGAAACACCATAACTTTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTA---------TGAATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTATCTTC-A-------AACC--CGACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATC---CAACTGCATAT-TC-AAAAAAATCAGAGTA-GCT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATTA-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT-AC--CCG-A---TATA-ATTTT-AACCATAATCCA-TTTCGA-TA-A-A-TACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATATTTT-TGTACAATA---GTGTA---TAACACAAAC--AAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGA-AACTATGCTATTCTTTTC---ACAGTATGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATT-ATTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCATTTATCA--GGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AA-AATATCACACAGATGAGAGGCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTA-TGAAATATTCATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CA--TATAT----ATATATATAA-AACATA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATATATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTATTAAAATATTTCCTATTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATAAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGACTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAGAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAATGAAATTCGTCTTCTATATCACCAGAATTACATCTTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TT-GCGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGGCAACCGTAACCTAG-CAAATGCAA--TACGAAGACGTCTTGTACTAAATAAATTAAAATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-ACTTAACTTCTTTATATAAAATCAGTACTCTAATACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTGAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTC--TGAA---CAAAGACA----A--AAGGGTTATATCAT-gtaggtcaccagcaaaggctttatttttctttaaacattttatacatttttctatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttcaaaagaacaattagttgaattaaaatcataaccattacaaaaagtctcagcatcagcatttggtgcgcttggcaacttctcattaagattagaaaaataatcataaaaagcttcattactaatattattacttttactagatttattttttttgaaaaaagctttcaaaaatcttttggtttaccaagacgtaatctttcaatatctttaattgttttatatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaagaaaaTTCAAACGTCCAATGTTACAC-TC-GAATACATCTAA-TAGACTGTTCAT-GC-GTTTTACGCACAATTTGACCTCGTTA-TACATAGAACGAATTAGTGCGAATAGTTAACAGTCAATAC-CT-AATTTC-------ATC-AGTTTAAACCACAAGCAA-TAACGA-TTTA-G-TAA-ATCATATGCTTTTAG---ATAATCCACGAAGCAACAGTACAA-------TTTC-TTCTTATTACATAAA-TGC-TGTTCAATGAGTGAGTT---CAATATAAAT--ATTGCATCCACGGT--ACTAT-AATTAGGTTTAAAACTAAATTGCAAGTCCGTTAG-----AATGTCATTTTGT--GAAGAAC-ATTTT-TAA-ATGCTCATTTAATATATCGGAAAAAAGCTTTGCAAAGCAGCTTATTAATGTTATTCCCCTGTAATTAATTGG-----GTCC-GATGATTCTCCTCGTTTATATAGTGGTATAACAA--CGCCAGTAGACCA--TGACAATGGAAATGTTTGAGTATTTAAAATATGATTAGTTAA-TATTTCCAAAGAATG---AGCTATGATTTGT-ATAT---TTCCCTTGAAATATTCATATAAAA-TATTATC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGATGA-CGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGATTT-C-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGNTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATCGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAANGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-NCTCTTATGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGAAATTCGTCTTCTATATCGCCGGAATTACATCTTTGACAANAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTN-CGTATC----CG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTNG-CAAATGCAA-TTNCGAANNCGTCTTGTACTAAACATATCTAAATANTTTTCGTAACCAAACTNTA-TTTTNACCANTTTATATATACGTAACACTCGGNTNCTTTCNATGTCAGNCGTACCAGTTTTGANTAAANTCGTCCACCAAGCGTTGTCT----GAAC-AAAGACA--TTAACAAAGCTTTTATCAT-ATCGNTG-T-T--TT----GTTGATTCCATACGTACGNAAATCCATNTNCGTNCAATAAATATTTAATAT---TTGTCA-CCAA-ACTTTTTACCACCTTT-TCACTN-TCAT--GACAAG-AGTG-G-TT-CGTAAATAGCCTTTAACAATAATATTGTCAGTGTTAANNATTTTNANCCAATATTTNATAATNCTAACATATCTGNNA-ATATACAANGGGTATCTACCTAATTCTCCGTAAACACCCGCATTAC-T-GTAGTT--AGTTCTAACATTNAGNACGTATTTACAAAATTTTAAGTGNGTTCTTTCGATTTCTTTAGATTTAGNTANA-C-CCCANATTTCGNAGGCGTAATTAAGAATCGAGCCTACAAAGGCATCAAACAACTGAAGC-GA-CGATTT-AGGGCTTAAC-T-AT-ATTTNTTTAN---TATTNGCTAGTAAAACGTTCAATGCTTTAAGANCCTTNCCA----TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AANAGTTACCNGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTANAAGTCCAATTTTCATCGCCGTTTAANG-A-------CCCCGTTTT--CGAAATACGACAACCTTAGTTTTA-GCAGTATTCACCTCTAGNCCCCANTTTTCACAGTANT---------AATNTAAAAGATTAANACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAANATNACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGAATAAGCGTNATGTCATCCAANTTC-A-G-C-ACAGTTT--GA------ACTATTCGCGCAAGTATAGCTCCAGATCTTCNAAANACAGTGAAAACANTANC---GGCGAAATTACCTCCCCTTGTTTTAAAC---CAATNGCACAT-TC-AAAAAAATCGGAGTAGGCT-TTCACANC-CCTTGACACACGATTTCACCTTGTTA-TACATGNCTCGAATAATTCNNAACATTTTACCATTAACAC-CT-A---TC-G-A---TATA-AGTTTAAACCATAANCCA-TTTCGAT-A-A-A-TAA-ATCAAATGCTTTTTT---AAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCG----TTTT-TTANCATT-CATAAATTTT-TGTACAATG---GAATTN---AGTACAAAN--ATTGCGTCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCAGA-AACAATATTATTNTTTTCGATNCA--ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTAAAAANCTTNGATAAACAACTGACTAANGTTATNCCCCTATAATTA-TTANCG-TCGTCCTGGTCATTTTT----TTTATGTANTGGTATNATAA--CCCCNTCNGACCANTTATCA--GGAAAANTTCCAGAATTNAAAATNNCATTA---AA-AATNTCANAAANATGTGNAGCTA--ATATGTCACANGA-TTCNAT-GAAATATTCATTTAGTA-TATCATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGATGA-GGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAACCAAATTCCA-TTTCTAT-A-ATC-TAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAACA-TCT----TTTT-TTACTATT-AA-AAATTCTATTTATAATA---GA--------GTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAA-ATGCTTTTCCTCTGTCCA--ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTTA-T-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTTC--GGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTAACGTAGGT-GCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTAT-GAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTATTTCCTTGTTTCTGGAAAAA----ATATATC--TTTTTTATTATATGTTTATAGTTTTAGTATTGCTTTGTCCAACAGCAAAATATTCCACA-ATAAATTT-----AC-TTAAC-AAGTTACATGTTTACTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gTTGACACA-AACT--GTCTTATTA--AT-TGGC-CGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-C------TC-G-AGCTTATATAATTTCCACTATAACGCATTTTTTAT-A-A-ACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGTA----ACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTG-TTTTCACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gttaaCTGGCCATTTATCA--GAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AA-AATGTCAAAAATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           attaaaccA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTC-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTAA-AAAATGCAA-T-ACGAACACGTCTTGTACTAAATAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-TCTTAACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATAT--TTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATAA---CTGTCA-CCCA-ATTTTTTAATCCCTTT-TCACTT-TC-T--G-CAAG-AGTGCG-TT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTAC-TTGTAGTT---GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTTAGTTACA-C-CCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTGAAGC-GA-TGATTT-AGGGCTTAAC-TCAT-ATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTCA-TCCTTTAAGAACTTTGTCACACATAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATTGTCATTTACTTTA-------CCCCTTTTT--CTAAAAACGAAAACTTTAGTTTTA-TATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATT-A-A-C-ACATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGC---CAATCGCA-ATATC-AAATATGTCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTTG-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC-A---TC-ATA---TATA-ACTTTAA-CCATAAAGCA-TTTCTATTA-A-A-TGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATT-TATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAAG--GCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGA-AATAATATTGTTGCGTTCGCACCA--ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATTG-TCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCAATCCTCT--GGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AA-AATGTCTGTAATATGTGCAGATA--ATATGTCACATGA-CGAAAT-AAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACAAAACTCTG-TTTTCACCA------ATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCGagc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAACAT-TTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT---TCT---ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTA-ATTTTACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT---------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTG-T-TCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTACCAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA---------TT-TGTACATAACTTTTAATAATA-TATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---T-GAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTTA-CTATATC-CCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTG--GC-AAGCGATTT-TCGGCTTGAC-T-TTTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTACCAAC--TAGGTGTTC------T-T--GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAA----CATT--CGTTTGGCA-ATATTCTTCCACGCTTT--CGAAACACCATAACTTTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTATG---------AATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTATCTTC-A-------AACCC--GACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATC---CAACTGCATAT-TC-AAAAAAATCAGAGTAG-CT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATTA-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT-A---CCCG-A---TATA-ATTTTAA-CCATAATCCA-TTTCGAT-A-A-A-TACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATATTTT-TGTACAATA---GTGTAT---AACACAAAC--AAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGA-AACTATGCTATTCTTTTC---ACAGTATGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATTA-TTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCATTTATCA--GGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AA-AATATCACACAGATGAGAGGCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTAT-GAAATATTCATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAAAGGCATCAATTAACTGA--CAGA-CAGTTT-AAGGTTTCA----AT-GTTTATTTACGAGTATTTGCCAGTAAAATGTTTAATGCTTTAAGACCCTTTCCA----T----------------CC-AATTAAGAG-AATAGTTACCGGTATAATTGAAAATAGTGCCCAGATGATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTAAAAGTCCAATTTTCATCACTTTTTAAGG-A-------CCCCTTTTTTTCGAAATACAACAATCTTGCTTTTA-GCAATATTCACCTCTAACCCCCAAGTTTCACAATATT---------AATGTAAAAGAATAATACTATT----TTGCAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAATATCACCATATCATCAGCAAAAAGCATTAAAAAAAT----GTTATGTTATCCAAGTTC-ATGCC-ACAGTTT--GG------A-TCTTCGCACAAGTATAGCTCTAGATCTTCCAAAAACAATGAAAACAACAGA---GGAGAAATTACTTCCCCTTGCTTTAAAC---CGATAGCACAT-TTAAAAAAAATCGGAATAGGAG-TT-ACATC-CCTTAACACATGCTTTCACATT-TGAGTACATGTCACGAATAATTCATAACATTTTAGCATTAACACACA-A---TC-G-A---T-TA-AGTTTAAACCATAAACCA-TTTCGAT-A-A-A-TACTATCACAAGCTTTCTT---AAGGTCTACAAAGGCACAAGCTAAGCGGTCATTTT-TTAATA----ATACTTTTT-TGTATAATG---GAATTA---AGTACAAAT--TTTGCATCAACTGTCGA-----CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCACT-CACAATATTATTACTTTCAATACA--ATTAT-TAATTCGCTTATTTAAATTACCCGTAAATATCTTAGATAAACAACTGACTAAGCTTATACCTCTGTAATTA-TTGACA-TCGTCCGGGTCATTTTT----CTTATAAATAGGCACTATAA--TCGCTTCTGACCAATTATCA--GGAAAATGACCAGAATTGAAAATACCATTA---AA-AATATCAGAAAGATGTGCAGCCA--ATATATCACAAGA-TTCAAT-AAAATATTCATTTAGTA-aatcaaacaatcagaacctgcagacttatttcttttcaatgacttaactgcatttataatttcattaacagtaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CA--TATAT----ATATATATAA-AACATA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATATATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTATTAAAATATTTCCTATTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATAAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGACTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAGAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAATGAAATTCGTCTTCTATATCACCAGAATTACATCTTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTG-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGGCAACCGTAACCTAG-CAAATGCAA--TACGAAGACGTCTTGTACTAAATAAATTAAAATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-ACTTAACTTCTTTATATAAAATCAGTACTCTAATACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTGAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----A--AAGGGTTATATCAT-gtaggtcaccagcaaaggctttatttttctttaaacattttatacatttttctatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttcaaaagaacaattagttgaattaaaatcataaccattacaaaaagtctcagcatcagcatttggtgcgcttggcaacttctcattaagattagaaaaataatcataaaaagcttcattactaatattattacttttactagatttattttttttgaaaaaagctttcaaaaatcttttggtttaccaagacgtaatctttcaatatctttaattgttttatatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaagaaaaTTCAAACGTCCAATGTTACAC-TC-GAATACATCTAA-TAGACTGTTCAT-GC-GTTTTACGCACAATTTGACCTCGTTA-TACATAGAACGAATTAGTGCGAATAGTTAACAGTCAATAC-CT-AATTTC--------ATC-AGTTTAAACCACAAGCAA-TAACGAT-TTA-G-TAA-ATCATATGCTTTTAG---ATAATCCACGAAGCAACAGTACAA-------TTTC-TTCTTATTACATAAATGCT--GTTCAATGAGTGAGTTC---AATATAAAT--ATTGCATCCACGGT--ACTAT-AATTAGGTTTAAAACTAAATTGCAAGTCCGTTAGA-A----TGTCATTTTGT--GAAGAAC-ATTTT-TAA-ATGCTCATTTAATATATCGGAAAAAAGCTTTGCAAAGCAGCTTATTAATGTTATTCCCCTGTAATTAATTGG-----GTCC-GATGATTCTCCTCGTTTATATAGTGGTATAACAA--CGCCAGTAGACCA--TGACAATGGAAATGTTTGAGTATTTAAAATATGATTAGTTAA-TATTTCCAAAGAATG---AGCTATGATTTGT-ATAT---TTCCCTTGAAATATTCATATAAAA-TATTATC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGATGA-CGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGATTT-C-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGNTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATCGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAANGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGATGA-CGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-NCTCTTATGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGAAATTCGTCTTCTATATCGCCGGAATTACATCTTTGACAANAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTN-CGTATC----CG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTNG-CAAATGCAA-TTNCGAANNCGTCTTGTACTAAACATATCTAAATANTTTTCGTAACCAAACTNTA-TTTTNACCANTTTATATATACGTAACACTCGGNTNCTTTCNATGTCAGNCGTACCAGTTTTGANTAAANTCGTCCACCAAGCGTTGTCT----GAAC-AAAGACA--TTAACAAAGCTTTTATCAT-ATCGNTG-T-T--TT----GTTGATTCCATACGTACGNAAATCCATNTNCGTNCAATAAATATTTAATAT---TTGTCA-CCAA-ACTTTTTACCACCTTT-TCACTN-TCAT--GACAAG-AGTG-G-TT-CGTAAATAGCCTTTAACAATAATATTGTCAGTGTTAANNATTTTNANCCAATATTTNATAATNCTAACATATCTGNNA-ATATACAANGGGTATCTACCTAATTCTCCGTAAACACCCGCATTAC-T-GTAGTT--AGTTCTAACATTNAGNACGTATTTACAAAATTTTAAGTGNGTTCTTTCGATTTCTTTAGATTTAGNTANA-C-CCCANATTTCGNAGGCGTAATTAAGAATCGAGCCTACAAAGGCATCAAACAACTGAAGC-GA-CGATTT-AGGGCTTAAC-T-AT-ATTTNTTTAN---TATTNGCTAGTAAAACGTTCAATGCTTTAAGANCCTTNCCA----TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AANAGTTACCNGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTANAAGTCCAATTTTCATCGCCGTTTAANG-A-------CCCCGTTTT--CGAAATACGACAACCTTAGTTTTA-GCAGTATTCACCTCTAGNCCCCANTTTTCACAGTANT---------AATNTAAAAGATTAANACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAANATNACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGAATAAGCGTNATGTCATCCAANTTC-A-G-C-ACAGTTT--GA------ACTATTCGCGCAAGTATAGCTCCAGATCTTCNAAANACAGTGAAAACANTANC---GGCGAAATTACCTCCCCTTGTTTTAAAC---CAATNGCACAT-TC-AAAAAAATCGGAGTAGGCT-TTCACANC-CCTTGACACACGATTTCACCTTGTTA-TACATGNCTCGAATAATTCNNAACATTTTACCATTAACAC-CT-A---TC-G-A---TATA-AGTTTAAACCATAANCCA-TTTCGAT-A-A-A-TAA-ATCAAATGCTTTTTT---AAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCG----TTTT-TTANCATT-CATAAATTTT-TGTACAATG---GAATTN---AGTACAAAN--ATTGCGTCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCAGA-AACAATATTATTNTTTTCGATNCA--ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTAAAAANCTTNGATAAACAACTGACTAANGTTATNCCCCTATAATTA-TTANCG-TCGTCCTGGTCATTTTT----TTTATGTANTGGTATNATAA--CCCCNTCNGACCANTTATCA--GGAAAANTTCCAGAATTNAAAATNNCATTA---AA-AATNTCANAAANATGTGNAGCTA--ATATGTCACANGA-TTCNAT-GAAATATTCATTTAGTA-TATCATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGATGA-GGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAACCAAATTCCA-TTTCTAT-A-ATC-TAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAACA-TCT----TTTT-TTACTATT-AA-AAATTCTATTTATAATA---GA--------GTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAA-ATGCTTTTCCTCTGTCCA--ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTTA-T-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTTC--GGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTAACGTAGGT-GCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTAT-GAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTATTTCCTTGTTTCTGGAAAAA----ATATATC--TTTTTTATTATATGTTTATAGTTTTAGTATTGCTTTGTCCAACAGCAAAATATTCCACA-ATAAATTT-----AC-TTAAC-AAGTTACATGTTTACTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gTTGACACA-AACT--GTCTTATTA--AT-TGGC-CGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-C------TC-G-AGCTTATATAATTTCCACTATAACGCATTTTTTAT-A-A-ACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGTA----ACATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTG-TTTTCACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gttaaCTGGCCATTTATCA--GAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AA-AATGTCAAAAATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           attaaaccA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGATGA-CGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTCG---TGTTC--TTC-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTAA-AAAATGCAA-T-ACGAACACGTCTTGTACTAAATAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-TCTTAACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCAT-CCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATAT--TTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATAA---CTGTCA-CCCA-ATTTTTTAATCCCTTT-TCACTT-TC-T--G-CAAG-AGTGCG-TT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTAC-TTGTAGTT---GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTTAGTTACA-C-CCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTGAAGC-GA-TGATTT-AGGGCTTAAC-TCAT-ATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTCA-TCCTTTAAGAACTTTGTCACACATAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATTGTCATTTACTTTA-------CCCCTTTTT--CTAAAAACGAAAACTTTAGTTTTA-TATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATT-A-A-C-ACATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGC---CAATCGCA-ATATC-AAATATGTCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTTG-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC-A---TC-ATA---TATA-ACTTTAA-CCATAAAGCA-TTTCTATTA-A-A-TGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATT-TATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAAG--GCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGA-AATAATATTGTTGCGTTCGCACCA--ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATTG-TCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCAATCCTCT--GGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AA-AATGTCTGTAATATGTGCAGATA--ATATGTCACATGA-CGAAAT-AAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACAAAACTCTG-TTTTCACCA------ATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCGagc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAACAT-TTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT---TCT---ACAATA-TGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGTA----ACATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTA-ATTTTACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGA-GTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT---------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTG-T-TCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTACCAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA---------TT-TGTACATAACTTTTAATAATA-TATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---T-GAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTTA-CTATATC-CCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTG--GC-AAGCGATTT-TCGGCTTGAC-T-TTTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTACCAAC--TAGGTGTTC------T-T--GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAA----CATT--CGTTTGGCA-ATATTCTTCCACGCTTT--CGAAACACCATAACTTTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTATG---------AATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTATCTTC-A-------AACCC--GACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATC---CAACTGCATAT-TC-AAAAAAATCAGAGTAG-CT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATTA-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT-A---CCCG-A---TATA-ATTTTAA-CCATAATCCA-TTTCGAT-A-A-A-TACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATT-CAAATATTTT-TGTACAATA---GTGTAT---AACACAAAC--AAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGA-AACTATGCTATTCTTTTC---ACAGTATGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATTA-TTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCATTTATCA--GGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AA-AATATCACACAGATGAGAGGCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTAT-GAAATATTCATT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGATGA-CGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGATTT-C-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC


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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT






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Reference ( family-61 )       :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAG---CA-ATACAT----ATATATATAA-A---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGNTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATCGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAANGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAANTTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTANAAATTTAAACATACTTGGA-TGACGTA-TATAANAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATANGCA-GAACAAATTAA-GATAAAACGAAATTCGTCTTCTATATCGCCGGAATTACATCTTTGACAANAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTC---GTGTTC--TTN-CGTATC----CG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTNG-CAAATGCAA-TTNCGAANNCGTCTTGT----AA-CATATCTAAATANTTTTCGTAACCAAACTNTA-TTTTNACCANTTTATATATACGTAACACTCGGNTNCTTTCNATGTCAGNNNNCCAGTTTTGANTAAANTCGTCCACCAAGCGTTGTCT----GAAC-AAAGACA--TTAACAAAGCTTTTATCAT-ATCGNTG-T-T--TT----GTTGATTCCATACGTACGNAAATCCATNTNCGTNCAATAAATATTTAATAT---TTGTC-ACCAA-ACTTTTTACCACCTTT-TCACT-NTC--ATGACAAG-AGTG-G-TT-CGTAAATAGCCTTTAACAATAATATTGTCAGTGTTAANNATTTTNANCCAATATTTNATAATNCTAACATATCTGNNA-ATATACAANGGGTATCTACCTAATTCTCCGTAAACACCCGCATTAC-TGTAG--TTAGTTCTAACATTNAGNACGTATTTACAAAATTTTAAGTGNGTTCTTTCGATTTCTTTAGATTTAGNTANA-C-CCCANATTTCGNAGGCGTAATTAAGAATCGAGCCTACAAAGGCATCAAACAACTGAAGC-GA-CGATTT-AGGGCTTAAC-T-ATATTTNTTTAN---TATTNGCTAGTAAAACGTTCAATGCTTTAAGANCCTTNC----CA--TAG----CC------T-CC-GATTAAGAG-AANAGTTACCNGTATAATTAAAAATAGTGCCCAGATAATTAAAATCATTCACTACTTCTA--AAGGTTGATT---ATTANAAGTCCAATTTTCATCGCCGTTTAA-NG-A-------CCCCGTTTT--CGAAATACGACAACCTTAG-TTTTAGCAGTATTCACCTCTAGNCCCCANTTTTCACAGTA---------NTAATNTAAAAGATTAANACTATT----TTGTAGATCAGTC-GGGTT-TTTACCTAANATNACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGAATAAGCGTNATGTCATCCAANTTCA-GC-A-CAGTT--TGA------ACTATTCGCGCAAGTATAGCTCCAGATCTTCNAAANACAGTGAAAACANTANC---GGCGAAATTACCTCCCCTTGTTTTAAAC---CAATNGCACAT-TCAAAAAAA-TCGGAGTAGGCT-TTCACANC-CCTTGACACACGATTTCACCTTGTTA-TACATGNCTCGAATAATTCNNAACATTTTACCATTAACAC-CT--ANCGNATATAAGTTTAAACCATAANCCA-TTTCGA-TA-A-A-TAA-ATCAAATGCTTTTTT---AAAATCTACAAAGGCACAANACAAGCN----TTTT-TTANCATTN-ATAAATTTT-TGTACAATG---GAATT---NAGTACAAAN--ATTGCGTCAACNGTCGACTTT-CCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AG--CGTCAGA-AACAATATTATTNTTTTCGATNCA--ATTAT-TAATNCGCTTATTTAAAATACCGGTAAAAANCTTNGATAAACAACTGACTAANGTTATNCCCCTATAATT-ATTANCG-TCGTCCTGGTCATTTTT----TTTATGTANTGGTATNATAA--CCCCNTCNGACCANTTATCA--GGAAAANTTCCAGAATTNAAAATNNCATTA---AA-AATNTCANAAANATGTGNAGCTA--ATATGTCACANGA-TTCNA-TGAAATATTCATTTAGTA-TATCATC
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gi|10                         : aagattcaagattcaaataattctattcagtaatttaaacatataatgtttctcataacatacaaattcaaataataaatgcaacaaatgacacgtaggtaatagacatacatgtataatcaataatggtagattcaattaaattatatatatgatgttatctaaatatatttttataaaaaaaaatttgaggttggacaaatagaaataacctatttaacacactttgtcattatatacctgagtagatcaacacaaatagatcatagatgaaaacatttatgcattttgattatactaaaatttacgagcaccaaaagcttggtaaaaatattacgaagatttaataaaactgaatacttcttacattgcattaacttaTTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAAGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTGTTAAACTATTTCCTAGTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTATTTAAC-TTCAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATATTTGGA-TGAGGTA-TATAAAAAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GTTCTTATGA-CAgtcaccagtaaagactttatttttctttaacctttttatactatttaccatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttaaaaaaaaacaattagttgaactaaaatcatagtcattacaaaaagtctcagcattatcacttgatgcgcttgacaacttcttattaaaattagaacaataatcataataagcttaattactaatatcatacttttactagattttttttaatttgaaaaaagcttcaaaaaatcttcttttttttttattttttttttttattttgtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGAACCAAATTCCA-TTTCTA-TA-ATC-TAA-ATCAAATGCTTTTTTTAAAAAATGTATAAAGGCGCAAAACA-TCT----TTTT-TTACTATTA-A-AAATTCTATTTATAATA---GA--------GTGCAAAACAATTACG-CAAC------CTTTACCTT--GTCTAAATCCAAATTG--AT--GGTCTGATAACAA-ATGCTTTTCCTCTGTCCA--ATTAC-GAAGTCAACTGTCCAAAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aataCTGATTAAGATTATTCCCCTATAGTT-AT-ATCGATCGTC-TGGTGATTTTT----TTTGTGTACTGGTATTATAATGCCCCGT--GACCAGTGCTTC--GGAAAAGTTTTACAGTTTAATATTCTATTA---AATATTCTCTCTAACGTAGGT-GCTA--TTATGTTTAAAGT-TTCTA-TGAAGTATTCGTttgagaaaatattttttttaaaaatact
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atTATTTCCTTGTTTCTGGAAAAA----ATATATC--TTTTTTATTATATGTTTATAGTTTTAGTATTGCTTTGTCCAACAGCAAAATATTCCACA-ATAAATTT-----AC-TTAAC-AAGTTACATGTTTACTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gTTGACACA-AACT--GTCTTATTA--AT-TGGC-CGTATGATTATCAATATGTTGCCATTAAC-C-CTCGAGCTTATATAA-TTTCCACTATAACGCATTTTTTA-TA-A-ACTGA-GTCAAttcgattcatgagaaataagacactgacttgaat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTTGT----AA-CATGTCTAAATACTTTTCATAACCAAACTCTG-TTTTCACCAATTTATATATCTGCAACTCTTGGCTTCTTTCTATATCAGAGTACCAGTTTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gttaaCTGGCCATTTATCA--GAGAAAATT-----ATCGAGACTTGCATTA---AA-AATGTCAAAAATATGTG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           attaaaccA--TATTCTATTATCTTCAAT-TTTTACAGTTTCTCGTTATAAAAGACCCA-GT---T----ATATATACAA-A---TAGTTTACACATTTCAGGTATTAGAataaattgcatattaatactgttta
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATATTATTGGTACTGCTACATTTAATAGCACAAGTTTCTGCA-AGAAATTTGCTTAAA-TGAACGAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CATATACATTTATATATATATAACA---TA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATGTATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGATATACTAAATCATCAATGAGTGTTAAAATATTTCCTAGTCGCCAGAAAAACAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATTAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAATGCTTCCACA-ATTAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGTCTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAATATACTTGGA-TGACGTA-TATAAAAAC-TGCA----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAACGAAATTCGTCTTTTATATCACCAGAATTACATATTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTC---GTGTTC--TTC-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGACAACCGTAACCTAA-AAAATGCAA--TACGAACACGTCTTGTACTAAA-TAAATTAAGATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-TCTTAACTTCTTTATATAAAATTAGTACTCTGTTACTATGAAGGTCAGCCATCCAATTTTAAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----AA-AATGC----ACCGTGATTGTTGATAT--TTAACGGTTCATTCCATATGTACATAAAACCATGTGTGTTCAACAAATATTTAATAA---CTGTC-ACCCA-ATTTTTTAATCCCTTT-TCACT-TTC---TG-CAAG-AGTGCG-TT-CGTAAACAGTCCTCAA-AATGATATTGTCAGTGTTAATTATTTTCAGCCAATAGTTAATAATCCTAACAAATCTGCCA-ATATATAATGGGTATCGTCCTAATTCTCCGTAAACACCTGCATTACTTGTAG--TT-GTTTTTACCCCCAGGATGTGTTTGCAAAAGTGTAAGTGGGTTCTTTCTATTTCTTTAGATTTAGTTACA-C-CCCACATTTCGCAACCATAATTAAGAATTGAGGCTACAAAAGCGTCAAACAATTGAAGC-GA-TGATTT-AGGGCTTAAC-TCATATTTTTTTAA---TATTGGAAATTAATACATTC-ATCCTTTAAGAACTTTGTCACACA--TAG----CC------TGCT-GGTTTAGAC-AAAAATACCCCGTATAATTAAAACTAATACCCAAATAATTAAAGTCATCAACTACTTCAAGTAAG--TAATC---ATTATAATACCATTTCTCATTGTCATTTACTTT-A-------CCCCTTTTT--CTAAAAACGAAAACTTTAG-TTTTATATGTATTCACCTCTAGACCCCATTCTTCACAGTAATTATTGACATAATTTAAAAAATTAAAAGAAATGAAATTGTA-AGCTGTCTGGACT-CGAACCTACAAGAACCATATCATCGGCAAAAAG---TAAAAGGATAAGAGTTATATCATTTAATATTA-AC-A-CATTTTCTGA------ACTATTT-TGCAAATAAAGCTCCCGGTCTTCAATAAATAGTGCAAACATTATC---GGCGAGATTATCTCCCCTTGTTTAAGGC---CAATCGCA-ATATCAAATATG-TCTGAG-AACCT-TCCACAGT-GTTTGACACAAGATTTCACTATGTTG-TACATTGCTCGAATAATTCTTAACATTTTACCATTGATAC-CC--ATCATATATAACTTT-AACCATAAAGCA-TTTCTATTA-A-A-TGA-ATCAAAAGCTTTTTT---TAAGTCTATAAATGCACAATACAAACG----TTTT-TTATCATTT-ATAAATTGT-TCCACGAT------ATTTTGCAGTATAAAG--GCAGCGTCAACTTTTGATTTT-CCTT--TTCTGAACGTAAACTG--AG--CATCAGA-AATAATATTGTTGCGTTCGCACCA--ATTAT-TGAGACGCTTATTTACCACACTCGTAAAAAGTTTCCCCAAGCTGCTTACAAGAGTAATTCCCCTATAATT-GTCAACG-TTATCCTTATCGCCCTT----TTTATGTAATGGTATAATTA--CCCCATTGGTCCAATCCTCT--GGAAAAATTCCTGAATTAAAAATTATATTA---AA-AATGTCTGTAATATGTGCAGATA--ATATGTCACATGA-CGAAA-TAAAATATTCATTTAATA-TATCATC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGAAATAAACGTATATTATTAACTTAAGC-TGTTACAGTTTCTCG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        t---GTTCTATGAATTTAAACATACTTGGGTTTTCGTA--ATAATAACGTTC-----AATAAAT-TTC-CGTCTTAAAG-TATT---GTAA-CATGAAC-ATTTAATGATGAAATGATATTCATCTTCAATATC-TCG--ATT---TCT---ACAAT-ATGT---ACAGTATCTTTCGGCTCGAGGTATTCGGTTC-C-TACCAAAACGACCCGTTTGGATGTGTAAATT-GTGAGAAGACAGTC-TAATCTTG-CAAATATAAGTTCTTAAGTCAACTTGT----AA-CATATCTAAATACTTTTCATAACCAAATTCTA-ATTTTACCAATTTATATATATGTAACACTTGGTTTCTTTCTATATCAGAGTACCAGCTTTGATAAAAATTATCAACCAAACGTTGTTT---------AAAAACA--TTAATAAAGCTTTTATCAT--TTGCTG-T-TCCTT----GTTGATTCCAAACAAAAGCGAATCCATTTTGGCATAATAAATGTTTAACAT---TTGTTAACCAACACTTTTTACCAGCTAT-GCAATCGTCATATGACAA---------TT-TGTACATAACTTTTAATAAT-ATATTGTCTGTGTTTAACAACTTAAACCAATATTTTAAAATTCTAATATATC-GAGATATGTACAAAGGGTATCTAGCTAATTCTCCATAAACACCAACATT---TGAAGTTTTAGTTCTAACATTAAGAACAGATTTACAGTATTTTAAGTGAATACGTTCAATTTCCTTTGATTTA-CTATATC-CCCAAATTTCAGAGGCATATCCTAAAATCGAACCTACAAATGCATCAAACAATTG--GC-AAGCGATTT-TCGGCTTGACTT-TTATCTTTTTAC---AGTTAATTAACAGAACATTCAATGCCTTTAAAGCTTTAC----CAACTAGGTGTTC------T--T-GATTAAGAGCAAAAGTT-CCTGTATAGTTAAAAACTGTCCCCAAGTAATTAAAATCATTTACAACGTCCA--A---TTGATTTCCATTATAAGTAAAA----CAT--TCGTTTGG-CA-ATATTCTTCCACGCTTT--CGAAACACCATAACTTTAGTTTTTTGT-GCATTAACTTCTAGACTCCACTTTTTACAGTA---------TGAATTTAACAAATTTAAGCTGTT----CTGTAAGTT-TTC-TGGTGAGTCACCAAGGATAACCATATCATCAGCAAAAAG---TAAAAGTATTAACACGATATCATCTATCTTCA-------AACC--CGACAAAACACTGTCC-TGTAAAAATAGCTCCAAATCTTCAAGATACAGTGAAAACATTATT---GGCGACATTATCTCCCCTTGTCGTAATC---CAACTGCATAT-TCAAAAAAA-TCAGAGTA-GCT-GTTGCAAG-CCTTGACACACGATTTAACCTTATTA-TACATATCTCTAATAATTTTTAAAATGTTCCCACTTATAC-CT--ACCCGATATAATTTT-AACCATAATCCA-TTTCGA-TA-A-A-TACTATCAAATGCCTTTTT---AAAATCTACAAAAACACAATA-AAGCC----TTTTGTTATCATTC-AAATATTTT-TGTACAATA---GTGTA---TAACACAAAC--AAAGTATCAGTAGTTGATTTT-CCTT--TCCTAAATCCAAACTG--AG--AATCCGA-AACTATGCTATTCTTTTC---ACAGTATGATACAATCCGTTTGTTTAAAATAGTGGTGAAAATTTTTGATAAACAACTAACAAGTGTGATACCTCTATAATT-ATTTACA-TCACATTTATCCCCTTT----TTTATGTAATGGTATTACAA--CTCCTTCCGTCCATTTATCA--GGGAAAAAGCCACTATCTAGAATTGCATTA---AA-AATATCACACAGATGAGAGGCTA--AAATGTCA-ATGCTTTCTA-TGAAATATTCATT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TATTTTATTAACTTAAAC-TGTTACAGTTTCTCGTTACAAAAA---CA--TATAT----ATATATATAA-AACATA-TT--CACATGCCAGTTATCAGAATATAAATAACATATATAATATTATTTCAGATTGTATATTTTTGTA-TGTTATT-AGA-TGT-ATTAAATATACTGAGGATGAACTTCAAACTATGAGTTACTCAATCATTAATGAGTATTAAAATATTTCCTATTCGCCAGAAAAATAAAATATATTGGTATTTTATTATATGTTTATATTATAAGTAATGCCACGTCTAATAGCAAACGCTTCCACA-ATGAATTTACTTAAC-TTAAC-AAGTT-CAAATTTATTTATTGACTGCAGCA---GTGCTAGAAATTTAAACATACTTGGA-TGACGTA-TATAAAGAC-TGCG----AATAAAT-TTG-GCTCTTATGA-CATT---ATATGCA-GAACAAATTAG-AATAAAATGAAATTCGTCTTCTATATCACCAGAATTACATCTTTGACAAAAACGT---TCA-TGTCTCTCTACTC---GTGTTC--TTG-CGTATC----TG-CCGGTTTCAATCCTTAAGCT-ATGTGATGGCAACCGTAACCTAG-CAAATGCAA--TACGAAGACGTCTTGTACTAAA-TAAATTAAAATAGTTTGCGTAACCAAACTGTA-ACTTAACTTCTTTATATAAAATCAGTACTCTAATACTATGAAGGTCAGCCATCCAATTTTGAGTAAATTCGTCCACCAAGTGTTGTCT----GAAC-AAAGACA----A--AAGGGTTATATCAT-gtaggtcaccagcaaaggctttatttttctttaaacattttatacatttttctatttctgacacagtaattggcatatcgagttcttcaaaagaacaattagttgaattaaaatcataaccattacaaaaagtctcagcatcagcatttggtgcgcttggcaacttctcattaagattagaaaaataatcataaaaagcttcattactaatattattacttttactagatttattttttttgaaaaaagctttcaaaaatcttttggtttaccaagacgtaatctttcaatatctttaattgttttatatt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaagaaaaTTCAAACGTCCAATGTTACAC-TCGAATACA-TCTAA-TAGACTGTTCAT-GC-GTTTTACGCACAATTTGACCTCGTTA-TACATAGAACGAATTAGTGCGAATAGTTAACAGTCAATAC-CT--AATTT-CATCAGTTTAAACCACAAGCAA-TAACGA-TTTA-G-TAA-ATCATATGCTTTTAG---ATAATCCACGAAGCAACAGTACAA-------TTTC-TTCTTATTACATAAA-TGC-TGTTCAATGAGTGAGTT---CAATATAAAT--ATTGCATCCACGGT--ACTAT-AATTAGGTTTAAAACTAAATTGCAAGTCCGTTAG-----AATGTCATTTTGT--GAAGAAC-ATTTT-TAA-ATGCTCATTTAATATATCGGAAAAAAGCTTTGCAAAGCAGCTTATTAATGTTATTCCCCTGTAATTAATTGG-----GTCC-GATGATTCTCCTCGTTTATATAGTGGTATAACAA--CGCCAGTAGACCA--TGACAATGGAAATGTTTGAGTATTTAAAATATGATTAGTTAA-TATTTCCAAAGAATG---AGCTATGATTTGT-ATAT---TTCCCTTGAAATATTCATATAAAA-TATTATC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                        AGAAGAAG--AA--TA-------AG---AAATGTATTACAGTTTCTTGTAACAAA-G---CA-ATACA-------A-ATATAA---------T--CACATGTCAGTTATCAGAAAATAAATA---TGT-TA-CACTTTTTTA--------ATTTTTGTACTATTATCCAAACTGTTATTAAA-------AG--T---CGTCAAATCCTGAGG---------ATAAATTTGTGTTGAAATATTTCACAG--GCCAGAAAA-TAA----TATCATTATTCTAAAACATATTCATACGAGTAGTTATACTACGCCTGATAGCAAAAGCTTCCACA-ATAAATGTTCTTATA-TGAAC-AAGCT-CAACTTAATTTGTTGACTACATCA---GTGTTTAATACCTTATCAAACTTCGA-TGACGGA-TACACAAAC-TACG----AATACAT-ATT-TCTCTTATGG-CATT---ATATGCaaatgaaccagctttgttagtaccttacaatttggaagaaattggaatatgtaattcactaaaaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaagaGCTTC-AGATATGAATTGACT-AATATTAAT-GAGTT-CTGTTTAAGTTATT-TTTACATCAAAAGTGATTTAAACTTTAACATATTCGGA-TTTC-TAGTATAATAGC-TGCG----A--AAATATTGTTTTCTTATGT-CATT---GTAAGCT-GAAC-ATTTAA-GATAAACCAAAATTCATCTTCGATATC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): AAGATTTAAGATTCAAATTCTTTATTAAGTAATTTAAACATATAATTTTTCTCATTATATACACATTCAAAAAATAAATGTAACACATGACATACTGATAATAGATCAATATTATGTTATATTCTATTCAATTAGAAAATTACGTTATTTAAGTACATATATTTTAATAGTTTCTGAGGTTGGACACATATAAATTAAACATTTAAATACTTTGTCAAATACATACTTGAGTAGATCAACACAAAAAGATAGATGTATATATTATATATTTTGATTGTACAAGGAATTGCGAACACTAAAAACTTGATGAATAAACTTACAAAAAATTAAGAAAGATTAATTCTTCTTACTTTGCATTAACTCTATGAGTTTTATCATAGTTGGCCATTTATAATAATATGATTTAATAGAGCTTTAACGGATATCCTGATAACTAAGACATATTAACACAAAATGATATGCATCTTCTATGTTGTTAAAGTTACATAGAGTGCTTTAATGCAAGTTACGTTCAATTCTGTTTTGTGCATAACAACCGGTTTCAACTTTCAACTGATATGAAAATAATCTTAATCTTGACATAGGAATTCTTAATTTTCTTGGAAGCATATTTAAATAATTTTCAAATTCTAAAGTAGTCTTTAACATTTTATAAGTACAAAGTGAACGACTGTTTTCGATTTTATTAAACCATTTTTGTTTAAAGTACTCTCTCTTTAAAAATAATATGGAAGTGTAACAAATTTGAATAATCAGTAATTGACTATATATACGAAATTCCATAATCTTCCAATAGGTTTGAGATGTTTTTTACACAATTCTTACTACTTTTATTTCAATCAATAGGTAATGAATTATATAAATATTTAACTATAATGTTAGAATAAGACTACAAATT
Unaligned ( gi|12 ): CAATAGAAATATAAGTTTGAGTATTTACAATATGATTAAAACGTATTTCTAAAGAAAACGCTATGGCATGTATATTTTCCTTGAAATATTCATATAAAATATTATCAAATGAACAAGCTTTAAGTATCTAGCAATTTGGAAGCTGCAGTTATTTTTGAAATGGAAATTGGAATATCTATTTTTAAAAAT
Unaligned ( gi|20 ): AACAAAACTCTGTTTTCACCAATATCTGTAACATTTGGATTCTTTCTATAGC