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gi|2                          :                                                                                                                                                 tatgtttgaaatgtgctttaacTATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGTTT-TTTTT--AGAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT----TGTAATTTTTTA----TTTTCATTttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                             ATATACACAACAGTGCTATTGTT-CTAAATCAATTGTTA----T-TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAA-T--------------------TA---TTGTTTATA---------AT------GA-A-ATAAAATTAAATA-----TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAG-TCATA---AC----TACCTTGC-TCATTTAAA-------TTTTTAATTCCTTT-----TAAGTCAAAT---TAACTATTTTT------TATTAA--CT--------AT-TTTTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGATGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGCTTTTTATGTG--CTATCTcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAA-TTATTGTAAACAAT---GTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATT---CTTTTCTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-AT-A-G-ATTATAACT---CTGTTCAAATTTTATAAAAAAAA-------A--TCTTTTAAAGTCAAATTA---TTATA--TATTTTT------AAACTT--AA--------ATTAAGTTTCT--T--ACTAAAC---------------------C
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTCCG---------------AATGTTACGTCAACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTATGTT-----GTACTGTTATATATCATGC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCGTGATATTTGATATACGACATT----------------C--GTCTC----TCACCACTAAT-TCAAGTGGG-AAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTC---AAGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCcgacgttaaatacaattgatttgatttgatcaagacgatattcgacattc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATTCAGGTCTCGGTTTCATTATATATCTCAACTCGAGAAAGTCA-CACGTTACTTGCGCA-ATGGGTG-TGCTCAGTGAATACTGATTAACC---------gaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tggttttaatcatcgctgttgtttatatattaaaacggTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--TTT------ATTTGATTTGATTttccatgatccgagg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATACAA--TTG------ATTTGATTTGATCA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actatttgtatgttttgaattgtcactccgaatgttacgtcaactgctattattctaaatgtattaagattttgtattttcggttcaaacactttatatgtagcttatgttgtactgTTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--TTT------ATTTAATTTGATagacgatattcgacattc
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): CAGACCTGTGATAATATTTAATATCTATGTTTGTTCCATGCTTAACTATTTTTATGCTTAAACTTAACTGAATTTTATGTTTAACGCTAGTATTACATATGTCTAACATTATGTAGTGTCTTGTCAAATGCTTTATATCTAGGTTCTGTTTATTGT
Unaligned ( gi|8 ): TCAGTCCTGCAAATATTTTGAAGTCACACTGCGACACCGACATGCGTTATGGTCGAAATAACAGATAATCCGCGATTTTGTTATGCAATTTTCAATTAAATGAACCTTTCTATAATATTCCTTAACATTAATTTCATAAATCAAACGTCTC
Unaligned ( gi|9 ): TTTCTGTAATTTATTATTTTCATTATCCAATACATGAAATATTACAATTTATTATACAATAGCAATTTACAACATGTATAGTATTTTCATACAAAAGTAGCATTTTTTTTCTACAAAAACATATCATAATGGTAATTATATATAG
Unaligned ( gi|11 ): TTTGAGATAATAGTTTGTTACAAAGCCACTAATTTATTTTTTTATTTAATTTTTTTTTCATTCTCCAATACATGAAATATTACAATATGTTAATATTAGTACTATTTAAATAGTCTAATATT
Unaligned ( gi|13 ): TCGTCAATAACTATACATAGCTTATGTCTACTGTGTTATTATAATTCATGCCGACTTCAAACAAAATTTTGTA
Unaligned ( gi|14 ): TTACAATTGTTCTGGAGACACTGATTTATGTGATAACTCATGACATGTATATAACTTGTTT
Unaligned ( gi|15 ): TGCTCGAGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGCATAGATGTT
Unaligned ( gi|16 ): TGTTATGCCTCATGCCGACTAAATAACATTTTGTATATTGTCTCTTTT






Alignments
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTTATTGCACCTGAGAGNGNGNTGTTAATCANNTCANAGCAAATCTGATTTGAGNTGATATAGTTTATTNTTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATAGTG-TTTTTTTT--C-ATGTCANTTTTTA----TCTCCTTTTATGCTTCTTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACGTCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAA-TATTGTAAACAATG---T---AANATTATATATAC-----AT-AT------GACATATNTGATT-A----CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTCCCAAANNTTTTGCTAGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CGTTATNTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTACAAGTTAAA-TT-T-TA-C-TATTTTT------AAANAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ANTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANGTTTAAATGCTTATGCCTTTATGCTNTTTATGTGTGCTATNCTGAACTATTTNTATGTTTTGAATTGTCACTCCGCTGAATGTTATGTCAAATGCTACGTCAACTGCTATTATTCTAAATGTATCTAANATTNTGTATTNTCGGTTCAAANNCTTTATATGTA--GCTTATGTTTTATAGTACTGTTGTATATNATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--ATT---CAG-GTC--TCGGTT-TCACCACNNATCTCAANTNGGGAAAGTCATCACGTTNCTTGCGNAGATGGGNNGTGCTCAGTGAGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTG-TATATC--ATGCCGACGTTAAATGAAA--------TTNATTTGATTTGATNATATTAAACAACGATC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtTGCTC---GAGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGatgattgttt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGTTT-TTTTT--AGAACATTTCTT------------TAATA-TTTTTTTT-----TGTAATTTTTTA----T----TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---GTC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATAAA---TATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT--C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAAT---AAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGATTCA----CTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-TATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTT-TGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCA----ACTGAATGTTATGTCAAA------------TGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTTATATGTA--GCTTATG-TTTATAGT----TTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTG-CTATTGTT--CTAAATCAATTGTTA----T-TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAAT---AAAATTAAATA----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-AA-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGCTTTTTA--TGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATG---TAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATT-CTTTTCTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-TA-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AGT-TATTTTTAA-GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAG-TTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CG-TATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-T-A-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGTTTTGAATTGTCACTCA-CTGAATGTTATGTCAAATTTAACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAANGCTTT--ATATGTAGCTTATGTTTGTGCT-TTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCT--CGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--A---TTCA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-T-TTTTTTA-GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCT--TGGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAG-TTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-T-ATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCA---A-CTGAATGTTATGTCAAA------TGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTT--ATATGTAGCTTATGTTTATAGT-TTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAG-TTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-A-A-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAG-TTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-T-A-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTC---CGAATGTTACGTCAA------CTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTATG-TTGTACTGTTATATATCATGCCGAC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AAT-TATTTTTA--GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAG-TTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CG-TATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-T-A-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGCTTTAAATTGTCACTCACCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAAGCTTT--ATATGTAGCTTATGTTTGTACT-TTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCTCACGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--A---TTCA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCGAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-TTTTTTTA--GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAG-TTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-T-ATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCA---ACTGAATGTTATGTC-AAATGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTT--ATATGTAGCTTATGTTTATAGT-TTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAG-TTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-A-A-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAG-TTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-T-A-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTC--CGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTATG-TTGTACTGTTATATATCATGCCGAC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AAT-TATTTTTA--GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CGT-ATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-TA-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGCTTTAAATTGTCATACCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAAGCTTTATATGTA--GCTTATGTTTGTA-T--TTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCTCACGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--ATT---CA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCGAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-TTTTTTTA--GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CAT-ATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-TATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCA-ACTGAATGTTATGTC-AAATGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTTATATGTA--GCTTATGTTTATAGT--TTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-AA-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C-T-GTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-TA-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTCCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTTATATGTA--GCTTATG-TTGTA-CTGTTATATATCATGCCGAC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AAT-TATTTTTA--GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGNAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CG-TATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-T-A-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGCTTTAAATTGTCACACCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAAGCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-T-GCTTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCTCACGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--A---TTCA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCGAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-TTTTTTTA--GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-T-ATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCA-ACTGAATGTTATGTC-AAATGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-TAGTTTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-A-A-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-T-A-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTCCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTA-TGTTGTACT-G-TTATATATCATGCCGAC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AAT-TATTTTTA--GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGNAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CG-TATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-T-A-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGCTTTAAATTGTCAA-CCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAAGCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-T-GCTTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCTCACGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--A---TTCA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCGAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-TTTTTTTA--GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-T-ATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCAA-CTGAATGTTATGTC-AAATGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-TAGTTTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-A-A-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-T-A-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTCCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTA-TGTTGTACT-G-TTATATATCATGCCGAC
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AAT-TATTTTTA--GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGNAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CG-TATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-T-A-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGCTTTAAATTGTCAA-CCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAAGCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-T-GCTTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCTCACGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--A---TTCA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCGAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-TTTTTTTA--GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-T-ATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCAA-CTGAATGTTATGTC-AAATGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-TAGTTTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-A-A-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-T-A-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTCCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTA-TGTTGTACT-G-TTATATATCATGCCGAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATACAA--------TTGATTTGATTTGATCAgttaaatacaattgatttgatttgatcaagacgatattcgacattc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actatttgtatgttttgaattgtcactccgaatgttacgtcaactgctattattctaaatgtattaagattttgtattttcggttcaaacactttatatgtagcttatgttgtactg---------------------CAGACCTGTGATAATATTTAA-----TAT----CTATGTTT------GTTCCATGCTTAACTATTTTTATGCTTAAACTT---AA-CTGAATTTTATGTTTAAC-GCTAGTATT--ACATATGTCTAACATTATGTAGTGTCTTGTCAAATGCTTT--ATATCTAGGTTC-TGTT-TA-T-agacgatattcgacattc


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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|11 ): TTTGAGATAATAGTTTGTTACAAAGCCACTAATTTATTTTTTTATTTAATTTTTTTTTCATTCTCCAATACATGAAATATTACAATATGTTAATATTAGTACTATTTAAATAGTCTAATATT
Unaligned ( gi|14 ): TTACAATTGTTCTGGAGACACTGATTTATGTGATAACTCATGACATGTATATAACTTGTTT
Unaligned ( gi|16 ): TGTTATGCCTCATGCCGACTAAATAACATTTTGTATATTGTCTCTTTT






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Reference ( family-343 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGCTTAAATTTTNNATATATTCTGTGCTTTTANGTATAAAAAAATTTGTGTTTAATGNGACATTGCAGCCAATNATCTTGCGTCTNNTTTANTACCTTCCCCATAAATGATNTTATTGCATCTGAGAGGGTGTTGTTAATCAGGTCACAGCAAATCTGATTTGAGNTGATA-AAT-TATTTTTA--GAACATTTCTTA-GTATACACAATAGTGTTTTTTTT--C-ANGTCANTTTTTAT----CTCCTTTTATACTTCNTTTAGGCCTACGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACNTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGNAATAAAATTANATATGC-----AT-AT------GACATATGCGA-----TT--CTTTTTTCTAAACCG--TTAATTTCCCAAANANTTTGCTNGTCATA-T----ATTACT---TTGCT--CG-TATTTAAA--------TTTT----------A--TCCTTTATAAGTCAAA-TT-T-T-A-C-TATTTTT------AAATAT------------ATAT-TA--TTTTTT--A--ACTAAAC---------------------CAGA--TGTGATAANATTTAAGTG-TTATGCTTTTATGCTTTTTTGTGTNCTATGCTTAACTATTTNTATGCTTTAAATTGTCAA-CCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTGTCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAAGCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-T-GCTTGTATATCATGCGGNCNGGCCCGACTAGCTCAGGTNGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGNGTCNTGAGTTCGAATCCCCGCTCACGGTNACAATCTTCG-TGATGTTTGATATACGACATT--A---TTCA--G-TC--TCG-CT-TCATCACTNAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTACTTGCGGAGATGGGGTGTGCTCAG--AGTACCGGTTAACCTTCCAGGATCCGAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAGCCCTCGANGGCATAAAAACGACGCTAAATGTTCAATCAATCAATCAATTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATAAAA--------TTTATTTNATTTGATNACATTAAACAACGATC
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATATC--ATGTCGACGTTAAATGGAA--------TTTATTTAATTTGATtcgacgttaaatggaatttatttaatttgatatgattgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtcagttcacaactttatatgtagactactgtATTA-TAATTC--ATGCCGACTTCAAACAAAA--------TTTatgattgttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcgtcaataactatacatagcttatgtctactgtgttTGCTC-G--AGTATCAGTTGACCCTTCAGGATCCAAAGAAAAAGTGtgta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTGCACCTGAGAAGAAAATGTTAATCAGTTTAGAATAAATCTGATTTGAGATGATATAGT-TTTTTTTA--GAACATTTCTT------------TAATATTTTTTTT-----TGTAATTTTTTAT--------TTTCATTCTTCATTcatagatgtt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCCTGGCCCGACTAGCTCAG-TCGTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCTAGGTATCGTGAGTTCGAATCTCCGCTT--GGTCACAATCTTCG-TGATATTTGATATACGACATT--------C---G-TC--TC-----TCACCACTAAT-TCAAGT-GGGAAAGTTATCA-GTTTCTTGCGGAGATGAGGTGTGCTCA---AGTACTGGTTAACCTTCCAGGATCCAAAGAAACAGTGGTTAGGTTAACTGATCGTCTGTTAACTCTCGAAGGCATAAAAACGACGTTAAATGTTCAAT-AATCAATCAATTGTTATGTCTTATGCCGACAATAAATAAAACTTTGTATCTTGTTTTTTTTGGTAATATTAAACAACGATCacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttgcctggcccgactagctcagtcgttagcgcgtctgactgtcaatctaggtatcgtgagttcgaatctccgcttggtcacaatcttcgtgatatttgatatacgacattcgtctctcaccactaattcaagtgggaaagttatcagtttcttgcggagatgaggtgtgctcaagtactggttaaccttccaggatccaaagaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttaactctcgaaggcataaaaacgacgttaaatgttcaataatcaatcaattgttatgtcttatgccgacaataaataaaactttgtatcttgttttttttggtaatattaaacaacgatcgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                  tattgcacctgagaagaaaatgttaatcagtttagaataaatctgatttgagatgatatagttttttttagaacatttctttaatatttttttttgtaattttttattttcattcttcattacatgaagtattacaatatgaatatgcaacttcaatttacaacatgtatagtatttacatatttttttctacagataatatcatattttaattaaattatttgaataatgtataacattggatattaccttctcagttacacacactagtgtctgttttatatcttagttttttacaattatctttgcaggtcatattaagcatctttttctcattttaatttcatgtatataactttcttgatgtaatattgtgttgttacaattataatggagtcactgatgtatgtgtaaactcatcaaacgacttgtatttataacttgcttatctatgtaaatattggtcaatggctaaacattgctaaaataaatgtttatttATGCTTAAATTTTGC-----TTCTGTGCTTTTATGT-TAAAAAAATTTGTGTTT--TGTGATAT----GCTAATCATCTTGTGTCTAATTTATTACCTTTCCCA---ATGATTTT-TTGCATCTGAGAGTGTGTTGTTAATTATGTCACAGCAAATCTGATTTGAGTTGATA-AAT--ATTATTAAAGAACATTTCTTAAGTATACACAATGGTGTTTTTTTTT-C-AATTCACTTTTTATTATTCTCCTTTTATGCTTCTTTTAAGTCTATGGTCAAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTT-AACTTTTTGTAAATTATTGTAAATAATGAAATAAAATTAAATATAT-----ATAATAAAGAAGACATCTTTGA-----TTCACTTTTTTCT----TG--TTTATTTCTTAAAGATTTTGCTAGTCATATT----TTTACTGCATTGCT--CA-TATCTAAA--------TTTT----------AATTCCTTTA-AAGTTGAATTT-T-T-ATC-TATTTTTCATTAAAAAGATTGATCAATTTCCATA--TA--TTTTTTGAA--AATAAACTTAAAAATATTCTTATTATATCAGA--TGTGATAATGTTTAAATGCTTATGCTTTTATGCTGTTTTGTGTGCTATGCTGAACTATTTTTATGTTTTAAATTGTCAA-CTGAATGTTATGTC-AAATGCTATTATTCTAAATGTATCTAACATTATGTATTGTCGGTTCAAAATCTTT--ATATGTAGCTTA-TGTT-TA-TAGTTTGTATATAATGCGGACgaactttagttgccggaaggtctgtccagtaaatcttttgaaggcacgctgcggtaccgacatgcgttatggtcaaaataaaagataatccacgagttaattccgcacttttaaaataaattaaacattctataagacttctcatcatttctgattcaaacgtcagattc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgtttgaaatgtgctttaacTTG-TATATA--ATGCGGACGTTAAATGAAA--------TTTATTTGATTTGATgttaaatgaaatttatttgatttgatt
gi|4                          : tatgtttgaaatgtgctttaacatgcttaaattttgcttctgtgcttttatgttaaaaaaatttgtgttttgtgatatgctaatcatcttgtgtctaatttattacctttcccaatgattttttgcatctgagagtgtgttgttaattatgtcacagcaaatctgatttgagttgataaatattattaaagaacatttcttaagtatacacaatggtgtttttttttcaattcactttttattattctccttttatgcttcttttaagtctatggtcaagattaacatcactttctcagttttaactttttgtaaattattgtaaataatgaaataaaattaaatatatataataaagaagacatctttgattcacttttttcttgtttatttcttaaagattttgctagtcatatttttactgcattgctcatatctaaattttaattcctttaaagttgaatttttatctatttttcattaaaaagattgatcaatttccatatattttttgaaaataaacttaaaaatattcttattatatcagatgtgataatgtttaaatgcttatgcttttatgctgttttgtgtgctatgctgaactatttttatgttttaaattgtcaactgaatgttatgtcaaatgctattattctaaatgtatctaacattatgtattgtcggttcaaaatctttatatgtagcttatgtttatagtTATACACAACAGTGCTATTGTT--CTAAATCAATTGTTAT-----TCCTTTTATACTTCTTTTAGGCCTACGATCAATATTAACGTCACTTTCTCAGTTTTGAACTTTTTATAAATTATTGTTTATAATGAAATAAAATTAAATA-----------------------------------------TTTTGTTAAACTGTTTTAGTTT-CCAAACGTTTTGCTAGTTATAGTCATAACTACC---TTGCT--C---ATTTAAA--------TTTTTA--------A--TTCCTTTTAAGTCAAA--T-T-A-A-C-TATTTTT------TATTAA------------CTAT-TT--TTTTTT--ATTATTATAT---------------------AAGA--TGTAATAAGAT--------TTATGCCTTTATGC-TTTTTATGTGCTATt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aAGATTAACATCACTTTCTCAGTTTG-AGCATTTTGTAAATTATTGTAAACAATGTAAGAAGATTATATGTGCCCTGTAT-AT------AACATATGTGATTCTTTT--CTTTTTTCTAAACTG--TTAATTTTCCAAAATGTGTACTTAT-ATA-G----ATTA-----TAACT--C--TGTTCAAA--------TTTTATAAAAAAAAA--TCTTTTA-AAGTCAAA-TTAT-T-A-TATATTTTT------AAACTT------------AAAT-TAAGTTTCTT-----ACTAAAC---------------------Cct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTATTTGTATGTTTTGAATTGTCACTCCGAATGTTACGTC-AACTGCTATTATTCTAAATGTAT-TAAGATTTTGTATTTTCGGTTCAAACACTTT--ATATGTAGCTTA-TGTTGTACT-G-TTATATATCATGCCGAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTA-TATATC--ATGCCGACGTTAAATACAA--------TTGATTTGATTTGATCAgttaaatacaattgatttgatttgatcaagacgatattcgacattc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actatttgtatgttttgaattgtcactccgaatgttacgtcaactgctattattctaaatgtattaagattttgtattttcggttcaaacactttatatgtagcttatgttgtactg---------------------CAGACCTGTGATAATATTTAA-----TAT----CTATGTTT------GTTCCATGCTTAACTATTTTTATGCTTAAACTT---AA-CTGAATTTTATGTTTAAC-GCTAGTATT--ACATATGTCTAACATTATGTAGTGTCTTGTCAAATGCTTT--ATATCTAGGTTC-TGTT-TA-T-agacgatattcgacattc
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): TCAGTCCTGCAAATATTTTGAAGTCACACTGCGACACCGACATGCGTTATGGTCGAAATAACAGATAATCCGCGATTTTGTTATGCAATTTTCAATTAAATGAACCTTTCTATAATATTCCTTAACATTAATTTCATAAATCAAACGTCTC
Unaligned ( gi|9 ): TTTCTGTAATTTATTATTTTCATTATCCAATACATGAAATATTACAATTTATTATACAATAGCAATTTACAACATGTATAGTATTTTCATACAAAAGTAGCATTTTTTTTCTACAAAAACATATCATAATGGTAATTATATATAG
Unaligned ( gi|11 ): TTTGAGATAATAGTTTGTTACAAAGCCACTAATTTATTTTTTTATTTAATTTTTTTTTCATTCTCCAATACATGAAATATTACAATATGTTAATATTAGTACTATTTAAATAGTCTAATATT
Unaligned ( gi|14 ): TTACAATTGTTCTGGAGACACTGATTTATGTGATAACTCATGACATGTATATAACTTGTTT
Unaligned ( gi|16 ): TGTTATGCCTCATGCCGACTAAATAACATTTTGTATATTGTCTCTTTT