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Reference ( gi|1 ) : GAGGCCCTCCCAGGGGGAGGGGGGG----------------TC-----CCTGTTCTCTGGATCTCTTAAAGTAA-TGCCTATTGTTCCCAAGATCTCCAAAA-----------------GTA----TTTG----CCAAAGTTCCCCA--------AAAGTATTTTGTCCA-TGTTCCCCAGATCTCTAAAA----GT--A-TTTCCACTGTTCCCTAGATCTCCAAAAGT-TTTAAAC-ATATTTCC-------CTGAAAGTA----CCAAATAG---TGTT-TCCTTAAGTAAAACGTCTACTATAATCTTCTCTATTATTATTTACACATCATCATAACAAGCAAAATCCATGTACTGTCTTCTTTTCCTTGTTTAAAATATCTATGGTCTATGGCTTTAACTTTCAGAGAAAAGGTGTTTTTTAAGTTTCCTTAAAAAAAGTGCTTGTAAGCCCTGTGGCAGGGAGCATTTGTGGTTCAATCACGCTGGTTCAAGAACTTCAAGAGTTTGTGGTTATACAAATGCTGTGCGAGTTTGGATAAGATTGTTTGAAAAATGTGGGGGATGCTATAGCTTCTACAAGAAAAAGGTGAACGGATGGACGACGGACAATTTACCACGACATAAGCCCTGCTGGCCTTTGGCAAGTAGAGCTAAAGAAAATATCGATGGAAGG--A---CAGAAGAGACAAAAAAATTGAACAGCTGAACGGTTGATTTACAAAAGGCAATAAATACACATAAATGATTATAAAAACACATAAATAATTGACTTTATTGTGTAAACACGATT---TAAT---AAAAAAGTAGATGACGAGTGGGATTGAACACCAGTCCTTACGATCCGAAATCGACGATATTAACCAC------TGCACTATTCTGCCT-TTACTCATCAGTACTGTAAATATATCTTTGGTCGGAATTACCATCCAAAATTTATTTCAGGTACATACGATTATGGGATGAAG-------TTGTGCAGGGTCCCAGACTAACACGTAAGAAACCTCCAAAGCTGTCATAAGCTGTTTCAAGAAGTCGACATCTCATTTTAAAAGTAAAATATGATCAAGTATAAAAATTATACATAAAATCAGTGACTTAATTACAGAGACTGGCAGGCTAATAGCAATATAATGTCCACGGCACTTTTAGTATTTCTATAATAACTCTTCGAATCTTGGTCTGAATTTAACAATTTTGGTGCCAAAGTAAAGCTGATAAAAATGATGACCAATTCCAATTA--TCAAT-----TATTAAATATT--TTTCTTCTGAATTTAAATTATTACGGATTGAAATCGAAATATGTTGAAATTTCACGAAAAAAAAAAAAAGATTTTTAAACAAAAAACGGTAGTCTTGATTTAACAAATACCATGTACGTTTAAACAAAACACAATAAAAAATAGAAATATT--AGGTAGAAAG-ATGAAGCA--GTAAGTTTTCCATCGGTGGCGAAAGTTTCATATTGATATTTATTGAAGT-CGTTTTTCT-----TATTTCTTATTTC---AAAAATGGGCTAAAAAAGAGAAAACGATCACACAAAAA-AACT------TTAAGAGTAAAATTC-TTCATTTCTTTAAA--TTTGAAAA------------A--GAAAAA-AATAATC-TCCC-------------AA-TC-AAGCCTTTTCTTTTGATACCATAATCACA-AAATTATGTTGT---TTGATTCTGGAAGATGTGTGTTTCCATGATTTAGAAAACGCCACGTGATCTAGTGGTAAAGCACCGAACCCGTGATCGGAGGGTCGTGGGTATTTCAAACCTTCGCCACGACTATGT-GTGGTGTCCTTGAGCAAGACACTTTTTCCACATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAGGAAGACTTCGAGCGTG--ATTTTTCTAAGTCGAAAGAACTTGTTTCAAAATCGAAGTAAAATAAATAAGTTCAAACTA--AACTA-GA--AAAA-GCTAAAATGTGCCACCTGAAATTTAG-A-CAAGTGCCTCCA-G----TTGCCTATCTCTGTTTATATGTCTCTGATAAAATTGATCAAA-TA-----AGGTACTTTTTTTCATTAAGGACAATATCCC-TAGATCTCTAAAATTA-G-GCCT-TTGATCCCTGGAT-CTCTGAAAGTAAT--GGCCAATGTTCCCCAGA------TCTCTGAAAATAAATGG-CCA-TGTTCTCCA---GATCTCTAAAAC--------CC-CCGGGAGGGCCTCA
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Reference ( family-536 ) : GAGGCCCTCCCAGGGGGGGGGG----------------GGGTC-----CCTGTTCCCTGGATCTCTTAAAGTAA-TGCCTATTGTTCCCCAGATCTCCAAAA-----------------GTA-TTTG--CCAAAGTTCCCCAAAAGTATTTTGTCCA-TGTTCCCCAGATCTCTAAAA----GT--ATTNCCACTGTTCCCTAGATCTCCGAAAGT-TTTAAACATAGTTCCCTGAAAGTACCAAATAGTGTTTCCTTAAGTAAAACGTCTACTATAATCTTCTCTATTATTATTTACACATCATCATAATAAGCAAAATCCATGTACTGTCTTCTTTTCCTTGTTTAAAATATCTATGGTCTATGGCTTGAACTTTCAGAGAAAANGTGTTTTTTAAGTTTCCTTAAAAAT-GTGCTTGTAAGCCCTGTGGCAGGGAGCATTTGTGGTTCAATCACGCTGGTTCAAGAACTTCAAGAGTTTGTGGTTATACAAATGCTGTGCGAGTTTGGATAAGATTCTTTGAAAAATGTGGGGGATGCTATAGCTTCTACAAGAAAAAGGTNAACGGATGGACGACGGACAATTTACCACGACATAAGCCCTGCTGGCCTTTGGCAAGTAGAGCCAAAGAAGATATCGATGGAAGG--A---CAGAAGAG-ACAAAAAA-TTGAACAGCTGAACGGTTAATTTACAAAAGGCAATAAAT--------------------ACACATAAATAATTGACTTCATTGTGTAAACGCGATC---TAAT---AAAAAAGTAGATGCCGGGTGGGATTGAACACCAGTCCTTACGATCCGAAATCGACGATATTAACC------ACTGCACTATTCTGCCT-TTACTCATCAGTACTGTAAATATATCTTTGGTCGGAATTACCATCCAAAATTTATTTCGGGTACATACGATTATGGGATGAAGTTGTGCATTGTGCAGGGTCCCAGACTAACACGTAAGAAACCTCCAAAGCTGTCAAAAGCTGTTTCAAGCAGTCGACATCTCATTTTAAAAGTAAANTATGATCAAGTATAAAAATTATACATAAAATCAGTGACTTAATTACAGAGACTGGCAGGCTAATAGCAATATAATGTCCACGGCACTTTTAGTATTTCTATAATAACTCTTCGAATCTTGGTCTGAATTTAACAATTTTGNTGNCAAAGTAAAGCTGATAAAAATGATGACCGATTCCAATTA--TCAAT-----TATTAAGTATTT-TTTCTTCTGAATTTAAATTATTACGGATTGAAATCGAAATATGTTGAAATTTCACGAAAAAAAAAAAAAGATTTTTAAANAAAAAACGGTAGTCTTGATTTAACAAATACCATGTNCGTTTAAACAAAACACAATAAAAAATGGAAACATT---AG-TA-AAAGCACGAAGCA--GNAAGTTTTCCATCGGTGGCGAAAGTTTCATATTGATATTTATTGAAGTCGT-TTTTCT-----TATT-TCTTATTTTAAAAATGGGCTAAAAATGAGAAAATNATCACACAAAA--A-AACTGTTAAGCGT-AAAATTC-TTCATTTCTTTAAA--TTTAAAAA------------A--GAAAAA-AATAAT-C-T------CCA-------AATCNAGCCCTTTCTTTTGATACCGTAATCACAAAAAT-ATGTTGT---TTGATTCTGGAGGATGTGTGTTTCCATGATTTAGAAAACGCCACGTGGTCTAGTGGTAAAGCACCGAACCCGTGATC-G-AGGGTCGCGGGTATTT-CAATCCTTCGCCACGACTATGTGTNGTGTCCTTGAGCAAGACAC-TTT-T-CCGCATATGCTTAGTAC-T--G-TTATACCCAAGAAGACTTCGAG---CGTG--ATTTGTCTAAGTCGTAAGAACTTGTTTCAAAATCGAAGTAAAATAAATAAGTTCAAACTA--AACTA---GAAA--AAGCCAAA----ATGTGCCACCTGAAATTNAGA-CAAGTGCCTCCAG----TT-GCCTATCTCTGTTTATATGTCTCTGATAAAATTGATCAAAT------TAGGTACTTTTTTTCATTAAGGACAATATCCC-CAGATCTCTAAAATT-------AGGCCT-------TTGATCCCTGGATCTCTGAAAGTAATGGCCAATGTTCCCCAGA------TCTCTGAAAATAAATGGCCATGTTCTCCA-GATCTCCAAAACCCCCGGGAGGGCCTCA
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