lowQualScore : 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222 111111 3333333333333333333333 11111111111111 11111111 222222 44444444444444444444444444444444444444 1111111 222222222222222 111 1111 111 22222 333333333333333333333333333333333333333333333333 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2
lowQualScore : 000 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 666 55 3 66666 3 0 44 5 44 1 9 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 1 0 88888888 222222 5 2 7777777777777777777777 2 66666666666666 00000000 66 8888888 111111 555 2 66666666666666666666666666666666666666 99999 4 77 4444444 55 3 666 77777777 555555555555555 44 222 444 1111 2 3 666 11111 3 888888888888888888888888888888888888888888888888 99 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0
lowQualScore : ... ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... .. . ..... . . .. . .. . . ..................................................................................... . . . ........ ...... . . ...................... . .............. ........ .. ....... ...... ... . ...................................... ..... . .. ....... .. . ... ........ ............... .. ... ... .... . . ... ..... . ................................................ .. . .............................................................................. .
lowQualScore : 000 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 444 00 6 55555 6 8 22 0 66 8 3 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7 7 5 22222222 222222 5 4 2222222222222222222222 4 66666666666666 99999999 55 1111111 666666 000 7 44444444444444444444444444444444444444 11111 7 33 1111111 00 6 444 99999999 333333333333333 88 777 777 1111 5 1 888 66666 1 666666666666666666666666666666666666666666666666 00 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAGGC--TTAAATTTTGNNA--ATTAAA---GTTATT--CATNC--G--GAG--GTC--AA------GGTCA-TC---N-AAA-----A-A--TG-CT--GCATGGTTTTG---AGT---A---------------G---TA------A--C------A---------------C-----AACTA--TGGACCAA-AT-----TTGG-GNG-----A--CTN-TAGG--------CCAAACA-GT--TTCTGAGAAAC-G-GAGC-TNA---CA--A--C-AA-AAACTTAA---CG-GT-T-G--TATTC--C---T--GTAT--------TCAT--CCCG---G--G----AGG----GGTCACT-C--ATGG--GA--CT-NA--G-TT----C---------TATCCATNA-CANAACTA--------TGGA----CCA-A--G----------T---T---T---G---G-------------------AAAC--------------------A-----GA------G-CT-----AAA--------------T--------G-------TAAN---A-----------TC----GT---G---CGGG---CTAAGTTATTCATCCATAG--G---AAG-GTCA---AGGT--CA-CC--ACGA-AAAATG-CTGCATGG-TCATATAGAAGAAACAGAGCT-----NA-----G-CACAAA------ACA--TAAC--ATT-TNGTG-GT---T---TTATTTA----NGTCATT-C--AGAGGTNAAG-GTCAAGGTCANCCNGA-AAAA-AATG-CTGCA-TGGTTTTGA-----GTAG------N------ACTACCC-AT------AACA----CAACTA--------TA--GAC-------CAAA-----TTT---G-G------------------------A-A-----------AC-G-G-AGNTTAACGCA--A----TT--T-TG---A---G---AAC--T--ACC-------CATT-ACAC--A---ACT----ATAGAC-CAAA--TTTGGTGACTCTAGGN-CAA-ACAGTTTCTGAGAAACAGAGCT---CAN--C---GC-AA---AA-GCTT------AACATTGAATTGTTGACGC--------CGCCA------CTG--ANAGAAAA-GTA-ACACC--TAT----CT-NTTT-------T-----------AGGCAAGACAATAAA
Reference ( gi|1 ) : TGACGCAAATTGGTAAGGAGGGT---AACATAAAATTTTGGTATAAAATGTGTCATTA--TTTTAACA--ATTAAA---GTTATT--TATCC--G--GAC--GTC--AT------GGTCA-TC---A-AGA-----A-A--TG-CT--GTTTGGTTTTG---AGT---A---------------G---TA------A--C------A---------------C-----AACTA--TGGACCTA-AT-----TTGG-GGG-----A--CTA-TAAG--------CCAAACA-AT--TTTTGATAAAC-G-GAGC-TAA---CA--A--C-AA-AAACTTA----TG-GT-T-G--TATTC--C---T--GTAT--------TCAT--CCCG---GGGG----AGG----GGTCACT-C--ATAA------CT-CA--G-TT----C---------TGCCCATAA-CATAACTA--------TAGA----CCA-A--G----------T---T---T---G---G-------------------AAAC--------------------A-----GA------G-CT-----AAA--------------T--------A-------TAAG---A-----------TC----GT---G---CGAG---CTAAATTATTCATCCACAACAGTT-AAG-GTCA---AGGT--CA-CC--ACAA-AAAATG-CTGCATGG-TCATATAGAAAAAACAGAGCT-----TA-----G-CACAAA------ATA--TAAG--ATT-TGGTG-GT---T---TTATTTA----CGTCATC-C-CAAAGGTTAAG-GTCAAGGTCAACCGGA-AAAA-AATG-CTGTA-TGGTTTTGA-----ACAG------C------ACTACCC-AT------AATA----TAACTA--------TA--GAC-------CAAG-----TTT---G-G------------------------A-A-----------AC-A-G-AGCTTAACGCA--A----TT--T-TG---A---G---AAC--T--AGC-------CATT-ACAA--A---ACT----ATGGAC-CAAG--TTTGGTGACTCTATGA-CAA-ACAGTTTCTGTGAAAGAGAGCT---CAT--C---GC-AA---AA-GCTA------AACGTTGAATTGTGGACAC-----T--TGCCA------TTG--ACAGAAAATGTA-AAACC--TAT----CT-ATTT-------T-----------AGGTAAGACAA-AAACTA
gi|3 : GGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAGGC--TTAAATTTTAATATGAGTAAA---G----------------------GTT--AT------GGTCA-TTT--A-AGATGAAAA-A--T--CG--GCATGGTTTTG---AGT---A---------------G---TC------A--C------ATGACTTCTCATATCAC-----AACTG--TGGACCAA-AT-----TTGG------------TTACTAGG--------CCAAACA-GT--TCTGGAGAAAC-AAGAGT-T-----TA--A--C-AC-AA---T-----TG-AT-TAG--TACT------------AT--------CCATAACACG----------------------ACT-T--ATAATGGA--CT-AA--A-TT----TAG-------TGACCCTGAGCA---------------AGA----C---A--G----------T---T---TCTGA---G-------------------AAGC--------------------A-----TA------G-CA-----AAA--------------T--------GCGAAACCTAAC---A-----------TT----GT---G---CGGT---GTAATTTATTCATCTGTAG-AGTTAAAG-GTC
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatA--TTTTGTGA--GTTAAACTAATTATT--CAT----A--GAG--GTA--AA------GATCC-TC---T-GAA-----A-A--TA-CTCTGCATGGTATTGTATAGT---ACTACCT---------A---TA------A--A------A---------------C-----AGCTA--TAAACC---AT-----TCTG-TG------A--CTG-TAGA--------TTAACCA-GA--TTTTGAGAAAC-A-GAAC-TAA---TG-----T-AA-AAATTTAA---CA-GTGT-G--TATT------------AT--------TCAT--CC
gi|9 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacCA--ATTTAA----TTATT--CATAT--A--G----GTC--AA------GGTCA-TC---T-GAA-----A-A--TATCT--GCATGGTTCAG---ATT---AGTGCTATCT------G---TA------G--C------A---------------C-----AGCTA--TGAACC---AC-----TTGGTGGG-----T--CTA-TA----------CCTAACA-GTGACTTTGaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|6 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgacaactatgaataaaatttggtgactcttgggcaaacagttttgaaaaaaattgacacaaatacttaacatttgtaggc--ATTAA----GTTATT--TTTGC--ATAAAA--GTC--AA------GGTCA-TC---C-AAA-----ACA--TT-CT--TCTTGATTTCA---AGT---G---------------GAACTACCCATTA--C------A---------------C-----AGTTA--TAGACCTATAT--------G-GTG-----A--CTC-TAGG--------TTAAACA-TT--TTCTGAGAAGC-G-GAGC-T-----CA--ATGC-AA-AAAgga
gi|19 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttTTAA-----TTATTCTTATA---A--GAG--GTC--ATTGTTGAGGTCA-TC---C-A-------A-A--TA-CT--CCATTGTTATC---AGT---A---------------G---TTCT----G--C------A---------------C-----AACTA--TGAACCAA-AG-----TTGG-ggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : TAAA-----TATT--CATAT--A--G----GTC--AA------GGTCA-TCTG-A-AG------A-A--TGTCT--GCATCATTTTG---AGT---ACCGTAGTTACTACACA---TA------A--C------A---------------C-----AACTA--TAGA-CTA-AT-----TTGG-TGG-----
gi|2 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagcAA---GTTGTT--CATCT--G--AAAAGGTC--AA------GATCAGCC---A-AAG-----G-G--TT-TT--GCATGGTTTTG---AGTTGAA---------------C---TA------A--CCATTACA---------------C-----AACTA--CAGACC-A-AA-----TTAG-GCA-----ATTCTA-TA----------TCAAACA-GT--TTCTGAGGAACAG-GACT-TTA---CAGGA--C-AA-AAACTTA----ctctgggcaactgagt
gi|5 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccAA---GTTAGT--CTTCC--GTAGAG--GTC--AA------GGTCA-CCTG-ACAAA-----A-A--TG-CT--GCCTGGTTTTG---AGT---A---------------T---TG--------------------------------------------------CCA-A-----------GTG-----A--CTC-AAGG--------CCAAACA-AT--TTCTGATAAGT-G-GAGCTTAA---C---G--C-AA-ACACTTA----AC-GT-T-G--Tacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|15 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacTTACC--TATCCCTG--GAT--GTTGAAT------G--CA-TCCAGA-AAA-----A-A--TA-GT--ATATAGTTATG---AGT---A---------------G---TA------A--T------A---------------C-----CATTA------CCCA-AT-------GA-TGGTTTTAA--TTA-CAAGACATTGGACCAAACA-CT--TTCCAAGAAAC-A-GCGC-TTA---AA--A--C-AAAAAACTTgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcatagttttgagtactacccactccaacactatataccaaatttagtgactctaagtcaaatagtttctgagaatcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|16 : --GAG--GTC--AA------GGTCA-TC---C-AGA-----A-AAATG-CT--GCATGGTTTTG---AGT---G---------------GTT-TA------ATTC------A---------------CTATATAACTA--TGGA
gi|13 : taAT--GTC--AA------GGTCA-TCC--A-AGA-----A-AA-TG-CT--GCATGGTTTTG---GGTATAA---------------A---TA------A--CAATTTGA---------------C-----TACTA--TTGACCAA-ATCCAAATTTG-GCA-----T--CTC-TAGG--------CAAAATACA-----CTGAGAAAC-G-GAGC-TCA----A--A--C-AA-GAataagtgttgaattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : catttttaaA-----A-A--AG-CT--GCAAGGCTTTG---AGT---ACCTC-----------A---TA---------C------A---------------C-----AGCAA--TGAACCAA-AT-----TT-G-GTG-----A--CTG-GGGG------------ACA-GT--TTTAAAGAAAC-G-GAGC-tggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|6 : a---TA------A--C------A---------------A-----AGTTAAATGGACCAA-AT-----TT-T-GAG-----A--CTC-CAAA--------CCATATG-GG--TTTTCAGAATC-G-GGGC-TAAATGCA-------AA-AAACATAAT--CT-GT-C-G--TAGGC--CAAGTTAATAT--------TCAT----CA---GCAG----AGGTTAAGGTCAC--CAAATAAATAATGCTGCATGG-TT----TGATTAGTAATACCCATTA-TATAACTA--------TGGG----CCA-A--ATACACTTACTT---T---T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--------------------A-----AA------G-CC-----AAA--------------T--------A-------CAAA---A-----------AC----TT---A----GGGTTATTAAGTTATTTTTGCATA-------AAA-GTCA---AGGT--CA-TC---CAA-AACATT-CTatttttaaacatt
gi|9 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtcca------A---------------C-----AACTA--TGAATAAA-AT-----TT-G-GTG-----A--CTC-TTGG--------GCAAACA-G---TTTTGAAAAA-----AAT-TGA---C---A--C-AA-ATACTTA----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|10 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgA-AT-----TTGG-TGA-----G--CT--TGGA--------CTAAACA-TT--TTCTGA--------AAGC-TAA----A--A--CGAA-AAACTTAACATTGTGT-T-GGTTATTTATT---T--GTATGGTCAAAGTCGT--CCCATAAGGTGCTAAAGA----GGTT--------TGG------AT--A--G-AA----C---------TACCCATTA-CCCAACTA--------CAGA----CCA-A--A----------T---T---T---G---G-------------------ATAC--------------------acatttgtaggccaatttaattattcatataggtcaaggtcatctgaaaatatctgcatggttcagattagtgctatctgtagcacagctatgaaccacttggtgggtctatacctaacagtgactttggga
gi|6 : caTCACTAC--ATGG------CT-TA--GATTAAAAC---------TGTCCATAA-CAAAGTTAAA------TGGA----CCA-A--A----------T---T---T---T---G-------------------AGACTCCAAACCATATGGGTTTTCA-----GAATCGGGG-CT-----AAA--------------T--------G-------CAAA---AAACATAATCTGTC----GT---AGGCCAAG---TTAA--TATTCAT---CAGCAG----AG-GTTA---AGGT--CA-CCAAATAA-ATAATG-CTGCATGG-Ttctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|7 : aaaaA--G-TT----C---------TATCCATAC-CATAGTTAAGTGACACTGGG----CCA-A--A----------TAATT---T---AAAAG-------------------AAAC--------------------A-----GA------G-CT-----GAAACACAAACAAGCAGC--------A-------TAAC---AGT---------TT----GT---GATCTAAG---CTAAA-TATTCAT--AT---------AG-GTCA---AGGT--CA-TC---TGA-AGAATGTCTGCATttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|5 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggt--G-TA----C---------TATCTGTAA-CAAAACTA--------TTGA----CCA-AA-G----------T---CAACT---T---A-------------------AAAC--------------------A-----AA------AACT-----AAA--------------C--------A----------G---T-----------GT----GT---A---CGA-----CAAGTTAGTCTTCC------GTA-GAG-GTCA---AGGT--CA-CCTGAC-A-AAAATG-CTGCCTGG-Tcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|14 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattgACAACTC--------TGGG----CCA-AAAG----------T---T---TCAAA---G-------------------AAAC--------------------A-----GA------A-TA-----AAA--------------T--------G-------CAAAGACA-----------TC----ATTTTG---AAGG---CCAAGTTACTTATCCACAGAGATC-AAG-GTCATCTAAGTAACA-CT--ACCC-ATAGTG-ATGCAGGG-Ttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcatagttttgagtactacccactccaacactatataccaaatttagtgactctaagtcaaatagtttctgagaatcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|4 : gtgTGACTG--------TAGATTAACCAGA--T----------T---T---T---GA--G-------------------AAAC--------------------A-----GA------A-CT-----AA---------------T--------G-------TAAA---AAT---------TTAACAGT---G---TG------TA--TTATTCATCCA-AACAA-------GTCA---AGGT--CA-CC--AAAT-AAAATA-CTACATGG-Tgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|2 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgAACTC--------TAGA----TCG-ACAG----------T---T---TTT-G---A-------------------AAAA--------------------AAGATGGA------G-CT-----AAA--------------TGCAAAAAAA-------TAAC---A-----------TT----GT---G---TAGG---CGAAATATTTCATCCACA-------GAG-GTCA---ATAT--CA-GC--TGAA-ATCATG-CTGTATtttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|9 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggc-A--G----------T---T---T---T---G-------------------AAA---------------------A-----AA------A-TTGACACAAA--------------T--------ACT-----TAAC---A-----------TT-----T---G---TAGG---CCAATTTAATTATTCATA-----T-A-G-GTCA---AGGT--CA-TC--TGAA-AATAT--CTGCATGGTTCAGAT--------TAGTGCTATCTGTA-----G-CAC-AG------CTA--TGAACCACT-TGGTG-GG---T---CTATtcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|3 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgacaactatgaataaaatttggtgactcttgggcaaacTAAGTTGGTTATTCATAA-------AG-GTCA---GGGT--CA-CC--ATGA-AGAATT-TTGCATCG-Tacctaacagtgactttggga
gi|13 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataatttttttTT-AAATGTCA---AGGT--CA-TC---CAAGAAAATG-CTGCATGG-Ttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|16 : catttAG-GTCA---AGGT--CATCC--A-GA-AAAATG-CTGCATGG-Ttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|4 : tagATAAAGAAAAGA---AGCT-----AAAACATG-CACAA--------CT--TAAC--ATT-TTGTGAGT---TAAACTAATTA----T-TCAT-----AGAGGTAAAG-ATC-----C--TCTGA-AAAT-ACT--CTGCA-TGGTATTGT-----ATAG------T------ACTACCT-AT------AAAA----CAGCTA--------TA--AAC-------CA-------TTC---T-G------------------------T-G-----------AC-T-GTAGATTAAC-CAG-A----TT--T-TG---A---G---AA---------------------ACAG--A---ACT----Atttgagtggtttaattcactatataactatggaataagtgttgaattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|7 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagATTTAAAAGAAACAGAGCT-----GA-----AACACAAACAAGCAGCA--TAAC--AGT-TTGTG-AT---C---TAAGCTA----AAT-ATT-C----ATAT--AG-GTCAAGGTCATCTG----AAG-AATGTCTGCA-TCATTTTGA-----GTAC------CGTAGTTACTACAC-AT------AACA----CAACTA--------TA--GAC-------TAA------TTT---G-G------------------------atgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|3 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataTAAAAGAAACAGAGCTAAAC-TAAT---G-CACACA------AAA--AAAA--ATC-C-ATA-AT---T---TTTTTTAAGTTGGTTATT-C------ATAAAG-GTCAGGGTCACCATG---AAG-AATT-TTGCA-TCGTTTTGAGTAGTACTG------T------ACTATCT-AT------AACA----CAACTA--------TG--Gtggctctgggcaactgagt
gi|9 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagttGAAAAAA---A--T-----TG-----A-CACAAA-------TACTTAAC--ATT-TGTAG-GCCAAT---TTAATTA----T-TCAT---------AT--AG-GTCAAGGTCATCTG---AAAA-TAT--CTGCA-TGGTTCAGA-----TTAG------T------GCTATCT-GT------AGCA----CAGCTA--------TG--AAC-------CA-------CTT---G-G------------------------tttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|2 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgacaactatgaataaaatttggtgactcttgggcaaacagttttAAACGGAACT-----AA-----G-CAAAAA------ACA--------ATG-TAGGA-G--------------A----AGTTATTAC-TAGAGGTAAAA-GTCAAG-TTAATCTGA-AATATAA---CTGAA-TGGTTTTTA-----TTAG------T------AGTAACC-GT------AACA----CAACCA--------TT--GAC-------CAAC-----TTT---G-G------------------------C-A-----------AC-tgggtctatacctaacagtgactttggga
gi|11 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgAGAGCT-----AA-----A-CACAAAC-----ATT--TAAC--ATT-GTGTA-GG---T---TAAT--A----AATCAT--------GG---AG-GTCAAGATC-ACTTGA-CAAA-GATA-CTGCACTGATTTTGA----------------------ACTACCC-ATCACACAAAAA----TAACTT--------TAGTGACTCGAGGTCAAA-----CAT---GAG------------------------G-A-----------AC-G-G-AGGTCAATGCA--AAGATTT--T-TG---A---tctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|10 : tttcaaAAA------ACT--TAAC--ATTGTGTTG-GT---TAT-TTATTT------GT-AT--------GGTCAAA-GTC---GTC--CC----ATAA-GGTG-CTAAA-GAGGTTTGG-----ATAG------A------ACTACCC-AT------TACC----CAACTA--------CA--GAC-------CAAA-----TTT---G-G------------------------ATACTCTAGGTCATAC-A-G-AGTTCAATGCA--A----tgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|6 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaTCATC-AGCAGAGGTTAAG-GTCA-------CCAAA-TAAATAATG-CTGCA-TGGTTT-GA-----TTAG------T------AATACCC-AT------TATA----TAACTA--------TG--GGC-------CAAA-----Taaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|3 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatatAAAGGTTATG-GTCA--TTTAA---GATGAAA-AAT--CGGCA-TGGTTTTGA-----GTAG------TCACATGACTTCTC-AT------ATCA----CAACTG--------TG--GAC-------CAAA-----TTT---G-GTTACTAGGCCAAACAGTTCTGGAGA-A-----------AC-AAG-AGTTTAACACA--A----TTGAT-T----A---G---TAC--T--ATC-------CATA-ACAC--G---ACTTATAATGGAC-TAAA--TTTAGTGACCCT--GAGCAAGACAGTTTCTG----AGA-AG-----CAT--A---GC-AA---AATGCGA------AACCTAACATTGTGacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|13 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtTTAAATGTCAAGGTCATCC--A-AGAA-AATG-CTGCA-TGGTTTTGG-----GTAT------A------AATA----AC------AATT----TGACTAC-------TATTGAC-------CAAA-----Tcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|6 : catttAAA-GTCAAGGTCATCC----AAAA-CATT-CTTCT-TGATTTCAA-----GTGG------A------ACTACCC-AT------TACA----CAGTTA--------TA--GAC-------CTA------TAT---G-G------------------------T-G-----------ACTC-T-AGGTTAA-ACA--T----TT--TCTG---A---G---AAG--CGGAGCT------CAAT-GCAA--A---Accaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|2 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataAAG-GTCAAGATCAGCC----AAAG-GGTT-TTGCA-TGGTTTTGA-----GTTG------A------ACTAACC-AT------TACA----CAACTA--------CA--GAC-------CAAA-----TTA---G-G------------------------C-A-----------Aaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|5 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaAG-GTCAAGGTCA-CCTGA-CAAA-AATG-CTGCC-TGGTTTTG--------AG------T------ATTGCC----------AA-G----TGACTC--------AA--GGC-------CAAACAATTTCT---G-AT-----------------------A-A-----------GT-G-G-AGCTTAACGCA--A----ttctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|16 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagAG-GTCAAGGTCATCCAGA-AAAA---TG-CTGCA-TGGTTTTGA-----GTGG------T------TTAATTC-AC------TATA----TAACTA--------TG--GAA-------TAAG-----TGT---T-G------------------------A-A-----------acacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcatagttttgagtactacccactccaacactatataccaaatttagtgactctaagtcaaatagtttctgagaatcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|12 : tag-GTCTAGGTCATCCA-A-AAAC-AATA-CCTCA-TTGTTCTGA-----GCGG------C------ATAACTC-AT------TACA----CAACTC--------TA--GAC-------CACA-----TTT---G-ttgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|15 : aCATCCAGA-AAAA--ATA-GTATA-TAGTTATGA-----GTAGTAATACC------ATTACCCAAT------GATGGTTTTAATTACAAGACATTG--GAC-------CAAACAC--TTTCCAA-G------------------------A-A-----------AC-A-G-CGCTTAAAACA--A----tccactccaacagtttttgtatagagagctaaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|4 : ttacctatccctggatgttgaatgACCTGA-AAAA-A-----TTTT-TGGTTTTGA-----ATAG------A------ACTACCC-ATTTAGG-ATTAT---TTACCA--------TA--GAC-------CAAA-----TTT---G-G------------------------aaaactt
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgt-G------------------------A-A-----------GC-A-A-A---TGATGCATAG----TT--T-TG---A---G---TAC--T--ACC-------CACT-CCAA--C---ACT----ATATAC-CAAA--TTTAGTGACTCTAAGT-CAA-ATAGTTTCTGAGAATCAGAACC---TTT--CTGAGA-AACTCGA-GCCATATCTTAACGTTGAATTGTTGCCAC-----CGACGCCG------ATG--AGACAACA-GTA-ACAC----AT----CT-CTTT-------T-----------tgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|18 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaaga-A-A-AGCT----GCA--AGG--CT--T-TG---A---G---TAC--C----T-------CAT--ACAC--A---GCA----ATGAAC-CAAA--TTTGGTGAC----TGG-GGG-ACAGTTTTAAAGAAACGGAGCt
gi|7 : aa--A----TT--T-TG---A---G---TACCGT--AGTTACTACACATA-ACAC--A---ACT----ATAGAC-TAA---TTTGGTGGCTCTG-GG-CAA-atttttaaacatt
gi|11 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatc--A----TT--T-TG---A--------AC--T--ACC-------CATC-ACAC--A---AAA----AT------AAC--TTTAGTGACTCGAGGT-CAA-ACA-----TGAGGAACGGAGGT---CAA--T---GC-AA---A-------------------GATTTTTGATGC--------TGCTA------CTG--TCGGAAAA-GT---AACCATTAT----AT-ATTT-------T-----------ctgagt
gi|2 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactg----TT--T-TG---A---GTTGAAC--T--AAC-------CATT-ACAC--A---ACT----ACAGAC-CAAA--TTAGGCAATTCTATAT-CAA-ACAGTTTCTGAGGAACAGGACTTTACAG--G---AC-AA---AA-ACTT------AACAATGAATTGCTGACA-----------CCA------CCG--AGAGAAAA-GAA-ATACC--TTTGTTCCT-TTTTCCTCAAAT-----------AAGCAAGACAATAAAtttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|4 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgg----TT--T-TG---AATAG---AAC--T--ACC-------CATTTAGGATTATTTACC----ATAGAC-CAAA--TTTGGTGACTCTAGGT-TAA-ATAGTTGCTACAAAACAGAGCC---CAT--T---GC-AA---AA-AGTT------AACAATGAATTATTGACACCAATGT--TACCA------CGGTCAAAGGAAA-GTA-GTACC--T
gi|10 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggT--T-TGGATA---G---AAC--T--ACC-------CATT-ACCC--A---ACT----ACAGAC-CAAA--TTTGGATACTCTAGGT-CAT-AC--------------AGAGTT---CAA--T---GCAAA---AA-ACTT------GATATTGAATTGTTGA-----------TGCCAACAATGCTG--ATTGAAAA-GTACCAATA--TAT----CTCATTT-------T-----------
gi|6 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtgctaaagagg---G---AAC--T--ACC-------CATT-ACAC--A---GTT----ATAGAC-CTA---TATGGTGACTCTAGGT-TAA-ACATTTTCTGAGAAGCGGAGCT---CAA--T---GCAAA---AA-GGTT------AACGTTGAACTATTGACAC--------AACCA------CTG--TCAGAAAA-GAA-ACACC--TGT----CT-TTTT-------TTATCTTCGAAAAGGTAAGACAA-AAAtctttcttcgaaaattgagaca
gi|12 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---AAC--T------------CATT-ACAC--A---ACT----CTAGAC-CACA--TTTGTCCACTCC-------A-ACAGTTTTTGT-ATAGAGAGCT---AAA--T---GC-AA---AT-ATT-------AACATTCAAC--TGGTCGC-----TA-CACCAC-----CT----CAGGAAAAATA-ACAAA--TGT----CT-ATTT-------T-----------
gi|7 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcatC-------CATT-ACAC--A---ACTTGG-ATGAACACAACACTTTGGTGACTCAAGGA-CAG-ACAGTTTC----AAAGAAAttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|9 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatc--A---ACT----ATGAAT-AAAA--TTTGGTGACTCTTGGG-CAA-ACAGTTT---TGAAAAAAA--T---TGA--C---AC-AA---AT-ACTT------AACATTtataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|8 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgac---ACT----TTGAAC-CAAA--TTTGGTATTTCTTTGA-TGA-ACAGTTTC-----AAAAGAATT---TATGAT---GC-TA---AA-GC--------AAC---AAATTGCAAACtgtaggccaatttaattattcatataggtcaaggtcatctgaaaatatctgcatggttcagattagtgctatctgtagcacagctatgaaccacttggtgggtctatacctaacagtgactttggga
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Unaligned ( gi|23 ): AATCACTGCCAGAAAAGTAAAACCTAATTCTTCTTTTTCCTTCGAAAAGACAAAAAGT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11111 77777777777777777777777777777777777 11111 3333333 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222222 333333333333333333333 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 7777777777777777777777777777777777777777777 11111111111 4444444444444444444444444444444444 4444444 3333333 3333333333 222222 1 22222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222222222222222222222 1111111 1111111 22222222222222222222222 111 1111111 44444444444444 111111111111 22222222222222222222222 11 2222222222 111111111 1111 3333333333333333333 2
lowQualScore : 5 22222 3 66666666666666666666666666666666666 44444 33 33 5555555 77 666666 33 666666 6666 666 999 2 4 3333333 7777 77777 555 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22 2 888888888888888888 2 7777777 333 3 5555 333 2 4444 4 555555555555555555555 2 55555 55 333 3 3 3 555 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 5 1 111111 4 5555555555555555555555555555555555555555555 88888888888 2222222222222222222222222222222222 2 1 6666666 4 7777777 88 6 5555555555 333333 3 4 99 66 1 66666666 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 666666666666666666666666 3 0000000 3 55 3 0000000 22222222222222222222222 000 1 3 555 999999 44 1111111 4 00000000000000 0 1 1 0 9999 777777777777 777 3 3 999999 555 3 555 2 2 6666 0 3 1 00000000000000000000000 3 22 4 7777777777 777 777777777 4 4 1 0000 66 1111111111111111111 0 3
lowQualScore : . ..... . ................................... ..... .. .. ....... .. ...... .. ...... .... ... ... . . ....... .... ..... ... .......................................................................... .. . .................. . ....... ... . .... ... . .... . ..................... . ..... .. ... . . . ... ............................................................................................................................................... . . . ...... . ........................................... ........... .................................. . . ....... . ....... .. . .......... ...... . . .. .. . ........ . ............................................................ ........................ . ....... . .. . ....... ....................... ... . . ... ...... .. ....... . .............. . . . . .... ............ ... . . ...... ... . ... . . .... . . . ....................... . .. . .......... ... ......... . . . .... .. ................... . .
lowQualScore : 0 55555 2 77777777777777777777777777777777777 77777 99 99 8888888 33 888888 11 444444 9999 222 000 0 0 8888888 0000 44444 222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44 2 999999999999999999 3 1111111 333 8 7777 555 0 2222 0 666666666666666666666 1 33333 22 000 1 1 1 444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 0 555555 0 2222222222222222222222222222222222222222222 66666666666 8888888888888888888888888888888888 2 4 0000000 0 2222222 22 7 0000000000 000000 3 2 22 11 0 00000000 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 999999999999999999999999 3 8888888 3 77 3 8888888 33333333333333333333333 444 7 3 888 666666 66 8888888 0 66666666666666 7 0 0 7 4444 666666666666 000 3 3 666666 888 1 111 8 1 5555 4 2 0 55555555555555555555555 6 33 4 4444444444 888 222222222 0 0 6 6666 00 0000000000000000000 7 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAA-----CATAAG--C--TTAA-ATTT-T--GCNA--ATTAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A---A-A-A---T-G-CT----GCATGGTTTT-----G---AGT---A---------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCAA--AT--------TTG-G-GCGACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTG---AG-AA----AC-GGAGCT-----------NA---NA--ACAA-A-----AA-CTTAA-CGG-T-T-G---TATTC----C----T--G---TA-TTCAT--C-C-CGGN--AGG----GGTCA----C----------------T---------------CA---TG--GT-T------G-ACT---------------NAGTN-C--T-----ACCCGTAA-CACAACTATG------G-ACCAA--G----------TT---T---GG-------------------AAACA-----GAG-CNAAATG--------TA---ACATCG---TGCGGG---C-CAAGTTATTCATCCGTAG-----AAGGTCAAGGTCANC----ACGAAA-AATGCTGCAT----------GGT------CAT-ATAAAAGAAA--CA--GAGCTAA------G-CACAAA------ACAT--AACATTNNGT-G-GTTTNATTTAAGTC----ATT--C-A---GA-GTAAAGGTCAAGGT------------CANC-----CNGAAA-A-------A-AATG-CTGCA-TG-------GTTTT----G------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACA-CA---A------CTATAG--AC-------CAAATTTG-GN-A-----------ACGGAGNTCAACGCAA----TTTTG---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACT---ATAGAC-CAA-A-TTTGGTGACTCTAGGTC----AAACAGTTTCTGAGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAA-AACTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC-ACCTGT----CT-NTTT-------T-----------AGGTAAGACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAA-----CATAGG--C--TTAA-ATTT-T--GNNA--ATTAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCN---A---A---A-A-A---T-G-CT----GCATGGTTTT-----G---AGT---A---------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCAA--AT--------TTG-G-GNGACT------NTAGGCC---AAACAGTTT---CTG---AG-AA----AC-GGAGCT-----------NA---CA--ACAA-A-----AA-CTTAA-CGG-T-T-G---TATTC----C----T--G---TA-TTCAT--C-C-CGGG--AGG----GGTCA----C----------------T---------------CA---TG--G---------G-ACT---------------NAGTT-C--T-----ATCCATNA-CANAACTATG------G-ACCAA--G----------TT---T---GG-------------------AAACA-----GAG-CTAAATG--------TA---ANATCG---TGCGGG---C-TAAGTTATTCATCCATAG--G--AAGGTCAAGGTCACC----ACGAAA-AATGCTGCAT----------GGT------CAT-ATAGAAGAAA--CA--GAGCTNA------G-CACAAA------ACAT--AACATTTNGT-G-GTTTTATTTANGTC----ATT--C-A---GAGGTNAAGGTCAAGGT------------CANC-----CNGAAA-A-------A-AATG-CTGCA-TG-------GTTTT----G------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACA-CA---A------CTATAG--AC-------CAAATTTG-GA-A-----------ACGGAGNTTAACGCAA----TTTTG---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACT---ATAGAC-CAA-A-TTTGGTGACTCTAGGNC----AAACAGTTTCTGAGAAACAGAGC---T---C-----ANC----GC-AAA-AGCTTAACATTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC-ACCTAT----CT-NTTT-------T-----------AGGCAAGACAATAAA
gi|1 : GGGT---AACATAAAATTTTGGTATAA-----AATGTG--TCATTA---TTT-T--AACA--ATTAAA---GTTAT--TT--ATC--CG--GA--CGTCA------TGGTC--A------TCA---A---G---A-A-A---T-G-CT----GTTTGGTTTT-----G---AGT---A---------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCTA--AT--------TTG-G-GGGACT------ATAAGCC---AAACAATTT---TTG---AT-AA----AC-GGAGCT-----------AA---CA--ACAA-A-----AA-CTTA--TGG-T-T-G---TATTC----C----T--G---TA-TTCAT--C-C-CGGGGGAGG----GGTCA----C----------------T---------------CA---TA--------------ACT---------------CAGTT-C--T-----GCCCATAA-CATAACTATA------G-ACCAA--G----------TT---T---GG-------------------AAACA-----GAG-CTAAATA--------TA---AGATCG---TGCGAG---C-TAAATTATTCATCCACAACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATGCTGCAT----------GGT------CAT-ATAGAAAAAA--CA--GAGCTTA------G-CACAAA------ATAT--AAGATTTGGT-G-GTTTTATTTACGTC----ATC--CCA---AAGGTTAAGGTCAAGGT------------CAAC-----CGGAAA-A-------A-AATG-CTGTA-TG-------GTTTT----G------AACA-----GC-ACTACCCA---TAATA-TA---A------CTATAG--AC-------CAAGTTTG-GA-A-----------ACAGAGCTTAACGCAA----TTTTG---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACT---ATGGAC-CAA-G-TTTGGTGACTCTATGAC----AAACAGTTTCTGTGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAA-AGCTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA-ACCTAT----CT-ATTT-------T-----------AGGTAAGACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA-A-TTTGGTGAGCTTGGACT----AAACATTTTCTGA-AAGCTAA---------------AAC----G--AAA-AACTTAACATTG---TGTTGcta
gi|10 : A--AAGCTAA------AACGAAAA------ACTT--AACATTGTGTTG-GTT--ATTTAT--------TT-----------GT-ATGGTCAAAGT------------CGTC-----CC--AT-A-------A-GGTG-CTAAA-GA-------GGTTT----G------GATA-----GA-ACTACCCA---TTACC-CA---A------CTACAG--AC-------CAAATTTG-GATACTCTAGGTCATACAGAGTTCAATGCAA----gttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtgctaaagaggtttggatagaactacccattacccaactacagaccaaatttggatactctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgTTTGGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACT---ACAGAC-CAA-A-TTTGGATACTCTAGGTC----A-----T---------ACAGAGT---T---C-----AAT----GCAAAA-AACTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCAATATAT----CTCATTT-------T-----------aaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtgctaaagaggA--GAGCTAA------A-CACAAA-------CATTTAACATTGTGT-A-GGTTAAT--AAATC----AT-----------GG---AGGTCAAGAT------------CA-C-----TTGACA-A-------A-GATA-CTGCACTG-------ATTTT----G------A-----------ACTACCCA---TCACA-CA---AAAATAACTTTAGTGACTCGAGGTCAAACATGAGG-A-----------ACGGAGGTCAATGCAAAGATTTTTG---A---tctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaaA----TTTTG---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAA---ATA-AC-------TTTAGTGACTCGAGGTC----AAACA-----TGAGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAA-------------GATTTTTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAAC-CATTAT----AT-ATTT-------T-----------tgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgGTCTAGGT------------CATC-----CA-AAA-A-------C-AATA-CCTCA-TT-------GTTCT----G------AGCG-----GC-ATAACTCA---TTACA-CA---A------CTCTAG--AC-------CACATTTG-tttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : aGTCT------AGGTC--A------TCC---A---A---A-A-ACAAT-A-CC----TCATTGTTCT-----G---AGC---G---------G---------C----ATAACTCATTA---------------C------A--C---------AACTC--TAGACCAC--AT--------TTG--------T------CCACTCC---AA-CAGTTT---TTGTATAG-A---------GAGCT-----------AA---AT--GCAA-A-----TA--TTAA-Ctccactccaacagtttttgtatagagagctaaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACT---CTAGAC-CAC-A-TTTGTCCACTCC----------AACAGTTTTTG-TATAGAGAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC-AAATGT----CT-ATTT-------T-----------attcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--A------TCC---A---AGA-A-A-A---T-G-CT----GCATGGTTTT-----G---GGTATAA---------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACTA--TTGACCAA--ATCCAAA---TTT-G-GCATCT------CTAGGCA---AAATA--CA---CTG---AG-AA----AC-GGAGCT-----------CA----A--ACAA-G-----Attcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT-ACCTGT----CT-CTCT-------T-----------tggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaACAACTCTG------G-GCCAAAAG----------TT---TCAAAG-------------------AAACA-----GAA-TAAAATG--------CAAAGACATCATTTTGAAGG---C-CAAGTTACTTATCCACAG------AGATCAAGGTCATC----tttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|15 : gtgC--A------TCC---AGAAA---A-A-A---T-A-GT----ATATAGTTAT-----G---AGT---A---------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATTA--C---CCAATGATGGTTTTAATTA-C-AAGACA------TTGGACC---AAACACTTT---CCA---AG-AA----AC-AGCGCT-----------TA---AA--ACAAAA-----AA-CTTtaagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatg--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---AGA-A---A-A-A---T-G-CT----GCATGGTTTT-----G---AGT---G---------GTT-------T----A---------ATT-------------C------A--CTATAT----AACTA--TGGAATAA--GTG-------TTG-
gi|16 : taTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC-ACCTaattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagtg---A---A---A-A-A-----G-CT----GCAAGGCTTT-----G---AGT---ACCTC-----A---------T----A-------------------------C------A--C---------AGCAA--TGAACCAA--AT--------TT--G-GTGACT------GGGGG-------ACAGTTT---TAA---AG-AA----AC-GGAGCtagtataa
gi|19 : TTAA-----TTAT--TCTTATA---A--GA--GGTCATTGTTGAGGTC--A------TCC---A---A---A-------T-A-CT----CCATTGTTAT-----C---AGT---A---------G---------T----TCT-------G---------------C------A--C---------AACTA--TGAACCAA--AG--------TTG-G-atttttaaacatt
gi|2 : --GCCA--AGTAAA---AT-AT--TC--ATA------GA--GGTC---------GTCTAA------T-A---A---A---A-A-A---T---CTATTTGCATGGTTTT-----G---------A---------G---------T----A---------C---------------C------A--C---------AACTA--TGAGCCA-------------TTC-A-GTGATT------CTAGGCA---AAA---TTA---TTG---CG-AA----AC-GGAACT-----------A-----A--GCAA-A-----AA-
gi|2 : tgaagGAAA--CG--GAACTAA------G-CAAAAA------ACA------ATGTAGG-A-G--------AAGTT----ATTACT-A---GAGGTAAAAGTCAAG-T------------TAAT-----CTGAAA-T-------ATAA---CTGAA-TG-------GTTTT----T------ATTA-----GT-AGTAACCG---TAACA-CA---A------CCATTG--AC-------CAACTTTG-GC-A-----------ACacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcAA---GTTAT--TA--CTA------GA--GGTAA------AAGTC--AAGTTAATCT---G---A---A-ATA---T-AACT----GAATGGTTTTTATTAGT--AGT---AACC------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACCA--TTGACCAA--CT--------TT--G-GCAACT------CTAGATC----GACAGTTT---TTG---AA-AAAAAGAT-GGAGCT-----------AA---AT--GCAA-A-----AA-AATAA-C-A-T-T-G---TGTAG----G----C--GAAATATTTCAT--C-CAC-----AGA----GGTCAATATCAGCTGAAA--------T---------------CA---TGCTGTATTCTTTTG-AAT---------------GA-TA-C--T-----GTCCATTA-TACAACAAAG------GCACTGA--G----------TT----------------------------AATTA-----AAA---AAACT--------TC---ACGTAG---TGTAGA---C-CAAGTTGTTCATC--TGA--A--AAGGTCAAGATCAGC-----CAAAG-GGTTTTGCAT----------GGT------tctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagAACTCTA------G-ATCGACAG----------TT---TTT-GA-------------------AAAAAAGATGGAG-CTAAATGCAAAAAAATA---ACATTG---TGTAGG---C-GAAATATTTCATCCACAG------AGGTCAATATCAGC-----TGAAATCATGCTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCCATTATACAACAAAGGCACTGAGTTAA------T-TA-AAA------A-----AACTTCACGT-A-GTGTAGACCAAGTT----GTT--C-ATCTGA---AAAGGTCAAGAT------------CAGC-----C---AA-A-------G-GGTT-TTGCA-TG-------GTTTT----G------AGTT-----GA-ACTAACCA---TTACA-CA---A------CTACAG--AC-------CAAATTAG-GC-A-----------Atttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcAA---GTTGT--TC--ATC--TG--AAAAGGTCA------AGATC--A------GCC---A---A---A-G-GG--T-T-TT----GCATGGTTTT-----G---AGTTGAA---------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACTA--CAGACCAA--AT--------T-A-G-GCAATT------CTATATC---AAACAGTTT---CTG---AG-GA----ACAGGACTT-----------TA---CAGGACAA-A-----AA-CTTAA-CAA---T-G---AATTG----C----T--G----A---CAC--CAC-CGAG--AGttctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagacc----TTTTG---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACT---ACAGAC-CAA-A-TTAGGCAATTCTATATC----AAACAGTTTCTGAGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAA-AACTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT-ACCTTTGTTCCT-TTTTCCTCAAAT-----------AAGCAAGACAATAAAaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|3 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggGTAAAGGT------------CTTT-----CT-AAA-A-------A-AATG-TTGCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA-----GT-ACTACCTA---TTACA-CC---A------CTATGG--AC-------CAAGTT
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttCGTGTTTTT-----C---GGT---A---------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACTA--TGGACCAA--G---------TTA-A-GTTACT------TGGGGCTTTGAAATAGTTT---AAA---AG-AA----AC-AGAGCTAAACTAATGCACA---CA--AAAA-A-----AA-ATCCA-TAA-T-T-T---TTTTTAAG-T----T--GGT-TA-TTCAT--A-A-AGGT--CAG----GGTCA----C--------------------------------CA---TGAAG---------A-ATTTTGCATCGTTTTGAGTAGTA-C--TGTACTATCTATAA-CACAACTATGGTTTCTG-AAAAAT-G----------GG---T---GT-------------------AAACA-----TAA---AAATA--------TA---ACAT--------AGG---CTTAAATT-TTAAT--ATGA--GTAAAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT-CGGCAT----------GGT------aagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgttttt----TTTCGGT-A---G---TA---CTACCTAT-TA-CACC------ACT---ATGGAC-CAA-G-TTAAGTTACT-TGGGGCTTTGAAATAGTTTAAAAGAAACAGAGC---T---A-----AAC----tttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgttTAAAAGAAA--CA--GAGCTAAACTAATG-CACACA------AAAA--AAAATCCA-T-A-ATTTTTTTTAAGTTGGTTATT--C-A-------TAAAGGTCAGGGT------------CACC-----ATGAAG-A-------A---TT-TTGCA-TC-------GTTTT----G------AGTAGTACTGT-ACTATCTA---TAACA-CA---A------CTATGG--taatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagttGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAA-----CATAGG--C--TTAA-ATTT-T--AATATGAGTAAAG--GTTATGGTC--AT-------------TTA------AGAT------------G---A---A---A-A-A---T---CG----GCATGGTTTT-----G---AGT---A---------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACTG--TGGACCAA--AT--------TT--G-GTTAC--------TAGGCC---AAACAGTTC---TGG---AG-AA----ACAAGAGTT-----------T-----A--ACAC-A-----A---TT----GA-T-TAG---TAC------------------TA-TCCATAAC-A-CG---------------A----C----------------T---------------TA---TAATG---------G-ACT---------------AAATT-TAGT-----GACCCTGAGCAAGAC----------------A--G----------TT---TCTGAG-------------------AAGCA-----TAG-CAAAATGCGAAACC-TA---ACATTG---TGCGGT---G-TAATTTATTCATCTGTAG------AGTTAAAGGTCtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAAA-----ACATG------CACAA---C--TTAACATTT-T--GTGA--GTTAAACTAATTAT--TC--ATA------GA--GGTAA------AGATC--C------TCT---G---A---A-A-A---T-A-CTCT--GCATGGTATT-----GTATAGT---ACTACCT---A---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCTA--TAAACCA-------------TTC-T-GTGACT------GTAGATT---AACCAGATT---TTG---AG-AA----AC-AGAACT-----------AA---T---GTAA-A-----AA-TTTAA-CAG-TGT-G---TAT------------------TA-TTCAT--C-C-
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctAGAAA--CA--GAACTAAT-----G-TA-AAA------ATTT--AACA----GT-GTGTATTATT-----C----ATC--C-A---AA---CAAG-TCAAGGT------------CACC--------AAATA-------A-AATA-CTACA-TG-------GTTTT----C------AGAA-----TA-ATTACCAA---TAA-G-CA---A------CTGTTG--GC-------AATATCTG-aaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgTTAT--TC--ATC--CA--AACAAGTCA------AGGTC--A------CCA---A---ATA-A-A-A---T-A-CT----ACATGGTTTTCA---G---AAT---A---------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACTG--TTGGCAAT--AT--------CT--G-CTGACTCAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTA---AG--A----AT-TGAACTG----------TA---C---GCAA-A-----AA-TTTAA-Cctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtaC-----CTGAAA-A-------A-A-TT-TT----TG-------GTTTT----G------AATA-----GA-ACTACCCATT-TAGGATTATTTA------CCATAG--AC-------CAAATTTG-Gattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgta----TTTTG---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACC---ATAGAC-CAA-A-TTTGGTGACTCTAGGTT----AAATAGTTGCTACAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAA-AAGTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT-ACCTtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggCTA--TGGATCAA--AT----------GAG-GCGACT------CTAAGCC---AAACAAATT---CTG---TG-AA----AC-A-AGCT-----------AA---------AG-A-----AA-AT------G-T-T-G---T---C----A----T--GG--TA----A---C-C-TGCA--AA---------A----C----------------TTCTG-----------CA---TG--GTTTT-----G-ATT---------------G-GTA-C--T-----ATCTGTAA-CAAAACTATT------G-ACCAAA-G----------TCAACT---TA-------------------AAACA-----AAAACTAAAC----------A---GTGT-G---TACGA------CAAGTTAGTCTTCCGTAG------AGGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATGCTGCCT----------GGT------
gi|5 : AA---GTTAG--TC--TTC--CGTAGA--GGTCA------AGGTC--A------CCTGACA---A---A-A-A---T-G-CT----GCCTGGTTTT-----G---AGT---A---------T---------T------------------------------------------------------------GCCAA------------------GTGACT------CAAGGCC---AAACAATTT---CTG---AT-AA----GT-GGAGCT-----------TA---AC--GCAA-A-----CA-CTTAA-C-G-T-T-G---Ttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcatagttttgagtactacccactccaacactatataccaaatttagtgactctaagtcaaatagtttctgagaatcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|5 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgac--GAGCTTA------A-CGCAAAC-----ACTT--AACGTTGTGA-G-GTCGAAGTTAC-TT----ATC--C-A---GA----AAGATTAATGCACCCCCCCCCCCCACCTACTTCAAAAA-AGAGAAGCA-AATG-ATGCA-TA-------GTTTT----G------AGT---------ACTACCCACTCCAAC-------A------CTATAT--AC-------CAAATTTA-Ggaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcatagttttgagtactacccactccaacactatataccaaatttagtgactctaagtcaaatagtttctgagaatcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|5 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtgAG----TTTTG---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACT---ATATAC-CAA-A-TTTAGTGACTCTAAGTC----AAATAGTTTCTGAGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CAT-ATCTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC-AC--AT----CT-CTTT-------T-----------tgactctaagtcaaatagtttctgagaatcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcat---A---A-A-A---TCA-CT----ACATGGCTTA-----G---ATT---A---------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTTAAATGGACCAA--AT--------TT--T-GAGACT------CCAAACC---ATATGGGTT---TTC---AG-AA----TC-GGGGCT-----------AAATGCA----AA-A-----AA-CATAATCTG-T-C-G---TAGGC----CAAG-TTAA---TA-TTCAT--C-A-GCAG--AGGTTAAGGTCA----C----------------CAAATAAATAATGCTGCA---TG--GTTT------G-A-T---------------TAGTA-A--T-----ACCCATTA-TATAACTATG------G-GCCAA--ATACACTTACTTT---T---GGCCAAACATTTTTTTCTCAGAAATA-----AAG-CCAAATA--------CA---AAAACT---TA-GGGTTAT-TAAGTTATTTTTGCATA------AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATTCTt
gi|6 : AAAA-----ACATAATCTGTCGTAGG--C----------------CAA--GTTAA------TAT--TC--ATCAGCA--GA--GGTTA------AGGTC--A------CCA---A---ATAAATA-A---T-G-CT----GCATGGTTT------G---ATT---A---------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACTA--TGGGCCAA--ATACAC----TT-------ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTC---AG-AA----AT-AAAGCC-----------AA---AT--ACAA-A-----AA-CTTAG--GG-T-T-A---Ttcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaAA-----ATACAA--------AAA--C--TTAG-GGTT----------ATTAA----GTTAT--TT--TTG--CATAAA--AGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A---A-ACA---T-T-CT----TCTTGATTTC-----A---AGT---G---------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTTA--TAGACCTAT-AT------------G-GTGACT------CTAGGTT---AAACATTTT---CTG---AG-AA----GC-GGAGCT-----------CA---AT--GCAA-A-----AAGGTTAA-C-G-T-T-GAACTATTtaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagcc---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTT---ATAGAC-CTA---TATGGTGACTCTAGGTT----AAACATTTTCTGAGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GCAAAA-AGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC-ACCTGT----CT-TTTT-------TTATCTTCGAAAAGGTAAGACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtgCCCAT-TA-CACA------ACTTGGATGAACACAACACTTTGGTGACTCAAGGAC----AGACAGTTTCAAAGAAATATA-------------------------AAA-A--TTAACATT---TTGT
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatAAATATAAAA-----AT-TAA-----CAT---------------TT-T--GTAA--GCCAA----GTTAA--TT--ATT--TGTTAA--GGTCA------AGGTC--A------TCT---A---A---A-A----------------CAAAATTTG-----G---GGT---A---------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CCA--T--ACCAT--AG--------TTA-A-GTGACA------CTGGGCC---AAATAATTT---AAA---AG-AA----AC-AGAGCT-----------GA---AAC-ACAA-ACAAGCAG-CATAA-CAGTT-T-G---TGATCTAAGC----TAAA---TA-TTCAT--A-T-AGGT--CAA----GGTCA----TCTGAAGAATGTCTGCAT---------------CATTTTG--A---------GTACCG--------------TAGTTAC--T-----ACACATAA-CACAACTATA------G-ACTAA-------------TT---T---GG-------------------aagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagAT-TTAAAAGAAA--CA--GAGCTGA------AACACAAACAAGCAGCAT--AACAGTTTGT-G-ATCTAAGCTAAAT-----ATT--C-A-------TATAGGTCAAGGT------------CATC-----TG---A-A-------G-AATGTCTGCA-TC-------ATTTT----G------AGTACCGTAGTTACTACACA---TAACA-CA---A------CTATAG--AC-------T-AATTTG-Gtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataA---CTACACAT-AA-CACA------ACT---ATAGAC-T-A-A-TTTGGTGGCTCT-GGGC----AAtggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagtt----TTTTG---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACT---TTGAAA-TAA-A-TGTAACGACTCTTGATC----TAGAAGTTTCTGCGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAA-AACATAACATTGctgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgTAAACATAAAA-----ACATAA-----CAT---------------TG-T--GT--------AA---GTTAT--TC--ATC--TA--TA--GGTCA------A--CC--A------AC----A---G---C-A-A---T---CT----GCGCGGTTTC-----A---AAT-------------G---------T----A---------A----------------------A---------------TA--TAGATAAA--AG--------TT--A-GTGATT------GTATGTT---AAA-ATTTT---CTG---AATGA----TC-GTGGTC-----------AA---C---ACAA-A-----AA-tgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACTA--TGAATAAA--AT--------TTG-G--TGACT------CTTGGGC---AAACAGTTT----TG---AA-AA----A----AATT-----------GA---C---ACAA-A-----TA-CTTAA-CAT-T-T-G---TAGGC----CAATTT--AAT-TA-TTCAT--A-T-AGGT--CAA----GGTCAT---C----------------TGAAAATATCTG----CA---TG--GTTCA-----G-A-T---------------TAGTG-C--T-----ATCTGTAG-CACAGCTATG------A-ACCA--------------CT---T---GG-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgAAAA-----AT-TGA-----CACAAATAC--TTAACATTTGTAGGCCA--ATTTAA----TTAT--TC--ATA--T----A--GGTCA------AGGTC--A------TCT---G---A---A-A-A---T-ATCT----GCATGGTTCA-----G---ATT---AGTGCTATCTG---------T----A---------G---------------C------A--C---------AGCTA--TGAACC----AC--------TTG-GTGGGTCT------ATA--CC---TAACAGTtgggtctatacctaacagtgactttggga
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Unaligned ( gi|23 ): AATCACTGCCAGAAAAGTAAAACCTAATTCTTCTTTTTCCTTCGAAAAGACAAAAAGT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11111 55555555555555555555555555555555 1111 33333333333 11111 111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2222222222222222 22222222222222222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5555555555555555555555555555555555555555 1111111111 333333333 111 1111111111111 2222222222 3333333 55555555555555555555555555555555 2222 222 111 22222222222222 11111111 1111 2222222222222 11 777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333333333 111111111 1111111 22222222222222222222 111 1111111 222222222222222222 11 111 111111111 2222222222 111111111 11111111 9999999999999999999 111
lowQualScore : 5 44444 2 77777777777777777777777777777777 8888 44 44 55555555555 777777 33 7777777 333 666 55 55555 4 2 111 7777 6666666 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 2 44 8888888888888888 777777 0 0 333 4 5555 333 4444 55 44444444444444444 2 2 55555 55 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 555 2 2 33 555 9999999 2 1 2222222222222222222222222222222222222222 55 7777777777 777777777 222 55 1111111111111 1 6666666666 1 4444444 88 6 22222222222222222222222222222222 1111 1 555 000 33333333333333 4 77777777 1111 3333333333333 00 444444444444444444444444444444444444 1 1111111111111111111111111 3 111111111 88 3 0000000 44 33333333333333333333 000 1 3 555 999999 44 1111111 4 999999999999999999 1 44 7777 3 111 88888888 555 3 3 999999 555 3 666 3 7777 1 666 3 777 444444444 99999 4 77 0 4 7777777777 777 777777777 4 44444444 66 77 1 2222222222222222222 444 0 8
lowQualScore : . ..... . ................................ .... .. .. ........... ...... .. ....... ... ... .. ..... . . ... .... ....... ...................................................................................... .. . .. ................ ...... . . ... . .... ... .... .. ................. . . ..... .. ............................................................................................................................................................................... . ... . . .. ... ....... . . ........................................ .. .......... ......... ... .. ............. . .......... . ....... .. . ................................ .... . ... ... .............. . ........ .... ............. .. .................................... . ......................... . ......... .. . ....... .. .................... ... . . ... ...... .. ....... . .................. . .. .... . ... ........ ... . . ...... ... . ... . .... . ... . ... ......... ..... . .. . . .......... ... ......... . ........ .. .. . ................... ... . .
lowQualScore : 0 33333 3 33333333333333333333333333333333 8888 66 66 11111111111 222222 22 8888888 999 666 00 55555 2 1 999 4444 8888888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 1 33 5555555555555555 888888 5 2 555 9 7777 555 2222 88 11111111111111111 1 1 33333 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 222 2 9 99 000 8888888 9 2 8888888888888888888888888888888888888888 55 1111111111 000000000 222 66 7777777777777 0 2222222222 0 7777777 22 7 66666666666666666666666666666666 2222 2 000 000 55555555555555 0 33333333 5555 0000000000000 44 888888888888888888888888888888888888 0 2222222222222222222222222 1 222222222 33 1 0000000 66 66666666666666666666 444 7 3 888 666666 66 8888888 0 222222222222222222 0 44 7777 6 444 55555555 888 3 3 666666 888 3 333 4 1111 4 444 0 000 555555555 00000 4 33 5 4 4444444444 888 222222222 0 55555555 11 99 0 1111111111111111111 000 8 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAAGC--T----TAA-ATTTTGNCA--A-TTAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A-T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTG---AGAA----AC-GGAGCT-----------NAAN--AC-AA-A-----AA-CTTAA-CG----G-T-T-G------T--ATT--C----C----T--G---TA-T--------TCA---T---C--CCGGN--AAG----GGTCA----C--------T---------------C------ATG---G----------------TT--GA----NT--NA----G-T---ACTACCCG--TNACA-C--A---ACTATG------G-ACCAA--G----------TTT---GG-------------------AAAC--A-----NAGCAAAATG--------TAA---CATCGT---GTAGG---C-CAAGTTATTCATCCGCAG-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATGCT------------GCAT----------G-----GTC----ATATAAC--AAG---AAACA--------------GAGCT-AA------G-CAC---AAA------A-CAT--AACATTNCGT-GGTCTAATTTAA----GTTATT--C--A----AG-TAAAGGTCAAGGT------------CANC-----CNGAAA-A-------A-AATG-CTGCA-TG-------GTTTT--G--------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACA-CA---A------CTATAG--AC-------CAAATTTG-G-CG-----------AC-NGAGNTCAAC-GCAA----TTT-TG---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACT---ATAGAC-CAA-A-TTTGGCGACTCTAGGTC----AAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TGT--CTNTTT-------TT-TCT------AG---GTAAGACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAAGC--T----TAA-ATTTTGCNA--A-TTAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A-T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTG---AGAA----AC-GGAGCT-----------NANA--AC-AA-A-----AA-CTTAA-CG----G-T-T-G------T--ATT--C----C----T--G---TA-T--------TCA---T---C--CCGGN--AGG----GGTCA----C--------T---------------C------ATG---G----------------TT--GA----CT--NA----G-T---NCTACCCG--TAACA-C--A---ACTATG------G-ACCAA--G----------TTT---GG-------------------AAAC--A-----GAGCNAAATG--------TAA---CATCGT---GCGGG---C-CAAGTTATTCATCCGTAG-----AAGGTCAAGGTCANC----ACGAAA-AATGCT------------GCAT----------G-----GTC----ATATAA---AAG---AAACA--------------GAGCT-AA------G-CAC---AAA------A-CAT--AACATTNNGT-GGTTTNATTTAA----GTCATT--C--A---GAG-TAAAGGTCAAGGT------------CANC-----CNGAAA-A-------A-AATG-CTGCA-TG-------GTTTT--G--------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACA-CA---A------CTATAG--AC-------CAAATTTG-G-NA-----------AC-GGAGNTCAAC-GCAA----TTT-TG---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACT---ATAGAC-CAA-A-TTTGGTGACTCTAGGTC----AAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TGT--CTNTTT-------T-----------AG---GTAAGACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACATAAAATTTTGGTATAAAATGTGTCAT----TA---TTTTAACA--A-TTAAA---GTTAT--TT--ATC--CG--GA--CGTCA------TGGTC--A------TCA---A---G--A-----A-A-T-G-CT----GTTTG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCTA--AT--------TTG-GGG-GACT------ATAAGCC---AAACAATTT---TTG---ATAA----AC-GGAGCT-----------AACA--AC-AA-A-----AA-CTTA--TG----G-T-T-G------T--ATT--C----C----T--G---TA-T--------TCA---T---C--CCGGGGGAGG----GGTCA----C--------T---------------C------ATA-------------------------A----CT--CA----G-T---TCTGCCCA--TAACA-T--A---ACTATA------G-ACCAA--G----------TTT---GG-------------------AAAC--A-----GAGCTAAATA--------TAA---GATCGT---GCGAG---C-TAAATTATTCATCCACAACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATGCT------------GCAT----------G-----GTC----ATATAG---AAA---AAACA--------------GAGCT-TA------G-CAC---AAA------A-TAT--AAGATTTGGT-GGTTTTATTTAC----GTCATC--CCAA---AGG-TTAAGGTCAAGGT------------CAAC-----CGGAAA-A-------A-AATG-CTGTA-TG-------GTTTT--G--------AACA-----GC-ACTACCCA---TAATA-TA---A------CTATAG--AC-------CAAGTTTG-G-AA-----------AC-AGAGCTTAAC-GCAA----TTT-TG---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACT---ATGGAC-CAA-G-TTTGGTGACTCTATGAC----AAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TAT--CTATTT-------T-----------AG---GTAAGACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaaggaCAA--AT--------TTG-G-T-GAGC------TTGGACT---AAACATTTT---CTG---A-----------AAGCT-----------AAAA--CG-AA-A-----AA-CTTAA-CATTGTG-T-T-GGT----T--ATTTAT----T----T--G---TA-TGGTCAAAGTCG---T---C--CCATA--AGG----TGCTA----A--------A---------------G------A-G---G----------------TTTGGA--------TA----G-A---ACTACCCA--TTACC-C--A---ACTACA------G-ACCAA--A----------TTT---GG-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCT-AA------AACGA---AAA------A-CTT--AACATTGTGTTGGTT--ATTTA---------TT--T--------G-TAT-GGTCAAAGT------------CGTC-----CC--AT-A-------A-GGTG-CTAAA-GA-------GGTTT--G--------GATA-----GA-ACTACCCA---TTACC-CA---A------CTACAG--AC-------CAAATTTG-GATACTCTAGGTCATAC-AGAGTTCAAT-GCAA----tctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgTT-TGGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACT---ACAGAC-CAA-A-TTTGGATACTCTAGGTC----ATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACC--------Aaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtgctaaagaggA--------------GAGCT-AA------A-CAC---AAA--------CATTTAACATTGTGT-AGGTTAAT--AA----ATCAT---------------GGAGGTCAAGAT------------CA-C-----TTGACA-A-------A-GATA-CTGCACTG-------ATTTT--G--------A-----------ACTACCCA---TCACA-CA---AAAATAACTTTAGTGACTCGAGGTCAAACATGAG-GA-----------AC-GGAGGTCAAT-GCAAAGATTTT-TG---A---atatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaaA----TTT-TG---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAA---ATA-AC-------TTTAGTGACTCGAGGTC----AAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TTT--TTATTT-------TTCCTCA-----AGAATGTGAGACAA-AAAtgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgGTCTAGGT------------CATC-----CA-AAA-A-------C-AATA-CCTCA-TT-------GTTCT--G--------AGCG-----GC-ATAACTCA---TTACA-CA---A------CTCTAG--AC-------CACATTTG-c
gi|12 : aGTCT------AGGTC--A------TCC---A---A--AAAC--A-A-T-A-CC----TCATT-------GTTCT-----G------AGC---G------G---------C----ATAACTCATTA---------------C------A--C---------AACTC--TAGACCAC--AT--------TT--GTC-CACT------CC---------AACAGTTT---TTGTATAGA---------GAGCT-----------AAAT--GC-AA-A-----TA--TTAA-Ctccactccaacagtttttgtatagagagctaaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACT---CTAGAC-CAC-A-TTTGTCCACTCC----------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TGT--CTATTT-------T-----------attcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--A------TCC---A---AGAA-----A-A-T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACTA--TTGACCAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT------CTAGGCA---AAATA--CA---CTG---AGAA----AC-GGAGCT-----------CA-A--AC-AA-G-----Attcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TGT--CTCTCT-------TTTTCTTTGGAAAG---GTA--ACAA-AAAtggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaA-C--A---ACTCTG------G-GCCAAAAG----------TTTCAAAG-------------------AAAC--A-----GAATAAAATG--------CAAAGACATCATTTTGAAGG---C-CAAGTTACTTATCCACAG------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|15 : gtgC--A------TCC---AGAAA--A-----A-A-T-A-GT----ATATA-------GTTAT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATTA--C---CCAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA------TTGGACC---AAACACTTT---CCA---AGAA----AC-AGCGCT-----------TAAA--AC-AAAA-----AA-CTTtaagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatg--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---AGA-A--A-----A-A-T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---G------GTT-------T----A---------ATT-------------C------A--CTATAT----AACTA--TGGAATAA--GTG-------TTG-
gi|16 : taGTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Taattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagt---A---A--A-----A-A---G-CT----GCAAG-------GCTTT-----G------AGT---ACCTC--A---------T----A-------------------------C------A--C---------AGCAA--TGAACCAA--AT--------TT--GGT-GACT------GGGGG-------ACAGTTT---TAA---AGAA----AC-GGAGCtagtataa
gi|19 : -TTAA-----TTAT--TCTTATA---A--GA--GGTCATTGTTGAGGTC--A------TCC----------A-----A-A-T-A-CT----CCATT-------GTTAT-----C------AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACTA--TGAACCAA--AG--------TTG-Gatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-GTAAA---AT-AT--TC--ATA------GA--GGTC---------GTCTAA------TA----A---A--A-----A-A-T---CTATTTGCATG-------GTTTT-----G------------A------G---------T----A---------C---------------C------A--C---------AACTA--TGAGCCA-------------TTC-AGT-GATT------CTAGGCA---AAA---TTA---TTG---CGAA----AC-GGAACT-----------AAG----C-AA-A-----AA-
gi|2 : tgaagG---AAACG--------------GAACT-AA------G-CAA---AAA------A-CA------ATGTAGG-AG--------AA----GTTATTACT--A---GAGGTAAAAGTCAAG-T------------TAAT-----CTGAAA-T-------ATAA---CTGAA-TG-------GTTTT--T--------ATTA-----GT-AGTAACCG---TAACA-CA---A------CCATTG--AC-------CAACTTTG-G-CA-----------ACTCTAGATCGACAGT------TTT-TG---A---A---AA---acaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcAA---GTTAT--TA--CTA------GA--GGTAA------AAGTC--AAGTTAATCT---G---A--A-----ATA-T-AACT----GAATG-------GTTTTTATTAGT-----AGT---AACC---G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACCA--TTGACCAA--CT--------TT--GGC-AACT------CTAGATC----GACAGTTT---TTG---AAAAAAAGAT-GGAGCT-----------AAAT--GC-AA-A-----AA-AATAA-C-----A-T-T-G------T--GTA--G----G----C--GAAATATT--------TCA---T---C--C--AC--AGA----GGTCAATATCAGCTGAAAT---------------C------ATGCT-GTATTCTT---------TT--GA----AT--GA------T---ACTGTCCA--TTATA-C--A---ACAAAG------GCACTGA--G----------TT-------------------------AATT--A-----AA--AAAACT--------TCA---CGTAGT---GTAGA---C-CAAGTTGTTCATCTG-AA-----AAGGTCAAGATCAGC-----CAAAG-GGTTTT------------GCAT----------G-----GTaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggag-C--A---ACTCTA------G-ATCGACAG----------TTTTT-GA-------------------AAAA--AAGATGGAGCTAAATGCAAAAAAATAA---CATTGT---GTAGG---C-GAAATATTTCATCCACAG-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATGCT------------GTATTCTTTTGAATGATACTGTCCATTATACAACA-AAG---GCACT--------------GAGTT-AA------T-TA----AAA------A------AACTTCACGT-AGTGTAGACCAA----GTTGTT--C--ATCTGA---AAAGGTCAAGAT------------CAGC-----C---AA-A-------G-GGTT-TTGCA-TG-------GTTTT--G--------AGTT-----GA-ACTAACCA---TTACA-CA---A------CTACAG--AC-------CAAATTAG-G-CA-----------Atttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggAA---GTTGT--TC--ATC--TG--AAAAGGTCA------AGATC--A------GCC---A---A--A-----G-GGT-T-TT----GCATG-------GTTTT-----G------AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACTA--CAGACCAA--AT--------T-A-GGC-AATT------CTATATC---AAACAGTTT---CTG---AGGA----ACAGGACTT-----------TACAGGAC-AA-A-----AA-CTTAA-CA----A---T-G------A--ATT--G----C----T--G---ttctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagacc----TTT-TG---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACT---ACAGAC-CAA-A-TTAGGCAATTCTATATC----AAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTGTTCCTTTTTCCTCAAAT-----------AA---GCAAGACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|3 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggA------G-CACCAGGAA------A-CGT--AGCATTT-GT-AGACCAAGTTGA-----TTATT--T--------G-TAAAGGTC-------------------TT-----TCTAAA-A-------A-AATG-TTGCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA-----GT-ACTACCTA---TTACA-CC---A------CTATGG--AC-------CAAGTT
gi|3 : GTAA------AGGTC--T------TTCTAAA---A--A-----A-A-T-G-TT----GCGTGTTTTTCTGTTTTTCGT-GTTTTTCGGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACTA--TGGACCAA--G---------TTA-AGT-TACT------TGGGGCTTTGAAATAGTTT---AAA---AGAA----AC-AGAGCTAAACTAATGCACACA--AA-AA-A-----AA-ATCCA-TA----A-T-T-T------T--TTT--TAAG-T----T--GGT-TA-T--------TCA---T---A--AAGGT--CAG----GGTCA----C------------------------C------ATG---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA----GT--AGTACTG-T---ACTATCTA--TAACA-C--A---ACTATGGTTTCTG-AAAAAT-G----------GGT---GT-------------------AAAC--A-----TA--AAAATA--------TAA---CAT--------AGG---CTTAAATT-TTAATATG-AGTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT-CG------------GCAT----------G-----GTaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattattt----TTT-CGGT-A---G---TA---CTACCTAT-TA-CACC------ACT---ATGGAC-CAA-G-TTAAGTTACT-TGGGGCTTTGAAATAGTTTAAA---AGAAACAGAGC---T---A-----AAC----tttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgttTAA---AAG---AAACA--------------GAGCT-AAACTAATG-CAC---ACA------A-AA---AAAAATCCAT-AATTTTTTTTAAGTTGGTTATT--C--A-------TAAAGGTCAGGGT------------CACC-----ATG--A-A-------G-AATT-TTGCA-TC-------GTTTT--G--------AGTAGTACTGT-ACTATCTA---TAACA-CA---A------CTATGG--taatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagttGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAGGC--T----TAA-ATTTTAATATGA-GTAAAG--GTTATGGTC--AT-------------TTA------AGAT------------G---A---A--A-----A-A-T---CG----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACTG--TGGACCAA--AT--------TTG-G-----TTA-----CTAGGCC---AAACAGTTC---TGG---AGAA----ACAAGAGTT-----------TAAC--AC-AA-----------TT----G----A-T-TAG------T--AC--------------------TA-T--------CCA---TAA-C--ACG---------------A----C--------T---------------T------ATA---A----------------TG--GA----CT--AA----A-T---T-TA---G--TGACC-CTGA---GCAA--------G-AC--A--G----------TTTCTGAG-------------------AAGC--A-----TAGCAAAATGCGAAACC-TAA---CATTGT---GCGGT---G-TAATTTATTCATCTGTAG------AGTTAAAGGTCtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAAA-----ACATG-CACAA-C--T----TAACATTTTGTGA--G-TTAAACTAATTAT--TC--ATA------GA--GGTAA------AGATC--C------TCT---G---A--A-----A-A-T-A-CTCT--GCATG-------GTATT-----GTAT---AGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCTA--TAAACCA-------------TTC-TGT-GACT------GTAGATT---AACCAGATT---TTG---AGAA----AC-AGAACT-----------AAT---GT-AA-A-----AA-TTTAA-CA----G-TGT-G------T--AT--------------------TA-T--------TCA---T---C--CAAAC--AAGTCAAGGTCA----C--------
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctAG---AAACA--------------GAACT-AAT-----G-TA----AAA------A-TTT--AACAGTGTGT-------ATT--A----TTCATC--C--A---AA--CAA--GTCAAGGT------------CACC--------AAATA-------A-AATA-CTACA-TG-------GTTTT--C--------AGAA-----TA-ATTACCAA---TAA-G-CA---A------CTGTTG--GC-------AATATCTG-caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgTTAT--TC--ATC--CA--AACAAGTCA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAA--A-A-T-A-CT----ACATG-------GTTTTCA---G------AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACTG--TTGGCAAT--AT--------CT---GCTGACTCAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTA---AG-A----AT-TGAACT-----------GTAC--GC-AA-A-----AA-TTTAA-C-----A-T-T-A------TTAATT--T----TA---T--G---TA-----------CA---TGTAC--CTGAA--AAA--------A----T--------T---------------T------TTG---GTT--------------TT--GA----AT---A----G-A---ACTACCCATTTAGGATT--ATTTACCATA------G-ACCAA--A----------TTT---GG-------------------ctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtaC-----CTGAAA-A-------A-A-TT-TT----TG-------GTTTT--G--------AATA-----GA-ACTACCCATT-TAGGATTATTTA------CCATAG--AC-------CAAATTTG-G-TG-----------AC-tgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgta----TTT-TG---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACC---ATAGAC-CAA-A-TTTGGTGACTCTAGGTT----AAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Ttctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggCTA--TGGATCAA--AT----------GAGGC-GACT------CTAAGCC---AAACAAATT---CTG---TGAA----AC-A-AGCT-----------AA-------AG-A-----AA-AT----------G-T-T-G------T-------C----A----T--GG--TA------------A----------CCTGC--AAA----ACTT-----C--------TG--------------C------ATG---G----------------TTTTGA----TT--G-----G-T---ACTATCTG--TAACA-A--A---ACTATT------G-ACCAAA-G----------TC--------------------------AACTTA-----AAACAAAAAC--------TAAA--CAGTGT---GTACG---A-CAAGTTAGTCTTCCGTAG-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATGCTGCCTGGTTTTGAGTAT----------T-----GCC----AAGTGACTCAAGGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA------A-CGC---AAAC-----A-CTT--AACGTTGTGA-GGTCGAAGTTAC-----TTATC--C--A---GA----AAGATTAATGCACCCCCCCCCCCCACCTACTTCAAAAA-AGAGAAGCA-AATG-ATGCA-TA-------GTTTT--G--------AGT---------ACTACCCACTCCAAC-------A------CTATAT--AC-------CAAATTTA-G-TG-----------ACTCTAAGTCAA--ATAG----TTTCTG---A---G---AA---
gi|5 : AG----TTT-TG---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACT---ATATAC-CAA-A-TTTAGTGACTCTAAGTC----AAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------ACA--TCT--CTTTTT-------tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcat---A--A-----A-A-TCA-CT----ACATG-------GCTTA-----G------ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTTAAATGGACCAA--AT--------TTT-GA--GACT------CCAAACC---ATATGGGTT---TTC---AGAA----TC-GGGGCT-----------AAAT--GCAAA-A-----AA-CATAATCT----G-T-C-G------T--AGG--C----CAAG-TTAA---TA-T--------TCA---T---CA-GCAG---AGGTTAAGGTCA----C--------CAAATAAATAATGCTGC------ATG---GT---------------TT--GA-----T--TA----G-T---AATACCCA--TTATA-T--A---ACTATG------G-GCCAA--ATACACTTACTTTT---GGCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGCCAAATA--------CAA---AAACTT---A-GGGTTAT-TAAGTTATTTTTGCATA------AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATTCT------------
gi|6 : TAAATGCAAAA-----A----ACATAATC--TGTCGTAG------GCCA--AGTTAA------TAT--TC--ATCAGCA--GA--GGTTA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAAATA-A-T-G-CT----GCATG-------GTTT------G------ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACTA--TGGGCCAA--ATACAC----TT-------ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTC---AGAA----AT-AAAGCC-----------AAAT--AC-AA-A-----AA-CTTAG--G----G-T-T-ATTAAGTT--ATT--T----T----T--G---CA-TAAAAG---TCAAGGT---CATCCAAA--A---------CA----T--------T---------------C-------TT---C----------------TT--GA----TTTCAA----G-TGGAACTACCCA--TTACA-C--A---GTTATA------G-ACCtcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggcAA-----ATACAA---AAAC--T----TAG-GGTT-------A-TTAA----GTTAT--TT--TTG--CATAAA--AGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----ACA-T-T-CT----TCTTG-------ATTTC-----A------AGT---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTTA--TAGACCTAT-AT------------GGT-GACT------CTAGGTT---AAACATTTT---CTG---AGAA----GC-GGAGCT-----------CAAT--GC-AA-A-----AAGGTTAA-C-----G-T-T-GAAC---T--ATT--tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagcc---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTT---ATAGAC-CTA---TATGGTGACTCTAGGTT----AAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TGT--CTTTTT-------TTATCTTCGAAAAG---GTAAGACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtgCCCAT-TA-CACA------ACTTGGATGAACACAACACTTTGGTGACTCAAGGAC----AGACAGTTTCAA---AGAAA
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatG--TGACT-C--A---AGGACA------G-AC--A--G----------TTTCAAAG-------------------AAAT--A-----TA--AAAAT---------TAA---CATTTT---GTAAG---C-CAAGTTAATTATTTGT-T-----AAGGTCAAGGTCATC----tataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttgCAAAGAA-----ATATAA---AAA---T----TAACATTTTGTAA--G-CCAA----GTTAA--TT--ATT--TGTTAA--GGTCA------AGGTC--A------TCT---A---A--A-----A--------------CAAA-------ATTTG-----G------GGT---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CCA--T--ACCAT--AG--------TTA-AGT-GACA------CTGGGCC---AAATAATTT---AAA---AGAA----AC-AGAGCT-----------GAAAC-AC-AA-ACAAGCAG-CATAA-CA----GTT-T-G------T--GAT--CTAAGC----TAAA---TA-T--------TCA---T---A--TAGGT--CAA----GGTCA-------------T---------------CTGAAGAATGTCTGCATCATT---------TT--GAGTACCG--TA----GTT---ACTACACA--TAACA-C--A---ACTATA------G-ACTAA-------------TTT---GG-------------------taaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagttt----ATTTAA---AAG---AAACA--------------GAGCTGAA------A-CAC---AAACAAGCAG-CAT--AACAGTTTGT-GATCTAAGCTAA----AT-ATT--C--A-------TATAGGTCAAGGT------------CATC-----TG---A-A-------G-AATGTCTGCA-TC-------ATTTT--G--------AGTACCGTAGTTACTACACA---TAACA-CA---A------CTATAG--AC-------T-AATTTG-G-tggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataA---CTACACAT-AA-CACA------ACT---ATAGAC-T-A-A-TTTGGTGGCTCTGGG-C----AAtggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagtt----TTT-TG---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACT---TTGAAA-TAA-A-TGTAACGACTCTTGATC----TAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGctgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactg--------------GAGCT-AA------A-CAT---AAA------AACAT--AACATT--GT-G--------TAA----GTTATT--C--A---T-C-TATAGGTCAA--C------------CAAC----------A-G-------C-AAT--CTGCG-CG-------GTTTtgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatgTAAACATAAAA-----ACATAACAT-----------------TGTGT---------AA---GTTAT--TC--ATC--TA--TA--GGTCA------A--------------CC---A---AC-AGC---A-A-T---CT----GCGCG-------GTTTC-----A------AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------TA--TAGATAAA--AG--------TT--AGT-GATT------GTATGTT---AAA-ATTTT---CTG---AATG----AT-CGTGGT-----------CAAC--AC-AA-A-----AA-caaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACTA--TGAATAAA--AT--------TTG-G-T-GACT------CTTGGGC---AAACAGTTT----TG---AAAA----A----AATT-----------GAC---AC-AA-A-----TA-CTTAA-CA----T-T-T-G------T--AGG--C----CAATTT--AAT-TA-T--------TCA---T---A--TAGGT--CAA----GGTCAT---C--------TGAAAATATCTG----C------ATG---G----------------TTCAGA-----T--TA----G-T---GCTATCTG--TAGCA-C--A---GCTATG------A-ACCA--------------CTT---GG-------------------
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Unaligned ( gi|23 ): AATCACTGCCAGAAAAGTAAAACCTAATTCTTCTTTTTCCTTCGAAAAGACAAAAAGT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11111 5555555555555555555555555555555555555555555 3333333 111111111111111111111111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222222222 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111 1111111 4444444444444444444444444444444444444444 111111111 333333333 111 111111 22222222222 3333333 88888888888888888888888888888888888888888888 111 22222222222222 11111111 2222222222222 4444444444444444444444444444444444444 11111111111111 222222222 1111111111111 1111111 11111111 22222222222222222222 2222222222222222222222222222222 11111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 5555555555555555555555
lowQualScore : 5 22222 2 2222222222222222222222222222222222222222222 44 44 5555555 77 777777 33 333333333333333333333333333333333333 7777 2 6666666 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 3 44 7777777777777777 777777 333 7 6666 4444 33 9999999999999 3 4 55555 99999999 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3 00000 1 777777 0000000 2 0 6666666666666666666666666666666666666666 55 333333333 777777777 222 777 1 777 111111 1 1 66666666666 0 4444444 88 6 99999999999999999999999999999999999999999999 5 000 33333333333333 55 99999999 7777 0000000000000 3333333333333333333333333333333333333 2 66666666666666 77 999999999 2 0000000000000 2 2222222 00000000 44 00000000000000000000 999 0 3 555 6666 1 9999999999999999999999999999999 9999 22222222 666 555 555 555 4 4 111111 777 0 4 777 2 2 7777 3333 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 1 4 4 5555555555555555555555 5
lowQualScore : . ..... . ........................................... .. .. ....... .. ...... .. .................................... .... . ....... ....................................................................................... .. . .. ................ ...... ... . .... .... .. ............. . . ..... ........ .............................................................................................................................................................................................. . ..... . ...... ....... . . ........................................ .. ......... ......... ... ... . ... ...... . . ........... . ....... .. . ............................................ . ... .............. .. ........ .... ............. ..................................... . .............. .. ......... . ............. . ....... ........ .. .................... ... . . ... .... . ............................... .... ........ ... ... ... ... . . ...... ... . . ... . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. . . . ...................... .
lowQualScore : 0 55555 8 7777777777777777777777777777777777777777777 22 22 9999999 99 222222 22 111111111111111111111111111111111111 4444 1 8888888 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66 8 33 7777777777777777 888888 555 4 2222 2222 44 6666666666666 1 2 33333 77777777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 22222 0 777777 1111111 7 5 8888888888888888888888888888888888888888 00 444444444 000000000 222 666 1 888 222222 0 9 44444444444 8 7777777 22 7 22222222222222222222222222222222222222222222 7 000 55555555555555 11 22222222 6666 9999999999999 5555555555555555555555555555555555555 9 11111111111111 11 666666666 9 6666666666666 9 1111111 44444444 22 22222222222222222222 666 8 1 444 5555 2 8888888888888888888888888888888 1111 44444444 444 888 888 888 0 0 555555 000 7 0 888 1 5 8888 6666 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 0 4 4 2222222222222222222222 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ACATAACATAANC--T----TAA-ATTTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TC---C---A---A--A-----A-A-T-G-CT----GCA-TG-------GTTTT-----G------AG-T---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAA----AC-GGAGCT---NA--------ACGC-AAA-----AA------CTTAA-CG--------G-T-T-G------T--ATTC----C----T----G---TA---------T-----------TCAT---C--C--NGGN--AAA----G-GTCA----C--------T---------------C------A-TG---G----------------TT--GA-NT----NA----G--T---ACT-ACCC----GTNACACA------ACTATG------G-ACCAA--G----------TTT---GG-------------------AAAC--AN-----AGCAAAATG--------TAA---CATCGTGT---AGG----C-CAAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATGCTGCAT----------G-----GTC----GTAT----AA------C----AA-G---AAACA--------------GAGCT-AA------G-CAC---AAA------A-CNT--AACATTNCGT-GGTCTAANTTAAGTT----ATTC---A--T--ANAGGTCAAGG------------TCA-TC-----CNGAAA-A-------AAATG-CTGCA-TG-------GTTT--------T--G--------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACA-CA---ACT----ATAGACCAAATTTGG-----------CG-A--C-NGAGNTCAA--GCA---GTTT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACT---ATAGAC-CAA-A-TTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCTCT-TTTT-TC-----TT-----AG---GT---AAGACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAAGC--T----TAA-ATTTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TC---C---A---A--A-----A-A-T-G-CT----GCA-TG-------GTTTT-----G------AG-T---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAA----AC-GGAGCT---NA--------ANAC-AAA-----AA------CTTAA-CG--------G-T-T-G------T--ATTC----C----T----G---TA---------T-----------TCAT---C--C--CGGN--AAG----G-GTCA----C--------T---------------C------A-TG---G----------------TT--GA-NT----NA----G--T---ACT-ACCC----GTNACACA------ACTATG------G-ACCAA--G----------TTT---GG-------------------AAAC--AN-----AGCAAAATG--------TAA---CATCGTGT---AGG----C-CAAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATGCTGCAT----------G-----GTC----ATAT----AA------C----AA-G---AAACA--------------GAGCT-AA------G-CAC---AAA------A-CAT--AACATTNCGT-GGTCTAATTTAAGTT----ATTC---AAGT--AAAGGTCAAGG------------TCA-NC-----CNGAAA-A-------AAATG-CTGCA-TG-------GTTT--------T--G--------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACA-CA---ACT----ATAGACCAAATTTGG-----------CG-A--C-NGAGNTCAAC-GCA---ATTT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACT---ATAGAC-CAA-A-TTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCTNT-TTTT-TC-----T------AG---GT---AAGACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACATAAAATTTTGGTATAAAATGTGTCAT----TA---TTTTAACA--A-T---TAAA---GTTAT--TT--ATC--CG--GA--CGTCA------TGGTC--A------TC---A---A---G--A-----A-A-T-G-CT----GTT-TG-------GTTTT-----G------AG-T---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACTA--TGGACCTA--AT--------TTG-GGG-GACT------ATAAGCC---AAACAATTT---TTGATAA----AC-GGAGCT---AA--------CAAC-AAA-----AA------CTTA--TG--------G-T-T-G------T--ATTC----C----T----G---TA---------T-----------TCAT---C--C--CGGGGGAGG----G-GTCA----C--------T---------------C------A-TA-------------------------A-CT----CA----G--T---TCT-GCCC----ATAACATA------ACTATA------G-ACCAA--G----------TTT---GG-------------------AAAC--AG-----AGCTAAATA--------TAA---GATCGTGC---GAG----C-TAAATTATTCATCCACA-ACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATGCTGCAT----------G-----GTC----ATAT----AG-----------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA------G-CAC---AAA------A-TAT--AAGATTTGGT-GGTTTTATTTACGTC----ATCCCAAAGGT--TAAGGTCAAGG------------TCA-AC-----CGGAAA-A-------AAATG-CTGTA-TG-------GTTT--------T--G--------AACA-----GC-ACTACCCA---TAATA-TA---ACT----ATAGACCAAGTTTGG-----------AA-A--C-AGAGCTTAAC-GCA---ATTT-T------G---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACT---ATGGAC-CAA-G-TTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TCTAT-TT----------T------AG---GT---AAGACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaaggaCAA--AT--------TTG-G-T-GAGC------TTGGACT---AAACATTTT---CTGAAA-----------GCT---AA--------AACG-AAA-----AA------CTTAA-CATTGT----G-T-T-GGT----T--ATTTAT--T----T----G---TA---------TGGTCAAAG---TCGT---C--C--CA-T--AAG----GTGCTA----A--------A---------------G------A-GG---T----------------TT--GG-AT-----A----G--A---ACT-ACCC----ATTACCCA------ACTACA------G-ACCAA--A----------TTT---GG-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCT-AA------AACGA---AAA------A-CTT--AACATTGTGTTGGTT--ATTTA---------TTT-----GT--AT-GGTCAAAG------------TCG-TC-----CC--AT-A-------AGGTG-CTAAA-GA-------GGTT--------T--G--------GATA-----GA-ACTACCCA---TTACC-CA---ACT----ACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATA--C-AGAGTTCAAT-GCA---Atctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgTT-T------GGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACT---ACAGAC-CAA-A-TTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TCTCA-TTTT-TC-----T------aaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtgctaaagaggA--------------GAGCT-AA------A-CAC---AAA--------CATTTAACATTGTGT-AGGTTAAT--AAATC----AT-----------GGAGGTCAAGA------------TCA--C-----TTGACA-A-------AGATA-CTGCACTG-------ATTT--------T--G--------A-----------ACTACCCA---TCACA-CA---AAA----ATA-AC----TTTAG-----------TG-A--CTCGAGGTCAAttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaaAACACAAACATT----TAACATTGTGTAG--G-T---TAA-----TAAA--TC--AT----G--GA--GGTCA------AGATC--A------CTTGAC---A---A--A-----G-A-T-A-CT----GCACTG-------ATTTT-----G------AACT---ACCC---A---------T----C---------A---------------C------A--C---------AAAAA--T------A--AC--------TTT-AGT-GACT------CGAGGTC---AAACA--------TGAGGA----AC-GGAGGT---CA--------ATGC-AAA-----GA------TTTacatgaggaacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|11 : tttcaaagagctaG-A--C-AAAGAT--ACTGCACTGATTT-T------G---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAA---ATA-AC-------TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TTTAT-TTTT-CC-----TCA----AGAATGT---GAGACAA-AAAttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttGTCTAGG------------TCA-TC-----CA-AAA-A-------CAATA-CCTCA-TT-------GTTC--------T--G--------AGCG-----GC-ATAACTCA---TTACA-CA---ACT----CTAGACCACATTTGT-----------CC-A--C-----TCCAA---CA---GTTT-TTGTATAG---A---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACT---CTAGAC-CAC-A-TTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TCTAT-TTTT-TC-----TTCA---AA---ATGAAAAGAAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--A------TC---C---A---AGAA-----A-A-T-G-CT----GCA-TG-------GTTTT-----G------GG-TATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACTA--TTGACCAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT------CTAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAA----AC-GGAGCT---CA--------A-AC-AAG-----Att
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TCTCTCTTTT-TC-----TTTGGAAAG---GT---A--ACAA-AAAtggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaACA------ACTCTG------G-GCCAAAAG----------TTTCAAAG-------------------AAAC--AG-----AATAAAATG--------CAAAGACATCATTTTGAAGG----C-CAAGTTACTTATCCACA-G------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|15 : gtgC--A------TC---C---AGAAA--A-----A-A-T-A-GT----ATA-TA-------GTTAT-----G------AG-T---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATTA--C---CCAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA------TTGGACC---AAACACTTT---CCAAGAA----AC-AGCGCT---TA--------AAACAAAA-----AA------CTTtaagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatg--GA--GGTCA------AGGTC--A------TC---C---AGA-A--A-----A-A-T-G-CT----GCA-TG-------GTTTT-----G------AG-T---G------GTT-------T----A---------ATT-------------C------A--CTATAT----AACTA--TGGAATAA--GTG-------TTG-
gi|16 : taGTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Taattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagt---A---A--A-----A-A---G-CT----GCA-AG-------GCTTT-----G------AG-T---ACCTC--A---------T----A-------------------------C------A--C---------AGCAA--TGAACCAA--AT--------TT--GGT-GACT------GGGGG-------ACAGTTT---TAAAGAA----AC-GGAGCtagtataa
gi|19 : -T---TAA-----TTAT--TCTTATA---A--GA--GGTCATTGTTGAGGTC--A------TC---C----------A-----A-A-T-A-CT----CCA-TT-------GTTAT-----C------AG-T---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACTA--TGAACCAA--AG--------TTG-Gatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-G---TAAA---AT-AT--TC--ATA------GA--GGTC---------GTCTAA------TA-------A---A--A-----A-A-T---CTATTTGCA-TG-------GTTTT-----G-------------A------G---------T----A---------C---------------C------A--C---------AACTA--TGAGCCA-------------TTC-AGT-GATT------CTAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAA----AC-GGAACT---AA--------GCA--AAA-----AA------C--AA-TGTAGGAGAAG-T----------T--ATTA----C----TAGAGG---TAAAAGTCAAGT-----------TAAT---C--T-----G--AAA----T-ATAA----C--------T---------------G------AATG---G----------------TT-----TT----TATTA-G--T---AGT-AACC----GTAACACA------ACCATT------G-ACCAA--C----------TTT---GG-------------------CAAC--
gi|2 : tgaagAA---GTTAT--TA--CTA------GA--GGTAA------AAGTC--AAGTTAATC---T---G---A--A-----ATA-T-AACT----GAA-TG-------GTTTTTATTAGT-----AG-T---AACC---G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACCA--TTGACCAA--CT--------TT--GGC-AACT------CTAGATC----GACAGTTT---TTGAAAAAAAGAT-GGAGCT---AA--------ATGC-AAA-----AA------AATAA-C---------A-T-T-G------T--GTAG----G----C----GAAATAT--------T-----------TCAT---C--C----AC--AGA----G-GTCAATATCAGCTGAAAT---------------C------A-TGCT-GTATTCTT---------TT--GA-AT----GA-------T---ACT-GTCC----ATTATACA------ACAAAG------GCACTGA--G----------TT-------------------------AATT--AA-----A--AAAACT--------TCA---CGTAGTGT---AGA----C-CAAGTTGTTCATCTG-A-A-----AAGGTCAAGATCAGC-----CAAAG-GGTTTTGCAT----------G-----GTtctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagCA------ACTCTA------G-ATCGACAG----------TTTTT-GA-------------------AAAA--AAGATGGAGCTAAATGCAAAAAAATAA---CATTGTGT---AGG----C-GAAATATTTCATCCACA-G-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATGCTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCCATTATAC----AA------C----AAAG---GCACT--------------GAGTT-AA------T-TA----AAA------A------AACTTCACGT-AGTGTAGACCAAGTT----GTTC---ATCTGAAAAGGTCAAGA------------TCA-GC-----C---AA-A-------GGGTT-TTGCA-TG-------GTTT--------T--G--------AGTT-----GA-ACTAACCA---TTACA-CA---ACT----ACAGACCAAATTAGG-----------CA-ATTC-T-ATATCAA--ACA---GTTTCT------G---A---G---GA---tttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggAA---GTTGT--TC--ATC--TG--AAAAGGTCA------AGATC--A------GC---C---A---A--A-----G-GGT-T-TT----GCA-TG-------GTTTT-----G------AG-TTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACTA--CAGACCAA--AT--------T-A-GGC-AATT------CTATATC---AAACAGTTT---CTGAGGA----AC-AGGACTTTACA--------GGAC-AAA-----AA------CTTAA-CA--------A---T-G------A--ATTG----C----T----G---acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccTTT-T------G---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACT---ACAGAC-CAA-A-TTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TTCCT-TTTT-CCTCAAAT------AA---GC---AAGACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-TTTT-TCCT---T------CG---AA---AAGACAA-AAA
gi|3 : aatA------G-CACCAGGAA------A-CGT--AGCATTT-GT-AGACCAAGTTGA-TT----ATTT-----GT--AAAGGTC--------------------TT-----TCTAAA-A-------AAATG-TTGCG-TGTTTTTCTGTTT--------TTCGTGTTTTTCGGTA-----GT-ACTACCTA---TTACA-CC---ACT----ATGGACCAAGTTgt
gi|3 : GTAA------AGGTC--T------TT---CTAAA---A--A-----A-A-T-G-TT----GCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGT-GTTTTTCGG-T---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACTA--TGGACCAA--G---------TTA-AGT-TACT------TGGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAA----AC-AGAGCT---AAACTAATGCACAC-AAA-----AAAAAATCCATAA-------------T-T-T------T--TTTTAAG-T----T----GGT-TA---------T-----------TCAT---A--A--AGGT--CAG----G-GTCA----C------------------------C------A-TG---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----AGTACTG--T---ACT-ATCT----ATAACACA------ACTATGGTTTCTG-AAAAAT-G----------GGT---GT-------------------AAAC--AT-----A--AAAATA--------TAA---CA-----T---AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT-CGGCAT----------G-----GT------TTT----GA------G----TA-G---TCACA--------------TGACT---------T-CTC---ATA------T-CAC--AAC----TGT-GGACCAAATTTGGTT----ACT------------AGGCCAAA--------------CAGTT-----CTGGAG-A-------AA-------CA-AGA------GTTTAACACAATT--G--------ATTA-----GT-ACTATCCA---TAACA-CG---ACTTATAATGGACTAAATTTAG-----------TG-ACCC-TGAG--CAAG-ACA---GTTTCT------G---A---G---AA---aagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttT----AA-----------AA-G---AAACA--------------GAGCT-AAACTAATG-CAC---ACA------A-AAA--AAAAT-CCAT-AATTTTTTTTAAGTTGGTTATTC---A--T--AAAGGTCAGGG------------TCA-CC-----ATGAAG-A-------A--TT-TTGCA-TC-------GTTT--------T--G--------AGTAGTACTGT-ACTATCTA---TAACA-CA---ACT----ATGGgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagttGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAGGC--T----TAA-ATTTTAATATGA-G---TAAAG--GTTATGGTC--AT-------------TTA------AGAT---------------G---A---A--A-----A-A-T---CG----GCA-TG-------GTTTT-----G------AG-T---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACTG--TGGACCAA--AT--------TTG-G-----TTA-----CTAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAA----ACAAGAGTT---TA--------ACAC-AA---------------TT----G--------A-T-TAG------T--AC--------------------TA---------T-----------CCATAA-C--A--CG----------------A----C--------T---------------T------A-TA---A----------------TG--GA-CT----AA----ATTT---AGTGACCC-----TGA-GCA------A-----------G-AC--A--G----------TTTCTGAG-------------------AAGC--AT-----AGCAAAATGCGAAACC-TAA---CATTGTGC---GGT----G-TAATTTATTCATCTGTA-G------AGTTAAAGGTCtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAAA-----ACATG-CACAA-C--T----TAACATTTTGTGA--G-T---TAAACTAATTAT--TC--ATA------GA--GGTAA------AGATC--C------TC---T---G---A--A-----A-A-T-A-CTCT--GCA-TG-------GTATT-----GTAT---AG-T---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCTA--TAAACCA-------------TTC-TGT-GACT------GTAGATT---AACCAGATT---TTGAGAA----AC-AGAACT----A--------ATGT-AAA-----AA------TTTAA-CA--------G-TGT-G------T--AT--------------------TA---------T-----------TCAT---C--C--AAAC--AAGTCAAG-GTCA----C--------
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctA-G---AAACA--------------GAACT-AAT-----G-TA----AAA------A-TTT--AACAGTGTGT-------ATT--ATTC----ATCC---AAAC--AA--GTCAAGG------------TCA-CC--------AAATA-------AAATA-CTACA-TG-------GTTT--------T--C--------AGAA-----TA-ATTACCAA---TAA-G-CA---ACT----GTTGGCAATATCTGC-----------TG-A--C-caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgAGAA-----ACAGAAC-TAATG--T----AAA-AATTTAACA--G-TGTGTA------TTAT--TC--ATC--CA--AACAAGTCA------AGGTC--A-------C---C---A---A--ATAA--A-A-T-A-CT----ACA-TG-------GTTTTCA---G------AA-T---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACTG--TTGGCAAT--AT--------CT---GCTGACTCAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAG-A----AT-TGAACT---GT--------ACGC-AAA-----AA------TTTAA-C---------A-T-T-A------TTAATTT----TA---T----G---TA----------------------CATGTAC--C--TGAA--AAA---------A----T--------T---------------T------T-TG---GTT--------------TT--GA-AT-----A----G--A---ACT-ACCC----ATTTAGGATTATTTACCATA------G-ACCAA--A----------TTT---GG-------------------tcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgC-----CTGAAA-A-------AA-TT-TT----TG-------GTTT--------T--G--------AATA-----GA-ACTACCCATT-TAGGATTATTTACC----ATAGACCAAATTTGG-----------TG-A--C-tgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtaTTT-T------G---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACC---ATAGAC-CAA-A-TTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Ttctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggCTA--TGGATCAA--AT----------GAGGC-GACT------CTAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAA----AC-A-AGCT---AA--------AGA----A-----AA------T---------------G-T-T-G------T-----C----A----T----GG--TA-----------------------A-------C--CTGC--AAA----A-CTT-----C--------TG--------------C------A-TG---G----------------TTTTGA-TT----G-----G--T---ACT-ATCT----GTAACAAA------ACTATT------G-ACCAAA-G----------TC--------------------------AACTTAA-----AACAAAAAC--------TAAA--CAGTGTGT---ACG----A-CAAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATGCTGCCT----------G-----GTTTTGAGTATTGCCAAGTGACTC----AA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA------A-CGC---AAAC-----A-CTT--AACGTTGTGA-GGTCGAAGTT-ACTT----ATCC---AG----AAAGATTAATGCACCCCCCCCCCCCA-CCTACTTCAAAAA-AGAGAAGCAAATG-ATGCA-TA-------GTTT--------T--G--------AGT---------ACTACCCACTCCAAC-------ACT----ATATACCAAATTTAG-----------TG-A--CTCTAAGTCAA--ATA---GTTTCT------G---A---G---AA---
gi|5 : A---GTTT-T------G---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACT---ATATAC-CAA-A-TTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TCTCT-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcat---A--A-----A-A-TCA-CT----ACA-TG-------GCTTA-----G------AT-T---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTTAAATGGACCAA--AT--------TTT-GA--GACT------CCAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAA----TC-GGGGCT---AA--------ATGCAAAA-----AA------CATAATCT--------G-T-C-G------T--AGGC----CAAG-TTA--A---TA---------T-----------TCAT---CAGCAGAGGT--TAA----G-GTCA----C--------CAAATAAATAATGCTGC------A-TG---G----------------TT--TG-AT----TA----G--T---AAT-ACCC----ATTATATA------ACTATG------G-GCCAA--ATACACTTACTTTT---GGCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--AA-----AGCCAAATA--------CAA---AAAC-T-T---AGGGTTAT-TAAGTTATT--TTTGCATA-----AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATTCT
gi|6 : TAAATGCAAAA-----A----ACATAATC--TGTCGTAG------GCCA--AGT---TAA------TAT--TC--ATCAGCA--GA--GGTTA------AGGTC--A-------C---C---A---A--ATAAATA-A-T-G-CT----GCA-TG-------GTTT------G------AT-T---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACTA--TGGGCCAA--ATACAC----TT-------ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAA----AT-AAAGCC---AA--------ATAC-AAA-----AA------CTTAG--G--------G-T-T-ATTAAGTT--ATTT----T----T----G---CA---------TAAAAGTCAAGGTCAT---C--C----AA--AA---------CA----T--------T---------------C--------TT---C----------------TT--GA-TTTC--AA----G--TGGAACT-ACCC----ATTACACA------GTTATA------G-ACCtcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggcAA-----ATACAA---AAAC--T----TAG-GGTT-------A-T---TAA----GTTAT--TT--TTG--CATAAA--AGTCA------AGGTC--A------TC---C---A---A--A-----ACA-T-T-CT----TCT-TG-------ATTTC-----A------AG-T---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTTA--TAGACCTAT-AT------------GGT-GACT------CTAGGTT---AAACATTTT---CTGAGAA----GC-GGAGCT---CA--------ATGC-AAA-----AAG-----GTTAA-C---------G-T-T-GAAC---T--ATTtatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagcc---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTT---ATAGAC-CTA---TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TCTTT-TTTTATC-----TTCGAAAAG---GT---AAGACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtgCCCAT-TA-CACA------ACTTGGATGAACACAACACTTTGGTGACTCAAGGACAGACAGTTTCAA---AGAAA
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaat----------------TT--GG-AT----GA----A--C---ACA-ACACTTTGGTGACTCA------AGGACA------G-AC--A--G----------TTTCAAAG-------------------AAAT--AT-----A--AAAAT---------TAA---CATTTTGT---AAG----C-CAAGTTAATTATTTGT--T-----AAGGTCAAGGTCATC----tataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacCAAAGAA-----ATATAA---AAA---T----TAACATTTTGT-A--A-G---CCAA---GTTAA--TT--ATT--TGTTAA--GGTCA------AGGTC--A------TC---T---A---A--A-----A--------------CA-AA-------ATTTG-----G------GG-T---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CCA--T--ACCAT--AG--------TTA-AGT-GACA------CTGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAA----AC-AGAGCTG--AA--------ACAC-AAACAAGCAG------CATAA-CA--------GTT-T-G------T--GATCTAAGC----TAA--A---TA---------T-----------TCAT---A--T--AGGT--CAA----G-GTCA-------------T---------------CTGAAGAA-TGTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGTA----GT-T---ACT-ACAC----ATAACACA------ACTATA------G-ACTAA-------------TTT---GG-------------------taaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagttt----------G-----GCC----AAAT----AA------TTTAAAA-G---AAACA--------------GAGCTGAA------A-CAC---AAACAAGCAG-CAT--AACAGTTTGT-GATCTAAGCTAAAT-----ATTC---A--T--ATAGGTCAAGG------------TCA-TC-----TG---A-A-------GAATGTCTGCA-TC-------ATTT--------T--G--------AGTACCGTAGTTACTACACA---TAACA-CA---ACT----ATAGACT-AATTTGG-----------TG-G--C-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgTTT-T------G---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACT---TTGAAA-TAA-A-TGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGtctgggcaactgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactg--------------GAGCT-AA------A-CAT---AAA------AACAT--AACATT--GT-G--------TAAGTT----ATTC---ATCT--ATAGGTCAA--------------CCA-AC----------A-G-------CAAT--CTGCG-CG-------GTTT--------tgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatgTAAACATAAAA-----ACATAACAT-----------------TGTGT------------AA---GTTAT--TC--ATC--TA--TA--GGTCA------A--------------C---C---A---AC-AGC---A-A-T---CT----GCG-CG-------GTTTC-----A------AA-T----------G---------T----A---------A----------------------A---------------TA--TAGATAAA--AG--------TT--AGT-GATT------GTATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATG----AT-CGTGGT---CA--------ACAC-AAA-----AA------caaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACTA--TGAATAAA--AT--------TTG-G-T-GACT------CTTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAA----A---AA--T---TG--------ACAC-AAA-----TA------CTTAA-CA--------T-T-T-G------T--AGGC----CAATTT----AAT-TA---------T-----------TCAT---A--T--AGGT--CAA----G-GTCAT---C--------TGAAAATATCTG----C------A-TG---G----------------TT--CAGAT----TA----G--T---GCT-ATCT----GTAGCACA------GCTATG------A-ACCA--------------CTT---GG-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg-CAC---AAAT-----A-CTT--AACATTT-GT-AGGCCAATTTAA-TT----ATTC---A--T--ATAGGTCAAGG------------TCA-TC-----TG--AA-A-------ATAT--CTGCA-TG-------GTTC--------A--G--------ATTA-----GT-GCTATCTG---TAGCA-CA---GCT----ATGAACC--ACTTGG-----------TG-tgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 111111 6666666666666666666666666666666666666 33333333333 11111111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2222222222222222 111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111 1111111 222222222222 3333333 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 222222 222222 11111111111 111111111111111 3333333333333333333333333333 1111111111 11 1111111 22222222222222222222 2222222222 111 11111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 333333333333333333333 111
lowQualScore : 5 22222 000000 4 1 3333333333333333333333333333333333333 44 44 66666666666 777777 8888888888 7777777 55 33333333333333 7777 6666666 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 333 22 1 1 55 6666666666666666 1 555555 0 333 6 55555 77777777 55 333333333 6666666 77777 555 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 4 1 777777 99999999 1 2 66666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 6666666666666666666 2222222 1 0 0 999999999999 0 7777777 5 00 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 6666666 666 111111 3 2 55 333333 3 33333333333 1 777777777777777 2222222222222222222222222222 5555555555 00 44 3 0000000 55 00000000000000000000 666 2 7777 6 2 7777777777 000 3 00000000 888 555 555 4 4 222222 0 0 1 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 4 0 4 4 555555555555555555555 000 5
lowQualScore : . ..... ...... . . ..................................... .. .. ........... ...... .......... ....... .. .............. .... ....... ...................................................................................... ... .. . . .. ................ . ...... . ... . ..... ........ .. ......... ....... ..... ... ....................................................................................................................................................................................................... . . . ...... ........ . . ..... ......................................................................................... ................... ....... . . . ............ . ....... . .. .................................................................. . ....... ... ...... . . .. ...... . ........... . ............... ............................ .......... .. .. . ....... .. .................... ... . .... . . .......... ... . ........ ... ... ... . . ...... . . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. . . . . ..................... ... .
lowQualScore : 0 55555 999999 4 9 8888888888888888888888888888888888888 22 22 11111111111 222222 6666666666 2222222 00 22222222222222 4444 8888888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222 55 6 7 99 9999999999999999 9 555555 5 333 6 44444 00000000 77 555555555 8888888 44444 222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 9 0 777777 77777777 4 7 77777 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000000000000000000 9999999 0 1 1 111111111111 8 4444444 7 00 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 6666666 444 444444 6 3 00 222222 6 55555555555 3 222222222222222 3333333333333333333333333333 1111111111 66 66 3 8888888 00 88888888888888888888 444 6 7777 5 1 5555555555 666 1 99999999 999 000 000 4 4 888888 1 8 7 1 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 4 1 4 4 222222222222222222222 000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACAT-----AAAAAC-ATA-AC-ATAANCT----TAA--ATTTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT-C------TAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAA----AC-GGAGCT-NAA-C----GC-A-------AA-----AA-CTTAA-CG--------G-T-TG------T--ATTC----C----T----G---TA---------TTCAT---C--C--A---GGTN----A-AGGTCA----C--------T---------------C------A--------T-------------G---G----------------TT--GA-NT----NA----G--T---ACT-ACCCATNACACA------ACTA--------TGG-ACC-----AA--G----------T--T--T----GG-------------------AAAC--AG-----AGC--AA------------AATG--------TAA---CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----A-AGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GTAT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA-----A-CAC---AAA------A-CTTA--ACATTNC----GT-GGNCTAAGTTAAGTTATTC-----G--T----ANAGGTCAAG--G------------TCATC-----CGGAAAA-------A--AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTA-----GT-ACTACCCA---TNACACAACT----ATAGACCAAATTTGGCGA--C-CG-AGNTCAA-A-CAG-TTT-T------GA---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TC-TCT-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACAT-----AAAAAC-ATA-AC-ATAANCT----TAA--ATTTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATN--CG--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT-C------TAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAA----AC-GGAGCT-NAA-C----GC-A-------AA-----AA-CTTAA-CG--------G-T-TG------T--ATTC----C----T----G---TA---------TTCAT---C--C--N---GGNA----A-AGGTCA----C--------T---------------C------A--------T-------------G---G----------------TT--GA-NT----NA----G--T---ACT-ACCCGTNACACA------ACTA--------TGG-ACC-----AA--G----------T--T--T----GG-------------------AAAC--AN-----AGC--AA------------AATG--------TAA---CA--TCGTG---T---AGG----CC-AAGTTATTCATCCGCA-G-----A-AGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTC----GTAT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA-----G-CAC---AAA------A-CNTA--ACATTNC----GT-GGTCTAANTTAAGTTATTC-----A--T----ANAGGTCAAG--G------------TCATC-----CNGAAAA-------A--AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTA-----GN-ACTACCCA---TAACACAACT----ATAGACCAAATTTGGCGA--C-NG-AGNTCAA-G-CAG-TTT-T------GA---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TC-TCT-TTTT-TCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACAT-----AAAATT-TTG-GT-ATAAAATGTG-TCATTATTTTAACA--A-T---TAAA---GTTAT--TT--ATC--CG--GA--CGTCA------TGGTC--A------TCA---A---G--A-----A-A--T-G-CT----GTTTG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CTA--AT--------TTG-GGG-GACT-A------TAAGCC---AAACAATTT---TTGATAA----AC-GGAGCT-AAC-A----AC-A-------AA-----AA-CTT-A-TG--------G-T-TG------T--ATTC----C----T----G---TA---------TTCAT---C--CCGG---GGGA----G-GGGTCA----C--------T---------------C------A--------------------------------------------T--AA-CT----CA----G--T---TCT-GCCCATAACATA------ACTA--------TAG-ACC-----AA--G----------T--T--T----GG-------------------AAAC--AG-----AGC--TA------------AATA--------TAA---GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCACA-ACAGTTA-AGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTC----ATAT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA-----G-CAC---AAA------A-TATA--AGATTTG----GT-GGTTTTATTTACGTCATCCCAAAGG--T----TAAGGTCAAG--G------------TCAAC-----CGGAAAA-------A--AATG-CT--GTA-TG-------GTTTT--G--------AACA-----GC-ACTACCCA---TAATATAACT----ATAGACCAAGTTTGGAAA--C-AG-AGCTTAACG-CAA-TTT-T------GA---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TC-TAT-T------T----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA--AT--------TTG-G-T-GAGC-T------TGGACT---AAACATTTT---CTGAAA-----------GCT-AAAAC----G--A-------AA-----AA-CTTAA-CA----------T-TG------T--GTTG----G----T--------TA---------TTTAT---T--T--GTATGGTC----A-AAGTCGT---C--------C---------------C------A--------TAAGGTGCTAAAGAG---G----------------TTT-GG-AT-----A----G--A---ACT-ACCCATTACCCA------ACTA--------CAG-ACC-----AA--A----------T--T--T----GG-------------------ATAC--cta
gi|10 : TAAACATTTTCTGAAAGCTAAA-ACGAAAAACT----TAAC-ATTGTG-------T---TG-----GTTAT--TT--ATT--TG--TAT-GGTCA------AAGTC--G------TCC---C---A--T-----A-AGGT-G-CT----AAAGA-------GGTTT-----G------GAT---A------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------C--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------TTG-GAT--ACT-C------TAGGTC---ATACA----------------------GAGTT-CAA-T----GCAA-------AA-----AA-CTTGA-T---------A-T-TG------A--ATTtctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggacA--------------AAGCT-AA-----AACGA---AAA------A-CTTA--ACATTGT----GTTGGTT-------ATTTATTT-----G--T----AT-GGTCAAA--G------------TCGTC-----CC--ATA-------A--GGTG-CT--AAA-GA-------GGTTT--G--------GATA-----GA-ACTACCCA---TTACCCAACT----ACAGACCAAATTTGGgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgGCTAAA-G-AGG-TTT-G------GATA-G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TC-TCA-TTTT-TCT----T-----atactctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtA--------------GAGCT-AA-----A-CAC---AAAC-----A-TTTA--ACATTGT----GT-AGGTTAA--TAAAT----C-----A--T----GGAGGTCAAG--A------------TCA-C-----TTGACAA-------A--GATA-CT--GCACTG-------ATTTT--G--------A-----------ACTACCCA---TCACACAAAA----ATA-AC----TTTAGTGA--CTCG-AGGTCAA-A-CA------T------GA---G---GA---tcttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaa-TTT-T------GA--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TT-TAT-TTTT-CCT----C-----AAGAATGT---GAG---ACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaGTCTAG--G------------TCATC-----CA-AAAA-------C--AATA-CC--TCA-TT-------GTTCT--G--------AGCG-----GC-ATAACTCA---TTACACAACT----CTAGACCACATTTGTCCA--C-------TCCA-A-CAG-TTT-TTGTATAGA---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TC-TAT-TTTT-TCT----TCA---AAA----TGAAAAG---AAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--A------TCC---A---AGAA-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACT---A--TTGAC-CAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT-C------TAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAA----AC-GGAGCT-CAA-tt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TC-TCTCTTTT-TCT----T-----TGG----A---AAGGTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaACA------ACTC--------TGG-GCC-----AAAAG----------T--T--TCAA-AG-------------------AAAC--AG-----AAT--AA------------AATG--------CAAAGACA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCACA-G-------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|15 : gtgC--A------TCC---AGAAA--A-----A-A--T-A-GT----ATATA-------GTTAT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATT---A--C---C-CAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA-T------TGGACC---AAACACTTT---CCAAGAA----AC-AGCGCT-TAA-A----ACAA-------AA-----AA-CTTtaagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatg--GA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---AGA-A--A-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---G------GTT-------T----A---------ATT-------------C------A--CTATAT----AACT---A--TGGAA-TAA--GTG-------TTG-
gi|16 : taGTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Taattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagt---A---A--A-----A-A----G-CT----GCAAG-------GCTTT-----G------AGT---ACCTC--A---------T----A-------------------------C------A--C---------AGCA---A--TGAAC-CAA--AT--------TT--GGT-GACT-G------GGGG-------ACAGTTT---TAAAGAA----AC-GGAGCtagtataa
gi|19 : -T---TAA-----TTAT--TCTTATA---A--GA--GGTCATTGTTGAGGTC--A------TCC----------A-----A-A--T-A-CT----CCATT-------GTTAT-----C------AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACT---A--TGAAC-CAA--AG--------TTG-Gatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-G---TAAA---AT-AT--TC--ATA------GA--GGTC---------GTCTAA------TA----A---A--A-----A-A--T---CTATTTGCATG-------GTTTT-----G------------A------G---------T----A---------C---------------C------A--C---------AACT---A--TGAGC-CA-------------TTC-AGT-GATT-C------TAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAA----AC-GGAACT-AAG-C----A--A-------AA-----AA-C--AA-TGTAGGAGAAG-T---------T--ATTA----C----TAGAGG---TAAAAGTCAAGTTAAT---C--T--------GA----A-ATATAA----C--------TG--------------A------A--------T-------------G---GT---------------TT--TT-AT----TA----G--T---AGT-AACCGTAACACA------ACCA--------TTG-ACC-----AA--C----------T--T--T----GG-------------------CAAC--
gi|2 : tgaagAA---GTTAT--TA--CTA------GA--GGTAA------AAGTC--AAGTTAATCT---G---A--A-----ATA--T-AACT----GAATG-------GTTTTTATTAGT-----AGT---AACC---G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACC---A--TTGAC-CAA--CT--------TT--GGC-AACT-C------TAGATC----GACAGTTT---TTGAAAAAAAGAT-GGAGCT-AAA-T----GC-A-------AA-----AA-AATAA-C---------A-T-TG------T--GTAG----G----C----GAAATAT--------TTCAT---C--C--A-----CA----G-AGGTCAATATCAGCTGAAAT---------------C------A--------T-------------GCT-GTATTCTT---------TT--GA-AT----GA-------T---ACT-GTCCATTATACA------ACAA--------AGGCACT-----GA--G----------T--T----------------------------AATT--AA-----A----AA------------AACT--------TCA---CG--TAGTG---T---AGA----CC-AAGTTGTTCATCTG-A-A-----A-AGGTCAAGATCAGC-----CAAAG-GGTT-TTGCAT----------G-----GTtctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagCA------ACTC--------TAG-ATC-----GACAG----------T--T--TTT--GA-------------------AAAA--AAGATGGAGC--TA------------AATGCAAAAAAATAA---CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCACA-G-----A--GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATG-CTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCCATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTT-AA-----T-TA----AAA------A----A--ACTTCAC----GT-AGTGTAGACCAAGTTGTTC-----A--TCTGAAAAGGTCAAG--A------------TCAGC-----C---AAA-------G--GGTT-TT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTT-----GA-ACTAACCA---TTACACAACT----ACAGACCAAATTAGGCAATTC-T--ATATCAA-A-CAG-TTTCT------GA---G---GA---tttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggAA---GTTGT--TC--ATC--TG--AAAAGGTCA------AGATC--A------GCC---A---A--A-----G-GG-T-T-TT----GCATG-------GTTTT-----G------AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------T-A-GGC-AATT-C------TATATC---AAACAGTTT---CTGAGGA----AC-AGGACT-TTA-CAGG-AC-A-------AA-----AA-CTTAA-CA--------A---TG------A--ATTG----C----T----G---acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccG-TTT-T------GA---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TT-CCT-TTTT-CCTCAAAT-----AAG----C---AAG---ACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTCT-TTTT-CCT----T-----CGA----A---AAG---ACAA-AAA
gi|3 : aatA-----G-CACCAGGAA------A-CGTA--GCATTT-----GT-AGACCAAGTTGA-TTATTT-----G--T----A------AAG--G------------TCTTT-----CT-AAAA-------A--AATG-TT--GCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA-----GT-ACTACCTA---TTACACCACT----ATGGACCAAGTTgt
gi|3 : GTAA------AGGTC--T------TTCTAAA---A--A-----A-A--T-G-TT----GCGTGTTTTTCTGTTTTTCGT-GTTTTTCGGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACT---A--TGGAC-CAA--GT--------T-A-AGT-TACT-T------GGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAA----AC-AGAGCT-AAA-CTAATGC-ACACAAAAAA-----AA-ATCCA-TA--------A-T-TT------T--TTTTAAG-T----T----GGT-TA---------TTCAT---A--A--A---GGTC----A-GGGTCA----C------------------------C------A--------T-------------G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----AGTACTG--T---ACT-ATCTATAACACA------ACTA--------TGG-TTTCTGAAAA--A----------T--GGGT----GT-------------------AAAC--AT-----A----AA------------AATA--------TAA---CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---A-AGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT--CGGCAT----------G-----GTT----TT-----------------------------------------GAG-T-AG-----T-CAC---ATG------A-CTTCTCATATCACAACTGT-GGACCAAATTTGGTTACT----------------AGGCCAAACAG------------T--TC-----TGGAGAA-------ACAAGAG-TTTAACA-CA-------ATT----G--------ATTA-----GT-ACTATCCA---TAACACGACTTATAATGGACTAAATTTAGTGACCC-TG-AG--CAA-GACAG-TTTCT------GA---G---AA---aagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttGGGTGTAAACAT-----AAAAAT-ATA-AC-ATAGGCT----TAA--ATTTTAATATGA-G---TAAAG--GTTATGGTC--AT-------------TTA------AGAT------------G---A---A--A-----A-A--T---CG----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACT---G--TGGAC-CAA--AT--------TTG-G-----TTAC------TAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAA----ACAAGAGTT-TAA-C----AC-A-------A---------------------------T-TG---------ATTA--------------G---TA---------CT-AT---C--C--A-----TA----ACACG--A----C--------T---------------T------A--------T-------------A---A----------------TG--GA-CT----AA----ATTT---AGTGACCC-TGA-GCA------A-------------G-AC-------A--G----------T--T--TCTG-AG-------------------AAGC--AT-----AGC--AA------------AATGCGAAACC-TAA---CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTGTA-G-------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAA-G---AAAAG--------------AAGCT-AAAACATG-CAC---AA---------CTTA--ACATTTT----GT-GAGTTAAACTAA-TTATTC-----A--T----AGAGGTAAAG--A------------TCCTC------TGAAAA-------T--ACT--CT--GCA-TG-------GTATT--G--------TATA-----GT-ACTACCTA---TAAAACAGCT----ATAAACC--ATTCTGTGA--C-TGTAGATTAA-C-CAGATTT-T------GA---G---AA---
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataAAAAC-ATG--C-ACAA-CT----TAAC-ATTTTGTGA--G-T---TAAACTAATTAT--TC--ATA------GA--GGTAA------AGATC--C------TCT---G---A--A-----A-A--T-A-CTCT--GCATG-------GTATT-----GTAT---AGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCT---A--TAAAC-CA-------------TTC-TGT-GACT-G------TAGATT---AACCAGATT---TTGAGAA----AC-AGAACT--AA-T----GT-A-------AA-----AA-TTTAA-CA--------G-TGTG------T--AT--------------------TA---------TTCAT---C--C--A---AACAAGTCA-AGGTCA----C--------acagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagct-----AGAAAC-AGA-AC--TAATGT----AAA--AATTTAACA--G-TGTGTA------TTAT--TC--ATC--CA--AACAAGTCA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAA--A-A--T-A-CT----ACATG-------GTTTTCA---G------AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACT---G--TTGGC-AAT--AT--------CTG---CTGACT-CAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAGAA-----T-TGAACT-GTA-C----GC-A-------AA-----AA-TTTAA-C---------A-T-TA------TTAATTT----TA---T----G---TA-----------CATGTAC--C--T---GAAA----A-A----A----T--------T---------------T------T--------T-------------G---GTT--------------TT--GA-AT-----A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTACCA--------TAG-ACC-----AA--A----------T--T--T----GG-------------------caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgG-TTT-T------GAATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGAT-CAA--AT----------GAGGC-GACT-C------TAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAA----AC-A-AGCT-AAA---------G-------AA-----AA-T---------------G-T-TG------T-----C----A----T----GG--TA------------A----C--C--T---GCAA----A-ACTTC--------------TG--------------C------A--------T-------------G---G----------------TTTTGA-TT----G-----G--T---ACT-ATCTGTAACAAA------ACTA--------TTG-ACC-----AAA-G----------T--C-----------------------------AACTTAA-----AAC--AA------------AAAC--------TAAA--CA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A--GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATG-CTGCCT----------G-----GTTTTGAGTATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA-----A-CGC---AAAC-----A-CTTA--ACGTTGT----GA-GGTCGAAGTT-ACTTATCC-----A--G----AAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTCAAAAAAGAGAAGCA--AATG-AT--GCA-TA-------GTTTT--G--------AGT---------ACTACCCACTCCAAC---ACT----ATATACCAAATTTAGTGA--CTCT-AAGTCAA-A-TAG-TTTCT------GA---G---AA---
gi|5 : AG-TTT-T------GA---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TC-TCT-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgcat---A--A-----A-A--TCA-CT----ACATG-------GCTTA-----G------ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTT---AAATGGAC-CAA--AT--------TTT-GA--GACT-C------CAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAA----TC-GGGGCT-AAA-T----GC-A-------AAA----AA-CATAATCT--------G-T-CG------T--AGGC----CAAG-TTA--A---TA---------TTCAT---CAGCAGA---GGTT----A-AGGTCA----C--------CAAATAAATAATGCTGC------A--------T-------------G---G----------------TT--TG-AT----TA----G--T---AAT-ACCCATTATATA------ACTA--------TGG-GCC-----AA--ATACACTTACTT--T--T----GGCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--AA-----AGC--CA------------AATA--------CAA---AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATT--TTTGCATA-----A-AAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATT-CT
gi|6 : TAAATGC-----AAAAA------AC-ATAATCTGTCGTAG-------GCCA--AGT---TAA------TAT--TC--ATCAGCA--GA--GGTTA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAAATA-A--T-G-CT----GCATG-------GTTT------G------ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACT---A--TGGGC-CAA--ATACAC----TT-------ACT-T------TTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAA----AT-AAAGCC-AAA-T----AC-A-------AA-----AA-CTTAG--G--------G-T-TATTAAGTT--ATTT----T----T----G----------------CAT---A--A--A---AGTC----A-AGGTCA----T--------C---------------C------AAAACATTCT-------------T---C----------------TT--GA-TTTC--AA----G--TGGAACT-ACCCATTACACA------GTTA--------TAG-ACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggcAT-----AAAGCC-AAATAC-AAAAACT----TAG--GGTT-------A-T---TAA----GTTAT--TT--TTG--CATAAA--AGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----ACA--T-T-CT----TCTTG-------ATTTC-----A------AGT---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTT---A--TAGAC-CTAT-AT------------GGT-GACT-C------TAGGTT---AAACATTTT---CTGAGAA----GC-GGAGCT-CAA-T----GC-A-------AA-----AAGGTTAA-C---------G-T-TGAAC---T--ATTtatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaa---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TC-TTT-TTTTATCT----TCGAAAAGG----T---AAG---ACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------AACTTGGA--TGAACACAAC-AC--------TTT-GGT-GACT-C------AAGGAC---AGACAGTTT---C----AA----A---GA-----AA-T----AT-A-------AA-----AA--TTAA-CAT-------T-T-TG------T--AAGC----CAAGTT----AAT-TA---------TTTGT---T--A--A---GGTC----A-AGGTCAT---C--------TAAAA-----------C------A--------A-------------A---AT---------------TT--GG-GG----TA----G--T---TCT-ATCCATACCATA------GTTAAGTGACACTGG-GCC-----AA--A----------TAAT--TTAAAAG-------------------AAAC--AG-----AGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TAA---CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAA-TATTCAT------------ATAGGTCAAGGTCATC-----TGAAG-AATGTCTGCAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATAT-----AAAAAT--TA-AC-AT--TTTG---TAA-------GCCA--AGT---TAA-----TTAT--TT--GTT------AA--GGTCA------AGGTC--A------TCT---A---A--A-----A---------------CAAA-------ATTTG-----G------GGT---A------G---------T------------------------------T------C--T---------ATCC---A--T--AC-CAT--AG--------TTA-AGT-GACA-C------TGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAA----AC-AGAGCTGAAA-C----AC-A-------AACAAGCAG-CATAA-CA--------GTT-TG------T--GATCTAAGC----TAA--A---TA---------TTCAT---A--T--A---GGTC----A-AGGTCA-------------T---------------CTGAAGAA--------T-------------GTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGTA----GT-T---ACT-ACACATAACACA------ACTA--------TAG-ACT-----AA-------------T--T--T----GG-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagT----AA-------AA-G---AAACA--------------GAGCTGAA-----A-CAC---AAACAAGCAG-CATA--ACAGTTT----GT-GATCTAAGCTAAAT-ATTC-----A--T----ATAGGTCAAG--G------------TCATC-----TG---AA-------G--AATGTCT--GCA-TC-------ATTTT--G--------AGTACCGTAGTTACTACACA---TAACACAACT----ATAGACT-AATTTGGTGG--C-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataattGCAA--C-AA-ATTGCAA-A-CTG-TTT-T------GA---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGtctgggcaactgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaa--------------GAGCT-AA-----A-CAT---AAA------AACATA--ACATT------GT-G--------TAAGTTATTC-----ATCT----ATAGGTCAA--------------------------CCAACAG-------C--AAT--CT--GCG-CG-------GTTTtgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatgTAAACAT-----AAAAAC-ATA-AC-AT----------------TGTGT------------AA---GTTAT--TC--ATC--TA--TA--GGTCA------A--------------CC---A---AC-AGC---A-A--T---CT----GCGCG-------GTTTC-----A------AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------T---A--TAGAT-AAA--AG--------TT--AGT-GATT-G------TATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATG----AT-CGTGGT-CAA-C----AC-A-------AA-----AA-caaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACT---A--TGAAT-AAA--AT--------TTG-G-T-GACT-C------TTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAA----A---AA--T-TGA-C----AC-A-------AA-----TA-CTTAA-CA--------T-T-TG------T--AGGC----CAATTT----AAT-TA---------TTCAT---A--T--A---GGTC----A-AGGTCAT---C--------TGAAAATATCTG----C------A--------T-------------G---G----------------TT--CAGAT----TA----G--T---GCT-ATCTGTAGCACA------GCTA--------TGA-ACC-----A--------------C--T--T----GG-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg-CAC---AAAT-----A-CTTA--ACATTT-----GT-AGGCCAATTTAA-TTATTC-----A--T----ATAGGTCAAG--G------------TCATC-----TG--AAA-------A--TAT--CT--GCA-TG-------GTTCA--G--------ATTA-----GT-GCTATCTG---TAGCACAGCT----ATGAACC--ACTTGGTGtgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1111 666666666666666666666666666666666666666 333333333 1111111111111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222222222222 111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 222222222222 3333333 11 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222 222222 111 11111111111 111111111111 333333333333333333333333333333 1111111111111 333333 1 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 333333333333333333333 111
lowQualScore : 5 44444 0000 5 666666666666666666666666666666666666666 44 44 777777777 888888 9999999999999999999999999999999999999 8888 7777777 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 22 888888888 333 22 2 1 44 5555555555555555 777777 0 333 6 66666 4444 666 55 333333 4 7777777 77777 22 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 1 777777 99999999 1 2 66666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777 4 55555555555555 9999999 1 0 888888888888 0 7777777 5 00 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 55 7 55 222222 3 44 111111 4 1 3 888 3 55555555555 2 33 444444444444 888888888888888888888888888888 44 33 2 9999999 1111111111111 33 66666 2 1 6666 88 3 88 3 000000 5 44 5 2 444 0 777777 444 444 444 444 4 4 222222 0 0 1 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 999 4 4 555555555555555555555 000 5
lowQualScore : . ..... .... . ....................................... .. .. ......... ...... ..................................... .... ....... ......................................................................... .. ......... ... .. . . .. ................ ...... . ... . ..... .... ... .. ...... . ....... ..... .. ................................................................................................................................................................................................. . . ...... ........ . . ..... ............................................................................................ ... . .............. ....... . . ............ . ....... . .. ..................................................................... . .. . .. ...... . .. ...... . . . ... . ........... . .. ............ .............................. .. .. . ....... ............. .. ..... . . .... .. . .. . ...... . .. . . ... . ...... ... ... ... ... . . ...... . . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. ... . . ..................... ... .
lowQualScore : 0 33333 9999 0 888888888888888888888888888888888888888 66 66 222222222 222222 0000000000000000000000000000000000000 2222 6666666 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 99 444444444 555 88 0 9 55 8888888888888888 888888 2 555 2 77777 2222 666 99 000000 4 2222222 88888 99 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1 0 777777 77777777 4 7 77777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 888 4 66666666666666 9999999 0 1 222222222222 8 4444444 7 00 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 00 3 00 999999 3 66 111111 2 2 1 444 3 00000000000 1 99 666666666666 777777777777777777777777777777 11 99 9 3333333 6666666666666 99 55555 9 0 1111 33 1 22 3 333333 8 22 7 4 444 0 777777 777 444 444 777 4 4 888888 1 8 7 1 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 000 4 4 222222222222222222222 000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACAT-----AAAAAC-ATAAC-ATAANCTG---TAA--ATTTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATC--CGGA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAA----AC-GGAGCT-NAA-C----GC-A-------AA-----AACTTAA-CAG-T-T-G------T--ATTC----C----T--G-------TA-TTCATN----N----A---GGTCAA--GGTCA-------C-----T---------------C------A--------T-------------G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCATNACACA------ACTA--------TGG-ACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA--A-CG--CAAA------A-CTTA--ACATTNT----GTGGGCCAAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTA--G----TACTACC-CATTACACAACT----ATAGACCAAAT-TTGGT-GA-C-C--G-AGGTC--AA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACAT-----AAAAAC-ATAAC-ATAANCT----TAA--ATTTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATN--CGGA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAA----AC-GGAGCT-NAA-C----GC-A-------AA-----AACTTAA-CGG-T-T-G------T--ATTC----C----T--G-------TA-TTCATC----C----A---GGTNAA--GGTCA-------C-----T---------------C------A--------T-------------G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCATNACACA------ACTA--------TGG-ACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA--A-CA--CAAA------A-CTTA--ACATTNC----GTGGNCTAAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTA--G----TACTACC-CATNACACAACT----ATAGACCAAAT-TTGGC-GA-C-C--G-AGNTC--AA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACAT-----AAAATT-TTGGT-ATAAAATGTG-TCATTATTTTAACA--A-T---TAAA---GTTAT--TT--ATC--CGGA--CGTCA------TGGTC--A------TCA---A---G--A-----A-A--T-G-CT----GTTTG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CTA--AT--------TTG-GGG-GACT------ATAAGCC---AAACAATTT---TTGATAA----AC-GGAGCT-AAC-A----AC-A-------AA-----AACTT-A-TGG-T-T-G------T--ATTC----C----T--G-------TA-TTCATC----C----C---GGGGGAGGGGTCA-------C-----T---------------C------A--------------------------------------------T--AA-CT----C---------A----G--T---TCT-GCCCATAACATA------ACTA--------TAG-ACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------TA--AATA--------TA---A-GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCACA-ACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GT-C---AT---AT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA--G-CA--CAAA------A-TATA--AGATTTG----GTGGTTTTATTTACGTC-ATC----CCAAAGGTTAAGGTCAAG--G------------TCAAC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GTA-TG-------GTTTT----G------AACA--G----CACTACC-CATAATATAACT----ATAGACCAAGT-TTGGA-AA-C-A--G-AGCTT--AACGCAA-T---TT-T------G---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TCT-A-T-T------T----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA--AT--------TTG-G-T-GAGC------TTGGACT---AAACATTTT---CTGAAA-----------GCT-AAAAC----G--A-------AA-----AACTTAA-CA--T-T-G------T--GTTG----G----T----------TA-TTTATT----T----GTATGGTCAA--AGTCGT------C-----C---------------C------A--------TAAGGTGCTAAAGAG---G----------------TTT-GG-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTACCCA------ACTA--------CAG-ACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------ATAC--cta
gi|10 : TAAACATTTTCTGAAAGCTAAAACGAAAAACT----TAAC-ATTGTG-------T---TG-----GTTAT--TT--ATT--TGTAT-GGTCA------AAGTC--G------TCC---C---A--T-----A-AGGT-G-CT----AAAGA-------GGTTT-----G------GAT---A------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------C--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------TTG-GAT--ACT------CTAGGTC---ATACA----------------------GAGTT-CAA-T----GCAA-------AA-----AACTTGA-T-A-T-T-G------A--ATTtctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggacA--------------AAGCT-AA--AACG--AAAA------A-CTTA--ACATTGT----GTTG-----GTTA-TTT-ATT----T-----GTAT-GGTCAAA--G------------TCGTC-----C-C--ATA-------A--------GGTG-CT--AAA-GA-------GGTTT----G------GATA--G----AACTACC-CATTACCCAACT----ACAGACCAAAT-TTGGA-TA-CTC--T-AGGTC--AT-ACAG-gttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctg--AA-AGAG-G---TT-T------GGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TCT-CAT-TTTT-CTT----T-----agttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataaggtgctA--------------GAGCT-AA--A-CA--CAAAC-----A-TTTA--ACATTGT----GTAGGTTAA--TAAA-----T----C-----ATGGAGGTCAAG--A------------TCA-C-----T-TGACAA-------A--------GATA-CT--GCACTG-------ATTTT----G------A-----------ACTACC-CATCACACAAAA----ATA-AC----T-TTAGT-GA-CTC--G-AGGTC--AA-ACA---------T------G---A---G---GA---cttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaa-T---TT-T------G---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TTT-A-T-TTTT-CCT----C-----AAGAATGT---GAG---ACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaGTCTAG--G------------TCATC-----C-A-AAAA-------C--------AATA-CC--TCA-TT-------GTTCT----G------AGCG--G----CATAACT-CATTACACAACT----CTAGACCACAT-TTGTC-CA-C---------TC--CA-ACAG-T---TT-TTGTATAG---A---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TCT-A-T-TTTT-TCT----TCA---AAA----TGAAAAG---AAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--A------TCC---A---AGAA-----A-A--T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACT---A--TTGAC-CAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT------CTAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAA----AC-GGAGCT-CAA-tt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TCT-C-TCTTTT-TCT----T-----TGG----A---AAGGTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaACA------ACTC--------TGG-GCC-----AAAAG----------T---T--TCAAA---G-------------------AAAC--A-----GAAT------------AA--AATG--------CAAAGA-CA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCACA-G------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|14 : gtgAA-G---AAACA--------------GAATA-AA--A-TG--CAAAG-----A-CAT----CATTTT----GAAGGCCAAGTTAC-TT-ATC----C-----ACAGAGATCAAG--G------------TCATC-----TAAGTAAC-------ACTACCCATAGTG-AT--GCA-GG-------GTGTT-----------ACTG--A----TA-TACCACATTACAGAACC----Ataagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|15 : gtgacaactctgggccaaaagtttcaC--A------TCC---AGAAA--A-----A-A--T-A-GT----ATATA-------GTTAT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATT---A--C---C-CAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA------TTGGACC---AAACACTTT---CCAAGAA----AC-AGCGCT-TAA-A----ACAA-------AA-----AACTTatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatgTAGAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-AGAAAA-----------------ATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTG--G----TTTAATT-CACTATATAACT----ATGGAATAAGTGTTG
gi|16 : GTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Taattgttgacccgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagt---A---A--A-----A-A----G-CT----GCAAG-------GCTTT-----G------AGT---ACCTC--A---------T----A-------------------------C------A--C---------AGCA---A--TGAAC-CAA--AT--------TT--GGT-GACT------GGGGG-------ACAGTTT---TAAAGAA----AC-GGAGCtagtataa
gi|19 : -T---TAA-----TTAT--TCTTATA---AGA--GGTCATTGTTGAGGTC--A------TCC----------A-----A-A--T-A-CT----CCATT-------GTTAT-----C------AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACT---A--TGAAC-CAA--AG--------TTG-Gatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-G---TAAA---AT-AT--TC--ATA----GA--GGTC---------GTCTAA------TA----A---A--A-----A-A--T---CTATTTGCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------C----------------------------------------C------A--C---------AACT---A--TGAGC-CA-------------TTC-AGT-GATT------CTAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAA----AC-GGAACT-AA-------GC-A-------AA-----A----AA-CAA-T---G------T--A---------------GGAGAAGTTA-TTACTA----G----A---GGTAAA--AGTCAAGTTAATC-----TGAAA-----------T------A--------T-------------A---A----------------CT--GA-AT----GGTTTTTATTA----G--T---AGT-AACCGTAACACA------ACCA--------TTG-ACC-----AA--C----------T---T--T---G---G-------------------CAAC--
gi|2 : tgaagAA---GTTAT--TA--CTA----GA--GGTAA------AAGTC--AAGTTAATCT---G---A--A-----ATA--T-AACT----GAATG-------GTTTTTATTAGT-----AGT---AACC---G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACC---A--TTGAC-CAA--CT--------TT--GGC-AACT------CTAGATC----GACAGTTT---TTGAAAAAAAGAT-GGAGCT-AAA-T----GC-A-------AA-----AAAATAA-C-A-T-T-G------T--GTAG----G----C--GAAA----TATTTCATC----CACAGA---GGTCAA--TATCAG------CTGAAAT---------------C------A--------T-------------GCT-GTATTCTT---------TT--GA-AT----G---------A-------T---ACT-GTCCATTATACA------ACAA--------AGGCACT-----GA--G----------T---T------------------------------AATT--A-----AA--------------AA--AACT--------TC---A-CG--TAGTG---T---AGA----CC-AAGTTGTTCATCTG-A-A-----AAGGTCAAGATCAGC-----CAAAG-GGTT-TTGCAT----------G-----GTtctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagCA------ACTC--------TAG-ATC-----GACAG----------T---T--TTT-G---A-------------------AAAA--AAGATGGAGC------------TA--AATGCAAAAAAATA---A-CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCACA-G-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATG-CTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCC---ATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTT-AATTA-AA---AAA------A-CTTC--ACGTAGT----GTAGACCAAGTT--GTTCATC----T-----GAAAAGGTCAAG--A------------TCAGC-----C----AAA-------G--------GGTT-TT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTT--G----AACTAAC-CATTACACAACT----ACAGACCAAAT-TAGGC-AATT-C--T-ATATC--AA-ACAG-T---TTCT------G---A---G---GA---tttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggAA---GTTGT--TC--ATC--TGAAAAGGTCA------AGATC--A------GCC---A---A--A-----G-GG-T-T-TT----GCATG-------GTTTT-----G------AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------T-A-GGC-AATT------CTATATC---AAACAGTTT---CTGAGGA----AC-AGGACT-TTA-CAGG-AC-A-------AA-----AACTTAA-CAA---T-G------A--ATTG----C----T--G-------acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccG-T---TT-T------G---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TTC-C-T-TTTT-CCTCAAAT-----AAG----C---AAG---ACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-T-TTTT-CCT----T-----CGA----A---AAG---ACAA-AAA
gi|3 : aatAA------A-CGTA--GCATTT-----GTAGACCAAGTTGA-TT-ATT----T-----GTAAAGGTC------------------TT-TC-----T---AAAA-------A--------AATG-TT--GCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA--G----TACTACC-TATTACACCACT----ATGGACCAAGT-TAAGT-TA-C-TTGG-GGCTTTGAA-ATAG-T---TT-gt
gi|3 : agcaccaggGTAA------AGGTC--T------TTCTAAA---A--A-----A-A--T-G-TT----GCGTGTTTTTCTGTTTTTCGT-GTTTTTCGGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACT---A--TGGAC-CAA--GT--------T-A-AGT-TACT------TGGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAA----AC-AGAGCT-AAA-CTAATGC-ACACAAAAAA-----AAATCCA-TAA-T-T-T------T--TTTTAAG-T----T--GGT-----TA-TTCATA----A----A---GGTCAG--GGTCA-------C---------------------C------A--------T-------------G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----A---------GTACTG--T---ACT-ATCTATAACACA------ACTA--------TGG-TTTCTGAAAA--A----------T---GGGT---G---T-------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AATA--------TA---A-CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT--CGGCAT----------G-----GT------T---TT---------------------------------------GAG-T-AG--T-CA--CATG------A-CTTCTCATATCACAACTGTGGACCAAATTTGGTT-ACT--------------AGGCCAAACAG------------T--TC-----T-GGAGAA-------ACA------AGAG-TTTAACA-CA-------ATT------G------ATTA--G----TACTATC-CATAACACGACTTATAATGGACTAAAT-TTAGT-GA-C-CCTG-AG--C--AAGACAG-T---TTCT------G---A---G---AA---aaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttGGGTGTAAACAT-----AAAAAT-ATAAC-ATAGGCT----TAA--ATTTTAATATGA-G---TAAAG--GTTATGGTC--AT-----------TTA------AGAT------------G---A---A--A-----A-A--T---CG----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACT---G--TGGAC-CAA--AT--------TTG-G-----TTA-----CTAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAA----ACAAGAGTT-TAA-C----AC-A-------A------------------T-T-G---------ATTA------------G-------TA-CT-ATC----C----A------TAA--CACGA-------C-----T---------------T------A--------T-------------A---A----------------TG--GA-CT----A---------A----ATTT---AGTGACCC-TGA-GCA------A-------------G-AC-------A--G----------T---T--TCTGA---G-------------------AAGC--A-----TAGC------------AA--AATGCGAAACC-TA---A-CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTGTA-G------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAA-G---AAAAG--------------AAGCT-AA--AACATGCACA------A-CTTA--ACATTTT----GTGAGTTAAACTAA-TT-ATT----C-----ATAGAGGTAAAG--A------------TCCTC-----T-G--AAA-------A--------TACT-CT--GCA-TG-------GTATT----G------TATA--G----TACTACC-TATAAAACAGCT----ATAAACC--AT-TCTGT-GA-C-T--GTAGATT--AA-CCAGAT---TT-T------G---A---G---AA---
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataAAAAC-ATG-C-ACAA-CT----TAAC-ATTTTGTGA--G-T---TAAACTAATTAT--TC--ATA----GA--GGTAA------AGATC--C------TCT---G---A--A-----A-A--T-A-CTCT--GCATG-------GTATT-----GTAT---AGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCT---A--TAAAC-CA-------------TTC-TGT-GACT------GTAGATT---AACCAGATT---TTGAGAA----AC-AGAACT--AA-T----GT-A-------AA-----AATTTAA-CAG-TGT-G------T--AT----------------------TA-TTCATCCAAAC----A---AGTCAA--GGTCA-------C-----acagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagct-----AGAAAC-AGAAC--TAATGT----AAA--AATTTAACA--G-TGTGTA------TTAT--TC--ATC--CAAACAAGTCA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAA--A-A--T-A-CT----ACATG-------GTTTTCA---G------AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACT---G--TTGGC-AAT--AT--------CT---GCTGACTCAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAG-A----AT-TGAACT-GTA-C----GC-A-------AA-----AATTTAA-C-A-T-T-A------TTAATTT----TA---T--G-------TA---CATG----T----A---CCTGAA--AA-AA-------T-----T---------------T------T--------T-------------G---GTT--------------TT--GA-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTACCA--------TAG-ACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgG-T---TT-T------G---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGAT-CAA--AT----------GAGGC-GACT------CTAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAA----AC-A-AGCT-AAA---------G-------AA-----AAT-------G-T-T-G------T-----C----A----T--GG------TA----ACC----T---------GCAAA--ACTT--------C-----TG--------------C------A--------T-------------G---G----------------TTTTGA-TT----G--------------G--T---ACT-ATCTGTAACAAA------ACTA--------TTG-ACC-----AAA-G----------T---C-------------------------------AACTTA-----AAAC------------AA--AAAC--------TA---AACA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATG-CTGCCT----------G-----GTTTTGAGT---ATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA--A-CG--CAAAC-----A-CTTA--ACGTTGT----GAGGTCGAAGTT-ACTT-ATC----C-----AGAAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTC-AAAAAAGAGAAGCA--------AATG-AT--GCA-TA-------GTTTT----G---------A--G----TACTACC-CACTCCAACACT----ATATACCAAAT-TTAGT-GA-CTC--T-AAGTC--AA-ATAG-T---TTCT------G---A---G---AA---
gi|5 : -ATAG-T---TT-T------G---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TCT-C-T-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgc---A--A-----A-A--TCA-CT----ACATG-------GCTTA-----G------ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTT---AAATGGAC-CAA--AT--------TTT-GA--GACT------CCAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAA----TC-GGGGCT-AAA-T----GC-A-------AAA----AACATAATCTG-T-C-G------T--AGGC----CAAG-TTAA-------TA-TTCATCAG--CAG--A---GGTTAA--GGTCA-------C-----CAAATAAATAATGCTGC------A--------T-------------G---G----------------TT--TG-AT----T---------A----G--T---AAT-ACCCATTATATA------ACTA--------TGG-GCC-----AA--ATACACTTACTT---T--T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGC------------CA--AATA--------CA---A-AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATT--TTTGCATA-----AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATT-CT
gi|6 : TAAATGC-----AAAAA-----AC-ATAATCTGTCGTAG-------GCCA--AGT---TAA------TAT--TC--ATCAGCAGA--GGTTA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAAATA-A--T-G-CT----GCATG-------GTTT------G------ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACT---A--TGGGC-CAA--ATACAC----TT-------ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAA----AT-AAAGCC-AAA-T----AC-A-------AA-----AACTTAG--GG-T-T-ATTAAGTT--ATTT----T----T--G------------CATA----A----A---AGTCAA--GGTCA-------T-----C---------------C------AAAACATTCT-------------T---C----------------TT--GA-TTTC--A---------A----G--TGGAACT-ACCCATTACACA------GTTA--------TAG-ACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggcA-G---AAATA--------------AAGCC-AA--A-TA--CAAA------AACTTA---------------GGGTTA--TTAAGTT-ATTTTTGC-----ATAAAAGTCAAG--G------------TCATC-----C----AAA-------A--------CATT-CT--TCT-TG-------ATTTC----A------AGTG--G----AACTACC-CATTACACAGTT----ATAGACC-TAT-ATGGT-GA-CTC--T-AGGTT--AA-ACAT-T---TTCT------G---A---G---AA---tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctc---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TCT-T-T-TTTTATCT----TCGAAAAGG----T---AAG---ACAA-AAAgcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------AACTTGGA--TGAACACAAC-AC--------TTT-GGT-GACT------CAAGGAC---AGACAGTTT---C----AA----A---GA-----AA-T----AT-A-------AA-----AA-TTAA-CAT-T-TTG------T--AAGC----CAAGTT--AAT-----TA-TTTGTT----A----A---GGTCAA--GGTCAT------C-----TAAAA-----------C------A--------A-------------A---A----------------TTT-GG-GG----T---------A----G--T---TCT-ATCCATACCATA------GTTAAGTGACACTGG-GCC-----AA--A----------TAATT--T---AAAAG-------------------AAAC--A-----GAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TA---A-CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAAT-ATTCATAT-----------AGGTCAAGGTCATC-----TGAAG-AATGTCTGCAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATAT-----AAAAAT--TAAC-AT--TTTG---TAA-------GCCA--AGT---TAA-----TTAT--TT--GTT----AA--GGTCA------AGGTC--A------TCT---A---A--A-----A---------------CAAA-------ATTTG-----G------GGT---A------G---------T------------------------------T------C--T---------ATCC---A--T--AC-CAT--AG--------TTA-AGT-GACA------CTGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAA----AC-AGAGCTGAAA-C----AC-A-------AACAAGCAGCATAA-CAGTT-T-G------T--GATCTAAGC----TAAA-------TA-TTCATA----T----A---GGTCAA--GGTCA-------------T---------------CTGAAGAA--------T-------------GTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGT---------A----GT-T---ACT-ACACATAACACA------ACTA--------TAG-ACT-----AA-------------T---T--T---G---G-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagT----AA-------AA-G---AAACA--------------GAGCTGAA--A-CA--CAAACAAGCAG-CATA--ACAGTTT----GTGATCTAAGCTAAAT--ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G---AA-------G--------AATGTCT--GCA-TC-------ATTTT----G------AGTACCGTAGTTACTACA-CATAACACAACT----ATAGACT-AAT-TTGGT-GG-C-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataattC--AA-ACTG-T---TT-T------G---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGtctgggcaactgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgTAAACAT-----AAAAAC-ATAAC-AT----------------TGTGT------------AA---GTTAT--TC--ATC--TATA--GGTCA------A--------------CC---A---AC-AGC---A-A--T---CT----GCGCG-------GTTTC-----A------AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------T---A--TAGAT-AAA--AG--------TT--AGT-GATT------GTATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATG----AT-CGTGGT-CAA-C----AC-A-------AA-----AAtgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACT---A--TGAAT-AAA--AT--------TTG-G-T-GACT------CTTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAA----A---AA--T-TGA-C----AC-A-------AA-----TACTTAA-CAT-T-T-G------T--AGGC----CAATTT--AAT-----TA-TTCATA----T----A---GGTCAA--GGTCAT------C-----TGAAAATATCTG----C------A--------T-------------G---G----------------TT--CAGAT----T---------A----G--T---GCT-ATCTGTAGCACA------GCTA--------TGA-ACC-----A--------------C---T--T---G---G-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg--A-CA--CAAAT-----A-CTTA--ACATTT-----GTAGGCCAATTTAA-TT-ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G--AAA-------A--------TAT--CT--GCA-TG-------GTTCA----G------ATTA--G----TGCTATC-TGTAGCACAGCT----ATGAACC--AC-TTGGTGGG-T-C--T-ATACC--TA-ACAG-TGACTT-T------G---G---G---Atgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 555555555555555555555555555555555555555 22222222222 111111111111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333333333333333 111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111111111111 222222222222 3333333 11 0000000000000000000000000000000000000000000 22222222222222 1111111111 222222 111 11111111111 111111111111 333333333333333333333333333333 11111111111111111111111 222222222222222 11111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 333333333333333333333 111
lowQualScore : 5 99 0 999999999999999999999999999999999999999 44 8888888 99999999999 777777 777777777777777777777777777777777777 8888 8888888 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 888888888 333 22 2 2 66 1111111111111111 888888 333 5 4444 9999999 3 555555 2 7777777 77777 777 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 1 777777 99999999 1 2 66666 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 777 4 55555555555555 9999999 1 0 888888888888 0 7777777 5 00 4444444444444444444444444444444444444444444 5 888 77777777777777 55 3333333333 222222 3 1 9 0 0 5 888 33 55555555555 2 33 444444444444 555555555555555555555555555555 33 33 2 8888888 00000000000000000000000 2 3 5555 6 888888 2 2 444444444444444 5 2 444 00000000 444 444 444 444 4 4 222222 0 0 1 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 999 4 4 555555555555555555555 000 5
lowQualScore : . .. . ....................................... .. ....... ........... ...... .................................... .... ....... ......................................................................... .. ......... ... .. . . .. ................ ...... ... . .... ....... . ...... . ....... ..... ... . .................................................................................................................................................................................................. . . ...... ........ . . ..... ............................................................................................ ... . .............. ....... . . ............ . ....... . .. ........................................... . ... .............. .. .......... ...... . . . . . . ... .. ........... . .. ............ .............................. .. .. . ....... ....................... . . .... . ...... . . ............... . . ... ........ ... ... ... ... . . ...... . . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. ... . . ..................... ... .
lowQualScore : 0 11 1 999999999999999999999999999999999999999 22 3333333 88888888888 777777 222222222222222222222222222222222222 8888 1111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 999999999 777 99 6 0 88 0000000000000000 222222 777 7 8888 8888888 8 111111 2 2222222 88888 777 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 0 777777 77777777 4 7 77777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 888 4 66666666666666 9999999 0 1 222222222222 8 4444444 7 00 2222222222222222222222222222222222222222222 0 888 55555555555555 11 0000000000 999999 3 7 8 2 8 2 444 88 00000000000 1 99 666666666666 777777777777777777777777777777 11 77 7 7777777 33333333333333333333333 7 9 7777 7 222222 9 9 222222222222222 3 2 111 11111111 444 111 111 444 4 4 888888 1 8 7 1 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 000 4 4 222222222222222222222 000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAAACATAACATAA-CTGTA--A--AT-TTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--T----C--ATC--C--AGA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A-T-A-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAA----C-GGAGCTNAA-C----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CAGT-T-G------T-----------ATTC----C----T--G-------TATTCAT----ANA---GGTCAA--GGTCA-------C-----T---------------C------A--------T-------------G---G----------------TT--GA---------NT--N----A----G--T---ACT-ACCCATNACACA------ACTA--------TGG-ACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A---CGCAAA------A-CTTAACATT-TGTGGGCCAAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTA--G----TACTACC-CATTACACAACT----ATAGACCAAAT------TTGGT-GA-C-C--G-AGG---T--CAA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAAACATAACATAANCTGTA--A--AT-TTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--T----C--ATC--C--GGA--GGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----A-A-T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAA----C-GGAGCTNAA-C----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CAGT-T-G------T-----------ATTC----C----T--G-------TATTCAT----NNA---GGTCAA--GGTCA-------C-----T---------------C------A--------T-------------G---G----------------TT--GA---------NT--N----A----G--T---ACT-ACCCATNACACA------ACTA--------TGG-ACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A---CGCAAA------A-CTTAACATTNTGTGGGCCAAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTA--G----TACTACC-CATTACACAACT----ATAGACCAAAT------TTGGT-GA-C-C--G-AGG---T--CAA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACATAAAATTTTGGTATAAAATGTGTCATTAT-TTTAACA--A-T---TAAA---GTTAT--T----T--ATC--C--GGA--CGTCA------TGGTC--A------TCA---A---G--A-----A-A-T-G-CT----GTTTG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CTA--AT--------TTG-GGG-GACT------ATAAGCC---AAACAATTT---TTGATAAA----C-GGAGCTAAC-A----AC-A-------AA-----AA-C-TT-A-TGGT-T-G------T-----------ATTC----C----T--G-------TATTCAT----CCC---GGGGGAGGGGTCA-------C-----T---------------C------A--------------------------------------------T--AA---------CT--C----A----G--T---TCT-GCCCATAACATA------ACTA--------TAG-ACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------TA--AATA--------TA---A-GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCACA-ACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GT-C---AT---AT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA----G---CACAAA------A-TATAAGATTTGGTGGTTTTATTTACGTC-ATC----CCAAAGGTTAAGGTCAAG--G------------TCAAC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GTA-TG-------GTTTT----G------AACA--G----CACTACC-CATAATATAACT----ATAGACCAAGT------TTGGA-AA-C-A--G-AGC---T--TAACGCAA-T---TT-T------G---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TCT-A-T-T------T----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA--AT--------TTG-G-T-GAGC------TTGGACT---AAACATTTT---CTGAAA-----------GCTAAAAC----G--A-------AA-----AA-C-TTAA-CA-T-T-G------T-----------GTTG----G----T----------TATTTAT----TTGTATGGTCAA--AGTCGT------C-----C---------------C------A--------TAAGGTGCTAAAGAG---G----------------TTT-GG---------AT-------A----G--A---ACT-ACCCATTACCCA------ACTA--------CAG-ACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCT-AA----AA--CGAAAA------A-CTTAACATTGTGTTGG-----TTA-TTT-ATT----T-----GTAT-GGTCAAA--G------------TCGTC-----C-C--ATA-------A--------GGTG-CT--AAA-GA-------GGTTT----G------GATA--G----AACTACC-CATTACCCAACT----ACAGACCAAAT------TTGGA-TA-CTC--T-AGG---T--CAT-ACAG-tctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctg-AGG---TGCTAA-AGAG-G---TT-T------GGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TCT-CAT-TTTT-CTT----T-----agttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataA--------------GAGCT-AA----A---CACAAAC-----A-TTTAACATTGTGTAGGTTAA--TAAAT---------C-----ATGGAGGTCAAG--A------------TCA-C-----T-TGACAA-------A--------GATA-CT--GCACTG-------ATTTT----G------A-----------ACTACC-CATCACACAAAA----ATA-AC----T------TTAGT-GA-CTC--G-AGG---T--CAA-ACA---------T------G---A---G---GA---cttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaa-T---TT-T------G---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TTT-A-T-TTTT-CCT----C-----AAGAATGT---GAG---ACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaGTCTAG--G------------TCATC-----C-A-AAAA-------C--------AATA-CC--TCA-TT-------GTTCT----G------AGCG--G----CATAACT-CATTACACAACT----CTAGACCACAT------TTGTC-CA-C------------T--CCA-ACAG-T---TT-TTGTATAG---A---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TCT-A-T-TTTT-TCT----TCA---AAA----TGAAAAG---AAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--A------TCC---A---AGAA-----A-A-T-G-CT----GCATG-------GTTTT-----G------GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACT---A--TTGAC-CAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT------CTAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAAA----C-GGAGCTCAA-tt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TCT-C-TCTTTT-TCT----T-----TGG----A---AAGGTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaACA------ACTC--------TGG-GCC-----AAAAG----------T---T--TCAAA---G-------------------AAAC--A-----GAAT------------AA--AATG--------CAAAGA-CA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCACA-G------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|14 : gtgAA-G---AAACA--------------GAATA-AA----A---TGCAAAG-----A-CAT--CATTTTGAAGGCCAAGTTAC-TT-ATC----C-----ACAGAGATCAAG--G------------TCATC-----TAAGTAAC-------ACTACCCATAGTG-AT--GCA-GG-------GTGTT-----------ACTG--A----TA-TACCACATTACAGAACC----Ataagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|15 : gtgacaactctgggccaaaagtttcaTTAC--C----T--ATC--CCTGGA--TGTTG------AATGC--A------TCC---AGAAA--A-----A-A-T-A-GT----ATATA-------GTTAT-----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATT---A--C---C-CAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA------TTGGACC---AAACACTTT---CCAAGAAA----C-AGCGCTTAA-A----ACAA-------AA-----AA-C-TTatatcatgatacac
gi|16 : TAGAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-AGAAAA-----------------ATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTG--G----TTTAATT-CACTATATAACT----ATGGAATAAGTGTTGAATTGTT-GA-C-C--
gi|16 : GTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Tcgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagtAA-------A--------AA-G-CT--GCA-AG-------GCTTT----G------AGTA---------C--CT-CAT-ACACAGCA----ATGAACCAAAT------TTGGT-GA-C-T--G-GGG--------G-ACAG-T---TT-TA-----A---A---G---AA---tagtataa
gi|19 : -T---TAA-----TTAT--T----CTTATA-----AGA--GGTCATTGTTGAGGTC--A------TCC----------A-----A-A-T-A-CT----CCATT-------GTTAT-----C------AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACT---A--TGAAC-CAA--AG--------TTG-Gacggagcatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-G---TAAA---AT-AT--T----C--AT------AGA--GGTC---------GTCTAA------TA----A---A--A-----A-A-T---CTATTTGCATG-------GTTTT-----G------------A------G---------T----A---------C---------------C------A--C---------AACT---A--TGAGC-CA-------------TTC-AGT-GATT------CTAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAAA----C-GGAACTAA-------GC-A-------AA-----A------AA-CAA--T-G------T-----------A---------------GGAGAAGTTATTACT----AGA---GGTAAA--AGTCAAGTTAATC-----TGAAA-----------T------A--------T-------------A---A----------------CT--GAATGGTTTTTAT--T----A----G--T---AGT-AACCGTAACACA------ACCA--------TTG-ACC-----AA--C----------T---T--T---G---G-------------------CAAC--
gi|2 : tgaagAA---GTTAT--T-------A-C--T--AGA--GGTAA------AAGTC--AAGTTAATCT---G---A--A-----ATA-T-AACT----GAATG-------GTTTTTATTAGT-----AGT---AACC---G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACC---A--TTGAC-CAA--CT--------TTG-G-C-AACT------CTAGATC---GA-CAGTTT---TTGAAAAAAAGAT-GGAGCTAAA-T----GC-A-------AA-----AA-A-ATAA-CA-T-T-G------TGTAGGCGAAATATTT----C----------------ATCCAC----AGA---GGTCAA--TATCAG------CTGAAAT---------------C------A--------T-------------GCT-GTATTCTT---------TT--GA---------AT--G----A-------T---ACT-GTCCATTATACA------ACAA--------AGGCACT-----GA--G----------T---T------------------------------AATT--A-----AA--------------AA--AACT--------TC---A-CG--TAGTG---T---AGA----CC-AAGTTGTTCATCTG-A-A-----AAGGTCAAGATCAGC-----CAAAG-GGTT-TTGCAT----------G-----GTtctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatggttttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagCA------ACTC--------TAG-ATC-----GACAG----------T---T--TTT-G---A-------------------AAAA--AAGATGGAGC------------TA--AATGCAAAAAAATA---A-CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCACA-G-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATG-CTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCC---ATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTT-AATTAAA------AAA------A-CTTCACGTAGTGTAGACCAAGTT--GTTCATC----T-----GAAAAGGTCAAG--A------------TCAGC-----C----AAA-------G--------GGTT-TT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTT--G----AACTAAC-CATTACACAACT----ACAGACCAAAT------TAGGC-AATT-C--T-ATA---T--CAA-ACAG-T---TTCT------G---A---G---GA---tttgagttgaactaaccattacacaactacagaccaaattaggcaattctatatcaaacagtttctgaggaacaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggAA---GTTGT--T----C--ATC--T--GAAAAGGTCA------AGATC--A------GCC---A---A--A-----G-GGT-T-TT----GCATG-------GTTTT-----G------AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------T-A-GGC-AATT------CTATATC---AAACAGTTT---CTGAGGAA----C-AGGACTTTA-CAGG-AC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CAA--T-G------A-----------ATTG----C----T--G-------acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccG-T---TT-T------G---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TTC-C-T-TTTT-CCTCAAAT-----AAG----C---AAG---ACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-T-TTTT-CCT----T-----CGA----A---AAG---ACAA-AAA
gi|3 : aatAA------A-CGTAGCATT-TGTAGACCAAGTTGA-TT-ATT----T-----GTAAAGGTC------------------TT-TC-----T---AAAA-------A--------AATG-TT--GCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA--G----TACTACC-TATTACACCACT----ATGGACCAAGT------TAAGT-TA-CTT--G-GGGCTTT--GAA-ATAG-T---TT-gt
gi|3 : agcaccaggGTAA------AGGTC--T------TTCTAAA---A--A-----A-A-T-G-TT----GCGTGTTTTTCTGTTTTTCGT-GTTTTTCGGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACT---A--TGGAC-CAA--GT--------T-A-AGT-TACT------TGGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAAA----C-AGAGCTAAA-CTAATGC-ACACAAAAAA-----AA-A-TCCA-TAAT-T-T------T-----------TTTTAAG-T----T--GGT-----TATTCAT----AAA---GGTCAG--GGTCA-------C---------------------C------A--------T-------------G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA---------GT--A----GTACTG--T---ACT-ATCTATAACACA------ACTA--------TGG-TTTCTGAAAA--A----------T---GGGT---G---T-------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AATA--------TA---A-CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT--CGGCAT----------G-----GT------T---TT----GA------GTA-G---TCACAT-------------GACTT-----------CTCATA------T-CACAAC----TGTGGACCAAATTTGGTT-ACT--------------AGGCCAAACAG------------T--TC-----T-GGAGAA-------ACA------AGAG-TTTAACA-CA-------ATT------G------ATTA--G----TACTATC-CATAACACGACTTATAATGGACTAAAT------TTAGT-GA-C-CCTG-AG-------CAAGACAG-T---TTCT------G---A---G---AA---aaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttGGGTGTAAACATAAAAATATAACATAGGCT-TA--A--AT-TTTAATATGA-G---TAAAG--GTTATGGT----C--AT-------------TTA------AGAT------------G---A---A--A-----A-A-T---CG----GCATG-------GTTTT-----G------AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACT---G--TGGAC-CAA--AT--------TTG-G-----TTA-----CTAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAAA----CAAGAGTTTAA-C----AC-A-------A-----------TTGA----T-TAG------T-----------AC----------------------TATCCAT----AA-------CAC--G---A-------C-----T---------------T------A--------T-------------A---A----------------TG--GA---------CT--A----A----ATTT---AGTGACCC-TGA-GCA------A-------------G-AC-------A--G----------T---T--TCTGA---G-------------------AAGC--A-----TAGC------------AA--AATGCGAAACC-TA---A-CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTGTA-G------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAA-G---AAAAG--------------AAGCT-AA----AACATGCACA------A-CTTAACATTTTGTGAGTTAAACTAA-TT-ATT----C-----ATAGAGGTAAAG--A------------TCCTC-----T-G--AAA-------A--------TACT-CT--GCA-TG-------GTATT----G------TATA--G----TACTACC-TATAAAACAGCT----ATAAACC--AT------TCTGT-GA-C-T--GTAGA---T--TAA-CCAGAT---TT-T------G---A---G---AA---
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataAAAACATG-CACAA-CT-TA--AC-AT-TTTGTGA--G-T---TAAACTAATTAT--T----C--AT------AGA--GGTAA------AGATC--C------TCT---G---A--A-----A-A-T-A-CTCT--GCATG-------GTATT-----GTAT---AGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCT---A--TAAAC-CA-------------TTC-TGT-GACT------GTAGATT---AACCAGATT---TTGAGAAA----C-AGAACT-AA-T----GT-A-------AA-----AA-T-TTAA-CAGTGT-G------T-----------ATTA----T----T----------CATCCAA----ACA---AGTCAA--GGTCA-------C-----acagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctAGAAACAGAAC-TAA--TGTA--A--AAATTTAACA--G-TGTGTA------TTAT--T----C--ATC--C--AAACAAGTCA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAA--A-A-T-A-CT----ACATG-------GTTTTCA---G------AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACT---G--TTGGC-AAT--AT--------CT---GCTGACTCAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAG-AA----T-TGAACTGTA-C----GC-A-------AA-----AA-T-TTAA-CA-T-T-A------TTA---------ATTT----TA---T--G-------TA--CAT----GTA---CCTGAA--AA-AA-------T-----T---------------T------T--------T-------------G---GTT--------------TT--GA---------AT-------A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTACCA--------TAG-ACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgG-T---TT-T------G---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGAT-CAA--AT----------GAGGC-GACT------CTAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAAA----C-A-AGCTAAA---------G-------AA-----AA-TGTTGT-CA-T-G-G------T-----------AA-C----C----T--G---------------------------CAA--AACTT-------C-----TG--------------C------A--------T-------------G---G----------------TTTTGA---------TT--G---------G--T---ACT-ATCTGTAACAAA------ACTA--------TTG-ACC-----AAA-G----------T---C-------------------------------AACTTA-----AAAC------------AA--AAAC--------TA---AACA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATG-CTGCCT----------G-----GTTTTGAGT---ATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA----A---CGCAAAC-----A-CTTAACGTTGTGAGGTCGAAGTT-ACTT-ATC----C-----AGAAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTC-AAAAAAGAGAAGCA--------AATG-AT--GCA-TA-------GTTTT----G---------A--G----TACTACC-CACTCCAACACT----ATATACCAAAT------TTAGT-GA-CTC--T-AAG---T--CAA-ATAG-T---TTCT------G---A---G---AA---
gi|5 : -ATAG-T---TT-T------G---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TCT-C-T-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgc---A--A-----A-A-TCA-CT----ACATG-------GCTTA-----G------ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTT---AAATGGAC-CAA--AT--------TTT-GA--GACT------CCAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAAT----C-GGGGCTAAA-T----GC-A-------AAA----AA-C-ATAATCTGT-C-G------T-----------AGGC----CAAG-TTAA-------TATTCATCAGCAGA---GGTTAA--GGTCA-------C-----CAAATAAATAATGCTGC------A--------T-------------G---G----------------TT--TG---------AT--T----A----G--T---AAT-ACCCATTATATA------ACTA--------TGG-GCC-----AA--ATACACTTACTT---T--T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGC------------CA--AATA--------CA---A-AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATT--TTTGCATA-----AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATT-CT
gi|6 : TAAATGCAAAAA----ACATAATCTGTC--G-----TAGGCCA--AGT---TAA------TAT--T----C--ATCAGC--AGA--GGTTA------AGGTC--A-------CC---A---A--ATAAATA-A-T-G-CT----GCATG-------GTTT------G------ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACT---A--TGGGC-CAA--ATACAC----TT-------ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAAA----T-AAAGCCAAA-T----AC-A-------AA-----AA-C-TTAG--GGT-T-ATTAAGTT-----------ATTT----T----T--G-----------CAT----AAA---AGTCAA--GGTCA-------T-----C---------------C------AAAACATTCT-------------T---C----------------TT--GA---------TTTCA----A----G--TGGAACT-ACCCATTACACA------GTTA--------TAG-ACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggcA-G---AAATA--------------AAGCC-AA----A---TACAAA------AACTTA---------GGGTTA--TTAAGTT-ATTTTTGC-----ATAAAAGTCAAG--G------------TCATC-----C----AAA-------A--------CATT-CT--TCT-TG-------ATTTC----A------AGTG--G----AACTACC-CATTACACAGTT----ATAGACC-TAT------ATGGT-GA-CTC--T-AGG---T--TAA-ACAT-T---TTCT------G---A---G---AA---tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctc--A-T---TAA----GTTAT--TTTTGC--AT------AAA--AGTCA------AGGTC--A------TCC---A---A--A-----ACA-T-T-CT----TCTTG-------ATTTC-----A------AGT---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTT---A--TAGAC-CTAT-AT------------GGT-GACT------CTAGGTT---AAACATTTT---CTGAGAAG----C-GGAGCTCAA-T----GC-A-------AA-----AAGG-TTAA-C-GT-T-GAAC---T-----------ATTgcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggtt---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TCT-T-T-TTTTATCT----TCGAAAAGG----T---AAG---ACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------AACTTGGA--TGAACACAAC-AC--------TTT-GGT-GACT------CAAGGAC---AGACAGTTT---C----AAA-------GA----AA-T----AT-A-------AA-----AA---TTAA-CATT-TTG------T-----------AAGC----CAAGTT--AAT-----TATTTGT----TAA---GGTCAA--GGTCAT------C-----TAAAA-----------C------A--------A-------------A---A----------------TTT-GG---------GG--T----A----G--T---TCT-ATCCATACCATA------GTTAAGTGACACTGG-GCC-----AA--A----------TAATT--T---AAAAG-------------------AAAC--A-----GAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TA---A-CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAAT-ATTCATAT-----------AGGTCAAGGTCATC-----TGAAG-AATGTCTGCAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATATAAAAAT-TAACAT--TTTGTA--A--------GCCA--AGT---TAA-----TTAT--T----T--GTT------AA--GGTCA------AGGTC--A------TCT---A---A--A-----A--------------CAAA-------ATTTG-----G------GGT---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CC---A--T--AC-CAT--AG--------TTA-AGT-GACA------CTGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAAA----C-AGAGCTGAAAC----AC-A-------AACAAGCAG-C-ATAA-CAGT-TTG------T-----------GATCTAAGC----T--AAA-----TATTCAT----ATA---GGTCAA--GGTCA-------------T---------------CTGAAGAA--------T-------------GTCTGCATCATT---------TT--GA---------GT--ACCGTA----G--TT--ACT-ACACATAACACA------ACTA--------TAG-ACT-----AA-------------T---T--T---G---G-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagT----AA-------AA-G---AAACA--------------GAGCTGAA----A---CACAAACAAGCAG-CATAACAGTTTGTGATCTAAGCTAAAT--ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G---AA-------G--------AATGTCT--GCA-TC-------ATTTT----G------AGTACCGTAGTTACTACA-CATAACACAACT----ATAGACT-AAT------TTGGT-GG-C-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatt--CAA-ACTG-T---TT-T------G---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGtctgggcaactgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgTAAACATAAAAACATAACAT----TGT------------GT------------AA---GTTAT--T----C--ATC--T--ATA--GGTCA------A--------------CC---A---AC-AGC---A-A-T---CT----GCGCG-------GTTTC-----A------AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------T---A--TAGAT-AAA--AG--------TT--AGT-GATT------GTATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATGA----T-CGTGGTCAA-C----AC-A-------AA-----AA-tgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACT---A--TGAAT-AAA--AT--------TTG-G-T-GACT------CTTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAAA-------AA--TTGA-C----AC-A-------AA-----TA-C-TTAA-CATT-T-G------T-----------AGGC----CAATTT--AAT-----TATTCAT----ATA---GGTCAA--GGTCAT------C-----TGAAAATATCTG----C------A--------T-------------G---G----------------TT--CAG--------AT--T----A----G--T---GCT-ATCTGTAGCACA------GCTA--------TGA-ACC-----A--------------C---T--T---G---G-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg----A---CACAAAT-----A-CTTAACATT-TGTAGGCCAATTTAA-TT-ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G--AAA-------A--------TAT--CT--GCA-TG-------GTTCA----G------ATTA--G----TGCTATC-TGTAGCACAGCT----ATGAACC--AC------TTGGTGGG-T-C--T-ATA---C--CTA-ACAG-TGACTT-T------G---G---G---Atgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 7777777777777777777777777777777777777 333333 111111 111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333333333333333 1111111111111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222222222222222 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 1111111 333333333 3333333 1111111111111111111111111111111111111111111 111 33333333333333 22222222 11 11111111111 111111111111 33333333333333333333333333333 11111111 11111111 22222222222222 11111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 333333333333333333333 111
lowQualScore : 5 44444 1 8888888888888888888888888888888888888 55 55 000000 55 000000 6666 555 44 444444444444444 77 33 555 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 444 33 1 2 55 1111111111111111 77777777 444 0 6 5555 777 88 2222222222222222 22222 33 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 1 888888888888888888888888888 11111111 1 77777 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888 5 11111111111111 1111111 1 00 1 55 111111111 7777777 6 99 5555555555555555555555555555555555555555555 5 000 00000000000000 88888888888 55555555 2 3 88888 88 0 3 5 88 44 66666666666 2 44 555555555555 66666666666666666666666666666 2 33 2 9999999 33 00000000 1 33333333 2 3 6666 4 888888 3 3 55555555555555 5 444 11111111 444 444 444 444 4 4 222222 0 0 1 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 999 4 4 555555555555555555555 000 5
lowQualScore : . ..... . ..................................... .. .. ...... .. ...... .... ... .. ............... .. .. ... ........................................................................ ... .. . . .. ................ ........ ... . . .... ... .. ................ ..... .. .................................................................................................................................................................. . . ........................... ........ . ..... ............................................................................................ ... . .............. ....... . .. . .. ......... ....... . .. ........................................... . ... .............. ........... ........ . . ..... .. . . . .. .. ........... . .. ............ ............................. . .. . ....... .. ........ . ........ . . .... . ...... . . .............. . ... ........ ... ... ... ... . . ...... . . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. ... . . ..................... ... .
lowQualScore : 0 33333 4 6666666666666666666666666666666666666 55 55 888888 55 555555 8888 444 22 222222222222222 33 99 000 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 22 6 2 33 8888888888888888 33333333 111 6 1 6666 444 88 3333333333333333 22222 66 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 0 333333333333333333333333333 22222222 2 77777 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888 0 55555555555555 6666666 1 88 4 66 000000000 2222222 7 22 0000000000000000000000000000000000000000000 7 000 66666666666666 99999999999 55555555 5 6 99999 66 4 6 1 99 99 77777777777 2 22 888888888888 44444444444444444444444444444 9 99 9 3333333 99 44444444 2 99999999 9 0 1111 2 888888 1 1 00000000000000 7 444 33333333 777 444 444 777 4 4 888888 1 8 7 1 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 000 4 4 222222222222222222222 000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ACATAACATA--CTGTAA--AT-TTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATC--C--AGA--GGTCA------AGGTC--ATCCA---A--A-----AA---T-A--CT--GCATGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT-C------TAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AAC-TTAA-CA----G-T-T-G------T--ATTC----C----T--G--TATTCGT----ANAGGTCAA--GGTCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCGTAACACA------A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A-CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-T-GTG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--GT------------CATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTA-----GT-ACTACC-CATTACACAACT----ATAGACCAAAT------TTGGT-GA-CTC--GAGG---T--CAA-ACAGT---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ACATAACATA-ACTGTAA--AT-TTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--TC--ATC--C--AGA--GGTCA------AGGTC--ATCCA---A--A-----AA---T-A--CT--GCATGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT-C------TAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AAC-TTAA-CA----G-T-T-G------T--ATTC----C----T--G--TATTCAT----ANAGGTCAA--GGTCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCATNACACA------A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A-CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-T-GTG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--GT------------CATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTA-----GT-ACTACC-CATTACACAACT----ATAGACCAAAT------TTGGT-GA-C-C--GAGG---T--CAA-ACAGT---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACATAAAATTTTGGTATAAAATG---TGTCATTAT-TTTAACA--A-T---TAAA---GTTAT--TT--ATC--C--GGA--CGTCA------TGGTC--ATCAA---G--A-----AA---T-G--CT--GTTTGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CTA--AT--------TTG-GGG-GACT-A------TAAGCC---AAACAATTT---TTGATAAAC-GGAGCT-AACA----AC-A-------AA-----AAC-TT-A-TG----G-T-T-G------T--ATTC----C----T--G--TATTCAT----CCCGGGGGAGGGGTCA-CT---------------C------A---------------------------------T--AA-CT----C---------A----G--T---TCT-GCCCATAACATA------A--------------------CTA--------TAGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------TA--AATA--------TA---A-GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCACA-ACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GT-C---AT---AT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA----G-CACAAA------A-TATAAGA-T-T-TGGTG--GTTT-TATTTACGTC-ATC----CCAAAGGTTAAGGTCAAG--GT------------CAAC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GTA-TG-------GTTTT--G--------AACA-----GC-ACTACC-CATAATATAACT----ATAGACCAAGT------TTGGA-AA-C-A--GAGC---T--TAACGCAAT---TT-T------G---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TCT-A-T-T------T----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA--AT--------TTG-G-T-GAGC-T------TGGACT---AAACATTTT---CTGA-------AAGCTAAAAC----G--A-------AA-----AAC-TTAA-CATTGTG-T-T-GGT----T--ATT----------------TATTTGT----AT-GGTCAA--AGTCGTCC---------------C------A--------TAAG---GTGCTAAAGAGGT----TT--GG-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTACCCA------A--------------------CTA--------CAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCT-AA----AACGAAAA------A-CTTAACA-T-TGT-GTT--GG------TTA-TTT-ATT----T-----GTAT-GGTCAAA--GT------------CGTC-----C-C--ATA-------A--------GGTG-CT--AAA-GA-------GGTTT--G--------GATA-----GA-ACTACC-CATTACCCAACT----ACAGACCAAAT------TTGGA-TA-CTC--TAGG---T--CAT-ACAGtctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgAGG---TGCTAA-AGAGG---TT-T------GGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TCT-CAT-TTTT-CTT----T-----agttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataA--------------GAGCT-AA----A-CACAAAC-----A-TTTAACA-T-TGT-GTA--GGTT-AA--TAAAT---------C-----ATGGAGGTCAAG--AT------------CA-C-----T-TGACAA-------A--------GATA-CT--GCACTG-------ATTTT--G--------A-----------ACTACC-CATCACACAAAA----ATA-AC----T------TTAGT-GA-CTC--GAGG---T--CAA-ACA--------T------G---A---G---GA---cttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaaT---TT-T------G---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TTT-A-T-TTTT-CCT----C-----AAGAATGT---GAG---ACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaGTCTAG--GT------------CATC-----C-A-AAAA-------C--------AATA-CC--TCA-TT-------GTTCT--G--------AGCG-----GC-ATAACT-CATTACACAACT----CTAGACCACAT------TTGTC-CA-C-----------T--CCA-ACAGT---TT-TTGTATAG---A---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TCT-A-T-TTTT-TCT----TCA---AAA----TGAAAAG---AAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--ATCCA---AGAA-----AA---T-G--CT--GCATGGTTTT--G---GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACT---A--TTGAC-CAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT-C------TAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAAAC-GGAGCT-CAAtt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TCT-C-TCTTTT-TCT----T-----TGG----A---AAGGTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaACA------A--------------------CTC--------TGGGCC-----AAAAG----------T---T--TCAAA---G-------------------AAAC--A-----GAAT------------AA--AATG--------CAAAGA-CA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCACA-G------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|14 : gtgAA-G---AAACA--------------GAATA-AA----A-TGCAAAG-----A-CAT--CA-T-T-T--TGAAGGCC-AAGTTAC-TT-ATC----C-----ACAGAGATCAAG--GT------------CATC-----TAAGTAAC-------ACTACCCATAGTG-AT--GCA-GG-------GTGTT-----------ACTG-----AT-A-TACCACATTACAGAACC----Ataagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|15 : gtgacaactctgggccaaaagtttcaC--ATCCAGAAA--A-----AA---T-A--GT--ATATAGTTAT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATT---A--C---C-CAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA-T------TGGACC---AAACACTTT---CCAAGAAAC-AGCGCT-TAAA----ACAA-------AA-----AAC-TTatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatgTAGAGGTCAAG--GT------------CATC-----C-AGAAAA-----------------ATG-CT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTG-----GT-TTAATT-CACTATATAACT----ATGGAATAAGTGTTGAATTGTT-GA-C-C--
gi|16 : GTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Tcgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagtAA-------A--------AA-G-CT--GCA-AG-------GCTTT--G--------AGTA---------C--CT-CAT-ACACAGCA----ATGAACCAAAT------TTGGT-GA-C-T--GGGG--------G-ACAGT---TT-TA-----A---A---G---AA---tagtataa
gi|19 : -T---TAA-----TTAT--TCTTATA-----AGA--GGTCATTGTTGAGGTC--ATCC-------A-----AA---T-A--CT--CCATTGTTAT--C---AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACT---A--TGAAC-CAA--AG--------TTG-Gacggagcatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-G---TAAA---AT-AT--TC--AT------AGA--GGTC---------GTCTAAT--A---A--A-----AAATCT-A--TTT-GCATGGTTTT--G---AGT---A------C----------------------------------------C------A--C---------AACT---A--TGAGC-CA-------------TTC-AGT-GATT-C------TAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAAAC-GGAACT-AAGC----AA-A-------AAAC---AAT-GTAG-GA----G-A-A-G------TT-ATTA----C----T--A--GAG--GT----AAAAGTCAA--G-TTA-AT---------------CTGAAATA--------T--A---A----------------CT--GA-AT----GGTTTTTATTA----G--T---AGT-AACCGTAACACA------ACCATTGACCAACTTTGGCAACTC--------TAGATC-----GACAG----------T---T--TTT-G---A-------------------AAAA--AAGATGGAGC------------TA--AATGCAAAAAAATA---A-CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCACA-G-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATG-CTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCC---ATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTT-AATTAAA----AAA------A-CTTCACG-TAG-T-GTA--GACC-AAGTT--GTTCATC----T-----GAAAAGGTCAAG--AT------------CAGC-----C----AAA-------G--------GGTT-TT--GCA-TG-------GTTTT--G--------AGTT-----GA-ACTAAC-CATTACACAACT----ACAGACCAAAT------TAGGC-AATT-C--TATA---T--CAA-ACAGT---TTCT------G---A---G---GA---
gi|2 : tgaagAA---GTTGT--TC--ATC--TGAAAA--GGTCA------AGATC--AGCCA---A--A-----GGG--T-T--TT--GCATGGTTTT--G---AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------T-A-GGC-AATT-C------TATATC---AAACAGTTT---CTGAGGAAC-AGGACT-TTACAGG-AC-A-------AA-----AAC-TTAA-CA----A---T-G------A--ATTG----C----T--G--acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccGT---TT-T------G---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TTC-C-T-TTTT-CCTCAAAT-----AAG----C---AAG---ACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-T-TTTT-CCT----T-----CGA----A---AAG---ACAA-AAA
gi|3 : aatAA------A-CGTAGCA-T-T-T-GTA--GACC-AAGTTGA-TT-ATT----T-----GTAAAGGTC------T------------T-TC-----T---AAAA-------A--------AATG-TT--GCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA-----GT-ACTACC-TATTACACCACT----ATGGACCAAGT------TAAGT-TA-CTT--GGGGCTTT--GAA-ATAGT---TT-gt
gi|3 : agcaccaggCGTGTTTTT--C---GGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACT---A--TGGAC-CAA--GT--------T-A-AGT-TACT-T------GGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAAAC-AGAGCT-AAACTAATGC-ACACAAAAAA-----AAA-TCCA-TA----A-T-T-T------T--TTTTAAG-T----T--GGTTATTCAT----AAAGGTCAG--GGTCA-C----------------C------A--------T--G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----A---------GTACTG--T---ACT-ATCTATAACACA------A--------------------CTA--------TGGTTTCTGAAAA--A----------T---GGGT---G---T-------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AATA--------TA---A-CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT--CGGCAT----------G-----GT------T---TT----GA------GTA-G---TCACAT-------------GACTT---------CTCATA----------TCACA-A-C-T-GTG--GACC-AAATTTGGTT-ACT--------------AGGCCAAACAGT--------------TC-----T-GGAGAA-------ACA------AGAG-TTTAACA-CA-------ATT----G--------ATTA-----GT-ACTATC-CATAACACGACTTATAATGGACTAAAT------TTAGT-GA-C-CCTGAG-------CAAGACAGT---TTCT------G---A---G---AA---aaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttGGGTGTAAACATAAAA-----ATATAACATAGGCT-TAA--AT-TTTAATATGA-G---TAAAG--GTTATGGTC--AT-------------TTA------AGAT------GA---A--A-----AA---T----CG--GCATGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACT---G--TGGAC-CAA--AT--------TTG-G-----TTAC------TAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAAACAAGAGTT-TAAC----AC-A-------A----------TTGA---------T-TAG------T--AC-----------------TATCCAT----AA----CAC--G---A-CT---------------T------A--------T--A---A----------------TG--GA-CT----A---------A----ATTT---AGTGACCC-TGA-GCA------A---------------------------------GAC-------A--G----------T---T--TCTGA---G-------------------AAGC--A-----TAGC------------AA--AATGCGAAACC-TA---A-CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTGTA-G------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAAA-----ACATG-CACA-ACT-TAAC-AT-TTTGTGA--G-T---TAAACTAATTAT--TC--AT------AGA--GGTAA------AGATC--CTCTG---A--A-----AA---T-A--CTCTGCATGGTATT--GTATAGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCT---A--TAAAC-CA-------------TTC-TGT-GACT-G------TAGATT---AACCAGATT---TTGAGAAAC-AGAACT--AAT----GT-A-------AA-----AAT-TTAA-CA----G-TGT-G------T--ATTA----T----T-----CATCCAA----ACAAGTCAA--GGTCA-C
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctAGAA-----ACAGAAC-TA-A-TGTAA--AAATTTAACA--G-TGTGTA------TTAT--TC--ATC--C--AAACAAGTCA------AGGTC--A-CCA---A--ATAA--AA---T-A--CT--ACATGGTTTTCAG---AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACT---G--TTGGC-AAT--AT--------CTG---CTGACT-CAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAGAA-T-TGAACT-GTAC----GC-A-------AA-----AAT-TTAA-CA------T-T-A------TTAATTT----TA---T--G--TA--CAT----GTACCTGAA--AA-AA-TT---------------T------T--------T--G---GTT--------------TT--GA-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTA--------------------CCA--------TAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgGT---TT-T------G---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGAT-CAA--AT----------GAGGC-GACT-C------TAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAAAC-A-AGCT-AAA--------G-------AA-----AATGTTGT-CA------T-G-G------T--AA-C----C----T--G-------------------CAA--AACTT-CTG--------------C------A--------T--G---G----------------TTTTGA-TT----G--------------G--T---ACT-ATCTGTAACAAA------A--------------------CTA--------TTGACC-----AAA-G----------T---C-------------------------------AACTTA-----AAAC------------AA--AAAC--------TA---AACA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATG-CTGCCT----------G-----GTTTTGAGT---ATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA----A-CGCAAAC-----A-CTTAACG-T-T---GTGA-GGTCGAAGTTAC-TT-ATC----C-----AGAAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTC-AAAAAAGAGAAGCA--------AATG-AT--GCA-TA-------GTTTT--G--------AGTA---------CTACC-CACTCCAACACT----ATATACCAAAT------TTAGT-GA-CTC--TAAG---T--CAA-ATAGT---TTCT------G---A---G---AA---
gi|5 : -ATAGT---TT-T------G---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TCT-C-T-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgc---A--A-----AA---TCA--CT--ACATGGCTTA--G---ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTT---AAATGGAC-CAA--AT--------TTT-GA--GACT-C------CAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAATC-GGGGCT-AAAT----GC-A-------AAA----AAC-ATAATCT----G-T-C-G------T--AGGC----CAAG-TTAA--TATTCATCAGCAGAGGTTAA--GGTCA-CCAAATAAATAATGCTGC------A--------T--G---G----------------TT--TG-AT----T---------A----G--T---AAT-ACCCATTATATA------A--------------------CTA--------TGGGCC-----AA--ATACACTTACTT---T--T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGC------------CA--AATA--------CA---A-AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATT--TTTGCATA-----AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATT-CT
gi|6 : AAAA-----ACATAATCTG-TC-GTAG--------GCCA--AGT---TAA------TAT--TC--ATCAGC--AGA--GGTTA------AGGTC--A-CCA---A--ATAAATAA---T-G--CT--GCATGGTTT---G---ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACT---A--TGGGC-CAA--ATACAC----TT-------ACT-T------TTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAAAT-AAAGCC-AAAT----AC-A-------AA-----AAC-TTAG--G----G-T-T-ATTAAGTT--ATTT----T----T--G------CAT----AAAAGTCAA--GGTCA-TC---------------C------AAAACATTCT--T---C----------------TT--GA-TTTC--A---------A----G--TGGAACT-ACCCATTACACA------G--------------------TTA--------TAGACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaA-G---AAATA--------------AAGCC-AA----A-TACAAA------AACTTA------------G--GGTT-A--TTAAGTT-ATTTTTGC-----ATAAAAGTCAAG--GT------------CATC-----C----AAA-------A--------CATT-CT--TCT-TG-------ATTTC--A--------AGTG-----GA-ACTACC-CATTACACAGTT----ATAGACC-TAT------ATGGT-GA-CTC--TAGG---T--TAA-ACATT---TTCT------G---A---G---AA---tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctc---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TCT-T-T-TTTTATCT----TCGAAAAGG----T---AAG---ACAA-AAAgcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------AACTTGGA--TGAACACAAC-AC--------TTT-GGT-GACT-C------AAGGAC---AGACAGTTT---C----AAA---GA-----AAT----AT-A-------AA-----AA--TTAA-CA----T-T-TTG------T--AAGC----CAAGTT--AATTATTTGT----TAAGGTCAA--GGTCATCTAAAA-----------C------A--------A--A---A----------------TTT-GG-GG----T---------A----G--T---TCT-ATCCATACCATA------G--------------------TTAAGTGACACTGGGCC-----AA--A----------TAATT--T---AAAAG-------------------AAAC--A-----GAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TA---A-CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAAT-ATTCATAT-----------AGGTCAAGGTCATC-----TGAAG-AATGTCTGCAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATATAAAA-----AT-TAACATT--TTGTAA--------GCCA--AGT---TAA-----TTAT--TT--GTT------AA--GGTCA------AGGTC--ATCTA---A--A-----A--------------CAAAATTTG--G---GGT---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CC---A--T--AC-CAT--AG--------TTA-AGT-GACA-C------TGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAAAC-AGAGCTGAAAC----AC-A-------AACAAGCAGC-ATAA-CA----GTT-T-G------T--GATCTAAGC----TAAA--TATTCAT----ATAGGTCAA--GGTCA--T---------------CTGAAGAA--------T--GTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGT---------A----GT-T---ACT-ACACATAACACA------A--------------------CTA--------TAGACT-----AA-------------T---T--T---G---G-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagT----AA-------AA-G---AAACA--------------GAGCTGAA----A-CACAAACAAGCAG-CATAACAGT-T-T-GTG--ATCT-AAGCTAAAT--ATT----C-----ATATAGGTCAAG--GT------------CATC-----T-G---AA-------G--------AATGTCT--GCA-TC-------ATTTT--G--------AGTACCGTAGTTACTACA-CATAACACAACT----ATAGACT-AAT------TTGGT-GG-C-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatt--CAA-ACTGT---TT-T------G---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGtctgggcaactgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgTAAACATAAAA-----ACATAACAT----TGT----------GT------------AA---GTTAT--TC--ATC--T--ATA--GGTCA------A--------CCA---A--C-----AG---C-AATCT--GCGCGGTTTC--A---AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------T---A--TAGAT-AAA--AG--------TT--AGT-GATT-G------TATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATGAT-CGTGGT-CAAC----AC-A-------AA-----AAtgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACT---A--TGAAT-AAA--AT--------TTG-G-T-GACT-C------TTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAAA---AA--T-TGAC----AC-A-------AA-----TAC-TTAA-CA----T-T-T-G------T--AGGC----CAATTT--AATTATTCAT----ATAGGTCAA--GGTCATCTGAAAATATCTG----C------A--------T--G---G----------------TT--CAGAT----T---------A----G--T---GCT-ATCTGTAGCACA------G--------------------CTA--------TGAACC-----A--------------C---T--T---G---G-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg----A-CACAAAT-----A-CTTAACA-T-T-T-GTA--GGCC-AATTTAA-TT-ATT----C-----ATATAGGTCAAG--GT------------CATC-----T-G--AAA-------A--------TAT--CT--GCA-TG-------GTTCA--G--------ATTA-----GT-GCTATC-TGTAGCACAGCT----ATGAACC--AC------TTGGTGGG-T-C--TATA---C--CTA-ACAGTGACTT-T------G---G---G---Atgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 7777777777777777777777777777777777777 333333 1111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333333333333333 11111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222 1111111 333333333 3333333 1111111111111111111111111111111111111111111 111 22222222222222 1111111 22222222 111111111111 11111111111111111111 111111111111 33333333333333333333333333333 11111111111111111111111 11111111111 11111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 333333333333333333333 111
lowQualScore : 5 22222 0 5 2 0000000000000000000000000000000000000 55 7777 55 333333 0 55 999999 4444 555 33 5555555555555555 66 33 444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 999999999 333 33 1 2 77 3333333333333333 2 666666 333 6 4444 66 88 11111 2 7777777 88888 888 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 5 11111111111111 1111111 1 00 1 55 111111111 7777777 6 99 5555555555555555555555555555555555555555555 5 000 77777777777777 0000000 3 1 55555555 1 000000000000 6666666 99999999999999999999 2 33 444444444444 0 55555555555555555555555555555 33 33 2 8888888 00000000000000000000000 2 2 777777 5555 3 888888 22222222222 5 444 11111111 444 444 444 444 4 4 222222 0 0 1 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 999 4 4 555555555555555555555 000 5
lowQualScore : . ..... . . . ..................................... .. .... .. ...... . .. ...... .... ... .. ................ .. .. ... .......................................................... .. ......... ... .. . . .. ................ . ...... ... . .... .. .. ..... . ....... ..... ... .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. ... . .............. ....... . .. . .. ......... ....... . .. ........................................... . ... .............. ....... . . ........ . ............ ....... .................... . .. ............ . ............................. .. .. . ....... ....................... . . ...... .... . ...... ........... . ... ........ ... ... ... ... . . ...... . . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. ... . . ..................... ... .
lowQualScore : 0 55555 4 0 0 3333333333333333333333333333333333333 00 7777 00 000000 4 00 666666 8888 000 99 3333333333333333 88 77 777 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 444444444 999 11 9 1 11 0000000000000000 2 444444 999 6 8888 33 44 22222 4 6666666 22222 888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888 0 55555555555555 6666666 1 88 4 66 000000000 2222222 7 22 0000000000000000000000000000000000000000000 7 000 55555555555555 3333333 6 8 99999999 5 000000000000 1111111 55555555555555555555 1 99 666666666666 2 11111111111111111111111111111 11 77 7 7777777 33333333333333333333333 7 2 777777 7777 2 222222 00000000000 0 111 33333333 777 444 444 777 4 4 888888 1 8 7 1 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 000 4 4 222222222222222222222 000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ACATA-ACATA--NTGTAA--A--TTTGCCA--A-T---TAAA---GTTAT--T----C--ATC-----AGA--GGTCA------AGGTC--ATCCA---A--A-----A-A---T-A--CT--GCATGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT-C------TAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----GTANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A-CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-TG-TG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTA--G----TACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTC-NAGG---T--CAA-ACAGT---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAAA-----ACATA-ACATA--CTGTAA--AT-TTTGNCA--A-T---TAAA---GTTAT--T----C--ATC--C--AGA--GGTCA------AGGTC--ATCCA---A--A-----A-A---T-A--CT--GCATGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT-C------TAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----GTANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A-CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-TG-TG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTA--G----TACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTC-GAGG---T--CAA-ACAGT---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACATAAAATTTTGGTATA-AAATG---TGTCATTAT-TTTAACA--A-T---TAAA---GTTAT--T----T--ATC--C--GGA--CGTCA------TGGTC--ATCAA---G--A-----A-A---T-G--CT--GTTTGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CTA--AT--------TTG-GGG-GACT-A------TAAGCC---AAACAATTT---TTGATAAAC-GGAGCT-AACA----AC-A-------AA-----AA-C-TTA--TG----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----ATCCCGGGGGAGGGGTCA-CT---------------C------A--------T--A-------------------------A-CT----C---------A----G--T---TCT-GCCCA--TAACA-TA---A--------------------CTA--------TAGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------TA--AATA--------TA---A-GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCACA-ACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTC----AT---AT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA----G-CACAAA------A-TATAAGA-T-T-TGGTG--GTTT-TATTTACGTC-ATC----CCAAAGGTTAAGGTCAAG--G------------TCAAC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GTA-TG-------GTTTT----G------AACA--G----CACTACC-CATAATATA------ACT----ATAGACCAAGT------TTGGAAAC-A-GAGC---T--TAACGCAAT---TT-T------G---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TCT-A-T-T------T----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA--AT--------TTG-G-T-GAGC-T------TGGACT---AAACATTTT---CTGA-------AAGCTAAAAC----G--A-------AA-----AA-C-TTAA-CATTGTG-T-T-GGT-----T--ATT----------------TATTT----GTAT-GGTCAAAG--TCGTCC---------------C------A--------TAAG---GTGCTAAAGAGGT----TT--GG-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCA--TTACC-CA---A--------------------CTA--------CAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCT-AA----AACGAAAA------A-CTTAACA-T-TGTG-TT--GG------TTA-TTT-ATT----T-----GTAT-GGTCAAA--G------------TCGTC-----C-C--ATA-------A--------GGTG-CT--AAA-GA-------GGTTT----G------GATA--G----AACTACC-CATTACCCA------ACT----ACAGACCAAAT------TTGGATACTC-TAGG---T--CAT-ACAGtctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgAGG---TGCTAA-AGAGG---TT-T------GGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TCT-CAT-TTTT-CTT----T-----agttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataA--------------GAGCT-AA----A-CACAAAC-----A-TTTAACA-T-TGTG-TA--GGTT-AA--TAAAT---------C-----ATGGAGGTCAAG--A------------TCA-C-----T-TGACAA-------A--------GATA-CT--GCACTG-------ATTTT----G------A-----------ACTACC-CATCACACA------AAA----ATA-AC----T------TTAGTGACTC-GAGG---T--CAA-ACA--------T------G---A---G---GA---cttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaaT---TT-T------G---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TTT-A-T-TTTT-CCT----C-----AAGAATGT---GAG---ACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaGTCTAG--G------------TCATC-----C-A-AAAA-------C--------AATA-CC--TCA-TT-------GTTCT----G------AGCG--G----CATAACT-CATTACACA------ACT----CTAGACCACAT------TTGTCCACTC-----------C-A-ACAGT---TT-TTGTATAG---A---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TCT-A-T-TTTT-TCT----TCA---AAA----TGAAAAG---AAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--ATCCA---AGAA-----A-A---T-G--CT--GCATGGTTTT--G---GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACT---A--TTGAC-CAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT-C------TAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAAAC-GGAGCT-CAAtt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TCT-C-TCTTTT-TCT----T-----TGG----A---AAGGTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaA-CA---A--------------------CTC--------TGGGCC-----AAAAG----------T---T--TCAAA---G-------------------AAAC--A-----GAAT------------AA--AATG--------CAAAGA-CA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCACA-G------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|14 : gtgAA-G---AAACA--------------GAATA-AA----A-TGCAAAG-----A-CAT--CA-T-T-T--TGAAGGCC-AAGTTAC-TT-ATC----C-----ACAGAGATCAAG--G------------TCATC-----TAAGTAAC-------ACTACCCATAGTG-AT--GCA-GG-------GTGTT-----------ACTG--A----TA-TACCACATTACAGA------ACC----Ataagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|15 : gtgacaactctgggccaaaagtttcaC--ATCCAGAAA--A-----A-A---T-A--GT--ATATAGTTAT--G---AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATT---A--C---C-CAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA-T------TGGACC---AAACACTTT---CCAAGAAAC-AGCGCT-TAAA----ACAA-------AA-----AA-C-TTatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatgTAGAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-AGAAAA-----------------ATG-CT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTG--G----TTTAATT-CACTATATA------ACT----ATGGAATAAGTGTTGAATTGTTGACCC-G
gi|16 : GTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Tctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagtAA-------A--------AA-G-CT--GCA-AG-------GCTTT----G------AGTA---------C--CT-CAT-ACACA------GCA----ATGAACCAAAT------TTGGTGACTG-GGGG----------ACAGT---TT-TA-----A---A---G---AA---tagtataa
gi|19 : -T---TAA-----TTAT--T----CTTATA-----AGA--GGTCATTGTTGAGGTC--ATCC-------A-----A-A---T-A--CT--CCATTGTTAT--C---AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACT---A--TGAAC-CAA--AG--------TTG-Gacggagcatttttaaacatt
gi|2 : GCCA--A-G---TAAA---AT-AT--T----C--AT------AGA--GGTC---------GTCTAAT--A---A--A-----A-AATCT-A--TTT-GCATGGTTTT--G---AGT---A------C----------------------------------------C------A--C---------AACT---A--TGAGC-CA-------------TTC-AGT-GATT-C------TAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAAAC-GGAACT-AA------GC-A-------AA-----AA------A-CAAT--G-T-A-GGAGAAGTT--ATTA----C----T--A--GAG------GTAAAAGTCAAG---TTA-AT---------------CTGAAATA--------T--A---A----------------CT--GA-AT----GGTTTTTATTA----G--T---AGT-AACCG--TAACA-CA---ACCATTGACCAACTTTGGCAACTC--------TAGATC-----GACAG----------T---T--TTT-G---A-------------------AAAA--AAGATGGAGC------------TA--AATGCAAAAAAATA---A-CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCACA-G-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATG-CTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCC---ATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTT-AATTAAA----AAA------A-CTTCACG-TAG-TG-TA--GACC-AAGTT--GTTCATC----T-----GAAAAGGTCAAG--A------------TCAGC-----C----AAA-------G--------GGTT-TT--GCA-TG-------GTTTT----G------AGTT--G----AACTAAC-CATTACACA------ACT----ACAGACCAAAT------TAGGCAATTC-TATA---T--CAA-ACAGT---TTCT------G---A---G---GA---
gi|2 : tgaagAAAA-----ACTTC-ACGTA--GTGTAG--A------CCA--A------------GTTGT--T----C--ATC--TGAAAA--GGTCA------AGATC--AGCCA---A--A-----G-GG--T-T--TT--GCATGGTTTT--G---AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------T-A-GGC-AATT-C------TATATC---AAACAGTTT---CTGAGGAAC-AGGACT-TTACAGG-AC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----A---T-G-------A--ATTG----C----T--G--acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaGT---TT-T------G---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TTC-C-T-TTTT-CCTCAAAT-----AAG----C---AAG---ACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-T-TTTT-CCT----T-----CGA----A---AAG---ACAA-AAA
gi|3 : aatAA------A-CGTAGCA-T-T-TG-TA--GACC-AAGTTGA-TT-ATT----T-----GTAAAGGTC------------------TT-TC-----T---AAAA-------A--------AATG-TT--GCG-TGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGTA--G----TACTACC-TATTACACC------ACT----ATGGACCAAGT------TAAGTTACTT-GGGGCTTT--GAA-ATAGT---TT-gt
gi|3 : agcaccaggCGTGTTTTT--C---GGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACT---A--TGGAC-CAA--GT--------T-A-AGT-TACT-T------GGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAAAC-AGAGCT-AAACTAATGC-ACACAAAAAA-----AA-A-TCCA-TA----A-T-T-T-------T--TTTTAAG-T----T--GGTTATTC----ATAAAGGTCAGGG--TCA-C----------------C------A--------T--G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----A---------GTACTG--T---ACT-ATCTA--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGTTTCTGAAAA--A----------T---GGGT---G---T-------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AATA--------TA---A-CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT--CGGCAT----------G-----GT------T---TT----GA------GTA-G---TCACAT-------------GACTT---------CTCATA----------TCACA-A-C-TG-TG--GACC-AAATTTGGTT-ACT--------------AGGCCAAACAG------------T--TC-----T-GGAGAA-------ACA------AGAG-TTTAACA-CA-------ATT------G------ATTA--G----TACTATC-CATAACACG------ACTTATAATGGACTAAAT------TTAGTGACCCTGAG-------CAAGACAGT---TTCT------G---A---G---AA---aaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatgggtgtaaacataaaaatataacataggcttaaattttaatatgagtaaaggttatggtcatttaagatgaaaaatcggcatggttttgagtagtcacatgacttctcatatcacaactgtggaccaaatttggttactaggccaaacagttctggagaaacaagagtttaacacaattgattagtactatccataacacgacttataatggactaaatttagtgaccctgagcaagacagtttctgagaagcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|3 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttGGGTGTAAACATAAAA-----ATATA-ACATAGGCT-TAA--AT-TTTAATATGA-G---TAAAG--GTTATGGT----C--AT-------------TTA------AGAT------GA---A--A-----A-A---T----CG--GCATGGTTTT--G---AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACT---G--TGGAC-CAA--AT--------TTG-G-----TTAC------TAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAAACAAGAGTT-TAAC----AC-A-------A-----------TTGA---------T-TAG-------T--AC-----------------TATCC----ATAA----CACG-----A-CT---------------T------A--------T--A---A----------------TG--GA-CT----A---------A----ATTT---AGTGACCC---TGA-G-CA---A---------------------------------GAC-------A--G----------T---T--TCTGA---G-------------------AAGC--A-----TAGC------------AA--AATGCGAAACC-TA---A-CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTGTA-G------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAAA-----ACATGCACA-A--CT-TAAC-AT-TTTGTGA--G-T---TAAACTAATTAT--T----C--AT------AGA--GGTAA------AGATC--CTCTG---A--A-----A-A---T-A--CTCTGCATGGTATT--GTATAGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCT---A--TAAAC-CA-------------TTC-TGT-GACT-G------TAGATT---AACCAGATT---TTGAGAAAC-AGAACT--AAT----GT-A-------AA-----AA-T-TTAA-CA----G-TGT-G-------T--ATTA----T----T-----CATCC----AAACAAGTCAAGG--TCA-C
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctAGAA-----ACAGA-AC-TA--ATGTAA--AAATTTAACA--G-TGTGTA------TTAT--T----C--ATC--C--AAACAAGTCA------AGGTC--A-CCA---A--ATAA--A-A---T-A--CT--ACATGGTTTTCAG---AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACT---G--TTGGC-AAT--AT--------CTG---CTGACT-CAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAGAA-T-TGAACT-GTAC----GC-A-------AA-----AA-T-TTAA-CA------T-T-A-------TTAATTT----TA---T--G--TACAT----GTACCTGAAAAA-----A-TT---------------T------T--------T--G---GTT--------------TT--GA-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTA--------------------CCA--------TAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttg--------------GAACT-GT----A-CGCAAA------AATTTAACA-T-T---------------ATTAATTTTAT-----------GTACATGT---------------------ACC-----T-G--AAA-------A--------AATT-TT------TG-------GTTTT----G------AATA--G----AACTACC-CATTTAGGATTATTTACC----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTC-TAGG---T--TAA-ATAGT---Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattGT---TT-T------G---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Tgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGAT-CAA--AT----------GAGGC-GACT-C------TAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAAAC-A-AGCT-AAA--------G-------AA-----AA-TGTTGT-CA------T-G-G-------T--AA-C----C----T--G-------------------CAAAA--CTT-CTG--------------C------A--------T--G---G----------------TTTTGA-TT----G--------------G--T---ACT-ATCTG--TAACA-AA---A--------------------CTA--------TTGACC-----AAA-G----------T---C-------------------------------AACTTA-----AAAC------------AA--AAAC--------TA---AACA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATG-CTGCCT----------G-----GTTTTGAGT---ATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA----A-CGCAAAC-----A-CTTAACG---T-TG-TGA-GGTCGAAGTT-ACTT-ATC----C-----AGAAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTC-AAAAAAGAGAAGCA--------AATG-AT--GCA-TA-------GTTTT----G---------A--G----TACTACC-CACTCCAAC------ACT----ATATACCAAAT------TTAGTGACTC-TAAG---T--CAA-ATAGT---TTCT------G---A---G---AA---
gi|5 : -ATAGT---TT-T------G---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TCT-C-T-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgc---A--A-----A-A---TCA--CT--ACATGGCTTA--G---ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTT---AAATGGAC-CAA--AT--------TTT-GA--GACT-C------CAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAATC-GGGGCT-AAAT----GC-A-------AAA----AA-C-ATAATCT----G-T-C-G-------T--AGGC----CAAG-TTAA--TATTCATCAGCAGAGGTTAAGG--TCA-CCAAATAAATAATGCTGC------A--------T--G---G----------------TT--TG-AT----T---------A----G--T---AAT-ACCCA--TTATA-TA---A--------------------CTA--------TGGGCC-----AA--ATACACTTACTT---T--T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGC------------CA--AATA--------CA---A-AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATT--TTTGCATA-----AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATT-CT
gi|6 : AAAA-----ACATA-ATCTG--TCGTAG--------GCCA--AGT---TAA------TAT--T----C--ATCAGC--AGA--GGTTA------AGGTC--A-CCA---A--ATAAATA-A---T-G--CT--GCATGGTTT---G---ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACT---A--TGGGC-CAA--ATACAC----TT-------ACT-T------TTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAAAT-AAAGCC-AAAT----AC-A-------AA-----AA-C-TTAG--G----G-T-T-ATTAAGT-T--ATTT----T----T--G------C----ATAAAAGTCAAGG--TCA-TC---------------C------AAAACATTCT--T---C----------------TT--GA-TTTC--A---------A----G--TGGAACT-ACCCA--TTACA-CA---G--------------------TTA--------TAGACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaA-G---AAATA--------------AAGCC-AA----A-TACAAA------AACTTA------------G--GGTT-A--TTAAGTT-ATTTTTGC-----ATAAAAGTCAAG--G------------TCATC-----C----AAA-------A--------CATT-CT--TCT-TG-------ATTTC----A------AGTG--G----AACTACC-CATTACACA------GTT----ATAGACC-TAT------ATGGTGACTC-TAGG---T--TAA-ACATT---TTCT------G---A---G---AA---tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctc--A-T---TAA----GTTAT--TTTTGC--AT------AAA--AGTCA------AGGTC--ATCCA---A--A-----ACA---T-T--CT--TCTTGATTTC--A---AGT---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTT---A--TAGAC-CTAT-AT------------GGT-GACT-C------TAGGTT---AAACATTTT---CTGAGAAGC-GGAGCT-CAAT----GC-A-------AA-----AAGG-TTAA-C-----G-T-T-GAAC----T--ATTgcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggtt---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TCT-T-T-TTTTATCT----TCGAAAAGG----T---AAG---ACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------AACTTGGA--TGAACACAAC-AC--------TTT-GGT-GACT-C------AAGGAC---AGACAGTTT---C----AAA---GA-----AAT----AT-A-------AA-----AA---TTAA-CA----T-T-TTG-------T--AAGC----CAAGTT--AATTATTT----GTTAAGGTCAAGG--TCATCTAAAA-----------C------A--------A--A---A----------------TTT-GG-GG----T---------A----G--T---TCT-ATCCA--TACCA-TA---G--------------------TTAAGTGACACTGGGCC-----AA--A----------TAATT--T---AAAAG-------------------AAAC--A-----GAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TA---A-CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAAT-ATTCATAT-----------AGGTCAAGGTCATC-----TGAAG-AATGTCTGCAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATATAAAA-----AT-TA-ACATT--TTGTAA--------GCCA--AGT---TAA-----TTAT--T----T--GTT------AA--GGTCA------AGGTC--ATCTA---A--A-----A---------------CAAAATTTG--G---GGT---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CC---A--T--AC-CAT--AG--------TTA-AGT-GACA-C------TGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAAAC-AGAGCTGAAAC----AC-A-------AACAAGCAG-C-ATAA-CA----GTT-T-G-------T--GATCTAAGC----TAAA--TATTC----ATATAGGTCAAGG--TCA--T---------------CTGAAGAA--------T--GTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGT---------A----GT-T---ACT-ACACA--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TAGACT-----AA-------------T---T--T---G---G-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagT----AA-------AA-G---AAACA--------------GAGCTGAA----A-CACAAACAAGCAG-CATAACAGT-T-TG-TG--ATCT-AAGCTAAAT--ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G---AA-------G--------AATGTCT--GCA-TC-------ATTTT----G------AGTACCGTAGTTACTACA-CATAACACA------ACT----ATAGACT-AAT------TTGGTGGCTC-TGGG------CAA-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatt--CAA-ACTGT---TT-T------G---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGctgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgTAAACATAAAA-----ACATA-ACAT----TGT----------GT------------AA---GTTAT--T----C--ATC--T--ATA--GGTCA------A--------CCA---A--C-----A-G---C-AATCT--GCGCGGTTTC--A---AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------T---A--TAGAT-AAA--AG--------TT--AGT-GATT-G------TATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATGAT-CGTGGT-CAAC----AC-A-------AA-----AA-tgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACT---A--TGAAT-AAA--AT--------TTG-G-T-GACT-C------TTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAAA---AA--T-TGAC----AC-A-------AA-----TA-C-TTAA-CA----T-T-T-G-------T--AGGC----CAATTT--AATTATTC----ATATAGGTCAAGG--TCATCTGAAAATATCTG----C------A--------T--G---G----------------TT--CAGAT----T---------A----G--T---GCT-ATCTG--TAGCA-CA---G--------------------CTA--------TGAACC-----A--------------C---T--T---G---G-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg----A-CACAAAT-----A-CTTAACA-T-T-TG-TA--GGCC-AATTTAA-TT-ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G--AAA-------A--------TAT--CT--GCA-TG-------GTTCA----G------ATTA--G----TGCTATC-TGTAGCACA------GCT----ATGAACC--AC------TTGGTGGGTC-TATA---C--CTA-ACAGTGACTT-T------G---G---G---Atgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 11 88888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111111111111111111111 11111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333333333333333 11111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22222222222222 1111111 333333333 3333333 1111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222 11111111111 22222222 2222222222222222222222222222222222222222222 111111111111 333333333333333333333333333333 11111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 333333333333333333333 111
lowQualScore : 5 4 11111 3 0 33 66 88888888888888888888888888888888888888888888888 888888 33 1 666666666666666666666666666666 66 8888888 55555555555 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 999999999 333 33 1 2 77 3333333333333333 888888 333 6 4444 66 88 11111 2 7777777 88888 888 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 5 11111111111111 1111111 1 00 1 55 111111111 7777777 6 99 5555555555555555555555555555555555555555555 5 888 55555555555555 11111111111 0 55555555 0000000000000000000000000000000000000000000 2 33 444444444444 0 555555555555555555555555555555 44 33 2 4 88888888 2 3 777777 5555 6 888888 1 5555 2 2 444 00000000 444 444 444 444 4 4 222222 0 0 1 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 999 4 4 555555555555555555555 000 5
lowQualScore : . . ..... . . .. .. ............................................... ...... .. . .............................. .. ....... ........... .......................................................... .. ......... ... .. . . .. ................ ...... ... . .... .. .. ..... . ....... ..... ... .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. ... . .............. ....... . .. . .. ......... ....... . .. ........................................... . ... .............. ........... . ........ ........................................... . .. ............ . .............................. .. .. . . ........ . . ...... .... . ...... . .... . . ... ........ ... ... ... ... . . ...... . . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. ... . . ..................... ... .
lowQualScore : 0 4 11111 9 8 22 11 33333333333333333333333333333333333333333333333 888888 99 4 222222222222222222222222222222 33 7777777 55555555555 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 444444444 999 11 9 1 11 0000000000000000 666666 999 6 8888 33 44 22222 4 6666666 22222 888 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 888 0 55555555555555 6666666 1 88 4 66 000000000 2222222 7 22 0000000000000000000000000000000000000000000 0 888 00000000000000 22222222222 8 99999999 3333333333333333333333333333333333333333333 1 99 666666666666 2 777777777777777777777777777777 88 77 7 3 55555555 7 9 777777 7777 7 222222 0 9999 5 2 111 77777777 444 111 111 444 4 4 888888 1 8 7 1 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 000 4 4 222222222222222222222 000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAA-A-----ACATAACATNNTG--TAA--A--TT--GCCAA-T---TAA-GTTATT----C--ATC---AG---AGGTCA------AGGTC--ATCC------A---A--A-----A-A---T-A--CT--GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----GTANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A---CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-T-G-TG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TGGTTTTGAGTA-----GT-ACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTCTAGGT--CAA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAA-A-----ACATAACATANTG--TAA--A--TTT-GCCAA-T---TAAAGTTATT----C--ATC---AG---AGGTCA------AGGTC--ATCC------A---A--A-----A-A---T-A--CT--GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----GTANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A---CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-T-G-TG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TGGTTTTGAGTA-----GT-ACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTCNAGGT--CAA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|1 : GGGT---AACATAAA-ATTTTGGTATAAAAT-GTG--TCATTA--TTTTAACAA-T---TAAAGTTATT----T--ATCC--GG---ACGTCA------TGGTC--ATCA------A---G--A-----A-A---T-G--CT--GTTTG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CTA--AT--------TTG-GGG-GACT------ATAAGCC---AAACAATTT---TTGATAAAC-GGAGCT-AACA----AC-A-------AA-----AA-C-TTA--TG----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----ATCCCGGGGGAGGGGTCA-CT---------------C------A--------T--A-------------------------A-CT----C---------A----G--T---TCT-GCCCA--TAACA-TA---A--------------------CTA--------TAGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------TA--AATA--------TA---A-GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCACA-ACAGTTAAGGTCAAGGTCACC----ACAAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTC----AT---AT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCT-TA----G---CACAAA------A-TATAAGA-T-T-T-GGTG--GTTT-TATTTACGTC-ATC----CCAAAGGTTAAGGTCAAG--G------------TCAAC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GTA-TGGTTTTGAACA-----GC-ACTACC-CATAATATA------ACT----ATAGACCAAGT------TTGGAAAC-AGAGCT--TAACGCAA-T---TT-T------G---A---G---AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TCT-A-T-T------T----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaagga-CAA--AT--------TTG-G-T-GAGC------TTGGACT---AAACATTTT---CTGA-------AAGCTAAAAC----G--A-------AA-----AA-C-TTAA-CATTGTG-T-T-GGT-----T--ATT----------------TATTT----GTAT-GGTCAAAG--TCGTCC---------------C------A--------TAAG---GTGCTAAAGAGGT----TT--GG-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCA--TTACC-CA---A--------------------CTA--------CAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCT-AA----AA--CGAAAA------A-CTTAACA-T-TGT-G-TT--GG------TTA-TTT-ATT----T-----GTAT-GGTCAAA--G------------TCGTC-----C-C--ATA-------A--------GGTG-CT--AAA-GAGGTTTGGATA-----GA-ACTACC-CATTACCCA------ACT----ACAGACCAAAT------TTGGATACTCTAGGT--CAT-ACAG-tctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgAGGTGCTAA-AGAG-G---TT-T------GGATA---G---AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TCT-CAT-TTTT-CTT----T-----agttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataA--------------GAGCT-AA----A---CACAAAC-----A-TTTAACA-T-TGT-G-TA--GGTT-AA--TAAAT---------C-----ATGGAGGTCAAG--A------------TCA-C-----T-TGACAA-------A--------GATA-CT--GCACTGATTTTGA-----------ACTACC-CATCACACA------AAA----ATA-AC----T------TTAGTGACTCGAGGT--CAA-ACA---------T------G---A---G---GA---cttcgaaaattgagaca
gi|11 : tttcaa-T---TT-T------G---A--------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TTT-A-T-TTTT-CCT----C-----AAGAATGT---GAG---ACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaGTCTAG--G------------TCATC-----C-A-AAAA-------C--------AATA-CC--TCA-TTGTTCTGAGCG-----GC-ATAACT-CATTACACA------ACT----CTAGACCACAT------TTGTCCACTCC--------A-ACAG-T---TT-TTGTATAG---A---G---AG---CTAc
gi|12 : aACTCAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TCT-A-T-TTTT-TCT----TCA---AAA----TGAAAAG---AAAA-AAAaatgcaaatattaacattcaactggtcgctacaccacctcaggaaaaataacaaatgtctattttttcttcaaaatgaaaagaaaaaaatt
gi|13 : agtctaggtcatccaaaaacaatacctcattgttctgagcggcataGTCA------AGGTC--ATCC------A---AGAA-----A-A---T-G--CT--GCATG-------GTTTT----G------GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------TACT---A--TTGAC-CAA--ATCCAAA---TTT-GGC-ATCT------CTAGGCA---AAATA--CA---CTGAGAAAC-GGAGCT-CAAtt
gi|13 : catttttaaatG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TCT-C-TCTTTT-TCT----T-----TGG----A---AAGGTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaA-CA---A--------------------CTC--------TGGGCC-----AAAAG----------T---T--TCAAA---G-------------------AAAC--A-----GAAT------------AA--AATG--------CAAAGA-CA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCACA-G------AGATCAAGGTCATC----aa
gi|14 : gtgAA-G---AAACA--------------GAATA-AA----A---TGCAAAG-----A-CAT--CA-T-T-T---TGAAGGCC-AAGTTAC-TT-ATC----C-----ACAGAGATCAAG--G------------TCATC-----TAAGTAAC-------ACTACCCATAGTG-AT--GCA-GGGTGTT-ACTG-----AT-A-TACCACATTACAGA------ACC----Ataagtaacactacccatagtgatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|15 : gtgacaactctgggccaaaagtttcaC--ATCC------AGAAA--A-----A-A---T-A--GT--ATATA-------GTTAT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------CATT---A--C---C-CAATGATGGTTTTAATTA-CAA-GACA------TTGGACC---AAACACTTT---CCAAGAAAC-AGCGCT-TAAA----ACAA-------AA-----AA-C-TTatatcatgatacac
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatgTAGAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-AGAAAA-----------------ATG-CT--GCA-TGGTTTTGAGTG-----GT-TTAATT-CACTATATA------ACT----ATGGAATAAGTGTTGAATTGTTGACCC
gi|16 : GTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Tgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagtAA-------A--------AA-G-CT--GCA-AGGCTTTGAGTA---------C--CT-CAT-ACACA------GCA----ATGAACCAAAT------TTGGTGACTGGGGG-------ACAG-T---TT-TA-----A---A---G---AA---tagtataa
gi|19 : -T---TAA--TTATT----CTTATA---AG---AGGTCATTGTTGAGGTC--ATCC-------------A-----A-A---T-A--CT--CCATT-------GTTAT----C------AGT---A------G---------TTC--T---------G---------------C------A--C---------AACT---A--TGAAC-CAA--AG--------TTG-Gacggagcatttttaaacatt
gi|2 : -GCCAA-G---TAAAAT-ATT----C--AT----AG---AGGTC---------GTCTAAT--------A---A--A-----A-AATCT-A--TTT-GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------C----------------------------------------C------A--C---------AACT---A--TGAGC-CA-------------TTC-AGT-GATT------CTAGGCA---AAA---TTA---TTGCGAAAC-GGAACT-AA------GC-A-------AA-----AA------A-CAAT--G-T-A-GGAGAAGTT--ATTA----C----T--A--GAG------GTAAAAGTCAAG---TTA-AT---------------CTGAAATA--------T--A---A----------------CT--GA-AT----GGTTTTTATTA----G--T---AGT-AACCG--TAACA-CA---ACCATTGACCAACTTTGGCAACTC--------TAGATC-----GACAG----------T---T--TTT-G---A-------------------AAAA--AAGATGGAGC------------TA--AATGCAAAAAAATA---A-CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCACA-G-----A-GGTCAATATCAGC-----TGAAATCATG-CTGTATTCTTTTGAATGATACTGTCC---ATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTT-AATTAAA------AAA------A-CTTCACG-TAG-T-G-TA--GACC-AAGTT--GTTCATC----T-----GAAAAGGTCAAG--A------------TCAGC-----C----AAA-------G--------GGTT-TT--GCA-TGGTTTTGAGTT-----GA-ACTAAC-CATTACACA------ACT----ACAGACCAAAT------TAGGCAATTCTATAT--CAA-ACAG-T---TTCT------G---A---G---GA---
gi|2 : tgaagAAA-A-----ACTTCACGTAGTG--TAG--A-------CCAA---------GTTGTT----C--ATCTGAAA---AGGTCA------AGATC--AGCC------A---A--A-----G-GG--T-T--TT--GCATG-------GTTTT----G------AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------AACT---A--CAGAC-CAA--AT--------T-A-GGC-AATT------CTATATC---AAACAGTTT---CTGAGGAAC-AGGACT-TTACAGG-AC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----A---T-G-------A--ATTG----C----T--G--acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaG-T---TT-T------G---A---GTTGAA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TTC-C-T-TTTT-CCTCAAAT-----AAG----C---AAG---ACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-T-TTTT-CCT----T-----CGA----A---AAG---ACAA-AAA
gi|3 : aatA-A-----ACGTAGCAT-TTG--TAG--A-------CCAAGT---TGA--TTATT----T---------------GTAA------AGGTC--TTTCTAA---A---A--A-----A-A---T-G--TT--GCGTGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------CACT---A--TGGAC-CAA--GT--------T-A-AGT-TACT------TGGGGCTTTGAAATAGTTT---AAAAGAAAC-AGAGCT-AAACTAATGC-ACACAAAAAA-----AA-A-TCCA-TA----A-T-T-T-------T--TTTTAAG-T----T--GGTTATTC----ATAAAGGTCAGGG--TCA-C----------------C------A--------T--G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----A---------GTACTG--T---ACT-ATCTA--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGTTTCTGAAAA--A----------T---GGGT---G---T-------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AATA--------TA---A-CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATG-A-GTA---AAGGTTATGGTCATTTAAGATGAAA-AAT--CGGCAT----------G-----GT------T---TT----GA------GTA-G---TCACAT-------------GACTT-----------CTCATA----------TCACA-A-C-T-G-TG--GACC-AAATTTGGTT-ACT--------------AGGCCAAACAG------------T--TC-----T-GGAGAA-------ACA------AGAG-TTTAACA-CAATT--GATTA-----GT-ACTATC-CATAACACG------ACTTATAATGGACTAAAT------TTAGTGACCCTGAGC--AAG-ACAG-T---TTCT------G---A---G---AA---gt
gi|3 : agcaccaggGGGTGTAAACATAAA-A-----ATATAACATAG-GCTTAA--A--TTT---TAA-T---ATGAGT-----------------AA---AGGTTA------TGGTC--ATTTAAGATGA---A--A-----A-A---T----CG--GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------AACT---G--TGGAC-CAA--AT--------TTG-G-----TTA-----CTAGGCC---AAACAGTTC---TGGAGAAACAAGAGTT-TAAC----AC-A-------A-----------TTGA---------T-TAG-------T--AC-----------------TATCC----ATAA----CACG-----A-CT---------------T------A--------T--A---A----------------TG--GA-CT----A---------A----ATTT---AGTGACCC---TGA-G-CA---A---------------------------------GAC-------A--G----------T---T--TCTGA---G-------------------AAGC--A-----TAGC------------AA--AATGCGAAACC-TA---A-CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTGTA-G------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAA-G---AAAAG--------------AAGCT-AA----AACATGCACA------A-CTTAACA-T-T-TTG-TG--AGTT-AAACTAA-TT-ATT----C-----ATAGAGGTAAAG--A------------TCCTC-----T-G--AAA-------A--------TACT-CT--GCA-TGGTATTGTATA-----GT-ACTACC-TATAAAACA------GCT----ATAAACC--AT------TCTGTGACTGTAGAT--TAA-CCAGAT---TT-T------G---A---G---AA---
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataAAACATGCACA-----ACTTAACATTTTG--TGA--G--TT----AAA-C---TAA--TTATT----C--AT----AG---AGGTAA------AGATC--CTCT------G---A--A-----A-A---T-A--CTCTGCATG-------GTATT----GTAT---AGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------AGCT---A--TAAAC-CA-------------TTC-TGT-GACT------GTAGATT---AACCAGATT---TTGAGAAAC-AGAACT--AAT----GT-A-------AA-----AA-T-TTAA-CA----G-TGT-G-------T--ATTA----T----T-----CATCC----AAACAAGTCAAGG--TCA-Cacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaAGA-A-----ACAGAAC-TAATG--TAA--AAATTT-AACAG-TGTGTA---TTATT----C--ATCCAAAC---AAGTCA------AGGTC--A-CC------A---A--ATAA--A-A---T-A--CT--ACATG-------GTTTTCA--G------AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------AACT---G--TTGGC-AAT--AT--------CT---GCTGACTCAATCCCTGGGAC---AATTA-TTT---TTAAG-AAT-TGAACT-GTAC----GC-A-------AA-----AA-T-TTAA-CA------T-T-A-------TTAATTT----TA---T--G--TACAT----GTACCTGAAAAA-----A-TT---------------T------T--------T--G---GTT--------------TT--GA-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTA--------------------CCA--------TAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------caaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttg--------------GAACT-GT----A---CGCAAA------AATTTAACA-T-T----------------ATTAATTTTAT-----------GTACATGT---------------------ACC-----T-G--AAA-------A--------AATT-TT------TGGTTTTGAATA-----GA-ACTACC-CATTTAGGATTATTTACC----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTCTAGGT--TAA-ATAG-T---Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattG-T---TT-T------G---AATAG---AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Tgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGAT-CAA--AT----------GAGGC-GACT------CTAAGCC---AAACAAATT---CTGTGAAAC-A-AGCT-AAA--------G-------AA-----AA-TGTTGT-CA------T-G-G-------T--AA-C----C----T--G-------------------CAAAA--CTT-CTG--------------C------A--------T--G---G----------------TTTTGA-TT----G--------------G--T---ACT-ATCTG--TAACA-AA---A--------------------CTA--------TTGACC-----AAA-G----------T---C-------------------------------AACTTA-----AAAC------------AA--AAAC--------TA---AACA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCGTA-G-----A-GGTCAAGGTCACCTG--AC-AAA-AATG-CTGCCT----------G-----GTTTTGAGT---ATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCT-TA----A---CGCAAAC-----A-CTTAACG---T-T-G-TGA-GGTCGAAGTT-ACTT-ATC----C-----AGAAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTC-AAAAAAGAGAAGCA--------AATG-AT--GCA-TAGTTTTG---A-----GT-ACTACC-CACTCCAAC------ACT----ATATACCAAAT------TTAGTGACTCTAAGT--CAA-ATAG-T---TTCT------G---A---G---AA---
gi|5 : -ATAG-T---TT-T------G---A---G---TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TCT-C-T-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgc---A--A-----A-A---TCA--CT--ACATG-------GCTTA----G------ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------AGTT---AAATGGAC-CAA--AT--------TTT-GA--GACT------CCAAACC---ATATGGGTT---TTCAGAATC-GGGGCT-AAAT----GC-A-------AAA----AA-C-ATAATCT----G-T-C-G-------T--AGGC----CAAG-TTAA--TATTCATCAGCAGAGGTTAAGG--TCA-CCAAATAAATAATGCTGC------A--------T--G---G----------------TT--TG-AT----T---------A----G--T---AAT-ACCCA--TTATA-TA---A--------------------CTA--------TGGGCC-----AA--ATACACTTACTT---T--T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGC------------CA--AATA--------CA---A-AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATT--TTTGCATA-----AAAGTCAAGGTCATC-----CAAAA-CATT-CT
gi|6 : AAA-A-----ACATAATCTGTCG--TAG---------GCCAAGT---TAA---TATT----C--ATC---AGCAGAGGTTA------AGGTC--A-CC------A---A--ATAAATA-A---T-G--CT--GCATG-------GTTT-----G------ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATAACT---A--TGGGC-CAA--ATACAC----TT-------ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTCAGAAAT-AAAGCC-AAAT----AC-A-------AA-----AA-C-TTAG--G----G-T-T-ATTAAGT-T--ATTT----T----T--G------C----ATAAAAGTCAAGG--TCA-TC---------------C------AAAACATTCT--T---C----------------TT--GA-TTTC--A---------A----G--TGGAACT-ACCCA--TTACA-CA---G--------------------TTA--------TAGACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaA-G---AAATA--------------AAGCC-AA----A---TACAAA------AACTTA-------------G--GGTT-A--TTAAGTT-ATTTTTGC-----ATAAAAGTCAAG--G------------TCATC-----C----AAA-------A--------CATT-CT--TCT-TGATTTCAAGTG-----GA-ACTACC-CATTACACA------GTT----ATAGACC-TAT------ATGGTGACTCTAGGT--TAA-ACAT-T---TTCT------G---A---G---AA---tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcA-T---TAA-GTTATTTTTGC--AT----AA---AAGTCA------AGGTC--ATCC------A---A--A-----ACA---T-T--CT--TCTTG-------ATTTC----A------AGT---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------AGTT---A--TAGAC-CTAT-AT------------GGT-GACT------CTAGGTT---AAACATTTT---CTGAGAAGC-GGAGCT-CAAT----GC-A-------AA-----AAGG-TTAA-C-----G-T-T-GAAC----T--ATTgcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggtt---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TCT-T-T-TTTTATCT----TCGAAAAGG----T---AAG---ACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------AACTTGGA--TGAACACAAC-AC--------TTT-GGT-GACT------CAAGGAC---AGACAGTTT---C----AAA---GA-----AAT----AT-A-------AA-----AA---TTAA-CA----T-T-TTG-------T--AAGC----CAAGTT--AATTATTT----GTTAAGGTCAAGG--TCATCTAAAA-----------C------A--------A--A---A----------------TTT-GG-GG----T---------A----G--T---TCT-ATCCA--TACCA-TA---G--------------------TTAAGTGACACTGGGCC-----AA--A----------TAATT--T---AAAAG-------------------AAAC--A-----GAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TA---A-CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAAT-ATTCATAT-----------AGGTCAAGGTCATC-----TGAAG-AATGTCTGCAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATATAAA-A-----AT-TAACATTTTG--TAA---------GCCAAGT---TAA--TTATT----T--GTT---A----AGGTCA------AGGTC--ATCT------A---A--A-----A---------------CAAA-------ATTTG----G------GGT---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T-----------CC---A--T--AC-CAT--AG--------TTA-AGT-GACA------CTGGGCC---AAATAATTT---AAAAGAAAC-AGAGCTGAAAC----AC-A-------AACAAGCAG-C-ATAA-CA----GTT-T-G-------T--GATCTAAGC----TAAA--TATTC----ATATAGGTCAAGG--TCA--T---------------CTGAAGAA--------T--GTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGT---------A----GT-T---ACT-ACACA--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TAGACT-----AA-------------T---T--T---G---G-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagT----AA-------AA-G---AAACA--------------GAGCTGAA----A---CACAAACAAGCAG-CATAACAGT-T-T-G-TG--ATCT-AAGCTAAAT--ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G---AA-------G--------AATGTCT--GCA-TCATTTTGAGTACCGTAGTTACTACA-CATAACACA------ACT----ATAGACT-AAT------TTGGTGGCTCTGGG---CAA-tggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatt--CAA-ACTG-T---TT-T------G---A---G---TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGctgagt
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgTAAACATAAA-A-----ACATAACATTGTG--TAA-----------------------GTTATT----C--ATCT--AT---AGGTCA------A--------CC------A---A--C-----A-G---C-AATCT--GCGCG-------GTTTC----A------AAT----------G---------T----A---------A----------------------A---------------T---A--TAGAT-AAA--AG--------TT--AGT-GATT------GTATGTT---AAA-ATTTT---CTGAATGAT-CGTGGT-CAAC----AC-A-------AA-----AA-tgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------AACT---A--TGAAT-AAA--AT--------TTG-G-T-GACT------CTTGGGC---AAACAGTTT----TGAAAAA---AA--T-TGAC----AC-A-------AA-----TA-C-TTAA-CA----T-T-T-G-------T--AGGC----CAATTT--AATTATTC----ATATAGGTCAAGG--TCATCTGAAAATATCTG----C------A--------T--G---G----------------TT--CAGAT----T---------A----G--T---GCT-ATCTG--TAGCA-CA---G--------------------CTA--------TGAACC-----A--------------C---T--T---G---G-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttg----A---CACAAAT-----A-CTTAACA-T-T-T-G-TA--GGCC-AATTTAA-TT-ATT----C-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G--AAA-------A--------TAT--CT--GCA-TGGTTCAGATTA-----GT-GCTATC-TGTAGCACA------GCT----ATGAACC--AC------TTGGTGGGTCTATAC--CTA-ACAG-TGACTT-T------G---G---G---Atgggtctatacctaacagtgactttggga
blockSeqs : G C . T AG CT AAATTTAACAGTGTGTATTATTCATCCAAAC TTGTTG TA T AAGATGAAAAAT CT TTTTTCT TCGTGTTTTTC AGTCACATGACTTCTCATATC AG CCATTATAT TGG AA T A TG GGTTTTAATTACAA CAATCC TTG T TTTC AA AA CTAAT A CACAAAA CAAGC TG CAATGTAGGAGAAGTTATTACTAGAGGTAAAAGTCAAGTTAATCTGAAATATAACTGAATGGTTTTTATTAGTAGTAACCGTAACACAACCATTGACCAACTTTGGCAACTCTAGATCGACAGTTTTTGAAAAAAAGATGGAGCTAAATGCAAAAAAA AAG A GTTTGTGATCT GTTATT G T AC GTAAA TAAGATG T GT TCTTTTGAATGATACTGTCCATTATACAAC A GCC ATTTCTGATAAGTG AATTAAA CAAGCAG TTTTGAAGGCCAAGTTACTTATCCA T CA CACCCCCCCCCC TACTTCAAAAAAGAGAAGCAA GT TA C A CCGTAGTT A T TTATTT TATA A GTTGAA T TGCT . A GAC TTGTATA GAT ATA TTG GTG A A TTATTT A G TATA AACG CTTTCTGAGAAACTCGA A GG G CAATGTT ATG CCAAAACTG . CATTATAT CTT AT CA C A TCAAAATGAA GTA T
blockSeqs : . . G AG . GCCAAGTTAATATTCATCAGCAG . . T AAATAAATAATG T . GTAT ATAAATAACAATTTG . . . . G . T CCAAATTTGGC A . C C G GA CAGG . . A GG TCTGTCGTAGGCCAAGTTAATATTCATCAGCAGAGGTTAAGGTCACCAAATAAATAATGCTGCATGGTTTGATTAGTAATACCCATTATATAACTATGGGCCAAATACACTTACTTTTGGCCAAACATTTTTTTCTCAGAAATAAAGCCAAATA . . TCATTTTGA CTT A C AC TAAA TGAC . G GGTTTTGAGTATTGCCAAGTGACTC . . T AAAACA CA TAGTGTAGACCAAGTTGTTCATCTG G . . TAAGTAACACTACCCATA G . . G GA . C . . A . G TC . . . TA . . . . . . . T G A AACA TTTACAGG . C G CGAC . TCAAA . A A . TC . . TCGAAAAGGT . .
blockSeqs : . . A TT . ACCAAGTTGTTCATCTGAAA . . T AGAAAAAATA . . CAG TGAACTAACCATTAC . . . . G . C TTCAGT . . G C A C C . . . C CATTTTGTAAGCCAAGTTAATTATTTGTTAAGGTCAAGGTCATCTAAAACAAAATTTGGGGTAGTTCTATCCATACCATAGTTAAGTGACACTGGGCCAAATAATTTAAAAGAAACAGAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA . . TTGTGT CC A A GT GA TG . G GGTTTTGAG . . . AAAA GA TTTTGTGAGTTAAACTAATTATTCA G . . TGGAGAAACAA A . . C GC . T . . A . C TC . . . CT . . . . . . . C G A AACA TCAAT . T G TAC . ATT . . T . A . . CAAGAATGT . .
blockSeqs : . . T AA . GTTAAACTAATTATTCATAG . . T AAAAAATCTA . . G AGTACTACCTATTAC . . . . A . . TTCTGT . . G C G T A . . . C TAATTTTTTTTAAGTTGGTTATTCATAAAGGTCAGGGTCACCATGAAGAATTTTGCATCGTTTTGAGTAGTACTGTACTATCTATAACACAACTATGGTTTCTGAAAAATGGGTGTAAACATAAAAATA . . TTGTGC CG T C GT GA CA . T . . . GAAA AA TTGTGAGGTCGAAGTTACTTATCCA G . . TTGACAAAG A . . G AT . T . . A . G TC . . . CT . . . . . . . C G C ATCA TCAAT . C A C . TCG . . A . A . . CAAATAAGC . .
blockSeqs : . . A GT . GCCAAGTTAATTATTTGTTA . . G TAAAAAAATG . . G AAAACTGTCCATAAC . . . . G . . ACACTT . . G T A A C . . . C TTAGTACTATCCATAACACGACTTATAATGGACTAAATTTAGTGACCCTGAGCAAGACAGTTTCTGAGAAGCATAGCAAAATGCGAAACC . . GTGTGT GT G C GC GA TG . . . . . AAA CA GTTTGTGATCTAAGCTAAATATTCA A . . CAAAAACA G . . G GT . T . . A . T CA . . . CT . . . . . . . T T A AGCG TAAAT . G A T . CAG . . C . C . . TTGGA . .
blockSeqs : . . A TT . ACCAAGTTGATTATTT . . T AAATAAAATA . . C GGAACTACCCATTAC . . . . G . . TTTGGT . . G C A T T . . . A CATGGTAACCTGCAAAACTTCTGCATGGTTTTGATTGGTACTATCTGTAACAAAACTATTGACCAAAGTCAACTTAAAACAAAAAC . . ACTT AC G C G GA . . . AAA AA TTTGTAGGCCAATTTAATTATTCA G . . CCATAAG G . . G GA . T . . A . T TT . . . CT . . . . . . . T G A TATG CCATT . C A C . ATG . . C . C . . TCGAA . .
blockSeqs : . . A TG . ATTTTAATATGAGTAA . . T AAGAAAATG . . G ACTACCTATAAA . . . . A . . TTAAGT . . A A A A C . . . T . . T CT A . . A . . . GTA TA ACTGTGGACCAAATTTGGTTACT C . . CAGAAAA G . . T GT . A . . A . T TT . . . T . . . . . . . T . C . TCAAT . C A C . AGA . . C . C . .
blockSeqs : . . . T . GTTATTCATCTAT . . T AACAGCAAT . . G AATTACCAAT . . . . T . . TTGGT . . G T T T T . . . T . TAA A GGGTTATTAAGTTATTTTTGCA A . . TGAAAAT T . . A GT . A . . A . T TC . . . T . . . . . . . C . . . TAAAC . . . A . CCA . . C . T . .
blockSeqs : . . T AAAGGGTT . . G AGTTCTGC . . . . G . . TAGGC . . T T A G T . . . C . AAA A TTGTGTTGGTTATTTATTTG A . . TGAAAAA G . . A GA . T . . . . T TT . . . T . . . . . AGA . . C
blockSeqs : . . T AAAACATT . . G AGTAAT . . . . G . . TAAGT . . T T G A T . . . C . . A TTGTGTAGGTTAATAAATCA T . . TGAAAAT T . . G GT . T . . . . T CC . . . T . . . . TCA . . .
blockSeqs : . . . GAAAATA . . G AGTAAT . . . . G . . CTGCT . . G C A A T . . . C . TTATTAATTTTATG T . . CAAAGG T . . G GA . T . . . . T C . . . T . . . .
blockSeqs : . . . AAATA . . A AGTTCT . . . . A . . GAGGC . . A T G A C . . . C . . . CAAAAC G . . T GT . A . . . . T . . . . T . . . .
blockSeqs : . . AAAA . . G GTAA . . . . G . . TTTGA . . T C A C C . . . . . . TGAAGA T . . . . . A . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . A ACC . . . . A . . TTAGT . . G C C C C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . G . . TTGGT . . . A . T . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TTGG . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GGT . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ***** NN GCCAAGTTAATTATTCGTAA*************************** AAAAAAATA********************* TTGGT*********** GA******* CG***** NA****** TTTGTGGGCCAAGTTANTTATTCG******************* CGAAAAA*********************** C********* TCGAAAAG*************
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAA-A-----ACATAACATNNTG--TAA--A--TT--GCCAA-T---TAA-GTTATT----C--ATC---AG---AGGTCA------AGGTC--ATCC------A---A--A-----A-A---T-A--CT--GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--AT--------TTG-GGC-GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----GTANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCA-G-----AAGGTCAAGGTCATC----ACGAAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A---CGCAAA------A-CTTAACA-T-T-T-G-TG--GGCC-AAGTTAAGTT-ATT----C-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-GGAAAA-------A--------AATG-CT--GCA-TGGTTTTGAGTA-----GT-ACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTCTAGGT--CAA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCT----T-----AGG----T---AAG---ACAA-AAA
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAA-A-----ACATAACATNNTG--TAAGCCAAGTTAATTATTCGTAA---------------------------AGGTCA------AGGTC--ATCCAAAAAAATA---------------------CT--GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------AACT---A--TGGAC-CAA--ATTTGGT-----------GACT------CTAGGCC---AAACAGTTT---CTGAGAAAC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TTAA-CA----G-T-T-G-------T--ATTC----C----T--G--TATTC----GTANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TA---A-CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCGCAGA-------GGTCAAGGTCATCCG-----AAA-AATG-CTGCAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCT-AA----A---CGCAAANA------CTTAACATTTGTGGGCCAAGTTANTTATTCG-------------------TANAGGTCAAG--G------------TCATCCGAAAAA-----------------------ATG-CT--GCA-TGGTTTTGAGTA-----GT-ACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACTCTAGGT--CAA-ACAG-T---TT-T------G---A---G---AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGCC---------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TCT-C-T-TTTT-CCTTCGAAAAG-------------AAG---ACAA-AAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11111 1111111 111111 11111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 222222222222222222222222 11111111111111 2222222222 1111111111111111111111111111111111111111111 111 22222222222222 3333333333333333333 11111111 111111111111111 22222222222222222222222222222222222 11111111 1111111111 1 111111 111111 11111111111111111111 2222222222 111111111 11111111 11111 222222222
lowQualScore : 4 0 88 1 44444 44 2 1 2222222 33 888888 33 1 0 2 7777 2 888888 22 7777777 22222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 22 1 555555 1 1 44 1 3333 44444 1 555555 1 333 7777 00 1 333 44 77 22222 4 6666666 55555 999 333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222 000000000000000000000000 88888888888888 6666666666 5 88 99 3333333333333333333333333333333333333333333 5 000 77777777777777 2 55 8 3333333333333333333 3 44 11111111 2 666666666666666 2 22222222222222222222222222222222222 55 1 3 3 11111111 44 6 3 3 888888 6666 33 999999 888888 33 888888 2 0000000000 444 0 444 444 111111 444 4 4 111111 0 2 0 3 9999 5555 55555555555555555555 4 77 0 4 7777777777 777 666666666 3 66666666 555 66 4 44 4 22222 6 999999999 5
lowQualScore : . . .. . ..... .. . . ....... .. ...... .. . . . .... . ...... .. ....... ........... ..................................................................................... ... .. . ...... . . .. . .... ..... . ...... . ... .... .. . ... .. .. ..... . ....... ..... ... ... ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... ... ........................ .............. .......... . .. .. ........................................... . ... .............. . .. . ................... . .. ........ . ............... . ................................... .. . . . ........ .. . . . ...... .... .. ...... ...... .. ...... . .......... ... . ... ... ...... ... . . ...... . . . . .... .... .................... . .. . . .......... ... ......... . ........ ... .. . .. . ..... . ......... .
lowQualScore : 0 4 77 4 11111 22 7 1 6666666 44 222222 77 7 3 7 8888 4 888888 55 6666666 55555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 333 66 0 555555 8 8 33 8 9999 88888 9 555555 0 333 5555 22 9 333 77 66 44444 2 8888888 33333 555 999 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222 000000000000000000000000 11111111111111 1111111111 7 77 22 4444444444444444444444444444444444444444444 7 000 55555555555555 6 00 1 8888888888888888888 3 33 33333333 1 333333333333333 1 55555555555555555555555555555555555 44 4 1 1 22222222 22 5 8 1 888888 5555 66 666666 888888 99 222222 7 3333333333 111 0 777 444 666666 444 0 0 555555 9 1 9 9 7777 7777 44444444444444444444 4 33 5 4 4444444444 000 333333333 6 88888888 555 11 4 66 4 33333 2 000000000 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACGTAAA-AACNTAACATTNTGTAGGC-CAAG--TTAATTATTC----G--TAA-AGGTCA------AGGTC--ATCCA-A----A-AAAAT--A---CT-GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------A-------------ACT---A--TGGA------C-CA-A--A-T----TTGGT-----G-ACT------CTAGGCC---AAACA---GTTTCTGA-GAA---AC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TT---AA-C-------A----G-T-T-G-------T--A-TTC----C----T--G--TAT---------TC----G---TANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATA--------TAA---CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCG--TAG------AGGTCAAGGTCATC-C-----G--AAA-AATG-CTG--CAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCTAAA-CGCAAAAACTTAACAT-T-TG-TG--GGCC-AAGTT-AN-TTATCC-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-G--A-A-A---------A----------AATGCTGCA-TG-GTTT--------T--GAGTAGNACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACT------CTAGGT--CA------A-ACA----------GT---TT-TG---A---G------AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TC-TC-T-TTTT-C---CTTCGAA-AA--G--AAGACAA-AAA
Reference ( family-412 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGTGTAAACATAAA-AACATAACATNNTGTAAGC-CAAG--TTAATTATTC----G--TAA-AGGTCA------AGGTC--ATCCA-A----A-AAAAT--A---CT-GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------A-------------ACT---A--TGGA------C-CA-A--A-T----TTGGT-----G-ACT------CTAGGCC---AAACA---GTTTCTGA-GAA---AC-GGAGCT-NAAC----GC-A-------AA-----AA-C-TT---AA-C-------A----G-T-T-G-------T--A-TTC----C----T--G--TAT---------TC----G---TANAGGTCAAGG--TCA-CT---------------C------A--------T--G---G----------------TT--GA-NT----N---------A----G--T---ACT-ACCCG--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------AA--AATG--------TAA---CA--TCGTG---T---AGG----CT-AAGTTATTCATCCG--CAG------AGGTCAAGGTCATC-C-----G--AAA-AATG-CTG--CAT----------G-----GTCC---GT---AT----AA------CAA-G---AAACA--------------GAGCTAAA-CGCAAANACTTAACAT-T-TG-TG--GGCC-AAGTT-AN-TTATTC-----GTANAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-G--A-A-A---------A----------AATGCTGCA-TG-GTTT--------T--GAGTAGTACTACC-CATTACACA------ACT----ATAGACCAAAT------TTGGTGACT------CTAGGT--CA------A-ACA----------GT---TT-TG---A---G------AA---CTACCCAT-TA-CACA------ACTATAGACCAAATTTGGCGACTCTAGGTCAAACAGTTTCTG---AGAAACGGAGC---T---C-----AAC----GC-AAAAA-CTTAACGTTGAATTGTTGACGC---C------GCCA---CTG--ANA----GAAAA-GTAAC--------ACC--TG--TC-TC-T-TTTT-C---CTTCGAA-AA--G--AAGACAA-AAA
gi|1 : AAG--TTATTTATCC----G----G-ACGTCA------TGGTC--ATC---A----A-GAAAT--G---CT-GTTTG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------C------A--C---------A-------------ACT---A--TGGA------C-CT-A--A-T----TTGGG-----GGACT------ATAAGCC---AAACA---ATTTTTGA-TAA---AC-GGAGCT-AACA----AC-A-------AA-----AA-C-TT---A--T-------G----G-T-T-G-------T--A-TTC----C----T--G--TAT---------TC----A---TCCCGGGGGAGGGGTCA-CT---------------C------A--------T--A-------------------------A-CT----C---------A----G--T---TCT-GCCCA--TAACA-TA---A--------------------CTA--------TAGACC-----AA--G----------T---T--T---G---G-------------------AAAC--A-----GAGC------------TA--AATA--------TAA---GA--TCGTG---C---GAG----CT-AAATTATTCATCCA--CAACAGTTAAGGTCAAGGTCACCAC-----A--AAA-AATG-CTG--CAT----------G-----GTC----AT---AT----AG-------AA-A---AAACA--------------GAGCTTAG-CACAAA-ATATAAGAT-T-TGGTG--GTTT-TATTT-ACGTCATCCCAAAGGTTAAGGTCAAG--G------------TCAAC-----C-GGAA-A-A---------A----------AATGCTGTA-TG-GTTT--------T--GAACAGCACTACC-CATAATATA------ACT----ATAGACCAAGT------TTGGAAAC-------AGAGCT--TA------ACGCA----------AT---TT-TG---A---G------AA---CTAGCCAT-TA-CAAA------ACTATGGACCAAGTTTGGTGACTCTATGACAAACAGTTTCTG---TGAAAGAGAGC---T---C-----ATC----GC-AAAAG-CTAAACGTTGAATTGTGGACACT--T------GCCA---TTG--ACA----GAAAATGTAAA--------ACC--TA--TC-TA-T-TTT--------------AG--GT-AAGACAA-AAA
gi|10 : tgacgcaaattggtaaggagggtaacataaaattttggtataaaatgtgtcattattttaacaatta-CA-A--A-T----TTGGT-----G-AGC------TTGGACT---AAACA---TTTTCTGA-----------AAGCTAAAAC----G--A-------AA-----AA-C-TT---AA-C-------ATTGTG-T-T-GGT-----T--A-TT----------------TAT---------TT----G---TAT-GGTCAAAG--TCGTCC---------------C------A--------TAAG---GTGCTAAAGAGGT----TT--GG-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCA--TTACC-CA---A--------------------CTA--------CAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------ATAC--cta
gi|10 : A--------------AAGCTAAAACG-AAAAACTTAACAT-TGTG-TT--GG------TT-AT-TTATTT-----GTAT-GGTCAAA--G------------TCGTC-----C-C--A-T-A---------A----------GGTGCTAAA-GA-GGTT--------T--GGATAGAACTACC-CATTACCCA------ACT----ACAGACCAAAT------TTGGATACT------CTAGGT--CA------T-ACA----------Gtctaggtcatacagagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|10 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgAGGTGCTA------A-AGA----------GG---TT-TGGATA---G------AA---CTACCCAT-TA-CCCA------ACTACAGACCAAATTTGGATACTCTAGGTCATACA-----------------GAGT---T---C-----AAT----GCAAAAAA-CTTGATATTGAATTGTTGATGC---C------AACAATGCTG--ATT----GAAAA-GTACCA-------ATA--TA--TC-TCAT-TTTT-CTTTCTTCGAA-AATTG---AGACAagttcaatgcaaaaaacttgatattgaattgttgatgccaacaatgctgattgaaaagtaccaatatatctcatttttctttcttcgaaaattgagaca
gi|11 : caaatttggtgagcttggactaaacattttctgaaagctaaaacgaaaaacttaacattgtgttggttatttatttgtatggtcaaagtcgtcccataA--------------GAGCTAAA-CACAAACATTTAACA--T-TG-TG-----T-AGGTT-AA-TAAATC-----ATGGAGGTCAAG--A------------TCACT-----T-G--ACA-A---------A----------GATACTGCACTG-ATTT--------T--GA-----ACTACC-CATCACACA------AAA----ATA-AC----T------TTAGTGACT------CGAGGT--CA------A-ACA------------------TG---A---G------GA---
gi|11 : tttcaaT---TT-TG---A-----------A---CTACCCAT-CA-CACA------AAAATA-AC----TTTAGTGACTCGAGGTCAAACA-----TG---AGGAACGGAGG---T---C-----AAT----GC-AAAGA-TTT------------TTGATGC---T------GCTA---CTG--TCG----GAAAA-GTAACCATTATATATT--TT--TT-TA-T-TTTT-C---C-TCAAG-AAT-GT-GAGACAA-AAAacggaggtcaatgcaaagatttttgatgctgctactgtcggaaaagtaaccattatatatttttttatttttcctcaagaatgtgagacaaaaac
gi|12 : tttcaaagagctaaacacaaacatttaacattgtgtaggttaataaatcatggaggtcaagatcacttgacaaagatactgcactgaT------CTAGGT--CATCCAAAA-ACAATACCTCATTGT---TC-TG---A---GCGGCATAA---CT---CAT-TA-CACA------ACTCTAGACCACATTTGTCCACTCC------AACAGTTTTTGTATAGA----GAGC---T---A-----AAT----GC-AAATA--TTAACATTCAACTGGT--CGCTA-C------ACCA---CCT--CAG----GAAAA-ATAAC--------AAA--TG--TC-TA-T-TTTT-T---CTTCAAA-AT--G--AAAAGAA-AAAc
gi|13 : agATTT----T--TAA-ATGTCA------AGGTC--ATCCA-A----G-AAAAT--G---CT-GCATG-------GTTTT----G------GGTATAA------A---------T----A---------A---------------CAATTTGA--C---------T-------------ACT---A--TTGACCAAATC-CA-A--A-T----TTGGC-----A-TCT------CTAGGCA---AAATA-----CACTGA-GAA---AC-GGAGCT-CAAaatt
gi|13 : cG--ATG----GAAAA-GTAAT--------ACC--TG--TC-TC-TCTTTT-T---CTTTGGA-AA--G--GTAACAA-AAAacaagatggaaaagtaatacctgtctctctttttctttggaaaggtaacaaaaaaa
gi|14 : catttttaaatgtcaaggtcatccaagaaaatgctgcatggttttgggtataaataacaatttgactactattgaccaaatccaaatttggcatctctaggcaaaatacactgagaaacggagctcaaacaaA-CA---A--------------------CTC--------TGGGCC-----AAAAG----------T---T--TCAAA---G-------------------AAAC--A-----GAAT------------AA--AATG--------CAAAGACA--TCATT---TTGAAGG----CC-AAGTTACTTATCCA--CAG------AGATCAAGGTCATC-T-----A--AGT-AACA-CTACCCAT----------A-----GTaa
gi|14 : gtgAA-G---AAACA--------------GAATAAAA-TGCAAAGACAT--CAT-T-T--TGAAGGCC-AAGTT-AC-TTATCC-----ACAGAGATCAAG--G------------TCATC-----T-A--A-GTA---------ACACTACCCATAGTGATGCA-GG-GTGT--------T---ACTGATA-TACCACATTACAGA------ACC----Agatgcagggtgttactgatataccacattacagaaccaatatcatgatacac
gi|15 : gtgacaactctgggccaaaagtttcaTT-AC-CTATCC-----CTGGATGTTGAA--T------------GCATC-----CAG--A-A-A---------A----------AATAGTATA-TA-GTTA--------T--GAGTAGTAATA-C-CATTACCCA------ATG----ATGGTTTTAAT------TACAAGACA------TTGGAC--CA------A-ACA----------CT---TT-atatcatgatacac
gi|15 : C--ATCCAGA----A-AAAAT--A---GT-ATATA-------GTTAT----G------AGT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--C---------C-------------ATT---A--C---------C-CA-ATGA-TGGTTTTAATTACAAG-ACA------TTGGACC---AAACA---CTTTCCAA-GAA---AC-AGCGCT-TAAA----ACAA-------AA-----AA-C-TT---ccaagaaacagcgcttaaaacaaaaaactt
gi|16 : ttacctatccctggatgttgaatgTAGAGGTCAAG--G------------TCATC-----C-A--G-A-A---------A----------AATGCTGCA-TG-GTTT--------T--GAGTGGTTTAATT-CACTATATA------ACT----ATGGAATAAGTGTTGAATTGTTGACC------C
gi|16 : GTTGAATTGTTGAC-C---C------GCTG---CTGCCAAAACTGGAGAA-ATAAC--------ACC--Tgctgctgccaaaactggagaaataacaccttagtataa
gi|18 : tagaggtcaaggtcatccagaaaaatgctgcatggttttgagtggtttaattcactatataactatggaataagt----A-AAAA---G---CT-GCAAG-------GCTTT----G------AGT---ACCTC--A---------T----A-------------------------C------A--C---------A-------------GCA---A--TGAA------C-CA-A--A-T----TTGGT-----G-ACT------GGGGG-------ACA---GTTTTAAA-GAA---AC-GGAGCtagtataa
gi|19 : --TTAATTATTCTT--A--TAAGAGGTCATTGTTGAGGTC--ATCCA-A----A-----T--A---CT-CCATT-------GTTAT----C------AGT---A------G---------T----TCT-------G---------------C------A--C---------A-------------ACT---A--TGAA------C-CA-A--A-G----TTGGatttttaaacatt
gi|2 : TGAAGGC-CAAG--TAAAATATTC----A--TAG-AGGTC---------GTCTAAT----A----A-AAAATCTA---TTTGCATG-------GTTTT----G------AGT---A------C----------------------------------------C------A--C---------A-------------ACT---A--TGAG------C-CA------T----TCAGT-----G-ATT------CTAGGCA---AAA------TTATTGC-GAA---AC-GGAACT-AA------GC-A-------AA-----AA---------A-C-------AAT--G-T-A-GGAGAAGTT--A-TTA----C----T--A--GAG---------------G---TAAAAGTCAAG---TTA-AT---------------CTGAAATA--------T--A---A----------------CT--GA-AT----GGTTTTTATTA----G--T---AGT-AACCG--TAACA-CA---ACCATTGACCAACTTTGGCAACTC--------TAGATC-----GACAG----------T---T--TTT-G---A-------------------AAAA--AAGATGGAGC------------TA--AATGCAAAAAAATAA---CA--TTGTG---T---AGG----CG-AAATATTTCATCCA--CAG------AGGTCAATATCAGC-T-----G--AAATCATG-CTG--TATTCTTTTGAATGATACTGTCC---ATTATAC----AA------CAAAG---GCACT--------------GAGTTAAT-TAAAAAAACTTCACGTAG-TG-TA--GACC-AAGTT-GT-TCATCT-----GAAAAGGTCAAG--A------------TCAGC-----C----A-A-A---------G----------GGTTTTGCA-TG-GTTT--------T--GAGTTGAACTAAC-CATTACACA------ACT----ACAGACCAAAT------TAGGCAATT------CTATAT--CA------A-ACA----------GT---TTCTG---A---G------GA---
gi|2 : AAA-AACTTCACGTAGTGTAGAC-CAAG--TTGTTCATCT----G--AAA-AGGTCA------AGATC--AGCCA-A----A-GGGTT------TT-GCATG-------GTTTT----G------AGTTGAA------C---------T----A---------A---------------CCATTACA--C---------A-------------ACT---A--CAGA------C-CA-A--A-T----TAGGC-----A-ATT------CTATATC---AAACA---GTTTCTGA-GGA---AC-AGGACT-TTACAGG-AC-A-------AA-----AA-C-TT---AA-C-------A----A---T-G-------A--A-TTG----C----T--G--acaggactttacaggacaaaaacttaacaatgaattgctgacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|2 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaa----------GT---TT-TG---A---GTTG---AA---CTAACCAT-TA-CACA------ACTACAGACCAAATTAGGCAATTCTATATCAAACAGTTTCTG---AGGAACAGGAC---TTTAC-----AGG----AC-AAAAA-CTTAACAATGAATTGCTGACAC---C------ACC------G--AGA----GAAAA-GAAAT--------ACCTTTG--TT-CC-T-TTTT-C---C-TCAAATAA--GC-AAGACAATAAAacaccaccgagagaaaagaaatacctttgttcctttttcctcaaataagcaagacaataaa
gi|23 : tgaaggccaagtaaaatattcatagaggtcgtctaataaaaaatctatttgcatggttttgagtaccacaactatgagccattcagtgattctaggcaaaattattgcgaaacggaactaagcaaaaaacaatgtaggagaagttattactagaggtaaaagtcaagttaatctgaaatataactgaatggtttttattagtagtaaccgtaacacaaccattgaccaactttggcaactctagatcgacagtttttgaaaaaaagatggagctaaatgcaaaaaaataacattgtgtaggcgaaatatttcatccacagaggtcaatatcagctgaaatcatgctgtattcttttgaatgatactgtccattatacaacaaaggcactgagttaattaaaaaaacttcacgtagtgtagaccaagttgttcatctgaaaaggtcaagatcagccaaagggttttgcatgCA---CTG--CCA----GAAAA-GTAAA--------ACC--TAATTCTTC-T-TTTT-C---CTTCGAA--------AAGACAA-AAA
gi|3 : aatA-AACGTAGCATT-TGTAGAC-CAAG--TTGATTATTT----G--TAA-AGGTC----------TT---TCTA-A----A-AAAAT--G---TT-GCGTGTTTTTCTGTTTTTCGTGTTTTTCGGT---A------G---------T----ACTACCTATTA---------------C------A--C---------C-------------ACT---A--TGGA------C-CA-A--G-T----TAAGT-----T-ACT------TGGGGCTTTGAAATA---GTTTAAAA-GAA---AC-AGAGCT-AAACTAATGC-ACACAAAAAA-----AA-A-TC---CA-T-------A----A-T-T-T-------T--T-TTTAAG-T----T--GGTTAT---------TC----A---TAAAGGTCAGGG--TCA-C----------------C------A--------T--G---AAGAATTTTGCATCGTTTT--GA-GT----A---------GTACTG--T---ACT-ATCTA--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TGGTTTCTGAAAA--A----------T---GGGT---G---T-------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AATA--------TAA---CA--T-----------AGG----CTTAAATT-TTAATATGAGTAA------AGGTTATGGTCATT-TAAGATG--AAA-AAT--CGG--CAT----------G-----GT------T---TT----GA------GTA-G---TCACAT-------------GACTT----CTCATA----TCACAA-C-TG-TG--GACC-AAATTTGG-TTACT----------AGGCCAAACAG------------T--TC-----T-G--G-A-G---------A----------AA-----CA-AGAGTTTAACACAATT--GATTAGTACTATC-CATAACACG------ACTTATAATGGACTAAAT------TTAGTGACC------CTGAGC--AA------G-ACA----------GT---TTCTG---A---G------AA---gt
gi|3 : agcaccaggGGGTGTAAACATAAA-AATATAACA-----TAGGCTTAAATTTTAA-TATGA----G--TAA-AGGTTA------TGGTC--ATTTA-AGATGA-AAAAT------CG-GCATG-------GTTTT----G------AGT---A------G---------T----C---------ACATGACTTCTCATATC------A--C---------A-------------ACT---G--TGGA------C-CA-A--A-T----TTGGT-----T-A--------CTAGGCC---AAACA---GTTCTGGA-GAA---ACAAGAGTT-TAAC----AC-A-------A-----------TT---GA----------------T-TAG-------T--A-C-----------------TAT---------CC----A---TAA----CACG-----A-CT---------------T------A--------T--A---A----------------TG--GA-CT----A---------A----ATTT---AGTGACCC---TGA-G-CA---A---------------------------------GAC-------A--G----------T---T--TCTGA---G-------------------AAGC--A-----TAGC------------AA--AATGCGAAACC-TAA---CA--TTGTG---C---GGT----GT-AATTTATTCATCTG--TAG------AGTTAAAGGTCgcatagcaaaatgcgaaacctaacattgtgcggtgtaatttattcatctgtagagttaaaggtc
gi|4 : agcaccaggaaacgtagcatttgtagaccaagttgattatttgtaaaggtctttctaaaaaaatgttgcgtgtttttctgtttttcgtgtttttcggtagtactacctattacaccactatggaccaagttaagttacttggggctttgaaatagtttaaaagaaacagagctaaactaatgcacacaaaaaaaaatccataattttttttaagttggttattcataaaggtcagggtcaccatgaagaattttgcatcgttttgagtagtactgtactatctataacacaactatggtttctgaaaaatAAACATGCACAACTTAACATTTTGTGAGT-TAAA--CTAATTATTC----A--TAG-AGGTAA------AGATC--CTCTG-A----A-AATAC--T---CT-GCATG-------GTATT----GTAT---AGT---ACTACCTA---------T----A---------A---------------A------A--C---------A-------------GCT---A--TAAA------C-C-----A-T----TCTGT-----G-ACT------GTAGATT---AACCA---GATTTTGA-GAA---AC-AGAACT--AAT----GT-A-------AA-----AA-T-TT---AA-C-------A----G-TGT-G-------T--A-TTA----T----T-----CAT---------CC----A---AACAAGTCAAGG--TCA-C
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaA-G---AAACA--------------GAACTAA--TGTAAAAATTTAACA-----G-TG--TGT----ATT-AT-TCATCC-----AAACAAGTCAAG--G------------TCA-C-----C-A--A-ATA---------A----------AATACTACA-TG-GTTT--------TCAGAATA--ATTACC-AA-TAAGCA------ACT----GTTGGCAATAT------CTGCTGACTCAATCCCTGGGA--CA------A-TTA----------TT---TT-TA---A---G------AA---TTcaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgAATGTAAA-AATTTAACAGTGTGTA----------TTATTCATCC----A--AAC-AAGTCA------AGGTC--A-CCA-A----ATAAAAT--A---CT-ACATG-------GTTTTCA--G------AAT---A------A---------TTACCA---------A---------------T------AAGC---------A-------------ACT---G--TTGG------C-AA-T--A-T----CTGCT-----G-ACTCAATCCCTGGGAC---AATTA----TTTTTAA-G-A---AT-TGAACT-GTAC----GC-A-------AA-----AA-T-TT---AA-C-------A------T-T-A-------TTAA-TTT----TA---T--G--TAC---------AT----G---TACCTGAAAAA-----A-TT---------------T------T--------T--G---GTT--------------TT--GA-AT--------------A----G--A---ACT-ACCCATTTAGGATTATTTA--------------------CCA--------TAGACC-----AA--A----------T---T--T---G---G-------------------gaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttggttttgaatagaactacccatttaggattatttaccatagaccaaatttggtgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaact--------------GAACTGTA-CGCAAAAATTTAACAT-T---------------ATT-AA-TTTTAT-----GTACATGT---------------------ACC-----T-G--A-A-A---------A----------AATTTT----TG-GTTT--------T--GAATAGAACTACC-CATTTAGGATTATTTACC----ATAGACCAAAT------TTGGTGACT------CTAGGT--TA------A-ATA----------GT---Ttgactctaggttaaatagttgctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattACGCAAA-AATTTAACATTAT-TAA---------TT--TTAT------G--TAC-ATGT---------------ACCTG-A----A-AAAAT--T---TT----TG-------GTTTT----G------AAT---A------G---------A----ACT-------A---------------C------C--C---------ATTTAGGATTATTTACC---A--TAGA------C-CA-A--A-T----TTGGT-----G-ACT------CTAGGTT---AAATA---GTTGCTAC-AAA---AC-AGAGCC-CATT----GC-A-------AA-----AA-G-TT---AA-C-------A----A-T-gctacaaaacagagcccattgcaaaaagttaacaatgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|4 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgt----------GT---TT-TG---AATAG------AA---CTACCCAT-TT-AGGATTATTTACCATAGACCAAATTTGGTGACTCTAGGTTAAATAGTTGCTA---CAAAACAGAGC---C---C-----ATT----GC-AAAAA-GTTAACAATGAATTATTGACAC---CAATGTTACCA---CGGTCAAA----GGAAA-GTAGT--------ACC--Tgaattattgacaccaatgttaccacggtcaaaggaaagtagtacct
gi|5 : attaaattaaatacctcaatgtataatattgctttatcacaacttgaggctatgtagaagtctagtagataaagaaaagaagctaaaacatgcacaacttaacattttgtgagttaaactaattattcatagaggtaaagatcctctgaaaatactctgcatggtattgtatagtactacctataaaacagctataaaccattctgtgactgtagattaaccagattttgagaaacagaactaatgtaaaaatttaacagtgtgtattattcatccaaacaagtcaaggtcaccaaataaaatactacatggttttcagaataattaccaataagcaactgttggcaatatctgctgactcaatccctgggacaattatttttaagaattgaactgtacgcaaaaatttaacattattaattttatgtacatgtacctgaaaaaatttttgCT---A--TGGA------T-CA-A--A-T----GAGGC-----G-ACT------CTAAGCC---AAACA---AATTCTGT-GAA---AC-A-AGCT-AAA--------G-------AA-----AA-TGTT---GT-C-------A------T-G-G-------T--A-A-C----C----T--G-------------------------------CAAAA--CTT-CTG--------------C------A--------T--G---G----------------TTTTGA-TT----G--------------G--T---ACT-ATCTG--TAACA-AA---A--------------------CTA--------TTGACC-----AAA-G----------T---C-------------------------------AACTTA-----AAAC------------AA--AAAC--------TAAA--CA--GTGTG---T---ACG----AC-AAGTTAGTCTTCCG--TAG------AGGTCAAGGTCACC-T-----GACAAA-AATG-CTG--CCT----------G-----GTTTTGAGT---ATTGCCAAGTGACTCAA-GGCCAAACAATTTCTGATAAGTGGAGCTTAA-CGCAAACACTTAACG--T-TG-TGA-GGTCGAAGTT-AC-TTATCC-----AGAAAGATTAAT--GCACCCCCCCCCCCCACCTACTTC-A--A-A-AAAGAGAAGCA----------AATGATGCA-TA-GTTT--------T--G---AGTACTACC-CACTCCAAC------ACT----ATATACCAAAT------TTAGTGACT------CTAAGT--CA------A-ATA----------GT---TTCTG---A---G------AA---
gi|5 : -ATA----------GT---TT-TG---A---G------TA---CTACCCAC-TC-CAAC------ACTATATACCAAATTTAGTGACTCTAAGTCAAATAGTTTCTG---AGAATCAGAACCTTT---CTGAGAAACTCGAGC-CATAT-CTTAACGTTGAATTGTTGCCACCGAC------GCCG---ATG--AGA----CAACA-GTAAC--------AC----A--TC-TC-T-TTTT-tcagaacctttctgagaaactcgagccatatcttaacgttgaattgttgccaccgacgccgatgagacaacagtaacacatctcttttt
gi|6 : ctatggatcaaatgaggcgactctaagccaaacaaattctgtgaaacaagctaaagaaaatgttgtcatggtaacctgcaaaacttctgcatggttttgattggtactatctgtaacaaaactattgaccaaagtcaacttaaaacaaaaactaaacagtgtgtacgacaagttagtcttccgtagaggtcaaggtcacctgacaaaaatgctgcctggttttgagtattgccaagtgactcaaggccaaacaatttctgataagtggagcttaacgcaaacacttaacgttgtgaggtcgaagttacttatccagaaagattaatgcaccccccccccccacctacttcaaaaaagagaagcaaatgatgc-AAAATC-A---CT-ACATG-------GCTTA----G------ATT---A------AAACTGTCCAT----A---------A---------------C------A--A---------A-------------GTT---AAATGGA------C-CA-A--A-T----TTTGA-----G-ACT------CCAAACC---ATATG---GGTTTTCA-GAA---TC-GGGGCT-AAAT----GCAA-------AA-----AA-C-AT---AATC-------T----G-T-C-G-------T--A-GGC----CAAG-TTAA--TAT---------TCATCAG---CAGAGGTTAAGG--TCA-CCAAATAAATAATGCTGC------A--------T--G---G----------------TT--TG-AT----T---------A----G--T---AAT-ACCCA--TTATA-TA---A--------------------CTA--------TGGGCC-----AA--ATACACTTACTT---T--T---G---GCCAAACATTTTTTTCTCAGAAAT--A-----AAGC------------CA--AATA--------CAA---AA--AC-T----T---AGGGTTATT-AAGTTATTTTTGCA--TAA------AAGTCAAGGTCATC-C-----A--AAA-CATT-CT
gi|6 : AAA-AACATAATCTGTCGTAGGC-CAAG--TTAAT-ATTCATCAG--CAG-AGGTTA------AGGTC--A-CCA-A----A-TAAAT--AATGCT-GCATG-------GTTT-----G------ATT---A------G---------T----A---------A---------------T------A--CCCATTATATA-------------ACT---A--TGGG------C-CA-A--A-T----ACACT-----T-ACT------TTTGGCC---AAACATTTTTTTCTCA-GAA---AT-AAAGCC-AAAT----AC-A-------AA-----AA-C-TT---AG---------G----G-T-T-ATTAAGT-T--A-TTT----T----T--G---------------C----A---TAAAAGTCAAGG--TCA-TC---------------C------AAAACATTCT--T---C----------------TT--GA-TTTC--A---------A----G--TGGAACT-ACCCA--TTACA-CA---G--------------------TTA--------TAGACC-----tcttgatttcaagtggaactacccattacacagttatagacctatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaA-G---AAATA--------------AAGCCAAA-TACAAAAACTTAGGGT-T---------ATT-AAGTT-AT-TTTTGC-----ATAAAAGTCAAG--G------------TCATC-----C----A-A-A---------A----------CATTCTTCT-TG-ATTT--------C--AAGTGGAACTACC-CATTACACA------GTT----ATAGACC-TAT------ATGGTGACT------CTAGGT--TA------A-ACA----------TT---TTCTG---A---G------AA---tatatggtgactctaggttaaacattttctgagaagcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcAAATACAAA-AACTTAGGGTTAT-------TAAG--TTATTTTTGC----A--TAA-AAGTCA------AGGTC--ATCCA-A----A-ACATT------CT-TCTTG-------ATTTC----A------AGT---G------GAAC------T----ACCCATT---A---------------C------A--C---------A-------------GTT---A--TAGA------C-CT-A----T----ATGGT-----G-ACT------CTAGGTT---AAACA---TTTTCTGA-GAA---GC-GGAGCT-CAAT----GC-A-------AA-----AAGG-TT---AA-C------------G-T-T-GAAC----T--A-TTgcggagctcaatgcaaaaaggttaacgttgaactattgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|6 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagcc---G------AA---CTACCCAT-TA-CACA------GTTATAGACCTA-TATGGTGACTCTAGGTTAAACATTTTCTG---AGAAGCGGAGC---T---C-----AAT----GC-AAAAAGGTTAACGTTGAACTATTGACAC---A------ACCA---CTG--TCA----GAAAA-GAAAC--------ACC--TG--TC-TT-T-TTTTAT---CTTCGAA-AA--GGTAAGACAA-AAAgacacaaccactgtcagaaaagaaacacctgtctttttttatcttcgaaaaggtaagacaaaaa
gi|7 : aaaatcactacatggcttagattaaaactgtccataacaaagttaaatggaccaaattttgagactccaaaccatatgggttttcagaatcggggctaaatgcaaaaaacataatctgtcgtaggccaagttaatattcatcagcagaggttaaggtcaccaaataaataatgctgcatggtttgattagtaatacccattatataactatgggccaaatacacttacttttggccaaacatttttttctcagaaataaagccaaatacaaaaacttagggttattaagttatttttgcataaaagtcaaggtcatccaaaacattcttcttgatttcaagtg---------A---------------C------A--C---------A-------------ACTTGGA--TGAA------CACA-AC-ACT----TTGGT-----G-ACT------CAAGGAC---AGACA---GTTTC-----AA---A---GA-----AAT----AT-A-------AA-----AA---TT---AA-C-------A----T-T-TTG-------T--A-AGC----CAAGTT--AATTAT---------TT----G---TTAAGGTCAAGG--TCATCTAAAA-----------C------A--------A--A---A----------------TTT-GG-GG----T---------A----G--T---TCT-ATCCA--TACCA-TA---G--------------------TTAAGTGACACTGGGCC-----AA--A----------TAATT--T---AAAAG-------------------AAAC--A-----GAGCTGAAACACAAACAAGCAGCA--------TAA---CAGTTTGTGATCT---AAG----CT-AAAT-ATTCAT------AT------AGGTCAAGGTCATC-T-----G--AAG-AATGTCTG--CAT----------
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattAAATATAAA-AAT-TAACATTTTGTAAGC-CAAG--TTAATTATTT----G--TTA-AGGTCA------AGGTC--ATCTA-A----A-ACAAA--A-------------------TTTG----G------GGT---A------G---------T----T---------C---------------T------A--T------------------------CC---A--T--A------C-CATA--G-T----TAAGT-----G-ACA------CTGGGCC---AAATA---ATTTAAAA-GAA---AC-AGAGCTGAAAC----AC-A-------AACAAGCAG-C-AT---AA-C-------A----GTT-T-G-------T--G-ATCTAAGC----TAAA--TAT---------TC----A---TATAGGTCAAGG--TCA--T---------------CTGAAGAA--------T--GTCTGCATCATT---------TT--GA-GTACCGT---------A----GT-T---ACT-ACACA--TAACA-CA---A--------------------CTA--------TAGACT-----AA-------------T---T--T---G---G-------------------cattttgagtaccgtagttactacacataacacaactatagactaatttggtggctctgggcaactgagt
gi|7 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagA---CTACACAT-AA-CACA------ACTATAGACT-AATTTGGTGGCTCTGGG-CAAtggctctgggcaactgagt
gi|8 : ataaaatataaaaatatttatatttagagtcgccatgagataccaacacaataaacattagcgatgcatagctattgacagacatttacatgatgtaaatcccattacacaacttggatgaacacaacactttggtgactcaaggacagacagtttcaaagaaatataaaaattaacattttgtaagccaagttaattatttgttaaggtcaaggtcatctaaaacaaaatttggggtagttctatccataccatagttaagtgacactgggccaaataatttaaaagaaacagagctgaaacacaaacaagcagcataacagtttgtgatctaagctaaatattcatataggtcaaggtcatctgaagaatgtctgcatcattttgagtaccgtagtt---------T----A---------A---------------T------A--C---------T-------------ACT---T--TGAA------C-CA-A--A-T----TTGGT-----A-TTT------CTTTGAT---GAACA---GTTTCAAAAGAATTTAT-GATGCT-AAA-----GC-A-------AC-----AA-A-TTGCAAA-CTGTTTTGA----G-T-G-G-------T--GCTTC----C----C--A--TATAACACAACTTT----GAAATAAATGT-AACG----A-CT---------------C---------------------------------------TT--GA-TC----T---------A----G--A---AGT-TTCTG--CGA------------------------------TA--------TGGA-----------G----------C---T------------------------------AAAC--A-----TA--------------AA--AACA--------TAA---CA--TTGTG---T---A----------AGTTATTCATC----TAT------AGGTCAActgagt
gi|8 : a--CA------A-ACT----------GT---TT-TG---A---G------TGGTGCTTCCCATATAACACA------ACTTTGAAATAAATGTAACGACTCTTGATCTAGAAGTTTCTG---CGATATGGAGC---T---A-----AAC----AT-AAAAA-CATAACATTGccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|8 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgTAAACATAAA-AACATAACATTGTGTAAG------------TTATTC----ATCTAT-AGGTCA------A--------CCA-AC---A-GCAAT------CT-GCGCG-------GTTTC----A------AAT----------G---------T----A---------A----------------------A----------------------------T---A--TAGA------T-AA-A--A-G----TTAGT-----G-ATT------GTATGTT---AAA-A---TTTTCTGA-ATG---AT-CGTGGT-CAAC----AC-A-------AA-----AA-tgtaagttattcatctataggtcaaccaacagcaatctgcgcggtttcaaatgtaaatatagataaaagttagtgattgtatgttaaaattttctgaatgatcgtggtcaacacaaaaa
gi|9 : ataatactactttgaaccaaatttggtatttctttgatgaacagtttcaaaagaatttatgatgctaaagcaacaaattgcaaactgttttgagtggtgcttcccatataacacaactttgaaataaatgtaacgactcttgatctagaagtttctgcgatatggagc------A--C---------A-------------ACT---A--TGAA------T-AA-A--A-T----TTGGT-----G-ACT------CTTGGGC---AAACA---GTTT-TGA-AAA---A----AATT-GA-C----AC-A-------AA-----TA-C-TT---AA-C-------A----T-T-T-G-------T--A-GGC----CAATTT--AATTAT---------TC----A---TATAGGTCAAGG--TCATCTGAAAATATCTG----C------A--------T--G---G----------------TT--CAGAT----T---------A----G--T---GCT-ATCTG--TAGCA-CA---G--------------------CTA--------TGAACC-----A--------------C---T--T---G---G-------------------
gi|9 : aattaaaattaaatgtcttacctataattattatcttatcacaaagtgagactaaaaagaagtcgactatttctacccctttgA-CACAAATACTTAACAT-T-TG-TA--GGCC-AATTT-AA-TTATTC-----ATATAGGTCAAG--G------------TCATC-----T-G--A-A-A---------A----------TAT-CTGCA-TG-GTTC--------A--GATTAGTGCTATC-TGTAGCACA------GCT----ATGAACC--AC------TTGGTGGGT------CTATAC--CT------A-ACA----------GTGACTT-TG---G---G------Atgggtctatacctaacagtgactttggga
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ACAAGATTAAAAAAAATTAAAGACGGCATGAAATATAACGCAATAAACATAAGCTTTGCATGGCTATACTGACCGAGTTTTACACGAAGAAGCACATTATAAAC
Unaligned ( gi|20 ): ATACAAGATACACAATTTTATATATAGTCGGCATGAGATATAACACAATAAATTTTGTGCATATCTATTGACCGATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGATACAAAATTGTATTTATATAGTCGTCATGAGATATAGCTCAATAAGCATTAGCTATGTATAGCTATTGACTGA
Unaligned ( gi|22 ): AGATACACATTTTTTATTTATATTCTGCATGAGATATGATACAATAAACATTAGCTATGTAC